2ASMA

Structure of rabbit actin in complex with reidispongiolide a
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
370
structure length
363
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 129
structure length 363
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asmA03
1T6DA 3QICA 1BWFO 3O8MA 5AZIA 3LDOA 1HKGA 2NZTA 5E84A 5JLHA 2UYTA 1SQKA 2E88A 2YHXA 1GLFO 3O4WA 2P9SA 1WOQA 3O1BA 3FGUA 4JD2A 5KPRA 4GNIA 3F9MA 2QWMA 4CZHA 3ZX3A 4MLEA 4BVOA 4H0PA 3SMSA 5BN9A 3DAWA 5JLFA 3MN6A 1HUXA 1SZ2A 4WQ4C 2QWRA 2E2PA 5AQGA 5AZJA 4WQ5C 2P9PB 4FOIA 4FWSA 4MO5A 4FWPA 4FWKA 4FWLA 3BP8A 5BRFA 4PKIA 2E20A 5AQMA 3VEXA 3R9PA 2H3GX 3VF6A 2QWPA 5AQJA 4IWVA 4K41A 3FZMA 2A40A 1XC3A 3EKUA 3JXUA 4BQZA 3MN9A 3VEZA 2P9KA 3M3ZA 1HKBA 3TU5A 2BUPA 4BQLA 2IIRA 1TYQA 1E4FT 1MDUB 2P9KB 4H0TB 3L4IA 4BRGA 2NRHA 1BA0A 4PL8A 1KAXA 1BO5O 1QZ5A 3VERA 1U6ZA 4DQ8A 5ADXH 2ZWHA 5BRHA 5FPEA 2HF4A 2CGKA 4B1XB 3W0LA 3VPZA 3G25A 5I9EB 4CZKA 4PKGA 3VGLA 3GDQA 3BUZB 1HJOA 3C0BA 3H6EA 3FZLA 4JHDB 4O8KA 5JMVA 4BGBA 3LDPA 5BPMA 2E1YA 1V4SA 3HBTA 3DXKA 5AQKA 1Q18A 3AARA 1NGHA 3SK3A 3S41A 4B1UB 4ISFA 2GWKA 3VEYA 3IFRA 2A41A 1HX1A 4F9OA 1XUPO 5EY4A 1QQNA 2EWSA 3VOVA 1RFQA 4O5FA 3QFPA 5EXWA 3A8YA 2F9TA 3ID8A 5AQUA 5AQYA 3O1WA 4I6MA 4HTLA 4I6MB 4E1JA 1BUPA 3OHRA 1QQMA 3RSEA 4M7XA 4PKHA 2QWOA 2ASPA 4CZGA 2IVOA 5AQOA 4BRAA 3WT0A 4BC2A 3VEOA 2P9LB 3EO3A 1QZ6A 1SAZA 3SMPA 2FF3B 1X3MA 3BF1A 1S3XA 2PBDA 2Q1NA 1G99A 4BRHA 4CZEA 1C0FA 3WXKA 2ITMA 1D4XA 3UKRA 1GLEG 4WQ5A 2YCHA 4MO4A 3UKRB 3CJ9A 4BRNA 5B8HA 5KPZA 4BG9A 3R8EA 1XQSC 4BVPA 2GWJA 2Q31A 4XEIA 5E26A 3VEVA 1GLAG 3CIPA 4IO8A 2ASMA 4H03B 2P9PA 4XH5A 3AY9A 4IZ9A 4XH1A 4CI6A 3O6WA 4FSVA 3VETA 1TUYA 3AAPA 1U2VB 2PAVA 1U2VA 2P9UA 2A42A 3ATUA 1QHAA 4A2BA 1ATNA 4K43A 2CH6A 4A61A 2HOEA 1MWMA 5AQWA 3C7NB 1ZXOA 2P9IB 4QS9A 1ZC6A 1IJJA 2Q2RA 3CJ1A 3DXMA 3KVGA 3AAQA 4IXCA 4BC4A 5AQQA 1NGDA 3SLCA 5F1XA 1GLLO 1V4TA 4BR2A 2QXLA 5F2RA 1GLCG 3U9ZA 1RGIA 2Q36A 4Y0WA 3ZX2A 1JCFA 5AZIB 2ASOA 4K42A 4FWQA 2E2NA 3UB5A 5LJWA 3MCPA 1Z6RA 4M7YA 4FPAA 2FSJA 3WXIA 4CJ7A 3BEXA 3MN5A 4H5RA 4JD2B 4CD3A 3FFKB 3GOIA 1P8ZA 1EQYA 4H5TA 4WYBA 3VEWA 3ZETB 4BRKA 2Q97A 3ZETA 3D2EA 2QM1A 3ULEB 2QWQA 3ZEUA 1ATRA 4RWTA 2W41A 5EX5A 2AP1A 3DJCA 1DKGD 3HI0A 1BG3A 2HF3A 1H1VA 3MMVA 3FLCO 2P9NB 3QB0A 2QW9A 3CJCA 3FZFA 1CZAN 2IVNA 1YVNA 5AZJB 3VF2A 4FWNA 4EIAA 4NB4A 3LL3A 3CQXA 3QFUA 4RTFD 3CQYA 5BREA 4A62A 4AM6A 4BR9A 4L3QA 1BA1A 1BU6O 4LC9B 4YDUC 3SJHA 1NBWA 2A6AA 3HM8A 3D2FA 5AQIA 3JS6A 2DPNA 3P4IA 3QDKA 1TYQB 3CETA 2HMPA 4B1WB 1NGAA 3HTVA 4CZMA 3WUHA 3CHWA 3GE1A 3VENA 5AQLA 5LJVA 5BR9A 4BR0A 3VESA 1NGBA 4H0YB 4QS7A 3ENOA 4BR7A 1GLBG 3DXKB 2YI1A 3GL1A 4JHDA 3A5NC 2P9UB 1Z05A 5AQVA 4BROA 1JCEA 4H5VA 3A0IX 3MN7A 2V7ZA 5AQRA 4FWOA 2D0PA 3O08A 2NLXA 1JCGA 2P9IA 1YAGA 3DXMB 2AA4A 4H5WA 4KBOA 3LDLA 4H0OA 4BRPA 3O80A 3GBTA 4MLHA 1HKCA 4BRMA 4BC3A 4C23A 3W3DA 3IDHA 1BDGA 1QQOA 3U9DA 3HSCA 5AQXA 5AQTA 2CGJA 2ZGYA 4YDUA 2FXUA 2FSKA 3VF4A 2VCPA 3LM2A 3IUCA 5AQNA 2P9SB 4BRFA 3D7EO 1WUAA 2P9LA 3WEEB 5ADXA 3WEEA 1NGJA 2CH5A 4B9QA 1TUUA 4H5NA 3UE5A 1BOTO 1NGEA 3H46O 2OANA 3D2EB 4FPBA 4BRDA 4JAXA 3EN9A 2GEMA 4CBXA 3U8XA 4B1VA 4BREA 4BRQA 3MK6A 3UKUB 3ZX0A 4NO7A 3CI5A 4DHYA 3WQTA 5AFUA 4QS8A 1KAZA 1NGCA 1NWKA 2YHYA 3KHYA 4GY2B 4K25A 4BC5A 4B1YB 3TPQA 3BF3A 1GLDG 5FPMA 4BRIA 4EHTA 2BTFA 4BG8A 2FSNA 2CGLA 4FO0A 1K8KA 4FL9A 4FWRA 4ISEA 5AFUH 1MA9B 1K8KB 3HZ6A 4BRCA 3EL2A 4B1ZA 4CZIA 3LDNA 3MDQA 1IG8A 3C7NA 1LOTB 2FF6A 2J4RA 5AQZA 2YHWA 1NGGA 3A5OC 4JNEA 3WXLA 4HWIA 1T44A 2D0OA 3A5LC 4IJAA 3CERA 5KQ8A 5ELZA 4CZFA 3U4LA 5AQHA 5FPNA 2GELA 1T6CA 4XH4A 3CJ7A 3O5BA 2F9WA 2GTDA 3H45C 2YJFA 1HPMA 4H0XB 3KZBA 5FPDA 4EFHA 5BRDA 4EHUA 2V52B 2I7PA 3ZEUB 2V51B 3ENHA 2E8AA 1DGKN 3CJBA 2FLOA 1NGIA 3R6MA 3VGMA 1S22A 3ULEA 4FWMA 3FZHA 3WXJA 4CZJA 2W40A 4BR5A 3QBWA 5AR0A 3A5MC 4IJNA 3QBXA 3LDQA 2P9NA 2A5XA 5EVZA 3VGKA 2E2QA 2D4WA 1LCUA 3RSEB 1ESVA 1YUWA 3LM9A 2KHOA 4CZLA 3H1QA 3J8AA 1NM1A 2WUSA 3FE1A 1NLVA 3I33A 4FOEA 4Z94A 2VYPA 5AQSA 1NMDA 1OKJA 5TKYA 4CD1A 4CBUA 4J8FA 3L0QA 1HLUA 3D2FB 3ATVA 1MWKA 5LY3A 1J6ZA 1GLJO 2E2OA 5EOYA 5BPLA 4AM7A 3QMLA 4BR4A 1X9JA 3H1VX 3IMXA 2QWNA 1R59O 4ISGA 2ZGZA 1X3NA 2E1ZA 5JICA 3I8BA 3UKUA 1KAYA 1YXQA 2V7YA 2D1KA 1Y64A 4A2AA 2Q0RA 3B8AX 2IVPA 1RDWX 1DEJA 2VWBA 5CE3A 1NGFA 2YJEA 2QWLA 4RCHA 1KXPA 4EAHD 2A3ZA 2GUPA 4WQ4A 4DCHA 3EZWA 3FZKA 5BN8A 4DB3A 4BRLA 1ZBSA 5AQPA 3EKSA 3WQUA 4BGAA 5F0XA 2I7NA 4CBWA 2Q0UA 5KPTA 4M63C 3H3OB 4PL7A 3FR0A 3L6QA 5BPNA 3DWLA 3CJAA 4JN4A 1ATSA 3GG4A 5KQDA 3M6GA 5AQFA 1C0GA 4H0VB 1E4GT 3H3NO 2ZF5O 3M1FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O8FA 1NK4A 4FJ8A 1OVYA 1NOYA 4MFBA 5AZIA 2UXBK 1HKGA 5E84A 5JLHA 4DSJA 4DR2K 4OPHA 1EWQA 3TR8A 1WSIA 3QNNA 2F7TA 4Y1DA 4EP4A 1WOQA 3PSFA 3FGUA 5KPRA 4KH4A 4GNIA 4JI4K 3NH1A 2QWMA 4DV1K 1RTIA 4K8ZA 3F73A 5JLFA 1HYZA 2KQ2A 4PQUA 4UY8O 3P31A 2HHUA 3OYAA 1HUXA 3KWIA 4WQ4C 3O9UA 2P9PB 3G10A 4FWSA 5C25A 4DFJA 5BRFA 3CM5A 4CEFA 4PKIA 4BE0A 4BDPA 1U47A 2VG6A 4UQGA 3VQ4A 2QWPA 3TTCA 3NHGA 2P5GA 1BCOA 3L3VA 4QCLA 3FZMA 2F4VK 2A40A 3EKUA 4CIGA 3F2KA 4BQZA 3CC2N 1JL2A 1EWRA 2BUPA 2IIRA 1TYQA 2FC0A 1E4FT 2NRTA 3ASMA 4K8XA 2UXCK 2A1SA 3LPUA 1BA0A 4DSIA 2G8KA 2ZWHA 4B9LA 4B9VA 3VQ5A 3NF6A 3C6UA 1LV5A 4PKGA 3C0BA 3V9WA 4O8KA 2Y1JA 3VTIA 5AQKA 3J7AP 3OJUA 3PX4A 4BEBA 3IFRA 4OKEA 3L2RA 5JENA 3OYMA 4B3MK 3QIOA 2VG7A 3VTHA 3VOVA 5EY4A 1RFQA 3DOKA 4O5FA 2YNFA 3ID8A 4DTMA 5AQYA 1HNWK 4KRFA 4CESA 4I6MA 4I2PA 4E7LA 4AH9A 2Z1GA 3OHRA 4M7XA 4CZGA 2IVOA 1ASVA 4BRAA 1O13A 3VEOA 4BC2A 3EO3A 3SUOA 4B9NA 1GOBA 4B3TK 4JRPA 4O4GA 3ZSXA 3BF1A 1S3XA 3NGZA 4C8LA 4CZEA 1DTTA 1D4XA 3P39A 4B9MA 3IG1A 1S6PA 2WTUA 5C10A 5KPZA 1RT2A 5C0YA 3VEVA 3TSPA 4CFAA 3CIPA 3KLIA 4JYAK 5A2QO 1WN7A 1Q82O 4OLBA 1IV0A 4FSVA 3PY8A 3AAPA 4FW2A 2P9UA 4KHWA 2QXFA 1QHAA 3KK1A 4PUOA 4K43A 2CH6A 4CK3A 3CF5L 2NUBA 3SAHA 5I3UA 3OYNA 2KFZA 4ICLA 4FM2A 4GVEA 3TSQA 3CPWM 4QS9A 4DFKA 3I0RA 4IXCA 3DXMA 3VMFB 1SL1A 3AAQA 3DI6A 1HPZA 5AQQA 4YOYA 4CHNA 4O5BA 3SLCA 3RTVA 2O8DA 1GLLO 3U6FA 4DSKA 5HLFA 1V4TA 2QXLA 3VN5A 1T03A 4KI6A 4W5QA 3U9ZA 1RGIA 4ZTJA 2G8HA 3ZX2A 4JI8K 2ASOA 4K42A 1TL3A 2KKZA 3UB5A 1KVBA 3THYA 2FSJA 3MN5A 1U48A 4JD2B 4BDZA 4Q5VA 4BRKA 3VEWA 2IAJA 2WBNA 3RWUA 4GVMA 4FJIA 1ATRA 4RWTA 3DJCA 1DKGD 3HI0A 3DLBA 1TGOA 2HF3A 3TTDA 1NK6A 2P9NB 3NE6A 2RKIA 2QW9A 2IOCA 3KD5E 4WCEL 4CCHA 4YFUA 4FJ5A 3VQPA 3E9OA 3CQXA 1ZBLA 5I42A 5BREA 1VSDA 3NDKA 1WBDA 3CFOA 1XHXA 4LC9B 2E4LA 2A6AA 4F2SA 3ZSRA 1IKWA 2GBZA 4N76A 3AO5A 1XMQK 4DLGA 1TK8A 1KFSA 4B1WB 3WUHA 3CHWA 4HCCA 2IC3A 3VENA 1NGBA 4H0YB 5H1SQ 1NMNA 3AVBA 3P38A 3HM9A 2C1IA 1GLBG 2YI1A 4FZZA 3WNEA 2V7ZA 4CGFA 3NVMA 4BRPA 3HP6A 4CJRA 1K6YA 2HNYA 1HKCA 4BC3A 4GV9A 3IDHA 3U9DA 1JLCA 1O1WA 3G6EN 2ZGYA 4YDUA 1RT6A 2FXUA 4OVLA 3DLRA 3CC4N 5IWAK 3PO5A 5AQNA 4BRFA 1WAFA 2B6AA 1J9AA 3OJSA 1RT1A 2WFBA 4ZHRA 1BCMA 1KFDA 5CYQA 3PO4A 1RT7A 1YITN 3QEIA 4KTQA 2GEMA 4ILGB 4B8AB 4A5BA 4B1VA 4I9QA 4OPAA 1HYSA 3LDSA 1RDAA 4NO7A 4QOZB 5AFUA 3HYFA 4K25A 4JKCA 4ELUA 2OTJN 3TPQA 3BF3A 1GLDG 5J2NA 5FPMA 5HROA 1VQ7N 2KTQA 3V1RA 3CXCM 3AO4A 1K8KA 3DLEA 3V1QA 3HZ6A 4B1ZA 1RDBA 3T1YK 3B6OA 1QSLA 5FDLA 3KK3A 1IG8A 4KH5A 1LOTB 2J4RA 5AQZA 4C8NA 1NGGA 3OYHA 1VSFA 3O3FA 4NLCA 3AGRA 3NH2A 1T44A 2D0OA 4IJAA 4FLTA 5HL7L 2O8DB 3L2VA 5KQ8A 3N4PA 1CXQA 3U4LA 1L3VA 5FPNA 5HRNA 2F9WA 1SKRA 2GTDA 3KWGA 5JVHL 4E7IA 3THYB 3C95A 1HRHA 4EFHA 3HT3A 3S3OA 1TK0A 3P1GA 3ZEUB 4E7KA 4GMJB 3CJBA 1NGIA 1S22A 1S1UA 4CHOA 4O0JA 3QETA 3DM2A 4BR5A 3CCRN 3V9SA 1LW0A 5AR0A 4EZ6A 1YVUA 3A5MC 4IJNA 2X6NA 4CJQA 3KK7A 4M42A 2P9NA 3T19A 3VGKA 5FRNA 2E2QA 1JLQA 3NBPA 1J53A 3ZT4A 3NMUA 1JLAA 4R79A 3LM9A 3TI0A 3WNFA 3H1QA 3AVHA 1NM1A 4F2RA 2VQFK 4FOEA 4Z94A 2VYPA 3J80O 1NMDA 1OKJA 4CBUA 4J8FA 4OJRA 3L0QA 4JI6K 1OH5A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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