2ASMA

Structure of rabbit actin in complex with reidispongiolide a
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
370
structure length
363
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 363
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asmA03
5EVZA 3A0IX 3O8MA 4K43A 4F9OA 3D7EO 2D1KA 3U4LA 1IJJA 4MLEA 3R6MA 3BEXA 2QWRA 2AA4A 4E1JA 4A2BA 3WXIA 3CQXA 3QICA 2PBDA 3VF6A 4JD2B 4QS7A 4FSVA 4H0OA 3ID8A 1K8KB 4B1UB 4BRAA 2YHWA 1KXPA 3R8EA 4A62A 4DQ8A 1RGIA 4BQZA 5JLFA 4H0XB 1HKBA 2YHYA 2P9LB 2QWNA 3BF3A 5EXWA 3VGMA 2ZGZA 2E2OA 4BRNA 2FSKA 1BA1A 3MN7A 4FWPA 4ISEA 1ESVA 1YUWA 1U2VB 5LJVA 2QWLA 4WQ4A 4IJNA 2VCPA 5AZIA 1E4GT 4CZMA 3I33A 5AQVA 3TU5A 4BG9A 3VPZA 2D4WA 3WXKA 4H5WA 1YVNA 4QS9A 3H3NO 3LDOA 4C23A 3LDNA 1KAZA 3LM9A 3B8AX 4KBOA 3GDQA 2H3GX 4JN4A 1NGGA 2CH6A 3GBTA 3F9MA 4H03B 2CGLA 3EO3A 4FOIA 3I8BA 5JLHA 1QHAA 1ATRA 3GG4A 4BRDA 2GELA 4FWNA 2P9UA 2FLOA 2E2QA 3A5LC 2ZF5O 3O5BA 3VESA 1TUYA 4A61A 5AQUA 5KPTA 4H5NA 3WEEA 3FZKA 4BR0A 4CZLA 3GOIA 2FF3B 1V4TA 3SMSA 3CERA 1GLEG 1XUPO 5TKYA 2VWBA 2V7YA 3ATVA 1MWKA 1NGIA 4FWLA 4CZHA 4Y0WA 2E1ZA 4PL8A 3FGUA 4CZGA 2E20A 3ENHA 5BPMA 1JCGA 4FWQA 4I6MA 4BRCA 4RTFD 4BRKA 5BR9A 2HOEA 5KPZA 5BREA 4NO7A 4BGBA 1H1VA 5AQGA 1LCUA 1QQNA 3ULEA 2F9TA 4O5FA 5E26A 2NLXA 2P9IA 2P9KB 1YAGA 1Z05A 5F0XA 3MDQA 3L4IA 4IZ9A 2IVOA 3CJ1A 3FZHA 4H0YB 4FWOA 2BTFA 4PL7A 5KQDA 4H5VA 1ATSA 2P9KA 2W40A 4YDUC 4ISFA 4M7YA 5EOYA 3G25A 4LC9B 3WUHA 3VEOA 4L3QA 5AQXA 1SQKA 1QQMA 2GWKA 2FSNA 3VGLA 5LJWA 1MA9B 4BG8A 3DXMA 3MCPA 2A40A 4PKGA 5BPLA 3ZX2A 2FF6A 1CZAN 3M1FA 1EQYA 4BRFA 3L6QA 2ZGYA 4FL9A 5AQPA 3VEXA 4BRPA 1GLCG 3DWLA 5LY3A 4M7XA 4CI6A 2QXLA 3AAPA 1XC3A 1Q18A 4XH4A 3D2FA 3JS6A 3H46O 2NRHA 3O1BA 3LM2A 3IDHA 1BG3A 3EKSA 5BPNA 4BC4A 4DB3A 4H0PA 2QWQA 1NWKA 3BUZB 4JHDA 5AZJA 2A42A 4WYBA 4GY2B 3VF2A 2YHXA 3H1VX 1E4FT 4M63C 3M6GA 5AZIB 1KAYA 3VETA 1IG8A 2D0PA 3D2EB 4CZFA 1BA0A 1GLLO 3SLCA 1GLAG 3MK6A 4O8KA 3P4IA 1RFQA 1BUPA 5BN8A 3D2EA 3RSEA 4AM7A 3QB0A 3WQTA 1C0GA 5AQSA 2QW9A 2IVPA 5FPNA 2Q0UA 4BR5A 5AQZA 3VERA 4BVOA 2KHOA 3M3ZA 2E1YA 3WXJA 1LOTB 1NGCA 1JCFA 4BQLA 3VEZA 1Y64A 2CH5A 4XH1A 4IXCA 4BR7A 3BF1A 2P9UB 4WQ5C 4BC5A 1ZBSA 3L0QA 3A8YA 3WQUA 2YJFA 2P9PA 2IIRA 1DEJA 5FPDA 3QBWA 3FFKB 3WEEB 3ZX0A 2EWSA 4BR9A 2ZWHA 1S3XA 3FLCO 4RWTA 1SZ2A 2GTDA 5AQIA 2Q36A 1TYQA 3HZ6A 3IMXA 3EZWA 4GNIA 2W41A 4EHTA 4I6MB 1HUXA 2E2NA 4IJAA 1NBWA 4EFHA 3FZMA 2A41A 1KAXA 1NGEA 3CJAA 3ULEB 1NM1A 5AFUH 2QM1A 4J8FA 4PKHA 2P9IB 1V4SA 3VGKA 3IUCA 3MN9A 4MO5A 4EHUA 2I7NA 2A6AA 4PKIA 1GLBG 4DCHA 3H45C 2YI1A 1WOQA 5CE3A 1DGKN 3LDQA 2VYPA 3CJ9A 3GE1A 4BRLA 2QWPA 3MN5A 3O08A 3CQYA 3QFUA 2CGKA 1NGDA 1NGBA 3KHYA 4WQ4C 3DXMB 3ZX3A 3BP8A 3J8AA 2GEMA 4FO0A 5ELZA 1HKGA 4JNEA 3UE5A 3LL3A 3VENA 3C0BA 3AARA 3DJCA 3WXLA 3QFPA 3CIPA 3EKUA 5JMVA 3ZETA 3KZBA 5I9EB 5FPEA 1BO5O 3ZEUA 1NGJA 1MDUB 3JXUA 1RDWX 5AQQA 2ASOA 4BRIA 5BRHA 3HSCA 1OKJA 1D4XA 2GWJA 3CJBA 3D2FB 4ISGA 4K42A 1HJOA 1X3MA 4HTLA 4WQ5A 3R9PA 1NGHA 4CD3A 5B8HA 5BRFA 4IO8A 4BROA 1HPMA 3OHRA 3H6EA 5AQHA 3S41A 3QBXA 1C0FA 2V51B 3ENOA 3CETA 4H0VB 4JHDB 3O6WA 2E88A 5EY4A 3AY9A 5AZJB 4EAHD 5ADXH 1NGAA 3VEYA 1ZC6A 2HMPA 3CJ7A 4CD1A 4IWVA 1X3NA 4MLHA 1YXQA 4Z94A 3UB5A 4AM6A 2F9WA 1NGFA 1P8ZA 5F2RA 5AQMA 3DXKA 5AQYA 3U8XA 4B9QA 2FXUA 2PAVA 3AAQA 4CBWA 4CZJA 2Q97A 4BR2A 1X9JA 2UYTA 1BOTO 1U6ZA 2P9NB 4QS8A 4CZIA 4K41A 5KQ8A 3RSEB 1HLUA 5AQLA 3SMPA 1QZ5A 2OANA 3A5NC 4BGAA 5KPRA 3TPQA 4B1VA 4FPBA 2P9NA 3MN6A 4CZKA 2QWMA 2A5XA 4JD2A 3HM8A 4FWRA 2P9SB 5AQOA 4BRQA 1K8KA 3FZFA 4BRMA 2WUSA 2V7ZA 1R59O 3O1WA 3W0LA 1NMDA 2P9PB 3DAWA 2D0OA 3IFRA 3KVGA 3VEWA 1ZXOA 2P9SA 1DKGD 3WT0A 1GLFO 2P9LA 5F1XA 4YDUA 1QZ6A 5AFUA 3CHWA 1T6CA 4RCHA 4BR4A 4H5RA 5AQKA 2I7PA 3W3DA 4B1YB 1U2VA 4FPAA 3FR0A 4BC3A 5E84A 1G99A 5AQWA 2HF3A 2YJEA 3VEVA 4BC2A 1TYQB 3HBTA 3H1QA 2NZTA 4BVPA 1BDGA 1BWFO 4MO4A 2DPNA 1WUAA 1HX1A 4K25A 3VF4A 3H3OB 1J6ZA 2ITMA 4BRHA 5FPMA 3EL2A 3CJCA 3O80A 3U9DA 1T6DA 1HKCA 1S22A 5AQJA 4B1ZA 2ASPA 4FWSA 3HTVA 1MWMA 1GLJO 2E2PA 3SK3A 3QDKA 4HWIA 3FZLA 1GLDG 2A3ZA 3O4WA 3LDPA 1T44A 3QMLA 4B1WB 2BUPA 5EX5A 5BRDA 3C7NB 4CBUA 3LDLA 4A2AA 2CGJA 3ATUA 2J4RA 4B1XB 5JICA 4H5TA 5AR0A 4JAXA 4CZEA 2YCHA 4CBXA 1XQSC 2AP1A 4EIAA 3C7NA 5ADXA 5AQTA 5AQNA 4BREA 4XH5A 3GL1A 1ATNA 3A5MC 3ZETB 1BU6O 1SAZA 3ZEUB 2HF4A 2Q1NA 3VOVA 4FOEA 3A5OC 1NLVA 3CI5A 1TUUA 5AQRA 3FE1A 4FWKA 4CJ7A 2ASMA 4XEIA 4DHYA 1JCEA 4FWMA 2E8AA 3UKUB 2IVNA 2FSJA 2Q31A 3UKRB 1QQOA 2QWOA 3U9ZA 2V52B 3EN9A 1Z6RA 3UKUA 4NB4A 3SJHA 3UKRA 2GUPA 4H0TB 2Q2RA 5BN9A 3DXKB 3HI0A 3MMVA 4BRGA 2Q0RA 5AQFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I2PA 3KK1A 1RBUA 1ZYQA 1HPZA 3O8MA 4K43A 4F9OA 1NK0A 1IJJA 4MLEA 1KQSM 2B4JA 5C24A 3CC2N 4YHHK 3OYDA 3QLHA 4A2BA 4C8KA 3SQ4A 3P31A 3VF6A 4XIUA 4JD2B 4DFKA 1QSSA 4B9TA 4KHSA 3ID8A 1K8KB 4B1UB 3CCUN 3AO5A 4AQYK 1X9WA 1VQNN 1TK5A 2B5JA 5A2QO 1RGIA 4BQZA 4DTMA 4LFBK 1HKBA 2YHYA 2P9LB 3NGIA 5CYMA 1NK4A 1G15A 2E6MA 1KVAA 3VA0A 2ZGZA 2FSKA 3ZSYA 4CIFA 1TV6A 3K9JA 3O4QA 2G8WA 2BE2A 4FK4A 1W97L 5LJVA 2QWLA 4WQ4A 4HUGA 4JKCA 4OGCA 1E4GT 3TU5A 3VPZA 1KD1O 2JLEA 1YVNA 4IFVA 2Q3SA 4W5QA 1WSFA 3LWMA 4FW1A 4B3MK 4FVMA 2G8KA 4KBOA 2WTUA 1YIJN 2CH6A 3GBTA 1S6QA 4IEIA 4FJJA 3I56N 4LF5K 4DR7K 5HOOA 2A1SA 3OA9A 3T3FA 3A5LC 5LMUK 4H5NA 2F4VK 4BR0A 3MEGA 3NVKA 3FFIA 1KTQA 3HPGA 1V4TA 3QERA 2PY5A 1IKXA 4JK7A 4WF9L 1GLEG 4AHSA 2O8FA 3ATVA 1NGIA 2E1ZA 1JLAA 2ZM6K 2Z1IA 3ENHA 3PX6A 4JKEA 4KH5A 5BR9A 1XNQK 1GOCA 2HNYA 3T69A 3L3UA 4C8OA 4MQ3A 4FM0A 2ETJA 2P9IA 4FJ9A 5F0XA 2HBMA 3RR7A 3FZHA 5KQDA 4AHUA 2DY4A 1O13A 2W00A 3M8PA 3AVHA 4CGJA 1JXBA 3LAKA 2FSNA 1ZBFA 4O8UA 4DV1K 1FXXA 2FF6A 3V1OA 4DV5K 4KHWA 3EZ5A 3RRGA 4JK8A 1WLJA 2LSNA 3KLIA 4WE1A 3VEXA 4N56A 1NKCA 3U6FA 1XWLA 4M7XA 4CI6A 3SQ1A 2QXLA 2ZD1A 3AAPA 3CF5L 3D2FA 4OKKA 3O1BA 4IFEA 3LM2A 2AJQA 3L4QA 2XY5A 2F96A 3EKSA 4B8AB 3NH1A 5CHIA 3DYAA 4JHDA 4ICLA 4BE1A 3SV4A 5AZJA 4DR6K 3KLGA 1RDDA 1IBMK 1HJRA 4EP5A 3VF2A 3H1VX 3P39A 3NF8A 4B3SK 3M6GA 4FLZA 5AZIB 2ATQA 4DU4A 3DLLL 1XHZA 3QINA 3D2EB 1TL1A 4JS5A 4CZFA 1UA0A 3SLCA 3K58A 3K59A 3V6DA 1YJ9N 2WC9A 1U4BA 4FJ8A 4OGEA 3AVKA 1RFQA 3BGRA 3PIPL 4Z4FA 2D5RA 3D2EA 5EU7A 4AM7A 3WQTA 3OYKA 2QW9A 4CJKA 4E0DA 1RDBA 1FK9A 3EYZA 3NMUA 5AQZA 1ASVA 2IDOA 2UUAK 5M1KA 3WXJA 4FM2A 3EEQA 3AA4A 5JS1A 2HNZA 1Y64A 4IG0A 4XH1A 5C2DA 1KFDA 4BC5A 3V9XA 3KLEA 2G8FA 3A8YA 3MCAB 4U67L 4Y1DA 3FFKB 2ITGA 3PY8A 3RMCA 2DFHA 1RT2A 2PYJA 4LD0A 1NOZA 5J2PA 2RHKA 4DLGA 3MAQA 3G71N 3K5MA 4IOXA 1BIUA 1X1PA 2KTQA 4FLYA 3FLCO 4RWTA 2G8IA 5AQIA 1WBBA 2ZJPL 2Q36A 4CEQA 4KHYA 2VG6A 4GNIA 2DTUA 2E2NA 2YNFA 3VA3A 5TKWA 1C1AA 4LFCK 3FZMA 5C25A 2F7TA 2A41A 1KAXA 3J7ZO 3PO4A 1VSKA 3K5NA 1SUQA 1WSIA 3VGKA 5HL7L 3MN9A 4EHUA 1Q9YA 3ULDA 1NMNA 1NKEA 4YOWA 4PKIA 2YI1A 3AVAA 2VYPA 3OW2M 4KAZA 3J7AP 3GE1A 4WFAL 4BRLA 3ZT2A 3ITHA 3NF6A 3KKRA 3VQEA 1NGDA 2XHBA 4WQ4C 4CFCA 4CEFA 3ZX3A 3J8AA 2GEMA 4FO0A 5ELZA 4FW2A 1HKGA 4JNEA 5C10A 3LL3A 3VENA 3OTOK 4BE2A 1L3SA 4FLTA 4FVUA 3V1RA 3MX2A 4YNQA 2C1GA 3ZEUA 4Y1CA 1NGJA 1MDUB 1RDWX 1OH8A 5BRHA 1OKJA 3CJBA 1N6QA 2EHGA 4BROA 1HPMA 1GOBA 1X9MA 3H6EA 2R7YA 4CJ3A 3TSQA 2JGUA 4HVJA 3SJJA 1I94K 2IAJA 4H0VB 4EAHD 2DFEA 3CJ7A 4O4GA 1X3NA 4MLHA 4DQRA 5AQMA 2FC0A 3DXKA 5C42A 4B9QA 2FXUA 1S9EA 3MWTA 4Z4EA 2UYTA 4DR3K 1BOTO 3K5LA 2P9NB 4JS4A 1BGXT 2BGGA 3OJUA 2W42A 2OANA 5KPRA 2P9NA 4CZKA 3TWHA 2QWMA 3MEDA 1Q86O 3NF9A 4FWRA 2PZSA 2NRWA 1CZ9A 2IGIA 3QEVA 1R59O 3O1WA 1HR0K 2P9PB 2D0OA 1QQCA 1ZXOA 4CJSA 3CMAN 3HSTB 4KO0A 4IKFA 1QZ6A 5AFUA 1U47A 2YHAA 3CHWA 2G8UA 5SWMA 4NCGA 4RCHA 2UXCK 2I7PA 3HVRA 4FPAA 2C1IA 3D45A 4BC3A 1NJWA 3SAHA 3HBTA 4BY9C 2HW3A 2NZTA 3E01A 1BDGA 3QEIA 1BWFO 1VSIA 1TK0A 1EX4A 1WUAA 3O9TA 2ITMA 4BRHA 2P51A 5DM7L 4ILJA 3CJCA 3U9DA 5GIPA 3BZCA 4OPAA 5AQJA 4DR5K 3MXJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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