2ASMA

Structure of rabbit actin in complex with reidispongiolide a
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
370
structure length
363
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
total genus 129
structure length 363
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asmA03
4IJAA 4GNIA 4BRFA 3CJ9A 1YAGA 2HOEA 1NGDA 5AZJB 3DXMB 3CI5A 1XC3A 3VEXA 3ZX2A 4BQZA 5AQYA 2VYPA 3H46O 2QWPA 5ADXA 4FWPA 2Q0RA 2E20A 1Y64A 4H5RA 4C23A 3F9MA 4H0YB 4IJNA 4BRKA 3H1QA 3KHYA 4RWTA 4M7XA 4CI6A 1S3XA 5FPMA 1BU6O 3SJHA 2W40A 5AZIA 5AFUA 3DAWA 3ATUA 5JLFA 4FWMA 3D2FB 4FO0A 4FWSA 5AQSA 3FLCO 3VEOA 2CGLA 2A5XA 1V4SA 1HLUA 2P9SA 3QBWA 4JN4A 3VEYA 3VEVA 4JHDA 3VF2A 5AZIB 4Z94A 3WXLA 2V7ZA 4BROA 3ZEUA 4CZKA 1WOQA 3D7EO 2FF3B 3H6EA 1C0GA 3ZX0A 4BRHA 2D0PA 4H5VA 4IO8A 3FZMA 3GG4A 3KVGA 3M6GA 4FOIA 2FSNA 1JCEA 2P9SB 3AAQA 3I33A 4DB3A 4O5FA 2P9PA 4JHDB 3VERA 3O1BA 4FWKA 3IUCA 4I6MB 3ZEUB 1HX1A 3ENHA 2AA4A 2E1YA 1R59O 3CQXA 4CZGA 1DKGD 2F9TA 2PBDA 4JAXA 1MDUB 1MWMA 2E2NA 3O1WA 5BREA 3MN7A 2QWQA 4CZJA 1SZ2A 1T44A 4CD1A 2Q2RA 3GL1A 3WXKA 3HSCA 3IFRA 4BC3A 4B1UB 3OHRA 5I9EB 1Z05A 1NM1A 4H0TB 4BRDA 1NGFA 5AR0A 2E8AA 3A8YA 5BR9A 4GY2B 4F9OA 1DGKN 1EQYA 3EKUA 1TYQA 5TKYA 1KAZA 1D4XA 1ZBSA 1QZ5A 3O08A 4L3QA 4IZ9A 5LY3A 2P9KA 2ZGZA 3C7NB 3ENOA 1X9JA 3QDKA 4FWLA 3U8XA 1J6ZA 2Q1NA 1LCUA 2A41A 1ZXOA 3WT0A 4O8KA 3UE5A 2E88A 4HWIA 2H3GX 3HI0A 3CIPA 1GLCG 4DQ8A 4WYBA 5E26A 1BA0A 2D0OA 3P4IA 1KXPA 3SLCA 3VENA 3CJBA 4JD2A 3LDOA 4BRCA 1BO5O 2F9WA 3A5OC 3HM8A 4BVOA 4QS8A 3LM9A 1IJJA 3M1FA 5F1XA 4FOEA 1WUAA 4XH4A 2FF6A 3QB0A 2W41A 1BA1A 3B8AX 5BRFA 5ADXH 5AZJA 3GOIA 3SMPA 1T6DA 2ASMA 4BG9A 1V4TA 4DHYA 3LDPA 4B1WB 4XEIA 3LM2A 4RCHA 3BF3A 4CBUA 4ISEA 5B8HA 4M7YA 2ZGYA 3BP8A 3L0QA 4FWRA 4MO4A 4WQ5A 4ISFA 1QQMA 3M3ZA 1BOTO 2Q0UA 3A5LC 3MCPA 3EZWA 1GLBG 1KAXA 1ZC6A 5AQZA 2A6AA 1RDWX 3FGUA 1E4GT 1QQNA 3D2FA 4B1ZA 3VGLA 1GLAG 1H1VA 3S41A 4CZEA 2HF3A 5AQOA 4FPAA 2IVOA 4E1JA 4EAHD 1RFQA 4H0XB 2ASPA 4NO7A 4CJ7A 5FPEA 3U4LA 1XUPO 3FR0A 2QWRA 3LDLA 2VCPA 3FZLA 1HPMA 4CZLA 5AQHA 2V51B 1HKGA 3QICA 4BVPA 2QM1A 2KHOA 5KQ8A 4BC4A 4A61A 3A5NC 3QBXA 3WEEB 2GUPA 2P9NB 5JLHA 5BRHA 3G25A 3LDQA 3VGMA 4H0PA 4I6MA 5AQKA 3D2EB 5LJVA 1K8KB 5E84A 2YCHA 4MLHA 2E2QA 4BR9A 1NLVA 3ID8A 1MWKA 3DJCA 3MN6A 4BRNA 4BREA 3H3OB 3WQTA 2ASOA 3GBTA 4FWOA 3QFPA 1QZ6A 3FZKA 3EO3A 4IWVA 1X3NA 5FPDA 5F0XA 1ATSA 2YHXA 1BUPA 1U6ZA 4LC9B 5KQDA 4K43A 1TUYA 3L4IA 3QMLA 3C7NA 4J8FA 3R8EA 3TPQA 1HKCA 1P8ZA 2FXUA 3H45C 1GLEG 1YUWA 1SQKA 2Q97A 4H5WA 2D4WA 4WQ4C 3A5MC 3IMXA 1U2VA 4BRAA 5FPNA 4EFHA 3FE1A 5JICA 1NGEA 4CZHA 2J4RA 3MMVA 3VESA 3DXKA 1TUUA 2ITMA 1YXQA 3VEWA 2E2OA 4H03B 2FSKA 3CQYA 1YVNA 5JMVA 3BUZB 4RTFD 3FFKB 2IVPA 5KPTA 4FSVA 3ZX3A 3QFUA 4BGAA 3MN5A 1C0FA 1LOTB 4BR2A 4PKIA 2NLXA 1U2VB 3BEXA 4CBXA 1G99A 3HBTA 2NZTA 3J8AA 5AQRA 3DXKB 4HTLA 3AY9A 4B1VA 4FPBA 1QQOA 2P9LA 4H5NA 3TU5A 3JXUA 2V52B 4BR5A 3JS6A 2P9IB 1BWFO 3U9DA 3ZETB 3C0BA 5AQQA 1HKBA 5BPLA 4ISGA 3VGKA 3AARA 2YHWA 3MDQA 5EVZA 3VETA 2E2PA 3CJAA 5EOYA 3FZFA 4BRPA 1GLDG 2V7YA 3WXJA 2Q31A 4B1XB 4MLEA 3O8MA 2IVNA 1NGGA 2P9LB 2QW9A 4B9QA 1NGIA 2CGJA 4DCHA 2WUSA 5KPZA 5AFUH 1NWKA 3EN9A 3U9ZA 3IDHA 1NGBA 2BTFA 1DEJA 1X3MA 2QXLA 5AQXA 4CD3A 4H5TA 4BGBA 3AAPA 1QHAA 3LL3A 2FSJA 5BN8A 3H3NO 5BN9A 2VWBA 4XH5A 3H1VX 4QS9A 2CH6A 3WEEA 1HUXA 2P9NA 2ZF5O 2ZWHA 5LJWA 4FL9A 5AQFA 5BPMA 4FWQA 2NRHA 1KAYA 3D2EA 4BRQA 1K8KA 5AQWA 4CBWA 4AM6A 1E4FT 2GEMA 4BC5A 2BUPA 3HZ6A 2OANA 2PAVA 4IXCA 1NGHA 1GLLO 4K42A 4PKHA 2E1ZA 1BG3A 5AQUA 3SK3A 4BRMA 5AQGA 2GTDA 3A0IX 1ATNA 2CGKA 3VOVA 3O5BA 5ELZA 3UKRA 2YHYA 3L6QA 4XH1A 3SMSA 5AQLA 5BPNA 1RGIA 3I8BA 3R9PA 3ULEA 2I7PA 4FWNA 2QWLA 4H0OA 4BRIA 3R6MA 3DWLA 3BF1A 3UKRB 3VEZA 2D1KA 3ATVA 2A42A 5EX5A 1CZAN 4PKGA 4CZMA 5AQMA 2AP1A 4EIAA 1Q18A 4BC2A 4NB4A 5AQVA 1JCFA 4EHTA 3ULEB 4CZFA 2YJEA 4K25A 3UKUA 4BR7A 4A62A 1NGAA 4H0VB 2P9UA 5EXWA 1NBWA 4A2AA 3UB5A 1BDGA 1NGCA 2QWOA 3CERA 3LDNA 2A3ZA 1OKJA 2CH5A 3UKUB 4PL7A 2P9PB 3HTVA 3MK6A 2QWMA 2P9IA 1T6CA 2Q36A 1Z6RA 3ZETA 5F2RA 3GE1A 4BRGA 3FZHA 3MN9A 2P9UB 3O6WA 3CJ1A 4MO5A 5AQPA 2I7NA 3VF6A 3CJ7A 5CE3A 2GWKA 1XQSC 2FLOA 2UYTA 1NMDA 4QS7A 4CZIA 3CHWA 1ATRA 4YDUC 1ESVA 5BRDA 5KPRA 2QWNA 3RSEA 3WXIA 4WQ5C 5AQNA 1GLJO 4B1YB 3WUHA 4Y0WA 2HF4A 2A40A 3EL2A 4WQ4A 5AQIA 1TYQB 4BR0A 4JNEA 1IG8A 3CJCA 3VPZA 2IIRA 4BR4A 2P9KB 5AQJA 3EKSA 4PL8A 5AQTA 3RSEB 1NGJA 3W0LA 4M63C 1JCGA 4KBOA 2YI1A 3W3DA 5EY4A 3GDQA 3KZBA 4EHUA 3O4WA 4K41A 1MA9B 1SAZA 3CETA 4A2BA 2EWSA 3DXMA 3O80A 4JD2B 2GWJA 4AM7A 4BRLA 1HJOA 1GLFO 4BQLA 3VF4A 2GELA 3WQUA 4YDUA 2YJFA 2DPNA 1S22A 4BG8A 2HMPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1I3AA 4Z4CA 1YAGA 2FBTA 1Q9XA 3DXMB 2E4LA 3ZX2A 3RR8A 4BQZA 3EYZA 3LAKA 3SI6A 2VYPA 1HYVA 3H46O 1C0UA 4FWPA 4DLEA 3HJFA 2Q0RA 2E20A 4DV6K 2XRIA 4CECA 2HVHA 3AVAA 3KHYA 4RWTA 3NAEA 4M3WA 4OVLA 5HROA 2W40A 3HOSA 1C0TA 4E3SA 4C8KA 3KK1A 4DTSA 3KD1E 4ELTA 2C1IA 3FLCO 3OYHA 3VEOA 3VMFB 1HLUA 4LH4A 3AO3A 3PY8A 1RBSA 3OYDA 1TK0A 3QLHA 4CHNA 4CZKA 4KO0A 4KTQA 3NMUA 1HNWK 1C0GA 4AF1A 4BRHA 2D0PA 1ASWA 1T3VA 2XHBA 3M6GA 3HP6A 2P9SB 2HHSA 3VERA 3KIOA 3IUCA 2G8UA 3O9TA 1HX1A 4LFBK 2E1YA 3JYTA 2F9TA 2PBDA 4FJHA 5BREA 3O1WA 3MXJA 1Q86O 4CJFA 1SZ2A 4E89A 3AV9A 4F2SA 4IOCL 3HSCA 3VQAA 1N32K 3IFRA 4YOWA 4B1UB 3P38A 3T69A 4KH4A 4Z4HA 1DGKN 3S9HA 2QKBA 3EKUA 1S1VA 1KAZA 3DOKA 1ZBSA 1QZ5A 4B3TK 1HMVA 3O08A 3P39A 5DM7L 3AVLA 4IZ9A 3MECA 5LY3A 4I2QA 3C7NB 4I7FA 2X6NA 3ENOA 3ISNC 3WNGA 1J6ZA 1FKPA 1QVFM 1J53A 2HHQA 2QXFA 1NK6A 3UE5A 3P5JA 4OPKA 3V9UA 2PY5A 2O8FA 2O4IA 3E66A 1GLCG 3O4NA 5E26A 2BGGA 4GVMA 2D0OA 5HP1A 3PO5A 3OYJA 4XIUA 3VENA 4UQGA 4JD2A 3LDOA 4CHPA 4MFBA 4DU4A 2UU9K 4CJ3A 4RW6A 1CZBA 4PY5A 2FF6A 4CEZA 5BRFA 4JYAK 5ADXH 2OPRA 2XY6A 4CESA 1FXXA 4DHYA 5M1QA 4CJUA 4B1WB 5FRMA 4XEIA 4RCHA 4FM1A 4ISEA 5B8HA 4M7YA 1C1CA 1NJZA 4WQ5A 1D5AA 4ISFA 1QQMA 3SCXA 2X78A 4JI3K 2B4JA 4DTPA 4B1ZA 1H1VA 2ETJA 3CM6A 4CK1A 3E9OA 5AQOA 3ZT2A 4EAHD 1RFQA 1REVA 5HL7L 4K0KK 2HBLA 4H4OA 3U4LA 1BCOA 4CEBA 3NGIA 4R79A 3KD5E 3LWLA 4JI1K 4C1NK 4CJSA 3QICA 5KQ8A 4DKWA 3PO4A 3A5NC 3VQPA 3WEEB 4CEQA 3THXB 3VA3A 1VQMN 4CEAA 5JLHA 3LDQA 1JLAA 3SUPA 4CGFA 4I6MA 3D2EB 5LJVA 1RDBA 3T3FA 3K5NA 2RE2A 4MLHA 2E2QA 3NBPA 1SKWA 3TAQA 4BR9A 2B6AA 1MWKA 3MXMA 3RMAA 3OS1A 4CGIA 3FZKA 2YKNA 4IWVA 4BE1A 5GINA 3QESA 5FROA 5KQDA 1JLBA 4ICLA 4K43A 3SQ1A 1TUYA 3M8RA 4LF8K 4CF8A 1XMQK 3U3YA 1P8ZA 2JLEA 2DY4A 3AGKA 1YUWA 1SQKA 3TAMA 3A5MC 4BRAA 5M1OA 1YJWN 3K5MA 3MMVA 3HRGA 1VAZA 4KV8A 4H03B 3CQYA 1XWLA 1YVNA 5JMVA 4BGAA 1I39A 1SKSA 4YOUA 3EE8A 4EP4A 3IKMA 3CCQN 1U2VB 3E9PA 3QINA 1U47A 4IKFA 3VA0A 3J8AA 3DXKB 1DLOA 3AVKA 4N5SA 4HUEA 4FCYA 2OZMA 4FM2A 4PWDA 3HK2A 1YT3A 3ZETB 4AHRA 2HSTA 4HCBA 3MDQA 3VETA 4DFPA 5EOYA 1ZBUA 3FZFA 1LV5A 4B3SK 4F3TA 1RDCA 2IVNA 1NGGA 4LFCK 2UUBK 4DCHA 1RT6A 2WUSA 4ILGB 1YJ9N 1M1KO 4B9TA 2HHUA 2IC3A 2Y1JA 1NMNA 3KLFA 4CD3A 4BGBA 3SV4A 3KK3A 3DLHA 2O8CA 3QERA 4CHZA 3LL3A 4FJ9A 5BN8A 2VWBA 3SBGA 4E7IA 4H8KA 4KHYA 3LPUA 4JKHA 4FL9A 3BZKA 1T7PA 4M45A 5AQWA 1RDUA 4JI4K 3C65A 4MQ3A 3SUNA 1TAUA 5J2QA 4GV9A 2PAVA 3LP1A 1GLLO 4K42A 4PKHA 3VQDA 1L3UA 3O3GA 3AVNA 2E1ZA 3LPTA 3RMDA 1BG3A 1YIJN 1T8EA 1VQ4N 4KRFA 4DR7K 4LH5A 4CJLA 3RWUA 3OYKA 4CIEA 4FLZA 4DTUA 2CGKA 4PQUA 3VOVA 1JLGA 4Z4FA 4FJ7A 4LSLA 4FW1A 3LZIA 1RGIA 3I8BA 3HSTB 3MWPA 4B08A 3ULEA 2I7PA 2XY7A 4B3RK 3DLGA 4H0OA 3HM9A 4EZ9A 3BDPA 3ALYA 4BE0A 4C8MA 1RTDA 2NRVA 3DWLA 3BF1A 4TSXA 5EX5A 2ZJPL 1NK5A 2HBKA 4PKGA 4CZMA 3NE6A 1Q18A 4BC2A 4DR1K 5AQVA 3LP2A 1U45A 3IRXA 4ID1A 1DT9A 3UKUA 1JXBA 1X9MA 4CGHA 5HRSA 4JKBA 3V81A 2HHVA 2WC9A 4FJNA 3P31A 1KC8O 3DRSA 4DWIA 3CPEA 3AVBA 3B6PA 1KQSM 1G15A 1VSIA 1NGCA 2A3ZA 2KTQA 1EXQA 1IBKK 3MK6A 2OYQA 1IKXA 5F2RA 3GE1A 3MN9A 1R0AA 3CJ1A 5M1NA 3SPYA 1HQEA 4J2DA 4LF6K 1Q82O 1XQSC 4I9LA 4DTOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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