2ASMA

Structure of rabbit actin in complex with reidispongiolide a
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
370
structure length
363
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 363
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asmA03
3QMLA 4CJ7A 3IDHA 3GL1A 4BG8A 4K42A 4H0TB 1H1VA 2P9IB 4LC9B 2V51B 4FOEA 4BRIA 1MWKA 3J8AA 5BREA 2FSKA 5BRFA 4FWLA 4FPBA 2F9WA 2QWOA 1NGAA 4KBOA 4NB4A 3MK6A 4WQ4A 4XH4A 1V4TA 3QBXA 3JXUA 5BPLA 5AQWA 3BUZB 2P9LB 1NMDA 2P9KA 2ASPA 2Q1NA 1BWFO 3FZKA 2ASOA 3TPQA 2Q0UA 4CZKA 4Z94A 5AZJA 3MCPA 1HKCA 3W3DA 3L4IA 2Q2RA 5AQTA 4FWMA 3WQUA 2IVNA 5ADXA 1GLLO 4BC4A 3M6GA 5BR9A 1GLBG 1E4FT 3D2FA 3C7NB 2ZF5O 3VEWA 3SJHA 4BRHA 1KAYA 3EZWA 4CI6A 2W40A 1D4XA 3O8MA 5AQPA 4B1XB 4BC3A 2GEMA 3ZX3A 3BEXA 2CGJA 3EN9A 1GLFO 4RWTA 1R59O 4MO4A 4BGAA 4BR7A 5AQKA 1LOTB 5CE3A 5KPTA 2CH6A 4CBUA 5I9EB 3FZFA 2AA4A 5BPMA 1ATRA 5AFUA 5KPRA 2IIRA 2A3ZA 1YUWA 1T6DA 4BC2A 5AQVA 4ISEA 4BRLA 4K25A 5AQJA 4B1WB 2HOEA 3H1VX 5AQRA 5EOYA 5KQ8A 3DXMB 3VENA 3A5NC 3RSEA 1QZ5A 1NGIA 1SAZA 5LJWA 3HI0A 5BN8A 4IO8A 4JD2B 3M1FA 1DEJA 3ENOA 3LM9A 3WEEA 3O80A 4L3QA 1TUYA 2GWKA 1NGEA 5AQSA 3WXIA 2P9NA 4XEIA 4DCHA 1QQNA 1SZ2A 3B8AX 3SK3A 2P9SA 2P9UA 1XC3A 4CZFA 5AZIB 2CGLA 2E20A 1K8KB 2Q97A 2IVOA 2YHXA 1Z6RA 3F9MA 4FWRA 3AARA 1KAZA 4NO7A 1JCFA 3SMPA 5EY4A 4BC5A 3CJ9A 2A41A 2QM1A 2QW9A 1BU6O 3R6MA 3VPZA 3ATUA 4IXCA 2ITMA 4PKGA 3JS6A 4ISFA 3DWLA 5AQOA 3DXKA 5AQQA 3LDNA 3C0BA 2YJFA 3ZEUA 4JHDB 3VERA 3SMSA 5JICA 3BF3A 3MN6A 4BRFA 1HPMA 4CZEA 4FWNA 3L0QA 2Q0RA 5ELZA 1WUAA 2A6AA 4BRNA 3FE1A 4HTLA 4CBXA 3TU5A 2J4RA 3VGKA 3VETA 3H45C 2QWPA 3ID8A 1BO5O 1JCEA 1HLUA 4WYBA 4H0XB 1Q18A 2QWLA 2QWMA 3ZETA 4BREA 4H5TA 3UKUA 1GLCG 3ULEB 4AM6A 4A2AA 3LL3A 3FZLA 1TYQB 1KXPA 1XQSC 2I7PA 2OANA 2NZTA 2DPNA 3ENHA 1YXQA 4E1JA 3HM8A 2PBDA 4IJNA 2HF4A 4YDUA 3VF6A 1DGKN 2YJEA 4CZMA 2E1ZA 5EX5A 3LM2A 5LJVA 3QICA 5JMVA 3VEOA 1HUXA 4XH5A 3LDOA 1T6CA 3G25A 3BF1A 5FPNA 2BUPA 3IUCA 3MN9A 3U9DA 1NGFA 1NGHA 4QS7A 4GNIA 2E2QA 4BRAA 3ATVA 4JNEA 1HKGA 3IFRA 3QFUA 2E2NA 2GTDA 2H3GX 5TKYA 3M3ZA 1IJJA 3CJCA 3GDQA 2VCPA 1YVNA 3DXMA 1NWKA 1U2VA 4BRKA 1XUPO 4O5FA 2P9PB 4EAHD 4Y0WA 2VYPA 3CIPA 3QFPA 3O4WA 2P9KB 1JCGA 3U9ZA 1GLDG 2A42A 2GWJA 4BR9A 3IMXA 1NBWA 1HJOA 2E1YA 5AZJB 1ZBSA 5AQGA 3H6EA 4FWKA 4FL9A 3WXJA 2GUPA 4DHYA 5AZIA 1K8KA 4CD3A 5F1XA 4PL8A 4FWOA 1QQMA 5KQDA 2FSNA 3GOIA 2BTFA 5KPZA 2E8AA 1U6ZA 4M63C 2D1KA 3R9PA 3QBWA 4H0VB 2V7YA 2D4WA 4H5NA 4RTFD 1ESVA 1QQOA 4IZ9A 4BRCA 3DJCA 1X3MA 2CGKA 3CQXA 3VEXA 2Q36A 1HX1A 5LY3A 5FPMA 4BRGA 1G99A 2E88A 3WQTA 4EFHA 2YCHA 4CZJA 4CZHA 1NGBA 3CQYA 4BG9A 3VEYA 3O5BA 2V52B 2UYTA 5BRHA 2E2PA 4H5VA 4F9OA 1NGGA 3FR0A 1Y64A 5BPNA 3AAPA 4FPAA 3O1WA 3RSEB 3UKRA 1RFQA 3VGMA 4AM7A 2A5XA 4MO5A 2GELA 5AQNA 3WEEB 1KAXA 2P9IA 2QWNA 5AR0A 2FF3B 5BN9A 1T44A 3LDQA 4BRPA 1BDGA 1MWMA 2D0OA 1TUUA 2P9UB 2ZGYA 3GBTA 1C0FA 3WUHA 3O08A 3CETA 4XH1A 4I6MB 2P9LA 3A8YA 2CH5A 1TYQA 2FLOA 4H03B 1QZ6A 3D2EB 2I7NA 4H0OA 4CZGA 1C0GA 4A62A 4MLHA 3VEVA 1ZC6A 4JAXA 5FPEA 2NLXA 4JN4A 5E26A 5FPDA 2W41A 5AQXA 4MLEA 3EO3A 4QS9A 2QXLA 3GG4A 2ZGZA 4BRQA 2Q31A 3C7NA 2F9TA 2YHWA 3FZHA 5EVZA 3VEZA 2VWBA 1ATNA 3L6QA 3DXKB 4J8FA 4CZLA 4ISGA 3LDLA 1WOQA 3KVGA 4EHUA 4FSVA 3U4LA 4PKHA 4BVOA 3H3NO 1RDWX 1LCUA 3CJ1A 3KZBA 3VF4A 3ZEUB 5AQMA 2V7ZA 4B1YB 1X9JA 3I33A 5JLHA 1EQYA 5AQUA 1P8ZA 2P9PA 5F2RA 3BP8A 3WT0A 1SQKA 3GE1A 4BRMA 3A5OC 4H5RA 1E4GT 2A40A 1DKGD 5AQYA 4WQ5C 4BROA 3A0IX 3SLCA 1GLJO 1S22A 3UB5A 3ZX2A 3ZETB 1MA9B 1RGIA 1Z05A 3FGUA 3H3OB 3I8BA 4EIAA 3CJ7A 3VESA 5E84A 3UKUB 3S41A 3CJBA 4CBWA 2QWRA 4HWIA 4JD2A 2FSJA 4QS8A 2FXUA 1NM1A 2ASMA 3MDQA 1HKBA 1BOTO 4FWQA 1S3XA 3H46O 3O6WA 4RCHA 1ATSA 4CD1A 4PKIA 2NRHA 3EKUA 4A2BA 4GY2B 3A5MC 3FLCO 1J6ZA 3HTVA 4BRDA 2QWQA 3D7EO 1OKJA 4BR2A 3CI5A 4PL7A 3D2FB 4IJAA 4C23A 4IWVA 2HF3A 2AP1A 3CJAA 3FZMA 4B1UB 4FOIA 3CHWA 3WXKA 2E2OA 3UE5A 4BR5A 1V4SA 4M7XA 4BVPA 4DB3A 3LDPA 4BR4A 3O1BA 1ZXOA 4WQ5A 3HSCA 4B1ZA 1CZAN 1GLAG 3EL2A 4FO0A 3VOVA 1U2VB 4DQ8A 5B8HA 2WUSA 3CERA 1BA0A 3DAWA 3AY9A 4BQZA 4B1VA 4A61A 5JLFA 1NGCA 1X3NA 4FWSA 5AQFA 2EWSA 1BUPA 4FWPA 4JHDA 4BGBA 3QDKA 3AAQA 2PAVA 4M7YA 5ADXH 4BR0A 3KHYA 3A5LC 4EHTA 3P4IA 1MDUB 2YHYA 3EKSA 5AQIA 4I6MA 5AQHA 3FFKB 1BA1A 3U8XA 1YAGA 4H0PA 3WXLA 3D2EA 2YI1A 3HZ6A 3H1QA 4B9QA 2P9NB 2HMPA 3QB0A 3VF2A 5AQLA 5BRDA 4WQ4C 5F0XA 2FF6A 3W0LA 2P9SB 2D0PA 4BQLA 3ZX0A 3ULEA 4H5WA 4K41A 5AFUH 5AQZA 1IG8A 1QHAA 4H0YB 1NGDA 4O8KA 2IVPA 3OHRA 4CZIA 4YDUC 3VGLA 1NGJA 1GLEG 1NLVA 3R8EA 3MN7A 4K43A 1BG3A 3HBTA 2KHOA 3MMVA 3MN5A 2ZWHA 5EXWA 3UKRB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QMLA 3IDHA 3ZT4A 1XC9A 1KFDA 4C8LA 4JK9A 1LW2A 4LC9B 3E9OA 3DI6A 3VQBA 4AHRA 3E1YA 4YORA 2FSKA 4DTJA 4KH6A 3CFPA 4BE1A 3TAGA 4CHOA 1U04A 5BPLA 4B9SA 4KI6A 3BUZB 2IDOA 1JL1A 2P9LB 3DMJA 4WFAL 3G0ZA 1UA1A 3N4PA 1BWFO 1TAQA 5HRRA 4FJGA 2ASOA 4DLEA 4CHYA 3HOSA 5AQTA 4HUFA 4JI1K 1DT9A 1NNEA 1VQ8N 1S9GA 3HVTA 5BR9A 1FKPA 3D2FA 2ZF5O 2B5JA 1RDUA 3SJHA 3TSUA 4J2DA 1YF5L 4HUGA 5AQPA 3O8MA 1NG9A 2CGJA 3C6TA 4FJ7A 1VSIA 3SYZA 4E7LA 4FLYA 1B9DA 1R59O 3V9WA 1LOTB 1WSHA 5KPTA 2CH6A 5I9EB 4KRFA 2HBKA 2P51A 1YUWA 4WF9L 1HYZA 3NCIA 1NKBA 4FLUA 4ISEA 2HOEA 2WBNA 3THYA 2G8KA 4W5TA 1NU0A 1HQUA 3RSEA 1I3AA 3L2RA 3SV4A 2NRXA 4JD2B 3AVCA 4C1NK 3HVRA 4OPJA 1RBUA 1FJGK 3SK3A 3OYKA 1RDCA 2P9UA 4ELVA 1XC3A 1EETA 3HRGA 2DFHA 4DUZK 2CGLA 4NCGA 1K8KB 4CEEA 2Q97A 2D5RA 2IVOA 3AV9A 1KAZA 3O3FA 1JCFA 3UIQA 2PZSA 5EY4A 4BC5A 1T03A 4B3OA 4FVMA 1YTUA 2QXFA 4JKGA 3T19A 2QW9A 4CJSA 2KLAA 4DV0K 1LWEA 3J7YP 3J80O 1IKXA 4DR5K 1YVUA 4PKGA 3ISNC 3O3GA 4DTOA 2O8BB 3SAGA 2F7TA 4OX9K 3M8SA 5AQQA 3P31A 3C0BA 3OJSA 4ILGB 1VSDA 5DK5A 3KLGA 1NK5A 3SMSA 4OPHA 3HJFA 3MN6A 1HPMA 4CZEA 3THWA 2WC9A 3OYEA 4N5SA 2YV0X 3VQ6A 4FJJA 5ELZA 1TKTA 3L2UA 3ZSVA 3KKSA 3VGKA 3ID8A 1BO5O 2HB5A 3HP9A 1NMNA 3G4SN 4JLHA 3ZETA 3K5NA 3V81A 1N8RO 5M1FA 4ZTFA 1GLCG 3AVFA 3KK1A 3VQ5A 1FKOA 2HBMA 1YIJN 4FCYA 2OANA 4FK2A 3G6EN 4CJWA 1RNHA 3CCEN 1YXQA 4CE9A 3KKRA 2HF4A 4YDUA 5C25A 1HNXK 4L8RB 4NYNA 4FK4A 3T1YK 5EX5A 5LJVA 5JMVA 4E7HA 1T6CA 1FK9A 2HBLA 3IUCA 4O4GA 4DR4K 1NGFA 4BECA 3OW2M 2E2QA 3IFRA 4CJ5A 2H3GX 1LWFA 3GDQA 2VCPA 3DXMA 4M45A 4CW7B 3SPYA 4JKFA 4KTQA 1C1BA 4CEBA 3DLHA 3AGKA 1JCGA 2A42A 1RBRA 1JXBA 4BR9A 3PSIA 4C1NI 3OS1A 1NBWA 1TL1A 4JKHA 1B9FA 4CD3A 4ICLA 3ALYA 2FSNA 4X64K 2BTFA 4O55A 1U6ZA 1YI2N 3NF8A 4GV3A 1KLMA 4GVEA 4OJRA 2ZD1A 3AO1A 4RTFD 4E72A 4DF8A 4HVJA 3MAQA 3NVKA 4F3TA 1U45A 3CQXA 3M8PA 3VEXA 2Q36A 5LY3A 4CEFA 1TKDA 3E01A 3VQ7A 3CC7N 4LFAK 4EFHA 3NF7A 2YCHA 4CZJA 1RTJA 3HK2A 3NE6A 1C1CA 3AA3A 3HM9A 2V52B 2UYTA 3F5TA 4FLZA 3CPWM 4H5VA 4F9OA 1O13A 3KD1E 3UKRA 5GADP 5GAGP 1RFQA 2GELA 3AVLA 3E66A 4DR2K 5AR0A 3BZCA 5BN9A 4ZTJA 1BDGA 3A2FA 3MX2A 2KZMA 1BL3A 3KLHA 3GBTA 1C0FA 4EP5A 3R1XA 1RDAA 2FLOA 3DM2A 5FRMA 3I8DA 4Z4GA 1U48A 5GINA 4KH5A 1C0GA 4LFCK 3LP2A 3O3HA 3V9ZA 4TSXA 1RT4A 1XI1A 2O8EB 2IAJA 1MU2A 5J2PA 5AQXA 4C8KA 4QAGA 4QS9A 2QTDA 5M1PA 4H4OA 4FK0A 1JLCA 3C7NA 1RTIA 5LMUK 2XY7A 1UWBA 2YHWA 4DR6K 2NNWA 2PYJA 4OVLA 1U4BA 2RF2A 1N33K 4EHUA 4IFYA 4PKHA 1HYSA 3H3NO 3ZEUB 3Q7BA 3MXMA 2V7ZA 4B1YB 4M3TA 4JI6K 3CCRN 3OYDA 2UXBK 4KH4A 4C8MA 2YHBA 3A5OC 3OYAA 4H5RA 1E4GT 2A40A 4I2QA 2HHXA 2YNFA 4WQ5C 2O8CB 5DM7L 4DTRA 1NJYA 3ZSQA 3UB5A 3ZX2A 1WNSA 1RGIA 1Z05A 3H3OB 4MFBA 3S41A 4BE7B 2QWRA 1SKWA 4OGEA 2UXDK 4HWIA 1EWQA 3EE9A 4Z4CA 3H46O 3O6WA 3RR7A 4Z4HA 4H8KA 4CEQA 3VN5A 4CD1A 1T8EA 4PY5A 3EKUA 2XHBA 4GY2B 1EX4A 4A57A 1J6ZA 4YHHK 4OGCA 3NH0A 3D7EO 1HYVA 4PL7A 4HCBA 4IJAA 3CJAA 3SBTA 1BI4B 4FOIA 1WAJA 3WXKA 1HR0K 1BCOA 4BR5A 2XO7A 2KW4A 5MLCQ 4BR4A 4G9ZA 1K73O 1NK9A 1CZAN 1GLAG 2ZJQL 2ITGA 3CERA 4U7BA 1ZYQA 2X78A 1I39A 1CXQA 4DFKA 4CEDA 3TAEA 2YHAA 5HBMA 3KLEA 4FWSA 5AQFA 4CCHA 4JHDA 4FLVA 3QDKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2A5X A;  5C2D A;  1UAX A;  4DQQ A;  3WEE B;  1KAX A;  2P9I A;  3T7Z A;  4DFM A;  4CFA A;  1ZBU A;  3LP3 A;  4BRP A;  4CK2 A;  5KGX A;  3PY8 A;  1MWM A;  3C94 A;  1CZB A;  1TUU A;  3HPH A;  4A5A A;  1HQE A;  3WUH A;  4RW7 A;  3D45 A;  3O08 A;  3CET A;  4XH1 A;  2W42 A;  3A8Y A;  4DTS A;  1B92 A;  3D2E B;  2I7N A;  1IKY A;  4PHT X;  4CZG A;  4MLH A;  1BQN A;  3AA2 A;  3VEV A;  4KTW A;  3DOK A;  4ZHR A;  2JWK A;  2W41 A;  2QA4 N;  4MLE A;  4DMN A;  3GG4 A;  3CCJ N;  2ZGZ A;  1X9M A;  4GKK K;  5KGW A;  3FZH A;  1KSP A;  3DXK B;  4J8F A;  4JKA A;  3U4L A;  3LPT A;  1VSL A;  3O9T A;  4BVO A;  1RDW X;  3CJ1 A;  1K8A O;  3J7Z O;  4BE0 A;  4DFJ A;  1X9J A;  3O9U A;  4JI5 K;  2P9P A;  4BAC A;  4BRM A;  3GE1 A;  4GMJ B;  3WNH A;  1NJI O;  1WN7 A;  3ZSW A;  2VWK A;  2F96 A;  5AQY A;  3CME N;  4CJL A;  2X6S A;  3SLC A;  4CF2 A;  3I8B A;  1RT2 A;  4W5Q A;  5C24 A;  5E84 A;  3UKU B;  3AVI A;  3CJB A;  4CBW A;  3PO4 A;  2FSJ A;  1NK7 A;  5CR4 A;  1NM1 A;  1HKB A;  1BOT O;  1BIS A;  1NJW A;  2E6M A;  3K9K A;  1ATS A;  4LF6 K;  2OZS A;  1ZBI A;  3J81 O;  2C1I A;  3HTV A;  2BAN A;  3DLK A;  5M1Q A;  2HNY A;  4FJI A;  3CI5 A;  4DQI A;  1SL1 A;  4IWV A;  2HF3 A;  2AP1 A;  4B1U B;  3M5R A;  2D0B A;  3CHW A;  4RW9 A;  4MDB A;  1JLG A;  4IFV A;  4DTN A;  4DB3 A;  3LDP A;  4B8A B;  3C65 A;  1LW0 A;  1QTM A;  3HSC A;  1KQS M;  5B8H A;  4IEE A;  5D3G A;  4B1V A;  5AJ3 K;  4A61 A;  1NGC A;  1X3N A;  1BUP A;  4FWP A;  1HJR A;  4BGB A;  4YOX A;  5ADX H;  4CJT A;  2OA8 A;  2FBY A;  5C15 A;  1RDB A;  4JKC A;  4IOC L;  5HRN A;  4I6M A;  5AQH A;  4CGJ A;  1J53 A;  3CCU N;  1ZBF A;  3FFK B;  2C1G A;  3WXL A;  4CJF A;  5C12 A;  3H1Q A;  3SAF A;  3TAB A;  3PO5 A;  1VHX A;  4WQ4 C;  4J2B A;  2P9S B;  5FRO A;  3QET A;  4FLX A;  1IG8 A;  1QHA A;  1NGD A;  4O8K A;  4FLT A;  3AGR A;  5C10 A;  4YNQ A;  1S9E A;  4CJU A;  4CIE A;  4DV6 K;  4JI4 K;  4B08 A;  1NGJ A;  3K0S A;  1BGX T;  3ZT0 A;  1VQO N;  1BG3 A;  3V6D A;  2P5G A;  3L2W A;  2KHO A;  4DR1 K;  1HNW K;  1VAZ A;  5EXW A;  5F1X A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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