2ASMA

Structure of rabbit actin in complex with reidispongiolide a
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
370
structure length
363
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 129
structure length 363
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asmA03
1GLLO 3GOIA 5AQZA 4IWVA 1BO5O 3BF3A 1MDUB 3ENHA 1NGHA 1HPMA 4BG8A 5EX5A 4BROA 3D2FA 4M7YA 1S3XA 3LDQA 1NGIA 3VEXA 2QWOA 4PKGA 4FWPA 1U2VA 3VGLA 3CI5A 3O08A 1DEJA 4BC2A 2P9SB 4ISGA 3VESA 4BGBA 2GELA 3U9ZA 4BGAA 2FF3B 3EN9A 3HBTA 1Z05A 3SJHA 3ZEUA 3A0IX 3AY9A 3CJBA 3QFUA 1XQSC 1GLAG 4FWMA 3VEYA 3D2FB 5AQGA 4H5TA 2AA4A 3O80A 1U2VB 3W0LA 1JCFA 3ZETA 5JICA 1TYQA 3CJ1A 1MWKA 5AQNA 2I7PA 3DAWA 5AQIA 3H45C 1T44A 2PBDA 1NGBA 3WT0A 3ZEUB 4JN4A 3UKUA 4M63C 4MLHA 2D0OA 2H3GX 2QWQA 2V52B 3H46O 4FWOA 4H5WA 3VGMA 1NLVA 4FWSA 2YHYA 3IFRA 3ZETB 1HX1A 3MN9A 4ISEA 1NM1A 5B8HA 3CETA 1TYQB 5FPEA 1GLJO 3VOVA 2A42A 3MK6A 2P9IA 3EL2A 4BRKA 4WQ4C 2W40A 4QS9A 4O8KA 3QDKA 5AQFA 4WQ5C 4BR7A 2D1KA 5E84A 2IVOA 3UKUB 5F0XA 1GLDG 2V7YA 4EFHA 3VGKA 4L3QA 2GEMA 2YHWA 4XH4A 2E2NA 3O5BA 5FPMA 1BG3A 5AQKA 4DB3A 3UKRA 4XEIA 1T6DA 3UB5A 4BVPA 5KQ8A 2FLOA 2Q1NA 2P9IB 5BRDA 1Y64A 3KZBA 5EY4A 4WYBA 3DJCA 4H0PA 4YDUA 4H5NA 1BDGA 5JLFA 4RTFD 2BTFA 5AR0A 3P4IA 4YDUC 3S41A 2CGKA 5AQPA 2FF6A 2Q31A 3AAPA 3IMXA 3M1FA 1NBWA 1GLFO 4QS7A 1KAYA 4FOIA 1LOTB 2EWSA 2D4WA 1HUXA 5AQOA 3ULEB 4F9OA 4K42A 1QQNA 3FFKB 1WUAA 3F9MA 3H6EA 4CZGA 2P9NA 2ASOA 3GE1A 3EZWA 4H03B 3U8XA 1D4XA 1MA9B 4B1YB 1NGDA 2ZGZA 2CH5A 4BRHA 2NZTA 5I9EB 1C0FA 3IDHA 4GY2B 4JAXA 4IXCA 5TKYA 4BRPA 4BR9A 2GWKA 4CZEA 4K43A 2PAVA 4BR5A 2J4RA 4FWRA 2E88A 3SMSA 1SAZA 3C7NB 1LCUA 2NRHA 5BRFA 2A6AA 4CD1A 4XH1A 3MN6A 1T6CA 3WXJA 3CHWA 5AQRA 5F1XA 1ESVA 2P9NB 2E2OA 4BRGA 4Y0WA 2P9UA 5AQYA 2V51B 3WUHA 4J8FA 4H0OA 4CBUA 4BR2A 3EKSA 3DXMA 4RWTA 2IIRA 1XC3A 2BUPA 2GTDA 1NGAA 3QMLA 3ZX0A 1Z6RA 4BC5A 1ATNA 3QBWA 2FXUA 2IVPA 4JNEA 1GLEG 4PKHA 1X3NA 4BRAA 5CE3A 2E20A 5AQJA 2V7ZA 2YJEA 2YJFA 2P9UB 1ATRA 1RFQA 3FLCO 5FPDA 1QQMA 2CGJA 3O4WA 1QQOA 4DQ8A 3DXMB 2F9TA 4B1UB 3WEEA 1DGKN 5JLHA 4EIAA 4CZMA 1QZ5A 4BQZA 3VERA 4Z94A 1J6ZA 1MWMA 3VEVA 4H0TB 2ASMA 3CJAA 4H0YB 4H5VA 1KAXA 1NGFA 2E1YA 1JCEA 4BRNA 2KHOA 5EVZA 4FWLA 1R59O 4H0XB 3BUZB 1YVNA 2ASPA 2FSNA 1V4TA 3WEEB 2IVNA 2QWPA 4HTLA 3FZFA 3VPZA 1ZC6A 3VF6A 3LM2A 1Q18A 4NB4A 1WOQA 3I8BA 2ITMA 3SK3A 4EAHD 3HSCA 5AZIA 1QHAA 2P9KA 4K41A 3C0BA 2Q36A 3AARA 1OKJA 2HOEA 5AQHA 4CZIA 3A5OC 3O1WA 3H3OB 4CI6A 1GLCG 2QWMA 3B8AX 5BPMA 4FWNA 1TUYA 2I7NA 2FSKA 3WXIA 3ATUA 5BPNA 4I6MA 1JCGA 1HLUA 5BN8A 5KQDA 3GL1A 1E4FT 3L0QA 5LJWA 4BREA 1GLBG 4FSVA 5ELZA 1BA1A 3H1VX 2P9KB 3G25A 4BRCA 4A2BA 4B1XB 1HKGA 3UKRB 5AQVA 5LJVA 5E26A 5FPNA 3LM9A 5AQQA 3KHYA 5AQWA 4BVOA 3KVGA 2QXLA 4M7XA 5AQUA 2HMPA 4H0VB 4I6MB 3CJ9A 1KAZA 1NGEA 1BUPA 3MCPA 4CBWA 4IJNA 2VWBA 3BP8A 4BRLA 1H1VA 2CGLA 3VF2A 3I33A 4FL9A 3WXKA 1NWKA 3LL3A 3GBTA 4IZ9A 5AFUH 3VEOA 2ZF5O 1YXQA 4EHUA 2P9LA 4CJ7A 3ID8A 1ZXOA 1BOTO 3WQUA 4B1WB 2P9PA 3TU5A 2VYPA 4FWQA 3A5NC 2Q97A 3L6QA 1P8ZA 1YUWA 5LY3A 3DWLA 3WXLA 2QWNA 4FWKA 3MMVA 2E2PA 4H5RA 1NMDA 4CD3A 3M3ZA 3CQXA 1SZ2A 1XUPO 1QZ6A 3BEXA 3HZ6A 4XH5A 4CZKA 2E8AA 4JD2A 3FZKA 4AM7A 2P9LB 5AZJA 3EO3A 3QBXA 4IO8A 3UE5A 5AQXA 4CZHA 2P9PB 4BC4A 1U6ZA 3A5LC 2HF3A 4A61A 2D0PA 5ADXH 4DHYA 1K8KA 5JMVA 1V4SA 2YI1A 3FZHA 1E4GT 2A41A 3RSEA 3WQTA 5AFUA 2AP1A 2Q0UA 3QB0A 3QICA 3SLCA 3VETA 5EOYA 3LDPA 4E1JA 3M6GA 2E1ZA 4JD2B 3CERA 4A2AA 1RDWX 5AZJB 3JS6A 3O8MA 4FOEA 2QW9A 4B1VA 1G99A 3HI0A 3D2EA 4PL7A 5EXWA 4B9QA 4K25A 5BRHA 4FO0A 3LDNA 4PL8A 1S22A 1K8KB 3DXKA 5BN9A 2DPNA 3RSEB 4CZLA 4BG9A 1NGGA 3L4IA 4BRQA 1IJJA 3W3DA 5KPZA 3SMPA 4A62A 4MO5A 4C23A 5ADXA 4FPAA 1DKGD 3IUCA 4B1ZA 4PKIA 3ZX2A 2Q0RA 3D2EB 3H1QA 3CQYA 1BA0A 2FSJA 3VEZA 1BWFO 2F9WA 1YAGA 3DXKB 4DCHA 3GDQA 3LDLA 4MO4A 1HKBA 4CBXA 3ZX3A 2UYTA 1BU6O 3ATVA 4JHDA 3FZMA 1EQYA 4BRMA 3ENOA 4ISFA 2QWLA 1HJOA 3D7EO 4KBOA 4WQ4A 3JXUA 2WUSA 3GG4A 4QS8A 3MDQA 2VCPA 4WQ5A 3H3NO 4BR0A 4BR4A 3O6WA 2OANA 3FGUA 5KPRA 3FZLA 1ATSA 1HKCA 5AQLA 4BRIA 5AZIB 4CZFA 3MN5A 2YCHA 3R9PA 1X3MA 2QM1A 5BR9A 1SQKA 3OHRA 3QFPA 4JHDB 1RGIA 1NGJA 2A5XA 2HF4A 5BPLA 3CJCA 3ULEA 1NGCA 3U4LA 3HM8A 1C0GA 3CJ7A 4MLEA 5AQSA 4FPBA 4BRFA 5F2RA 3MN7A 4CZJA 4GNIA 2CH6A 3VF4A 3A5MC 4LC9B 2NLXA 3C7NA 4EHTA 1CZAN 3BF1A 4BQLA 4BRDA 1ZBSA 4IJAA 1X9JA 5AQTA 2A3ZA 4O5FA 4AM6A 1TUUA 4NO7A 2GWJA 2W41A 3O1BA 3TPQA 2E2QA 3VENA 4HWIA 5BREA 2ZWHA 3CIPA 3FE1A 3J8AA 3LDOA 3R8EA 3R6MA 3U9DA 3FR0A 2ZGYA 3VEWA 5KPTA 3HTVA 2GUPA 2A40A 5AQMA 1KXPA 3A8YA 3EKUA 2YHXA 2P9SA 4BC3A 1IG8A 2QWRA 3AAQA 2Q2RA 4RCHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1CZ9A 4Z4IA 4DG1A 4IWVA 5KGXA 1NGHA 4A57A 4H4OA 4ILGB 1Y97A 4JKHA 2C1GA 4CEDA 4JK7A 3AVKA 4IBNA 1U2VA 3VGLA 4AHSA 4EP5A 3MEDA 4IDHA 3TWHA 4YOTA 3O08A 1DEJA 4BC2A 3CM6A 5FROA 3ZLJA 3HBTA 1X9MA 3ZEUA 2RHKA 3CJBA 2QK9A 3MWTA 3F9KA 2HBJA 3U3YA 3JYTA 2OA8A 3ZETA 1KVAA 4DLEA 3SUQA 4CIFA 3MEEA 1XHZA 1TK5A 1WBBA 3DAWA 4CW7B 1LAWA 3AVLA 3OS2A 4MLHA 2D0OA 3P39A 4H5WA 3DRSA 3TTDA 2YHYA 3IFRA 1MU2A 4JKBA 3MN9A 3NBPA 4KFBA 2A42A 3LP2A 3D0PA 4OPKA 2W40A 4O8KA 3QDKA 5AQFA 1UA1A 2D1KA 1BIZA 3UKUB 4YFUA 4B8CA 1F21A 4OLBA 2V7YA 3VGKA 4L3QA 4XH4A 4B3OA 3PLAA 3L2RA 4OGEA 3UKRA 3IKMA 4XEIA 3UB5A 5CZ2A 4O4GA 3VTHA 5BRDA 1M90O 2NRXA 1Y64A 2GV9A 3QEXA 4YDUA 3VQ8A 2QTDA 4OJRA 2BTFA 3S41A 1IO2A 3AA5X 1NK8A 1L3VA 3WNHA 5FLXO 4JYAK 4QS7A 1KAYA 1VHXA 3AGKA 2Y1IA 4DMNA 4O0JA 1WUAA 2NNWA 4JI2K 2P9NA 3QERA 4B9NA 1MA9B 4KH5A 5I9EB 4JAXA 4GY2B 5HRSA 1X1PA 4IXCA 4HCCA 4K43A 2PAVA 1IBMK 3TTCA 1IKYA 2VWJA 1SAZA 1JKHA 5BRFA 2A6AA 1T05A 3NGZA 2F7TA 4Z4GA 3HT3A 3MN6A 1T6CA 3WXJA 5AQRA 4UY8O 5AQYA 2V51B 3WUHA 4J8FA 3DOLA 5LL6Z 4X65K 2HHTA 4R5PA 4AHVA 1HQEA 3EKSA 4XJXA 4DTJA 3CCRN 1R0AA 2BUPA 1NGAA 5J1EA 3QBWA 1A5WA 4R79A 1GLEG 1ASVA 1X3NA 3DLEA 1TK8A 4KAZA 1C0MA 4KREA 2E20A 2YJFA 3O3FA 2CGJA 4LSNA 3QIOA 1QQOA 3CC4N 2F9TA 4B1UB 5JLHA 3K5NA 4ICLA 3AVHA 2F8TA 1VQ8N 1QZ5A 1UWBA 4W5OA 3VERA 4JI1K 2QKKA 1S6PA 4W5NA 2OTJN 4CFAA 4H4MA 2HNYA 4H0TB 3PUFA 4DS5A 3NH0A 3VQDA 1KQSM 4M3RA 1JCEA 4DQIA 2PY5A 3KTQA 1A5XA 3M8RA 3OYJA 1YVNA 2FSNA 4JRPA 4B8AB 2O8DB 2G8WA 4DR6K 2O8EA 3FZFA 1U45A 1WSEA 1YT3A 5HL7L 4BEBA 4NB4A 3I8BA 4Z4HA 3SK3A 1XI1A 4LY7A 1BGXT 4DV0K 4C8OA 3NF7A 1KFDA 4CEQA 4CIGA 3LPTA 3U6FA 1HNZK 3C6TA 3H08A 4CZIA 2O4IA 5LMNK 3V9ZA 1VSKA 3H3OB 1RT4A 4NXNK 3P38A 5J2QA 2KFZA 5KQDA 5M1FA 3TAEA 1YVUA 1KRPA 4BREA 4JI8K 1BHLA 1KTQA 4DTXA 4IDKA 2P9KB 3VQ4A 4BRCA 1GOCA 4KHPK 1HKGA 3UKRB 4IEIA 3DLRA 5FPNA 4BVOA 2WTUA 4ZTFA 5MLCQ 3DM2A 4CEBA 5FRNA 4H0VB 2OPQA 4I6MB 1NGEA 3KWIA 4CBWA 2VWBA 4FLVA 3I33A 3WXKA 3LL3A 1NOYA 1RNHA 4EHUA 1I3AA 3ID8A 4B1WB 2P9PA 2YX6A 5HRNA 4PQUA 2VYPA 1QE1A 4DSLA 5KI6A 1O1WA 1P8ZA 5LY3A 3DWLA 2XHBA 4H5RA 1NMDA 2P5OA 2QKBA 3EZ5A 4BDPA 2UUCK 1QZ6A 3HZ6A 2KTQA 2E8AA 4JD2A 3KK1A 1RBSA 3C6UA 4CZHA 4BC4A 3ALYA 4DTSA 2OZMA 3A5LC 1S6QA 5JMVA 3OYLA 1RT2A 3MXMA 1TL1A 1JLEA 2YI1A 3E1YA 3MECA 3WQTA 5AFUA 2AP1A 3SLCA 4CJPA 5A2QO 3OW2M 2WBNA 2Z1JA 1QQCA 4IOXA 1XC9A 5AZJB 3JS6A 3G4SN 2NRTA 4FOEA 4B9UA 1G99A 1FK9A 1BI4A 3D2EA 2P1JA 4K25A 5BRHA 4FO0A 4IOCL 4HHTA 3AA3A 1N5YA 1RDAA 3RSEB 2KFNA 3L4IA 1IJJA 5HRPA 1EO1A 3VTIA 1JXEA 1YTAA 1YHQN 3IUCA 2Q0RA 3KK2A 4DR1K 1BA0A 4J2EA 5LMUK 5M1KA 1YAGA 1QSSA 3DXKB 4DCHA 3GDQA 2RPIA 3MCAB 3ATVA 4DR7K 2I5JA 1KVBA 1IBKK 3SAHA 3SV3A 4BDZA 1WLJA 1RTDA 3JXUA 3PX0A 1W9HA 4BR0A 3DRRA 4B3MK 1L3TA 4KI4A 3O6WA 3I56N 2XO7A 3FZLA 4BRIA 4DU4A 2A1SA 3K9JA 3QFPA 3CMAN 3ZSOA 1RDUA 2PYJA 5BPLA 4Y1DA 1S1UA 3CJCA 4DSKA 1YF5L 5AQSA 1UAXA 2YKNA 1C1CA 4IOAL 3O3GA 1CXUA 4ZHRA 3ZSVA 4CGIA 3S5TA 3N4QA 2R7YA 1OVQA 1DT9A 4CVNE 3J7YP 3SV4A 4EHTA 4C8MA 2DTUA 3NH1A 1XHXA 4DTRA 4BQLA 1ZBSA 3K58A 2JLEA 3CMEN 4GMJB 3VENA 2E2QA 3TPQA 5BREA 2VG5A 2ZWHA 3R8EA 3TTFA 4CGJA 1SUQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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