2ASMA

Structure of rabbit actin in complex with reidispongiolide a
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
370
structure length
363
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 363
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asmA03
1YAGA 3CQYA 2P9UA 3P4IA 4XH5A 3HBTA 4H0TB 3FE1A 4JNEA 4BC3A 1BG3A 1S3XA 4H0VB 3AAQA 4IWVA 4QS7A 3WXIA 3EKUA 3QBWA 4BGAA 2A3ZA 2QWRA 2ZGZA 3DXMA 3D2EB 5EVZA 3FZLA 3MMVA 1J6ZA 5E84A 2Q31A 4JD2B 5FPEA 1XC3A 5AQRA 4FWPA 3AAPA 2ASPA 5ADXH 1BWFO 1GLEG 4HTLA 1U2VB 3ZEUA 2FF6A 4BRDA 3HSCA 4FWLA 1XQSC 3VGMA 3WUHA 2NRHA 2Q36A 3A0IX 5JLFA 4CZFA 4AM7A 2P9IA 4H5RA 3ZX2A 4WQ5A 3MN9A 3RSEA 1HUXA 5TKYA 3MK6A 5AQKA 4BVPA 3EO3A 1HPMA 3H1QA 4FPBA 4E1JA 3U4LA 1K8KA 4FWMA 4M7XA 4BVOA 3WXLA 1NGBA 5AQXA 4FWRA 5AZIA 1ATRA 1BUPA 4GY2B 3VF2A 4BG8A 1NGDA 3CQXA 1BDGA 1JCFA 1BOTO 1DGKN 1NWKA 2F9WA 4M7YA 2HF3A 2D0OA 4BR7A 1TUYA 1LCUA 3CJ1A 4C23A 3IUCA 3KZBA 4CD3A 5AQGA 2V51B 4IO8A 1V4SA 4EFHA 4FWQA 1NGFA 5CE3A 1LOTB 3VEYA 3VPZA 4FOEA 4DHYA 4H0XB 4L3QA 1E4FT 3TU5A 1KXPA 4QS9A 3C0BA 4B1VA 5AQLA 1MDUB 4PL7A 5KQ8A 4CZIA 3VGLA 5FPDA 5AQYA 2AA4A 3FLCO 3F9MA 2Q0UA 3VENA 2FSNA 4CBWA 1HX1A 2QM1A 2D4WA 4WYBA 4DQ8A 5AQOA 1HKCA 3H1VX 4FWKA 1KAXA 2I7NA 4XH1A 3QFUA 3GE1A 4JD2A 1GLBG 1MA9B 3SK3A 4EAHD 1BO5O 1D4XA 3QFPA 3GG4A 3U9ZA 3ZX0A 2FF3B 5AR0A 3HM8A 3LDPA 5AQHA 3LM9A 1QZ5A 1GLAG 5BPNA 3O1BA 2CGKA 3EL2A 3LDNA 1QZ6A 5AQSA 5AZIB 2W41A 4H0YB 2FLOA 2NZTA 2WUSA 3VEZA 3VGKA 2IVPA 2E2QA 4ISGA 3VOVA 1X3MA 1YVNA 1NGIA 4BQLA 1H1VA 3R9PA 1EQYA 4BRKA 2QWOA 5BR9A 1SAZA 1NGGA 4XEIA 4H5TA 4LC9B 3UB5A 4XH4A 4BRGA 4BR2A 3CETA 1U6ZA 2PAVA 2UYTA 4YDUC 1HLUA 3DXKB 3JS6A 4CZKA 2V7ZA 1QQOA 3KVGA 1X9JA 4EHUA 2FSKA 3LDQA 4HWIA 1YUWA 3OHRA 1QQNA 3MN7A 1QQMA 4BRIA 4B1WB 2E2OA 5EOYA 4YDUA 1ESVA 3A5MC 3LL3A 2GWJA 4CZMA 4JN4A 4MLEA 1T44A 2YHWA 3FGUA 4Y0WA 3SJHA 2V7YA 4A2AA 4H03B 2D0PA 5EXWA 4FSVA 3VEOA 1OKJA 1NBWA 3MN6A 4Z94A 5BPLA 5AZJB 1QHAA 4ISEA 3H46O 3FZFA 3O8MA 4MLHA 3QMLA 1DEJA 2QWLA 2W40A 4FWOA 2CGJA 3EKSA 1NGCA 3CI5A 1TYQB 5AQZA 3WEEB 1IJJA 2ASMA 2Q1NA 4K41A 3R8EA 3D2FA 2P9KB 5EY4A 3DWLA 2ZGYA 1Q18A 3IFRA 4DB3A 4RTFD 4BC5A 1GLCG 4DCHA 3JXUA 3GDQA 2P9NB 5AQQA 2ITMA 3BP8A 4FL9A 5JMVA 4FPAA 4BR0A 3O5BA 3VF6A 4B1ZA 5BRFA 3BF1A 4PKIA 5AQPA 2CH6A 3M3ZA 2BUPA 4BC4A 2YHYA 3M1FA 2P9PB 1JCGA 2QWPA 3DXKA 2HMPA 2QW9A 3KHYA 3VEXA 4JAXA 4M63C 4I6MB 3CJ7A 2YJFA 1E4GT 3G25A 4BRCA 4H5WA 3ULEB 3L4IA 2HF4A 4IJAA 5KPRA 3O08A 3QBXA 3UKUB 2GTDA 3LM2A 4CD1A 2F9TA 5BRHA 1HJOA 1RFQA 2A42A 4K25A 2IVNA 1RGIA 3SMPA 5FPMA 3MN5A 2YJEA 4EHTA 1T6CA 2IVOA 3FZHA 3A8YA 3J8AA 4IXCA 5E26A 5ADXA 2V52B 4K42A 4F9OA 3LDLA 5BREA 3D2FB 5BPMA 3ATVA 2H3GX 2P9SB 3B8AX 5KPTA 2YCHA 4PKGA 3FR0A 4CZJA 2YHXA 2D1KA 5AZJA 3FZKA 3I8BA 4BRFA 4JHDA 2QWMA 1WOQA 1Y64A 4H5VA 3GL1A 4B1YB 4RWTA 2Q0RA 4J8FA 2AP1A 4AM6A 5JLHA 1TYQA 3M6GA 3WEEA 4FO0A 1WUAA 1GLJO 2E2PA 4H0PA 2P9KA 4WQ4C 1NGEA 2OANA 3CIPA 2NLXA 1T6DA 3U9DA 3HZ6A 4BRHA 2GWKA 2E20A 3ZX3A 4CJ7A 4CZLA 5AQVA 1X3NA 1DKGD 2P9NA 5BRDA 3HTVA 4BR5A 2A41A 4CZGA 3ENOA 5KQDA 1GLFO 3CHWA 2Q2RA 2GEMA 4BRAA 3H3NO 3O6WA 2QWNA 3IMXA 4BRMA 4K43A 4BRNA 3VETA 5JICA 2HOEA 4NB4A 4KBOA 3CJAA 1C0FA 1KAYA 2P9PA 4B1XB 4CZEA 3UKRB 2VCPA 4I6MA 4O8KA 1SQKA 3L6QA 3O4WA 3FZMA 2ZF5O 3C7NB 3QICA 4B9QA 2FSJA 4ISFA 3ULEA 2GUPA 5B8HA 5AQUA 3UKUA 1CZAN 2A5XA 3A5NC 2BTFA 5AQMA 4CI6A 1ZBSA 4JHDB 3CJBA 5F2RA 3VEWA 3A5OC 2A40A 3MDQA 5F1XA 1NGHA 3A5LC 5LJWA 1IG8A 2CH5A 2DPNA 2VYPA 4QS8A 4WQ5C 4MO4A 3ENHA 3CERA 1ATNA 5KPZA 2E1ZA 3LDOA 4BQZA 4BREA 2P9SA 3I33A 1GLDG 5LY3A 4O5FA 1YXQA 4IZ9A 4GNIA 3TPQA 2P9LB 2IIRA 1RDWX 4H5NA 3EN9A 3ATUA 3CJ9A 3ID8A 5BN9A 2E88A 5AQFA 3SMSA 1MWMA 4BRQA 4RCHA 4PKHA 4IJNA 3QDKA 3AY9A 3ZETB 4CBXA 3DJCA 5AQJA 1ATSA 2ASOA 3VERA 2EWSA 2KHOA 4NO7A 4EIAA 5AQWA 3W0LA 4MO5A 5AFUA 5F0XA 5BN8A 1HKBA 1V4TA 5ELZA 3D7EO 1ZXOA 3H3OB 2P9UB 2CGLA 1G99A 3FFKB 4FOIA 3WQTA 1NGAA 3S41A 3BUZB 5EX5A 1Z05A 4A61A 4BR4A 1JCEA 1GLLO 3UE5A 4CBUA 1KAZA 2E1YA 3W3DA 2QXLA 2Q97A 1MWKA 3O1WA 3O80A 1NGJA 3UKRA 4B1UB 3DXMB 4H0OA 1NM1A 2QWQA 3WXKA 1BU6O 3GOIA 3VEVA 2E8AA 3C7NA 1P8ZA 1NMDA 1BA1A 3IDHA 3MCPA 3AARA 3R6MA 5I9EB 3ZEUB 3SLCA 3QB0A 3WQUA 4A2BA 1BA0A 4BRLA 4PL8A 4BC2A 2P9IB 3D2EA 2E2NA 3U8XA 4FWNA 1R59O 1HKGA 3GBTA 3RSEB 3HI0A 3VESA 5FPNA 3CJCA 1U2VA 3VF4A 4BRPA 2FXUA 3WT0A 2J4RA 3EZWA 1K8KB 1S22A 3H45C 4BGBA 2A6AA 3WXJA 1XUPO 2GELA 2YI1A 1SZ2A 1NLVA 2PBDA 2P9LA 4BG9A 4FWSA 1ZC6A 3DAWA 5AQIA 1C0GA 3H6EA 3L0QA 5AQNA 4WQ4A 3BF3A 1Z6RA 3ZETA 2ZWHA 4CZHA 4A62A 2VWBA 4BR9A 3BEXA 1TUUA 2I7PA 5AQTA 5AFUH 4BROA 5LJVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TK5A 1YAGA 4DTJA 2E5LK 3M5RA 1EP4A 1JLGA 1TL3A 3ENBA 4B9TA 4W5NA 4FLXA 2DFHA 1RT2A 3OYEA 4BDZA 4BGAA 4CFDA 3DXMA 3S3MA 3AO2A 4C1NK 2Q31A 3HL8A 5FPEA 1VSDA 3SAHA 5ADXH 1W9HA 1NKCA 2OPQA 1U2VB 2FF6A 3NGIA 4FWLA 4J2DA 4B3TK 3WUHA 4CVNE 3MXIA 4OLAA 4AM7A 3ULDA 4KB0A 4H5RA 3AGKA 3DLEA 3PSFA 3QLHA 3ZX2A 3RVCA 4KV8A 4WQ5A 4B8CA 3MN9A 3RSEA 4M3ZA 5TKYA 3OYMA 3MK6A 3LPTA 4BVPA 2VG7A 3SQ2A 4B3OA 1WNSA 2VGNA 3AV9A 1Z25A 3DLGA 1VQKN 1TAQA 3L2VA 1DGKN 4N47A 3KD5E 3KTQA 1QQCA 1LCUA 3SQ0A 3I0RA 3EZ5A 3CMEN 4F2RA 3AA5X 4C23A 1C0MA 4BACA 3KZBA 4LY7A 2V51B 3FFIA 3C6HA 4FWQA 3PY8A 3CCQN 3P5JA 5KGXA 4L3QA 4C8NA 3SUQA 3M8SA 1Y97A 5HRRA 3RWUA 5KQ8A 4F2SA 5FPDA 3VQBA 4DF8A 3F9MA 3O3FA 1VSKA 3O9TA 4CBWA 4A5BA 3O9QA 1D9FA 1IKXA 1JL2A 5JS1A 4WYBA 4O8UA 2ZJQL 2HMIA 5FLXO 3CQ8A 1ZBUA 3M8PA 4EAHD 4CCHA 3OJSA 1D4XA 4FYDA 3H08A 4GMJB 5AQHA 3HP9A 1QZ5A 2Z1JA 2QKBA 3IAYA 5BPNA 4AHSA 1L3SA 4CECA 4ZTFA 3LDNA 1QZ6A 2HVHA 5AZIB 5DMRA 2WUSA 1BIZA 4ISGA 3VOVA 3AVMA 1NGIA 1ZBFA 2UUBK 3AVGA 4Y1DA 2QWOA 4AHUA 1RBSA 2IC3A 4H5TA 3UB5A 3V1QA 3V4IA 4IDHA 3NVKA 1ZBHA 4NYFA 3B6PA 4K8XA 1A5VA 3DXKB 3ISNC 4FM2A 4N76A 4NYNA 3C94A 3KVGA 1X9JA 4EHUA 5IWAK 1RTIA 1J5EK 3AA4A 3CMAN 4F4KA 2W00A 3CG7A 4E72A 3N4PA 4WF9L 3ZCMA 4ZHRA 4CEOA 1NK6A 4JI0K 5KI6A 3AVCA 5EOYA 3ZT1A 1U45A 4KREA 3HT3A 1Q9YA 4XIUA 2YHWA 3O4QA 4EZ9A 4KO0A 2V7YA 4A2AA 2G8FA 5EXWA 3KK1A 4E1NA 2OTLN 5BPLA 4CJSA 2XY7A 5AZJB 4MFBA 1QTMA 3V81A 2NNWA 3HPGA 4B3MK 1DEJA 2W40A 4PA1A 3EKSA 4W5OA 3TSQA 3WEEB 1XC9A 3L3VA 5GADP 3R8EA 2P9KB 5JVGL 3Q7BA 5EY4A 5HLFA 3V1OA 3DWLA 2ZGYA 1Q18A 1RT4A 4FLWA 3HOSA 4OPKA 1HNXK 4WFNL 4M3XA 3GDQA 5AQQA 2ITMA 3HP6A 3BP8A 3OYLA 3THYA 4FL9A 4E19A 4CJEA 3CPWM 3QETA 2OPRA 4LH4A 3KLFA 3VF6A 4KH5A 1B92A 3NGZA 5BRFA 3V1RA 1NK8A 4BC4A 3KHYA 3DXKA 1JCGA 2JLEA 3VEXA 3T7ZA 5T7BA 4DTSA 3QESA 3NHGA 2YJFA 1RDCA 2X74A 1QSYA 4H5WA 3ULEB 3AVIA 2HF4A 4IJAA 3NH0A 2XO7A 1NJXA 3O08A 1BL3A 2Y1JA 2IVNA 4CESA 1DTQA 1RGIA 3V9UA 2HW3A 4EHTA 3V9ZA 1T6CA 4DV6K 3NF9A 4BDPA 3R3LA 3UIQA 3JAMO 4DR4K 4PKGA 3ALYA 3FR0A 2JWLA 1U4BA 5AZJA 2GBZA 3I8BA 4RW4A 3TAPA 3K2PA 1NJZA 4RWTA 1JLFA 2AP1A 2YNHA 2HBJA 3WEEA 4FO0A 4H0PA 1BIUA 2P9KA 3ZT4A 1T8EA 3U3YA 1N34K 4IG3A 3MX5A 4ZTJA 3HZ6A 2FBYA 2KFZA 2Q3SA 3NF6A 4N5SA 1X3NA 1DKGD 3NFAA 4FK0A 2HBKA 3O4NA 1WN7A 3F9KA 1BGXT 2KTQA 3J80O 3ENOA 3SNNA 4DTOA 3VQQA 2GEMA 3O6WA 3L3UA 1ZYQA 3K58A 3KK7A 4BRNA 1DTTA 4CEDA 1NJIO 1NMNA 2JWKA 2O8CB 4CJ4A 3L6QA 3SAGA 2KLAA 5M1QA 2VWJA 2ZF5O 3QICA 3ULEA 4CHQA 3S9HA 1RT5A 4KHQA 4A57A 5F2RA 3CJBA 3SCXA 2G8HA 4LF8K 3QNOA 2A40A 5F1XA 5LJWA 1ATNA 4JK9A 4BQZA 1GOAA 4BREA 4AH9A 2XY6A 3I33A 1QSLA 1RILA 2BH1A 4O5FA 3QEXA 4KHUA 5HRPA 3ZSVA 3ATUA 3ID8A 4PHTX 2P1JA 1MWMA 3AVLA 3AVBA 3I0SA 3AY9A 3DOKA 4CBXA 3OYGA 5AQJA 2C1GA 3PO4A 2EWSA 4NO7A 2Y1IA 4EIAA 3CCMN 5AQWA 5F0XA 3G6EN 3C6UA 1HYZA 1ITGA 2P9UB 1VQ6N 1O13A 3BZKA 3WQTA 1DT9A 1WSGA 1JCEA 1OH6A 3NMUA 2YNGA 3HK2A 3LALA 4QAGA 1RTDA 1YHQN 1VSHA 3CC7N 2EX3A 2QWQA 3WXKA 2O8CA 2HB5A 1D5AA 3VEVA 4CIFA 3MCAB 4DUYK 3AVJA 4FJKA 5C2FA 5LMNK 1RBUA 3MEGA 3IDHA 3RR8A 4CJTA 3ZSOA 3QB0A 2PZSA 4Z4FA 4X62K 3K5NA 4GV3A 3KWIA 2P9IB 1HQUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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