2ASMA

Structure of rabbit actin in complex with reidispongiolide a
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
370
structure length
363
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 363
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asmA03
3VF4A 4WQ4C 5KPZA 3LDPA 3VGKA 4H0PA 4YDUA 5AQKA 5E26A 2V52B 4H5VA 4IJNA 4MLHA 2AP1A 1K8KA 2BUPA 2GTDA 4BRKA 2Q1NA 4MLEA 1NGDA 4WQ4A 5AFUH 3DXMA 4CI6A 3CJ9A 3HI0A 4JNEA 4MO4A 3FZLA 1DEJA 2CGLA 4M63C 4BG9A 5AQXA 5ADXH 3R9PA 2GEMA 4BRIA 3D2FB 2FXUA 3QICA 2Q31A 1EQYA 1SAZA 4PKHA 4K43A 2P9PA 4RCHA 2QW9A 3SMSA 1IJJA 2HF3A 2HOEA 3D2EB 2YJFA 2QM1A 2BTFA 3HBTA 2UYTA 4FSVA 4CZKA 1QQNA 4JAXA 3WXJA 2HMPA 3CHWA 2ZGZA 2P9SA 4GY2B 4BRDA 1GLBG 4QS9A 4BRNA 5BR9A 5FPEA 1E4FT 4BRLA 1Z05A 4DHYA 3B8AX 4MO5A 3U9DA 2I7NA 1LCUA 4BC5A 3IDHA 5AQQA 3MN7A 4FOIA 1NGGA 2E20A 4O8KA 4CZEA 1P8ZA 1T6DA 5AQOA 4FWNA 2Q97A 3H3OB 3UKRA 4BVOA 5JMVA 1GLLO 5AQUA 3BP8A 3TU5A 3H3NO 4BR5A 4FWOA 2A40A 3DJCA 1NGAA 2GWKA 4JD2B 3MMVA 4I6MA 4BG8A 3VOVA 3DAWA 1NGEA 2V51B 4Z94A 3UKUB 1ESVA 2FLOA 2NLXA 3LDQA 3L0QA 5EX5A 5LJVA 4FPBA 3ZEUA 3FLCO 2ZWHA 3VF6A 4CJ7A 4LC9B 2FF6A 3ATVA 2P9KB 3O4WA 1BU6O 4B1ZA 3FZMA 3ZETA 1BOTO 3WEEB 1QQOA 3CIPA 3VGLA 2A42A 4BR0A 1Z6RA 4HTLA 4XH5A 4BR4A 4CZIA 4BR2A 1Y64A 3O5BA 1G99A 3WXLA 1TUUA 1C0GA 5AR0A 4H0YB 4F9OA 3A5MC 2NZTA 3KZBA 2GWJA 3WQUA 2E2OA 4A2AA 1GLCG 3ENOA 4FOEA 1BO5O 3C0BA 4BR7A 2NRHA 1U2VB 4NO7A 3VESA 3O6WA 5AQYA 2IVNA 1YVNA 4BC3A 1JCEA 3ATUA 2P9LA 3GBTA 2A3ZA 3ENHA 2Q36A 3C7NB 5BRHA 4ISEA 4CD1A 4BC4A 1NWKA 1WOQA 3A5OC 3GOIA 3VEXA 2QWNA 1IG8A 1MWKA 2QWRA 3CJ1A 4ISFA 5BPMA 4BGBA 1H1VA 1HKCA 4WYBA 3MN6A 1NGFA 4BR9A 3RSEB 3U9ZA 2P9UB 1KAZA 2E8AA 4PKIA 2CGKA 2ZF5O 3O80A 2WUSA 1MDUB 1TYQA 3H46O 4CZLA 1YXQA 3WXKA 4H0VB 4H5RA 3VEVA 4BQZA 4FWRA 3LM2A 3QDKA 5LY3A 3QBWA 1XC3A 1ATNA 2P9NA 5AQJA 3AY9A 1MA9B 2V7YA 3H45C 4DB3A 5TKYA 1YAGA 2ASPA 3FZFA 5E84A 5F2RA 3IUCA 2A6AA 3SLCA 2YCHA 3MK6A 3U4LA 5BRFA 4BRHA 4JHDB 2QWPA 5AFUA 2IVOA 2YI1A 1JCFA 1HX1A 3G25A 3VGMA 2EWSA 1BG3A 4WQ5C 4BRAA 4B1YB 5BN8A 5F1XA 3O1BA 1U6ZA 3WT0A 1QZ6A 3DXMB 1QQMA 3F9MA 5ADXA 4IWVA 5EY4A 2D0PA 3A5LC 3S41A 5LJWA 1DGKN 5FPNA 4A61A 2CH6A 4WQ5A 3FR0A 4C23A 3JXUA 3VPZA 1S3XA 3BUZB 4JN4A 3ULEB 4EHUA 4H0TB 4BQLA 2OANA 3QB0A 4CBWA 4CZGA 3SMPA 5AQWA 1HJOA 2P9PB 3MCPA 3L4IA 2KHOA 2DPNA 3CJBA 4NB4A 2P9IA 1NMDA 2YHYA 3SK3A 4K25A 4K42A 2IIRA 3CJCA 3A8YA 1HKGA 3EN9A 1GLAG 3BF3A 1RDWX 2GELA 4IZ9A 5EOYA 1BWFO 3WQTA 1V4SA 2P9SB 1DKGD 3LDNA 1TUYA 3BF1A 3LM9A 5AQMA 4FWKA 2PBDA 2FSKA 1E4GT 2FF3B 3TPQA 1HPMA 3I33A 4FWLA 4QS8A 1GLFO 2ZGYA 1OKJA 1XQSC 2ITMA 5AQZA 4FO0A 3H1QA 5AQTA 1R59O 3MN5A 4PL8A 4PKGA 1ZC6A 4B9QA 3A5NC 4XH4A 1NGBA 1SZ2A 3QBXA 4FL9A 4AM6A 4FPAA 5BPNA 5F0XA 1NLVA 3CQYA 4BVPA 4I6MB 3O08A 1D4XA 2W41A 5AZJA 3W0LA 3UE5A 3FFKB 3EZWA 5AZIB 2D0OA 5AQFA 3VEWA 2D4WA 3ZEUB 1NGJA 1ZXOA 3FZKA 1XUPO 4BGAA 5AQIA 3ZETB 4IXCA 2PAVA 4PL7A 3MN9A 3O8MA 5AQRA 4H03B 4CZMA 1NGCA 1HUXA 4DCHA 2A5XA 3DXKA 4XH1A 3VENA 5JLHA 5AQPA 2F9TA 3IMXA 5EXWA 3SJHA 5AQGA 1T6CA 1KAYA 1ZBSA 2Q2RA 1S22A 4BRMA 4BRQA 2A41A 3H1VX 4Y0WA 2VCPA 3L6QA 4FWPA 2ASMA 1J6ZA 1RFQA 3P4IA 5BPLA 2HF4A 2P9LB 4B1WB 4EAHD 4XEIA 4BC2A 1RGIA 5EVZA 2E1ZA 3HSCA 3WUHA 1CZAN 4A2BA 3ID8A 3D2FA 3EO3A 3MDQA 4JHDA 4EFHA 1BDGA 4FWQA 3QFUA 3VEYA 3U8XA 2AA4A 3HZ6A 5AQLA 1YUWA 1LOTB 1TYQB 3AAPA 3CJ7A 3D2EA 1K8KB 3GE1A 2E2PA 3GG4A 4H5NA 5ELZA 1QHAA 3WXIA 3QFPA 3A0IX 3M6GA 2QWMA 3H6EA 1ATSA 5AQSA 5BN9A 4FWSA 1JCGA 3BEXA 4BREA 5AQHA 3I8BA 4CD3A 3ULEA 3AAQA 2P9NB 1WUAA 1SQKA 2YHWA 2E88A 3EKUA 2YJEA 3GDQA 2CGJA 1GLJO 4KBOA 1HLUA 4M7YA 4IJAA 3AARA 2F9WA 4HWIA 5FPMA 3HTVA 2GUPA 5KQDA 5BRDA 1GLDG 3CJAA 2D1KA 4E1JA 5I9EB 4ISGA 1V4TA 4H0XB 3J8AA 4EIAA 3CQXA 3FZHA 1QZ5A 2FSNA 3M1FA 4JD2A 4AM7A 1C0FA 5JLFA 3LDLA 1KXPA 3UKUA 1T44A 2CH5A 4K41A 4QS7A 2J4RA 3D7EO 4RWTA 1BA1A 2P9KA 3UB5A 3JS6A 3VF2A 2P9IB 5B8HA 1MWMA 1X3MA 5AQVA 3WEEA 3IFRA 1NM1A 4FWMA 3KVGA 3UKRB 1KAXA 3VETA 2VYPA 2Q0UA 1Q18A 2ASOA 3QMLA 4CZHA 3M3ZA 3CI5A 4B1UB 4CBUA 5KPRA 1ATRA 1NBWA 1NGHA 2VWBA 3EKSA 2FSJA 1BUPA 3KHYA 5KQ8A 4B1VA 4BRGA 5AZIA 2IVPA 4CZJA 3VEOA 1U2VA 1GLEG 4H5TA 4CBXA 3R6MA 4EHTA 2QWOA 4CZFA 2QWLA 3C7NA 4H0OA 3VEZA 1BA0A 4B1XB 2E1YA 3CETA 3GL1A 4J8FA 3ZX3A 3R8EA 4IO8A 1X9JA 3O1WA 2Q0RA 2W40A 5CE3A 1NGIA 5AZJB 3ZX2A 4A62A 5KPTA 2QXLA 3LL3A 3OHRA 3RSEA 2P9UA 4H5WA 3HM8A 2V7ZA 4L3QA 4RTFD 1HKBA 3ZX0A 4BROA 3CERA 3FE1A 4BRCA 2H3GX 2I7PA 4GNIA 4O5FA 5BREA 2QWQA 2YHXA 3FGUA 5AQNA 3EL2A 2E2NA 3DWLA 2E2QA 4M7XA 4YDUC 3DXKB 3LDOA 5FPDA 3VERA 4DQ8A 5JICA 3W3DA 4BRPA 4BRFA 1X3NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VF4A 4J2BA 1UA0A 1P90A 2O8EA 1LWFA 4YDUA 3HOTA 4ELTA 1N33K 2V52B 4NXMK 2HB5A 3LP3A 1OH6A 4CF0A 1RT3A 2VG6A 1M1KO 1NGDA 2VGMA 3CJ9A 4A59A 2XRIA 4GMJB 3KD5E 2CGLA 2WFBA 1K8AO 3OYEA 3CMAN 1HNVA 3E1YA 5AQXA 5HRNA 4CIGA 4BRIA 3LWLA 4B9UA 4LD0A 2Q31A 3HJFA 2HHWA 1EQYA 4AHSA 4BWJA 2QW9A 3E66A 4FJGA 4IKFA 1RBUA 3HOSA 3D2EB 2YJFA 3HBTA 2UYTA 1HYVA 4FSVA 5IWAK 1QQNA 1EXQA 4JAXA 3OW2M 2P9SA 2F8TA 3SAGA 3CCMN 1E4FT 4KHUA 4KO0A 1Z05A 3ZSYA 3HT3A 3LDSA 3I0SA 4CVNE 3VQ9A 1J53A 3DM2A 4JLHA 4NLBA 4FOIA 3NH0A 1NGGA 4FW2A 4NCBA 4O8KA 1P8ZA 4BVOA 4I7FA 3UKRA 3ZSZA 1N5YA 3VQEA 1B92A 3CM6A 4JI7K 4DTOA 3HPHA 4GKKK 3DLGA 4FWOA 4YOXA 1NGAA 3KKRA 1OH8A 2HHTA 4JKFA 2GWKA 1Q9YA 4ELVA 3VOVA 4OO1J 5KRSA 4Z94A 2X6NA 3RWUA 1RT1A 3OYDA 3LDQA 4CFAA 5GADP 4KH6A 4FPBA 3VQ6A 3ZEUA 2ZWHA 3KK2A 2P9KB 3L3UA 3O4WA 1BU6O 4UY8O 3AO5A 1N8RO 3SZ2A 4DSEA 4JS5A 3CIPA 1ZBFA 4OX9K 4HTLA 4AF1A 1IKYA 3O3GA 3O5BA 1G99A 3Q7BA 3PO5A 1C0GA 1MU2A 4H0YB 4DQPA 3WQUA 2E2OA 3AVNA 4C8KA 4CJRA 3ENOA 1BO5O 2E4LA 2HMIA 4CGFA 4NO7A 3VESA 4ILGB 4K0KK 5AQYA 1WLJA 4BC3A 1JCEA 3S3NA 3ENHA 2Q36A 2PY5A 3KLHA 4DU3A 3DI6A 4R5PA 4BC4A 1NWKA 2O8BB 1KQSM 4FLZA 1MWKA 2QWRA 3CJ1A 4JK7A 4B9NA 4FLWA 1CLQA 4Y1CA 1J54A 1NGFA 4BR9A 4DV7K 2UXDK 3MXIA 2CGKA 2ZF5O 1TL3A 2WUSA 2HNZA 4DTPA 4ZTJA 3C94A 3DOKA 1X9SA 4KTWA 4DWIA 3WXKA 4KFBA 4H0VB 1FKPA 3PX0A 4CJ3A 4BQZA 3SPYA 3VTHA 3J7YP 4CFBA 3QDKA 1VQ8N 2RHKA 3DLRA 1QE1A 3QBWA 1KC8O 4CK3A 3B6OA 3E9LA 4YOWA 1MA9B 2G8IA 1YAGA 5E84A 5BRFA 4KREA 4BE0A 3O3FA 4KH5A 4BRHA 3JAMO 4CHNA 2HHUA 2GV9A 1NU0A 1LWCA 4CJWA 1WAJA 2YI1A 2Z1JA 3MECA 4B1YB 5BN8A 3PIPL 3O1BA 1QQMA 3ZT1A 3EY1A 5ADXA 4B9MA 4IWVA 3S41A 1NJYA 3SCXA 3N4QA 5FPNA 4A61A 3OYIA 3P5JA 2Q3SA 2KKZA 3FR0A 3HYFA 3DLLL 5J2PA 3ULEB 3CD6N 4BQLA 3KIOA 3CC4N 5AQWA 1HJOA 2P9PB 3L4IA 3OYNA 3AVKA 2YHYA 4YNQA 2ZD1A 4K25A 4DV6K 4W5NA 1HKGA 4IOCL 2GELA 1Q86O 4FVMA 4M3XA 4JKCA 3QEPA 5EOYA 1BWFO 1TUYA 3TAGA 1VQMN 4M42A 1RT6A 4FWKA 2UXBK 3ZSOA 3THVA 3ZT3A 2BDPA 3I33A 4QS8A 4CEZA 4Z4IA 2ZGYA 1Y97A 2ITMA 4CJKA 2XY7A 1N36K 2D5RA 3I56N 4H4OA 2D0CA 4CERA 1JJ2M 3THWA 3AVAA 3MEDA 4PKGA 5TKWA 3A5NC 3C6TA 4KTQA 3AGRA 2GUIA 3QBXA 4CEDA 3WNGA 4FZXC 3VMFB 4I6MB 4CHQA 3CPWM 4KHWA 3EZWA 3S5TA 1VHXA 2G8FA 4CJ5A 1FW6A 5AQIA 4DR6K 2KZZA 2O4IA 4RW8A 2G8UA 1D8YA 1C6VA 3CCQN 4KI6A 1DLOA 4FJKA 4XH1A 5JLHA 5AQPA 2KTQA 3KK1A 3M8SA 3HO1A 4WFAL 3QETA 4DS5A 5M1PA 1KAYA 2Q2RA 1SS6A 1JLQA 3K5OA 2Y1JA 2QA4N 2P9LB 3B6PA 4N47A 4E19A 4E1NA 4EAHD 4E89A 2B4JA 3AVGA 4BC2A 5EVZA 3QEWA 3HXMA 3NAEA 4A2BA 3SAFA 1IBKK 3CCJN 4IOAL 4GKJK 3VQCA 4JHDA 1FK9A 4EFHA 3WXMB 2AA4A 3U3YA 5AQLA 3CCEN 1T05A 2PZSA 4B08A 3NH1A 3AAPA 3D2EA 4JKHA 4CECA 1L3TA 4NLCA 5ELZA 3WXIA 4E72A 2OPSA 3NGYA 3M6GA 1EX4A 2QWMA 1QVGM 4FWSA 3BEXA 2ZJQL 3C6HA 1XWLA 1ZBIA 2BANA 1XHXA 4RW4A 1JLAA 2YJEA 3DRPA 3CCVN 3AARA 1RTIA 5FPMA 4CJUA 2GUPA 1I39A 3CJAA 4B3OA 1LW0A 3CPEA 1NK0A 1RNHA 1BHLA 4BE2A 3J8AA 4EIAA 3FZHA 3KD1E 1XNRK 4PUOA 4LF4K 4JKGB 4B8CA 2FBYA 1KXPA 1TAQA 3LALA 4CFDA 3CG7A 5GAGP 3VN5A 4B3MK 2P9KA 3UB5A 4FJLA 3JS6A 5AQVA 3F73A 1HMVA 3IFRA 1NM1A 1VSKA 3ZSXA 3UKRB 4WF9L 3PIOL 4CIFA 2ASOA 3OYMA 3RMCA 4K8XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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