2ASMA

Structure of rabbit actin in complex with reidispongiolide a
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
370
structure length
363
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 129
structure length 363
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asmA03
2A42A 4BRPA 2HOEA 4CZIA 5BN8A 5F1XA 4BG8A 5AZJB 3VENA 3LDPA 3G25A 4BRAA 4C23A 5KQDA 2F9TA 4EHTA 3RSEB 5FPEA 5AQKA 1RGIA 4CBUA 3ZX2A 4BR0A 4FOEA 1Z6RA 4ISFA 4QS7A 3M6GA 3O4WA 4CZLA 2FF6A 1MWKA 2Q1NA 1OKJA 2Q0UA 4Y0WA 4AM7A 5FPNA 1T6CA 3VGLA 5JICA 1MWMA 5EY4A 5BRHA 3VEVA 1S22A 2W41A 5ADXA 3B8AX 3QDKA 2FLOA 2NLXA 3R8EA 4GNIA 4KBOA 3ULEA 3ZX0A 1IG8A 2ZGZA 2YHXA 4BVPA 1QHAA 3F9MA 1BO5O 3AARA 2Q31A 1LOTB 3H6EA 1KAZA 2E20A 3KZBA 3KVGA 4FO0A 3TU5A 4GY2B 5AQPA 4A61A 2I7NA 3HSCA 3R9PA 4PKHA 3CHWA 4PKIA 5JLHA 2V7ZA 4H5RA 1EQYA 1GLFO 3FLCO 4CZHA 4K43A 4BRCA 4H0YB 3UKRB 2E88A 1S3XA 4CBXA 3WXKA 3O80A 4BRDA 3L6QA 4FWKA 5AZIA 1BA1A 3VF6A 4EIAA 3VEZA 3ULEB 3IDHA 2D1KA 4CJ7A 1ATRA 4HTLA 3VEWA 5BN9A 1TYQB 4BC3A 4XH5A 2GWJA 3FGUA 3ZETA 5AR0A 1RFQA 5BPLA 4PKGA 4I6MB 1G99A 2ITMA 4M7YA 3AAPA 3MN7A 1NGBA 3O1WA 4K41A 1KXPA 3UKRA 3U9DA 2P9IA 4AM6A 1NGHA 3MN6A 4FSVA 1BDGA 3ZEUA 4JAXA 1BUPA 1HJOA 1DGKN 3I8BA 4MLHA 3DXMA 3JXUA 4DHYA 4CZFA 1NGGA 5AZJA 1HKGA 4CZJA 3I33A 1NLVA 2PBDA 4FWRA 4MO5A 4A2AA 3BP8A 2V7YA 3ZETB 5E84A 3O1BA 2E2NA 1NGIA 1HKBA 3MMVA 4FL9A 1GLDG 3MDQA 4CZGA 2J4RA 2P9PB 3QB0A 4BRMA 5AQFA 3GDQA 2GTDA 3CJAA 4QS8A 3DWLA 4H5NA 4BROA 4FWSA 2KHOA 1YVNA 5AQQA 3BUZB 3VEYA 3D7EO 3M3ZA 3QICA 3DXMB 1SQKA 4PL8A 2E2PA 3WQUA 4IZ9A 3D2EB 3CJCA 4BC4A 1T44A 1T6DA 3ENOA 4H5VA 3EKUA 1R59O 4IWVA 5FPDA 2QWNA 1NWKA 1DKGD 3WXIA 3LL3A 5AQWA 2D0PA 2Q2RA 3SJHA 2NZTA 2VYPA 1BOTO 4FWNA 4Z94A 5JMVA 1SAZA 5BPMA 4B1UB 3LDQA 3M1FA 4BREA 4CZEA 3VPZA 2AP1A 2YHWA 4WYBA 1LCUA 3HZ6A 4H0PA 2E1YA 2FSJA 5JLFA 1QQMA 4MLEA 4F9OA 1X3MA 3QBXA 4FWOA 4A62A 1GLLO 4CD3A 2IIRA 5B8HA 3DXKA 4ISGA 5AQJA 4BRHA 3WQTA 2A6AA 3SLCA 2YJEA 4BRQA 1Q18A 1TYQA 2YHYA 3L0QA 1QZ6A 2QWRA 3LDNA 1E4FT 1U2VA 1ZBSA 2I7PA 4XEIA 3VEOA 3W0LA 2GELA 5AQSA 1BWFO 3HBTA 3VOVA 3FR0A 5F2RA 4BR5A 4FWPA 3GOIA 5BREA 5F0XA 2F9WA 3H1QA 1NMDA 3WEEB 1Z05A 3VEXA 5ELZA 1MDUB 2P9NA 4RWTA 2W40A 5CE3A 4JHDB 2CH6A 2CH5A 4BG9A 4QS9A 3VGKA 2OANA 3O08A 3UKUA 4ISEA 2Q36A 2CGKA 1JCEA 1HX1A 3FZMA 4B1WB 4YDUC 4HWIA 4JD2B 2GUPA 3H1VX 4RCHA 4IJAA 1U2VB 3O6WA 1WOQA 4K42A 1CZAN 5KQ8A 2QWPA 3UE5A 4DCHA 5KPRA 3OHRA 3DJCA 2YI1A 3RSEA 3H46O 3FE1A 1GLJO 1KAYA 3IUCA 3WEEA 1BU6O 5TKYA 3EKSA 2P9KB 3O5BA 3VF4A 3MK6A 1GLEG 2ZWHA 3L4IA 1GLAG 5E26A 4WQ4A 3J8AA 4BRFA 4RTFD 3ATUA 1HPMA 1XQSC 3A5NC 4CZKA 3VETA 4H0TB 2PAVA 3BF1A 3D2EA 4E1JA 2VCPA 4EHUA 4B1VA 4DQ8A 3BF3A 1JCFA 5EX5A 4H5TA 3FZFA 4BRIA 1GLCG 4FPAA 3D2FA 4BR7A 1RDWX 1JCGA 4FWMA 5LJWA 2E1ZA 4CBWA 1U6ZA 3CJBA 1ZXOA 2P9UA 3AY9A 3WXLA 1C0FA 3A5MC 4L3QA 4XH1A 3SMPA 2ASMA 3P4IA 1HLUA 1ATSA 2HF3A 2GWKA 3AAQA 3BEXA 3ZEUB 1YUWA 3IFRA 5AQXA 5AZIB 3FFKB 3WUHA 1DEJA 3QBWA 3EL2A 3MN9A 1K8KA 4BR4A 2BUPA 3CETA 5AQMA 1NM1A 5EVZA 4BQLA 3MN5A 3HI0A 5AQOA 2UYTA 5AQNA 4H0VB 4B1YB 2P9SB 2CGLA 3D2FB 5BRDA 2E2OA 2A41A 5LJVA 1NGJA 2QWMA 2FF3B 4WQ5A 1X3NA 3WXJA 5BRFA 5BR9A 3O8MA 4WQ4C 1P8ZA 3GG4A 4BRNA 4IXCA 4O5FA 3H45C 4FWQA 1HKCA 3CQXA 2V51B 3EZWA 1NGFA 2V52B 4XH4A 1YAGA 3QFPA 3LM2A 1NGEA 3ZX3A 1K8KB 1QQNA 3CJ7A 3CI5A 3C0BA 3EN9A 4FOIA 3JS6A 2HF4A 2P9LB 3FZKA 2QWLA 1ATNA 5AQRA 2P9SA 4J8FA 2QWQA 1BA0A 1XUPO 4H03B 3VGMA 3EO3A 2ZF5O 3SK3A 3CQYA 4FPBA 4IO8A 2P9KA 3W3DA 4O8KA 3HM8A 4EAHD 2P9IB 2D4WA 3KHYA 3SMSA 5AQVA 2DPNA 4M63C 1Y64A 4M7XA 1NGAA 3VERA 1TUYA 1KAXA 4B1ZA 5AQHA 1IJJA 4DB3A 4BGAA 5BPNA 2ASPA 3A8YA 3A0IX 1GLBG 1MA9B 5AQYA 1XC3A 2YCHA 3CJ9A 3U4LA 2ASOA 4NB4A 5AQTA 4A2BA 3FZLA 1NGCA 3TPQA 3A5LC 1E4GT 3C7NB 3GBTA 3VESA 5KPTA 1HUXA 2P9UB 3LDOA 3H3NO 5AFUA 4BGBA 4B1XB 3GE1A 1J6ZA 3R6MA 3ATVA 4B9QA 4JNEA 2FSKA 5AFUH 5LY3A 2QM1A 3UKUB 4H0OA 3CIPA 5FPMA 2BTFA 2ZGYA 4BR2A 3IMXA 3S41A 2Q97A 1TUUA 1ESVA 2AA4A 4H0XB 4JD2A 1NBWA 1YXQA 2FSNA 2FXUA 3CJ1A 5AQGA 3VF2A 5EXWA 3U9ZA 1BG3A 4BRKA 4NO7A 4BQZA 1V4TA 4K25A 2Q0RA 2VWBA 3C7NA 3ID8A 1QZ5A 1C0GA 1X9JA 2HMPA 2P9PA 5I9EB 2IVNA 3LDLA 3QFUA 2P9NB 3LM9A 4JHDA 2NRHA 1ZC6A 4BC2A 5AQLA 3A5OC 3MCPA 2E2QA 1SZ2A 4PL7A 3GL1A 3CERA 1WUAA 2IVPA 3DXKB 5AQIA 4LC9B 2CGJA 3QMLA 2WUSA 3U8XA 4H5WA 3ENHA 4FWLA 3WT0A 1D4XA 4WQ5C 3DAWA 2A3ZA 2P9LA 1QQOA 4YDUA 3FZHA 4CD1A 3HTVA 2QW9A 3H3OB 1V4SA 2A5XA 3UB5A 4IJNA 4I6MA 2EWSA 4BR9A 1NGDA 2QXLA 4BRLA 4MO4A 5ADXH 5EOYA 4JN4A 1H1VA 2H3GX 4EFHA 5AQZA 5AQUA 4CI6A 2QWOA 4BC5A 2E8AA 2IVOA 5KPZA 4CZMA 4BVOA 2A40A 2D0OA 2GEMA 4BRGA 2YJFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H8KA 3L2VA 1U48A 3OYJA 4CZIA 5BN8A 1YF5L 5AZJB 3E9LA 3LDPA 1SL1A 3RWUA 3DRPA 3G25A 5I3UA 5JVGL 3OTOK 2F9TA 3V1QA 3OYMA 4C8KA 4XJXA 2RF2A 4PWDA 3HM9A 1ASWA 4ISFA 4O5BA 2FF6A 1MWKA 2E4LA 4AH9A 3KLHA 1CZ9A 4AM7A 4EP5A 2AJQA 3G10A 2XY8A 3HVRA 3NGZA 2O8BB 5BRHA 3J80O 3VEVA 3ZT1A 5ADXA 4FJGA 3I8DA 3BGRA 3R8EA 1VRTA 4GNIA 4N47A 3ZX0A 1IG8A 5CR4A 4E7JA 1GOAA 4J2DA 3AARA 3TAEA 1LOTB 1KAZA 2X74A 3LDSA 1VHXA 3VQ9A 5C0YA 2NRWA 4BE1A 2FBTA 3R9PA 3ZSYA 4CJQA 3LZIA 5A2QO 2OCEA 4CERA 4BE0A 2Z1JA 4FLXA 4B9TA 4CBXA 3O80A 3ZYYX 4KREA 4CGFA 4NCAA 5CYMA 4IDKA 2O4GA 3MWTA 4FWKA 3ULEB 2QA4N 2BGGA 2DY4A 4CJ7A 1FJGK 4HTLA 3L2RA 3AGKA 1X9MA 5BN9A 4Z4EA 2UUCK 2ITGA 1JLEA 3CCJN 3E01A 1RNHA 3QEXA 4M42A 1HNVA 4I2QA 3ZETA 1O1WA 4DUYK 3HYFA 1RFQA 2UXCK 1YIJN 2HHSA 3K9JA 2ITMA 2XY6A 1W2BM 4AILC 4NYNA 5H1SQ 1VQ4N 4M7YA 2UUAK 1NJZA 4OLBA 3SUPA 3U9DA 2GV9A 4F2RA 3V4IA 1NGHA 3HO1A 4I9LA 2KTQA 3OYKA 1RDCA 3BZCA 3JXUA 4IFYA 3VQCA 4CZFA 3OW2M 5AZJA 1HKGA 4M3UA 2QKBA 1LWEA 1NLVA 2PBDA 4FWRA 2X6SA 1TGOA 1RDUA 2RN2A 3BP8A 5E84A 3O1BA 1REVA 3Q7CA 1VRUA 1NGIA 4CGJA 2UU9K 1GLDG 5C25A 3DMJA 4KPYA 4F3TA 2P9PB 4BRMA 4QS8A 4BROA 2LSNA 4AHCA 1S9GA 2IGIA 3D7EO 2O4IA 3OS0A 2HNDA 1NJIO 4CE9A 4M3RA 3JSMA 1YITN 1SQKA 4A5AA 4BC4A 3QEVA 4H5VA 3ENOA 1RBSA 3EKUA 4IWVA 1NKCA 2OPPA 1DKGD 3V9WA 3LL3A 3KLFA 3VQBA 4F2SA 3AV9A 4L8RB 2HHQA 3ID6A 5JMVA 5BPMA 4M3WA 3SI6A 1TVRA 1HPZA 1MU2A 4XIUA 3M1FA 3VPZA 5D3GA 1JLFA 3CCSN 1LCUA 3HZ6A 4H0PA 3ZT4A 2E1YA 3OYBA 5JLFA 4FK2A 4MLEA 4DTRA 5CZ1A 1EKEA 1X3MA 4JKCA 1ASUA 1GLLO 2GUIA 3PO4A 3CYMA 2A6AA 2YJEA 3E1YA 4BRQA 4KH5A 5HOOA 4JI7K 2QWRA 3M8SA 4CFCA 5AQSA 1U04A 3NF8A 1JLAA 3HBTA 5F0XA 3GOIA 1N5YA 3QNNA 2F9WA 3LAMA 4C1NI 4DWIA 1KTQA 4RWTA 2W40A 4OO1J 4TSXA 3SJJA 1S1TA 4DS5A 4CHYA 3RR8A 4CK1A 2OANA 3O08A 3K5LA 1VQMN 1SKWA 4DR4K 4FJ8A 1ZBHA 4AF1A 1JCEA 1SV5A 3P5JA 3CPEA 2BE2A 4Q5VA 2G8VA 4RCHA 4IJAA 4F3OA 2F8TA 4K42A 4YOWA 2QWPA 4HUEA 3TSQA 1D8YA 1VSLA 2YI1A 2WONA 3H46O 1KAYA 3FE1A 1TL3A 4OGCA 1E3MA 3WEEA 1JLQA 2HBKA 3AVBA 3MK6A 3DOKA 3THXA 1GLAG 3T1YK 1LW2A 4IBNA 4ID1A 4DV4K 1U49A 4CIGA 3HXMA 1XQSC 4CZKA 3LPUA 4DTNA 4M3ZA 3KIOA 1QS4A 2YHAA 3K58A 1HRHA 3NHGA 3LP0A 1UA0A 2PY5A 3SQ1A 4U67L 4PHTX 3FZFA 3O9UA 1VQON 3P38A 2R7YA 4AHTA 4W5TA 5LJWA 4CBWA 2YNIA 3F9KA 1U6ZA 3OVNA 1BQMA 1ZXOA 2P9UA 3AY9A 1C0FA 2W6LA 3HVTA 4L3QA 4WFBL 3AO5A 3NGYA 3QESA 3BEXA 1QHTA 4CF1A 4IEIA 3FFKB 4JI2K 4JK7A 4BECA 3MN9A 2BUPA 2O8EA 3OYHA 4FJMA 5EVZA 2OPRA 3AGRA 3RRHA 4M3XA 1EXQA 2JWLA 5AQNA 3LZJA 4B1YB 4CIEA 4EZ6A 3TAFA 1Q7YO 3NF6A 1BHLA 3O3GA 1WBBA 4FJ9A 1X3NA 4PA1A 4CJTA 2BDPA 2HNZA 5FROA 2KKZA 2IAJA 4O5FA 4IFEA 4DSIA 4N76A 1HKCA 1HR0K 2V51B 3JYTA 1FXXA 2KQ2A 1FKOA 4DTXA 3LM2A 3MEDA 5GIOA 3VA3A 2HVHA 1ZBFA 3C0BA 3AA5X 2P9LB 3AVKA 1NU0A 5AQRA 2QWLA 3AVAA 3TAGA 2P9SA 1BA0A 1XUPO 3QEWA 4B3TK 3VGMA 2QK9A 5M1OA 1ZYQA 3CQYA 4FPBA 1IKYA 2NUBA 4IO8A 4LY7A 2D0AA 4RW8A 3HM8A 4OKKA 2NRZA 3O9RA 3HK2A 4GW6A 1Y64A 3VERA 4DB3A 2WTUA 1NMNA 3AO1A 1WSFA 1CXUA 3A8YA 1GLBG 1MA9B 4W5RA 4WFAL 2Z1HA 3PO5A 2BANA 1QE1A 2NRVA 3CJ9A 4CEOA 4AHRA 1OH5A 5SWMA 1NGCA 2OPSA 3TPQA 2X78A 4IKFA 4DU4A 3PUFA 1E4GT 2F4VK 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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