1T44A

Structural basis of actin sequestration by thymosin-b4: implications for arp2/3 activation
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
publication title Structural basis of actin sequestration by thymosin-beta4: implications for WH2 proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chimera of Gelsolin domain 1 and C-Terminal domain of thymos
total genus 123
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1t44A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1t44A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1t44A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1t44A04
3CJ1A 1Y64A 1E4FT 2AP1A 3FZHA 4H0OA 4B1VA 4A2AA 3JS6A 4FSVA 4HTLA 2PAVA 3DXKB 4IXCA 4H5NA 1MDUB 4XH5A 2QXLA 1GLLO 2IVOA 4FWPA 1SQKA 3WXLA 3R9PA 3WEEA 3U9DA 1BOTO 2KHOA 4H5TA 2ZWHA 3QDKA 2FSJA 3CJAA 3LDNA 1NGGA 1MWKA 3EL2A 1QZ6A 5EVZA 5EOYA 1X3NA 2FSKA 4BG9A 3VGKA 1R59O 3IFRA 3LDQA 4CZJA 3D2EB 4IWVA 3ZETB 2BUPA 3AY9A 3H6EA 3GBTA 2QWPA 3M6GA 4CZFA 4H0TB 2A42A 4BR2A 3KHYA 3O6WA 3GDQA 2E88A 4BRNA 3ULEB 5BRFA 1NGCA 2A6AA 3R8EA 3A0IX 3HBTA 4NO7A 1GLDG 4CBUA 3VERA 4BRAA 3FR0A 2GUPA 4JAXA 1C0GA 2E20A 3MCPA 1GLAG 1BG3A 4PKIA 3LDLA 4CD1A 1NLVA 5ADXA 4H0YB 4BVPA 4I6MA 2Q0UA 4L3QA 3ENOA 2QWOA 2Q97A 2YHXA 3A5OC 3DXMB 3HZ6A 5AQXA 5EY4A 3DAWA 4RTFD 3IMXA 2P9UA 1DKGD 4B1XB 3ATVA 5ELZA 4RCHA 3O8MA 3ZX3A 2FF6A 3VEXA 2ASOA 1YXQA 3MDQA 4DHYA 3AAQA 4K41A 4GNIA 1NMDA 3WQTA 5AZJB 4FWLA 1OKJA 1NM1A 1NGIA 5AQPA 1T44A 4K25A 2P9LA 3MN7A 1LOTB 3W3DA 2FF3B 1RGIA 3VEWA 1J6ZA 3H1QA 3O4WA 3DWLA 2HMPA 2P9SB 3CQYA 3BUZB 3MN6A 4FWQA 5BRHA 2GEMA 4CJ7A 2BTFA 3HM8A 3L6QA 5FPDA 2I7PA 2ZF5O 5ADXH 4FO0A 4BRGA 2P9NB 2P9SA 3QICA 3VEOA 1BU6O 1GLCG 3MN9A 3VENA 3QFUA 1ZBSA 2IVPA 5AFUH 4WQ5A 3CETA 5AQNA 1HKGA 3VEYA 4GY2B 2PBDA 3SJHA 3EN9A 2QM1A 3SMSA 4QS7A 1CZAN 1HJOA 4WQ5C 3CIPA 4EAHD 3I33A 4FWKA 4BGAA 3GOIA 4BG8A 2YI1A 3U8XA 2D1KA 1XC3A 5AQQA 5FPMA 5F2RA 3H46O 4EHUA 4XH1A 2A5XA 4BC5A 1DGKN 3EKSA 3KZBA 3LL3A 1QZ5A 4KBOA 3WQUA 1NGBA 3FFKB 1NGFA 1MWMA 3WEEB 1HLUA 3W0LA 4FWSA 1ESVA 2V7ZA 2E2QA 3G25A 3MMVA 4CZGA 4RWTA 4MLEA 1TUYA 3FLCO 3U4LA 4H5VA 3SK3A 5AQJA 2P9KA 4JD2A 4EIAA 1HUXA 2VYPA 4HWIA 4BR7A 3DJCA 4ISFA 2NZTA 5CE3A 2WUSA 4FPBA 4DCHA 4IJAA 3VGLA 3BP8A 3P4IA 3R6MA 4PKGA 1TUUA 3VF6A 5BPNA 1BUPA 4C23A 3TU5A 1EQYA 3WXKA 4FWNA 2P9PA 2Q1NA 2CH6A 2GTDA 4BRFA 4BRDA 5LJWA 3A5LC 3AAPA 5B8HA 2YJFA 4BRMA 1C0FA 4AM6A 2H3GX 5LJVA 1SAZA 4I6MB 3RSEA 3D7EO 3WXJA 3ID8A 3C7NA 2YHWA 1V4TA 3ATUA 4CZKA 2V51B 1BDGA 3B8AX 1WOQA 5FPNA 4BR9A 1NGJA 1ATSA 2P9UB 1SZ2A 1K8KA 1ATRA 2QWNA 4BC2A 4BQLA 3VOVA 3SLCA 5AQFA 2E1YA 1BA0A 5AFUA 1WUAA 4JHDA 4CBWA 3CQXA 2P9LB 2QWQA 4DB3A 5JLFA 3LM9A 2IVNA 3QB0A 3VGMA 5JICA 2F9WA 3H3NO 4PKHA 5AQZA 5AQTA 3CJBA 2P9IA 2Q2RA 3IUCA 4MLHA 3ZEUA 3MK6A 1HKCA 3HSCA 1IJJA 2D0OA 2ZGYA 3MN5A 4BRCA 3EKUA 5AQRA 1BA1A 2ASMA 3O5BA 4CZEA 3CJCA 5BRDA 3F9MA 5KPZA 2V52B 3I8BA 4BROA 3O1BA 5TKYA 1TYQA 1ZXOA 1GLEG 2E1ZA 4M7XA 3OHRA 2QWRA 4BR0A 4NB4A 4BRPA 1NGDA 1GLJO 4H5RA 2CH5A 4QS9A 3O08A 3FGUA 3D2FA 2GELA 3WT0A 3FE1A 5AQIA 1ATNA 4K42A 4IZ9A 3VEVA 4QS8A 1NGEA 2D0PA 3LDOA 5BPMA 4LC9B 5JLHA 2F9TA 3UKUA 5AQLA 1T6CA 4MO5A 1DEJA 3CHWA 3C0BA 4BR5A 4H0VB 4F9OA 4FWMA 1Q18A 3VPZA 4BREA 3ZX0A 3UKRA 4E1JA 1S3XA 1U2VA 2FXUA 4CZHA 3UE5A 3M1FA 2ZGZA 3CERA 4BC4A 3H45C 4IO8A 4JNEA 4CBXA 4B1WB 3VF2A 2NLXA 3L4IA 2A3ZA 1MA9B 2P9KB 5E84A 3UB5A 5LY3A 4CD3A 4JD2B 4MO4A 2HOEA 3S41A 4Z94A 5AQOA 4WYBA 3TPQA 3FZMA 4M63C 5FPEA 3O1WA 1D4XA 3H1VX 1JCGA 1X9JA 1BWFO 3EO3A 4CI6A 1IG8A 5AQUA 1H1VA 1NWKA 2W40A 3A5NC 2A41A 1YAGA 1KAXA 5AR0A 2YCHA 4EHTA 3JXUA 4BC3A 2AA4A 1QQMA 4DQ8A 1GLFO 2D4WA 2P9PB 4B9QA 2HF4A 5AZIA 2QWMA 3AARA 4FWOA 3GE1A 2NRHA 3QFPA 1KAZA 4CZMA 3ENHA 2Q0RA 4IJNA 2W41A 2Q31A 1YVNA 4BRLA 5BN8A 3RSEB 3ZX2A 3J8AA 2E2OA 4WQ4A 3C7NB 2OANA 3QBWA 4PL8A 1KXPA 3FZKA 2QWLA 3DXKA 1QQOA 5AQSA 2ITMA 5EX5A 3L0QA 4WQ4C 1YUWA 3CI5A 1GLBG 4H0XB 1X3MA 1K8KB 1QQNA 1JCEA 3CJ9A 1QHAA 1BO5O 2YJEA 4BVOA 4A61A 4JHDB 4YDUA 3GG4A 5F1XA 4BQZA 2GWKA 4FL9A 2CGJA 4XEIA 3M3ZA 3BF3A 5BREA 1HKBA 3D2EA 4YDUC 3ZETA 1RFQA 4A62A 2P9IB 3A5MC 2YHYA 3ZEUB 1U6ZA 1V4SA 3FZFA 2QW9A 4CZLA 4EFHA 2FLOA 3ULEA 4BRQA 4H03B 3WUHA 2E2PA 1T6DA 3QMLA 4FOEA 3VEZA 3WXIA 4BRIA 4AM7A 4CZIA 2I7NA 2E8AA 5JMVA 4XH4A 4B1ZA 5KQ8A 2UYTA 5AQKA 3O80A 2FSNA 3LDPA 3KVGA 3QBXA 3EZWA 1TYQB 2IIRA 2CGLA 1JCFA 1HPMA 1Z6RA 4A2BA 3U9ZA 3BF1A 4BRKA 3DXMA 3HI0A 3D2FB 5AQGA 2VWBA 1NBWA 2V7YA 3FZLA 3VF4A 2HF3A 4Y0WA 4FPAA 3GL1A 4BGBA 1NGAA 5KPRA 3CJ7A 5BPLA 3UKUB 2CGKA 5I9EB 4H0PA 5AZJA 5KPTA 5AQYA 3SMPA 3UKRB 2A40A 1U2VB 2Q36A 4FOIA 4J8FA 4JN4A 3H3OB 2J4RA 5EXWA 4BRHA 3HTVA 5AQWA 5AQMA 3VESA 5BN9A 3IDHA 4PL7A 4FWRA 4M7YA 4ISEA 4B1UB 4B1YB 4K43A 1ZC6A 2GWJA 2EWSA 3LM2A 2P9NA 1NGHA 2ASPA 2VCPA 4ISGA 1G99A 5E26A 1XUPO 5AQVA 1XQSC 2DPNA 4O8KA 1P8ZA 1HX1A 3A8YA 5F0XA 4O5FA 5AQHA 4BR4A 5AZIB 4H5WA 3BEXA 1Z05A 5KQDA 1KAYA 2E2NA 1RDWX 1E4GT 1LCUA 5BR9A 3VETA 1S22A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2B6AA 4CJLA 4A2AA 4AHCA 2G8KA 1XNRK 4A57A 4K8ZA 1MDUB 2QXLA 4Q0BA 2O8BB 3WXLA 4DTUA 1WN7A 3ZT1A 4GV6A 2QI2A 2KHOA 2HHQA 3T69A 3LPUA 1RTHA 2FSJA 5KTQA 3KK1A 1MWKA 1QZ6A 2G8WA 1U48A 1HRHA 1X3NA 4JI4K 1R59O 2D0CA 4CZJA 3O9RA 3DRRA 3HOSA 1BIUA 3AVGA 1OH7A 1HJRA 2A42A 4WE1A 3O6WA 4BR2A 3GDQA 4I2QA 1IKYA 1VQ9N 4CJWA 1GLDG 3U3YA 2KZMA 3FR0A 4CJFA 3NF9A 3SCXA 1BHLA 2YHBA 1VSLA 3ZSZA 1E3MA 2HBKA 4F4KA 2NRRA 3VQDA 3J81O 1YTAA 3LDLA 4PKIA 1ASWA 3DYAA 5ADXA 4AILC 5C42A 3SUPA 4RW4A 3U6FA 4CEFA 2QWOA 3MWPA 4HUEA 2E6LA 2XY7A 5EY4A 3MXIA 1K6YA 3SV4A 3M8RA 4FLXA 3IMXA 1RDUA 4B1XB 3ATVA 5ELZA 4RCHA 1RT2A 3ZX3A 1QE1A 3VEXA 1YXQA 3MDQA 3AAQA 4GNIA 1BQNA 2QA4N 2OTLN 1NGIA 2P9LA 2IOCA 3MN7A 3CCEN 4CGGA 5M1NA 3O3GA 1J6ZA 2NRWA 4DTMA 5SWMA 2P9SB 3CQYA 3EE9A 1J9AA 3ULDA 3BUZB 4FWQA 4JI6K 3HM9A 4CJ7A 3HM8A 2I7PA 4O0JA 4FO0A 2VWJA 2VGNA 4BRGA 4B3TK 4DR7K 3VEOA 3M8QA 3QFUA 1BCMA 4MFBA 1TGOA 5AFUH 5C12A 4WQ5A 3VQQA 1JLBA 2PBDA 3SJHA 3LP1A 3AA4A 3EN9A 2BANA 3K2PA 2F4VK 1CZAN 4K0KK 3MEEA 4WQ5C 3CIPA 4H8KA 4CF1A 3T1AA 4LFCK 3SPYA 4N41A 1N8RO 1BGXT 4KB1A 1XC3A 3V9UA 4O4GA 3H46O 1K8AO 2YV0X 2A5XA 4LY7A 3DM2A 3P39A 3NH1A 1WSFA 3KZBA 1NGBA 4RW9A 1NGFA 5CZ2A 3W0LA 3CCUN 3KK7A 3SYZA 2V7ZA 3O4NA 4A5AA 3CCJN 2VQFK 3CFRA 1TUYA 4OPJA 4B8CA 4UY8O 1RDDA 3CCRN 4EIAA 1HUXA 3OYGA 3MX5A 1W7AA 1JL1A 3CM6A 3JAMO 1HNVA 4N56A 3VGLA 3AVHA 3R6MA 4PKGA 5HRPA 1OH5A 4GV9A 1RDAA 3BGRA 3QINA 2OZSA 4HTUA 2P9PA 2D0BA 1IBLK 1UWBA 3AO1A 1C0FA 3AA2A 5LJVA 4I6MB 3AVNA 3RSEA 1T7PA 3ID8A 1JKHA 3O9QA 3NH0A 3AVKA 1V4TA 3S9HA 2KFNA 1WSIA 1W2BM 3O3FA 3B8AX 2VQEK 2PY5A 3EE8A 1SZ2A 1K8KA 1ATRA 2QWNA 3LP0A 4NCGA 3WNEA 2X74A 2ETJA 1WUAA 5M1PA 2W6KA 2BH1A 3HXMA 4KO0A 3LM9A 4FJ8A 3VGMA 4DTNA 3CC2N 2F9WA 4Z4GA 3I0SA 3EY1A 2Q2RA 3DRSA 1HKCA 4DFMA 3V9WA 3HSCA 4YORA 1IJJA 4DU3A 2ZGYA 3DLRA 1SKWA 5KI6A 5AQRA 3V1QA 1YJWN 1BA1A 3AVBA 1U4BA 1VQMN 1OH8A 1BIZA 4DV1K 3E66A 4NXMK 3O9TA 3F9MA 5BRDA 4DU1A 3I8BA 2ATQA 2C1IA 1EXQA 4FJLA 3CYGA 4CJTA 1GLEG 2XO7A 2OA8A 3OHRA 4JEPA 3THWB 4BRPA 1NGDA 1GLJO 3AO5A 1D9FA 2C1GA 4DSEA 2ZJQL 1W0HA 4KHPK 3VEVA 4FJIA 1O13A 4LC9B 1REVA 3WXMB 2XHBA 3HVTA 3C0BA 4BR5A 4H0VB 4F9OA 4I7FA 4FWMA 1Q18A 3R3LA 4OJRA 1M1KO 3UKRA 1S3XA 1U2VA 4CZHA 3CERA 4PWDA 3BZKA 3C6UA 4DFJA 4B1WB 2NLXA 1HYVA 2A3ZA 1MA9B 1NMNA 3CCLN 3HPOA 3S41A 4OPAA 1TK8A 4Z94A 4WYBA 1A5XA 1YHQN 2RN2A 3AVCA 4E0DA 3DLGA 3KLEA 4CFBA 4AHUA 3A2FA 2UXBK 1JCGA 1KVCA 1BWFO 3EO3A 4CI6A 1KD1O 2OCEA 1IG8A 5AQUA 4FJJA 1H1VA 2W40A 3PSFA 4OPHA 1RT7A 1KAXA 4FLWA 4BC3A 2D4WA 3MXJA 2HF4A 4DFKA 3AARA 4IFVA 4FWOA 3TWHA 1HYSA 4FJ5A 1XMOK 3SUNA 2B5JA 4CZMA 3MCAB 5HRNA 4FJGA 2KW4A 2UU9K 1BI4A 3ZX2A 3J8AA 2E2OA 3C7NB 2OANA 4PL8A 3AO4A 2RPIA 3S3MA 4CJVA 3DLKA 1EP4A 3LZJA 4YOTA 1X3MA 4M3UA 2YNGA 3P1GA 4LF5K 3VQ5A 1QHAA 4BVOA 5GIPA 4FLZA 5JS2A 4YDUA 1S1TA 4BQZA 4FL9A 2CGJA 4XEIA 3M3ZA 1FKOA 4YDUC 4CEOA 4A62A 4CHOA 4Z4FA 2YHYA 1DTTA 3THXA 2QW9A 4EFHA 4M3XA 2FLOA 2OPPA 1NK7A 1O1WA 4H03B 2E2PA 4JI0K 5EU7A 4E7JA 3QMLA 4FOEA 1XNQK 3WXIA 1ZBFA 1HR0K 2E8AA 3SAFA 1CLQA 4JYAK 3SQ2A 4CEAA 4CCHA 5KQ8A 1NG9A 2UYTA 4CFDA 5AQKA 2DFEA 3PO4A 3VQPA 3LDPA 3HP6A 1CZ9A 4OKJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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