1T44A

Structural basis of actin sequestration by thymosin-b4: implications for arp2/3 activation
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Chimera of Gelsolin domain 1 and C-Terminal domain of thymos
publication title Structural basis of actin sequestration by thymosin-beta4: implications for WH2 proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 123
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1t44A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1t44A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1t44A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1t44A04
5ADXH 1QZ5A 1RGIA 3QICA 2PAVA 5AQTA 1HJOA 3VEYA 2QWRA 4NB4A 4CBUA 2QWQA 2A3ZA 3ZETA 3FZLA 3L4IA 4Y0WA 2QWNA 3CQYA 2I7PA 4CZIA 2YHWA 4Z94A 1K8KB 3UKRA 4IZ9A 3RSEA 4JHDA 4FWRA 3M6GA 4QS9A 5AQZA 1U2VB 4FWLA 4KBOA 3CQXA 3U9ZA 2P9IB 3CJ7A 1BA1A 4BRPA 3SMSA 3W3DA 4CZMA 2ZGZA 3H6EA 5LJWA 1K8KA 1KAYA 3LM2A 4RWTA 2E2PA 1YXQA 4BQZA 5AQMA 1U2VA 2NZTA 2Q0RA 5EY4A 4CZFA 3A5OC 1NGAA 5CE3A 4A61A 1WOQA 4FSVA 4WQ4C 5ELZA 1DGKN 5LY3A 3HI0A 5AQGA 4A62A 4L3QA 2P9KB 3O4WA 1XUPO 3U9DA 4H5RA 2AP1A 2YHXA 5FPDA 2A6AA 3QMLA 2D0PA 4BC4A 4WQ4A 3MN7A 4FOEA 4B1UB 3VGLA 2ZGYA 4BRMA 3KZBA 3VETA 3H46O 4BRNA 4DCHA 1XQSC 1NGDA 3WXJA 2P9KA 4FPAA 1X3MA 3P4IA 3BF1A 1BUPA 3EKSA 4H03B 2D0OA 3L6QA 3LDQA 4CZGA 5ADXA 1BA0A 1X9JA 3ULEB 4BRCA 4BG8A 1GLFO 2HOEA 2P9NB 4ISEA 5FPMA 4MO5A 2P9LB 3A0IX 5AQKA 4IXCA 4H0XB 2WUSA 1NGCA 3H1VX 3DJCA 1HUXA 1NGGA 3FR0A 4H0YB 3HTVA 5AQIA 4MLEA 3DXKB 5AQQA 1LOTB 4BG9A 2CGKA 1D4XA 1MA9B 2P9NA 3LM9A 1S22A 2DPNA 3A8YA 2P9LA 4BR4A 4BQLA 3CJAA 1ATRA 4M7YA 2FSNA 3CJ1A 4BREA 4B1ZA 2D4WA 2P9UA 1EQYA 4XEIA 5AQLA 4BRFA 3WQTA 1GLBG 4QS8A 3DXKA 4K25A 4BRAA 3VOVA 2AA4A 3FE1A 2F9TA 3I33A 4FWQA 4BGAA 1WUAA 2V52B 5F2RA 5AQUA 2Q31A 5EVZA 2Q0UA 3FZHA 4XH4A 2A41A 3KHYA 5AQOA 2Q97A 2P9SB 2VWBA 5JMVA 1NGJA 2GWJA 3GBTA 5AQFA 3VEVA 3ENHA 1BWFO 4LC9B 3G25A 4H0TB 4RTFD 2Q36A 1BO5O 4CBXA 3WUHA 4F9OA 2W41A 2GTDA 2FF3B 1V4SA 3ATUA 3UE5A 2P9SA 3VESA 1HKBA 4BR2A 3VERA 2Q2RA 4MLHA 1JCEA 3VEOA 5FPEA 2ASPA 3R6MA 4H0VB 1YAGA 3ZX2A 3CJBA 1GLCG 2J4RA 3LDPA 3O1BA 3EO3A 1NGBA 1GLAG 1ATSA 3VGKA 5EX5A 1QHAA 1T44A 1BDGA 1GLDG 3VEWA 5AQWA 2OANA 5AQRA 5AR0A 2QWMA 3U4LA 1NLVA 3C0BA 1NM1A 2YHYA 3CI5A 1NGFA 3MN5A 3MN6A 1LCUA 1H1VA 2P9PB 2PBDA 1DEJA 4NO7A 2P9IA 1QQNA 3UKUB 1IJJA 2CGJA 4PKHA 1IG8A 3O1WA 4O8KA 1GLEG 2VCPA 3L0QA 4IWVA 4EAHD 3FZKA 1HLUA 4EHTA 4BRKA 2GEMA 3ENOA 3O8MA 3HM8A 3WXIA 3LL3A 2CGLA 4FOIA 2NLXA 2P9PA 4H5WA 3EZWA 3A5MC 1Y64A 4I6MB 3UKUA 4XH1A 3HBTA 5EOYA 2HF3A 2EWSA 2IVPA 1Z6RA 5BRDA 5F0XA 3H1QA 3MMVA 3OHRA 5AQYA 4H5NA 1U6ZA 1TYQB 4CD1A 5JICA 3BEXA 2KHOA 1HKGA 1NGIA 4I6MA 3SK3A 4K42A 3D2EB 1G99A 3GOIA 4BC3A 4ISFA 2E88A 4MO4A 1T6DA 3DXMB 2ASMA 3S41A 1TYQA 3ULEA 2A42A 4K41A 1DKGD 2FSJA 1ATNA 2A40A 3H3NO 3D2EA 4EFHA 3D2FB 5BPMA 4RCHA 2YJFA 4XH5A 3CHWA 1ZBSA 4JAXA 4CD3A 3O08A 5FPNA 3CETA 3GDQA 5AQVA 3ID8A 3JXUA 3CERA 5AQXA 3LDLA 3D2FA 2E20A 4O5FA 1SZ2A 1R59O 2F9WA 5AQHA 1HX1A 3WQUA 3R8EA 1P8ZA 2Q1NA 3WXKA 2D1KA 3VF6A 3BP8A 3VF4A 4B1VA 4BR0A 4A2BA 2ITMA 1MWMA 1ESVA 3F9MA 3GG4A 1QQOA 1YVNA 4C23A 3FGUA 2NRHA 3KVGA 4H5TA 3GE1A 3J8AA 1XC3A 3DWLA 4CZKA 4DQ8A 5KPTA 3BF3A 3LDOA 4AM6A 5BPNA 2H3GX 4YDUC 1KXPA 3FFKB 3AAQA 4B1XB 1J6ZA 5F1XA 2ZWHA 2V7YA 5BPLA 1Z05A 2YCHA 2E2QA 1BOTO 4EIAA 2GWKA 1YUWA 1KAXA 3TPQA 2GELA 4B9QA 2BUPA 5KQ8A 4CZLA 4K43A 4JNEA 3DAWA 3O6WA 4JD2B 4YDUA 2W40A 2E1YA 3IUCA 2ASOA 3FZFA 4PL7A 3QFUA 3VENA 3UKRB 2YJEA 4PKIA 2E1ZA 3O80A 2FLOA 3RSEB 1NWKA 3UB5A 5BRFA 3GL1A 3W0LA 3M1FA 2HF4A 3IMXA 3HZ6A 3QFPA 4JD2A 3H3OB 5EXWA 5TKYA 5B8HA 2YI1A 3A5NC 3FLCO 4FPBA 4BR7A 1RFQA 3LDNA 4BR9A 2QXLA 1NGEA 3SJHA 5AQSA 1QZ6A 2QWLA 1SAZA 2A5XA 2VYPA 1BG3A 3WXLA 3M3ZA 5JLFA 3R9PA 4BVPA 1CZAN 4GY2B 5BRHA 5KPRA 1V4TA 1MDUB 3QB0A 3TU5A 3VGMA 2E8AA 5AZJB 3C7NB 4BRDA 3VEZA 3ZX0A 1MWKA 4BC5A 3MN9A 3HSCA 4BRLA 2FSKA 4JN4A 1BU6O 4HTLA 3ZEUB 3H45C 2I7NA 2UYTA 2IVOA 2CH6A 4FWPA 4IO8A 1GLJO 3AARA 4FWNA 5AZJA 3C7NA 1QQMA 1T6CA 4FWOA 3SMPA 5JLHA 5KPZA 4ISGA 3IDHA 5AFUH 4CJ7A 4AM7A 2QW9A 3SLCA 3JS6A 2CH5A 1E4FT 2E2OA 4IJAA 4FWMA 3QBWA 3EL2A 1ZXOA 4FWKA 4CZEA 3ZEUA 3VPZA 4WQ5C 4HWIA 1Q18A 2GUPA 5BN8A 4A2AA 2QM1A 2IVNA 5LJVA 2QWPA 1X3NA 5E84A 1JCFA 1NMDA 4BGBA 4BROA 3MK6A 5KQDA 4CZHA 4M63C 1ZC6A 3QBXA 4GNIA 4WQ5A 5I9EB 1E4GT 4BRHA 4H0OA 5BREA 4BRGA 3VF2A 1SQKA 1KAZA 4FWSA 2FXUA 3DXMA 4CI6A 4M7XA 2V51B 4CBWA 2P9UB 3A5LC 4PL8A 3ATVA 1NBWA 4B1WB 2HMPA 4BVOA 3D7EO 3IFRA 4IJNA 3WEEB 3B8AX 2FF6A 5E26A 5BR9A 2IIRA 4BR5A 4PKGA 3AAPA 4QS7A 3QDKA 4WYBA 3ZX3A 4FL9A 1S3XA 3I8BA 5AZIB 1HKCA 1JCGA 1NGHA 3WEEA 3U8XA 3MCPA 4FO0A 4DHYA 1C0FA 2QWOA 3CJ9A 3CIPA 4J8FA 3O5BA 5AQPA 4BRIA 4BRQA 3EN9A 4BC2A 2ZF5O 4B1YB 5BN9A 4CZJA 3BUZB 3FZMA 4H0PA 3VEXA 5AFUA 1OKJA 1TUYA 2V7ZA 5AZIA 5AQNA 5AQJA 1HPMA 3EKUA 4DB3A 4E1JA 1RDWX 2BTFA 2E2NA 3ZETB 1C0GA 3WT0A 4EHUA 4JHDB 3MDQA 4H5VA 3AY9A 3CJCA 1TUUA 1GLLO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DTJA 5J2NA 2PAVA 1OVQA 1Q9YA 5DMRA 1RT3A 4NB4A 1VRUA 3L4IA 4Y0WA 4J2BA 3J7AP 3VQ5A 3HL8A 3DLBA 1KFSA 1VQNN 4IZ9A 5AQZA 4OGCA 1JKHA 4CF0A 1U2VB 1N8RO 4KBOA 3CJ7A 1N6QA 4BRPA 4OLBA 4CZMA 1IKYA 3CYMA 5C42A 3Q7CA 1Q7YO 2KTQA 4DV6K 1K8KA 3LM2A 5HBMA 3HO1A 2ZQBA 1FK9A 1ZYQA 2Q0RA 5EY4A 3OBWA 3RTVA 3SV4A 3KJVA 1XMQK 2QK9A 4FSVA 4DR4K 3HI0A 4FK2A 4LD0A 5FPDA 2A6AA 3QMLA 4DR2K 4FJMA 4WQ4A 3MN7A 4BRMA 3KZBA 4GVEA 3H46O 3VETA 4B9SA 4FJXA 1NGDA 4CJQA 4KHSA 1YTAA 1WB9A 2NRXA 2OA8A 4IFYA 2IOCA 3P4IA 1S6QA 3LP3A 4FCYA 1NJYA 2HBLA 3LDQA 2HHHK 4RW4A 4BG8A 4CGDA 3L2QA 2P9NB 1BISA 3VQAA 2O8CA 1RTJA 4TSXA 4DG1A 2ZJQL 4E7LA 3HM9A 1D9DA 4K8XA 1IBMK 4H0YB 2D0CA 3NGYA 3ZLJA 3CC7N 3HTVA 4JEPA 5AQIA 2KFNA 1MA9B 1EP4A 1RCHA 1TVRA 4H4MA 4LF8K 2P9LA 1S1VA 3CJAA 4GMJB 5C2FA 1QTMA 1HNXK 4BREA 2D4WA 3KLEA 4Z4GA 3WQTA 3DXKA 2AA4A 3AVGA 3LWMA 2ZE2A 2VG5A 1T05A 1LWEA 4CEQA 3OYNA 4KB1A 1WSHA 1ZBHA 1X9SA 1NK6A 3LP2A 2Q3SA 3E66A 2V52B 3THYA 3EYZA 5J1EA 1N36K 4XH4A 2A41A 3OYMA 4KB0A 3AO4A 4E3SA 4CJ5A 3GBTA 5AQFA 4DV0K 1BWFO 2JGUA 3G25A 4IKFA 1J5OA 2Q36A 4HUEA 2W41A 4DTRA 1NG9A 3EE8A 4ZTFA 2QKBA 2P9SA 1NU0A 2VQEK 2ASPA 3LZIA 5I42A 1N34K 1YAGA 3CJBA 5CY4A 2HHTA 1GLCG 1C1BA 4RW8A 3SUNA 1GLAG 4JKAA 1BQMA 4BWMA 1RBSA 3C6TA 3VGKA 2ITGA 4DS4A 1T44A 3L2RA 4Q5VA 5AQRA 3TARA 1IG9A 2XY6A 3MN5A 3N4QA 4KI4A 4KRFA 3L8BA 3VA0A 3KWGA 4NO7A 2YNGA 3KKSA 4CHOA 3T3FA 4Z4EA 2P9IA 1REVA 4PKHA 3CC2N 4O8KA 1W97L 4O44A 2YV0X 3V81A 4OX9K 2YNIA 4FJHA 3HM8A 2P51A 4CEFA 2P9PA 3S5TA 3VQ9A 3S3MA 3OW2M 5JENA 3UKUA 3VMFB 2ATQA 1CXUA 2HF3A 2EWSA 3D45A 4DV1K 3TAGA 2Z1GA 3K9JA 3L2UA 5F0XA 3CXCM 3PIPL 3PX4A 1SKWA 4PWDA 4OLAA 1TYQB 4CD1A 1HNVA 2OPQA 3T1HK 3SK3A 4I6MA 5KGXA 3D2EB 3DRRA 3SQ1A 1RBRA 3P83D 1XNQK 2BH1A 2HNDA 4GKKK 3ULEA 1OH5A 1DKGD 1LAVA 1N33K 2A40A 4JKGA 4EFHA 1OH6A 1WN7A 3MX2A 3AA5X 5BPMA 5GIOA 3AA2A 3QESA 1GOCA 5HRPA 1KVBA 1R0AA 3AGKA 3NGZA 3SCXA 4YOXA 4JKCA 5AQXA 1QQCA 4LSNA 4GV3A 4CJLA 4DR3K 1P8ZA 4FJ8A 3VF6A 1FXXA 4O55A 2ITMA 1MWMA 1ESVA 4CFDA 2BANA 3M8PA 4XJXA 3GG4A 1QQOA 2LSNA 3S9HA 1JXEA 2NRHA 3GE1A 2HHXA 4F2RA 3J8AA 5KPTA 4DUZK 3BF3A 4AM6A 4JI1K 4YDUC 4FLTA 1YIJN 1J6ZA 2UUCK 5KRTA 3WNHA 4EIAA 5C10A 1KAXA 3K9KA 3F9KA 3O9SA 4CZLA 4K43A 3NVMA 3MEDA 3V4IA 2W40A 3T19A 3V9XA 4FJNA 3FZFA 1IBLK 3DLGA 4OGEA 2HBJA 3VENA 3UKRB 5BRFA 2FLOA 1GOBA 3THXB 2PZSA 1N32K 1NOYA 2HF4A 3IMXA 1QS4A 4JD2A 4CVNE 5TKYA 3OYBA 1ITGA 2W6LA 4NCBA 1RFQA 3LDNA 1NK9A 3CFRA 1NGEA 1RT4A 2DTUA 2QEXN 3ZSYA 1XI1A 2VYPA 2ZM6K 4HCBA 4DF8A 3WXLA 4CHZA 4JYAK 1CZAN 2G8IA 3KWIA 2PYLA 3RR8A 3TU5A 4KFBA 2B5JA 4BRDA 3ZX0A 2HVHA 3G71N 3ZSOA 4BC5A 3CCSN 3KIOA 3CM5A 2G8UA 1U4BA 4FK4A 1X9WA 3P38A 3ZEUB 1FJGK 2G8KA 3OYKA 4FWPA 3MXIA 3AA4A 4C8MA 3O9TA 4IO8A 1KSPA 4HVJA 1CZBA 1VQ7N 1B9FA 5JLHA 3IDHA 1RDBA 2QW9A 3JS6A 2CH5A 1E4FT 3NH0A 4CZEA 3C6HA 3HK2A 5GADP 4WQ5C 3C65A 3MWPA 4RW9A 2QM1A 2RHKA 4CEEA 5E84A 5E41A 3CCVN 4DQPA 1JCFA 2NRVA 4BGBA 1VSJA 3NDKA 4CZHA 4M63C 4NCGA 4GNIA 4CJPA 4BRHA 5BREA 3KLFA 1NKBA 4JK8A 1EWRA 4CFCA 4CK1A 4PL8A 3EZ5A 4B1WB 2O8FA 3QETA 3D7EO 3Q7BA 5CYQA 2UUAK 3CM6A 4BR5A 1RDUA 3AAPA 4BDPA 4QS7A 4GVMA 1HQUA 2KLAA 3P1GA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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