1T44A

Structural basis of actin sequestration by thymosin-b4: implications for arp2/3 activation
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Chimera of Gelsolin domain 1 and C-Terminal domain of thymos
publication title Structural basis of actin sequestration by thymosin-beta4: implications for WH2 proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 123
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1t44A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1t44A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1t44A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1t44A04
4RTFD 4F9OA 3ZEUB 3IMXA 5BREA 4FPBA 4H03B 4BRNA 4CZIA 1RGIA 3BF1A 1MWKA 4ISFA 4ISGA 5FPDA 2V7YA 3LDLA 2CH6A 1H1VA 3EL2A 4MO5A 5BN9A 2OANA 3SJHA 3U4LA 3GG4A 3UKUA 3ZX2A 2VCPA 5BRDA 2V51B 4H0YB 3O08A 1GLEG 3F9MA 1XC3A 3S41A 2NZTA 4AM6A 4BG8A 3P4IA 2QWOA 1E4FT 3ENOA 1EQYA 1GLAG 2WUSA 4EIAA 5KQDA 2FF6A 4BC3A 4A2BA 5FPMA 3M6GA 1T6CA 1NGDA 1HKGA 3QFUA 4BRMA 4CZJA 3FE1A 4IJAA 3VGMA 3DXMA 3ATUA 1IG8A 1NBWA 2QWMA 2YCHA 4FWRA 3UKUB 5B8HA 4FL9A 2CGLA 3VEVA 2E2QA 1QQOA 1LCUA 2ZGYA 2A41A 3LDPA 4CZEA 3FR0A 2E1YA 4BR5A 3I33A 3A5MC 4CZFA 4MLEA 1MWMA 3H3OB 4B1WB 5JICA 3BEXA 1NM1A 3VEZA 3VGKA 1ESVA 1ZC6A 3WT0A 4EHTA 4H0VB 5ELZA 2Q0RA 4BQZA 3DXMB 3GOIA 2CH5A 4QS8A 5AZIA 5AQFA 1IJJA 5CE3A 3FZHA 4XH1A 1E4GT 1YAGA 3C7NA 2VYPA 3AAQA 1WOQA 3D2FA 1NLVA 4O8KA 4H5NA 2Q31A 4H0PA 3CJAA 3CJ9A 1NGJA 2A6AA 5F1XA 5F2RA 4MO4A 3FZLA 5LY3A 1HKCA 2Q1NA 3CHWA 1BO5O 1QQNA 5EY4A 1C0GA 3QICA 4JAXA 2I7NA 1C0FA 5AZIB 1CZAN 1XQSC 1GLCG 5FPNA 4K42A 3D2FB 3C7NB 1BWFO 3CQYA 5EVZA 1NGAA 4BR9A 3VEOA 3H1VX 3VEYA 4QS9A 1BG3A 4WQ4A 1DGKN 3ZX0A 2E2NA 2QWLA 3KHYA 5BPNA 1WUAA 3MN5A 4J8FA 4IWVA 2A5XA 2QWPA 4K41A 1JCEA 2E1ZA 4B1YB 1Z6RA 5BRHA 3CJ1A 2GWKA 3ZETA 3CETA 3D2EA 4WQ4C 3GL1A 1HX1A 5AQUA 4H0XB 5AQTA 4CI6A 3OHRA 5AR0A 4BRDA 1K8KA 5AQIA 3R8EA 4C23A 3FZKA 5AQNA 3R6MA 1Q18A 4CJ7A 4IZ9A 3UE5A 3VESA 2QWNA 2ZWHA 2V52B 2GUPA 3A0IX 3EZWA 1D4XA 4IXCA 4A61A 3DXKB 2YHXA 2P9KB 3ZETB 3D2EB 4GNIA 2YI1A 1X3MA 2D0OA 2YJFA 1NGIA 1ZBSA 1K8KB 2CGJA 1MDUB 4FWSA 2P9SA 5AFUH 2QXLA 2P9LA 3U9ZA 1HLUA 3QBXA 2ASPA 1V4SA 4BRHA 3LM9A 4BC2A 4DCHA 4CBWA 2IVOA 1RFQA 4H0OA 2AA4A 3L4IA 4YDUA 2QW9A 3MMVA 1KAXA 4NB4A 5KPZA 2P9SB 4BROA 4MLHA 2D1KA 4BRKA 2P9LB 3BP8A 3C0BA 3LL3A 4CZHA 4JNEA 1ATNA 4FWOA 3U8XA 2A3ZA 3O5BA 4HWIA 5EX5A 4YDUC 2GEMA 2NRHA 2FSKA 4BRCA 2QWRA 1P8ZA 2Q36A 5JLHA 4E1JA 4CD1A 3VF2A 2VWBA 4B1ZA 3H45C 4B1VA 1JCFA 2HOEA 1MA9B 1RDWX 4BRLA 3FZFA 5JMVA 3I8BA 4BGBA 4H0TB 4PKHA 2D0PA 3KZBA 4BRFA 2EWSA 3HTVA 2YHWA 4BREA 3WQTA 4CD3A 1YXQA 4WYBA 3O80A 5E84A 2HF4A 2J4RA 3CI5A 5AQHA 2P9NA 4FWMA 4BG9A 3AY9A 5AFUA 3H46O 1KAZA 3WXJA 3HI0A 2GELA 1NGBA 2Q97A 4FWNA 2P9IA 4DHYA 3LDOA 2P9UA 3MN9A 2YHYA 3VF6A 3IFRA 2E2OA 3CJCA 3WEEA 5AQVA 4A62A 1V4TA 4QS7A 5AZJA 4PL8A 1TUYA 1S22A 3SMSA 4BC4A 2A42A 2W40A 1NWKA 4FWLA 4FO0A 4JN4A 5ADXH 3TPQA 4M63C 2ZGZA 1NGCA 3WXIA 1ATSA 2P9PA 3QMLA 1R59O 2P9IB 5AQWA 2P9UB 3DJCA 1BA0A 3QBWA 4A2AA 2IVPA 2Q2RA 5AZJB 1SAZA 2IVNA 2UYTA 4FOIA 3G25A 3ATVA 5AQKA 3IUCA 3HSCA 5TKYA 3O6WA 4XH4A 3SLCA 1X3NA 3VERA 3A8YA 1DEJA 2E8AA 3GE1A 4BRPA 1BU6O 2P9PB 5FPEA 4BR7A 3CJBA 4Y0WA 3H1QA 1OKJA 1TUUA 3HM8A 2KHOA 2GWJA 4K43A 3UB5A 4RWTA 4CZKA 5AQQA 4CZLA 3H6EA 4CBUA 1NMDA 1Y64A 4BVPA 3AAPA 4EAHD 3DAWA 3D7EO 2FF3B 5AQJA 5JLFA 2E20A 3VEWA 2ASMA 1GLDG 4FOEA 5EXWA 5BRFA 4GY2B 3DWLA 2GTDA 4FWKA 4BQLA 3IDHA 1SQKA 2H3GX 1LOTB 4EHUA 2ZF5O 3FZMA 4FSVA 3LDNA 4FWPA 2DPNA 1QHAA 5AQGA 1U2VA 3VENA 1HJOA 3MN7A 3EKSA 3VOVA 3VF4A 4B9QA 5ADXA 2QM1A 5KPRA 5AQPA 5AQLA 3MDQA 4BRQA 3MN6A 4L3QA 4BRAA 3EO3A 2ITMA 4BGAA 3LM2A 2ASOA 3KVGA 2PBDA 5AQMA 5EOYA 1U2VB 2FLOA 1T44A 3VEXA 1J6ZA 2E88A 4K25A 3B8AX 2F9WA 3W3DA 3MCPA 1KAYA 2HMPA 1T6DA 1QZ6A 3FGUA 3LDQA 1U6ZA 3BUZB 4H5VA 4JHDA 4BR4A 1DKGD 4BRIA 3CIPA 3O8MA 1ZXOA 4O5FA 4IJNA 3O1WA 1HPMA 2A40A 3A5NC 4PL7A 4KBOA 3VGLA 3CJ7A 5I9EB 1Z05A 3UKRA 3SMPA 3U9DA 3BF3A 4AM7A 2V7ZA 2I7PA 5AQYA 5AQOA 4DQ8A 3QB0A 3A5OC 3HBTA 2IIRA 4PKGA 3GBTA 3QDKA 4CBXA 5LJVA 4JHDB 1BDGA 1NGFA 3MK6A 3WUHA 4WQ5A 3ZX3A 4PKIA 1QZ5A 1G99A 4JD2A 3WXLA 4H5RA 1GLFO 3R9PA 4H5WA 3UKRB 1KXPA 2P9NB 3AARA 2BTFA 3ID8A 2HF3A 2QWQA 1X9JA 1GLJO 3RSEA 4I6MA 3WQUA 5BPMA 2E2PA 2FSJA 1HKBA 2D4WA 4WQ5C 2CGKA 3O4WA 2AP1A 4CZMA 5AQSA 3JS6A 2F9TA 3WEEB 2FXUA 4B1XB 3H3NO 4JD2B 3GDQA 1ATRA 3ENHA 4FWQA 1HUXA 1TYQA 3WXKA 1GLBG 4FPAA 4BC5A 1XUPO 1BUPA 3VETA 5KQ8A 5BN8A 3VPZA 3HZ6A 3ULEA 4BR2A 4BVOA 4XEIA 1SZ2A 4I6MB 4ISEA 5E26A 3RSEB 4H5TA 3FLCO 3J8AA 2YJEA 5F0XA 4EFHA 4NO7A 4B1UB 3JXUA 1GLLO 3EKUA 5AQRA 3DXKA 4M7XA 2P9KA 3FFKB 5LJWA 1TYQB 5BPLA 1QQMA 5AQZA 5BR9A 4BR0A 2FSNA 3W0LA 3EN9A 4LC9B 3ULEB 2PAVA 4XH5A 1NGGA 1YVNA 4Z94A 3ZEUA 1BA1A 1S3XA 3TU5A 3CQXA 5AQXA 2BUPA 3A5LC 2Q0UA 2W41A 3M1FA 3QFPA 4DB3A 3O1BA 4M7YA 3CERA 3L6QA 2NLXA 4IO8A 4HTLA 1BOTO 1JCGA 1NGEA 4RCHA 5KPTA 3SK3A 1YUWA 1NGHA 4BRGA 3M3ZA 3L0QA 4CZGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RTFD 3ZSYA 4PUOA 4GKKK 4CZIA 1RGIA 1LAVA 2HNYA 3KK7A 3ZSOA 1KVCA 2V7YA 3LDLA 4A59A 2DFHA 2CH6A 1H1VA 4CHOA 3VQBA 3FFIA 1TL1A 4KHQA 5CHIA 1D9DA 3C65A 3UKUA 3S3OA 1ASVA 1RBUA 3THXA 1GLEG 4CJPA 4BACA 1XC3A 3J81O 3P4IA 3TSUA 5HRRA 1TV6A 4DKWA 2FBYA 3LZIA 1IG9A 3NFAA 5FRNA 4ELVA 4CZJA 3DXMA 1IG8A 4DTNA 4OLBA 3ZSQA 4FL9A 4DMNA 3DOLA 2E2QA 4LY7A 1QQOA 3AVBA 2A41A 2HHHK 4O8UA 2XY8A 3A5MC 3VQEA 2FBVA 3AVMA 4HUEA 5JICA 3V1QA 1YHQN 3NGZA 3VEZA 4EHTA 1ZC6A 1EX4A 2HHUA 4BQZA 1A5XA 4DTUA 4JKHA 1DLOA 1IJJA 4KAZA 5KRSA 5LMUK 3AAQA 1WOQA 3T1HK 1E3MA 3CJ9A 3KJVA 1NGJA 3AVLA 2YKMA 3FZLA 4GVMA 4CF1A 1HKCA 1QS4A 3CHWA 2O8DB 5EY4A 1YJ9N 1YJWN 5FPNA 1QVGM 1KTQA 1BWFO 1RDBA 3EY1A 4BR9A 3MEGA 3VA3A 3M8QA 2QWLA 1BHLA 4C1NK 5BPNA 2VWJA 1WUAA 1RT4A 3F73A 5KGXA 3BZCA 1L3UA 1HR0K 4AHSA 2XY6A 1Z6RA 2YKNA 4F8RA 3CJ1A 3ZETA 1IBMK 2G8WA 4CI6A 1D9FA 3CCVN 3OHRA 4IOXA 3KLIA 1VQ8N 4ILHA 5C2FA 4BRDA 3KK2A 3SI6A 2XRIA 3HJFA 5AQNA 4JKAA 2ZWHA 4FJ9A 4UY8O 3EZWA 1TAQA 4EP5A 4DUYK 2YHXA 2WC9A 3H08A 3RR8A 1NK8A 2ZJPL 2YI1A 2YNFA 1X3MA 1B9FA 2BGGA 4CHYA 2G8VA 1RDDA 3HRGA 3WNEA 2P9LA 1HLUA 3QBXA 3K5LA 4CFBA 4CEZA 4E0DA 4FZXC 5DM6L 3Q7CA 3KKSA 4DUZK 4LF4K 3A2FA 1L5UA 1UAXA 4CBWA 4YDUA 5KPZA 4JK9A 3V9UA 4X64K 4MLHA 2D1KA 5KRTA 3BP8A 4PA1A 3C0BA 4JNEA 1ATNA 4JS4A 3U8XA 3QEWA 2A3ZA 4HWIA 4DV6K 1SKWA 4YDUC 4DF8A 1ZBLA 2QWRA 3RMBA 4CHNA 3AVIA 5FRMA 3EE9A 2Q36A 1QTMA 4FLUA 2OPPA 4DFJA 2QEXN 4B1ZA 1JJ2M 4WF9L 1JCFA 1YITN 3OYDA 2W6KA 1GOCA 3NF7A 1K6YA 3V1OA 4OGEA 3THYA 1LV5A 2HBJA 5JMVA 1W9HA 1M1KO 4PKHA 1TL3A 1N6QA 4JKGA 2Z1GA 2YHWA 4K0KK 4W5QA 4YOTA 3O80A 4DFPA 4CGDA 5GAEP 2HF4A 4DLGA 4JS5A 5AFUA 3OTOK 3PO5A 1VQ9N 4BE7B 2FBXA 4CF8A 2GELA 3LDOA 4AHUA 3EE8A 1CZBA 4BDZA 2OZSA 2G8IA 3CJCA 2OCEA 4A62A 4QS7A 4CERA 4DSLA 2XY7A 4BC4A 4JKBA 2W40A 1NWKA 4FWLA 3LPTA 1TKZA 1WB9A 4CHQA 2P9UB 3DJCA 4CJLA 3QEVA 2KZMA 4IOAL 5AZJB 2G8KA 3KTQA 4CFDA 5AQKA 3G0ZA 3NGIA 2E5LK 4U67L 3O6WA 3CCMN 3R1XA 2Z1IA 3A8YA 3GE1A 1FKPA 1EWRA 2P9PB 5FPEA 4BR7A 3NE6A 4LSNA 1VQ6N 1VRUA 4WFNL 2VGMA 3O3GA 1S1XA 3HM8A 2KHOA 3ZSXA 3UB5A 1VQKN 3SCXA 4I7FA 4CZLA 3H6EA 1IKWA 1VQON 5HRPA 2F7TA 4B9MA 3RTVA 5JLFA 2I5JA 2ASMA 2GTDA 4JRPA 4BQLA 1WSIA 3AGKA 1SQKA 4I9LA 1JLEA 1LOTB 3SBGA 4EHUA 3SUNA 3LDNA 3QIPA 2Z1JA 4FWPA 4CECA 1EO1A 1VSIA 5C12A 3T1AA 1QHAA 5HP1A 3ZT2A 3VENA 1WNSA 5HLFA 3ID6A 3DLHA 2HBLA 3SV4A 4JK7A 4Y1DA 3VQ8A 1R0AA 3V9ZA 2GV9A 3HPHA 1N33K 5AQPA 3MDQA 1A5VA 3MN6A 4L3QA 4DFKA 1T3VA 4BGAA 4CJVA 1HRHA 1U2VB 4FW2A 3QETA 1T44A 1I39A 2F9WA 3NH2A 3N4PA 3I8DA 4GV3A 3W3DA 3IRXA 5C0YA 4IEEA 3MCPA 1BCOA 3LDQA 1J53A 1I3AA 4E7KA 4BR4A 1DKGD 3AA5X 2HBMA 5CYMA 4DV3K 1OH6A 3I0SA 4F2SA 4CGFA 3O1WA 1HPMA 4PL7A 3DOKA 1KCFA 3RWUA 3BF3A 2W42A 3ITHA 2DFEA 1NJYA 4CEEA 4HUGA 1RBSA 3QDKA 1FW6A 5LJVA 2O8EB 1BDGA 4C8OA 3MK6A 4DV0K 4ILJA 4WQ5A 3AO4A 3ZX3A 4NYFA 3PY8A 3I55N 1QZ5A 4FJ8A 4GW6A 1DTTA 1NU0A 3UKRB 3L2RA 1ASUA 3PO4A 3G6EN 2P9NB 4LFAK 3OYFA 4FLZA 1GLJO 3P31A 3WQUA 5LMNK 3HVTA 4DV1K 1T7PA 4WQ5C 4CVNE 1NK6A 4K8ZA 2AP1A 4UQGA 5AQSA 4C8KA 3JS6A 5HROA 2ATQA 1S72N 4JEPA 1ATRA 1KLMA 3WXKA 1GLBG 1NK4A 1VSEA 4DFMA 3O9RA 4ISEA 1SZ2A 4I6MB 4H5TA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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