1T44A

Structural basis of actin sequestration by thymosin-b4: implications for arp2/3 activation
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis of actin sequestration by thymosin-beta4: implications for WH2 proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
molecule keywords Chimera of Gelsolin domain 1 and C-Terminal domain of thymos
total genus 123
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1t44A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1t44A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1t44A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1t44A04
3CIPA 1U2VA 3QMLA 4CZMA 3LDPA 4BR0A 2QWPA 5FPEA 4AM6A 3LDLA 4BRDA 1NGAA 3WEEA 4BRCA 2W41A 3VETA 4H03B 1NGIA 4HTLA 5JMVA 3QBXA 2EWSA 4FOIA 3J8AA 3U9DA 3CJCA 2P9IB 4GY2B 2E2QA 2A5XA 2HF4A 2GWJA 1QQMA 5I9EB 3AY9A 1J6ZA 3H45C 3C7NB 1KAYA 4EFHA 2E1ZA 4DCHA 3WXKA 2P9SA 4B1XB 3WUHA 2F9WA 2V51B 4EIAA 3UB5A 3I33A 3VF2A 3I8BA 1ZC6A 4RCHA 2H3GX 4CBXA 1QZ6A 4AM7A 5AQYA 3FFKB 3LDNA 1YUWA 3KHYA 3VEVA 1EQYA 1NGGA 4BQZA 2BTFA 2P9UA 4BRAA 4IXCA 4FL9A 3DXKA 2WUSA 4BC3A 4F9OA 3ZEUA 1MWMA 5KPRA 4C23A 1GLCG 2YI1A 1QHAA 1BU6O 4BG9A 3S41A 1SAZA 2PAVA 1XQSC 2F9TA 4K25A 5FPNA 2DPNA 2ITMA 1C0GA 4JAXA 4BRMA 4I6MB 5EY4A 4H5NA 2GEMA 3KZBA 2A42A 1HKGA 3FE1A 3SMSA 1JCFA 5BPNA 3IDHA 3BF1A 1HX1A 3DJCA 4YDUA 2AA4A 3CQYA 2FSNA 4L3QA 4EHTA 5EVZA 1Z05A 2QWRA 3WXJA 4BRHA 5TKYA 5BN9A 3CJAA 5F2RA 1ZXOA 3LDOA 3DAWA 4RTFD 3FZFA 3BUZB 2D4WA 2D0PA 4B1YB 2ZGYA 2IVOA 5AQUA 3D2EA 1MWKA 3ULEA 2P9SB 3IMXA 4H0OA 3FZHA 3FZLA 2ZGZA 1X9JA 4O8KA 3H1QA 3L4IA 5AQFA 2CGKA 4WQ5A 3HM8A 3VEXA 2E1YA 4M7XA 2ASOA 3VEZA 2P9IA 3F9MA 2Q97A 3AAPA 3EKSA 3MDQA 4GNIA 4H0PA 3FZKA 1QZ5A 5AQWA 3WT0A 3UKUA 3CJ7A 2E2PA 1TYQB 1MDUB 3DWLA 4XH5A 3GL1A 4IO8A 4H0TB 5AQNA 1WOQA 3O6WA 3VF4A 1NGDA 2OANA 3UKUB 3ZX0A 4M7YA 4LC9B 3ZETB 2P9LB 3CJ1A 2ASMA 4M63C 2P9KB 3QFUA 3O5BA 5AZIB 5KQDA 5AQQA 2HF3A 3HZ6A 1NGBA 3VEWA 1K8KB 2I7PA 1HLUA 4CZGA 2FF6A 3FGUA 4B1VA 4QS7A 1T44A 4BRQA 4QS8A 3QDKA 3ATUA 3W0LA 5BN8A 5F0XA 1Z6RA 5JLHA 2AP1A 1DGKN 5AQIA 1P8ZA 1U2VB 4BRGA 3A5OC 4FPBA 4MLEA 2W40A 4H5TA 1JCEA 2J4RA 2QW9A 5AQJA 3WEEB 5ADXA 4BVOA 5AQHA 2Q1NA 3P4IA 3VEYA 4JHDA 2VCPA 1DKGD 3BP8A 3LM9A 4HWIA 3ID8A 4B1UB 1NGJA 4PKGA 5AQVA 4EHUA 2NLXA 1T6CA 4JD2A 5AQPA 5BPMA 3JS6A 3W3DA 2QWLA 1LCUA 5ADXH 3EL2A 4KBOA 3G25A 3U4LA 1MA9B 2QWMA 2IVNA 3VEOA 1NM1A 2P9UB 4MO5A 3VESA 5AZJB 5LY3A 4NO7A 4BRLA 4E1JA 3H3NO 4FO0A 5F1XA 5ELZA 3IFRA 1E4FT 2QXLA 3TU5A 1BG3A 3AAQA 3L0QA 1GLEG 2P9NA 4I6MA 1C0FA 3GE1A 2Q36A 1IG8A 4H0VB 2IVPA 1NGCA 2FLOA 2HOEA 2QWQA 4A61A 4ISFA 4XH4A 4PKHA 3QICA 3RSEB 5AR0A 3VPZA 4NB4A 4BR4A 5KPZA 3A5LC 3ATVA 5AQSA 1U6ZA 3DXMA 1ESVA 1GLFO 2P9KA 3EO3A 4WQ5C 3VENA 5AZIA 3BEXA 5KQ8A 5BR9A 2E20A 4EAHD 5FPMA 1S22A 3WQTA 3O8MA 4JNEA 4CZEA 4CZHA 3ENHA 4H0YB 1ATNA 1X3NA 4B1ZA 2YHYA 2Q2RA 4FWKA 2P9PB 1QQNA 5CE3A 3VGMA 4BRKA 4K41A 5BRFA 4BRNA 4CZLA 3R9PA 3CJBA 4DQ8A 4CZIA 2E2NA 3CETA 1OKJA 1SZ2A 3WXIA 4CBUA 1T6DA 4FWPA 2BUPA 4PL7A 2NZTA 5AQKA 4ISGA 5BREA 3C7NA 1NGHA 5AQXA 1V4SA 1GLAG 5AQLA 2V7ZA 3HTVA 4IJAA 2CGLA 3ZEUB 4FWNA 3GDQA 1XUPO 1X3MA 4BRIA 3RSEA 2E2OA 3QBWA 4BREA 5AQGA 3OHRA 2YHXA 3H6EA 3O1BA 4BGAA 3WQUA 1Q18A 1NWKA 1XC3A 4IWVA 3LL3A 3A8YA 2P9NB 1WUAA 1SQKA 2YCHA 3O08A 4DB3A 3FLCO 4K43A 1DEJA 1TUYA 3C0BA 2CGJA 2GELA 2QM1A 1HKBA 1NMDA 5JICA 2ASPA 4MLHA 4H5WA 4DHYA 1HJOA 3D2FA 5AFUA 3FR0A 3A0IX 3CQXA 4CBWA 4FWLA 3VGKA 2Q31A 1BO5O 3MN5A 3O4WA 3R6MA 2D1KA 2P9LA 3BF3A 3D2FB 2VWBA 4BC5A 1GLJO 4CZJA 4O5FA 5JLFA 5BRHA 1BDGA 3M3ZA 1BOTO 5EX5A 2PBDA 5AZJA 4FWSA 4CJ7A 2FF3B 3LDQA 2D0OA 2FSJA 5E26A 3ENOA 2FXUA 2V52B 4FOEA 1BA1A 4WYBA 4A62A 4WQ4A 4FWQA 2I7NA 1K8KA 4BG8A 3HBTA 2E8AA 5B8HA 1KAZA 4CD1A 2CH5A 4BQLA 4CD3A 3B8AX 3EN9A 2HMPA 4FWOA 4BVPA 3H1VX 4B1WB 1HPMA 2GWKA 1ATRA 2FSKA 2YJEA 3D2EB 1ATSA 1GLDG 3HSCA 1JCGA 3IUCA 3R8EA 3U8XA 3VGLA 3D7EO 3KVGA 4BR9A 1KXPA 1D4XA 2UYTA 1YVNA 3UKRA 3EZWA 3HI0A 5AQZA 3DXKB 2ZF5O 1CZAN 3MN6A 5LJVA 4RWTA 4YDUC 3U9ZA 4PKIA 4FSVA 1KAXA 4BR2A 4JD2B 2A41A 3GBTA 2Q0RA 2Q0UA 3H46O 4BC2A 1ZBSA 3MMVA 4BRFA 3M1FA 4BC4A 1IJJA 3L6QA 1NBWA 2V7YA 3A5NC 4J8FA 3GOIA 4CZFA 3O80A 4IZ9A 4WQ4C 4A2AA 1NLVA 1YXQA 4H5VA 1LOTB 3FZMA 4FPAA 4ISEA 4PL8A 3LM2A 3CI5A 3ZETA 3ULEB 1RDWX 2YJFA 4FWRA 3SJHA 1HKCA 5BPLA 3AARA 4CI6A 5E84A 4CZKA 4H5RA 4FWMA 3TPQA 5AQMA 1GLLO 1HUXA 1TUUA 5EOYA 4A2BA 5EXWA 4XH1A 3VF6A 2QWNA 2NRHA 4XEIA 2VYPA 4B9QA 1H1VA 1RGIA 1RFQA 4JN4A 3MCPA 3JXUA 5AFUH 1BUPA 5AQOA 2E88A 3SLCA 4JHDB 1S3XA 4BROA 2ZWHA 2A40A 3M6GA 5LJWA 1G99A 1E4GT 2GTDA 3SK3A 5KPTA 1V4TA 3EKUA 3ZX2A 1R59O 2YHWA 1TYQA 1NGEA 2KHOA 5FPDA 4Y0WA 5AQTA 5BRDA 1Y64A 2A3ZA 3VOVA 3UE5A 3VERA 2GUPA 4BRPA 3H3OB 4MO4A 4IJNA 3CERA 3O1WA 3QFPA 3DXMB 3GG4A 3MN7A 3A5MC 3CHWA 2IIRA 4H0XB 4BR5A 5AQRA 2QWOA 2A6AA 1BA0A 2CH6A 4K42A 1YAGA 3MK6A 4Z94A 1QQOA 2P9PA 3WXLA 3SMPA 3MN9A 3ZX3A 1BWFO 3QB0A 3UKRB 1NGFA 4BGBA 3CJ9A 4BR7A 1GLBG 4QS9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CIPA 3O4QA 4GKKK 1S1VA 4BR0A 1S72N 3MWTA 3WEEA 3ENBA 4GVMA 2W41A 2BANA 5JMVA 1IKVA 5LMUK 2P9IB 4KRFA 4GY2B 1LW2A 2A5XA 5FROA 3ZLJA 4KV8A 1QQMA 3QESA 1VQ5N 5I9EB 2PFUA 3H45C 1I3AA 4Z4FA 2YKNA 3K58A 1FXXA 4KHSA 3T69A 3VQ9A 4X62K 3TAMA 4EIAA 2X6NA 1D5AA 3I33A 3HT3A 3DYAA 1YHQN 3AVAA 1D8YA 5C25A 1IG9A 4OPHA 3LP3A 4M42A 5GAHP 1YIJN 1NOZA 1VQMN 4CGIA 1YF5L 3DRRA 3VQ8A 3VEVA 2BTFA 3K59A 4FL9A 3CXCM 2WUSA 3S9HA 4FJXA 4C23A 4M3UA 1GLCG 5FDLA 4DR7K 3PSIA 5FRNA 2GBZA 3VQQA 4CECA 4BG9A 1SAZA 2PAVA 5FPNA 2DPNA 1RBRA 1C0GA 4BY9C 3CM5A 2HHVA 2IAJA 2WTUA 1BCOA 5BPNA 3IDHA 1HX1A 2DY4A 4YDUA 3CQYA 2FSNA 2JGUA 4Y1CA 4EP5A 4FLVA 2OCEA 4L3QA 3HK2A 5EVZA 3OJSA 3KLEA 2B5JA 4FM1A 1ZXOA 4RTFD 3WNGA 3OYAA 2DFFA 5HLFA 2D4WA 1EWQA 3HPGA 3ULEA 3ZSRA 3T1YK 3H1QA 3L4IA 3MECA 2G8IA 1LWCA 3ULDA 4J2EA 5C2DA 5AQFA 3JAMO 3KKSA 1R0AA 4E1MA 3CFPA 3EE9A 3VEZA 1U49A 2RKIA 2Q97A 3QNOA 3AAPA 1M90O 3ZSOA 4B8AB 5GINA 3VTIA 4JI3K 3NGIA 3TABA 4XH5A 1W97L 3GL1A 5AQNA 1WOQA 3O6WA 4RW6A 1NGDA 3ZX0A 4M7YA 2W6KA 3LANA 1TGOA 3QFUA 3O5BA 2HB5A 4C8NA 3HZ6A 1ITGA 3VEWA 1XMQK 2WOMA 3FGUA 1T44A 3THXB 1GOBA 3I55N 3AA4A 5C2FA 3W0LA 3OYBA 5BN8A 5F0XA 3M8SA 5D3GA 4PWDA 2AP1A 1DGKN 1NJIO 5AQIA 2HHUA 4E3SA 1JCEA 1CZ9A 1NK6A 1WAJA 4DTMA 2OTLN 1K6YA 3JYTA 1SV5A 2KFZA 5C42A 4JHDA 3BP8A 5CZ2A 3RMAA 4B1UB 4PQUA 4PKGA 5AQVA 2G8VA 2G8UA 5J2PA 3O9SA 5BPMA 2KKZA 3W3DA 1TL1A 4DLGA 4DS4A 4YOWA 4CGGA 3EL2A 3RMDA 3E9LA 3L4QA 4FLYA 1T05A 1MA9B 2QWMA 2IVNA 3CCMN 1NM1A 3L3VA 4CJ4A 1NKEA 3LZIA 3SI6A 1XWLA 4E1JA 4FO0A 3H3NO 2E5LK 3IFRA 1WBBA 3NBPA 3VQCA 1E4FT 1JXBA 2GX9A 3KD5E 1QTMA 3J80O 5IWAK 4FJLA 1C0FA 3GE1A 1IG8A 4DV5K 4KPYA 2FLOA 2RHKA 3G71N 3TSQA 4JKGB 1ILYA 4ISFA 2B6AA 4BEBA 1DTTA 3A2FA 1SKSA 3VPZA 1RBSA 2PYLA 3LP1A 1NK5A 1U6ZA 3MEDA 1GLFO 1VQ7N 3EO3A 1RT5A 4WQ5C 3C6HA 4DUZK 3BEXA 4DFPA 2WONA 3PIOL 1TAUA 2NRRA 1T8EA 4FJIA 3E9PA 4KKOA 4JNEA 3DLBA 3QEIA 1GOAA 1K8AO 4IBNA 1QQCA 3OYEA 1X3NA 2ZJQL 3BDPA 3OYCA 3MWPA 2Q2RA 4KH6A 4BRKA 4ILJA 3K5OA 4IFYA 4H4OA 3R9PA 5A2QO 2O8CA 4AILC 4FJGA 3SAHA 4FW2A 3WXIA 4CBUA 4KHQA 3NF8A 2O8EA 1T6DA 4PL7A 3L2RA 5BREA 3C7NA 1RDCA 2V7ZA 3HTVA 1HMVA 3V9ZA 3ZEUB 3KWGA 1SS6A 4DQIA 3OYDA 2G8WA 2OZMA 1X3MA 4FLTA 3PV8A 3VMFB 4W5NA 2YHXA 4CGJA 3H6EA 4YFUA 1DTQA 4OLAA 1HJRA 3HL8A 2VQEK 1S6PA 3WNFA 4DSKA 3A8YA 3MXMA 1HNZK 1WUAA 3E66A 1BIUA 1SQKA 2YCHA 3LDSA 4DB3A 1TUYA 2QM1A 3CD6N 2QTDA 1HKBA 3VQBA 2DTUA 4MLHA 4H5WA 1IBKK 5AFUA 1XNQK 3OA9A 2XY6A 2YNIA 3B6PA 2OTJN 1SL1A 4B3SK 3R6MA 3VTHA 4CF9A 5H1SQ 4DU4A 4BC5A 1GLJO 2Z1JA 4DR4K 4OVLA 4KTQA 1BDGA 5EX5A 1LV5A 3HOTA 4OKJA 4F3TA 4FWSA 4CJ7A 4CEEA 2WC9A 1RTHA 3CCJN 1CZBA 1NKBA 5EU7A 1IKYA 3LP2A 4O4GA 4WE1A 4X66K 2X74A 3OYLA 1X9MA 2HHIA 4A62A 2UUAK 2I7NA 1E3MA 2E8AA 5B8HA 1VQPN 1J5EK 2CH5A 5IT9O 1FJGK 1RCHA 3KLIA 3H1VX 2I5JA 1HPMA 1S1XA 2YJEA 3D2EB 4DQSA 4CF0A 3SUPA 4UQGA 1X1PA 3KVGA 4CJFA 1D4XA 5M1NA 4NYNA 1ZBHA 4ILGB 1JLQA 2XRIA 3AVIA 3DXKB 1CZAN 5LJVA 4B9TA 2E6LA 3OYHA 4JI0K 3CG7A 2XY8A 1KAXA 4JD2B 2A41A 3SAFA 1EXQA 2ZE2A 3ZSYA 2Q0RA 3KTQA 3H46O 4KI6A 4BRFA 5J2MA 4JI7K 2HMIA 3AVNA 4M3YA 1CLQA 4CHOA 3OYGA 4KH4A 3QEPA 4CHZA 4CZFA 3O80A 4B3MK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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