2BTFA

The structure of crystalline profilin-beta-actin
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
374
structure length
373
Chain Sequence
b'DDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structure of crystalline profilin-beta-actin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-ACTIN
source organism Bos taurus
molecule tags Acetylation and actin-binding
total genus 106
structure length 373
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2btfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2btfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2btfA03
2P9NB 1BO5O 4O5FA 1LCUA 3HI0A 3P4IA 3QBWA 2E1YA 2QWLA 3WQTA 3A5LC 1NMDA 4CJ7A 5AQTA 1HUXA 3EL2A 2BTFA 1WUAA 3LDOA 4ISFA 1RGIA 3M6GA 4RWTA 4XH1A 2V51B 3VEWA 5FPDA 2ASOA 3D2EA 2H3GX 5AQYA 2PBDA 3VENA 1WOQA 1BDGA 3O1BA 3VEVA 2CH5A 4J8FA 2I7NA 3JS6A 4WYBA 4FOEA 4BC5A 4BR0A 1QHAA 2QWRA 5KQ8A 1Z05A 4DCHA 2FF3B 4CI6A 1NGCA 3FZHA 3VERA 3H46O 2YJFA 1ZXOA 3U9ZA 5JLHA 4LC9B 5CE3A 4B1VA 1ATSA 2ZGYA 3DXKB 2GELA 1DKGD 1X3MA 2P9UB 4Z94A 4A61A 5AFUA 1HKBA 4FWNA 3FR0A 4CBUA 3H45C 3I8BA 2ZWHA 5AQPA 4YDUC 3SMPA 3L0QA 3UE5A 3A5NC 2QXLA 4H0XB 1NGBA 4ISGA 4PL7A 1BG3A 4H0OA 3C7NB 4BRAA 2ITMA 3R6MA 2CGKA 4PKHA 3TPQA 3UB5A 4H0TB 4H5WA 1G99A 1NGDA 2EWSA 4MLEA 3AAQA 1GLFO 1GLEG 4QS8A 4BRMA 4K41A 3HM8A 4BRNA 3LDNA 4BQLA 2YCHA 4CZEA 1X3NA 1X9JA 1TUUA 4RCHA 4WQ5C 4XH5A 4CBWA 3KVGA 2Q97A 2A41A 3QICA 4GNIA 1YVNA 4BRIA 3DXKA 1Q18A 4YDUA 2P9UA 4BVPA 4BRDA 5ADXH 3CJ1A 3H3OB 1NGEA 3MMVA 3O1WA 1NLVA 2A3ZA 1TYQB 2QWNA 1HJOA 2GUPA 2FXUA 4JNEA 3GDQA 3BUZB 4FPBA 3C7NA 3RSEA 3O4WA 4M7XA 4EHUA 1EQYA 1GLDG 1GLJO 3ZX3A 2HOEA 2A40A 3WUHA 4BR7A 4EHTA 1V4TA 4AM7A 3UKUB 2D0OA 3VEZA 2E2PA 3WXLA 5LJWA 4WQ5A 4MO4A 2GTDA 1RFQA 4B1ZA 1C0FA 5AQKA 4H5NA 2QM1A 4FWLA 5ADXA 4FWQA 1NGAA 5FPEA 1YUWA 3VGMA 3H3NO 1E4FT 4M7YA 5AQGA 2HF3A 4CBXA 2P9KB 4QS7A 2ASPA 4WQ4C 5I9EB 1H1VA 4BQZA 3CJBA 3BEXA 1NBWA 5KQDA 1Z6RA 4DB3A 1TYQA 3UKRA 3M3ZA 2CGJA 3G25A 5E84A 3MDQA 4A2BA 4CZFA 1E4GT 3MK6A 3B8AX 4FWRA 1BU6O 3EZWA 3ENOA 3VOVA 3ZX0A 3VESA 1IG8A 2E8AA 2QWOA 4CZLA 3LDQA 2Q1NA 4CZKA 3EO3A 3ULEB 3BF1A 4BRPA 2YJEA 3UKUA 5EX5A 2YI1A 3CERA 2YHWA 2YHXA 2QW9A 3EKSA 3IFRA 4H03B 5AR0A 3TU5A 3KHYA 4EFHA 3O5BA 3DAWA 3WEEA 4CZIA 2FSNA 4WQ4A 4BGAA 1RDWX 3H1VX 3I33A 4FWPA 2NRHA 5BPNA 2P9KA 5LJVA 3A8YA 3MN7A 2VYPA 4RTFD 3WT0A 5EVZA 5BN9A 1XUPO 5AZJA 5F1XA 4BROA 5AQLA 4BGBA 5AQXA 2GWJA 3U8XA 3IMXA 1GLCG 3ZEUB 2E88A 3CJ9A 4QS9A 3KZBA 3ULEA 5AQJA 5FPMA 3VEYA 3DWLA 2IVOA 4K43A 2D1KA 3AARA 3GOIA 1BOTO 3QB0A 3RSEB 3VF6A 4DQ8A 4E1JA 1YXQA 3ZETA 5BREA 2D4WA 2F9WA 1HKGA 3MN9A 3CIPA 1U6ZA 5EY4A 4AM6A 1NGHA 2QWMA 4Y0WA 4BRHA 2V7ZA 2E1ZA 3BF3A 5AQRA 1MWKA 5AQVA 5AQZA 3VF4A 5BPMA 1QQOA 3BP8A 4MLHA 2P9PB 3FE1A 4BRCA 2FSKA 3SLCA 4B9QA 1S3XA 3F9MA 4BR9A 1ESVA 1SQKA 3VEXA 3ZEUA 4IXCA 4BRQA 2IVPA 2UYTA 4ISEA 4NB4A 4BRFA 2ASMA 4A62A 5BPLA 4BG8A 5F0XA 3H1QA 5BRDA 2J4RA 3UKRB 4IO8A 5KPTA 2NLXA 3S41A 4JHDB 5KPRA 1JCFA 2A6AA 3D2FB 3SMSA 4B1WB 5AQWA 1T44A 1GLLO 4XEIA 4CD3A 1NWKA 4F9OA 5LY3A 3QFPA 3CJ7A 2IIRA 4B1UB 1K8KB 4BR4A 4BRLA 4CZHA 4I6MB 2E2NA 3WXJA 5JICA 4JD2B 1HKCA 4DHYA 1CZAN 3AAPA 3WQUA 2CGLA 2E2QA 2P9PA 3R8EA 3CHWA 3LM9A 4GY2B 3VETA 4EIAA 4CZGA 4M63C 1XC3A 4BC4A 2HMPA 1HX1A 2FSJA 5AQHA 3DJCA 2Q0RA 1ATNA 3MCPA 4BR5A 1JCEA 4IJAA 4FWSA 2QWQA 3VGKA 2A5XA 2BUPA 3IUCA 1S22A 5TKYA 3OHRA 5BRHA 3U9DA 4BR2A 2WUSA 4JHDA 3D2FA 5AZJB 3LL3A 1JCGA 3L4IA 3ATVA 2Q0UA 1BA0A 5BR9A 4FWOA 4FSVA 1NGGA 5BN8A 4FO0A 4B1YB 3HBTA 4H5VA 3FZFA 3GG4A 4JAXA 1V4SA 1K8KA 3CETA 2IVNA 2D0PA 4H0YB 4I6MA 1NGFA 4JD2A 2F9TA 3QDKA 4CZMA 1SAZA 2HF4A 5AQOA 2QWPA 3JXUA 3FZMA 3ZETB 3QBXA 3CQXA 4FPAA 1YAGA 4JN4A 5AQIA 3HZ6A 2V7YA 4NO7A 4K42A 3SK3A 3CQYA 3LDLA 3FGUA 1R59O 4BVOA 3FLCO 1T6CA 5AFUH 5AZIB 1KXPA 1XQSC 2Q2RA 2W40A 3CJCA 5AQFA 4FL9A 1DGKN 1GLBG 4KBOA 1QQMA 3A0IX 4BRKA 2V52B 3O8MA 3LDPA 1QZ5A 2I7PA 3QFUA 3CJAA 1MA9B 4BC3A 2A42A 4CD1A 2P9NA 1BWFO 2DPNA 1IJJA 3QMLA 1SZ2A 5AQSA 2Q36A 3VF2A 5AQNA 1ZBSA 3VEOA 1NGIA 4MO5A 3A5OC 1ZC6A 2GEMA 2E2OA 3A5MC 1ATRA 1BUPA 4PL8A 3IDHA 3FZLA 5AQUA 3WXIA 2OANA 3ZX2A 5EOYA 3LM2A 3GBTA 3W0LA 1NM1A 3DXMB 2P9LB 1DEJA 5JMVA 5AZIA 4K25A 5FPNA 1OKJA 2CH6A 2NZTA 5B8HA 4PKIA 3CI5A 2FF6A 3M1FA 5ELZA 3WXKA 4H5RA 3ENHA 4IZ9A 2P9SB 4CZJA 2ZF5O 2GWKA 1T6DA 3VPZA 2P9IB 3R9PA 3VGLA 5AQQA 2KHOA 3U4LA 2VCPA 3EN9A 4L3QA 3J8AA 3W3DA 3GE1A 3ID8A 4H5TA 2AP1A 1U2VB 1Y64A 5BRFA 1BA1A 3O6WA 5EXWA 3WEEB 3FFKB 1NGJA 3MN5A 4H0PA 4EAHD 4IWVA 1D4XA 3DXMA 4XH4A 2E20A 3C0BA 3FZKA 3EKUA 2P9LA 4A2AA 1C0GA 4BG9A 4HTLA 3D7EO 4BRGA 4H0VB 1KAYA 4C23A 2PAVA 3H6EA 2W41A 4B1XB 2VWBA 5F2RA 3AY9A 2Q31A 3GL1A 5E26A 4BC2A 4HWIA 2YHYA 4FWKA 5KPZA 2AA4A 1HPMA 3SJHA 1P8ZA 2P9SA 1LOTB 3L6QA 3O80A 1MDUB 4FOIA 4BREA 3ATUA 2P9IA 1MWMA 1QZ6A 2ZGZA 4PKGA 3HSCA 1J6ZA 3D2EB 5AQMA 1TUYA 1KAXA 3MN6A 5JLFA 4O8KA 3O08A 1QQNA 1HLUA 1KAZA 1U2VA 2FLOA 1GLAG 3HTVA 4IJNA 4FWMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O4GA 4DTOA 1BO5O 1XHZA 1LCUA 5GAHP 3DI6A 4IFEA 1JKHA 3P4IA 3QBWA 4IDKA 3B6OA 3KLFA 1HUXA 2BTFA 3LDOA 3CCJN 2Q3SA 3J7AP 4KI6A 1TK5A 4JI8K 3IAYA 3VEWA 4CGJA 1X9SA 4FYDA 4FJHA 4GV3A 2IOCA 4NYFA 3WNGA 4U67L 1NJIO 4Z4IA 1RBTA 4M3XA 5C2DA 4KH5A 4FJ5A 1BCMA 1HJRA 2I7NA 4DF8A 5KQ8A 4DCHA 4CI6A 1WAFA 4CJLA 3FZHA 3VERA 3H46O 4DTRA 2YJFA 3HK2A 3TSUA 4LC9B 2F8TA 4JV5K 3T7ZA 1IG9A 2O8FB 1RTIA 1ATSA 3HL8A 4B1VA 4FW2A 2GELA 4CVNE 1LV5A 4LFAK 1VSFA 3VQDA 1JL1A 4CBUA 5AQPA 1S6PA 4F2SA 4JRPA 2QXLA 4Z4FA 4H0XB 1U47A 4O5BA 4PL7A 4H0OA 4B9LA 3E9OA 2CGKA 3LALA 3KKSA 4M3TA 3UB5A 1RDDA 3SQ1A 4H0TB 2Z1HA 3QLHA 3LP2A 4DSEA 3AAQA 1GLEG 2G8HA 2OCEA 3HM8A 5CZ1A 2RE2A 3QEXA 1A5WA 4BQLA 1D9DA 3KWGA 1KVBA 4Z4EA 4JKDA 4CBWA 3HVTA 1S72N 3AVNA 4FZYA 4BACA 3VA0A 1LWEA 1Q18A 1QSLA 1SKRA 1HR0K 3CJ1A 1F21A 3U6FA 4CJQA 1NLVA 1KD1O 2A3ZA 4DTXA 2FXUA 3RSEA 5J1EA 3CMAN 5GIOA 3PO4A 4DR4K 1GLJO 1NK4A 3OYFA 4BR7A 2BH1A 3QESA 2E2PA 5LJWA 1S1XA 1NOYA 1C0FA 3G4SN 1NK6A 4KFBA 4FWLA 3SPZA 4CIFA 3VGMA 1WSIA 3WNEA 3HPGA 4IEIA 2HF3A 1K9MO 4QS7A 5JVGL 5I9EB 1H1VA 4BQZA 3G6EN 4DB3A 3QIOA 3CC2N 4RW7A 4OLBA 1RTJA 1VK0A 3ALYA 4FWRA 4FJ9A 4O55A 3DLKA 2VQEK 3VESA 1IG8A 2E8AA 4CZLA 4CECA 4DQRA 4ZTFA 3HM9A 4CZKA 3ULEB 3LWMA 1IO2A 4FLUA 4KPYA 3M5RA 2YHWA 4FJKA 2QW9A 3CM5A 4O0IA 3T19A 3O5BA 5GAEP 4WQ4A 4BGAA 1RDWX 4B3OA 4WFAL 3LANA 4FVMA 1OVYA 4WFBL 5FLXO 4BE1A 2PY5A 2VYPA 4YOUA 4C8OA 1NG9A 3S5TA 5F1XA 4BROA 4J2DA 1SS6A 5AQXA 1Y97A 2GWJA 5GAGP 4IEEA 4E1NA 4OKKA 4FCYA 3QETA 3RRHA 4OGEA 1N6QA 1BOTO 2QI2A 3QB0A 3BDPA 4J2BA 4E1JA 4B3SK 3LAMA 1LW2A 3CIPA 5EY4A 3HT3A 3I56N 1ASUA 4Y0WA 4E7IA 2V7ZA 3RTVA 2PZSA 1MWKA 4OVLA 1HQEA 5AQZA 4DV7K 5KRTA 5BPMA 1QQOA 1L5UA 4TSXA 2WBNA 4BR9A 3O9QA 1DTQA 2F96A 1ESVA 3D0PA 1SQKA 3K57A 3VEXA 4BRQA 1YT3A 4ISEA 2ASMA 1EO1A 4AF1A 3G0ZA 3ZSOA 5F0XA 3H1QA 3SAFA 5DM7L 1YVUA 3KKRA 4UQGA 1JCFA 3ISNC 3QERA 1WSJA 5LY3A 4CF8A 1HYVA 4I2QA 4BRLA 1XHXA 1S9GA 2WC9A 3WXJA 1CZAN 3AAPA 1RBUA 2OTJN 1VQNN 2P9PA 4EIAA 2O4IA 1N33K 4DF4A 4CK3A 1XC3A 4CHOA 1HX1A 2FSJA 2Q0RA 4HVJA 4BWMA 5HLFA 1VQ6N 1BIUA 2VWKA 5J2NA 3VGKA 3AVLA 2A5XA 3IUCA 1S22A 4EZ6A 3OHRA 5BRHA 3U9DA 4YHHK 1N36K 5AZJB 1BA0A 3DMJA 4FWOA 5BN8A 3ZSXA 3RWUA 3HBTA 4H5VA 4YNQA 4FVUA 4IO9L 4BECA 4QOZB 1JXBA 4DV0K 2D0PA 4H0YB 2G8WA 4LY7A 3ZYYX 1NU0A 2XY8A 4JKAA 2QWPA 3FZMA 3ZETB 4E3SA 3KTQA 5AQIA 3HZ6A 2Z1GA 5M1KA 3F5TA 4A57A 3SNNA 1T7PA 4K42A 4RG8A 5C0YA 5HP1A 1SKWA 2ZJRL 4CJ3A 1X9MA 1IV0A 4BVOA 1IKWA 2JWKA 3CJCA 4ILJA 3SUOA 3RMAA 4FL9A 1RDAA 4FJGA 1GLBG 4CHPA 1QQMA 1WBBA 3LDPA 2I7PA 3QFUA 3CJAA 4BC3A 3THWB 3VQPA 3I0SA 4LSLA 5C42A 1SZ2A 3I8DA 2Q36A 4F3TA 1ZBSA 1QVGM 3VEOA 1NGIA 1JJ2M 3SBTA 2PYJA 4JLHA 4FM1A 3IDHA 3FZLA 3WXIA 4FJ8A 3M8SA 2OANA 5EOYA 1VSMA 3LM2A 3GBTA 3W0LA 1NM1A 1WAJA 1DEJA 3RMCA 1FKOA 3PV8A 4RW8A 5AZIA 1VQKN 3SBGA 1OH8A 1MU2A 3C6HA 1QHTA 4PKIA 4M41A 3M1FA 4H5RA 3AVKA 4B3TK 1KLMA 4DR1K 1BI4B 4JKGA 4CHQA 4CZJA 4LF8K 4JYAK 4M3YA 1T6DA 1TGOA 3VGLA 5C10A 5LL6Z 5FRMA 4DV5K 5DK5A 3PIPL 3PLAA 1XNRK 3ID8A 4B3RK 2AP1A 3L2RA 1U2VB 1Y64A 2O8FA 1BA1A 1WSFA 3C6AA 2OZMA 1ITGA 3FFKB 2KFNA 4RW4A 2E6MA 3VQQA 3LZIA 4XH4A 3RR7A 4CEFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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