2BTFA

The structure of crystalline profilin-beta-actin
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
374
structure length
373
Chain Sequence
b'DDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords BETA-ACTIN
publication title The structure of crystalline profilin-beta-actin.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Acetylation and actin-binding
total genus 106
structure length 373
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2btfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2btfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2btfA03
3SMPA 4BRHA 3MN7A 3KVGA 1IG8A 4CZGA 5JMVA 1HPMA 2ZGZA 2F9WA 2W40A 3LM2A 3BUZB 1BA0A 4BG9A 2E88A 3ZEUB 4IO8A 5AQVA 1NGIA 3VEVA 3MK6A 4B9QA 4JNEA 1MDUB 1EQYA 1XQSC 5I9EB 3H1QA 3UE5A 3ATVA 3QMLA 5AQIA 4CJ7A 1MWMA 5LJVA 4FOIA 2V51B 4HWIA 1LCUA 4I6MB 2A6AA 2HF4A 4IJAA 4BR0A 4WYBA 2I7PA 2D4WA 4FPBA 2A41A 4K42A 1NGEA 2A42A 2W41A 5AZIA 3RSEB 1NGJA 3FZFA 3VF4A 3CJ9A 1RFQA 4M63C 1YVNA 4FPAA 1HLUA 2YI1A 5AQXA 2ITMA 3VPZA 4BR4A 2E2PA 4GNIA 4FWPA 4BRKA 3U9ZA 4QS7A 3FZHA 3O6WA 3O80A 4CBXA 3MMVA 1QQOA 4C23A 1KAXA 4AM6A 3ID8A 4B1XB 3A5MC 4NB4A 5AQNA 4H5VA 2E1YA 1JCGA 3AY9A 2CGLA 4DB3A 2YHWA 2GWKA 1K8KA 4BRLA 5AQUA 2ASMA 2IVOA 1V4SA 3L0QA 2GWJA 1YXQA 4JD2A 5KPTA 4BRGA 3HZ6A 3QFUA 3WT0A 5JICA 2FSJA 5E84A 3R6MA 1BA1A 2ZF5O 5BREA 5EX5A 2QW9A 1NGFA 5LJWA 5AZIB 4A61A 1XUPO 3H3OB 3QB0A 3VENA 5ADXH 3MCPA 3H6EA 4YDUC 3WXIA 4Z94A 4H5TA 4A2BA 3WXKA 5AQHA 4CZMA 1BOTO 2D0OA 5BPNA 1GLLO 2P9PA 1Y64A 4FWQA 4QS9A 3TU5A 4IXCA 4E1JA 2QWRA 5AQTA 3VEXA 4FWSA 4CD1A 3CJ1A 3HTVA 1QZ5A 4B1YB 3QBWA 3CJCA 4BRNA 1XC3A 1NMDA 4BQLA 1HUXA 1NGAA 1S3XA 4BREA 2ZWHA 3AAPA 4BROA 1TUYA 4PL7A 3FLCO 3F9MA 1ZXOA 4JD2B 4XH1A 2ASPA 3VOVA 3EN9A 2P9UA 2GTDA 3LDPA 4PKIA 3VF2A 2P9LA 4CBWA 3HBTA 3EKSA 3UKRA 1NGGA 5AQOA 3SJHA 2I7NA 1S22A 3ZX2A 3GL1A 4HTLA 1Q18A 2P9SA 3C7NA 4BGAA 3ZX0A 3FZKA 3FFKB 3O08A 1RGIA 3D2FB 2A3ZA 5KPRA 4DCHA 2AA4A 2QWQA 2P9KA 4MO4A 2P9PB 1SZ2A 1YUWA 4BVPA 2BUPA 3DJCA 3FZLA 1IJJA 1KAYA 1NLVA 3DAWA 3HM8A 3BF3A 2E2NA 3A5OC 3U4LA 4O8KA 4O5FA 4JHDA 2ZGYA 5AQKA 4B1ZA 4WQ5C 2UYTA 1BDGA 4BVOA 2ASOA 5EVZA 1Z6RA 4MLHA 4RCHA 5FPNA 5BN9A 2QXLA 3VEWA 1GLFO 1ATSA 5AQQA 2D0PA 1GLCG 1BU6O 3GDQA 2IVPA 5AQGA 1V4TA 2NZTA 2P9UB 4XH5A 4EHTA 1T44A 3L6QA 2P9LB 4FOEA 3D2EA 2BTFA 4BC5A 3UKRB 1GLJO 5AQRA 4J8FA 1NGDA 4BRDA 2V7YA 4BRAA 1E4GT 3CQXA 1HX1A 3FZMA 3WEEA 3OHRA 5BRFA 3LL3A 1ATRA 5E26A 2GELA 1GLBG 5B8HA 3VF6A 2P9KB 4KBOA 3JXUA 4IZ9A 3VEZA 2A5XA 1NGCA 2VWBA 3WXLA 1ATNA 3I8BA 2H3GX 5EXWA 3AAQA 1GLDG 4CZKA 4JHDB 4BG8A 3MN9A 1NBWA 1NGBA 3ENOA 3JS6A 3KHYA 4CZFA 4DHYA 1C0GA 4BR2A 5ELZA 1P8ZA 3D7EO 3BP8A 1DGKN 2NLXA 3R8EA 1QQMA 4BQZA 5BPLA 1QQNA 3QBXA 4RWTA 4H03B 3O4WA 5AFUA 3D2EB 4BRFA 4H5WA 4WQ4C 2CGJA 3ATUA 3GOIA 3IFRA 5EY4A 3B8AX 3CI5A 3TPQA 3CHWA 4PKGA 2YJEA 3H1VX 3VERA 3WEEB 1RDWX 5JLFA 4XH4A 2QWPA 5AR0A 2HMPA 2Q0UA 4WQ5A 3P4IA 3S41A 5F2RA 3H3NO 4EHUA 4K43A 2YHYA 2QWMA 3VEYA 1T6DA 4CI6A 4ISGA 3LDNA 3QICA 3ZETA 5AZJA 5AQMA 3M1FA 1U2VA 1ZBSA 2VYPA 3EZWA 3CJ7A 4B1WB 2E1ZA 3M3ZA 4A62A 4H0OA 4B1VA 5AQYA 5KQDA 2YJFA 1K8KB 5AQJA 2CH5A 4A2AA 2KHOA 4CBUA 2FF3B 4JN4A 4H0TB 3ULEA 2E2QA 1QHAA 4MO5A 4RTFD 2DPNA 1SQKA 1ZC6A 3A0IX 4M7YA 1HKBA 5KPZA 5FPEA 1OKJA 4ISEA 5LY3A 4EIAA 2OANA 3LDOA 1JCFA 4H0PA 1JCEA 2P9NA 3VGLA 1KAZA 5KQ8A 4CZJA 3KZBA 3I33A 3QFPA 3UKUA 2FLOA 2QWNA 3FR0A 4H0XB 2Q1NA 5JLHA 4K41A 3LM9A 1DKGD 2GUPA 1ESVA 1U2VB 2GEMA 4CZIA 4EFHA 4Y0WA 4BRMA 1R59O 1Z05A 4WQ4A 3WUHA 5BN8A 3RSEA 3MN5A 5BPMA 4BC2A 4CD3A 2WUSA 3IUCA 3ULEB 3VGKA 4FWLA 5F0XA 3J8AA 3A5LC 3WQUA 3DXMA 2VCPA 2FF6A 1LOTB 4YDUA 2F9TA 1DEJA 3O1WA 4AM7A 2Q97A 1G99A 2V52B 3FGUA 4F9OA 2P9SB 3C7NB 5FPDA 2FSNA 4FSVA 4BR5A 4LC9B 4NO7A 2P9NB 5FPMA 3HI0A 5AQSA 3W0LA 3UKUB 4BC3A 5EOYA 4BR9A 3HSCA 2NRHA 3SLCA 3UB5A 2CH6A 5BR9A 2E20A 3R9PA 4H5RA 1CZAN 4FO0A 5CE3A 2P9IA 1GLAG 3O8MA 4IJNA 2PBDA 2E2OA 4DQ8A 3AARA 1D4XA 4GY2B 3C0BA 1MA9B 3EL2A 1X3MA 3DXKA 1WOQA 4M7XA 3VEOA 1C0FA 3GBTA 2Q0RA 5BRHA 3DXMB 1J6ZA 1BWFO 4H0VB 1NGHA 2HOEA 4H5NA 4EAHD 3CJBA 3CIPA 3EKUA 3GG4A 3MN6A 1H1VA 1T6CA 1E4FT 1MWKA 5AFUH 2Q2RA 3QDKA 3O1BA 5AQFA 4BRPA 3ZX3A 3EO3A 4K25A 3WQTA 1HKCA 3GE1A 2Q31A 5ADXA 1BG3A 2EWSA 2QWLA 2FSKA 2QWOA 3ENHA 4FWNA 1X9JA 5AQZA 1BUPA 2P9IB 1NM1A 4XEIA 1HJOA 3LDQA 4CZLA 1X3NA 1BO5O 1TYQA 4IWVA 3CERA 4CZHA 2AP1A 3O5BA 3U8XA 3FE1A 2CGKA 4FWOA 1YAGA 4BRCA 3DXKB 3DWLA 3D2FA 3IMXA 3L4IA 1NWKA 2J4RA 5AQLA 4FWKA 3W3DA 4BC4A 4JAXA 1GLEG 4BRIA 4L3QA 5F1XA 2A40A 2IIRA 1QZ6A 4BRQA 2QM1A 3U9DA 4PKHA 1KXPA 4QS8A 2V7ZA 4BR7A 4H0YB 5BRDA 2D1KA 3ZEUA 2IVNA 4FWRA 4FL9A 1TUUA 1SAZA 3IDHA 2FXUA 3G25A 3MDQA 4BGBA 3A8YA 3CQYA 3H45C 4CZEA 3BF1A 3CETA 3M6GA 4ISFA 3WXJA 5AQPA 5AZJB 3BEXA 3ZETB 4I6MA 3A5NC 2YHXA 2E8AA 5TKYA 1WUAA 1TYQB 3VGMA 1U6ZA 4PL8A 3CJAA 5AQWA 3LDLA 4B1UB 4MLEA 3SMSA 3VESA 3SK3A 1HKGA 4FWMA 3VETA 2YCHA 2HF3A 2Q36A 3H46O 2PAVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C6AA 2O8FA 4DFKA 3SMPA 3MN7A 5CHIA 3KVGA 4X66K 3I56N 1HPMA 1VSMA 3L8BA 2W40A 3CCSN 2WBNA 4KH5A 1ASUA 1C1AA 2Z1JA 3OYDA 1NGIA 2W6KA 3MK6A 1MDUB 1EQYA 1XQSC 3OYEA 3V9ZA 1J53A 4CJ7A 5LJVA 4J2DA 3DYAA 4JKGB 4HWIA 4L8RB 4R79A 3EE8A 5JS2A 5GIPA 1S72N 3WNEA 3RVCA 2XY6A 1NGEA 3RSEB 2G8IA 4WFNL 2VWJA 4M63C 4QCLA 4FPAA 2ITMA 3VPZA 4NXNK 4ZTJA 4QS7A 3O80A 3HVRA 4AHCA 1KAXA 3U3YA 1KD1O 4AM6A 3ID8A 4OVLA 4JI6K 3K59A 4B1XB 2JWKA 3B6PA 4NB4A 5AQNA 1FXXA 5J2PA 3AY9A 4FJGA 1J54A 3CCJN 3AVHA 4DB3A 1K8KA 4HUEA 4DV3K 3RWUA 5GAGP 2IGIA 2YV0X 1TK8A 4BRGA 1RT3A 2NRXA 2BGGA 3ZSWA 1YTAA 4CHNA 4XIUA 4LFAK 2FSJA 5E84A 4IDHA 2W42A 1BA1A 1N6QA 5LJWA 3QB0A 3VENA 1QHTA 1NNEA 3MCPA 4E7HA 2FBYA 3TABA 5BPNA 3AVJA 4FM1A 5FRNA 4IXCA 4DFJA 1KFSA 4N47A 3TAPA 3QEXA 4JKEA 4CJ3A 3L2WA 4DR5K 4DFMA 2O8EA 4OGCA 4BREA 3MEGA 3AAPA 4BROA 5DMRA 4RW7A 4RW9A 4JRQA 4B3MK 1IKWA 3IKMA 4DU4A 3NH2A 3NBPA 4XH1A 3ZCMA 3VMFB 4PA1A 2GTDA 2OYQA 3HBTA 4E7KA 1NGGA 1S22A 4JLHA 1W0HA 3GL1A 1YITN 1Q18A 2P9SA 2JGUA 2Z1IA 4DKWA 1L5UA 3ZX0A 4FLTA 3QINA 3TI0A 5KPRA 2QWQA 4WFBL 4MDBA 2G8KA 4H4MA 1IJJA 1NLVA 3DAWA 3HM8A 1CZ9A 3VQ9A 3NVMA 5AQKA 2D0CA 4M45A 4WQ5C 4CFCA 1BDGA 5KRTA 2ASOA 3AVMA 5EVZA 2KZZA 1S1XA 4MLHA 5BN9A 1IO2A 4QAGA 1ATSA 5HL7L 3IRXA 5C42A 4B3RK 3CG7A 4FXDA 3K2PA 4XH5A 2ZQBA 3TARA 4FOEA 4JS4A 1BGXT 1T05A 3KLHA 3NH1A 2QXFA 1Q9XA 5HOOA 3LL3A 1ATRA 1RT2A 3VQ5A 4XJXA 3ZLJA 4ICLA 4OKEA 2YNHA 4KBOA 4F2RA 5SWMA 4B9UA 1W2BM 3IS9A 3MX5A 4K8ZA 4JKHA 3I8BA 4DFPA 4IEIA 4FJ9A 4JHDB 3NAEA 4DF4A 1KFDA 1NK0A 2DFFA 1NGBA 5KTQA 3HRGA 2UUBK 2E6LA 3KHYA 4CGFA 2Q3SA 1WAJA 3KLFA 1S1UA 2AJQA 1DLOA 1VAZA 1VSEA 3R8EA 1QQNA 4RWTA 5AFUA 1WSIA 3D2EB 1HRHA 3ATUA 1KVCA 4O55A 3TPQA 3CHWA 4PKGA 4CJ4A 2D0BA 3H1VX 3WEEB 3VA3A 3PX6A 1VK0A 4N56A 1RDWX 1EETA 4JK9A 1NJZA 3AVGA 3SBTA 3HPHA 3KLEA 4K43A 1LV5A 2G8UA 3VEYA 1WAFA 3MEEA 4NYFA 4DV1K 5AJ3K 4BWMA 3F73A 4G9ZA 1U2VA 1T7PA 5FROA 4NLBA 4C8NA 5HRNA 3CJ7A 5KQDA 2ZE2A 1C0UA 4AHVA 4CBUA 3ZSQA 1VQ9N 2FF3B 4JN4A 4AQYK 3TSUA 1QHAA 1JLGA 3C6HA 3NGIA 4YFUA 4F8RA 2DPNA 1ZC6A 3MCAB 4YOTA 4OKJA 5KPZA 2O8CB 1X1PA 4BE0A 3CMEN 1X9WA 3IAYA 4DLGA 2OANA 4EP4A 1RDCA 4W5TA 1KAZA 1WSEA 3VTIA 3CFOA 3OBYA 2FLOA 2WOMA 2QWNA 3WNFA 1JL1A 3FR0A 3BZKA 3THVA 1CLQA 1VSDA 3OYBA 2HBJA 5JLHA 1NK7A 1N8RO 1FKOA 3SQ1A 1ASVA 4Y0WA 4H4OA 4CJVA 3HJFA 1R59O 1Z05A 4WQ4A 3WUHA 3RSEA 3N4QA 3I0SA 1YJWN 3S9HA 1QSSA 3A5LC 5FRMA 2VCPA 4YNQA 4B9TA 4IG3A 4E72A 4KB1A 3OYCA 2Q97A 2FBVA 3VQEA 4F9OA 5FPDA 1A5WA 2FSNA 1RBTA 4FSVA 4LC9B 1Q81O 3VTHA 3MX2A 3HI0A 2GUIA 4RW4A 4U67L 4BC3A 4FJJA 4IO9L 3SLCA 1KQSM 2PYLA 4KV8A 1IKYA 1VQ6N 1S6QA 1RTJA 3T1YK 3AVNA 3R9PA 1CZAN 5CE3A 1U47A 3K5LA 1VQ8N 4V19S 4DQ8A 1KRPA 5KI6A 3AARA 1RBRA 5HBMA 1HQUA 4GY2B 4B08A 1X3MA 3KLIA 2Y1JA 1C0FA 1D5AA 1XMOK 2RN2A 3MWPA 2OPSA 4ZHRA 1BWFO 4H0VB 1BIUA 1JLQA 4DQPA 4BDYA 1T8EA 1HJRA 3EKUA 1H1VA 4O4GA 3QETA 3QERA 2KTQA 4KHSA 3QDKA 4Y1CA 2RF2A 3OYAA 4M3WA 4I7FA 1OH5A 4JI8K 3TAQA 3OYIA 2ETJA 2Q31A 1EWQA 3KKSA 2QWLA 4CW7B 1RTDA 2C1IA 1X9JA 1NG9A 2Y1IA 2FC0A 3L2RA 2P9IB 4XEIA 3LDQA 3F2KA 1TYQA 3KK1A 3CCUN 1RNHA 2CGKA 4FWOA 3LWLA 1N32K 1NU0A 3DXKB 4LY7A 3SYZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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