2BTFA

The structure of crystalline profilin-beta-actin
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
374
structure length
373
Chain Sequence
DDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The structure of crystalline profilin-beta-actin.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Acetylation and actin-binding
molecule keywords BETA-ACTIN
total genus 106
structure length 373
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2btfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2btfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2btfA03
2ZGYA 4K25A 4B1YB 4RCHA 1IJJA 5CE3A 3ZETB 1QQNA 1NGCA 3QB0A 1K8KA 3VF6A 1DEJA 4CZKA 3SMSA 2CGKA 3WUHA 3ULEB 3VEZA 4WQ5A 4BQZA 3DXMB 1NGFA 1GLEG 3VF4A 4BRNA 5KPRA 3EKSA 2J4RA 3EKUA 3QBXA 4LC9B 1TYQB 4FWLA 4ISGA 4GNIA 4BROA 1LCUA 5AFUH 1E4GT 2A40A 4YDUA 2ASPA 5BRHA 2D0PA 3EN9A 1NWKA 3H1VX 4FWMA 1HLUA 4IZ9A 5EXWA 4BC3A 1GLCG 3GOIA 4MLHA 4EAHD 2GUPA 1NGIA 4H5WA 4BRGA 1RFQA 2A6AA 2E20A 3CJAA 1WUAA 5FPNA 3WEEA 3ATVA 4CZIA 4JD2A 3O08A 3CHWA 3FE1A 3O4WA 4PKIA 5AQRA 5KQDA 3DWLA 5EX5A 3L6QA 4FPBA 2E1ZA 2IVPA 3QDKA 2HF4A 2ITMA 2IIRA 5E26A 1TUUA 2Q97A 2QWPA 3DXKB 4PL8A 3WXIA 3ZX2A 3QICA 1MA9B 5JLFA 2P9KA 1S3XA 2KHOA 4JHDA 1RGIA 1WOQA 2ZWHA 3M6GA 4BRFA 2F9WA 1ATSA 5AQLA 1KAYA 1YVNA 4CBUA 3UKRA 1NGAA 3FZHA 3VF2A 3WXLA 4FWOA 1GLLO 4M7XA 4MLEA 1T6DA 4C23A 5AZJA 4BRAA 2HMPA 1NGHA 2HOEA 3AAPA 1QQMA 3ID8A 4CZLA 4Z94A 3HSCA 1HKCA 4CZGA 3VEYA 4BR9A 2FLOA 1RDWX 3UKUB 4B1XB 4A2BA 2YHYA 4WQ4C 1GLFO 1NM1A 1GLJO 3FZFA 1H1VA 4FWSA 4H0OA 3TPQA 2QWNA 4BRMA 3SLCA 4PL7A 4MO5A 4DHYA 2ASOA 5BPLA 2ZF5O 3WXJA 4BREA 3WQTA 3U9DA 3LDQA 3R9PA 3RSEA 5I9EB 5AQWA 3CJBA 1X3NA 2Q0UA 2FXUA 4YDUC 2A42A 3LL3A 3EL2A 4BRLA 4I6MB 2FSKA 1JCFA 3H3NO 2AA4A 2IVOA 1D4XA 1TYQA 3ATUA 3W0LA 2YJEA 2P9PB 3LM9A 2PBDA 3O1BA 5AQMA 3LDPA 3VEVA 3IUCA 3RSEB 3ZEUA 3ULEA 3D2FA 2ZGZA 4FOIA 1NGDA 4XH5A 2VYPA 3S41A 4BRPA 4CD1A 4RTFD 1HX1A 2GWKA 3ZX0A 4BRQA 3O80A 3R6MA 3GL1A 2P9SA 2V52B 4JAXA 3UB5A 3GDQA 4BGAA 3H6EA 1NLVA 4QS8A 3ZEUB 1BWFO 2A41A 3D2FB 5AQJA 3VGMA 2V7ZA 1BDGA 3AY9A 3L0QA 3ENHA 1YUWA 1BU6O 3ENOA 5AQUA 3D2EA 4FPAA 3GG4A 1R59O 1QHAA 3CQYA 3LDLA 4JD2B 4K42A 1BA1A 5FPEA 3VEWA 5B8HA 5LJWA 4QS9A 4HTLA 4EHTA 4PKGA 3O6WA 1DGKN 1BA0A 4BRKA 4BVPA 2FSNA 1GLAG 1J6ZA 5BR9A 2VWBA 4H0TB 1HJOA 2YHXA 3A5NC 1ESVA 3CJCA 3HM8A 4JNEA 4BRCA 3UKRB 4B1WB 4BR7A 3VEOA 1BUPA 3CERA 1KXPA 3GBTA 4CBXA 5AQIA 1XQSC 4A61A 1NGBA 2IVNA 3FZKA 3HTVA 4K41A 1XC3A 2YHWA 4A62A 2E2PA 5AQYA 4BGBA 2QWQA 1JCEA 2WUSA 1U6ZA 3GE1A 3CJ1A 2I7PA 3IDHA 5BRDA 3F9MA 2YCHA 3D7EO 5EY4A 4H5RA 2Q31A 5AQZA 1V4TA 2OANA 1K8KB 3B8AX 3HBTA 2A5XA 3UKUA 2CGJA 4AM6A 1IG8A 3H1QA 5AQNA 3ZX3A 4CZJA 4BC4A 3KVGA 3QFUA 5LJVA 1ATRA 3MK6A 4BG8A 2P9UA 3FZLA 4A2AA 5ADXH 3WXKA 3C7NA 5AQXA 3SK3A 2P9PA 3H3OB 3A5OC 2Q1NA 3BUZB 4K43A 1LOTB 4ISEA 1HPMA 3I8BA 4L3QA 5F0XA 4XH1A 4FWRA 3SJHA 3MN6A 3QMLA 3CETA 2BUPA 2P9UB 3FGUA 3AAQA 5BRFA 4CBWA 3HZ6A 4JN4A 4MO4A 1C0FA 3ZETA 5AQFA 4BRDA 2QWOA 4BRIA 4M7YA 4H0PA 4CJ7A 2P9NB 4IXCA 3W3DA 2P9LA 4H0VB 1X9JA 2V7YA 4H5TA 5AR0A 2E1YA 4IJAA 4H5VA 3VOVA 2QW9A 5AQGA 5AQHA 1NGGA 3U8XA 2QWLA 2F9TA 3WQUA 5BPNA 3VGLA 2P9SB 4BR2A 2YI1A 3CQXA 3LDNA 2I7NA 4IJNA 5F2RA 2P9NA 1Q18A 3M3ZA 3I33A 4O5FA 5BN8A 1MDUB 2PAVA 2FF3B 1BG3A 5AQTA 5AZIB 1HUXA 2E88A 2NLXA 2QWRA 4CZHA 3FFKB 1BO5O 4XEIA 3MN7A 3FZMA 1C0GA 3U9ZA 1U2VB 4EFHA 4BQLA 4EHUA 1Z05A 4FO0A 1ZC6A 4ISFA 2NZTA 4DB3A 2V51B 4H03B 3FR0A 1QZ6A 4H0XB 4IO8A 5JMVA 2D4WA 3DXKA 4IWVA 3MN5A 3JS6A 2CH6A 1EQYA 4PKHA 3SMPA 3L4IA 3EO3A 1MWMA 4EIAA 3KZBA 2P9KB 1CZAN 3O8MA 3VGKA 1GLDG 2QM1A 3LDOA 1ZXOA 1NGJA 1U2VA 4BVOA 4BRHA 5JICA 5AQVA 4B9QA 4BR4A 3BF1A 4BR0A 3CI5A 1X3MA 4B1ZA 5E84A 4KBOA 2CGLA 3TU5A 1SAZA 4FWQA 2Q2RA 5TKYA 4QS7A 5JLHA 3BEXA 2QXLA 1ATNA 4NB4A 2UYTA 5AFUA 4B1UB 2QWMA 4FL9A 3BF3A 2E8AA 4Y0WA 4NO7A 5KPZA 3O5BA 3IFRA 2VCPA 2P9IA 1NGEA 1G99A 2GEMA 5FPMA 3IMXA 1QQOA 4CI6A 3OHRA 2HF3A 1YAGA 3J8AA 3M1FA 3O1WA 5AQKA 5EOYA 4BG9A 4BR5A 5BREA 5KPTA 2E2QA 4BC2A 1TUYA 4FWPA 3VEXA 4H0YB 4F9OA 1DKGD 1YXQA 3P4IA 5FPDA 4WYBA 3R8EA 2D0OA 1SZ2A 3DXMA 3AARA 3H45C 3C0BA 1BOTO 3HI0A 4RWTA 5KQ8A 3D2EB 4CZFA 1Y64A 1MWKA 4AM7A 3BP8A 1HKGA 3DJCA 3VERA 3VETA 5ADXA 4FOEA 4BC5A 5LY3A 1T6CA 3UE5A 1Z6RA 3H46O 2P9LB 2GTDA 1S22A 3U4LA 2EWSA 4M63C 5AZIA 1NBWA 3WEEB 3MMVA 3JXUA 3MDQA 3VPZA 5AQPA 5F1XA 4WQ5C 3A5LC 4JHDB 4WQ4A 1JCGA 1T44A 5BPMA 4XH4A 3G25A 1NMDA 2A3ZA 3VESA 4FWNA 2GELA 2BTFA 2CH5A 1HKBA 3KHYA 5BN9A 4FWKA 5AQOA 1QZ5A 4DQ8A 1KAZA 1ZBSA 3LM2A 2YJFA 2AP1A 3CIPA 4O8KA 1E4FT 4B1VA 2NRHA 4CD3A 5AZJB 4HWIA 2GWJA 3QBWA 3EZWA 4DCHA 4CZMA 4GY2B 3A0IX 3CJ7A 5AQQA 2D1KA 2Q0RA 4J8FA 4FSVA 1SQKA 2W40A 1V4SA 3VENA 1XUPO 4CZEA 2ASMA 5AQSA 3FLCO 3WT0A 3A8YA 3C7NB 4E1JA 3MCPA 3MN9A 2E2OA 3CJ9A 2FSJA 1P8ZA 2W41A 1KAXA 3QFPA 1OKJA 2DPNA 2P9IB 4H5NA 2H3GX 2FF6A 4I6MA 3A5MC 5EVZA 2E2NA 5ELZA 3DAWA 2Q36A 1GLBG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E5LK 4B1YB 3SUNA 5CE3A 3VF6A 2UUAK 4E1MA 1DEJA 5C12A 4J2AA 2O4IA 2Z1HA 1IO2A 1KLMA 4CE9A 1NGFA 3VF4A 4CJTA 1WNSA 5KPRA 4ILJA 2UXDK 2O8FA 3QBXA 2RHKA 4DFKA 3UIQA 1M90O 5BRHA 3VMFB 4CJ3A 1S9GA 4BC3A 5EXWA 2OZSA 4IBNA 3GOIA 1QVFM 4MLHA 4EAHD 2GX9A 2O8DB 1RT6A 3T19A 1RFQA 2A6AA 2E20A 2OZMA 3CJAA 1WUAA 3VQ7A 4AHCA 3ATVA 1P90A 3O08A 3QINA 3O4WA 4PKIA 4UQGA 3AVKA 5M1OA 4CIEA 4JI6K 3TTFA 1NJZA 1NJIO 3QDKA 4GV3A 2HF4A 4KREA 1YIJN 3CG7A 3SBTA 5E26A 1TUUA 2Q97A 3DLHA 2KTQA 3SQ1A 3PLAA 1T7PA 3L3UA 2YNHA 2RF2A 3ZX2A 3C6TA 3QICA 2HSTA 3M5RA 4JHDA 4FYDA 4B3SK 3SZ2A 4CW7B 4U67L 4HCBA 3D6RA 4E1NA 4LFBK 4CGHA 4DV0K 5HRRA 3K9KA 3V4IA 4DMNA 1YVNA 2OYQA 3AVJA 3PX4A 3FZHA 4B9NA 2HNDA 3L2QA 4LF6K 4DTOA 4BE1A 3QEWA 1Q81O 2HHUA 3AAPA 3ID8A 3K58A 4FJXA 1JXEA 3OY9A 4JEPA 2XHBA 3LANA 3ZSXA 4W5RA 1Q7YO 3UKUB 4A2BA 2YHYA 3M8RA 3VTIA 4FXDA 1BGXT 5HBMA 4FLZA 4DR2K 2HBLA 3AVBA 3O4NA 1S1UA 1QQCA 1YF5L 3TPQA 4FJ7A 2QWNA 1W97L 1WN7A 4OLAA 1FKPA 4BREA 5FRNA 4C8NA 3QIOA 5I3UA 3LAMA 3HXMA 3R9PA 3J7AP 1X3NA 4YDUC 3QLHA 3EL2A 1TAQA 1NOYA 3H3NO 2AA4A 1TKZA 1IH7A 3ZSVA 4F8RA 1LAVA 4KHQA 1TYQA 1NOZA 3ATUA 5A2QO 3LM9A 3OA9A 4M45A 3O1BA 1C6VA 4FOIA 1BL3A 4DUYK 4XH5A 3CMAN 3AVNA 3ZT4A 4CJPA 3BZKA 5J2PA 2XY8A 4DSEA 1WBDA 3R1XA 3HK2A 1FJGK 2V52B 3KD5E 3AVMA 3GDQA 5H1SQ 4FM1A 3LPUA 2DFFA 3ZEUB 3D2FB 1BDGA 3J7ZO 2ZD1A 3L0QA 3AV9A 4M42A 4GW6A 3V6DA 1JJ2M 5AQUA 4CGIA 4FLYA 4DTNA 4JD2B 1UA1A 1KD1O 2A1SA 3IG1A 3VEWA 4PKGA 4A59A 2B4JA 4BRKA 3CD6N 1GLAG 1J6ZA 2JLEA 2VWBA 1HJOA 3I0SA 1IKXA 1ESVA 4CIGA 4BRCA 4KH6A 4B1WB 3CERA 4E7IA 1KXPA 3ZT3A 3GBTA 2ZJRL 1FXXA 2UXCK 4CHZA 3FZKA 4KFBA 1UWBA 4CF2A 3JAMO 3DRRA 4IO9L 4A5AA 4IEEA 2QWQA 4CCHA 1JCEA 1S6QA 3C6HA 1EXQA 2I7PA 2PYJA 2NRTA 3D7EO 1U48A 4JRQA 1A5XA 2Q31A 3WNGA 4CFBA 4DKWA 3D0PA 4YNQA 3NGIA 1OVQA 1BI4B 1IG8A 3SV4A 4UY8O 5AQNA 3MX5A 1ATRA 4BG8A 4A2AA 4DFPA 1SS6A 4OPJA 4KH4A 5AQXA 4BACA 4DU1A 2IS3A 3CCMN 5F0XA 1LOTB 4ISEA 3C65A 2VGMA 1U45A 1RTDA 4LF4K 1EKEA 3QERA 1TV6A 2BUPA 3AAQA 5LL6Z 4FK4A 1C0FA 3HVRA 1BQMA 1FK9A 3DLLL 5M1KA 2QWOA 4BRIA 4KTWA 4M7YA 2OCEA 4CJ7A 1KLNA 3JYTA 3HYFA 4IXCA 4H0VB 2HMIA 4H5TA 3F9KA 1WBBA 3LP0A 1WAFA 5AQGA 3JSMA 4F3OA 1YI2N 5BPNA 3VGLA 3U6FA 3C6AA 2I7NA 5DK5A 1L3TA 1U49A 4DFMA 5BN8A 3KTQA 4CF8A 1T3VA 1BG3A 3CM5A 5AZIB 3WNEA 4J2DA 1BO5O 4DQSA 4CHQA 1TKXA 1T03A 2Z1IA 5JVHL 1ASUA 3K5OA 3IKMA 2X6SA 4FO0A 3PX6A 2HVHA 2V51B 5DMRA 5M1PA 3O3GA 3FR0A 5C24A 2HB5A 3HP6A 4H0XB 1YTUA 4IWVA 3MN5A 3JS6A 4G1QA 3F73A 4AHVA 4YFUA 3E01A 1CZAN 4KV8A 5J2NA 2QM1A 1U47A 4NXMK 4CJRA 2ZM6K 4BVOA 1CZBA 3BF1A 5M1QA 4DLEA 4KTQA 5JS2A 1BHLA 2P1JA 4JKDA 4OJRA 1VQ7N 3TU5A 3ZT0A 2IOCA 2ETJA 1VQ6N 3BEXA 4NB4A 4CHPA 2WTUA 2UYTA 5AFUA 3SYZA 1ZBLA 4B1UB 4IDHA 3OYEA 3OYKA 4FL9A 4C8OA 4JI5K 4OKJA 4IOXA 4B9VA 2EX3A 5KPZA 4M3YA 1CZ9A 1I94K 3OYMA 4YHHK 4KTZA 1G99A 5FPMA 3IMXA 1QQOA 4CJ5A 3OHRA 2HF3A 3M1FA 3B6OA 5EOYA 2E2QA 3IRXA 3V9WA 4F2SA 4NCAA 1S9EA 4F9OA 1X9SA 4WYBA 1WSGA 5LMNK 3CQ8A 1T05A 3E9OA 2VWKA 4B3RK 3H45C 3OYNA 1X9WA 3KK7A 2WFBA 3HI0A 3D2EB 4JK9A 1TK8A 2KZMA 1Y64A 3DJCA 3VERA 4CGGA 3EE8A 2UUCK 3O9UA 4BC5A 1VSFA 1N6QA 3AVCA 4HCCA 4G9ZA 1QSSA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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