2BTFA

The structure of crystalline profilin-beta-actin
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
374
structure length
373
Chain Sequence
DDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Acetylation and actin-binding
source organism Bos taurus
publication title The structure of crystalline profilin-beta-actin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-ACTIN
total genus 106
structure length 373
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2btfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2btfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2btfA03
2Q31A 1U6ZA 5AQZA 4KBOA 5KPRA 1KXPA 5AFUH 2P9UB 5BREA 3A0IX 3SLCA 2QW9A 3SMSA 2H3GX 2DPNA 4Y0WA 4PKGA 1HUXA 5AQFA 1BA0A 2P9KB 3GE1A 4FOEA 4PL8A 4EHTA 1NWKA 1TUYA 4FPAA 1NGHA 2EWSA 3IDHA 4WQ5C 1BUPA 4CBWA 4BRKA 3MN9A 4QS7A 3VEYA 5F1XA 4BVPA 2YCHA 3VENA 1XQSC 2P9IA 3LDQA 1NMDA 1ESVA 4BR2A 2A6AA 3A5LC 2J4RA 4MO5A 4RCHA 5AQSA 3HM8A 2IVNA 4JD2B 4BR5A 5FPMA 3HTVA 1SQKA 3QBXA 3HBTA 5E26A 1QZ5A 2P9PA 5AQLA 2E20A 2I7PA 3O08A 5AQRA 4DB3A 3ID8A 2BUPA 1BA1A 4BR4A 4BR0A 5EY4A 2Q2RA 4I6MA 2P9SA 4CD3A 3UKRA 5AQJA 3H1QA 4HTLA 3BUZB 1ATSA 5KQDA 2NLXA 3DJCA 2GWJA 3W0LA 5AZJA 1GLEG 1C0FA 1YAGA 1ZC6A 2Q36A 3CERA 3ENOA 4HWIA 4H0YB 5FPDA 3O5BA 1YUWA 3GDQA 3G25A 5ELZA 4BC3A 5ADXA 1GLBG 1T44A 4CZMA 3I33A 1NGBA 4CJ7A 1YVNA 3WEEA 4CZHA 4FWSA 4AM6A 4EAHD 4QS8A 3FZMA 1NGDA 4BVOA 4BR7A 3M6GA 5EXWA 1TUUA 3U9ZA 3ULEA 3ZEUA 1WOQA 4B1VA 3FGUA 2HF4A 3KHYA 2CGKA 1G99A 2ZGZA 3KZBA 4BRHA 3LDOA 1SAZA 2QWPA 4EHUA 1BG3A 2QM1A 4CZLA 4FO0A 3FE1A 3IMXA 3O80A 3W3DA 4H0XB 2A40A 3A8YA 2A3ZA 5BN9A 2GWKA 1EQYA 4BC5A 5AZIA 4CD1A 1NGJA 1KAZA 2YI1A 4B1YB 1H1VA 4EFHA 1NGEA 3BP8A 3FZFA 3VF6A 3EKUA 2V51B 4H0TB 2CGJA 3VF4A 3AARA 1QQNA 3I8BA 5B8HA 5CE3A 4FWNA 4B9QA 1K8KA 3QFPA 1GLAG 3GOIA 3QBWA 4XH1A 5BR9A 4BRLA 1J6ZA 3H46O 4L3QA 3VEVA 1HPMA 3DXMA 4FL9A 1GLCG 1MWMA 2GUPA 4BGBA 2FSKA 3LM9A 2OANA 3D2EA 3DXKA 4FOIA 5AQNA 4BR9A 5F2RA 3TU5A 3EN9A 4A62A 2P9NA 3EL2A 1C0GA 3M1FA 3O8MA 4IZ9A 1D4XA 3GBTA 3U9DA 2E8AA 1YXQA 1ATRA 3UKUA 3WEEB 1TYQA 3FLCO 2KHOA 4H0OA 4LC9B 1JCEA 1S22A 2ASOA 2VWBA 3ZETA 1NGGA 4B1ZA 3R9PA 3ULEB 3EZWA 2Q0RA 3CJ1A 2AP1A 3JXUA 3O1WA 3O4WA 1Q18A 2P9LB 3MDQA 4IWVA 3AY9A 4BRFA 3H3NO 2Q1NA 2E1YA 2F9WA 5AFUA 4K43A 4DQ8A 3CJCA 4O5FA 1WUAA 3MCPA 3ZX2A 4JHDB 4WQ5A 1P8ZA 2V7YA 3GL1A 2ITMA 3VGMA 3D7EO 2ZGYA 3CHWA 4M7YA 4DCHA 4BRDA 4EIAA 1CZAN 1LOTB 2ASPA 2NZTA 1U2VB 3L6QA 5AQOA 5BRHA 5EVZA 1MDUB 4BQLA 1JCGA 5BPMA 3A5NC 2YHXA 1K8KB 1NGCA 1LCUA 2YHWA 4FPBA 5FPNA 3WXLA 2ASMA 1XUPO 5AQXA 4WYBA 1GLJO 1BO5O 4H5RA 1QQMA 3RSEB 5AQPA 5AQWA 5AQMA 3CQXA 4GY2B 4RWTA 4WQ4C 3D2FA 4A2AA 3H6EA 2E1ZA 3VF2A 1NGIA 2P9NB 2ZWHA 3EO3A 1OKJA 2E2OA 2PBDA 2GELA 1HKCA 2UYTA 4CZIA 3CJBA 5KPZA 5E84A 1V4SA 1ZBSA 3U8XA 3HZ6A 2NRHA 4BRGA 5KPTA 1NBWA 1QZ6A 3QB0A 4MLEA 1MWKA 3WXIA 2A5XA 4YDUC 3C7NA 3LM2A 3ZETB 2Q97A 4NO7A 2P9UA 5KQ8A 3WT0A 2E2NA 2A42A 3GG4A 4MLHA 2D0PA 2P9KA 3L4IA 4CZEA 3BEXA 5AQQA 3FZLA 3H1VX 3R6MA 4H0PA 2P9IB 3QDKA 3OHRA 3UE5A 2GTDA 4QS9A 4BRMA 3VESA 4FWOA 2IIRA 3H3OB 4FWKA 3ENHA 4BRCA 1NGFA 3MN5A 3WUHA 3WXKA 3SJHA 5FPEA 3CETA 3CIPA 1RGIA 5JLHA 1E4FT 4FWRA 3P4IA 3AAQA 3QMLA 2P9PB 2I7NA 5AQIA 3L0QA 4BRPA 4AM7A 1HLUA 1RDWX 2E2PA 5AR0A 4JD2A 3A5OC 5TKYA 1SZ2A 4I6MB 2P9SB 5I9EB 3UKRB 3WQTA 4XH4A 2V7ZA 1QQOA 3S41A 3VEZA 3MK6A 4B1WB 1MA9B 2QWOA 4MO4A 2D0OA 5BN8A 5AZJB 4XH5A 4JNEA 3VEWA 4CZFA 3D2FB 1R59O 4BROA 5BPLA 2D4WA 2VCPA 1HKGA 4NB4A 4BRQA 4DHYA 3DWLA 4CZKA 3M3ZA 4CBXA 1KAXA 2VYPA 2W40A 4M63C 3ZEUB 5BRDA 3VGKA 3C7NB 4ISGA 1ZXOA 3LDPA 3FFKB 1X3NA 4CI6A 4JAXA 2YJFA 2GEMA 3C0BA 3LDLA 5F0XA 2QWQA 4K25A 5EX5A 1X3MA 3R8EA 2Q0UA 3DAWA 4M7XA 2D1KA 5AQUA 1HX1A 1HKBA 4FWLA 3VERA 5AZIB 4BG9A 5JICA 3CJ9A 3A5MC 4K41A 3LDNA 3ATVA 1ATNA 3VEOA 2PAVA 4O8KA 2W41A 1IG8A 1S3XA 5JLFA 4ISEA 2FSNA 3VOVA 4BREA 5LY3A 4B1XB 1DKGD 4BGAA 4PKIA 4IJNA 2HMPA 1GLLO 3CJ7A 3DXMB 1NGAA 4K42A 4BC4A 5LJWA 3ZX3A 4GNIA 1Z6RA 4IXCA 3DXKB 3D2EB 5ADXH 1E4GT 3IUCA 3VPZA 2BTFA 1Y64A 3O6WA 5LJVA 1GLDG 2QWRA 3H45C 2YJEA 1HJOA 1XC3A 5JMVA 3FZHA 2YHYA 2ZF5O 4CBUA 3B8AX 4FSVA 2HF3A 4H0VB 4WQ4A 2QWLA 3BF1A 2QWMA 3UKUB 4BG8A 4C23A 1TYQB 1QHAA 2F9TA 4CZJA 3AAPA 1BU6O 2HOEA 3QICA 4PKHA 5AQKA 3SK3A 2CGLA 3LL3A 3MMVA 4J8FA 3VGLA 4F9OA 4PL7A 2FF3B 3WQUA 4BRNA 4YDUA 2E2QA 2E88A 5AQVA 3VEXA 1GLFO 1T6CA 1NLVA 4A61A 5BPNA 3SMPA 4FWMA 1BWFO 5EOYA 5AQTA 4BQZA 3MN7A 3F9MA 3TPQA 3ATUA 2CH6A 2P9LA 4H5WA 3MN6A 5AQHA 4A2BA 2A41A 2FXUA 4BC2A 1KAYA 1Z05A 3FZKA 4H03B 2V52B 1T6DA 4ISFA 3CI5A 4JHDA 2FSJA 3WXJA 2QWNA 1IJJA 4FWQA 3HSCA 4Z94A 1DGKN 3EKSA 1JCFA 4FWPA 3HI0A 3KVGA 2IVOA 3VETA 3JS6A 1U2VA 4RTFD 4IO8A 1DEJA 1X9JA 3FR0A 1BOTO 5AQGA 2CH5A 3ZX0A 4H5NA 4E1JA 4BRIA 3IFRA 1RFQA 1BDGA 4H5TA 3QFUA 2AA4A 3O1BA 3UB5A 2WUSA 4IJAA 1V4TA 3BF3A 4H5VA 3J8AA 4JN4A 2FF6A 5BRFA 2QXLA 3RSEA 4CZGA 4B1UB 3CJAA 2IVPA 3U4LA 5AQYA 3CQYA 4BRAA 4XEIA 2FLOA 1NM1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N47A 2X6SA 2XY6A 5BREA 1Y97A 3SLCA 3VQAA 4OPJA 4OPHA 2DPNA 2Z1HA 1HUXA 3CCUN 4DTMA 1EP4A 4O0IA 2GUIA 4PL8A 1EETA 1TUYA 5HRNA 2UXDK 1NGHA 2EWSA 3IDHA 1BUPA 3AO5A 3HYFA 4M42A 4CBWA 4M3UA 1KD1O 3MN9A 4QS7A 5M1OA 3HJFA 2YCHA 2WBNA 3FFIA 4FK0A 3LWLA 1WBDA 3AA2A 1NMDA 1ESVA 1QVFM 3O3HA 4CGJA 4FJJA 3JYTA 5IWAK 2G8HA 4BR5A 2QXFA 1BI4A 5FPMA 3HTVA 2Q3SA 3HBTA 1QZ5A 2P9PA 5FRNA 3TTCA 3EE9A 2BUPA 2WTUA 4BR4A 2PFUA 3QEWA 4CERA 4JI4K 4WF9L 5EY4A 2Q2RA 4I6MA 3UKRA 5JVGL 4DQRA 4HTLA 3AVFA 3BUZB 4FJIA 1ZBHA 4CF2A 1WSJA 1ZC6A 2RHKA 4H0YB 5FPDA 1S1XA 3O9UA 3GDQA 5ELZA 3OYMA 5DM7L 4JK7A 1NGBA 4CJUA 1VQON 4KHWA 4AM6A 4QS8A 4IO9L 3RMBA 3G71N 3V9WA 4BVOA 3M6GA 4GVEA 1O1WA 1WOQA 3V9UA 3NH2A 4N41A 4DU1A 3LWMA 4DSFA 1ILYA 1OVQA 3CG7A 3DLKA 3ZT1A 5I3UA 1Q81O 4FZXC 1OVYA 3FE1A 1VSKA 3IMXA 1VSHA 4CVNE 4XIUA 4HTUA 2P5GA 4GV9A 5HOOA 2A40A 2OPQA 5CYQA 4CJTA 2GWKA 3KK3A 3HP6A 3LDSA 4CJRA 3CQ8A 1NGJA 3AVAA 5HLFA 4B1YB 1H1VA 1NGEA 1BIZA 3VF6A 3VQQA 3SAHA 5IT9O 2ZD1A 1VSDA 3AARA 1QQNA 1K8KA 5FROA 4YOXA 4OKKA 4R79A 1GLAG 3H46O 2W6LA 3VEVA 3ZT0A 4PUOA 2Z1GA 2UXBK 1MWMA 4X64K 4FOIA 3D2EA 1LW2A 4BR9A 4O55A 5F2RA 3EN9A 4E7HA 1L3SA 4V19S 4IEEA 3VTHA 3M1FA 3O8MA 4IZ9A 4DR1K 1E3MA 3GBTA 3U9DA 3U3YA 1FK9A 2E8AA 4CJ5A 2OTLN 2YNIA 3K5OA 3WEEB 3B6OA 4ICLA 3HOSA 2KHOA 1J53A 2ASOA 4FM0A 3LP2A 4B1ZA 3SUPA 5JS1A 4CJQA 3ULEB 3D0PA 2OZSA 3OBYA 3EZWA 4LD0A 2BH1A 1IO2A 2AP1A 3CJ1A 3JXUA 3TWHA 1RT2A 3O4WA 1D9DA 4IWVA 5HROA 4E7LA 3AY9A 4Q5VA 2IDOA 3H3NO 2E1YA 2F9WA 5MLCQ 4O5FA 1WUAA 3MCPA 3ZX2A 4WQ5A 3ULDA 2BE2A 2HVHA 4DS4A 3AVNA 4CW7B 1KVAA 1CZAN 1WSHA 2XO7A 1LOTB 2ASPA 3OYBA 5AQOA 1KFDA 3ZT2A 3VQ6A 3OYAA 4LF5K 2XY7A 3S3MA 1K9MO 3NDKA 3IAYA 4FPBA 3WXLA 4M45A 5AQXA 3K9KA 3Q7CA 1BO5O 4H5RA 4JRPA 3RSEB 5AQPA 3G10A 3D2FA 1RCHA 3CF5L 2P9NB 2E2OA 1RBRA 5FLXO 2UYTA 3CJBA 1B92A 3KJVA 1DLOA 1CZ9A 2PY5A 2NRHA 1NBWA 3CYMA 4MLEA 4W5TA 3WXIA 4CEAA 3OYLA 1OH8A 3AVLA 3NVKA 2Q97A 1RILA 1Q9XA 4ELTA 2Y1JA 3GG4A 3NF8A 2G8VA 3CFOA 3L4IA 3MX2A 3BY5A 3V1RA 4H0PA 4CK3A 3TSUA 3QDKA 4CGIA 2GTDA 4QS9A 2HNZA 1VQKN 3WUHA 1NMNA 1NK8A 5CYMA 4DLGA 1BI4B 4DQSA 4OO1J 4RW7A 4B3OA 4EZ9A 2P9PB 4AHCA 4O5BA 4FK4A 3QIOA 5AQIA 3MWTA 1RDWX 3SBTA 2VWKA 3A5OC 1NOYA 1SZ2A 2B4JA 4I6MB 2IOCA 4FYDA 4DR7K 3UKRB 3K59A 3AO4A 1KTQA 3AVHA 1VQLN 1QQOA 1W97L 1S5JA 3RR7A 4OGCA 2Z1IA 3HOTA 4XH5A 4MFBA 1ASVA 5BPLA 2HNYA 3TAFA 4YOWA 3VTIA 1HR0K 2E6LA 2QKKA 4CHNA 2HBKA 3KLEA 4CF8A 1KVBA 4CBXA 1S1WA 1KAXA 4DTPA 3S5TA 4KPYA 4B08A 2VQFK 3HXMA 3OJUA 4C8KA 3LDLA 4K25A 5EX5A 4CJEA 1XHXA 3DAWA 3O4NA 1HKBA 1TAQA 1ZBIA 3VERA 4BG9A 4KO0A 4F8RA 2GX9A 1TK0A 5JICA 1S6QA 4I7FA 3ZSWA 3A5MC 4K41A 4DTRA 3V9ZA 4NXNK 3ATVA 1NJWA 4MDAA 1ATNA 3VEOA 4J2DA 1ITGA 5HBMA 5JLFA 3D45A 5J2QA 4DTJA 3OS2A 3C94A 4IJNA 4CK2A 5D3GA 1GLLO 2VGNA 3P38A 4K42A 3ZX3A 4Q0BA 1VQ5N 3HL8A 3K5NA 3D2EB 3B6PA 1E4GT 2BTFA 1Y64A 5LJVA 2QWRA 1HJOA 1UWBA 4B3MK 4FW1A 3F5TA 3NBPA 4CHQA 5C10A 4WQ4A 1R0AA 2QWLA 4BG8A 2WOMA 1B9DA 3E01A 2RPIA 4CHYA 4C8OA 4CZJA 1M1KO 1BU6O 2HOEA 4JI3K 3SK3A 2WC9A 1JXEA 4KAZA 2CGLA 2D0AA 2HNDA 5C0YA 3SNNA 3V6DA 5AQVA 1W0HA 4DTUA 1T6CA 2YNHA 2X78A 4GKJK 4JKEA 4FWMA 5EOYA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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