2BTFA

The structure of crystalline profilin-beta-actin
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
374
structure length
373
Chain Sequence
DDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Acetylation and actin-binding
molecule keywords BETA-ACTIN
publication title The structure of crystalline profilin-beta-actin.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 106
structure length 373
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2btfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2btfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2btfA03
3WXJA 4K43A 5F2RA 1P8ZA 1HLUA 5AZJA 4BC2A 2I7NA 1U6ZA 3G25A 4CZMA 3FGUA 4BRFA 4PKGA 3HM8A 4LC9B 1D4XA 1ESVA 3A5OC 3CJBA 3QB0A 1SZ2A 3ULEA 4AM6A 1GLEG 1RDWX 2QWOA 4FWNA 4WQ5A 3CHWA 4K41A 1BO5O 3QBXA 3D2EB 3C7NB 2NZTA 4XEIA 3DXMA 2CGLA 1ATSA 3CQYA 5BREA 4AM7A 2HF4A 2ZGZA 2E2NA 2ITMA 3WEEA 3EN9A 4CD3A 3RSEB 2GWJA 1HX1A 5LJVA 4K42A 3MK6A 5KQDA 1T44A 2YJFA 3CIPA 2Q36A 4FPBA 2WUSA 4FSVA 4FWSA 3S41A 4BR2A 3A0IX 3CJCA 3VEYA 2YHXA 3AAPA 1DEJA 5JMVA 5AQOA 1LOTB 4XH1A 3R8EA 3ZX0A 1GLAG 1TUYA 3WUHA 1H1VA 1Y64A 4BVOA 2DPNA 2Q31A 4YDUC 2VYPA 5EY4A 3ZETB 5FPMA 5EX5A 3VF6A 2BTFA 3FR0A 2A41A 2P9NB 3GE1A 2BUPA 2P9SA 5BRDA 4IJAA 4FWRA 5FPDA 4CZLA 2J4RA 3DXKB 3WQUA 2GELA 3SK3A 3A5LC 4B9QA 4BVPA 1QQMA 3CJ1A 2A42A 3CJ9A 1HPMA 2P9UB 5B8HA 3VEOA 1NGCA 3HBTA 2A40A 1JCEA 5AZIB 4B1YB 4CZFA 4CBWA 1ZC6A 4BRDA 1WOQA 4HTLA 1YUWA 4IZ9A 1GLJO 3SMSA 4JHDB 2IVNA 4CBUA 5AQLA 3P4IA 2YHYA 1R59O 3JS6A 4MLEA 4QS7A 3GDQA 2Q1NA 5E26A 1YAGA 5AQGA 4Y0WA 2QWMA 4BGAA 4GNIA 5AQXA 3WQTA 3HI0A 1MWKA 5EVZA 2GEMA 1BG3A 1GLFO 3VOVA 5F0XA 4BRNA 4H5TA 1S3XA 4RCHA 3CJ7A 2IIRA 3ULEB 3L0QA 1NMDA 4CZJA 2GUPA 3FZLA 3R6MA 2FXUA 2P9PA 3ATUA 3VEXA 5BR9A 5AQJA 2ASOA 3EKUA 3MCPA 1T6CA 3M6GA 3LDPA 4MLHA 5KQ8A 2HMPA 2E2OA 2EWSA 2GWKA 3AARA 3JXUA 2QWRA 2YI1A 3BF3A 3LM9A 5F1XA 3LDQA 3SMPA 4CJ7A 4PKIA 3BEXA 3I8BA 2IVPA 3MN5A 4DQ8A 1KAXA 2QWLA 3H3OB 3VEVA 3MDQA 1OKJA 1QZ5A 2W40A 3MN6A 3BF1A 3EL2A 4O5FA 1NGIA 2CH6A 2QW9A 4IJNA 5KPZA 4BRLA 4NO7A 3AAQA 4JD2A 3IFRA 2D4WA 3GOIA 1ZBSA 4BRGA 4XH5A 5AQKA 4H0OA 3J8AA 4EFHA 1TYQB 1NLVA 5AQTA 4I6MB 4M63C 5AQYA 5AQZA 3A5MC 2P9SB 1EQYA 1C0GA 4BC3A 5TKYA 2P9KA 3CI5A 4IWVA 2E2PA 4BC4A 2I7PA 3O80A 4L3QA 3O1BA 3ID8A 3FE1A 2A6AA 2D0OA 4FWQA 2PBDA 1K8KA 4A61A 2E2QA 1G99A 4ISEA 3FFKB 3ZEUB 2P9LB 2H3GX 2E20A 3O8MA 3H1VX 4WQ5C 4HWIA 2CH5A 2QWNA 3UKUA 5JLFA 2P9IB 1XQSC 3KHYA 3WXKA 1NGGA 1KAYA 5BPLA 1DGKN 3LDLA 3WT0A 4BG8A 4BRCA 1X9JA 1KAZA 4FWMA 5BN9A 2CGJA 3BP8A 2ASPA 5EXWA 4WQ4A 1HKBA 4JAXA 5FPNA 5CE3A 3D2FB 4CI6A 3M3ZA 1E4FT 3U4LA 5ADXA 1BUPA 3O08A 5BPMA 4BRHA 4M7YA 3C7NA 4MO4A 3B8AX 4FOEA 1CZAN 1U2VB 3DJCA 4CBXA 3UKRA 4BR0A 4BR7A 3RSEA 5BPNA 3IUCA 3SLCA 1ATNA 3L4IA 1X3MA 1X3NA 2A3ZA 2GTDA 4H0XB 3R9PA 4XH4A 1TUUA 4Z94A 3CQXA 5KPTA 5AQUA 1YVNA 4BGBA 2QM1A 4BR5A 1Q18A 1E4GT 3VEWA 1HKCA 3F9MA 2AA4A 3HSCA 3VEZA 1SAZA 1V4SA 3C0BA 4WQ4C 3CETA 2VWBA 3VERA 1BA1A 4KBOA 1QQNA 3ENOA 2F9WA 5AZJB 1SQKA 1MA9B 4QS8A 3WXIA 5BN8A 4BQLA 3HZ6A 3LM2A 4GY2B 1C0FA 5AR0A 2P9NA 4BROA 5AFUA 4FWOA 2NLXA 4CZIA 4CZEA 2AP1A 2D1KA 1GLBG 2FSJA 4H03B 1WUAA 3DXKA 4F9OA 4M7XA 4H0PA 3QFPA 3H1QA 4BC5A 3DXMB 3IDHA 3EZWA 1ZXOA 3WEEB 3H46O 2P9UA 2Q0UA 2HOEA 2Q2RA 1NM1A 3O6WA 1NGEA 1Z05A 2W41A 4IXCA 3D7EO 3GBTA 5AZIA 4A2AA 3MMVA 3FZMA 4B1XB 1NGFA 1YXQA 2ZWHA 2FLOA 4B1ZA 2FF6A 1HKGA 1T6DA 3WXLA 4JHDA 3EKSA 5AQSA 4H0YB 1BDGA 2OANA 1RFQA 2QWPA 1IJJA 3FZHA 3UKUB 5BRFA 1BWFO 2IVOA 3QDKA 3CJAA 3U8XA 4H0VB 3DAWA 3M1FA 4A2BA 3QMLA 2KHOA 3FZFA 4BRMA 2V51B 4FOIA 3GL1A 5AQQA 2YCHA 4EHUA 2NRHA 2F9TA 4H0TB 1J6ZA 2E8AA 3IMXA 2YHWA 3W3DA 1RGIA 1BOTO 5AQWA 4YDUA 5BRHA 1S22A 4MO5A 2Q97A 3ZX2A 3UB5A 3VGMA 2QXLA 3FLCO 1NGHA 1Z6RA 2HF3A 3ATVA 3GG4A 2Q0RA 3UKRB 4BRPA 3VENA 4FWPA 1QZ6A 1HJOA 4FO0A 3VPZA 3QBWA 1KXPA 5AQVA 4FWLA 4ISFA 3OHRA 3TU5A 2ASMA 4FL9A 3O5BA 4H5WA 1XC3A 1NGAA 2FSKA 4H5VA 5AQFA 5I9EB 3VGKA 4CD1A 5AQPA 4RWTA 4H5RA 3LDNA 3U9ZA 3EO3A 1MDUB 4BG9A 4PL7A 3QICA 4B1UB 3A8YA 4CZHA 3D2EA 3A5NC 4EIAA 3MN7A 4IO8A 4BQZA 4DB3A 2FSNA 4BRIA 3BUZB 4DCHA 3UE5A 4E1JA 4EHTA 1LCUA 5JLHA 3H6EA 4JN4A 1TYQA 4BR9A 1XUPO 1GLDG 1NGJA 1MWMA 4I6MA 4FPAA 4BRQA 1NWKA 2V7ZA 2P9PB 2E1ZA 5AQRA 3W0LA 2V52B 3VF2A 3QFUA 1BU6O 3VESA 4A62A 4ISGA 2UYTA 5LY3A 1JCFA 3FZKA 3KVGA 4JNEA 2CGKA 3O1WA 4FWKA 3ZEUA 2P9LA 5EOYA 3TPQA 2D0PA 4NB4A 3LL3A 2P9IA 4EAHD 3ZETA 5AQNA 3AY9A 5ADXH 4O8KA 2E1YA 3L6QA 1QHAA 2VCPA 3VETA 3H3NO 3H45C 3U9DA 4CZGA 5JICA 4J8FA 3D2FA 4CZKA 1NGDA 4JD2B 1NBWA 1HUXA 3HTVA 3LDOA 4BRKA 2QWQA 4BREA 3DWLA 1JCGA 5AQMA 1GLCG 1U2VA 4BRAA 4B1VA 1GLLO 3MN9A 2ZF5O 5AQIA 2FF3B 4RTFD 3ENHA 1V4TA 2ZGYA 4BR4A 5AQHA 5LJWA 1IG8A 2A5XA 1NGBA 2P9KB 4WYBA 2PAVA 4C23A 4QS9A 3VGLA 4K25A 4DHYA 1BA0A 5ELZA 2V7YA 3CERA 3VF4A 3KZBA 4PL8A 1K8KB 2E88A 5FPEA 3O4WA 5E84A 1QQOA 1DKGD 3SJHA 3ZX3A 1ATRA 5KPRA 4H5NA 4PKHA 4B1WB 2YJEA 5AFUH 3I33A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NK4A 1P8ZA 3SBGA 1HLUA 4CK3A 4CECA 2I7NA 1U6ZA 3IAYA 4E7IA 3OA9A 3HM8A 1ESVA 2X74A 1SZ2A 1GLEG 1KVBA 4WQ5A 4K41A 3OYIA 3C7NB 3KWIA 3TAQA 4JK8A 3OBWA 4W5TA 1NOZA 2CGLA 2Z1IA 1ATSA 5EU7A 5BREA 2ZGZA 4L8RB 1G15A 1LWEA 3WEEA 1WSFA 1WBDA 1T44A 3CIPA 4DSEA 1OH7A 1HQUA 2WUSA 3I8DA 3K5NA 3OYJA 4FSVA 4N41A 1EP4A 3VEYA 2PZSA 2YHXA 3AAPA 4BWMA 4DF8A 3LP1A 3VN5A 1W97L 3NF6A 3SZ2A 3CXCM 3AV9A 4IO9L 3S3NA 1VQ9N 3WUHA 2Q31A 3CCJN 1A5XA 3NGIA 2VYPA 3F9KA 5EY4A 4BE0A 3VF6A 3OYNA 4OX9K 2HVHA 2BUPA 1ITGA 5M1NA 1YJ9N 3J7AP 2P9SA 4JRPA 5FPDA 4CZLA 3SV3A 1I39A 4FXDA 4B3OA 3SK3A 3A5LC 4CF0A 2UUCK 3CJ1A 2WFBA 4KO0A 1TK0A 1JLFA 2HHIA 1A5VA 2OPPA 3VEOA 3CC7N 3QINA 3HBTA 2A40A 4CEAA 4KI6A 1RTDA 1SUQA 1YHQN 4CZFA 1ZC6A 3ASMA 1YUWA 2FBTA 4YHHK 4ID5A 1GLJO 4DV7K 3N4QA 3HPHA 4FVMA 4CJ3A 1R59O 1JKHA 3JS6A 3L4QA 1CXUA 4IEEA 3U6FA 4Y0WA 2QWMA 4FZYA 4BGAA 4EZ9A 1TKTA 3WQTA 3HI0A 3RMCA 1JJ2M 3DOKA 1OVYA 1GLFO 4F4KA 5F0XA 4AH9A 1S1TA 2IS3A 3CJ7A 2IIRA 4CGDA 2NRXA 3DYAA 4CZJA 2P9PA 3VQ9A 4RW6A 2DY4A 4DTRA 4JI5K 3EKUA 4CGIA 3M6GA 1UWBA 3LDPA 5KQ8A 4CW7B 1HJRA 4M3YA 2HW3A 2GWKA 3EYZA 3BF3A 3KLIA 3BEXA 3I8BA 3MN5A 3NAEA 4JS4A 1XWLA 2HHQA 3H3OB 4C8LA 3U3GA 3O3HA 2UXBK 2NRWA 2B4JA 3LWMA 3TANA 1VQON 1VAZA 3D45A 3MN6A 2LSNA 3EL2A 3E9OA 4O5FA 2CH6A 2QW9A 4IJNA 2F8TA 4IDHA 3AAQA 3O3GA 4UQGA 4XH5A 1ZBLA 3G0ZA 1LWFA 4EFHA 1N8RO 5AQTA 2EX3A 4M63C 5FRNA 3C6UA 2P9SB 4JS5A 2HHSA 4BC3A 1NOYA 3SJJA 4DMNA 1KRPA 3QESA 4PQUA 3CI5A 3AA2A 3O80A 4B9VA 3HPOA 1HMVA 3OYLA 2E2QA 1G99A 4ISEA 3FFKB 1IO2A 4FJJA 4HWIA 4JI1K 2CH5A 2P9IB 4E1MA 3CFOA 4JKGB 1KAYA 5BPLA 4LF5K 3LDLA 3QEPA 1VSFA 3SPZA 4CHOA 1QSLA 3RRGA 3DLGA 1X9JA 3AGKA 4FWMA 2BGGA 3THYA 2CGJA 3EE8A 1L5UA 1HKBA 4RG8A 4JAXA 5FPNA 4CJTA 3VQBA 4IEIA 3D2FB 1RBRA 4CI6A 3U4LA 3VQDA 1E3MA 1BUPA 5BPMA 1N5YA 1VSMA 3J81O 1I94K 4GKJK 4JKDA 3PX6A 1IKXA 3N4PA 4E72A 3VQCA 4DQRA 3SAHA 3L2RA 4CBXA 3HK2A 2G8KA 3QNOA 3NCIA 2P5GA 4KHNA 3O9RA 2GTDA 1CZ9A 2E6MA 5DK5A 1KFDA 1WSGA 3V4IA 3NF9A 4Y1CA 3OY9A 5AQUA 4KH6A 3VEWA 3F9MA 2AA4A 4G1QA 3K0SA 4IFVA 4WQ4C 3CETA 4GV6A 4R79A 3OTOK 2Y1JA 4JKFA 4KBOA 4QS8A 1C0TA 3RR7A 4YOWA 2WC9A 2G8VA 4BROA 4FJ7A 5AFUA 4CZIA 4CZEA 3NH1A 2FSJA 5KTQA 4KH4A 5GAEP 3LZIA 4H0PA 3QFPA 3H1QA 1HNIA 5CYMA 1RBSA 5IWAK 3VTHA 2P9UA 2Q0UA 2HOEA 4IXCA 1J5OA 4AHUA 1YXQA 3OYDA 1GOBA 3TTFA 2FF6A 4FJGA 3AO4A 5GIOA 4BE1A 3TR8A 3DAWA 4BRMA 2V51B 4FOIA 3GL1A 3THYB 2YCHA 1BCOA 1DLOA 3CYMA 3O9QA 4FLTA 3HOTA 2E8AA 3IMXA 3W3DA 4M41A 4CEOA 1QE1A 3MXMA 2O8CA 4MO5A 5KGXA 3TSUA 1FKPA 4GW6A 2O8EA 3AVGA 3AA4A 4CEZA 2HF3A 1EXQA 4JLHA 4N56A 3VENA 4RW9A 1QZ6A 3VPZA 1ASVA 4IOCL 3ITHA 4CJFA 4FWLA 4ISFA 1CLQA 1RT3A 2ASMA 1XC3A 3OYCA 1XNQK 4H5VA 1QQCA 5AQPA 1HNWK 1IKYA 3SAGA 3U9ZA 2VQEK 4H4OA 3ZT3A 4BDZA 4CZHA 3S3OA 1LAVA 4BQZA 2FSNA 3RMBA 4DCHA 5J2MA 3K9JA 2OCEA 1GLDG 2HBLA 2X6NA 4I6MA 2YV0X 2KLAA 5J2PA 2E1ZA 5JVGL 5JENA 3KLHA 4WFNL 2V52B 3VF2A 4O4GA 2OZMA 1BU6O 3VESA 4A62A 1REVA 5LY3A 4I2PA 4DFMA 3KVGA 1LV5A 3NMUA 1WAFA 4LF4K 3LPTA 4CHYA 3ZEUA 4Z4CA 3LPUA 1NKCA 4ILHA 3IRXA 2ITGA 3WXMB 4N5SA 5ADXH 1NK6A 2E1YA 1OH6A 3TAFA 1RTJA 2RN2A 1NK8A 1BIUA 3V9UA 3U9DA 4LFBK 3TARA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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