2BTFA

The structure of crystalline profilin-beta-actin
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
374
structure length
373
Chain Sequence
DDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The structure of crystalline profilin-beta-actin.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Acetylation and actin-binding
molecule keywords BETA-ACTIN
total genus 106
structure length 373
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2btfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2btfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2btfA03
1C0GA 4JD2A 3BUZB 1GLLO 3WEEA 4C23A 5EVZA 1BG3A 4B1YB 3WEEB 1LCUA 4EHUA 1GLBG 1ESVA 4JN4A 4DQ8A 3CJAA 1YAGA 1HX1A 2QWNA 3QBXA 3SK3A 2E2PA 4XH4A 3W3DA 3LDNA 3RSEA 1NGCA 4CZIA 4CZFA 2GUPA 2E88A 4WQ5A 3I33A 4FOEA 3WQTA 4BR2A 3WXIA 5F1XA 4A61A 3O6WA 3UE5A 1HJOA 2QXLA 3C7NA 1U2VB 1XUPO 3HTVA 5FPEA 2FXUA 3EKUA 2D1KA 4DCHA 2QWRA 3ZEUB 3AARA 5EOYA 4JAXA 4IJNA 1CZAN 3L6QA 4EFHA 1ZC6A 3D2EA 3VENA 3A5OC 1DEJA 1GLFO 4BGAA 5AZIB 4EIAA 2A3ZA 4GY2B 3VF6A 1TUUA 5AQVA 1K8KA 1HKGA 2QWMA 5AR0A 4BC2A 4EAHD 4AM7A 3FZFA 1BOTO 5BRDA 2Q2RA 3U9ZA 1RDWX 3VEXA 2V7ZA 3VEZA 3CIPA 4H5NA 4H0PA 4CD1A 1J6ZA 1HPMA 3QFPA 2IIRA 1X9JA 3L0QA 4H0YB 4BRCA 2IVOA 2DPNA 5FPMA 3FZKA 2KHOA 4BC4A 4B9QA 4BREA 5EX5A 5BRFA 3ATUA 3D2FA 3QFUA 4MO4A 3B8AX 4NO7A 1DKGD 4IJAA 5BREA 2NZTA 1DGKN 4DB3A 3L4IA 5AFUA 4GNIA 4BRPA 2E1YA 3ZEUA 2P9KA 4JNEA 5AQFA 1GLCG 1YUWA 3ENHA 2I7NA 3CJ1A 3O5BA 4MO5A 3TPQA 3O08A 2AA4A 5KQ8A 2QWOA 3EZWA 3FLCO 3FZLA 2V7YA 3QDKA 4BVPA 1S3XA 4PL7A 3CHWA 3FGUA 1IG8A 4JHDB 3HI0A 4H5TA 1TUYA 1KXPA 1K8KB 3GL1A 1E4GT 1BA0A 3CERA 4RWTA 4IZ9A 4FL9A 2GEMA 4BR7A 4BR4A 3M3ZA 4NB4A 4MLEA 1NGEA 1X3NA 4BRQA 1BO5O 4BRNA 1IJJA 5KQDA 2VWBA 3MMVA 4BRHA 2YJFA 4CZKA 2P9LB 2P9NB 1NGHA 1NLVA 3FZHA 3CI5A 4BR0A 2CGKA 2WUSA 3GBTA 5KPRA 4CZJA 4CJ7A 3DJCA 4CZLA 4ISFA 3ZX3A 1HUXA 3A0IX 3ZX0A 3FR0A 2P9SB 2P9PA 3VEYA 2NLXA 2ZGYA 4QS7A 1OKJA 3VEOA 4J8FA 1NWKA 4O8KA 3CJCA 2VYPA 4PKHA 1T6CA 3O8MA 5E26A 4XH5A 3P4IA 1BA1A 4BRMA 4FWQA 3AAPA 4PKIA 5AQZA 3A8YA 2A41A 5AFUH 2ASOA 3UKUB 1U6ZA 5LJWA 3LDLA 5AQPA 3AAQA 3GOIA 4CBUA 1NGIA 4I6MA 2QWLA 1Q18A 1MWKA 5AQKA 2V52B 3LL3A 1KAZA 1WOQA 3ZX2A 4F9OA 4B1ZA 2CH5A 5CE3A 3I8BA 2BUPA 2ASPA 1V4TA 2FF3B 4Y0WA 4CBXA 3H45C 4YDUA 5AZJB 3UKRB 1ZBSA 3CETA 3WXJA 3M6GA 3M1FA 2E2NA 1XQSC 2FSKA 2FF6A 3JS6A 1ATRA 4FWMA 3D2EB 1HLUA 2D4WA 5JLHA 3BEXA 3BP8A 3SMPA 1KAXA 3HM8A 4B1XB 2YHWA 4KBOA 3VOVA 4QS9A 5BR9A 3R8EA 3EN9A 4H0XB 4FOIA 2A6AA 5F0XA 2P9IB 5BN8A 2P9KB 5AQXA 3LDOA 4MLHA 4WYBA 4K25A 3VESA 3IUCA 1P8ZA 2YHXA 4A2BA 1GLEG 2A42A 3DAWA 4H5WA 4K43A 4BRFA 3H1QA 5AQLA 4H0VB 3CQYA 1NGDA 3H3NO 4ISGA 3WXLA 1LOTB 3ID8A 3SLCA 1C0FA 3W0LA 5LJVA 2HF3A 1NGAA 1MDUB 2Q31A 2ZGZA 3MN9A 4H03B 3H3OB 3QB0A 2QWQA 4CZMA 4B1WB 5KPTA 1NMDA 1RGIA 1R59O 2J4RA 3F9MA 5AQSA 3GG4A 3VGLA 4BRGA 4FPAA 3SMSA 3DWLA 4IWVA 1NBWA 5EXWA 2YHYA 4A62A 3ZETA 1Y64A 3VF4A 4JHDA 2ZWHA 3C0BA 3VETA 2YI1A 1BWFO 1NGBA 2V51B 3J8AA 4HTLA 4K41A 1BU6O 4LC9B 4PKGA 2P9UB 1D4XA 5AQUA 2NRHA 1QQOA 2P9UA 2Q0RA 4WQ5C 3LM9A 2ZF5O 3LDPA 4M7YA 3H1VX 5AQQA 4BR5A 2BTFA 3WXKA 2FSJA 4FWKA 1MWMA 1NGGA 4A2AA 2GELA 1ZXOA 5JMVA 1YVNA 3R9PA 1QZ6A 3O1BA 1JCGA 4O5FA 4FWPA 2ITMA 4B1VA 4BRKA 5AQJA 3EKSA 3G25A 1S22A 5FPNA 4BGBA 1NGFA 4FO0A 3UKRA 3MDQA 5AZJA 2ASMA 5AQRA 3MK6A 1QHAA 4H5VA 5ADXA 5JLFA 2OANA 3U4LA 4WQ4C 2HMPA 2H3GX 5E84A 2E2OA 2AP1A 4H0TB 2GWKA 4ISEA 3DXMA 1NM1A 5F2RA 5BPMA 3CJBA 4B1UB 5AQWA 4XEIA 3QMLA 4PL8A 4BRAA 3GE1A 3ENOA 5AZIA 2CGJA 3FZMA 4HWIA 3UB5A 3OHRA 5BPNA 5AQMA 3LM2A 2D0OA 3CQXA 3VGKA 3MN6A 2D0PA 2CH6A 5AQIA 2FSNA 4BRLA 2VCPA 1E4FT 3MN7A 2E1ZA 2Q36A 2YJEA 3BF1A 1QQNA 4H5RA 3TU5A 4E1JA 5TKYA 3SJHA 3AY9A 3IDHA 3O4WA 3VPZA 3MN5A 4BRIA 2UYTA 2YCHA 5I9EB 3IMXA 3RSEB 3WUHA 1HKBA 1SQKA 4H0OA 4CD3A 3O80A 4FWSA 2Q1NA 1Z05A 2Q97A 3KHYA 3HSCA 1EQYA 3A5NC 4CZEA 1JCFA 4CZHA 3VEWA 2P9IA 4Z94A 1V4SA 3D7EO 2IVNA 3C7NB 4FWNA 1SAZA 4L3QA 5AQYA 5ADXH 2QWPA 1MA9B 4CBWA 4BC5A 3HBTA 3JXUA 4RTFD 1TYQA 2E8AA 4QS8A 3EL2A 1BDGA 3D2FB 2W41A 5KPZA 1WUAA 4CI6A 3A5LC 2IVPA 1NGJA 5JICA 3LDQA 2EWSA 1GLJO 4FWLA 1Z6RA 1JCEA 2HF4A 1GLAG 3FFKB 5BPLA 4CZGA 5EY4A 3VEVA 4FSVA 1BUPA 1QZ5A 2GWJA 5B8HA 3A5MC 3U9DA 3VGMA 1HKCA 1X3MA 4BROA 4FWOA 4IXCA 2QM1A 1TYQB 3H6EA 3QICA 3S41A 4YDUC 1ATNA 4BR9A 1QQMA 2HOEA 3EO3A 3DXKA 4I6MB 4EHTA 2CGLA 3ULEB 3DXMB 5ELZA 1T44A 5AQNA 3UKUA 4BC3A 4XH1A 2F9TA 2PBDA 3H46O 4FWRA 4FPBA 3HZ6A 1YXQA 4AM6A 3O1WA 2P9NA 2P9LA 1RFQA 3KZBA 3U8XA 3BF3A 2FLOA 4BQLA 1T6DA 3CJ7A 3R6MA 2A5XA 5AQTA 3FE1A 1KAYA 4DHYA 3CJ9A 1ATSA 5AQHA 1U2VA 3MCPA 4IO8A 3GDQA 3ATVA 3IFRA 1G99A 3WQUA 4BG9A 2E2QA 3KVGA 2F9WA 3WT0A 2E20A 2W40A 5LY3A 4K42A 5AQGA 2I7PA 2QW9A 2A40A 3ZETB 1H1VA 2GTDA 3DXKB 3VF2A 1SZ2A 4RCHA 3VERA 5BRHA 3ULEA 2P9PB 2P9SA 3QBWA 5BN9A 4BVOA 1XC3A 2PAVA 4M63C 5AQOA 5FPDA 4WQ4A 1GLDG 2Q0UA 4JD2B 4M7XA 4BG8A 4BQZA 4BRDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DU3A 3K5MA 4F3TA 2EX3A 1BG3A 1JLCA 5JVHL 3CCRN 1S9GA 4EHUA 4IDKA 1YI2N 3NGZA 1ESVA 5C0YA 3NH0A 1YAGA 2BH1A 3FFIA 1KFSA 3W3DA 3LDNA 3P1GA 3P39A 3Q7CA 4Q5VA 3ZSYA 2KKZA 3EE8A 4MDBA 2FC0A 4CZFA 3LZIA 5F1XA 3HP6A 2QK9A 2OPRA 3C95A 3WXIA 5HLFA 3I0RA 3TAEA 4JI8K 2E5LK 2O8EB 3ZEUB 4FW1A 2HBMA 3AARA 1NMNA 1CZAN 2A1SA 2OPSA 3NF8A 1ZC6A 4EFHA 3VENA 4O0JA 5GADP 1DEJA 1RDCA 1NKBA 5SZTA 3VF6A 4B3RK 3OYNA 2QWMA 3PSFA 1SUQA 3M8QA 4I7FA 2ZJRL 1BOTO 3VEZA 2V7ZA 4OPHA 4H5NA 4H0PA 2JWKA 4CD1A 3QFPA 2YNIA 2IVOA 2DPNA 2W6LA 2VQFK 3O9RA 4JI5K 1Z26A 4KRFA 4KREA 4RW6A 1K8AO 4MO4A 3B8AX 4DTXA 1DKGD 4X65K 1DGKN 4DB3A 5AFUA 4CIGA 3THXA 2E4LA 3C6AA 4BRPA 1L3UA 3ZEUA 3G0ZA 2P9KA 4KV8A 5HRNA 1HRHA 5AQFA 4AQYK 1M90O 2RHKA 3LP1A 4MO5A 3TPQA 4DF4A 3O08A 4ZTJA 5KQ8A 3QDKA 3E1YA 3ZSVA 3S3OA 1EKEA 3FGUA 2P5GA 4KTWA 4G9ZA 4H5TA 1TUYA 4M3WA 2O8FA 3EE9A 4JK7A 3NH1A 2O4GA 1BA0A 5DM6L 4R5PA 4RWTA 2O8DA 2WOMA 3VQPA 3NE6A 1RT2A 4O4GA 2HNZA 1X3NA 2AJQA 1BO5O 1IJJA 3MMVA 2P9NB 2ZJPL 3SQ1A 4BR0A 5KRSA 2CGKA 4A57A 4CZLA 1L3VA 4ISFA 1I39A 3A0IX 4DQSA 2P9PA 4GVEA 4O8KA 2VYPA 4CJTA 4PKHA 1ZBUA 1W0HA 4CJUA 1FJGK 4DTMA 3A8YA 2A41A 5EU7A 5C42A 3RWUA 3E66A 3DOLA 2ZD1A 4CBUA 4B3MK 4I6MA 3LP2A 4K0KK 1MWKA 3KD1E 3LZJA 4IOAL 3E9OA 3KLGA 3LANA 4FJ5A 2BUPA 1EP4A 2FF3B 4OKKA 1JXBA 3AVHA 4YDUA 1ZBSA 1M1KO 3M8PA 3NF6A 1JL1A 2WONA 4BACA 1K9MO 3JS6A 4UY8O 4RW8A 1YITN 1ATRA 2GV9A 1HLUA 4JKDA 2D4WA 4BE2A 3OYLA 3PLAA 1UA1A 1W7AA 4B1XB 4DV2K 4FJ9A 2YHWA 4KBOA 3VOVA 1XHXA 4QS9A 4A5BA 2OZSA 1WSEA 4ZHRA 4IG0A 3TANA 4FOIA 4QOZB 2VQEK 1VSMA 1BIZA 1IKXA 3OJUA 4DV6K 2YHXA 5J2QA 4AHUA 1YVUA 1QQCA 3G10A 3DAWA 4N41A 4K43A 2WFBA 1F21A 2KFNA 4CHOA 2XO7A 4CGHA 4KH5A 3KK2A 1Q7YO 1NGAA 2ZGZA 4WE1A 4H03B 3H3OB 4FLXA 4FJHA 2QWQA 4DF8A 4CZMA 4ID1A 2YNHA 1S1TA 3AVJA 3CCUN 1NK7A 1ILYA 3VGLA 3SMSA 4DWIA 2FBYA 3K9JA 1NBWA 2YHYA 3ZT0A 2FBTA 4A62A 2QI2A 4HUEA 4DQPA 1RBSA 4JHDA 2ZWHA 3VETA 3J7ZO 1QSYA 1IG9A 4DTSA 3MWPA 4QAGA 4OVLA 4R79A 1T03A 3UIQA 2P9UA 3WNEA 2ZF5O 3HJFA 2BTFA 1IKVA 3WXKA 3CC2N 3CD6N 1OVQA 2IAJA 1WSIA 1VQLN 1ZXOA 3L2UA 1U49A 4DMNA 3O1BA 2ITMA 4B1VA 4FLWA 5AQJA 4X66K 1N33K 3OYEA 3V1OA 3EZ5A 1TV6A 3ZYYX 1NGFA 5LMNK 2HSTA 3UKRA 5AZJA 3VTIA 1ZBFA 4W5NA 1Q8IA 1RT6A 5E41A 1RILA 5BR8K 3T1HK 2OYQA 3QINA 2HMPA 1JKHA 1D9DA 3KK7A 4CEAA 3I8DA 3DXMA 3K58A 3QEWA 1KVBA 3JYTA 3O9TA 4EZ6A 3NBPA 3QMLA 1QVFM 4BRAA 3ENOA 4ILJA 1IKYA 2B6AA 3UB5A 4DFMA 3THWB 1QTMA 2D0OA 3ZSZA 4CEQA 3VGKA 3MN6A 2FSNA 4BRLA 3LAMA 4YOYA 2E1ZA 4E7JA 2Z1IA 4CCHA 4F4KA 1RBRA 3K9KA 3V81A 4FZXC 4KI6A 3AY9A 3VPZA 3SV4A 3D6RA 3J80O 1RT7A 1NG9A 4J2DA 2UUCK 4H0OA 1TK8A 3O80A 2DFHA 4WFAL 4B9NA 4CHZA 2Q97A 3HSCA 1QE1A 3A5NC 4KPYA 3KKRA 2P9IA 4IFYA 4CESA 4WFNL 1SAZA 3TAMA 5I3UA 4JI0K 5ADXH 1RT1A 4CBWA 4QS8A 3EL2A 5JVGL 1FK9A 3MCAB 4KFBA 4FJ7A 3CYGA 1RDBA 4JKGB 3TTDA 1VQ8N 1JCEA 3FFKB 1WBBA 4QCLA 5BPLA 3S3NA 4CZGA 1EETA 1NK5A 4Y1DA 3P38A 5C15A 3CG7A 3U9DA 1LW0A 3L2RA 2QKBA 1TYQB 1WSJA 4DS4A 3H6EA 4DV3K 4J2AA 2HVHA 2P1JA 3EO3A 2D0BA 4I6MB 1U4BA 3L2QA 3NF9A 3ZT3A 5AQNA 3UKUA 4BC3A 3RR7A 1NJWA 2PBDA 4BE1A 3HZ6A 5GINA 2P51A 1RFQA 3KZBA 2YV0X 3CJ7A 3T1YK 3R6MA 4DHYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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