4B1XB

Structure of the phactr1 rpel-2 bound to g-actin
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
371
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structures of the Phactr1 RPEL domain and RPEL motif complexes with G-actin reveal the molecular basis for actin binding cooperativity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
total genus 123
structure length 357
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4b1xB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4b1xB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4b1xB03
4FWOA 3GL1A 4BRPA 3CETA 4EAHD 3CQYA 5TKYA 2P9UA 3LDPA 4CZHA 4DQ8A 4B1YB 5ELZA 3FR0A 1NGCA 4EHTA 4H0OA 2ZGZA 3W3DA 3KVGA 3O80A 1CZAN 4F9OA 3M3ZA 4BGAA 3FGUA 4XH5A 3GBTA 2YHYA 1ATNA 4QS7A 2H3GX 3DXKA 2P9IB 1NGAA 3MK6A 4M63C 2Q36A 3FLCO 5E84A 4FOIA 2YHXA 3DJCA 3I33A 4CZLA 1DEJA 1K8KA 3CJ9A 3U8XA 4WQ4C 2ZWHA 5F2RA 4H0YB 4GY2B 2NLXA 4BRHA 5E26A 4WQ5C 3DWLA 4LC9B 1GLJO 1BDGA 2Q0RA 4BR2A 3H45C 4H0VB 3A5LC 3J8AA 3H1QA 3CI5A 3ZEUA 2A40A 1JCGA 1NBWA 3QDKA 3UKUB 4EFHA 2E8AA 4Y0WA 3O1WA 4GNIA 5AQWA 4BRAA 3D2FB 2EWSA 4CD3A 3CIPA 5AQGA 4ISEA 3HM8A 4BREA 1Q18A 3SJHA 2FF3B 1MA9B 2GWKA 3QICA 4FWQA 2FLOA 1JCEA 1LOTB 3VGMA 5EX5A 3IMXA 3ZETB 3FZLA 5EVZA 4PKIA 3A8YA 3AAQA 1YUWA 3MDQA 2P9IA 3VPZA 2ZGYA 4BC5A 4B1WB 2ZF5O 3IDHA 4JN4A 3BP8A 3ULEB 4B1ZA 4DHYA 4H5WA 2VCPA 4IWVA 4H0XB 5LJVA 2GTDA 3VEVA 2HMPA 1ZXOA 5BPLA 4H03B 2P9KB 3FZMA 4FL9A 1TUYA 2QWLA 5AQIA 1XQSC 3R9PA 4BC2A 3LDOA 5AZIA 3D2FA 1QQNA 2CGKA 3MN9A 3VF2A 1J6ZA 1BO5O 5KPTA 1ZC6A 4WYBA 2W41A 5AQNA 2CGLA 3KHYA 3VF6A 1RFQA 1QHAA 4YDUC 2E1YA 3U9DA 4IJAA 2Q0UA 4NO7A 3SMSA 2P9NA 4O8KA 5BRHA 3L0QA 3ZETA 1TUUA 4B1UB 3CJBA 1HJOA 3B8AX 4BR0A 2P9PA 1YAGA 1LCUA 4DB3A 1S22A 3GDQA 2F9WA 5JLHA 3QFUA 3QBXA 4BC4A 3D2EA 5AFUA 3ATUA 2P9KA 1DKGD 1WOQA 4FPBA 3JXUA 4CBUA 1X3MA 4M7YA 3WUHA 4BRNA 2E2OA 2FSJA 3C7NA 3ZX0A 4J8FA 4CZFA 1C0FA 4JNEA 2QWOA 3U9ZA 4BRMA 5AQZA 4JD2A 1X9JA 1Z6RA 5F1XA 4A62A 4FWNA 4A2BA 1ZBSA 4PL8A 2E2PA 4ISFA 1GLBG 3UKRB 2QM1A 2P9NB 4BVPA 3H1VX 5AQJA 4BRGA 1NM1A 1NLVA 1G99A 1HPMA 3EZWA 3KZBA 3D7EO 4I6MA 3LDNA 2P9PB 1H1VA 5BREA 2PAVA 2V51B 2OANA 1RDWX 4K42A 2P9SA 2D4WA 3BUZB 3QMLA 3TPQA 5AQHA 2YCHA 3A5NC 2GELA 2D0OA 3VEYA 1ATRA 1IJJA 2HF4A 1GLAG 4JAXA 5BR9A 3W0LA 4BR5A 1KAYA 2GUPA 5FPNA 4HTLA 5AZJA 4B9QA 3EKUA 4IJNA 3VEWA 1ESVA 3C7NB 4L3QA 4B1VA 1TYQA 2CGJA 1NGJA 1MDUB 4CD1A 1BOTO 3VETA 3VOVA 2ASOA 3OHRA 4O5FA 4CZJA 5BN8A 3QB0A 4FWMA 1BG3A 3UKRA 3AARA 3MMVA 3BF3A 4H0TB 4BR4A 2V52B 4BRKA 3LM9A 3DXMA 3WQUA 3ZX2A 3C0BA 2UYTA 2YI1A 1YXQA 4BRDA 4BG9A 5KPZA 4KBOA 4CJ7A 1JCFA 4BG8A 1NGGA 1U2VA 1XUPO 1SZ2A 3VEOA 5KQDA 4BGBA 2Q31A 2W40A 4RWTA 2P9LA 5JMVA 3VGKA 4FO0A 1HKCA 3ZX3A 3SLCA 3A5OC 3GOIA 2FXUA 1E4FT 1HLUA 4XH1A 3WEEB 4CZEA 2DPNA 5JLFA 3SK3A 4CZKA 5FPDA 1NGEA 3ULEA 3FZKA 2E2QA 1KXPA 1TYQB 2D0PA 5AQOA 3VESA 3U4LA 3WXIA 2NZTA 4QS9A 4CBWA 4HWIA 4BRFA 3WXKA 2IVNA 4RCHA 2A3ZA 1QQOA 4B1XB 4FWSA 4K43A 4K25A 3VF4A 3I8BA 2VWBA 4DCHA 1NMDA 5JICA 3LDLA 2Q97A 3DXMB 3JS6A 2FSKA 4CBXA 2BTFA 3IUCA 4FOEA 4CI6A 1BA0A 1U2VB 3G25A 3MN5A 4BRQA 3P4IA 4BRIA 3H46O 2P9LB 5AQFA 5AQTA 4FWRA 4H5NA 5LY3A 2E1ZA 2YJFA 4H0PA 1BWFO 2HF3A 3WEEA 3QBWA 1HX1A 4PKGA 4JHDA 2QXLA 2ITMA 4E1JA 1QZ5A 2CH6A 5KQ8A 1QQMA 3S41A 3L6QA 1Y64A 2V7YA 5AQPA 5AQYA 1RGIA 4MLHA 4WQ5A 2QW9A 2A42A 4BR9A 1P8ZA 3O1BA 1C0GA 2P9UB 3HBTA 2QWNA 4K41A 2GEMA 2AP1A 3UB5A 4PL7A 4JD2B 4C23A 4PKHA 4BC3A 1SAZA 1YVNA 1D4XA 4BRCA 1GLDG 1Z05A 2AA4A 3MN7A 5AQMA 2I7PA 4WQ4A 1V4TA 4EIAA 3M1FA 4BROA 4I6MB 1V4SA 2CH5A 2YJEA 3HI0A 3HZ6A 2ASPA 4M7XA 3EN9A 3H6EA 1HKGA 3RSEA 1K8KB 5AQQA 1NGBA 4CZIA 1GLCG 2P9SB 3ATVA 5FPEA 3BEXA 1NGFA 4XEIA 4BVOA 5BPMA 3VGLA 2E88A 3CJAA 3ENHA 4FWKA 5KPRA 2WUSA 3L4IA 3VENA 1HKBA 3ZEUB 3GG4A 1NWKA 3HTVA 3UKUA 1T44A 1E4GT 3FE1A 3FFKB 3CQXA 1WUAA 3O4WA 3O8MA 4XH4A 5AZJB 4BR7A 1KAXA 2QWPA 3SMPA 5AQXA 1MWKA 3LL3A 4FWPA 1NGHA 4QS8A 2I7NA 1ATSA 4MO5A 3EKSA 4AM7A 4CZMA 3O5BA 1KAZA 5BN9A 4CZGA 4FWLA 4IZ9A 2FSNA 5AQSA 4A61A 5AFUH 2VYPA 5AQRA 5AQLA 4BQZA 1T6DA 1OKJA 5AR0A 1GLLO 1S3XA 3WQTA 1MWMA 2QWQA 1QZ6A 2IVPA 5AQUA 2BUPA 4FPAA 3RSEB 4AM6A 3ENOA 2HOEA 5B8HA 3VEXA 1IG8A 4IO8A 2Q1NA 4H5TA 5EOYA 4MO4A 4YDUA 3CJCA 3FZFA 3UE5A 1BA1A 2YHWA 3MCPA 5ADXA 5CE3A 2J4RA 4ISGA 3F9MA 3CERA 4A2AA 3FZHA 3WXLA 2D1KA 3CJ7A 3LDQA 5AZIB 2A41A 2IIRA 4H5VA 3AAPA 1NGDA 1NGIA 1XC3A 5AQKA 2KHOA 2GWJA 5ADXH 5BRFA 1R59O 3MN6A 2QWRA 1HUXA 4NB4A 1X3NA 2IVOA 1DGKN 2NRHA 2QWMA 3EL2A 4BQLA 4RTFD 4Z94A 3LM2A 3QFPA 3M6GA 3DAWA 3O6WA 5FPMA 1BU6O 3H3NO 5I9EB 3H3OB 3IFRA 4IXCA 2V7ZA 4EHUA 1GLEG 5BRDA 3D2EB 3CJ1A 2E2NA 3DXKB 5BPNA 5F0XA 3R6MA 4MLEA 5LJWA 1SQKA 4JHDB 5EY4A 3EO3A 2A6AA 3HSCA 3BF1A 2FF6A 2ASMA 1U6ZA 2PBDA 1GLFO 3WXJA 2E20A 3CHWA 4H5RA 3VEZA 2Q2RA 5EXWA 3VERA 5AQVA 2A5XA 2F9TA 3WT0A 3O08A 4FSVA 4BRLA 3A0IX 3R8EA 3AY9A 3A5MC 3GE1A 3ID8A 1BUPA 1T6CA 1EQYA 3TU5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SS6A 4HCBA 1RBRA 3OYLA 4CJWA 3AA4A 4CF0A 5ELZA 5JVGL 5HRPA 4CEQA 4FLYA 3O80A 1CZAN 4CESA 4M3ZA 3SJJA 4WCEL 1ATNA 4QS7A 3CG7A 1Q9YA 4M63C 2Q36A 4FOIA 1HNXK 3DJCA 3TAGA 4JI8K 3I33A 3VQ5A 4KKOA 4HCCA 1NU0A 3DRRA 1NJZA 4FM0A 2NLXA 4QAGA 1D9FA 4FZXC 4IOCL 2Q0RA 3A2FA 3VN5A 4DR3K 4CEZA 5IT9O 4CHPA 4JS5A 3H45C 4OLAA 4DR2K 1KSPA 4DS4A 2VWJA 1ZBLA 4I7FA 3TAQA 3PUFA 3AA5X 1VAZA 4LF5K 2B4JA 4CD3A 5HRRA 3OYKA 3HM8A 2QKBA 1Q18A 3SJHA 1NK9A 3V9ZA 4TSXA 3QICA 2FLOA 5EX5A 3IMXA 4N56A 2D0CA 3A8YA 3NHGA 3QLHA 3JSMA 4C8NA 3ULEB 1LV5A 3M8QA 3V9UA 4IEEA 1Q7YO 4FW1A 2HNYA 4YOUA 3VEVA 1OH8A 1X9SA 1FW6A 1HNVA 3FZMA 2YKMA 3ZCMA 4OX9K 1Q82O 3ZSRA 1BO5O 1CZBA 5KPTA 1YJWN 1HNZK 4O4GA 2IOCA 2CGLA 4FK2A 1RFQA 3P5JA 2KTQA 2P9NA 3MEGA 3RTVA 3I0RA 5FLXO 1MU2A 1TKZA 3ASMA 3THYA 4WFAL 3AO5A 5FRMA 1P90A 4DB3A 1S22A 4W5NA 4CGFA 3QFUA 4KV8A 4DV4K 1WSFA 1JLCA 5CHIA 5AFUA 1L3TA 5JS1A 3CQ8A 1WOQA 5EU7A 3M5RA 3AVMA 3DMJA 4DSIA 2FSJA 4JNEA 4DV1K 4BRMA 1RT3A 4CJ4A 1I94K 1X9JA 4A62A 4FWNA 3E01A 4PL8A 4R79A 2P51A 3WXMB 3L3UA 2PZSA 4BVPA 2XY5A 4BRGA 4JKHA 5DM6L 3KZBA 3D7EO 4V19S 4B3OA 1H1VA 5BREA 4CEFA 1XHZA 2WONA 3D6RA 3BUZB 1YJ9N 4I9LA 5AQHA 2G8UA 2YCHA 5K14A 3CD6N 1NJYA 4JAXA 3W0LA 3HSTB 2ZJPL 2KFZA 3V1RA 4HTLA 3EKUA 4DTOA 1IKXA 1ESVA 1S72N 1RDAA 4EZ9A 4BWMA 2CGJA 4CW7B 3TSUA 2GV9A 1NGJA 4KPYA 4RW6A 1MDUB 5GADP 4J2BA 4ILJA 1BOTO 2ASOA 4O5FA 4OPAA 4PY5A 1C1AA 3QB0A 1VSMA 4JI6K 2OTJN 3DLLL 1QSLA 4W5TA 1S6PA 2OPQA 5CY4A 5DM7L 4LFAK 1VQ9N 4DF8A 4MFBA 3ZX2A 3BDPA 3O9UA 3AO3A 4KBOA 4BG9A 4Z4FA 4BY9C 1U2VA 5KQDA 1WBDA 2OPPA 3IG1A 4CJSA 1S1WA 3SAHA 3NH2A 3SLCA 4XH1A 2DPNA 4M45A 3RRGA 1Q9XA 3AA2A 4CZKA 5FPDA 4JI3K 1KXPA 3K58A 3CFOA 2IVNA 5GAGP 4FCYA 2HMIA 3IS9A 1QQOA 2NRWA 3HVRA 3I8BA 4M42A 1NMDA 5JICA 3LDLA 5HROA 4CHQA 5A2QO 1E3MA 2VQEK 4FJGA 2FBXA 2UU9K 2FSKA 2O8CA 3IUCA 4FOEA 2F4VK 3M8PA 4OJRA 1TL3A 4CHNA 3MCAB 5AQFA 4GMJB 4CFCA 4H8KA 2DFFA 4KHWA 3EEQA 4CHZA 1XMQK 1HX1A 1OVQA 4PKGA 1RBUA 1L3VA 4E1JA 4LSNA 3SCXA 1OH7A 2Y1JA 3KD1E 2BGGA 4YNQA 1NK4A 1QQMA 5C2FA 3S41A 3UIQA 3K57A 3KK1A 1J5EK 3VMFB 4WQ5A 1U45A 4FK4A 4JKFA 4A5BA 4DTNA 1VQPN 3NF9A 4JRQA 4B9VA 1P8ZA 3CC7N 1C0GA 3HBTA 3OYCA 2QWNA 4WFBL 1YITN 4EZ6A 1HJRA 3K2PA 4AHRA 3K5OA 1YVNA 1GLDG 1KFDA 1LWEA 3OYBA 2YNFA 3FFIA 4JK9A 1WNSA 3IKMA 1V4TA 2I5JA 2WTUA 3RR8A 1V4SA 2CH5A 3P39A 2X6NA 4KREA 3ZYYX 1M1KO 5FPEA 5BPMA 3H08A 3VGLA 3VTIA 3ENHA 2UUAK 4LH4A 3NGIA 3GG4A 3RVCA 4DQQA 1XI1A 1E4GT 3FE1A 3HL8A 3KK7A 3O4WA 4FW2A 4XH4A 4CEEA 2HBKA 1WAJA 3TWHA 4CJKA 2HBLA 3ID6A 1O1WA 4MO5A 3AO1A 4OKKA 2HVIA 4XJXA 4O8UA 4CFAA 3ZSXA 4FVMA 1OKJA 3HP6A 1S6QA 4Z0UA 1NJXA 1TAQA 4FXDA 3PLAA 2JWKA 4OPJA 3CFRA 1S9GA 4AM6A 3ENOA 4W5RA 1ASUA 5B8HA 3OYAA 4IO8A 1YTUA 3DI6A 5CYQA 5HBMA 3WNHA 3SQ1A 4WE1A 4A2AA 4FK0A 3WXLA 4NCGA 1J9AA 2IIRA 4JKAA 5AQKA 5C2DA 1VSKA 4YOTA 5ADXH 2HW3A 5BRFA 4FZYA 1QSSA 4UY8O 4O44A 3C6TA 1HUXA 1NG9A 1ASWA 4NB4A 4CECA 1W2BM 3THYB 1IG9A 1B9FA 1VHXA 2Z1JA 4BQLA 3C6UA 5GIPA 3OYIA 1VQ6N 1RTIA 2G8WA 3DAWA 3O6WA 3F73A 3MXMA 3H3OB 4EHUA 3SI6A 4IG3A 3AA3A 3HVTA 4CCHA 3AGKA 2YHAA 1RTDA 3TSQA 2EHGA 3SQ4A 1SQKA 3THWB 2OCEA 4A5AA 3L2WA 1U48A 1IV0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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