4B1XB

Structure of the phactr1 rpel-2 bound to g-actin
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
371
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Structures of the Phactr1 RPEL domain and RPEL motif complexes with G-actin reveal the molecular basis for actin binding cooperativity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 123
structure length 357
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4b1xB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4b1xB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4b1xB03
4FWOA 5LY3A 3ZX0A 4BQZA 4FWKA 1BA0A 4WYBA 2A5XA 3DXMB 4I6MA 3VF6A 2AP1A 5JLFA 5AQRA 1NLVA 1QZ6A 3UE5A 4O5FA 4BR2A 3ATUA 3LDQA 1YUWA 4B1VA 2Q97A 4CD1A 4J8FA 4WQ5C 3B8AX 1NGAA 1BWFO 3C7NB 4H5VA 1BDGA 4M7YA 4WQ4A 2ZF5O 3FR0A 3IDHA 4O8KA 3FZHA 1RFQA 4H5NA 5EY4A 1XQSC 3FFKB 4C23A 1LOTB 3MN6A 1HJOA 2I7NA 1WUAA 1HKBA 3CJ1A 3QICA 2ZWHA 3HZ6A 3CJ9A 4NB4A 3QBWA 4H0XB 4PL7A 3GL1A 3VEZA 4QS8A 4BC2A 2KHOA 4B9QA 3A5LC 4BG9A 4BROA 3VGMA 2IVOA 3ULEA 1JCEA 4JHDA 1V4SA 2QWNA 1TYQA 2E2OA 3MN5A 4HTLA 5AQJA 4YDUC 3SMSA 1GLFO 1ATSA 1NGJA 3CJCA 1ATRA 3P4IA 1TUUA 3F9MA 3WXKA 1BO5O 3R9PA 3SK3A 2ASMA 5BN9A 4BR7A 3MK6A 3VEWA 5AQNA 1QQMA 2A3ZA 2GTDA 2P9IA 1NGFA 3MMVA 4FWNA 4WQ5A 3QB0A 3M1FA 2YJEA 4MO4A 4JN4A 3WXLA 4EFHA 5AQKA 2FSKA 3EKUA 3W3DA 4B1YB 5CE3A 4A62A 3O6WA 2IVPA 2HMPA 2D1KA 3FGUA 5JLHA 2PAVA 2E88A 3ID8A 3R8EA 3SJHA 5FPDA 2Q1NA 3VEOA 4IO8A 3WUHA 3ULEB 5AQYA 5F2RA 2GELA 4BRCA 3CI5A 1R59O 1TYQB 2FLOA 4BRGA 2Q31A 5AQGA 4CD3A 3DXKA 1BG3A 1GLEG 5AQFA 4CZFA 4FWQA 3O08A 1QQNA 4BRKA 3GDQA 3EL2A 4B1ZA 3O4WA 1QHAA 3IUCA 2GWJA 3KVGA 5TKYA 4AM7A 2Q0UA 3UB5A 4YDUA 4NO7A 3VF4A 1NGEA 2P9IB 2QM1A 1JCGA 2CGJA 3IMXA 5LJWA 2NRHA 4B1XB 5F0XA 3WEEA 3L4IA 4RWTA 1E4GT 1HX1A 4BRNA 2QWQA 2QWMA 3S41A 3CIPA 2E8AA 4FOIA 1RDWX 1NM1A 4MLHA 3CJ7A 1EQYA 2P9NA 4RTFD 5EX5A 3LDNA 5BPNA 3DXKB 2NLXA 1NGGA 2IIRA 4MLEA 4Z94A 1NGBA 2UYTA 3QFPA 4PL8A 4CZIA 3WQUA 4DHYA 2YJFA 1BU6O 2FXUA 5KPZA 2ZGZA 3HTVA 1CZAN 4B1UB 3O8MA 4BRMA 3SMPA 4DCHA 3O5BA 4RCHA 5AQLA 4E1JA 3HI0A 4ISEA 1NGIA 3D2EB 4MO5A 1ZBSA 4CZMA 5AQSA 1GLAG 4XEIA 3WEEB 3GOIA 4H0PA 1X3MA 3MCPA 4K25A 3A5OC 2P9LB 3FE1A 5AQOA 3VESA 2FSJA 3IFRA 4BVOA 1HPMA 1G99A 1DGKN 1GLDG 2BTFA 2H3GX 3H1QA 1K8KA 2Q0RA 2YHWA 1NBWA 3D7EO 3CJBA 4H0OA 5ELZA 4XH4A 4JD2A 5AQUA 3DAWA 3ZX3A 2A40A 3UKRA 5BN8A 2P9NB 3ENOA 4BGBA 2VWBA 4I6MB 4BC3A 1YXQA 1S3XA 5EOYA 4H5WA 1MWMA 4BRDA 3ATVA 3R6MA 4H5TA 5KPTA 4BRAA 2D0OA 4FO0A 5AR0A 5KPRA 4GY2B 4DB3A 4CBWA 1S22A 4IXCA 3U8XA 4K41A 3VENA 1H1VA 2E1ZA 4FWLA 1BOTO 2NZTA 2V52B 3QDKA 5AQIA 2OANA 3AAQA 5EVZA 2A42A 4FL9A 2E20A 2F9WA 2YHYA 4BG8A 5F1XA 5AFUA 3MN9A 1QZ5A 4IJAA 1JCFA 1WOQA 1GLCG 5AQXA 3VF2A 5AQQA 4CBUA 2QWLA 1ATNA 1U2VA 2CGLA 4BRQA 1X9JA 1GLBG 2YI1A 3DWLA 4A2AA 4XH5A 2ASOA 1K8KB 3TU5A 2QWRA 3EN9A 4BGAA 1NWKA 3WXJA 3JS6A 1HUXA 5BREA 1SZ2A 3BF3A 3UKRB 2DPNA 3VGKA 4PKIA 1KAXA 4JHDB 4CZJA 4IWVA 3JXUA 3UKUA 1V4TA 3EKSA 2A41A 1GLJO 1ESVA 3H1VX 4CBXA 4EIAA 2HF3A 3I33A 3FZLA 3MDQA 5AQHA 3G25A 2P9UA 5JICA 4CZKA 3BUZB 4JAXA 3C0BA 3HM8A 3J8AA 2Q36A 3CJAA 3WT0A 4A61A 3VERA 1ZXOA 2Q2RA 3O1WA 2CH6A 3DXMA 1QQOA 4K43A 1XC3A 4H5RA 3M6GA 1U2VB 1OKJA 4BRIA 3QMLA 1SQKA 5AQTA 4ISGA 2YHXA 3GE1A 4H0YB 4A2BA 4BC5A 3WXIA 1J6ZA 5BRFA 1HKGA 3VOVA 3FLCO 5BRDA 5ADXH 1NGCA 2D4WA 2E2PA 5JMVA 4IZ9A 3UKUB 2A6AA 1C0FA 1KXPA 3CETA 2E1YA 3A0IX 4H0TB 4QS7A 3O80A 4BRPA 3KZBA 5BR9A 2E2NA 2P9UB 3ZX2A 2I7PA 4FOEA 2HF4A 2EWSA 4ISFA 1IJJA 4GNIA 1NGDA 1Y64A 4EHUA 5E26A 5ADXA 3VGLA 4CJ7A 3FZFA 4EAHD 3SLCA 4DQ8A 2V51B 3WQTA 4CZEA 2FSNA 4QS9A 1ZC6A 1SAZA 1YVNA 2F9TA 3AARA 3A8YA 1TUYA 5AQZA 4FWPA 3TPQA 1KAZA 1T6CA 3LM2A 4FPBA 4K42A 3VEVA 2P9PA 2VCPA 1DEJA 2QWPA 4CZLA 4CZHA 4AM6A 4BC4A 4BR9A 3CHWA 3ZEUA 5AZJA 3QFUA 3FZMA 3LDLA 3U9ZA 1KAYA 5AFUH 3I8BA 2P9SA 3ZETA 3LL3A 3AAPA 3GG4A 4PKGA 5KQDA 3BF1A 3EZWA 2QWOA 3BEXA 3HBTA 1HKCA 4BRHA 3RSEA 4Y0WA 1C0GA 1U6ZA 2FF3B 1MWKA 3U9DA 3H45C 3W0LA 4BREA 5BPLA 3FZKA 2HOEA 1Z05A 3D2FA 3L6QA 3H3OB 5I9EB 5FPEA 1NGHA 4XH1A 2W41A 2ZGYA 2P9KA 4FSVA 3VPZA 3LDOA 3CERA 5FPNA 3CQYA 1E4FT 3DJCA 1RGIA 2IVNA 3OHRA 5AQVA 2P9PB 3A5NC 2E2QA 4L3QA 3VEYA 3H3NO 3VEXA 4BQLA 2ASPA 3O1BA 4CZGA 5EXWA 2QW9A 3MN7A 1LCUA 1DKGD 3H46O 4JD2B 2V7YA 5AZJB 3ZEUB 5AZIA 1BA1A 3ENHA 5AQPA 3EO3A 3CQXA 2P9SB 3ZETB 2D0PA 2VYPA 3HSCA 3U4LA 4F9OA 2GWKA 4BR4A 1HLUA 2CH5A 4H0VB 5B8HA 1IG8A 2V7ZA 3RSEB 2PBDA 3LM9A 4EHTA 2GEMA 2W40A 4HWIA 4BRFA 3D2FB 3H6EA 5KQ8A 2YCHA 2P9KB 1MA9B 1XUPO 4WQ4C 3KHYA 4B1WB 4BRLA 3QBXA 5BRHA 5AQWA 3GBTA 4M7XA 4IJNA 3VETA 1D4XA 4FPAA 2WUSA 1BUPA 4LC9B 2AA4A 4FWRA 2FF6A 4BVPA 5BPMA 3BP8A 3AY9A 1Z6RA 4M63C 1MDUB 1T6DA 3C7NA 1X3NA 2ITMA 2BUPA 4H03B 2QXLA 2J4RA 1P8ZA 4FWMA 5AZIB 5LJVA 2GUPA 4JNEA 4KBOA 3L0QA 4FWSA 3D2EA 1Q18A 1T44A 5FPMA 4PKHA 4BR5A 1NMDA 5E84A 4CI6A 1GLLO 5AQMA 3M3ZA 2P9LA 2CGKA 3A5MC 1YAGA 3LDPA 4BR0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5SWMA 2HBKA 5LY3A 3ZX0A 1BA0A 4CJRA 3K0SA 2A5XA 4DFMA 1EKEA 4IO9L 2AP1A 1QZ6A 1N36K 1KLNA 1SL1A 4BR2A 4O5FA 3ATUA 2UXCK 1YUWA 4B1VA 4DTNA 3J7YP 4NYFA 4J8FA 4WQ5C 3B8AX 3VQQA 4H5VA 3P39A 3FR0A 3IDHA 1QSLA 4H5NA 5EY4A 1S1XA 4UQGA 4JS5A 3OA9A 4DTPA 4YHHK 5AJ3K 1WSJA 3PO4A 1LOTB 4E7HA 3MN6A 1HJOA 2UU9K 1HKBA 3TWHA 3KLFA 2ZWHA 4DQSA 3OYNA 4RW4A 2EX3A 1TV6A 4JI6K 2KZMA 2Z1GA 3PSFA 3CC4N 4W5QA 1JKHA 4B9QA 4KHUA 1B9FA 4B9LA 4HTUA 1RBRA 1JCEA 3LPTA 1V4SA 1TYQA 2E2OA 1L5UA 5AQJA 4WE1A 1WSGA 3LANA 4YOTA 5C0YA 1W0HA 3SUOA 1QHTA 4HCBA 2HSTA 3R9PA 5BN9A 3QEXA 1QTMA 4BR7A 3MK6A 1JLAA 2PZSA 4MQ3A 3CQ8A 1TGOA 1HNVA 3NF6A 1NGFA 3QB0A 3KLGA 1YTUA 4LFCK 4JN4A 3AA2A 4X65K 5BR8K 4KTZA 5CE3A 2A1RA 3O6WA 2IVPA 5CR4A 2Z1JA 2B6AA 3R8EA 5FPDA 4IO8A 4IBNA 3AV9A 3ULEB 1QVGM 2GELA 3K9JA 3E01A 2FLOA 4MDBA 4ELUA 4FJIA 4JK9A 4E7IA 1GLEG 4CZFA 2OPRA 3DYAA 3R1XA 1VQ4N 4BRKA 1KVCA 3CM6A 3IUCA 2GWJA 5TKYA 4AM7A 2Q0UA 3UB5A 5HRRA 5KRTA 4YDUA 5C15A 5FROA 2NUBA 3FFIA 2P9IB 3V9WA 1JCGA 2CGJA 1QQCA 4OGCA 4KTQA 3NGZA 3K2PA 3U3GA 4RWTA 5GAHP 4B8AB 3PO5A 4BE7B 3S41A 2E8AA 4FOIA 4OKJA 4DF4A 3CJ7A 2NRWA 3SCXA 1DTTA 2NLXA 2RN2A 4MLEA 2WONA 3RMCA 3V9UA 2NRXA 4CZIA 4DQQA 3M8PA 2WBNA 3MXMA 2ZQBA 1ILYA 2VWJA 3HTVA 4A59A 1CZAN 4CGGA 2G8WA 4LSLA 1ASVA 3O5BA 4E1JA 4DQPA 3HI0A 3WNHA 1ZBSA 4CZMA 4I2PA 4JKHA 4E1NA 1GLAG 4XEIA 4FLXA 3CYMA 1W97L 4CGHA 1VSFA 4K25A 4EHTA 2P9LB 4XIUA 4JYAK 1HPMA 1G99A 5H1SQ 3J81O 3L2UA 2GUIA 1QVFM 1JLCA 2RE2A 3JSMA 2LSNA 3D7EO 4H0OA 1TKDA 4HVJA 4UY8O 4XH4A 1IKYA 3DAWA 3UKRA 4CK1A 5BN8A 1NOYA 4BGBA 2VWBA 3SZ2A 4DV0K 1S3XA 1DLOA 5EOYA 3C65A 3ATVA 4PHTX 4H5TA 5KPTA 1TKZA 5KPRA 4GY2B 3J7ZO 5LMUK 3OJUA 4DB3A 1S22A 4IXCA 4CJ3A 2E1ZA 3IKMA 4FWLA 3NDKA 2NZTA 1T7PA 3QNNA 2ZE2A 2G8IA 3I55N 2F9WA 3DLLL 5F1XA 4BG8A 4NLCA 5J2NA 2KLAA 4K8ZA 4CEEA 4FLYA 3L3VA 3O9RA 4CJVA 4LH4A 3DWLA 4XH5A 4DV4K 5JS2A 4X62K 1Q7YO 2DFEA 1HUXA 2YKMA 4AQYK 3BF3A 3TAMA 2FC0A 3SQ4A 5C10A 1V4TA 3EKSA 4N56A 1VQON 1GLJO 4CJSA 1D5AA 3MX5A 4DTJA 4FJGA 4DTOA 5C12A 3VQ4A 1TAQA 2F96A 2YHAA 2G8VA 2VGNA 5KI6A 3PX6A 3OYIA 1DT9A 3HM8A 3B6PA 2Q36A 3WT0A 3VERA 5I42A 5M1KA 1ASWA 4IKFA 5GADP 3SQ0A 3K5MA 4K43A 1K6YA 4H5RA 3M6GA 1U2VB 4DUYK 4NYNA 4ISGA 4OPKA 4H0YB 4FVMA 3QEWA 3VOVA 2VGMA 3K5OA 4M3RA 1VSEA 2E2PA 3TR8A 1EETA 3M8RA 2E1YA 3A0IX 3KK7A 4H0TB 3AVCA 4BRPA 4LF7K 1YHQN 3KZBA 1N32K 4FOEA 2HF4A 3KLIA 3O9SA 3HO1A 1I39A 1HRHA 3D6RA 4GNIA 2HHWA 2O8EA 1NGDA 3CF5L 3V9SA 1KFSA 3MEGA 3SLCA 3ZLJA 3DRSA 3LP3A 1XNQK 1ZC6A 1WAFA 3PSIA 3SI6A 3A8YA 5M1NA 5AQZA 3S9HA 4KH6A 3TPQA 4B3OA 1NU0A 1T6CA 2HHHK 3QESA 3VEVA 2ZM6K 2VCPA 3LZIA 4CF9A 4CZHA 4KHSA 3NF8A 4BR9A 4H8KA 2P9SA 3CG7A 3ZETA 3AAPA 3NF7A 4E7JA 1LWEA 1JLFA 2Z1IA 3BEXA 4WFBL 4HUFA 3HBTA 4GMJB 3RSEA 1TL1A 4C8NA 1MWKA 3OVNA 4DFPA 3H45C 2WOMA 4BREA 2Y1JA 3FZKA 2XRIA 2HOEA 4FJHA 3D2FA 4FXDA 3CCUN 3DOLA 2W41A 3S3MA 2P9KA 5J2MA 4BWJA 5FPNA 3PLAA 4CHYA 3AVIA 3DLEA 3LP0A 4KRFA 1C1CA 2E2QA 4L3QA 3OS1A 4BQLA 3CCEN 3O1BA 4CZGA 2FBVA 3H46O 3RMBA 3VQ9A 3ZEUB 3ENHA 4JKEA 5AQPA 3EO3A 3CQXA 4OO1J 2W6LA 2DFHA 2D0PA 2VYPA 1J9AA 2BH1A 2HBLA 3M8SA 2IDOA 4Q5VA 1KSPA 1IG8A 4JI5K 1NK4A 4FJKA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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