4B1XB

Structure of the phactr1 rpel-2 bound to g-actin
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
371
structure length
357
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Structures of the Phactr1 RPEL domain and RPEL motif complexes with G-actin reveal the molecular basis for actin binding cooperativity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 123
structure length 357
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4b1xB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4b1xB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4b1xB03
2P9IB 3VEYA 4B1WB 3WT0A 5JMVA 4DCHA 5EX5A 4MO4A 2GTDA 3DAWA 4BVPA 3MK6A 5AQGA 4PL7A 4MLHA 4DQ8A 3D2EA 4BGAA 1K8KA 2Q0RA 1GLDG 2CGJA 4BRDA 5BRHA 4M7YA 1BA1A 2YHXA 2CH5A 3C0BA 3LDQA 4B1XB 2ASMA 4B1VA 4MO5A 1LCUA 5AQSA 4WQ4C 2ZWHA 5F0XA 1SAZA 3QMLA 2FF6A 4CJ7A 5ELZA 5AQYA 2A6AA 2GWKA 1NGFA 3VEXA 3ZEUA 5KQDA 1NGAA 3VF4A 4BC3A 3RSEA 3MDQA 5EY4A 2IVOA 5BPLA 2GELA 4XH4A 3UKUB 3FFKB 4A61A 3LDNA 3O8MA 2YJEA 1XUPO 5BREA 4H0OA 1HLUA 3MCPA 2P9KA 3GG4A 5LJWA 2V51B 1QQMA 1NGDA 1T44A 3TPQA 1ATSA 4M63C 2J4RA 4CI6A 4JN4A 4B1YB 4BGBA 4CBWA 1JCGA 3ZETA 1WOQA 3EZWA 1G99A 1NGIA 2E2PA 4FWSA 3P4IA 4FWOA 3D2EB 1K8KB 2E2NA 5AQXA 1QZ5A 4H5RA 3U4LA 3W3DA 2P9PA 3CJCA 2Q97A 3QDKA 3HZ6A 3FZKA 1XQSC 4FWLA 4CZMA 3CQXA 1GLBG 2P9LA 3DWLA 5EOYA 4PL8A 1Y64A 2WUSA 3M3ZA 1KAYA 4BR5A 2EWSA 3O08A 2V52B 2A40A 5F2RA 4BR9A 1TUYA 2H3GX 3RSEB 3DXMB 2AA4A 5AZJA 2E2OA 3EL2A 2E1YA 1HKGA 2D4WA 2QWNA 3VENA 2P9KB 1NGBA 4EFHA 4QS9A 3IDHA 4C23A 3GL1A 3O5BA 4FWQA 4BC2A 1R59O 3SJHA 2Q31A 3BF3A 1P8ZA 4CZIA 2E1ZA 1X9JA 1BWFO 2P9NA 4IJAA 4PKIA 3IFRA 3O6WA 5AZIA 4BRIA 1NGCA 4PKHA 3FZFA 3ZETB 4BR0A 3CJ9A 4RWTA 1RDWX 1E4GT 4ISFA 2YJFA 4BRHA 4RTFD 4H5VA 4BR2A 2P9PB 1BA0A 1ZXOA 3R8EA 1YAGA 1CZAN 4O8KA 2P9LB 4H5WA 5E84A 5BR9A 2P9SA 3ATUA 4IO8A 5FPEA 4FWRA 4FPAA 4BRQA 1HJOA 2ZGZA 3WUHA 3H1QA 5AZJB 3A5NC 3UE5A 2QWRA 1NMDA 4BRLA 2V7ZA 4CD1A 4XEIA 1H1VA 2QWQA 3L4IA 5JLFA 4FL9A 3FE1A 3GE1A 3O1WA 1JCEA 4JNEA 5AQLA 4BRCA 2Q1NA 4IJNA 3W0LA 1NGGA 3WQUA 3DXKA 4M7XA 5KPZA 3HSCA 4BRGA 4IXCA 4BR7A 1RFQA 4JAXA 3WXKA 2P9NB 5AZIB 2YCHA 3EKUA 4H0YB 3FLCO 4B1UB 3G25A 3VERA 3DJCA 4H5NA 1S22A 3LL3A 1ZC6A 1YUWA 5AQMA 1LOTB 4EIAA 2E88A 5F1XA 2NZTA 2VYPA 3LDLA 3H3OB 3LDOA 3UKRA 3DXMA 5AQVA 3KHYA 4FSVA 3F9MA 3VEZA 5CE3A 1GLJO 1GLCG 4XH5A 1IJJA 3U8XA 2P9SB 3S41A 2IVPA 1HPMA 4CZGA 2NRHA 3R9PA 3FZHA 1T6DA 1SQKA 3ULEA 1WUAA 2CGKA 1GLAG 1E4FT 1TYQA 3QBXA 3VETA 2QWMA 3AAQA 2IIRA 5KPTA 1X3MA 2D0OA 4EHUA 2GEMA 3SMSA 2OANA 2QM1A 2CGLA 1RGIA 1D4XA 3GOIA 4BRFA 3LM2A 3DXKB 5B8HA 4NO7A 3UB5A 4BC5A 3LDPA 1QQNA 4CZEA 3BP8A 1YXQA 3AY9A 4FOEA 1BDGA 3SLCA 5ADXH 4WQ5A 3JS6A 3VGMA 3VEOA 1DKGD 1GLLO 3CJ1A 4I6MA 3ENHA 2GWJA 3O4WA 2ZGYA 4HWIA 5FPMA 4K41A 2D1KA 2AP1A 5AQRA 4Z94A 3AARA 3VEWA 4BRMA 3UKRB 2YI1A 2QWLA 2FSJA 5E26A 4QS7A 4JHDA 1MA9B 5I9EB 4O5FA 2NLXA 2W40A 2HOEA 4JD2A 2ZF5O 3QFPA 4GY2B 4IZ9A 1NGHA 3VOVA 4CZJA 5FPNA 1GLFO 4XH1A 3H6EA 3ID8A 3ULEB 4ISEA 4FPBA 3CJ7A 4CBUA 2F9TA 3A5OC 3CERA 3VGLA 2A42A 4CBXA 1TYQB 4FWNA 3CHWA 4FWKA 4B9QA 2Q0UA 5AQZA 2E2QA 4WYBA 4BRKA 1MWMA 2QWOA 3D2FA 1S3XA 3EKSA 4BG8A 3L6QA 4FWPA 3CJBA 1DEJA 3KVGA 1NGJA 5AQKA 2A3ZA 3M6GA 3SK3A 4EHTA 2KHOA 1SZ2A 2FSKA 3BEXA 3FR0A 4QS8A 3CI5A 4I6MB 3QBWA 3HTVA 2ASPA 4LC9B 4EAHD 4F9OA 3ZX2A 3QICA 3A5LC 2GUPA 2Q36A 1ATNA 3TU5A 3MMVA 3HM8A 4FOIA 4JHDB 5LJVA 3I8BA 3H46O 1BU6O 5AQIA 5AQJA 3AAPA 4GNIA 4BVOA 1J6ZA 4BQLA 4BROA 4JD2B 4WQ5C 1C0GA 2VCPA 4K42A 4BG9A 4H0XB 2HF4A 4PKGA 1BO5O 3FZMA 4Y0WA 1OKJA 1U2VA 2P9UA 4BREA 2HMPA 5FPDA 2FF3B 5AQTA 3WXLA 2F9WA 4L3QA 3WXIA 2W41A 3ZX3A 2DPNA 5AFUH 2PBDA 1KXPA 3D2FB 1V4SA 2ITMA 4CD3A 2YHWA 3CETA 1NM1A 4K25A 2PAVA 3H45C 2V7YA 3D7EO 3WEEA 2E8AA 4CZLA 3MN5A 3A8YA 1QZ6A 3HBTA 5AQQA 2IVNA 3WQTA 1U6ZA 3B8AX 1BOTO 3VESA 2A41A 5AFUA 3ENOA 1GLEG 3ZX0A 2A5XA 1NBWA 1NLVA 1ESVA 4FWMA 4K43A 4A62A 3C7NA 4A2AA 2ASOA 4CZHA 3IUCA 4YDUC 2QXLA 3VEVA 1NGEA 3EO3A 3VGKA 5JLHA 2Q2RA 5AQOA 3O80A 5AQHA 5BRDA 2QWPA 4BQZA 1BUPA 1U2VB 2P9UB 4BRPA 2I7PA 3U9DA 3FGUA 3O1BA 1V4TA 2FLOA 4BR4A 4DHYA 4DB3A 2HF3A 2VWBA 5BN9A 3WEEB 3L0QA 5TKYA 2YHYA 4HTLA 4J8FA 5ADXA 1TUUA 4NB4A 3BF1A 3GBTA 3J8AA 3R6MA 3A0IX 3CJAA 5EXWA 3OHRA 4IWVA 3EN9A 4RCHA 4BRAA 1Z05A 4MLEA 2UYTA 5LY3A 2I7NA 1BG3A 4CZKA 3I33A 5BN8A 3ZEUB 3SMPA 3VPZA 3U9ZA 2D0PA 3C7NB 1HX1A 2P9IA 1HUXA 4E1JA 3MN9A 1Z6RA 1YVNA 1EQYA 4WQ4A 3WXJA 4A2BA 4CZFA 5BRFA 5EVZA 1QHAA 1T6CA 3FZLA 1HKBA 1X3NA 3LM9A 4H0PA 4AM7A 5AR0A 1MDUB 3A5MC 5AQFA 4H0TB 4ISGA 4KBOA 4AM6A 1Q18A 4YDUA 1JCFA 1ATRA 2E20A 3VF2A 3M1FA 2FSNA 1QQOA 4H5TA 4BRNA 3H3NO 3QFUA 5BPNA 3JXUA 3ATVA 4FO0A 5KQ8A 1DGKN 5AQNA 3MN6A 2FXUA 3HI0A 1IG8A 1ZBSA 2BTFA 2CH6A 5KPRA 3CQYA 3BUZB 3QB0A 2BUPA 1KAZA 1NWKA 4H0VB 3GDQA 3UKUA 4BC4A 3KZBA 5AQWA 3IMXA 3H1VX 1MWKA 3CIPA 5AQPA 5AQUA 5BPMA 1XC3A 2QW9A 3MN7A 1C0FA 1KAXA 1HKCA 4H03B 4B1ZA 3VF6A 5JICA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B1WB 1QTMA 1T7PA 4DCHA 4H8KA 4JI0K 2W42A 2GTDA 4DTPA 3DAWA 3MK6A 5AQGA 4B08A 3THYB 4LF5K 2XY5A 4DQ8A 4BGAA 4CF2A 3K0SA 2DTUA 1OVYA 1CLQA 2YHXA 3KLIA 3C0BA 4CHNA 4DQIA 5C2DA 3DLHA 2ASMA 1YITN 3AVFA 4WQ4C 2ZWHA 4CGDA 4YNQA 4ZTJA 5KQDA 4JEPA 2HHQA 3MDQA 2GELA 2UU9K 4A61A 5SWMA 2OPQA 3AVMA 1S6QA 5I42A 2X6SA 4J2BA 5GINA 3ZSVA 3E9PA 1TL1A 5KGWA 2BGGA 3THWA 4CVNE 3L2UA 1IKXA 1NGDA 2NRZA 3BDPA 4CI6A 3OA9A 2YNFA 4JKEA 4Z4EA 2Z1IA 3OS1A 1JLGA 3AVHA 1G99A 1NGIA 4G1QA 4CJTA 4M3YA 4FWSA 2KQ2A 3P4IA 1KVCA 3D2EB 4FW1A 3CC2N 2P9PA 2Q97A 2HHXA 3HOSA 3CQXA 3V1RA 3M8RA 3G4SN 4PL8A 1JJ2M 3TI0A 4LF8K 3OYMA 1KAYA 4BR5A 3L2RA 2V52B 5M1PA 1TKZA 1C6VA 3D6RA 2AA4A 1RT7A 3EL2A 4FM1A 1T05A 1HKGA 1B9FA 3CCRN 3KKRA 2QWNA 4XJXA 4RW4A 3CM6A 3SJHA 3BF3A 5CR4A 4CZIA 2DY4A 3CCSN 1BWFO 1JLQA 4FCYA 1NGCA 4RWTA 3L2QA 4AHVA 3VQEA 3E01A 4MFBA 3NAEA 1Q81O 4CJ5A 1S1UA 2HNYA 1N33K 1IKWA 2LSNA 4F2RA 2HHVA 1IBMK 3QEWA 4L8RB 5E41A 1XNQK 5BR9A 4JKCA 2RHKA 2G8IA 4KRFA 4W5OA 1SS6A 3G71N 1Q8IA 1KTQA 3AVNA 4LSNA 3WUHA 3H1QA 4M3ZA 4FJGA 3TWHA 3A5NC 3I56N 2UUAK 1VQ8N 2V7ZA 4XEIA 1HYSA 4IOXA 1H1VA 3AA5X 3L4IA 5JLFA 4KHQA 4NXNK 3ZT1A 5AJ3K 2YX6A 5DMRA 2Q1NA 3SAFA 4BRGA 2A1RA 1JXBA 4BR7A 1UA0A 4FK2A 2P9NB 3O3FA 2PYJA 3VA3A 1RTIA 3U6FA 3G25A 4IOAL 2XHBA 3LL3A 4EIAA 2E88A 5F1XA 4J2EA 4KTQA 4R79A 3P38A 2YNGA 1EETA 1GLCG 3S41A 4EZ9A 5DK5A 2FBYA 1WSHA 4NCAA 3DI6A 3R9PA 5FRNA 1EP4A 3CYMA 3OY9A 4FLUA 3QLHA 4FLVA 4OKKA 4FLTA 4RW6A 4CHQA 4W5RA 3ZSXA 1GLAG 5M1QA 1TYQA 5TKWA 3VETA 2QWMA 2IIRA 3AAQA 1BISA 4DS4A 4JRPA 2D0OA 2QTDA 3NHGA 4E0DA 2XO7A 2CGLA 1I94K 1HNIA 4AHCA 3MAQA 1X9MA 1D4XA 1L3TA 3K57A 5B8HA 4NO7A 4JKAA 3AO2A 4BC5A 3LDPA 1X9SA 4Z4FA 4HVJA 4CIFA 4DTOA 1C1BA 4WQ5A 1DKGD 1GLLO 3CJ1A 3PO4A 3SBTA 2GWJA 3LAKA 5FPMA 4KI6A 4K41A 2D1KA 4JI1K 2QWLA 2O8CB 3AVCA 3ID6A 1RILA 4Q5VA 2O8BB 2KKZA 1RTDA 1MA9B 4AHTA 5HLFA 5I9EB 2A1SA 1ZBFA 4O5FA 3HYFA 1IKYA 1N8RO 3NH1A 5CYMA 2B5JA 3ULDA 4KHNA 4KB0A 1TK0A 3ULEB 4CECA 4CBUA 1YTAA 3A5OC 3CHWA 1A5WA 5AQZA 2C1GA 1WBDA 3OYJA 4BRKA 5C42A 4HTUA 3D2FA 3PV8A 3CJBA 1DEJA 1BIZA 3KJVA 4YOWA 4EHTA 2KHOA 1SZ2A 3L8BA 3R3LA 3FR0A 3E1YA 3QO9A 4E19A 4C1NI 1Y97A 3AV9A 2HHWA 1D8YA 3THXB 3OYBA 3SZ2A 3F5TA 3SBGA 4UY8O 4M3WA 4WF9L 4UQGA 4ID1A 2HHTA 1SL0A 3MEEA 1VQ6N 1ATNA 4CFDA 3HM8A 3S3OA 5LJVA 1NKEA 4FZXC 4JI4K 4BVOA 4KH6A 4BQLA 1Q9YA 4G9ZA 1NJIO 1LWCA 1C0GA 4JI6K 1BO5O 4N56A 1NK4A 4BY9C 3JAMO 4YOUA 2WONA 4JK7A 4BREA 5AQTA 3O3HA 4CEBA 4L3QA 4GVMA 3ZYYX 2W41A 2PBDA 3HPOA 3QEIA 1KXPA 1V4SA 4FJLA 2ITMA 1GOBA 2KTQA 4C1NK 3OJSA 1NM1A 2PAVA 2V7YA 3D7EO 3OYGA 3CCVN 1ASVA 2VG5A 3CCJN 4I9LA 1U6ZA 4CJSA 3QEXA 1VSKA 3U3YA 1GLEG 3ZX0A 2A5XA 1L3VA 3MCAB 2OA8A 4B8CA 4A2AA 4DS5A 3AVJA 2Y1IA 3TAMA 3DLRA 1NGEA 3CCLN 2ETJA 1BIUA 2Q2RA 1SKRA 4EZ6A 3NGZA 3O80A 5AQHA 5BRDA 2QWPA 2BDPA 3MEGA 2D0BA 2P9UB 3KLFA 3LP0A 2RE2A 3K5NA 2O8FB 3FGUA 3O1BA 1YT3A 1NJYA 2DFEA 4CJKA 4M3RA 4HUEA 2HF3A 3K5LA 1S5JA 2YKNA 3L0QA 4JLHA 3S3MA 1WAFA 4JI5K 3KLEA 2HHHK 3AO4A 1N34K 3T19A 3GBTA 2ZJQL 1NNEA 1CXUA 3A0IX 3CJAA 4FJHA 1UOCA 2RPIA 4M3TA 1Z05A 4JRQA 2I7NA 3AO1A 1BG3A 3IAYA 1VK0A 4DTMA 1NG9A 4HHTA 4KPYA 4FYDA 1FW6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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