2F9TA

Structure of the type iii coaa from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
250
structure length
241
Chain Sequence
ASMILELDCGNSLIKWRVIEGAARSVAGGLAESDDALVEQLTSQQALPVRACRLVSVRSEQETSQLVARLEQLFPVSALVASSGKQLAGVRNGYLDYQRLGLDRWLALVAAHHLAKKACLVIDLGTAVTSDLVAADGVHLGGYICPGMTLMRSQLRDAEARRALASLQPGQATAEAVERGCLLMLRGFVREQYAMACELLGPDCEIFLTGGDAELVRDELAGARIMPDLVFVGLALACPIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Pantothenate Kinase
publication title Prokaryotic Type II and Type III Pantothenate Kinases: The Same Monomer Fold Creates Dimers with Distinct Catalytic Properties.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
total genus 66
structure length 241
sequence length 250
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2005-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2f9tA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2f9tA02
4RWTA 5BPMA 3MMVA 3ID8A 1NGAA 2CGJA 4M7XA 5BREA 2GELA 4BR9A 2E2PA 2PAVA 3GDQA 5ELZA 2VCPA 2YJEA 4H0OA 4DHYA 4JHDB 4BC3A 1HPMA 4GY2B 1TYQB 1HKGA 1X3NA 3VEVA 3VETA 4A61A 4H0TB 5F1XA 2P9UB 4BG8A 3O1WA 1GLAG 5AQKA 1HX1A 3GBTA 5F0XA 5F2RA 2GEMA 3JXUA 5BN8A 3UKUA 3CHWA 4MLHA 4CZLA 2P9KB 4HWIA 3WXJA 1BUPA 3L4IA 3MN5A 2QW9A 4NB4A 3D7EO 1NGDA 3MK6A 4E1JA 2QWOA 2Q31A 3ZETB 3LDLA 4XEIA 3FR0A 4BC2A 4BQZA 3VEOA 4FO0A 1C0GA 5AQGA 2A6AA 2P9NB 1DEJA 3WQUA 1K8KA 1GLFO 2H3GX 3EKSA 3BP8A 4BR7A 3JS6A 1ESVA 4M63C 4H0VB 2BTFA 2IVPA 1BG3A 1BDGA 3VEWA 2HMPA 3CQXA 1U2VA 3OHRA 5AQZA 2E2NA 3FZLA 4A2AA 4JNEA 4L3QA 4IZ9A 3GG4A 3VENA 1YUWA 3I8BA 4BRGA 3WQTA 1QZ5A 4DB3A 4H0PA 5AZJB 1XC3A 3J8AA 4JD2B 4EFHA 5BN9A 3UKUB 1V4SA 4CD3A 3FZFA 3DAWA 3D2FA 2YHXA 3IUCA 3AAQA 3DXKB 1ZXOA 3BF3A 4BG9A 4FWLA 3EL2A 3CERA 3C7NA 3C0BA 2P9LB 1S3XA 2QM1A 3VF2A 2E8AA 3BF1A 4RCHA 3H3NO 2A41A 4ISFA 1BA1A 5BPLA 2CGKA 3H46O 4Y0WA 3SLCA 1NGJA 3A5OC 3WEEA 4CZFA 4FPAA 2FF3B 4MO4A 2F9WA 1P8ZA 3H1VX 1YVNA 3R9PA 1OKJA 2E2QA 4FSVA 2Q36A 3A5MC 4BRNA 4BGBA 1GLBG 4CZGA 1RDWX 2FSJA 4PL7A 3FZHA 2GWKA 3LDNA 4BGAA 4CBUA 3D2FB 5JLFA 2P9IB 1GLCG 4FPBA 3AY9A 2IVNA 4FWSA 1TYQA 1ZBSA 3MN6A 4EAHD 1TUYA 5AQHA 3SJHA 3CJAA 1GLDG 2I7NA 2P9UA 3LDPA 3IFRA 3M1FA 5FPMA 4A2BA 3S41A 2V7YA 3KVGA 1Q18A 3R8EA 1RFQA 1GLJO 3UB5A 4BC4A 4EHTA 3UKRB 3LM9A 3LDQA 5AQVA 1HKBA 2P9KA 3QICA 4BR2A 1TUUA 4CZJA 4B1YB 3ZETA 3BEXA 1XUPO 3QB0A 4K41A 4H5WA 5AQTA 4BRDA 4BR0A 4H0XB 3QMLA 3U9ZA 2P9NA 2Q0UA 2E2OA 3H3OB 3QFPA 5AQJA 2V7ZA 2W41A 5BRHA 3ULEB 4KBOA 1CZAN 1NGCA 2IVOA 4EIAA 3VPZA 4BRFA 2DPNA 3EZWA 2E88A 1NGBA 1SAZA 2P9SB 3VERA 5B8HA 2AP1A 3GOIA 4YDUA 5AZJA 4JD2A 4MO5A 4H5TA 3O1BA 2QWQA 4CZIA 5AQOA 3DXKA 3VESA 1BU6O 3CJ9A 5EVZA 3CI5A 3H1QA 1KAYA 1XQSC 3FZMA 3O4WA 2P9LA 1Z05A 2YI1A 5BR9A 4ISEA 1QQMA 2ASOA 4BC5A 3L6QA 3EKUA 4H5NA 5EXWA 4CD1A 1RGIA 3SMPA 4K43A 4CJ7A 5FPDA 5LJVA 2ITMA 1E4FT 4K42A 4O5FA 4XH4A 4CZKA 1HKCA 4O8KA 1DGKN 1NMDA 1MA9B 2Q97A 3CJ1A 5AFUH 4FWNA 3CJBA 3HI0A 3MCPA 4H03B 4Z94A 2FXUA 3IMXA 2ZGYA 1HLUA 4QS7A 2FLOA 2ASPA 4JN4A 3EN9A 3UE5A 5AR0A 2P9IA 2CH5A 5FPEA 4HTLA 3A5LC 3FFKB 4XH5A 5AFUA 3SK3A 2NZTA 4B1XB 2YHWA 4CZMA 3W3DA 4WQ4A 1Y64A 1MDUB 3CJ7A 1SQKA 1YAGA 4WQ5A 3U4LA 3UKRA 3M3ZA 5AQXA 3CQYA 3VGLA 3A0IX 3VEZA 4BRMA 3VGMA 4CBWA 5LY3A 4JAXA 5JMVA 4PKIA 4XH1A 4WQ5C 4BROA 4FL9A 4BRQA 2V52B 2VYPA 1MWKA 2A40A 5KPZA 3F9MA 4ISGA 4BRCA 1JCEA 3FGUA 2KHOA 1T6DA 5KPTA 4I6MB 5BPNA 3A5NC 3BUZB 4IJNA 2D0PA 2W40A 1SZ2A 4NO7A 4IO8A 5KPRA 4H5VA 1U6ZA 4CI6A 1T44A 3FLCO 5AZIA 3ULEA 3VF4A 5EY4A 5EX5A 3AAPA 3AARA 2Q0RA 4FWKA 1ZC6A 4BQLA 1MWMA 2E20A 3VF6A 1WUAA 1R59O 2P9SA 3IDHA 5BRDA 3ATVA 4MLEA 3KZBA 3M6GA 3RSEB 1DKGD 3DWLA 4H5RA 2GWJA 4PL8A 2E1ZA 2FSKA 4LC9B 1NM1A 5AQIA 1QQOA 1KXPA 3ENHA 1WOQA 2Q2RA 1ATSA 3D2EB 3ATUA 5AQPA 3WT0A 4AM6A 1T6CA 2A3ZA 3CJCA 5AQUA 1YXQA 5AQNA 1NLVA 5KQ8A 1J6ZA 3H45C 4BVPA 3U9DA 2HF4A 5AZIB 2WUSA 4F9OA 2AA4A 2YCHA 2ZWHA 2CGLA 4J8FA 1NGIA 2GUPA 5AQRA 1GLLO 4BRIA 1JCFA 4B1WB 1NGFA 4CZEA 4AM7A 2QWMA 1ATNA 2EWSA 3O5BA 4FWMA 3R6MA 2QWLA 2GTDA 5JLHA 2V51B 3L0QA 4PKGA 1HUXA 1X3MA 4YDUC 1QHAA 1QQNA 2A42A 3ZX0A 3HZ6A 3WXKA 3W0LA 1QZ6A 2E1YA 4BRKA 5AQFA 3O08A 4GNIA 5BRFA 3HM8A 4B1VA 4IWVA 5I9EB 3VEYA 3GE1A 1KAZA 3O8MA 1HJOA 3LM2A 2I7PA 1NGHA 2YHYA 5KQDA 2F9TA 1BWFO 1IG8A 1S22A 3ZEUB 4I6MA 3LL3A 1G99A 3QBXA 2QWPA 2NRHA 5E26A 2OANA 2IIRA 2QXLA 4A62A 2CH6A 4DQ8A 2P9PA 1JCGA 3P4IA 2UYTA 4FOIA 3I33A 1KAXA 5AQMA 2HF3A 1C0FA 3ZX3A 3LDOA 1Z6RA 4EHUA 2D4WA 4M7YA 3B8AX 3VOVA 2VWBA 3FE1A 3HTVA 5LJWA 4B1ZA 2QWNA 1BO5O 2BUPA 3ENOA 3RSEA 4WQ4C 4B9QA 3TU5A 1ATRA 4FWOA 3VGKA 3MN9A 3KHYA 1NBWA 5AQSA 4CBXA 2HOEA 1LOTB 4BR4A 4DCHA 2FSNA 3A8YA 5AQYA 3TPQA 3SMSA 3ZX2A 3D2EA 3GL1A 4CZHA 3QFUA 5AQWA 1V4TA 2ZGZA 3O80A 1K8KB 3WXLA 2P9PB 4RTFD 1NGEA 5TKYA 1X9JA 3DXMA 3HSCA 2QWRA 1BOTO 4IJAA 4K25A 3WUHA 1E4GT 3G25A 2NLXA 5AQQA 3CETA 4B1UB 3DJCA 1U2VB 3FZKA 1BA0A 5JICA 1NGGA 5AQLA 2PBDA 2D0OA 4BRPA 4WYBA 3QDKA 2YJFA 3MDQA 2FF6A 4BRLA 4QS8A 2Q1NA 3MN7A 4FWPA 4FOEA 4IXCA 4JHDA 5ADXH 4BRAA 4BREA 3U8XA 2A5XA 3O6WA 3VEXA 4QS9A 3C7NB 4BRHA 1EQYA 3QBWA 1GLEG 1IJJA 5CE3A 1D4XA 1LCUA 2ASMA 5FPNA 3CIPA 5ADXA 3HBTA 3H6EA 4FWRA 3WXIA 2D1KA 4H0YB 3DXMB 4BR5A 2J4RA 5E84A 5EOYA 2ZF5O 3EO3A 3WEEB 4BVOA 4FWQA 3ZEUA 1H1VA 1NWKA 4PKHA 4C23A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1G15A 3L3VA 3OYFA 5BPMA 2CGJA 3SZ2A 2WBNA 1RDDA 2PAVA 3G10A 3J7AP 4H0OA 4DHYA 3TAEA 3QNNA 4Z4CA 3AVHA 4FJ9A 3G0ZA 3VETA 4V19S 2P9UB 5AQKA 1HX1A 3GBTA 4BDPA 4NCGA 3DLEA 4DTUA 4W5RA 4UQGA 4OO1J 5GIPA 4C1NI 4WF9L 4MLHA 2P9KB 3WXJA 4L8RB 1BUPA 3L4IA 3CPEA 3D7EO 3NF6A 4R5PA 2Q31A 4C8LA 3ZSVA 3THVA 2VQEK 3VEOA 5AQGA 2OYQA 3M8PA 3ZT4A 3HJFA 4CF8A 3NGIA 1DEJA 4DSJA 3K0SA 1I3AA 1S5JA 4JRQA 4NCBA 5FLXO 4CJLA 4H0VB 2IVPA 1BG3A 1BDGA 4IBNA 3ID6A 3AVGA 3VEWA 1U2VA 1FJGK 1XHXA 2ZQBA 4IZ9A 4ELTA 3I8BA 1NJYA 2KLAA 3WQTA 4JD2B 5BN9A 1Q9XA 1V4SA 4GKJK 1S6PA 1RTJA 3DAWA 1YTAA 3D2FA 4DQSA 4DWIA 1BGXT 1EO1A 4BG9A 4QAGA 3HP6A 1HNXK 3C0BA 1S3XA 3VF2A 3QIPA 2E8AA 4E0DA 4RCHA 2A41A 5CR4A 2PZSA 5BPLA 1IKVA 3K5NA 3EE8A 3TAPA 4M3XA 2F9WA 4MDBA 4FXDA 1S1VA 3O9QA 2IAJA 5DMRA 4QOZB 4BGBA 1LAVA 2FSJA 1Q81O 1S9GA 4PL7A 1QVFM 1X1PA 3KLEA 4DTNA 3WXMB 3D2FB 1HYZA 4FPBA 3AY9A 1WSHA 3CD6N 4B9UA 1ZBSA 3A2FA 4CHZA 5AQHA 2P1JA 1YI2N 1GLDG 2VG5A 3PO5A 2RPIA 3M1FA 1IH7A 4A2BA 1OH8A 3UB5A 3TANA 3HOTA 4EHTA 1R0AA 3LPUA 3UKRB 3LM9A 3DLGA 3QLHA 3ISNC 1ZBFA 2DY4A 1TUUA 4ICLA 1WAFA 4CK1A 4CZJA 4B1YB 3ZETA 3U9ZA 3KJVA 2Q0UA 2E2OA 4CGFA 3OS1A 1K6YA 3QFPA 1KVAA 4FJIA 3SUQA 3L2WA 3DRSA 5BRHA 1EXQA 3TAQA 4Y1CA 2O8DB 1CZAN 2IVOA 2O8CA 2DPNA 1RILA 4MFBA 4B9LA 2P9SB 3PX0A 1FXXA 3GOIA 3WNGA 3MAQA 4BWMA 3O1BA 2B4JA 2QWQA 1RT3A 4FZXC 5AQOA 3DXKA 4OKEA 5EVZA 1C0TA 2O8EA 1YF5L 2P9LA 5BR9A 4ISEA 4JI1K 3F9KA 2ASOA 4E3SA 3G6EN 3EKUA 4H5NA 5EXWA 3JAMO 3E66A 1RGIA 4CESA 4DR4K 3QO9A 5FPDA 5LJVA 1YJ9N 3MXIA 4RW8A 2HHTA 1RT4A 3OS2A 4JKAA 3CJ1A 1ASWA 1RT7A 1KLNA 1YITN 3DLKA 4Z94A 4KHSA 4JKGA 2G8FA 1KLMA 2D0AA 1WN7A 2NRZA 3J81O 2O8FA 1I39A 4WE1A 4FK4A 2NRRA 4HTLA 3AO4A 4XH5A 5AFUA 3LDSA 3SK3A 3CMAN 2NZTA 2WONA 4DQIA 3SBTA 3W3DA 5J1EA 1SQKA 1JLQA 3SQ0A 1MU2A 4NLCA 3VGLA 4BRMA 3A0IX 3SQ1A 4JAXA 5JMVA 3ZSXA 4XH1A 4BRQA 1VRTA 4IFYA 3ZT3A 3F9MA 3DI6A 1JCEA 3FGUA 3O3GA 2YNGA 3HXMA 2FC0A 2E4LA 1BQNA 3DMJA 4AF1A 1C6VA 3OYMA 2UXDK 3VQAA 3RMCA 1RDUA 5EY4A 2O4GA 3F73A 1VSKA 2KW4A 2OTLN 3WNFA 3SJJA 3VF6A 2F4VK 3P1GA 3DLBA 1LW0A 5BRDA 2KTQA 4CHPA 5C12A 5IT9O 3L2QA 3ZSOA 3VQCA 4PL8A 5HOOA 3DOKA 2BGGA 3KK7A 3OJSA 3JYTA 3KKRA 3S9HA 1U45A 4BY9C 4Z4EA 4W5TA 3D2EB 5AQPA 4AM6A 4IG0A 3I0RA 4RW4A 2ATQA 5AQUA 2HVIA 4FJ8A 5AQNA 3H45C 4F9OA 2AA4A 3THXA 3HSTB 4CF0A 2GUPA 5AQRA 1JCFA 3CFPA 4IOXA 1KRPA 3QETA 4CZEA 1NOYA 3S3NA 1WNSA 3V4IA 3CC7N 3O5BA 3N4PA 4CEEA 1N33K 4DV3K 2QWLA 2VQFK 3L0QA 3E1YA 3HPGA 3KWGA 1HUXA 2VWKA 4PWDA 4DV2K 3HZ6A 4J2BA 2G8HA 4EZ9A 5E41A 4BRKA 5AQFA 5J2NA 4GNIA 4CJKA 3G71N 3AVJA 5C25A 1VQMN 1N32K 4JLHA 4B1VA 3OW2M 3NCIA 4IWVA 4CF1A 5I9EB 1DTTA 2DFEA 3GE1A 4FLWA 2XY7A 1L3UA 3LP1A 3LALA 3BZCA 1HJOA 3LM2A 4JK8A 3T3FA 3ZCMA 1VSFA 3THXB 5BR8K 5KQDA 4DR1K 5KGXA 5J2MA 1RNHA 4CF9A 1IBMK 4I6MA 2YV0X 3QBXA 1UA1A 1U04A 2QWPA 5CY4A 2HHHK 4CJWA 2YNIA 1LWEA 5M1NA 3TAGA 1TKXA 2QXLA 4A62A 2CH6A 3KD5E 3V1QA 1JCGA 2WFBA 3P4IA 4FOIA 3ZX3A 1S1UA 3B6PA 1ZYQA 4M7YA 2VWBA 4E1MA 3FE1A 1QTMA 1JLBA 2QWNA 3ENOA 4IKFA 3TU5A 4C1NK 3LP2A 5EU7A 1QE1A 3QINA 4JKCA 2DFHA 1ZBUA 4BR4A 4DCHA 2DTUA 1HYSA 1KVCA 3OBWA 3QERA 1RT6A 1HPZA 3ZX2A 4AHTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1JLC A;  1NKB A;  1NM1 A;  5AQI A;  1FKP A;  5SWM A;  1WOQ A;  4M42 A;  4HUG A;  1ATS A;  1BIS A;  5HRN A;  1T6C A;  2A3Z A;  4FJL A;  3TAB A;  1YXQ A;  4B9T A;  1NLV A;  1J6Z A;  1TL1 A;  2IDO A;  3LAM A;  2YCH A;  3CPW M;  3OJU A;  2CGL A;  3BGR A;  4J8F A;  1GLL O;  1IKW A;  3AVL A;  4B1W B;  3V6D A;  4RW7 A;  3ZSY A;  3FFI A;  2QWM A;  1NU0 A;  3RMD A;  1WSJ A;  1ATN A;  2EWS A;  4CEC A;  1OH6 A;  4FVU A;  1L3V A;  1XWL A;  3F5T A;  5K14 A;  1D9F A;  2V51 B;  4PKG A;  1VSD A;  4YDU C;  1W97 L;  2A42 A;  5IWA K;  3W0L A;  2E1Y A;  5CHI A;  3L4Q A;  4CK3 A;  1VQP N;  4EZ6 A;  4Y1D A;  3SNN A;  3NGZ A;  2YX6 A;  3HM8 A;  3CM5 A;  1ZBH A;  1EX4 A;  1T3V A;  4MQ3 A;  3C6T A;  3O8M A;  3HO1 A;  2EHG A;  1VSI A;  2YHY A;  4JS4 A;  3NBP A;  1IG8 A;  3ZEU B;  3V1O A;  4A5A A;  3QNO A;  5KI6 A;  1G99 A;  1NKC A;  3TTC A;  3SV3 A;  2QI2 A;  3KLH A;  5C2F A;  1EP4 A;  3DLR A;  1UA0 A;  3S3O A;  1VSJ A;  2UYT A;  1NKE A;  4CFB A;  2HF3 A;  2VGN A;  4IEE A;  4EHU A;  2D4W A;  3VOV A;  1LWF A;  2X6S A;  2KZZ A;  1OVQ A;  4DU3 A;  4CFD A;  5LJW A;  4E7L A;  4DLG A;  4WQ4 C;  1Z26 A;  4CBX A;  1NBW A;  1D8Y A;  2Y1I A;  4A5B A;  4U7B A;  4KHW A;  5HRR A;  3TPQ A;  4ID5 A;  2FBY A;  3OYC A;  3QFU A;  5DM7 L;  1T03 A;  5AQW A;  3TI0 A;  3O80 A;  1K8K B;  3WXL A;  1SL2 A;  4RTF D;  1B9F A;  5TKY A;  3K57 A;  4KI6 A;  2F96 A;  4IJA A;  4RW6 A;  3ZT2 A;  3WUH A;  2F8S A;  3AA5 X;  1E4G T;  5AQQ A;  3O9U A;  4B3R K;  3SYZ A;  5JIC A;  1NGG A;  5AQL A;  4BAC A;  4BRP A;  1L5U A;  5J2Q A;  4DF4 A;  3AO2 A;  4QS8 A;  4YOY A;  2Q1N A;  2QA4 N;  3MN7 A;  1SUQ A;  3SPZ A;  1SKS A;  4B9N A;  3K5O A;  3P39 A;  3MCA B;  3OYA A;  1GLE G;  1WSI A;  4FYD A;  5FPN A;  2GBZ A;  2ITG A;  4DR7 K;  3ALY A;  2ZE2 A;  3K58 A;  3H6E A;  3C6U A;  1HNZ K;  3K2P A;  4BR5 A;  4TSX A;  2HNY A;  2Z1I A;  3WEE B;  4BVO A;  4A59 A;  4DTJ A;  3HM9 A;  4YOX A;  3OYJ A;  3VMF B;  3SBG A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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