4BC2A

Crystal structure of human d-xylulokinase in complex with d-xylulose and adenosine diphosphate
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
528
structure length
528
Chain Sequence
APRRCCLGWDFSTQQVKVVAVDAELNVFYEESVHFDRDLPEFGTQGGVHVHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKASGFDFSQVLALSGAGQQHGSIYWKAGAQQALTSLSPDLRLHQQLQDCFSISDCPVWMDSSTTAQCRQLEAAVGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIYQQNPEAYSHTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGSGMNLLQIQDKVWSQACLGACAPHLEEKLSPPVPSCSVVGAISSYYVQRYGFPPGCKVVAFTGDNPASLAGMRLEEGDIAVSLGTSDTLFLWLQEPMPALEGHIFCNPVDSQHYMALLCFKNGSLMREKIRNESVSRSWSDFSKALQSTEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIIGRHRFNTENHKVAAFPGDVEVRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMSKTKILATGGASHNREILQVLADVFDAPVYVIDTANSACVGSAYRAFHGLAGGTDVPFSEVVKLAPNPRLAATPSPGASQVYEALLPQYAKLEQRILSQTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure and Function of Human Xylulokinase, an Enzyme with Important Roles in Carbohydrate Metabolism
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
molecule keywords XYLULOSE KINASE
total genus 180
structure length 528
sequence length 528
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2012-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc2A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc2A01
2Q97A 4XH1A 3FZFA 1NGDA 2P9NA 3CQXA 1IJJA 5AQKA 4BGBA 4EHUA 3GG4A 3VEWA 2HMPA 3EKUA 4H0XB 4WQ4C 4FO0A 1TYQB 4CZLA 2E88A 4XH4A 5ADXH 3ZEUA 2FXUA 2GUPA 1KAYA 2EWSA 1NGCA 5LY3A 3U8XA 1T44A 4FWQA 5KPTA 1TYQA 4QS8A 3HBTA 3A5OC 4C23A 5KPRA 4RTFD 3WXLA 3LDLA 3R8EA 4A2AA 2Q36A 1ATSA 1RDWX 2KHOA 3B8AX 2HF4A 2CGKA 4MLHA 3P4IA 3J8AA 1ZBSA 1S3XA 4BRAA 1NGFA 3SK3A 4BREA 4B1ZA 3UKUA 5BPLA 5EOYA 3R9PA 3WEEA 3ID8A 1RGIA 3AAQA 1WUAA 1U6ZA 3FZKA 5AZJB 4O5FA 3ATVA 3DWLA 4JN4A 2WUSA 5AQIA 3BF3A 3TPQA 5AFUH 1XC3A 3M1FA 1GLDG 5BN8A 1DKGD 2QWNA 5AQYA 4O8KA 4FL9A 3CJAA 3VEOA 4EHTA 5B8HA 4WQ4A 3UKRB 4DCHA 4BRQA 1BOTO 1NGHA 3WQUA 4EFHA 1CZAN 1YXQA 3KZBA 3LDNA 4CBUA 2ZF5O 2CH6A 2QWQA 2BTFA 4IJAA 3FZLA 1GLJO 4I6MA 4RCHA 4YDUC 5BRDA 1LOTB 3LL3A 1HJOA 2GEMA 3CI5A 2AA4A 2IIRA 2A6AA 1GLCG 3GL1A 4BRPA 3FZHA 4B1YB 4H5NA 4CJ7A 5EXWA 1NMDA 3VGMA 4K41A 1Q18A 2QWOA 4JD2B 4BG9A 2Q2RA 2HOEA 2E20A 1GLLO 2ASMA 3MMVA 4KBOA 3ZX2A 5FPNA 3O08A 3H1QA 3O1WA 5AQGA 3HZ6A 4CZHA 3HI0A 4FWMA 3MDQA 4BRKA 1YUWA 1QZ5A 2HF3A 1BU6O 3LM9A 5AQHA 2Q31A 4FOEA 2QXLA 4B1XB 4I6MB 4B1UB 4PKHA 1GLEG 1DEJA 4L3QA 2Q1NA 1SAZA 3ZETB 4BRDA 3ZX0A 2YHXA 1NLVA 4FPBA 2FF3B 2CGLA 4J8FA 3VEYA 3UKRA 3VF6A 1C0GA 3D2EA 3A5LC 5FPEA 4BC4A 3QBXA 2NZTA 3ZEUB 2P9PB 5BPMA 3M6GA 1ATRA 4A62A 2YI1A 3BUZB 3VETA 2IVPA 4JD2A 3D2FA 2A41A 1BDGA 1KAXA 2D4WA 2YJFA 3H46O 3JS6A 1R59O 5AQQA 4AM7A 3VEXA 3MCPA 4BR0A 2NLXA 1V4SA 4IXCA 3CJ9A 1MA9B 1DGKN 3UKUB 2Q0RA 3C0BA 3R6MA 3BP8A 3DJCA 2A3ZA 3CERA 3TU5A 5LJVA 2IVOA 5LJWA 5AQXA 2D0PA 2ZGZA 3DXKB 4BVPA 3FGUA 3C7NA 5FPMA 2D0OA 3RSEB 4HWIA 3SMSA 4BRFA 4BRIA 1Y64A 4MLEA 1BA0A 3VEVA 2FLOA 2V51B 3UB5A 3D2EB 1HKBA 2H3GX 1ZC6A 4BRMA 3L0QA 2F9TA 2ZWHA 1GLAG 2PAVA 3VERA 1MDUB 2GWJA 4FWRA 1S22A 5AZIA 1NGIA 3MN9A 3O80A 1GLFO 2W40A 3EL2A 2AP1A 5AQFA 4Z94A 4RWTA 3FE1A 2FF6A 1KAZA 2ASPA 4CZEA 3MK6A 2BUPA 2QWRA 2P9SA 4CZIA 4FWOA 2DPNA 3D7EO 4YDUA 2YCHA 2PBDA 4H5RA 4QS7A 1G99A 2V52B 3LDQA 3VPZA 4DB3A 5JMVA 1T6DA 2ZGYA 5EX5A 3FFKB 1K8KB 1NWKA 3L6QA 3I8BA 4BR2A 3DXMB 5AQWA 3LM2A 3VENA 4IO8A 2CH5A 4FWSA 4DQ8A 4ISEA 1ZXOA 3IDHA 2P9KA 5AQJA 4H0OA 3KVGA 5AQTA 2VYPA 4BR5A 3UE5A 5JICA 3MN5A 4DHYA 3L4IA 3O6WA 2FSKA 4WYBA 3W3DA 4CZMA 2VCPA 2I7NA 5AZIB 3SJHA 3WXJA 2E2NA 3SLCA 4K42A 1HKGA 1IG8A 1QHAA 2E1ZA 2P9UB 4MO5A 5BRFA 3MN7A 2QW9A 3GOIA 4LC9B 4BC3A 3FR0A 5AQMA 1X3MA 4BG8A 1U2VA 3M3ZA 4FWPA 3QFUA 3RSEA 3DXMA 1NGBA 1NGGA 4NO7A 4BGAA 3GDQA 1ESVA 4WQ5A 4EIAA 3O4WA 3ENHA 3H1VX 5CE3A 3ULEA 3H6EA 4A61A 5FPDA 3A5MC 5BN9A 2ITMA 3G25A 2V7ZA 4BR7A 2A42A 5AFUA 2A40A 3ENOA 3O8MA 2P9KB 3AARA 2P9IB 4FWLA 1BO5O 5KQDA 3ULEB 2QWLA 4PKIA 3ATUA 4K25A 2GELA 1X3NA 2QWMA 4BRGA 1BUPA 5BR9A 1SQKA 3CIPA 1QQOA 2E2PA 2D1KA 1EQYA 4M7XA 1HX1A 4H0YB 3A0IX 3VEZA 4MO4A 3EN9A 4CD1A 1QZ6A 1SZ2A 3A8YA 3HM8A 5TKYA 2FSNA 5BPNA 1HPMA 4H0TB 4Y0WA 1U2VB 1BWFO 4GY2B 3I33A 2E2QA 1Z6RA 4ISGA 2QM1A 2P9SB 4B1WB 5AQSA 3HTVA 3QICA 2P9UA 5F1XA 3IFRA 4B1VA 1X9JA 5AQRA 4M63C 1XQSC 3GBTA 2QWPA 3ZETA 2YHWA 2IVNA 5AQZA 5JLFA 4IJNA 4F9OA 4BC2A 4AM6A 3H3OB 4CI6A 2YHYA 4PL8A 4JNEA 4CZGA 1JCEA 3OHRA 4H5VA 3QFPA 2UYTA 1MWMA 4QS9A 1ATNA 1Z05A 3AAPA 3QBWA 3CJ7A 2E1YA 3CJBA 4M7YA 3QB0A 2I7PA 4FOIA 5AQPA 3WEEB 3CQYA 4K43A 3QDKA 3SMPA 4BR4A 5BRHA 3FLCO 4BROA 4CZJA 5JLHA 3W0LA 1WOQA 3VOVA 4H03B 3JXUA 5KQ8A 2OANA 4BC5A 5AQLA 3BF1A 1KXPA 2P9LA 5EY4A 4BRHA 4BRLA 2ASOA 2FSJA 2CGJA 4XH5A 5AQOA 4CZKA 3BEXA 3FZMA 5ELZA 5F2RA 1H1VA 4GNIA 3CJ1A 2J4RA 3C7NB 2GTDA 4JAXA 4JHDA 4CD3A 1P8ZA 2P9NB 3DXKA 3VESA 2VWBA 4BRCA 5E26A 4FSVA 5AQNA 3EKSA 3CETA 1YAGA 3VF2A 2Q0UA 4ISFA 3WQTA 4H0PA 3H45C 3MN6A 5E84A 1HLUA 3O5BA 1QQMA 1V4TA 1NM1A 2W41A 1BG3A 1C0FA 5AQVA 4H5TA 1NGAA 2F9WA 3CJCA 1BA1A 1E4FT 3WUHA 3D2FB 5EVZA 4JHDB 3U9ZA 1K8KA 1OKJA 3VGKA 1D4XA 3HSCA 3WT0A 1E4GT 3EZWA 2P9PA 4BRNA 2E2OA 2A5XA 3H3NO 4PKGA 1XUPO 5AR0A 4HTLA 3VF4A 4BR9A 4IZ9A 3AY9A 3EO3A 5BREA 2GWKA 1NGEA 2E8AA 4EAHD 3KHYA 1J6ZA 3LDOA 2P9LB 1LCUA 2V7YA 5AQUA 4B9QA 4CZFA 3F9MA 5KPZA 3O1BA 5F0XA 2YJEA 1MWKA 4PL7A 4CBXA 4CBWA 4FWKA 4BQLA 3S41A 3GE1A 1JCGA 3VGLA 1NBWA 3DAWA 3U4LA 1GLBG 3A5NC 2NRHA 3U9DA 3QMLA 4BVOA 1TUUA 4H5WA 5I9EB 3LDPA 1YVNA 3ZX3A 3CHWA 1NGJA 1QQNA 1TUYA 5ADXA 1T6CA 4IWVA 4E1JA 4A2BA 5AZJA 3IUCA 1HKCA 1JCFA 4XEIA 1RFQA 4H0VB 3WXKA 2P9IA 4NB4A 4FWNA 3WXIA 4WQ5C 4FPAA 3IMXA 4BQZA 1HUXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4A5AA 1OH7A 3V9ZA 3OYDA 4FK4A 1L3UA 1WB9A 4FO0A 4CEQA 4CHNA 5ADXH 1NGCA 4U7BA 3U8XA 5J2PA 4BDZA 4FWQA 3CFPA 5GADP 2G8VA 5KPRA 4EZ9A 4N56A 3KWGA 5KTQA 4C1NI 1RDWX 3B8AX 3THYB 2HF4A 4JS4A 1VSFA 3J8AA 4BRAA 3SK3A 1JLBA 1T3VA 3HK2A 4B1ZA 5BPLA 2F96A 3WEEA 3K0SA 1TKZA 3SQ1A 2ZJQL 3AAQA 4A57A 3VQBA 1VQPN 2PZSA 2VGMA 2XY8A 1Z25A 2I5JA 3E9PA 3PX6A 3BF3A 4FJKA 1MU2A 3O3GA 1Q86O 3ID6A 1XC3A 3MXMA 3K9KA 2F8SA 1D9DA 4X66K 3M1FA 3SQ4A 5AQYA 1U04A 4EZ6A 3LZIA 1VRTA 3WQUA 5CZ2A 3O9UA 4CBUA 4DSEA 3QO9A 2EX3A 3FZLA 1WSGA 1ASUA 5M1NA 2IIRA 3M5RA 1C1BA 1RDUA 4B1YB 3OYLA 3V9WA 1VRUA 2ZQBA 3VGMA 3QEIA 4LF7K 3QESA 5CHIA 3MMVA 5T7BA 4KBOA 3RMBA 4JYAK 5AQGA 1NK0A 4JI1K 2IGIA 3HI0A 1U47A 1QZ5A 4H4MA 2HVIA 2XHBA 1BQMA 3MXJA 3TTDA 2D0AA 2Q31A 3B6PA 4B1UB 4FOEA 4DTUA 5M1FA 4L3QA 3TI0A 1TL1A 3CCLN 4BDPA 1KVAA 1KVBA 1DT9A 5M1OA 1WBBA 3THXA 1C0GA 1RT2A 4CESA 4FLWA 4O4GA 5FPEA 3NF9A 4JI5K 3AA4A 1FK9A 1HYVA 3IS9A 3QEWA 3V1RA 1ATRA 3HJFA 3AVJA 3J7YP 4JD2A 2A41A 2D4WA 2UU9K 5CZ1A 5AQQA 3HPHA 3VEXA 1V4SA 4IXCA 3V1OA 3S9HA 3UKUB 3LAMA 3THVA 2Q0RA 4NLBA 3TAEA 3AVGA 4OKJA 2ETJA 4RW7A 4YNQA 3I56N 3DRSA 3DLEA 3SPYA 3I55N 4JKCA 4BVPA 4DU1A 1XWLA 4Y1CA 2D0OA 3SUNA 1BCMA 4HUEA 4JKGB 2FLOA 2V51B 3QIOA 3NVMA 1JXEA 3C6HA 4DTPA 3VQ4A 4KO0A 1OH8A 3EEQA 2F9TA 5FDLA 5HROA 3J80O 1T8EA 1S22A 3TR8A 3MN9A 3O80A 1GLFO 3TAQA 2AP1A 4CHQA 4RWTA 4OGEA 3SQ2A 4CZEA 3L3VA 2G8UA 4FWOA 4WF9L 3MEGA 1G99A 4DB3A 3VPZA 4GKKK 1KLMA 1S9GA 2KFNA 3RTVA 4C8KA 4CVNE 4E7JA 1NWKA 1JLGA 1X9SA 2O8BA 1KCFA 2FBYA 3G0ZA 4IO8A 1JLEA 3IDHA 3L2UA 3J81O 4BR5A 4L8RB 4CGFA 3UE5A 2NRWA 1J53A 3MN5A 4DHYA 3L4IA 1GOCA 4CZMA 1RT1A 4KHPK 4JKEA 3SLCA 1CLQA 2E1ZA 5CY4A 1HNWK 3HYFA 4M3YA 5BRFA 4BC3A 2G8FA 4E7LA 2B5JA 4BG8A 3SAFA 4CFCA 4JI6K 3M3ZA 4FWPA 2VQEK 4WCEL 2UXBK 5KRSA 2HNYA 4W5OA 4CCHA 4JI4K 3CM5A 2G8HA 1VSIA 4DR7K 3O8MA 4FWLA 1XMQK 1YVUA 5KQDA 1RT6A 3ULEB 3OTOK 2KW4A 4K25A 2HSTA 4E7IA 4FJ5A 5BR9A 3CIPA 1QQOA 3QETA 4CHPA 3NHGA 1A5XA 4CD1A 4YOYA 1QZ6A 3CFOA 4RW6A 4DTXA 4Y0WA 1U2VB 1EX4A 2E2QA 2E6MA 1Z6RA 2QM1A 3K9JA 3AO1A 3OYFA 4B1WB 5AQSA 4WFAL 4AF1A 2RPIA 1N33K 3QICA 5F1XA 4HCCA 4BACA 4B9NA 4FK2A 1C6VA 1KD1O 3GBTA 3ZETA 3T69A 4FYDA 3CF5L 1ITGA 3MCAB 3H08A 4YFUA 2UUCK 4F9OA 3H3OB 3AV9A 3NAEA 3AO5A 4JNEA 5C0YA 3OY9A 1SKRA 4I9QA 4Z4GA 4FLXA 4GKJK 4QS9A 1JLAA 4DLEA 3AVCA 4YHHK 4CEFA 1Z05A 1EKEA 3CJ7A 1Q81O 4DR3K 3KLHA 3DOLA 4IFYA 4N76A 4K43A 3SMPA 3MWTA 4NLCA 5BRHA 1P90A 4EP4A 3VOVA 1VQ4N 3Q7BA 5AQLA 4KTZA 4HVJA 2QKKA 4B3MK 2ASOA 4JK7A 2E4LA 4XH5A 4Z4HA 3BEXA 4B8AB 3AVAA 5ELZA 4M3UA 1I39A 2NRTA 3CC4N 1Q7YO 3UIQA 3VTIA 4JHDA 4LD0A 3EY1A 2FBVA 4KTWA 3CQ8A 2PYLA 5AJ3K 5GIOA 1X9WA 2P5GA 4BRCA 1K8AO 4CIFA 1LWFA 4C8MA 4O0JA 3VMFB 3SV3A 1KSPA 1BI4A 4FJXA 1NM1A 4IOAL 2YV0X 1NGAA 3CJCA 1IO2A 4OGCA 3QERA 1K9MO 2HBKA 1L3TA 1U49A 2WTUA 4DR4K 3ZCMA 3D2FB 5EVZA 1OKJA 3VGKA 3TSPA 1E4GT 4BRNA 2O4IA 2A5XA 3T1HK 2E6LA 2QKBA 1ZBFA 2HHQA 1BGXT 1B92A 1XUPO 4LH5A 1UOCA 3N4QA 3AY9A 3I8DA 2GWKA 1NGEA 2E8AA 4EAHD 1J6ZA 3LDOA 2V7YA 1LCUA 1T7PA 3O1BA 1Q9YA 4CHYA 5F0XA 4DS5A 1MWKA 2ZD1A 1NK4A 4CBWA 4FWKA 1NOYA 4BQLA 1BI4B 3C6UA 2YNGA 3GE1A 4B08A 5JS1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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