4BC2A

Crystal structure of human d-xylulokinase in complex with d-xylulose and adenosine diphosphate
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
528
structure length
528
Chain Sequence
APRRCCLGWDFSTQQVKVVAVDAELNVFYEESVHFDRDLPEFGTQGGVHVHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKASGFDFSQVLALSGAGQQHGSIYWKAGAQQALTSLSPDLRLHQQLQDCFSISDCPVWMDSSTTAQCRQLEAAVGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIYQQNPEAYSHTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGSGMNLLQIQDKVWSQACLGACAPHLEEKLSPPVPSCSVVGAISSYYVQRYGFPPGCKVVAFTGDNPASLAGMRLEEGDIAVSLGTSDTLFLWLQEPMPALEGHIFCNPVDSQHYMALLCFKNGSLMREKIRNESVSRSWSDFSKALQSTEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIIGRHRFNTENHKVAAFPGDVEVRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMSKTKILATGGASHNREILQVLADVFDAPVYVIDTANSACVGSAYRAFHGLAGGTDVPFSEVVKLAPNPRLAATPSPGASQVYEALLPQYAKLEQRILSQTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure and Function of Human Xylulokinase, an Enzyme with Important Roles in Carbohydrate Metabolism
pubmed doi rcsb
molecule keywords XYLULOSE KINASE
total genus 180
structure length 528
sequence length 528
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2012-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc2A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc2A01
3JS6A 1ATRA 2P9UB 1NGCA 4CZMA 2QWRA 2QWQA 3A5OC 3R6MA 2ITMA 2CH5A 4IZ9A 3J8AA 1NGDA 3C0BA 2D0PA 2QWLA 4EFHA 1HKGA 2P9NB 4XEIA 2I7NA 4QS9A 3GL1A 3WXIA 2P9SB 5CE3A 4IJAA 4K41A 3VOVA 4FWSA 5JICA 1NLVA 2D4WA 3M3ZA 4GY2B 2Q36A 3A5LC 3M6GA 5AQYA 3O5BA 3U9DA 3HSCA 3LM2A 2OANA 3LDPA 4WQ5C 3VF4A 4DQ8A 2E1ZA 4CZFA 3FE1A 4H0PA 1RDWX 2FLOA 1XC3A 3VEOA 5JLHA 4I6MA 3CJAA 1V4SA 1ESVA 5LY3A 4CD1A 1KAYA 3U9ZA 2WUSA 4B1ZA 2GUPA 2BTFA 1SZ2A 1U2VA 3DXMA 4BC3A 1QZ5A 2CGJA 3FZMA 3FZFA 1TUUA 5AZJB 1Y64A 1EQYA 5AQKA 4FWPA 1LCUA 2QM1A 3CJCA 2VYPA 2P9PB 3VGKA 2VWBA 2E2PA 3WEEB 4BR4A 4RTFD 1T44A 3MCPA 3C7NA 3KVGA 1QZ6A 4LC9B 1BG3A 3WQUA 1J6ZA 2W40A 1XQSC 3QBWA 3QDKA 5F0XA 2V51B 3WXJA 4JHDA 3BEXA 4DCHA 3WT0A 3A0IX 3EL2A 4FOEA 4H5NA 5ADXH 4IWVA 4CBXA 2HOEA 3VESA 4IJNA 1JCGA 4BRAA 3IUCA 2QWPA 3D2FB 1X3MA 1X9JA 2V52B 4BRLA 4FPAA 4J8FA 1NGGA 2D1KA 4PKGA 4CBWA 3I8BA 1MDUB 1BU6O 3TPQA 5AQSA 3L0QA 4A61A 5AQPA 4BROA 1T6DA 1KAZA 2FSNA 3DXKB 5EY4A 3MN7A 3SMPA 3ZETA 4BQLA 2NZTA 3IDHA 4C23A 4DB3A 3H1QA 3VGMA 4FL9A 5AQLA 2FSKA 1WUAA 3ATUA 4FWRA 3UE5A 2ZF5O 5F1XA 2ZGZA 4BRNA 5BPMA 4B1XB 4CZKA 2Q31A 1HPMA 3HBTA 3WEEA 4EHUA 5JMVA 1LOTB 4QS7A 3MMVA 1BOTO 5AQQA 3KZBA 2ZWHA 4BR7A 1S3XA 2A5XA 3AY9A 3ENOA 3L4IA 4H5TA 5BRHA 3KHYA 4FO0A 4BRHA 3H3NO 5AQGA 4I6MB 4BGAA 2GWKA 5AQRA 3D2FA 1HX1A 4YDUA 1GLFO 1YUWA 1GLLO 2GEMA 3LDLA 3CJ9A 4A2AA 3DXMB 5AQXA 4A2BA 1GLEG 4H0TB 5KPRA 3LDOA 2P9IA 5ELZA 3UKRA 3C7NB 1HJOA 2J4RA 3CJBA 4HWIA 4XH1A 3SJHA 3O4WA 4PKIA 1T6CA 4JHDB 2AA4A 3MN9A 3EN9A 5AQOA 4H0XB 4CZGA 2UYTA 2HMPA 4BR0A 1BA0A 2GWJA 2NRHA 1S22A 2Q1NA 2PAVA 3VENA 4H03B 1QQMA 2DPNA 3GDQA 4BR9A 3FLCO 3CERA 2EWSA 5BRDA 5AQHA 4BVOA 1NWKA 3BP8A 3CQYA 2E20A 3VF2A 1DEJA 3ZETB 5BN9A 2CH6A 4BC5A 3VETA 1HLUA 2IVOA 3O80A 1BO5O 5LJWA 3O8MA 2PBDA 3CJ1A 2E8AA 3GBTA 3ULEB 5LJVA 2FF6A 3ENHA 1D4XA 3VGLA 3RSEA 2IIRA 3L6QA 3M1FA 4EHTA 5AR0A 4FWOA 1RGIA 4XH5A 5E26A 2YCHA 2CGLA 5E84A 4BQZA 2F9TA 2GTDA 5TKYA 5AFUA 3HI0A 1ATSA 1GLCG 2IVNA 1IJJA 2YI1A 4YDUC 3IFRA 1ZXOA 1NGBA 4BR5A 5AQFA 5AZIA 5AQTA 4JN4A 2YHXA 4E1JA 5FPDA 4MLEA 3JXUA 4BRIA 5FPMA 4JAXA 1IG8A 2NLXA 3ID8A 3SK3A 2Q0RA 3DAWA 1YXQA 2ASOA 2GELA 4XH4A 1NGHA 4NB4A 3OHRA 3I33A 4FWQA 2W41A 4BG8A 4ISGA 1ZC6A 2F9WA 3A5MC 1MWMA 2P9IB 1HKBA 4MO5A 3UKRB 3D7EO 4BG9A 2ASPA 1C0GA 2FF3B 3CQXA 1P8ZA 1GLJO 2KHOA 2A6AA 3ULEA 3FZHA 3LDNA 4H5RA 1RFQA 1Z05A 1TYQA 4B1UB 4CZHA 5BN8A 4BRMA 4CD3A 3FFKB 4IXCA 3HM8A 4Z94A 2QW9A 3FZLA 3VPZA 5FPEA 3CHWA 4JNEA 4BRCA 4CZJA 3W0LA 2FXUA 3VEXA 1ATNA 4B1YB 1E4GT 2E2QA 2A42A 5AQIA 3SMSA 2CGKA 1GLBG 3H3OB 1MA9B 3EO3A 3G25A 4BRQA 4RWTA 3MK6A 5KQ8A 3MDQA 2QXLA 3W3DA 3LL3A 4H0YB 3ZX3A 1HKCA 4PL8A 5AQVA 3U4LA 4MLHA 5JLFA 4RCHA 1NGJA 2YJEA 4K42A 4DHYA 3RSEB 5BRFA 5B8HA 4GNIA 2P9LA 2ASMA 4M7YA 4BRFA 4FWMA 4CJ7A 3H46O 1X3NA 3A8YA 2ZGYA 4EIAA 3WQTA 3GG4A 1BWFO 4WQ4A 3BUZB 2I7PA 1C0FA 5AQWA 4O5FA 3D2EA 2YHYA 1YAGA 1JCFA 5AQJA 4K43A 3MN6A 5AQNA 3UKUA 4F9OA 5BPNA 4H0OA 1YVNA 4MO4A 5AZIB 3FZKA 1NM1A 4QS8A 3WUHA 4A62A 3QFUA 3ZEUB 4FWLA 5BREA 5AQUA 4PKHA 4BVPA 2H3GX 1DGKN 3TU5A 4M63C 1SAZA 3IMXA 2Q97A 1BUPA 2Q0UA 4FOIA 3A5NC 3QFPA 3P4IA 4BRDA 4CZLA 1NGAA 4FSVA 3VEYA 4M7XA 3GOIA 4KBOA 2A3ZA 2BUPA 3AAPA 4CBUA 1GLDG 2HF4A 4H5VA 1TYQB 4BC2A 4CZIA 4JD2A 1R59O 2QWNA 2E1YA 3R8EA 2D0OA 1QQNA 2P9KA 4BRGA 4B1WB 3DWLA 1E4FT 2Q2RA 3FR0A 3AAQA 1JCEA 4ISFA 3UB5A 4Y0WA 2FSJA 3DJCA 5EXWA 1QQOA 2VCPA 1BA1A 5EOYA 1QHAA 2YJFA 3QB0A 3ATVA 3O1BA 4AM7A 1V4TA 4O8KA 1MWKA 3U8XA 4CI6A 3R9PA 3F9MA 1K8KA 2V7YA 3ZEUA 2E2OA 2HF3A 5AQMA 2YHWA 2E88A 1XUPO 3AARA 1NBWA 4PL7A 3GE1A 1WOQA 4NO7A 3HZ6A 1HUXA 2P9UA 3ZX0A 1G99A 4FWKA 4WQ4C 3BF3A 3VERA 2P9NA 2AP1A 2V7ZA 5KPTA 5F2RA 2P9LB 2P9SA 2IVPA 3BF1A 3EKUA 4WYBA 3WXLA 3QBXA 4CZEA 3O08A 4K25A 4FPBA 4B1VA 1H1VA 3D2EB 1CZAN 1KXPA 3QMLA 3UKUB 3O6WA 3EKSA 1Q18A 3LM9A 1GLAG 1SQKA 1BDGA 3H1VX 3VEWA 1Z6RA 5KQDA 1NGFA 4ISEA 4WQ5A 3FGUA 4L3QA 3CETA 3CJ7A 4B9QA 3WXKA 3CIPA 1NGEA 3MN5A 1NGIA 5AZJA 1OKJA 3S41A 5AQZA 2P9PA 3VEVA 3LDQA 3O1WA 5BR9A 4EAHD 4IO8A 4BREA 4BC4A 4BR2A 1TUYA 4JD2B 2E2NA 3H45C 3EZWA 5I9EB 2QWOA 1NMDA 2P9KB 5ADXA 3B8AX 5FPNA 4AM6A 1ZBSA 2A40A 4BRPA 3VEZA 4FWNA 3H6EA 3QICA 5AFUH 1U6ZA 2A41A 5EVZA 3SLCA 1U2VB 3ZX2A 4BGBA 3CI5A 1DKGD 1K8KB 5EX5A 3DXKA 4HTLA 3HTVA 4H5WA 4BRKA 5BPLA 5KPZA 4H0VB 2QWMA 1KAXA 3VF6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3Q7CA 4CZMA 2QWQA 2JWLA 1JLGA 2Z1JA 1NGDA 1OVYA 4XEIA 1N34K 4QS9A 4FK0A 3C65A 2ZD1A 4I2PA 4K41A 4EZ6A 2OPRA 2Q36A 4G9ZA 5AQYA 3O5BA 3SNNA 3O9QA 3HSCA 3VF4A 2OANA 4WQ5C 4U7BA 4CZFA 3OYKA 2FLOA 1XC3A 5JLHA 1JKHA 2PYLA 1KAYA 3U9ZA 4B1ZA 1LV5A 3RR7A 1BIUA 2GUPA 3NF8A 2E5LK 3KK3A 2BTFA 1U2VA 1HPZA 1B92A 3HPHA 3RMAA 3FZFA 1Y64A 1RCHA 1EQYA 5AQKA 3OYJA 4JK7A 1KVCA 3VGKA 2VWBA 2E2PA 4RTFD 1C0MA 2GBZA 3KVGA 4Y1CA 2PY5A 5DM6L 4IG3A 4V19S 2W40A 5C2DA 3QBWA 3KLIA 5HRPA 5F0XA 1SS6A 3QINA 3NH2A 3EL2A 4IWVA 4CBXA 5C42A 3M8RA 3WXMB 2O8BA 1C1AA 2V52B 4J8FA 4PKGA 2XY6A 3HYFA 4M3ZA 4CIFA 1NK5A 3M8QA 5AQPA 3P31A 3DLEA 1T6DA 2FSNA 3DOKA 3MN7A 2HW3A 2NZTA 3E9LA 3DM2A 4DQSA 3A2FA 3H1QA 4FL9A 3P83D 4NYNA 2G8WA 2FSKA 2ZGZA 4LF4K 5BPMA 3HBTA 1LOTB 4QS7A 4DV6K 4FJLA 3MMVA 4CHNA 4CHYA 4YNQA 3E01A 1S3XA 3AY9A 2RKIA 3Q7BA 3L4IA 4IKFA 5LMUK 3WNFA 3KHYA 3H3NO 3HT3A 4HUFA 4BGAA 2GWKA 3D2FA 5C10A 1HX1A 2KW4A 3V9WA 3K2PA 3PUFA 3G10A 3DXMB 3DOLA 4RW7A 4AH9A 4KFBA 4IOXA 1SL1A 1KD1O 2WC9A 5ELZA 3VQ9A 1EWRA 1VQNN 3TSPA 3SJHA 3SV3A 3SJJA 3MN9A 1T05A 4CZGA 2GWJA 3DRPA 4DFMA 1QQMA 2DPNA 3GDQA 3NVKA 3VQ5A 1UAXA 3J7YP 1QTMA 1RT2A 3ZSZA 3CQYA 4X62K 3AGRA 2E20A 3G4SN 3PX6A 4KI4A 3ZETB 4JI3K 3SBGA 2CH6A 4DSLA 5M1QA 4FM2A 2IVOA 4DQQA 1BO5O 4E7HA 4FZXC 3K9KA 2E8AA 3ULEB 4FW2A 2P51A 3VQDA 3ENHA 3DYAA 5J2QA 3AO1A 1RTHA 3L6QA 1KCFA 5AR0A 3V81A 4XH5A 1A5XA 3HI0A 1MU2A 2IVNA 4K8ZA 4WF9L 1S1UA 3CFOA 2XO7A 2PFUA 3QEXA 3HM9A 1NGBA 4CGJA 4BDPA 5AQFA 5AZIA 2QA4N 1WAJA 1C0TA 3JXUA 4CIGA 2OPSA 3SK3A 3I8DA 3DAWA 2G8KA 4XH4A 1NGHA 3KIOA 1YJ9N 3OHRA 2W41A 4ELVA 3MECA 4ISGA 2F9WA 3A5MC 3D0PA 4DSJA 4DR2K 4E0DA 3KJVA 3UKRB 2KZZA 2ASPA 4AHCA 1C0GA 3THYB 1P8ZA 2A6AA 3LDNA 4H5RA 3K5MA 1HR0K 3DLLL 4DU3A 3V9ZA 2YX6A 3G6EN 3CF5L 4CZHA 2YHAA 2QKBA 4JI4K 4BRMA 1YTAA 4RW6A 3OTOK 4IO9L 4KREA 1U04A 1NMNA 4JNEA 3FFIA 3V1OA 3OS0A 3F5TA 3BZKA 3VEXA 1ATNA 4B1YB 3CYMA 5C25A 3TAPA 2QK9A 3H3OB 4KHNA 3G25A 1RNHA 1SKWA 4H0YB 3THXA 4IDKA 5HROA 3DLBA 1OH8A 1KFDA 4E89A 1I94K 2OA8A 2NRXA 3VQPA 4KHQA 1VSKA 3U4LA 3M5RA 4JKFA 5JLFA 4JKBA 1NK8A 3B6PA 4RCHA 1ZBIA 4K42A 1TK8A 4GV9A 1ZYQA 4GNIA 1FJGK 1RDUA 2B5JA 3C6UA 3ISNC 4CJRA 4FM0A 3H46O 3A8YA 4EIAA 3WQTA 3DI6A 4OLBA 3VQ6A 3BUZB 2I7PA 1C0FA 1QSYA 4O5FA 3G71N 1YAGA 5AQJA 2XY8A 1WAFA 3HSTB 4F9OA 1C6VA 4H0OA 5TKWA 2OPQA 3FZKA 4DTUA 4CK3A 4A62A 3WUHA 4MFBA 5BREA 4PKHA 2H3GX 1RBTA 3L8BA 3OYHA 4KRFA 4M63C 1SAZA 4Q0BA 3AA5X 4A5BA 3A5NC 1IBLK 4CGIA 4BRDA 4CZLA 4DTSA 2ZJRL 1CXUA 2P5OA 4FSVA 4CF1A 4RW4A 4FK2A 2BUPA 4CHOA 3P38A 5HRSA 1GLDG 4M41A 4CJ4A 2HHHK 3S3MA 1JLCA 1R59O 2QWNA 3VA3A 1QQNA 1Z25A 1D9FA 3FR0A 4IFEA 4CGHA 1JCEA 3UB5A 3ZLJA 4ID1A 3QB0A 3NF6A 4E19A 3O1BA 4AM7A 2QXFA 1IKVA 4BE2A 4NCBA 3HRGA 4X66K 3NF9A 4K8XA 2PYJA 2E88A 3AARA 3MX2A 3GE1A 3V4IA 2P9UA 3TAFA 5C15A 4KTWA 3AVIA 4GVEA 3K0SA 4G1QA 1ILYA 4FJMA 3RMDA 2P9SA 1RBSA 3EKUA 1BI4A 1NKCA 1QHTA 2YNFA 4CZEA 3O08A 1RDDA 4OKJA 2KQ2A 2X78A 4GV6A 4DU4A 1H1VA 3D2EB 4DS4A 1CZAN 1KXPA 3TARA 3QMLA 2HHXA 1RTJA 3O6WA 2HHUA 3DRSA 5IT9O 4N41A 1BDGA 3VEWA 4MQ3A 2O8DA 1NGFA 4WQ5A 3I55N 2HBMA 3IKMA 1I3AA 3FGUA 2HHSA 3CETA 4IFVA 4Z4EA 3CIPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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