The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
116
|
structure length |
116
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| molecule tags |
Ribosome
|
| total genus |
27
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| structure length |
116
|
| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HNW K; 4LFA K; 2VQE K; 4NXN K; 4DR7 K; 4X62 K; 4LF9 K; 4LF6 K; 1N33 K; 4DV7 K; 4DR6 K; 3J7A P; 5IWA K; 4DV1 K; 4B3T K; 1HNZ K; 4CVN E; 2VQF K; 4JI8 K; 1HNX K; 4AQY K; 4JV5 K; 4V19 S; 3J80 O; 4OX9 K; 4LFB K; 3OTO K; 4JI7 K; 4LF5 K; 4JI0 K; 4CW7 B; 1XNR K; 4GKJ K; 3J7Y P; 1HR0 K; 1FJG K; 5FLX O; 2UUB K; 2UXB K; 1XMQ K; 2UU9 K; 1N34 K; 4JI3 K; 3JAM O; 2ZM6 K; 5LL6 Z; 1N36 K; 4DR4 K; 2UXD K; 4DV3 K; 2HHH K; 5IT9 O; 2UUC K; 4LF8 K; 2E5L K; 5LMU K; 4X64 K; 2UUA K; 4YY3 K; 4X66 K; 4GKK K; 4DUZ K; 4X65 K; 4JI1 K; 4JI2 K; 1XMO K; 4DV4 K; 4NXM K; 4DUY K; 1I94 K; 4DR1 K; 4JI4 K; 4DV2 K; 4DV5 K; 1XNQ K; 4B3S K; 3T1H K; 4DR3 K; 4DV0 K; 4B3R K; 1IBL K; 1IBK K; 4LF7 K; 4KHP K; 4JI6 K; 4DV6 K; 4K0K K; 3J81 O; 2UXC K; 1J5E K; 4LFC K; 4DR5 K; 1IBM K; 4LF4 K; 4B3M K; 4DR2 K; 2F4V K; 4JYA K; 5BR8 K; 4YHH K; 1N32 K; 3T1Y K; 5AJ3 K; 4JI5 K; 5A2Q O; 5LMN K; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KAZ A; 3GOI A; 4DF8 A; 3TTF A; 4BGA A; 4MQ3 A; 5BPM A; 1NMD A; 3FFK B; 1N33 K; 4FJJ A; 1ITG A; 4CZG A; 5AQO A; 3ZX2 A; 2CGL A; 3VTI A; 5IWA K; 4DV1 K; 4CJK A; 5F2R A; 3DLR A; 4WE1 A; 1P8Z A; 2IIR A; 3CI5 A; 3P31 A; 4QS8 A; 2VWB A; 2HHQ A; 1DEJ A; 1LAW A; 1WAF A; 1SZ2 A; 3EN9 A; 2VQF K; 4BG9 A; 3KLF A; 2GX9 A; 1EKE A; 3R8E A; 1EQY A; 2ZGZ A; 3AVA A; 4JD2 B; 5GIO A; 1KAX A; 4JV5 K; 3GBT A; 2NZT A; 2XHB A; 3G71 N; 1VSM A; 2ZJQ L; 3WEE B; 5GAE P; 2YNG A; 4M3T A; 2NUB A; 3RMC A; 2Q1N A; 3JXU A; 1RDA A; 4A61 A; 2OAN A; 3D2F A; 5GIN A; 3NF8 A; 4DLE A; 4F2R A; 3VQA A; 5DM7 L; 5AZJ A; 5HBM A; 3LDQ A; 4DFP A; 3T69 A; 4BRF A; 2YV0 X; 2UXD K; 2HHU A; 4FLY A; 4N41 A; 2UUA K; 4JKA A; 1BI4 A; 4CEA A; 4FM1 A; 3OHR A; 5CYQ A; 4MLE A; 2FF3 B; 4IEE A; 3LAM A; 1NGB A; 3FGU A; 3C0B A; 5AQN A; 2P1J A; 4QS9 A; 2Z1I A; 1JL1 A; 3G0Z A; 3CJC A; 1RTJ A; 2YHW A; 3O80 A; 4LSN A; 4F8R A; 3HP9 A; 4DS4 A; 2NRV A; 4BRH A; 1UAX A; 1JLG A; 4DFM A; 3SUP A; 1TL3 A; 1TKZ A; 4JKH A; 4C8O A; 4JI6 K; 1UOC A; 1L3U A; 1VSI A; 4M7X A; 5AZI A; 4CZF A; 3CJB A; 3DOL A; 3AAR A; 4M3Z A; 1VK0 A; 3P5J A; 1IO2 A; 4FPB A; 2HOE A; 5KQ8 A; 4A2A A; 3SAH A; 2V51 B; 3U6F A; 1VQN N; 5HRS A; 2NRR A; 3SQ2 A; 2OPP A; 3HVT A; 1LCU A; 3V9S A; 1S3X A; 3OVN A; 4DR6 K; 2FSN A; 4F3O A; 1B92 A; 3QIC A; 1L5U A; 2A1R A; 4E89 A; 3MXI A; 2B6A A; 1D5A A; 4JI8 K; 3KK1 A; 4CBU A; 3OBY A; 1YIT N; 3AAP A; 1BA0 A; 4LFB K; 3O3H A; 4FWL A; 4ID1 A; 4WYB A; 5AQM A; 3T3F A; 3K59 A; 1X9W A; 3C7N A; 3R3L A; 1VQ8 N; 3UIQ A; 1T6C A; 4B1V A; 5AQR A; 1HNI A; 3SAF A; 2O8C B; 4EFH A; 5LY3 A; 2QXF A; 3M6G A; 4DG1 A; 3F9K A; 3ZYY X; 4CGI A; 3LP0 A; 5LL6 Z; 2VGN A; 2NRW A; 3SBT A; 1N36 K; 4DR4 K; 3CM5 A; 3MX2 A; 3CFO A; 4I9Q A; 3GL1 A; 4IFV A; 1MA9 B; 1VQ7 N; 2QWN A; 4DTR A; 2OZM A; 3DRP A; 3ZSY A; 1ASW A; 3NAE A; 4K8X A; 3AVF A; 4LH5 A; 3OS1 A; 3H08 A; 4Y0W A; 3AVH A; 1KFD A; 2Q97 A; 4FM0 A; 2HBM A; 4JKG A; 4DV4 K; 2DPN A; 4YOU A; 4DCH A; 4FOE A; 1HNV A; 2WTU A; 4EP4 A; 1XQS C; 3AO2 A; 4JN4 A; 2EWS A; 3AO4 A; 1M1K O; 1MWK A; 5D3G A; 4RG8 A; 3H6E A; 1GLB G; 3VQD A; 3SJJ A; 4K25 A; 1NJW A; 2J4R A; 3VPZ A; 5AQW A; 1M90 O; 1ESV A; 4HTL A; 3VQ6 A; 4JYA K; 3ZSW A; 1VSK A; 2HBK A; 3QEX A; 3O9Q A; 4DTP A; 3OYI A; 4C8M A; 4DQP A; 3DOK A; 2OZS A; 4YOX A; 1VSD A; 2VWJ A; 3OYF A; 3AVM A; 2D0A A; 3ZET A; 2X6N A; 1ASV A; 4CGH A; 1IKY A; 4DLG A; 1RTD A; 3DYA A; 3ZT4 A; 4WF9 L; 1QZ5 A; 4CEO A; 1NGH A; 4K41 A; 4W5O A; 5J2Q A; 1YUW A; 2P9K A; 1ATR A; 1QVF M; 4YOR A; 1NM1 A; 3KKR A; 1T7P A; 3KIO A; 1NOZ A; 1Z05 A; 4Z4F A; 4IKF A; 4KB0 A; 1JJ2 M; 1S1X A; 2CH6 A; 1XWL A; 3HTV A; 3CET A; 3H1V X; 1GLE G; 3ZT0 A; 5E41 A; 4CGG A; 3BZK A; 4CJF A; 4PA1 A; 4JK8 A; 3D7E O; 4BR2 A; 1JLF A; 3KD5 E; 4DU3 A; 2PYJ A; 1GLC G; 3CJ9 A; 5ADX A; 4B9Q A; 1YVN A; 3KLG A; 3UKU A; 1NK8 A; 1X1P A; 4IFE A; 3TAG A; 1A5X A; 3BF1 A; 5KGW A; 5AQI A; 4X65 K; 4B1W B; 3SAG A; 3O4Q A; 4HWI A; 4AM7 A; 2PFU A; 3BY5 A; 3V9Z A; 3LAK A; 3VET A; 3HL8 A; 4NXM K; 4JS4 A; 5DM6 L; 3OYG A; 1Q9X A; 4Y1D A; 4H0T B; 4YDU C; 4AHT A; 1FK9 A; 2I7P A; 2E1Y A; 2G8V A; 3IFR A; 1RBT A; 3SLC A; 4DTO A; 2FXU A; 3NMU A; 3LPU A; 2D0B A; 4KHU A; 1FKP A; 2OCE A; 3CCS N; 1QE1 A; 3FFI A; 3TSU A; 3VEY A; 2HBL A; 1L3V A; 4B8A B; 5H1S Q; 5SWM A; 4WFB L; 1EWR A; 3LDP A; 1X9J A; 4FJ5 A; 4O0I A; 4AH9 A; 1HYZ A; 3IRX A; 3LWL A; 1ZBI A; 2PAV A; 1EXQ A; 2P9L B; 3CD6 N; 4A5A A; 1EET A; 4FLU A; 4IBN A; 4YDU A; 4DF4 A; 2XO7 A; 1RT5 A; 1C6V A; 4FLT A; 3SPY A; 1LAV A; 1TAQ A; 3FZM A; 3BGR A; 3VOV A; 1N6Q A; 1E4F T; 4DTN A; 5CHI A; 2E8A A; 5AQJ A; 4FCY A; 2IDO A; 3MX5 A; 4M41 A; 3WNE A; 4DWI A; 4YOY A; 1XNR K; 4BDP A; 2JWK A; 3SCX A; 2KFN A; 3ALY A; 5I3U A; 1FXX A; 2HB5 A; 4DQI A; 3OY9 A; 5BR9 A; 3TAP A; 4AM6 A; 2YX6 A; 1NK7 A; 2R7Y A; 3RSE B; 2Q0U A; 1XI1 A; 4H03 B; 4KTW A; 5M1O A; 5GAG P; 3P4I A; 2E2Q A; 4FWS A; 4CGD A; 4OLA A; 2FSJ A; 3KK7 A; 3ZEU B; 2QWM A; 2OTJ N; 3LM2 A; 2F8S A; 1QQM A; 1SS6 A; 4G9Z A; 5I42 A; 2AJQ A; 4Z0U A; 4C8N A; 1U6Z A; 3CM6 A; 4LH4 A; 3QLH A; 3VF6 A; 1U4B A; 2PY5 A; 2QKK A; 1QS4 A; 1TK5 A; 3THY A; 3TAF A; 1S1T A; 4JS5 A; 1IKV A; 1DTQ A; 2HND A; 2NNW A; 1NGA A; 2UXC K; 2DTU A; 3U9D A; 3DAW A; 2HST A; 1LOT B; 2I7N A; 5AQP A; 4LF4 K; 4CEE A; 3SUO A; 2KZZ A; 3HVR A; 3HST B; 1IKW A; 4I9L A; 2X78 A; 5AFU A; 2Y1J A; 1U45 A; 1RCH A; 2W6K A; 2WUS A; 4H5V A; 5AR0 A; 1NGE A; 3ZSV A; 2HHV A; 3DLE A; 4LFA K; 1E3M A; 4J2D A; 2XY7 A; 2ASP A; 4I6M B; 3CQY A; 3CYM A; 1JXE A; 3HBT A; 2D0C A; 4Z4E A; 3VQ9 A; 3V9U A; 3VEO A; 4CK1 A; 4AQY K; 1ATS A; 1TUU A; 3HPO A; 4QS7 A; 5HL7 L; 1HKB A; 3SI6 A; 5J2P A; 3VGK A; 3VQ4 A; 4KHN A; 2LSN A; 4J2E A; 3BZC A; 3NF9 A; 2WBN A; 3S41 A; 1HR0 K; 2JWL A; 1D9D A; 3RR7 A; 3QES A; 2QTD A; 1VSJ A; 5B8H A; 3OYE A; 5BPN A; 3JAM O; 2ZM6 K; 4BC2 A; 3Q7B A; 3OYC A; 4DSI A; 4NO7 A; 2KHO A; 3E9O A; 3G6E N; 1VSH A; 3HM9 A; 4B9M A; 1U47 A; 2W40 A; 3OYM A; 3LL3 A; 1WSF A; 4ILG B; 3V81 A; 4JRQ A; 1JLQ A; 3J8A A; 1HX1 A; 2V7Y A; 2FF6 A; 1QQO A; 4B1U B; 1O1W A; 1G99 A; 1I94 K; 3AAQ A; 4DR1 K; 1SL2 A; 4M45 A; 4B9V A; 3U9Z A; 3KTQ A; 5CZ2 A; 1BUP A; 1YTU A; 4FK4 A; 4B3S K; 1C0M A; 1JLA A; 4K43 A; 1YHQ N; 4DV0 K; 3QBX A; 2P9S A; 3A5N C; 1GOC A; 4FM2 A; 3MXM A; 2I5J A; 1U2V B; 5C25 A; 4BR0 A; 4Z94 A; 2VG6 A; 2EHG A; 4DR5 K; 3ID6 A; 3VA0 A; 3OYK A; 1ZBS A; 1RTI A; 1VQ4 N; 2HHS A; 3U3Y A; 1YTA A; 3LP3 A; 1SL0 A; 2O8D B; 3AVL A; 2ETJ A; 4CJW A; 2DFH A; 3BP8 A; 3IDH A; 4CZE A; 4YNQ A; 1TYQ A; 4G1Q A; 4B9T A; 3RWU A; 1BQN A; 5KTQ A; 4CEF A; 2HMI A; 2A3Z A; 2RF2 A; 3CHW A; 4CJQ A; 1S9E A; 4IWV A; 4EP5 A; 5M1F A; 3VEZ A; 1OH7 A; 3THV A; 4BRE A; 4AIL C; 3AGK A; 3ZSQ A; 4CJ7 A; 3L4I A; 3NDK A; 1I39 A; 4V19 S; 4OX9 K; 4E7H A; 4FXD A; 4EHT A; 3QFP A; 4FJ8 A; 2CH5 A; 4CJS A; 4ZTJ A; 5MLC Q; 4ELV A; 4HCC A; 2G8I A; 2BDP A; 1A5W A; 4JD2 A; 3AVK A; 4JNE A; 4BGB A; 2H3G X; 4CF8 A; 3F9M A; 1XMQ K; 3WEE A; 3I8B A; 4BVO A; 4DS5 A; 3L3V A; 3NGI A; 1TV6 A; 2GTD A; 3HRG A; 4KTQ A; 5KRS A; 4DV3 K; 4AHC A; 1KCF A; 3K57 A; 1Z26 A; 1CZA N; 4AHR A; 4X66 K; 2HHW A; 4LY7 A; 1KVB A; 3KLE A; 3IKM A; 3SNN A; 2F96 A; 4FZX C; 2ZJP L; 4OPH A; 1ZBU A; 3EZ5 A; 3NH1 A; 3L8B A; 1WB9 A; 1TKX A; 4MLH A; 3OYH A; 4KB1 A; 3QFU A; 3NE6 A; 3RR8 A; 3HJF A; 1WOQ A; 1YF5 L; 4YOV A; 3P38 A; 4NCA A; 3FLC O; 1H1V A; 3ZLJ A; 4NYN A; 1S22 A; 2D0O A; 4B1X B; 4CD3 A; 4M3R A; 4I2P A; 4FYD A; 3NF6 A; 4B3M K; 4E1J A; 2G8W A; 5FPM A; 2FLO A; 2GEM A; 4HTU A; 4PL8 A; 3JS6 A; 2WOM A; 4JKE A; 3TAQ A; 2OTL N; 4CER A; 5AQU A; 2HF3 A; 4FJI A; 3EE8 A; 5AZJ B; 1A5V A; 1WBD A; 4A2B A; 4OKJ A; 2VG5 A; 1BIU A; 5BN9 A; 3V9X A; 1VQ9 N; 2GV9 A; 3I55 N; 4OLB A; 4KHY A; 4WFN L; 1BIZ A; 3L2U A; 1NK6 A; 4BRK A; 1RTH A; 5CR4 A; 1XUP O; 4BRQ A; 4M3Y A; 1RDU A; 4J2B A; 4FLV A; 3E66 A; 4CD1 A; 3VQB A; 3G10 A; 4GKJ K; 4CF2 A; 3LDN A; 3C6T A; 4BWM A; 5EU7 A; 1GLL O; 1KLN A; 3V1O A; 5GAH P; 1T03 A; 3TAN A; 5M1K A; 4J2A A; 3F5T A; 4DSF A; 1YJW N; 4C1N I; 3MWP A; 3OJS A; 2O8C A; 1T6D A; 2O4G A; 1KQS M; 2BGG A; 2A40 A; 3A8Y A; 3WNF A; 3HM8 A; 4M3U A; 3VEW A; 2B5J A; 4B9U A; 4F4K A; 5AZI B; 3ULE B; 4IOA L; 4PL7 A; 3ENB A; 2GWK A; 3VER A; 2YKM A; 3SMP A; 4ELT A; 1RT1 A; 2V7Z A; 3MDQ A; 1HJR A; 1VRU A; 4CEZ A; 1GOB A; 4Z4I A; 3O4W A; 4MDB A; 1OH8 A; 1CXQ A; 2B4J A; 2IAJ A; 4EHU A; 4PY5 A; 3RTV A; 1Q9Y A; 4C23 A; 3HOT A; 3VTH A; 3WXJ A; 2YCH A; 3CFP A; 3SQ1 A; 3K9J A; 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4H0P A; 4B3O A; 3CCJ N; 1XHZ A; 1KC8 O; 4E3S A; 3PLA A; 1WSH A; 1MU2 A; 3CJA A; 1SKS A; 2ATQ A; 3C95 A; 4JAX A; 3BF3 A; 4CGJ A; 4YFU A; 3SUN A; 1IBK K; 2RKI A; 2G8K A; 3LAN A; 3NVK A; 4KHW A; 3NBP A; 2YJF A; 3ZCM A; 4U7B A; 1N5Y A; 5F1X A; 3S9H A; 1QQN A; 4DFK A; 1HKC A; 4CFD A; 4B8C A; 3M3Z A; 4FWP A; 2E2P A; 3M8S A; 3EYZ A; 5JVH L; 3E9P A; 4BRI A; 1TAU A; 3KZB A; 5EOY A; 3PY8 A; 1DGK N; 4DSE A; 1YJ9 N; 1LW0 A; 4FLX A; 5M1P A; 2NRZ A; 4FVM A; 4KTZ A; 3QB0 A; 2KW4 A; 2YNH A; 3H3O B; 4H0V B; 3E1Y A; 3J7A P; 4FJN A; 1BHL A; 3TTC A; 2QM1 A; 4FLZ A; 4CZJ A; 3L3U A; 2QKB A; 1S72 N; 3PUF A; 3SMS A; 1TKD A; 3B8A X; 2A6A A; 4BDY A; 3EKS A; 3ZT2 A; 1J5O A; 1XC3 A; 1OVY A; 4OPK A; 1RDB A; 3CCU N; 3ISN C; 3WNG A; 4OJR A; 4KRF A; 4H0O A; 5AQS A; 2G8F A; 2GUP A; 1WAJ A; 1X9S A; 2A5X A; 1EP4 A; 1SKR A; 1TL1 A; 5C12 A; 3EO3 A; 4FVU A; 2FBY A; 1IG8 A; 1BG3 A; 4CZM A; 1NMN A; 3F73 A; 2WFB A; 4IFY A; 4DU1 A; 2P5G A; 4XH5 A; 5AQX A; 4KPY A; 2HVH A; 3KKS A; 3PIO L; 2Z1G A; 3IAY A; 4FL9 A; 3PSI A; 3C6U A; 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