2ZWHA

Model for the f-actin structure
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
374
Chain Sequence
DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title The nature of the globular- to fibrous-actin transition.
pubmed doi rcsb
total genus 114
structure length 374
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2zwhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zwhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zwhA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2zwhA04
4K43A 1HUXA 4LC9B 1DGKN 1X9JA 5AQFA 2DPNA 4CZFA 5KPRA 2ZF5O 5AQIA 1SZ2A 4FWMA 3D2FB 3JXUA 1J6ZA 3IMXA 4H5NA 3LDQA 1KAXA 1NGDA 1GLJO 3FZKA 1GLFO 3VF4A 4BG9A 2A41A 3W0LA 1ZC6A 3ZETA 4QS7A 2YJEA 4BREA 5AQKA 3QB0A 5AQTA 3HI0A 5AQRA 4H5TA 3R6MA 3I8BA 5JLHA 2FF3B 4JAXA 3IUCA 3WXLA 4EHTA 4IWVA 5LJVA 3GBTA 1TYQB 3CIPA 4Y0WA 3C7NA 4MO5A 5BRFA 2CH6A 3ENHA 3A5OC 1K8KB 1QQOA 2ZWHA 5EVZA 4AM6A 4A2AA 4PKIA 4CZHA 1R59O 1OKJA 1Z6RA 4BRAA 2QWMA 3HM8A 4CBWA 3U4LA 2EWSA 2Q0UA 1GLBG 1D4XA 1S22A 1QQMA 4AM7A 4FO0A 4BRMA 1SAZA 4B1XB 1BA1A 2QWRA 4O8KA 2HOEA 5AZJA 5LJWA 3VEXA 2P9PA 2CGLA 4H0OA 4BGBA 3R9PA 4H5RA 1YUWA 3MN9A 1NGBA 3VEYA 3W3DA 4CD1A 1SQKA 3DXMB 3CI5A 1U2VB 4I6MA 1LOTB 2NRHA 2FSJA 2QWQA 4FWPA 5AFUH 1HJOA 1ESVA 1X3NA 2YCHA 1GLEG 2GELA 2P9IB 4WQ4A 3KZBA 3LDPA 2NLXA 3H3OB 2Q1NA 4WYBA 3L6QA 1DKGD 2GEMA 2IVOA 1NGHA 2OANA 4H0PA 4H0YB 3C0BA 4CZEA 2V7YA 3A5LC 4FSVA 1WUAA 4CBUA 4XH5A 1ATRA 4B1UB 4MLEA 2J4RA 4ISEA 3UB5A 4BR0A 4FWSA 4BGAA 1MWKA 3FZHA 3HTVA 3O6WA 3GL1A 1RFQA 4EFHA 2A40A 4H5VA 4BROA 2HF4A 5KPZA 1NGEA 4FWLA 2E20A 2P9UA 4IZ9A 4YDUC 2V51B 4PL7A 3CJ1A 4BRQA 4FWKA 4B9QA 2VCPA 1GLAG 4BRLA 4DCHA 2YJFA 1NMDA 4IJAA 1WOQA 5FPDA 3L0QA 3LDNA 3LDOA 4QS9A 4B1WB 4CZKA 2W41A 4FPAA 1NGFA 1QHAA 2CGJA 3A8YA 5EXWA 5EOYA 1IG8A 5F0XA 3WT0A 3R8EA 2P9KB 1YXQA 3WXIA 3VEOA 2Q36A 4PKHA 2ASOA 4KBOA 4A62A 3WQUA 3DXKA 2IVPA 4CZIA 4DQ8A 1QQNA 4H0XB 5BREA 4H0TB 4BR2A 4BR5A 4CBXA 4CD3A 3AAQA 4E1JA 3VETA 3UKRA 1NGAA 5I9EB 3FZMA 2QXLA 3D2EB 3U9DA 3VEVA 2FLOA 2QM1A 2QWPA 3A5MC 1LCUA 3OHRA 5B8HA 2QW9A 2V52B 3O80A 4B1VA 2A5XA 3WEEB 3EL2A 4A61A 2FXUA 4L3QA 2KHOA 4WQ5C 2F9TA 1EQYA 3U8XA 1E4FT 4K41A 3CQYA 2PBDA 3QBXA 5E84A 3U9ZA 3B8AX 3CQXA 3QBWA 4XH4A 2GUPA 2P9LA 3FZFA 3VERA 5JICA 1XUPO 3ZEUA 1NGCA 3FLCO 2Q97A 3WXJA 1ATSA 2D0PA 2A42A 2A3ZA 3VF2A 2FF6A 5AQJA 3ZETB 3FZLA 4BVOA 2ZGYA 2E8AA 2QWNA 4JHDA 2ASMA 2Q0RA 1H1VA 4PL8A 2BUPA 3M6GA 4C23A 2P9NA 3TU5A 1HKGA 1RDWX 3LM9A 2ITMA 3D7EO 3FE1A 3M1FA 4J8FA 5BR9A 1V4TA 1E4GT 3ID8A 3DJCA 5AZIA 3GOIA 1BDGA 3CJ9A 3MCPA 3C7NB 4MO4A 4M7XA 5KQ8A 5AQVA 4ISGA 5EY4A 4A2BA 3RSEA 1G99A 5JMVA 2NZTA 1HKCA 1JCEA 5AQXA 4BRDA 1DEJA 5AQLA 2YHYA 5AQHA 2Q31A 1KAYA 1MA9B 2H3GX 2FSNA 3M3ZA 1BUPA 4BC5A 4IJNA 2GTDA 2UYTA 3FFKB 3WUHA 3SJHA 3VEZA 2P9SA 5FPEA 1BU6O 1NGGA 3UKUA 5BPNA 4CJ7A 3FR0A 4BRPA 4BR9A 2F9WA 3LL3A 4JD2A 4XH1A 1YVNA 4GNIA 5AZJB 2P9PB 3A5NC 1NGIA 1QZ5A 5AQSA 3H6EA 3ULEA 3SLCA 4H5WA 2IVNA 5FPMA 2D1KA 1BOTO 1C0GA 3CJAA 3ZX3A 1HX1A 3BUZB 3HZ6A 3WQTA 3D2FA 3A0IX 4FL9A 4FPBA 1V4SA 5TKYA 1HKBA 4K25A 3MN7A 5AQGA 4NB4A 3JS6A 3ZX0A 4BRIA 2CGKA 2AP1A 3TPQA 5KPTA 3MK6A 1JCGA 1NGJA 5AQMA 1GLDG 4BQZA 3EN9A 5KQDA 2E2PA 1YAGA 3ENOA 3GE1A 1TYQA 5AR0A 2CH5A 1QZ6A 4FWRA 5AQOA 5E26A 3IFRA 3VENA 1T6CA 3MN6A 3VPZA 4PKGA 1XQSC 4BRFA 5AQUA 1K8KA 2FSKA 2I7PA 3IDHA 3VGLA 1U6ZA 5BN8A 5BRDA 2ZGZA 4K42A 3ZX2A 3O4WA 3J8AA 2P9UB 1Z05A 4RCHA 2PAVA 1NLVA 4DHYA 1T44A 3DAWA 1Y64A 1KXPA 2BTFA 3VESA 1BG3A 5BPLA 3VGMA 2A6AA 5ADXA 4BRNA 4BC4A 2YHWA 4CI6A 4QS8A 2IIRA 3L4IA 2WUSA 4FWOA 4O5FA 1P8ZA 4FWQA 4M63C 2VWBA 4FOIA 4IXCA 5AQPA 1NBWA 3EKSA 1TUUA 3VEWA 3MMVA 3HSCA 3QDKA 4WQ5A 3S41A 3O08A 3O5BA 3H1VX 5AQQA 3DXMA 5JLFA 3DXKB 3HBTA 3VOVA 3MDQA 2GWJA 1U2VA 3EO3A 2E2QA 2E2OA 3AY9A 1X3MA 2QWOA 3GG4A 3H1QA 3LM2A 5EX5A 2E1YA 3UKRB 1Q18A 5ELZA 2P9IA 4MLHA 4FWNA 3F9MA 3GDQA 2YHXA 4BR7A 4CZGA 3P4IA 3VF6A 3H3NO 1NWKA 1ZBSA 4H03B 4BRCA 5BPMA 4IO8A 3EZWA 4B1YB 1BO5O 3CJCA 1MWMA 3AAPA 4M7YA 3O1WA 4RWTA 2D4WA 4H0VB 1RGIA 3BP8A 3ATUA 1KAZA 5BRHA 2GWKA 3EKUA 4JNEA 2P9LB 2AA4A 5AQYA 3ZEUB 1IJJA 4XEIA 1TUYA 4BQLA 3LDLA 2I7NA 4BR4A 1S3XA 3H45C 4B1ZA 2E1ZA 4WQ4C 3CJ7A 3I33A 3AARA 3FGUA 3QFPA 4EHUA 4JHDB 4BC3A 5CE3A 4JN4A 4RTFD 3QICA 4CZJA 2YI1A 2P9NB 4BRHA 3SMPA 1GLCG 2W40A 4ISFA 5BN9A 4FOEA 1XC3A 4CZMA 4EAHD 4BC2A 2HF3A 5AZIB 4Z94A 3KVGA 3QFUA 3O1BA 1BWFO 4NO7A 1CZAN 1HPMA 5AQZA 3H46O 2E2NA 4I6MB 1GLLO 2P9KA 3RSEB 4BG8A 1T6DA 3WXKA 4BVPA 5AQNA 4EIAA 3DWLA 2E88A 1C0FA 2VYPA 1MDUB 3O8MA 4YDUA 4GY2B 4F9OA 4CZLA 5ADXH 4BRGA 2D0OA 2HMPA 5AQWA 2ASPA 2QWLA 3SMSA 1JCFA 3QMLA 3G25A 2Q2RA 3VGKA 5LY3A 3CJBA 2P9SB 3CETA 3D2EA 4HWIA 3SK3A 3UKUB 5AFUA 4DB3A 1NM1A 3CHWA 4JD2B 5F2RA 3KHYA 5FPNA 1ATNA 3MN5A 3WEEA 3UE5A 5F1XA 3BEXA 3ATVA 3ULEB 3BF3A 1HLUA 2V7ZA 4BRKA 3CERA 4HTLA 1ZXOA 3BF1A 1BA0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JV5K 1HUXA 1T3VA 4FJJA 5AQFA 5KPRA 2ZF5O 1UWBA 1RILA 3SBGA 3JXUA 4H4OA 5J2QA 3NF9A 4B3MK 1U04A 1KQSM 3W0LA 2QEXN 3ZETA 1JLBA 4CJ3A 5AQKA 2OZSA 2W42A 4H5TA 1U49A 3HT3A 1ASWA 4IFVA 2WBNA 4KHYA 4N56A 3WXLA 2ATQA 1RT5A 4IWVA 1TYQB 1A5VA 4OGEA 3CIPA 3AVMA 4MO5A 4FJ9A 3ENHA 2HBMA 3A5OC 3G6EN 4R79A 4AM6A 2O8BA 4M3ZA 4Z4HA 3K0SA 1OKJA 3P38A 2QWMA 4M42A 3U4LA 2Q0UA 1IKWA 4RW7A 1RT3A 1EKEA 2ZJRL 1OVQA 1S22A 2HBJA 4CW7B 4E89A 1ZBUA 4BRMA 1O1WA 1SAZA 1TK8A 3F73A 1NK4A 1HNXK 3SQ2A 3PO4A 1WSEA 2HOEA 2KKZA 3KLIA 3O3FA 3EE9A 1M90O 1WSFA 4H8KA 5KRTA 4W5RA 4X64K 4KH6A 1RNHA 3MN9A 3VEYA 3NH2A 3W3DA 3G71N 3QEXA 5C2DA 4BE1A 4FJMA 3ZSYA 3IKMA 3KD1E 2NRHA 2FSJA 1ESVA 4C8NA 4I2PA 3AA3A 1YHQN 2Y1JA 2YKMA 2PY5A 1N34K 3KZBA 4L8RB 1NK6A 4X62K 2Q1NA 4DU3A 2HBKA 1TVRA 2WC9A 3KIOA 3ZSQA 4CZEA 4YFUA 4XH5A 4B1UB 4CGHA 1VRUA 2E6LA 1OH6A 2O8FB 2QA4N 4ZTFA 4FJNA 4KREA 3HYFA 3O6WA 2KLAA 1JLQA 4I2QA 4EFHA 4H5VA 3UIQA 1C0MA 5KPZA 5GAGP 4G9ZA 1FW6A 4M3RA 4CVNE 4IZ9A 2EHGA 4YDUC 5AJ3K 2V51B 4G1QA 4BRQA 4M3TA 1FXXA 3NHGA 5FPDA 1NJZA 3L0QA 1RTDA 4OKJA 5C42A 4CZKA 1BI4B 5EXWA 4JK7A 3C6UA 1NG9A 1IG8A 3V9XA 1YXQA 4NCBA 4KBOA 3DXKA 2IVPA 4KHWA 4A57A 4DQ8A 1VQLN 4X65K 4H0TB 4ILJA 4JI4K 2PFUA 5CHIA 4E1JA 3VETA 4C1NK 2NRZA 1NGAA 4JI6K 3D2EB 4JI7K 2R7YA 3OYMA 3ZSWA 1LCUA 3OHRA 2QW9A 2V52B 2OA8A 4B9LA 2A5XA 1S9EA 3WEEB 1TL1A 2DFFA 2HMIA 4WQ5C 2F9TA 1CLQA 2GUIA 3SUOA 2IC3A 1NNEA 1BQNA 3TAEA 1Z26A 5SZTA 3KKSA 2D0PA 3BGRA 3OS2A 2FF6A 5H1SQ 5AQJA 3T19A 3HVTA 4BVOA 2ZGYA 2P5OA 2ASMA 2Q0RA 3VMFB 3M6GA 1S1XA 4JKEA 4CHQA 3TU5A 1HKGA 1RDWX 2ITMA 3TTCA 2NRWA 5AZIA 1FKOA 4ID5A 3CJ9A 2XRIA 3V4IA 3C7NB 4B8AB 4M7XA 3CCRN 5AQVA 1VQPN 3KD5E 4DTUA 5D3GA 5AQXA 2E6MA 3MAQA 4BRDA 4GV9A 5AQLA 3KWIA 1KAYA 2H3GX 2EX3A 1NOYA 4BDYA 3M3ZA 3NGZA 2YHAA 2E4LA 1KD1O 1HNZK 3WUHA 4I7FA 4W5TA 3SJHA 1BU6O 3FR0A 1YIJN 4HUFA 3PX6A 4LF6K 3DLEA 4B3TK 3CD6N 2WTUA 4DUYK 4JD2A 1C1BA 1YVNA 4XH1A 1IBLK 3A5NC 2IS3A 3H6EA 3ULEA 3O9TA 2ZJPL 2KZZA 1S6QA 3TANA 1GOBA 4OGCA 4NXMK 2D1KA 3LANA 2OPQA 1BOTO 3ZX3A 3TWHA 3TSUA 1NKBA 4C8KA 1TV6A 3HZ6A 3D2FA 4BWMA 3A0IX 5TKYA 1WAFA 3T69A 4CE9A 3L2WA 2HHSA 3PSIA 3TSPA 5AQGA 4NB4A 3T3FA 2PYJA 3RTVA 5LL6Z 1J5EK 2X74A 3ZT4A 4DR5K 3LZJA 1GLDG 3DLHA 4CHNA 4BE7B 1NU0A 5HRPA 5AR0A 4FWRA 5JENA 3C6HA 5E26A 4R5PA 3VENA 4DQIA 5FRMA 4PKGA 1XQSC 1B92A 2FSKA 2I7PA 4E7LA 3P5JA 1EWRA 2ZGZA 4K8ZA 3NVKA 3O4WA 5C24A 3RMDA 4FJ5A 3NF8A 4CEEA 1TL3A 4CEQA 3NAEA 3AVGA 5M1KA 4FLXA 1BG3A 3TARA 2A6AA 3B6OA 5ADXA 4BRNA 4PA1A 2YHWA 4DFKA 4QS8A 2WUSA 1IKVA 4O5FA 1P8ZA 2WONA 4DS4A 1HR0K 3ZSRA 1ZBFA 1SL1A 1Y97A 2DTUA 2NRVA 1KLNA 3MMVA 3HSCA 1I94K 4CERA 3O08A 3O5BA 2A1RA 3JAMO 2G8IA 4GMJB 1KVBA 3PX0A 2E2QA 1DLOA 1X3MA 1KVAA 4OPKA 3S5TA 3GG4A 4UQGA 4FK0A 3LM2A 3LP0A 3D0PA 3SUQA 5KI6A 4ICLA 5DK5A 3E01A 3HRGA 3I56N 2YHXA 1R0AA 4BR7A 3H3NO 5BPMA 1RBUA 3J7YP 3OBYA 3SV4A 3EZWA 3NGYA 4B9TA 3PLAA 4B1YB 2Z1JA 1M1KO 3SQ1A 1TKZA 1RCHA 4ILGB 4HHTA 4AH9A 3C6TA 3CFOA 3CC7N 4DSJA 1KAZA 2GWKA 4JNEA 1SV5A 1D9DA 3OTOK 3QIPA 4IOAL 1KLMA 1J5OA 3CMEN 1IJJA 1TUYA 4BQLA 4HCCA 4IKFA 4FJXA 3AARA 3FGUA 4EHUA 5CE3A 2C1GA 3F5TA 3QICA 2YI1A 3RR8A 5C12A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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