2ZWHA

Model for the f-actin structure
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
374
Chain Sequence
b'DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title The nature of the globular- to fibrous-actin transition.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
total genus 114
structure length 374
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2zwhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zwhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zwhA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2zwhA04
4JD2A 2FLOA 1G99A 4A2AA 4BR9A 1XC3A 2ASOA 4BVPA 1K8KB 1ATNA 5AQJA 2FF3B 1E4GT 4BRGA 4BVOA 3QBXA 5KQ8A 3VEZA 4H5VA 2A41A 1YVNA 2HMPA 2ZGYA 4KBOA 4RWTA 1IG8A 2P9SB 1ZXOA 1X3NA 3GG4A 4E1JA 3L6QA 3A8YA 2H3GX 5AQSA 4BRIA 2QWLA 3CHWA 1X9JA 3A5MC 4Y0WA 3M3ZA 4CZGA 4BC2A 2V7YA 2V51B 3JS6A 5KPTA 4H0XB 3W0LA 1IJJA 2P9LB 1QQNA 2YHXA 2EWSA 4JHDB 1JCGA 3VEVA 3WEEA 3ENOA 5EXWA 1OKJA 1XUPO 3CJBA 4BROA 1BG3A 2NLXA 1RGIA 4H0TB 1BO5O 2FXUA 4MLEA 2VWBA 3RSEB 1U2VB 2IIRA 3A5NC 3UKRB 1YUWA 1SZ2A 2ASMA 4BC4A 4FWNA 2ZWHA 2YJFA 3VESA 1EQYA 1BA0A 3BF3A 1XQSC 4DB3A 5BRDA 3ZEUB 2HOEA 1HKBA 1H1VA 2VCPA 2CH5A 4CD3A 2J4RA 3SMPA 3VEOA 3CETA 2GTDA 1BUPA 3FZLA 5AZIB 3KZBA 3EO3A 4PKIA 2E2PA 2GWJA 4PKGA 2UYTA 4BQZA 3O1BA 2CGLA 5BPNA 4C23A 2Q1NA 1QZ5A 4BGBA 3ENHA 3FGUA 5FPEA 1T6DA 2P9SA 4WQ4C 5E84A 1HUXA 4FWPA 3U9DA 4AM6A 4M7YA 3TPQA 2V7ZA 1TYQB 3WXKA 1BU6O 1YXQA 1C0FA 3GDQA 2QWMA 3O4WA 3H3OB 3LDQA 3EKUA 3EN9A 3FZKA 1NGJA 3U4LA 3DJCA 2E88A 2P9LA 4JHDA 3JXUA 4H0OA 5JMVA 3SMSA 2FSNA 5AQPA 5TKYA 4H03B 5AZJB 2I7NA 3R6MA 3QB0A 2YJEA 5AQKA 4FWLA 4A62A 1ZBSA 3HM8A 3G25A 4FPBA 4K42A 1NMDA 2ZF5O 4B1XB 3HI0A 1NGAA 3UKRA 5CE3A 4ISEA 4PKHA 3UB5A 4BRPA 2ZGZA 4MO4A 2WUSA 1R59O 4DHYA 4PL8A 4XH5A 4K43A 3L0QA 3ZEUA 3GE1A 3LDLA 4ISGA 3WXJA 1GLAG 3MDQA 2GWKA 4CZIA 3VPZA 1NGEA 4AM7A 4H0VB 1NGFA 3DXKB 4XH1A 1P8ZA 3SK3A 4IWVA 1LOTB 2BTFA 3LDOA 3A0IX 3IUCA 2YI1A 4FWMA 3ATVA 3WXIA 5F2RA 5AQMA 4BC5A 3CJ1A 4CZKA 3ZX2A 5AQUA 4XEIA 1JCFA 3HBTA 3IFRA 2D1KA 5AQLA 1TYQA 4GY2B 4J8FA 1NM1A 4BRLA 4FL9A 2Q2RA 3O1WA 3LM9A 5F1XA 3QBWA 4BC3A 2P9KB 5AQVA 3MMVA 4B1YB 1JCEA 1QQOA 1RFQA 5KPRA 3CERA 3FLCO 2QW9A 3QFPA 2Q0RA 2D0PA 3AAQA 3H46O 5I9EB 5AZJA 4CZJA 1CZAN 1KAXA 1ESVA 3H6EA 4FPAA 4CZLA 3ZX0A 3EL2A 4FWQA 5ADXA 2YHYA 4CD1A 4CZHA 3WT0A 3KVGA 3VEWA 4HWIA 4IO8A 2E2OA 2QWNA 1YAGA 3FE1A 4EHTA 3VOVA 2GEMA 1TUUA 4NO7A 1LCUA 2QWPA 3ZETB 5AFUH 3LL3A 4BREA 5BREA 1WOQA 5BPLA 4A61A 3L4IA 2NRHA 1BA1A 4BR7A 1NGCA 1WUAA 3AARA 3MN7A 2FF6A 4NB4A 2QWRA 3EZWA 4BRAA 3DAWA 2OANA 3LDNA 2E8AA 3UE5A 5AQWA 3A5OC 5F0XA 1MWMA 3DXKA 5JLHA 1HKGA 4BR5A 4BRFA 1NGHA 4CBWA 3DXMA 3FFKB 1Q18A 1V4TA 2D0OA 1T6CA 4JNEA 1NGIA 3CQYA 3M1FA 3O08A 3FZHA 3VEYA 1HPMA 3WXLA 1KAZA 3VGMA 4MLHA 2P9KA 4EAHD 2P9NB 4RCHA 4IZ9A 5BRFA 5AQGA 3F9MA 4BRMA 4WQ4A 1E4FT 4GNIA 1DEJA 2P9IA 3D2EB 3MK6A 4Z94A 2YCHA 3U9ZA 1NGBA 1HLUA 1GLCG 3BF1A 3CJ9A 3KHYA 4L3QA 4BQLA 4BRCA 3AY9A 3VETA 4YDUC 4FOEA 2E1YA 5KQDA 5BR9A 5AQHA 4QS7A 5FPNA 3GL1A 1X3MA 4IJNA 1KXPA 2ITMA 3MN5A 1BDGA 2E1ZA 2CH6A 3O8MA 4FWOA 5FPMA 3ULEB 3ZETA 1NGGA 3SLCA 1TUYA 5AQZA 4WQ5C 4FOIA 2BUPA 2QM1A 5JLFA 4K25A 3H1QA 4JAXA 2A42A 3BEXA 4QS9A 3I8BA 1GLEG 4RTFD 1QQMA 1HJOA 4H5NA 3M6GA 5AQXA 4A2BA 1BWFO 1HKCA 4EIAA 4WQ5A 1QZ6A 3SJHA 5KPZA 4CZEA 3BUZB 3WUHA 5EX5A 4B1WB 4BRQA 2E2NA 3I33A 2PAVA 2FSJA 4BR2A 4BR4A 2CGKA 3DXMB 2KHOA 3S41A 1HX1A 1SAZA 3P4IA 1S3XA 5AQQA 2ASPA 3VERA 3CI5A 3EKSA 1S22A 2P9UB 3QICA 4B1ZA 4B1UB 4BRKA 3LM2A 4WYBA 2P9NA 3W3DA 4H5TA 3O5BA 2PBDA 4IJAA 4O5FA 3UKUB 1GLJO 2GUPA 3GBTA 3D2EA 1ATSA 2A5XA 5LJWA 2P9IB 5AQOA 2NZTA 3AAPA 3MN9A 4DCHA 1KAYA 2HF4A 2Q36A 2QXLA 3LDPA 1NGDA 4IXCA 4PL7A 5JICA 5BPMA 2HF3A 4BRHA 5AQYA 4O8KA 3H1VX 5AQFA 3ULEA 4CBUA 2V52B 3OHRA 4BGAA 2W41A 3C7NB 2P9PA 3A5LC 3D7EO 3CQXA 3O6WA 2IVNA 2Q97A 2D4WA 4QS8A 4EHUA 4FSVA 3WQUA 3DWLA 2AP1A 1Y64A 2IVPA 2E2QA 1BOTO 1U6ZA 3C0BA 1SQKA 2VYPA 3TU5A 3FR0A 5AR0A 1MDUB 2W40A 2YHWA 5BRHA 5FPDA 5LJVA 3QFUA 2A40A 5BN9A 5LY3A 4CI6A 1GLBG 4LC9B 4B1VA 4BRNA 2I7PA 2QWOA 5AQIA 5AQTA 4M7XA 4I6MB 2DPNA 1NBWA 4DQ8A 2P9UA 2CGJA 3MN6A 3D2FB 4CZFA 1T44A 1GLDG 3HTVA 2FSKA 3VGKA 4CBXA 1DGKN 3B8AX 3VEXA 5ELZA 3UKUA 1GLFO 5EOYA 3MCPA 1MA9B 2Q31A 3FZMA 1NWKA 2AA4A 3VF6A 3VF2A 3CIPA 5B8HA 4JD2B 1K8KA 3ATUA 1NLVA 1GLLO 3QDKA 4CZMA 5E26A 3H45C 4XH4A 1RDWX 3R8EA 2GELA 4FO0A 4FWSA 3U8XA 4CJ7A 5BN8A 5EVZA 3CJ7A 1Z6RA 3C7NA 4BRDA 4BG8A 3CJCA 3FZFA 4EFHA 1V4SA 3VF4A 4F9OA 5AQNA 4YDUA 4H5WA 5AFUA 2P9PB 2Q0UA 2E20A 4JN4A 3J8AA 4HTLA 1DKGD 3HZ6A 3ZX3A 3H3NO 2A6AA 1ZC6A 4M63C 4FWKA 1D4XA 3WEEB 3IMXA 5ADXH 3HSCA 3VGLA 2F9TA 3CJAA 3VENA 1Z05A 3GOIA 2F9WA 3R9PA 5EY4A 1J6ZA 1U2VA 4FWRA 3RSEA 3QMLA 4B9QA 4I6MA 5AQRA 3O80A 4H0PA 4H5RA 3D2FA 3ID8A 3IDHA 3BP8A 2QWQA 2A3ZA 1MWKA 1ATRA 4BR0A 1QHAA 4H0YB 4ISFA 4MO5A 2IVOA 1C0GA 3WQTA 4BG9A 5AZIA 4K41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JD2A 1NOYA 1G99A 4KHPK 1FK9A 4W5NA 1RTJA 4LFCK 4DF8A 1W7AA 2FF3B 2YNFA 2QA4N 1YVNA 5M1KA 2HMPA 1D9DA 4GKJK 4DSJA 1IG8A 4BE1A 3GG4A 4FJXA 5JVHL 4I2QA 3HP6A 2BDPA 3A5MC 3E9OA 3NGIA 3LP3A 1XWLA 2IAJA 2EWSA 4KPYA 1JCGA 3VEVA 3PX0A 3V81A 2EX3A 4KH4A 5D3GA 4OPAA 1X9MA 1LWFA 1HNIA 3LDSA 1YT3A 5IWAK 3SQ2A 1U45A 1BG3A 2C1IA 3NGZA 3FFIA 1SUQA 3DMJA 3A5NC 3SPYA 1SZ2A 5H1SQ 5KRTA 2ZWHA 1WBBA 3O3GA 4CFDA 1EQYA 2P5GA 3BF3A 2KFZA 3ZEUB 2HOEA 4B8AB 4DFJA 4HUEA 1HKBA 2VCPA 4CJPA 4DR3K 3AO3A 4JLHA 3VQBA 3VEOA 3L2RA 4F3OA 1BUPA 3FZLA 4FJ5A 3MXJA 3J7YP 4DV3K 4J2AA 2WTUA 3PIOL 4LF8K 1QZ5A 1HMVA 3H08A 1J54A 3OYAA 4B3MK 3KKRA 3EY1A 4FJMA 4IDHA 4AM6A 2O8BB 4M7YA 3TPQA 3WXKA 3OYEA 3A2FA 1C1CA 2FBYA 4FYDA 3NH0A 4DV1K 2UXDK 3H3OB 3FZKA 3QEIA 2WFBA 1NGJA 3OJSA 3DJCA 4YOUA 1S6QA 3RWUA 3DOLA 3U3GA 3SMSA 3ZSZA 3V4IA 3O4QA 2I7NA 3L3UA 2YJEA 1ZBSA 4Z4CA 3LPUA 1F21A 2ZF5O 1W97L 1Y97A 3AVFA 3HI0A 1D8YA 1NJYA 4J2DA 4UQGA 1N8RO 4PKHA 3THVA 4J2EA 4MO4A 4CF1A 4E89A 3DRPA 4DHYA 2QTDA 4PL8A 3ZEUA 3GE1A 3HVRA 4KTWA 3LWLA 3TARA 3O9TA 1GLAG 2YKNA 5DM7L 1NJWA 1VQMN 3LPTA 4LF7K 1NGEA 1RDUA 4AM7A 4LY7A 1NGFA 3SK3A 4IWVA 1VHXA 2BTFA 1I3AA 5F2RA 3AVHA 5AQMA 4CZKA 3RRGA 3AVJA 1ZYQA 4XEIA 3IFRA 3KD5E 2O8BA 2D1KA 5HBMA 4J8FA 3O1WA 1G15A 1QSYA 4CJSA 4BC3A 5JS1A 3MMVA 4CJKA 1RFQA 2XRIA 3TAGA 3PX6A 1U04A 4IFEA 4B9UA 2JGUA 4DV2K 1TV6A 1K6YA 2QW9A 3QFPA 1Q86O 2UXBK 3AAQA 2VGNA 4DTPA 3C95A 4CZJA 1KAXA 4CJ3A 3ZX0A 1X1PA 4OX9K 1BISA 4CGHA 3OA9A 4C1NI 3O9UA 1VQNN 4ID5A 5TKWA 4KRFA 1UAXA 3QNNA 1NK5A 4B9SA 3PO4A 1KTQA 3AA3A 3CCSN 4H4MA 3ZETB 3NVKA 5AFUH 3LL3A 1VQ8N 5BREA 2VG7A 4A61A 1YVUA 3L4IA 3TSQA 1RDBA 4BR7A 1NGCA 3U3YA 1U4BA 4E0DA 4XIUA 4KHNA 1N34K 2OANA 5K14A 3RMBA 3QO9A 4YORA 1TAQA 5F0XA 1MWMA 1W2BM 2YNIA 1HKGA 4IO9L 4BRFA 4FK4A 3V9XA 3J7ZO 4IFYA 3TAMA 4JNEA 4KKOA 3JSMA 4FZZA 1VRTA 1RDAA 2RHKA 4X65K 5CHIA 4BRMA 3I0SA 4CK2A 1DEJA 1A5XA 2DY4A 3D6RA 4DSEA 1GLCG 4L3QA 4CE9A 1LAVA 3AY9A 4M3XA 3IS9A 3C6AA 4FOEA 3OTOK 3DRRA 5AQHA 4QS7A 1YI2N 3GL1A 2YNHA 4IJNA 1RBSA 1QE1A 1S72N 5IT9O 5FPMA 3ZETA 3HM9A 4PQUA 2KQ2A 4KHQA 1C0TA 1ZBHA 2BUPA 4K25A 4KHUA 4B08A 1IKXA 4JK8A 4QS9A 1QQMA 1HJOA 4H5NA 3SUPA 3M6GA 5AQXA 3OBWA 1HKCA 4EIAA 1QZ6A 4AHSA 1KVCA 3WUHA 4BRQA 3K58A 2E2NA 2PAVA 4DG1A 3OYIA 4DQQA 3ENBA 4BR4A 3S41A 5HL7L 1S3XA 2B4JA 3LAKA 4CHOA 3BGRA 1S22A 2G8HA 1VQ4N 4WYBA 2W42A 3K5LA 4C8MA 3LWMA 3W3DA 3VQAA 3O5BA 3UKUB 1GLJO 2KTQA 4FLTA 3QIPA 2GUPA 3TSUA 3MAQA 4FK0A 4R79A 5HOOA 4Z0UA 4DCHA 2DFFA 2QXLA 3CMEN 4K0KK 4CIFA 1YJWN 1VQON 2YHBA 2BANA 3ALYA 4PL7A 3VA0A 2O8CB 2O8DB 4OGCA 3RMAA 5BPMA 4BRHA 3KD1E 3TTCA 4O8KA 4KH6A 3JYTA 2E6LA 3SBGA 3T7ZA 4C8KA 4W5TA 3CQXA 3P5JA 4DR1K 4DTMA 1U48A 3HOSA 4Y1CA 4CJLA 3QESA 4DV6K 2D4WA 4LSNA 4EZ9A 2BH1A 4CF9A 2QKBA 1BGXT 4DQSA 2F7TA 1RBVA 5I3UA 3CFPA 3T1AA 3E9PA 1IKWA 5AR0A 1MDUB 4KHYA 4HTUA 5CY4A 5M1OA 4B1VA 4OPKA 4M7XA 2NRWA 5CYMA 3CYMA 4FVUA 3MN6A 1GOBA 3D2FB 4U67L 1DGKN 3B8AX 5SZTA 3UKUA 1BL3A 1EWRA 4AHCA 1NK7A 3K9JA 4CGGA 3NHGA 3S9HA 3HXMA 1L5UA 5B8HA 2QEXN 3HT3A 2HBJA 1LW0A 2R7YA 2O8DA 1EXQA 2O8CA 4WF9L 4CHNA 4O0IA 1RDWX 3R8EA 4WCEL 2PZSA 4CJ7A 1U49A 4FK2A 3R3LA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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