2ZWHA

Model for the f-actin structure
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
374
Chain Sequence
DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The nature of the globular- to fibrous-actin transition.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 114
structure length 374
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2zwhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zwhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zwhA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2zwhA04
3LL3A 1ZC6A 1TUUA 4QS7A 4IO8A 3WQTA 3VOVA 5EX5A 3ID8A 3GBTA 4MLHA 3LDPA 1QQMA 3A5LC 3U9DA 4FL9A 4IZ9A 4JN4A 4O5FA 3S41A 3LM9A 2CGLA 3ZETA 5BPNA 4BVOA 1YXQA 3WXKA 1JCGA 3BF1A 5F0XA 2P9PA 1TYQA 4H0TB 1C0FA 3MMVA 3VESA 4DB3A 3DWLA 3MK6A 3LDOA 2P9LB 3SLCA 5BRHA 3VGMA 1NWKA 2Q31A 4FWKA 4BRKA 3AAPA 3JS6A 4XH5A 2FLOA 3WEEA 3D2FB 3M3ZA 3WXJA 4B1VA 4MO5A 2IVNA 1T6DA 3IDHA 1S3XA 2QWMA 3QMLA 4H5VA 5AQPA 2V52B 5EXWA 4DQ8A 3ZX2A 1SAZA 3UKRB 2YHYA 1ATSA 3O80A 3M6GA 5E26A 4H0VB 4CD1A 4PKGA 5AQKA 3VF2A 4CZKA 4FOEA 1RDWX 1QQNA 3VPZA 1GLDG 2ASMA 4B9QA 2PBDA 3ULEA 3D2EB 1R59O 5AQLA 3CJ9A 5BREA 4H5RA 1U2VB 2YJFA 1Z6RA 3D2FA 2E20A 2HMPA 3EKSA 4FWQA 3SJHA 1WUAA 3R8EA 1HJOA 3CQXA 5JLFA 5AQQA 4H03B 2P9LA 4WYBA 1V4TA 1KAZA 1K8KA 3AAQA 3P4IA 2YI1A 4FPAA 3FLCO 5JMVA 5AQMA 1KAXA 4BRLA 5BN8A 1JCEA 2AP1A 1XUPO 4IJNA 2HF3A 4YDUA 2D4WA 1BDGA 3EKUA 4H0XB 4BC5A 1SZ2A 1QZ5A 1CZAN 4BRGA 3BP8A 5KPTA 3VEYA 5EVZA 3CJ7A 5F2RA 3W3DA 4WQ5A 4PL7A 2QWPA 3QBXA 4Z94A 1HLUA 4FWSA 2FSKA 1QQOA 2GELA 2Q97A 5AZIA 4H5TA 3VEXA 3AY9A 5FPMA 5AQIA 1T6CA 3QDKA 4EHTA 2FF6A 4FWLA 2E2PA 4KBOA 2Q2RA 3FFKB 3AARA 3FZKA 3D2EA 3ULEB 4CBUA 5KQ8A 2IVPA 5AFUA 1YAGA 4ISFA 4BRQA 2CH5A 4IXCA 3ENHA 3VF6A 5AQGA 4BQLA 2Q0RA 2FXUA 3TU5A 4FPBA 3CI5A 3FGUA 4BRIA 3H1QA 3J8AA 4BR0A 4A2AA 5LJWA 1KXPA 4LC9B 1BWFO 2P9NB 3GE1A 1NM1A 3QFUA 2Q1NA 1DGKN 1QZ6A 3O4WA 4BC4A 3BEXA 3SMPA 5BRDA 2E1ZA 2PAVA 5AQTA 4BRAA 1GLAG 1D4XA 3SK3A 4NO7A 1MA9B 4JD2B 3VERA 4FWMA 1Y64A 2OANA 3ZX3A 4EFHA 2NRHA 4MLEA 5AFUH 5JLHA 1J6ZA 4PL8A 3UKUB 4BR2A 1H1VA 4BR5A 4JHDB 2QWRA 1RFQA 4K25A 1WOQA 2V7YA 2P9SA 5KPRA 4M7YA 4BROA 1LOTB 4ISEA 4H0OA 4WQ5C 4XEIA 5FPNA 4JD2A 4RWTA 4BRCA 2E2NA 2A41A 1G99A 3QICA 1MDUB 3ATVA 4JAXA 4A2BA 4JNEA 3CERA 1NGJA 4H0YB 2A6AA 5AQFA 5AQRA 3B8AX 3L4IA 4H5WA 1GLFO 3O1WA 3M1FA 4WQ4C 1GLLO 2BUPA 2A5XA 1HPMA 4BR9A 5BPLA 1E4GT 1XC3A 2KHOA 4BRMA 2YCHA 3C7NB 3CJCA 2F9TA 3HZ6A 2IVOA 2YHXA 4C23A 5CE3A 3CETA 4FSVA 3W0LA 5BPMA 1YVNA 4EHUA 2FSNA 1ESVA 1Q18A 2ZGYA 3RSEB 5F1XA 2P9SB 5FPDA 2FSJA 2UYTA 3O5BA 4M63C 3ZX0A 2HOEA 3L6QA 4PKIA 3TPQA 4BGAA 4BREA 1EQYA 2GTDA 3DXKB 5I9EB 2IIRA 1C0GA 3UKUA 4H5NA 3JXUA 3UB5A 3QFPA 1DKGD 3ZETB 2P9NA 4BRDA 1U6ZA 5B8HA 3CHWA 1JCFA 4RCHA 4B1WB 4BRNA 3UE5A 4H0PA 2P9KA 2VCPA 1GLEG 1Z05A 1S22A 2CGKA 2D1KA 3GG4A 4IJAA 4AM6A 4CZIA 1GLCG 3CQYA 2P9IA 1TUYA 5BN9A 1BUPA 4L3QA 1P8ZA 4FWNA 4BGBA 2DPNA 2E8AA 3QBWA 4BQZA 4DCHA 4Y0WA 1KAYA 3VEWA 2FF3B 5EY4A 1GLJO 5KQDA 4B1XB 2P9KB 1NGAA 2J4RA 4A62A 2ASOA 3O8MA 3CJ1A 4CZJA 2YHWA 3MCPA 3VGKA 2F9WA 4GNIA 2GUPA 3VGLA 4A61A 3H45C 5AQWA 5AZJB 4BRHA 2P9UA 3A8YA 5AQVA 5TKYA 4BG9A 5FPEA 2QWNA 2GEMA 1K8KB 2BTFA 1V4SA 3L0QA 3IMXA 2D0PA 4I6MA 1HX1A 2W41A 2W40A 4QS9A 3WUHA 4CD3A 3DXMA 2V51B 1NGBA 1NGHA 4CZFA 4MO4A 4BC3A 1U2VA 5AZJA 3O1BA 1NBWA 5AZIB 3IUCA 4IWVA 4WQ4A 1E4FT 3QB0A 3U9ZA 2ITMA 5AQUA 1X3MA 2QXLA 4FOIA 3MN9A 4YDUC 4BRFA 2HF4A 1NGDA 4XH1A 5AQJA 3EN9A 4RTFD 3G25A 2I7PA 4NB4A 5AQXA 2NLXA 3VENA 2P9IB 1NGCA 3GDQA 5LY3A 3GL1A 3I33A 4B1UB 3CIPA 2E2QA 3C7NA 2V7ZA 1HKCA 2VYPA 5EOYA 3MN5A 3H3NO 4QS8A 4HWIA 5AQHA 1BU6O 2QWLA 1RGIA 3A5NC 3MN6A 3ZEUB 5ADXA 5BRFA 5AQOA 1XQSC 3HTVA 1QHAA 2P9PB 3F9MA 3FZHA 4CZHA 3MDQA 2Q36A 1MWKA 1HKGA 2GWKA 4FO0A 3VETA 3O6WA 3LM2A 1BG3A 3FR0A 3ZEUA 4BVPA 3BUZB 4CBXA 3FZFA 3SMSA 1IJJA 3A5OC 3U4LA 3A0IX 1BOTO 2QW9A 3A5MC 3KVGA 1IG8A 2E1YA 5AQYA 5LJVA 4B1ZA 1SQKA 2ZWHA 1MWMA 5KPZA 4JHDA 4EAHD 1LCUA 1BO5O 4K42A 1NGFA 3KHYA 3LDQA 3VEZA 3H1VX 3R6MA 1YUWA 4K41A 1NGIA 3BF3A 2A40A 2VWBA 4EIAA 3HSCA 3DXMB 2CH6A 3H46O 3CJBA 3ATUA 3D7EO 3WQUA 4FWOA 2A42A 4J8FA 3VF4A 2YJEA 2QWQA 3H3OB 3U8XA 4FWPA 5AR0A 4DHYA 3R9PA 5ADXH 4CZMA 5JICA 3WEEB 3EZWA 4CBWA 2I7NA 2P9UB 2ZF5O 3GOIA 5ELZA 5AQSA 2WUSA 4CZLA 4GY2B 4BG8A 1NLVA 3C0BA 3I8BA 4PKHA 4O8KA 3VEOA 4I6MB 2QWOA 2D0OA 4XH4A 1ATRA 3EO3A 1TYQB 3LDLA 2NZTA 4CZGA 1NGGA 3FZLA 4K43A 4BC2A 3WXIA 3WT0A 5AQNA 3WXLA 1NMDA 3H6EA 3O08A 4CI6A 4B1YB 3FE1A 3OHRA 2CGJA 2ZGZA 2H3GX 4CJ7A 4AM7A 3MN7A 1ATNA 3EL2A 4BR7A 5BR9A 2E2OA 3CJAA 2E88A 3ENOA 4M7XA 1OKJA 3RSEA 4CZEA 1BA1A 1BA0A 4HTLA 2ASPA 2EWSA 5AQZA 4E1JA 4ISGA 1DEJA 3HI0A 1X3NA 3FZMA 2GWJA 1ZBSA 1HKBA 1T44A 4F9OA 4BRPA 4BR4A 1HUXA 3DXKA 3LDNA 3DAWA 1GLBG 3UKRA 2QM1A 2Q0UA 2A3ZA 3VEVA 3HBTA 4FWRA 1NGEA 3IFRA 3KZBA 5E84A 2AA4A 1X9JA 3DJCA 1ZXOA 3HM8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RBUA 3CC4N 3OYCA 3AO1A 4IO8A 4QAGA 2KTQA 2E4LA 3L8BA 5J2NA 3O9TA 3OYHA 2UXBK 1DT9A 3RTVA 3M8QA 4O5FA 1WBDA 3LM9A 2CGLA 1YITN 4E19A 3O3HA 3KLIA 3EYZA 4H0TB 3SQ1A 3VESA 4DB3A 4JRQA 3ZSYA 4GMJB 2XY6A 3F9KA 3VGMA 1NWKA 4FZXC 4K8XA 2Z1GA 1C0MA 3ASMA 3NAEA 3V4IA 4BRKA 3JS6A 4N76A 4XH5A 2D0AA 2GX9A 4A5BA 3NMUA 3M3ZA 3WXJA 4B1VA 2IVNA 4IBNA 4EP4A 4HCBA 4JKEA 1VQ8N 3IDHA 1A5VA 3P83D 1D9DA 4JS5A 3ENBA 2UUAK 2HHVA 1ATSA 3NBPA 3M6GA 3P38A 2DTUA 1YTAA 1VQPN 3VA3A 1RDWX 2X74A 3HOTA 1GLDG 1NOYA 2Z1IA 5AQLA 4CJSA 3QO9A 1U2VB 3N4PA 3OYJA 3D2FA 2HMPA 3EKSA 3ZLJA 4DMNA 3SUOA 4F2RA 2LSNA 5AQQA 2HBKA 4CE9A 1TKXA 2WTUA 4CJLA 3P31A 3PX4A 3L2UA 4O5BA 4F2SA 3P4IA 2YI1A 4CHOA 3NGYA 2AP1A 3AVHA 4H0XB 3LP2A 1SZ2A 1VSKA 5KPTA 2G8WA 3VEYA 1C0TA 5F2RA 4WQ5A 2WC9A 3KJVA 4R5PA 4M41A 3MXJA 4JI5K 5AQIA 4MDAA 4CJPA 3QDKA 3MECA 5CYMA 1XHZA 3AA2A 2ZE2A 1HYVA 1L3SA 4LD0A 2KFZA 3D2EA 4CBUA 1RCHA 4JK8A 3SCXA 4F4KA 3TAFA 2I5JA 3ENHA 3PO4A 1CXUA 1O1WA 4BQLA 1BIZA 3CC7N 4B9NA 1ILYA 4CF9A 1VSJA 3PIPL 3H1QA 4IOCL 2KFNA 4OKEA 1KXPA 1BWFO 3QFUA 1NM1A 1VSLA 2Q1NA 4CEAA 4JRPA 3SMPA 2PAVA 5AQTA 1IBMK 4BRAA 3SK3A 1CZ9A 1S1XA 4EFHA 2NRHA 3RRGA 5M1FA 4BR5A 2QA4N 3HRGA 1WSEA 2F8TA 3M5RA 1UA0A 2QWRA 4BY9C 4K25A 2P9SA 4BROA 1LOTB 4NYNA 4H0OA 4WQ5C 3T19A 3CFPA 3D6RA 1OH8A 3ZSZA 5KRSA 4JAXA 4JNEA 4DTNA 2HNZA 4JK9A 4CEOA 4WFAL 3SUNA 5AQRA 1NU0A 5E41A 2A1RA 3THXA 4N5SA 3MX5A 4WF9L 1NK7A 2O8EA 4CJVA 4IO9L 3TAPA 4HUGA 4WQ4C 1VQLN 4E1NA 2BUPA 1K6YA 3OYFA 1HPMA 1RT5A 5BPLA 4ELVA 1HNVA 3THVA 1SL2A 4G9ZA 3NGZA 1BL3A 4A5AA 4C23A 5BPMA 3DRPA 1XMQK 1VSEA 2FSNA 3DLEA 3J7AP 3KLFA 1Q18A 1W97L 4CJTA 3ZSWA 4IKFA 1VK0A 4DU1A 4FVUA 2UYTA 4ILJA 3ZX0A 1K9MO 3O4NA 3MCAB 5D3GA 3MXMA 3O9QA 1C0GA 3JXUA 2E5LK 3QFPA 4BRDA 1U6ZA 3PV8A 1JCFA 1VQ6N 4O8UA 4H0PA 4RW4A 2VCPA 2NRXA 2A1SA 4OPAA 2CGKA 3GG4A 5KI6A 3SNNA 4ID1A 3U3GA 4FJLA 1IO2A 1RT3A 1VSDA 5C24A 1W0HA 5BN9A 4BGBA 3C95A 2UXDK 4Z4HA 3SQ2A 3VEWA 1NK8A 2X6NA 1NGAA 3AVLA 3I56N 4A62A 1S1TA 5HRRA 3OYGA 4CZJA 5J2MA 4FJIA 1S1VA 3HJFA 2KZMA 4BE7B 1RT2A 3FFIA 1IKYA 1I3AA 2GUPA 5AQWA 1EKEA 3CCMN 1C1AA 3OYAA 3EEQA 4BG9A 1V4SA 3QLHA 4Y1DA 3V9XA 4LF9K 1QE1A 1NMNA 3NE6A 1HX1A 4YOWA 4DUYK 1WNSA 2FBVA 2V51B 4Z4IA 2HHIA 2Z1JA 2B4JA 1RILA 5C10A 4E7LA 2OCEA 3RMAA 2HBJA 3CCQN 4IDHA 4E7JA 5C2FA 1E4FT 3U9ZA 5GIPA 1C6VA 3K9JA 2QXLA 3E66A 4YDUC 4F3TA 3O4QA 4O44A 3V9UA 3AA5X 2HHQA 3G25A 2I7PA 3OBYA 3VENA 4W5QA 5LY3A 3CCRN 3AO3A 1HKCA 3KD5E 5FLXO 1ZBLA 3H3NO 3SAFA 5LMNK 4HWIA 3NHGA 4B9VA 2QWLA 3ZEUB 5ADXA 5CYQA 4CZHA 1BCOA 3MDQA 1KC8O 2HHWA 5JS2A 4DFPA 4FO0A 3VETA 1KTQA 1S72N 3TSQA 4PY5A 5JVHL 2ZJPL 3MEEA 3L2VA 1E3MA 3ZEUA 4CERA 4DTRA 1S1WA 3CCUN 3OYBA 1IJJA 1EXQA 4YOUA 2OPPA 4CF2A 4RG8A 1NJXA 1SQKA 4FJHA 1VSMA 4CFBA 4EAHD 2VG6A 3HYFA 1LCUA 2YX6A 3ALYA 3O3FA 4CEFA 4KTZA 5A2QO 3LDQA 3R6MA 3BF3A 1WSGA 2A40A 2VWBA 3HSCA 3CPWM 2ETJA 3WQUA 3H3OB 3HVTA 3DLHA 3O9SA 2KLAA 4FWPA 3R9PA 5HOOA 1TVRA 4DV2K 5DM6L 1XMOK 2P9UB 3OJUA 4CIEA 5ELZA 5AQSA 5BR8K 3E9LA 3AVIA 3ZSQA 4BE1A 2FBXA 5TKWA 4ILGB 1ATRA 4CECA 4CZGA 4NYFA 4BC2A 1UOCA 1IBKK 1NOZA 3F73A 1NMDA 4BECA 2EX3A 3CCJN 2CGJA 4JKDA 1K73O 2ZGZA 4CJ7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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