2ZWHA

Model for the f-actin structure
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
374
Chain Sequence
DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title The nature of the globular- to fibrous-actin transition.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
total genus 114
structure length 374
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2zwhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zwhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zwhA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2zwhA04
2VWBA 3D2FB 3U9ZA 2IVOA 3LDPA 2D1KA 3VEWA 4EHUA 1X3NA 2OANA 1JCFA 3H46O 5BR9A 3DXKA 1NGCA 3EKUA 1JCGA 2YI1A 3L6QA 2GWKA 4ISGA 2E1ZA 3QICA 1HJOA 1BG3A 2VYPA 4JD2B 4EHTA 3MN7A 1YAGA 4BRNA 3OHRA 4B1YB 1YVNA 4RWTA 3M6GA 4FWRA 4B1ZA 3UKUA 3CI5A 2QWLA 3VEOA 3DXMB 5AQOA 3LDLA 5AQUA 4FSVA 1T6CA 3SLCA 3G25A 3VF2A 2IVPA 3A5LC 4BC2A 5BN9A 3FR0A 5JICA 2W41A 2WUSA 4CZJA 3ZEUA 1BDGA 4BR0A 3ENHA 2GELA 3U4LA 1IG8A 3AY9A 3FGUA 5AQWA 4AM6A 4CZGA 3CJ7A 3VPZA 3ENOA 2Q97A 4JHDA 5EXWA 3WXKA 5AQHA 4H5RA 4O5FA 3GBTA 4BRIA 3D7EO 1ESVA 5AQIA 3CJCA 4PKHA 3FLCO 2D0PA 3CERA 4K41A 4BROA 1QHAA 3MN6A 3RSEB 5JMVA 1C0FA 3D2FA 1RFQA 4BRDA 3H3NO 4JAXA 1MA9B 5KPZA 1BO5O 3VENA 3ZETB 2QM1A 2Q0RA 3A5MC 4MLEA 3AAPA 4CI6A 2Q0UA 3A8YA 4JD2A 4JNEA 1NBWA 2I7PA 2P9NB 4EIAA 2GWJA 2DPNA 5EY4A 3L4IA 4H5VA 4FWQA 4I6MB 1QQMA 3DXMA 3M3ZA 4MLHA 2AA4A 3HI0A 1DKGD 1XC3A 3HM8A 2QWPA 4M7XA 2YHYA 5EVZA 4BQLA 4BR2A 5E84A 3S41A 1KAZA 1IJJA 4BC4A 3QFUA 3L0QA 3O1WA 1Z6RA 5FPMA 1ZC6A 2GTDA 4A62A 1NGEA 2ZWHA 4E1JA 1T44A 2E20A 3GL1A 3UKUB 1G99A 4NO7A 2FLOA 3H6EA 1J6ZA 4BGAA 1HPMA 2E8AA 5CE3A 5AZIB 3RSEA 3O4WA 1HKBA 2FF6A 2CH6A 3H45C 3ULEB 3R8EA 3EZWA 3WQTA 4BRMA 3IMXA 4RCHA 5ELZA 1NGDA 1P8ZA 3MDQA 4Y0WA 3ZETA 1S3XA 2ZGYA 5AQPA 1DEJA 1YXQA 1HLUA 1WOQA 4CBXA 5KQ8A 3C7NB 5AFUH 3W3DA 3MN5A 2P9NA 3CHWA 1MDUB 1QZ5A 3O6WA 4QS9A 4EAHD 5BREA 3M1FA 2V52B 4HTLA 4I6MA 3UE5A 4BREA 3QMLA 3FZHA 5KPTA 3CJ9A 5TKYA 2W40A 5AQRA 4BRFA 3DAWA 4M63C 2QXLA 2VCPA 1E4GT 2QWNA 2HMPA 3BP8A 1TUUA 1KAYA 3A0IX 3LL3A 5AR0A 2E1YA 4BRGA 5LY3A 1ZBSA 4FO0A 3VEVA 3GOIA 3I8BA 3MMVA 2E2QA 3BF3A 3R9PA 3BEXA 3FZMA 3P4IA 2YHWA 3C0BA 5AZIA 2E2OA 3ULEA 2EWSA 3IUCA 4CZKA 4F9OA 2QWQA 4CZLA 5LJWA 4H5WA 2ZF5O 4J8FA 2IIRA 4XH4A 1EQYA 2NZTA 4PL7A 1BUPA 3LDQA 5AQYA 3TU5A 2V7ZA 3FZFA 4DHYA 4BR4A 3LM9A 4BVPA 1TYQB 2E2PA 2YJEA 2FF3B 2A41A 3R6MA 3C7NA 4CZIA 1TUYA 1XUPO 3EKSA 1E4FT 1R59O 3QDKA 2A3ZA 4MO4A 2AP1A 3EL2A 1GLFO 3O08A 1MWKA 3AARA 5I9EB 3TPQA 2QWRA 5AFUA 2Q31A 2P9PB 4BRLA 1GLCG 1RDWX 3ATVA 4CZHA 3VF4A 1OKJA 4YDUA 2F9TA 5JLFA 2FSJA 5AQMA 4MO5A 3VF6A 2P9UB 2E2NA 1SZ2A 4BVOA 3U9DA 3ZX0A 5BRDA 2E88A 4GY2B 1BA0A 2HOEA 2CH5A 3WQUA 3O80A 3FZKA 1MWMA 2BUPA 3CJAA 4CBUA 3J8AA 2NLXA 1HUXA 2FSNA 5FPNA 3HSCA 3VEXA 3ZX2A 1GLAG 4IWVA 4BG9A 5AQGA 5F2RA 1LOTB 3WXIA 2A5XA 2FSKA 2Q2RA 4H03B 4IJAA 4DB3A 1TYQA 3HZ6A 5AQXA 4FWPA 1QZ6A 2PBDA 5AQFA 2A42A 4BRCA 4CD3A 3FZLA 4NB4A 5AZJB 5BRHA 3ATUA 1NGBA 5LJVA 3QBWA 5AQLA 5BRFA 1QQNA 3WEEB 4BRPA 4H0PA 4FWNA 4K25A 3IDHA 1ZXOA 4C23A 2Q1NA 1ATRA 3WXLA 5BPNA 1U2VA 4WQ4C 2P9PA 4A61A 1SQKA 2ZGZA 1NGHA 4GNIA 4B1WB 1T6DA 3SMSA 5AQTA 4XH1A 3SK3A 2V7YA 3B8AX 1RGIA 3AAQA 3O8MA 1BWFO 3VESA 4FWOA 2P9UA 4WQ5C 4H0YB 5BPMA 3HBTA 4CZMA 2P9LB 5AQNA 5BN8A 3KVGA 2A40A 4WYBA 1NGIA 2BTFA 4KBOA 5AQKA 5AQZA 1Z05A 3GE1A 5AQQA 2QWOA 4FL9A 4DCHA 2HF4A 4A2AA 3SJHA 4M7YA 3U8XA 1Y64A 5ADXH 3MCPA 3A5NC 1XQSC 4FOIA 4FPBA 1QQOA 1WUAA 2HF3A 5AZJA 4FWSA 3HTVA 3QBXA 3QFPA 3A5OC 3WUHA 4B1VA 4BC5A 2ASPA 2FXUA 3KZBA 3WEEA 4FWKA 2YHXA 4H5TA 4BR5A 5KQDA 4FOEA 2ASMA 5FPDA 4BRQA 3LDOA 4BRAA 3CJBA 3DJCA 3VGLA 1HX1A 4ISFA 4BR9A 4RTFD 1HKGA 4JN4A 4XH5A 4BG8A 2P9IB 3FFKB 2V51B 4H0OA 4FWLA 3H1QA 2P9SB 4L3QA 3UKRB 1SAZA 2YJFA 1GLDG 1X9JA 4A2BA 3LDNA 4H0TB 2CGKA 1GLLO 3JXUA 2ITMA 1DGKN 4FWMA 5E26A 3W0LA 1KXPA 4K43A 2P9LA 2P9KB 3WT0A 3ID8A 4CD1A 1GLBG 1NGFA 4CJ7A 4IXCA 3EO3A 1C0GA 1Q18A 1BOTO 1K8KB 1LCUA 3EN9A 2CGLA 4H0VB 4HWIA 4K42A 3ZX3A 4AM7A 4B1UB 5B8HA 4O8KA 3CJ1A 4B1XB 4Z94A 3VEYA 3FE1A 1NGAA 5F0XA 5BPLA 2KHOA 4H0XB 1NLVA 3H3OB 3UB5A 4QS8A 5AQVA 2A6AA 3D2EB 3O5BA 4YDUC 1X3MA 2Q36A 4IO8A 3BF1A 5ADXA 5AQSA 4CZEA 3I33A 1NMDA 3CETA 1U2VB 4PKIA 2QW9A 3VGMA 4QS7A 2UYTA 3SMPA 3O1BA 2QWMA 2P9IA 2IVNA 4DQ8A 1H1VA 1GLEG 4PL8A 3VGKA 2H3GX 1BU6O 3WXJA 2P9SA 3UKRA 2D4WA 4BC3A 2D0OA 3F9MA 4ISEA 2NRHA 2YCHA 1YUWA 2F9WA 3DXKB 3VOVA 4CZFA 2I7NA 1CZAN 2GEMA 1U6ZA 4BRKA 4H5NA 1KAXA 3CQYA 2PAVA 3KHYA 3DWLA 4IJNA 4FPAA 4BR7A 4BRHA 1NM1A 4LC9B 2P9KA 5EX5A 3JS6A 4PKGA 2ASOA 1NGJA 2CGJA 3GDQA 3MN9A 1NWKA 3MK6A 3VERA 4CBWA 2J4RA 3QB0A 1V4SA 3LM2A 1K8KA 1S22A 1BA1A 4WQ4A 4EFHA 5FPEA 3GG4A 5F1XA 4XEIA 4B9QA 3ZEUB 1JCEA 3CIPA 1V4TA 3VETA 1NGGA 4BGBA 3VEZA 2GUPA 3CQXA 4JHDB 3D2EA 5JLHA 4WQ5A 1ATSA 1D4XA 1ATNA 4BQZA 4IZ9A 5AQJA 5KPRA 3BUZB 5EOYA 3H1VX 1HKCA 1GLJO 3IFRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CFDA 1WSFA 3QEXA 2XO7A 3QERA 3K9JA 2IVOA 4B3TK 3VEWA 4EHUA 1LAWA 4JKBA 3OJUA 2XY7A 2NRTA 3L6QA 5KRTA 4ISGA 4YOUA 3QICA 1BG3A 4B9LA 4JD2B 4EHTA 4DR2K 4AHRA 3KK1A 3CC7N 4W5OA 2E4LA 4CIFA 1NJWA 2G8VA 3CI5A 4RW6A 4OPKA 3DXMB 3NF6A 4I9LA 3DLLL 1BIUA 5AQUA 4LD0A 2BANA 5C15A 1T6CA 3QIPA 3SLCA 1YTUA 3CCMN 4BC2A 3P31A 2WUSA 4JYAK 4CZJA 3THYA 1BDGA 1VRTA 5GAGP 3PIOL 3QEPA 2HB5A 2O8BA 3QETA 1T8EA 1TAQA 4CZGA 1TK5A 3O9TA 3VQPA 1GOAA 3GBTA 3D7EO 3PO5A 3FFIA 1ESVA 1O1WA 1YF5L 1QHAA 3KWGA 1KFSA 3I56N 3SUQA 1C1BA 1SV5A 3C95A 2F8TA 1C0UA 4DV0K 5J2PA 3P5JA 1VSIA 3M8PA 4IFEA 3J80O 4Z4GA 1WSGA 1NBWA 4FYDA 3HVRA 2P9NB 4EIAA 4KHYA 4I6MB 4FWQA 4MLHA 1EO1A 3LP1A 4O8UA 3SJJA 5GADP 1DKGD 3M8QA 1XC3A 4BR2A 1HMVA 5E84A 1U4BA 1IJJA 3ZSWA 4NYNA 4NYFA 4BC4A 3SQ1A 1P90A 3U6FA 3C6UA 1ZC6A 3PX0A 4E1JA 3D45A 1VSLA 1G99A 4DR3K 4KHQA 2FLOA 3CC2N 3KLGA 4H8KA 1HPMA 1TK0A 4DS4A 5AZIB 1UA0A 3RSEA 3AVBA 1QE1A 3THYB 3S3NA 4CERA 3LANA 4RCHA 4OX9K 3ZETA 3AO4A 1U48A 3V1QA 4FK2A 1S3XA 3OYKA 4GV3A 1NKEA 3KD5E 3HJFA 3CCJN 1NK6A 2D0BA 4FLTA 1N34K 3AVNA 4GV9A 4CBXA 3W3DA 3CHWA 1X9MA 1VSEA 3NMUA 4C8OA 3ZSYA 3IG1A 2VWJA 1TVRA 4DQRA 1VSMA 1VQ8N 3L2VA 3TTFA 1RILA 1HNWK 2QWNA 3LDSA 1TUUA 3LL3A 3DOLA 2E1YA 4FO0A 3MMVA 5IWAK 3PLAA 3DI6A 3FZMA 2ZJQL 2HBKA 2JWLA 3CPEA 3ULEA 1HQUA 3L2WA 4X65K 2YX6A 1T3VA 4CZKA 2QWQA 1QTMA 4H5WA 1EWQA 2X78A 1EQYA 3LPUA 1XWLA 4PL7A 2O8EB 3TU5A 3FZFA 4WFAL 3K5NA 4V19S 1JLQA 3T7ZA 2A41A 3R6MA 3C7NA 3QLHA 3L2QA 4CGGA 1E4FT 1R59O 3TAEA 3AVIA 3V9UA 4H4MA 3MWPA 4HUFA 3E1YA 4F2RA 1Z26A 5HROA 1FXXA 5I9EB 3SQ0A 3DLBA 2QWRA 1TV6A 4PWDA 4R5PA 2FBXA 5C2DA 3E9PA 3VF4A 1Q9XA 2UUBK 4CECA 3DMJA 2FSJA 3LAMA 4MO5A 1KLMA 4NLBA 4ICLA 4O4GA 1N36K 4KFBA 2R7YA 1RBVA 2E2NA 1SZ2A 1T03A 3L4QA 5BRDA 2E88A 3WNFA 4GVEA 4W5RA 4DSKA 3OYNA 4DSIA 3J8AA 2Q3SA 2FSNA 3VEXA 3HSCA 1GLAG 4WFBL 5AQGA 3THVA 1LOTB 3WXIA 4H03B 4B3OA 1RDAA 4HTUA 2PBDA 3HRGA 4FJNA 2A42A 4OVLA 3V4IA 5BRHA 3ATUA 1NGBA 1RTJA 3V1OA 4KTZA 5LL6Z 1I94K 5AQLA 5BRFA 4H0PA 4CIEA 4DR4K 1ZYQA 1ZXOA 1ATRA 4CHZA 4FJ7A 3C94A 5C25A 3HT3A 1XHZA 1LAVA 3AA4A 2B5JA 2QI2A 4J2EA 3O3FA 5H1SQ 4JV5K 1YVUA 1SQKA 1SL0A 4GNIA 4JKAA 1T6DA 4EP4A 3V9WA 4NCBA 3B6PA 2V7YA 2VGNA 4N56A 3I55N 5HRRA 3O8MA 1KD1O 3VESA 3K59A 2OTLN 3HBTA 2XRIA 1SKWA 4HCBA 5AQNA 5M1QA 3OA9A 2O8DA 4WYBA 1NGIA 3H08A 3U3YA 5AQQA 4DCHA 4A2AA 2EHGA 1WAJA 3U8XA 1Y64A 2JWKA 3NGIA 3G6EN 1ZBLA 4FOIA 4CIGA 3AVMA 2P5OA 2HVHA 1WUAA 4CF0A 3VQEA 5HOOA 2NRWA 3HM9A 2FXUA 1HYSA 1D9FA 3WEEA 4CW7B 3PSIA 1LW0A 2Z1HA 3LDOA 4FJLA 3OYCA 3CJBA 1CZ9A 4M3ZA 3SPZA 3VGLA 4CJ4A 1VQ9N 3NH0A 3FFKB 1JL1A 1W0HA 1OH8A 2BGGA 3VA0A 4A2BA 4CGJA 3V6DA 4B9MA 4H0TB 2CGKA 2Y1IA 1W2BM 3AGRA 3NGZA 4AHVA 5KTQA 2IAJA 3L2RA 3BZKA 4QCLA 1KXPA 4EZ9A 2P9LA 4BE0A 1VQMN 2F7TA 4JKCA 1ZBFA 1DTQA 3EO3A 1HJRA 3IRXA 1Q18A 3MXMA 1LWCA 3QINA 4DV3K 4HWIA 4H0VB 1RTIA 1F21A 4B1UB 3K57A 4O8KA 4DTMA 5J1EA 4B9UA 1S1XA 4AHSA 4N41A 1NOZA 3AVHA 4E0DA 3D6RA 1TGOA 2YNFA 4DKWA 4DSLA 4QS8A 3TR8A 1NK8A 1NK0A 4PHTX 3CF5L 1WSEA 1QHTA 1M1KO 5ADXA 3AO2A 3S5TA 3ZYYX 1NMDA 1LWFA 3CETA 4GVMA 4QS7A 3PSFA 2EX3A 2P9IA 1GLEG 2OCEA 1UA1A 2D4WA 2D0OA 2KZZA 3ALYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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