2P9KB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with atp and crosslinked with glutaraldehyde
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
356
structure length
275
Chain Sequence
VVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPSYPMENWDDMKLLTEPPMNPTKNRAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLADI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Structural protein
total genus 69
structure length 275
sequence length 356
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9kB02
3.30.420.520 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9kB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9kB03
4WQ4A 1V4TA 5AQWA 1SZ2A 3CI5A 3ID8A 1ATRA 1MWMA 2A5XA 1DKGD 4H0PA 1KXPA 2I7NA 4CZIA 4DCHA 4BRNA 4BRKA 2UYTA 3SMSA 1C0FA 1MA9B 4ISGA 2HMPA 3U9ZA 3VEWA 1GLBG 1XQSC 2FXUA 5BRFA 5AQHA 1EQYA 1YVNA 5AQKA 5BRHA 3GBTA 2P9SB 5EX5A 1D4XA 1ZXOA 4FWMA 2A6AA 4B1VA 1BU6O 4PKGA 3VOVA 5AQFA 1DGKN 4BROA 3BP8A 2QXLA 2E2QA 1IJJA 3QICA 4AM6A 1BWFO 3DJCA 1NGEA 1QQOA 2FF3B 4BRCA 2P9SA 1T6DA 3M6GA 3O1BA 4LC9B 3WQTA 3IDHA 4L3QA 2D1KA 5FPNA 3MMVA 1BUPA 3HM8A 2EWSA 4IJNA 4FPAA 1NWKA 4QS7A 4PL8A 3LDPA 3AARA 4MLHA 3CQYA 2P9PB 4YDUC 5BN9A 4MO4A 2A41A 3S41A 4CZGA 3AAQA 3U9DA 2FSKA 4CZLA 1RDWX 5AQIA 3UB5A 3C7NB 3EN9A 1NGIA 4BRAA 1G99A 3ULEB 3DXKB 5BRDA 2W40A 1QQNA 5EY4A 2NZTA 2KHOA 1YUWA 4BRFA 3DAWA 2FSNA 5I9EB 1NGAA 4CZFA 1LCUA 5AQXA 3WXIA 3W0LA 4IXCA 2BTFA 3H45C 3LDLA 3CJAA 3O80A 1RFQA 4FSVA 3QFUA 4CZKA 1NGGA 3C7NA 5CE3A 3ATUA 4B9QA 3D7EO 4H5WA 3A0IX 3ULEA 4BQZA 3DXKA 2A40A 4BR5A 4EHTA 2IVNA 3VESA 3CJ9A 3LDQA 4BQLA 5TKYA 2ASPA 1GLDG 3CJCA 4H0TB 5AR0A 2QM1A 4JAXA 2D0OA 2QWPA 1R59O 3EO3A 5BREA 1ESVA 4J8FA 3ZX2A 4DHYA 1NM1A 1WUAA 2NRHA 3EKSA 5AQOA 5EVZA 5ADXH 5E26A 3JS6A 3KVGA 4H5NA 1ZC6A 4IJAA 3TU5A 3AY9A 2AA4A 4K41A 3UKRB 3VENA 4BVOA 4FWQA 1V4SA 2CGJA 1ZBSA 3VERA 2GEMA 1U2VB 1HKBA 2ASMA 2GUPA 4Y0WA 1GLFO 2E8AA 4B1ZA 4I6MB 3A5NC 4FO0A 2P9KB 1E4FT 2E1ZA 1TUUA 4M7YA 3ZEUB 4A61A 4ISFA 3IMXA 3WQUA 3W3DA 5KPRA 3HZ6A 1MWKA 2CH6A 3MCPA 1U2VA 5BPMA 2F9WA 1C0GA 5FPDA 4DB3A 1NMDA 2E2NA 4I6MA 3KHYA 3UE5A 2P9KA 2VYPA 4FWRA 3ZEUA 4JN4A 4ISEA 1KAXA 2QWMA 4CZHA 4FPBA 2HF3A 2YJEA 2BUPA 4HWIA 3MN7A 3ZX3A 2HF4A 2Q1NA 4O5FA 2GTDA 4H0YB 3VF2A 2IVPA 4E1JA 1S3XA 3A5OC 3L4IA 1E4GT 5AQTA 2H3GX 2CH5A 3FZHA 3ATVA 3ZETB 2ASOA 4FWLA 3I8BA 4A2BA 5LJWA 4BRQA 1OKJA 2CGLA 2V7YA 4PKIA 4XH5A 4H5VA 3SJHA 4FWPA 1NGDA 2P9UB 2Q97A 2GELA 2QW9A 5LJVA 4IWVA 5BPLA 1ATNA 4EAHD 3FR0A 3CQXA 3WT0A 4FWOA 5AZJB 2V51B 3VEVA 3O4WA 4RCHA 3ZETA 2D4WA 1JCFA 3SLCA 1HJOA 2AP1A 3BF1A 3D2EB 1LOTB 3VETA 2P9UA 5AQVA 4CZEA 4BVPA 3B8AX 5ELZA 3GDQA 4H0OA 1BA1A 5AZJA 5FPMA 4BC4A 4XH1A 4YDUA 1GLJO 5F2RA 5JMVA 3MK6A 4IO8A 1GLCG 2F9TA 2P9PA 3D2EA 3BEXA 1HPMA 1U6ZA 2GWKA 4BGBA 4H0VB 4HTLA 5AQUA 4B1YB 1KAZA 3OHRA 4K42A 4O8KA 3VEXA 4BRMA 2E1YA 1X3NA 4BR2A 3VEOA 2V52B 5KPTA 2Q0UA 5EOYA 1XUPO 1NGFA 5E84A 4JHDB 5AQRA 5EXWA 3H1VX 5FPEA 4M63C 4BRGA 4M7XA 4BR9A 4RTFD 3LL3A 3HTVA 4EHUA 1SAZA 1X3MA 2V7ZA 1J6ZA 4CJ7A 1HKGA 1QQMA 4CBWA 1QZ6A 3R8EA 3QBWA 4JHDA 4H5TA 1NGJA 3BF3A 5AFUH 1K8KB 2E2OA 3HI0A 3A8YA 3GL1A 2YCHA 1SQKA 2PBDA 1JCGA 4BRDA 3HBTA 3MDQA 3VGMA 1DEJA 2P9LB 4CD1A 4CD3A 2J4RA 2YI1A 3VF6A 2QWOA 4MLEA 3H3OB 3GE1A 5KQ8A 2QWRA 1MDUB 3WEEB 4A62A 3H1QA 3H46O 5AFUA 3L0QA 3ZX0A 1HX1A 3WUHA 4BREA 3H6EA 1GLLO 3FZMA 4FWNA 4WQ5C 4C23A 1K8KA 5AQSA 4CBUA 3UKRA 1YAGA 3FGUA 4H0XB 4FWSA 1XC3A 1ATSA 3LM2A 2P9LA 2Q31A 2QWQA 3A5LC 4BR0A 2DPNA 5BR9A 3WEEA 4PL7A 4IZ9A 2IVOA 4WQ4C 3IUCA 3M1FA 1BG3A 3R9PA 3O08A 2CGKA 1BA0A 4B1WB 4CI6A 4BR7A 4RWTA 1NGBA 3LDNA 4GNIA 5AQPA 2ZF5O 3VF4A 1T6CA 4GY2B 3DXMB 5AZIB 3G25A 5BN8A 1Q18A 3AAPA 4FOIA 3U4LA 3IFRA 3QFPA 5JICA 3MN5A 3O5BA 4DQ8A 3O8MA 3UKUB 1BO5O 3EL2A 1GLAG 1TUYA 2QWNA 2ZGZA 3CHWA 4EFHA 2VCPA 5KQDA 1NBWA 2QWLA 4FWKA 4BR4A 5JLHA 1TYQB 4BC5A 3CJBA 3DXMA 5AZIA 4FL9A 4BRHA 5LY3A 3BUZB 4EIAA 3VEYA 3UKUA 2A42A 4QS9A 3GOIA 3KZBA 1CZAN 5F1XA 2PAVA 2ZWHA 1BDGA 3R6MA 2A3ZA 4K43A 1TYQA 3CERA 5AQGA 4A2AA 1Y64A 3ENHA 3LDOA 3RSEB 4BRPA 2OANA 4B1XB 4MO5A 2HOEA 3QB0A 2E2PA 2YHXA 3LM9A 3U8XA 3FFKB 1Z6RA 3VPZA 5AQJA 3FZLA 3C0BA 1NLVA 5AQQA 3QMLA 3SMPA 3JXUA 3FLCO 4CZMA 3I33A 2Q2RA 3QDKA 3RSEA 3L6QA 3WXKA 2E20A 1HUXA 5AQMA 1HLUA 1GLEG 4BG8A 5B8HA 4CZJA 1NGHA 5JLFA 1NGCA 4NB4A 1QZ5A 4XEIA 4BG9A 2GWJA 2VWBA 3H3NO 2YHYA 3QBXA 2YHWA 2YJFA 3D2FB 4XH4A 2I7PA 5BPNA 4QS8A 2P9NB 4BC2A 1S22A 3TPQA 4AM7A 1X9JA 2ZGYA 3J8AA 5AQLA 2NLXA 4JD2B 3VGLA 4PKHA 3SK3A 3MN9A 3MN6A 1BOTO 5AQZA 3O6WA 4K25A 3FZKA 4H03B 2P9IB 2W41A 1Z05A 3EZWA 4FOEA 3D2FA 1JCEA 2FSJA 3P4IA 1T44A 3DWLA 5KPZA 2P9NA 4F9OA 3VGKA 3CJ7A 3ENOA 3CJ1A 4JD2A 3WXLA 4WYBA 4H5RA 4B1UB 3GG4A 3M3ZA 2D0PA 1IG8A 1QHAA 5F0XA 4CBXA 5AQYA 3F9MA 4JNEA 3O1WA 2P9IA 1YXQA 3A5MC 3FZFA 4KBOA 3HSCA 3EKUA 4WQ5A 2ITMA 4NO7A 5ADXA 3WXJA 4Z94A 3VEZA 4BC3A 2E88A 1P8ZA 2FF6A 1RGIA 2WUSA 3CIPA 1KAYA 1HKCA 1WOQA 2IIRA 1H1VA 5AQNA 3CETA 4BRLA 4BRIA 2FLOA 4BGAA 2Q36A 3FE1A 2Q0RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CCUN 2AJQA 5AQWA 1SZ2A 1ATRA 2A5XA 1SS6A 4MDBA 3WNEA 4CZIA 3KWIA 4BRNA 2WONA 2PYJA 5JENA 3SMSA 1C0FA 4ISGA 3V9UA 3CXCM 1XQSC 3IRXA 3CFRA 2FXUA 3ASMA 3WXMB 2KZZA 3AA2A 3MEDA 5BRHA 3GBTA 3RMDA 1VQ5N 4PKGA 1S1WA 3E9PA 4BROA 3ZT4A 4ID1A 3AVIA 1QTMA 1BWFO 4DTJA 1S1VA 3U3GA 2HHHK 2D0AA 4UQGA 2FF3B 3TSUA 3V9XA 1ITGA 5A2QO 4LFBK 3AVGA 3O9RA 1T6DA 3L2WA 3MMVA 4BWMA 3OYDA 2DFEA 2EWSA 3OYMA 1XHXA 4PL8A 3F2KA 3AARA 1C0TA 4IO9L 4MO4A 4ILHA 2A41A 1BGXT 3J7ZO 3SBGA 3TR8A 1KRPA 4BRAA 3AVFA 5BRDA 5J2QA 2W40A 2G8UA 1YUWA 4DMNA 4CZFA 1NJWA 1M90O 1BCOA 1LCUA 4CJSA 4KHYA 3W0LA 2G8WA 4DV3K 3K58A 2HHUA 1T05A 1RFQA 3ZSRA 3DLRA 3D7EO 3IKMA 3ULEA 4BQZA 4F8RA 1D9DA 1RDDA 3QEXA 4LH5A 3CJ9A 4JKEA 4BQLA 1VSMA 3MAQA 3KTQA 1TK5A 1CZBA 2KQ2A 4E19A 1VRUA 4JAXA 3ZSOA 3ZX2A 2NRHA 4JI1K 1BCMA 2NUBA 3EKSA 3OS1A 3G6EN 1WBBA 3CYMA 3JS6A 3J81O 2HBLA 3VQ5A 3UKRB 4DS4A 3SZ2A 1NU0A 4DV2K 4M3TA 4FWQA 1IBMK 1V4SA 2CGJA 5GAHP 3BZCA 3VERA 2Z1JA 1I94K 3HM9A 2ZJPL 1GLFO 1NJIO 2UUAK 4CJ3A 4FJHA 1KVAA 1KQSM 4DWIA 1E4FT 4CFDA 4DF4A 3WQUA 2F7TA 1LWEA 2JGUA 3HZ6A 5CZ2A 4LFCK 1MWKA 3MCPA 3VQ6A 2F9WA 4YHHK 4M3ZA 3RTVA 4DB3A 4I6MA 2P9KA 1N6QA 3ZEUA 4KI4A 1NG9A 1KAXA 4KKOA 4F2SA 4I9QA 4FPBA 2YJEA 3SUPA 1CXQA 1S1UA 1S1TA 3LP0A 3KK2A 2GUIA 3LP3A 3D45A 3OBWA 4O5FA 4H0YB 1HRHA 4E1JA 1NK8A 3ZT0A 3C65A 4TSXA 3THVA 3L4IA 1EX4A 3OYIA 2ASOA 1XC9A 4XH5A 1YIJN 1Y97A 4FWPA 2VWJA 2Q97A 3TAMA 1ATNA 5I3UA 3FR0A 3CQXA 5AZJB 1SL1A 3NH0A 3VEVA 5MLCQ 3ZETA 2IGIA 4JS4A 1JCFA 3I0RA 4CK3A 2PYLA 1B9DA 3JYTA 2BE2A 2P9UA 4CEEA 2NNWA 4CZEA 5ELZA 1TV6A 4Z4EA 2W6KA 5FPMA 4BC4A 1RT3A 4XH1A 3BDPA 1GLJO 1QE1A 4DTOA 3KKRA 3HXMA 3V1QA 2OPRA 3MK6A 3V1RA 2VQEK 5J2PA 1W2BM 1I3AA 5HROA 1HPMA 1FXXA 1DTTA 4RW8A 4DR5K 4H0VB 4HTLA 4N56A 3NDKA 4LF4K 1OVYA 3OHRA 1L3TA 1IBLK 4LF8K 1X3NA 5KPTA 1RBUA 2V52B 3VEOA 4DTMA 1R0AA 2UUBK 1RTJA 2Q0UA 3N4PA 5EXWA 3H1VX 5FPEA 2QEXN 1C0MA 1WNSA 4BR9A 4C8KA 3LL3A 4DFJA 1RDBA 4N76A 1UA1A 2P5GA 1P90A 4AHVA 2O8CB 3HP9A 4CGFA 4IDKA 1CLQA 4CJPA 4H5TA 5AFUH 4O4GA 2QI2A 3AV9A 1EWRA 2YCHA 3AVLA 2YNGA 3VGMA 3QEVA 1EKEA 1DEJA 3O3HA 3NGYA 1CZ9A 4M45A 2QWRA 4DSEA 3WEEB 2FC0A 2JWLA 1FK9A 4JRPA 3L0QA 4BREA 4CJEA 1GLLO 3QNOA 1VQNN 3K2PA 2I5JA 4H0XB 4O0JA 4CF1A 1YI2N 4FWSA 1XC3A 3HPGA 4KREA 1S9EA 1JKHA 4B9LA 2KKZA 4BDYA 4I2QA 1OH8A 4FZZA 1C1CA 4IZ9A 3O08A 2CGKA 1BA0A 4B1WB 1N36K 1RDAA 4B3SK 1NGBA 1KLMA 4KHQA 3THXA 2ZF5O 4DTSA 3DXMB 3G25A 1G15A 1W0HA 1Q18A 3AAPA 4DQRA 5K14A 2WTUA 4DQIA 3MN5A 3O5BA 2IS3A 3NF7A 2ETJA 2QWNA 2YNFA 1RDCA 1BQMA 5IWAK 4FK2A 1NBWA 1KLNA 2QWLA 4CFBA 1WSJA 3SPZA 3O3GA 4KHUA 5CY4A 4FJIA 1LWCA 1EWQA 4AF1A 1BIZA 3BZKA 4FL9A 5LY3A 2JWKA 3L8BA 3UKUA 2P1JA 3KZBA 2DFHA 3NHGA 2D0BA 2PAVA 2ZWHA 3RRGA 4K43A 5GINA 4JI7K 1Y64A 5TKWA 3MEGA 1ILYA 4BRPA 3CQ8A 4MO5A 2HHIA 1YVUA 3V81A 3I8DA 3QEWA 1GOAA 4RG8A 3CCMN 4HUFA 4ILJA 3CMEN 1NLVA 3M5RA 2HMIA 3RWUA 3SMPA 3JXUA 4BACA 1XI1A 2DFFA 4OLBA 2WBNA 5M1QA 2Q2RA 3QDKA 4IDHA 2E20A 4B8AB 4CK2A 4FYDA 1HUXA 1XNQK 2UXDK 4AQYK 4NCGA 4R5PA 1NGCA 2OZSA 3NH2A 1NK7A 4BG9A 4YOVA 4KHWA 2GWJA 2VWBA 4KO0A 4EP4A 3SQ4A 3M8QA 4MDAA 4XH4A 3TTCA 4OJRA 4BE7B 1RT2A 4ID5A 4E7KA 4AM7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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