2P9KB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with atp and crosslinked with glutaraldehyde
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
356
structure length
275
Chain Sequence
b'VVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPSYPMENWDDMKLLTEPPMNPTKNRAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLADI'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Structural protein
total genus 69
structure length 275
sequence length 356
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9kB02
3.30.420.520 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9kB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9kB03
3W3DA 5KPZA 2IVOA 2NRHA 3MDQA 2GTDA 5FPEA 4ISFA 5EOYA 2BTFA 2I7NA 1YUWA 4FWMA 2ZGYA 1LOTB 4KBOA 3QBXA 3RSEA 3JS6A 3QMLA 4FWKA 3MN6A 4I6MB 1QQNA 1JCEA 4GY2B 1MWMA 3KZBA 1HLUA 1V4TA 5AQIA 3CJ7A 5EY4A 5KQ8A 1WOQA 2IIRA 2V51B 5JLFA 1J6ZA 4ISEA 2GEMA 3VGKA 1ZBSA 2QM1A 4B1WB 3LDLA 4BR7A 1BO5O 4GNIA 2Q31A 2P9UB 1EQYA 4IZ9A 1XUPO 2QWMA 2E20A 1DGKN 4JN4A 3B8AX 1BUPA 3S41A 3VEXA 3CJAA 4JD2B 4JHDB 3KHYA 2HF3A 1E4GT 3C7NB 3TU5A 2GWKA 4RTFD 2QXLA 3O6WA 1ATRA 1SQKA 1CZAN 2V7YA 4K42A 5AZIA 1BA0A 3VEOA 2HMPA 3SJHA 4EIAA 4MLHA 5BN8A 3JXUA 4WYBA 4IJNA 3R9PA 4B1ZA 3GBTA 4WQ5C 3CQXA 5BPNA 3BP8A 2UYTA 4F9OA 2Q97A 2P9KA 5AQNA 3VF4A 3LDOA 5AQWA 3DXMA 1GLBG 3FGUA 4J8FA 3DAWA 5E84A 5BRHA 3BF1A 4H0PA 5AQXA 4CZMA 1U2VA 2F9TA 3VESA 4BC4A 2ZF5O 3FZKA 3MK6A 3MN5A 4FWQA 4XH1A 2GWJA 3BUZB 3MN7A 3HSCA 4NB4A 3AY9A 2FXUA 3DJCA 1HKCA 3GL1A 1U6ZA 3VERA 4CD3A 1HUXA 1HJOA 1D4XA 3WEEB 4DQ8A 3EO3A 4BRMA 4EHUA 2YHWA 5AQYA 1QQOA 4RCHA 4BRFA 2KHOA 3M6GA 2AP1A 4EFHA 2P9IA 3RSEB 2P9SA 2Q0RA 3GG4A 1BOTO 3FR0A 4PKHA 1BU6O 1QQMA 4FSVA 4CD1A 2HOEA 3H3NO 3G25A 2FSNA 4BC5A 1V4SA 1GLAG 4RWTA 4XH4A 3EKSA 3ULEA 2AA4A 4HWIA 2OANA 2A6AA 1K8KA 4QS8A 5EXWA 2H3GX 1DEJA 3GOIA 3P4IA 4BVOA 5BRFA 2YCHA 1NGJA 3ZEUA 1Q18A 4BROA 5ELZA 3UKRA 4BR4A 3A5NC 1RGIA 3VEVA 1ZXOA 1MA9B 2P9LA 3EL2A 5FPDA 2FSJA 1NGAA 3D2EA 3AAPA 5AQJA 3ZX3A 4H5TA 4QS9A 4BRKA 4XEIA 1HKBA 3MCPA 3VEZA 4AM7A 5ADXH 4BRCA 4Y0WA 3CERA 1LCUA 4FWRA 3CETA 1T6CA 1XQSC 3DXKB 4O8KA 1S22A 4BG8A 1NGCA 3HM8A 4WQ4C 3QFPA 1NGFA 2FLOA 3ZETA 1T44A 3HZ6A 4NO7A 3VETA 2DPNA 3H1QA 4CJ7A 2P9KB 5ADXA 1H1VA 5CE3A 1KAZA 5AQKA 2CGJA 1Z6RA 5BPMA 1C0FA 3ZX0A 3L6QA 1U2VB 1ESVA 4K43A 4BQLA 4YDUC 4CBXA 3OHRA 2VWBA 2E8AA 4M63C 4B1XB 1ATNA 2EWSA 2FF6A 1OKJA 1QZ5A 2ASMA 5BREA 1BA1A 2BUPA 4B9QA 3D2FB 4BRDA 3BEXA 1TUUA 4XH5A 4PKGA 1WUAA 2QWQA 3ATVA 3LL3A 1IG8A 5AQVA 1C0GA 4H5NA 5F2RA 3EKUA 2ZGZA 3UKUA 1BWFO 2P9IB 2V52B 4DB3A 2QWLA 3BF3A 4BRHA 3QDKA 3EN9A 3WXKA 1TYQB 3W0LA 4BVPA 4E1JA 2ZWHA 3CHWA 3SMSA 3CJ9A 4EHTA 2NZTA 1HPMA 4PL7A 5AQQA 2Q2RA 4IO8A 3ZEUB 1GLEG 3M3ZA 5BR9A 5AQZA 2PAVA 3MMVA 2QWOA 3UKRB 4BRNA 3M1FA 5AQMA 1NGGA 2FSKA 3KVGA 3QFUA 4BGBA 5B8HA 3D2EB 5AZJA 1NLVA 2D0PA 4MO5A 3U9DA 1TUYA 1NMDA 3O5BA 4H03B 4H0OA 5AFUH 4BR5A 4CI6A 2IVPA 3L0QA 2F9WA 4MO4A 2NLXA 3A5MC 2Q36A 4ISGA 1NWKA 4IXCA 3R6MA 3VGMA 1JCGA 2P9UA 3O1BA 3WUHA 3O80A 3FZFA 3CJCA 5AQOA 3HBTA 3WXJA 5AFUA 4BG9A 4CBWA 2A40A 4FWLA 1X3MA 1XC3A 2E88A 2J4RA 1YAGA 2A3ZA 3ID8A 2YJFA 3ATUA 4JNEA 2QWNA 4FPBA 1SZ2A 1S3XA 4CZKA 1ATSA 2ASPA 4H5VA 3VEWA 3C7NA 5BPLA 2VYPA 3IUCA 5AQFA 5F1XA 2Q0UA 3LDPA 3IDHA 5F0XA 2E1YA 1GLDG 4CZFA 4IWVA 3I8BA 2E2OA 1T6DA 4A62A 3LM2A 3FLCO 1RDWX 4BC3A 3FZLA 4FWNA 1NBWA 4K41A 4BC2A 4O5FA 4BQZA 1KAYA 5FPMA 1GLLO 4HTLA 4B1YB 4BR2A 1NGEA 5AQTA 1RFQA 3U9ZA 5AZIB 3DWLA 1E4FT 4H0YB 1SAZA 3VOVA 3VGLA 3A0IX 2YI1A 3O4WA 3FZMA 4CZLA 2Q1NA 4QS7A 4A2BA 4BGAA 4FWOA 3FE1A 3DXMB 4FWSA 1G99A 3H1VX 4FL9A 1IJJA 3WEEA 4DCHA 3IMXA 3VENA 4C23A 4MLEA 4FO0A 5BN9A 2P9NA 4FOIA 5AZJB 2E2NA 3QICA 4L3QA 1P8ZA 2CGKA 4WQ5A 4CZEA 1ZC6A 3H46O 3F9MA 2D4WA 5KQDA 4CZGA 2CH6A 2P9PA 2CGLA 3SK3A 3O08A 1BG3A 4IJAA 4H0TB 4BRPA 3FFKB 5I9EB 2A41A 2I7PA 3IFRA 2P9SB 5AQRA 1Y64A 4H5WA 3VF6A 2ITMA 5JICA 5AQHA 5KPRA 4M7YA 4AM6A 4B1UB 3CI5A 4H0VB 3ULEB 2ASOA 5AR0A 2W40A 1K8KB 5EVZA 1NGBA 4JAXA 3D7EO 3CJ1A 3UE5A 4FOEA 1NGIA 3QB0A 3H45C 4B1VA 3UB5A 4PKIA 1GLJO 2QWPA 4BRQA 2D0OA 1KXPA 2P9LB 2YHYA 4H0XB 4A2AA 5LJWA 3DXKA 3FZHA 3O8MA 5EX5A 3L4IA 2YHXA 4CBUA 5TKYA 3QBWA 3VEYA 3HI0A 4A61A 1MWKA 3H3OB 3HTVA 3VPZA 4I6MA 4BR9A 3I33A 4H5RA 4CZHA 3U8XA 5AQLA 3LM9A 3ENHA 1NM1A 2W41A 3C0BA 3ZETB 4BR0A 3WQUA 4PL8A 1Z05A 1KAXA 3WT0A 4CZJA 1JCFA 1YXQA 3AARA 1NGDA 3EZWA 1QHAA 3O1WA 3WXLA 3CQYA 4FWPA 5BRDA 5E26A 3D2FA 4K25A 1NGHA 3A8YA 2V7ZA 3LDQA 1X3NA 2P9NB 2GELA 4JD2A 4JHDA 4WQ4A 4Z94A 1GLFO 3GDQA 1R59O 4BRIA 4BRLA 2E2QA 3A5OC 4BRGA 1BDGA 1X9JA 2P9PB 3AAQA 3H6EA 4CZIA 1GLCG 1TYQA 2FF3B 4BREA 5AQSA 3UKUB 4FPAA 2QW9A 4BRAA 1MDUB 2A42A 5JMVA 1QZ6A 4YDUA 2IVNA 2QWRA 3A5LC 2A5XA 5FPNA 5LY3A 3ZX2A 2VCPA 2GUPA 4M7XA 1YVNA 2E2PA 3J8AA 3LDNA 3R8EA 5KPTA 2YJEA 3SMPA 3ENOA 2E1ZA 1DKGD 1HKGA 4DHYA 5AQGA 3MN9A 2WUSA 2CH5A 5JLHA 3SLCA 3TPQA 4LC9B 5AQUA 2PBDA 3CJBA 2D1KA 3CIPA 3VF2A 3WXIA 3WQTA 5LJVA 3U4LA 2HF4A 5AQPA 1HX1A 3GE1A 4EAHD
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3W3DA 4LF4K 2IVOA 2NRHA 4G9ZA 1LAVA 1CLQA 3O9RA 4CJKA 1RILA 2BTFA 1IKWA 3DYAA 1LOTB 4CECA 4JLHA 4CJFA 2WOMA 1UA0A 3AO1A 4I6MB 1UWBA 4CIGA 1VQ4N 3EY1A 2YKNA 1TAUA 5EY4A 3O9UA 1S1XA 5M1OA 3N4PA 1VHXA 2XY8A 5KRTA 2IIRA 1JLGA 2GEMA 3CFRA 1ZBSA 2QM1A 3SZ2A 2UXBK 1BO5O 5TKWA 5GAEP 2Q3SA 4CHYA 1ZBIA 4CF1A 1X9SA 1XUPO 3LANA 1YJNN 3ZT1A 3O3FA 3C6UA 3S41A 3VEXA 3ZT0A 3THWA 4JD2B 4CJ3A 3KHYA 1UOCA 3QERA 4KO0A 5CY4A 3NHGA 4B9TA 4ELVA 3T69A 1D9DA 4B9UA 2HMPA 3HK2A 3CM5A 1BGXT 5BN8A 1TVRA 1HPZA 1IKXA 4B1ZA 1FKOA 2QKBA 3CQXA 4CE9A 2UYTA 4F9OA 2Q97A 2P9KA 4CF2A 1IH7A 5AQNA 1T7PA 4F2SA 4AF1A 3DXMA 5HBMA 3VQPA 4CHQA 1JLCA 1YT3A 1G15A 3KD5E 3LAKA 4M3RA 3TI0A 2O8CB 4LFBK 4BC4A 3FZKA 3SJJA 2HBKA 4FLYA 4XH1A 4DV5K 3SQ2A 3HSCA 3DLHA 4DR7K 4I9LA 3VERA 3KLFA 1HJOA 2XY7A 1WSIA 1HQUA 3HOSA 4ILHA 4BRFA 2KHOA 1DTQA 2ZE2A 2NRXA 3NGZA 4A59A 3FR0A 4PKHA 1BU6O 4CD1A 3H3NO 4DUZK 2FSNA 1NNEA 1A5WA 5CHIA 1J54A 4CCHA 2AA4A 4HWIA 2OANA 1W9HA 1K8KA 3T7ZA 1EXQA 2H3GX 4NXNK 2FC0A 1NGJA 3J81O 1Q18A 1IO2A 4BROA 4FK2A 4CF8A 4RW7A 3C94A 1NOZA 2VQFK 1ZXOA 2P9LA 3I0RA 4OJRA 1JLBA 1XWLA 3HVRA 5FPDA 1NGAA 3D2EA 4B3RK 5AQJA 1BQMA 4LSLA 4O55A 1X9WA 3MCPA 3KK2A 4AM7A 3J7ZO 2BE2A 4FWRA 2ZD1A 3CYMA 3LAMA 4IEIA 1NGCA 3QFPA 1KQSM 4K8ZA 1SV5A 3VETA 2HHUA 2P9KB 4LFAK 5DK5A 3QIPA 1BCOA 3VQAA 3IG1A 2PY5A 3JAMO 3DRRA 1OVYA 4JI4K 3R1XA 1TKZA 2X6SA 4CF9A 3K5OA 4MQ3A 3TTCA 3VQ6A 4B1XB 2BGGA 4C1NK 2ASMA 5BREA 3D2FB 4DR6K 2P5OA 3VQ5A 5DM6L 3ATVA 3LL3A 5F2RA 1ZBFA 2D0CA 4O4GA 4FM0A 3SUNA 4F3TA 3CCEN 3TSUA 3OYNA 4DQRA 3CHWA 3SMSA 3M8QA 4GW6A 5A2QO 4RW4A 5MLCQ 3F73A 3K5LA 4KTWA 4IKFA 4AILC 4CFBA 4JRQA 2EX3A 1TK8A 4AHTA 4KI6A 2O8BA 4CGIA 3K5NA 4GV6A 2IOCA 3MMVA 2QWOA 1SKWA 1O1WA 1NGGA 1VSJA 3QFUA 5B8HA 3D2EB 4YOXA 2O8DA 1W7AA 2D0PA 4CJRA 2HHHK 4BE0A 4MO5A 3U6FA 1U4BA 5I42A 2JLEA 5C42A 3L0QA 3TAFA 4ISGA 4DTNA 3CCLN 4DV3K 2OPSA 2ATQA 2ZJRL 2P9UA 3WUHA 5AQOA 5AFUA 4BG9A 2ZQBA 3THXA 4FZXC 3SPZA 1YAGA 1L3SA 3KKSA 3Q7CA 4JNEA 2YV0X 3DLKA 3E66A 2ASPA 4H5VA 4DTOA 2VYPA 3AVNA 1LWFA 1SL2A 1BQNA 4JKBA 2Q0UA 1TKDA 4NYFA 4MFBA 5F0XA 3NE6A 2E2OA 1HNVA 4A62A 4IEEA 2W6LA 5J2QA 1NBWA 3PX4A 1Q82O 4BQZA 1VQPN 1S9EA 3WNFA 4HTLA 4B1YB 1NGEA 5AQTA 3L3UA 5AZIB 3V81A 1J5EK 3CM6A 3PV8A 2YX6A 1S1UA 2HNYA 4QS7A 4A2BA 2ZJQL 4OGEA 3SI6A 1VAZA 1D8YA 3KLHA 3BY5A 2O8BB 5GIPA 1N6QA 4QAGA 1XI1A 1NKCA 4GV9A 3AA3A 4O5BA 3MEGA 2P9NA 2E2NA 4HTUA 2O8DB 3VA3A 3THYB 3SBTA 3OW2M 2Y1IA 4DUYK 1K6YA 1WSGA 2FBYA 4GV3A 1WAFA 3T1HK 1VQON 5HRNA 1X9MA 1B92A 1S9GA 3HPHA 3VQ4A 4CHOA 4E19A 3TR8A 4W5NA 4BRPA 3FFKB 5I9EB 4B3OA 1N33K 5H1SQ 3K2PA 2NRRA 4QOZB 4H5WA 2DTUA 2ITMA 4DWIA 4F4KA 4AQYK 3PX6A 3SNNA 4B1UB 3CCQN 3CI5A 1A5VA 5JS2A 1YITN 4C8LA 4KPYA 5AR0A 2W40A 3MWPA 3ZSYA 1WSHA 4FOEA 2HW3A 5J2MA 5T7BA 3H45C 1RDBA 4B1VA 4PKIA 3U3GA 4BWJA 2BDPA 4U67L 2E6MA 4DR5K 1K73O 4H0XB 4A2AA 3DXKA 3FZHA 1VSHA 3MX2A 4IDKA 4CBUA 4N5SA 3VEYA 2Z1IA 2XHBA 5IT9O 3H3OB 4LSNA 2G8VA 2O8FA 2QKKA 3SV3A 1KVCA 3U8XA 3QINA 1NJWA 1RTDA 4KHPK 4FVUA 3HP9A 2G8HA 2W41A 5DM7L 3C0BA 2JWKA 3ZETB 3D6RA 4BDYA 1N34K 2GV9A 3SUOA 4FJ5A 1U48A 1OH8A 1Z05A 1JCFA 2IC3A 4DR1K 1NGDA 3DLBA 3WXLA 2RPIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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