2P9KB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with atp and crosslinked with glutaraldehyde
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
356
structure length
275
Chain Sequence
VVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPSYPMENWDDMKLLTEPPMNPTKNRAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLADI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 69
structure length 275
sequence length 356
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9kB02
3.30.420.520 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9kB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9kB03
3LDQA 3SMSA 3LDLA 1NGIA 4H0PA 3AAQA 4BR7A 3VEVA 2YHYA 1Z6RA 3BUZB 4FWOA 3VF2A 2P9UA 3FGUA 4CZKA 3LM2A 1BG3A 4RTFD 3DXKB 2WUSA 4EAHD 4IXCA 5AQPA 3J8AA 3ZEUA 1U6ZA 3VEOA 3JXUA 3MK6A 3A5MC 4BG9A 2Q0UA 4MO4A 1RFQA 3QFUA 3FE1A 2AP1A 2D0PA 1SAZA 5LJVA 3DJCA 4XH1A 1X9JA 3U9ZA 2Q97A 2F9WA 4MLHA 3BEXA 5ADXH 4IWVA 5TKYA 5AQYA 3VGMA 4H0VB 4IZ9A 2I7PA 2QWQA 3HBTA 3R6MA 2ZGYA 1QQOA 3QICA 1BO5O 1C0GA 1NGFA 3H46O 4FWNA 1ESVA 3RSEB 3DXMB 4B1XB 5EY4A 1TUYA 3CQYA 3D2FA 3W3DA 3KZBA 5EOYA 4BRPA 3M6GA 3WQTA 3FZLA 4BRHA 5KQDA 1NGAA 3P4IA 5AQQA 3CETA 2ASMA 3VETA 2EWSA 2P9LA 3FZHA 1NGBA 2I7NA 4AM7A 4BR4A 2NLXA 4QS8A 5KPRA 3HSCA 5AR0A 1BDGA 1SZ2A 5AQUA 1D4XA 3LDPA 3EKSA 4BC3A 1QQNA 2Q0RA 3KVGA 3G25A 3ID8A 4AM6A 2CGJA 4H0YB 3MN9A 1IG8A 4NO7A 3MCPA 5AQKA 4H5WA 1WOQA 2QWRA 1MWMA 2VCPA 2ZF5O 3HZ6A 3LDOA 3S41A 3M3ZA 3D2EA 5AQSA 4HTLA 4BRMA 5BPLA 1NGJA 4FPBA 2ZWHA 4I6MA 3TPQA 5E84A 1K8KB 1GLJO 1P8ZA 4EHTA 3H1QA 3D7EO 4EIAA 3GE1A 3GL1A 1G99A 4O5FA 2QWOA 1ZC6A 4H0TB 1KAZA 3ULEB 1E4GT 3HM8A 5AZIB 2J4RA 4XH5A 5EX5A 5AFUH 1SQKA 1V4SA 1KAXA 4H5TA 4M7YA 2QW9A 3FLCO 5AQNA 3WXJA 4DB3A 2CGKA 4HWIA 2P9NB 3L6QA 5BPNA 4BR0A 1NWKA 2F9TA 5FPEA 4QS7A 5JMVA 3M1FA 5AZJB 4DCHA 1C0FA 1DGKN 1ZXOA 3GDQA 3ZX2A 4PKIA 4CBXA 3RSEA 1GLLO 3DXMA 2E88A 3A5OC 3WT0A 1BU6O 4A62A 1DEJA 1BOTO 3BP8A 4CZEA 2E1YA 3ENOA 2GUPA 4H03B 5BRHA 4ISGA 4M63C 3A8YA 1JCFA 1QZ5A 3DWLA 3KHYA 2UYTA 4WYBA 3CJAA 1T44A 2E2NA 3MMVA 3U4LA 5BRDA 4CD1A 3I33A 1NBWA 1GLFO 5AQZA 1NGHA 4C23A 1GLAG 2YHXA 3CI5A 5AQJA 3ENHA 2A40A 4K25A 4BC2A 1NGEA 2A42A 3EN9A 1WUAA 2ITMA 2D4WA 5BPMA 3QBWA 3SK3A 2GELA 3O4WA 1HX1A 5LY3A 4FWKA 3WUHA 1K8KA 3AY9A 4IJAA 3FFKB 2QXLA 4BVOA 3ZETA 4B9QA 4IO8A 3IDHA 1XQSC 2D1KA 3VF4A 3HTVA 4CZMA 5AZIA 2AA4A 2V52B 4K41A 4JAXA 2YHWA 1KXPA 3QBXA 3CERA 4H5NA 4CD3A 3CHWA 3LDNA 3LM9A 2FXUA 2P9NA 2CH5A 2E2PA 3I8BA 3L4IA 2E8AA 4A2AA 4ISEA 4JD2B 2P9KB 4JN4A 4L3QA 4BRKA 3CJBA 4J8FA 3FZMA 1RDWX 2IVPA 5AQHA 1LCUA 5JLFA 4IJNA 4CZHA 1J6ZA 5AQTA 2Q31A 3TU5A 3R8EA 1X3NA 3IMXA 4B1VA 4CZFA 3U8XA 1GLBG 3GOIA 4NB4A 2Q2RA 1MWKA 2P9SB 4PKGA 4FWSA 2PBDA 3O8MA 4BRQA 4YDUA 2ASPA 4YDUC 4ISFA 4BRDA 1HKCA 2A3ZA 4BRIA 2GWKA 4FL9A 2Q1NA 3O1WA 3OHRA 3WEEB 2ZGZA 3VEYA 3DXKA 5BREA 1JCEA 2YI1A 5JICA 1BUPA 1H1VA 1ATSA 1YAGA 5AQRA 3VEWA 3W0LA 1TUUA 1U2VB 1X3MA 5AQLA 3ZEUB 4GY2B 3QFPA 3ZX0A 4BRNA 5FPDA 1NGGA 1KAYA 1LOTB 1YVNA 3GBTA 3H45C 4B1YB 4PL7A 3VOVA 4QS9A 5BN9A 4A61A 4H0XB 4GNIA 4CZLA 2BTFA 3L0QA 2A41A 3IUCA 4F9OA 1XUPO 1Z05A 4K43A 5KPTA 3QDKA 3EO3A 1EQYA 5F2RA 5LJWA 5AQGA 3EZWA 2HMPA 2H3GX 3BF3A 4BR2A 2GTDA 5JLHA 4CZIA 5EXWA 3QB0A 3EL2A 3F9MA 3VGLA 2QWLA 1GLDG 2P9KA 3UKRB 1TYQB 3LL3A 3R9PA 1QZ6A 5AQIA 1Q18A 4FWRA 2Q36A 3VESA 3CJ1A 4FWLA 4FWMA 4CZJA 1XC3A 3AARA 2QM1A 3BF1A 5ADXA 1NGCA 2P9IB 4O8KA 1S22A 1CZAN 1HLUA 2QWMA 1IJJA 1ATRA 1E4FT 3ATVA 4JHDB 3VENA 4FOEA 5AQWA 4BC5A 1QQMA 3UE5A 3SMPA 4BRLA 3U9DA 1GLCG 2P9SA 3C7NB 2VYPA 1HUXA 1MDUB 2A5XA 2E1ZA 2YJEA 3O08A 2E2QA 2IIRA 4BREA 1JCGA 3CQXA 2CGLA 3D2EB 1S3XA 2HOEA 4CJ7A 4DQ8A 5BN8A 3WXIA 4I6MB 3WEEA 5CE3A 4BR9A 3ATUA 2NRHA 3VEZA 4CZGA 3ULEA 5ELZA 4DHYA 1U2VA 1NM1A 4EFHA 4FPAA 4FWQA 1NGDA 3O5BA 3CJCA 4EHUA 5F0XA 1BWFO 4CBUA 4BR5A 2QWPA 2HF3A 4A2BA 4CBWA 4BQLA 2NZTA 3HI0A 3JS6A 4MO5A 3MN7A 3UKUB 2W40A 2DPNA 5B8HA 2V51B 3MDQA 3WXKA 2P9PB 4XEIA 1HKGA 1OKJA 2CH6A 1HKBA 1QHAA 4H0OA 2FLOA 1BA1A 3FZFA 4BGAA 5AZJA 4WQ4C 4WQ4A 3WQUA 3MN6A 2FF3B 1NMDA 1T6CA 2V7YA 4PKHA 1MA9B 3VEXA 3H6EA 3VPZA 4Z94A 3VF6A 5BRFA 3VERA 1V4TA 4WQ5A 4WQ5C 4BGBA 1BA0A 5AQXA 4B1WB 4FO0A 4Y0WA 3WXLA 3UKRA 1TYQA 2FF6A 4FSVA 5AFUA 2YCHA 1YUWA 3UB5A 2D0OA 4MLEA 5FPNA 5KQ8A 3B8AX 5EVZA 2OANA 2FSNA 2FSKA 2P9UB 4BRCA 3A5LC 5AQVA 2P9IA 3ZX3A 5AQOA 4M7XA 5AQFA 4RWTA 3SJHA 5I9EB 3CJ7A 1GLEG 3O1BA 2GEMA 4JHDA 4B1ZA 2YJFA 1HPMA 4BC4A 5FPMA 3C7NA 4KBOA 1R59O 5BR9A 2ASOA 4BQZA 3DAWA 1ZBSA 4BRFA 2HF4A 2IVNA 4K42A 2GWJA 2VWBA 4FOIA 4BRGA 3AAPA 4BVPA 4FWPA 4BG8A 4CI6A 4LC9B 4BROA 2BUPA 2V7ZA 4E1JA 1Y64A 1NLVA 3A5NC 3FR0A 3O80A 3ZETB 5F1XA 3MN5A 2FSJA 3C0BA 1DKGD 2E2OA 1T6DA 4H5RA 2A6AA 5E26A 4JNEA 3IFRA 4H5VA 1ATNA 2QWNA 3CIPA 3GG4A 3D2FB 3H3NO 5AQMA 4B1UB 3UKUA 2KHOA 2IVOA 3CJ9A 2PAVA 3QMLA 3VGKA 3O6WA 2E20A 2P9PA 3FZKA 2P9LB 4JD2A 4XH4A 1YXQA 1RGIA 4PL8A 3SLCA 3H3OB 5KPZA 4BRAA 3H1VX 2W41A 1HJOA 3A0IX 3EKUA 4RCHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SMSA 3AAQA 4FLVA 1BI4A 3V81A 3VEVA 2G8IA 1Z6RA 1WSGA 4PY5A 4OX9K 3U6FA 3O4NA 2BE2A 4HUGA 3V1QA 2NRRA 2XO7A 1VQKN 4DTMA 4F4KA 3HRGA 3DLLL 4RTFD 4LF9K 4DUYK 5AQPA 3J8AA 4FJKA 1HJRA 1U6ZA 3MK6A 3AVNA 3PX4A 5IT9O 1HYVA 4CEEA 5M1QA 1ZBLA 3ISNC 4OLAA 3G0ZA 4XH1A 3SAHA 3HJFA 3U9ZA 2Q97A 3B6OA 3F9KA 4B8CA 4IWVA 4E7KA 1WBDA 3LP0A 1LAVA 3DRSA 3VGMA 5M1OA 1WSJA 3V4IA 3NH2A 2QWQA 3HBTA 4FLYA 3LZIA 1VSJA 4GW6A 4CEBA 4LF6K 2Z1GA 1IH7A 3SPYA 4B1XB 1S1UA 1TUYA 3ZT3A 1XNRK 1RBVA 3FZLA 4BRHA 2ZE2A 1I3AA 4EP5A 3DLKA 4AQYK 1NGBA 4CJUA 3OYNA 4AM7A 2NRWA 4E7LA 4FVUA 2NLXA 4EZ9A 1ZBFA 3HSCA 5AQUA 3OBWA 1JLAA 4V19S 1QQNA 2Q0RA 1NJYA 2FC0A 3G25A 4AM6A 1X9WA 4I9LA 4HCBA 4F2SA 1LWFA 5J2MA 4X64K 4G1QA 3K9KA 1NKCA 3J81O 3CM5A 1EWQA 1MWMA 1CZBA 1S6PA 4CEQA 4F3OA 3HZ6A 3K2PA 3AA5X 5AQSA 4CEDA 3AVIA 4BRMA 4IG0A 3HYFA 3VQCA 3Q7CA 5E84A 1K8KB 1GLJO 4EIAA 1SKWA 3GL1A 4ID1A 3AVMA 4OO1J 2BGGA 1N33K 1KAZA 4IEEA 5T7BA 4DFKA 3LZJA 4FJ9A 2J4RA 4XH5A 1Q82O 4M7YA 1JJ2M 2CGKA 3L6QA 5BPNA 1W2BM 4E7IA 4OVLA 4FJNA 2F9TA 4A5AA 2OCEA 3I0RA 1JLQA 3TARA 3RSEA 1GLLO 3DXMA 1YJNN 3A5OC 3TWHA 4Q5VA 5GAEP 3K5MA 1HYZA 4A62A 4H8KA 4CZEA 3AVGA 3DLRA 2GUPA 1HPZA 3A8YA 4OPAA 4JKBA 2E2NA 4C8LA 3CCMN 3CFOA 5BRDA 5A2QO 4RW6A 4DQQA 1N32K 1GLAG 2YKMA 2YHXA 5C0YA 1JL2A 2A42A 1O1WA 4OKKA 2W00A 2ITMA 3BZCA 3VQ7A 4YOUA 4JEPA 4CK1A 3THWB 3QBWA 3SK3A 1HX1A 1D5AA 4FWKA 1WAFA 1ZBHA 3HP6A 2G8KA 1VSDA 4FJIA 4BDYA 3SQ0A 4JV5K 3IDHA 1XQSC 1U4BA 1S1WA 2KW4A 3VQ8A 4J2DA 2YHWA 1FJGK 4H5NA 3SI6A 2FXUA 2P9NA 3KK1A 1NK0A 4DWIA 2WFBA 3NF7A 4JRPA 5GAGP 1IV0A 3RR7A 4L3QA 4CEFA 3PX6A 3CJBA 4HUEA 5I42A 3BDPA 1YF5L 4O4GA 4JKGB 1S5JA 1NNEA 1WNSA 4AHVA 5JLFA 3O9SA 5C2FA 3ZSYA 1J6ZA 3R8EA 1X3NA 1VSFA 2ITGA 4J2AA 3M8QA 3U8XA 3LP3A 1VQ7N 3VQPA 1KD1O 4FWSA 4B9MA 5GINA 1S9EA 4YDUC 4ISFA 4BRDA 3N4QA 1FKOA 3G4SN 2HBLA 4DV6K 1JCEA 1H1VA 4ZHRA 3ZT1A 1XI1A 3VA3A 1X3MA 5AQLA 3ZEUB 4PWDA 3QLHA 3J80O 3ZX0A 1NGGA 1ZYQA 1KAYA 1YVNA 4B1YB 3LPTA 1IKYA 2HHVA 3VOVA 4QS9A 4A61A 1QVFM 3AVLA 4GNIA 4M41A 1XMOK 4F9OA 1Z05A 4X62K 4K43A 1KC8O 5KPTA 5J2PA 3QDKA 4JI7K 1F21A 2NRTA 4JS4A 3EZWA 2H3GX 2YNGA 4X66K 1VQ9N 1Z25A 5JLHA 5HRPA 3O9QA 3DLEA 2ZD1A 3QB0A 3EL2A 3SAGA 4FK0A 4KTWA 2P9KA 3AO3A 3RTVA 3LL3A 4CJPA 1QZ6A 3CJ1A 3AGKA 3EZ5A 3DLHA 4CGFA 2YX6A 3CYMA 3OYCA 1KQSM 3BF1A 5ADXA 3I55N 3V9SA 1S22A 4DV0K 3RR8A 1HLUA 2QWMA 3TR8A 1ATRA 2IS3A 4FOEA 5AQWA 4BRLA 4CGIA 2HSTA 4DTOA 3C7NB 4CFBA 3SUNA 1HQUA 1REVA 3E1YA 2YJEA 1X1PA 2IIRA 3P39A 1JCGA 3D2EB 3JAMO 2P51A 1BL3A 3WEEA 2F96A 4CF1A 3IRXA 3ZT2A 3VEZA 1VRTA 5HBMA 4G9ZA 1WSEA 4FPAA 4NLBA 4FLTA 1NGDA 4Z4FA 5F0XA 3TABA 5C42A 4A2BA 4CBWA 4AHSA 4FJ7A 4HTUA 1RT1A 3TANA 3C6HA 1X9MA 2DPNA 4FJ8A 4FZZA 1QHAA 4HVJA 1IG9A 4WQ4C 3WQUA 2FF3B 4KV8A 4MDAA 1NMDA 5JENA 1CXQA 4M42A 4MFBA 3J7AP 4KH5A 1MA9B 3VEXA 4CJLA 2ZJPL 3VF6A 4WQ5A 1HRHA 4BGBA 1BA0A 5AQXA 4DTXA 3DRRA 3KD1E 2QKKA 1P90A 3C6UA 3N4PA 4C8NA 1J5EK 4Y0WA 4M3TA 3VQQA 1TYQA 1YVUA 1YUWA 3HPHA 4FVMA 1VSEA 4GMJB 5FPNA 5KQ8A 1VSMA 4B9VA 3DLBA 5AQVA 2P9IA 4IEIA 3K57A 4M7XA 3ASMA 3P1GA 3SJHA 4B3SK 1VSKA 3ZSOA 1C1BA 4DSFA 2OZMA 1A5WA 1R59O 4CJEA 2HF4A 2IVNA 4K42A 4FOIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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