2Q1NA

Actin dimer cross-linked between residues 41 and 374
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
369
structure length
345
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHLTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Multiple crystal structures of actin dimers and their implications for interactions in the actin filament.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 114
structure length 345
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q1nA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q1nA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q1nA03
3JS6A 2VYPA 2E1ZA 1X9JA 4FWRA 3AAPA 3MK6A 3FZKA 3QFPA 1XQSC 3UKUB 1NMDA 3CJAA 3WXJA 4CZHA 5FPDA 2DPNA 5AZIB 2GWJA 5AQTA 1ATRA 5B8HA 3R6MA 4M7YA 2YJFA 2P9NB 3ZEUB 3CQXA 2A42A 3O6WA 1BUPA 3D7EO 3A5OC 4BRLA 3CQYA 5EOYA 3M3ZA 4BRIA 3LM2A 5AQIA 1HUXA 1RGIA 5LJWA 1YXQA 3S41A 3QBXA 3LDLA 4BREA 4CJ7A 2F9TA 1Q18A 2D4WA 4E1JA 1BU6O 4BRCA 2A6AA 4BRGA 2FXUA 5AQOA 2I7PA 4DB3A 2VCPA 1WUAA 4MO4A 4CZEA 3I8BA 3KZBA 5JMVA 3CIPA 3H6EA 1HX1A 3BEXA 3ZX3A 5AQPA 5KPZA 5JLHA 5EX5A 1RDWX 2BUPA 3I33A 4FO0A 5BREA 4BRFA 5I9EB 4H0XB 2CGJA 3A5LC 4BROA 3CJCA 2CH6A 1MDUB 4BVPA 2E2NA 2EWSA 1SZ2A 3U8XA 4FWOA 1ZXOA 4BQZA 2Q0RA 3CJBA 4H5VA 2YI1A 1HJOA 2NZTA 3EO3A 3VGKA 4HWIA 4CBUA 4DCHA 1NM1A 1NWKA 5ELZA 2PAVA 2ZWHA 4BC2A 2V52B 4B1ZA 1IJJA 5AQRA 2P9LA 1BO5O 4IJAA 5F1XA 2WUSA 4BRQA 3GE1A 1QQOA 1QQNA 1X3NA 5AQSA 3SJHA 2P9PA 2GWKA 2FSJA 4EFHA 3UKRB 3F9MA 3H3NO 4BRPA 4FWPA 4ISGA 3MN9A 4Y0WA 2ITMA 1GLAG 1HPMA 4ISEA 3TU5A 3W0LA 1NGBA 3EN9A 3LL3A 3VF4A 2P9IA 4JN4A 3GL1A 4O5FA 4BR0A 1JCGA 1JCFA 4H5TA 1S3XA 1QZ6A 2I7NA 1QQMA 4JHDA 4H0PA 2CGLA 1H1VA 2IVPA 3O1BA 3O5BA 4FWLA 3D2EA 4JAXA 3FZLA 2Q0UA 3RSEB 4XH5A 4PL7A 2E1YA 1T6DA 1DKGD 1BA0A 2E2QA 4PL8A 3VGLA 1YVNA 3FLCO 1TYQB 3QB0A 5EXWA 4EHUA 2Q97A 1BG3A 2HF3A 4DHYA 2F9WA 1U2VB 4BRNA 4BR9A 5AQYA 2H3GX 3BF3A 2P9KA 5AQVA 2J4RA 3VGMA 1WOQA 1J6ZA 5BR9A 4FWSA 1XC3A 2FSNA 4FSVA 4K41A 2W41A 3ZX2A 1EQYA 4K42A 4BGBA 2CGKA 2P9SB 4MLHA 5TKYA 2FLOA 5KPRA 2IVOA 3ULEB 3FFKB 3KHYA 1BOTO 1NGHA 2E20A 4M63C 5CE3A 2A3ZA 3SK3A 2IVNA 2ASMA 4B1VA 4FOIA 5AQJA 5AZIA 5KQDA 4IWVA 4QS9A 2ZF5O 2A41A 5LY3A 4BRHA 3HM8A 5AZJA 5BPMA 3C7NB 2P9NA 4BR4A 4H5NA 5BRHA 1BA1A 4YDUC 2FSKA 2A5XA 2Q1NA 3D2FA 4L3QA 4IO8A 5KPTA 3HZ6A 4CZJA 1Y64A 2GEMA 4A2BA 3LDQA 5AQKA 5BRDA 3EL2A 4FPBA 4BR2A 4FL9A 3GBTA 4WQ5C 4MLEA 1HKGA 1X3MA 3FZFA 3SMPA 1K8KB 4IZ9A 3VF6A 2P9UB 2QWOA 3H45C 3HSCA 5JICA 1NGEA 4H0YB 3U4LA 3WUHA 4FWNA 1MWMA 3FR0A 3VETA 3IFRA 3L4IA 3CJ9A 4J8FA 4H0TB 4A61A 4BVOA 4EHTA 1MWKA 1XUPO 3H1QA 3VEOA 4CZLA 1KXPA 2FF3B 2ZGZA 4PKHA 3QDKA 3A8YA 3O4WA 4RCHA 2YJEA 2YHWA 3O8MA 1LCUA 1ZC6A 4PKIA 3U9ZA 3DXKA 5AQHA 2CH5A 5EVZA 4RWTA 3WEEB 3VEYA 4XEIA 1GLEG 2A40A 2NRHA 3UKRA 5BPLA 3VPZA 4EIAA 3H1VX 4H0VB 4CD1A 3FGUA 5BPNA 4AM6A 2AA4A 5BN8A 2QWRA 4BC5A 4BGAA 3LDOA 5F0XA 3ATVA 3ZETA 4I6MA 1KAYA 4IJNA 4H5WA 2QWLA 1C0GA 3IUCA 3UB5A 4BG9A 3VERA 3B8AX 5EY4A 3FZHA 3VF2A 2E2PA 1OKJA 1Z05A 1LOTB 2ASOA 3A0IX 1ESVA 4B1WB 3WQUA 4JNEA 4XH1A 4H03B 3FE1A 5AR0A 1P8ZA 3VEZA 4XH4A 3GOIA 1SQKA 1Z6RA 4K25A 3ULEA 2W40A 1G99A 2Q2RA 4CZIA 2V7YA 4FPAA 1GLCG 1GLFO 5AQUA 3VENA 4JD2B 2QWNA 1NGJA 4KBOA 4EAHD 4ISFA 1TUUA 2FF6A 2E8AA 1JCEA 4WQ5A 2GTDA 4CBWA 1S22A 4MO5A 3ENHA 2P9PB 4BR5A 1V4TA 1BDGA 1IG8A 4RTFD 3WQTA 3DXMB 3AARA 3DJCA 4CZFA 2V7ZA 1HKCA 3UKUA 5AFUH 1KAZA 4JHDB 4FWMA 3MDQA 5F2RA 2HOEA 3VOVA 1K8KA 3CHWA 1KAXA 3H46O 2IIRA 1NGCA 2P9UA 2HMPA 3ZEUA 1NGDA 4CZKA 4B1YB 1NGIA 2QW9A 3SMSA 4BRAA 5ADXH 3WXIA 2QM1A 1QHAA 2P9KB 3R8EA 2HF4A 3IMXA 4CD3A 4BRMA 4F9OA 5LJVA 1NLVA 2UYTA 2E2OA 3C0BA 3MN6A 4HTLA 4BQLA 3CETA 3R9PA 1ATSA 2D1KA 2YHYA 5E84A 1T6CA 4BG8A 1HLUA 3ENOA 3O08A 3O1WA 3QBWA 3VESA 3VEVA 5AQXA 1E4GT 1NGFA 3CI5A 4B1XB 2E88A 1MA9B 3WEEA 2Q31A 3VEXA 1E4FT 5AZJB 1C0FA 2ZGYA 5E26A 4WQ4C 1D4XA 3MN5A 3GDQA 1NGGA 3D2FB 2OANA 5ADXA 5BN9A 3BP8A 3CJ1A 4CZMA 4PKGA 4BRKA 4BC4A 2QXLA 3MCPA 3HI0A 3HBTA 4WYBA 4Z94A 4QS8A 4FOEA 4H5RA 3ATUA 1BWFO 2D0OA 4BRDA 4NO7A 3P4IA 3J8AA 4GY2B 5AQNA 3CJ7A 2YCHA 1GLLO 1TUYA 3SLCA 4CBXA 3RSEA 2AP1A 3FZMA 3EZWA 3QICA 4DQ8A 5AQGA 2QWMA 3M6GA 3EKUA 1TYQA 3LM9A 3WXLA 1U2VA 2YHXA 1R59O 3W3DA 4GNIA 3U9DA 3L6QA 4O8KA 3LDNA 1T44A 4JD2A 4IXCA 2PBDA 2QWPA 3QFUA 4B1UB 3DXKB 3JXUA 1GLJO 3WT0A 3HTVA 3QMLA 3ID8A 5KQ8A 1YUWA 2P9SA 1YAGA 3EKSA 4NB4A 4YDUA 1SAZA 3AAQA 3DXMA 5AQMA 3DWLA 2VWBA 1GLDG 4A2AA 3TPQA 5AQWA 3DAWA 4B9QA 4C23A 2QWQA 3KVGA 2P9LB 5BRFA 3C7NA 2BTFA 4FWKA 2GUPA 3LDPA 3BUZB 3M1FA 4QS7A 4I6MB 3ZETB 4BC3A 5AQZA 2ASPA 5FPEA 3BF1A 2GELA 2NLXA 5AQFA 4LC9B 2V51B 5FPMA 2P9IB 3A5MC 4AM7A 1U6ZA 3CERA 3WXKA 1ZBSA 3D2EB 1DGKN 3GG4A 4A62A 3ZX0A 2D0PA 1V4SA 3MMVA 3H3OB 3O80A 3VEWA 1NBWA 4WQ4A 4CI6A 4K43A 3A5NC 5AQLA 5AFUA 4M7XA 2Q36A 4H0OA 3G25A 2KHOA 1CZAN 3L0QA 4BR7A 3IDHA 3OHRA 4FWQA 5AQQA 1ATNA 1GLBG 1QZ5A 1DEJA 4CZGA 3UE5A 3MN7A 1NGAA 5JLFA 3AY9A 1RFQA 1HKBA 5FPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JS6A 3VA3A 3S3NA 2E6MA 3MK6A 4KTZA 3QFPA 1SL1A 3VQEA 3KK3A 3M8SA 5FPDA 4OKKA 2ZQBA 2KTQA 1RDBA 4O8UA 1TGOA 4C8KA 4DTXA 1ATRA 5B8HA 3CYMA 4DS4A 5GIOA 3S5TA 2A42A 3D7EO 2RPIA 1LV5A 1LAVA 1JXBA 3CQYA 5EOYA 3I55N 1J53A 3OYGA 4DSLA 5AQIA 3SAFA 1RGIA 5LJWA 1YXQA 3S41A 3H08A 3LDLA 2F9TA 4DLGA 4Y1CA 1TKDA 2RF2A 4BRGA 5AQOA 2G8HA 4DB3A 4IEEA 3P31A 2ZJRL 5JMVA 2FBTA 3H6EA 1HX1A 4GVMA 2WC9A 5KPZA 5HRRA 5BREA 4H0XB 1I94K 1KLNA 3VTHA 4BROA 4RW9A 4NYFA 2E2NA 2HVHA 4BQZA 1ZXOA 3AVFA 3AO2A 4LF5K 2YI1A 1B9DA 1HJOA 3EO3A 3VGKA 2VG7A 3EZ5A 2BE2A 3VN5A 1XMOK 1IJJA 2Q3SA 3C6HA 4IJAA 4YY3K 4W5NA 3EYZA 3GE1A 4F3TA 2G8WA 2P1JA 2P9PA 1KFDA 4LY7A 3F9MA 2HNYA 3E9OA 3H3NO 4FWPA 3QEWA 3TU5A 4Y0WA 2F7TA 4DWIA 4KV8A 1NGBA 3EN9A 4IDHA 4JI5K 3F2KA 4BR0A 3CFRA 4IFEA 4H5TA 3AVCA 1N6QA 1QQMA 3HT3A 3O5BA 4FWLA 2RHKA 3RSEB 1W9HA 4CFCA 3CCVN 4DV3K 3TR8A 4PL7A 3AA2A 3K59A 4OO1J 4PL8A 4B8CA 1NKBA 4IOAL 3QB0A 5EXWA 2Z1HA 4JRQA 4FXDA 2HF3A 4O44A 4DHYA 5HOOA 2F8TA 3AVBA 4NCAA 3L2RA 2P9KA 5AQVA 1C1CA 1VQON 1A5XA 2KW4A 1XC3A 4E1NA 3VTIA 4I2QA 4K42A 4BGBA 2OPPA 5FROA 4JKCA 4MLHA 4CJSA 4AHSA 3KHYA 3DLEA 3KJVA 2ITGA 3QESA 4KFBA 3ZSZA 3O9QA 2A41A 5LY3A 4BRHA 1RCHA 3L2WA 3HM8A 1IBLK 4EZ6A 1BA1A 5CYMA 3AGKA 3CM5A 1KCFA 2UU9K 1ZBFA 2GEMA 3LDQA 4XJXA 1TL1A 3V1RA 3NFAA 3GBTA 4WQ5C 1NK7A 1HKGA 1X3MA 2B6AA 3VA0A 1JL2A 3OYKA 5FLXO 4Y1DA 1VSKA 5JICA 5MLCQ 3WUHA 3OS2A 1MWMA 3IFRA 3CJ9A 4J8FA 4CK1A 4A61A 1HPZA 1XUPO 3VEOA 3KD1E 5DMRA 3PSIA 2O8DA 3HL8A 3T7ZA 4J2BA 2HHXA 4UQGA 1LAWA 2YNFA 4DR6K 2YJEA 1BI4A 3PO4A 4B8AB 3AA4A 3KD5E 1XMQK 4C8NA 2CH5A 4RWTA 3WEEB 3VEYA 3ZSRA 1RBUA 4XEIA 1OH6A 5C2FA 3EE9A 2JLEA 1ZBUA 3LZIA 3DYAA 4JI7K 3RR8A 1VRTA 4BGAA 4YORA 3AVLA 1RDUA 3ZCMA 2G8IA 1N36K 4WE1A 3ATVA 3ZETA 4I6MA 3TAGA 4K0KK 4H5WA 2QWLA 3IUCA 3UB5A 5LMNK 3WNGA 4CJVA 2HBKA 3THWB 1L3SA 1SL0A 4CEFA 5GINA 1Z05A 4LF6K 2IS3A 1S6PA 3QEIA 4JNEA 3F73A 4H03B 1XHXA 4X62K 4HTUA 1QVGM 1REVA 4CEDA 3GOIA 4BEBA 3ULEA 3SCXA 1GLCG 1Z25A 2XY6A 4WFNL 4M3YA 4N47A 2VG6A 4IO9L 5KRTA 1TUUA 2E8AA 1BCOA 3LAKA 4MO5A 4CJPA 2P9PB 2WOMA 1IKXA 3CG7A 2ZE2A 4M41A 1V4TA 1BDGA 4JKBA 4Q5VA 4PQUA 2C1GA 4I9LA 4U7BA 3WQTA 4OLAA 3DXMB 3AARA 3DJCA 3UKUA 1NJIO 1Q86O 4DTRA 4KPYA 3OW2M 2HOEA 4GKJK 1RDDA 1IKYA 3P39A 1KAXA 3H46O 1NGCA 2P9UA 4A5BA 3RMDA 1NGIA 1WSEA 5ADXH 2GUIA 3TAEA 2HBJA 2YKMA 3WXIA 4DV4K 3R1XA 1SV5A 3ZSYA 2OPQA 4LSLA 2P9KB 4OGCA 5JVGL 2OPRA 3WNFA 1NLVA 5M1NA 3MN6A 5EU7A 2YHYA 2Z1GA 1T6CA 4BG8A 1HLUA 3ENOA 5CR4A 3O1WA 1QVFM 3QBWA 3VEVA 2D0CA 3TAPA 1RILA 1E4GT 1NGFA 3CI5A 1RDCA 1HNWK 5CZ1A 2ZJQL 5GAHP 2DFHA 2W6LA 4NLCA 4LFCK 2QK9A 5E26A 1D4XA 4W5RA 5C0YA 4KH5A 3BP8A 3SYZA 2FC0A 2KKZA 4CJUA 3PX4A 4Z4EA 3MWPA 2NRWA 3VQ5A 3HI0A 3OYHA 2D0OA 4BRDA 1EX4A 1NKEA 2XHBA 4GY2B 4DQQA 1TAUA 1EWQA 1GLLO 4GMJB 2B5JA 4CBXA 4DTPA 4YOUA 4IOXA 3IKMA 1F21A 2YHAA 3EZWA 4TSXA 4DQ8A 2QWMA 3PO5A 3M6GA 1IV0A 3G10A 4FJIA 3EKUA 3LM9A 4KO0A 1BIZA 3WXLA 4DSJA 2YHXA 1XI1A 1R59O 4CHZA 1IO2A 1HR0K 5CHIA 2PYJA 2PBDA 2ATQA 3E1YA 1VSMA 1BQMA 4Z4IA 3JXUA 1GLJO 3K5MA 2BANA 3T1HK 4KREA 3T69A 3LPUA 3HTVA 3QMLA 4E7IA 1CXQA 4YOTA 3OS1A 2DFEA 2P9SA 1YAGA 4MDAA 4NB4A 3V9SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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