2Q1NA

Actin dimer cross-linked between residues 41 and 374
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
369
structure length
345
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHLTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Multiple crystal structures of actin dimers and their implications for interactions in the actin filament.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 114
structure length 345
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q1nA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q1nA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q1nA03
4BRPA 2QWNA 3M3ZA 4A2BA 3CJ7A 2HF4A 2E8AA 3AAPA 3CETA 1KAYA 1T6DA 5ADXA 2P9SB 5FPEA 3C7NB 3BF3A 4GY2B 3AAQA 3UKUB 5AQOA 1BO5O 2OANA 2P9NB 3MN5A 5BREA 3VEXA 5KQDA 1JCFA 1U2VA 2E2NA 2PBDA 5EVZA 1TUYA 4BG9A 3CI5A 4AM6A 2E2PA 2ASPA 4ISEA 4FO0A 3VF6A 3KHYA 5F1XA 3GDQA 1TYQB 2P9UB 4IJAA 5BN9A 1KAXA 2NZTA 4BC5A 3LDQA 5EY4A 3ZETB 4BRHA 2FSJA 4M7YA 3I8BA 4QS9A 2D1KA 5EX5A 4H5TA 3EL2A 3DJCA 3FR0A 1WUAA 2NLXA 1E4GT 3U9ZA 3MN7A 4FWLA 1NGEA 3VF2A 4QS7A 3A5OC 3DXKA 5TKYA 4JD2A 3WQTA 2CGJA 3UKRB 4B1WB 4I6MA 2A41A 2D0PA 1DKGD 2J4RA 4B1XB 1HPMA 1S3XA 4FL9A 4H0YB 4FPBA 5AQXA 4A62A 4H0PA 4CZFA 4BC4A 3ID8A 1HJOA 3DXMA 4EAHD 1DEJA 3LDLA 1U2VB 3VPZA 4CBUA 4BRKA 4DB3A 5AQSA 2QXLA 3CQYA 1RFQA 1HKBA 1YUWA 2H3GX 4WQ4A 1MA9B 2IVNA 4PL8A 4CD3A 1U6ZA 3CQXA 3RSEB 3EKUA 3A5MC 2QWQA 5FPNA 4FWKA 4BRLA 4JN4A 4CZHA 3CJ1A 2FLOA 4NB4A 4O8KA 2UYTA 3O80A 4IWVA 4CZEA 4GNIA 3QBXA 4H5VA 4JD2B 4ISFA 5FPMA 4B1ZA 4CI6A 1QQOA 4I6MB 4FWOA 5AR0A 2WUSA 3CJCA 4K41A 1V4SA 4WQ4C 4BC2A 4H5NA 1OKJA 3H6EA 1NGBA 5ELZA 1GLJO 2IVPA 3UB5A 4FPAA 3DXMB 4WYBA 3EN9A 1C0FA 4IJNA 1ATSA 3G25A 1MWKA 3H1VX 1NGGA 4B1YB 1X9JA 4EHUA 5AQWA 1BWFO 1GLFO 1V4TA 3KVGA 3H3OB 1NLVA 2CH5A 2Q0UA 3LDNA 3W0LA 1BA0A 1QQNA 2YI1A 4A61A 2Q0RA 2A42A 2E2QA 1WOQA 3CJ9A 3MMVA 1HUXA 3ULEA 4BQZA 2QWMA 5ADXH 2V51B 4H0XB 3O4WA 1ATNA 3O5BA 4BR9A 2KHOA 2HOEA 3TU5A 2I7NA 2E2OA 4H0OA 1R59O 3BP8A 3VEVA 5KPZA 1NBWA 2P9KA 5LY3A 1BDGA 1NGJA 3FZLA 3CJBA 3MCPA 3R8EA 2Q2RA 4K25A 4DCHA 4AM7A 1GLCG 4B1VA 3IMXA 4BRAA 1HLUA 5F0XA 1ATRA 5B8HA 1ZC6A 2W40A 2Q36A 3JS6A 3L0QA 4RCHA 4BGBA 2DPNA 1Q18A 3MDQA 1XC3A 3U8XA 5CE3A 2FXUA 5AQTA 1GLAG 4PKIA 3GBTA 4CD1A 1BU6O 3CJAA 3ULEB 2GUPA 3AARA 4FWSA 3FGUA 3EZWA 4CZJA 5KQ8A 3FFKB 3GG4A 1NGFA 1ZBSA 4O5FA 4BR4A 3ZX3A 1H1VA 5BPLA 2ZWHA 4BR7A 3WT0A 3QFPA 3SK3A 1QHAA 4CZGA 1NGAA 1S22A 4YDUA 2P9KB 2ZGZA 1T44A 3FE1A 1SZ2A 3ZX2A 5E84A 2GEMA 1MWMA 4Z94A 3VF4A 1KXPA 4PKGA 4BC3A 1Z6RA 2V52B 1BUPA 4A2AA 3EKSA 3DAWA 4XH5A 3ENOA 3ATUA 5JLHA 1GLEG 5E26A 2ASOA 3IFRA 3J8AA 4JNEA 3LL3A 4EIAA 2P9LA 4H5RA 3IDHA 4BR5A 5AQVA 3A8YA 1J6ZA 4YDUC 3JXUA 2E88A 1QZ5A 2QWOA 3BUZB 3BEXA 3QBWA 1TUUA 2AP1A 2YCHA 2YHYA 4Y0WA 3O8MA 3M1FA 3A5NC 3DWLA 3D7EO 1XQSC 3ATVA 2HMPA 5BPNA 4H0TB 2GTDA 3KZBA 3DXKB 3GE1A 2D0OA 2P9IA 1NMDA 1Y64A 1GLBG 2FSKA 1QZ6A 4CZMA 1HX1A 3QMLA 4K42A 2VWBA 1YAGA 3M6GA 2IVOA 1LOTB 4KBOA 4BVPA 4RTFD 3B8AX 3EO3A 2QM1A 4BRMA 5AQMA 5BPMA 1X3NA 1C0GA 4BVOA 3OHRA 1SAZA 3O08A 4CBWA 4CBXA 2FSNA 4LC9B 3WXKA 2ITMA 1LCUA 3O1BA 4PKHA 4MLHA 3FLCO 3WUHA 5BN8A 5AQFA 2P9LB 2Q31A 5AQYA 3VEYA 4L3QA 5EXWA 3HZ6A 4BREA 1IG8A 4CZIA 4BRGA 3U9DA 1NGDA 1ZXOA 5BRDA 4FWQA 3H46O 3S41A 3BF1A 5LJVA 3HM8A 3WEEA 5JICA 3MN9A 3H45C 2A3ZA 4HTLA 4BRNA 3VETA 2P9IB 2EWSA 1GLLO 1BA1A 3CHWA 3VEWA 4CZKA 5AFUH 1YVNA 3D2EA 3HI0A 5AQJA 3QFUA 4WQ5C 4CZLA 4H03B 1JCEA 4RWTA 2ZGYA 2ZF5O 2Q1NA 3VERA 2AA4A 3H3NO 3O6WA 5AQPA 1XUPO 4XH4A 3R9PA 1NM1A 3LDOA 4XEIA 2I7PA 3O1WA 4HWIA 1BG3A 5AFUA 2V7YA 3QB0A 1HKGA 4PL7A 4M63C 4DHYA 5EOYA 2Q97A 5AQIA 3UKRA 5AQZA 2D4WA 5BR9A 4J8FA 2GELA 2A40A 4C23A 4H5WA 2YHWA 3WEEB 3WXLA 4E1JA 4BGAA 3FZMA 4XH1A 5KPTA 3SMPA 4M7XA 3SMSA 4BRCA 1ESVA 4NO7A 3D2EB 1HKCA 1YXQA 1CZAN 1BOTO 1QQMA 2FF3B 3QICA 3RSEA 5BRFA 2F9TA 3LM2A 3C0BA 5AQGA 2VYPA 3IUCA 4BQLA 2PAVA 1DGKN 2QWLA 4BRQA 3A5LC 3ZEUA 5I9EB 1JCGA 2QW9A 3A0IX 3WQUA 3HBTA 1P8ZA 4FSVA 3CIPA 5AQRA 5LJWA 2E1YA 1KAZA 2BTFA 3U4LA 4MO5A 3VESA 2CGLA 2YJEA 5KPRA 1RGIA 5AZIA 3MN6A 4MLEA 3FZFA 1D4XA 2YJFA 3UE5A 1IJJA 3FZKA 3FZHA 3AY9A 4FOIA 4JHDA 2CH6A 2QWPA 4FWMA 3QDKA 3ZX0A 4BR0A 4QS8A 4B1UB 1EQYA 2CGKA 2A6AA 3LM9A 3GL1A 5AQHA 3TPQA 4MO4A 4FWRA 2VCPA 2E1ZA 1NGIA 2A5XA 4FWPA 5AQQA 3H1QA 5AQLA 1RDWX 4EHTA 1X3MA 3SJHA 3D2FA 4IXCA 3VOVA 1K8KA 3CERA 3ZEUB 3L6QA 4F9OA 2ASMA 3LDPA 3HTVA 3F9MA 2IIRA 5BRHA 2P9PA 4CJ7A 4IO8A 3VENA 3GOIA 3L4IA 3I33A 5AZJA 5FPDA 3MK6A 4WQ5A 4FWNA 2W41A 5AQUA 5AZIB 4BR2A 3HSCA 3VEZA 2E20A 3R6MA 2P9SA 3C7NA 3P4IA 5F2RA 2GWJA 1G99A 3VEOA 4BRIA 3ENHA 3UKUA 4JHDB 3VGLA 2FF6A 2QWRA 2P9NA 1T6CA 5JLFA 5AQNA 1MDUB 4BRFA 2GWKA 4B9QA 4IZ9A 2HF3A 1NWKA 1Z05A 3VGMA 3WXIA 3SLCA 4BG8A 3D2FB 4BRDA 3VGKA 1TYQA 2P9UA 2V7ZA 4BROA 1SQKA 4EFHA 4JAXA 1E4FT 1K8KB 4ISGA 2BUPA 2NRHA 4FOEA 3ZETA 2YHXA 5JMVA 3W3DA 2F9WA 1GLDG 2P9PB 3WXJA 5AQKA 1NGHA 4K43A 5AZJB 4H0VB 1NGCA 4DQ8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2I5JA 3DLGA 3M3ZA 3F73A 5I3UA 2IDOA 3MWTA 4CIEA 4LFAK 1X1PA 1LAVA 4HTUA 3C7NB 4BWMA 3TSUA 3S5TA 4BE7B 4FVUA 3OYLA 1LW2A 3G4SN 4FZZA 1BO5O 5BREA 3MN5A 3VEXA 4AILC 1RT1A 2PBDA 3C6UA 5EVZA 4GVEA 1X9SA 3CI5A 4CEAA 3IS9A 2ASPA 3K9KA 4ISEA 4JK7A 5M1FA 4AHSA 2B4JA 5F1XA 3V1OA 1QSYA 1TYQB 3CPWM 2JGUA 4Y1DA 4LSLA 5BN9A 4DQSA 2NRZA 1VQ7N 2HHXA 3HXMA 3LDQA 4O4GA 5EY4A 4FW1A 4AHRA 4WFNL 3OS2A 2D1KA 3LWMA 3EL2A 4JI8K 3DJCA 2O8FB 3LANA 3P39A 3VQ6A 1NGEA 3VF2A 4QS7A 3NF6A 4JD2A 1I3AA 1W0HA 2CGJA 3UKRB 1T05A 4FL9A 1VSLA 4FPBA 4A62A 4H0PA 3LPUA 4BC4A 1ASUA 3RVCA 4EAHD 4BRKA 5AQSA 3C65A 4OX9K 1RDDA 4NCBA 1D9DA 1N33K 1HKBA 1YUWA 4IBNA 3WXMB 3OY9A 1NJWA 3ZSRA 3HSTB 1U6ZA 1U45A 1OH6A 3A5MC 1FJGK 3L2WA 1Q86O 3SUPA 3SQ0A 4JN4A 4LF6K 2NRXA 4CZHA 4NB4A 4NYFA 3OYMA 4YORA 4B8AB 2HHUA 4KAZA 2Q3SA 3AGKA 1VSDA 4JD2B 5FPMA 4CI6A 1QQOA 3PLAA 3T3FA 1KD1O 3TTDA 4BC2A 4H5NA 4KH5A 3H6EA 4FPAA 1NJIO 3AVJA 3ZSZA 2OTJN 3H1VX 1MWKA 3HVTA 3THXA 1X9JA 4EHUA 5LMNK 2OPQA 1BWFO 1GLFO 3VA3A 2GUIA 3W0LA 1BA0A 1QQNA 4CW7B 4A61A 4JS4A 4FJHA 5C2FA 3CM6A 1CXQA 3E9PA 3MMVA 3HP6A 4HCBA 4I2PA 2YKNA 4DKWA 1FW6A 3CC2N 3K58A 1VQMN 3DRRA 4ID1A 4H0OA 3DRPA 4RW9A 4F8RA 5KPZA 2P9KA 5LY3A 3U6FA 1TKXA 3R8EA 2Q2RA 1IO2A 4EZ6A 3OS1A 2QA4N 3CCEN 3CCLN 3LP2A 4B1VA 1S1VA 2OA8A 1ZBFA 3TAMA 3PX6A 3VQ8A 4KI6A 2QEXN 3IG1A 1ZC6A 3AVMA 1WNSA 3MECA 3THXB 3L0QA 3E1YA 5KGWA 2HNYA 4CHOA 3U8XA 3VQAA 4BACA 5C0YA 3J7AP 1LWCA 1GLAG 3RRGA 3AA3A 3CJAA 1QQCA 2GUPA 4FCYA 4IEEA 3HYFA 3O9TA 1A5VA 5KQ8A 4CK3A 3CC4N 3HK2A 3ZX3A 4BR7A 3WT0A 3SK3A 3OA9A 4DTJA 2P9KB 2ZGZA 1NK8A 4FJ8A 1WAJA 1T44A 1BGXT 1SZ2A 1JKHA 1RDCA 4CJWA 3VF4A 3T19A 4JRPA 4JKAA 1BUPA 1VSIA 3VQ4A 3DM2A 1VQ4N 4I7FA 2W00A 4CF0A 4CJVA 3LPTA 3AO2A 5E26A 2ASOA 3THWA 3AVBA 4JNEA 3NAEA 3IDHA 3I56N 3A8YA 1C1BA 3VN5A 5GAHP 3K57A 5C15A 4YOXA 1Q9YA 4IFVA 3V1RA 1XC9A 3BUZB 2FBXA 1OH7A 1XNQK 3V9ZA 3NMUA 4AQYK 3A5NC 4J2BA 5KGXA 5AJ3K 3L2RA 1SUQA 4X65K 1K6YA 3SUQA 3PX0A 4H0TB 2UUAK 3HVRA 4LF4K 3DXKB 4FLWA 1QZ6A 4CZMA 3NFAA 3RR7A 5GAEP 2YKMA 2VWBA 3M6GA 2IVOA 2AJQA 4JI0K 2QM1A 4YOUA 1YTUA 3MCAB 5AQMA 1U48A 5HL7L 2XRIA 3OHRA 3NBPA 4C8OA 1SAZA 1TAQA 1M90O 2FSNA 3WXKA 3THWB 1EXQA 1HR0K 4ZHRA 3VEYA 1KVAA 4L3QA 2O8DA 3PIPL 1T3VA 2JWLA 1IG8A 2D0AA 4CZIA 3CCUN 5CY4A 1HPZA 2HB5A 1P90A 2QKKA 4B8CA 5J2QA 4FWQA 3H46O 3S41A 3HM8A 3U3GA 3WEEA 4C8KA 3H45C 4HTLA 4GV3A 1NKEA 4M3WA 2VG5A 3T1AA 1BHLA 1SS6A 4DFJA 4CJRA 1BA1A 3RR8A 3VEWA 1J5EK 3DLLL 2PYJA 4FLXA 1Y97A 4WQ5C 1X9MA 2ZD1A 4DV6K 1LV5A 1WSEA 1XUPO 4YNQA 4FK2A 3V1QA 1NM1A 3CFPA 1LW0A 3VA0A 4DV5K 4IKFA 1ZBIA 5JVHL 1HKGA 5C10A 4PL7A 2O8DB 1KLNA 3ZT4A 5AQZA 3K5NA 2GELA 2RPIA 2YHWA 3WEEB 3KLGA 1QE1A 1WB9A 1VQLN 3C6TA 5IT9O 3F2KA 5KPTA 2NUBA 3VQ7A 1HNIA 3N4PA 4BRCA 4NO7A 4H4OA 4DTXA 1VRUA 1Q82O 3NHGA 1QQMA 3LZJA 4KO0A 2O8CA 2FF3B 5BRFA 3RSEA 2F9TA 2RE2A 3C0BA 1C0UA 5CYQA 2VYPA 3O3GA 3UIQA 2PAVA 1DGKN 2QWLA 4BRQA 3ZEUA 1GOAA 2QW9A 4N47A 3A0IX 3WQUA 1OH8A 4Q5VA 1KAZA 2BTFA 4KPYA 2VG7A 3VESA 2CGLA 5KPRA 3TWHA 1RGIA 4YFUA 3QEXA 2F96A 4CJQA 1VHXA 1JXBA 4MLEA 3CYMA 4Y1CA 4DV1K 3KJVA 1IJJA 4OPJA 4JHDA 2CH6A 4AH9A 3QDKA 1RBRA 3ZX0A 1WN7A 4B1UB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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