2Q1NA

Actin dimer cross-linked between residues 41 and 374
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
369
structure length
345
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHLTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Multiple crystal structures of actin dimers and their implications for interactions in the actin filament.
pubmed doi rcsb
total genus 114
structure length 345
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q1nA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q1nA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q1nA03
4BQZA 4BRNA 4MLEA 3R6MA 5AQJA 4H0PA 1E4GT 1NWKA 4H5VA 1ZXOA 2A42A 1GLAG 5LY3A 5AQYA 1X3MA 3C7NB 2P9KA 2VYPA 4BRGA 4CZHA 1XQSC 4BRAA 5BPMA 4CZEA 2QM1A 2V51B 2V7ZA 5KQ8A 5AQGA 1V4SA 5F0XA 3UKUB 2CH5A 5AQFA 3U9ZA 3ULEB 1ATNA 4IWVA 4CI6A 2E20A 1TUUA 2E8AA 3MK6A 2A40A 4H5WA 5BREA 3A0IX 4DQ8A 4FWPA 4JHDB 4CZKA 3EZWA 3VF4A 3CQXA 3VESA 2P9NB 2D1KA 3CQYA 2W40A 4CD1A 2PAVA 5BRFA 3R8EA 1U2VA 1TUYA 3H46O 1JCFA 3B8AX 3FZFA 1BU6O 4F9OA 2A6AA 3DXKA 4J8FA 4EIAA 1XC3A 1LOTB 4M7XA 1CZAN 3CJBA 4BRHA 4DCHA 3P4IA 1MDUB 4WQ4C 1IG8A 1JCGA 4BRLA 3ZETA 5KQDA 2CGJA 4FL9A 3DXMA 2Q0RA 1NBWA 4XH4A 4XH1A 3O8MA 4H0VB 2E1YA 2E2OA 2FSNA 3HBTA 4AM7A 2NZTA 3ENOA 3MN7A 2ZF5O 1GLLO 2ZGYA 4ISEA 1DKGD 4WYBA 3U4LA 2P9PB 1D4XA 1KXPA 3DAWA 3ATVA 3CJAA 2P9UA 1NGHA 4MO5A 2PBDA 3O1WA 3FR0A 3KZBA 3C7NA 1E4FT 2ASOA 2KHOA 3H3NO 3S41A 3A5OC 4GNIA 3I33A 3UE5A 3SMSA 2ZGZA 4BR4A 3FZHA 5EY4A 3ULEA 3WUHA 2P9SA 1BO5O 2E1ZA 3H6EA 4YDUA 4BRPA 3GBTA 3VETA 1KAYA 2GWJA 1GLCG 1XUPO 2A3ZA 4EHUA 1NGIA 4IXCA 3CERA 4EAHD 3LDQA 4RCHA 1QZ5A 3QFPA 3JXUA 3CJ9A 3VEXA 4JD2B 3U8XA 2FSJA 3AAQA 3QBWA 2P9NA 1YUWA 4BREA 4PL7A 2FLOA 3HZ6A 4BROA 3IUCA 1S22A 4PKHA 3A5MC 5AZIB 3G25A 1NGGA 3J8AA 4CZGA 2GELA 2GTDA 2A41A 5FPMA 3KVGA 4FWRA 4FOEA 3L4IA 1OKJA 3KHYA 2IVNA 3D2FB 1KAXA 4H5TA 4CJ7A 1HKCA 1BUPA 4IJNA 1BDGA 4BRCA 1HKGA 4EFHA 5AQXA 1BA0A 3RSEB 5JICA 5AQMA 1NLVA 4DHYA 4ISFA 4CD3A 4CZIA 4DB3A 3SMPA 3L6QA 3CHWA 4E1JA 4BRIA 3BUZB 4H0YB 2P9PA 5AQVA 2VWBA 1GLDG 5F2RA 1T6DA 1HKBA 3ZEUA 2FF6A 1EQYA 3H1VX 4BR2A 4C23A 1TYQA 1BG3A 1IJJA 1GLFO 2ASMA 4MLHA 3TPQA 4M63C 1T44A 1SAZA 4BVPA 2D0PA 3O5BA 3EO3A 2P9LB 3W3DA 1HLUA 4CZJA 3LDLA 4YDUC 1P8ZA 1NGFA 2P9IB 3JS6A 1YVNA 3ENHA 4FPAA 3WXKA 4BG9A 2ZWHA 4FWSA 4B1WB 3D2EB 3IDHA 4BGBA 4JD2A 5BPNA 1V4TA 3ID8A 4BC3A 4BR5A 4K25A 2Q31A 2Q97A 3FGUA 4RTFD 4BRFA 2D0OA 1RDWX 3VOVA 4BR9A 1C0FA 3C0BA 1K8KB 4WQ5A 3EL2A 1WOQA 5AQNA 3WT0A 4FSVA 5AQWA 3WEEB 5AZIA 4BC2A 4BR0A 2QWMA 3H3OB 4H0OA 5ELZA 1QQMA 4IJAA 2UYTA 1ZC6A 2J4RA 1RGIA 2IIRA 2ASPA 2Q36A 5AQKA 3LM9A 4CZFA 2CGLA 4BC5A 4EHTA 4NO7A 1LCUA 3H45C 4I6MB 3RSEA 3M6GA 4JNEA 4A62A 3O4WA 4XEIA 4A2AA 4BG8A 5BN9A 1MA9B 1Y64A 4H0XB 1Z05A 3TU5A 5ADXA 4FPBA 4CZLA 2OANA 2YJEA 4B1UB 2P9KB 3IMXA 4BGAA 5BN8A 3GG4A 4O5FA 2QWQA 3UKUA 2FF3B 2V52B 2I7PA 5AQHA 2GUPA 3MMVA 3A8YA 3LM2A 1NGJA 3HSCA 1HPMA 1BWFO 1SQKA 2I7NA 4LC9B 4GY2B 4QS8A 5AQTA 4A61A 3O08A 2CGKA 2YJFA 3I8BA 4JHDA 1WUAA 3VGLA 2P9LA 2H3GX 3O6WA 3O80A 1YAGA 4ISGA 2D4WA 4L3QA 1ATRA 3UB5A 3EN9A 1HUXA 2DPNA 3VEWA 3VENA 3D2EA 2Q1NA 4FO0A 4BRQA 2HOEA 4JN4A 4K43A 2GEMA 3WXIA 5BR9A 3L0QA 1MWMA 3BF1A 3ZX3A 4Y0WA 1HX1A 3F9MA 3CIPA 4B1YB 2NLXA 5AZJB 4CBUA 3HM8A 5EVZA 3AY9A 4WQ4A 3WEEA 3VERA 4PKIA 3WXJA 3VEOA 3DXMB 5AQPA 4A2BA 3VEVA 3GOIA 3VF2A 3UKRB 3OHRA 5BRDA 2F9WA 2GWKA 4KBOA 4QS7A 5AQQA 3VEYA 1NGAA 4H5NA 1QQNA 1YXQA 3SK3A 5ADXH 4K41A 4I6MA 2NRHA 3CJ7A 2Q2RA 2F9TA 4BC4A 2HMPA 4FWLA 3FE1A 2YI1A 5BRHA 4O8KA 3H1QA 1KAZA 1R59O 3IFRA 3QBXA 3QFUA 4RWTA 3WQUA 2A5XA 2EWSA 4B1XB 2BUPA 3FZKA 3LDNA 5JLFA 1GLEG 3ZX2A 1X9JA 4BR7A 1DGKN 4B1ZA 1NGDA 1H1VA 2AP1A 5AQUA 5AQZA 1NGCA 2FXUA 2P9SB 5CE3A 4FOIA 1GLBG 5FPEA 1BA1A 1GLJO 1NGBA 2QWRA 2VCPA 1U6ZA 2W41A 3FLCO 3M1FA 4FWKA 3CETA 5EOYA 1QHAA 4PKGA 1BOTO 1JCEA 3QICA 3CJ1A 3GDQA 2BTFA 5AQLA 4B9QA 3CJCA 5AFUA 4B1VA 2E88A 2FSKA 2HF3A 4FWNA 4NB4A 3M3ZA 1Z6RA 4BRDA 2V7YA 5F1XA 5LJVA 4H0TB 1S3XA 1QQOA 3R9PA 3WQTA 1G99A 2E2PA 1X3NA 3CI5A 3LL3A 2HF4A 3MN9A 5B8HA 3D2FA 3HI0A 3MCPA 4BRMA 2WUSA 1QZ6A 1ZBSA 3W0LA 4XH5A 3LDOA 5JLHA 5AZJA 3D7EO 3U9DA 5AR0A 4BQLA 2E2QA 2QXLA 2QWPA 2QWLA 3VPZA 4FWOA 3UKRA 4IO8A 2QWNA 3ATUA 3WXLA 3FZMA 3ZX0A 3BP8A 4CBWA 1NMDA 3EKSA 2QW9A 5AQIA 1Q18A 5E84A 5TKYA 3O1BA 3VF6A 3ZEUB 4K42A 2QWOA 1ESVA 2YCHA 3FFKB 2Q0UA 3VGMA 1TYQB 5FPNA 3HTVA 2CH6A 3QMLA 3VEZA 3VGKA 3BEXA 5KPZA 2YHXA 4Z94A 4CZMA 4HTLA 2P9IA 1J6ZA 1RFQA 2E2NA 4BVOA 1T6CA 1U2VB 5AQSA 3A5LC 5EXWA 2IVOA 5AFUH 4BRKA 3AARA 5BPLA 3GE1A 3DXKB 1DEJA 5KPTA 3LDPA 3DJCA 3SLCA 1K8KA 4WQ5C 2YHWA 2IVPA 4JAXA 4CBXA 4H03B 5I9EB 1C0GA 3MN6A 2ITMA 4AM6A 4MO4A 4HWIA 4FWQA 3ZETB 3A5NC 3DWLA 3QDKA 4PL8A 2YHYA 5AQRA 3SJHA 5KPRA 4IZ9A 1NM1A 5E26A 1NGEA 2AA4A 3FZLA 4FWMA 4QS9A 1ATSA 5EX5A 1MWKA 1SZ2A 5FPDA 5LJWA 5AQOA 3QB0A 4M7YA 3EKUA 3GL1A 3MDQA 4H5RA 1HJOA 3MN5A 5JMVA 2P9UB 3AAPA 3BF3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3R6MA 4UY8O 4CEZA 4QCLA 1GLAG 4BRGA 2P9KA 2VYPA 4CZHA 3OJUA 5JVGL 4BRAA 2VGMA 4KB0A 2QM1A 4FYDA 5F0XA 3UKUB 1X9MA 3ULEB 5J2PA 4NXMK 5CYMA 3C94A 3SUNA 4DSIA 4CF2A 3HT3A 2E8AA 1IKXA 3ZSXA 3K9JA 4JLHA 4H5WA 1RT7A 1S5JA 4CZKA 4KI6A 4JRPA 3VF4A 1E3MA 3L2WA 4CD1A 2PFUA 4FLTA 3DLHA 1GOCA 4CFBA 1BI4A 1TGOA 1IG9A 3L2VA 2PYJA 5HL7L 2YV0X 4FVMA 4GV9A 3CYMA 4EIAA 3PX4A 1XC3A 3CJBA 4IG3A 3PX6A 4DCHA 1MDUB 4BE1A 3G6EN 4B3TK 1C6VA 3NMUA 3SQ1A 4FL9A 5M1OA 3DXMA 3RRHA 4XH1A 4CJKA 2G8IA 4WCEL 2FBVA 1FW6A 5GAEP 1VQ8N 3SAFA 1GLLO 4WYBA 3VA0A 2BANA 3CJAA 2GV9A 1W9HA 3TTCA 3WNFA 1TVRA 3BY5A 3FR0A 3CQ8A 1VAZA 3C7NA 5C15A 1UA0A 3S41A 4DSKA 3SUOA 3SMSA 4DR5K 4BR4A 3EE8A 3WUHA 2P9SA 1KAYA 1XUPO 2GWJA 3K2PA 3SYZA 1NGIA 4IXCA 2WC9A 2UXBK 3LDQA 4RCHA 3AVAA 4O55A 3P83D 4DWIA 1ILYA 1JXBA 2G8FA 3SUQA 3AAQA 1J5EK 4JI5K 3LZIA 1VK0A 2FLOA 3HZ6A 3HYFA 3KLEA 4FK4A 3A5MC 4RW6A 2XY5A 3VQPA 3OYNA 4OPKA 3L4IA 3KHYA 1RT1A 1B92A 4CJ7A 5DM7L 3DLGA 3ZT3A 1BUPA 4WF9L 5FRMA 1KD1O 4YOTA 1C1BA 3V1QA 2O8EA 3LP0A 5FDLA 4KHWA 4DHYA 3C95A 2KW4A 4CD3A 4CHOA 4CHPA 3QNNA 2G8WA 2QKBA 1VSDA 4E1JA 4H0YB 1JXEA 4HUFA 1SL1A 4C8LA 4JKDA 3V1OA 3AV9A 1NK4A 3HXMA 3SPYA 1EQYA 3H1VX 2HHXA 2G8VA 3BGRA 1BG3A 4FLZA 3K58A 1IJJA 4YFUA 2HNDA 2ZJPL 4M63C 2ETJA 4C1NK 1T44A 3LALA 3CCRN 1J54A 4GKKK 3C6AA 2LSNA 3EO3A 2P9LB 3W3DA 1HLUA 4CZJA 3LDLA 4YDUC 1P8ZA 2P9IB 4WFNL 3JS6A 4OGEA 3ENHA 2IGIA 5J1EA 4B1WB 3D2EB 4CVNE 3AVIA 4JD2A 1VSHA 4JI3K 4MDBA 4NLCA 1NK7A 2Q31A 4RTFD 1RDWX 4HUEA 1HNIA 1K73O 1WOQA 5AQNA 1NK9A 3V81A 2HHWA 3WEEB 4WE1A 5AZIA 2NRRA 3H3OB 4OJRA 1JLAA 4LFAK 3RRGA 4HCBA 3K5MA 4DQPA 1J53A 3OJSA 2IIRA 2VG7A 4CF8A 2CGLA 4CFCA 1LCUA 3RSEA 4JNEA 4N56A 5GAGP 4CIEA 3KK1A 1J9AA 3HVRA 1TK5A 5ADXA 3U3GA 4N76A 4LF4K 1NJXA 1RTJA 3IMXA 1CZ9A 3GG4A 5CHIA 3CXCM 2V52B 4IEIA 5SWMA 4OPJA 1NK0A 4B9TA 1RTHA 4JI2K 2GUPA 2O8BB 4CE9A 2I7NA 5C25A 4YY3K 4GKJK 4GY2B 4QS8A 2FBYA 3OVNA 3K0SA 1P90A 1RT5A 2CGKA 3CF5L 3ASMA 1SKWA 3LAMA 3O80A 1YAGA 3DOLA 3ZSZA 4DQSA 2QKKA 4EP5A 4ISGA 2D4WA 1ZBUA 2VQEK 3EYZA 4IBNA 3EN9A 4O8UA 3BZCA 1SV5A 4FO0A 1RDCA 1QVGM 4BRQA 5AJ3K 3RMDA 3S3OA 4DSJA 2KLAA 2YHAA 1RT2A 2GEMA 3L0QA 2VG6A 4B1YB 1NJWA 4CBUA 1TKTA 3TAMA 4WQ4A 1YIJN 1C0TA 3NH2A 2O8DA 1L5UA 1IKVA 4A2BA 3VEVA 1L3SA 3VF2A 3UKRB 2HNYA 1ZBLA 3OHRA 5BRDA 2GWKA 3ZYYX 2HMIA 4QS7A 4B3SK 1YI2N 3VEYA 3OYDA 1S6PA 4K41A 3U3YA 5CZ2A 1JLFA 5HP1A 4U7BA 3HM9A 4LF7K 1SUQA 1N5YA 4BC4A 4Y1CA 4RW8A 1Q7YO 4J2BA 4FK0A 4IEEA 3NH0A 3FE1A 4LSLA 4O8KA 5C0YA 1S6QA 1KLMA 3IFRA 3ZSOA 1U4BA 4DF4A 4MFBA 2D0CA 4B1XB 3FZKA 3DLBA 4CJQA 3LZJA 4DFJA 5K14A 2JWLA 1X9JA 4B1ZA 3D0PA 1IKYA 4DTXA 2NRVA 1BA1A 2VCPA 3CD6N 3QNOA 4BWJA 1ZYQA 3SCXA 4L8RB 1VQ4N 4NCGA 4KH5A 1QHAA 1BOTO 5AQLA 4H4OA 1LWCA 4B1VA 3QINA 4JEPA 3M3ZA 5F1XA 2V7YA 1L3UA 4FJNA 3P39A 2D0BA 4CCHA 1JL1A 4I7FA 2XO7A 1S1WA 2DFHA 5JLHA 4DV6K 5BR8K 5AR0A 4JKFA 4BQLA 5H1SQ 3KKRA 4I9QA 2E2QA 3CFPA 3DLEA 2QWLA 3VPZA 4FWOA 4KTZA 4MDAA 2QWNA 3K5LA 3WXLA 2E6MA 4BE7B 1NMDA 4C8KA 1BQMA 2XY8A 5KRSA 5TKYA 3MCAB 3AVBA 4DV2K 3ZEUB 3J7AP 4K42A 2GUIA 3VGMA 3O4QA 4B3MK 2Z1GA 3HTVA 4CW7B 3QMLA 1WB9A 1EP4A 3VEZA 3VTHA 3VGKA 4DSEA 3AVJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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