4MO4A

Crystal structure of anmk bound to amppcp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
362
structure length
345
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGDDDTSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLANLPWLQEHLARHPALPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
publication title Conformational Itinerary of Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase during Its Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 118
structure length 345
sequence length 362
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo4A01
4XH4A 1T44A 1BU6O 2Q1NA 3QFPA 2P9KB 3JXUA 3ENOA 4NB4A 5AFUA 2I7NA 1TYQA 2HMPA 3GBTA 4BRFA 1IG8A 1C0GA 2AA4A 1U2VA 2QWPA 4EIAA 3VEYA 2D0PA 1IJJA 2P9UA 4MO4A 4BC5A 1R59O 5AZJB 4BRCA 2ZGYA 4H5TA 4K25A 2P9SB 1JCFA 1GLFO 2VCPA 1ESVA 2QM1A 3VGMA 4BRHA 1HKCA 4WQ5C 3QDKA 3G25A 3IDHA 4PL8A 3QBWA 3W3DA 1JCGA 2Q97A 5FPEA 4BR2A 5F0XA 3A0IX 1U6ZA 3H3NO 2P9SA 5AQLA 1EQYA 1GLCG 3CJAA 3CQXA 3DAWA 4BRIA 3I33A 2YHWA 4RWTA 4CZEA 3KVGA 3A5OC 3CJBA 4CBXA 3WEEB 2QWMA 1T6DA 3LDNA 4CI6A 4XH5A 2FSNA 2E2NA 3D2EA 4CZFA 3F9MA 4CJ7A 4A2BA 1LOTB 3QMLA 2CGLA 3WEEA 3VEWA 4DHYA 2GTDA 5AQMA 3ZX3A 3MN7A 4B1ZA 5EX5A 3O08A 4K42A 1J6ZA 3R6MA 5AQOA 4BC3A 3TU5A 1HJOA 4FWPA 2I7PA 3VF4A 1BO5O 3AAPA 1HKGA 1S22A 4GY2B 1RDWX 4H0OA 5AZIB 1GLDG 5I9EB 2ASPA 4DB3A 1DEJA 3ZX2A 2UYTA 4BRMA 2A6AA 2FF6A 2YJFA 5ADXA 3DXMB 3EKSA 4WQ4C 3R9PA 4YDUA 1GLJO 1GLLO 2QXLA 3W0LA 4K41A 3J8AA 5EY4A 4A62A 2A42A 5AZIA 3O6WA 4BVPA 3RSEA 3SMPA 4ISFA 5BRDA 3DXMA 1NGCA 4IO8A 5EOYA 5JMVA 4BRKA 3H6EA 3FZMA 3LDOA 3O1WA 4XH1A 4FWKA 4HTLA 3CIPA 2QWNA 4B1YB 3ID8A 2YCHA 3EL2A 4I6MA 4CZMA 3VEXA 3FR0A 2VWBA 2FF3B 1QQMA 4B9QA 4CZIA 3ENHA 3H3OB 3R8EA 5BPNA 2OANA 1YUWA 1HKBA 3ATVA 2E1ZA 4FWNA 3CJCA 2P9NA 5LJWA 1T6CA 4BR4A 1NGBA 4JNEA 4NO7A 5ELZA 2ASOA 2E2QA 3D2FB 1NGJA 1JCEA 3BF1A 3CI5A 4L3QA 5JLHA 5BPMA 5JICA 1KAXA 1BUPA 3C7NB 3VETA 2E2OA 3GE1A 3LM9A 1K8KB 4BR0A 3U9DA 4PKGA 3U4LA 4DQ8A 3VEOA 5FPNA 4AM7A 1GLEG 4O8KA 5AFUH 2HF3A 3D2FA 4IZ9A 1D4XA 1CZAN 4FL9A 4E1JA 5F2RA 3C7NA 2P9KA 4A2AA 4BG9A 2A5XA 4BG8A 1HX1A 1K8KA 2YHXA 2YI1A 4FPAA 4RTFD 3P4IA 3BF3A 4BRPA 1KXPA 3VF2A 5AQNA 3WXJA 5AZJA 3VF6A 2E2PA 3UKUB 4IJAA 1WOQA 2GEMA 5KQ8A 1X9JA 2Q31A 5EXWA 1ATSA 4Y0WA 2FLOA 1SQKA 1Q18A 5AQSA 2V7ZA 5E26A 2W40A 4CZJA 4FWRA 1X3NA 2PAVA 3FZLA 4DCHA 3D7EO 3MMVA 3A5LC 4O5FA 1GLAG 1QQOA 3UKUA 2E1YA 2P9PB 4B1WB 4H5VA 3IFRA 4WYBA 1NGIA 1Y64A 3AY9A 5LJVA 4BRGA 2GUPA 3MDQA 3HBTA 3MN9A 2QWOA 4H0YB 4BREA 3B8AX 4FWLA 3ZEUB 3LDQA 3QICA 3VOVA 2ASMA 2P9PA 2QWRA 3LM2A 4FWQA 5KQDA 3FLCO 3JS6A 1ATNA 3CETA 4H0XB 3AARA 3O80A 4IWVA 3A5NC 2VYPA 3MN5A 4YDUC 3AAQA 4EFHA 2YJEA 4GNIA 2IVOA 1MWMA 3DJCA 3SK3A 1NM1A 4XEIA 5ADXH 5BN8A 5AQKA 2CH5A 3H45C 4FWMA 3CERA 3BP8A 3QFUA 5FPDA 4M63C 1DKGD 3UB5A 3MCPA 4BC4A 2D1KA 1V4TA 3KHYA 4JAXA 4BC2A 3MK6A 3UE5A 1QQNA 4BQLA 3H1QA 4BR7A 3GOIA 1G99A 4IXCA 1E4FT 4BR5A 3A5MC 4FO0A 4WQ4A 3UKRB 1TUYA 2F9TA 2D4WA 5AQTA 1QZ6A 3CJ9A 4JD2B 4CD1A 3OHRA 3ATUA 2F9WA 1NMDA 5AQVA 4MO5A 3WXKA 2P9LB 3CHWA 1WUAA 4QS8A 5AQYA 1X3MA 4FWSA 1NGHA 5BRHA 1C0FA 3UKRA 4CD3A 1XC3A 4FSVA 1GLBG 2ZF5O 1HPMA 2A40A 2V51B 4CBUA 3SMSA 4H0TB 3O4WA 1HUXA 2E20A 3BEXA 5BREA 4BGBA 3KZBA 4BROA 1NBWA 5AQGA 3VGLA 2H3GX 3C0BA 5FPMA 3EO3A 2ITMA 4M7XA 1NWKA 1TYQB 4BRDA 4H0VB 3VESA 2GELA 5AQIA 3HI0A 4BR9A 4IJNA 1NGFA 4B1VA 2HF4A 3ULEB 4HWIA 1BG3A 1KAZA 2P9UB 4RCHA 4C23A 4J8FA 1YXQA 3L0QA 1P8ZA 2PBDA 4JHDB 2E8AA 4PKIA 3VEZA 5E84A 1YAGA 2GWKA 4QS9A 2Q0UA 3U9ZA 3MN6A 1OKJA 3ULEA 4B1UB 5KPRA 3VGKA 5BR9A 4K43A 3EZWA 4QS7A 5AQJA 3CJ1A 3IUCA 4JHDA 4MLEA 4BRNA 3FZFA 1ZBSA 2E88A 3WUHA 5AQZA 3DWLA 1SAZA 4BQZA 3CQYA 4FWOA 1Z6RA 4BRAA 1BA1A 4WQ5A 2AP1A 1MA9B 5F1XA 4BRLA 5CE3A 1NLVA 5BN9A 2A41A 3VEVA 2YHYA 3HSCA 3ZETB 4Z94A 4CZGA 3D2EB 5TKYA 3LDLA 3I8BA 1MDUB 3DXKB 1KAYA 2CH6A 4M7YA 3M1FA 2NZTA 4BVOA 3GG4A 4FPBA 1QZ5A 2V7YA 1MWKA 2W41A 2FSJA 2Q2RA 2CGJA 4PKHA 3EN9A 1BA0A 1SZ2A 3WXIA 1LCUA 2WUSA 2V52B 3FZKA 4A61A 3ZETA 4H5NA 3L4IA 3O5BA 5BRFA 4AM6A 3LL3A 2IVPA 3DXKA 1V4SA 1NGGA 4EHUA 1NGEA 3M6GA 4EAHD 4MLHA 3FZHA 5AQPA 5AQQA 1ATRA 3ZEUA 5B8HA 1QHAA 2P9IB 2A3ZA 1BWFO 4KBOA 3SLCA 3WXLA 3H1VX 1HLUA 5KPTA 4CBWA 2QWLA 3LDPA 2FSKA 3GDQA 3S41A 3H46O 2QW9A 2Q36A 4CZHA 1YVNA 3QBXA 1DGKN 3VPZA 1NGDA 4BRQA 4PL7A 3BUZB 1ZXOA 2P9IA 2DPNA 3CJ7A 2QWQA 3WQUA 1H1VA 3RSEB 1XQSC 1RFQA 5KPZA 4H5RA 3SJHA 2CGKA 2D0OA 4EHTA 3VERA 5AQHA 2BUPA 1TUUA 4I6MB 4JN4A 5AQXA 4BGAA 3M3ZA 4CZKA 4CZLA 2KHOA 3WQTA 2EWSA 3ZX0A 3WT0A 2Q0RA 5AQRA 2NRHA 5AQUA 1Z05A 5AR0A 4H03B 2NLXA 2P9NB 5JLFA 3O1BA 1NGAA 1XUPO 2BTFA 3A8YA 3QB0A 4JD2A 1E4GT 5EVZA 2J4RA 3HZ6A 3IMXA 3U8XA 5LY3A 1BOTO 2ZGZA 1S3XA 2HOEA 1ZC6A 3FFKB 5AQFA 3FE1A 2FXUA 3HTVA 2P9LA 3TPQA 2IIRA 1BDGA 4FOEA 4H0PA 2ZWHA 3GL1A 3EKUA 4ISGA 5AQWA 4FOIA 4F9OA 2IVNA 3L6QA 4ISEA 3HM8A 4LC9B 5BPLA 2GWJA 3FGUA 1U2VB 3VENA 3O8MA 1RGIA 4B1XB 4H5WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O8FA 1T44A 3E9PA 3DOLA 5AFUA 3KLIA 1TYQA 2HMPA 4BWJA 3NGZA 3EY1A 5A2QO 3D0PA 3VEYA 4DTPA 2D0PA 4ICLA 1XNRK 4JK7A 3I8DA 4F2SA 1N8RO 2KZZA 1BL3A 2KLAA 4CIGA 2QM1A 3VGMA 1D8YA 2HNZA 4BRHA 3K9JA 3KTQA 4FK0A 4M3UA 3SZ2A 3CM6A 5FPEA 1SKWA 4H4OA 3H3NO 2OZMA 1EQYA 4A5AA 3CQXA 3CJAA 2X74A 1U49A 2YHWA 4RWTA 4CZEA 4KB1A 2ITGA 3CJBA 1J5OA 3ZSYA 2QXFA 2QWMA 3ZT2A 4A59A 1X9WA 1BHLA 3OYMA 4ZHRA 3D2EA 1L3TA 4CZFA 1Z26A 2WOMA 3OBYA 3TTDA 4CJ7A 1NKCA 3SQ4A 3L2QA 3QMLA 1VQON 3FFIA 2CGLA 3WEEA 3VEWA 2GTDA 1U4BA 3ZX3A 5T7BA 3C94A 3T1YK 1NOZA 2Y1IA 1J6ZA 1WSIA 4IG0A 3TU5A 4HVJA 3AAPA 4KV8A 4JI6K 1RDWX 1S72N 4H0OA 5AZIB 1NJIO 4B3MK 4FW1A 1DEJA 3ZX2A 1KD1O 2G8VA 4DU4A 4CGDA 3M8PA 2ZQBA 2PFUA 3W0LA 4M3TA 2XY8A 5FRMA 3PSIA 1XNQK 3LP2A 5I3UA 4CCHA 3NCIA 3HRGA 5C25A 4AF1A 4C8NA 4B9UA 2OTLN 3ULDA 3EL2A 4N56A 1UAXA 1YTUA 1QQMA 2Z1JA 4KH5A 4F2RA 4OGCA 4CZIA 3AVHA 3ZT4A 3ATVA 3NVKA 2P9NA 2ZM6K 4R79A 4QAGA 1T8EA 2BH1A 4JNEA 1E3MA 5ELZA 4DFMA 3L2WA 2ASOA 1NGJA 4L3QA 3AVMA 5JICA 4FJ9A 2O8BA 3O3FA 3C7NB 1TKZA 1CZ9A 4DMNA 4RG8A 1J5EK 3LM9A 2Z1IA 4BR0A 4PKGA 3U4LA 4NYNA 3VEOA 3EE8A 5FPNA 3AVFA 1GLEG 2O8CB 5AFUH 1JXBA 1S6QA 3D2FA 4CJWA 1VQPN 4EP5A 4FL9A 3KIOA 4JEPA 3J7ZO 4CJ5A 1Q8IA 3WNHA 1T03A 4CJUA 4KTQA 2ZE2A 1WAFA 1LAWA 4BG8A 4JI3K 1K8KA 3CFRA 2YI1A 4FLZA 5KRSA 2OZSA 4RTFD 3LPTA 1TVRA 1KXPA 3S3NA 3VF6A 1VQLN 3UKUB 4IJAA 4CFAA 2GEMA 5KQ8A 1X9JA 4Y0WA 2FLOA 1SQKA 5C2FA 2NRRA 2V7ZA 1RBRA 4FWRA 1X3NA 4O4GA 5SZTA 4CVNE 3OS1A 4M45A 3D7EO 4IKFA 3V9SA 2Z1GA 2E1YA 4CGIA 1NGIA 4LFCK 3VA3A 4KHNA 3AY9A 3CYMA 3VQQA 4BRGA 4DR3K 2GUPA 3HBTA 2Q3SA 2PZSA 4BREA 4ILHA 4AQYK 3LDQA 3SAHA 1RILA 4CW7B 4FWQA 1TGOA 3KKSA 4JKAA 1VK0A 3E66A 3CETA 5HRRA 3DLEA 1KFDA 3AARA 3CC2N 4LH4A 3MN5A 4YDUC 3AAQA 4EFHA 3CCRN 4GNIA 2IVOA 4IOCL 4F8RA 3OYGA 5HBMA 1NM1A 5D3GA 1VSKA 4XEIA 3ZT0A 4FLXA 2PY5A 1VSFA 3C95A 1QSSA 3O9TA 5AQKA 3BY5A 3TAQA 2B5JA 4E7IA 4FWMA 3KKRA 5FPDA 4M63C 1UA1A 1DKGD 3V4IA 5C15A 2WFBA 3KD1E 1D9DA 1RCHA 1V4TA 4CEDA 3OY9A 4BC2A 3OYBA 3CCLN 2GUIA 3AVLA 1RDAA 1E4FT 4KTWA 3L2UA 4BR5A 3UKRB 4M3XA 3V1OA 4OKEA 5C24A 5AQTA 4BY9C 4KHPK 1K73O 4CD1A 4BE1A 1VSHA 3OYKA 1DTTA 3RMCA 3CHWA 1WUAA 4QS8A 2IOCA 4DSEA 5BRHA 1C0FA 1NK9A 3DRPA 3OYNA 4KPYA 4FSVA 1EWQA 4HUGA 2RF2A 1ZBHA 2A40A 2FBXA 1S9EA 1HUXA 3BEXA 1S5JA 4BGBA 1NBWA 1LW0A 4UY8O 3OA9A 2O8FB 4FXDA 3K0SA 5FPMA 1YITN 3VTIA 3I0SA 2ZJPL 1TYQB 4BRDA 4H0VB 3KK2A 3VQEA 3E9OA 3HI0A 4IJNA 2YKMA 4KHQA 4B1VA 4W5TA 1X1PA 2FC0A 1BG3A 1NK6A 4DTMA 2HBJA 4CFCA 1T7PA 4OPAA 1P8ZA 4Z4HA 4JHDB 2BANA 1WB9A 1WNSA 5E84A 4B8AB 1YAGA 2GWKA 1NKBA 5M1FA 3CC7N 2JGUA 1YI2N 3ULEA 4B1UB 5KPRA 3VGKA 1IH7A 2QK9A 3EZWA 3NH2A 3SPZA 3CCVN 4BRNA 3FZFA 4FCYA 1ZBSA 4FLWA 4LD0A 3WUHA 4DQIA 3DWLA 5JS2A 3CQYA 1Z6RA 1RTDA 1BA1A 4KFBA 4X62K 2IDOA 5F1XA 3DYAA 4DSLA 2RHKA 1BISA 3D2EB 3LDLA 3I8BA 3NF6A 4M7YA 1ASVA 1JLFA 2NZTA 1JLCA 3GG4A 4FPBA 1BQNA 1HNIA 3M8SA 4KB0A 3QLHA 3EN9A 1SZ2A 4JLHA 1JLAA 2YX6A 2V52B 4YNQA 1XC9A 1NGEA 3CPWM 3G4SN 2PYJA 3CM5A 4JRPA 1ATRA 3ZEUA 1NJWA 5CZ1A 4CGHA 1DT9A 5KPTA 4CBWA 3E9LA 4IOXA 1RNHA 3HYFA 2Q36A 4G9ZA 3QBXA 4OJRA 1DGKN 3VPZA 1NGDA 4PL7A 4FM0A 2P9IA 3WQUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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