4MO4A

Crystal structure of anmk bound to amppcp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
362
structure length
345
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGDDDTSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLANLPWLQEHLARHPALPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
publication title Conformational Itinerary of Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase during Its Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
total genus 118
structure length 345
sequence length 362
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo4A01
1SAZA 3CJ1A 4QS8A 1T6CA 4B1WB 5BRDA 2P9IB 3R9PA 4I6MB 2BUPA 3CQXA 4BRFA 3LL3A 2F9WA 1NGHA 1BO5O 3D7EO 1R59O 5AQOA 3VENA 3U9ZA 4CZGA 3CJ9A 3QB0A 2IVOA 3GOIA 3I8BA 1YAGA 5AQGA 3DXMB 4RWTA 4BRAA 5KPTA 3FR0A 4CBWA 2D0PA 3QBXA 3MK6A 4H0XB 4M63C 2YHXA 5AZJA 3VEZA 5AQZA 4B1ZA 3CERA 4JHDA 3UB5A 1NBWA 2Q36A 2QXLA 5EVZA 4H0VB 2E2OA 3W0LA 3VF4A 4F9OA 4ISEA 2H3GX 1QHAA 2ASPA 4FWPA 1BOTO 3H45C 4FWMA 3UE5A 2QW9A 4BRGA 2P9UA 4XEIA 2J4RA 1KXPA 4BR9A 3ATUA 1S22A 3VETA 4EFHA 5E26A 1WOQA 2D4WA 4YDUA 1GLJO 4FWLA 2KHOA 3UKUA 3A5NC 2HF3A 3QICA 5CE3A 1X3NA 5AZJB 4BRCA 2QWPA 3FZFA 2W40A 5AQHA 4H5VA 5AQWA 2NLXA 2GWKA 3BEXA 4GY2B 4A2AA 4CZLA 4EAHD 1C0FA 2FXUA 2P9UB 4WQ4C 4H0PA 3CI5A 3H1QA 3R8EA 2P9PA 4CBUA 2Q0RA 3KVGA 4Y0WA 3H3NO 4PKGA 4FO0A 3FZKA 5AQRA 4FOIA 3U8XA 3UKUB 1ZC6A 1T6DA 1DEJA 2A40A 1DGKN 3A0IX 2BTFA 1NGBA 2QWMA 1JCGA 2NRHA 2ITMA 3SMPA 3WXIA 2V52B 2A5XA 4XH4A 1BG3A 2IVNA 1G99A 4BG9A 4LC9B 1NMDA 3LDQA 1Z05A 3RSEA 1NGEA 3VGLA 3KHYA 3D2EA 2NZTA 5KPZA 3ZEUA 1TYQA 1V4SA 4BR5A 5BR9A 3ZETB 1HKCA 2YCHA 1ATRA 4PKHA 4BRNA 4FPBA 3M6GA 5AQUA 1Z6RA 3U9DA 3WQUA 4QS7A 5AQQA 1HUXA 4BC3A 3MMVA 1NGDA 5TKYA 3LDLA 3CJCA 3MCPA 3QBWA 2ASOA 2E20A 3C7NB 3GE1A 3I33A 1ATNA 1E4FT 2GTDA 3QMLA 4IO8A 1HX1A 1TUYA 4H0TB 5BPMA 3VPZA 4WQ4A 3RSEB 2QM1A 4PL7A 3O1BA 3D2EB 3ATVA 3HI0A 3VOVA 1NLVA 3ZEUB 5FPEA 2HF4A 3DXKB 3LDNA 2OANA 1GLBG 1QZ6A 3GG4A 4CZFA 4E1JA 4DHYA 4MLEA 3WXKA 5FPDA 5BN9A 4JN4A 4CD3A 1BWFO 4JNEA 3WUHA 3GDQA 3WT0A 1SQKA 5JMVA 3VF2A 4IJAA 2ZF5O 2Q31A 3WQTA 3A5LC 3O80A 2Q97A 4FWRA 4BR2A 2P9LA 1NGGA 2AP1A 4BRQA 3MDQA 1T44A 1X3MA 4FOEA 2DPNA 3VEYA 1GLFO 5E84A 2FLOA 1QQNA 3IDHA 4FWQA 1QQMA 1E4GT 3AY9A 1ESVA 1YUWA 5AQYA 4H03B 4BC5A 3VESA 3HTVA 4H5TA 3P4IA 4DCHA 4AM6A 3FE1A 1GLEG 1RGIA 2IIRA 4BGAA 2PAVA 5AQLA 5F0XA 3FZLA 2I7PA 1GLLO 2ZGZA 3H1VX 4BR7A 2YHYA 1Q18A 2P9KA 1NGIA 3R6MA 2CGLA 2GELA 3H46O 5FPMA 2QWOA 1S3XA 4K41A 3SK3A 4AM7A 4H5RA 4H5NA 2P9LB 4JHDB 4XH1A 4BQLA 1KAXA 2ASMA 5AQVA 2HOEA 1NWKA 3ULEA 3BF1A 4EHTA 4O8KA 2VWBA 3QFUA 4BRPA 1ZBSA 4CZKA 5JICA 5AQKA 3VEVA 3EL2A 4HTLA 5EX5A 5F2RA 4WYBA 2YJEA 2D1KA 3CHWA 1BA1A 5BPLA 2E2PA 4FL9A 5KPRA 3AARA 2A6AA 3O6WA 4BR4A 3CETA 4BRKA 2P9NA 2VYPA 1J6ZA 5AQTA 2V7YA 1NGAA 3FFKB 4BRHA 1HLUA 1HPMA 3HSCA 1TUUA 4CZJA 4IJNA 3L4IA 3WEEA 3VERA 2A3ZA 1HKBA 4H0OA 4M7XA 3GL1A 1EQYA 3U4LA 1U6ZA 4BRIA 3ULEB 2I7NA 4H0YB 3TU5A 4WQ5C 1CZAN 1GLAG 3A5MC 5F1XA 3MN5A 1ATSA 5AQSA 5AZIA 4BG8A 3SMSA 5AFUH 2P9PB 5AR0A 1D4XA 4B1UB 2FSKA 3G25A 4NO7A 1ZXOA 2YHWA 1U2VA 5AQNA 1XQSC 2P9NB 1RDWX 1QZ5A 4IWVA 4NB4A 4CD1A 2W41A 4CZHA 4JD2A 4A2BA 3HM8A 3LM9A 4FSVA 2PBDA 3O8MA 1MWKA 1QQOA 4KBOA 5AQIA 3QDKA 4BRLA 2FF6A 3CJBA 4J8FA 5BPNA 4FWKA 4BRMA 5BRHA 1TYQB 2VCPA 2WUSA 4YDUC 4MLHA 1V4TA 5AZIB 3GBTA 3EN9A 4PKIA 4A61A 3ZX2A 3BUZB 3VEOA 3FGUA 1MDUB 4M7YA 1U2VB 2CGKA 3IMXA 2E2QA 3BP8A 4BROA 5B8HA 3WXJA 4FWSA 3CQYA 3H3OB 4BVOA 4CJ7A 2QWRA 2AA4A 3CJAA 1MWMA 1GLCG 4DQ8A 2FF3B 3OHRA 4MO4A 3IUCA 1BU6O 4JD2B 3JS6A 4WQ5A 2D0OA 5BREA 2QWNA 1XC3A 2EWSA 1LOTB 1NGJA 1GLDG 1BUPA 1NGCA 1XUPO 3LDOA 4B9QA 1P8ZA 5KQ8A 3EO3A 4C23A 4BC2A 4FWNA 3ENHA 3O5BA 4CZEA 5LY3A 2F9TA 1YXQA 4BREA 2FSNA 2UYTA 4FWOA 1LCUA 4RCHA 1HJOA 1NM1A 3MN9A 3A8YA 2CGJA 3F9MA 2CH6A 5AQPA 3M3ZA 1HKGA 2E8AA 3CIPA 4CZIA 3MN7A 4MO5A 4XH5A 5AQXA 3UKRA 3VGKA 3FZMA 3IFRA 1K8KA 3O4WA 2QWLA 5EOYA 2GEMA 4HWIA 3J8AA 4RTFD 5ELZA 1WUAA 3ID8A 2GWJA 3HBTA 3DJCA 4L3QA 5AFUA 5AQMA 5LJVA 4B1XB 2E2NA 3LDPA 3S41A 2GUPA 3WXLA 3FZHA 1MA9B 1IG8A 1RFQA 3QFPA 2Q2RA 3HZ6A 3D2FA 4O5FA 2P9KB 2QWQA 3BF3A 3L0QA 3O08A 2A42A 3VEWA 4B1YB 2CH5A 4A62A 4BGBA 3ZETA 3C0BA 2ZWHA 3L6QA 3VF6A 3SJHA 3UKRB 2E1ZA 1SZ2A 3ENOA 1JCEA 4ISFA 1JCFA 1K8KB 4Z94A 2P9SA 4K42A 4IZ9A 3TPQA 4QS9A 3MN6A 3AAPA 5BRFA 1H1VA 2YI1A 1NGFA 4BRDA 4EIAA 5ADXA 4GNIA 4EHUA 3FLCO 1KAZA 2FSJA 4JAXA 1X9JA 2Q0UA 1IJJA 3H6EA 3C7NA 2A41A 4BR0A 4CI6A 3EKSA 1OKJA 2V51B 1BDGA 4PL8A 4BQZA 3A5OC 4IXCA 3D2FB 1Y64A 4BVPA 5KQDA 5BN8A 3ZX3A 2P9IA 1KAYA 4H5WA 4CZMA 3B8AX 4I6MA 3SLCA 3VEXA 5JLHA 5EY4A 4BC4A 3WEEB 2YJFA 5FPNA 5AQJA 2Q1NA 3DXKA 1YVNA 3EZWA 5LJWA 3O1WA 4CBXA 4ISGA 2P9SB 5JLFA 3ZX0A 3M1FA 4K43A 3DXMA 3W3DA 3DWLA 2E1YA 1C0GA 2E88A 3LM2A 3VGMA 3EKUA 5ADXH 4DB3A 2ZGYA 5AQFA 4B1VA 3CJ7A 3KZBA 4K25A 3JXUA 1DKGD 5EXWA 2HMPA 2V7ZA 1BA0A 2IVPA 3DAWA 5I9EB 4FPAA 3AAQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O9RA 3CCMN 3CJ1A 1T6CA 4WFNL 4B1WB 5BRDA 3KD5E 4PWDA 4JRPA 4MQ3A 3CCSN 4I6MB 4FLUA 3VQDA 3CQXA 1TAUA 3LAKA 3D7EO 5AQOA 1TVRA 5KI6A 1VSLA 3O9TA 4CZGA 4A5AA 3DRPA 3A2FA 3QEVA 1JLCA 3FR0A 3PV8A 2OPQA 4A5BA 3VEZA 3HP9A 4H4MA 1XNRK 4ZTFA 4DV5K 1QHAA 2ASPA 1BOTO 2WTUA 4FWMA 3K5OA 4DR5K 3EYZA 3SUNA 1Z25A 5KTQA 4N56A 3G6EN 5FRMA 3L3UA 4CIFA 2KKZA 4XEIA 3KTQA 1KXPA 3MWPA 2OYQA 4EFHA 4CEAA 1K6YA 4QAGA 1VSIA 3UKUA 5H1SQ 3A5NC 3RWUA 3I0SA 3QICA 1KTQA 1D5AA 4DV6K 1X3NA 3FZFA 3MXMA 3LP3A 3RMCA 3PLAA 1C1CA 4DR2K 3ZSYA 1ZBIA 3O9QA 1NJIO 4FJXA 1G15A 5JS1A 2EHGA 4A2AA 4DFPA 4DTOA 1C0FA 3V1QA 2XRIA 3H1QA 4LSNA 4DV3K 4HVJA 3H3NO 4FO0A 3NGIA 3TI0A 1A5WA 1W7AA 2GV9A 3A0IX 2BTFA 3CCVN 3WXIA 2E5LK 1KRPA 4E19A 3S3MA 1G99A 3PSIA 4BG9A 4LC9B 3LDQA 1ASVA 4C1NK 1RTIA 3KHYA 3D2EA 2BDPA 5IT9O 3HXMA 3O9UA 1ATRA 3NF7A 4HUFA 4DR7K 4B8CA 4FPBA 2P5OA 4GV3A 1RT3A 1VQ8N 4DV0K 1C6VA 4FLXA 3SQ4A 4BC3A 1LWEA 2YKMA 1RDDA 2ASOA 2E20A 3C7NB 4Y1DA 4AHVA 1KVCA 3HYFA 3LANA 1ATNA 4KTWA 2XY5A 4DUZK 3MECA 5BPMA 1NK0A 4WQ4A 3L2VA 3CMAN 2FC0A 3RSEB 2YHBA 1WSIA 1VSHA 3ZEUB 5FPEA 2HF4A 3LDNA 3P5JA 3ENBA 4DHYA 5FPDA 4M3XA 3I55N 3THXA 1VSFA 3WT0A 5JMVA 3VF2A 4IJAA 2ZF5O 4CJ3A 1VQMN 3CG7A 4FWRA 1RDCA 3SJJA 2P9LA 4FXDA 3TSQA 3E1YA 3NH1A 3HVRA 4OVLA 3SV3A 3MDQA 4FOEA 2DPNA 2OTLN 3VEYA 3K5LA 5E84A 4LF7K 2DFHA 1QQNA 3OYIA 1QQMA 1K8AO 3LAMA 4G1QA 5AQYA 3QNNA 4DV4K 1B92A 5AQLA 1SS6A 3S3NA 1BCOA 2PZSA 1Q18A 1ILYA 3F2KA 3R6MA 3AO1A 5FPMA 4JKEA 3P31A 3FFIA 1JL1A 4AM7A 2D0BA 3OYDA 3K58A 4IOAL 4FK2A 4X66K 1NK4A 4FW2A 3SNNA 5K14A 3VQ4A 1QSYA 1CZBA 1ITGA 3ZSRA 5AQKA 3VEVA 3EL2A 4YHHK 2DTUA 1WSGA 4WYBA 2D1KA 1BA1A 5BPLA 4DU1A 4KI6A 3MEDA 4CJSA 2HHWA 1J6ZA 3J7AP 3P83D 2V7YA 4CF1A 3RMAA 4KHQA 1TUUA 4IJNA 3VQCA 2HHQA 4DV1K 2G8VA 4CEZA 3CXCM 4M7XA 3U4LA 2ZM6K 3ULEB 2YNIA 3K59A 4MDBA 2I7NA 3G4SN 1BL3A 3O3FA 3M8RA 1QE1A 3MN5A 1HQUA 5AQSA 1M90O 4LF6K 5AZIA 3DLGA 1KFSA 4KAZA 3V9XA 3SMSA 4LF4K 4B1UB 4GVEA 4KHPK 3QEXA 1EXQA 4CCHA 3ZT1A 3THWA 5AJ3K 4J2BA 2P9NB 2F8SA 1RDWX 5M1OA 1NK5A 1BISA 1MU2A 1L3VA 1HNZK 3HJFA 2E6MA 4A2BA 4B3TK 3LM9A 5CHIA 2PBDA 1JXBA 3VQ6A 2O4GA 4LF8K 3O8MA 1QQOA 1WBBA 3CJBA 1NKCA 4FWKA 1YT3A 3QEWA 5LMNK 3GBTA 3VQAA 3EN9A 3BGRA 3ZLJA 1LWCA 3V4IA 5C10A 3QO9A 4M7YA 1VSKA 3CCQN 4JK7A 2E2QA 3BP8A 1C0MA 4I2QA 3WXJA 3VQ5A 3CQYA 3H3OB 2QWRA 3T7ZA 1MWMA 3AA2A 1U4BA 1GLCG 3ZSZA 4WQ5A 3PO4A 4GKKK 4KB0A 4N47A 4DTSA 3HT3A 2QXFA 1SL1A 1GLDG 3ZT2A 3RMDA 5DM6L 3K5NA 4C23A 4BC2A 4FWNA 1TL1A 3ZSWA 3T1YK 2JLEA 3LP2A 4X65K 4HCCA 3P38A 1NM1A 2ZJRL 3MN9A 4HCBA 3A8YA 3F9MA 4DSJA 3TTDA 1OH7A 3BZCA 3CIPA 4CZIA 1NJWA 3MN7A 4XH5A 4JEPA 5AQXA 4DU4A 2IDOA 3OYEA 1K8KA 1RT7A 3O4WA 5EOYA 4OGCA 4X62K 2O8CA 5ELZA 2GWJA 3HBTA 3DJCA 4B9LA 3ASMA 3OYJA 4C8OA 1NOZA 1U04A 2GUPA 3FZHA 1RFQA 4IEIA 4I9LA 2W42A 1GOAA 3L0QA 2A42A 4B1YB 4J2AA 4A62A 4BGBA 1REVA 3VTHA 2ZWHA 3L6QA 3SJHA 3QLHA 4LFBK 4E7HA 4M3TA 4Z94A 4FVMA 4K42A 4IZ9A 4QS9A 3DYAA 4LY7A 3MXIA 5DK5A 1NKEA 5J2MA 4EIAA 1ZBLA 4N41A 4GNIA 5SZTA 3FLCO 2VGNA 1HNWK 3OJSA 3CCRN 1OKJA 2V51B 2O8EA 2RKIA 3L2QA 3CC2N 4DQIA 4UY8O 5HBMA 4Z4GA 5T7BA 1Y64A 3I8DA 4BVPA 3ZCMA 5BN8A 1BIUA 4CZMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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