1NMDA

Crystal structure of d. discoideum actin-gelsolin segment 1 complex crystallized in presence of lithium atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
372
structure length
362
Chain Sequence
DVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEQEMATAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Structure Of The Non-Vertebrate Actin: Implications For The ATP Hydrolytic Mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
total genus 118
structure length 362
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nmdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nmdA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1nmdA03
3M3ZA 4FSVA 1HX1A 4BGAA 2GTDA 2CGJA 4I6MA 4M7YA 2P9IA 3AARA 3M1FA 3ULEA 3UB5A 1HKGA 3P4IA 3A5OC 3GE1A 4IJAA 4HTLA 1BOTO 5BPLA 2VCPA 3LM2A 2A3ZA 3O5BA 5AFUH 3MN5A 2P9SB 5LY3A 4H0OA 3ZX3A 3QMLA 1RFQA 4B1WB 3LDPA 2YJFA 3ENHA 4BGBA 3EL2A 3H6EA 4JNEA 1X9JA 5BPNA 5BR9A 4FOIA 3H1QA 3DXKA 5AQOA 4NB4A 5I9EB 4JHDB 3BF3A 5LJWA 1HPMA 3I33A 4BC3A 2P9NA 3WXIA 2GWKA 2Q0UA 4I6MB 3VEVA 3VEZA 1NLVA 2P9IB 5AQIA 3UKUA 3ULEB 4CZEA 1QQMA 4FL9A 4K43A 3R9PA 4C23A 1KAYA 3O8MA 3CERA 3VEYA 2WUSA 5AZIA 4CZLA 3CJ9A 4E1JA 2QWMA 5JMVA 5AQFA 3G25A 1MA9B 3H3NO 2PAVA 4BREA 1S3XA 2YCHA 3MK6A 1X3MA 4IJNA 2ZWHA 2V7YA 3GBTA 4BRCA 2GUPA 3DXKB 2FF3B 2YI1A 4BR0A 2P9UA 1DKGD 3O08A 1QHAA 5E84A 2P9NB 4FWSA 4BR4A 4H0PA 3UKUB 4BC5A 1QQNA 1K8KA 2QWOA 3WQTA 4CD1A 3WEEA 1MWMA 4J8FA 5AZIB 4B1UB 3EN9A 5ADXA 3IFRA 1HKCA 3LL3A 3ZEUA 3VEOA 4CZJA 3GG4A 3EO3A 1Q18A 3FZMA 3W0LA 3HZ6A 2P9UB 2QWLA 3GL1A 3FZHA 1GLDG 1QZ5A 4K42A 4KBOA 1KXPA 3VGMA 3CI5A 4A61A 1K8KB 3WEEB 3VGKA 1EQYA 1GLCG 1XQSC 2CH5A 3CJAA 4BRAA 2QWPA 2GELA 4BRGA 1C0GA 5BN8A 1QZ6A 1XUPO 5AQPA 3IDHA 2IVPA 5BN9A 2NZTA 3ZEUB 1OKJA 5AQGA 4AM7A 2E2PA 3JXUA 4PL8A 3HI0A 4CZGA 4WYBA 3SJHA 3DXMA 3FZFA 1NMDA 3O6WA 3L6QA 2GWJA 1U6ZA 3MDQA 4CZHA 5FPEA 2QWQA 2FF6A 5LJVA 4K41A 1HLUA 5BREA 2A5XA 1S22A 3DWLA 5KQ8A 2FSKA 4BRDA 2E2NA 3R6MA 4QS9A 4B1VA 5KQDA 1MDUB 4BQZA 1GLFO 3FR0A 1NM1A 1Z05A 2IVNA 5ELZA 1YXQA 2Q0RA 3QFPA 2QWRA 5F1XA 3VEWA 3DXMB 2V7ZA 2P9KA 5AQKA 2VYPA 1LCUA 5AQUA 4JD2A 3KHYA 1MWKA 3VF6A 3AAPA 1X3NA 4WQ5C 3AY9A 1R59O 3MN9A 5JLHA 5AQJA 1NGAA 1BU6O 4IO8A 1NGFA 1SAZA 3BF1A 4FWPA 4MLHA 2ZGZA 4JN4A 4BRKA 3MCPA 2DPNA 4H5TA 5AQVA 4A2BA 4BRHA 3MN6A 1E4FT 3HSCA 3KZBA 4MO4A 5BRDA 4ISGA 1HUXA 5KPZA 4FWOA 4A62A 4DB3A 4Y0WA 4B1XB 2P9KB 2HMPA 4CZIA 1TYQA 3GDQA 2HOEA 4JD2B 4QS7A 3MMVA 4CZMA 3H45C 4M63C 3H46O 4MO5A 4PL7A 4BROA 4CD3A 1ATSA 1TUUA 1T6CA 4CBXA 1NGIA 2ASMA 4EHTA 3B8AX 1NGJA 4O5FA 3QFUA 4H0YB 4RWTA 3FLCO 2FLOA 1Y64A 1BWFO 3RSEA 5FPDA 1SQKA 4XEIA 5AQTA 3AAQA 3O1BA 2ZF5O 4GY2B 3SMSA 3VPZA 4FWMA 4BRQA 3QICA 1GLAG 4EFHA 2D0PA 1G99A 1SZ2A 1Z6RA 5AFUA 5CE3A 2F9WA 4FO0A 1TYQB 2W41A 4DHYA 4JAXA 2VWBA 3M6GA 4CBWA 2Q31A 2FSJA 3J8AA 1ZBSA 5AQLA 4FWNA 2PBDA 3UE5A 1BUPA 2H3GX 1NGHA 2F9TA 4AM6A 2ZGYA 3BEXA 2ITMA 4BC2A 3CIPA 1NGDA 3RSEB 3FZLA 1KAXA 1NBWA 2E20A 2GEMA 3WXLA 1V4SA 3WXKA 3I8BA 4F9OA 2HF4A 4CBUA 1NGGA 2Q36A 1ATNA 4H0XB 4BR2A 3FFKB 3D2FA 4PKGA 3HTVA 5AQMA 1WOQA 2D1KA 3WT0A 3ATVA 3EKUA 3EZWA 1BO5O 4XH5A 1ZXOA 2CGKA 1T6DA 2Q2RA 1GLBG 4EAHD 3IMXA 5AQWA 3VERA 3VGLA 4B1YB 5KPRA 4EHUA 4WQ4C 3C7NA 1YUWA 1NGBA 4LC9B 5BRFA 4ISFA 2V52B 3CQYA 3QBWA 5FPNA 3O4WA 2QXLA 2I7NA 3H1VX 3HM8A 3WXJA 2HF3A 3CHWA 3VETA 3ID8A 1GLJO 3D2FB 5KPTA 5AQZA 4H5WA 1NGCA 4H5NA 1RDWX 3ENOA 1GLLO 4BRNA 1JCGA 3F9MA 4DCHA 3CJBA 4RCHA 3BUZB 3C7NB 1YVNA 3VOVA 2ASPA 3VF2A 3ZX0A 3LDNA 4IZ9A 4K25A 3U4LA 2CH6A 1BG3A 3CJCA 4L3QA 5EX5A 3LDQA 3MN7A 1D4XA 1WUAA 2A40A 3HBTA 4BVOA 4BRPA 2YHXA 4BRMA 4BC4A 3SLCA 2E1ZA 2UYTA 3A8YA 3CJ1A 4FWKA 1KAZA 3QB0A 1E4GT 3FE1A 5EXWA 4A2AA 1ZC6A 5FPMA 1ESVA 5JLFA 4CI6A 2P9PA 1CZAN 3BP8A 2CGLA 4FWLA 1HJOA 3O80A 4PKHA 5AQRA 3CETA 4FWRA 5ADXH 3LDOA 4O8KA 2YHWA 4DQ8A 5AQQA 2E88A 4WQ5A 5F2RA 4PKIA 3D7EO 4CZKA 4ISEA 4H5RA 4FPBA 3O1WA 4B9QA 4BQLA 4BR9A 5JICA 3VENA 2D0OA 1DEJA 3R8EA 3SK3A 1U2VA 2P9PB 5F0XA 1TUYA 5EVZA 4BRLA 2EWSA 3TU5A 3VF4A 3QBXA 4BG9A 4CZFA 3VEXA 1ATRA 1P8ZA 1BDGA 2ASOA 1XC3A 2QWNA 5AQXA 5AQHA 2W40A 2A42A 4H0TB 4M7XA 3CQXA 4BVPA 2V51B 4XH4A 3DJCA 2YJEA 4GNIA 2J4RA 3A5NC 4RTFD 3ZETA 3H3OB 3C0BA 5AZJA 5TKYA 4EIAA 1BA1A 1U2VB 3DAWA 3GOIA 2AA4A 3ATUA 4B1ZA 1NGEA 2NRHA 3U9ZA 5AQNA 2KHOA 1IJJA 4BR5A 2E1YA 2E8AA 2FSNA 1YAGA 3D2EA 1V4TA 2E2QA 2IVOA 3IUCA 2NLXA 4FWQA 4NO7A 4YDUC 3LDLA 3OHRA 3SMPA 2P9LA 3UKRA 2OANA 4HWIA 5AR0A 3JS6A 4JHDA 3S41A 3WQUA 1QQOA 1RGIA 2Q1NA 4BR7A 3ZETB 1J6ZA 1BA0A 3A0IX 4QS8A 3VESA 2FXUA 2QW9A 5AZJB 1NWKA 1LOTB 3A5MC 3U9DA 2BUPA 4H0VB 3EKSA 2IIRA 3FGUA 5EOYA 1C0FA 5B8HA 3CJ7A 3L4IA 1GLEG 1JCFA 3QDKA 3D2EB 2AP1A 5AQYA 2A6AA 5E26A 1JCEA 2BTFA 1T44A 2P9LB 3U8XA 3FZKA 3UKRB 4H03B 2E2OA 4XH1A 4BRIA 4YDUA 2A41A 5AQSA 2P9SA 3TPQA 3L0QA 2Q97A 4BRFA 4MLEA 5BPMA 3A5LC 3ZX2A 1DGKN 4FPAA 4Z94A 4H5VA 5EY4A 3WUHA 4BG8A 2D4WA 4IXCA 4CJ7A 4WQ4A 3W3DA 2YHYA 1IG8A 3KVGA 3LM9A 1H1VA 2I7PA 1HKBA 2QM1A 5BRHA 4IWVA 4FOEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZSXA 4FSVA 4AF1A 1HX1A 1HR0K 3HL8A 3M1FA 3ULEA 1XHZA 1HKGA 2NNWA 3L3UA 3A5OC 2OZSA 2VG5A 3O9UA 2A3ZA 3SUNA 1KVAA 1KVBA 3NH2A 1L3UA 3HXMA 4LH4A 3CCUN 2WBNA 2YJFA 3EL2A 5CZ2A 4M3UA 4QOZB 1GOAA 5AQOA 2X6SA 4NB4A 5KGXA 4OGCA 5HRNA 4Y1DA 1HPMA 1KCFA 5CY4A 3TAPA 1RT2A 4CEAA 4CGDA 1KRPA 3VEVA 1C1CA 3ULEB 4BE1A 4PY5A 3E9PA 4ILGB 3O8MA 3B6OA 3CERA 3VEYA 4B8CA 4CZLA 3V1QA 3J80O 5JMVA 1LWFA 2GX9A 2XY8A 3QEIA 3IRXA 5KRTA 1CZ9A 4BREA 3JSMA 2YCHA 4FJNA 1WBDA 2PFUA 5D3GA 4JK7A 1QS4A 4BRCA 3PX6A 2GUPA 3NGZA 3M8PA 3EY1A 5E84A 3LPTA 4DFPA 4FWSA 4AHSA 2KLAA 1IKYA 4PUOA 4I9LA 3WQTA 4FLTA 3AVHA 3K9JA 2QKKA 2UUCK 3MXMA 4B1UB 1ZBUA 3KK2A 3T3FA 2FC0A 2OZMA 1BIUA 3IFRA 1S1WA 2OPSA 3GG4A 3AGKA 3P83D 3OYJA 4BDZA 3TI0A 4H4MA 1R0AA 3FZHA 4HVJA 1N33K 3CCEN 4K42A 3SAHA 4B9SA 1KXPA 3VGMA 3MECA 2OA8A 4N56A 2FBYA 1EKEA 2W42A 1GLCG 3CJAA 3C6AA 3DOKA 2QWPA 3VTIA 2ZM6K 2GELA 3E9OA 4BRGA 2G8UA 3SZ2A 4K8ZA 1FKOA 1TAQA 4AM7A 3CPWM 4XJXA 1ZBHA 2O8CA 3CM6A 4PL8A 3RVCA 4CZGA 4NLCA 2QXFA 2UXDK 4FJ9A 3L3VA 1JLQA 3O6WA 1U6ZA 3ZT0A 1VRTA 5LJVA 2E4LA 1NKEA 3HP9A 1VQKN 2FSKA 4FYDA 4E7HA 4W5NA 4C8OA 4CF0A 3R6MA 4DU4A 1Q81O 4BQZA 1M1KO 1Z05A 4YOUA 4F4KA 1TVRA 2O8CB 2G8KA 2V7ZA 1VQ8N 2P9KA 4GKJK 1TK5A 4E19A 3PO4A 4WQ5C 3AY9A 1R59O 3AGRA 4M41A 3MN9A 3QNNA 5AQJA 1RBVA 4A59A 1NGFA 1VSLA 4FWPA 3SPZA 4FXDA 4MLHA 4FVUA 4H5TA 4A2BA 4BRHA 1KTQA 3MN6A 4DR3K 3KZBA 3SI6A 1C0MA 4OJRA 4DQPA 4LF4K 5KPZA 4FWOA 4A62A 3O4NA 5SWMA 4B1XB 3CCSN 2P9KB 2HMPA 4PHTX 1D9DA 3GDQA 4QS7A 3NBPA 4JI5K 4PL7A 3AVMA 5C0YA 1KSPA 5AJ3K 1TUUA 1BIZA 4CGIA 5CYMA 1XWLA 2ASMA 5H1SQ 2UUAK 1TKXA 3CCQN 4H0YB 1VQ7N 2FLOA 1ZBLA 4LY7A 4NXMK 4FM2A 3BDPA 3G4SN 1C1BA 3DLBA 4GY2B 4FWMA 1SL2A 2D0PA 3E01A 4QAGA 2I5JA 4JAXA 4CBWA 3SUPA 1ZBSA 3L2RA 4FWNA 2PBDA 4DR2K 4GKKK 3D6RA 2H3GX 1NGHA 4N76A 4E0DA 2F9TA 4IEEA 3CCRN 3VQQA 4DR6K 2G8FA 4CIGA 2JWLA 2QA4N 5JVHL 4CIEA 4CJ3A 1YJ9N 3WXLA 1QVGM 3LZIA 1VSMA 4B9NA 1NKBA 1WAJA 2P1JA 4CBUA 2Q36A 4YOXA 1D9FA 4IDKA 1VQON 3ULDA 4ID1A 4FJKA 4CFAA 5GAGP 1KQSM 2Y1IA 2P5GA 3HTVA 1GOCA 3EZWA 3OYMA 3TAMA 1IKVA 3WNGA 1ZXOA 1KFSA 2CGKA 3QEXA 2HHUA 3THVA 1NJWA 5FROA 4X62K 3I8DA 5AQWA 3VERA 2IC3A 4DSLA 3V9SA 1WSGA 5KPRA 4WQ4C 1NGBA 3MEEA 2OCEA 3HOTA 4WFBL 2E6LA 3D0PA 4Z0UA 3DLHA 4FK0A 3O4WA 2QXLA 4OKJA 3WXJA 3O9TA 3TTDA 3VETA 4H4OA 3C65A 3ZSQA 1XNQK 4CESA 4Z4HA 1NGCA 1RDWX 1WBBA 3MXIA 4DTSA 4M3XA 3F9MA 1ASVA 4MDBA 3VQ5A 4AHCA 4RCHA 5T7BA 1YI2N 2HNYA 1GOBA 1KVCA 2B5JA 3EYZA 3VF2A 2HVIA 3LDNA 4K25A 2CH6A 4JS5A 4L3QA 4BC4A 3ZT4A 3KLEA 4LH5A 1KAZA 1OH5A 3FE1A 5FPMA 1SKSA 1ESVA 1HYVA 2VQEK 2CGLA 2RHKA 1U49A 3AO5A 4HUFA 2YV0X 4CJWA 5AQRA 3CETA 4O8KA 2YHWA 2Y1JA 3TAQA 3SBTA 4KH5A 3NVMA 3UIQA 4PKIA 3NFAA 2FBVA 3S3MA 2HHXA 2HVHA 3O1WA 4LFCK 4BQLA 4CFDA 5JICA 2BANA 4M3YA 1RTIA 2WC9A 2VWKA 3LPUA 4JKEA 3WXMB 4DSIA 2EWSA 4NXNK 3TU5A 1S1XA 2NRWA 4CJQA 4CZFA 3VEXA 1ATRA 2UXCK 2ASOA 1XC3A 5FLXO 1JKHA 2W40A 4XH4A 1B92A 3QLHA 3PSIA 1HNZK 1BI4A 4GNIA 2DFFA 3IG1A 2J4RA 5E41A 1TK0A 4RTFD 3ZETA 4CJVA 3QESA 3S3NA 2HW3A 1TV6A 3DRSA 4EIAA 4ZHRA 3SAFA 1IO2A 1KLNA 3CCVN 3ATUA 4M42A 4B1ZA 2NRHA 2NRTA 4DR5K 3EE9A 2E8AA 4NCGA 4KREA 4FLXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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