1GLJO

Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
498
structure length
494
Chain Sequence
EKKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSWTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Phosphotransferase
molecule keywords GLYCEROL KINASE
publication title Crystal structures of Escherichia coli glycerol kinase variant S58-->W in complex with nonhydrolyzable ATP analogues reveal a putative active conformation of the enzyme as a result of domain motion.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 165
structure length 494
sequence length 498
chains with identical sequence Y
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gljO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gljO01
1ATNA 1YVNA 4H5VA 2GWKA 2Q0UA 5ELZA 1K8KB 3JXUA 4B9QA 2Q1NA 2D0OA 2ZWHA 4BROA 5JLHA 3C7NB 3FLCO 1IJJA 4EHTA 3SJHA 3KZBA 2IVPA 4CI6A 3A5MC 3O08A 4PKGA 4CD3A 1Y64A 5AZJA 1NGBA 3VEYA 5AQFA 3DJCA 3WXLA 4MLHA 2P9KA 4BR2A 4JAXA 4BRDA 4CJ7A 3DWLA 3HM8A 3L4IA 4RWTA 5E26A 4NB4A 2ASPA 3L6QA 1KAZA 4H03B 5KPRA 3GL1A 4FWMA 2CGKA 3VOVA 4BG8A 4H0PA 3CI5A 4I6MB 4O8KA 3VGKA 4FWQA 3ENHA 1V4SA 1LCUA 1U2VB 5AFUH 2WUSA 1BOTO 5KQDA 3IMXA 1JCEA 4WYBA 4A2BA 4DHYA 1MDUB 3UKRA 3UE5A 4XH5A 3QFUA 4CZLA 3EN9A 3CERA 3O6WA 2NZTA 1MA9B 3WT0A 5AZJB 2W41A 5AQJA 4JHDB 3I33A 4PKHA 4XH4A 1HKBA 3VF2A 2GEMA 3VEZA 2QM1A 2I7NA 4GY2B 4CZKA 3DXKB 3GBTA 2VCPA 2D4WA 4B1XB 4B1VA 5CE3A 3WXIA 3TU5A 4C23A 2E20A 1D4XA 4WQ5A 2HMPA 3FZLA 3MN7A 5AQGA 3UKRB 2PAVA 3HTVA 3R6MA 3ATUA 4XH1A 1NGAA 1J6ZA 3IFRA 2GTDA 1MWKA 5BN9A 4L3QA 5AQYA 1LOTB 2QWOA 4BVOA 1YUWA 3FZMA 4BREA 3HSCA 1ZBSA 4BR7A 3VGMA 5AQTA 5EX5A 3JS6A 2VYPA 4JN4A 1K8KA 3H1QA 1HUXA 4BRMA 3C7NA 3O5BA 3O1BA 1NGFA 3IUCA 4YDUC 4HTLA 3H6EA 5AQIA 1IG8A 1QZ6A 5AQZA 1TYQB 2A41A 3MK6A 5JICA 1GLCG 1T6DA 1RDWX 2NRHA 4CZJA 4LC9B 1Z6RA 5AQLA 3U8XA 1NGCA 2E2QA 3VESA 3VEOA 1BA1A 3CQYA 3U9ZA 4J8FA 3MMVA 3ZX3A 5JMVA 4BR0A 5AQKA 4BGAA 2VWBA 3TPQA 1QHAA 1NGGA 2Q2RA 1HKGA 4EFHA 3A5OC 2KHOA 2P9IA 1U2VA 1QQNA 3MN6A 3UB5A 4BRFA 3WXJA 2FXUA 3ID8A 4H5RA 4H5NA 2CH5A 4YDUA 5KPZA 3AARA 5EXWA 4BVPA 4IWVA 1XQSC 2IVOA 3CJ7A 2F9WA 3VETA 5AQUA 4B1UB 3MN9A 2QWMA 4H5TA 4ISGA 2HOEA 4FWNA 1SZ2A 2Q0RA 1X3NA 1NMDA 2P9SA 3OHRA 4FL9A 4H0VB 4JHDA 4CZGA 5KPTA 3RSEA 5BRFA 1NGIA 3G25A 3SK3A 3DXKA 1RFQA 4PL7A 3ENOA 4FPAA 5BRDA 4IZ9A 1XUPO 4QS9A 3H45C 2CGLA 3W0LA 1U6ZA 5BPLA 1BG3A 1H1VA 2P9IB 4PKIA 2CGJA 1WOQA 1NGJA 3VF4A 1X3MA 4BC2A 3SMSA 5E84A 1S22A 4BRPA 4BRHA 4CBWA 3QBWA 5AR0A 2ASOA 4K42A 4HWIA 3U9DA 4CZMA 2V52B 2YCHA 2P9SB 4K25A 2BUPA 2Q31A 5AQQA 3F9MA 5F1XA 1HPMA 1G99A 1DEJA 3A0IX 3RSEB 4BRCA 1SQKA 1EQYA 2YJFA 1NLVA 3AY9A 2E8AA 2QW9A 5FPEA 1HKCA 5TKYA 2QWRA 4H5WA 4GNIA 5AQWA 2E2PA 3M1FA 2FLOA 3QDKA 3VF6A 1BA0A 4EIAA 4KBOA 2FF3B 2FSNA 5AQPA 3SMPA 1TYQA 4BRAA 2UYTA 4IO8A 3DXMA 4BRGA 4FOIA 4BG9A 5JLFA 4AM7A 3I8BA 4BC3A 5AZIA 2ITMA 4K43A 4MO4A 1BUPA 1Z05A 3A5NC 3H3NO 4H0YB 3LDOA 1R59O 3GG4A 2HF4A 3FE1A 4A62A 3B8AX 3L0QA 4IJAA 3DAWA 1XC3A 2EWSA 3QB0A 3CIPA 3D2FA 2QWPA 4B1WB 2ASMA 3D2EA 3LDLA 2E88A 3KHYA 1HLUA 3FZFA 4CBXA 4H0TB 4FSVA 1GLFO 2FSJA 4FWRA 5EY4A 1ATRA 3W3DA 2E2NA 4QS8A 2ZGYA 4BGBA 1BDGA 3DXMB 4EHUA 1C0GA 5ADXA 3VERA 4FOEA 2DPNA 4BR5A 1OKJA 4Z94A 4BC4A 5F0XA 5AZIB 5BREA 4DB3A 3ZEUB 1ZXOA 3MCPA 1GLAG 3H46O 5AQXA 2GUPA 3VEXA 4BRQA 1CZAN 3QBXA 2A5XA 1ZC6A 4H0OA 3CJCA 1YAGA 3LL3A 2P9UB 3D2FB 3BP8A 1NWKA 2IVNA 5KQ8A 2A3ZA 3CJAA 3GOIA 3LDPA 3D2EB 2NLXA 5LY3A 1GLLO 5BPNA 2YHYA 4IXCA 4CZIA 5FPNA 4H0XB 4A61A 5AQRA 2D1KA 2P9LA 1KAXA 4K41A 1GLBG 1NGHA 2A40A 3LDQA 3CJ9A 3CETA 3ULEA 3A8YA 3EKSA 4CZEA 1V4TA 2E1YA 3M3ZA 4M63C 3HI0A 1DGKN 2QWLA 4WQ4C 2E2OA 5AQSA 3BEXA 3H1VX 2YHWA 1BWFO 2V7YA 4QS7A 3D7EO 4AM6A 4E1JA 5BPMA 3VGLA 2A42A 3WUHA 2Q97A 4RTFD 2P9NA 2FF6A 3QFPA 3P4IA 3FGUA 3LDNA 2W40A 3O80A 1BO5O 3QMLA 2V51B 1T44A 3HBTA 3O1WA 4MLEA 5AQNA 1TUYA 4ISFA 1QQOA 2P9LB 1X9JA 3WEEA 1QZ5A 1KAYA 3VEWA 4BQZA 1KXPA 1DKGD 4ISEA 4FWOA 3WQTA 3GE1A 1RGIA 2CH6A 1QQMA 3O4WA 4RCHA 4BRKA 1GLEG 5AQMA 4WQ4A 4F9OA 4DQ8A 1WUAA 3ULEB 2H3GX 2Q36A 3VENA 3EL2A 1Q18A 1NGDA 1NM1A 3EKUA 3IDHA 4WQ5C 1GLJO 2QXLA 3S41A 5AQHA 4BQLA 4O5FA 2FSKA 1ESVA 2OANA 5BR9A 5AQVA 3FFKB 3ZETA 2P9KB 1ATSA 3BF1A 4EAHD 2P9NB 3WQUA 3R8EA 4MO5A 2YJEA 4JD2A 5BRHA 1C0FA 5AQOA 1YXQA 3ZEUA 4CBUA 4CZFA 1HX1A 5AFUA 3R9PA 1BU6O 3WEEB 5ADXH 5B8HA 2QWQA 4FPBA 3BF3A 1TUUA 4FO0A 2D0PA 3QICA 1JCFA 3O8MA 1MWMA 3BUZB 4BR9A 2P9PA 2P9UA 1S3XA 4BRNA 2YI1A 2E1ZA 4CZHA 3UKUA 5EVZA 2QWNA 2ZF5O 4BRLA 4FWSA 2GELA 2GWJA 4B1ZA 3LM9A 3FR0A 2V7ZA 3ZETB 3KVGA 3AAPA 5FPMA 2AP1A 2PBDA 3AAQA 3M6GA 4JD2B 3J8AA 4B1YB 3LM2A 1NBWA 3MN5A 4BR4A 3MDQA 1E4GT 4M7YA 5LJVA 2BTFA 3CJBA 4Y0WA 3H3OB 5F2RA 3HZ6A 4FWPA 4M7XA 3U4LA 1SAZA 3FZHA 1T6CA 2HF3A 3A5LC 5BN8A 3ZX0A 1JCGA 2ZGZA 1P8ZA 1GLDG 2AA4A 4NO7A 2IIRA 3FZKA 5LJWA 2P9PB 2J4RA 4A2AA 4BC5A 2YHXA 4JNEA 3CHWA 4PL8A 3UKUB 3WXKA 3SLCA 4CD1A 3ATVA 3VEVA 3CJ1A 3CQXA 4IJNA 1HJOA 4FWKA 1NGEA 4XEIA 4I6MA 5I9EB 3GDQA 4BRIA 3EZWA 3ZX2A 4DCHA 4FWLA 2A6AA 3EO3A 3C0BA 5FPDA 2I7PA 5EOYA 3VPZA 2F9TA 1E4FT
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RW6A 4DTOA 2GUIA 1CZ9A 2OZSA 3RMAA 1K8KB 2IC3A 4B9QA 4BROA 5JLHA 4FJIA 1IJJA 4OGCA 3ZSYA 4CI6A 5AZJA 3PO4A 2UUBK 1NGBA 4DSIA 5AQFA 3DJCA 5EU7A 4BR2A 4BRDA 4W5RA 1BIUA 4CJ7A 3DWLA 4YNQA 3L4IA 4HUFA 2G8HA 3L6QA 3KLEA 4LF7K 1KAZA 4H03B 4B3MK 3GL1A 3MXJA 4FWMA 3VOVA 4H0PA 3C95A 2KQ2A 3EE9A 1LCUA 4I9LA 3P39A 1RTDA 4Z4HA 3D6RA 4CJVA 1JCEA 4PHTX 2ZJRL 4KB1A 4DHYA 2F8SA 3UKRA 3AGRA 3UE5A 3QFUA 3EN9A 3HP9A 3QEPA 1MA9B 1UA0A 2B6AA 1LV5A 2OPRA 2O4IA 1N34K 5AQJA 4CIGA 2OA8A 5A2QO 2WBNA 3VF2A 2GEMA 4IFVA 4LH4A 3DXKB 3K9KA 1K9MO 4B3SK 5C24A 3SQ4A 4B3TK 3VQ5A 3AGKA 4JKGB 1HYZA 3M8PA 1DTTA 1HJRA 2HMIA 4C23A 1F21A 3H08A 1NMNA 4LF4K 2HBKA 3HTVA 3R6MA 4XH1A 1NGAA 5GAGP 4E89A 1KLMA 2QKKA 2WFBA 2ZD1A 2Z1JA 2GTDA 2OTLN 2QTDA 3LZJA 1TL1A 4IG0A 2QWOA 4FM2A 4BVOA 4FW1A 3FZMA 4BREA 2PZSA 3HSCA 2PFUA 5C2DA 5AQTA 5EX5A 3ZT2A 4UY8O 2YNGA 5SWMA 4JN4A 4G9ZA 1NJIO 4F3OA 3C7NA 2YHBA 1RBRA 3IUCA 3NH2A 4FK0A 3H6EA 1TKDA 3LDSA 4DTXA 4O8UA 2O8EA 1REVA 3TR8A 2A41A 5GAHP 3EE8A 5FDLA 3SAFA 4LC9B 3AV9A 1S9GA 3E66A 1VQ4N 5AQLA 2BDPA 1NGCA 2E2QA 3IG1A 3VEOA 3ZX3A 3U9ZA 3ZSVA 1L3TA 4BR0A 5AQKA 1VQ8N 2VWBA 1JLCA 3TPQA 3A5OC 1U2VA 3UB5A 5C2FA 4BE2A 4DR3K 2X6NA 4H5RA 4BVPA 4CFAA 1NOZA 1WLJA 5AQUA 3QINA 2QWMA 5M1NA 3D0PA 1IBLK 1SZ2A 3CG7A 2Q0RA 1X3NA 4OKKA 4Q5VA 5KPTA 1SV5A 1NK9A 4BWMA 3MCAB 1XWLA 4DQQA 1FJGK 1OVQA 3ENOA 1XUPO 5CZ2A 4DR6K 3HT3A 5KGWA 4JKAA 1BG3A 2P9IB 2Z1HA 5E41A 4PKIA 1W2BM 4B9VA 3V1QA 3VF4A 4A57A 4BC2A 1YHQN 2XRIA 4BE0A 1S22A 4B3OA 3OYFA 3K57A 3C6HA 4CBWA 3QBWA 4DTRA 2ASOA 1U45A 1VQ9N 3VQQA 4K42A 3U9DA 4O0JA 2ITGA 3O9TA 1YIJN 1NK5A 1UAXA 2P9SB 4FLUA 5F1XA 3F9MA 1RT4A 3U3YA 1RDUA 5LMUK 4DLGA 4M3TA 2QW9A 2VQFK 2O8DB 5FPEA 3UIQA 1NJZA 4JS5A 4DTPA 4MFBA 2VG5A 3M1FA 3E9OA 5M1PA 2DY4A 3VQ7A 1Y97A 4BDYA 4C8OA 4JK8A 1BI4B 4KV8A 1N36K 3DXMA 4IFEA 3TSUA 4NYNA 1OH5A 4CHQA 5JLFA 1QS4A 4BC3A 1QVFM 1CXQA 1B9DA 1Z05A 3A5NC 3H3NO 4JI7K 4IOAL 2HF4A 3FE1A 1EKEA 2LSNA 4KHYA 4Y1CA 1RBVA 1WSHA 2EWSA 4CK2A 3CIPA 3D2FA 3AVGA 1QTMA 2QWPA 4FLYA 3D2EA 4CBXA 2FC0A 1KVBA 4FSVA 5CHIA 4FWRA 4CHNA 4YOVA 1WB9A 2WONA 3W3DA 2HHVA 1NJWA 1IG9A 2NRRA 3T1YK 1VSMA 1LWFA 3PLAA 5H1SQ 1CXUA 2OPQA 4BC4A 5F0XA 5BREA 4DB3A 3Q7BA 3V9ZA 3OJSA 3LAKA 1D9DA 2EHGA 3MCPA 1NKCA 3H46O 1IKWA 3I0SA 4PA1A 4BRQA 1CZAN 1IH7A 2R7YA 3QBXA 2KFZA 2A5XA 4DS5A 1ZBUA 3O3GA 4H0OA 1YAGA 3V9UA 2KZMA 1EX4A 1GOCA 4N41A 1TL3A 3NBPA 3AVLA 3GOIA 3EYZA 2NLXA 3HOSA 2XHBA 1XMQK 4A61A 1M90O 3HO1A 1KAXA 1HNVA 1NGHA 2KTQA 4OPHA 4AHCA 3HL8A 2W6KA 4FZZA 4R79A 4PY5A 1KFSA 4YOWA 1LAWA 3VQPA 3BY5A 3DLLL 3BEXA 3K58A 4MQ3A 3JAMO 2V7YA 3SUQA 4K0KK 3K9JA 4Z4CA 4E1JA 3HP6A 4CF2A 3CFOA 3SZ2A 1TK0A 3P4IA 2O8FB 3LDNA 2W40A 3O80A 2V51B 1I39A 3O1WA 3DRPA 4CHPA 1TUYA 3WEEA 2P9LB 3VEWA 4BQZA 4I9QA 3U3GA 3K5MA 4Z4FA 1S1WA 4DSKA 3O4WA 1QQMA 1RT5A 3HJFA 1RT2A 1W97L 4KH5A 3VENA 3EKUA 3HPHA 1VSKA 4ID5A 3HXMA 1S5JA 2OANA 3OS1A 3PSFA 3HM9A 4KHWA 4GVEA 1P90A 2F96A 5M1KA 5BRHA 4M3RA 3VA3A 2OYQA 4CE9A 3KD1E 5AFUA 1A5XA 1VSIA 5B8HA 3SUOA 4CJKA 1JCFA 4LY7A 4X66K 4OPJA 1MWMA 3BUZB 2P9PA 1W0HA 3OW2M 5HL7L 4FJ9A 2E1ZA 4OJRA 4Q0BA 3ZLJA 2QWNA 2ZF5O 3HVTA 4N56A 3V1OA 1QVGM 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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