1GLJO

Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
498
structure length
494
Chain Sequence
EKKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSWTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords GLYCEROL KINASE
publication title Crystal structures of Escherichia coli glycerol kinase variant S58-->W in complex with nonhydrolyzable ATP analogues reveal a putative active conformation of the enzyme as a result of domain motion.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Phosphotransferase
total genus 165
structure length 494
sequence length 498
chains with identical sequence Y
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gljO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gljO01
3WUHA 3VEVA 2A42A 5AQFA 2P9LA 3GG4A 3VPZA 3MCPA 4WQ4A 4BVOA 1NGEA 5F1XA 1KAYA 3QB0A 4CZLA 1V4TA 1HUXA 3CJ1A 4J8FA 3LDLA 1Z6RA 3AY9A 3CERA 3F9MA 3IFRA 3UKUB 3O8MA 4A2AA 3FR0A 2YCHA 3TPQA 4PKGA 1QQOA 2GWJA 3WXJA 4C23A 4MO4A 2V7ZA 4CI6A 1BO5O 4BRPA 3O4WA 4KBOA 2P9LB 3VETA 2QW9A 1T6CA 1LOTB 5AR0A 1Y64A 4YDUC 1K8KA 2E8AA 3SLCA 4A62A 2YJEA 2CGKA 3HZ6A 2Q2RA 1R59O 3ZX0A 4CBWA 2GWKA 1TYQA 4FWLA 3KZBA 1NM1A 3GE1A 4BR5A 3CQXA 3H46O 1X3NA 3HI0A 2OANA 4DCHA 3MN9A 1GLDG 2A5XA 5KPZA 4K41A 2KHOA 3HSCA 2UYTA 4BRCA 3MMVA 3FZFA 2CH6A 1GLJO 2E1YA 1K8KB 2VYPA 1ESVA 4A2BA 4FSVA 2GUPA 4FPBA 1NBWA 4BR0A 1NMDA 4RTFD 4IO8A 3FZLA 1JCFA 1NGJA 3M1FA 3O80A 1YVNA 2ASMA 3W3DA 4BC5A 2F9WA 2VCPA 5AQUA 5BRFA 3A5MC 1V4SA 3SMSA 3FGUA 2CGJA 3LDNA 2CH5A 4MLEA 2P9PA 3EL2A 3DAWA 1MDUB 4FWNA 2V7YA 5BRDA 3RSEA 1YUWA 1P8ZA 2H3GX 4FWSA 5EX5A 1ZBSA 3VENA 3KHYA 4MO5A 3C7NB 1YAGA 4IJNA 3M6GA 4F9OA 5BPLA 1JCEA 1MA9B 4AM7A 1KAZA 4BQZA 2E2OA 2V51B 5KPRA 2QWOA 2W41A 2P9PB 4DB3A 3H6EA 4BGAA 2IVOA 5JLHA 3ULEB 3HTVA 5AQIA 4FWRA 2ZF5O 3WXIA 4BC3A 1NLVA 5KQ8A 5AQSA 1ATRA 2Q97A 3AAQA 4CZFA 5AQHA 3VF4A 3GOIA 1BU6O 3UKUA 3H3NO 3U9ZA 4IXCA 4BRDA 3A0IX 2D1KA 4MLHA 5AFUH 2YHXA 3BP8A 4BRNA 2Q0RA 4RWTA 3WQTA 4WQ5C 3R6MA 5LJWA 4M63C 1BA0A 2YHWA 3U8XA 3CQYA 2E2PA 5AQYA 3GBTA 1T44A 2QWQA 2QWPA 1BWFO 4EIAA 5CE3A 5ADXH 2FSJA 3JXUA 3FZMA 3TU5A 4HWIA 1HKGA 5AQKA 1BDGA 2P9KB 1RFQA 2P9UB 1IG8A 3KVGA 3MDQA 3L6QA 2WUSA 2Q36A 3O5BA 4CBXA 2E88A 4BR4A 3EZWA 4Y0WA 5JLFA 4JD2A 1YXQA 1U2VA 4I6MA 4WYBA 1C0GA 4FWOA 2BUPA 4O5FA 3CJCA 4A61A 5BPNA 5BR9A 4BRAA 1KXPA 2I7PA 3SJHA 4BRFA 2YHYA 4JHDA 4XH1A 4CBUA 4YDUA 3BF3A 4FO0A 4B1ZA 4GNIA 1X9JA 4JAXA 4BC2A 3O6WA 5AQQA 3VEYA 1S22A 3R8EA 1HPMA 3VEWA 3WT0A 1J6ZA 1GLFO 3AAPA 4K42A 3BEXA 3MN6A 4EHUA 4K25A 3QFUA 4DHYA 3ZX3A 3ENOA 1WUAA 5F2RA 4M7YA 4JD2B 3J8AA 4DQ8A 1U2VB 4I6MB 4H0YB 3H45C 4CZMA 1ATNA 2J4RA 2FSKA 5FPDA 3HBTA 2EWSA 2ITMA 4BGBA 3ATUA 4JHDB 1NGCA 4CZEA 5AQTA 4BR9A 3D7EO 1ZXOA 4B1WB 3FLCO 2E2QA 4IWVA 2A3ZA 4GY2B 5AQPA 4CZGA 4CJ7A 3ZETA 2D4WA 2DPNA 4CZKA 3A5NC 5KPTA 3LM2A 2ZGYA 3C7NA 3IDHA 3QMLA 4CD3A 3H1QA 4XEIA 3CHWA 5E26A 2A41A 2QM1A 4B1UB 3I33A 3L0QA 2ZWHA 4FWPA 4B1XB 2Q0UA 3O1BA 3DWLA 1BOTO 4H0VB 3WXLA 4LC9B 3CJ9A 3ULEA 1QZ5A 5AQZA 3EKSA 4FOEA 5EVZA 3QBXA 4FWMA 3ZETB 1WOQA 1X3MA 1DEJA 1Q18A 4IJAA 4ISGA 5FPMA 2IVNA 3VOVA 3VEOA 2F9TA 4BR2A 2P9IB 5AZJB 3FFKB 2E20A 1NGFA 4L3QA 5I9EB 1HLUA 3ENHA 3LDQA 4BVPA 2D0PA 5JICA 4PL7A 2QWNA 2BTFA 4B1VA 3SK3A 2GTDA 3DXKA 3FE1A 4FPAA 4H5TA 5FPEA 2NLXA 2P9KA 4CZHA 2P9UA 1MWKA 4EHTA 4QS9A 4WQ5A 2QWRA 4EAHD 4H0TB 4M7XA 1HX1A 4BRKA 2AA4A 1NWKA 3LL3A 3MN5A 1SAZA 1LCUA 3SMPA 5AQMA 2W40A 4Z94A 1GLEG 4ISEA 3R9PA 3LM9A 3LDPA 2HMPA 3UKRA 3UB5A 3DXMB 5EY4A 3O1WA 2D0OA 4O8KA 5ELZA 1KAXA 3DXKB 3U9DA 1HKCA 1GLLO 5AQXA 3CJAA 4BRHA 3HM8A 3WEEA 1OKJA 1MWMA 1G99A 2FF6A 5BRHA 1HKBA 1XC3A 1GLAG 4BREA 1RGIA 4NB4A 3VF6A 4BRLA 2FF3B 5AQWA 1TUUA 3W0LA 4FWKA 3FZHA 3UKRB 4WQ4C 3D2EA 1JCGA 1DKGD 1TUYA 3MN7A 1ZC6A 1E4GT 2I7NA 1NGHA 3G25A 4FL9A 4BG8A 4BC4A 4CZIA 2HF4A 5EOYA 3WEEB 3BUZB 3LDOA 3U4LA 3H3OB 4K43A 5BN9A 1S3XA 2ZGZA 2QWLA 3A5OC 4IZ9A 1BG3A 5AQLA 4BRQA 1D4XA 1Z05A 5LJVA 1CZAN 4CZJA 1HJOA 3QICA 3P4IA 2V52B 4EFHA 4BG9A 5AQOA 3WXKA 3EO3A 3D2EB 4B1YB 2QXLA 3M3ZA 3GDQA 3VEXA 3VERA 1EQYA 4FOIA 3A8YA 4NO7A 3OHRA 1QHAA 2CGLA 1SQKA 4BROA 2Q31A 3AARA 2AP1A 2ASPA 4PL8A 4BQLA 4JNEA 3VGLA 2P9IA 2A6AA 3BF1A 3I8BA 3L4IA 5AZJA 2P9SA 2HOEA 1BUPA 4ISFA 1C0FA 5AQNA 4E1JA 2FLOA 2PBDA 2GELA 2A40A 5F0XA 2P9NA 2YJFA 1XQSC 3O08A 3H1VX 4H5WA 3D2FA 4QS8A 4H0XB 4H5RA 1TYQB 2NZTA 3CJBA 4JN4A 5KQDA 2VWBA 1NGDA 3QDKA 1ATSA 1DGKN 1QQMA 3C0BA 3EKUA 3VGMA 1GLCG 4BRGA 2P9SB 3QFPA 3GL1A 4H5NA 3VF2A 5AQVA 5AQJA 1E4FT 2E1ZA 2YI1A 4BRIA 1T6DA 4H0OA 3CETA 3DJCA 3IMXA 4QS7A 4XH4A 4AM6A 5FPNA 1BA1A 2IIRA 3CI5A 3ZEUA 4B9QA 4CD1A 3DXMA 2P9NB 5BN8A 5AQRA 5E84A 3D2FB 1H1VA 3B8AX 5AZIA 5BREA 3VESA 2ASOA 3UE5A 3ATVA 5JMVA 4RCHA 2PAVA 2E2NA 4BRMA 2FXUA 5AFUA 1QQNA 5LY3A 3JS6A 3WQUA 3IUCA 4PKHA 1IJJA 3QBWA 3EN9A 2IVPA 2GEMA 3VEZA 1NGIA 1NGGA 5ADXA 1NGBA 3CIPA 4FWQA 4XH5A 1XUPO 3RSEB 1GLBG 3ZEUB 3S41A 4H5VA 4HTLA 4BR7A 3ID8A 1NGAA 5AZIB 1QZ6A 5BPMA 2FSNA 4H03B 2NRHA 3MK6A 5AQGA 2QWMA 4H0PA 1SZ2A 3A5LC 3VGKA 1U6ZA 4PKIA 5TKYA 2HF3A 2Q1NA 5B8HA 3FZKA 1RDWX 3ZX2A 5EXWA 3CJ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IOXA 2A42A 1XHXA 3CC7N 1HNZK 4M45A 3SCXA 1Z25A 4J8FA 2O8CA 1YTUA 4BE0A 1Z6RA 3CERA 4FCYA 3I0SA 4LFAK 3TPQA 1WB9A 2ITGA 2GWJA 3G10A 3TTDA 4OJRA 1ZBFA 3WXMB 4CI6A 1VRTA 5HOOA 4Z0UA 3AO3A 2QTDA 1Q7YO 4E7IA 4Z4IA 5M1KA 1JLQA 1LOTB 1Y64A 2GUIA 3AGKA 5HL7L 4YDUC 3CMEN 1XNQK 3SAFA 3AVHA 2E8AA 3SLCA 1VQNN 4AH9A 2YJEA 1CXQA 3HZ6A 4C8OA 1SL2A 2YNFA 2IC3A 3HOTA 2VG6A 3KZBA 1NM1A 3VQ6A 4BR5A 3AVIA 3SPYA 1Q9YA 3MN9A 1GLDG 2A5XA 3EZ5A 2BGGA 3IKMA 2KHOA 4IFYA 4ID1A 2BANA 1K8KB 1ESVA 2FBVA 4FSVA 4FPBA 4KI6A 1NBWA 3K5LA 4FLXA 1NGJA 3M1FA 3O80A 1EETA 4N56A 3ZSOA 4BC5A 3CFRA 4BDYA 2X74A 1S6PA 1V4SA 3SMSA 3FGUA 3LDNA 5CY4A 3EL2A 5M1PA 3DAWA 3LAMA 1SKRA 4BE1A 1NKEA 2V7YA 5BRDA 3RSEA 4FJJA 3J7AP 1VSEA 3PSIA 5FDLA 3CCEN 1ZBSA 4X62K 3VENA 1SV5A 1RBRA 4JK7A 1NK8A 3KHYA 3C7NB 5D3GA 4CEZA 3K57A 3M6GA 1JLFA 4LF6K 2O8EA 1KAZA 1VQ7N 5KPRA 2KLAA 1OVYA 2QWOA 2W41A 3D0PA 4C1NI 1YTAA 4JRPA 3H6EA 2IVOA 3NCIA 3OS0A 1ASWA 2ZF5O 3HSTB 3WXIA 3PY8A 1RTJA 2UU9K 3TAQA 1A5VA 3ZSYA 3AAQA 4FLUA 2HHXA 3H3NO 4A59A 2D1KA 2WBNA 1KQSM 1NMNA 3BP8A 4JI8K 4RWTA 4WQ5C 3O3FA 4NXNK 3Q7CA 2YHWA 3CQYA 3TAEA 2E4LA 3SJJA 2QWPA 1BWFO 1EX4A 1RDAA 5ADXH 4GMJB 3MWPA 4FJKA 3L2QA 3TU5A 5AQKA 4AF1A 2NRXA 1BDGA 2P9KB 3K5OA 1RDBA 4Y1DA 3EZWA 4F4KA 1S1UA 4DV2K 1YXQA 3E01A 3J81O 4LF5K 4I6MA 4PQUA 4WYBA 1EP4A 3J80O 2I7PA 3C65A 3OS2A 4FZXC 4HHTA 4JAXA 5AQQA 3KIOA 2RE2A 4C1NK 3VEWA 3PLAA 4YY3K 4CEAA 4W5OA 2OTJN 1C0UA 3BEXA 1WSJA 5LMUK 4EHUA 4B9TA 4KV8A 3ENOA 4LFBK 1NG9A 4H0YB 3MECA 1DTQA 2J4RA 2FSKA 5FRMA 4MFBA 4CJTA 3LPUA 4V19S 3HPGA 4BGBA 4JHDB 1RILA 4CZEA 5AQTA 3D7EO 3RTVA 3FLCO 2A3ZA 4CJ3A 1NOZA 3AVMA 2Q3SA 5AQPA 1NKCA 2DPNA 4CZKA 3A5NC 1XI1A 3C7NA 3IDHA 3NMUA 1JKHA 4XEIA 4E89A 4KPYA 4CK1A 4B1UB 4YNQA 1W7AA 2Z1GA 2ZWHA 4B9UA 3NVMA 3EYZA 5M1OA 3AO2A 4H0VB 4IFEA 3T69A 4N5SA 3OW2M 4B9LA 4LC9B 4FJ9A 1ASUA 1QZ5A 3E1YA 1LWCA 3EEQA 5EVZA 4CK3A 4JI1K 3ISNC 4A57A 4IJAA 1BI4B 5FPMA 4FLVA 4JS4A 3VOVA 1KD1O 2P9IB 1SKWA 4LF8K 3WNHA 1D5AA 2O8BB 2E20A 1NGFA 1HLUA 5JICA 4CEBA 2QWNA 2G8WA 4B3SK 2ATQA 2BTFA 2OTLN 4WE1A 4DR7K 3DXKA 3FE1A 3NH0A 4CJFA 2P9KA 4NCGA 4CZHA 1O1WA 1UAXA 2KFZA 5C0YA 3MAQA 2OCEA 4LH5A 4M7XA 3KLFA 2R7YA 1NWKA 3LL3A 2O4GA 2KZMA 1WAJA 3I8DA 4FLZA 4Q5VA 4Z94A 1N34K 3UKRA 2UXBK 4C8LA 2JGUA 2D0OA 3AO4A 4O8KA 5ELZA 1KAXA 1N36K 4Z4GA 1RDDA 2RF2A 3CCSN 3MEEA 3V1QA 4BRHA 3NDKA 4A5BA 3OYEA 3WEEA 4FJ7A 1XC3A 3ID6A 2YNIA 1VAZA 3DLKA 3K5MA 5J1EA 4DTRA 4BREA 4KHPK 1RGIA 4CJ5A 5HRSA 4FZYA 1VRUA 4NB4A 4FJGA 2GV9A 3JSMA 4JYAK 3OYKA 5MLCQ 1L3TA 3OJSA 5AQWA 3OTOK 4LD0A 2DFFA 1IO2A 3CPEA 3KLGA 1JCGA 3MN7A 1TUYA 4RG8A 4CJSA 2I7NA 2WTUA 3A2FA 1RCHA 2HHHK 4FZZA 1OH6A 1J9AA 4CZIA 3U4LA 3LDOA 4K43A 3F5TA 4EZ6A 2ZGZA 3A5OC 1L3UA 4IZ9A 1BG3A 3VQ7A 4FJXA 1CZAN 4CZJA 2VGMA 1GOBA 3AVJA 2W6KA 5J2NA 1X1PA 3NE6A 5AQOA 1WN7A 3EO3A 1JLAA 5SWMA 3T3FA 4MDAA 4BROA 2PFUA 4JKGA 4N41A 1Z26A 4BQLA 1HMVA 2YHBA 5A2QO 2P9IA 3KJVA 2O8BA 2AJQA 2P9SA 4HUGA 1UA1A 4JI7K 3HVRA 2FLOA 3KD1E 1DT9A 3CPWM 5F0XA 2I5JA 4YOYA 5GINA 1NKBA 4H0XB 1SL0A 4JN4A 2NUBA 3G71N 1C1AA 3KLEA 1L5UA 1M1KO 3GL1A 4GVMA 1ZYQA 1FKOA 3C6TA 2IIRA 3ZEUA 4CD1A 2P9NB 2RN2A 5CYMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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