5F0XA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with 2'-deoxy-adp and inorganic phosphate
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 118
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5f0xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f0xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f0xA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5f0xA04
5AQPA 1X9JA 5LJWA 4RWTA 3O8MA 3O1WA 3FFKB 2E88A 2QXLA 3H45C 1S22A 4BQLA 2A41A 1TUYA 4DQ8A 2PAVA 3WXKA 1C0GA 4BG8A 5AZIB 1YUWA 3WEEA 1NM1A 2YI1A 1DEJA 3WT0A 3VF6A 3ZX0A 4PKGA 1LCUA 1GLCG 1JCFA 3ZEUB 4B9QA 1U2VA 5AQHA 1NGBA 1E4GT 2ASPA 3VERA 1BA0A 2Q1NA 4FWKA 3W3DA 4NB4A 3VEWA 4CZLA 4BRKA 5KQ8A 4EIAA 5KPRA 1J6ZA 5EOYA 2CGJA 5BPLA 2F9TA 2Q0UA 4AM7A 4CJ7A 4CZIA 2QWQA 1U6ZA 3O08A 5AFUH 1GLFO 5F0XA 2W40A 3D2FA 4CZGA 2EWSA 1T6CA 2YHXA 1KXPA 3ZETA 5BRFA 2BUPA 2QWPA 5EVZA 3I33A 1NLVA 2YJFA 2IVOA 3O5BA 2QM1A 1YAGA 3AY9A 4BVPA 4GY2B 2P9IB 2IIRA 5I9EB 3VF4A 1V4SA 3O6WA 5AQZA 1XQSC 3A5OC 2QWOA 1GLBG 3M3ZA 5AQOA 2Q2RA 2FF3B 1QZ5A 3SMPA 3HBTA 5AQNA 3GDQA 2QWRA 5AQKA 3GL1A 3MK6A 3EL2A 5KPTA 2ASOA 4H5VA 3ZX3A 4BRNA 4E1JA 1ZBSA 3WEEB 2FSJA 4O8KA 1RFQA 2YHWA 4CBUA 1DKGD 5BRHA 3QBWA 5AQSA 5FPNA 4JD2A 4BRGA 3VF2A 4MO5A 1RDWX 3RSEA 1T44A 1U2VB 5AQYA 1BWFO 5KPZA 4FO0A 1LOTB 4H5NA 1Q18A 3WUHA 5E26A 3GBTA 2ZGYA 1MA9B 3C0BA 3CJCA 1NGFA 4MO4A 4CI6A 3W0LA 2A42A 2QWLA 2YCHA 3D2FB 3VPZA 2P9LA 1GLAG 4AM6A 3ZX2A 2V7ZA 3M6GA 1R59O 1HKCA 1DGKN 3JXUA 5EXWA 3KVGA 3UKRA 3ZETB 1G99A 3CJ9A 5AZJA 2GEMA 2CH5A 4C23A 3L6QA 3ID8A 2V51B 2VYPA 4M63C 1NGEA 2VWBA 3AAPA 3J8AA 1OKJA 1E4FT 1P8ZA 3FGUA 1BDGA 2F9WA 2ITMA 2P9NA 3SK3A 3G25A 4Z94A 4FWMA 4EHTA 1NGJA 4PKIA 1ATNA 4FWOA 5ADXA 2HF3A 4CZFA 4RCHA 2AA4A 3H46O 1ATRA 4CZKA 5F1XA 2YJEA 2ASMA 4JN4A 5EY4A 3R6MA 2P9UA 5FPEA 5BRDA 3MN5A 1H1VA 2WUSA 4JD2B 4MLEA 3U4LA 5JMVA 1QQOA 2HOEA 4FWQA 5KQDA 3RSEB 4IO8A 3BF1A 1T6DA 4BC3A 3IUCA 1IJJA 3MMVA 1NGAA 3QMLA 5ELZA 4BRPA 5AR0A 2Q0RA 3QFUA 1HX1A 4QS8A 3WXIA 1XC3A 3VOVA 4H5TA 4B1VA 1BOTO 3SMSA 2P9LB 5BN9A 4WQ5A 3FZFA 4BREA 3IDHA 1TYQA 3UKRB 1SQKA 3VEXA 5AZJB 3S41A 3U9DA 3ULEA 3CQYA 4BRDA 1QQNA 2GELA 3SLCA 4K25A 1WOQA 2UYTA 5BR9A 4B1XB 2E2OA 3ATVA 2E1ZA 2NZTA 2P9NB 3VEVA 1JCEA 4Y0WA 2QW9A 3HI0A 2W41A 5AQTA 1BG3A 2Q36A 4EFHA 2D0OA 1BU6O 1JCGA 2E1YA 1X3MA 4LC9B 3R9PA 5AQQA 4FL9A 5JLHA 1IG8A 3HM8A 4HTLA 3H3NO 4QS7A 5BREA 5CE3A 3A5NC 2P9UB 4PKHA 1HJOA 4CZEA 2J4RA 1NGHA 3VGKA 4FPAA 3BP8A 2E20A 3LM9A 1XUPO 2IVPA 1MDUB 3O4WA 2E2PA 3IMXA 4CBXA 2AP1A 5AQUA 4FWNA 4H0VB 3A5MC 3DWLA 3ENOA 3QFPA 4WYBA 1NGCA 2P9SA 1GLJO 2H3GX 2A5XA 2GUPA 3DXKA 5AQFA 4JAXA 1NGGA 1GLEG 3WXJA 4EHUA 3LDQA 4K42A 4CD1A 1HKGA 1TYQB 3I8BA 1SAZA 2QWNA 1MWKA 1HLUA 4J8FA 3ULEB 2A6AA 4H5WA 2E2QA 4O5FA 3CJBA 4FOIA 3KZBA 3CERA 3MN6A 4ISEA 4BVOA 4M7YA 1HUXA 5FPDA 2FSKA 4L3QA 4BRFA 2Q31A 3H1QA 4PL7A 3LDOA 3L0QA 3FZMA 2E2NA 3QBXA 1ESVA 3GG4A 3JS6A 3LDNA 4RTFD 3U9ZA 2FLOA 2I7PA 3HTVA 4BRMA 5E84A 5AQXA 3AAQA 4HWIA 3BF3A 2E8AA 4H0XB 3EKUA 5AQGA 1QHAA 2FXUA 4A62A 3CIPA 5B8HA 4BR9A 1CZAN 3OHRA 2I7NA 4B1ZA 3FZLA 3CJ7A 1MWMA 4BR0A 4FOEA 2ZGZA 3C7NA 3TU5A 3L4IA 3TPQA 3SJHA 1BO5O 4NO7A 2QWMA 4B1YB 3EN9A 4BR2A 3WQTA 3KHYA 3ENHA 1S3XA 5BN8A 4FWSA 1C0FA 3VGMA 4BG9A 1HPMA 1Z05A 4IZ9A 2A3ZA 2P9SB 2VCPA 3AARA 3VEOA 3DXKB 1QQMA 4CZMA 2YHYA 5TKYA 4GNIA 4BC4A 1WUAA 5BPMA 2D4WA 3QICA 3DXMA 3UE5A 4WQ5C 3CETA 4FSVA 5AQLA 3B8AX 4A2AA 4BC5A 2NLXA 2ZF5O 4PL8A 4F9OA 3HZ6A 1X3NA 4FWLA 3VENA 4FWPA 4BC2A 3LDLA 4XH4A 4IJNA 3QB0A 4JNEA 4CZHA 4CBWA 3H1VX 3LM2A 2OANA 2A40A 1QZ6A 4XH5A 3UKUA 3HSCA 5JICA 2V7YA 2HMPA 2ZWHA 3DAWA 2FSNA 4EAHD 4ISGA 1KAXA 5AQIA 2HF4A 4XH1A 4BR4A 4BGBA 3EZWA 4K41A 4BQZA 3CHWA 3FE1A 4ISFA 2P9PA 3EKSA 1YVNA 3C7NB 3GOIA 4DHYA 4B1WB 5BPNA 4CD3A 1K8KA 3D2EA 2PBDA 2IVNA 3A5LC 3U8XA 3FZKA 2KHOA 3CJAA 3MDQA 2P9KA 4BROA 5AFUA 2FF6A 3CQXA 2GWJA 5EX5A 4H0TB 1TUUA 1NGDA 4H03B 3FR0A 4YDUC 3UB5A 1Z6RA 4XEIA 3M1FA 2CGKA 4BGAA 4YDUA 1HKBA 1Y64A 4I6MB 4BRQA 1YXQA 5F2RA 1NWKA 4JHDA 4BR5A 1EQYA 3R8EA 1ZXOA 4M7XA 3DXMB 4FPBA 2Q97A 4I6MA 1NGIA 4MLHA 4IXCA 3IFRA 5LY3A 4B1UB 3CJ1A 3D7EO 1V4TA 4A2BA 4KBOA 5AQMA 2GTDA 2BTFA 4K43A 4IWVA 1D4XA 2D1KA 5AZIA 1ZC6A 5AQWA 4BRIA 2V52B 4DB3A 3FZHA 3VEZA 3MN7A 3UKUB 3VGLA 5JLFA 5ADXH 2NRHA 3ZEUA 2DPNA 3VESA 3A0IX 2D0PA 3MCPA 3BUZB 4H0YB 3LL3A 3VETA 5LJVA 3F9MA 4BRAA 4BRCA 3GE1A 2GWKA 3O80A 1NBWA 3H3OB 5AQRA 3BEXA 4DCHA 2P9PB 1SZ2A 5AQVA 1BA1A 3O1BA 4IJAA 1K8KB 3D2EB 5FPMA 4H0OA 3H6EA 3DJCA 2P9KB 4H5RA 3QDKA 4CZJA 1KAZA 3VEYA 3MN9A 4WQ4C 3FLCO 1GLDG 5AQJA 4WQ4A 4FWRA 3EO3A 3WQUA 1ATSA 3P4IA 4H0PA 2CGLA 3LDPA 1KAYA 1BUPA 3ATUA 4BR7A 2P9IA 1NMDA 3CI5A 4JHDB 4QS9A 3WXLA 4BRLA 4BRHA 1GLLO 4A61A 2CH6A 1RGIA 3A8YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OPPA 5LJWA 4HTUA 4WFNL 3DLEA 4FJ9A 2E88A 2QXLA 4BQLA 2A41A 3OYFA 2LN8A 3K9JA 4O0JA 3HPOA 4DQQA 1UA0A 5M1OA 4BG8A 2HHWA 3WT0A 1NK4A 4E72A 4CF8A 4OKJA 3ID6A 3ZEUB 3O9TA 5AJ3K 2KPYA 4BACA 1JL1A 1U2VA 1OZZA 4NB4A 3VEWA 1RDAA 1HJRA 1RTIA 4BRKA 4KHSA 2KW4A 4EIAA 5KPRA 1NK8A 5BPLA 1BMRA 2ZJQL 2HHVA 4LF5K 3E1YA 5CYMA 2KBJA 2NRRA 4C1NI 1K9MO 4CESA 2YHXA 4CK3A 1KXPA 3CPWM 4DV5K 3VQCA 4CVNE 4DR2K 1FH3A 3PV8A 1W2BM 3AVIA 2QWPA 2W42A 1LW0A 3KC6A 4HUEA 1SKWA 4AHSA 1HYSA 2IVOA 3AA2A 1KC8O 2QM1A 3AO5A 3O9UA 4DUZK 1N8RO 3OYJA 5I9EB 4CJLA 4DF8A 3VF4A 5J2PA 2HHIA 5AQZA 1T3VA 3RRHA 3TSQA 2QWOA 1QSLA 3DRRA 2NRTA 3SMPA 2QA4N 2D5RA 3MX2A 4XIUA 3EL2A 4FJGA 4FLZA 1XNRK 1AHOA 3VTIA 2UUCK 4C8LA 1ZBSA 1ZYVA 3SAGA 3WEEB 3ZT2A 1JXBA 4FK0A 2YHWA 4N56A 4M3UA 5AQSA 5FPNA 4JD2A 4BRGA 3SAFA 2Y1IA 2DFFA 5AQYA 1LAVA 4O44A 1BWFO 3AGKA 4EP5A 3C95A 4YHHK 2I5JA 2Z1IA 1T03A 1IBLK 3L3VA 4KTZA 4BDPA 1RBTA 3W0LA 4CJKA 2QWLA 4DG1A 4DV4K 3VPZA 1GLAG 3HT3A 1X1PA 2V7ZA 4KTWA 4PUOA 3JXUA 3KVGA 1W9HA 3RR7A 3DLGA 3AVHA 2GEMA 1T7PA 4IOXA 4JKHA 3NH0A 3R3LA 3IG1A 5LMUK 3THYB 4X64K 2UXCK 5M1NA 1RT3A 3TR8A 3DYAA 2AJQA 2F9WA 2ITMA 3MCAB 1BISA 3G25A 2KJAA 4FWMA 4EHTA 4GKKK 4WF9L 3M8QA 4DV2K 1JLBA 4KI6A 1ATRA 4K8XA 4H4MA 2UXBK 2ASMA 3MEDA 4JN4A 1I94K 3H08A 3NAEA 3N4QA 3PUFA 2P9UA 2WOMA 1EKEA 3MN5A 3U4LA 5JMVA 1P0AA 2HOEA 5KQDA 1XMQK 2ATBA 2NNWA 4CGIA 1IJJA 3MMVA 4AH9A 4J2BA 5ELZA 5AR0A 3CC7N 5IT9O 3QFUA 1Q86O 3LWLA 4ZHRA 2NY9X 1GPSA 4HVJA 3SUOA 4B1VA 1BOTO 1VQLN 5KI6A 5BN9A 1WAFA 4B9VA 3C6TA 3CD6N 3UKRB 1POIA 2E4LA 5DM7L 5M1QA 2X6SA 4JRPA 3VEXA 3S41A 2HHSA 3U9DA 3ULEA 4KO0A 3KLGA 2HHUA 3TAQA 4Z4CA 4YNQA 1T05A 1DLOA 4ILGB 1XRSB 2UYTA 2JWKA 3SV4A 1NG9A 2E2OA 3ATVA 4DTPA 3HVTA 3AVBA 4JK7A 3VEVA 2G8KA 3KIOA 2DY4A 2QW9A 2W41A 1I2VA 5FRMA 3DI6A 1OMYA 1SS6A 1CN2A 2E1YA 3K5MA 1B3CA 3NFAA 4FL9A 4HCBA 5CE3A 3A5NC 1D5AA 2BDPA 4AB0A 3EE8A 4CJ5A 5K14A 4JKFA 3LM9A 3KKSA 4DMNA 2ZE2A 2IVPA 4CBXA 4CK2A 1VK0A 4RG8A 4H0VB 1VNAA 3WNFA 1FW6A 4Z4FA 1P90A 4CEFA 1L3SA 3OTOK 3KK3A 1NGCA 1WSIA 2HB5A 2H3GX 1A5WA 4A5BA 5AQFA 2KFZA 3WXJA 1EETA 3FFIA 2GMOA 1WSGA 3LDQA 1TYQB 3CCMN 1RT2A 1HLUA 4QOZB 4DR7K 3CFRA 4Q0BA 3KZBA 3OYBA 1XHXA 1VHXA 4FXDA 5FPDA 4BRFA 4PL7A 3IKMA 3LDOA 4OGEA 2JLEA 3THWB 4RW6A 3SBGA 2LKBA 4FLUA 4RTFD 5JVHL 2I7PA 3HTVA 2E6MA 2KTQA 3VQEA 4R5PA 5E84A 5AQXA 1N34K 3BF3A 4H0XB 2O8FB 1S72N 3EKUA 1SKSA 2MZ0A 4LY7A 3NGYA 4BE7B 4Z4HA 3CW4A 4CF1A 2C1GA 3QEXA 2HHQA 3HP6A 2QXFA 3AO3A 4LSLA 2ZGZA 3THVA 1NJYA 4KTQA 3TU5A 1BO5O 4NO7A 4BE2A 3EN9A 2YKNA 3WQTA 1S3XA 4DU4A 4FJXA 1Z05A 2A3ZA 4X62K 3CPEA 2YHYA 4FYDA 4GNIA 3TAMA 3L3UA 4B3MK 1XMOK 1F21A 4X65K 4CGJA 2O8CA 3DXMA 3UE5A 5FDLA 3CETA 4BC5A 4DFPA 2NLXA 1S1UA 2NY8X 4F9OA 3RMDA 2VG7A 1J54A 4FWLA 4BC2A 4XH4A 3QB0A 4JNEA 2QK9A 5C42A 3K2PA 1LQIA 3TAPA 1JKZA 1QZ6A 3CG7A 4XH5A 4CHZA 4FJ5A 1HNIA 2NUBA 2HMPA 2ZWHA 3DAWA 1RTJA 2FSNA 2XRIA 4EAHD 4ISGA 4ID1A 5AQIA 3QNOA 4I9LA 5KRSA 3I56N 3EZWA 3R2VA 4K41A 3VTHA 2D0AA 5LL6Z 4BQZA 3L2QA 3VQQA 3CHWA 3FE1A 2IDOA 3I0SA 3HRGA 2YC1C 4DWIA 4JK9A 1NJIO 4B1WB 1TK5A 3D2EA 2PBDA 3FZKA 3CJAA 3MDQA 2MBKA 2B68A 4H0TB 1TUUA 1N32K 2SN3A 4KH4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4QS9 A;  3WXL A;  4BRL A;  4BRH A;  1GLL O;  4A61 A;  2CH6 A;  1RGI A;  3A8Y A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2OPP A;  5LJW A;  4HTU A;  4WFN L;  3DLE A;  4FJ9 A;  2E88 A;  2QXL A;  4BQL A;  2A41 A;  3OYF A;  2LN8 A;  3K9J A;  4O0J A;  3HPO A;  4DQQ A;  1UA0 A;  5M1O A;  4BG8 A;  2HHW A;  3WT0 A;  1NK4 A;  4E72 A;  4CF8 A;  4OKJ A;  3ID6 A;  3ZEU B;  3O9T A;  5AJ3 K;  2KPY A;  4BAC A;  1JL1 A;  1U2V A;  1OZZ A;  4NB4 A;  3VEW A;  1RDA A;  1HJR A;  1RTI A;  4BRK A;  4KHS A;  2KW4 A;  4EIA A;  5KPR A;  1NK8 A;  5BPL A;  1BMR A;  2ZJQ L;  2HHV A;  4LF5 K;  3E1Y A;  5CYM A;  2KBJ A;  2NRR A;  4C1N I;  1K9M O;  4CES A;  2YHX A;  4CK3 A;  1KXP A;  3CPW M;  4DV5 K;  3VQC A;  4CVN E;  4DR2 K;  1FH3 A;  3PV8 A;  1W2B M;  3AVI A;  2QWP A;  2W42 A;  1LW0 A;  3KC6 A;  4HUE A;  1SKW A;  4AHS A;  1HYS A;  2IVO A;  3AA2 A;  1KC8 O;  2QM1 A;  3AO5 A;  3O9U A;  4DUZ K;  1N8R O;  3OYJ A;  5I9E B;  4CJL A;  4DF8 A;  3VF4 A;  5J2P A;  2HHI A;  5AQZ A;  1T3V A;  3RRH A;  3TSQ A;  2QWO A;  1QSL A;  3DRR A;  2NRT A;  3SMP A;  2QA4 N;  2D5R A;  3MX2 A;  4XIU A;  3EL2 A;  4FJG A;  4FLZ A;  1XNR K;  1AHO A;  3VTI A;  2UUC K; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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