5F0XA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with 2'-deoxy-adp and inorganic phosphate
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 118
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5f0xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f0xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f0xA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5f0xA04
2GEMA 2V7YA 1U6ZA 2GTDA 4L3QA 4RCHA 4CBXA 3ZX0A 1BWFO 2P9PB 5I9EB 3FE1A 3MMVA 1H1VA 4PKHA 5JLHA 3VGLA 4CZIA 4ISGA 2E2NA 4FWNA 4Z94A 2FSKA 3WEEB 2AP1A 3HBTA 2Q1NA 4H0PA 3C7NA 4IJAA 2P9IA 3FFKB 3QBXA 2FLOA 2Q0UA 2D1KA 3DWLA 4BRPA 3EN9A 5LJVA 2NLXA 3M1FA 2ASPA 2P9SA 4QS9A 3QDKA 5AZJA 4JAXA 4CBWA 5AQVA 4A2AA 5B8HA 4BGBA 1S22A 2P9KA 2E2OA 3ENHA 5F1XA 3W0LA 4BRIA 3R8EA 1YUWA 2IIRA 1U2VB 4IWVA 5AQIA 2YI1A 2P9PA 3H1VX 3VEYA 5E84A 4K25A 3CJ7A 3CERA 3WT0A 5KPZA 3CI5A 1GLEG 2D4WA 4GY2B 4YDUC 4F9OA 2F9WA 2YCHA 4BC3A 2CGLA 3QFUA 3GL1A 3IFRA 4BR0A 1QQNA 4BRCA 5BPNA 4MO4A 3U9DA 4NB4A 2IVOA 3FZLA 2HF3A 2Q97A 3VENA 5AFUA 2WUSA 3OHRA 4CZHA 4H5NA 4BRKA 3H45C 4CJ7A 3A5MC 3DXKB 4H03B 3FZKA 2W40A 4C23A 1BOTO 3BF3A 2HF4A 3BUZB 1HKGA 3CIPA 1U2VA 4MO5A 4FWSA 2A6AA 1R59O 2VYPA 3R6MA 2V7ZA 3O6WA 1GLLO 2ASMA 5AFUH 4DB3A 1HPMA 3QB0A 2BUPA 3ENOA 3DXMB 4XH1A 1Y64A 2P9UB 4K43A 3RSEB 5CE3A 3H3NO 4FO0A 3FZFA 1ZBSA 5AQGA 3B8AX 1YXQA 3CETA 4AM6A 2F9TA 3EZWA 5KQ8A 4BC5A 1KAXA 4BR2A 4BR4A 4FWRA 3DXKA 5EX5A 3HTVA 4PKIA 2I7PA 4B1VA 2ITMA 2HMPA 4YDUA 4BREA 5AQMA 3SLCA 3DAWA 1E4GT 3A8YA 3D7EO 3FGUA 2E2PA 3VF4A 1GLDG 2P9IB 5BN9A 5KQDA 3CHWA 3D2FB 4EAHD 4FPAA 5AR0A 2PBDA 4FWPA 2GUPA 4IJNA 5LJWA 2E8AA 5E26A 3D2EB 2P9UA 3MCPA 1DKGD 2CGKA 3MN7A 2Q2RA 2DPNA 4BQLA 1RFQA 3RSEA 3WXLA 4RWTA 1XUPO 1JCEA 2KHOA 5F2RA 2YHXA 1JCGA 3ZEUB 5KPRA 1JCFA 4CD3A 1GLJO 1BA1A 2FSNA 3AARA 3FZMA 3IUCA 2E88A 1K8KB 4BR9A 1RDWX 1QHAA 4CZEA 1HUXA 3O1BA 4JHDB 1TYQB 1ATSA 1J6ZA 3WXJA 3F9MA 1ATNA 2P9NB 3AAPA 5AQTA 1QZ6A 2A5XA 5BRHA 3D2FA 1C0FA 3MN6A 4CZMA 4JNEA 2P9LB 2Q36A 4FL9A 1NGDA 1HJOA 4H5TA 2A42A 3D2EA 4J8FA 2CH5A 5AQFA 3SMSA 4MLEA 2H3GX 2EWSA 4H5VA 1KAZA 3UB5A 3CQYA 3MN9A 4BRMA 3CJ1A 1T44A 3GG4A 3SMPA 1TUUA 5AQNA 3ZEUA 4FOIA 4FWOA 4O5FA 1HKCA 3WQTA 2YJEA 4I6MA 2Q31A 3IDHA 1ZXOA 5KPTA 3CJ9A 5LY3A 2QWPA 1BUPA 1K8KA 1BG3A 3GBTA 1QQMA 5BREA 1GLBG 3FLCO 2QWOA 3ATVA 1Q18A 3H46O 3GOIA 4JHDA 1TYQA 5AQJA 1XC3A 2QWMA 4PKGA 4BROA 2P9NA 5AQRA 2FF3B 1Z6RA 3BP8A 2QWLA 2P9LA 1SAZA 3QFPA 2IVNA 1ATRA 5TKYA 3CQXA 4H0VB 4WQ4C 4HTLA 1IJJA 3VF2A 4AM7A 4M63C 1NGJA 3CJCA 5BRFA 4CZKA 4BVOA 3C0BA 5ADXA 4FSVA 3LDQA 1HX1A 2J4RA 4ISFA 4H0TB 3A0IX 4B1WB 2QXLA 4IO8A 5BN8A 5AQUA 3W3DA 4BR5A 3AAQA 3O5BA 4BC2A 2GWKA 3LDOA 3AY9A 4MLHA 1NLVA 4A2BA 2ASOA 3UKUA 4DQ8A 2PAVA 5F0XA 1NBWA 3VF6A 5EOYA 4BQZA 5ELZA 4Y0WA 3U8XA 1GLCG 4ISEA 4DCHA 3M6GA 3P4IA 3GDQA 5FPDA 3HSCA 2V52B 2E1YA 5FPEA 2CGJA 3EKSA 2E20A 3A5OC 4QS7A 3WXKA 4FPBA 2A3ZA 3VEOA 4BRHA 1YVNA 4PL7A 3VEXA 2GWJA 4EHTA 4FWKA 3A5LC 4H0XB 2FXUA 4FWQA 1EQYA 1NGIA 4EHUA 4K41A 3O80A 3FZHA 1WUAA 3R9PA 1MA9B 1LCUA 1KXPA 4BRFA 1NGEA 3EL2A 4B1YB 2QW9A 4WQ5C 5BRDA 1SQKA 3A5NC 2ZWHA 4WQ4A 4NO7A 5BPLA 3S41A 1NGCA 4XEIA 3HI0A 4CD1A 1V4TA 2NZTA 5AQOA 4I6MB 5EY4A 2UYTA 4RTFD 4LC9B 4B9QA 3M3ZA 4EFHA 2AA4A 2NRHA 4FWLA 2A40A 3EKUA 1OKJA 3I8BA 4IXCA 3CJBA 5AQHA 1C0GA 3J8AA 4PL8A 2ZGYA 3O08A 3L6QA 4BRQA 1X3MA 2D0OA 3KVGA 2V51B 4BRLA 4BG8A 4B1UB 2FF6A 4O8KA 3TPQA 3ZETB 3O8MA 3LM2A 3U9ZA 1WOQA 4M7XA 3VOVA 2FSJA 4H5WA 4CBUA 4CZGA 3CJAA 3ZX2A 2QM1A 2QWQA 1DGKN 5EVZA 3U4LA 2E1ZA 3SK3A 1D4XA 1T6CA 3VPZA 4XH4A 3KZBA 2D0PA 3GE1A 3VESA 4A62A 2VCPA 1X9JA 1HKBA 2Q0RA 3UKUB 4K42A 3H6EA 1V4SA 1RGIA 3O4WA 4BR7A 3JS6A 4WQ5A 3JXUA 4BVPA 4HWIA 2QWRA 5AQPA 1DEJA 3EO3A 1NWKA 1NGFA 3MDQA 3WUHA 1BO5O 4CZLA 1ZC6A 2ZGZA 4KBOA 1NGBA 2YJFA 5AQLA 3ZETA 4H0YB 2VWBA 1MDUB 3ULEB 5AQSA 4IZ9A 1NMDA 1P8ZA 1BA0A 1YAGA 1BU6O 2I7NA 3H3OB 4H0OA 3VEVA 5JMVA 1QQOA 1E4FT 4BRDA 2BTFA 3LDPA 3WEEA 3H1QA 4BGAA 3L0QA 2GELA 1Z05A 3LM9A 3BF1A 5AZIB 3IMXA 3G25A 4BC4A 1BDGA 5AQXA 4BRAA 4EIAA 1LOTB 3ZX3A 1KAYA 3VETA 4JD2B 4CZJA 4CI6A 3VEWA 5FPMA 3VERA 3SJHA 5EXWA 3FR0A 5AQQA 4A61A 2IVPA 3HZ6A 4CZFA 5ADXH 1X3NA 1ESVA 4BRGA 1T6DA 2E2QA 3TU5A 3ATUA 5BPMA 3I33A 1NM1A 3KHYA 3ULEA 3UKRB 4JN4A 3BEXA 5AQKA 4XH5A 4DHYA 2YHWA 1NGHA 1G99A 3ID8A 5AQWA 4FOEA 4BRNA 2QWNA 2W41A 1SZ2A 3UE5A 1NGAA 5AZIA 3VGMA 4H5RA 1TUYA 2YHYA 5FPNA 3O1WA 1IG8A 3QMLA 4BG9A 3LL3A 1XQSC 4JD2A 3WXIA 4B1XB 1CZAN 3VEZA 2CH6A 1GLAG 3VGKA 2OANA 4GNIA 5BR9A 3HM8A 4B1ZA 1MWKA 3MK6A 2A41A 3DJCA 1S3XA 3LDLA 5JICA 3LDNA 3QICA 3MN5A 3C7NB 1NGGA 4E1JA 1HLUA 3UKRA 4M7YA 3DXMA 3WQUA 2HOEA 2P9SB 5AZJB 1QZ5A 4QS8A 2ZF5O 1MWMA 5JLFA 2P9KB 4FWMA 5AQZA 4WYBA 1GLFO 3L4IA 3QBWA 5AQYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GEMA 2V7YA 3AA5X 1VSDA 3ZX0A 3FE1A 3QIPA 4HCCA 3K5NA 3VGLA 4IFYA 2E2NA 3NCIA 2VGMA 2FSKA 2D0AA 1T03A 2AP1A 3TSUA 5J2QA 3C7NA 2BE2A 1VQNN 3UIQA 3KP0A 1WSFA 5LMNK 1TKXA 3OYCA 5LJVA 2FBTA 2ASPA 5AZJA 4JAXA 2YC1C 1KRPA 3THWA 4IG3A 3P31A 5B8HA 3S9HA 2LJMA 5F1XA 3ENHA 4CEEA 2GUIA 4BECA 3AVBA 1OH5A 2FBVA 4ILGB 3VQBA 3AVGA 4Y1CA 2P9PA 3H1VX 3CJ7A 3QIOA 4F9OA 2CGLA 3QFUA 3LAMA 1I39A 1BCOA 4Z4EA 4DV7K 2RF2A 2YNFA 2YV0X 3LZJA 3OHRA 4BRKA 3VQ9A 3HVRA 3DXKB 4H03B 5CY4A 2G8HA 1LWCA 2YNIA 4DU4A 1WSJA 4FZZA 3BF3A 2O8EA 1ZYVA 1VSLA 3BUZB 3CMEN 1HKGA 4DSLA 3C65A 1UA1A 2E3GA 1U2VA 4YOXA 3L2VA 1R59O 3HVTA 3R6MA 2V7ZA 5KK4A 2QEXN 1GLLO 3DLLL 4BEBA 3LAKA 3TSQA 4CFAA 4FXDA 2P9UB 2P5GA 1C6VA 2B3CA 4K43A 4CECA 1NJZA 4FO0A 3FZFA 5J2NA 1HNXK 1YXQA 1FW6A 4E0DA 3CETA 2F9TA 1LW0A 5KQ8A 3SBGA 1NH5A 4E72A 3ENBA 4BR2A 3L3UA 4BR4A 4FWRA 2O8BB 1JLCA 3OYAA 2I7PA 4CGJA 2ITMA 1ICAA 4JKAA 4DTSA 4KKOA 5AQMA 3SLCA 3DAWA 3KKRA 3V9UA 3JSMA 3A8YA 1W7AA 4JI7K 1WSGA 3BZCA 3CHWA 4KHYA 5AR0A 3RR8A 1TAQA 3AVKA 4B3TK 4ELTA 4FWPA 4B9NA 4OLAA 2HHUA 3CW4A 2CGKA 4YFUA 2W00A 1CZ9A 2DPNA 1W0HA 4EP4A 3CG7A 3WXLA 1XUPO 4I7FA 4RWTA 4G9ZA 2GX9A 4DLEA 2E3FA 2HNZA 1HNVA 3AARA 3IG1A 4CHYA 4YOUA 1S72N 1HQEA 2XY5A 1JLEA 4IEIA 3AO3A 2WTUA 1WT7A 1JLQA 1ATNA 5DK5A 1L3VA 1KV0A 3HT3A 4J2AA 4JEPA 1RDUA 3ASMA 4AH9A 1MR4A 4TSXA 4H5TA 3SMSA 4DV5K 2CH5A 2EX3A 3UB5A 2B68A 3CQYA 2LR3A 1XI1A 3GG4A 3SMPA 1C55A 2E6LA 2B4JA 4FOIA 4FWOA 1VQ9N 3DRPA 4B9TA 3AO5A 4RW8A 3DOLA 2Q31A 3IDHA 1IV0A 2B6AA 3DLRA 4N5SA 3K9JA 3P1GA 1N33K 2GL1A 2ATBA 3K5LA 4M42A 3PO5A 1KD1O 1N6QA 3FLCO 3ZSXA 3H46O 2HBMA 2E5LK 3P39A 2A7TA 2KYQA 1TYQA 5AQJA 1Z25A 3PX4A 3ZYYX 2P9NA 4BROA 1HNZK 3RVCA 1CXQA 5HRRA 5FROA 4DMNA 5GINA 4Y1DA 1ATRA 4C8NA 5DM7L 4H0VB 4HTLA 5M1QA 3CFRA 3U6FA 3CJCA 1BMRA 4JI8K 3O9UA 1RTIA 3LDQA 1FH3A 3K2PA 4ISFA 4CJKA 2F8SA 4BDZA 4H0TB 3A0IX 4B1WB 2QXLA 4AHCA 1J53A 4KH5A 3OYIA 2HHQA 4R5PA 2I61A 3HPHA 2XO7A 3LDOA 1RT6A 4X66K 4MLHA 1TV6A 5J2PA 1PX9A 5GIPA 2PAVA 3VQ8A 4M3ZA 4Q0BA 4MFBA 3V1QA 1RT7A 3VF6A 1ZYQA 5EOYA 1K73O 1J54A 2DFHA 2W6KA 4Y0WA 4DV3K 1IG9A 1GLCG 4ISEA 1RBSA 4DCHA 4Z4IA 3M6GA 2NRXA 3HSCA 3AVMA 1Q9YA 1NJYA 2CGJA 3A5OC 4QS7A 3WXKA 3J7AP 1K8BA 2YX6A 1VNAA 4O4GA 1YVNA 4H4OA 3U3YA 2BDPA 3N4QA 4JKHA 5T7BA 4FLYA 4FJMA 4DFKA 2HNDA 4FWQA 1EQYA 4EHUA 4CQKA 3K5OA 4A5BA 3V9WA 4FJ8A 3FZHA 4W5QA 3R9PA 1MA9B 2HHIA 1C1CA 4NXNK 2EHGA 4IG0A 1L3SA 4DU1A 3A5NC 3PUFA 4WQ4A 5BPLA 3THVA 4XEIA 2NY8X 5DM6L 1KSPA 2D5RA 4DSJA 3HI0A 2QK9A 2KPYA 1NJXA 1SNBA 1BIZA 2HHTA 1YT3A 2A40A 3NH2A 3ZT4A 1AHOA 4V19S 1WBDA 2YKMA 3I8BA 3O4QA 1C0GA 1T3VA 4OKKA 3THXB 4CFBA 1X3MA 2D0OA 2V51B 2OTLN 3T1YK 4BDPA 4KFBA 1BRZA 4O8KA 4BY9C 3O8MA 3U9ZA 1WOQA 3SCXA 2FSJA 2QM1A 5HRNA 1T1TA 4XIUA 2E1ZA 1D4XA 1T6CA 4MDBA 3VPZA 1IBLK 2B5JA 4XH4A 3GE1A 4OKEA 3V4IA 1PTXA 4KRFA 1HYSA 4K42A 2KJAA 3H6EA 3O4WA 3FFIA 3K0SA 3IAYA 2YILA 3BZKA 4WQ5A 4BVPA 2QWRA 1YIJN 2D0CA 2G8WA 3EO3A 4CHOA 1NGFA 4FJKA 4KV8A 4KHUA 5M1OA 2LSNA 4CEOA 2O8CB 5AQLA 1MDUB 3Q7CA 1T0ZA 3BGRA 1NMDA 2OPSA 1BU6O 3H3OB 4H0OA 3CPWM 4CEFA 1QQOA 4DSKA 4AHTA 1B92A 1RT3A 1HYVA 4BRDA 3R1XA 1NKBA 4OPHA 3P5JA 1S1UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2GEM A;  2V7Y A;  3AA5 X;  1VSD A;  3ZX0 A;  3FE1 A;  3QIP A;  4HCC A;  3K5N A;  3VGL A;  4IFY A;  2E2N A;  3NCI A;  2VGM A;  2FSK A;  2D0A A;  1T03 A;  2AP1 A;  3TSU A;  5J2Q A;  3C7N A;  2BE2 A;  1VQN N;  3UIQ A;  3KP0 A;  1WSF A;  5LMN K;  1TKX A;  3OYC A;  5LJV A;  2FBT A;  2ASP A;  5AZJ A;  4JAX A;  2YC1 C;  1KRP A;  3THW A;  4IG3 A;  3P31 A;  5B8H A;  3S9H A;  2LJM A;  5F1X A;  3ENH A;  4CEE A;  2GUI A;  4BEC A;  3AVB A;  1OH5 A;  2FBV A;  4ILG B;  3VQB A;  3AVG A;  4Y1C A;  2P9P A;  3H1V X;  3CJ7 A;  3QIO A;  4F9O A;  2CGL A;  3QFU A;  3LAM A;  1I39 A;  1BCO A;  4Z4E A;  4DV7 K;  2RF2 A;  2YNF A;  2YV0 X;  3LZJ A;  3OHR A;  4BRK A;  3VQ9 A;  3HVR A;  3DXK B;  4H03 B;  5CY4 A;  2G8H A;  1LWC A;  2YNI A;  4DU4 A;  1WSJ A;  4FZZ A;  3BF3 A;  2O8E A;  1ZYV A;  1VSL A;  3BUZ B;  3CME N;  1HKG A;  4DSL A;  3C65 A;  1UA1 A;  2E3G A;  1U2V A;  4YOX A;  3L2V A;  1R59 O;  3HVT A;  3R6M A;  2V7Z A;  5KK4 A;  2QEX N;  1GLL O;  3DLL L;  4BEB A;  3LAK A;  3TSQ A;  4CFA A;  4FXD A;  2P9U B;  2P5G A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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