5F0XA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with 2'-deoxy-adp and inorganic phosphate
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 118
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5f0xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f0xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f0xA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5f0xA04
2VWBA 4H0VB 3SK3A 4B1YB 1ATRA 3GBTA 3LDLA 2QWPA 2E2QA 1HKBA 1P8ZA 4C23A 1T6DA 1BDGA 2V7ZA 3HI0A 3IFRA 2ITMA 1BWFO 5KQDA 3ZEUB 3D7EO 3ATVA 3LDQA 3J8AA 3UB5A 4O5FA 3A5OC 1X3NA 1NGBA 2E2OA 2P9LA 3VF6A 5BR9A 4FWMA 1GLDG 5FPEA 4DB3A 4FOEA 4RTFD 3C7NB 1NM1A 3UKUA 4K42A 2P9IB 5FPMA 3CJBA 2CH5A 3VPZA 3KVGA 4CJ7A 3I8BA 4CZIA 2CGLA 2QWRA 5FPDA 2ASOA 3WQTA 4FWKA 5E84A 3S41A 4H5RA 3DXMA 4M7XA 5CE3A 4JD2B 2IVOA 3FLCO 3GL1A 3MMVA 2QWOA 4B1XB 2HF3A 2AA4A 4ISFA 3BEXA 2FXUA 3MN7A 2E20A 4JAXA 4QS8A 1S3XA 3EZWA 4FO0A 2A41A 1QZ5A 4CZLA 5AQUA 1HKGA 3EKSA 3CJ9A 2P9NB 5AQMA 3QDKA 1RFQA 3O5BA 3WUHA 2HMPA 2QW9A 2A6AA 4JN4A 4DQ8A 4BRAA 3FR0A 4BR9A 4FWPA 3RSEB 3ULEA 5KPZA 1BG3A 2QWMA 2A40A 4BRMA 1BO5O 1RDWX 3I33A 3FE1A 1NGEA 4JNEA 5F2RA 4EIAA 3EN9A 3VF4A 4XH5A 3B8AX 4H5TA 4LC9B 5AFUA 1ATNA 2ZGYA 2EWSA 4L3QA 2GELA 3LDPA 4B9QA 3ZX0A 4CD3A 1C0FA 3CHWA 3GDQA 2GEMA 5TKYA 1DGKN 3F9MA 4FWSA 2P9KB 5ELZA 2Q0UA 2YJEA 3C0BA 4WYBA 2FSNA 3CJAA 2CGJA 3VESA 1QQNA 1NGDA 2NZTA 3HTVA 2UYTA 3O6WA 4WQ5A 1RGIA 3UKRA 4BC3A 4BROA 1Y64A 5AFUH 1K8KA 3DWLA 4WQ5C 3EKUA 4B1WB 5KPTA 3A8YA 3FGUA 3FZKA 4Y0WA 1BU6O 5KPRA 3VEVA 1GLCG 3LL3A 3CJCA 3ENHA 3VEYA 1HJOA 2Q1NA 4IJAA 3BP8A 1D4XA 5AZJA 4A61A 1MA9B 5B8HA 3H3NO 3A5MC 1GLFO 3D2EA 3ENOA 5I9EB 1T44A 2P9SB 4Z94A 4H0PA 2P9UB 2ASPA 1HPMA 1ESVA 1KAZA 1LOTB 3O80A 2FSJA 4I6MA 5BREA 1NGIA 3D2FB 3JXUA 1SAZA 2BUPA 3ZETB 4CZGA 4FPBA 2F9TA 3FZMA 1SZ2A 5EXWA 2OANA 4H0OA 4CZKA 3LDOA 3ID8A 3VEOA 3JS6A 3MK6A 4PKHA 4IZ9A 4FWQA 3H1QA 2W40A 1XC3A 2ZWHA 4BRLA 1U2VB 4MLEA 5EOYA 2KHOA 1JCEA 1HLUA 1BA1A 5EX5A 1XQSC 4XH1A 3WEEA 2GWJA 3GG4A 3FZLA 4A62A 3VETA 3QBXA 1S22A 2QXLA 3VGMA 3QFUA 2P9PB 4ISEA 3KZBA 4WQ4A 1TYQA 4HTLA 3QICA 1JCGA 3O8MA 3VEZA 2I7PA 4WQ4C 3H6EA 2E1ZA 2PBDA 4FWRA 4EFHA 4MO4A 2FF3B 4DHYA 1X3MA 4JHDA 5AZIB 2IVPA 3DXKB 3U4LA 4CZFA 2GWKA 2YCHA 3AY9A 4FSVA 2H3GX 3M3ZA 2D0PA 2ASMA 4BRDA 2A42A 3VOVA 4FOIA 2IIRA 1V4TA 4BRFA 5LJWA 2W41A 3FFKB 1ZXOA 5BPMA 5BN9A 4RWTA 4H5NA 4PL8A 5JICA 3ZEUA 3MCPA 3VGKA 3L6QA 4BR0A 2DPNA 3P4IA 3TU5A 2FLOA 4RCHA 3MN9A 1GLJO 4XEIA 3H1VX 3A0IX 3R8EA 2Q97A 3DAWA 5FPNA 5AQQA 3EO3A 5BPNA 4B1UB 3WQUA 3C7NA 3BF1A 3ATUA 4BC4A 2V7YA 2YHYA 4BR5A 2P9IA 1E4GT 1KXPA 4XH4A 4BRGA 2BTFA 1KAYA 1QQMA 1QHAA 1DEJA 1H1VA 4FWOA 5AQHA 4H0YB 4BRIA 4BRCA 2D0OA 2NLXA 4DCHA 4JD2A 1MWMA 1NMDA 2GUPA 1WOQA 2P9LB 4EHTA 4ISGA 5AQIA 1J6ZA 4CI6A 2QWLA 4BR2A 3WXLA 1Z05A 2E2NA 3KHYA 5F0XA 1QZ6A 4H0XB 4QS9A 1NGAA 3M6GA 1IJJA 2VCPA 3UKUB 1YVNA 4A2BA 2QM1A 1TUYA 2FF6A 1HUXA 4BGBA 2CGKA 2I7NA 3H45C 4B1ZA 3SJHA 2P9NA 4NB4A 1CZAN 3U9ZA 1XUPO 1TUUA 4BG9A 5E26A 4H5WA 3O1WA 5AR0A 3DXMB 3UE5A 3RSEA 3LDNA 2Q31A 5AQLA 1NGCA 5AQFA 4CBXA 2YHWA 5AQKA 3HZ6A 2PAVA 3IMXA 4PKGA 3FZFA 2YJFA 5BN8A 4EHUA 4PL7A 4AM6A 5AQOA 5AQRA 1NGFA 3VERA 5JLFA 4K41A 4NO7A 4FWNA 3CIPA 2QWNA 3SLCA 4BVPA 3MN5A 1SQKA 3CETA 1EQYA 3QB0A 5JLHA 2QWQA 1DKGD 4B1VA 1E4FT 4BRPA 4BGAA 2P9KA 2J4RA 4BC2A 1GLEG 3ULEB 3W3DA 2YI1A 2Q36A 1ZBSA 3MN6A 1ZC6A 1T6CA 4FL9A 3HSCA 3H3OB 5AQYA 4CZHA 4F9OA 1GLLO 3VENA 4CZMA 5AQPA 3DJCA 4CZJA 4GY2B 5EVZA 2VYPA 3WT0A 5BPLA 2Q2RA 3CJ1A 5LY3A 5AQXA 1NGHA 1QQOA 3CERA 3AARA 3CJ7A 2E2PA 4AM7A 1JCFA 4IXCA 2NRHA 4KBOA 3AAQA 2F9WA 3BF3A 1NWKA 3O08A 4YDUA 3L4IA 1ATSA 4CZEA 3MDQA 2D4WA 5AQGA 3HM8A 4FWLA 3A5NC 5JMVA 4H0TB 1X9JA 2WUSA 3QBWA 3FZHA 4YDUC 1NLVA 1MWKA 2GTDA 4BRQA 5AQNA 1KAXA 4MO5A 4QS7A 1R59O 4H03B 3UKRB 3CQYA 4GNIA 1K8KB 5AQWA 4M7YA 3L0QA 3W0LA 2P9SA 3VGLA 2YHXA 4K43A 2FSKA 2P9UA 3QMLA 4BRKA 4BREA 4K25A 4FPAA 1NGGA 5F1XA 1HKCA 3BUZB 3O1BA 5BRFA 3LM2A 3A5LC 3WXIA 4PKIA 3D2FA 1NBWA 1BOTO 4J8FA 3ZETA 3WXKA 1BUPA 1YAGA 3M1FA 5ADXA 1MDUB 2V52B 3G25A 4E1JA 5AZJB 4IWVA 2Q0RA 1Z6RA 3H46O 4H5VA 2ZGZA 4IJNA 3AAPA 4BRNA 3D2EB 1IG8A 3O4WA 1WUAA 5BRHA 4CBWA 4BR4A 1U2VA 2ZF5O 1U6ZA 2E1YA 3OHRA 5AQZA 3LM9A 4CBUA 4I6MB 2CH6A 5BRDA 1GLAG 3IDHA 3GOIA 4MLHA 5AQTA 2P9PA 5AQJA 2HF4A 2A5XA 3VEXA 5ADXH 3EL2A 4BQZA 1YXQA 3R9PA 5EY4A 4EAHD 1C0GA 3R6MA 4O8KA 5AZIA 4BR7A 3DXKA 3U9DA 5AQVA 3WXJA 3IUCA 4BRHA 3VEWA 2A3ZA 3WEEB 3ZX2A 3ZX3A 1GLBG 4HWIA 1HX1A 1LCUA 4CD1A 1G99A 1BA0A 5KQ8A 4BC5A 4A2AA 4BVOA 2E88A 1TYQB 3CQXA 5AQSA 2V51B 1YUWA 3U8XA 2E8AA 4IO8A 3VF2A 1V4SA 3SMPA 1NGJA 2AP1A 3GE1A 3HBTA 3QFPA 4BQLA 3CI5A 3TPQA 1Q18A 4JHDB 5LJVA 4M63C 3SMSA 4BG8A 1OKJA 2IVNA 2HOEA 2D1KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H0VB 2HSTA 3RR7A 4C23A 3SQ2A 2HVIA 2NUBA 4HHTA 4GV6A 2V7ZA 3PV8A 4KH4A 1S5JA 5K14A 3IFRA 3C94A 4JS4A 3QINA 5KQDA 3NFAA 2O8FB 1TK0A 3ZSWA 3LDQA 4NLBA 3TTFA 4O5FA 3V4IA 3A5OC 4OPHA 2KZMA 1BL3A 1WT7A 3QNNA 4AB0A 1HRHA 5BR9A 1TKDA 1N6QA 4KHSA 1W97L 4C8NA 5JS2A 2HNYA 1RBVA 1K73O 3DLBA 5FPMA 3CJBA 2CH5A 4WE1A 2F8TA 3F9KA 1POIA 2ASOA 3G71N 5E84A 2LSNA 4JRPA 5IWAK 2QTDA 4H5RA 2E6MA 3DXMA 5FDLA 1RT2A 3SV3A 3VTIA 5J2QA 1C56A 4KHNA 1VQPN 3GL1A 1ZYVA 5AJ3K 1VSLA 2AA4A 1FKOA 4XIUA 4JAXA 3JSMA 4GW6A 1VQ5N 1S3XA 2M8BB 3HVTA 5AQUA 3KLGA 4AQYK 2MZ0A 2G8HA 3CJ9A 2I5JA 1XNRK 5C42A 3NVKA 1OVYA 4KREA 2HMPA 2NRTA 3IKMA 3KOYA 1ITGA 4JN4A 3FR0A 1RCHA 2FC0A 4FWPA 1HPZA 1FK9A 3RMBA 3B6OA 4BRMA 3ULDA 3E9PA 3KP1A 3CW4A 1REVA 4JNEA 1B9DA 3M8QA 1WBDA 2Z1HA 3EN9A 3OYIA 4GV9A 4XH5A 3CCUN 5AFUA 1ATNA 3PSIA 4OPAA 3MWTA 1EXQA 2EWSA 3ENBA 4LD0A 5C10A 2GELA 1W2BM 4B9QA 1C0FA 3CHWA 1MYNA 3ZT2A 1DGKN 3OVNA 5ELZA 4DF8A 2Q0UA 3AGRA 3C0BA 2FSNA 4CEOA 3TI0A 3VESA 4O0JA 1B3CA 3HVRA 3DLGA 4DFKA 2UYTA 2C1GA 1DJTA 4WQ5A 2ZM6K 2W42A 3UKRA 4BC3A 2D0CA 4BROA 1HNIA 5AFUH 5CZ2A 4DTMA 4B1WB 1XMQK 1EWRA 5KPTA 3FZKA 4A59A 1KV0A 5C2DA 1LWEA 3TAPA 4NYNA 1LQIA 3PO5A 3WNEA 3MEDA 3CJCA 3ENHA 5LL6Z 5SWMA 3VEYA 2Q1NA 3KK1A 4FLTA 1HYZA 3PX0A 3RRGA 3E66A 1FW6A 1KFDA 4YY3K 3V9UA 2LN8A 3CPWM 3D2EA 1ZBHA 4ILHA 4CECA 2P9UB 2ASPA 2KKZA 4MQ3A 1LOTB 3TAFA 3O80A 4DV5K 2G2KA 1HNXK 4C8LA 3DOLA 3D2FB 3JXUA 1SAZA 3MWPA 3ZETB 4CZGA 4FPBA 2F9TA 1NNEA 5EXWA 2ATBA 3U3GA 3ISNC 1S1XA 2YIPA 3MK6A 4ZTFA 2KJAA 2OTJN 2YEOA 1HNZK 2SN3A 1U2VB 4MLEA 5EOYA 2KHOA 1JCEA 4EP5A 4BE0A 4CHYA 1WAJA 1UWBA 4IO9L 4DV1K 4PHTX 1LWCA 1SL2A 4A5BA 1NOZA 4A62A 4KTWA 3VETA 2GUIA 1S22A 2QXLA 3TWHA 3VGMA 3QFUA 3ZSQA 3CC7N 1TAUA 4UJ0A 2P9PB 3PX6A 2ZJPL 4IEIA 1FXXA 5EU7A 1JCGA 1JL1A 3MX5A 3H6EA 2E1ZA 2UXDK 4MO4A 4OGCA 4FJ9A 4DHYA 1X3MA 1AHOA 4FJMA 3AY9A 1CZ9A 1C1CA 4J2AA 3DRPA 5CR4A 3VOVA 3FFKB 1T1TA 5CY0A 5BPMA 4DU4A 4FK0A 4TSXA 4CJQA 4DS4A 3A2FA 3KWGA 4YOWA 4GV3A 3TU5A 2FLOA 4DR7K 3H1VX 4BWJA 4KHYA 1BI4B 3WNFA 2O8CB 1JLBA 4Z4CA 4HCBA 5AQQA 1X9MA 5BPNA 3WQUA 3ATUA 2MN5A 4BR5A 1KXPA 3LP0A 4BRGA 2BTFA 3AVCA 4E7HA 3DLRA 4YNQA 4N76A 5AQHA 2WFBA 4DCHA 3T1HK 4JD2A 1QSLA 4FJ5A 3TSPA 2E3GA 2GUPA 2P9LB 3TAEA 4DS5A 2QWLA 4BR2A 1NKCA 1K9MO 2UXCK 3CYGA 4H0XB 4QS9A 2PYLA 4LFAK 1NGAA 3ZLJA 3UKUB 4FJ8A 3H08A 3SZ2A 4B1ZA 2P9NA 2DFHA 3U9ZA 2FBXA 1ICAA 4LFCK 3LDNA 2Q31A 2F7TA 3TANA 1WSEA 4CBXA 4CGFA 5E41A 4FLVA 1OH7A 4B9UA 3T19A 3IMXA 4EHUA 5M1OA 4U67L 1UA1A 4DQIA 3KWIA 3M8RA 4OKJA 3AO3A 1BGXT 5J2MA 4CHOA 1XC9A 1EQYA 1RT6A 1A5WA 3AA2A 2P9KA 4BC2A 1GLEG 1BMRA 1OVQA 3W3DA 1GOCA 1KLMA 3V81A 4JKCA 3MX2A 3HSCA 5D3GA 5AQYA 1P00A 4CZHA 2HNZA 2Z1IA 1F21A 4F9OA 3ZT0A 2OZSA 1GLLO 1P0AA 3DJCA 1Z26A 1B9FA 3Q7CA 4E0DA 4DR1K 5BPLA 3CJ1A 4WF9L 3QNOA 4JEPA 4I7FA 4AM7A 4AILC 3RR8A 4DG1A 5KGWA 3BF3A 1NWKA 2XY6A 3E7RL 3PSMA 4CZEA 2YILA 3S3OA 4AHCA 4R79A 3QBWA 4YDUC 3L2RA 4O4GA 4E89A 4NCAA 1YIJN 4BRQA 1VSEA 1K8BA 1NK7A 1VK0A 4DTXA 2KTQA 3CCLN 3CFOA 1K8KB 3NE6A 3W0LA 2P9SA 2LJ7A 3QMLA 4B3SK 5HRNA 1RILA 1NGGA 1HKCA 2UU9K 4LSNA 5BRFA 1S6QA 3HO1A 2KQ2A 1JLFA 1NBWA 2X6SA 1BOTO 3C6TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4H0V B;  2HST A;  3RR7 A;  4C23 A;  3SQ2 A;  2HVI A;  2NUB A;  4HHT A;  4GV6 A;  2V7Z A;  3PV8 A;  4KH4 A;  1S5J A;  5K14 A;  3IFR A;  3C94 A;  4JS4 A;  3QIN A;  5KQD A;  3NFA A;  2O8F B;  1TK0 A;  3ZSW A;  3LDQ A;  4NLB A;  3TTF A;  4O5F A;  3V4I A;  3A5O C;  4OPH A;  2KZM A;  1BL3 A;  1WT7 A;  3QNN A;  4AB0 A;  1HRH A;  5BR9 A;  1TKD A;  1N6Q A;  4KHS A;  1W97 L;  4C8N A;  5JS2 A;  2HNY A;  1RBV A;  1K73 O;  3DLB A;  5FPM A;  3CJB A;  2CH5 A;  4WE1 A;  2F8T A;  3F9K A;  1POI A;  2ASO A;  3G71 N;  5E84 A;  2LSN A;  4JRP A;  5IWA K;  2QTD A;  4H5R A;  2E6M A;  3DXM A;  5FDL A;  1RT2 A;  3SV3 A;  3VTI A;  5J2Q A;  1C56 A;  4KHN A;  1VQP N;  3GL1 A;  1ZYV A;  5AJ3 K;  1VSL A;  2AA4 A;  1FKO A;  4XIU A;  4JAX A;  3JSM A;  4GW6 A;  1VQ5 N;  1S3X A;  2M8B B;  3HVT A;  5AQU A;  3KLG A;  4AQY K;  2MZ0 A;  2G8H A;  3CJ9 A;  2I5J A;  1XNR K;  5C42 A;  3NVK A;  1OVY A;  4KRE A;  2HMP A;  2NRT A;  3IKM A;  3KOY A;  1ITG A;  4JN4 A;  3FR0 A;  1RCH A;  2FC0 A;  4FWP A;  1HPZ A;  1FK9 A;  3RMB A;  3B6O A; 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