1BOTO

Crystal structure of the complex between escherichia coli glycerol kinase and the allosteric regulator fructose 1,6-bisphosphate.
Total Genus 178
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
178
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
KKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGGKGGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords PROTEIN (GLYCEROL KINASE)
publication title Crystal structure of a complex of Escherichia coli glycerol kinase and an allosteric effector fructose 1,6-bisphosphate.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transferase
total genus 178
structure length 497
sequence length 497
chains with identical sequence Z
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-08-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1botO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1botO01
2P9KB 2D0OA 4BQZA 1QQNA 2AP1A 3ENHA 3KHYA 5F2RA 4BR5A 2P9LA 1GLFO 4QS8A 3GBTA 4PL8A 3WXLA 4BR9A 4BRHA 3VEOA 4CZFA 2D1KA 2QWOA 3A5OC 2E2PA 4FWSA 3WT0A 4Z94A 3H3OB 3SMSA 1TUYA 2QWMA 4O8KA 3DXMA 3VEYA 4BVOA 3HZ6A 4CBXA 3ZX2A 1Z6RA 3FZMA 4I6MA 2A6AA 5B8HA 2YCHA 3QBXA 2ITMA 1H1VA 2P9NB 3QMLA 4FSVA 3FE1A 5ADXH 4A62A 3IDHA 4QS7A 4DQ8A 5AQSA 1HKGA 5AQLA 2D0PA 4FL9A 1QQOA 3UE5A 2QWPA 3IFRA 1ATSA 1DGKN 4EFHA 5BN9A 3ULEA 4FPAA 4WQ5A 2GWKA 2E1YA 5AQOA 1HJOA 3FZFA 2I7NA 2QW9A 1XC3A 2ASMA 4H0XB 3A8YA 4J8FA 1NGBA 4WQ4C 5BR9A 3R8EA 3M3ZA 3EO3A 3O8MA 4BROA 2A41A 1JCGA 4XH1A 2VYPA 1KAXA 2E8AA 3WUHA 2E2NA 4M7YA 2FSNA 2ZGZA 4FWPA 4YDUC 4CZJA 2F9WA 5TKYA 3ZEUB 3ENOA 4JHDB 2ZGYA 2PAVA 4CZMA 3DJCA 3G25A 3HBTA 1BDGA 3L6QA 1NGJA 4QS9A 4BG8A 1KXPA 1X3MA 4BRGA 2NLXA 4BRKA 2QWNA 3U9DA 4A2BA 3BUZB 4JD2B 3TPQA 1T6CA 4NO7A 1LCUA 4CZLA 2AA4A 3HI0A 1GLDG 3QDKA 4IJNA 3CHWA 3CJ7A 4L3QA 1GLBG 1XUPO 4H5WA 5AR0A 5BRDA 3EKSA 1NGHA 4BR4A 1NMDA 4RCHA 1K8KB 1HPMA 4ISGA 1XQSC 1EQYA 3S41A 1ATRA 1BU6O 2FF3B 2EWSA 3JXUA 3JS6A 4FO0A 4MO5A 3ZX0A 5FPDA 4BR0A 5KPRA 3EL2A 1QZ6A 3TU5A 4BVPA 4CD3A 4F9OA 2V52B 5KQ8A 4H5VA 3HSCA 2P9UB 1GLJO 2A5XA 4A2AA 4B1ZA 3EN9A 1NGAA 4EHUA 5AFUA 2Q0RA 4H0OA 5LJVA 2IVPA 5BN8A 3QICA 5FPMA 4BC4A 1U2VB 3VGKA 4BC2A 2GEMA 1WUAA 3IUCA 5AQXA 4B1YB 2Q0UA 3O08A 2VCPA 4KBOA 5AQFA 3W0LA 3ZETB 3CJ9A 1JCEA 4K43A 5FPEA 1NM1A 3I33A 3LDLA 2P9KA 1X3NA 3L4IA 4IZ9A 3VPZA 2KHOA 4RWTA 5EXWA 2IIRA 2W40A 2W41A 3AARA 3FZKA 4JNEA 3VF2A 4EIAA 2ASOA 4XH4A 4FPBA 5EX5A 1KAYA 3CJ1A 3FR0A 3DAWA 5AQYA 3O1BA 2V7ZA 3SK3A 3KVGA 3EKUA 3H45C 4EHTA 1RFQA 4JN4A 2P9NA 2FLOA 3VEWA 3MCPA 4DCHA 5CE3A 1TYQB 1G99A 1IG8A 3O1WA 3FZHA 1C0GA 4BGBA 3MMVA 5AQUA 4BG9A 4BRPA 2A3ZA 2V7YA 1MWKA 4GY2B 4H0TB 4IO8A 4M63C 4BRCA 2CH5A 3QB0A 3ID8A 5BPMA 3MN6A 3ATUA 2F9TA 3EZWA 4CZGA 1SQKA 4BC3A 1Z05A 2HOEA 2ZWHA 3H6EA 5AQNA 3ZEUA 1YAGA 3BP8A 2P9IB 4JHDA 3VF6A 3FLCO 2Q2RA 3QFUA 4B1UB 1SAZA 3D2FB 3D2EB 2HMPA 4IJAA 3FFKB 4BR7A 4Y0WA 5JLFA 4H5TA 1WOQA 4CJ7A 2Q36A 3ULEB 4CZKA 4JD2A 4BRIA 4BREA 4FWNA 2CGJA 2E2QA 4C23A 3UKUB 3P4IA 5AZIB 4H0PA 2YI1A 1U6ZA 4BGAA 5EOYA 1BWFO 1BA0A 2WUSA 5E84A 3C7NB 1BUPA 3U8XA 4FWKA 1R59O 4A61A 1K8KA 3CETA 3CJBA 2NRHA 3OHRA 4FOEA 2BTFA 1KAZA 4PKHA 3SLCA 3VOVA 3H1QA 4LC9B 4CBUA 3VETA 4EAHD 4WYBA 3VGLA 3SJHA 1NGGA 1GLCG 5AQQA 5AQMA 4FWOA 1YXQA 5F0XA 4RTFD 5AQPA 5I9EB 3HTVA 5AZJB 3GDQA 5BPNA 1P8ZA 2P9UA 4B1VA 2BUPA 3H1VX 3H3NO 3AY9A 4XH5A 4BRLA 3RSEB 2QXLA 3D7EO 3R9PA 3AAPA 3QFPA 5BPLA 3VESA 1U2VA 4WQ5C 1JCFA 1IJJA 3IMXA 3WQUA 3U4LA 4HTLA 1HX1A 3GL1A 5AQJA 3I8BA 2YHXA 3CERA 3VEXA 3DXKA 4ISFA 3ZETA 2P9PB 2QWRA 2YHWA 1NWKA 3CJAA 1QHAA 3LDNA 2ASPA 3C0BA 3ATVA 4PKGA 4WQ4A 3M1FA 1ESVA 2CGKA 1ZBSA 3MN5A 2CGLA 3WEEB 3L0QA 3H46O 5KPZA 1LOTB 1NGFA 3A5MC 3GE1A 3LM9A 4YDUA 2GELA 2HF4A 5EVZA 1RGIA 1E4FT 5KQDA 2D4WA 4PKIA 1YUWA 4B1XB 3DWLA 4PL7A 2E1ZA 2I7PA 4MO4A 3GG4A 2GUPA 1T6DA 4ISEA 3UKRB 1TYQA 4O5FA 3WQTA 1ZXOA 2FSJA 2P9SB 4E1JA 1S22A 1SZ2A 3LDPA 1HKBA 2CH6A 3A5LC 5AQHA 3KZBA 4H5RA 3VEVA 3BEXA 4CI6A 4JAXA 4M7XA 2J4RA 1X9JA 5AQTA 2A42A 3CIPA 3LL3A 4DB3A 2P9LB 1RDWX 4FWQA 3MN7A 5AQVA 3U9ZA 5BRHA 4HWIA 3M6GA 2P9IA 3DXMB 3LDOA 4XEIA 4MLEA 1HKCA 4FWRA 4I6MB 5ELZA 3FGUA 1YVNA 3D2FA 3D2EA 1TUUA 3LM2A 4BRAA 3MK6A 5LJWA 2FF6A 2QWLA 3VF4A 4FOIA 3B8AX 1S3XA 5AFUH 2E20A 2DPNA 1CZAN 3F9MA 4BRDA 2YJFA 1ZC6A 5AQRA 3CJCA 2YHYA 3VEZA 3UB5A 3MN9A 4BRFA 3LDQA 3UKUA 5AZIA 1OKJA 3CQYA 2NZTA 3FZLA 1MWMA 4FWLA 5AQGA 4BQLA 2OANA 3GOIA 1QQMA 2GTDA 1NGDA 2Q1NA 3C7NA 1E4GT 5KPTA 1MA9B 4H0VB 2E2OA 2E88A 5JICA 4H03B 5LY3A 3VGMA 4CD1A 1BO5O 2HF3A 5E26A 2YJEA 1HLUA 4BRQA 2QWQA 5F1XA 5FPNA 3W3DA 2A40A 1MDUB 4CZEA 2QM1A 2VWBA 5AQZA 1J6ZA 5AZJA 1DEJA 2GWJA 4K25A 3R6MA 4DHYA 3BF3A 2FSKA 5BREA 1NBWA 4IXCA 2Q31A 3RSEA 1V4SA 4AM6A 3QBWA 3AAQA 2Q97A 5BRFA 5ADXA 3CI5A 1BA1A 1BG3A 4H0YB 2IVNA 2H3GX 1GLEG 2PBDA 2ZF5O 3O4WA 4CBWA 4CZIA 3SMPA 2V51B 1GLLO 4H5NA 1D4XA 3O80A 3ZX3A 1NGCA 5AQKA 2P9PA 5JLHA 5AQWA 4NB4A 4IWVA 4B9QA 1V4TA 3WXJA 1NLVA 2UYTA 3CQXA 2IVOA 3A0IX 4MLHA 1NGEA 1T44A 4CZHA 3WEEA 3O6WA 4BRNA 5EY4A 3MDQA 3O5BA 3A5NC 1BOTO 4AM7A 1DKGD 4BRMA 4BC5A 1C0FA 1QZ5A 3WXKA 3VERA 3J8AA 3HM8A 1HUXA 1Q18A 5JMVA 4GNIA 1GLAG 4BR2A 4K42A 1Y64A 3UKRA 3DXKB 2FXUA 1ATNA 1NGIA 4FWMA 3WXIA 4B1WB 2P9SA 3BF1A 5AQIA 4K41A 3VENA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1P90A 1S9GA 1QQNA 4WCEL 2AP1A 4LFAK 4KAZA 2P9LA 1GLFO 4CJRA 2KFZA 1X1PA 3H3OB 1TUYA 3O9TA 4NYNA 4O8KA 4BVOA 3AO3A 3ZX2A 1C0UA 1JL1A 4I6MA 5B8HA 3TSPA 2ITMA 1HPZA 1H1VA 3RVCA 3K5LA 3RRHA 2P9NB 2QKBA 5J2MA 3FE1A 3ZSWA 4A62A 5AQSA 1HKGA 3PIPL 1YHQN 2D0PA 4FLVA 4FJXA 1QVFM 1M1KO 3OS1A 4O55A 2OCEA 5HROA 4I2PA 4EFHA 5BN9A 3KK3A 1Y97A 2HHXA 4LF8K 1NK5A 2KZMA 1RTJA 2O8DB 3NGIA 2I7NA 3C6TA 1XC3A 4WQ4C 1U45A 3M3ZA 1WSIA 3CCJN 1S1UA 4XH1A 3HO1A 1N6QA 3D45A 4YHHK 4CZJA 5KGXA 4Z4EA 4DLEA 3LWLA 4FK2A 3HJFA 4CZMA 1W9HA 3C94A 3NVMA 4PA1A 3OVNA 1LWEA 1DLOA 4BRKA 4YNQA 2O8FB 4K0KK 1T6CA 4U67L 4CZLA 1OVQA 3E01A 1SKRA 3OJUA 4IJNA 3CHWA 2ZJRL 3CJ7A 3V1QA 1GLBG 3OYJA 1XUPO 1NGHA 4RCHA 2QA4N 2HHWA 4ISGA 5M1NA 1YF5L 3MX5A 4V19S 1ATRA 1BU6O 3JXUA 3ZX0A 5KPRA 3C6AA 4F9OA 3VQ7A 3HK2A 2VGNA 4ICLA 2A5XA 3AVIA 3THWA 2DTUA 1NGAA 1QSYA 4EHUA 3RTVA 4I9LA 2IVPA 3P1GA 3AA5X 2QI2A 5FPMA 4BC4A 4DS4A 2OPPA 1BGXT 1WUAA 2DFFA 2GEMA 3IUCA 3QNOA 4CIGA 1TK8A 2VCPA 3AA4A 3WNGA 3LALA 1JXBA 4K43A 5FPEA 3I33A 2Z1HA 1VQON 3K9JA 1VQLN 1X3NA 3L4IA 4IZ9A 4IFYA 5EXWA 3AVCA 1RBTA 3OA9A 3QIPA 4JNEA 4EIAA 1LAVA 4F4KA 4FJHA 2WOMA 4ID5A 1L3UA 4K8XA 4FJ7A 2VG5A 3KVGA 3EKUA 4FZZA 2P9NA 3VQ8A 2FLOA 3MAQA 4J2DA 3QERA 4CEBA 2F4VK 3NAEA 3FZHA 1EP4A 3Q7CA 4A59A 4BGBA 1U49A 1N32K 3AVAA 4FYDA 1KSPA 2G8FA 1MWKA 2O8DA 4H0TB 4KV8A 4WFNL 4BDZA 4DTPA 3AA3A 4DQRA 1RNHA 3NGYA 1JLCA 1XNRK 3PY8A 2F9TA 4E7JA 4AQYK 1GOCA 5AQNA 3CMAN 3J81O 3BP8A 1ASUA 4GKJK 3SCXA 4IJAA 4NYFA 4BR7A 4Y0WA 4A5AA 4H5TA 3AO1A 5JS2A 4HUEA 4KHSA 2E2QA 3HYFA 4YOUA 4UY8O 2YHAA 2Z1JA 4FLXA 3T1YK 2E5LK 4FJGA 5E84A 3KJVA 1R59O 1D9DA 4PWDA 3CETA 3CJBA 3OHRA 4JK9A 4AILC 4KB1A 2VWKA 3PX0A 1I94K 3H1QA 3TAEA 3AGRA 3KLGA 4FZYA 3VETA 4EAHD 4C8OA 4WYBA 3VGLA 3QEVA 3OYCA 4LFCK 1VRTA 4DQSA 4RTFD 5AZJB 3OBYA 3SV4A 2BH1A 4EZ9A 3H3NO 1ILYA 1VSJA 4OPHA 1C1BA 3D7EO 3AAPA 3QFPA 4B3OA 3S9HA 5BPLA 5GAHP 4DU4A 3WQUA 3U4LA 5GADP 4HTLA 1HX1A 1OH5A 2YHXA 1RDUA 4B3SK 3CERA 2G8VA 2QWRA 1VQKN 2X6NA 3NH0A 1T3VA 4DS5A 1HR0K 4FCYA 3VA3A 4WQ4A 5C24A 3V6DA 1U47A 2EX3A 3NFAA 4IO9L 1E3MA 1SL2A 3WEEB 2OTLN 2X78A 1BQMA 1K6YA 4CF0A 1QS4A 5EVZA 2QTDA 4DKWA 1KQSM 5C12A 4O4GA 1TKTA 2OZSA 3QO9A 4PL7A 2E1ZA 4ILGB 1JLGA 1YITN 1RBSA 2KFNA 3UKRB 2GUPA 1HQEA 2YNFA 2G8UA 3LDSA 3F73A 3CXCM 1IBKK 1RT1A 2FSJA 2P9SB 2RPIA 1IKYA 1S22A 3N4PA 4H5RA 3VEVA 1X9WA 1L5UA 1IO2A 3BEXA 4CI6A 1C1AA 4M7XA 3DRSA 4B8CA 1CXUA 3CIPA 4DB3A 3OTOK 1XNQK 4ILHA 4FWQA 2RE2A 1Q82O 2NRZA 1WSHA 3M6GA 1SL0A 1C1CA 1RTIA 1NNEA 5ELZA 3FGUA 3O9UA 1TUUA 3NDKA 4BRAA 4AHVA 3NBPA 4CFCA 1YJWN 3ZLJA 2WC9A 5AFUH 2NRVA 3RMDA 3L8BA 3F9MA 3AV9A 4DTXA 1ZBLA 2HB5A 3K58A 1NK8A 1FKPA 3AVFA 3J7ZO 3MXIA 3GOIA 2GTDA 1E4GT 4PHTX 3VTIA 3KD1E 1UAXA 4DFMA 4B9VA 2HF3A 2A1RA 5J2QA 1K73O 3K9KA 5SWMA 1U4BA 1LWFA 1MDUB 4HUGA 5AZJA 3PO4A 1DEJA 3V4IA 3U6FA 2GWJA 4FLTA 4IOAL 3CCQN 1NU0A 4JKDA 4KH6A 3I8DA 2Q97A 3ITHA 5ADXA 1BG3A 3C6UA 2H3GX 3PSFA 4FLWA 1YJNN 3WNEA 4CZIA 4CJLA 4L8RB 2V51B 1LAWA 1C0TA 1KVCA 3A2FA 4JKCA 4NB4A 2UU9K 1JJ2M 3VQDA 2UYTA 1IBLK 3L3UA 4MLHA 1NGEA 3WEEA 4BRNA 5JS1A 4OJRA 3ZSZA 4DR5K 4CHZA 3NHGA 5T7BA 2UUAK 3M8SA 1KCFA 2ATQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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