1BOTO

Crystal structure of the complex between escherichia coli glycerol kinase and the allosteric regulator fructose 1,6-bisphosphate.
Total Genus 178
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
178
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
KKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGGKGGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords PROTEIN (GLYCEROL KINASE)
publication title Crystal structure of a complex of Escherichia coli glycerol kinase and an allosteric effector fructose 1,6-bisphosphate.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 178
structure length 497
sequence length 497
chains with identical sequence Z
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-08-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1botO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1botO01
2YCHA 1MA9B 2H3GX 1U2VB 4M63C 4BRPA 2P9NB 3DXMB 1KAZA 4A61A 4BR5A 4O5FA 3IDHA 5B8HA 1XUPO 2HF4A 1NGJA 3W0LA 4YDUA 1E4GT 4HTLA 4MO5A 4BVOA 3CJAA 2QWMA 3D2EB 3FR0A 1QHAA 2P9IB 2ASMA 3HI0A 3ATVA 2YHWA 1NMDA 3TPQA 3M1FA 2ZGZA 3EZWA 3L6QA 3MDQA 3FGUA 3CQXA 5AQTA 3UKUA 1MWMA 3CIPA 1ATSA 4JHDB 2E1ZA 5AQKA 1TUUA 1NGFA 1K8KA 2E20A 4I6MA 5JICA 4FWOA 3U9DA 4RTFD 2QWRA 1YUWA 1TUYA 3VEOA 4BRFA 2V52B 5LY3A 5EX5A 3JXUA 3UKRA 1C0FA 3G25A 2Q1NA 3BUZB 3QFPA 1HLUA 2E88A 3WQTA 4AM6A 4BR7A 4IZ9A 4H03B 3EL2A 4BC2A 2AA4A 1HKCA 3CETA 4FOIA 4H5NA 4H0XB 3ULEB 2IIRA 1RDWX 2ZWHA 1IJJA 1JCFA 3FLCO 1DKGD 3HM8A 3FZKA 3LDLA 4PKGA 1S22A 5KPTA 3ZX0A 3DAWA 3R6MA 1MDUB 1XC3A 2PBDA 2D1KA 4H0OA 1ZXOA 4WQ4C 3WXLA 2IVOA 1GLBG 3VGKA 3IMXA 2FSNA 3MN6A 3QBXA 4EIAA 2P9UB 4JNEA 5ELZA 4FWRA 2FLOA 4BRKA 1HKBA 4H5RA 4Z94A 2A5XA 4JAXA 4Y0WA 4K25A 4B1WB 2GTDA 4CZHA 2F9TA 4FWKA 3A0IX 2E2NA 2D0OA 1NGDA 1Q18A 3O80A 1ZBSA 4FO0A 3CJ1A 3QMLA 4JN4A 1BOTO 4KBOA 4BRMA 4RCHA 2ASOA 4BVPA 1BUPA 3D2FB 1HJOA 3DXKA 3F9MA 1TYQB 3WEEA 1MWKA 3O5BA 4CZEA 3LL3A 1QQOA 2P9LA 3A8YA 3ZEUB 1HKGA 4EHTA 1GLLO 2GWJA 1QQNA 2NZTA 2FXUA 4ISEA 3KVGA 3GL1A 4BRLA 3A5LC 3BF3A 5AZIB 3L0QA 2AP1A 3FZHA 1GLCG 4CZGA 3CJ9A 4CZFA 2E1YA 3VF4A 3QFUA 1NLVA 4EAHD 3H46O 1U2VA 3QBWA 3LM9A 4NO7A 2NLXA 2P9NA 2V7ZA 3DXMA 4BQLA 1X3MA 1XQSC 1BA0A 2QM1A 3O1BA 5TKYA 3SLCA 3GG4A 1EQYA 4BG9A 4AM7A 2IVNA 3D2EA 2YHXA 3ZETB 3SK3A 2Q2RA 4CBUA 2P9IA 5BPLA 3U4LA 2HF3A 4BRQA 1HPMA 4FOEA 4O8KA 4PKHA 5AQZA 3O4WA 3VF2A 3C0BA 3FZFA 1LOTB 1V4SA 3MMVA 4JHDA 4H0VB 3EN9A 4F9OA 2EWSA 2HOEA 4XH5A 5AQIA 4BROA 4BR4A 2D0PA 4XEIA 3UB5A 2HMPA 4IWVA 4K42A 1YAGA 4B1ZA 1X3NA 2J4RA 5AFUA 2W41A 4BGBA 1P8ZA 4B1VA 4WYBA 3AARA 5AQXA 1R59O 3WXKA 2P9PB 1RGIA 2CGKA 5LJWA 3ULEA 1WUAA 5AQJA 3CHWA 3IFRA 3M6GA 1SZ2A 5FPNA 2DPNA 1DEJA 2QW9A 1NGCA 2QWQA 3C7NB 4BQZA 1G99A 3CJCA 4CZLA 3MCPA 3HBTA 3O1WA 2A3ZA 4MO4A 4A2AA 1J6ZA 2P9UA 2V51B 2CH5A 2A40A 3ATUA 1NGBA 3BF1A 3VENA 1QQMA 3A5MC 4IJAA 4BRNA 3VOVA 4C23A 1RFQA 4H5VA 2UYTA 3RSEB 4PL7A 1BWFO 1CZAN 3ENHA 3EO3A 5AQYA 5AZJB 4BRCA 4FL9A 1E4FT 2Q97A 5LJVA 3D2FA 4BREA 3HZ6A 3VPZA 1S3XA 2P9SB 3SMPA 4A62A 2I7PA 1TYQA 4HWIA 4JD2B 2QXLA 3EKUA 5AQQA 3P4IA 4L3QA 3ZEUA 4EFHA 1H1VA 3WQUA 2P9KB 2BTFA 1Y64A 2ZGYA 3B8AX 1QZ5A 3ENOA 1Z6RA 5BN9A 1T6CA 4IXCA 4XH1A 1ATNA 4E1JA 5AZIA 2GWKA 3M3ZA 5AR0A 4DCHA 3H1QA 3I8BA 3MN7A 4BRHA 4QS9A 5JLFA 4FWQA 1C0GA 2F9WA 3WUHA 2GUPA 1YXQA 2QWLA 3H3OB 4PL8A 5F1XA 4WQ4A 3WT0A 3MN9A 3W3DA 4B1YB 3H3NO 4RWTA 2A42A 5FPDA 5JMVA 5AQUA 5AQSA 4BGAA 4BR0A 1ESVA 4J8FA 4M7YA 5AQFA 2V7YA 1D4XA 5FPEA 1NGGA 2VYPA 4LC9B 1Z05A 5BRFA 5ADXH 5AQGA 3QB0A 1GLJO 3BEXA 3VF6A 3KHYA 3ZETA 5BPMA 2E8AA 1T6DA 1GLAG 4BR2A 2NRHA 4M7XA 3A5NC 2FF3B 4XH4A 1GLEG 1IG8A 5KPZA 1NGAA 3GOIA 2QWOA 3LDPA 5KQ8A 1U6ZA 5F2RA 4BC5A 5E84A 1NBWA 3WXJA 1BG3A 1NM1A 2BUPA 4BRDA 1GLFO 3UE5A 5I9EB 3VESA 3VERA 4BR9A 4BC4A 3H45C 4H0YB 4FWLA 2P9PA 1OKJA 4DHYA 3LDNA 3DWLA 2VCPA 5F0XA 5CE3A 4CJ7A 2ASPA 1HX1A 2D4WA 2Q31A 2PAVA 2WUSA 3GDQA 3FFKB 2ZF5O 4WQ5C 3C7NA 3CJBA 1BA1A 4BG8A 2FSKA 2Q36A 2I7NA 4K43A 4B9QA 4H0PA 1DGKN 1HUXA 4H5TA 3VEVA 3O6WA 2E2PA 1YVNA 3HSCA 5ADXA 4GNIA 3FZLA 5AQWA 1JCEA 3R9PA 3U8XA 1JCGA 3WXIA 3L4IA 3FZMA 3H1VX 5AQPA 5AQRA 3RSEA 4MLHA 5BN8A 3SMSA 5AZJA 3CI5A 1LCUA 3CQYA 2CGLA 4B1XB 3ZX2A 5BRDA 4B1UB 3H6EA 5BPNA 2YHYA 4IO8A 3AAPA 2P9SA 3J8AA 3AY9A 5KQDA 2KHOA 4JD2A 3JS6A 4WQ5A 2IVPA 5AQMA 1WOQA 5BR9A 4IJNA 5AQHA 3LDQA 3VGMA 4CZKA 5E26A 3A5OC 5EY4A 2P9KA 3FE1A 3MN5A 4FPBA 3UKUB 3VEYA 2QWNA 1K8KB 4I6MB 5EVZA 2YJEA 4ISFA 3ZX3A 4BRAA 4DQ8A 1T44A 2VWBA 2CH6A 3UKRB 3LDOA 2ITMA 4ISGA 5AQVA 5AQNA 3VEZA 4CZJA 4CBXA 3GE1A 5AQOA 3S41A 3AAQA 5EOYA 2E2QA 1QZ6A 4PKIA 1GLDG 1SQKA 4GY2B 4QS8A 3BP8A 2OANA 3VEWA 3VETA 1BDGA 3GBTA 4CZIA 3QICA 1NGIA 1BO5O 4K41A 4BC3A 3LM2A 2FSJA 5BRHA 1KAYA 1ZC6A 3HTVA 3KZBA 5BREA 5JLHA 3ID8A 2GEMA 1SAZA 2FF6A 3OHRA 4FWNA 1NWKA 3CJ7A 3DJCA 4H0TB 2A6AA 4FWMA 4CD3A 4BRGA 1NGEA 1KXPA 2GELA 3SJHA 1ATRA 3VGLA 2YI1A 3CERA 3U9ZA 3EKSA 5AFUH 3R8EA 3MK6A 4MLEA 5EXWA 2E2OA 4CD1A 3DXKB 1BU6O 3WEEB 4CI6A 4FSVA 5FPMA 4NB4A 3O08A 4EHUA 2W40A 4YDUC 5AQLA 4DB3A 2Q0UA 4H5WA 2P9LB 1KAXA 3O8MA 4FWPA 4A2BA 4CBWA 4CZMA 4QS7A 2A41A 3VEXA 3I33A 1X9JA 3IUCA 4FPAA 3QDKA 2Q0RA 2CGJA 2QWPA 4FWSA 1NGHA 4BRIA 5KPRA 1V4TA 3TU5A 2YJFA 3D7EO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LWCA 4K8XA 1WSGA 3ZT3A 4B9MA 4GKJK 3LDSA 3DXMB 4DTNA 3ZCMA 1S1TA 4O5FA 4GW6A 4C8OA 4KTQA 4C8MA 1IKWA 1XHXA 1YJNN 4HTLA 4BVOA 3SAGA 3V81A 3BZCA 1RT4A 1VSMA 4CGJA 1QHAA 2P9IB 1S1VA 2ASMA 3HI0A 2YHWA 3TPQA 3FGUA 4MFBA 3C6UA 1ATSA 4JHDB 2E1ZA 5AQKA 4CHNA 3O9UA 5CZ1A 1K8KA 2P5GA 3V9UA 5JICA 1E3MA 2P1JA 2KLAA 3LP0A 2E6MA 5EX5A 4RW9A 3WQTA 1EX4A 3AA5X 4DR5K 4WE1A 4H03B 4BC2A 2AA4A 3OYHA 3QEWA 4FOIA 1RDWX 4FW1A 1JCFA 1DKGD 3CCJN 4DU3A 3LDLA 3K2PA 4G1QA 2BH1A 5KPTA 3R6MA 5GIPA 1QVGM 1N8RO 2XY5A 4OPHA 2IVOA 5FRNA 1QE1A 2FSNA 2P9UB 3G6EN 1XNQK 1IBKK 4H5RA 4DQIA 1HRHA 2OPSA 3L2UA 1B92A 2GTDA 4FWKA 5KRSA 2D0OA 4JKEA 5C12A 3WNFA 4WFNL 4BRMA 5TKWA 1BUPA 3CCSN 3KLFA 1B9DA 2Y1IA 5CY4A 3HVTA 1JXEA 3A8YA 1U48A 3PO4A 1NJYA 1QQNA 4FJLA 3KWGA 3NH2A 4LF7K 4M41A 3T1AA 3KJVA 2WTUA 2JWLA 1RT1A 4B8CA 3CJ9A 2UXBK 3SQ4A 3AVBA 1NLVA 3A2FA 4WFAL 3ZLJA 1U2VA 3DI6A 2PZSA 4CEQA 3QBWA 4NO7A 4CJ3A 2P9NA 4BQLA 4GV6A 3HL8A 2XY7A 1VSKA 4X65K 4FLWA 3SLCA 4CHYA 3MEDA 1EQYA 1RILA 3VN5A 1K73O 4DKWA 4DQPA 3QLHA 2DY4A 1BI4A 3G0ZA 4FK2A 3U4LA 1BIUA 3OJUA 3MXJA 3N4QA 3FZFA 4CGIA 1V4SA 3ID6A 3EN9A 4F9OA 4BROA 4M3TA 4XEIA 3C6AA 4K0KK 4V19S 4CJUA 5AFUA 4FZZA 2IOCA 2W41A 4BGBA 4B1VA 3LWMA 4DTMA 4FVUA 5LJWA 2UU9K 1RDBA 2WBNA 3U3YA 1WUAA 1TL1A 5M1OA 3IFRA 3M6GA 4B08A 3CCUN 2NRRA 3QESA 1VQ5N 3F9KA 2QWQA 3NF7A 3C7NB 1RDDA 3RR8A 4IKFA 3CJCA 3VQ7A 3HBTA 2UXCK 2JGUA 3VMFB 3VQCA 4A2AA 4Z4IA 2XY8A 2XY6A 3ZT4A 3ZSZA 4J2AA 2A40A 3CFOA 4AHSA 1Q86O 3TARA 2W6KA 1TAQA 3VENA 1QQMA 4IJAA 4BRNA 2PFUA 3TAPA 3J7YP 4W5QA 4HCBA 3BDPA 5I3UA 3NMUA 1BWFO 5BR8K 3ENHA 2W6LA 4YHHK 1N36K 1GOCA 1M90O 1QTMA 1Q9YA 4FK4A 2Q97A 4A5AA 3VPZA 1NMNA 4A62A 4CF9A 2O4GA 4HWIA 1VQ8N 1HJRA 5AQQA 1XC9A 1L3VA 2Z1IA 1YJ9N 1RBUA 2VG6A 3R1XA 4JI3K 1Y64A 3AA3A 4DTUA 3I56N 4ELVA 1RBVA 5BN9A 4IXCA 4BE2A 2O8CA 4DCHA 4YOUA 4BRHA 5JLFA 4FWQA 2HHVA 3O9RA 1OH5A 3MAQA 1JXBA 1ZBIA 4B1YB 1S9GA 4DQSA 3H3NO 4RWTA 5JMVA 1SKSA 2X78A 3M8SA 1D4XA 3NCIA 1JLQA 3ZSVA 4CJQA 4LC9B 4FLTA 1HMVA 2YNFA 3O9SA 3EY1A 4DSLA 1T6DA 3PX6A 1GLAG 4TSXA 3K57A 1CZ9A 1GLEG 3AVMA 2QWOA 5GAGP 3NHGA 3AVKA 4CJLA 1NBWA 1NM1A 4DV0K 4HUGA 5JS1A 3UE5A 5I9EB 2OPRA 2OPPA 3NF9A 4I9LA 3VERA 2RF2A 2VGNA 2YHBA 4FWLA 1Q81O 4DHYA 1KSPA 3F5TA 2VCPA 1BQNA 3Q7CA 2KKZA 3SV3A 3DRSA 1EWQA 3U6FA 2ZF5O 4WQ5C 5HLFA 1BA1A 1RBTA 1FW6A 2FSKA 4CJEA 2I7NA 3OW2M 1LWFA 1UOCA 3K59A 2ZJPL 4CEFA 3VEVA 2QEXN 1WN7A 1KC8O 4CF8A 2PYLA 1EKEA 1JLFA 3HSCA 4JI6K 3HP6A 2WONA 5GINA 4IFVA 3JYTA 5AQRA 3RSEA 4I7FA 3OYLA 4DSKA 2KQ2A 3CQYA 2CGLA 3ZX2A 4DFKA 2F8SA 1JLGA 2YHYA 2ZE2A 1VQLN 5JVGL 4DG1A 4GV3A 3JS6A 2IVPA 5HOOA 1KCFA 1RT7A 3LDQA 5I42A 5EY4A 2EHGA 3MN5A 1CLQA 4KI6A 3NF8A 3VEYA 4FLZA 3CC4N 4DU4A 2QWNA 4LF8K 1NJXA 2YJEA 4C1NI 4DQ8A 4CGDA 3QETA 2CH6A 3HM9A 1D8YA 4ISGA 5AQNA 5LL6Z 3SBTA 2ZJRL 2QXFA 2ZJQL 1KRPA 4BDZA 1SQKA 2OANA 4NXNK 1BDGA 5FROA 4CZIA 4JV5K 3QICA 1NGIA 1BO5O 1KVCA 4IDHA 4OJRA 1DT9A 5BRHA 1OVQA 1RBSA 3HPOA 5BREA 3KKRA 5JLHA 3DM2A 3J7AP 4NYFA 3MWPA 3OYFA 2NRVA 3CC7N 3CJ7A 1DTTA 3DJCA 1Z25A 4CD3A 1VQNN 4GMJB 4BRGA 1QHTA 1HQEA 4KFBA 1NGEA 5M1QA 1KXPA 1UAXA 4O55A 4GVMA 3QIPA 3VGLA 3RMAA 4ELUA 1TKTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3GOI A;  2PYJ A;  2I5J A;  3ZT1 A;  2HNY A;  3LDP A;  2A1S A;  4BC5 A;  1S1U A;  3WXJ A;  3RRH A;  2FBX A;  1IH7 A;  3OYD A;  4ZTJ A;  4JI2 K;  3DOK A;  1RDU A;  4JKG B;  4DQQ A;  5EU7 A;  3CYM A;  3DRR A;  1SV5 A;  5SWM A;  4CJ7 A;  3CCQ N;  1XMQ K;  2Q31 A;  1HX1 A;  2WUS A;  3C7N A;  4BG8 A;  3F73 A;  3HOS A;  1N33 K;  4H5T A;  3HP9 A;  2D5R A;  1RBR A;  1YVN A;  2R7Y A;  3OTO K;  1T3V A;  3CPE A;  1JCE A;  3QEI A;  5AJ3 K;  3U8X A;  3WXI A;  3L4I A;  3O4Q A;  4MLH A;  5BN8 A;  1YTA A;  5BRD A;  4CJ5 A;  5BPN A;  2Z1J A;  4CF0 A;  4F3O A;  3J8A A;  4W5R A;  2KHO A;  3RVC A;  5AQM A;  1WOQ A;  1O13 A;  5BR9 A;  4CE9 A;  3PIO L;  3A5O C;  5GAE P;  1F21 A;  1U04 A;  3M8Q A;  4KB1 A;  1JLE A;  4E3S A;  4F8R A;  3MXI A;  1ZBL A;  4KHS A;  4I6M B;  2KFZ A;  4NXM K;  2GX9 A;  1ITG A;  1S1W A;  4BRA A;  3L2Q A;  1S72 N;  1T44 A;  4DR3 K;  4YOR A;  1U45 A;  3SNN A;  4PHT X;  4OPJ A;  4CZJ A;  4CBX A;  1B9F A;  2E5L K;  2RE2 A;  3AAQ A;  5EOY A;  4PKI A;  1C0M A;  4HUF A;  2QK9 A;  1WBB A;  3T1H K; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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