1BOTO

Crystal structure of the complex between escherichia coli glycerol kinase and the allosteric regulator fructose 1,6-bisphosphate.
Total Genus 178
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
178
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
KKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGGKGGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords PROTEIN (GLYCEROL KINASE)
publication title Crystal structure of a complex of Escherichia coli glycerol kinase and an allosteric effector fructose 1,6-bisphosphate.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 178
structure length 497
sequence length 497
chains with identical sequence Z
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-08-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1botO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1botO01
1ZXOA 5F0XA 3H1QA 2E1YA 5EVZA 3O1BA 3U8XA 5BPMA 2E2OA 5JLFA 4DQ8A 1EQYA 2I7PA 3WT0A 2GELA 1S3XA 2WUSA 1DGKN 3ULEB 3QFPA 1GLCG 5FPDA 4BC3A 1QQOA 5BN9A 4QS7A 5FPEA 2F9TA 5AQTA 3HI0A 3KHYA 1TYQA 5LJWA 2E2NA 3SK3A 4H5VA 5AQNA 1NM1A 5FPMA 4B1XB 2IVPA 5F2RA 1U6ZA 2YCHA 4CBUA 2P9SA 3KVGA 2E88A 3FGUA 4K43A 4BG9A 2Q31A 4I6MA 3LM2A 1LOTB 3QB0A 3WXLA 1T6CA 3GG4A 3FLCO 4CZLA 1GLFO 5KPRA 1BU6O 5BN8A 1JCEA 3B8AX 2D0OA 4B1UB 3W0LA 3DJCA 2Q2RA 3EZWA 1ZC6A 4WQ4A 3MK6A 5F1XA 2P9IB 3LM9A 5AQYA 4CBWA 2GEMA 4YDUC 2A6AA 4FPAA 3VERA 3FZFA 3WXIA 4BRPA 4HWIA 3QBWA 4O5FA 3H3OB 4FWRA 3AY9A 3HSCA 4BQZA 4PKIA 3CIPA 1NGFA 3GOIA 3L6QA 4CZKA 3VEOA 1QZ5A 5AQPA 5BPNA 4IO8A 3L4IA 5AQRA 4BRKA 4EFHA 5BRFA 2A5XA 1C0GA 3VF2A 3H6EA 3SLCA 4DB3A 3IDHA 4Y0WA 3HZ6A 4H0VB 1Q18A 2PBDA 2QWPA 3CJCA 3C7NB 3RSEB 4BVPA 1T44A 2QWQA 4BR0A 4FSVA 2ZGZA 2QWRA 4O8KA 2YHXA 3VENA 1TUUA 3UKUB 4GY2B 3AARA 4FO0A 3H46O 4FWLA 3ULEA 2BUPA 2GWKA 3VGLA 1ATRA 2Q0RA 2FXUA 1MWKA 2D4WA 3CQXA 3MDQA 3ZEUB 3FZHA 2ITMA 5CE3A 3IMXA 1NLVA 4H0XB 3QFUA 4Z94A 4DCHA 3WEEB 3A0IX 4YDUA 3MN6A 4A2BA 2NLXA 3KZBA 3BF3A 4KBOA 3LDOA 1OKJA 3U9DA 1H1VA 3SMSA 3C0BA 3DAWA 1DKGD 3I8BA 5AQXA 1IG8A 2CGLA 2FF6A 4H0OA 4FWQA 2PAVA 3SMPA 2GWJA 1QHAA 1QZ6A 4H5NA 2P9IA 3W3DA 4NO7A 4K42A 1YUWA 3CJ7A 3A5NC 4EHUA 5KPTA 4DHYA 4FWNA 2D1KA 3LDLA 3LL3A 4BGBA 3EL2A 3VEVA 2QWMA 2FF3B 2NRHA 3A5LC 3A5OC 3VESA 1HLUA 3EKSA 2V7YA 3DXKB 2GTDA 3I33A 3MN9A 2FLOA 1G99A 2AP1A 3QICA 3FZKA 5KQ8A 3G25A 3VF4A 4B1ZA 4PL7A 1KAXA 2AA4A 2E20A 4A61A 3TPQA 2P9KB 1NGDA 4BR2A 1JCFA 5LJVA 1NGIA 1Z6RA 2YJEA 2V7ZA 4H5WA 3ZX3A 2ZF5O 4JHDA 3ZX2A 4BQLA 3A5MC 1ZBSA 5JMVA 3C7NA 3RSEA 4L3QA 1BG3A 4FOEA 2E2QA 3TU5A 3ATUA 4H5TA 4M7YA 1QQNA 3VEZA 4B9QA 2CGKA 3JXUA 1RGIA 2CH5A 4CZGA 1GLLO 1DEJA 3O5BA 3UKUA 3CJ1A 3H45C 2DPNA 3VF6A 4FWPA 5AZJA 3VGMA 1GLDG 1MA9B 2A42A 4CD3A 1U2VB 2QWNA 3ZEUA 2HF4A 2I7NA 1NGCA 3D2FB 4BR4A 2A3ZA 3IUCA 3MCPA 5AQQA 3WEEA 5JICA 2V52B 4FWMA 4B1YB 1HKBA 2QM1A 2KHOA 4ISFA 1NWKA 3GBTA 2IVOA 3VEXA 4BRIA 1D4XA 1RDWX 3MN7A 1Z05A 3D2EB 5AZIB 2BTFA 4E1JA 3R6MA 3QDKA 1V4TA 1BA1A 1S22A 4CZHA 2IVNA 4BRGA 5AQMA 4BRAA 5AQSA 5AQGA 5KPZA 1V4SA 3CJBA 1XQSC 4JHDB 2VWBA 3BF1A 3BUZB 2A40A 4FWOA 1E4FT 1WOQA 1TUYA 4BR5A 4M63C 2P9LB 2ASOA 5E26A 2QWOA 1X9JA 3DXKA 1HUXA 1SAZA 5AQZA 3O80A 1HKGA 3ENOA 2ASPA 5AZJB 3CJ9A 1ATSA 1K8KB 2ZWHA 2FSNA 4ISGA 5AQIA 4J8FA 2P9UB 2UYTA 2P9KA 4H0YB 3J8AA 3CERA 1NMDA 3OHRA 2QW9A 4NB4A 3CETA 1WUAA 3LDNA 4MLHA 3ZETB 3O08A 3ZX0A 2Q1NA 4BROA 1NGGA 5KQDA 1QQMA 4JNEA 3U9ZA 1R59O 1XUPO 4BRQA 1YAGA 1BA0A 1SZ2A 2F9WA 2QXLA 5AQWA 5ADXA 4CBXA 5ADXH 4GNIA 3L0QA 4EHTA 1U2VA 3DWLA 2YHYA 3AAQA 5AQVA 1NGHA 3MN5A 4K25A 1X3MA 3D2FA 4A2AA 3FZMA 1NGAA 3HBTA 3VPZA 4CZMA 5JLHA 3GE1A 3H3NO 4EAHD 1BWFO 5BREA 4BRCA 4JN4A 1NGBA 1YXQA 1NBWA 3HTVA 4M7XA 3O4WA 3O8MA 1SQKA 1J6ZA 4CZFA 4EIAA 2E8AA 1ATNA 5AZIA 3D2EA 4FPBA 5EX5A 2P9NB 3GDQA 3UKRB 5AQKA 3VEWA 4AM7A 5AQOA 4XH5A 3DXMB 4BG8A 3MMVA 2ZGYA 1YVNA 5AR0A 5AQLA 5EXWA 3ENHA 3UE5A 4CJ7A 2P9PA 3IFRA 1KAYA 1HX1A 2NZTA 3F9MA 4MLEA 1X3NA 3ATVA 4B1VA 2P9LA 2Q36A 4CD1A 2E1ZA 1E4GT 2D0PA 5E84A 3M6GA 1T6DA 3QMLA 3FE1A 4CZEA 1Y64A 2E2PA 2HMPA 4WQ5C 4F9OA 4BRDA 4CI6A 1NGJA 3CQYA 5AQUA 5BPLA 1K8KA 3FZLA 4FWKA 4BGAA 4BREA 2P9UA 5EOYA 3EO3A 4BRMA 4JAXA 2YI1A 4BRHA 3D7EO 4B1WB 1JCGA 4BRLA 4JD2B 3VOVA 5BR9A 5AQJA 1P8ZA 3ZETA 5BRDA 4FOIA 1C0FA 3VETA 2VYPA 4IZ9A 1NGEA 4CZIA 1GLBG 1GLAG 2CGJA 3LDQA 4C23A 3BEXA 4BRNA 3LDPA 1MDUB 3R9PA 3R8EA 2QWLA 4ISEA 2VCPA 2HOEA 2P9PB 3WUHA 2V51B 3VEYA 2Q0UA 4QS9A 4AM6A 2J4RA 4H0TB 4MO4A 4IXCA 3SJHA 3CHWA 4XH4A 3AAPA 4RTFD 4IJAA 4PL8A 3VGKA 4IJNA 1TYQB 2W41A 2P9NA 3FR0A 5ELZA 1LCUA 3M1FA 5TKYA 3UKRA 4CZJA 1KXPA 4PKGA 2GUPA 3O1WA 4WQ5A 1ESVA 1XC3A 4FWSA 5BRHA 3DXMA 4PKHA 4H5RA 2P9SB 4HTLA 2YHWA 4BR7A 2H3GX 4I6MB 3EN9A 3FFKB 5LY3A 3WQUA 1CZAN 1HPMA 5AQFA 5I9EB 2W40A 4BC2A 2IIRA 3A8YA 3JS6A 4RWTA 5B8HA 4H03B 3WXJA 4K41A 1RFQA 3S41A 1IJJA 3EKUA 2Q97A 4IWVA 1BOTO 2FSJA 5FPNA 2EWSA 1KAZA 3CI5A 4QS8A 3O6WA 4A62A 3BP8A 4H0PA 2OANA 3GL1A 3WQTA 3P4IA 1BUPA 4XH1A 5AFUA 5AFUH 4MO5A 4BC4A 2YJFA 1HJOA 4BVOA 2HF3A 3UB5A 4WYBA 4XEIA 1MWMA 3CJAA 4JD2A 3M3ZA 4BRFA 5AQHA 1GLEG 3QBXA 3HM8A 3ID8A 1GLJO 4BC5A 4WQ4C 4LC9B 2CH6A 4FL9A 1BDGA 4RCHA 1BO5O 2A41A 2FSKA 3H1VX 5EY4A 3U4LA 4BR9A 1HKCA 2ASMA 3WXKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VSIA 3H1QA 3O1BA 4KO0A 2E2OA 5JLFA 4DQ8A 2P5OA 5JS2A 1EQYA 3WT0A 2NRRA 2WUSA 1DGKN 3ULEB 2G8UA 3QFPA 2X74A 5FPEA 1VQ6N 1NK7A 4DLGA 2PY5A 2E2NA 4B1XB 3QEPA 4J2DA 1N8RO 2IVPA 5F2RA 1Q9XA 2KLAA 3DYAA 2E88A 1LWCA 4BG9A 2Q31A 1LOTB 1W7AA 3GG4A 1K73O 1GLFO 2EHGA 4CJFA 1TK5A 3AVCA 4H4OA 3V1RA 3QETA 4LY7A 4B3MK 2JWKA 2YNGA 1D9DA 4B1UB 4KH5A 4CFDA 1OVYA 3E01A 1VSEA 1JLFA 3VQ6A 2KFNA 4CBWA 4Y1CA 1RT7A 2P51A 4DFKA 2A6AA 2YKNA 3FZFA 3WXIA 1Q8IA 3QBWA 4KTZA 3VA3A 4DTRA 5C25A 2YHAA 3CIPA 4U67L 2VG5A 4O44A 3WXMB 5D3GA 2PYLA 1T7PA 2O8FB 1QZ5A 3QEWA 1YTAA 3K58A 4CJPA 4LFAK 4TSXA 3BZKA 3K5MA 3VF2A 4FJ9A 2RF2A 1QS4A 1TVRA 3IDHA 4PA1A 4LF9K 3C7NB 4FLWA 4CHNA 2QWQA 3B6PA 4RW9A 4BR0A 1NKEA 4FSVA 1YT3A 1WB9A 4KPYA 2QWRA 1CZ9A 3VENA 2E6MA 2NUBA 1EXQA 3E9PA 4F2SA 4I2PA 1ATRA 4CGHA 3MXIA 2OYQA 3L2QA 2D4WA 2ITMA 5CE3A 1TGOA 3IMXA 1NLVA 1J54A 5KRTA 4Z94A 3S3OA 4CJ3A 2YHBA 3AO5A 2G8WA 4LF5K 2ZJRL 4KBOA 2OA8A 5AJ3K 2OZMA 1T8EA 4M3TA 2RPIA 3DAWA 3I8BA 1W0HA 3MECA 3CFRA 5FDLA 4FWQA 4DTJA 3WNHA 4K42A 1HNXK 2D1KA 4JKFA 5M1QA 2QWMA 2NRHA 3VESA 3OY9A 1M90O 1FK9A 4JYAK 3MN9A 1MU2A 3TSPA 5KGWA 3QICA 1WAJA 3HPOA 3NF9A 2E20A 3F5TA 3TSUA 2X6SA 2P9KB 1NGDA 4I7FA 4GKKK 4E1MA 3AVKA 4AH9A 2RN2A 2YJEA 3AGKA 3OYLA 2V7ZA 5HL7L 2B6AA 2ZF5O 3ZX3A 2QTDA 1ZBSA 1K6YA 4PHTX 3ATUA 4IEIA 4M7YA 3CCJN 4DR4K 4B9QA 1TAQA 3DLEA 4KREA 4CJ4A 1X1PA 1GLLO 3UKUA 1DEJA 1U49A 4FWPA 3AVJA 3S3MA 4DSKA 4DR3K 2A42A 5K14A 4XIUA 3SNNA 1IKXA 4CD3A 2JWLA 1U2VB 4IFVA 4MQ3A 1VK0A 2QWNA 2I7NA 1NGCA 1I39A 2XY6A 4Z0UA 2O8CA 2HBMA 1HQEA 3HOTA 3CPEA 3IUCA 3MCPA 3AO3A 1X9WA 2IGIA 4B1YB 2QM1A 1KFSA 3CCMN 1XMQK 3GBTA 4DTXA 4W5QA 3OS1A 3QDKA 3RTVA 1BA1A 1S22A 3G0ZA 1ITGA 4CZHA 3HP6A 3LZIA 2OTLN 4NCBA 4KHWA 3VQQA 4NLBA 4FJ8A 1BI4B 4DQIA 4RG8A 3S3NA 1Y97A 3BUZB 3SQ2A 4ELTA 4M63C 2ASOA 3OYNA 2D0BA 3CC4N 4PQUA 3O80A 3ENOA 1L3VA 2VG6A 2ASPA 4O55A 5AZJB 3TANA 2WBNA 4OKEA 1ATSA 2ZWHA 1OH8A 4FJGA 3TAQA 3DLLL 4H0YB 5C42A 3RRHA 2HBJA 1RTHA 1RT5A 3CERA 3D6RA 2BH1A 4X64K 2GUIA 4MLHA 1HR0K 3KK3A 3ZYYX 1D9FA 4CW7B 5KTQA 4OPKA 1ILYA 1BQMA 2UXCK 4BRQA 4LF6K 3DOKA 1BA0A 2F9WA 1IBMK 1IO2A 4GNIA 4IDHA 3CCEN 4KHYA 3PV8A 3FZMA 3HBTA 4CZMA 1SKSA 3GE1A 4DR5K 2HMIA 1BWFO 4DF8A 3THWA 3DLRA 1EX4A 3PO4A 4Z4GA 3HTVA 3QIOA 2Y1JA 4YOYA 1ASUA 3D0PA 5AZIA 4V19S 4CGIA 4BE1A 3VQ9A 1U47A 2P9NB 3PSIA 2E6LA 5AQKA 5AQOA 1QQCA 4RW4A 3VQ8A 3ZSQA 4IKFA 4W5NA 1YTUA 4BG8A 2ZGYA 1YVNA 5AR0A 2HHWA 3UE5A 1ZBFA 3ZSZA 3IFRA 1G15A 4JRPA 4YFUA 1HX1A 3F9MA 4DR6K 1X3NA 4B1VA 1ASWA 3AVGA 4BDPA 4YNQA 3P83D 4BDZA 3KTQA 1E4GT 4CJWA 1OH5A 1T6DA 3ID6A 3QMLA 4CJ5A 4CZEA 4DU3A 4WQ5C 4DG1A 1IKVA 3KKRA 3S9HA 3CQYA 4FWKA 3DMJA 1VQ9N 4NCGA 4BRMA 1C0MA 4YY3K 4DV2K 4BRHA 2Z1IA 4JI5K 1JLQA 3Q7BA 4JD2B 4WFBL 5AQJA 5GAGP 1I94K 4CJVA 1NGEA 5DM6L 4CZIA 4HUFA 4JI6K 3LANA 1GLBG 4KV8A 3OS0A 1GLAG 1RCHA 1WSJA 1VSKA 2CGJA 3LDQA 4C23A 1RBSA 4OPAA 1RBTA 2OPQA 2QWLA 2I5JA 2P9PB 3O3GA 3VEYA 3KLFA 5C10A 3EYZA 3HL8A 3G10A 3QEVA 4E7LA 2NNWA 3VTHA 5BR8K 3AAPA 4RTFD 4CF2A 3V1OA 4A5AA 1TYQB 3OYGA 5TKYA 3M1FA 2BGGA 1RT6A 4DSFA 2GUPA 3O1WA 4WQ5A 1ESVA 5BRHA 3TTDA 2F96A 3QERA 2G8HA 2HBKA 2YHWA 4I6MB 2UUCK 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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