3M3ZA

Crystal structure of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitor
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Protein binding
source organism Homo sapiens
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 114
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3m3zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3m3zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3m3zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3m3zA04
1S3XA 3M3ZA 3CQYA 5AQFA 2CGJA 4WQ5C 3A5OC 3D2FB 4XH4A 2F9TA 3OHRA 5AQIA 4QS7A 3UB5A 4IWVA 5ADXH 2QWRA 3MN7A 3GE1A 4FO0A 4A61A 4BR0A 3EZWA 5AQHA 2IVOA 3CJ1A 4FWQA 3BF1A 3CQXA 3U8XA 3U4LA 4JD2B 4F9OA 5AQXA 3M1FA 3IUCA 3GOIA 4LC9B 3R9PA 3VENA 5ADXA 2V7ZA 2P9LB 3CJCA 3BP8A 1TYQA 2A5XA 1ZXOA 1OKJA 4M7XA 4B9QA 5FPNA 2ASMA 3O80A 1XUPO 1JCFA 1U6ZA 4BROA 1X3NA 2FSJA 4DHYA 4H5RA 2Q31A 3D2FA 4BC3A 1NM1A 4CZFA 3AAQA 3UE5A 1BOTO 2ASOA 4CZEA 5EY4A 4BR4A 5AZJB 4IJNA 1HKBA 3ZX0A 4BQZA 5AQQA 4BR5A 1DGKN 1TUUA 2W40A 3EN9A 3VF6A 2VYPA 4Y0WA 3R8EA 1IG8A 4CBUA 5LJVA 2BUPA 1NGDA 3C7NB 3TPQA 4H0YB 4E1JA 1QZ6A 1Z05A 2QXLA 5KPRA 5BR9A 1EQYA 4B1WB 2P9UB 3F9MA 1D4XA 2P9IB 3LDOA 4NB4A 4MLHA 4WYBA 3VEWA 4BGBA 4CZKA 2P9LA 1WUAA 5F1XA 3WUHA 5E84A 3IMXA 5AQOA 4MO5A 3VEXA 1WOQA 4K42A 2HF4A 4HWIA 5AQUA 2QWQA 2OANA 1IJJA 4C23A 2P9NB 3QBXA 4HTLA 4L3QA 5EXWA 3L0QA 4QS8A 4EAHD 1RGIA 5AZIA 3CETA 1MWKA 5AQNA 5F0XA 3RSEB 3BUZB 3QFPA 3WXLA 3W0LA 1HKGA 3H3NO 4DB3A 1V4TA 5EVZA 2GWJA 3B8AX 1YXQA 2ASPA 3ATUA 3DAWA 3VESA 3WXJA 3GG4A 4AM6A 1Z6RA 3TU5A 1J6ZA 3C7NA 4EHTA 2WUSA 2A41A 3ENHA 3H1VX 1SQKA 2P9UA 2E1ZA 2P9IA 4FL9A 3HBTA 3LDPA 4FSVA 4YDUA 4BREA 5AQYA 5BPLA 4XH1A 2V52B 4BC4A 5AQVA 3FLCO 4FPBA 2NLXA 1KAYA 1BU6O 3O8MA 1GLBG 1HUXA 1ESVA 2ZGYA 1BO5O 4CJ7A 1BWFO 2IVPA 2P9NA 3ULEB 1LOTB 3H3OB 3H46O 3ENOA 3RSEA 2GEMA 4XH5A 3QMLA 1GLCG 4JNEA 2PAVA 5JICA 4CBXA 3ZEUA 3O4WA 3LM2A 3VGMA 3WT0A 3LDLA 5AQTA 3WQUA 3D2EA 1BDGA 5ELZA 2E2QA 3VF2A 3WXKA 1H1VA 5EOYA 3CJAA 3MK6A 4I6MB 2HOEA 3SK3A 4H03B 1E4FT 2J4RA 4BVOA 3FR0A 2YHXA 1RDWX 4PL7A 3JS6A 4K43A 4AM7A 2QM1A 2CGKA 2YHWA 2E20A 1S22A 3H1QA 4FWKA 3HZ6A 3EL2A 3U9DA 2YJEA 4BRHA 4H0PA 5AQJA 2NZTA 4H0XB 3U9ZA 5E26A 2BTFA 1LCUA 4CBWA 1QQOA 2A6AA 4O8KA 2V51B 4RCHA 1DEJA 4FWRA 1NMDA 3FFKB 3WXIA 3FZMA 4YDUC 5FPEA 3ULEA 2FSNA 1BA0A 3BF3A 1HLUA 2FF6A 5AZIB 1HKCA 1JCGA 2H3GX 4BC5A 3A5LC 3HM8A 1U2VB 4QS9A 3A5NC 3CHWA 4BRLA 3FZLA 3QFUA 1HJOA 2AA4A 4CD1A 3H45C 2I7PA 2YHYA 5KPZA 4PKGA 5BPNA 4RTFD 1TUYA 2QWPA 4MLEA 4I6MA 5BRFA 1QZ5A 4CZMA 2E2OA 2E2PA 1YVNA 2YCHA 4H5TA 5BRHA 4H5VA 1NGCA 3L6QA 4MO4A 3VERA 1GLEG 1GLAG 1T6DA 3FZFA 4PL8A 1NGEA 3DWLA 4BRNA 4FWNA 2FF3B 1QQNA 5BRDA 1YUWA 4IXCA 3JXUA 2Q2RA 4FWPA 4BVPA 2Q0UA 1NGAA 4NO7A 3CERA 2KHOA 1GLDG 4A2BA 4BR9A 4EFHA 3J8AA 4CZJA 3QICA 5I9EB 4PKIA 4BG8A 1NGBA 2V7YA 1BA1A 1SAZA 3CI5A 1U2VA 1JCEA 3ZEUB 3D2EB 3G25A 1QHAA 4IO8A 5AQZA 4DQ8A 2HMPA 4J8FA 5KQDA 1DKGD 2GUPA 5AQLA 1ATSA 4BRKA 1BG3A 3VOVA 4BR2A 2ZWHA 3CJ9A 4BRAA 5B8HA 2ZF5O 4GNIA 4EIAA 4XEIA 3O08A 1ATNA 1NGIA 2E8AA 1CZAN 4B1UB 4ISEA 2HF3A 3LL3A 4B1YB 4FWSA 4GY2B 3AY9A 3VGLA 4K41A 2F9WA 5AQWA 4A2AA 3LDQA 3GBTA 3VETA 3O1BA 2CH5A 2DPNA 3VF4A 3MDQA 2D0PA 2W41A 2QWNA 5FPMA 2D1KA 2CGLA 1QQMA 4K25A 3QDKA 2P9PA 4BGAA 3EO3A 1YAGA 3MN5A 3ATVA 4KBOA 4O5FA 5F2RA 2ZGZA 1XQSC 3VEVA 5BPMA 4WQ4A 3VGKA 2P9SB 3O1WA 3A0IX 3C0BA 3ZX3A 1GLFO 1R59O 4B1VA 2FLOA 5TKYA 3ZX2A 5AQGA 1ZC6A 2YI1A 5EX5A 2Q97A 2FSKA 3EKSA 3ZETB 2ITMA 3DXMB 3VEYA 3GDQA 4BG9A 5LJWA 1NBWA 3CJBA 2Q1NA 5BN8A 3KVGA 5AFUH 1GLLO 1P8ZA 1G99A 3FE1A 1RFQA 2D0OA 5JMVA 1NWKA 3MN6A 2VCPA 4H0TB 4H5NA 2AP1A 2IVNA 1K8KB 1T44A 1E4GT 4CZLA 2P9KA 3WQTA 5BREA 3AARA 3HTVA 4DCHA 4EHUA 4H5WA 4B1XB 2EWSA 3S41A 1MA9B 5AFUA 3LDNA 3LM9A 3UKUB 3QBWA 3I33A 2FXUA 3HI0A 5AQRA 2P9SA 4CZHA 4IZ9A 3CJ7A 3IDHA 4H0OA 4BC2A 1Y64A 4PKHA 3MCPA 3O6WA 1C0FA 4FWMA 2E88A 1BUPA 2Q0RA 4ISFA 4WQ4C 3MN9A 3ZETA 2GWKA 3AAPA 4Z94A 1HX1A 3DXMA 3W3DA 1Q18A 5FPDA 4FWOA 2D4WA 4CZIA 2QWMA 2E1YA 3BEXA 1KXPA 4BRPA 4M63C 3FGUA 2NRHA 4BRMA 1NGJA 3QB0A 2Q36A 3EKUA 5JLFA 1NLVA 3MMVA 3UKRB 4BRGA 4JD2A 3A8YA 3WEEB 1X3MA 1K8KA 1ZBSA 2YJFA 3DXKB 1GLJO 4BRFA 1NGHA 2P9PB 5JLHA 5AR0A 3P4IA 4WQ5A 3H6EA 4A62A 4M7YA 3O5BA 3GL1A 4JHDB 5AQMA 3D7EO 3VPZA 3UKUA 3SMPA 1SZ2A 3R6MA 4CD3A 4RWTA 1ATRA 2QWLA 2I7NA 3VEOA 3CIPA 2QWOA 3SMSA 3HSCA 1MWMA 2IIRA 4ISGA 5KQ8A 3VEZA 1MDUB 1HPMA 3M6GA 4BQLA 3L4IA 5AZJA 1KAZA 4FOIA 3SJHA 1X9JA 2PBDA 3FZHA 4BRDA 1KAXA 5AQKA 1NGGA 3KZBA 4H0VB 4FOEA 5CE3A 4CI6A 1XC3A 3SLCA 3ID8A 3UKRA 3WEEA 2GELA 4FPAA 2CH6A 1T6CA 2GTDA 1C0GA 2A40A 4CZGA 1NGFA 4JN4A 4BR7A 3DXKA 5KPTA 2QW9A 2P9KB 2A42A 4JAXA 1TYQB 3I8BA 2E2NA 5AQPA 5BN9A 3A5MC 4FWLA 4JHDA 4BRQA 4B1ZA 5AQSA 3KHYA 2VWBA 1V4SA 4IJAA 5LY3A 4BRIA 2UYTA 2A3ZA 4BRCA 3FZKA 3IFRA 3DJCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HVRA 2N66A 1S3XA 2O8DA 1WBBA 3D2FB 1ZYVA 3JSMA 1B92A 4E7LA 1N8RO 1S72N 2QWRA 1T8EA 3MN7A 3GE1A 1RNHA 3EZWA 3CJ1A 4FWQA 3OYHA 3BF1A 3WNFA 1KTQA 1IKXA 1A5WA 3KC6A 3RR8A 3U4LA 1K73O 3ZSWA 4K8XA 4LC9B 3AVLA 5ADXA 3OJUA 4YOUA 3B6PA 2O8CB 4X65K 4DFMA 3O9SA 4M7XA 4DV7K 3SCXA 1WAJA 4ID1A 3I0RA 4DTMA 1JCFA 1XMOK 1WBDA 1X3NA 1EWRA 4DHYA 4H5RA 1POIA 1KVCA 4BDYA 1NM1A 4IOAL 2LJMA 1KCFA 3UE5A 1K8AO 1Z25A 3T1HK 5AQQA 3K9JA 4CERA 1TUUA 4IDKA 2VYPA 4DLEA 1S1UA 3R8EA 1IG8A 5LJVA 2BUPA 4AQYK 1HR0K 3TPQA 1HPZA 3CC4N 1NK0A 4JI7K 3CMEN 2P9IB 3LDOA 4MLHA 2P9LA 1KLMA 1WUAA 2QXFA 1BL3A 3IMXA 5C2FA 4DFKA 1WOQA 3SUPA 3E01A 4DU1A 5M1OA 4V19S 2KFNA 4IEEA 5D3GA 2QWQA 4I7FA 1IJJA 4C23A 1T1TA 4QS8A 4CVNE 3IAYA 3CETA 1ITGA 2XRIA 2IS3A 2P1JA 3SAHA 5MLCQ 3J7ZO 4CFBA 3NFAA 3E7UX 3B8AX 2ASPA 5GADP 3V9WA 1HMVA 4MDAA 1WSJA 3EEQA 3RR7A 4CGFA 3LDSA 5M1KA 4N76A 5GINA 3KP0A 1KVBA 4JRQA 2QI2A 4DSJA 3HBTA 1WAFA 4FSVA 2ITGA 3AA5X 4BREA 5AQYA 1ZBFA 5BPLA 5SWMA 1Q81O 2V52B 3VA0A 1U45A 1HUXA 3HL8A 1A5VA 3QEIA 4F8RA 3KOZA 4CJ7A 4GKKK 1J5OA 4DTNA 4GKJK 2IVPA 2P9NA 1I94K 1S6PA 1LOTB 4JKFA 4WE1A 3HPGA 3RSEA 1NK5A 3THYB 1GLCG 4JNEA 2PAVA 5JICA 2BANA 3ZEUA 3LDLA 4CGHA 4LFAK 3D2EA 1YTUA 4M3RA 5ELZA 4CJ3A 4DV6K 3ZT1A 1HYVA 3CJAA 4I6MB 3V1OA 2NRXA 3JS6A 1I39A 2CGKA 1WWNA 2HHUA 3H1QA 3VTHA 4FLYA 4FWKA 2G8WA 2FBTA 3HZ6A 4CEEA 4BRHA 1JLAA 1TL1A 2NZTA 4DR7K 4U7BA 4UQGA 2A6AA 4WFBL 1VSDA 1RTHA 3S3OA 4OGEA 2HNYA 3WXIA 1S6QA 3K58A 1TKTA 4JK7A 2FSNA 3VA3A 2HHIA 3BF3A 1WB9A 1BQNA 4JI8K 4OKJA 2H3GX 1NKEA 3A5LC 1U2VB 3A5NC 3SI6A 3THWA 3NF8A 2AA4A 2FBVA 4FJ7A 5CY0A 3AO4A 3DLRA 4PKGA 1KC8O 5C15A 4E19A 4MLEA 1BIUA 1QZ5A 1Y97A 3DRRA 2YCHA 4KTWA 1JXEA 1T6DA 4X66K 3FZFA 4NXMK 2UXBK 4DTOA 2QKBA 3CYGA 2E6MA 1F21A 1IV0A 1RDBA 2O8EA 4KKOA 5BRDA 1L5UA 1YUWA 2RE2A 4IXCA 3KD5E 2RF2A 2Y1IA 3F73A 4FLZA 4DR5K 1NG9A 1T7EA 4C8OA 2KHOA 1GLDG 3RRHA 2JWKA 1WNSA 3P5JA 5TKWA 4BG8A 1NGBA 3CCQN 2E3FA 4B08A 1BA1A 1XMQK 1BCOA 3NCIA 3KOWA 3M8PA 3ZEUB 1I2UA 1JLFA 3D2EB 2XY7A 5AQZA 4WF9L 3TABA 4DQ8A 3O9RA 4YOTA 1VAZA 5KQDA 1ATSA 3EZ5A 3C95A 3K5LA 2OYQA 1RT6A 4EZ6A 4G9ZA 4YOXA 2XO7A 1QVGM 2N69A 3SUQA 4GNIA 4JK9A 4B9UA 4XEIA 1NGIA 4FCYA 2A1RA 2E8AA 4CESA 4ISEA 4FWSA 4GY2B 3AY9A 4KB0A 4K41A 4PQUA 3VQCA 3PUFA 2X6NA 3HP9A 1JKZA 4A2AA 3R1XA 3BK3C 3PLAA 4LF5K 3VETA 2CH5A 4BDZA 3MDQA 1O1WA 3SV4A 1NKBA 1B9DA 3K9KA 2QTDA 4LF8K 4Y1DA 5FPMA 4YOWA 2D1KA 2P5OA 4DQPA 1FJGK 2CGLA 4BGAA 2P9PA 3EO3A 3SQ0A 1YAGA 3ATVA 3MEEA 3WXMB 3KOXA 1KLNA 4MFBA 1VSMA 4C1NK 1JLCA 3VEVA 3H08A 1TKDA 4DV3K 4FW1A 4MQ3A 5HRPA 5GAGP 1BI4B 1R59O 4Q0BA 2KLAA 4B1VA 4CJWA 3QEWA 1NJZA 4W5RA 1S1VA 2Q97A 2Z1JA 3N4PA 3THXA 3OYMA 1RTDA 3RMCA 5HOOA 1D9DA 4Z4GA 3OA9A 4KTQA 1NBWA 4HTUA 3HSTB 5M1FA 4OGCA 4YHHK 2OPQA 1P8ZA 3SPYA 1RFQA 3ZSRA 3PO4A 5JMVA 2FBXA 4XJXA 4CEFA 3ULDA 4H5NA 2OPPA 2IVNA 3D45A 4RG8A 1K8KB 1NJYA 1E4GT 1NOYA 4E0DA 4CGJA 5BREA 3MXMA 3S41A 2YV0X 4W5OA 4BE0A 4QAGA 2P9SA 4CZHA 2HBLA 4FLVA 3DOLA 3IDHA 2ASCA 4H0OA 4BC2A 4CGIA 1QVFM 4O5BA 2RHKA 4CJFA 2E88A 1ASVA 1JXCA 3M5RA 1VK0A 4ISFA 3MN9A 3ZETA 4CHYA 2GWKA 1W7AA 3AAPA 1WSHA 4I9QA 3Q7CA 1Q18A 1OVQA 3J7AP 3KLIA 1KXPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HVR A;  2N66 A;  1S3X A;  2O8D A;  1WBB A;  3D2F B;  1ZYV A;  3JSM A;  1B92 A;  4E7L A;  1N8R O;  1S72 N;  2QWR A;  1T8E A;  3MN7 A;  3GE1 A;  1RNH A;  3EZW A;  3CJ1 A;  4FWQ A;  3OYH A;  3BF1 A;  3WNF A;  1KTQ A;  1IKX A;  1A5W A;  3KC6 A;  3RR8 A;  3U4L A;  1K73 O;  3ZSW A;  4K8X A;  4LC9 B;  3AVL A;  5ADX A;  3OJU A;  4YOU A;  3B6P A;  2O8C B;  4X65 K;  4DFM A;  3O9S A;  4M7X A;  4DV7 K;  3SCX A;  1WAJ A;  4ID1 A;  3I0R A;  4DTM A;  1JCF A;  1XMO K;  1WBD A;  1X3N A;  1EWR A;  4DHY A;  4H5R A;  1POI A;  1KVC A;  4BDY A;  1NM1 A;  4IOA L;  2LJM A;  1KCF A;  3UE5 A;  1K8A O;  1Z25 A;  3T1H K;  5AQQ A;  3K9J A;  4CER A;  1TUU A;  4IDK A;  2VYP A;  4DLE A;  1S1U A;  3R8E A;  1IG8 A;  5LJV A;  2BUP A;  4AQY K;  1HR0 K;  3TPQ A;  1HPZ A;  3CC4 N;  1NK0 A;  4JI7 K;  3CME N;  2P9I B;  3LDO A;  4MLH A;  2P9L A;  1KLM A;  1WUA A;  2QXF A;  1BL3 A;  3IMX A;  5C2F A;  4DFK A;  1WOQ A;  3SUP A;  3E01 A;  4DU1 A;  5M1O A;  4V19 S;  2KFN A;  4IEE A;  5D3G A;  2QWQ A;  4I7F A;  1IJJ A;  4C23 A;  1T1T A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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