1GLLO

Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
498
structure length
494
Chain Sequence
EKKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSWTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Phosphotransferase
molecule keywords GLYCEROL KINASE
publication title Crystal structures of Escherichia coli glycerol kinase variant S58-->W in complex with nonhydrolyzable ATP analogues reveal a putative active conformation of the enzyme as a result of domain motion.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 163
structure length 494
sequence length 498
chains with identical sequence Y
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gllO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gllO01
4CZEA 2QWMA 3J8AA 3H6EA 3AY9A 3DJCA 4H0OA 4CZIA 4KBOA 1WOQA 4A61A 3WQUA 1KXPA 2D0OA 3LDNA 1DKGD 4BROA 1HKBA 3JS6A 3HZ6A 1Y64A 3QFPA 3VERA 2HMPA 1NGHA 1GLCG 3CJCA 4PKGA 3VEYA 4CZFA 1H1VA 4BR4A 4CZGA 1TUYA 3DAWA 2E1YA 2QWRA 3M6GA 2OANA 1NGGA 3FGUA 3O08A 3A5LC 3D2EA 4XH1A 1ZC6A 1NMDA 3KZBA 5LJWA 3QBWA 1YVNA 1S3XA 2ASMA 4FPAA 5EX5A 5ADXH 1QZ6A 1KAXA 1X3MA 3ZETB 1HKCA 5FPNA 3DXMB 2P9LB 1BG3A 1T6DA 1HUXA 2IVOA 2ZWHA 4LC9B 3DWLA 1P8ZA 4BVPA 3U9DA 1IG8A 4FWPA 5AZJA 3IFRA 4H03B 3I33A 4AM7A 5BREA 4JNEA 4B1ZA 3A0IX 3QICA 2J4RA 4B9QA 4MLHA 1QZ5A 2P9UB 3F9MA 5BRDA 3A5OC 2V7ZA 3FE1A 4H0XB 4GY2B 1T6CA 3H45C 4I6MB 3U9ZA 4WYBA 4ISFA 2I7PA 3L4IA 3UKUB 5BPMA 3D2FB 5KQDA 4PKHA 2FSJA 3VF6A 5LY3A 3ZX3A 1R59O 2QXLA 3ZX2A 4K42A 4BRFA 4H0VB 2HOEA 1U6ZA 5F2RA 3S41A 2ITMA 4IZ9A 2Q0RA 2Q97A 1CZAN 1ATSA 2Q2RA 3SK3A 3EKUA 4Z94A 5BR9A 1C0FA 3A5MC 3LM9A 3LDOA 1BA0A 1X3NA 1V4SA 3MN7A 3FZMA 3A5NC 3GOIA 4B1YB 5FPEA 4RCHA 2E2NA 4K43A 3MN9A 3M3ZA 1NGEA 1NGAA 4JD2B 2A5XA 2P9SA 2V7YA 3HTVA 4QS9A 4WQ4C 5JICA 4BRDA 1DGKN 5AQOA 3UKRB 2QWLA 4A62A 2V52B 5EXWA 1BDGA 1NBWA 4IWVA 1QQMA 5B8HA 1EQYA 4FWKA 4PKIA 2QM1A 4IJNA 1GLAG 4BRCA 5AQZA 2FF6A 3CJBA 4EAHD 2P9KA 4GNIA 4Y0WA 3ZEUA 3CJ7A 3H3NO 3WXJA 2CGJA 5AQWA 3D7EO 5TKYA 5FPDA 5AZIA 2A40A 2E1ZA 3BEXA 3H1QA 5AQSA 1ESVA 3O4WA 2AP1A 2Q36A 4BRIA 2UYTA 2GEMA 4BRKA 2P9NA 2CGLA 4BR7A 5JMVA 4BRNA 3LL3A 2I7NA 3VF4A 4FSVA 4WQ4A 4JN4A 2ZF5O 5BRHA 4CBWA 3VF2A 2GELA 3KHYA 4EHUA 4YDUC 2YHYA 3VESA 5AQXA 2NRHA 5AQLA 2GWJA 1BUPA 4FPBA 4CZLA 4BR0A 2P9PA 3MN5A 3H1VX 3M1FA 1ATRA 3LM2A 2PBDA 1U2VA 4BC2A 3C7NB 1MWMA 4QS8A 5AFUH 3SLCA 1NGDA 4BRLA 4AM6A 3FR0A 2GUPA 3OHRA 2W41A 3BF3A 4B1XB 4QS7A 2QWPA 4IXCA 3A8YA 4BR2A 4YDUA 2WUSA 5E26A 3VPZA 4FWMA 2A42A 4XEIA 3FZFA 4M7XA 3EZWA 1JCFA 3MCPA 1K8KB 3WXIA 1MA9B 4BRMA 1Q18A 4H0YB 4BG9A 4NO7A 1NWKA 2P9IB 1ZBSA 3WEEB 3CQYA 3WUHA 3EKSA 3QB0A 4FOIA 3CERA 3ULEB 4EIAA 3VENA 1NGCA 4BC5A 4CD3A 3R6MA 1QQNA 3SJHA 4H5VA 3W3DA 4A2BA 3ZX0A 4CI6A 3CHWA 1X9JA 4ISEA 3CI5A 2Q31A 1RDWX 1HPMA 3I8BA 3EO3A 4MLEA 4FWRA 2ZGZA 3MMVA 5AQKA 2QW9A 3L6QA 5ELZA 3DXKB 4BGAA 1NGJA 3O5BA 2F9TA 2YJEA 2YHXA 2CH5A 3P4IA 3ZETA 4MO4A 3VGKA 3DXMA 2P9LA 1WUAA 3AARA 5BN9A 3VEVA 3RSEB 2Q0UA 1JCEA 3VGMA 5BPLA 3BF1A 1GLDG 4BQLA 3ATUA 3TU5A 2D0PA 2YHWA 4HTLA 4E1JA 1T44A 4JHDB 2ASOA 3LDQA 4O5FA 3FZKA 2P9UA 5AQRA 2GWKA 2A41A 4CZHA 1G99A 4I6MA 4BC3A 2YCHA 2ZGYA 3UKUA 3WT0A 4L3QA 3O1BA 4CJ7A 3D2FA 4O8KA 1NGBA 3MN6A 5BPNA 3CJ1A 3IMXA 4RWTA 2Q1NA 1TYQB 4CZJA 3UE5A 1LOTB 3G25A 1HLUA 5FPMA 3IDHA 2E8AA 3FLCO 3EL2A 2W40A 3O1WA 2NLXA 1HKGA 3HI0A 4BR9A 3FZLA 4H5RA 5E84A 3CIPA 4A2AA 4IJAA 2FSNA 2HF3A 2E2OA 3MDQA 2DPNA 4H5WA 3L0QA 3SMPA 3CETA 2QWOA 3U8XA 5ADXA 2VYPA 4DB3A 2FSKA 3AAQA 5KPRA 4JD2A 3D2EB 1E4FT 1NLVA 3ATVA 3O6WA 4BVOA 4H5TA 3WXLA 4M7YA 5F0XA 2E2QA 3LDPA 3UKRA 1D4XA 5AQVA 1ZXOA 4PL7A 3HM8A 1BO5O 5AQIA 3KVGA 2QWQA 3W0LA 3VEWA 4BQZA 3B8AX 5AZJB 1HJOA 2F9WA 2KHOA 4K25A 2EWSA 3EN9A 2A6AA 4BGBA 3GDQA 3VEZA 4J8FA 4FWQA 3H46O 4H0PA 5EOYA 2NZTA 3WQTA 1HX1A 5AQPA 4B1WB 1Z05A 3JXUA 2VWBA 3BP8A 4FO0A 1RGIA 4EHTA 1GLBG 1E4GT 1MWKA 1SZ2A 3QDKA 4FL9A 4MO5A 1SAZA 3O8MA 3FFKB 1KAYA 4BRHA 5KPZA 4H5NA 3QFUA 1QHAA 4XH4A 3C0BA 1BOTO 5AQYA 2VCPA 4HWIA 1RFQA 3C7NA 4F9OA 1IJJA 5I9EB 4M63C 2QWNA 1JCGA 5AQGA 4C23A 5F1XA 1GLFO 2YI1A 5AQHA 1S22A 4H0TB 3BUZB 2BUPA 2FLOA 3QBXA 2P9SB 5AQUA 3O80A 1GLLO 1KAZA 3TPQA 4CBUA 1BWFO 2E2PA 3GE1A 3QMLA 1DEJA 5AQNA 1NGFA 3WXKA 1K8KA 3HSCA 3ENHA 1V4TA 5JLHA 3AAPA 3UB5A 2P9KB 3ZEUB 4K41A 3U4LA 2P9IA 2CH6A 2V51B 4B1VA 4CBXA 4CD1A 5BRFA 5CE3A 3WEEA 5AZIB 3HBTA 4FWLA 4DCHA 3ULEA 4DHYA 3R8EA 2FXUA 3R9PA 4FWOA 2BTFA 4JAXA 4WQ5C 4FOEA 2E88A 1BA1A 1NGIA 4DQ8A 3GL1A 2P9NB 4PL8A 4FWSA 4BRPA 1ATNA 4BG8A 3GG4A 2A3ZA 2PAVA 1NM1A 1XQSC 5AQQA 3VGLA 4CZKA 5LJVA 2IVNA 4FWNA 3DXKA 4BRGA 1GLJO 5BN8A 4B1UB 5AFUA 1YAGA 2P9PB 2GTDA 1YXQA 3ID8A 2E20A 2D1KA 4BC4A 4XH5A 1U2VB 4NB4A 3CJAA 2FF3B 1GLEG 1YUWA 4BRAA 3RSEA 4IO8A 5KPTA 1OKJA 4EFHA 3IUCA 1BU6O 1XC3A 1LCUA 1J6ZA 4WQ5A 1MDUB 3CQXA 3VETA 3FZHA 3MK6A 3CJ9A 4JHDA 1XUPO 4BREA 3H3OB 4CZMA 5AQFA 5AQMA 2ASPA 5EY4A 5AR0A 4RTFD 4BR5A 2IVPA 2AA4A 4ISGA 4BRQA 2D4WA 3ENOA 1QQOA 5KQ8A 3SMSA 3LDLA 5AQJA 3GBTA 2CGKA 3VOVA 2H3GX 1SQKA 2IIRA 1TUUA 3VEOA 1Z6RA 1TYQA 5AQTA 5EVZA 2HF4A 2YJFA 3VEXA 5JLFA 1C0GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QWMA 3J8AA 4KHWA 4BDYA 3HP9A 3AY9A 4H0OA 2D0OA 4NYFA 1ASWA 4BROA 4FJ5A 4PUOA 1TVRA 4YNQA 2HMPA 3E66A 4N76A 3TAMA 1YT3A 5J2MA 2BDPA 1GLCG 4CZFA 4JKGA 1H1VA 4BR4A 4CZGA 3N4QA 3DAWA 3SV3A 4AF1A 4CJ3A 5JS1A 2OANA 3A5LC 1C1CA 3D2EA 3OYHA 3KZBA 1YVNA 2ASMA 4FPAA 3ZETB 1X3MA 3I8DA 3DXMB 2HHHK 2IVOA 4LC9B 1P8ZA 4CFCA 3PSFA 1Z26A 2LSNA 3IFRA 4QAGA 4RG8A 4AM7A 4CHPA 1TAQA 1NJWA 4B9QA 4N5SA 4LF5K 4OJRA 4DR6K 5BRDA 1VQON 3KLFA 4ELVA 3TANA 4H0XB 3EY1A 4GY2B 1T6CA 3J80O 1C6VA 4DR2K 3OYMA 1RT3A 1WSIA 3L2RA 1G15A 4R79A 3KLIA 2HBLA 5LY3A 4W5QA 3ZX3A 2E5LK 4K42A 3TAGA 1CZAN 2D0CA 4Z4FA 4DSFA 3QIPA 4GVEA 4AHSA 1C0FA 1T3VA 5CHIA 3LDOA 1BA0A 4KH6A 1IO2A 1X3NA 4PY5A 4M3YA 1HNXK 3FZMA 4BE1A 3A5NC 3GOIA 4KRFA 3LAMA 5FPEA 4OGEA 4RCHA 2E2NA 3I56N 3BY5A 1NU0A 2YX6A 4B3SK 4JD2B 2A5XA 3HPHA 5FRNA 3CC4N 2P9SA 2V7YA 2D0AA 2KTQA 4BRDA 4NLBA 5IT9O 3J7ZO 4DR3K 4A62A 2V52B 4IWVA 3P31A 1EQYA 4PKIA 1KLNA 4BRCA 2FF6A 2P9KA 4Y0WA 1WAFA 2GX9A 4CF8A 3AVGA 2A40A 4MQ3A 3BEXA 4U7BA 3ZT3A 1N36K 1ESVA 3KLHA 2KLAA 2P9NA 2CGLA 3CCRN 3VF4A 1F21A 2X74A 3M5RA 4JN4A 3H08A 1JJ2M 2GELA 3AA4A 3KHYA 4C1NI 2YHYA 2QEXN 1RDAA 4PHTX 5AQXA 4FLVA 2AJQA 5AQLA 4CJQA 1QVGM 3LANA 3ZSOA 4BR0A 1C1BA 4JKAA 1FKPA 3M1FA 3SJJA 4CEOA 3CFOA 4QS8A 3AVMA 1NGDA 2HHSA 4AM6A 1W7AA 2JWKA 3LALA 1RDCA 1VQLN 2WTUA 3HT3A 4TSXA 2O8CA 2R7YA 2W41A 3BF3A 2NRRA 3NDKA 4IXCA 1D9DA 1QSSA 2ZD1A 4Z4HA 2WUSA 1BCOA 3F2KA 1HMVA 4ID5A 4B08A 4CJTA 1GOAA 5JVGL 1SS6A 5CZ1A 3OS2A 3EZWA 4LFBK 4DTSA 1K8KB 1MA9B 3KK2A 1VK0A 4BRMA 4H0YB 4BG9A 5C2DA 1NWKA 2VQFK 4DS4A 5KI6A 1IBKK 1ZBSA 2UUCK 1EP4A 3WUHA 2VGNA 1YITN 4LSNA 4FLXA 3SQ4A 1HJRA 1Q86O 1QQNA 2WFBA 3W3DA 4KHQA 4A2BA 3KK3A 4CI6A 4UY8O 4B9SA 4ISEA 2Q31A 3EZ5A 1R0AA 3B6PA 3EO3A 5AQKA 5HL7L 2HHTA 1HYVA 3THYB 1RBTA 3NGYA 1YIJN 1NNEA 5C15A 3HRGA 2CH5A 3P4IA 3ZETA 1BIZA 2WBNA 1Q82O 3VQCA 4FLZA 3DXMA 4WCEL 2B4JA 4WE1A 3RSEB 4YY3K 1K73O 3TU5A 4B8AB 3DLHA 4LF8K 4B9VA 5HROA 4DQPA 3PY8A 2QXFA 3VQ4A 4CECA 1WSJA 5LL6Z 3RMCA 4CEZA 1G99A 4DQRA 3MXIA 2VGMA 4LF7K 2YCHA 2ZGYA 2XY8A 1JLGA 4OGCA 3V4IA 1JLFA 3UE5A 3J7YP 5GAEP 3G25A 1UA0A 2G8VA 4JS4A 3O1WA 2NLXA 3BZKA 3HI0A 4RW9A 4BR9A 4B8CA 5E84A 3KK1A 3KKRA 4FJ9A 3K58A 1RNHA 4A2AA 3CD6N 4IJAA 1KD1O 1W97L 2PFUA 3OBYA 1VQ6N 4AHRA 3CETA 3C65A 3T7ZA 1HQUA 3K9JA 3WNHA 4DB3A 4CHZA 2UXDK 4F4KA 4FJMA 4JD2A 2QTDA 2HNDA 4H5TA 4E0DA 1EWRA 3WNFA 3LDPA 1D4XA 3JSMA 5AQVA 4PL7A 3SPZA 1WN7A 3HM8A 1KFDA 3OYAA 5AQIA 3RTVA 3KVGA 3MWTA 2QWQA 3W0LA 3VEWA 1VQNN 1E3MA 3OY9A 4AQYK 1HJOA 1RBSA 4CFAA 4B9NA 3KTQA 2B6AA 4M3UA 4FK0A 2A6AA 2VG7A 1IV0A 3VQ9A 3OW2M 5EOYA 1O13A 3PO4A 2RKIA 4WFBL 5FLXO 3BP8A 3U3YA 3KWGA 4AHUA 1BCMA 3TSUA 4C8LA 4IEIA 4E3SA 1MWKA 1SZ2A 4MO5A 1C0MA 3QNOA 3ULDA 3V9SA 4DTNA 1CLQA 4H5NA 3QFUA 1Q9YA 2HVHA 1MU2A 3L3UA 3F9KA 4LH5A 2QWNA 4C23A 4L8RB 4JI2K 1GLFO 2NRWA 3RRGA 4GV9A 4GMJB 3S3NA 4H0TB 1RT1A 3HPGA 3BUZB 2BUPA 2FLOA 5AQUA 3O80A 1VQ8N 3QEXA 4FJ7A 3CYMA 1WLJA 3GE1A 3MXMA 3QMLA 4DFPA 1DEJA 4ILJA 1QHTA 3Q7BA 1K8KA 3HSCA 3UB5A 5FDLA 3QLHA 1VSHA 2CH6A 5AZIB 3T69A 3G0ZA 4DHYA 3R8EA 2FXUA 3R9PA 3AVLA 1W2BM 1HYSA 4WQ5C 1YTAA 3LZJA 1BA1A 3DLKA 3GL1A 4FWSA 4F2SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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