1GLLO

Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
498
structure length
494
Chain Sequence
b'EKKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSWTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords GLYCEROL KINASE
publication title Crystal structures of Escherichia coli glycerol kinase variant S58-->W in complex with nonhydrolyzable ATP analogues reveal a putative active conformation of the enzyme as a result of domain motion.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Phosphotransferase
total genus 163
structure length 494
sequence length 498
chains with identical sequence Y
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gllO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gllO01
4H0XB 1OKJA 4BR9A 3H6EA 2W41A 3H1VX 2GUPA 3ENHA 2E1ZA 4BRFA 5F2RA 3QMLA 3VF4A 2Q1NA 3U4LA 1YAGA 4A2BA 2GEMA 3FE1A 3HI0A 1HKBA 5AQQA 4H5RA 3EZWA 1GLAG 3A0IX 3QFPA 3UB5A 1YUWA 1NMDA 4IJAA 1SQKA 4GY2B 4BC5A 3WQTA 5F1XA 1JCFA 3DAWA 2FSJA 1GLEG 3RSEB 2P9UA 2VYPA 4FWSA 4FPAA 1HLUA 4YDUA 2QW9A 4BRKA 4CD3A 4DHYA 3U8XA 2V52B 1K8KA 4JAXA 3GOIA 3MN6A 3H1QA 1XUPO 4QS7A 1QZ5A 3UKUB 3VEYA 2Q31A 4CZGA 5AQNA 3GG4A 3LDPA 2E2PA 2Q36A 5AFUA 2P9KB 5ELZA 2I7NA 3H46O 2A3ZA 4PL8A 3FLCO 1NGGA 2A40A 3L0QA 4O8KA 3D2EA 2V7YA 4JHDB 3F9MA 1MWKA 1E4GT 3H3NO 4XH4A 3ZEUB 1BUPA 3CJ1A 5KPTA 4JN4A 3HTVA 3VGKA 3KVGA 4H03B 1NGCA 5EVZA 1NBWA 5BN9A 1XQSC 3O1BA 4BREA 5AQTA 1NGAA 5AQVA 5LJWA 1NGHA 3L6QA 2ITMA 1MWMA 5LJVA 1ZC6A 2ASPA 4CZIA 4CD1A 4BVOA 4Z94A 3EKUA 3VENA 2P9IB 3A5OC 3J8AA 4BRPA 3MN7A 3CJ7A 3RSEA 4B1WB 4M7XA 2CGLA 1J6ZA 4LC9B 4CI6A 1HX1A 2E2NA 4HWIA 4RCHA 3VERA 1TUUA 3CIPA 3D2FB 4BVPA 3WQUA 3VEWA 3CETA 4BG8A 4BC3A 3VEVA 2E1YA 3CHWA 5ADXA 1DEJA 1IJJA 2P9KA 4BRMA 3CQYA 4A62A 2GTDA 4BGAA 1JCGA 4CZJA 4H0TB 4ISGA 4JHDA 3JS6A 2P9PB 3U9DA 4PKHA 2NRHA 2YJEA 2AA4A 3ATVA 4K43A 5AQGA 4F9OA 4EHTA 5AR0A 4H0OA 5BPMA 4NO7A 2UYTA 3DXKB 3QFUA 2QWOA 3EO3A 4IZ9A 3VGLA 4BR0A 1NWKA 3IDHA 4L3QA 2Q97A 4CBWA 3CJBA 2I7PA 3L4IA 5JLFA 3IMXA 3B8AX 1T6CA 5FPNA 1BA1A 4BC4A 1RGIA 1TUYA 2QWPA 1HUXA 4FSVA 1GLFO 3ZETB 4BROA 1LOTB 3VESA 3UKRB 5AQZA 4CZFA 3FR0A 1GLJO 5LY3A 2EWSA 5AQJA 3EKSA 3SK3A 3WXLA 1NGFA 3ZX0A 3D2FA 1QQNA 1ATSA 5EOYA 5AQUA 3SLCA 5I9EB 3H45C 3VF6A 4WQ4A 3A5NC 2D0PA 3O8MA 4M63C 5EX5A 5FPDA 1C0GA 4WYBA 3MDQA 3CJ9A 3AARA 5AQKA 4BRAA 2A41A 4BRGA 2QWMA 1GLDG 3WXKA 1NM1A 2E8AA 4CBUA 2P9LA 4CBXA 4B1VA 5BRHA 2QWQA 2YHWA 3CJCA 3O1WA 2YHXA 3MCPA 4DB3A 3W3DA 2P9PA 4MLEA 1D4XA 1GLLO 3VEZA 1ATRA 2IVOA 3MN5A 5FPEA 1S22A 4H0PA 1XC3A 1T6DA 3DXKA 1BG3A 2KHOA 4H5TA 5BRFA 2ZGYA 3R8EA 2A6AA 3C7NB 2PBDA 2ZWHA 3ATUA 3BF1A 1BO5O 3GBTA 4B1XB 2HOEA 2A5XA 4QS8A 1BWFO 2HMPA 1NGBA 4PKIA 1NGEA 4O5FA 2FXUA 3JXUA 3P4IA 4ISEA 3O5BA 4K42A 1E4FT 2WUSA 4FWNA 2E88A 4FWQA 3VOVA 3R6MA 3EN9A 3ZETA 3ZX2A 2YI1A 5AQPA 3UKRA 4E1JA 1KAZA 4AM6A 4BR4A 4JNEA 3M6GA 4CZEA 1QQMA 5JICA 1QZ6A 4BRIA 2A42A 3CJAA 1NLVA 2FF6A 4K41A 4IJNA 4Y0WA 3AAPA 1ESVA 1H1VA 5ADXH 2E2OA 1TYQB 4BRLA 2Q2RA 3DJCA 4CZKA 4FWRA 2QWRA 1ZXOA 1U2VB 3MN9A 3O08A 2CH6A 3IUCA 5BPLA 3TU5A 2QWNA 2V51B 2AP1A 4B1YB 4PKGA 4ISFA 3QICA 3I33A 3QBWA 3BUZB 3ULEB 5FPMA 4KBOA 3DWLA 2V7ZA 3O6WA 2E20A 3WXJA 4MO5A 2QWLA 1R59O 3UKUA 4EHUA 4I6MB 4FWKA 4BR7A 4RTFD 3G25A 3C0BA 3BF3A 1GLBG 1NGJA 5AQSA 3VETA 3MMVA 3VF2A 4H0VB 4H5VA 1QHAA 3FZHA 2BTFA 1CZAN 2GELA 3GL1A 5E84A 4BRQA 4CZLA 2CGKA 3CERA 4H0YB 4M7YA 3C7NA 4DQ8A 1Z6RA 1KAYA 3VPZA 1V4TA 3ZEUA 3KZBA 5BPNA 2DPNA 4RWTA 1IG8A 2D0OA 3O80A 3LDQA 1S3XA 1T44A 2HF3A 4BR2A 2F9WA 4FL9A 5KQDA 4WQ4C 2HF4A 5AQIA 4JD2B 1WOQA 1GLCG 3D7EO 3GE1A 3FZFA 3LDOA 3FZKA 4BRDA 3VEXA 2NZTA 5BN8A 1MDUB 2P9IA 4EFHA 1TYQA 1EQYA 3ZX3A 4CJ7A 5KPRA 1RDWX 1U2VA 2FSKA 3LDNA 3LM9A 3ULEA 2NLXA 3BEXA 5AQYA 4BR5A 2P9SB 3ID8A 3R9PA 5AFUH 2FF3B 3M3ZA 4B1UB 5KPZA 4I6MA 1NGIA 3VGMA 4C23A 1HPMA 1LCUA 2D1KA 3FZLA 4FPBA 2PAVA 5AZJB 2ASMA 5EXWA 4IXCA 5KQ8A 3QDKA 3HM8A 2QM1A 5AQRA 4A2AA 2GWJA 3QBXA 5BREA 2ZF5O 1Z05A 2YJFA 5AZIB 1NGDA 3SJHA 1SAZA 4QS9A 3LDLA 4BRHA 4EIAA 3LL3A 5JLHA 4FOEA 2W40A 3UE5A 3HZ6A 2IIRA 2FSNA 4JD2A 4EAHD 2F9TA 4B1ZA 3OHRA 4XH5A 2QXLA 4FWMA 2H3GX 4K25A 3S41A 2CH5A 3WXIA 5BRDA 1QQOA 2CGJA 1Y64A 2IVNA 1C0FA 3EL2A 4IO8A 2OANA 3WEEB 4FWPA 1JCEA 1WUAA 5EY4A 3DXMB 4XEIA 2P9SA 3CI5A 5E26A 1KXPA 4WQ5C 1YVNA 5AQWA 1ATNA 4CZMA 2P9NB 3SMPA 3I8BA 4BG9A 1BDGA 5AZJA 3CQXA 1DGKN 2YCHA 1X3NA 1RFQA 2IVPA 5B8HA 1MA9B 1BA0A 1X9JA 2BUPA 1BOTO 2YHYA 4J8FA 2FLOA 5AQFA 4FOIA 4BQLA 2D4WA 4BGBA 4CZHA 5AZIA 1V4SA 1ZBSA 4BRNA 3FZMA 3LM2A 4AM7A 5AQLA 3HBTA 3IFRA 3WT0A 3HSCA 4BQZA 4GNIA 4BRCA 3U9ZA 2Q0RA 3VEOA 4WQ5A 3TPQA 1KAXA 4PL7A 2VCPA 1DKGD 3MK6A 4XH1A 4MO4A 5CE3A 2ASOA 2E2QA 3A5LC 4DCHA 5AQHA 2GWKA 2P9UB 2VWBA 3AAQA 1SZ2A 5BR9A 2J4RA 4BC2A 1HKGA 3O4WA 2Q0UA 3QB0A 3KHYA 4H5WA 3H3OB 5AQMA 3FFKB 3ENOA 4HTLA 2P9LB 1HJOA 1K8KB 1HKCA 4MLHA 3BP8A 3A5MC 4FWLA 5TKYA 3WEEA 2ZGZA 3GDQA 3A8YA 1BU6O 1Q18A 3WUHA 3DXMA 3FGUA 5F0XA 4H5NA 1X3MA 4IWVA 5AQOA 2P9NA 1U6ZA 3AY9A 1YXQA 1P8ZA 4B9QA 3D2EB 4FO0A 5AQXA 4A61A 4NB4A 3W0LA 5JMVA 1G99A 4YDUC 3M1FA 3SMSA 4FWOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H0XB 5J2MA 3QMLA 4DR7K 1IKXA 3TARA 1YJNN 3EZWA 2OPQA 4DR5K 3CG7A 4XIUA 5KRSA 3WXMB 4FLZA 1RDDA 1SQKA 3WQTA 5F1XA 1JCFA 4W5NA 4KH4A 4YOVA 5D3GA 4DHYA 3S9HA 3AO3A 1CXQA 1K8KA 4FVMA 4JAXA 3LPTA 1QZ5A 1B9DA 1LAVA 1VQ5N 3VEYA 4CFDA 3QEWA 3AO5A 3NGIA 4FJMA 4BWJA 5C12A 3SI6A 2P9KB 2QEXN 4E7KA 4L8RB 5LMNK 4O8KA 4NCBA 1MWKA 3H3NO 2XY5A 3KVGA 4H03B 4AHTA 2DFFA 3CCEN 5BN9A 4B3OA 1XQSC 1RILA 4BREA 4BWMA 1IO2A 5LJWA 3OYIA 3G6EN 1NGHA 3L6QA 1MWMA 5LJVA 3HP9A 2ASPA 5FROA 3VENA 1TVRA 4FYDA 4Y1CA 3J8AA 3RSEA 3CJ7A 4KH5A 2B4JA 2CGLA 2QXFA 3AGKA 1EETA 3AO4A 4DU3A 3T3FA 4DLEA 3SV3A 1TUUA 1XHZA 3LP2A 2F8SA 4FCYA 3L2UA 4CJKA 3OW2M 2HBLA 2E1YA 3V81A 1KLMA 3D45A 1IJJA 3AVIA 4BDPA 4BGAA 2UXBK 3QINA 4CF8A 4H0TB 4ISGA 3NH1A 4HVJA 2P9PB 3U9DA 3THYA 4FVUA 2YJEA 1K8AO 3ATVA 4KHWA 4BE1A 4K43A 4LFCK 5AR0A 4JI5K 5BPMA 3EO3A 4DQRA 5J2QA 3PV8A 3CC4N 1NWKA 4L3QA 4CBWA 3HOSA 2I7PA 5HRRA 3SNNA 3L4IA 4JKGB 1T6CA 2E6LA 3P38A 4JKAA 5CHIA 1C0TA 2KTQA 1VHXA 3JSMA 1RGIA 1QSLA 1JLCA 4GVEA 2YNGA 3ZETB 4BROA 4YHHK 1LOTB 3V1RA 1VK0A 2NNWA 4FZZA 2ZD1A 2W6KA 4DQPA 5LY3A 3QERA 4A59A 5HL7L 5AQJA 1YHQN 3KKRA 4CIGA 3O4NA 1NGFA 3OYJA 4FLTA 4WF9L 1W7AA 5AQUA 1S72N 4FK4A 2NRVA 4HHTA 3O9RA 1BI4A 2D0PA 3K5OA 4FW2A 1C0GA 3KKSA 3MDQA 4WYBA 3AARA 2A41A 1I94K 3QEVA 3AVGA 3CC2N 4B1VA 3HYFA 3T1AA 1DLOA 3F2KA 2YHXA 1TL3A 3ID6A 2QA4N 4GMJB 4KPYA 1C6VA 1ATRA 3HPOA 4Q0BA 1S22A 5H1SQ 1X1PA 1T6DA 3DXKA 2KHOA 1JJ2M 1F21A 2PBDA 2PYJA 5GAGP 1BO5O 4KHSA 4DS5A 2HOEA 4QS8A 1BWFO 4PKIA 3KLGA 4X64K 4O5FA 2FXUA 3P4IA 2NUBA 3BY5A 3LAKA 4K42A 1QSSA 2PY5A 1E4FT 3C65A 2WUSA 4PA1A 4DKWA 1KC8O 4J2EA 2HHWA 4FWNA 3RMCA 1A5VA 3VOVA 3R6MA 1NK8A 4AHRA 4M3XA 3OYDA 3QNNA 3K57A 1KQSM 4DUYK 1TKZA 3ASMA 1S1UA 3THXA 1QZ6A 1SV5A 1K6YA 4GV6A 4ILJA 3CJAA 1LW2A 4K41A 2XRIA 3SYZA 3AAPA 1RT4A 5ADXH 3MCAB 4FWRA 4ILHA 4Z4HA 2HMIA 3IUCA 3TU5A 3OYGA 2QWNA 2V51B 4OJRA 3QICA 4KBOA 3K59A 4M3TA 3J80O 3O6WA 2E20A 4PHTX 4MO5A 2QWLA 3UKUA 2O8BB 3G10A 4CEQA 2KZMA 4RTFD 4C8OA 1NGJA 3OBYA 3CM6A 1TKTA 3RWUA 5E84A 1EKEA 3DRRA 5DM7L 1ZBHA 3ZEUA 4EP5A 3O3GA 4N5SA 1RTIA 2ZJPL 2HF3A 4ZHRA 3P1GA 2F9WA 1JKHA 2AJQA 5KQDA 2HF4A 4IOXA 2YV0X 3VMFB 1W0HA 1GLCG 2ZE2A 4FM0A 3VEXA 3K58A 2NZTA 5BN8A 1MDUB 2P9IA 4EFHA 3LP0A 1KD1O 5A2QO 4KB1A 3ZSWA 2QTDA 1TKXA 4LF6K 3J7YP 4NLBA 2FSKA 1XMQK 2KKZA 1RT1A 1HMVA 4DG1A 3DI6A 3ULEA 3E9PA 3QIPA 5AQYA 3G0ZA 2P9SB 4X62K 4B8AB 4CGFA 3CPWM 3SQ2A 2IGIA 2YHBA 1LCUA 4FPBA 1HQUA 1BL3A 1G15A 4IXCA 2DFHA 5KQ8A 3HM8A 4MDAA 4N76A 1CLQA 1SKWA 3QBXA 1Z05A 1SL1A 5AZIB 3DLKA 3SJHA 2G8FA 3O9UA 4O0IA 4KTQA 4BRHA 1XC9A 3WNGA 3OYMA 1EO1A 5M1PA 4CGIA 3OYAA 3AVKA 4IDKA 4FOEA 4CEOA 3UE5A 3HZ6A 2IIRA 4DR2K 1LW0A 3EEQA 4M3YA 3ITHA 4FWMA 1CZ9A 3AVJA 3WXIA 1RBSA 2JGUA 4F2RA 1UA0A 2IVNA 3RRHA 2WFBA 4CJLA 1HNIA 5CY4A 1UA1A 4FZYA 4FWPA 3P39A 1WUAA 2YNFA 4AHVA 1JLQA 3QIOA 1EX4A 3DXMB 2X6SA 2UUBK 3QNOA 3OA9A 4UY8O 4CZMA 3KWGA 3SMPA 1UWBA 1BDGA 3TAMA 4BG9A 3E66A 5B8HA 1D8YA 2G8HA 1Q8IA 3V6DA 3K2PA 5JVGL 1L3UA 4FJNA 5AQFA 4FOIA 1V4SA 4I9QA 4JK7A 3FZMA 3K0SA 4IOCL 4C8KA 4NXNK 4RW6A 2OPRA 1VQPN 3ZT2A 5GINA 3ISNC 4BQZA 3SUQA 2BH1A 4FZXC 3TPQA 1ZYQA 2YHAA 2VCPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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