5EVZA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 119
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5evzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5evzA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5evzA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5evzA04
1KAYA 3ID8A 1NM1A 5AQRA 3M3ZA 2E2OA 3ZETA 3WUHA 2GELA 3MN7A 4B1UB 2ASMA 3LDQA 1YXQA 4CZJA 3F9MA 2J4RA 4K43A 2EWSA 3TU5A 3EKSA 2FSNA 3VEZA 2UYTA 4XH4A 1KAZA 4FWLA 5AZIA 3HZ6A 4E1JA 4FWRA 4BR0A 2Q31A 1RGIA 2A5XA 1MA9B 3AAQA 3WT0A 3VGKA 4WQ4C 3RSEA 4AM7A 1ATRA 5AQPA 4PL8A 1JCFA 3JS6A 2QM1A 5ADXH 1J6ZA 3ZX3A 3VOVA 4BR4A 2ZGZA 5JMVA 4HWIA 4HTLA 1YUWA 5AZJB 3ULEA 2ASOA 4MO4A 2I7NA 3O6WA 2P9UA 4JHDB 2QWLA 3D2EB 4AM6A 1TUYA 2ZWHA 1KAXA 4H0PA 4CZEA 2A3ZA 4CJ7A 5EOYA 1TYQA 4K41A 1D4XA 1BA0A 3O5BA 4H5NA 3W3DA 2HOEA 2I7PA 3P4IA 4FWSA 3MN5A 3GE1A 1X3MA 3GDQA 5AQNA 3L4IA 1LOTB 1X3NA 5AQVA 3QB0A 3FZHA 3ZX2A 2DPNA 4IJNA 4MLEA 3U9DA 2QXLA 4IZ9A 2E2NA 4J8FA 4EAHD 5E84A 3BEXA 3VF6A 2GWJA 1K8KA 2YJEA 3QDKA 4FWPA 4WQ5C 4H0XB 2NRHA 1H1VA 3WXIA 4IO8A 5ADXA 2IVPA 4XH1A 3CJAA 4BG9A 3SJHA 2YHXA 3H1QA 4FWQA 5LJVA 3GL1A 4BRNA 3VGMA 5AQQA 3ENHA 2IVNA 1NGEA 2E2PA 3ATUA 4BROA 1RFQA 4BC5A 1BDGA 2P9LB 4RWTA 3MCPA 4EHUA 1IJJA 4NO7A 1MDUB 5BPNA 1CZAN 2GTDA 2P9KB 2E20A 2Q36A 2KHOA 4O8KA 3HTVA 2P9NB 4BRQA 5AQSA 1E4GT 2W41A 3ENOA 4CI6A 1HKCA 3FE1A 4YDUA 2YJFA 3AAPA 3EO3A 5AZJA 1WUAA 2Q0UA 1Z05A 4JNEA 2GWKA 5BPMA 3IDHA 4ISEA 4JHDA 1T6DA 3D2FB 1Y64A 3DWLA 3MK6A 3D2EA 4BR7A 5AR0A 5I9EB 4H5WA 3VEYA 1GLCG 3A5NC 4H5RA 3AARA 1NGFA 4O5FA 1NGDA 2FF6A 3BF1A 2QWOA 3A0IX 5BN8A 3W0LA 4BR5A 3DXMB 3QMLA 3MN9A 1ZBSA 5F0XA 4LC9B 3QBXA 4M63C 4BREA 1KXPA 5BN9A 4A61A 4B1XB 4CD3A 2D4WA 4XEIA 4A62A 1SZ2A 2VCPA 5BRFA 3VESA 4JN4A 2HF3A 5AQLA 3U8XA 3O4WA 5AQHA 1ZXOA 2ZF5O 4BC2A 3UKUB 1V4SA 1QHAA 3H46O 4RTFD 1BWFO 3MDQA 3U9ZA 2FSJA 5JLFA 4WQ4A 3R8EA 1QQNA 5ELZA 4BR9A 1TUUA 3UKRB 3C0BA 3CETA 1HKBA 4JD2A 4XH5A 2CGLA 2ITMA 2P9LA 1SQKA 3H6EA 3D7EO 1U6ZA 4BRPA 1GLEG 4CBWA 3WXJA 3EL2A 3A5LC 3DXKB 4H5TA 1HKGA 4L3QA 1XQSC 2P9NA 5AQGA 4EHTA 4BGAA 5KPRA 4H0TB 4CZFA 2QWNA 1DGKN 3CJ7A 3I8BA 5EX5A 2CH5A 4BVPA 3SMSA 5LJWA 1JCGA 1T6CA 4QS7A 3JXUA 5JICA 5KQDA 4CZIA 4B1VA 5KPZA 4EIAA 3L0QA 4BGBA 1P8ZA 5AQIA 3CERA 3DXMA 3LDNA 2OANA 3FFKB 1NMDA 3KHYA 4H0OA 2P9PB 3HI0A 4CBXA 3H3OB 1GLLO 5EXWA 5BREA 1YVNA 1BO5O 2IIRA 3CQXA 3LM2A 3QICA 4WQ5A 3FLCO 3VETA 2E1ZA 3TPQA 2IVOA 2Q0RA 4DHYA 4FO0A 3LL3A 1Q18A 1S22A 2P9IB 4BQZA 5AQWA 1V4TA 1ATSA 1XC3A 4CZMA 2HMPA 2D0OA 5CE3A 3UKUA 3UB5A 1BG3A 5FPMA 5AFUH 4BC3A 2FLOA 3CI5A 4BRCA 1JCEA 3UKRA 5BRDA 3BUZB 4CZGA 3FR0A 3O08A 2F9WA 1QQOA 3O80A 4RCHA 4BR2A 1ZC6A 2QW9A 3OHRA 3SLCA 5BPLA 4QS9A 2FF3B 2QWRA 2CGJA 1S3XA 1BUPA 3MN6A 4FPBA 3VENA 4CBUA 3I33A 3KZBA 5EY4A 2QWQA 1NWKA 3WXKA 3H3NO 1U2VB 2VYPA 4FOEA 3RSEB 3IMXA 3SMPA 4DB3A 2VWBA 1NGAA 3FZKA 1OKJA 2PBDA 2Q2RA 3VEXA 5FPNA 4BVOA 2YHYA 1GLFO 5AQMA 2YI1A 3EKUA 4BQLA 5BR9A 3IUCA 5AQJA 2F9TA 2QWPA 3UE5A 1G99A 3LM9A 2P9UB 4BRLA 1BOTO 5AFUA 3CJ9A 3B8AX 3FZFA 4FL9A 3WQUA 3WQTA 3GG4A 3VGLA 1RDWX 5LY3A 2NZTA 1DKGD 4H0YB 1NLVA 2A41A 1GLDG 4M7YA 4B1ZA 2CGKA 3HM8A 3L6QA 4H5VA 4FOIA 2P9IA 4MO5A 3CJBA 5AQOA 2E1YA 4DCHA 2W40A 2HF4A 1E4FT 2P9SB 1YAGA 3FZLA 4ISFA 3QFUA 1QQMA 2D0PA 1C0GA 2V51B 3HBTA 4FWOA 3CIPA 2PAVA 3VEVA 3WEEB 2GUPA 1XUPO 3C7NB 3H1VX 1NGHA 4K42A 3VEWA 1GLAG 3VERA 1K8KB 3FZMA 3VF4A 4BC4A 2P9KA 5F1XA 4CZHA 2A6AA 3VPZA 4Z94A 3DAWA 3SK3A 1X9JA 1NGGA 4BRIA 4BRGA 1DEJA 3ZX0A 1C0FA 4FPAA 1EQYA 4F9OA 3DJCA 2E8AA 1ESVA 3CHWA 4PKGA 3S41A 4EFHA 3D2FA 2V52B 1HX1A 1U2VA 1WOQA 2D1KA 4GNIA 3ATVA 4PKIA 2FXUA 1QZ6A 1HPMA 3CJ1A 4BRAA 4H0VB 2GEMA 1HUXA 4NB4A 5AQUA 1NGJA 1HLUA 3WXLA 5AQXA 5EVZA 4IXCA 4CD1A 4B1YB 1LCUA 5TKYA 4BG8A 1NGBA 3LDLA 1HJOA 3G25A 4CZKA 5KPTA 3M1FA 4IWVA 1BA1A 4I6MB 4MLHA 5AQTA 4KBOA 1BU6O 4BRMA 3M6GA 2WUSA 1SAZA 5AQKA 1NBWA 2ZGYA 4B9QA 1ATNA 1GLJO 1NGIA 3ZEUB 5KQ8A 4C23A 1Z6RA 3J8AA 2V7ZA 2P9SA 2CH6A 3QFPA 5AQZA 3WEEA 4H03B 3VF2A 1R59O 3O1BA 2V7YA 2AP1A 3CJCA 4CZLA 3KVGA 3C7NA 1QZ5A 2H3GX 3A5OC 3ZETB 4K25A 1MWKA 1GLBG 2BUPA 2YHWA 2BTFA 3HSCA 4FSVA 3DXKA 2Q1NA 3LDOA 3GOIA 3BF3A 5AZIB 2ASPA 3EN9A 4B1WB 4BRFA 4JD2B 3A5MC 2A40A 4IJAA 4FWKA 4BRKA 3IFRA 2Q97A 4A2BA 4FWNA 2NLXA 3O8MA 4JAXA 1MWMA 3A8YA 5BRHA 2A42A 4Y0WA 3GBTA 2E2QA 3ULEB 3MMVA 4A2AA 5AQFA 1IG8A 3VEOA 4DQ8A 2P9PA 1NGCA 5FPDA 4WYBA 3BP8A 2FSKA 3QBWA 4YDUC 4ISGA 5B8HA 3U4LA 4BRHA 3CQYA 3FGUA 4FWMA 4PL7A 1TYQB 5JLHA 4I6MA 2E88A 3LDPA 4M7XA 5F2RA 3EZWA 3R9PA 1T44A 2YCHA 3ZEUA 3AY9A 5FPEA 5E26A 2AA4A 4QS8A 4GY2B 3H45C 2QWMA 3O1WA 4BRDA 5AQYA 3R6MA 4PKHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BEBA 2XY7A 1JLCA 3WUHA 4QOZB 2RHKA 1CXUA 1KVCA 5DK5A 5C12A 2LY5A 4M3WA 4H8KA 1BI4A 4B9LA 2X78A 4E1JA 4QCLA 3F9KA 2MZ0A 3G10A 1SV5A 1ATRA 1C0UA 4WFBL 1RDDA 1TL1A 1C6VA 1LAWA 1DT9A 1TKTA 3THWB 1J6ZA 4Y1CA 3VOVA 5JMVA 4HWIA 1F21A 3J7AP 4PWDA 2UUCK 4DSJA 2I7NA 2A7TA 1A5WA 3TI0A 2QWLA 4ILHA 3OYIA 1VQ6N 1TUYA 3AVCA 4H0PA 3UIQA 4K41A 3KWIA 3PSMA 4M42A 1BA0A 3QO9A 2QKKA 4H5NA 1VQ4N 3W3DA 2HOEA 3LAKA 4CJEA 3HOSA 3VQAA 2ATBA 3L4IA 2YBRC 3QB0A 3ZX2A 4DR2K 4HHTA 4FK0A 2NRWA 3DLLL 3JSMA 4AHCA 2E2NA 3AO4A 4B3SK 1W97L 4AHSA 3O9UA 5LMNK 2YJEA 4H0XB 4DTOA 2X6NA 1POIA 4IO8A 1LQQA 2IVPA 5ADXA 5A2QO 3CJAA 4CK1A 1WT7A 4J2AA 1JXEA 4JLHA 4F4KA 3GL1A 5KI6A 3ENHA 4NCGA 1NK4A 4BROA 4AILC 2KZMA 2P9LB 1NK8A 4EHUA 1IJJA 5KK4A 5BPNA 4GV6A 1HYSA 2GTDA 2E20A 3U3YA 1HYVA 4CE9A 1VK0A 2Q36A 3THWA 4O8KA 1QSYA 2W41A 4CI6A 1EX4A 1HKCA 2OPRA 4YDUA 3DLEA 2YJFA 3AAPA 3SAGA 2BGGA 4JNEA 5BPMA 4ISEA 3DLBA 1T6DA 3MK6A 3DWLA 2EHGA 4C8LA 1VQON 4DUYK 4B9NA 2BRZA 2F8TA 1I2UA 1SS6A 4LY7A 4CW7B 3AARA 4CGJA 4FM0A 1T1TA 5KTQA 4FJNA 5JENA 2QWOA 3A0IX 3R3LA 4FLWA 1BMRA 3QMLA 1NKBA 1ZBSA 3QBXA 4M3UA 4BREA 1EXQA 3C6HA 3WNHA 2KLAA 2ZJPL 3KOXA 3TANA 1XNRK 1ZBLA 1N6QA 1EKEA 1SZ2A 3THYB 4NCBA 2K35A 1M1KO 1HQEA 2LI7A 3SNNA 1ASUA 4KAZA 3H46O 3MDQA 3E66A 3U9ZA 4B8AB 1QHTA 1NJWA 3HXMA 1KQSM 5J2NA 2ETJA 1TUUA 5M1FA 1WMTA 3CC4N 1HKBA 2ITMA 2P9LA 3HPGA 3PX0A 3QIOA 3AVLA 4BRPA 3M8QA 4PHTX 4DTUA 4CBWA 4BECA 5IT9O 1SNBA 3NF8A 4N47A 3DXKB 1NPIA 1NRAA 4EHTA 3L3VA 3VA3A 1W7AA 4J2EA 1FKPA 3CJ7A 2CH5A 5LMUK 3WNFA 4B8CA 5LJWA 1JCGA 1WBDA 2NUBA 3JXUA 3C65A 2N69A 4CZIA 4B1VA 3P83D 4I2PA 4CJKA 3KK3A 3F2KA 2G2KA 2C1GA 3U3GA 2FBYA 1EWRA 3H3OB 1VSLA 3CXCM 1IKWA 3LM2A 4WQ5A 3SAFA 3TPQA 4FJHA 3LL3A 2HHTA 2O8BB 3O9TA 3THYA 2DFEA 4BQZA 3O4QA 5DM6L 5FLXO 3LPTA 4CZMA 1VNBA 3UB5A 3SUNA 5FPMA 4BE1A 4BC3A 4C8MA 4E7IA 1RBUA 4IEEA 5C2DA 3BUZB 5M1KA 4AH9A 1KFDA 4DV1K 1QQOA 1HNZK 1ZC6A 3OHRA 4W5QA 3L2WA 2E3FA 2YIOA 2FF3B 4FJ8A 3QNOA 4KHQA 1S3XA 2GMOA 5CZ1A 4FW2A 1KC8O 1WB9A 3I33A 2UXBK 4OPAA 4KHPK 2QWQA 2JWLA 3QESA 4H4MA 3H3NO 4PY5A 2ATQA 1ASVA 2VYPA 4FOEA 4WFNL 4DB3A 1T05A 3FZKA 2PBDA 5M1OA 4GKJK 1L4VA 1GLFO 4FLVA 3E9LA 3EKUA 3QEXA 3TSPA 2G8VA 4KHUA 4CHZA 1C55A 3LP0A 1E3MA 3ID6A 4N41A 4BRLA 3LAMA 5AFUA 4YORA 1KLMA 2ZD1A 4FL9A 4JRPA 3THVA 4JI0K 1RDWX 1DKGD 3AVHA 2NRVA 3HM8A 3KLEA 2O4GA 4DR5K 4DQRA 1NG9A 4MO5A 3CJBA 5AQOA 4DCHA 2GUIA 2HBMA 4PA1A 1YAGA 1RNHA 1QQMA 4I7FA 2V51B 4C1NI 4FJMA 3K9JA 4OPKA 2IAJA 3VQCA 3WEEB 2GL1A 2X6SA 4B3RK 4CFCA 3IG1A 1OH8A 2E4LA 3H1VX 1S1UA 3R1XA 4K42A 1ICAA 4QAGA 1REVA 2BE2A 5EU7A 4YOVA 1K8KB 4BC4A 4CVNE 2P9KA 4HVJA 5F1XA 4IDKA 1BIUA 3T3FA 4Z94A 4Z4GA 4O55A 3DAWA 4Q5VA 1WAJA 4BRIA 1NGGA 1DEJA 3ZX0A 3ZT1A 2KFZA 4F9OA 3CHWA 2KGQA 1DLOA 4E1MA 1VNAA 3S41A 4EFHA 3D2FA 2V52B 4B9SA 3PSFA 1HX1A 5JVGL 4MDBA 4KB0A 3ATVA 1YTUA 4YFUA 1QZ6A 1JLGA 3KIOA 1HUXA 3S3OA 3KOZA 3WXLA 5LL6Z 4CD1A 4M3YA 1LCUA 5TKYA 4X64K 2HHSA 1KD1O 3IAYA 3NVMA 1BQMA 5CYMA 4O5BA 4CZKA 4JI8K 1HPZA 1D9DA 1S1WA 5KPTA 3M1FA 3RMCA 4IWVA 3LALA 4I6MB 5AQTA 1BU6O 4RG8A 4E0DA 3M6GA 3M8RA 3ZCMA 2UXDK 4IOXA 5AQKA 1N4NA 4CF8A 1RILA 1VSEA 1Q7YO 1GLJO 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4BEB A;  2XY7 A;  1JLC A;  3WUH A;  4QOZ B;  2RHK A;  1CXU A;  1KVC A;  5DK5 A;  5C12 A;  2LY5 A;  4M3W A;  4H8K A;  1BI4 A;  4B9L A;  2X78 A;  4E1J A;  4QCL A;  3F9K A;  2MZ0 A;  3G10 A;  1SV5 A;  1ATR A;  1C0U A;  4WFB L;  1RDD A;  1TL1 A;  1C6V A;  1LAW A;  1DT9 A;  1TKT A;  3THW B;  1J6Z A;  4Y1C A;  3VOV A;  5JMV A;  4HWI A;  1F21 A;  3J7A P;  4PWD A;  2UUC K;  4DSJ A;  2I7N A;  2A7T A;  1A5W A;  3TI0 A;  2QWL A;  4ILH A;  3OYI A;  1VQ6 N;  1TUY A;  3AVC A;  4H0P A;  3UIQ A;  4K41 A;  3KWI A;  3PSM A;  4M42 A;  1BA0 A;  3QO9 A;  2QKK A;  4H5N A;  1VQ4 N;  3W3D A;  2HOE A;  3LAK A;  4CJE A;  3HOS A;  3VQA A;  2ATB A;  3L4I A;  2YBR C;  3QB0 A;  3ZX2 A;  4DR2 K;  4HHT A;  4FK0 A;  2NRW A;  3DLL L;  3JSM A;  4AHC A;  2E2N A;  3AO4 A;  4B3S K;  1W97 L;  4AHS A;  3O9U A;  5LMN K;  2YJE A;  4H0X B;  4DTO A;  2X6N A;  1POI A;  4IO8 A;  1LQQ A;  2IVP A;  5ADX A;  5A2Q O;  3CJA A;  4CK1 A;  1WT7 A;  4J2A A;  1JXE A;  4JLH A;  4F4K A;  3GL1 A;  5KI6 A;  3ENH A;  4NCG A;  1NK4 A;  4BRO A;  4AIL C; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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