5EVZA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
total genus 119
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5evzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5evzA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5evzA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5evzA04
3R8EA 4H5VA 4GNIA 4CBUA 3H6EA 2Q31A 4A2AA 2IVOA 1NMDA 3MCPA 5TKYA 5EXWA 3FZLA 4IZ9A 5KPZA 3TPQA 3DWLA 1NGIA 4BRHA 3L0QA 4BRMA 3FLCO 3VGKA 1GLLO 2NLXA 3G25A 1KAYA 4H0VB 3VESA 2OANA 5AQXA 2P9SB 4ISFA 1DEJA 2I7NA 3EKUA 3CI5A 3UB5A 1BWFO 4B9QA 3LM9A 3VEOA 4BG8A 4FWLA 2QWPA 4MLHA 1BUPA 3F9MA 1E4GT 1T6DA 1WUAA 3WT0A 5BPMA 4DHYA 1MA9B 4BR9A 5BREA 3WUHA 1DKGD 1Y64A 2YHYA 3VGMA 2GUPA 3CHWA 4E1JA 3H3NO 3CQXA 1Z05A 4H5TA 1QZ5A 4ISEA 3U9DA 1JCEA 5BN9A 1GLFO 4XH1A 3UKRB 4FWNA 5E84A 3LDPA 1T44A 1ATNA 4EIAA 4CBWA 2BUPA 1RGIA 3EZWA 2Q0UA 1GLEG 3DXKB 2F9WA 3L6QA 2VCPA 3CJ9A 5AQGA 1ATRA 2ASMA 3ENOA 3EKSA 3GOIA 3TU5A 5FPDA 2ASPA 2CH5A 2J4RA 1HUXA 2PAVA 3MK6A 1S3XA 4WQ5C 3A8YA 3AY9A 1U6ZA 1BU6O 3L4IA 4JN4A 2ASOA 3CIPA 1MWMA 3HI0A 5AR0A 1U2VA 1E4FT 1XQSC 4IJNA 5JICA 3QMLA 4IO8A 1GLCG 3WXIA 2Q36A 1X3MA 3UKRA 5EVZA 2A42A 2IVPA 3C7NA 5ADXA 3FR0A 5JLFA 3LL3A 1HLUA 2Q1NA 2CGLA 3IDHA 3EL2A 3FZFA 2GEMA 3HBTA 3W0LA 3CJ7A 3O8MA 4BR4A 3LDOA 3O4WA 2P9UB 3H1QA 4BRQA 4QS7A 2QXLA 2P9UA 1V4SA 1NGFA 2NRHA 2EWSA 2A41A 2P9IA 4CZMA 5KPRA 2E88A 3LDNA 5AQYA 2D4WA 3WQUA 3GG4A 2P9LB 3VOVA 4BRPA 1XC3A 3CQYA 4ISGA 4RTFD 2W41A 3H3OB 3I8BA 3GDQA 2BTFA 2I7PA 3H45C 4H5WA 5EY4A 1ESVA 4WQ4A 3VPZA 3WEEA 2Q97A 3ZEUB 5AQMA 4O8KA 3P4IA 4O5FA 3AAPA 2E2NA 1NGBA 4B1VA 3VERA 4CD1A 2UYTA 3VEZA 4DQ8A 1DGKN 2E2PA 1NGJA 2QWRA 3ZX2A 3BF3A 2VYPA 1QQOA 3VETA 2E2QA 1D4XA 3A5OC 4FWSA 4BR2A 1NGDA 4BROA 1C0GA 5FPMA 2CH6A 2E1ZA 4EAHD 3FZKA 1HX1A 5AQVA 3JS6A 4JD2B 1SAZA 1X9JA 4JD2A 3D2FB 3CJAA 1OKJA 4I6MB 4BQLA 5AQLA 1RDWX 1KXPA 1JCGA 5AQHA 2AP1A 3ZEUA 1QHAA 4MLEA 3EN9A 3B8AX 5BR9A 5ELZA 4FOEA 4AM7A 3SJHA 1NWKA 1TYQB 3O80A 4LC9B 2E20A 4QS8A 1K8KA 1NGCA 4K41A 3VGLA 4F9OA 1K8KB 2FSJA 4BR7A 4K43A 4WYBA 1BOTO 4YDUA 3WXLA 4CZGA 3M3ZA 3DXKA 3WQTA 5AQIA 4AM6A 4BC3A 4BRKA 4CZFA 1EQYA 1BA0A 2V7ZA 4H03B 1H1VA 3DJCA 4CI6A 5AQNA 3A5NC 3MN9A 2QWNA 4PKGA 4IJAA 4B1XB 5BN8A 1NGHA 3QFPA 2FXUA 3D2FA 5EOYA 1GLDG 5B8HA 3IUCA 4FWQA 4BVPA 5AQSA 2P9NB 4MO5A 4PKHA 1T6CA 1IJJA 1NLVA 3HTVA 4BC2A 3A5LC 1U2VB 3HSCA 1BO5O 4BREA 3SMSA 3ULEB 5AQFA 4PKIA 3QDKA 1R59O 2Q0RA 1MWKA 4L3QA 5FPEA 3UKUA 4BRCA 3EO3A 4XH4A 3DXMA 4MO4A 1Z6RA 3LDQA 4BRLA 1G99A 4J8FA 2QWQA 4DCHA 2ZWHA 4XH5A 4CZLA 2A40A 3H46O 3A5MC 3IMXA 4BRFA 5KPTA 4HWIA 2YJFA 5F2RA 1BG3A 3VEXA 2GELA 4JHDA 2NZTA 1SZ2A 3QFUA 2QWOA 5AQOA 4CBXA 2PBDA 5AFUA 1LCUA 5KQDA 3HM8A 2QWMA 4CZJA 5I9EB 2DPNA 3IFRA 5AQUA 4FPBA 5LJVA 5BPLA 3WXKA 4BGBA 1SQKA 3UE5A 3UKUB 1ATSA 4FOIA 2YCHA 3DXMB 5LJWA 4B1WB 2CGKA 3C7NB 4H0PA 4Z94A 3BP8A 4EHUA 3O1BA 3ZETA 4A2BA 2ZF5O 3LDLA 1TUYA 4A62A 1NBWA 1S22A 1C0FA 2YHWA 5BRDA 1NGEA 4WQ5A 1TUUA 2ZGYA 3WXJA 3RSEA 3LM2A 1J6ZA 4H5RA 2AA4A 3U9ZA 3D7EO 1YXQA 4CZHA 5AQPA 4M7XA 4K25A 3ZX0A 5AQZA 1ZC6A 3MDQA 4H0TB 3M6GA 4BR5A 4FSVA 2D1KA 3R6MA 5AFUH 3QICA 4BR0A 3A0IX 1Q18A 3I33A 4PL8A 4XEIA 4CZIA 1GLJO 3FE1A 3ID8A 4FWKA 5BRFA 1GLBG 3FZHA 2P9PA 1ZXOA 5AQKA 1HJOA 1YVNA 2QWLA 1XUPO 2V52B 1QQMA 4RCHA 4KBOA 4BG9A 5AZIA 5AQWA 3VENA 4BQZA 1WOQA 4FWPA 5AZIB 4JNEA 3MN6A 1BA1A 4BGAA 2YHXA 2V51B 4FO0A 1LOTB 3ATVA 3BEXA 2H3GX 2F9TA 4B1YB 1IG8A 2ZGZA 3D2EA 1RFQA 3R9PA 3S41A 1ZBSA 3VEWA 2GWKA 3D2EB 3DAWA 2P9SA 4FWOA 1NGAA 5ADXH 4BC4A 3W3DA 4B1ZA 5LY3A 5BRHA 1HPMA 4IXCA 3QBWA 1X3NA 3MMVA 3U8XA 3J8AA 4EHTA 1YAGA 4FWMA 3MN7A 1QQNA 4BRAA 2P9NA 1HKGA 3VF4A 1GLAG 5AZJB 3CJ1A 5AZJA 2A6AA 3ULEA 2P9KA 5F0XA 4Y0WA 3FZMA 1TYQA 4BC5A 2HF3A 4GY2B 4CD3A 1P8ZA 3ATUA 1JCFA 4NO7A 4JAXA 3KVGA 2HMPA 3SLCA 3H1VX 3KZBA 1BDGA 2VWBA 2IIRA 4M63C 3CERA 4WQ4C 4CZEA 3O5BA 4RWTA 3GBTA 4H5NA 2GWJA 2IVNA 3VEVA 3VF2A 2D0PA 4JHDB 3M1FA 3ZX3A 2QW9A 3JXUA 2D0OA 3AARA 2FF3B 4CZKA 3FGUA 3CJCA 2P9IB 2A3ZA 4FWRA 1CZAN 2FSNA 4BRDA 3QB0A 2QM1A 1MDUB 2W40A 4BVOA 1V4TA 2YJEA 4C23A 3AAQA 3O08A 4EFHA 1HKBA 2P9KB 5JMVA 4M7YA 4BRIA 5AQRA 1HKCA 1NGGA 5F1XA 2KHOA 1KAZA 3ENHA 1YUWA 1NM1A 3OHRA 3WEEB 3KHYA 5FPNA 3SK3A 3BF1A 4B1UB 3HZ6A 5KQ8A 3QBXA 2E2OA 3GE1A 3GL1A 4BRNA 4CJ7A 3O1WA 2FF6A 4FL9A 3RSEB 2CGJA 2HF4A 3VF6A 3U4LA 4BRGA 4QS9A 3CETA 5CE3A 2V7YA 5AQTA 4K42A 4A61A 2HOEA 4HTLA 3MN5A 2WUSA 2YI1A 2FSKA 3BUZB 4FPAA 4YDUC 4NB4A 4DB3A 2ITMA 3CJBA 1KAXA 3O6WA 5AQJA 5E26A 3C0BA 5EX5A 2Q2RA 2P9LA 3SMPA 4H0XB 2A5XA 2P9PB 3VEYA 2E8AA 3FFKB 2GTDA 1QZ6A 5BPNA 5AQQA 4H0YB 4H0OA 4I6MA 2E1YA 5JLHA 4IWVA 4PL7A 3ZETB 2FLOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3R8EA 4H5VA 4GNIA 4CBUA 3H6EA 2ETJA 4A2AA 1QQCA 4PUOA 1NMDA 3QEIA 5TKYA 5EXWA 3OS1A 1BRZA 1S5JA 4IZ9A 3E7UX 3TPQA 3P39A 3DWLA 2QTDA 4BRHA 3VGKA 3G71N 1U48A 1XNQK 3G25A 4H0VB 3CM5A 4DQPA 2P9SB 5C12A 3ZT1A 3SQ1A 2ATBA 5TKWA 4N56A 5HRSA 4DLGA 1JLAA 4B3TK 3OBYA 4CEFA 3VEOA 4JS4A 4FWLA 3L2UA 4MLHA 3LANA 4KI6A 5J2MA 4JLHA 2E5LK 1WUAA 4DG1A 3L2RA 1RILA 1S6QA 4DTXA 4LFCK 5BREA 1X9MA 3VGMA 5DMRA 1Z05A 4ISEA 1RCHA 4H8KA 3NBPA 1MR4A 4IDKA 3E9PA 4DFJA 3AA3A 4EIAA 4CBWA 4NLCA 2A1SA 3V1RA 3EZWA 2Q0UA 1YI2N 3IKMA 2F9WA 3L6QA 3CJ9A 4CHNA 4GV9A 4FK4A 4DU1A 2ASMA 2XY8A 2ZD1A 3M8RA 3TU5A 1I3AA 5I42A 3MK6A 2HBKA 2FBYA 3BZKA 4H4OA 3OYMA 3L4IA 1VQ5N 1OVQA 3E01A 1TK5A 4BDPA 2G8HA 1NK9A 2EX3A 4ID5A 1QTMA 3QMLA 4IO8A 1HNIA 3NH1A 5EVZA 1HQUA 4NCBA 1NJIO 1EWQA 4J2EA 3QETA 3PIPL 3HRGA 1CLQA 2B6AA 2HMIA 3WNFA 5CYMA 2Q1NA 3KOXA 2VGMA 4DUYK 3IDHA 3E7RL 4BR4A 1RDDA 3LDOA 4G1QA 3O4WA 4ELVA 4YOYA 4QAGA 4F3OA 4BRQA 4OVLA 3PSFA 1NGFA 2A41A 2EWSA 2X78A 4CZMA 1A5XA 4Z4EA 3CCEN 2BE2A 5JS2A 1RBTA 1VSEA 3CC7N 3WQUA 1VQKN 2P9LB 5C10A 2SN3A 3I8BA 1W9HA 2DFFA 3GDQA 1LQHA 2I7PA 1ZVGA 4FLVA 3WEEA 4CK2A 4KI4A 4O8KA 3P4IA 3QEWA 3QERA 4FJ9A 1S9GA 4LF4K 2E2NA 1FW6A 4DS5A 1LWCA 4DR4K 4E89A 3DOLA 4HTUA 3VEZA 5KGWA 3EY1A 1S1WA 1GOAA 3NGIA 1DGKN 1XMOK 1NGJA 1Q86O 2XY5A 1QQOA 2E2QA 1W97L 1SN1A 4BR2A 3KD5E 2YIOA 1IBKK 5FPMA 1NK5A 4OPJA 1NE5A 1S1VA 1HX1A 5AQVA 4KFBA 3KLFA 3NAEA 4JRPA 3OVNA 1WSGA 2VG6A 2W6LA 2P1JA 5AQLA 2B3CA 1OH5A 2ZJQL 4FJLA 1HNVA 2XRIA 3B8AX 5BR9A 5ELZA 1J5OA 2A7TA 2WONA 1NWKA 2VG7A 2E20A 4BDZA 2NRRA 5J2PA 4JKFA 3OYFA 3J7YP 4X62K 3WXLA 3C94A 3DXKA 4DTSA 4JKCA 1T0ZA 4ELTA 3CYGA 4H03B 4CGDA 2O8BA 3DJCA 4JI4K 4K0KK 2KLAA 2RF2A 2FBXA 3A5NC 1KFDA 3SQ4A 3L56A 1KC8O 1NGHA 2KFNA 5EOYA 3V1QA 3IUCA 2O8FB 2QXFA 2X6NA 3L3VA 4W5RA 3LP0A 5KGXA 4BVPA 1VRUA 4JI7K 1NLVA 4CW7B 3A5LC 1U2VB 1FKPA 4BREA 3SMSA 3NFAA 3I0SA 5AQFA 4L8RB 3F5TA 3TAFA 2LKBA 1MWKA 4L3QA 3EO3A 3R2VA 3CC4N 3TAPA 2D0CA 3ZSQA 1C1CA 2QWQA 1SKSA 2C1IA 4CZLA 4CHZA 2A40A 3IMXA 5KPTA 2PZSA 3VEXA 2GELA 2WTUA 1RT5A 4WFBL 3BZCA 3I56N 1J5EK 1YITN 4FM0A 5AFUA 1LCUA 4C8LA 5I9EB 2OTJN 2DPNA 2JWKA 2Y1IA 4CFCA 5BPLA 2UUAK 4R5PA 1SQKA 3THVA 1WSJA 1E3MA 5LJWA 4OPAA 3C7NB 4H0PA 1HQEA 1X9SA 1NG9A 3L3UA 1ASUA 3CMEN 2F4VK 4RG8A 1VHXA 4N76A 1NBWA 3SZ2A 1NGEA 2M8BB 2RN2A 5CZ2A 4DR1K 1TL3A 4PQUA 1ICAA 2Y1JA 1J6ZA 1YXQA 4J2DA 4CZHA 5AQPA 5C25A 1DJTA 2RE2A 2F96A 3DI6A 3I55N 1REVA 3OA9A 3MDQA 4B08A 3M6GA 4DTNA 1TKZA 4BR0A 1N4NA 4IO9L 2EHGA 4LF6K 1HNZK 1RTIA 3KLGA 3E9OA 1GLBG 4GKJK 3NF7A 3RTVA 1VQ7N 2HBLA 4KH6A 1HJOA 1YVNA 3VQ6A 3F73A 3RMCA 4C8KA 4AHUA 2LY5A 2IAJA 4RCHA 2N2QA 1VK0A 5M1PA 4LFBK 4JI8K 4LFAK 1WOQA 4CHQA 3E66A 1J53A 3MN6A 1HRHA 1IBMK 3I8DA 4HVJA 4K8XA 2V51B 3O9TA 1TGOA 3AO2A 2HHVA 1GOBA 3HM9A 4CJ5A 1RFQA 3S41A 5DM6L 3SI6A 4CGJA 2NNWA 3CPEA 4CJFA 2JDQD 5ADXH 4KAZA 3O9UA 3DLLL 3TAMA 1HPMA 1C1BA 3QBWA 1X3NA 4AHTA 3VN5A 1EXQA 3V4IA 5D3GA 1WBBA 1BIUA 1IBLK 4C1NK 4DV0K 1QQNA 1XWLA 1HKGA 3WNEA 5AZJB 1VSLA 1RT2A 2LI7A 3VQPA 4CFDA 3SAFA 2UXBK 3MAQA 2P9KA 3DM2A 3DOKA 2VWJA 1JLCA 2O8CA 1P0AA 4GY2B 2WFBA 1P8ZA 1FXXA 4LH5A 2G8IA 2HMPA 3SLCA 4OKEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3R8E A;  4H5V A;  4GNI A;  4CBU A;  3H6E A;  2ETJ A;  4A2A A;  1QQC A;  4PUO A;  1NMD A;  3QEI A;  5TKY A;  5EXW A;  3OS1 A;  1BRZ A;  1S5J A;  4IZ9 A;  3E7U X;  3TPQ A;  3P39 A;  3DWL A;  2QTD A;  4BRH A;  3VGK A;  3G71 N;  1U48 A;  1XNQ K;  3G25 A;  4H0V B;  3CM5 A;  4DQP A;  2P9S B;  5C12 A;  3ZT1 A;  3SQ1 A;  2ATB A;  5TKW A;  4N56 A;  5HRS A;  4DLG A;  1JLA A;  4B3T K;  3OBY A;  4CEF A;  3VEO A;  4JS4 A;  4FWL A;  3L2U A;  4MLH A;  3LAN A;  4KI6 A;  5J2M A;  4JLH A;  2E5L K;  1WUA A;  4DG1 A;  3L2R A;  1RIL A;  1S6Q A;  4DTX A;  4LFC K;  5BRE A;  1X9M A;  3VGM A;  5DMR A;  1Z05 A;  4ISE A;  1RCH A;  4H8K A;  3NBP A;  1MR4 A;  4IDK A;  3E9P A;  4DFJ A;  3AA3 A;  4EIA A;  4CBW A;  4NLC A;  2A1S A;  3V1R A;  3EZW A;  2Q0U A;  1YI2 N;  3IKM A;  2F9W A;  3L6Q A;  3CJ9 A;  4CHN A;  4GV9 A;  4FK4 A;  4DU1 A;  2ASM A;  2XY8 A;  2ZD1 A;  3M8R A;  3TU5 A;  1I3A A;  5I42 A;  3MK6 A;  2HBK A;  2FBY A;  3BZK A;  4H4O A;  3OYM A;  3L4I A;  1VQ5 N;  1OVQ A;  3E01 A;  1TK5 A;  4BDP A;  2G8H A;  1NK9 A; 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