5EVZA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 119
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5evzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5evzA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5evzA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5evzA04
1SAZA 3FZKA 2VCPA 5BR9A 3MN5A 4MLEA 4FSVA 5KPTA 4CZHA 3MK6A 3G25A 5AQTA 1ATNA 3CHWA 3MCPA 1GLJO 2D0PA 4FWMA 4BRPA 3LDQA 1GLFO 3UKUB 4BGAA 5BN9A 1K8KB 3VESA 4WYBA 3VGMA 5AQUA 1HKBA 2P9UA 3J8AA 1MA9B 1T6CA 3GOIA 1J6ZA 1G99A 5ADXA 2H3GX 1JCFA 3A5NC 3VEYA 2QXLA 4H5TA 5F2RA 3MMVA 5AQKA 3O1WA 1X9JA 3QICA 5F0XA 3AY9A 4QS8A 2I7NA 5AZIA 1QQNA 4BRDA 2P9SA 2P9IB 5AQXA 3JXUA 4K43A 3O8MA 3VF6A 3B8AX 2IVOA 4FWKA 1T44A 2QWRA 1QZ5A 2CGLA 3LDPA 2YJEA 4B1ZA 5B8HA 2A6AA 3D2EB 1XQSC 3S41A 3FZMA 1H1VA 3ZETA 3IFRA 5BRFA 2NLXA 2QWOA 1RFQA 4BRFA 1NMDA 3WT0A 4K41A 4CZIA 3LDNA 4H5VA 3AARA 4BR7A 2PAVA 1R59O 1KAYA 2F9TA 2GWJA 3VPZA 3WUHA 2GUPA 1DGKN 2V7YA 4WQ4A 5BPNA 1GLAG 4BRAA 4MO4A 2P9KA 2IVNA 4E1JA 3ZEUB 3VEZA 3EKSA 4O5FA 4FWOA 2AP1A 5AQQA 2FSKA 3KZBA 3U9DA 3A0IX 3FR0A 4MLHA 4BG9A 3VERA 1BOTO 4KBOA 5AR0A 4WQ4C 3KHYA 3HI0A 3QFPA 1RGIA 3H46O 5FPDA 5FPEA 5F1XA 3HTVA 3HZ6A 4K25A 4CBWA 3TPQA 4I6MB 5AQYA 5JLFA 2YJFA 3BUZB 4IJNA 3I8BA 3IMXA 4NO7A 3SLCA 3ATVA 1TUYA 3ZX0A 3SMPA 1MDUB 2F9WA 3L0QA 2P9UB 3FZLA 4FWNA 3D7EO 4M63C 2QWLA 4M7XA 1DEJA 2HF4A 4EHUA 5ADXH 1NGFA 4DHYA 1Z6RA 3O4WA 2W40A 1X3MA 1NGEA 3CIPA 4FWPA 5AZIB 2AA4A 3RSEA 1D4XA 4NB4A 3D2FB 2QWMA 1NGGA 3UB5A 3GBTA 3WQTA 3LM9A 2P9LA 4B1UB 2Q1NA 3A5OC 1TUUA 1TYQB 4EHTA 4H5RA 5AQGA 4BG8A 4DB3A 4ISEA 3L4IA 2E2OA 2GWKA 3EKUA 5AQNA 3EL2A 3WXKA 4BRKA 3ZETB 3VGLA 3BF1A 1KAZA 2E20A 4F9OA 3VEVA 5AZJA 2BTFA 5FPNA 4FO0A 4FWSA 1C0GA 4B1VA 4GNIA 1WOQA 2ZGZA 3CQXA 4BR4A 1IJJA 4RTFD 3FGUA 5FPMA 5CE3A 3WEEB 2QWQA 2ASPA 1XUPO 3ID8A 4HTLA 4PL8A 1IG8A 4B1WB 4H5WA 3LDLA 3LDOA 1BA0A 2V7ZA 5AQWA 1NWKA 3SK3A 4A61A 4BRNA 1ESVA 3QB0A 4JD2A 4ISGA 4DCHA 2Q0UA 4BRMA 4CD3A 4DQ8A 1MWMA 3O08A 4FOEA 1ATRA 2E1ZA 4FPBA 3ULEA 1NGAA 4CZEA 4BR2A 3DXMB 1X3NA 1CZAN 1NBWA 1GLCG 2P9PA 2Q2RA 2J4RA 1GLLO 3VEXA 4CZFA 2BUPA 2V52B 4FL9A 4H5NA 5JICA 3U4LA 3A5LC 3H1VX 3GE1A 2NZTA 4BC5A 2FSJA 1NGCA 4Z94A 2QWNA 3CJBA 1MWKA 2QW9A 3VENA 1ZXOA 3H3NO 3P4IA 4H0TB 1GLDG 1WUAA 1NM1A 2CH6A 5JLHA 1HJOA 1HUXA 1S22A 2Q31A 1KXPA 4JN4A 4IJAA 2OANA 1YUWA 3C7NB 1SZ2A 4PKIA 4PKHA 4O8KA 5TKYA 3DXKB 2DPNA 2P9LB 5LJVA 2E1YA 3CJ9A 3OHRA 5KQDA 3SMSA 2CH5A 2E2NA 4B1YB 2VWBA 1Y64A 3R8EA 2P9NA 2HMPA 1BWFO 4BQLA 3BF3A 1YXQA 4QS7A 1U6ZA 3EN9A 4BVOA 2PBDA 3CJ7A 3SJHA 4BROA 1ZBSA 3W0LA 5BPLA 1NGBA 3HBTA 2E88A 1YAGA 4IO8A 2Q36A 3HSCA 3CI5A 3CQYA 1JCGA 1K8KA 2ITMA 1HX1A 2Q0RA 3VEOA 4GY2B 3FZFA 1E4FT 4H0XB 3O80A 3CJAA 5BN8A 3VETA 2ZF5O 4L3QA 3ZX2A 3A8YA 4BRCA 4ISFA 5AQPA 3R6MA 4J8FA 3CJCA 1SQKA 4A62A 2EWSA 1BA1A 3MDQA 2P9SB 4B1XB 3ULEB 2FF6A 3EO3A 1GLEG 1JCEA 3IDHA 3FLCO 3LL3A 1QZ6A 3HM8A 1P8ZA 3D2EA 1HLUA 2D0OA 3VOVA 5LJWA 1S3XA 2HF3A 2FLOA 2D1KA 2GTDA 3MN9A 1BG3A 4CD1A 4PKGA 1XC3A 5AQJA 3FFKB 3M1FA 2KHOA 5JMVA 3ZX3A 1HPMA 3CERA 4RCHA 1KAXA 1Z05A 5AQSA 4BREA 4RWTA 3H6EA 4BRQA 4JAXA 4IXCA 2GEMA 4JNEA 4CZJA 4BVPA 4CZLA 1NGDA 4LC9B 3ZEUA 2P9KB 5E26A 5KPZA 2YHYA 3QFUA 4QS9A 4BRIA 2E2PA 1LOTB 4BR0A 4JHDA 4YDUC 3QBWA 5EY4A 1OKJA 2W41A 2P9NB 3CJ1A 3H3OB 5BRHA 2YCHA 5AQRA 4H0OA 4AM6A 3O6WA 2FXUA 5AQFA 1BO5O 3GL1A 1HKCA 2D4WA 2VYPA 3FZHA 3O5BA 4A2AA 2UYTA 3QMLA 3I33A 4I6MA 5BRDA 3AAQA 5AQOA 2ZGYA 5AQZA 1NGHA 1E4GT 4K42A 3VF2A 2YHWA 5BREA 4CZMA 1T6DA 5EOYA 4IWVA 4AM7A 3DJCA 1C0FA 3DAWA 1Q18A 2GELA 3L6QA 4CJ7A 2NRHA 3AAPA 1QQOA 2CGJA 3LM2A 1RDWX 4XEIA 3KVGA 1U2VA 5AFUA 3D2FA 3RSEB 3GG4A 2FSNA 4EIAA 1LCUA 4B9QA 4BRHA 3BEXA 4BC4A 3UKRA 1ATSA 2A41A 4CBUA 3BP8A 3M3ZA 1TYQA 3ENHA 3C0BA 4BR9A 1EQYA 5AQIA 5EVZA 4H03B 5I9EB 1V4SA 2E2QA 3F9MA 3O1BA 2A40A 5KPRA 5AZJB 5EXWA 2A5XA 5BPMA 3VF4A 3M6GA 4CZGA 3WQUA 4M7YA 2YHXA 1GLBG 1QHAA 2QM1A 4XH1A 3VGKA 3DWLA 4WQ5A 5AQHA 3UKUA 1NLVA 2YI1A 3H45C 3GDQA 3WEEA 4CI6A 4EFHA 2ZWHA 1DKGD 3R9PA 3QDKA 4BGBA 1BU6O 3U8XA 3U9ZA 4JHDB 4C23A 3WXJA 3WXIA 4BR5A 3VEWA 2WUSA 4EAHD 3W3DA 5AQVA 1HKGA 5E84A 4H0VB 4JD2B 4FOIA 5ELZA 3MN6A 2P9IA 3FE1A 2IVPA 5AQMA 3DXMA 3ENOA 3JS6A 4FWQA 4WQ5C 4BRLA 1BUPA 1NGIA 1NGJA 2ASOA 4H0PA 3MN7A 2P9PB 1QQMA 2HOEA 5KQ8A 4BRGA 4FWRA 1V4TA 2IIRA 4XH4A 2I7PA 3UE5A 3WXLA 2E8AA 4YDUA 4A2BA 5AQLA 3A5MC 3IUCA 3EZWA 4MO5A 4BQZA 5EX5A 1ZC6A 4FWLA 4CBXA 2FF3B 3QBXA 5AFUH 2QWPA 3H1QA 1U2VB 1YVNA 4H0YB 4XH5A 3CETA 3ATUA 4FPAA 3C7NA 4HWIA 2CGKA 3DXKA 3UKRB 4BC2A 1BDGA 4IZ9A 2A42A 3TU5A 4CZKA 5LY3A 2A3ZA 4PL7A 2Q97A 2ASMA 4Y0WA 4BC3A 2V51B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WT7A 2LY5A 5BR9A 1TVRA 4KHSA 3KHWA 3MK6A 1C6VA 1POIA 1RCHA 5HLFA 1GLJO 4A57A 4H4MA 3UKUB 1GLFO 1KVCA 1K8KB 4DS5A 1T0ZA 3VESA 1CXUA 4N41A 3TR8A 3KOXA 4X65K 3J8AA 5SWMA 1DTQA 4HCCA 1TK0A 1NK6A 1G99A 4KHWA 5AQKA 2W00A 1HJRA 3AY9A 1Q82O 4DTUA 3T19A 3K58A 2GMOA 1WSHA 1N36K 3VF6A 2IVOA 1UWBA 1OH8A 1I94K 3AVJA 1T44A 2WFBA 3MEEA 3TABA 4LF6K 3VQ5A 2VG6A 3D2EB 3L3UA 1H1VA 3AA5X 3HJFA 3ENBA 3IFRA 2VG7A 4OPKA 1NK4A 2O8EB 4JKHA 1NMDA 1VSMA 3LDNA 4X62K 3AARA 3SBTA 2GWJA 4Z4IA 2V7YA 3K5LA 3PY8A 2Y1IA 1AHOA 1W7AA 4E1JA 4LFCK 3EKSA 4F2SA 2OCEA 3V6DA 3C6HA 2AP1A 5AQQA 3WNFA 4FM2A 4EP5A 4FW2A 1Y97A 3FR0A 3VERA 4KKOA 1P0AA 5AR0A 1ZVGA 4FM1A 4RW9A 3KHYA 4YOYA 1HR0K 4DR1K 4CEZA 1EWRA 4B9TA 4CJWA 1J5EK 3HZ6A 4FZZA 2HSTA 4AAZA 2FBVA 4CJKA 3VQEA 2YJFA 4JKBA 4BDYA 2MN5A 5HL7L 4DV3K 2VQEK 2N2QA 4NO7A 1RTHA 3SMPA 2P9UB 1BHLA 3FFIA 2KJAA 1Z6RA 4CEEA 1NGEA 3G10A 5LL6Z 1PTXA 1ZYVA 3NHGA 3HO1A 3L3VA 5M1KA 1RT7A 4DTMA 3GBTA 3WNEA 1WB9A 3M8PA 3P31A 4AHRA 2B3CA 4NCBA 3NBPA 2P9LA 3TAGA 4W5QA 3A5OC 1TUUA 1TYQB 4EHTA 4JKGA 4H5RA 3G6EN 1MU2A 3T1AA 4RW6A 2G8VA 3EKUA 5AQNA 1QS4A 4B3TK 3AVCA 3VQPA 1U47A 2E20A 4LF8K 4F9OA 2HHTA 3L4QA 2ASCA 2BTFA 4DTXA 5C2FA 2IGIA 1RBTA 4FWSA 4B3OA 3EEQA 3KK3A 4B08A 2HHXA 2I61A 1SNBA 3I56N 3IS9A 3SQ2A 4JRQA 2PY5A 5FPMA 2D0BA 1XUPO 3ZT0A 4HTLA 3I55N 1YJWN 3KP1A 5FLXO 4DF4A 4OGEA 3AVBA 4ILJA 3CQ8A 1OH7A 1ESVA 2C1IA 5M1PA 2YKNA 2KFNA 4FOEA 1ATRA 1JXCA 4RG8A 2G8WA 3AO2A 3KC6A 2KZMA 3S5TA 1CZAN 2J4RA 4JI3K 3IRXA 4CZFA 2BUPA 4H5NA 1B9FA 3H1VX 4OVLA 1L5UA 3AO1A 1YT3A 3V1QA 1MWKA 1KCFA 3ALYA 3VENA 1ZXOA 3H3NO 5DM6L 4JI1K 3AO3A 1J5OA 4M42A 3K57A 3VMFB 1WNSA 3MAQA 4FK4A 1IKWA 3OHRA 3RMAA 3Q7CA 3SMSA 3ZSOA 2MZ0A 5KI6A 5C12A 2VWBA 2P9NA 1NOYA 4BQLA 2PYJA 2WONA 3CJ7A 3LDSA 3V81A 5C25A 1ZBSA 4OPHA 4FLVA 4K8ZA 3HBTA 3OYGA 3NGYA 1G15A 3M8RA 1CZ9A 1WSIA 3DLEA 4GY2B 1A5VA 4I2PA 3SPYA 5BN8A 3HSTB 4M45A 3NF6A 4ISFA 1J53A 4BACA 3K5NA 4FLXA 2HW3A 3ITHA 3R6MA 1KTQA 5T7BA 2EWSA 1BA1A 3WNHA 3TARA 1HNZK 4DTPA 1VK0A 4C8LA 1X1PA 1N32K 1JCEA 1RTJA 4DSFA 3O9SA 3SUNA 3OYBA 3SCXA 3CCEN 1R0AA 3JAMO 4CEAA 3VTHA 2HF3A 4DR3K 2D56A 4O0JA 1BG3A 4I7FA 3OYAA 5JS2A 1EO1A 4DV4K 1O1WA 4CFDA 3ZX3A 1W0HA 4RWTA 4BREA 1KAXA 1Z05A 5AQSA 4QCLA 4CFAA 3RRGA 1RT6A 2HHHK 3GKUA 4JNEA 3KTQA 4CERA 4DU3A 4Z4GA 4BVPA 2B4JA 4C8MA 3ZSQA 4DR2K 3L2VA 3HOTA 1QQCA 4C1NI 4BRIA 3LAMA 4LF7K 3NAEA 4BR0A 1BI4A 5HP1A 3QBWA 5HRSA 2W41A 3PIPL 3KLIA 2YCHA 5AQRA 2QI2A 4H0OA 5AQFA 1BO5O 2XY8A 1HKCA 2D4WA 1C55A 2GBZA 1KRPA 2F8TA 3FZHA 2P5GA 2E4LA 1ZUTA 1VQ6N 3AVGA 3HP6A 1WSEA 4CZMA 5CYMA 4IG0A 4I9QA 3VA0A 3LWMA 1OH5A 1C0FA 3U6FA 3L6QA 1ZVEA 4FJXA 3CG7A 2CGJA 4GV9A 3LM2A 1RDWX 4NLBA 5J1EA 2O8DB 3QERA 4BRHA 4FVMA 4K0KK 3BEXA 4AHVA 1LQHA 2Z1GA 4IDKA 4CBUA 3SAHA 5KTQA 2FBYA 3DLLL 3ENHA 3SV4A 4DWIA 4JKGB 1EQYA 4DQRA 1KFDA 4H03B 3TAEA 3QINA 1RDCA 1V4SA 3DYAA 3IAYA 4IEIA 4KAZA 4CW7B 2PFUA 1QSSA 3CF5L 5KPRA 3K2PA 1RT1A 3CYMA 3IKMA 1KD1O 4L8RB 2YHAA 3WQUA 2YHXA 3QLHA 1KVAA 4WQ5A 3UKUA 2YI1A 3QO9A 3WEEA 3G4SN 4IOAL 3OS2A 1JLEA 1DKGD 3AO4A 3JYTA 4DSIA 4JHDB 3WXJA 3WXMB 4EAHD 1HKGA 3P5JA 4X64K 3OYLA 5E84A 5HRRA 4ILHA 1W97L 4F8RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1WT7 A;  2LY5 A;  5BR9 A;  1TVR A;  4KHS A;  3KHW A;  3MK6 A;  1C6V A;  1POI A;  1RCH A;  5HLF A;  1GLJ O;  4A57 A;  4H4M A;  3UKU B;  1GLF O;  1KVC A;  1K8K B;  4DS5 A;  1T0Z A;  3VES A;  1CXU A;  4N41 A;  3TR8 A;  3KOX A;  4X65 K;  3J8A A;  5SWM A;  1DTQ A;  4HCC A;  1TK0 A;  1NK6 A;  1G99 A;  4KHW A;  5AQK A;  2W00 A;  1HJR A;  3AY9 A;  1Q82 O;  4DTU A;  3T19 A;  3K58 A;  2GMO A;  1WSH A;  1N36 K;  3VF6 A;  2IVO A;  1UWB A;  1OH8 A;  1I94 K;  3AVJ A;  1T44 A;  2WFB A;  3MEE A;  3TAB A;  4LF6 K;  3VQ5 A;  2VG6 A;  3D2E B;  3L3U A;  1H1V A;  3AA5 X;  3HJF A;  3ENB A;  3IFR A;  2VG7 A;  4OPK A;  1NK4 A;  2O8E B;  4JKH A;  1NMD A;  1VSM A;  3LDN A;  4X62 K;  3AAR A;  3SBT A;  2GWJ A;  4Z4I A;  2V7Y A;  3K5L A;  3PY8 A;  2Y1I A;  1AHO A;  1W7A A;  4E1J A;  4LFC K;  3EKS A;  4F2S A;  2OCE A;  3V6D A;  3C6H A;  2AP1 A;  5AQQ A;  3WNF A;  4FM2 A;  4EP5 A;  4FW2 A;  1Y97 A;  3FR0 A;  3VER A;  4KKO A;  1P0A A;  5AR0 A;  1ZVG A;  4FM1 A;  4RW9 A;  3KHY A;  4YOY A;  1HR0 K;  4DR1 K;  4CEZ A;  1EWR A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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