5EVZA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
total genus 119
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5evzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5evzA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5evzA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5evzA04
3EZWA 3QFUA 1S3XA 3I8BA 3H1QA 2E2NA 2F9TA 4H0OA 3KVGA 3ATUA 4EHUA 1G99A 3P4IA 4H5TA 3BEXA 2I7NA 4BRIA 5BREA 2J4RA 3MN6A 3O8MA 3QDKA 4CZMA 3L6QA 2D0OA 5AQFA 5FPDA 1WOQA 2FF6A 3C0BA 3DXKB 1JCFA 4FWPA 1LCUA 1Q18A 3CJAA 2QW9A 3D2FB 2P9KB 4M7XA 4CI6A 4RCHA 3M1FA 3FE1A 3MK6A 1HKGA 4A61A 4BRHA 3TPQA 3VESA 3VGLA 1IJJA 4BR0A 1T6CA 3VEWA 5AQUA 3A5MC 2HOEA 1QHAA 3VF4A 1HX1A 3UKRA 1RDWX 2OANA 5AQOA 4FWSA 2P9NA 4BRFA 2IVNA 3WQTA 2F9WA 1NMDA 2V7ZA 3C7NA 2FSKA 4IZ9A 3H6EA 3UKUB 2E2OA 3VGKA 2A6AA 3HM8A 2GELA 3UB5A 5EXWA 1RGIA 1MDUB 4ISFA 2CGKA 4DQ8A 5F1XA 4CZKA 2QWLA 1BOTO 1E4FT 2FXUA 3BF3A 3O6WA 4B1XB 2P9SA 3R6MA 3AARA 3VEZA 1GLAG 1JCGA 3IMXA 3B8AX 1GLLO 3H3NO 1NWKA 3WT0A 1NM1A 3D2EA 3ZEUA 4FPAA 3TU5A 4CBUA 3HZ6A 1OKJA 3VF6A 2ZWHA 3FZHA 4GNIA 2AA4A 5TKYA 3LDPA 1BO5O 4IXCA 1GLFO 3IFRA 1X3MA 4ISEA 1YUWA 1X3NA 2YCHA 3LM2A 4FPBA 4C23A 5I9EB 5EVZA 2BUPA 5AQXA 3LDNA 2ASOA 2P9IA 1KAZA 1NGEA 1MA9B 4CBWA 4J8FA 1QQMA 3G25A 1U2VA 3MN7A 3GL1A 4MO5A 3H45C 4DCHA 3HBTA 1NGBA 4FWRA 5CE3A 3FGUA 5ADXA 1KAYA 1Z05A 2YJFA 1ATRA 1SQKA 1DKGD 1BU6O 3R8EA 4RTFD 2A41A 1TYQB 2HMPA 4IJNA 4QS8A 5ADXH 5AZIB 3CJ7A 3WQUA 2PBDA 1NGFA 1D4XA 1WUAA 5FPEA 4BREA 5FPMA 3VERA 1HJOA 1HLUA 2P9UA 1U6ZA 4BRDA 3ZX0A 3ZETA 5AQGA 1TUYA 2AP1A 5AZJA 1GLEG 4H5VA 3DWLA 3HSCA 2Q0RA 3DXMB 4EFHA 1ATNA 1GLBG 5AQJA 5KQDA 4MO4A 4B1UB 4GY2B 1EQYA 1P8ZA 2QWOA 5AQHA 1SAZA 3A5NC 3SLCA 3QB0A 1E4GT 3C7NB 4EIAA 1GLDG 2V7YA 4FWNA 4A2AA 3EKSA 3BP8A 2NZTA 4FWOA 1V4TA 4Z94A 4CBXA 2P9UB 3CI5A 4CZIA 4XH1A 1GLCG 4CD1A 1YAGA 4FOEA 3CJ1A 4YDUA 5LJVA 2YHWA 2Q1NA 3VEVA 4H5NA 1BDGA 3VEYA 4BRKA 2QWRA 1BG3A 2FSNA 3DJCA 2NRHA 3ZX2A 2GEMA 1KAXA 4BRNA 2E88A 3I33A 4K41A 3M3ZA 3U4LA 3L0QA 1T44A 4EHTA 5AQRA 2UYTA 4L3QA 4BC4A 4CD3A 1HKCA 2ZGZA 3LM9A 1MWMA 3S41A 2ASMA 3ULEA 1XC3A 4BG8A 3GDQA 5JLHA 5AQLA 1HKBA 4BG9A 2WUSA 4BQLA 4WQ5A 4B1ZA 3W0LA 1NLVA 1QZ5A 3O1WA 4AM6A 4CZLA 3QMLA 1NGHA 4PKGA 5BRFA 4BRLA 3OHRA 3D7EO 4JHDB 1BA0A 1BWFO 4XEIA 3EN9A 5KPRA 5AQVA 3D2EB 3ZEUB 2P9PB 3KZBA 2E2PA 3WEEA 4CZJA 2FF3B 3UKUA 5BPMA 2KHOA 3LDOA 2I7PA 5BRDA 3QFPA 3AAQA 1NGGA 2DPNA 4BGAA 3QBWA 3AAPA 4Y0WA 3RSEB 3CHWA 1QQOA 4PKIA 3EKUA 3WXLA 2EWSA 3ENHA 2IVPA 3A5LC 3FLCO 5B8HA 4H03B 4BR2A 2A42A 4WQ5C 1U2VB 3VF2A 3DAWA 3F9MA 4BRQA 3U8XA 1YVNA 5EY4A 2CH6A 4FWKA 5AFUH 2HF3A 1TUUA 1HPMA 2P9PA 4PKHA 5LY3A 4H0PA 4XH5A 2YHXA 3VPZA 1ZXOA 1HUXA 2QWNA 3H46O 4H5WA 3ID8A 1NGJA 2ASPA 4FL9A 2P9KA 5AQTA 4BR9A 4BVOA 3FR0A 3U9ZA 4JAXA 2CGJA 4BRAA 3H3OB 4H0YB 4CJ7A 4FSVA 2A40A 1KXPA 3WUHA 5AQPA 4ISGA 4FWQA 3ULEB 3CJCA 3VEOA 4EAHD 5AQQA 1T6DA 3SMPA 3A0IX 3A5OC 1RFQA 2E2QA 4BR5A 1CZAN 2E8AA 4K25A 4PL7A 3GG4A 5F0XA 2PAVA 2QWPA 3UKRB 3IUCA 4B1YB 5BPLA 4WQ4C 3GOIA 4BR4A 3CERA 3A8YA 4YDUC 5E26A 1S22A 2A3ZA 3FZKA 3VOVA 4CZEA 4IO8A 1MWKA 4CZFA 2YJEA 2GWJA 2VYPA 5BN8A 4M63C 1ATSA 2D1KA 3DXKA 2E1YA 3MN5A 3FFKB 4BR7A 1C0FA 5AQNA 3QICA 5E84A 3JS6A 1K8KB 4WYBA 5KPTA 1J6ZA 3MN9A 2IIRA 1Z6RA 4FOIA 2ZGYA 4IJAA 1R59O 3ZX3A 4BROA 4E1JA 4F9OA 3JXUA 3O1BA 4WQ4A 1NBWA 5JLFA 4QS7A 4FWLA 2P9NB 4XH4A 3L4IA 3IDHA 4BC2A 2E20A 4K43A 1YXQA 1XQSC 2NLXA 2IVOA 3SJHA 3U9DA 4BRPA 4H5RA 3MCPA 4BC5A 1DEJA 4NO7A 1BA1A 3LDLA 4NB4A 5AFUA 2GWKA 4HWIA 2Q97A 3O80A 1JCEA 2VCPA 3CETA 4QS9A 3MDQA 4MLEA 3SMSA 2ITMA 2GUPA 1QQNA 3QBXA 3CIPA 3O5BA 2W40A 2Q2RA 5BPNA 3CJBA 5AZIA 2Q0UA 3LL3A 4BRMA 4JNEA 4LC9B 3BF1A 3BUZB 5AQKA 3AY9A 4PL8A 2FSJA 3CQYA 4BRCA 5FPNA 4H0TB 5JICA 3CJ9A 4JHDA 3HTVA 4BVPA 3MMVA 1C0GA 1NGAA 3M6GA 4FWMA 4CZGA 3LDQA 3KHYA 1NGDA 1GLJO 3UE5A 4K42A 2Q36A 4BGBA 2P9LA 1SZ2A 3EO3A 4JN4A 3FZMA 2QWMA 5AQMA 4HTLA 4JD2B 2Q31A 3WXJA 3GBTA 2ZF5O 1BUPA 2D0PA 2YI1A 2BTFA 1TYQA 3ATVA 2HF4A 1K8KA 3FZFA 4H0XB 1H1VA 3VENA 3SK3A 3WXIA 1NGIA 1QZ6A 2CH5A 3ENOA 2VWBA 3R9PA 2H3GX 5EOYA 5F2RA 5AQZA 3H1VX 4O5FA 4I6MA 1DGKN 4A62A 4B1VA 4BRGA 1IG8A 2P9IB 3D2FA 2YHYA 4JD2A 5AQYA 5ELZA 2FLOA 4MLHA 2W41A 2P9LB 3RSEA 4BC3A 4A2BA 4AM7A 5AQWA 2QXLA 2A5XA 4DB3A 1X9JA 2D4WA 5BN9A 3O08A 2E1ZA 5KPZA 3DXMA 5EX5A 3VETA 3WEEB 3W3DA 4IWVA 1LOTB 5AR0A 3EL2A 2V51B 1Y64A 3FZLA 2GTDA 3J8AA 1ZC6A 5LJWA 2V52B 4KBOA 1V4SA 4I6MB 2CGLA 4FO0A 4CZHA 2P9SB 5JMVA 4DHYA 2QM1A 4BQZA 5AQIA 4M7YA 3O4WA 3HI0A 3VGMA 5AZJB 1NGCA 3ZETB 4O8KA 3GE1A 4H0VB 4B9QA 1ESVA 5AQSA 3VEXA 5BR9A 5KQ8A 4B1WB 4RWTA 1ZBSA 3WXKA 2QWQA 1XUPO 5BRHA 3CQXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DSIA 1JLQA 4FLVA 1D9FA 2BGGA 2E2NA 3F5TA 3KVGA 3ATUA 3TANA 4EHUA 4WFAL 3P4IA 3TI0A 2I7NA 2QI2A 3O8MA 3QDKA 3DLEA 4CZMA 4M41A 4CEFA 3S3NA 4GV6A 5FPDA 4CERA 2FF6A 3C0BA 4DTOA 3SBTA 1JCFA 4HUEA 1NK0A 3CJAA 2QW9A 4M7XA 1S1VA 4K8XA 3OYLA 3CM6A 5K14A 3MK6A 1S1XA 1HKGA 3T1AA 1LQHA 1D9DA 3VGLA 1D8YA 4ILHA 1T6CA 3VEWA 3A5MC 3AVGA 4DR5K 3KLEA 1ZYVA 4KO0A 5CYQA 4CJRA 3SQ4A 1ASWA 4DV4K 4PQUA 5AQOA 4Z4HA 2IAJA 3WQTA 1EWRA 2F9WA 3C6TA 2UU9K 3KWGA 1L3VA 3UB5A 1RGIA 1NK7A 3KTQA 5F1XA 1E4FT 2FXUA 3MWPA 4B1XB 3R6MA 3AARA 3VEZA 2QXFA 4M3XA 1XMQK 3L2VA 1TGOA 2A1RA 1RBRA 1GLLO 1HNIA 4LFBK 3H3NO 3TAQA 4FPAA 4CGIA 3V9SA 4CBUA 1S1UA 3G10A 2ZWHA 3FZHA 4FZXC 4IXCA 3PLAA 1GLFO 4H4OA 3IFRA 3E66A 1JLEA 3RRGA 4WF9L 3HXMA 3SUNA 5H1SQ 4OKJA 4C8NA 5I9EB 5AQXA 3AVKA 2QTDA 1EETA 1L4VA 4JI8K 2P9IA 4DSKA 1NGEA 4IOCL 4DQPA 3EE8A 4J8FA 2WTUA 3MN7A 3H45C 3WNFA 2NUBA 3HT3A 1S6PA 3VQ4A 3RMBA 1ATRA 1JKZA 1DKGD 3KLFA 3R8EA 1HNWK 1MU2A 2A41A 3PSIA 5I3UA 1Y97A 4CFBA 2YKNA 4CEOA 2KBKA 2OPPA 5AZIB 1C6VA 4JI1K 4CHQA 1ZYQA 1NGFA 1WUAA 5FPEA 3I56N 3ZCMA 4DTPA 1BI4A 4UJ0A 4C1NK 1TUYA 5AZJA 2FBXA 4H5VA 1BRZA 2HBKA 4OGEA 4EFHA 3VQ9A 4ICLA 4CJKA 3K2PA 2ZJPL 5C0YA 4MO4A 4B1UB 1SL0A 1TK8A 3M8PA 2F96A 1EQYA 3LP0A 2C1GA 4CF2A 5AQHA 2YNIA 2YKMA 5HL7L 1PX9A 2NY8X 2KKZA 3NF7A 4EIAA 3G6EN 4N5SA 3ZSOA 3EKSA 3BP8A 4BECA 1O13A 3V1RA 5C25A 5HRNA 1WSEA 3V6DA 4CBXA 2HBLA 4K0KK 3KK2A 1NOYA 4CD1A 3OYBA 1YAGA 4DS4A 1LQQA 4YDUA 5A2QO 3CXCM 4CEAA 1WAJA 3RMCA 3AVNA 4KHYA 4HE7A 2OTJN 4I9QA 1BCMA 1VQ4N 3WNGA 3KC6A 1VRTA 3OY9A 5FROA 1BCOA 3K5LA 3ZX2A 2GEMA 1OH7A 3KKRA 3LWMA 3THYB 1N4NA 3U4LA 3M3ZA 4DV1K 1N32K 3L0QA 3PX4A 4BDYA 4YOXA 5CY4A 1HKCA 5CYMA 2ZGZA 5M1NA 4B9VA 3G71N 2YHBA 4WFBL 3CD6N 3LWLA 3U6FA 2ASMA 1I2UA 4ELVA 4NYFA 5LL6Z 4BQLA 4B1ZA 1REVA 3RTVA 4CZLA 3TSUA 4LY7A 5BRFA 4AHCA 4LF9K 4AF1A 3EZ5A 3H08A 1QS4A 1BWFO 3LP3A 4CK1A 4XEIA 2X6NA 2DFFA 3WNHA 5C2DA 3VQBA 4CECA 4ZTJA 3UKUA 2OZSA 1U49A 1XNQK 5BPMA 2I7PA 2MN5A 2HBMA 4KTQA 4BGAA 3AAPA 2ZJQL 4BE1A 3CFRA 3CHWA 1OH8A 3EKUA 1VQKN 1RDUA 1KFDA 4H8KA 1KTQA 1ZBFA 2EWSA 3AA3A 1OVYA 3ENHA 2LY5A 3SZ2A 2BANA 3A5LC 3FLCO 2KSKA 4CF9A 5B8HA 3SAGA 4W5OA 5GINA 4BR2A 1YJNN 3F9MA 4JI2K 4X65K 4KI6A 3NCIA 3D45A 2P9PA 4PKHA 3K5OA 2Y1IA 3KP1A 3KLHA 4DFPA 1KFSA 1NJZA 4IOXA 4YNQA 1XHXA 4DWIA 1T8EA 4FL9A 2E3FA 5AQTA 5IWAK 1N34K 1BIZA 1RILA 3L3UA 4BDPA 5AQPA 1WB9A 3CJCA 3VEOA 4EAHD 2LR3A 3RWUA 4J2AA 5HRRA 1EP4A 4A5AA 1T6DA 3KD1E 2K35A 1ZUTA 4BR5A 3GG4A 4IFEA 4LD0A 4W5QA 4B8AB 2PAVA 2GX9A 4JK8A 3THYA 1VK0A 4AHSA 3CCSN 3MXJA 2A7TA 1S22A 4OPKA 4KB0A 3AO5A 3CCEN 2GWJA 3SJJA 3S3MA 1SS6A 3ID6A 4DU1A 4DQSA 2D1KA 2BRZA 3FFKB 2YEOA 1HNXK 2HHWA 4DR3K 3CM5A 4CJSA 4FZYA 3ENBA 3SQ1A 1K8KB 4WYBA 4F3OA 1DJTA 1AHOA 3SQ0A 1IBKK 2X78A 4FOIA 1OMYA 4CHZA 4IJAA 1R59O 3ZX3A 4OVLA 1VSMA 4BROA 3MX5A 4CEEA 4WQ4A 3TAMA 5JLFA 4H4MA 3J81O 4K43A 3CMEN 1NK4A 3SBGA 4BRPA 2JWKA 1I39A 4C8KA 4AAZA 3LP2A 2ZM6K 4O5BA 4DQIA 4HWIA 3O80A 5M1OA 4CJWA 1JCEA 3CETA 4B9LA 2KBHA 1JL1A 4FLUA 1CXQA 2OPSA 3O5BA 3K58A 3MECA 4KKOA 5AZIA 2HHHK 1NPIA 2E2FA 1FK9A 3CG7A 4JNEA 4CJTA 4Y1CA 1VSFA 4BRCA 4G9ZA 3CQYA 1WBDA 4H0TB 4FJ7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4DSI A;  1JLQ A;  4FLV A;  1D9F A;  2BGG A;  2E2N A;  3F5T A;  3KVG A;  3ATU A;  3TAN A;  4EHU A;  4WFA L;  3P4I A;  3TI0 A;  2I7N A;  2QI2 A;  3O8M A;  3QDK A;  3DLE A;  4CZM A;  4M41 A;  4CEF A;  3S3N A;  4GV6 A;  5FPD A;  4CER A;  2FF6 A;  3C0B A;  4DTO A;  3SBT A;  1JCF A;  4HUE A;  1NK0 A;  3CJA A;  2QW9 A;  4M7X A;  1S1V A;  4K8X A;  3OYL A;  3CM6 A;  5K14 A;  3MK6 A;  1S1X A;  1HKG A;  3T1A A;  1LQH A;  1D9D A;  3VGL A;  1D8Y A;  4ILH A;  1T6C A;  3VEW A;  3A5M C;  3AVG A;  4DR5 K;  3KLE A;  1ZYV A;  4KO0 A;  5CYQ A;  4CJR A;  3SQ4 A;  1ASW A;  4DV4 K;  4PQU A;  5AQO A;  4Z4H A;  2IAJ A;  3WQT A;  1EWR A;  2F9W A;  3C6T A;  2UU9 K;  3KWG A;  1L3V A;  3UB5 A;  1RGI A;  1NK7 A;  3KTQ A;  5F1X A;  1E4F T;  2FXU A;  3MWP A;  4B1X B;  3R6M A;  3AAR A;  3VEZ A;  2QXF A;  4M3X A;  1XMQ K;  3L2V A;  1TGO A;  2A1R A;  1RBR A;  1GLL O;  1HNI A;  4LFB K;  3H3N O;  3TAQ A;  4FPA A;  4CGI A;  3V9S A;  4CBU A;  1S1U A;  3G10 A;  2ZWH A;  3FZH A;  4FZX C;  4IXC A;  3PLA A;  1GLF O;  4H4O A;  3IFR A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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