1P8ZA

Complex between rabbit muscle alpha-actin: human gelsolin residues val26-glu156
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
365
structure length
354
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Gelsolin precursor, plasma
publication title From the First to the second domain of gelsolin: A common path on the surface of actin?
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein/contractile protein
total genus 112
structure length 354
sequence length 365
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1p8zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1p8zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1p8zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1p8zA04
4B9QA 2P9UA 3IUCA 1Y64A 4FWNA 4A2BA 1CZAN 4BRMA 2P9IB 1JCGA 3A5LC 5AQMA 4FPBA 3FR0A 4B1VA 5BRFA 3MK6A 1HKGA 1G99A 4J8FA 3CJAA 1ZBSA 5BREA 1HUXA 4CZEA 3C7NB 4DHYA 4CZGA 3KVGA 1BWFO 3BEXA 2P9IA 2QWLA 4BR9A 5EVZA 3S41A 4K25A 5AQKA 1DGKN 3QBWA 5AR0A 3VETA 2KHOA 2I7NA 3D7EO 3H45C 4H5TA 1T44A 2CGJA 1NWKA 1T6DA 2E8AA 5AQHA 3QFPA 3IMXA 3CI5A 3C7NA 3FE1A 4H03B 1NBWA 3O5BA 2GWJA 3A5MC 3FZFA 4K43A 5AQWA 3EZWA 4XEIA 2QXLA 3GL1A 3W3DA 2OANA 3SMSA 4BREA 5KPZA 3UB5A 4CZIA 4C23A 2E1ZA 5EX5A 2YCHA 5LY3A 2V51B 1NGCA 5AQQA 4FOEA 5AQGA 2QWPA 3LDPA 4BRDA 3KHYA 5AQUA 5B8HA 3FZHA 1LOTB 5AZIA 3HTVA 1U2VB 4WQ5A 4QS8A 1GLCG 5BN8A 2VCPA 5FPMA 3D2FB 3FZLA 2CGLA 1KXPA 3WXJA 3FLCO 3SJHA 1KAZA 2YI1A 3O08A 3AY9A 3WXKA 5F0XA 5CE3A 2ZGYA 4BQZA 4H0PA 4K42A 4BRQA 3LDOA 3WEEB 3F9MA 3WQTA 3C0BA 5JMVA 5BPNA 5TKYA 1ZXOA 3EO3A 5EY4A 4EHTA 3A8YA 1KAXA 2AA4A 3ULEB 4BRIA 4FPAA 4KBOA 3TU5A 2UYTA 3ZEUB 3VENA 3GOIA 1HLUA 2P9PB 3U8XA 5FPDA 2A5XA 4FWRA 1QQOA 4BR0A 4BC5A 3BUZB 3CQYA 4B1XB 2FF6A 1BG3A 2E2PA 4JN4A 4CZFA 2NLXA 2ZF5O 5AQPA 4CZJA 4IJAA 3HSCA 4DB3A 2BTFA 2E2QA 3MCPA 4H0OA 3ZX3A 3VESA 4M7XA 4PL8A 3ATVA 3SMPA 4B1ZA 4CBWA 3HI0A 4YDUA 1WUAA 2W41A 3CETA 4WQ4A 2QW9A 1C0FA 1SQKA 2V52B 1RDWX 1NGAA 3DXMB 4CZLA 2P9PA 4I6MB 5AZJA 1NM1A 3DWLA 5AFUH 3VF4A 3GG4A 2Q0UA 3EL2A 4HWIA 4XH4A 1HKCA 2J4RA 3VGLA 3BF1A 5E26A 4A61A 2P9SB 4DCHA 5KPRA 2A3ZA 4JHDB 5I9EB 3IFRA 4GNIA 3TPQA 3H6EA 4CBXA 4M7YA 3GDQA 3DXMA 4H5WA 4BRKA 2WUSA 4LC9B 4I6MA 3UE5A 3VEXA 1RGIA 2EWSA 4BRAA 4RWTA 4ISFA 4IJNA 4CI6A 1V4SA 1E4GT 4A2AA 2FF3B 1H1VA 4Y0WA 4H0VB 2P9SA 4XH5A 2Q1NA 1QQMA 5EXWA 4JHDA 5KPTA 2HF3A 1RFQA 2CGKA 2E1YA 4NO7A 2P9NA 5ADXA 2YHYA 3ZETB 4BRHA 3WUHA 1QHAA 4PKIA 1Q18A 1TUYA 2FSNA 3EKUA 3OHRA 1GLAG 4AM6A 4BR4A 1Z05A 5AQJA 5AZIB 2ZWHA 5KQDA 3FZKA 4EIAA 2HF4A 3GE1A 3QDKA 1GLEG 3AAPA 2FSKA 3VGMA 3P4IA 3A5OC 3CHWA 5JLFA 5ELZA 5FPEA 1SAZA 2I7PA 2V7ZA 4BGBA 3ZETA 1R59O 3LDLA 2W40A 2YHXA 2Q97A 1IJJA 4FWOA 2GTDA 2QWNA 4B1WB 1K8KB 2E88A 3VEYA 1NGGA 4FWKA 3VF6A 4IWVA 3FFKB 5AQIA 2PAVA 2P9LA 4FO0A 3MN6A 5AQLA 2D1KA 1NMDA 2VWBA 1XQSC 1NGEA 4F9OA 3QBXA 2DPNA 3LL3A 1TYQB 4ISGA 3EKSA 3A0IX 3ENHA 5AQXA 4BR5A 2A41A 4BVPA 4HTLA 3IDHA 4WQ5C 3CJ7A 1YUWA 3QFUA 3W0LA 1ESVA 1QZ5A 1QZ6A 1K8KA 1YAGA 3O8MA 3L0QA 1T6CA 1GLJO 4BRPA 2ITMA 4CBUA 2HOEA 4JD2B 2CH5A 2E2OA 1BO5O 2A6AA 2QWQA 3I8BA 4CZMA 3WQUA 3O80A 3MMVA 3CJCA 1BUPA 3M6GA 1XUPO 5AZJB 5LJWA 1TYQA 5AQYA 2ASMA 4CZKA 4K41A 1GLFO 1SZ2A 1V4TA 3VERA 4O8KA 3CERA 4BRFA 1NGJA 1X3NA 3QMLA 4EAHD 1BA1A 1YVNA 4JD2A 5JICA 4MO5A 3H46O 4BRCA 3UKUB 4FL9A 1MWMA 3SLCA 4H5RA 1P8ZA 5EOYA 1U6ZA 3LM2A 4FOIA 3CJBA 3JS6A 4MLEA 1BDGA 2E2NA 4FWMA 3VEOA 4MO4A 3DXKA 5BN9A 1S3XA 1NLVA 4DQ8A 1HX1A 3O4WA 2A42A 4BVOA 4EFHA 2P9NB 3LDQA 4JNEA 4FWLA 2GWKA 4H0XB 3H3NO 3UKUA 1KAYA 4ISEA 4EHUA 4FWPA 4QS7A 3B8AX 4BC4A 2F9WA 3VF2A 5BRDA 3H3OB 3EN9A 3L4IA 2ZGZA 4B1UB 2Q31A 4RCHA 4A62A 3M3ZA 2ASPA 4Z94A 5F1XA 4H5NA 1ATRA 2A40A 4L3QA 3DAWA 5AQNA 2Q0RA 5AFUA 3ATUA 1BOTO 2F9TA 4IXCA 3ZX0A 2V7YA 2YJEA 1OKJA 3QB0A 3MDQA 1NGIA 1Z6RA 3O6WA 4FSVA 4AM7A 4IZ9A 5AQOA 4BRGA 4PKHA 2D4WA 3H1QA 1QQNA 3MN7A 3JXUA 5JLHA 3L6QA 2P9LB 3M1FA 3U4LA 4CJ7A 1C0GA 1ATNA 3ENOA 3O1BA 5FPNA 3VPZA 2BUPA 5KQ8A 2AP1A 3HBTA 2QWRA 2GEMA 3CJ1A 2IIRA 2E20A 4BG9A 4BR2A 2IVPA 2NRHA 3BF3A 1J6ZA 3WXIA 1JCFA 3CIPA 4PL7A 1X9JA 4BQLA 1DEJA 1X3MA 2HMPA 3D2EB 1XC3A 1JCEA 4CD3A 1D4XA 2VYPA 4PKGA 4BROA 3VEZA 3SK3A 4FWQA 4IO8A 3R6MA 2D0PA 3U9ZA 3CQXA 3DJCA 4BRNA 4FWSA 2QM1A 5AQRA 5BPMA 2H3GX 4RTFD 3LDNA 2FSJA 3G25A 1GLDG 4BC2A 2IVOA 1BA0A 3BP8A 1ZC6A 2QWOA 3UKRB 3LM9A 3AAQA 3H1VX 3J8AA 3WT0A 3VOVA 3D2EA 4H0TB 4BC3A 1WOQA 1E4FT 5E84A 2NZTA 4WYBA 3HZ6A 1MA9B 5AQZA 4CD1A 2FLOA 3CJ9A 4NB4A 1IG8A 4B1YB 5BRHA 1MWKA 2Q2RA 2YJFA 1NGFA 1LCUA 1DKGD 1YXQA 3I33A 2QWMA 3MN5A 3KZBA 3UKRA 3R8EA 4BG8A 5LJVA 2D0OA 4BR7A 2Q36A 3DXKB 3GBTA 1U2VA 1TUUA 4MLHA 4H5VA 4M63C 5AQTA 1S22A 4XH1A 3D2FA 4E1JA 4BGAA 2FXUA 3FGUA 3VEWA 5BR9A 2P9KB 2GELA 1MDUB 3RSEB 1HKBA 1HPMA 5AQVA 4CZHA 2CH6A 1ATSA 4QS9A 1GLLO 3VEVA 3O1WA 3WEEA 5AQFA 2P9UB 3HM8A 5F2RA 1NGHA 1GLBG 2IVNA 3FZMA 4O5FA 4YDUC 1EQYA 3VGKA 4JAXA 3AARA 2PBDA 4WQ4C 5BPLA 1HJOA 3ZX2A 3ULEA 3R9PA 3ID8A 5AQSA 3ZEUA 3WXLA 4H0YB 4GY2B 1BU6O 2P9KA 1NGBA 2GUPA 3RSEA 4BRLA 3A5NC 3U9DA 2ASOA 5ADXH 1NGDA 3MN9A 2YHWA 3QICA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KD1E 4B9QA 3DMJA 3MX5A 1Y64A 1B9DA 4FWNA 4CF0A 2P9IB 3HPOA 3A5LC 4KHWA 2RE2A 4Z4CA 2XY8A 4GMJB 4FPBA 3FR0A 4QAGA 4JRPA 2D0BA 5SWMA 1HKGA 1XMQK 3CJAA 4XIUA 2HBKA 1JLCA 1ZBSA 3QLHA 4Q0BA 1N36K 2F4VK 3NHGA 3KVGA 4ICLA 4WF9L 1NNEA 5EVZA 4K25A 3QBWA 4LSLA 5AR0A 4AF1A 1NKBA 1QE1A 3SQ0A 3K5OA 3AVBA 4ILJA 4OGEA 3V1QA 4H5TA 2CGJA 3RR8A 4JKHA 3V9UA 2E8AA 4CK2A 5AQHA 3IMXA 3CI5A 1RTJA 1QTMA 3ISNC 3A5MC 3PX0A 3I0SA 3SMSA 3OS2A 3M5RA 4CHPA 1BQNA 2E1ZA 1Q7YO 4JKAA 5LY3A 4KHUA 2V51B 3K59A 1HNXK 2UXDK 3VQDA 4EP4A 5AQQA 4DTSA 5AQGA 3WXMB 3CG7A 4ZTJA 4KV8A 4CJFA 4E7KA 1BCMA 1UA1A 5BN8A 4JI1K 3ZLJA 2CGLA 3Q7CA 3ZCMA 3FLCO 4CF1A 4JKGA 1KAZA 5F0XA 2RHKA 4HUEA 3LDOA 1RTHA 4IFVA 3WEEB 3B6PA 1HYSA 1TL3A 3C0BA 5TKYA 1D9FA 3K5LA 1IV0A 5EY4A 4EHTA 4I9QA 5KRSA 1SV5A 1N33K 4IOAL 3VQ4A 2UYTA 3DRRA 2YNIA 4FJMA 1HLUA 1JL2A 2NRXA 2OCEA 5FPDA 2A5XA 3QETA 1B9FA 4LFCK 1JLFA 4BR0A 3BUZB 3VQAA 2FF6A 1S1XA 2YKMA 4CZFA 3OS0A 2ZF5O 5AQPA 4IJAA 2E2QA 4M7XA 4YHHK 3HI0A 1XHXA 4DQSA 4WFNL 3CETA 1NGAA 1HQUA 3P83D 2P9PA 3N4QA 4I6MB 1BHLA 4O44A 5AFUH 3S3NA 1I3AA 3EL2A 2NUBA 4HWIA 3VGLA 1HKCA 3KLGA 1C0TA 1RBTA 3OYHA 3KK3A 5GAEP 4JI7K 3ZYYX 5BR8K 4DR7K 5KTQA 1JJ2M 2G8IA 1ITGA 4R5PA 3IAYA 2Z1JA 4H5WA 4FK0A 1ZBHA 3NGYA 4CJRA 4JS5A 2FBTA 4EP5A 3VEXA 3NH0A 4Y1DA 1HMVA 4LH4A 1N8RO 2G8VA 1W0HA 4RWTA 4IJNA 3HM9A 1ZYQA 3DLEA 4PHTX 4KO0A 3ZT4A 4Z4HA 4H0VB 2P9SA 1QQMA 2X74A 5KPTA 4FLYA 1D5AA 1RFQA 2CGKA 3SUQA 2E1YA 1SUQA 4DF4A 4DF8A 3WUHA 1Q18A 4M41A 1GLAG 3IG1A 4AM6A 4CIGA 4DUYK 4BR4A 5DM6L 3SBTA 4E1MA 5AQJA 2HMIA 3L2VA 3KK1A 1HRHA 3FZKA 4CFAA 3VGMA 3EE9A 2D5RA 1Q9XA 4LF7K 2KLAA 4M45A 1EKEA 1SAZA 3P31A 4CJVA 3ZETA 1R59O 3LDLA 4LF4K 3KTQA 1IJJA 1L3VA 3BZKA 3TABA 1W97L 4FWKA 3VF6A 2X78A 4IWVA 3KK7A 5AQIA 2PAVA 3CM6A 3TAFA 3E9PA 3HVRA 3MN6A 2VWBA 3BZCA 5IWAK 2JLEA 3NFAA 1NGEA 4F9OA 1TYQB 4C8OA 4CW7B 3V9XA 4CCHA 1LWFA 4WCEL 1ZBLA 2A41A 3IDHA 3CJ7A 3K5MA 1RILA 4CEFA 1KC8O 3O8MA 2ETJA 1GLJO 3PX4A 1RNHA 2A6AA 2RN2A 2Y1IA 3QNOA 4DV5K 1CZ9A 2UUBK 3M6GA 5LJWA 5HRPA 5AQYA 3ZSQA 1FW6A 2ASMA 3F9KA 4IG3A 4K41A 3JAMO 1C0MA 2DY4A 2KZMA 4BRFA 4KHYA 4DV6K 1X3NA 4RW4A 1YVNA 2O8BA 1CZBA 1TKDA 2O8CA 2ZD1A 1VQNN 3SLCA 1QQCA 1J54A 3ZT3A 3SBGA 1U6ZA 4MLEA 1ILYA 1HQEA 2UUCK 4MO4A 5BN9A 3V81A 2W00A 3LDQA 4FWLA 2GWKA 3CFRA 4H0XB 3TR8A 3TTDA 4ISEA 1BI4B 5BRDA 2D0AA 3VQCA 3H3OB 3EN9A 3L4IA 4AHCA 2A1RA 3AA2A 5M1PA 4RCHA 3MEDA 3C6UA 4CGGA 5CZ1A 4K8ZA 2A40A 3L2RA 2F9TA 2V7YA 4FZXC 2YJEA 4DR6K 4GV6A 3FFIA 1VSKA 1Z6RA 3H08A 4FSVA 4O0IA 3M8SA 1QSLA 3THXA 1EWRA 2G8KA 4IOCL 4CHNA 4WFAL 4B3RK 2ZM6K 4V19S 4X64K 1NK9A 3M1FA 3U4LA 1C0GA 3ENOA 2BE2A 3L4QA 1NK7A 2HBMA 1BQMA 3J7YP 2BUPA 3DLLL 5KQ8A 3HBTA 4BE0A 2GEMA 3AVIA 3E66A 4BG9A 2QKBA 1VSLA 1RT6A 1J6ZA 3BF3A 1JCFA 3CIPA 1VQ8N 1C1CA 4CJEA 1XC3A 3AV9A 4CD3A 2YHAA 4A5BA 2XRIA 3VEZA 3PIOL 1S1UA 2PFUA 4DR2K 1RT1A 3HJFA 4FWSA 4Q5VA 2XY7A 1X9MA 2H3GX 4CGIA 3THWB 1JLEA 1SKSA 1BA0A 3P1GA 1NJZA 3EEQA 3LM9A 4L8RB 1W2BM 3WT0A 3HVTA 4H0TB 3AA3A 2HHXA 4OKJA 3MXIA 4FJIA 1REVA 2WTUA 1U4BA 2O8BB 4DQPA 4WYBA 3HZ6A 4RW6A 3ULDA 2FLOA 3CJ9A 4CEAA 5BRHA 2E4LA 1NGFA 2VGNA 1YXQA 4CF8A 1RDUA 2QWMA 4JK9A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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