1P8ZA

Complex between rabbit muscle alpha-actin: human gelsolin residues val26-glu156
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
365
structure length
354
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Gelsolin precursor, plasma
publication title From the First to the second domain of gelsolin: A common path on the surface of actin?
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein/contractile protein
total genus 112
structure length 354
sequence length 365
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1p8zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1p8zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1p8zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1p8zA04
2GEMA 4BRQA 3DXKB 2FSNA 4B1ZA 1GLJO 1X3MA 1NMDA 2Q1NA 2YCHA 3MN9A 2Q36A 4BGAA 1JCFA 3CQYA 4A62A 1C0GA 4FWSA 4QS7A 1IG8A 4IJNA 1NLVA 4CBXA 3QDKA 4NO7A 3GG4A 2HMPA 1ATNA 1NGDA 4FPAA 4BR2A 4FWNA 2ITMA 1YAGA 4B1XB 1V4SA 3EL2A 3OHRA 5AQVA 3A8YA 3LM9A 2P9SA 2P9UA 3O4WA 3FFKB 1KXPA 1BG3A 3RSEA 3VF4A 4BC5A 1QQMA 5AQLA 5BN8A 4BRKA 4BC2A 2P9SB 3FZHA 2P9UB 2Q97A 4K43A 4CZEA 3HM8A 1HKCA 3RSEB 1NGCA 3BUZB 4EAHD 5AQYA 3WXIA 3CERA 3CI5A 1Z6RA 1NGBA 5AQGA 4A61A 4BG9A 3L6QA 1E4GT 4CZMA 1NBWA 3MK6A 4LC9B 2PBDA 5AQIA 4C23A 4IJAA 3I33A 2E20A 3TU5A 3KHYA 3MN7A 1U6ZA 2ZF5O 2ASOA 5I9EB 1NGFA 4K41A 4O5FA 2Q0RA 4DQ8A 2IVPA 2ZGZA 5BPMA 2YJFA 4BRNA 4FL9A 4BRFA 3G25A 5EX5A 1HUXA 3IUCA 3A5OC 2A3ZA 4XH5A 2FF6A 4BR0A 3WQUA 4WQ5C 1RDWX 3QFPA 3VEWA 3AAPA 1QZ6A 4JAXA 4DB3A 1WOQA 3H3OB 4BRAA 4BGBA 4Z94A 1ATRA 5AQSA 2IVOA 5TKYA 5AQTA 3VF6A 2QWOA 3M6GA 2QWQA 3D2FA 4BRDA 4JN4A 1C0FA 1J6ZA 2GUPA 4IXCA 5AR0A 2A41A 1X3NA 4IWVA 4CJ7A 3EZWA 3D2FB 2V51B 5ELZA 2A42A 3H1VX 5AQQA 1X9JA 2CH6A 4WQ4A 3C7NA 3CJ7A 5EVZA 2YJEA 3FE1A 2V7ZA 4H5WA 4BRMA 3KZBA 3VEOA 3FZLA 3C7NB 1T6DA 3HBTA 3S41A 3VGKA 5F2RA 2Q0UA 2I7PA 1GLCG 1TUUA 2ASMA 2KHOA 5AQPA 3EKSA 4BRIA 4RCHA 4B9QA 2CGLA 3P4IA 3FZMA 1ESVA 3W3DA 3VEYA 3GBTA 3ULEA 1GLFO 1TYQA 3FZFA 3LDPA 1HKBA 2A5XA 4HTLA 3FZKA 3H3NO 5AQZA 4B1VA 3MN6A 2GELA 1NGGA 3ULEB 5KPRA 1BDGA 2QWPA 1TYQB 3SJHA 5BRDA 3WXJA 1S3XA 3VOVA 1ZC6A 3BEXA 1LOTB 4H0VB 4H0TB 3SLCA 4FPBA 4FSVA 3M3ZA 3LDOA 2HF3A 2CGKA 3ATUA 2YHWA 1QZ5A 5ADXA 1E4FT 5BN9A 3AY9A 3DJCA 1K8KA 4DCHA 1Q18A 4L3QA 1YUWA 3UB5A 1T6CA 3A5LC 2V52B 3UKRA 3VGMA 3ZETA 2Q31A 3VEVA 4CZKA 5BR9A 4HWIA 4JD2A 3LDQA 2NLXA 4EFHA 3J8AA 4AM6A 1K8KB 4H0XB 4NB4A 1BOTO 1KAYA 3BF1A 3UKRB 4CZLA 3DWLA 4JD2B 1CZAN 1HX1A 1MWKA 2IIRA 5BPNA 5BPLA 4CZHA 1Y64A 1QHAA 5CE3A 3AARA 4KBOA 3VGLA 2D0PA 4BG8A 4BRGA 2P9KA 5EY4A 4M63C 4BRCA 3L4IA 2P9NA 1GLBG 4BR4A 1G99A 2ASPA 4H5RA 4H0YB 2D0OA 2P9KB 4XEIA 4H03B 1NM1A 3CJ9A 1JCEA 2P9NB 3HZ6A 1HLUA 4MLEA 1BU6O 3LL3A 3ZEUA 4CBUA 3WXKA 2A40A 4PKHA 2A6AA 4FOIA 1S22A 3JXUA 3W0LA 3VESA 3ZX2A 2YHXA 3D7EO 3QB0A 3MN5A 3ZEUB 5ADXH 4XH4A 5AFUA 4H5TA 4FWRA 4YDUA 4M7XA 1KAZA 5JMVA 3DAWA 4RTFD 5EXWA 5E84A 2E1ZA 3IDHA 3HI0A 4BQLA 1GLEG 2AP1A 4J8FA 3SK3A 3BF3A 4FWMA 5KPZA 3QMLA 3GE1A 3WT0A 4B1YB 4CZGA 3H46O 4BVPA 2EWSA 1RGIA 4JHDA 3H1QA 3VEZA 4CI6A 2CGJA 4DHYA 4BROA 5KQ8A 2DPNA 2GWKA 4FWQA 2GTDA 5BREA 2OANA 2QXLA 4JHDB 3B8AX 5LJWA 3CETA 4ISEA 5EOYA 3HTVA 3WQTA 4WQ4C 3CJAA 2E1YA 1ZBSA 5FPMA 1BWFO 2VCPA 3CHWA 3UKUA 3ID8A 2P9PA 1WUAA 3I8BA 2E2QA 3SMSA 1V4TA 3O80A 2E2NA 4O8KA 1XUPO 3GOIA 3EKUA 3UKUB 3VF2A 4CBWA 2P9PB 5AQRA 3R9PA 5AQKA 2NRHA 4BR5A 4EHTA 2GWJA 2VWBA 4H0OA 2F9WA 1Z05A 3R8EA 1HJOA 4PL8A 4BQZA 4K25A 1TUYA 2FF3B 1MDUB 2E88A 4BRPA 2E2OA 5FPEA 2IVNA 5AZJA 3A0IX 3O8MA 5AFUH 2V7YA 2YI1A 5KPTA 2QWRA 3A5MC 3DXKA 3O1WA 2D4WA 2QM1A 5AZJB 5AQWA 3VEXA 4FWPA 5F0XA 1MA9B 4BRHA 4FWOA 3C0BA 3ENHA 2UYTA 4H5NA 1R59O 3U4LA 4QS8A 1U2VA 1QQOA 1GLLO 4EHUA 1HPMA 1SZ2A 2WUSA 1YXQA 4I6MA 3CJ1A 1JCGA 1NGAA 1ATSA 3GDQA 1NWKA 4IZ9A 3U8XA 3VPZA 4QS9A 1HKGA 5BRHA 1U2VB 2QWMA 3O08A 3ZETB 1YVNA 3O1BA 1GLDG 5JLFA 4I6MB 1T44A 3M1FA 2E8AA 3QBWA 3LDNA 1XQSC 3O6WA 3EN9A 4FOEA 4FO0A 5AQUA 4ISFA 4WYBA 4CZIA 3QBXA 2FXUA 4BC3A 1NGHA 3U9DA 3U9ZA 5AQHA 4BRLA 4MO4A 2YHYA 3ENOA 5F1XA 1DKGD 5BRFA 1QQNA 2QWNA 2QWLA 3A5NC 5AQFA 1P8ZA 1OKJA 1DGKN 4CZJA 3VETA 3ZX3A 2W41A 2F9TA 1RFQA 4B1UB 4F9OA 3WEEA 2Q2RA 2BUPA 1BUPA 3WUHA 4M7YA 3VENA 5B8HA 4K42A 2P9IA 4ISGA 3IFRA 4GNIA 2FSJA 2E2PA 2J4RA 1BA1A 3WEEB 4PKIA 1GLAG 1KAXA 4CD3A 4WQ5A 4Y0WA 2P9IB 5FPDA 4A2BA 5AQMA 3R6MA 3JS6A 2W40A 4AM7A 2AA4A 1XC3A 3O5BA 3H6EA 3QICA 3ATVA 2ZWHA 3F9MA 4H5VA 4XH1A 4H0PA 3MDQA 4E1JA 1ZXOA 5LY3A 1NGEA 5JLHA 4YDUC 3H45C 1MWMA 4CZFA 1EQYA 2BTFA 2ZGYA 5AQNA 3CIPA 2P9LA 3CQXA 3D2EA 1SQKA 5AQJA 4RWTA 5LJVA 1H1VA 4PKGA 4MLHA 3TPQA 3MMVA 3ZX0A 4BR7A 1BO5O 4FWLA 2H3GX 3D2EB 1IJJA 2P9LB 5AZIA 3GL1A 3IMXA 1BA0A 3CJBA 4BREA 3DXMA 5E26A 5FPNA 4B1WB 5AQXA 5AZIB 1DEJA 3EO3A 2I7NA 3DXMB 3UE5A 3WXLA 4IO8A 4MO5A 4BR9A 2FLOA 4BVOA 4GY2B 3LM2A 2VYPA 3HSCA 3FR0A 4A2AA 1D4XA 4FWKA 3VERA 5KQDA 2FSKA 3CJCA 4BC4A 2CH5A 2HOEA 3MCPA 4PL7A 3SMPA 3LDLA 2HF4A 5JICA 3BP8A 3FGUA 2NZTA 1SAZA 3L0QA 1LCUA 2QW9A 3AAQA 4EIAA 2D1KA 3FLCO 3KVGA 4CD1A 2PAVA 5AQOA 1NGJA 1NGIA 3QFUA 4JNEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GEMA 3VQ8A 3RRHA 4Q5VA 3OYNA 1UA1A 1X3MA 2YCHA 2OYQA 3KD5E 1LW0A 3QEVA 1NLVA 4I2PA 1HRHA 1KSPA 1ATNA 1BCOA 5IWAK 2DFEA 1YAGA 4B3OA 2PZSA 3SQ1A 3A8YA 4CEDA 1TL1A 3LM9A 2P9SA 5C2FA 4BWJA 3O4WA 4OGEA 3VF4A 4KTZA 3UIQA 1O13A 3NGZA 1N34K 4DFPA 4R79A 3L2UA 3HM8A 3RSEB 3SQ0A 4CFAA 2HVIA 3BUZB 4FK0A 3VQ9A 2P5GA 3QNNA 3KKSA 4BG9A 4CEEA 1IH7A 1G15A 3RRGA 4CZMA 3D0PA 2UU9K 1NBWA 4Z4IA 2PBDA 1RILA 4DR1K 2WTUA 4JKAA 4M3ZA 3VTIA 3MN7A 1U6ZA 1T03A 1NJWA 2IVPA 2ZGZA 4CJRA 1NKCA 5BPMA 2YJFA 3G25A 5EX5A 2HHIA 1RBTA 1HUXA 3R1XA 3A5OC 3L2QA 4B3MK 5DM6L 4JKHA 2YHAA 4KHUA 4WQ5C 4B9MA 3C94A 3AAPA 1QZ6A 4JAXA 3NCIA 1U45A 3ZSOA 4BGBA 4Z94A 3E9LA 1ATRA 4FZYA 2IVOA 1XHXA 2QWQA 2XHBA 3OYCA 1VSIA 1WSIA 1C0FA 1J6ZA 4GW6A 3C65A 4IXCA 5AR0A 4CFDA 1X3NA 4IOXA 1UWBA 4IWVA 3T19A 3WNFA 4CJ7A 3D2FB 3I55N 1ZYQA 5C42A 5AQQA 2CH6A 1T3VA 4CFCA 4WQ4A 4GKKK 1BIUA 2YNIA 1VQ8N 2X6NA 3FE1A 4DV7K 2A1SA 5F2RA 1VQNN 3TI0A 2QTDA 1TUUA 2HHSA 1I3AA 3BGRA 3LZJA 1VAZA 4ZTJA 4Q0BA 4DF8A 1ESVA 3CMEN 3VEYA 3ULEA 1GLFO 1TYQA 3ZSWA 2ZJPL 1S5JA 3H3NO 1SV5A 4B1VA 2OPQA 2GELA 1XMOK 1N5YA 1Z26A 4CHNA 3VOVA 1XWLA 4YHHK 3NAEA 1LV5A 4J2DA 5J2NA 3LDOA 2HF3A 4KHPK 1QZ5A 5BN9A 3T7ZA 3DJCA 1K8KA 2KZMA 1KD1O 4JI8K 2V52B 3VGMA 2O8DB 2Q31A 1L3SA 4EFHA 1IBMK 4C8OA 4LSLA 1UOCA 1HJRA 4H0XB 2G8WA 2E6LA 3V4IA 2XY6A 3CM6A 4KFBA 2O8BA 3AVGA 1BL3A 5BPLA 3QNOA 1HPZA 5CE3A 3AARA 4KBOA 4EZ6A 4BG8A 3LP1A 2P9KA 3HO1A 3O9RA 1LAWA 3L4IA 5GAHP 1IV0A 3OYHA 1HMVA 2ASPA 4H0YB 2D0OA 3HSTB 1EETA 1ITGA 4CECA 3L8BA 1HLUA 4CF0A 4FLXA 1BU6O 2VG5A 2A40A 4PKHA 1S22A 2Y1JA 2C1GA 3TTCA 5C10A 5HROA 3VESA 3CPEA 3RMAA 2W42A 5AFUA 5ADXH 3LDSA 1RTDA 1NK8A 4YDUA 1NOYA 4LFCK 1WBDA 1GLEG 2NRVA 3SK3A 5KPZA 3LZIA 3GE1A 1QVFM 2HHQA 4IO9L 4DSLA 1HR0K 5C15A 1RGIA 1OVQA 3H1QA 4CI6A 4DTNA 5KQ8A 2DPNA 2GWKA 3MEGA 5JVHL 5LJWA 3CQ8A 3PIPL 4CF2A 2KLAA 3HTVA 1HQEA 3RR8A 3NMUA 4DTUA 4DMNA 5E41A 3CJAA 2FBVA 4YFUA 3NF9A 5FPMA 1SKSA 3THYA 3M8RA 1BQNA 1WUAA 1T8EA 2E2NA 3UKUB 3VF2A 2FC0A 3PSIA 4LF4K 2NRHA 3TSQA 2HBMA 3HP6A 2X78A 3P39A 4DV4K 1TKDA 2RPIA 1HJOA 4RW4A 4DU1A 3O9QA 1MDUB 4CJVA 2IVNA 5AZJA 1WN7A 3E01A 3SAFA 2UXBK 5CY4A 5KPTA 3KLFA 3CF5L 2D4WA 2BDPA 3G4SN 4ILJA 1HNZK 4AF1A 4FWPA 3PO5A 4KREA 3C0BA 1EO1A 4F3OA 1U2VA 1GLLO 4EHUA 1HPMA 3DOKA 3J7ZO 1KFDA 1YXQA 3RWUA 2NRZA 3CJ1A 2O4IA 3VPZA 3U8XA 4QAGA 1U4BA 5EU7A 1ZBUA 3ZETB 3ZT0A 3K57A 1WSEA 1VQON 3NE6A 4CIEA 5I3UA 3ZSVA 2DFHA 1JJ2M 1OH8A 4FOEA 3QO9A 1NGHA 4PHTX 3SUQA 4DU3A 2YHYA 5F1XA 4O0IA 3T1YK 2QWNA 4G9ZA 2OA8A 2PFUA 2D0AA 3ULDA 2KFZA 1RBUA 4Y1CA 4B8CA 1WSJA 3AVCA 3KK7A 2P1JA 2F9TA 2HVHA 4B1UB 2YKMA 3ITHA 4F9OA 4C8LA 3WUHA 4CGDA 1VQ9N 1JKHA 2E2PA 3V9XA 1BA1A 3TAEA 1NKBA 4PKIA 3K58A 3QEIA 4KB1A 1YT3A 4DLGA 2UUAK 3M8SA 4WQ5A 3U6FA 1C0UA 3RMCA 4LF7K 1VSKA 3JS6A 2W40A 4CJ4A 3CC4N 4CJLA 4I2QA 2AA4A 3O5BA 1TGOA 3H6EA 4O0JA 4AHSA 3QICA 3OBYA 2E4LA 4H5VA 4XH1A 3DYAA 4FJIA 3MDQA 1KVBA 3K5NA 4DSEA 5LY3A 3DM2A 4CJSA 5HLFA 1RT7A 1MWMA 1NK5A 1I94K 5M1NA 3CIPA 2P9LA 1IO2A 1VQ7N 1WB9A 5AQJA 1KLNA 3TPQA 3ZX0A 3TR8A 4OX9K 1BO5O 1LAVA 3SCXA 1OVYA 1VSDA 3P1GA 2ZM6K 3GL1A 4NYNA 3C6TA 3KKRA 2YX6A 1ZBIA 1EKEA 5DK5A 2BGGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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