1P8ZA

Complex between rabbit muscle alpha-actin: human gelsolin residues val26-glu156
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
365
structure length
354
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title From the First to the second domain of gelsolin: A common path on the surface of actin?
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein/contractile protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Gelsolin precursor, plasma
total genus 112
structure length 354
sequence length 365
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1p8zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1p8zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1p8zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1p8zA04
1NMDA 2P9UA 3D7EO 5F2RA 1KAZA 2DPNA 2F9TA 3W0LA 4BRFA 3FZLA 2YJFA 2CH6A 3FLCO 4FWMA 2E88A 2QWNA 4BR5A 4NB4A 2E1YA 4IO8A 4EAHD 3FFKB 1BG3A 3RSEB 1T6DA 3DXMA 4CBUA 5AQPA 3LDLA 2P9SA 3MDQA 1BDGA 1NGJA 1IJJA 2QWQA 3WXJA 3A8YA 4BRCA 4IXCA 5EX5A 2GELA 3H6EA 3UKRA 1K8KA 2J4RA 2OANA 3CHWA 2P9PB 3VEXA 3CJ1A 4CZKA 1NGBA 1X9JA 4O5FA 2ZWHA 3ZX3A 3HBTA 2D0OA 3MN5A 3O4WA 1LCUA 2QWLA 3I33A 4FWNA 4K25A 2E2QA 4H03B 4MLEA 4FPBA 3GOIA 4CD3A 4RTFD 2VYPA 2WUSA 2IVPA 5I9EB 4BVOA 2FF6A 3L0QA 4B9QA 1IG8A 3JS6A 4BR0A 3WUHA 5JLFA 3EKSA 3IUCA 4AM6A 5AQYA 4DHYA 2PAVA 1QQOA 2ZGYA 1BWFO 5AQJA 3ULEB 1HUXA 3ZX0A 3ENHA 4FSVA 5FPNA 3AAQA 3VEOA 5EVZA 3WEEB 1KAXA 5KPTA 2IVNA 5AZJB 3VEWA 3MK6A 3C0BA 2W41A 1NGCA 2Q31A 5CE3A 3FE1A 4CZGA 3ZETB 5BN9A 3HI0A 4XH4A 2A3ZA 1JCEA 4CZFA 3IFRA 3ENOA 4FOIA 3AY9A 4EIAA 2E20A 4A61A 5KPZA 5BRDA 3HSCA 3ATUA 5AQKA 3HZ6A 3EN9A 4F9OA 3BF3A 3U9ZA 4BR2A 2GEMA 2D4WA 2E2NA 2IIRA 5AQFA 4QS7A 4HTLA 2ZF5O 3MCPA 1SZ2A 5E26A 4M7YA 1SAZA 3VGMA 3WQTA 5KQ8A 4PKIA 2NLXA 4L3QA 3CI5A 4A62A 4RWTA 3A5LC 2A42A 1S22A 3DWLA 4MLHA 3EKUA 4BC4A 3ULEA 5EY4A 1J6ZA 1NGGA 3ATVA 4H0OA 1QQNA 1DKGD 3WEEA 1RFQA 5AZJA 2D0PA 3U9DA 1DEJA 3KVGA 5EXWA 4BGAA 4EHTA 2P9NA 4BG9A 1E4FT 1NGAA 5BN8A 4H0XB 3M6GA 3H1QA 3UKUA 4IJAA 4B1ZA 3EZWA 4BR7A 3DJCA 2CGJA 3C7NB 3R6MA 2A40A 2V7ZA 4K41A 4QS9A 4AM7A 1GLAG 1ESVA 3WXKA 3BF1A 3WT0A 3QFUA 4BROA 1ATNA 3LDPA 4JN4A 4CZEA 1ATSA 2ASMA 5FPEA 1YXQA 3VGKA 4BQZA 1X3MA 4C23A 3H3OB 2GWKA 5BREA 3UB5A 4B1XB 5AQMA 1WOQA 4BRHA 2I7PA 3AARA 4BRDA 2P9LA 2NZTA 2UYTA 2P9IB 1U6ZA 4H0PA 4I6MA 1YAGA 1KAYA 1KXPA 2E8AA 5TKYA 5B8HA 5AZIA 2Q2RA 3HM8A 4JHDB 2Q36A 3P4IA 1MWKA 3L6QA 3O1WA 2A6AA 4FO0A 5AQXA 4H0VB 1XQSC 3VPZA 2FF3B 3R9PA 5BRHA 4H0YB 3S41A 1NM1A 4NO7A 3VENA 5BPNA 1GLLO 3U4LA 4CD1A 2P9KA 2QXLA 1HX1A 3QFPA 1MWMA 3CJAA 4FWPA 4K42A 3DXKB 3UE5A 3ZEUB 1H1VA 1RGIA 3CQYA 4H5RA 2YHWA 4B1WB 3CJBA 5AQLA 1ZXOA 4GNIA 4IWVA 3RSEA 4MO5A 4CZLA 4CZJA 1Z6RA 5AQHA 5JICA 4CJ7A 4BRGA 3CIPA 3QMLA 4M63C 2PBDA 1G99A 1MDUB 4HWIA 1GLEG 1QHAA 5BPLA 5JLHA 3O1BA 4ISFA 1S3XA 4RCHA 4FWKA 1HKGA 4DCHA 3MN6A 2Q0RA 4JHDA 2BUPA 3G25A 2D1KA 4CBXA 4DQ8A 2P9PA 3GG4A 3I8BA 1DGKN 3D2FB 1JCFA 5KPRA 4PL7A 3FR0A 1V4SA 3VGLA 1NGDA 1GLFO 3LDNA 1NGEA 1RDWX 5AQWA 4LC9B 5AR0A 3QDKA 3SMSA 2HMPA 4EHUA 1BA1A 1D4XA 5AQSA 2Q1NA 5BR9A 5AQGA 4QS8A 3GBTA 4JD2B 3EO3A 1U2VB 4FOEA 3R8EA 2V51B 3CQXA 3VEVA 1T44A 1ZC6A 3BEXA 2P9UB 3VOVA 3ZEUA 3H1VX 1BUPA 5AQVA 4BRKA 1GLJO 3WQUA 4BQLA 3ID8A 3J8AA 5BPMA 2YJEA 4E1JA 4BC2A 5EOYA 4B1VA 2E2OA 2YI1A 5ADXH 4WYBA 3TU5A 4Z94A 2ASOA 4BG8A 5LJWA 1HKCA 3CJ7A 2P9SB 3D2EB 3U8XA 4CI6A 1X3NA 5AQOA 5ADXA 1E4GT 3AAPA 2V52B 4H0TB 1NGHA 3ZETA 1NBWA 2Q0UA 1V4TA 4XH5A 5ELZA 1ATRA 3MN7A 1C0FA 2YCHA 3UKRB 1BU6O 1K8KB 5AQZA 3GE1A 3D2FA 5AQQA 2E2PA 3LDOA 4BRAA 4J8FA 3TPQA 4BRIA 2VCPA 4A2AA 4ISGA 4BRMA 2ASPA 2GTDA 4PKGA 3HTVA 3M3ZA 1JCGA 4PKHA 1C0GA 3VF6A 3FZFA 3VF4A 1Z05A 3IMXA 1U2VA 3KHYA 1GLCG 4BRLA 4H5VA 2GUPA 2ZGZA 4MO4A 4H5NA 4M7XA 4BREA 2VWBA 2QM1A 4FWQA 4BC5A 5JMVA 2BTFA 4H5TA 4JAXA 5LJVA 3F9MA 3CETA 2KHOA 3LM2A 2CH5A 4ISEA 5KQDA 4BR9A 1BO5O 2HOEA 3H46O 3MN9A 1TYQB 3A0IX 3D2EA 4JNEA 4FL9A 1WUAA 2YHYA 3QBXA 3A5MC 4FWRA 3GL1A 4FWSA 1HJOA 1EQYA 3QBWA 1QZ6A 3QICA 2Q97A 3O08A 4FWOA 3C7NA 1TUUA 2FXUA 4XEIA 3FGUA 5AQRA 2FSJA 2QWRA 3H45C 4B1UB 4BRPA 1XC3A 3O5BA 4A2BA 3LDQA 4BRNA 5AQIA 3SLCA 2HF3A 4CBWA 2QW9A 4BRQA 1HKBA 3EL2A 4IJNA 1OKJA 4BVPA 3VETA 1SQKA 4WQ4A 3JXUA 4WQ5A 5BRFA 3ZX2A 2EWSA 5AQNA 2CGKA 2P9IA 3VF2A 1QZ5A 3OHRA 2FSKA 3CJ9A 1YUWA 3B8AX 4O8KA 3VEZA 4DB3A 3WXIA 1MA9B 1XUPO 5AFUH 1QQMA 3H3NO 3WXLA 2YHXA 1NGIA 5AQUA 4WQ4C 2ITMA 4WQ5C 2HF4A 2I7NA 3IDHA 4BGBA 3BUZB 2AA4A 4Y0WA 3SMPA 2CGLA 3SJHA 1TYQA 1Y64A 5AFUA 2AP1A 4YDUA 2QWOA 2W40A 5AQTA 3VEYA 5F1XA 2E1ZA 4H5WA 2P9NB 1BA0A 3KZBA 3SK3A 3DAWA 2FLOA 3UKUB 2V7YA 2QWMA 2QWPA 1HPMA 4YDUC 3DXKA 2A5XA 2FSNA 2IVOA 4BR4A 4B1YB 3CERA 4XH1A 3FZHA 3W3DA 4GY2B 3CJCA 1NWKA 3MMVA 1GLBG 4BC3A 3GDQA 2A41A 2F9WA 3DXMB 2H3GX 4FPAA 1P8ZA 1Q18A 3A5NC 5E84A 1YVNA 3VERA 1ZBSA 3O8MA 4IZ9A 2P9LB 4EFHA 3VESA 4FWLA 3BP8A 4I6MB 2GWJA 5FPMA 1TUYA 4CZHA 5F0XA 5LY3A 1NLVA 5AZIB 3O6WA 3L4IA 1R59O 4CZMA 3LM9A 3LL3A 1BOTO 1T6CA 4CZIA 4KBOA 3A5OC 3QB0A 1LOTB 3M1FA 1HLUA 1CZAN 1GLDG 4PL8A 1NGFA 3FZKA 4JD2A 3FZMA 5FPDA 4K43A 2P9KB 2NRHA 3O80A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D7EO 2DPNA 3ISNC 4F2RA 4M3RA 3FZLA 4BRFA 2YJFA 3SBGA 2CH6A 4FWMA 4C1NK 4E7HA 3V1OA 4NLCA 1T6DA 1LV5A 4MDBA 4IEEA 3KK2A 1SL0A 5AQPA 2OPQA 1OVQA 3MDQA 4I9QA 4YOTA 5A2QO 4H4MA 1IKYA 2O8BA 3WXJA 4CF2A 1I94K 4IXCA 4DV6K 4CJKA 3K9JA 4EP5A 2JWKA 1JLGA 2OANA 1JJ2M 1DT9A 1XMOK 1LW0A 3O9QA 3CJ1A 1S1WA 4IFVA 4O5FA 2ZM6K 4TSXA 4KO0A 2QWLA 4K25A 4DTSA 1WSHA 3F2KA 3TAEA 1TKZA 3CCJN 4B8AB 4DMNA 2WUSA 3S3NA 1FW6A 3L4QA 1IH7A 3DMJA 3L0QA 4J2BA 4KV8A 4BR0A 3C94A 3ID6A 4CEEA 3NH2A 3IUCA 5JENA 4E7JA 5KRTA 3VQAA 2ZGYA 1Y97A 3OYCA 1QQCA 3ZSWA 3QEVA 1VSFA 3VEOA 3MWPA 2IVNA 3EY1A 2F7TA 3VQBA 3P5JA 2QK9A 1Q9XA 3I56N 5BN9A 1HNVA 1GOCA 1RBRA 2A3ZA 1TK5A 3ENOA 4IOCL 3MXIA 3HSCA 3ATUA 3VTHA 3K0SA 3VQQA 4NYNA 4HCCA 3SZ2A 3EN9A 2PYJA 1BQNA 4F9OA 4Z4GA 2VWKA 4BR2A 4JI0K 1W7AA 3DLRA 4YOWA 3CCMN 3CM6A 3E1YA 4W5OA 3SUPA 3K2PA 4FYDA 3LP0A 3WQTA 3IRXA 1IKXA 4FJNA 4FLUA 4PKIA 2NLXA 1VQ7N 4CCHA 4L3QA 3CI5A 4A62A 1ZYQA 3P38A 3AVKA 2A42A 1SUQA 1S22A 3DWLA 4MLHA 4O44A 1WBBA 4BC4A 3SJJA 3MEGA 3MEDA 5HLFA 1BI4B 3ATVA 1JLFA 1B9FA 3WEEA 4DTJA 5HP1A 1EP4A 3CFOA 2D0PA 3BGRA 1S1TA 1N32K 4BGAA 2IS3A 2P9NA 5KGWA 4A5AA 2D0AA 1NGAA 5BN8A 4H0XB 3M6GA 3SAHA 3J7AP 3UKUA 3CCEN 5LL6Z 4BR7A 3DJCA 3ITHA 2A40A 2V7ZA 2O4IA 4K41A 4AM7A 1GLAG 1VSKA 1U47A 3LWLA 4YOVA 2OZSA 3QFUA 3SV4A 3ZT3A 4JK7A 4CZEA 1ATSA 2ASMA 3NFAA 5FROA 4BQZA 3H3OB 1RDBA 1UA1A 1RDAA 1NK0A 2HHXA 3AARA 4DV1K 3M8PA 1CZ9A 2NZTA 2UYTA 3AO3A 4BRDA 3OYDA 4H0PA 1EWRA 1YAGA 5CYMA 5B8HA 2WBNA 5AZIA 3T1HK 1IBLK 4KB0A 2Q36A 1MWKA 2A6AA 4H0VB 1NJWA 4FCYA 3VPZA 5J1EA 2IOCA 4CK1A 2ZJRL 5BRHA 3LP3A 5CY4A 1NM1A 4FZYA 2BANA 2VGMA 5BPNA 4CERA 1S5JA 3THYB 3KIOA 2QXLA 2FBTA 2IAJA 3CJAA 4M3TA 4I2QA 4CFAA 4J2AA 3VQEA 4FJ7A 1UWBA 3CJBA 4K8ZA 4K0KK 2UXDK 1X9SA 5KGXA 4CZLA 4CZJA 4X66K 5JICA 4M63C 3MXMA 5BPLA 2W42A 3HOTA 4BWMA 3TWHA 4G9ZA 1S3XA 1VSHA 4HUFA 4DCHA 3QIOA 2Q0RA 2KQ2A 2QKKA 1OVYA 3I8BA 4LSLA 4PL7A 3CCSN 4CVNE 5CHIA 1S1XA 1VSJA 3LWMA 3G71N 3E9OA 4M3ZA 1NGEA 2VQFK 1RDWX 5DMRA 3EZ5A 3HPGA 5AQSA 4QS8A 3GBTA 3EO3A 1U2VB 4RW7A 2V51B 1VQ5N 2Z1HA 1ZC6A 3RRGA 2YV0X 4BECA 1MU2A 1BUPA 4AHTA 3KK3A 5AQVA 4Y1CA 4E1MA 4BQLA 3ID8A 3OS0A 4FJJA 3EYZA 1DLOA 5LJWA 5JS2A 5HRSA 5AQOA 4OPJA 3ZETA 2O8BB 3K57A 3K5MA 1V4TA 1TAQA 4CJQA 3SI6A 4KTWA 4BRAA 3O9RA 4E72A 2ASPA 2KFZA 5HRPA 4N41A 4ZTFA 3HM9A 4AHRA 3TI0A 1FK9A 4ILHA 3QEWA 1N6QA 2G8VA 3AVFA 4FJGA 4PKHA 3RWUA 4I7FA 4CFDA 1WB9A 4GV9A 4BRLA 4H5VA 4JKCA 4FM0A 5LMUK 3CYGA 3S5TA 4MO4A 4DKWA 2PFUA 4BREA 4FK2A 3AO5A 4JAXA 5LJVA 1D9DA 3CMEN 1BIUA 4ISEA 3JYTA 4LH5A 5KQDA 1BO5O 4BE2A 5SWMA 4KH4A 2FBYA 3H46O 4DSLA 4FL9A 4JS4A 4CEOA 2NRWA 3GL1A 4DR2K 4LF8K 3AO1A 3QBWA 4FWOA 3CCLN 1XHXA 1TUUA 3VQ7A 4XEIA 5D3GA 1JLAA 4DF4A 2UUCK 5AQRA 2FSJA 4LFCK 3SNNA 4YHHK 4B1UB 3I0RA 3OYIA 3O5BA 2QI2A 4BRNA 3QESA 3G4SN 1IO2A 4CK2A 1HKBA 2UXBK 3OJSA 1VQ4N 1SQKA 4DU1A 3TAFA 3ZX2A 4J2EA 2EWSA 3VQ8A 2KZMA 4CESA 4CEQA 4JI3K 4O8KA 3WXLA 1KCFA 3ALYA 3PSIA 3IDHA 1M90O 5J2QA 2AA4A 4Y0WA 3SMPA 4B08A 1E3MA 4OGCA 1Y64A 3OBWA 3SQ2A 4IOXA 4YDUA 2E6MA 4O8UA 1EXQA 4OKEA 2P9NB 3OYNA 1Q86O 3DAWA 4OX9K 3UKUB 4CJSA 4PQUA 1NKCA 1Q81O 2QWMA 1QTMA 2HBLA 4FLWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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