4KTZA

Lactococcus phage 67 ruvc
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
MKKILAINFSTASKKGEGTGYAFRKDGQVYVGSIKAYNPKKTAWERTFDIVNAIKDIIDEFDLKGYHLAIETPIMGRNRKHSITLANCNGYFIGAIDGLVNGYTFIDNSKWCSYHLISGKREQRKEESLELLKATGLVDSNCKDDNIADAYNILTYCEHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutants of phage bIL67 RuvC with enhanced Holliday junction binding selectivity and resolution symmetry.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Lactococcus phage bil67
molecule keywords RuvC endonuclease
total genus 57
structure length 160
sequence length 160
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07066 DUF3882 Lactococcus phage M3 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4ktzA00
4CEAA 4CJRA 4KHWA 5HRRA 3CQ8A 3DLBA 1TAQA 1UOCA 3L3VA 5FROA 1JLCA 1X9SA 3KLIA 3L8BA 3CFPA 3MEGA 5J2MA 5J1EA 1XI1A 1U48A 4HCBA 4N41A 2QKBA 1QE1A 3QLHA 4KPYA 1CXUA 4E7HA 2P51A 4M41A 4CHNA 3M8QA 4BDYA 2G8HA 4M3WA 1VSKA 2YHBA 3AO3A 4KHNA 3HSTB 1VSIA 1RILA 4CF8A 1S1TA 2KW4A 4CK1A 3NH2A 5C24A 2RKIA 4F3OA 2OA8A 2D0BA 1TKDA 1BIZA 1EKEA 2X6NA 5SZTA 1W0HA 4ZHRA 4E7JA 1NK9A 4ELVA 4C8OA 4IG3A 2XRIA 1DLOA 4Y1CA 1S9EA 4C8NA 3S3OA 4ZTJA 4CCHA 3SNNA 3C95A 4CFBA 1HYSA 1J54A 3DM2A 3DLGA 3KKRA 1NK4A 4FJKA 2HHQA 1D9DA 3OYIA 3CFRA 3HXMA 2Q3SA 1GOBA 4QCLA 1RDBA 1EXQA 3KJVA 1NKCA 4CK2A 3CFOA 1J9AA 3TI0A 3ZSXA 3V1RA 1BIUA 4DQSA 1SKSA 1BHLA 4HHTA 1F21A 3HPHA 3BDPA 2YNFA 2VG6A 4YFUA 4F8RA 2HMIA 1XHXA 3AVNA 2ZE2A 3T3FA 1KLMA 1QTMA 1JXEA 2YKMA 1SUQA 3KLGA 4KTWA 3PX4A 3PY8A 4BACA 4OLBA 3RTVA 3UIQA 3QEVA 3CM5A 3OS0A 3QEXA 3S9HA 4FLYA 3RR7A 4CJTA 5HLFA 2IGIA 2HVIA 1RT4A 1EX4A 2I5JA 3ZSVA 4LD0A 3RMBA 1VSDA 2PYLA 3QESA 4J2BA 3L3UA 3JYTA 4PQUA 3VA0A 3OYEA 3PX6A 1JLFA 2HNYA 4ID5A 3ZT1A 3CYMA 2G8IA 4W5RA 4KHQA 3VQAA 5C42A 1UAXA 3VQQA 4DFPA 2P5GA 3LAKA 5DK5A 4C8MA 1QSYA 1JLEA 3ASMA 4AH9A 4CECA 3NH0A 1QQCA 2OPPA 3AV9A 4WE1A 1JLGA 3MAQA 2HNDA 4HUEA 2DY4A 1IH7A 2KZMA 4W5OA 1HYZA 3NF6A 3IAYA 2Z1HA 1KFDA 3NFAA 5J2QA 2HHUA 2YV0X 4CGFA 1WN7A 3OYAA 3C6UA 3SV3A 5FRNA 4E1NA 4FK0A 1C0MA 3VQ9A 2A1SA 4DWIA 4FK2A 2B4JA 1GOAA 3HVTA 3D0PA 4Q5VA 1L3SA 2QKKA 1FKOA 4N56A 4BE0A 3SUQA 3O3GA 3I8DA 2F8TA 2IS3A 4NCAA 4CJKA 2E6MA 3A2FA 4CJEA 3LP2A 3IS9A 1FXXA 3MEDA 4DSEA 2YNGA 1HQEA 4NCBA 3WNHA 4FJMA 1RT3A 1BQNA 3O3HA 4DS4A 4Z4EA 2KFZA 1HYVA 4ICLA 3ITHA 3KLHA 3NF9A 3K2PA 3ULDA 4DS5A 3QEPA 4PA1A 3ZSQA 2FC0A 4Y1DA 1QHTA 3U3YA 5FDLA 3HPOA 3QNNA 1K6YA 4B9TA 1RDAA 4TSXA 1TKXA 4AILC 3AVIA 4RW6A 1NOZA 1A5XA 2A1RA 4OPKA 1U4BA 3RMCA 3U6FA 4Z4IA 1YTUA 4FJ9A 4M42A 4FLZA 3V9ZA 4CFAA 3SQ4A 4CGGA 1TV6A 3H08A 1CXQA 1QS4A 2FBTA 3T19A 3SZ2A 4N5SA 3K5LA 3K5NA 1IG9A 1S1WA 1UA1A 4OVLA 2HHVA 3SUNA 1IKVA 3B6PA 4DF8A 2BANA 3KTQA 1B92A 1RT5A 1KSPA 1EP4A 1WSGA 4J2EA 4M3YA 1LV5A 5HBMA 2G8KA 4G1QA 4DTJA 1A5WA 3O3FA 2BE2A 3TWHA 4MFBA 3OYLA 5HROA 1RBVA 1SKWA 4O44A 3OYHA 3SCXA 1NKEA 1IKXA 1UA0A 3ZT3A 4CHZA 1LW0A 4E89A 4DU4A 4IDKA 5T7BA 3NE6A 4C8LA 4OLAA 1JLBA 3AVHA 3TARA 4LY7A 2PZSA 3BGRA 1QSSA 3RWUA 3L2QA 4B3OA 4LH5A 3TABA 5HRNA 3ZSWA 2B5JA 4HTUA 3LP3A 1J5OA 2OPQA 3MEEA 3OYCA 3QIOA 2XY5A 3SV4A 1ZBFA 3ZSRA 4KB1A 2QXFA 2KFNA 3O4NA 2RPIA 4CHPA 2RF2A 3K5MA 4FM0A 5HP1A 3P1GA 4C8KA 1RT7A 4FJ7A 1ASVA 2JLEA 2GBZA 1BQMA 1Z25A 2DFHA 2P5OA 4Z4GA 5KGXA 4ELUA 1WAFA 3F9KA 3P5JA 2Z1GA 1CLQA 4Z4HA 4B9UA 4O4GA 5JS2A 3QIPA 3SI6A 4OKKA 1ZBLA 4HUFA 2VG5A 4RG8A 3NHGA 1TK5A 1W9HA 1A5VA 5CYQA 1KLNA 3QNOA 2HHSA 4DTOA 1BCOA 3DOLA 4JRQA 1RNHA 3V1OA 2VWKA 2YNHA 1XHZA 2HW3A 1KFSA 4BDZA 1YVUA 1ZBHA 4FM1A 4QOZB 3U3GA 1TK0A 4DU3A 1YTAA 3NH1A 2GUIA 3OY9A 3QERA 4IFYA 4CIGA 1JXBA 3AVGA 4CF9A 3V9XA 1T03A 2ITGA 4NCGA 4QAGA 4DFMA 4E0DA 4N47A 3TAMA 5CZ1A 1RTDA 3NDKA 3HP9A 2E6LA 1ZBUA 4OGEA 3KK3A 3TAQA 1FKPA 5FRMA 2XY8A 1FK9A 4DF4A 2G8WA 4CERA 3OYKA 4KTQA 4KO0A 2YNIA 4CEDA 2X6SA 4CJ3A 1NK6A 4J2AA 1HQUA 4I7FA 4CEBA 3JSMA 3TANA 1JLQA 3AO4A 3HVRA 4FZZA 1S6QA 4ZTFA 4LH4A 1C1CA 3G10A 4H8KA 4CJ4A 3O4QA 4DLGA 4FJIA 1VK0A 3DOKA 4XIUA 1TL1A 3ZSZA 1ZYQA 3VQDA 2W42A 2G8FA 4I9LA 3LP0A 4CEOA 4GMJB 1T8EA 3SQ0A 1KVAA 3LWMA 4B8CA 3AO5A 2X78A 4DSLA 2B6AA 1VSLA 3HPGA 4AHTA 3EY1A 4F2SA 1YT3A 2D5RA 3VA3A 4DTUA 2BDPA 4Z4CA 3HO1A 4OKEA 1NOYA 3ZSYA 1BI4B 4IFVA 3VQ8A 2E4LA 3EZ5A 4I9QA 3MECA 4DMNA 4GVMA 1X1PA 3AVBA 3AVKA 1ITGA 1VSMA 3DRPA 4OPJA 3OYFA 1S1VA 4FVMA 4RW4A 3OYDA 3K58A 4EZ9A 3ZSOA 4KB0A 4K8XA 1LW2A 4OKJA 1X9MA 3HT3A 1ZBIA 4BWJA 1LWCA 4KFBA 3HM9A 1LAWA 3F73A 1O1WA 4DSIA 4BDPA 4JS4A 3AO2A 2EX3A 4OGCA 3LZIA 2G8VA 4FJNA 1RBTA 1TVRA 4F3TA 1DTQA 2QK9A 3KIOA 3NCIA 2WONA 2P1JA 4W5TA 1RTJA 4E3SA 3KD1E 1BL3A 3K59A 4R5PA 2PYJA 3SUPA 3K5OA 4DSJA 4CJLA 4ELTA 4DLEA 3AVCA 3VQCA 4CHYA 3WNFA 3RMAA 1S9GA 1RBRA 2F96A 2G8UA 4B9NA 2EHGA 1KVBA 4NYFA 4PWDA 4DFJA 3TAEA 4M3RA 3M8RA 3AA5X 3NBPA 1NK0A 4DTMA 3OS1A 2VG7A 1U49A 1HMVA 3PO4A 1KVCA 1TGOA 2DFFA 4DTRA 4FJ8A 4FLTA 5C25A 4CHOA 4DU1A 3ZT0A 3OYBA 3SYZA 2R7YA 1NK8A 4FCYA 1U47A 1BGXT 3OYGA 4DFKA 3VQ4A 4CGIA 1C1AA 4FLWA 1NJWA 3RR8A 4E1MA 4FK4A 1HJRA 1IKWA 2HB5A 2BGGA 4CGDA 4FJJA 4BWMA 3V9WA 4PUOA 3CM6A 4AHSA 4FYDA 4OJRA 3OYMA 4FZYA 1T7PA 3RMDA 4M3TA 1N5YA 2Y1JA 1WSHA 4LSLA 2IC3A 4CJSA 4M3UA 3MXJA 2Y1IA 1VRUA 1TK8A 3LAMA 4NYNA 4J2DA 1JLAA 4BE2A 1RT2A 1Z26A 4CESA 3AA2A 3HYFA 4CF2A 3K57A 4FLUA 1HNVA 1EETA 3AA4A 1HPZA 3AVJA 1RTHA 4KKOA 1SV5A 4KV8A 3LPUA 3OS2A 2LSNA 3V9UA 4B8AB 4DQQA 1WLJA 4KI6A 2O4GA 2HHTA 2YKNA 3LPTA 3ZT4A 4O5BA 1TKZA 3C94A 3LANA 3PX0A 1SL0A 3HK2A 3SUOA 4KAZA 1KRPA 3VQBA 2IDOA 2X74A 5KGWA 2Z1IA 2JGUA 4PY5A 2HVHA 2HHXA 5K14A 1VSHA 4CEQA 2D0CA 3IRXA 4E19A 5KI6A 3TAGA 3SJJA 1LAVA 4Z4FA 1WSFA 3OVNA 1JL2A 3LDSA 3HJFA 1JL1A 4H4OA 4EP4A 3WNEA 1R0AA 4O0JA 3AVFA 3AA3A 1I3AA 1C0UA 3VQ6A 5HRSA 4FXDA 1NJZA 5J2NA 3QEIA 3VQEA 3L2RA 4FW1A 3EYZA 3TAPA 2OPRA 1C1BA 1VSJA 4E7LA 1C0TA 4RW7A 2KTQA 1RBSA 4AHCA 4HUGA 4RW8A 4MQ3A 1NJYA 3LP1A 3VQ5A 1NK5A 1L3VA 3S3MA 2O4IA 4KHUA 1WSJA 1VSFA 4KREA 4FZXC 4CK3A 4FJ5A 4IBNA 3HL8A 1S6PA 3DLHA 4FM2A 2OYQA 4B08A 1WAJA 4B9VA 4FJXA 1S1XA 1XC9A 1S5JA 4GW6A 2XY7A 2DTUA 4K8ZA 1KCFA 4HCCA 1N6QA 3PUFA 2ZQBA 5E41A 3ZT2A 1SL1A 1J53A 1REVA 2HNZA 3G0ZA 3V6DA 3NF7A 4F4KA 2RN2A 3I0SA 3WNGA 4AHRA 1Q9YA 1RBUA 3THVA 3DRRA 1JKHA 4DQIA 3MXIA 4B9MA 3OJSA 1T05A 4CJQA 1NJXA 3AVLA 4JS5A 4E7KA 4Z0UA 4W5NA 4CFDA 4KHYA 4CEZA 3S3NA 3KKSA 4FLXA 4E7IA 3P83D 4EP5A 3SQ2A 4FJHA 1S1UA 1TAUA 3DLKA 2VWJA 1KTQA 2WOMA 1IO2A 4CJPA 1TKTA 5CZ2A 5I42A 1D8YA 3ALYA 4M3ZA 4O55A 3NAEA 3L2VA 4KHSA 3M8SA 3QEWA 3SPZA 1QSLA 1SKRA 4FJGA 3VQ7A 5DMRA 3KLFA 1BISA 3AVMA 4CJUA 1B9DA 3VN5A 3PV8A 2IOCA 1MU2A 3I0RA 1VRTA 3AVAA 3B6OA 1G15A 1IKYA 1TL3A 1C6VA 2OPSA 4AHUA 3MXMA 1RT6A 5CYMA 5J2PA 1RDCA 4M3XA 4CF1A 1Q8IA 5KTQA 3L2UA 3DYAA 1BI4A 4CFCA 3LZJA 3DRSA 4DSFA 2FBXA 1RDDA 2KZZA 3NGYA 3E01A 3TAFA 4L8RB 2ZD1A 3V4IA 2PY5A 1VSEA 2ETJA 5EU7A 4FJLA 4DTXA 2FBVA 5CY4A 2D0AA 4HVJA 1UWBA 4FLVA 3OJUA 5D3GA 1HRHA 3RRGA 4CHQA 4DSKA 4KI4A 3V81A 1L3UA 4DTNA 2GV9A 2Z1JA 4UQGA 3SPYA 3PO5A 1RT1A 3L2WA 1GOCA 3ZCMA 1RTIA 1HNIA 1I39A 4CJ5A 4W5QA 4KRFA 3D45A 3FFIA 3IG1A 1XWLA 1WSIA 5KRSA 4DQRA 2DFEA 1D9FA 4BE1A 1WSEA 4I2QA 1D5AA 4LSNA 1L5UA 4N76A 5I3UA 4CIEA 5HRPA 2OZSA 3DLEA 3QETA 4KTZA 3V1QA 4I2PA 1ASUA 3VQPA 4CIFA 5JS1A 3DLRA 4CJFA 2KQ2A 4YNQA 4JLHA 1CZBA 1DTTA 1U04A 1WNSA 4DQPA 3QO9A 5SWMA 3QINA 3SQ1A 3NGIA 1RCHA 3NGZA 3C6TA 1BCMA 4B9SA 1LWFA 4DG1A 1B9FA 4CJWA 1U45A 2AJQA 1ASWA 4M45A 2ATQA 5KRTA 4JRPA 3RRHA 3KK1A 2F8SA 3OYJA 1NKBA 4Q0BA 1CZ9A 1Y97A 3ISNC 1NK7A 3M8PA 4O0IA 1Q9XA 4IG0A 1SL2A 2FBYA 3NF8A 3KK2A 4CJVA 4CEEA 4CE9A 3KD5E 4ID1A 4EZ6A 3CG7A 2IAJA 2YHAA 3OYNA 4F2RA 3TR8A 4FW2A 2NUBA 4CF0A 1LWEA 4RW9A 4CEFA 2XO7A 3HP6A 4B9LA 4CGJA 4DTSA 3LALA 3DI6A 3LWLA 1X9WA 3T1AA 3KLEA 2XY6A 2HHWA 4H4MA 4CGHA 4DTPA 2OZMA 3DMJA 2XHBA 4IKFA 3V9SA 1L3TA 4AHVA 3AO1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CEAA 5HRRA 1JLCA 3LDNA 1YF5L 5J2MA 5ELZA 5GINA 5IWAK 1E4FT 4HCBA 4N41A 2O8BA 4BR5A 4M41A 1NGFA 1SAZA 2YHBA 4E1JA 5IT9O 2HF4A 3SAFA 3THWB 1RDUA 4F3OA 1TKDA 2ZJPL 1IG8A 1W0HA 1DLOA 2Q36A 5HOOA 1V4SA 4WQ4C 4CFBA 4FJKA 3VGKA 2QWMA 3BP8A 4BGAA 3OYIA 3CFRA 1HNWK 2Q3SA 1GOBA 1U2VA 1NKCA 1TYQA 3O8MA 4CK2A 3CFOA 1SKSA 3SAGA 1HR0K 1BIUA 3SBGA 3CC4N 5JICA 4K0KK 4C23A 3CM5A 4BRPA 3QEXA 3E66A 5BRFA 2IGIA 2I5JA 1VSDA 3QESA 1RGIA 5BR8K 3PX6A 3ZT1A 4BRMA 2PAVA 1NMDA 4BC5A 4KHQA 5C42A 5M1PA 1D4XA 1QSYA 3CXCM 3T69A 1QQCA 3E9LA 2E8AA 2NRVA 2CH5A 2WBNA 4BC4A 4W5OA 2HHUA 4X66K 3OYAA 4EIAA 1C0MA 1XMQK 2B4JA 3D0PA 1L3SA 2QKKA 1BO5O 1IBMK 2F8TA 1T3VA 4NCAA 2IVNA 3LP2A 2YNGA 3WNHA 1QZ6A 1RT3A 2O8EA 5ADXA 3IUCA 5DM7L 3O3HA 4DS5A 3K2PA 1VQ9N 3ZSQA 3CJ7A 4B1ZA 1K6YA 3THXA 4LF7K 3TTFA 3A5NC 4RW6A 1NOZA 3ZETA 3RMCA 4JKEA 1YTUA 4FJ9A 3ZEUA 3S41A 3SQ4A 3T19A 4B1WB 3K5NA 1Z05A 1IG9A 3J7AP 4CZJA 3SUNA 3B6PA 3QBXA 4CD3A 4DF8A 4Z94A 1RT5A 1NWKA 2FF3B 4RCHA 1NGIA 1HLUA 4CZIA 4IEIA 3CQYA 4OPAA 2BE2A 5M1NA 3TWHA 1FW6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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