3H1VX

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 172
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
172
sequence length
446
structure length
446
Chain Sequence
MVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glucokinase
publication title The design and optimization of a series of 2-(pyridin-2-yl)-1H-benzimidazole compounds as allosteric glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 172
structure length 446
sequence length 446
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h1vX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3h1vX01
1NMDA 2V52B 3ZX2A 1ESVA 4MLHA 2D0PA 4IWVA 4A2AA 3D7EO 3MN5A 5AFUA 3D2FB 3EKSA 3CJ9A 5AQWA 3D2EA 2YJEA 2ZGZA 3H1QA 4BRNA 3SMPA 2NLXA 4BROA 1R59O 1HX1A 1YXQA 1MA9B 2HF3A 2KHOA 1T6DA 5AFUH 3WXIA 4ISFA 1BU6O 4LC9B 5ELZA 3M6GA 3CJCA 5JMVA 2FF6A 2AA4A 1GLLO 5AQKA 4BRKA 1HKCA 3CJAA 1IG8A 1Z05A 1NGBA 5KPTA 5LJVA 3QDKA 4O8KA 4BR4A 4E1JA 2E88A 1HKBA 1NGIA 1X9JA 3U4LA 4MLEA 3EZWA 4WYBA 3CETA 3U8XA 3SK3A 1J6ZA 2P9IB 5AQQA 1YUWA 4JN4A 1XUPO 1S3XA 2DPNA 4H0VB 2P9KA 3ATVA 1TUYA 1RFQA 3IUCA 4IO8A 1Z6RA 3U9DA 2IIRA 4BRAA 5JLFA 2W41A 4EHUA 3L6QA 3BF3A 3GL1A 4NB4A 3CHWA 4CJ7A 1MDUB 5AQIA 3ULEA 1QHAA 4WQ5A 5AQXA 3QICA 3F9MA 3FGUA 4RWTA 4BR9A 4MO4A 3DXKA 4H0PA 3BEXA 2ASPA 4BG9A 4DCHA 2IVOA 3LM9A 2Q0RA 3VGKA 3EL2A 1E4GT 5TKYA 3MMVA 3VEWA 4DQ8A 2YHYA 5E26A 4CBUA 4KBOA 5EVZA 4JHDA 3MK6A 4H5NA 1GLCG 1SAZA 4QS8A 4YDUC 4RTFD 3D2FA 4BR7A 3VPZA 3CI5A 2FLOA 2QWRA 3FZHA 4BGBA 2EWSA 2V51B 4FPBA 1JCEA 1KXPA 1WUAA 1BA0A 2FSJA 2VWBA 3BUZB 3VERA 4QS7A 3WQUA 1K8KA 4BGAA 2HMPA 4BR2A 2QWPA 4B1XB 2YCHA 4CZMA 1BO5O 5AZJA 5BRFA 2P9KB 1DKGD 3QFUA 4FWKA 4BRFA 2I7NA 3HZ6A 3SJHA 3DXMA 3UKUA 1C0GA 3FZMA 2GUPA 3J8AA 2WUSA 3CQXA 2CGJA 4BRCA 3QB0A 4XH5A 3ULEB 1SZ2A 3BF1A 5KPRA 4HWIA 5AZIA 1BOTO 3DXKB 2CGLA 4H5WA 2QWQA 5LJWA 1G99A 3WXJA 2NRHA 3FLCO 3LDQA 5AQFA 3VOVA 3H46O 3VESA 3FZFA 1QZ5A 1T6CA 5KQ8A 2D4WA 4EHTA 4H5RA 4BC3A 3C0BA 5AQYA 4H0XB 3O6WA 4JHDB 4M7YA 3U9ZA 4BVOA 3SMSA 4CZLA 1QQOA 3GOIA 4K41A 4H0TB 2QXLA 3FR0A 1RGIA 1YAGA 3MDQA 3QMLA 4F9OA 2GWKA 2PBDA 3O1BA 4RCHA 3H6EA 1ATRA 1ZC6A 2P9PA 3GG4A 1NM1A 3HBTA 4H5TA 1E4FT 1BWFO 4IJAA 1K8KB 1GLEG 4BREA 1NGHA 5BREA 2V7ZA 3ID8A 2YHWA 4B1YB 3O4WA 4BQLA 5AZJB 3LDNA 4QS9A 5BRDA 4B1ZA 4FWOA 3DXMB 1NGCA 3UKUB 3VEZA 1GLAG 3FZLA 2QM1A 4WQ5C 1QQMA 3A0IX 3FE1A 3GBTA 3L0QA 1KAZA 2FSNA 3JS6A 2QW9A 3EO3A 2A40A 4WQ4A 1NLVA 5AZIB 4FWPA 2FF3B 4CZFA 5CE3A 2A41A 4BC2A 2E8AA 3O5BA 3A5LC 1DGKN 2GTDA 5AQNA 4AM7A 4FSVA 3TU5A 4FWQA 3ZX0A 1Y64A 3KZBA 3HI0A 4BRHA 5KPZA 1KAYA 3IMXA 5EX5A 1NWKA 2H3GX 4M63C 3L4IA 4A2BA 3FFKB 1X3MA 2QWOA 4GNIA 4L3QA 2P9PB 4BVPA 4JAXA 3DWLA 5EXWA 1JCFA 3VF2A 3B8AX 1NGGA 3WXKA 4CZEA 3DAWA 2P9SA 3ENOA 2OANA 4HTLA 4PL8A 2QWLA 1NBWA 4A61A 3ZETA 5ADXA 5AQGA 1V4TA 5I9EB 1RDWX 1BDGA 2VYPA 2E2OA 2A6AA 3VEYA 4BQZA 5ADXH 3CQYA 3CJ1A 3O08A 5AQUA 2YHXA 1QQNA 1QZ6A 3LL3A 4EFHA 1WOQA 4FOEA 5KQDA 4M7XA 2E2NA 4AM6A 5BPLA 3H3OB 2Q1NA 5AQZA 2F9TA 1HJOA 4JD2A 5LY3A 5EY4A 4FPAA 2Q2RA 1Q18A 1LOTB 4IXCA 2HOEA 2E20A 2F9WA 3O80A 4PKIA 5AQVA 3S41A 3P4IA 4EIAA 1S22A 4FWRA 1U6ZA 4FOIA 4DB3A 4H5VA 1XC3A 4XH1A 3LDOA 4B1WB 1HUXA 4GY2B 4XH4A 3DJCA 4A62A 3QFPA 1NGEA 3M3ZA 4BR5A 4FWNA 4H03B 1H1VA 3KVGA 3A5NC 5BPNA 3CERA 2FSKA 3GDQA 2Q36A 2E2QA 3ZEUA 1HLUA 4MO5A 2P9SB 2GEMA 2ZWHA 3VEVA 1LCUA 1SQKA 3ZETB 3JXUA 2YJFA 1GLJO 2P9NB 5BN9A 3HM8A 1ZXOA 2P9UA 4K25A 5AQHA 4WQ4C 5AQTA 2I7PA 2ZF5O 3AARA 3W3DA 4BRMA 1MWKA 1ZBSA 5BR9A 1XQSC 3HSCA 4FO0A 5AQRA 3TPQA 5AQOA 2AP1A 3UKRA 1YVNA 4CBXA 4BC4A 2ASOA 1ATNA 2YI1A 4PL7A 4JD2B 3ENHA 4H0YB 2QWMA 1X3NA 4FWLA 4H0OA 1OKJA 3LDLA 5AQMA 3VF6A 1GLBG 2BTFA 3ZX3A 4FL9A 4CZJA 3LM2A 4XEIA 2IVPA 5E84A 5B8HA 1TYQA 4IZ9A 5AQPA 4PKGA 3CJBA 5F1XA 2A5XA 3IFRA 3H1VX 4BRQA 2E1YA 2VCPA 3MN7A 2PAVA 3O1WA 3ZEUB 5FPNA 3WT0A 1V4SA 1NGJA 5BRHA 3VEOA 4BRLA 3UB5A 2P9UB 3EN9A 3MN9A 3A5OC 2Q31A 3AAQA 4I6MA 4B1VA 3CJ7A 5AQJA 1EQYA 1CZAN 3VEXA 4CZKA 2A42A 2QWNA 4O5FA 1C0FA 1KAXA 3AY9A 2V7YA 3VGMA 3RSEB 2P9LA 3LDPA 1HPMA 4BC5A 1GLDG 4CI6A 2J4RA 1BG3A 3UKRB 4BRPA 2E1ZA 2ZGYA 5AR0A 2Q0UA 4CD3A 3H3NO 1P8ZA 4IJNA 4JNEA 4BR0A 4CZIA 2Q97A 4Y0WA 5AQLA 3VF4A 4DHYA 3M1FA 3R9PA 1D4XA 3C7NA 4BRDA 2P9NA 4CD1A 2E2PA 4PKHA 3D2EB 1TUUA 1U2VA 2GWJA 3W0LA 3AAPA 4C23A 1NGDA 3WEEA 3MN6A 3GE1A 3H45C 2ITMA 5BPMA 1TYQB 2UYTA 5FPDA 2W40A 5EOYA 3QBWA 4K43A 2GELA 4BRIA 4FWSA 3UE5A 1IJJA 3R6MA 2HF4A 1BA1A 1BUPA 1NGAA 3VETA 3A5MC 3QBXA 5BN8A 1GLFO 2A3ZA 3CIPA 1ATSA 4I6MB 3KHYA 4BG8A 4BRGA 5AQSA 4ISEA 4CZGA 3G25A 3I8BA 2D0OA 4FWMA 4J8FA 5F0XA 2P9LB 3WQTA 2FXUA 3BP8A 4B9QA 4ISGA 4K42A 4CZHA 2CGKA 3MCPA 3EKUA 2CH5A 4CBWA 2IVNA 5JLHA 3C7NB 3VGLA 3HTVA 5FPEA 2D1KA 3SLCA 3R8EA 3IDHA 1JCGA 5JICA 2CH6A 4NO7A 1U2VB 4YDUA 5F2RA 5FPMA 4Z94A 3O8MA 3WXLA 1DEJA 3ATUA 3WEEB 3A8YA 2BUPA 3RSEA 3WUHA 3OHRA 4B1UB 3VENA 2P9IA 4EAHD 3FZKA 1T44A 2ASMA 3I33A 1NGFA 1HKGA 1MWMA 2NZTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2V52B 3ZX2A 4FM0A 3WNFA 4A2AA 5H1SQ 4DLGA 3CJ9A 3D2EA 3ENBA 4DWIA 3H1QA 4M3UA 2KZZA 4KHSA 5GINA 2IOCA 3SMPA 4CF0A 3WNEA 4DUYK 1HX1A 4ISFA 2QKKA 1BU6O 3MWTA 4DSIA 4YOUA 3BZCA 3CJCA 3PX6A 3V1OA 4DTSA 2AA4A 3QEVA 1HKCA 3NMUA 3CJAA 3TSQA 3HOSA 3MEEA 1IG8A 2Y1IA 4IG0A 3PV8A 4I2PA 4E7LA 4BY9C 5LMNK 3N4PA 4CK1A 4MLEA 4CEBA 1NKEA 3AA2A 1X9SA 3LWLA 1VQMN 5E41A 1J6ZA 3V9SA 2P9IB 5AQQA 4JN4A 3ZT4A 4H0VB 3S3OA 1RDAA 1TUYA 1RFQA 3KKRA 4BRAA 5JLFA 3ZT1A 2KLAA 3BF3A 4X62K 4NB4A 1VSKA 4IDHA 2ZJRL 3ULEA 3DMJA 4QCLA 3F9MA 3NAEA 1S72N 3DXKA 3OTOK 1A5WA 1Q7YO 1BCMA 4H0PA 2ASPA 3O9SA 3LM9A 2XO7A 4JRQA 2HHVA 3CCRN 3NE6A 4B9SA 3VEWA 4DQ8A 5E26A 4F4KA 1T05A 4KHQA 5EVZA 3RRGA 4JHDA 3OS0A 2OTLN 1SKRA 4YDUC 4RTFD 1X9WA 4BACA 4Q5VA 3S3MA 1X9MA 2V51B 1JCEA 3KD5E 1N34K 4OLBA 3WQUA 2HMPA 2HW3A 2YCHA 1Q86O 4K8ZA 2E5LK 4CZMA 5AZJA 3EEQA 3TWHA 3KTQA 3DLKA 3SJHA 4GKJK 3TANA 1D8YA 2ZJQL 4X64K 2GX9A 2WUSA 2CGJA 1QSSA 1WBBA 4ELUA 5AZIA 4NYFA 5LJWA 3RMDA 2NRHA 5TKWA 4B9LA 1QZ5A 4DTMA 4KHPK 4EHTA 4X65K 4M7YA 4BVOA 3MECA 5IT9O 1QQOA 3QIOA 4CGJA 3SAGA 4F9OA 3VQ8A 4E7JA 3PY8A 1JL2A 3RWUA 3ISNC 4IJAA 4JI1K 1NGHA 3DLRA 4OPKA 3K5LA 1L3TA 1LV5A 2V7ZA 3O4WA 3HVRA 1JKHA 3LDNA 4QS9A 2KW4A 5BRDA 3AO5A 3UIQA 4FJLA 4KHNA 1GLAG 1REVA 1BI4A 5HBMA 3A0IX 4CIFA 4YORA 4WQ4A 4B9TA 1J5OA 3E01A 3CCMN 4E7KA 3KK3A 4JI6K 4PY5A 3SUNA 5C2FA 4AF1A 3CFRA 3C6UA 2VGMA 1KSPA 5KGWA 1DGKN 3QERA 3AVJA 4CJSA 4TSXA 4DU1A 1M90O 2QTDA 3TU5A 3AVHA 4J2DA 3LANA 4CF9A 1Y97A 3D0PA 4BRHA 5KPZA 3IMXA 3ULDA 2W6LA 2QK9A 1NWKA 2H3GX 4FXDA 3RR7A 2OPRA 2QA4N 4FJKA 5FDLA 3FFKB 2QWOA 3OYHA 2O4IA 3LZIA 1U48A 1RT1A 4JYAK 2WONA 3EE8A 3AVLA 2EX3A 2RE2A 4FJGA 2O8CB 3DAWA 4HTLA 3ENOA 2OANA 3HRGA 2FBXA 4LFAK 1GOCA 3L3UA 4BQZA 4GV3A 1NJWA 1WNSA 1XMQK 4DFJA 3O08A 4EP5A 4PQUA 1RTIA 2KZMA 4KAZA 3L4QA 3LL3A 1WOQA 4EFHA 5KQDA 5A2QO 2E2NA 4AM6A 1RCHA 4E19A 2Q1NA 4RG8A 2WTUA 1J54A 4E89A 4CHNA 5LY3A 1Q8IA 4DQSA 3THYA 3F5TA 2UUBK 3VQ9A 1C6VA 4X66K 1U6ZA 3I0RA 3KK7A 1XC3A 4XH1A 5M1OA 2VGNA 4A62A 3QFPA 1NGEA 3HJFA 5CR4A 1N33K 2HHTA 4FLTA 1JLCA 3A5NC 2Y1JA 4K8XA 4OVLA 1X1PA 1ZBLA 4O44A 1SQKA 2YJFA 1ZXOA 2P9UA 3PO5A 1SV5A 2ZF5O 4IDKA 3NF6A 1RDDA 3TARA 1ILYA 4JKFA 2YX6A 5BR9A 2FBTA 1A5XA 4M3TA 3UKRA 4CBXA 3OYNA 2ASOA 1ATNA 3C6TA 4PL7A 3DYAA 4JD2B 1G15A 5HRSA 4FWLA 4CEEA 4B8CA 1IKVA 1OKJA 4JKBA 4PA1A 1KD1O 3KIOA 4M3RA 3ZX3A 3LM2A 2O8FB 2Z1HA 3TAQA 3C95A 4A5BA 4AHCA 3MEGA 5CZ2A 3CCLN 2HBMA 3C65A 4CJKA 4PKGA 3PX4A 4KI6A 5F1XA 2A5XA 3H1VX 2E6LA 1NOZA 2VCPA 3MN7A 3O1WA 1WSJA 2RF2A 3AVMA 4YOTA 3ZEUB 2BDPA 1RTJA 4GKKK 4JV5K 3AVCA 4N41A 1VQ9N 3UB5A 3EN9A 3ZSOA 1KLMA 3J80O 5AQJA 3VEXA 3SPYA 4CGGA 4FJ8A 1C0FA 4CHQA 4FLVA 4CI6A 3J7YP 2J4RA 3DM2A 3ZCMA 3V9UA 4EZ6A 4FJMA 4IJNA 5C10A 1BCOA 4BR0A 4CZIA 2Q97A 4UY8O 4FCYA 3MXJA 1ASWA 3BZKA 1LWFA 3K59A 3DI6A 1D9DA 2O8DA 4CW7B 4PKHA 1FW6A 3D2EB 1UA1A 3W0LA 2YHAA 1A5VA 4LF7K 4KHWA 1J5EK 4DSFA 3GE1A 1VQ4N 1HYSA 4IFVA 3ZT0A 2UYTA 1DT9A 2XHBA 4B9VA 4L8RB 3O9QA 4LH4A 3UE5A 4JI8K 1XHXA 3NF7A 3OJSA 3V1RA 1BA1A 4GV9A 2B4JA 3VETA 3LDSA 4CIGA 2HHHK 5BN8A 4YNQA 4CFAA 1C1BA 1GLFO 4H4MA 1ATSA 1YVUA 4BRGA 5AQSA 4ISEA 2HHQA 4CJVA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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