3H1VX

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 172
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
172
sequence length
446
structure length
446
Chain Sequence
MVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
publication title The design and optimization of a series of 2-(pyridin-2-yl)-1H-benzimidazole compounds as allosteric glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 172
structure length 446
sequence length 446
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h1vX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3h1vX01
2I7PA 1NGBA 5AQKA 3QFUA 4IZ9A 4PKGA 5EXWA 5AQXA 3ATVA 1KAXA 4DB3A 4BC2A 3MN7A 5AQSA 5BPMA 2W40A 3LM2A 4M7YA 1YVNA 4DQ8A 4CZHA 4EIAA 3QFPA 5EY4A 4EHUA 5AR0A 4H0PA 3HZ6A 4H5TA 4CBUA 4CZMA 2YJFA 2A5XA 2P9UB 2P9KA 2HOEA 3F9MA 4WQ4A 4H0TB 5KPZA 5LJWA 4LC9B 5AQJA 1Y64A 1ATNA 3RSEA 3AARA 4EFHA 1NMDA 1V4SA 4JD2A 4IJAA 1NGFA 4WQ5A 2F9WA 4FWNA 5AQTA 3LDPA 5LY3A 4WYBA 1GLBG 3C7NA 5JICA 3IDHA 4H0YB 2FSJA 5FPEA 2P9SB 1XUPO 1Z6RA 3U9DA 5AQYA 4AM6A 1NGJA 3H45C 4FPBA 4CZJA 3IFRA 3I33A 3QB0A 4DCHA 5AZJB 3LDNA 3W3DA 4FWKA 5F0XA 3D2EA 1JCEA 1Q18A 3QBXA 3JXUA 1WUAA 3BF1A 4A2BA 4BR0A 5JLHA 4XH5A 2E2PA 5BN9A 3H6EA 3B8AX 3KVGA 3H1QA 5BR9A 3QICA 3MK6A 3LDQA 2YCHA 1HKGA 2QW9A 1P8ZA 1HLUA 3U8XA 1RGIA 4MO5A 3VEVA 3WXIA 4Z94A 5AZIA 2YHYA 2FSNA 3LM9A 1DKGD 3HI0A 5F1XA 1J6ZA 3FR0A 4GY2B 4BROA 4H5VA 4BGAA 4CJ7A 1QZ6A 3SK3A 4FWPA 4B1YB 3ZETA 4CBXA 3QDKA 2YI1A 2Q36A 5EX5A 3HTVA 3DJCA 2FLOA 3VGMA 2CGLA 2P9IA 1BWFO 2OANA 3A5LC 3RSEB 2HF3A 3ULEA 5KPTA 5KQ8A 2E1ZA 4BRQA 1HPMA 3VGKA 3VOVA 4CI6A 1G99A 1H1VA 3C7NB 5AQRA 4BQZA 2QWLA 3ATUA 4ISFA 4NB4A 5AQFA 3DXMA 3WXLA 2V52B 4BGBA 3MDQA 2J4RA 3TU5A 4BRNA 2ASMA 3L6QA 4B9QA 1NWKA 2VCPA 2GUPA 3FGUA 3D2EB 3C0BA 3A5NC 5JLFA 3EL2A 4RWTA 2Q1NA 1V4TA 5EVZA 4PL7A 5FPNA 4E1JA 3MN5A 1TYQA 1ZBSA 3IMXA 4H03B 3CQXA 2P9PA 5BN8A 5JMVA 1BA0A 3CI5A 5CE3A 5AQGA 4FSVA 5ELZA 3FLCO 3LDLA 2P9NA 4CZKA 4K42A 1JCGA 4BR5A 5AZIB 2Q97A 2P9LA 4CZEA 4JN4A 3MCPA 1U2VA 3MN9A 4BRPA 3BEXA 3JS6A 4FWOA 5FPMA 3J8AA 4O8KA 4EHTA 4WQ5C 2H3GX 4K41A 3ZETB 1IJJA 3BUZB 1JCFA 3AY9A 4BC5A 2ZGYA 3O80A 3M3ZA 4XH4A 1D4XA 5AFUH 1XQSC 3ULEB 3FZKA 1HUXA 4H5WA 2D1KA 3L4IA 3ID8A 3A5MC 4CZGA 5B8HA 2V51B 1S3XA 4H5NA 5AFUA 4B1XB 3DXMB 5AQIA 1LCUA 5AQMA 1MWKA 2E8AA 2A3ZA 4IWVA 1YXQA 2BUPA 5BRDA 3ZEUB 2ZGZA 1HJOA 1IG8A 3L0QA 3CETA 3I8BA 4YDUC 1BU6O 3DXKA 3GOIA 1SAZA 4CD1A 3VETA 1NGGA 2P9PB 2Q0UA 3R6MA 1RDWX 3S41A 2GEMA 2IVOA 3O08A 3H46O 3VF2A 2P9NB 4BRCA 3WT0A 4BRIA 2D4WA 4KBOA 1T6CA 2YJEA 2P9LB 3GDQA 2NRHA 3CJ9A 1U2VB 3O8MA 1BA1A 5AQLA 3ZX3A 5AQWA 5E26A 1NBWA 3H3NO 2E20A 5I9EB 2QWPA 4O5FA 2YHXA 4QS9A 1ATSA 1WOQA 3FZHA 3G25A 3VF6A 3WEEA 2E88A 2FF6A 1SQKA 3GE1A 3GL1A 3VEWA 2QWRA 1E4FT 2ZWHA 1NGDA 3GG4A 3VESA 1RFQA 4FWQA 4FPAA 4H0OA 2D0OA 5AQQA 4BG8A 2P9KB 1NLVA 4H0XB 1QHAA 4CD3A 2V7ZA 4FWMA 4L3QA 1ESVA 3VEXA 4JD2B 4PKHA 2Q2RA 5KQDA 1GLEG 1E4GT 2CGJA 3O6WA 1GLLO 1OKJA 2A6AA 2YHWA 3KHYA 3BP8A 3CJBA 4ISGA 4M63C 3UKUA 3VENA 3ENHA 2A42A 3FE1A 3W0LA 3EKUA 3CJAA 4JNEA 1HKCA 1DGKN 4BC4A 4H0VB 2QXLA 1T44A 2QWOA 2ZF5O 4BQLA 4IO8A 2PBDA 4MO4A 2GELA 5LJVA 3VERA 2QWQA 2PAVA 3P4IA 1QQOA 2Q0RA 4FWSA 3VEZA 1X9JA 4IXCA 3CQYA 2IIRA 4BRHA 1DEJA 4J8FA 4BR9A 3CIPA 5F2RA 4BRGA 4IJNA 3M6GA 1KAZA 4BR2A 3ZX2A 4WQ4C 3SMSA 5AZJA 4A61A 4BRDA 3WEEB 4FOEA 3BF3A 4C23A 2P9SA 4Y0WA 3SJHA 2BTFA 2Q31A 4CZIA 5KPRA 1QQMA 1GLJO 2A40A 5ADXA 3OHRA 4B1WB 3UKRA 2P9IB 2IVNA 1HKBA 4BC3A 3U9ZA 3DWLA 3CERA 5BRFA 4EAHD 3R9PA 3H1VX 4JHDA 3UB5A 3FZFA 1BG3A 1NGEA 2V7YA 2E1YA 1BDGA 1QQNA 4QS8A 3UKUB 3HBTA 3A0IX 1MA9B 1NM1A 1NGIA 3EO3A 3M1FA 4M7XA 1C0FA 4K43A 4A2AA 4HWIA 4A62A 1SZ2A 2E2QA 5AQOA 3UE5A 3EN9A 4BVPA 5BRHA 3VEOA 3WQUA 2GWJA 4FOIA 1HX1A 3VGLA 1TYQB 3LL3A 2WUSA 3D2FA 4PL8A 3WQTA 4MLEA 3QBWA 3O1WA 4QS7A 2CGKA 4BVOA 4I6MA 1BO5O 1GLCG 1TUYA 3HSCA 3QMLA 3WUHA 3EKSA 3MMVA 2NLXA 5FPDA 2VYPA 3HM8A 4RCHA 5AQZA 4FWRA 4BRLA 2F9TA 3LDOA 5EOYA 1KAYA 2VWBA 2IVPA 1X3NA 3A5OC 2E2NA 1K8KA 4CZLA 1QZ5A 3CJCA 4FL9A 2ITMA 1R59O 2E2OA 4FWLA 1MDUB 3O5BA 4JAXA 4BRKA 4HTLA 2UYTA 3UKRB 5E84A 3KZBA 2CH5A 3GBTA 3O1BA 4XEIA 1NGAA 1BOTO 4BRFA 4PKIA 1KXPA 1ATRA 1GLDG 3O4WA 5AQUA 2I7NA 4JHDB 2EWSA 4B1UB 4FO0A 4NO7A 2HMPA 1GLAG 4CBWA 5AQVA 4BREA 1GLFO 3H3OB 4YDUA 1U6ZA 2ASPA 3CJ1A 4BR4A 3IUCA 2QWMA 5BPNA 5BREA 4XH1A 1CZAN 5TKYA 1Z05A 2GWKA 3AAPA 3FZMA 5AQHA 2HF4A 3SLCA 4BRMA 3VF4A 4B1ZA 3DXKB 4K25A 3SMPA 4MLHA 3D2FB 4RTFD 2QM1A 2A41A 1X3MA 3MN6A 4H5RA 4I6MB 2QWNA 5BPLA 4CZFA 4F9OA 2AP1A 3DAWA 2P9UA 1S22A 4AM7A 1MWMA 2FSKA 3AAQA 1BUPA 4BR7A 1T6DA 3EZWA 2D0PA 3CJ7A 2CH6A 5AQNA 3FFKB 1XC3A 3FZLA 3ZEUA 1NGHA 3WXJA 4B1VA 1K8KB 4BG9A 1TUUA 1ZC6A 5ADXH 2GTDA 1NGCA 3ZX0A 3CHWA 4DHYA 1YAGA 1C0GA 3VEYA 3ENOA 2AA4A 2FXUA 3D7EO 1YUWA 3A8YA 2ASOA 3TPQA 2W41A 3VPZA 3WXKA 2DPNA 1LOTB 4BRAA 3U4LA 1EQYA 2NZTA 1ZXOA 3R8EA 2FF3B 4GNIA 5AQPA 2KHOA 4ISEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2NRRA 2IGIA 2NRZA 5EU7A 4F3OA 2P1JA 3AA4A 2KKZA 4DF8A 1I94K 3VQ9A 1VSLA 5K14A 4DB3A 1WAJA 3OA9A 4BC2A 4DLEA 2O8EA 4BDPA 1T05A 3OYCA 1YVNA 4JK7A 4DQ8A 3S3NA 4YNQA 1Q7YO 1N6QA 3AGRA 4IDKA 4EHUA 3S3OA 4H0PA 4CBUA 2YJFA 2P9KA 3F9MA 3NGIA 4FLZA 4DSKA 3PIPL 1LWCA 4IJAA 3M8SA 4HCCA 1VSJA 4WQ5A 5AQTA 4NCGA 1GLBG 3NGYA 3IDHA 5JICA 2ZE2A 4YOXA 2BANA 2P9SB 2KLAA 2IS3A 1XUPO 3SUQA 3U9DA 4N47A 5AQYA 4BWJA 2OTLN 1NGJA 4FPBA 3IFRA 3I33A 4C8KA 5AZJB 3LDNA 5KRTA 4FWKA 5F0XA 3D2EA 3TSPA 1JCEA 1LV5A 3T3FA 3WNFA 3CC2N 3JXUA 4CEZA 3WNGA 2E2PA 3PSFA 3KVGA 3DOLA 1S9GA 3QEWA 3OYBA 3MK6A 4KREA 1S5JA 4RW7A 4CESA 4AF1A 2QW9A 3LZJA 3HM9A 3U8XA 3HO1A 4LH5A 2YNIA 3ISNC 4RW9A 3WXIA 3PV8A 4Z94A 5AZIA 1ILYA 4FJXA 4ID5A 2O8EB 1YVUA 4B9UA 3HI0A 5F1XA 3CM5A 3V9SA 4FJGA 4GVMA 1YI2N 4CBXA 3DRSA 5AJ3K 3HTVA 1HNWK 2KTQA 2CGLA 3PX6A 4LF4K 2ATQA 1IKVA 1U48A 3AVFA 3F9KA 4N56A 4KI4A 2G8WA 4M42A 3ZSYA 4Z4IA 1ZBHA 3KKSA 3ATUA 4ISFA 3CCQN 3DXMA 4B9TA 2BE2A 1RDAA 3MDQA 4FJHA 4F3TA 2O4IA 3L6QA 2VCPA 2GUPA 4BE1A 4NLCA 1S1UA 3NF7A 3D2EB 3A5NC 5JLFA 2QEXN 4RWTA 4O55A 4FJ9A 1OH8A 4FK4A 4LSNA 4E1JA 1D8YA 3U3GA 4M45A 1J5OA 4G1QA 4CEFA 3M8RA 1NKCA 3TANA 4JRPA 4U67L 1RDCA 3KWGA 5CE3A 4M3WA 4FSVA 1C0TA 3DLKA 5ELZA 4JK9A 3RMCA 3RMAA 3V81A 4K42A 5AZIB 4EP5A 4IFEA 4JN4A 4CEQA 4BRPA 4IOXA 4X65K 4EHTA 1HQEA 4HHTA 4KHNA 2G8IA 2VG6A 4BC5A 3AVLA 4KAZA 4H5WA 4CEAA 3L4IA 1I39A 3TAMA 1ASUA 3O9RA 4LD0A 4DTMA 1HYSA 3DXMB 5AQIA 3J7ZO 4PUOA 2NUBA 1J9AA 4CJPA 3D45A 2ZGZA 1HJOA 4IDHA 1OVYA 1N5YA 3T1YK 3U6FA 1K8AO 4JI4K 3HT3A 5CR4A 4IOCL 3TWHA 5KGWA 4DQPA 3GOIA 1SAZA 4CD1A 1JLEA 1NGGA 2KZMA 4CHZA 3LP3A 2IVOA 3AO5A 3H46O 3E66A 2FBTA 4JKHA 4BRIA 2D4WA 4KBOA 3OYNA 1U47A 1T6CA 3GDQA 3DYAA 4LF8K 3O8MA 5AQLA 5C15A 4WCEL 4KTQA 3M8QA 1VK0A 2QWPA 3Q7CA 4O5FA 2QKKA 1WSJA 3FZHA 4O44A 3AO2A 2E88A 4CHYA 4Y1DA 3V9XA 1N33K 4M3XA 3VEWA 2ZWHA 1WLJA 1NGDA 3VQ4A 3VQ7A 5DMRA 4FWQA 4FPAA 3MWPA 1VQMN 2ITGA 5HRRA 2V7ZA 5MLCQ 4L3QA 5IWAK 3CPWM 1ESVA 3KLHA 4DTSA 4E0DA 3VEXA 3F73A 4M3RA 1JLFA 4CIGA 1E4GT 2CGJA 2Z1JA 1LWEA 3CJBA 1T3VA 1HPZA 5C42A 4KHUA 3VENA 3AVNA 1WB9A 3OS1A 4JI0K 4ILHA 4BC4A 1T44A 4MQ3A 3EZ5A 3VTIA 2VWJA 4C8OA 3L3VA 4BQLA 1VQ9N 3P1GA 4OJRA 1BHLA 1KLNA 2YNGA 3VERA 2PAVA 3P4IA 2O4GA 3NHGA 3VEZA 4FWSA 3CQYA 2IIRA 5T7BA 1DEJA 3OW2M 1VQ6N 4BRGA 3NMUA 4IJNA 5HRPA 3ZX2A 3RRGA 3O4QA 4FOEA 3BF3A 4C23A 2E6LA 5FROA 3SQ1A 4DV3K 4CZIA 3S3MA 1ASWA 5JVGL 1S1WA 4B1WB 4KHPK 4HTUA 1D9FA 1ZBIA 4GW6A 1ITGA 1NK8A 5FRNA 3VTHA 4HUGA 4CE9A 1CZBA 4ELTA 3CERA 5BRFA 4CF8A 4EAHD 4JI5K 4PQUA 3H1VX 4JHDA 3UB5A 4CJVA 1BG3A 1NGEA 2V7YA 3QERA 1BDGA 1JKHA 1BIUA 4CF2A 3AVBA 4KI6A 3HBTA 1MA9B 4KHWA 4K43A 3HVTA 3B6PA 3I0SA 3QEVA 3NH0A 5AQOA 1RDDA 4IO9L 4QCLA 4DU4A 5BRHA 1GOCA 3WQUA 2P51A 3ZT3A 4FOIA 3MECA 4CEEA 1WSGA 3SUOA 2VG7A 4MLEA 1QS4A 2CGKA 3MEDA 4BVOA 3K5MA 4I6MA 3BGRA 4FJKA 4FJ8A 1GLCG 1TUYA 3QMLA 4Z0UA 4IOAL 4FJJA 5FPDA 2NLXA 3CCRN 3HM8A 4RCHA 4I2PA 1NK5A 1NNEA 4DMNA 4B8CA 2Y1JA 1QVGM 3LDOA 3O3HA 5KGXA 1YJ9N 3MX5A 2VWBA 1SKWA 3A5OC 2OYQA 1K8KA 1HNIA 4FWLA 1MDUB 2CH5A 4OKEA 2B6AA 1NKEA 3VQCA 2YHBA 3M8PA 3ID6A 1KXPA 1ATRA 4JI1K 4NCBA 4JHDB 2EWSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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