3H1VX

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 172
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
172
sequence length
446
structure length
446
Chain Sequence
MVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The design and optimization of a series of 2-(pyridin-2-yl)-1H-benzimidazole compounds as allosteric glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glucokinase
total genus 172
structure length 446
sequence length 446
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h1vX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3h1vX01
2QWOA 5AQQA 3DXMB 3EN9A 4DHYA 2WUSA 4BG8A 4FWLA 5EVZA 2P9SA 2IVOA 4O8KA 2P9UA 4BC2A 4CJ7A 3DJCA 3J8AA 5E26A 1NGBA 3GE1A 2CGLA 4H0PA 3WEEA 1TUYA 3FZMA 2QWPA 4CZGA 1NGEA 4WYBA 4BR2A 4WQ4C 1ZC6A 3H45C 3LDLA 2P9SB 4BC3A 5KPTA 2P9UB 4H5VA 5AQOA 3VGLA 4CZEA 2ZF5O 3WEEB 3O08A 2W41A 3LDQA 4H0TB 3RSEA 2E8AA 2P9LA 3ENOA 1ESVA 3VEXA 1HLUA 4MLEA 4BRLA 3ZX2A 5KQ8A 4BR4A 4EFHA 4DQ8A 4AM6A 4FWOA 1BO5O 2A40A 4FWKA 1XC3A 1P8ZA 4BRHA 3R8EA 1K8KA 3I8BA 3RSEB 4IZ9A 2P9LB 4CBUA 3H6EA 3H1VX 1R59O 2D0PA 4ISGA 3M3ZA 4IJNA 1V4TA 3UKRA 4O5FA 1MA9B 3D2EA 5F2RA 3CJCA 3ZX3A 2VWBA 3VF6A 5AQFA 1BOTO 3D7EO 3FLCO 3UKRB 4A62A 4M63C 4Z94A 1HUXA 1OKJA 5AQXA 3TPQA 5JMVA 3D2EB 2ITMA 1NM1A 5AQWA 1MWMA 5AZJA 4H5RA 1NGCA 2FF3B 2Q2RA 4BROA 2YHYA 4FPAA 4BRQA 4EHTA 1GLCG 3EKUA 2F9WA 4EIAA 5AZJB 1IJJA 3LDOA 3HM8A 1QZ5A 1KXPA 2UYTA 5ELZA 1BA0A 2QWQA 3I33A 5AQZA 3GL1A 2NRHA 5F1XA 4H0OA 3FZHA 4NO7A 4B1ZA 3B8AX 4WQ5C 1HPMA 4ISEA 1CZAN 3A8YA 3M1FA 4MO4A 4CI6A 3CIPA 1T6CA 1U2VA 4BRNA 4HTLA 4JD2A 3EL2A 5AZIA 1S22A 3MCPA 2DPNA 2P9PA 1Y64A 2QXLA 3AAPA 1NGDA 3VGKA 5JICA 1U2VB 2P9IA 3HTVA 4CD3A 1HKCA 4IXCA 4YDUA 3FGUA 4JD2B 5AZIB 1XQSC 2P9PB 4B1VA 4BRAA 1HKBA 3O8MA 3F9MA 5EY4A 1QZ6A 5AQHA 3S41A 3D2FA 5AQLA 1JCGA 2YI1A 3A5NC 2VCPA 2P9IB 3FR0A 3VEOA 1ATRA 2A3ZA 2I7NA 1NGFA 4CZIA 3BEXA 2YJEA 1JCEA 1MWKA 1WUAA 3U9DA 3D2FB 1ATNA 2VYPA 4FPBA 3JXUA 4ISFA 4DB3A 3MN6A 1S3XA 3MN9A 2A6AA 3EZWA 3KHYA 3H1QA 4XEIA 3SLCA 4H03B 3O4WA 2E20A 5AR0A 4BR0A 4MLHA 2PBDA 3QB0A 2FSJA 5JLFA 5AQJA 3C7NA 2NLXA 5AFUA 1E4GT 3GG4A 3WUHA 1NGHA 3FZFA 5F0XA 1U6ZA 1GLAG 3A5LC 4PL8A 3ULEA 3W3DA 3A0IX 1Z6RA 2P9KA 4FL9A 2ASMA 4B1UB 3C7NB 4BRFA 4MO5A 4CD1A 3VEWA 5AQNA 3O5BA 2QWRA 5AQPA 4M7YA 4PKGA 2A41A 3ULEB 1DKGD 5AQIA 3ENHA 3CQXA 1G99A 2V7YA 2P9KB 3WXLA 4JN4A 2ASOA 1GLLO 4WQ4A 2QWMA 2E2QA 5BN8A 2YHWA 3CHWA 4JHDA 1QQOA 4PKHA 1HJOA 4FOIA 5AQTA 3QICA 1ZXOA 5AFUH 3DXKA 3AY9A 2HF3A 1C0GA 4Y0WA 1YUWA 4BVOA 4IJAA 1K8KB 3WQUA 1RGIA 4FWSA 4FWQA 1H1VA 4JHDB 3WXJA 2E88A 5BRFA 4K25A 1QHAA 3LL3A 2CH6A 3DXKB 2ASPA 3MDQA 3U8XA 2CGJA 4CZJA 4NB4A 5AQSA 3P4IA 5BPNA 2BUPA 4GY2B 4I6MA 1T6DA 2ZGYA 2Q0UA 4HWIA 2E2NA 1WOQA 2E2PA 1X3NA 2ZWHA 5EX5A 2Q97A 4BGAA 3MK6A 1GLEG 4K41A 1GLBG 5ADXA 4K42A 2YJFA 3LDPA 5EOYA 1LCUA 5FPNA 4I6MB 2ZGZA 3SMPA 5FPMA 1NMDA 3MN7A 3JS6A 2J4RA 3BUZB 1SAZA 1QQMA 2V7ZA 4B1XB 3QMLA 3HBTA 3QDKA 5AQRA 4BC5A 1V4SA 3BP8A 2E2OA 4H5NA 4BRCA 3CJAA 5AQVA 2AA4A 4FOEA 2FSKA 2I7PA 2Q1NA 5FPEA 3ZETA 4FWMA 1LOTB 2QW9A 1NLVA 3VF2A 3IFRA 3VGMA 3CERA 4WQ5A 3WT0A 1NGJA 5BPLA 2HOEA 3U9ZA 3CI5A 5ADXH 3ZETB 3DAWA 5LY3A 2Q36A 3EKSA 3H3NO 1Q18A 1TYQA 3AARA 3FZKA 3EO3A 4M7XA 1NWKA 3WXIA 4J8FA 2FSNA 3FE1A 4F9OA 4PKIA 1Z05A 1QQNA 3SJHA 5I9EB 3LM9A 3M6GA 3UE5A 2Q31A 3W0LA 3KVGA 1HX1A 1TYQB 2A5XA 1BG3A 2HF4A 4H5TA 5LJVA 1BWFO 4B1YB 5KPRA 5BRHA 2YCHA 1X9JA 3VEVA 3O6WA 2GUPA 4BC4A 2W40A 2Q0RA 1SZ2A 4BR7A 2D0OA 3L6QA 4FSVA 2QWLA 5B8HA 1HKGA 4A2BA 3VPZA 4FWPA 2NZTA 1RFQA 4JAXA 2OANA 2D4WA 5CE3A 3ATUA 1YXQA 3BF1A 1NBWA 4BRIA 2FXUA 4A61A 3C0BA 4H5WA 3VEYA 4AM7A 2AP1A 3H46O 3WXKA 2PAVA 2IIRA 5JLHA 4RWTA 4BRMA 3U4LA 2V52B 2IVNA 1IG8A 1D4XA 1X3MA 2BTFA 2F9TA 4BREA 3LM2A 1ZBSA 5LJWA 1BDGA 3GOIA 4XH4A 3HI0A 3KZBA 3MN5A 4BQLA 3O1WA 4H0VB 4H0XB 2D1KA 3CQYA 4QS8A 1T44A 3VERA 2V51B 4RCHA 3L0QA 4KBOA 5BPMA 2CH5A 3QFPA 4FO0A 1RDWX 3FFKB 5AQGA 3VEZA 3ATVA 3BF3A 2A42A 4QS9A 4L3QA 2CGKA 4K43A 4CZHA 4IWVA 1BU6O 3AAQA 3QBWA 3A5MC 4BRPA 2QWNA 4BR5A 2KHOA 5AQMA 3LDNA 1NGAA 3IMXA 5BN9A 2GELA 3SK3A 2GTDA 3L4IA 2GWJA 1J6ZA 3GBTA 3O80A 3CETA 2GWKA 1GLFO 4BQZA 3FZLA 1JCFA 4FWNA 3TU5A 4XH5A 4FWRA 3HZ6A 3ZX0A 4CZKA 3ZEUA 4CZFA 5AQUA 3SMSA 1SQKA 1ATSA 3VESA 4B1WB 1YAGA 4BVPA 5AQKA 3ID8A 1NGGA 3ZEUB 5KPZA 4CZMA 3OHRA 3G25A 3O1BA 3VENA 3QFUA 4BRGA 4DCHA 4BG9A 1TUUA 3CJ7A 1MDUB 3R6MA 1BA1A 3CJ9A 4EHUA 4YDUC 4BRKA 5FPDA 2E1YA 3VF4A 4H0YB 3CJ1A 2P9NA 3VETA 1KAZA 1E4FT 1DGKN 5EXWA 4BR9A 4BGBA 4B9QA 2IVPA 4LC9B 1BUPA 2EWSA 2GEMA 2HMPA 2P9NB 1NGIA 4A2AA 3A5OC 3VOVA 4CZLA 1KAYA 3QBXA 3MMVA 3DWLA 2FLOA 5BREA 3IDHA 1XUPO 5BRDA 4EAHD 3UKUA 4CBWA 1KAXA 4GNIA 2H3GX 5E84A 2E1ZA 1C0FA 3IUCA 3WQTA 3HSCA 4QS7A 4C23A 4RTFD 4JNEA 4CBXA 5BR9A 4XH1A 3UB5A 2QM1A 3UKUB 3DXMA 2FF6A 2YHXA 5TKYA 5AQYA 4E1JA 4IO8A 5KQDA 3CJBA 1DEJA 1EQYA 1YVNA 4PL7A 3R9PA 4BRDA 3GDQA 1GLDG 3H3OB 1GLJO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DXMB 3EN9A 3DRPA 3ISNC 4DHYA 2WUSA 3DLEA 2WTUA 5LMNK 3LPUA 4J2AA 4BC2A 1XNQK 3DJCA 4H0PA 3OYNA 4I2QA 5GAGP 1TUYA 3OYLA 2QWPA 4CZGA 3OBYA 4WQ4C 1ZC6A 1WSFA 1QS4A 2P9SB 3LDLA 4XIUA 1W9HA 3VGLA 1YITN 3WEEB 3VQ5A 2W41A 3CQ8A 4DR1K 4A59A 4A5AA 4CW7B 3NDKA 5I3UA 3LP1A 4BRLA 2QKBA 4AM6A 4FWOA 4B9UA 1BO5O 2A40A 4FWKA 4B3SK 3LP0A 4NYFA 4CBUA 3H6EA 3H1VX 4IJNA 4CGHA 3AA5X 3QEIA 4O5FA 3AVFA 4CEOA 4DQSA 2ZJQL 3SYZA 1KRPA 1MA9B 4ELTA 4OPAA 2VWBA 3VF6A 5AQFA 1BOTO 3M8QA 3UKRB 3QERA 3OJSA 4M63C 3OYHA 2ZJRL 5JMVA 3D2EB 1EWRA 4FJ9A 5AQWA 1MWMA 5AZJA 5KRTA 2ZJPL 3L3UA 5BR8K 2YHYA 4X65K 4BRQA 2VQFK 4EIAA 3M8PA 3O9TA 3M8RA 4AILC 3OYDA 2XO7A 3LAKA 2UYTA 1WLJA 2QWQA 1U45A 4M3YA 1S6PA 4M42A 2PFUA 1YI2N 3CPEA 5M1NA 5J2NA 1JLBA 3QEXA 3G6EN 4BDYA 4B1ZA 1HPMA 4ISEA 1XNRK 3IG1A 3R3LA 5C42A 3ZSZA 1LWCA 1BQNA 4CEEA 3NGYA 1NKBA 4ZHRA 3VMFB 1S22A 1Y64A 3RMBA 3NGIA 2PY5A 1YTUA 1JKHA 5JICA 2P9IA 4E7IA 4WFAL 4IXCA 3OS1A 4DG1A 4B1VA 3O8MA 3F9MA 2UXDK 3NGZA 2W6KA 5AQHA 3D2FA 2G8FA 1BIUA 1DLOA 4DFMA 4MFBA 3QEPA 4CEQA 2VCPA 1XMOK 3EZ5A 1NGFA 4OX9K 4RW4A 3BEXA 2YV0X 1FKPA 1W0HA 1WUAA 4ISFA 4KI4A 3MN6A 3EE8A 1TKTA 4CIGA 2UXCK 3AVKA 4HTUA 3B6PA 4H03B 4Z4GA 3V1RA 2E20A 3ZSWA 3QB0A 2WFBA 2ZD1A 2NLXA 1VSLA 1E4GT 2BH1A 4B8CA 4CK2A 4KH4A 4CEBA 3FZFA 2QA4N 4PL8A 1LWFA 2VG6A 3DRSA 2OA8A 3I55N 2P9KA 3K9JA 4FL9A 2EX3A 4BRFA 3SAGA 2VQEK 3ULEB 5AQIA 3CQXA 3E66A 1I94K 4PA1A 4JKDA 4CF8A 4KB0A 4KH5A 4BE2A 4PWDA 1JXEA 3OA9A 4WQ4A 3TSQA 2E2QA 2YHWA 3P5JA 1HYZA 4PKHA 2E6MA 5AQTA 4KPYA 1QHTA 4KTZA 4L8RB 2HF3A 4BVOA 3VQ4A 3KLGA 4JI0K 1K8KB 3WQUA 1RGIA 4FWSA 4JHDB 4W5OA 4DFJA 4K25A 1QHAA 1L3UA 3O3GA 3LL3A 3N4PA 2CH6A 2O8BB 4CZJA 1VRTA 4JKHA 2BDPA 3AA4A 2VWKA 1NK0A 4GY2B 4WFNL 4FJHA 3D45A 3J7AP 2Q0UA 2E2NA 4LD0A 3NH1A 3DRRA 3BGRA 3T69A 2E4LA 3ZT1A 1GLBG 5ADXA 3LDPA 5EOYA 3RRGA 3TAEA 1EP4A 4B9NA 4LFBK 2QI2A 2VWJA 4H8KA 1SAZA 2WBNA 2E6LA 3FFIA 1VAZA 3QMLA 1N6QA 2BE2A 1B9FA 3O9QA 4H5NA 3QEWA 2FBXA 3CJAA 2RE2A 4CESA 1KCFA 3LALA 2I7PA 4CJ5A 4N56A 3SQ4A 3AO3A 3EYZA 1C6VA 2QW9A 1L3SA 4DQIA 3CERA 3RVCA 4M45A 3VQ6A 4CFBA 1REVA 1RBRA 1Y97A 1W7AA 1RT5A 3CI5A 3MWPA 4B3MK 3ZSYA 3QIOA 1NMNA 2Q36A 4CECA 1J5OA 3H3NO 1TYQA 4E1MA 2P51A 3L3VA 4M7XA 1NWKA 3HT3A 1QSSA 2FSNA 3FE1A 4PKIA 3TTFA 2IS3A 3OYJA 4B3OA 4FW1A 5IWAK 3UE5A 1IH7A 1SS6A 3KVGA 1DTQA 4H5TA 3QNOA 5KPRA 5BRHA 1HNWK 1Q7YO 5J2PA 4Z4FA 1HMVA 4DV0K 4FZXC 4Q0BA 2Y1JA 1TKDA 1VQ7N 4ILHA 1RT3A 4CK3A 4CF1A 4BR7A 3KLHA 3OYEA 3TANA 2D0OA 3L6QA 5B8HA 1S5JA 2UUAK 4A2BA 3VPZA 3DLGA 2OANA 3QNNA 5CE3A 3ATUA 4ZTFA 3C94A 1NBWA 1KVBA 4BRIA 3VEYA 4AM7A 3U6FA 4DV7K 3WXKA 1BIZA 2IIRA 1VQ4N 4N47A 2V52B 2X6NA 4NCGA 5HP1A 1FK9A 2IVNA 1NK6A 4BREA 1RTJA 1O13A 3CC7N 1BDGA 3GOIA 3MN5A 1NKCA 3CYMA 4G9ZA 1N36K 2D1KA 4JKGB 1JXBA 3TSUA 1YJNN 2KFNA 4DTUA 3ZT3A 3QFPA 3VEZA 1J53A 4B9LA 2P5GA 4DTMA 3SBGA 1RBUA 3RMAA 3C65A 3TAFA 1IV0A 3K5LA 2KHOA 3LDNA 2B4JA 1NGAA 3KWIA 1RT1A 4CJTA 3IMXA 2HBMA 5BN9A 2VGMA 4W5TA 1NNEA 1WAFA 3SK3A 4IKFA 3L4IA 2EHGA 3PO5A 3CETA 4IOXA 4ELUA 2P1JA 2FBVA 1GLFO 3THVA 3DLHA 3TU5A 1Q9YA 3HZ6A 2IDOA 3NAEA 4CZKA 5AQUA 2HNYA 1UOCA 1VQNN 4CCHA 1ATSA 4B1WB 4BVPA 5AQKA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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