2E6LA

Structure of mouse wrn exonuclease domain
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
source organism Mus musculus
total genus 60
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6lA00
4KPYA 3QIOA 3AVGA 4CK3A 4W5OA 4M3RA 1LWCA 3AVNA 3E01A 4E1MA 4M42A 3SV4A 1TL1A 1S1TA 3QIPA 4CJ3A 4JRQA 3V81A 2PZSA 4E19A 4ID1A 1WN7A 2LSNA 2B6AA 4HUFA 1I39A 1U47A 1X1PA 3LAKA 3TAQA 3SUQA 4E89A 4CGGA 1KFDA 3KK2A 2D0BA 4KO0A 3F9KA 5KGXA 3RMDA 3NDKA 2HNZA 4BACA 4IFVA 4OVLA 2QXFA 3KKSA 1NOYA 2IDOA 4OKEA 3LANA 4DS4A 1TV6A 3VQ9A 4RW7A 4AHUA 4BE0A 5HP1A 4PA1A 4ZTJA 3VQ6A 4DU1A 3TAPA 1A5XA 4M3YA 3CFRA 1BQMA 1S5JA 2E6MA 1FK9A 2X78A 3DMJA 2Y1JA 1TAUA 3HM9A 4E7KA 1XWLA 4AHRA 2FBXA 3CM5A 3ZCMA 1TL3A 3I0SA 4CHZA 1L3VA 1QSLA 3IG1A 3G0ZA 1NK9A 5KRSA 1EETA 4BE1A 3ASMA 2Q3SA 4ZTFA 1SKSA 1T05A 3SPYA 3OYDA 4FJGA 4DFKA 4KHYA 3OYLA 1JKHA 3AVLA 2ZD1A 2HB5A 2KQ2A 4RW6A 4PUOA 1KSPA 1S1VA 4CFAA 4F4KA 1LW0A 1TK5A 1N5YA 3I0RA 3DRSA 1KCFA 2DY4A 3NE6A 1RBRA 4Y1DA 4B3OA 2X6NA 4RW8A 4CF0A 3KD1E 4O4GA 1NK5A 3OS2A 3M8PA 1JLGA 1HYSA 3QEWA 4IKFA 1JL2A 1BISA 3F73A 3CG7A 4DLGA 3C94A 4GMJB 1NKEA 4HHTA 2A1RA 3VA3A 1NJWA 2KTQA 1RCHA 4ZHRA 1ZBHA 1S6QA 3MEGA 3ZT4A 4CEOA 4CF2A 1GOBA 2VWJA 2XHBA 4FXDA 4FM0A 5HROA 3SQ2A 5D3GA 4CHQA 5E41A 4HUGA 3AO2A 3G10A 4M3WA 5FRMA 4N5SA 4GVMA 3K5NA 3VQEA 3VQBA 4IFYA 1W9HA 3LPTA 4CGIA 4DSEA 1S6PA 3OYEA 3RMBA 1NK7A 3IRXA 1ZYQA 4CJWA 5CZ1A 3LZJA 3IAYA 4DQQA 3SV3A 4FYDA 1WAJA 4C8KA 1NJZA 2HHQA 3RRGA 1ZBLA 3SPZA 1N6QA 4E0DA 2KZZA 3OYGA 3TI0A 3OYFA 3NGIA 2X6SA 4JS5A 1RDCA 1IKWA 1JLFA 4OLAA 3NF9A 3TWHA 1UOCA 2F96A 4CEAA 5K14A 4B9NA 4FW1A 3NGZA 2VWKA 1NK6A 3UIQA 3NF7A 1SV5A 5C25A 4CFBA 3AVBA 2EX3A 3NCIA 3V6DA 4YNQA 1SL0A 2HNYA 4OKKA 4OGCA 2PYLA 2KW4A 1RNHA 3WNEA 4B9TA 4QAGA 3CFOA 1XC9A 5CZ2A 4E7JA 2HHUA 1NJXA 1Y97A 4LY7A 1RT4A 2YNIA 3AO4A 3BDPA 3KLHA 4ELVA 5CYQA 3V1RA 4F3OA 1UA1A 3DLEA 3ZSZA 4CIGA 1TKZA 4FVMA 5CYMA 4CJRA 1K6YA 5KGWA 1TVRA 3WNFA 3SI6A 2D0AA 4M3ZA 1RDAA 4FJJA 3RMCA 4FZZA 1C1AA 3QINA 5C24A 4O0IA 2QKKA 4Z4EA 3HVTA 4FJLA 3OYHA 4CHYA 4IG0A 3HSTB 1TKXA 3V9SA 1D8YA 4CERA 3OYJA 4Z4FA 3L3UA 4AHVA 4O0JA 1NOZA 4OPJA 4RW4A 3CQ8A 3QERA 1NK4A 2G8HA 4B9LA 4KHSA 4FJNA 4B9UA 1HMVA 4CJLA 3QEPA 3L2WA 5T7BA 1WSHA 3HP9A 4CK1A 3PV8A 1RTHA 1EP4A 3HXMA 4HVJA 4E1NA 1JLBA 3M8SA 3HP6A 1FXXA 2FC0A 1L3TA 4FM1A 4M45A 3KD5E 3QO9A 3HT3A 3ITHA 3P83D 4KB1A 3ZSRA 1UAXA 4HUEA 4CJ5A 1J54A 3DLRA 4DS5A 1NKCA 2XY7A 4CESA 4J2BA 2IAJA 1VSDA 1WAFA 3MAQA 2HVIA 4UQGA 3SUNA 3LP3A 2IS3A 5CY4A 5DK5A 2HHSA 3T1AA 1DTQA 5HRSA 4BE2A 2G8IA 4KKOA 3U3GA 2D5RA 3DLBA 2IGIA 1VSIA 2Z1HA 4LSLA 1TKTA 4FLUA 2XY5A 5HLFA 2G8WA 3L2QA 4CEQA 3LP2A 4K8XA 3U3YA 3OS0A 1RT3A 2D0CA 1IG9A 4DSKA 3LWLA 1JLAA 1RTJA 4CGJA 5I42A 4FJXA 3WNHA 1HRHA 1O1WA 3RTVA 3DLHA 2KZMA 5JS1A 5J1EA 2GBZA 3V4IA 4H4OA 2PYJA 4CEEA 4OJRA 1NK8A 4CJTA 4C8NA 4O44A 3ZT0A 1KLNA 4LH4A 4TSXA 5C42A 4DF4A 4I7FA 1L5UA 3LZIA 4HCBA 1JLEA 1VSEA 4CIFA 1D9DA 1BHLA 3ZT2A 3TAMA 3TR8A 1HQUA 1C1BA 3P5JA 4ELUA 1JXEA 2ETJA 4KHWA 1VRTA 3PO4A 1B9DA 1RDDA 2O4GA 5FDLA 1YVUA 1RBTA 3NF8A 2JLEA 3C6TA 2OZSA 3L8BA 2KFNA 3OY9A 1UA0A 1RT5A 4NCBA 5SZTA 3ISNC 4F2SA 1WNSA 3K5LA 3VA0A 2BGGA 3HJFA 2Z1IA 1U4BA 4CEBA 1QE1A 1UWBA 3QNNA 4J2DA 1VSMA 1CZ9A 2W42A 5J2QA 4FJKA 4KHUA 1LWFA 2FBVA 4Z4HA 3QEXA 1SKRA 4BWJA 3SQ4A 1TK8A 3K58A 3ZSWA 2F8TA 4MQ3A 3P1GA 1L3SA 2E6LA 2DTUA 3L2UA 1RILA 3S3MA 1X9SA 3QNOA 1CXUA 3AA4A 3AA3A 4DQIA 3AA2A 1CZBA 3KKRA 3NH0A 1U48A 1JXBA 3TAEA 3L2VA 2OA8A 2QKBA 5FROA 2VG7A 4DU3A 4B8AB 1CLQA 3OYCA 3C95A 4Z0UA 1HPZA 1WSGA 3PY8A 3V1QA 4FJHA 4DTMA 4I2PA 4CEFA 4FJ9A 4DQRA 3RRHA 3AVIA 2BANA 4KHNA 3KK1A 3DRPA 3ZSVA 1QTMA 1BCOA 3NHGA 1U45A 1RT6A 4FJ7A 3NAEA 4OKJA 4HTUA 3TABA 3MXIA 4GW6A 1IKVA 3KLFA 1SUQA 4HCCA 1LWEA 2XY8A 1BIZA 3SJJA 4CJQA 1S9GA 2XRIA 4C8LA 2HW3A 1BQNA 2WOMA 4CF8A 2ATQA 4B9VA 1CXQA 3ZSYA 4DQSA 3SCXA 5KRTA 4DF8A 1ZBUA 1G15A 3AO3A 4CJVA 4N56A 4E7LA 1X9MA 4B8CA 2RKIA 1IO2A 3NF6A 4FJ5A 1BL3A 2B4JA 3MECA 3LP0A 3ZT1A 1HQEA 2XY6A 1RTDA 4M3TA 1KVAA 4W5QA 4N47A 4JRPA 4DG1A 5FRNA 4ICLA 3OYBA 4QCLA 2B5JA 4FJ8A 3A2FA 3ZSOA 3T3FA 1QHTA 3EYZA 4DTNA 3U6FA 3ZSXA 5J2NA 1QQCA 4F3TA 2OPQA 4KI4A 5J2MA 4Z4GA 1RBSA 4AH9A 2HVHA 4CECA 3MXMA 3ALYA 3LDSA 4CF9A 1RT7A 5I3UA 4EZ9A 4F2RA 3AVCA 4OGEA 2OZMA 3VQ8A 1Z26A 3LPUA 4CGDA 3ULDA 3SQ1A 1JLCA 2G8UA 4FLTA 3KTQA 1NJYA 1D9FA 2HHTA 1LAWA 2XO7A 4FM2A 4DTXA 1SL1A 1TAQA 5KI6A 3HO1A 2VG6A 4FCYA 4DWIA 4FJMA 1REVA 1Q8IA 2FBTA 4I2QA 3BGRA 4DTUA 1R0AA 2E4LA 4DSLA 3K5OA 1KLMA 2FBYA 5J2PA 4FLWA 5EU7A 3AVAA 4ID5A 2YHBA 4BDZA 3AV9A 1S1XA 4FK0A 3V9WA 4CGFA 3DOKA 2OPSA 1Q9YA 4C8OA 3NFAA 1DTTA 3LALA 2JGUA 3M8QA 2EHGA 3D45A 3OVNA 1HNVA 1BIUA 3QLHA 4LSNA 1LW2A 4KTZA 4CJUA 3K59A 2R7YA 1ASWA 4LH5A 4NCGA 3AVKA 3SQ0A 2YV0X 1GOAA 4M41A 4YFUA 3D0PA 1XHXA 2YKMA 3DI6A 4IBNA 1A5VA 3L2RA 4RG8A 3K2PA 1YTUA 3CM6A 4OPKA 3VQAA 4J2EA 4DU4A 3O3HA 3K5MA 3JSMA 1JLQA 3KK3A 3C6UA 3AO5A 3L3VA 3TAFA 1VSJA 2ZQBA 1IKYA 3DLKA 2P5GA 2YNHA 2P1JA 3O3FA 1NKBA 3QEVA 2Z1GA 3MEEA 4JS4A 4B08A 4CE9A 1GOCA 3AO1A 3SYZA 4CHOA 3PX0A 3THVA 1X9WA 3O4NA 4N41A 1VSLA 2YNFA 4F8RA 1XHZA 2HNDA 4CF1A 1IH7A 1WSEA 3AVJA 4AHSA 1XI1A 2BDPA 2DFHA 1C0TA 3DOLA 5DMRA 1QSYA 3PO5A 4FK2A 4DFJA 2RN2A 4KFBA 1C6VA 1RT1A 4C8MA 3NH1A 2G8FA 3RR8A 4PQUA 4CEZA 4Z4IA 3KJVA 2DFFA 4XIUA 4DLEA 4B9MA 4FZYA 2KFZA 4Y1CA 2VG5A 3HL8A 4NYFA 5KTQA 3HVRA 2PY5A 1I3AA 1JL1A 1WSIA 4MFBA 1EX4A 3MEDA 4DSIA 4BDPA 5JS2A 1D5AA 4CJSA 3HPHA 4CGHA 4EP4A 1HJRA 3OJSA 3SZ2A 3AVFA 3V9UA 3VQ4A 3LWMA 4E7IA 2HHWA 2IOCA 1C1CA 3NBPA 3O3GA 4NCAA 5HBMA 2HHXA 1A5WA 4CHNA 4FLYA 4CIEA 1WSJA 4NYNA 4W5RA 4JLHA 1WSFA 1W0HA 4BDYA 3EZ5A 2OPPA 3T19A 3SUPA 4CCHA 2X74A 3ZSQA 4KAZA 4W5NA 2G8VA 3HPOA 3NH2A 3MXJA 3V9ZA 4KV8A 4KRFA 3QESA 3OYMA 3K57A 4N76A 1RTIA 2BE2A 4CEDA 3AA5X 3LAMA 3KLEA 4PY5A 3RMAA 3HK2A 4OLBA 1U04A 1YTAA 1ASVA 1NK0A 4KHQA 1J53A 2F8SA 1BCMA 4DTJA 4DTSA 3DYAA 2QK9A 4CJKA 1VRUA 4FLXA 1FKPA 3OYIA 3TANA 1RT2A 2DFEA 3VQPA 3EY1A 2P5OA 4K8ZA 2ZE2A 3NGYA 3SUOA 3S3OA 4IDKA 1Z25A 2Y1IA 3PX6A 4CJ4A 4IG3A 4I9QA 3OS1A 3CFPA 1RDBA 1ZBFA 4DSFA 4L8RB 4I9LA 3DRRA 4B9SA 4DTRA 4KI6A 4Z4CA 2YKNA 1RBUA 4LD0A 1TK0A 1DLOA 4FLZA 1Q9XA 1C0UA 1KRPA 1VK0A 2HHVA 4KB0A 4DFMA 3JYTA 4KTQA 3O4QA 1T03A 3AVHA 2G8KA 1VSFA 3KIOA 1B9FA 5SWMA 4E7HA 3OYAA 3RWUA 4W5TA 2RF2A 4Q0BA 1SKWA 4KTWA 3SNNA 1VSKA 1TGOA 2OPRA 2RPIA 3S9HA 4J2AA 2OYQA 4QOZB 2Z1JA 1KTQA 4AHCA 2AJQA 3OYKA 3V1OA 1S1WA 3VQCA 3H08A 1EKEA 1F21A 1BI4B 1RBVA 4WE1A 3PX4A 3RR7A 3KLGA 3VN5A 3TAGA 4DTPA 4DFPA 1C0MA 3VQ5A 5HRNA 4Q5VA 1J5OA 4O55A 4DQPA 1IKXA 4G1QA 3QEIA 5HRPA 4CJEA 4EP5A 4CJFA 1VSHA 3PUFA 4R5PA 2A1SA 1J9AA 1S1UA 1B92A 1TKDA 1T8EA 3IS9A 3VQ7A 4CFCA 3FFIA 4CJPA 2I5JA 4RW9A 4DTOA 1ITGA 1HNIA 3DLGA 1QS4A 4EZ6A 3VQDA 4M3UA 3S3NA 4KREA 4H8KA 1HYVA 2GV9A 1SL2A 1L3UA 1FKOA 3AVMA 1BGXT 3KLIA 3V9XA 2YHAA 1YT3A 4FW2A 3LP1A 1EXQA 4FLVA 1ZBIA 3M8RA 4AHTA 2YNGA 4M3XA 4DSJA 1KVBA 4DMNA 4AILC 3I8DA 4E3SA 1T7PA 1BI4A 1S9EA 4CFDA 1ASUA 3B6PA 2IC3A 2GUIA 3WNGA 4CK2A 4ELTA 4FZXC 3OYNA 3OJUA 4CHPA 2HMIA 4FJIA 1LAVA 1WLJA 4BWMA 3HPGA 3ZT3A 1KFSA 5HRRA 1MU2A 2NUBA 2WONA 2P51A 3B6OA 3VQQA 1KVCA 3QETA 1QSSA 4H4MA 3HYFA 4O5BA 3TARA 3DM2A 4FK4A 3CYMA 2O4IA 4PWDA 1U49A 1HYZA 2ITGA 1LV5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JI5K 4KPYA 3AVGA 5E26A 1OH8A 4V19S 3P31A 4FWPA 1S1TA 3QIPA 4JRQA 3CCJN 5GAHP 4EHTA 1WN7A 4DV6K 5GAEP 3K9JA 4BR4A 1X1PA 2P9KA 3TAQA 3J80O 4KO0A 4DV7K 5KGXA 3TPQA 3OTOK 2NRTA 4H5RA 4IFVA 2QXFA 1BWFO 3KKSA 1K9MO 4OKEA 4WF9L 3VQ9A 4FWMA 3QICA 1S5JA 2E6MA 5AFUH 5BPLA 4GV6A 3HM9A 2QA4N 1TL3A 1W97L 3A5MC 4PL7A 1JCGA 4XH4A 1BU6O 1MWKA 4NXNK 4DV4K 3SPYA 3OYDA 1T05A 4DFKA 4FJGA 4EHUA 1GLBG 2ZD1A 1QQOA 4JKDA 4DR3K 3CC2N 1LW0A 4Z94A 3PLAA 3BF1A 5TKYA 1NG9A 3OS2A 3QEWA 3A5LC 1JL2A 1BISA 3D6RA 3C94A 2KTQA 3PIOL 3VA3A 2P9IA 3MEGA 2ZGYA 3O6WA 4FM0A 5D3GA 2ZJPL 3S41A 3FE1A 2WTUA 3VQEA 3VQBA 3OYEA 5M1NA 1TYQB 2E88A 2CH6A 1NJZA 2HHQA 3SPZA 1ZBSA 3L6QA 1BOTO 3UB5A 4JKEA 5ADXH 3NGIA 1RDCA 1JLFA 5LJVA 3TWHA 4J8FA 5K14A 4B9NA 3BZKA 4FW1A 3NGZA 3UIQA 3NF7A 5C25A 3AVBA 2O8BA 3IDHA 4OGCA 3DXKB 4IZ9A 5AQXA 3WNEA 2UXCK 3CFOA 1XC9A 5CZ2A 4LY7A 5CYQA 1UA1A 4LF4K 3FGUA 4NLBA 4JD2A 1XNQK 4M3ZA 4A59A 1C1AA 5C24A 4BG8A 4IG0A 2GEMA 1D8YA 1HNZK 1LOTB 3EL2A 4RW4A 4B9LA 4A5BA 1GLCG 4DKWA 5T7BA 1WSHA 4FOIA 1RTHA 3QDKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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