2E6LA

Structure of mouse wrn exonuclease domain
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Hydrolase
total genus 60
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6lA00
4CJ5A 1RT3A 3DOLA 3OVNA 3ZT1A 3MXMA 1J5OA 4CEOA 2JGUA 1RBTA 4Y1CA 2EHGA 2FBVA 4ZHRA 3TAEA 4HCBA 4CF0A 3KLHA 3WNGA 4RW9A 1NKBA 4FK4A 2HHXA 3K5LA 2RN2A 3SCXA 4FLZA 3AO1A 4LH4A 3ZSZA 3OYIA 4OGEA 3PX0A 3NBPA 1QQCA 1IKWA 4CJWA 4DFKA 3QEIA 4IFVA 3UIQA 1HYVA 4DS4A 5JS1A 3VA0A 1G15A 3ZCMA 4KV8A 4EP5A 1GOAA 1TVRA 1TV6A 1REVA 2X74A 1IG9A 4FJ8A 3B6PA 4O5BA 5DMRA 2XO7A 2HNZA 2FBYA 3VQAA 4DTMA 5HLFA 2ZD1A 3LAKA 1D9DA 4FJ5A 1N5YA 4FW1A 3AA4A 4B9SA 1RCHA 3V1RA 4IKFA 3ULDA 3OYFA 3IAYA 4DSJA 3K5MA 1L3TA 2IGIA 4E19A 3LP2A 2D0BA 3M8SA 1NKEA 4KHNA 3DOKA 4DS5A 4HTUA 2B4JA 1T8EA 1LAWA 2OPSA 4HVJA 1HQEA 3DYAA 3KD1E 4E7LA 5KTQA 4B3OA 2DFFA 1FK9A 4DTUA 2F8SA 1RT5A 3QLHA 4CJQA 3ZSOA 1C1AA 1LWFA 1HNIA 1LW2A 3QO9A 3AVMA 4F2RA 1VSMA 3AVHA 3OYJA 3SUPA 4CF2A 1NJWA 3NH0A 1RBSA 5K14A 4C8LA 3HYFA 2HB5A 3NF6A 4CFBA 2HHTA 3P1GA 3TAGA 3V9XA 3VQ4A 1DLOA 4CFAA 3AA3A 4E0DA 3T1AA 1S9GA 1W0HA 2EX3A 4HUEA 4DTPA 4C8KA 4I2PA 2F96A 3OYKA 4DQQA 1VSKA 4CEAA 5KGXA 4J2EA 1UOCA 1J53A 3I8DA 4DFMA 4DQPA 2Q3SA 4KTQA 5FRNA 4Q0BA 3HPGA 3P5JA 4KTZA 3VQBA 4CEZA 1ASWA 2WONA 3EYZA 4WE1A 3WNEA 3H08A 3M8PA 3DRPA 2HVIA 4FM0A 4O4GA 1ITGA 3P83D 1WSGA 4BACA 3VQEA 1BHLA 2IS3A 2R7YA 4DQSA 4W5RA 1VSIA 1IKVA 4B9VA 4LD0A 2ZE2A 4N56A 5I3UA 3QEPA 3DM2A 3S3MA 4Y1DA 3U3YA 4KB1A 1J54A 1BIUA 5J2PA 1UWBA 4CJPA 1X1PA 2LSNA 1B9FA 1Q8IA 3NGYA 4H4MA 3TARA 1BGXT 1RBVA 2KQ2A 1RTDA 5J2QA 3ZT0A 1VSJA 2G8VA 1TK8A 1NK4A 3SUOA 4CEFA 3HXMA 3KKRA 3DLGA 3KD5E 4CJKA 4FJGA 3SPZA 3DLRA 1TK0A 1B9DA 3AVJA 3OYCA 1HMVA 4LSLA 1SKWA 3TABA 1SUQA 1QSLA 4RW4A 4KI6A 3L2RA 4PQUA 4O0JA 1BI4A 4NCAA 1BCMA 1EP4A 3ZSVA 5SZTA 4CJTA 1C0TA 3KLFA 4FJXA 2FBTA 3EZ5A 3NGZA 1RBUA 1SKRA 1D9FA 2VWJA 4QOZB 1EX4A 3PV8A 3LZJA 2YKNA 3TI0A 1C6VA 1HQUA 2P51A 4OKJA 1S5JA 3L2QA 3NE6A 3AVAA 4ELUA 4CF8A 4CCHA 2Z1GA 4FJNA 4HCCA 2ATQA 3L2VA 5CY4A 2YNGA 4DSKA 1TL1A 4XIUA 2OPQA 3MXIA 5C25A 2Z1HA 4DG1A 4B9UA 3DLHA 3OYLA 4JS4A 2KTQA 2FC0A 3CQ8A 2YNFA 3QEVA 4O0IA 3PUFA 4GVMA 3OYDA 2X78A 1JLQA 1ZBIA 1LW0A 1FKPA 4YFUA 3PY8A 4E7KA 2VG7A 1LWEA 2VWKA 1T03A 4KB0A 3QNNA 2W42A 3ZSWA 2HHUA 4DTXA 4FW2A 2E4LA 1BQNA 4NCBA 2IAJA 4CJ4A 1TGOA 3SQ4A 3SQ0A 1NJXA 2HW3A 2XY6A 1NKCA 1ZBFA 2Y1JA 3CFOA 3RRGA 4FJKA 5DK5A 4FJLA 3DLKA 4KREA 3OYEA 3HK2A 1NOZA 4CJSA 2PYJA 1UA0A 4FLVA 3DRRA 1ZBUA 5CZ1A 3OYNA 3RMAA 2OZMA 4R5PA 3DI6A 2P1JA 1NJZA 3PO4A 1JLFA 1LWCA 3AO4A 1XC9A 3QERA 1HJRA 1QE1A 1RDBA 1X9MA 2OYQA 2HNDA 3LZIA 2X6SA 3QINA 2DTUA 1S1WA 3LAMA 3OYAA 4E7JA 4W5TA 1JLBA 3HO1A 4RW8A 5C24A 4DWIA 3S3NA 1NK8A 4FJ7A 2IC3A 1CLQA 1VSDA 3LANA 3C94A 4LSNA 5KRTA 3HPOA 1C1BA 1WLJA 1U4BA 1TKZA 2JLEA 4M45A 4DF8A 4DQIA 1LV5A 1T05A 4FZZA 2D0CA 1BISA 2Y1IA 4DU4A 4DSLA 3VQ6A 4AH9A 4CFCA 1EETA 3LP3A 1TKXA 3V1OA 3V1QA 3QESA 5HP1A 1U49A 2XY8A 3LPUA 1T7PA 3AA2A 4MQ3A 1WNSA 4JS5A 3RMBA 5I42A 3ITHA 1ASUA 1RDCA 3OY9A 1U48A 2DFHA 4CGJA 4FM1A 1Z25A 2XHBA 3K5OA 3AO2A 2E6MA 1VK0A 2RKIA 3VQCA 2GUIA 3IG1A 2G8IA 4CGGA 2PY5A 3TAMA 2XRIA 4H4OA 4CEQA 1BIZA 3MEEA 2IDOA 4BE1A 2P5OA 4DSIA 4PUOA 2D5RA 3G10A 4KI4A 4BDYA 2OPRA 4IBNA 2YHBA 4OPKA 4Z4IA 1TL3A 3CFRA 3SQ1A 1LAVA 5HBMA 3NH1A 1NK0A 1ASVA 1EXQA 4CEBA 2IOCA 1S9EA 5E41A 4B9NA 4KPYA 3A2FA 3HSTB 4RW7A 2G8FA 3OYBA 3MEDA 4CFDA 2D0AA 5HROA 3RR8A 4I9QA 3AVFA 3HP9A 3KK3A 1Z26A 2B6AA 5KGWA 4KAZA 3HL8A 2F8TA 4FM2A 1D5AA 4FLWA 4Z4EA 1S1VA 4H8KA 1Q9XA 4KKOA 3TAFA 4CHQA 1RDAA 1BL3A 3TWHA 1GOCA 3SQ2A 4M3UA 4F3OA 1ZYQA 4CHOA 1NOYA 3I0RA 1EKEA 4HUGA 1TKTA 4ID5A 1JL2A 1NK6A 1D8YA 3V6DA 5FRMA 3AO5A 4OVLA 4E1NA 3LP0A 4CK3A 1Y97A 1VSHA 3RR7A 4CGIA 4FVMA 4CGDA 4CK1A 4CHYA 3NAEA 3U6FA 4PY5A 5KRSA 3SNNA 4CEDA 3L8BA 3RRHA 1KVAA 3ZSYA 4BDPA 1A5WA 5CYMA 4FXDA 1QSSA 2B5JA 3OYGA 4C8OA 3HPHA 3OYMA 3OYHA 1NK7A 3AVCA 4HUFA 3G0ZA 3SV4A 4E3SA 4J2DA 3KLEA 2KZZA 3KLIA 3K57A 4GMJB 1VRUA 3CM6A 1I39A 2DFEA 3IS9A 5J2MA 1QTMA 2KFNA 1W9HA 2FBXA 3HVRA 2A1RA 4CGHA 4CECA 1U47A 4B8AB 5J1EA 4FJMA 3HT3A 3MAQA 4OJRA 4KFBA 4ELVA 1WSFA 2YKMA 1KCFA 3U3GA 1S6PA 4M42A 1CZ9A 3E01A 4FJIA 1S1UA 1WAJA 4AHSA 2GBZA 1K6YA 3IRXA 3ZT3A 1VRTA 2X6NA 3KK1A 5HRSA 4FLYA 5JS2A 3OS1A 2Z1IA 3OS2A 1JKHA 3AVNA 4IFYA 4YNQA 1X9WA 3HVTA 3C95A 3NGIA 2QK9A 4CJVA 3K59A 5CZ2A 3ZT2A 4CJEA 1HRHA 4K8XA 4FLUA 3OJUA 3O3GA 4CESA 2RPIA 1QS4A 3AVLA 3OJSA 3RTVA 3ZSQA 5FDLA 4CE9A 3RWUA 2DY4A 4ID1A 5KI6A 4W5NA 3QETA 1X9SA 5FROA 1L5UA 3NF7A 3VQPA 2YHAA 4CHNA 3KKSA 4NCGA 4FJ9A 4F3TA 1S1TA 1I3AA 4DTJA 1SL2A 3SPYA 1KRPA 4M3RA 1HPZA 4KHYA 4JRQA 3K2PA 3B6OA 4CHZA 2BDPA 1B92A 4FJHA 1WSJA 3TR8A 3DRSA 1GOBA 3MXJA 4AILC 1XI1A 3VQ5A 4DFPA 2Z1JA 3M8RA 3L3UA 3TAPA 2OPPA 3AA5X 3VQQA 4AHVA 4F4KA 2RF2A 3ISNC 2P5GA 2HVHA 3AVBA 1XHXA 2BE2A 3MEGA 3DLBA 1BI4B 3SJJA 4B9LA 3O4QA 1XWLA 1KFSA 4OPJA 3S3OA 1C0UA 1RNHA 2HHVA 3LDSA 2HNYA 4TSXA 4CJLA 4DMNA 5T7BA 4OGCA 4E1MA 1L3UA 4OKKA 1TKDA 3SUNA 4N5SA 4DLEA 2G8KA 2KW4A 4CJRA 3C6TA 1YT3A 2QKKA 3MECA 3V81A 4N41A 3D45A 1L3VA 1SL1A 4KHUA 4DFJA 3RMCA 4DSFA 3QEWA 1NJYA 3K58A 4M3WA 5J2NA 3NHGA 1JXBA 1YVUA 3CG7A 2HHQA 1JLCA 3VN5A 4IDKA 3L2UA 1WN7A 4F8RA 1JL1A 1IKYA 2HHSA 4I7FA 4O55A 1UAXA 2E6LA 4DSEA 1RT1A 3BDPA 4KHWA 4Z4FA 3ASMA 1S1XA 3VQDA 3NDKA 4J2BA 3AV9A 4NYFA 3NCIA 3V4IA 4QAGA 4E7IA 4FK0A 4PWDA 2AJQA 1IH7A 4Z4GA 5HRRA 1DTTA 3LWLA 2G8WA 1MU2A 4DU1A 4B9MA 1RTHA 2WOMA 1KLNA 2ZQBA 5D3GA 1NK9A 1SL0A 4ZTJA 1QHTA 3D0PA 1HYSA 4DU3A 2A1SA 2YNHA 3SV3A 4B9TA 4AHCA 3TANA 4O44A 3V9SA 4W5QA 4W5OA 3M8QA 4CGFA 3NF8A 4FZXC 1YTUA 4CIFA 1RTJA 3I0SA 3V9ZA 3LWMA 4JLHA 4M3YA 4C8NA 3NH2A 2ETJA 4AHTA 2PZSA 3K5NA 4F2SA 4OLAA 3NFAA 4LY7A 1TAUA 4CERA 3VQ8A 2YNIA 4DTNA 4G1QA 4EP4A 4E89A 4EZ6A 4Z0UA 1U04A 4FYDA 3KTQA 3NF9A 3ZSXA 3OS0A 3VA3A 1Q9YA 3VQ9A 4M3ZA 4DQRA 3T19A 4JRPA 4E7HA 1KLMA 2GV9A 3DLEA 4IG3A 3DMJA 1S6QA 4ELTA 1IKXA 1CXUA 3AVGA 2I5JA 1BQMA 3KIOA 3SI6A 1IO2A 4N76A 4MFBA 1DTQA 3LPTA 5SWMA 4DTSA 4DLGA 1F21A 3LP1A 3AVIA 2NUBA 1RT4A 4C8MA 4CIGA 4M41A 1ZBLA 3QIPA 1WAFA 2VG6A 2OA8A 4CJ3A 1RT6A 2O4IA 1FKOA 4I2QA 2YV0X 1XHZA 4I9LA 4CJUA 1BCOA 1A5XA 1C1CA 1JLAA 1VSFA 3KLGA 1ZBHA 3THVA 1JLEA 4QCLA 3L3VA 2KFZA 1RDDA 1RILA 3O3FA 1C0MA 2BGGA 1SV5A 4PA1A 3AO3A 1L3SA 3F73A 4BWMA 3O4NA 2QXFA 4GW6A 4BE0A 3LALA 3ALYA 4KO0A 1N6QA 3JYTA 4M3XA 4M3TA 3QIOA 1WSIA 3BGRA 3SUQA 4K8ZA 4CK2A 2HHWA 3RMDA 4N47A 3CFPA 4FLXA 2VG5A 4B8CA 1KTQA 4IG0A 4Q5VA 1HYZA 4LH5A 2HMIA 1KFDA 4CF9A 3HP6A 3AVKA 1JXEA 4KRFA 1YTAA 2O4GA 4Z4CA 4B08A 4AHRA 4L8RB 3PX4A 1CXQA 4CHPA 4ICLA 3PO5A 1SKSA 1O1WA 4CIEA 3QEXA 1RT7A 1KSPA 4CJFA 3T3FA 3HJFA 1A5VA 3WNFA 3PX6A 4KHSA 1TK5A 4CEEA 1UA1A 1VSLA 3WNHA 1U45A 2ITGA 2KZMA 3V9WA 1KVCA 4DF4A 2XY5A 1TAQA 1J9AA 4FCYA 3ZSRA 5C42A 2QKBA 4BDZA 3QNOA 4ZTFA 3CM5A 3VQ7A 4UQGA 4NYNA 5HRPA 4AHUA 5CYQA 1HNVA 4FJJA 3V9UA 1RT2A 1CZBA 3L2WA 3KK2A 3F9KA 4RW6A 1WSHA 3C6UA 3FFIA 1VSEA 4KTWA 1JLGA 4CF1A 2G8UA 1WSEA 2PYLA 3EY1A 3SYZA 4OKEA 4J2AA 4FLTA 1R0AA 2G8HA 4OLBA 3KJVA 4FK2A 1RBRA 4BE2A 5HRNA 1NK5A 1FXXA 3HM9A 4KHQA 1QSYA 3TAQA 4HHTA 4DTRA 4RG8A 3S9HA 3JSMA 2OZSA 3ZT4A 2XY7A 4EZ9A 3O3HA 1KVBA 4BWJA 3SZ2A 4DTOA 5EU7A 3CYMA 4FZYA 2BANA 4Z4HA 1RTIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJ5A 3VGLA 4JI0K 4ZHRA 3VTIA 3THWA 2HHXA 4OPAA 4FWLA 2RN2A 1NU0A 3GL1A 2JWKA 2YI1A 4DFKA 1HYVA 1G15A 1X9JA 1GOAA 1JCGA 2X74A 4FL9A 3E9OA 4IDHA 4YOUA 4U7BA 1S72N 3O9TA 2FBYA 2ZD1A 3AA4A 2HHHK 1D4XA 4IKFA 3IAYA 3H46O 3OYFA 3VF4A 3SLCA 3LP2A 3M8SA 3E66A 4DS5A 1LAWA 2OPSA 1MDUB 1HQEA 4E7LA 4B3OA 5AQQA 4FVUA 4IEEA 3SK3A 3QLHA 4CJQA 4F2RA 1VSMA 4IEIA 3HYFA 2O8FA 3P1GA 5FPDA 3V9XA 5M1KA 1T6CA 3HOTA 4YOTA 3M5RA 1V4SA 4JKGA 2QWMA 4I2PA 4C8KA 3OYKA 3GE1A 4CEAA 4DV1K 2Q3SA 3CHWA 3K9JA 3P5JA 4CEZA 4WQ5C 2WONA 3WNEA 1VQ6N 5AQSA 1ITGA 3AAPA 4BACA 4A62A 4W5RA 4CJ7A 4EFHA 1QQNA 2ZE2A 5I3UA 4JKCA 2CGLA 4YDUA 4CJPA 3CJBA 1Q8IA 3NGYA 1RBVA 1Q7YO 1JJ2M 2KQ2A 3ZT0A 1TK8A 4ILJA 3SUOA 1HJOA 2ITMA 3KKRA 3SPZA 3DLRA 1TK0A 5E84A 3TSPA 4LSLA 3VEWA 3TABA 1SUQA 4PQUA 4O0JA 1BCMA 3ZSVA 1C0TA 3KLFA 4FJXA 3D6RA 4JKFA 1BUPA 4J8FA 1RBUA 3BEXA 2VWJA 3FFKB 4ELUA 1HQUA 2P9IB 1K8KB 1S5JA 3L2QA 4KH5A 4A2AA 5AQPA 2QI2A 1XUPO 4FJNA 1TL1A 3MXIA 5GADP 4DUYK 4DG1A 4JS4A 2V51B 4FOEA 4O0IA 3PUFA 1ZBIA 4WQ4A 4E7KA 3DJCA 4KH4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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