2E6LA

Structure of mouse wrn exonuclease domain
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
total genus 60
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6lA00
2VG7A 1LAVA 5T7BA 4R5PA 2PYLA 1RDAA 4CEFA 4DLEA 4CK1A 4NYNA 3C6TA 3CFPA 4CJ5A 4KHSA 4EZ6A 4B9SA 3DOLA 4J2BA 4CECA 3OYCA 3LZIA 3SV3A 3AO1A 3SPZA 2HHTA 5FRNA 3MECA 3QEPA 2HVIA 4OKKA 4AH9A 4CHOA 1ASWA 3HSTB 3KLFA 2FBXA 3CM5A 4DTRA 3ULDA 4DTOA 3TAGA 2HNZA 1NK5A 1SKRA 3LWMA 4FJIA 3VQAA 4W5OA 4BWMA 5D3GA 3LZJA 4ZTFA 4RW4A 2G8VA 4FJ9A 4CF8A 5JS1A 3V9XA 3NDKA 2HHXA 4E7IA 3F73A 3NH0A 1RDBA 3TARA 2XRIA 3IAYA 4QCLA 4HVJA 4CEEA 4IFYA 3IG1A 3JYTA 1LV5A 2D0CA 4DFMA 4B8AB 4B3OA 1VSFA 3K2PA 5J2QA 1NK8A 4ICLA 3AA2A 3WNGA 4CGIA 1YTAA 4KV8A 3UIQA 1TVRA 2BANA 4E3SA 3BGRA 3LP3A 3U3GA 3TAPA 4Q0BA 1CXUA 1XHXA 4FLWA 1VSDA 4O4GA 4CGJA 4CIFA 3KLEA 2XO7A 2ZE2A 4DSFA 3CQ8A 1MU2A 1RT7A 3FFIA 3PY8A 1QSLA 3ISNC 4JRQA 3VQQA 1S1UA 1UWBA 3HO1A 3NCIA 3O4QA 4CIGA 2KQ2A 4JRPA 4PQUA 2O4IA 3OYFA 2WONA 2YNFA 5KGXA 5CZ2A 4KPYA 4M3TA 3PX4A 3M8PA 4KHUA 4FLTA 1ZBIA 4FJ7A 4CJSA 3SQ1A 1HYZA 4E0DA 1GOCA 1JLAA 1IH7A 2LSNA 1VK0A 1D8YA 3KK3A 2Z1GA 4OKJA 4DTJA 3O3HA 1JLGA 4OKEA 1WNSA 4DLGA 1Q9YA 1RT4A 4N41A 3V1OA 1WSFA 1CXQA 1X1PA 1VSHA 5CYQA 4OPJA 4FM2A 4FZXC 4FXDA 3AVCA 2ITGA 4G1QA 4F3TA 4DSLA 4KHYA 2QK9A 5KI6A 4KRFA 4ELTA 1X9MA 1RT2A 1CZ9A 2E6LA 2ZD1A 3ZT3A 2B4JA 2IGIA 2IC3A 5C24A 4B9VA 4CJLA 4KHQA 3V6DA 3NGYA 1DTTA 3HL8A 4H4MA 3TR8A 4N5SA 4FJNA 3LP0A 1BIUA 3RWUA 3VQDA 1S1TA 3T1AA 3L2QA 1TGOA 1FKPA 1JLQA 3K5MA 4MFBA 2X74A 2YNHA 3ZT1A 3EY1A 3U6FA 2G8FA 4DU3A 1WAJA 2PYJA 1VSEA 1BQMA 4LSNA 3L2UA 1IKYA 4B9TA 5J2PA 5HROA 4FZZA 3DM2A 3D0PA 2QKBA 4CHNA 3O3GA 4NCBA 1YTUA 4C8NA 3BDPA 3CM6A 4QAGA 3THVA 4KTWA 1KFDA 1QE1A 5JS2A 4YNQA 1T7PA 5KGWA 1TK0A 1B9DA 1ZBUA 3DOKA 4AHVA 3M8RA 1NK4A 2AJQA 4DTUA 1RT1A 1SKSA 1DTQA 3HYFA 2E6MA 4N56A 3KK1A 4FJGA 4I9QA 4J2DA 3QEWA 1JL1A 3TI0A 1J53A 4FK4A 4DQSA 4M3YA 1HJRA 2P1JA 1WSEA 4DF4A 4K8ZA 4CJTA 3V1RA 1NK7A 3DYAA 1LAWA 3K57A 4FJLA 4CHYA 1VRTA 4OJRA 3LPUA 3SQ0A 2Y1JA 3V81A 1Z25A 3AO3A 3DRSA 3NHGA 3ZSZA 4CJ4A 1X9WA 1KLNA 4CCHA 2HHWA 1ASUA 3HT3A 1JXBA 5KRTA 4CF0A 4CEQA 1VSLA 1TK8A 3AA3A 4MQ3A 2RF2A 4W5QA 3MXIA 1U47A 3NH2A 1NKCA 1L3UA 5J2NA 3RMCA 4FJJA 3VQ9A 1O1WA 1RDCA 2KTQA 1BGXT 2A1RA 4KI4A 1A5WA 3CFOA 5CYMA 4BACA 1IKWA 1SL1A 4CEDA 4KHNA 4FK2A 4DMNA 1GOAA 3LP2A 4IG3A 2QKKA 4RG8A 3KD5E 2P5OA 4O44A 4CFCA 4DQRA 2YKMA 3ZT0A 4E7KA 1HNIA 2YHAA 1Y97A 4LY7A 4NYFA 3U3YA 5HLFA 2BDPA 2PZSA 3TABA 5FRMA 1JLEA 4Z4IA 1HYSA 2G8WA 2BGGA 2E4LA 3V9SA 1JL2A 1S6QA 5SWMA 4E7HA 4E1MA 3L2RA 3JSMA 4CF9A 3KTQA 4M3UA 4CJVA 1NJYA 2HHUA 3AO2A 3HJFA 5FROA 1C0MA 2VWKA 3AVHA 2F8TA 4GVMA 3ZSRA 3VA3A 3AA5X 2HHSA 3NBPA 4CE9A 1SL0A 4TSXA 4K8XA 4AHTA 2RPIA 3MXJA 1KVBA 4LH5A 3VQEA 1VSMA 4NCGA 3VQ5A 3I8DA 3OS0A 3DRPA 4DQQA 1S1WA 2DFFA 3QERA 4CERA 1N5YA 3SYZA 2YNGA 3NAEA 1S1VA 5KTQA 2RKIA 3TANA 5CY4A 4B9UA 3KK2A 4HUEA 4HCCA 5J1EA 4BWJA 1TKZA 5C25A 4M45A 1BL3A 1RTJA 4W5TA 3ZSVA 1RILA 1QTMA 4OPKA 3HPOA 1HPZA 1NJZA 2IS3A 4FJXA 3HK2A 3QO9A 1BI4A 3RRHA 3WNFA 1C1AA 4CGDA 2KZZA 3MXMA 3DLHA 4RW6A 4CGFA 1FXXA 3KKRA 4LD0A 1TAQA 3L3UA 3C6UA 4FW1A 1SUQA 2HW3A 3AVBA 4FJHA 3K5NA 3NH1A 5SZTA 4W5RA 1JLBA 1C6VA 3VA0A 4M3ZA 3HPGA 1S5JA 3KIOA 3OYKA 1IKXA 1RTIA 1LWEA 4CFBA 4CHPA 3SJJA 2HNDA 4BDYA 4M41A 2DFHA 2G8UA 2DY4A 3ASMA 1Q8IA 3ZSOA 4AHCA 2XHBA 4FM1A 3KLGA 4E7LA 1L5UA 2NUBA 3RRGA 1WSJA 4FLVA 3P1GA 1JLCA 3OYNA 4ELUA 1TKTA 1W0HA 1YT3A 2PY5A 2X6NA 2D0AA 2KFNA 1S9GA 2F96A 1JLFA 3T3FA 4PY5A 4FYDA 3KD1E 1UOCA 4DTPA 4AHRA 4FJMA 4IBNA 2A1SA 1VSKA 1S6PA 2JGUA 3M8SA 4HCBA 3EZ5A 3L8BA 4DQIA 4FW2A 3SV4A 2VWJA 1QQCA 1REVA 1HYVA 1RTHA 3AVLA 3MEGA 1NK0A 2D0BA 4Y1CA 1BISA 2B6AA 4EP4A 1RT5A 3P5JA 3OYGA 2XY5A 4I7FA 4DU4A 3SUQA 3RMBA 2BE2A 1KVAA 3S3MA 5HBMA 4H8KA 4RW8A 2YKNA 4OGEA 3VQCA 1ZBHA 4DFJA 1D9DA 2HMIA 3NGIA 3ZCMA 4L8RB 3HVTA 4OVLA 3OYIA 1D9FA 4KKOA 2OPSA 3DI6A 4I2QA 4WE1A 3HP6A 4FLXA 1C0TA 5KRSA 2IDOA 3CYMA 4FLZA 2B5JA 5I3UA 4Q5VA 3TAQA 2HHVA 1U49A 4IG0A 1KFSA 3OS1A 4FJKA 3PO5A 1XI1A 1EETA 4E7JA 2W42A 5K14A 3AVFA 1F21A 1TKDA 4KO0A 3TAFA 1B92A 4IKFA 3RMDA 1LWFA 4O0IA 4JS5A 3OY9A 2OPRA 1XWLA 3S3NA 4F4KA 3RTVA 2OPPA 3MEEA 3OS2A 3V4IA 3SUPA 2ATQA 4ID1A 4JLHA 1HQEA 2HHQA 1C0UA 1IO2A 3C94A 4FJ8A 3ZSWA 3NF8A 4DFKA 4XIUA 4DSIA 1KSPA 4J2AA 1WAFA 1HNVA 3OJUA 4M3RA 4YFUA 3L2WA 5HP1A 1EX4A 4OGCA 3AO5A 2FC0A 5C42A 3PV8A 1A5XA 1RCHA 1NOZA 4JS4A 3TAEA 3ZSQA 4BE1A 1UA1A 4FZYA 4Z0UA 1RBSA 1RT3A 2WOMA 4KI6A 2GUIA 3KLHA 3P83D 3VQ4A 4H4OA 4CJFA 2G8KA 4CEZA 3O3FA 3AVIA 1J9AA 4N47A 4LSLA 1VSJA 4AHSA 1QHTA 2XY8A 1VSIA 4CEAA 3V9WA 1YVUA 1U45A 1RTDA 4BE2A 1JXEA 4DG1A 4DU1A 4E89A 1Z26A 1I3AA 2F8SA 4F2SA 3NE6A 4B08A 3RMAA 1VRUA 4KTQA 4CK3A 1ITGA 2EX3A 3AO4A 3VQ6A 4F3OA 4E19A 3PX0A 1HQUA 2O4GA 4NCAA 2EHGA 1U04A 3AVJA 4BE0A 3VQ8A 3OYMA 3VQ7A 3DLRA 3AVAA 3HM9A 2OA8A 4LH4A 1BIZA 3LPTA 4CGHA 4C8LA 1TKXA 2VG6A 4I2PA 3PUFA 4RW7A 3NF6A 3ZSYA 4UQGA 2HVHA 2DFEA 4DF8A 1TL3A 3LAMA 3AVGA 1KLMA 4CESA 3NFAA 4FK0A 1RBRA 3OYLA 3QEVA 4CJEA 2OYQA 4KHWA 3QIOA 1WSGA 1J54A 3ZT2A 1KCFA 3LANA 2FBVA 2XY6A 3QNOA 3F9KA 3EYZA 3TAMA 3M8QA 3NF7A 5HRPA 1S1XA 4O5BA 4PA1A 4HUGA 4DS5A 2YV0X 5E41A 2DTUA 1RDDA 1U4BA 3V9ZA 4CEOA 1CLQA 1X9SA 4DQPA 3DRRA 4KB0A 4ELVA 1B9FA 1G15A 5DMRA 3SI6A 3OVNA 4CJRA 3DLBA 3K5OA 3AVMA 4PUOA 1IKVA 1EKEA 1HRHA 1LWCA 2IOCA 4IDKA 2ZQBA 1K6YA 4OLBA 4Z4CA 3AV9A 1RBTA 3LAKA 4CEBA 1UAXA 5CZ1A 1T8EA 1EP4A 3SPYA 1QSYA 3H08A 4QOZB 1L3VA 1RNHA 1BCOA 3OYBA 1W9HA 4CJWA 3WNEA 4CJPA 3TWHA 4O0JA 4FVMA 1SL2A 4M3WA 1L3TA 1SV5A 3B6PA 1EXQA 3WNHA 1SKWA 4ID5A 1TV6A 3T19A 1NK9A 4CGGA 1TK5A 5J2MA 3SZ2A 3QLHA 3PX6A 3SUOA 4CJQA 1WN7A 3K59A 4HUFA 4Z4EA 2XY7A 4BDZA 3LALA 1BHLA 4DWIA 5EU7A 4CF2A 3HVRA 1NKEA 2GBZA 2IAJA 2Z1IA 3NGZA 1FKOA 2RN2A 2YNIA 1RT6A 4C8MA 4AHUA 1UA0A 1XC9A 2Z1JA 1C1BA 4CHQA 1L3SA 4J2EA 1A5VA 3ZSXA 4B9MA 1ZBFA 4FLYA 4DS4A 3RR8A 4B9LA 4M42A 3KKSA 3DLGA 1WLJA 2KW4A 2X78A 5HRRA 3SUNA 2OPQA 4IFVA 4ZHRA 1RBVA 3AA4A 4RW9A 1U48A 1S9EA 3KLIA 3LDSA 3OYJA 3MAQA 3MEDA 4CJUA 3QEXA 2OZMA 3SQ2A 4HHTA 2I5JA 4DSEA 3E01A 1ZBLA 4PWDA 4DTMA 5HRNA 3OYEA 3ALYA 3AVKA 4DTNA 1NOYA 2KFZA 1KTQA 3B6OA 4HTUA 1T03A 2Y1IA 4C8OA 4F8RA 1ZYQA 3L2VA 2D5RA 3I0RA 4KB1A 2X6SA 5FDLA 2YHBA 3HP9A 2HB5A 4ZTJA 2G8IA 5I42A 3VN5A 4CJKA 3QETA 4EZ9A 3G0ZA 4CF1A 2HNYA 3AVNA 1CZBA 3HPHA 1LW0A 1DLOA 4KTZA 4CFDA 2R7YA 3OYHA 1ASVA 2G8HA 3SCXA 1KVCA 3RR7A 3DLEA 4DTSA 4BDPA 3K5LA 3HXMA 3ZT4A 1NK6A 3L3VA 1TL1A 1T05A 1NJXA 1JKHA 2GV9A 3V1QA 2KZMA 3QEIA 4FM0A 4OLAA 4W5NA 3CFRA 3S3OA 3CG7A 4CFAA 4E1NA 3QNNA 1R0AA 1BCMA 3K58A 4M3XA 1XHZA 4C8KA 4KREA 3QIPA 3DMJA 2ETJA 3LWLA 3I0SA 3S9HA 1NKBA 1KRPA 1J5OA 5DK5A 3NF9A 3OYAA 1NJWA 4DSKA 4EP5A 4FCYA 1BI4B 3G10A 3OJSA 2JLEA 2OZSA 4DSJA 1WSIA 4Z4FA 4Z4HA 3SNNA 4FLUA 3KJVA 2P5GA 3QESA 3SQ4A 3C95A 3VQPA 4N76A 3OYDA 4AILC 4GW6A 3ITHA 1N6QA 4Z4GA 3A2FA 1HMVA 2QXFA 2P51A 1I39A 2FBTA 1D5AA 2FBYA 4I9LA 4KAZA 1RBUA 3LP1A 3VQBA 1IG9A 2VG5A 3O4NA 4DFPA 4B9NA 1C1CA 1TAUA 4CJ3A 4DTXA 3D45A 3PO4A 1FK9A 1Q9XA 4FJ5A 4Y1DA 2Z1HA 3DLKA 3IRXA 3IS9A 4F2RA 4B8CA 1QSSA 4CHZA 1LW2A 1QS4A 1WSHA 5HRSA 1BQNA 2Q3SA 4GMJB 4KFBA 4O55A 4CIEA 4CK2A 3V9UA 1GOBA 3QINA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QICA 4WFNL 4R5PA 5LMNK 3TTFA 1RDAA 5C2FA 4DLEA 4CJ5A 2P9NA 4EZ6A 4KHSA 4CECA 3SV3A 5FRNA 3QEPA 4G9ZA 3O6WA 3HSTB 3KLFA 4A2AA 2E1ZA 2QWMA 3LZJA 4RW4A 1NGDA 2QWOA 2P9KB 5JVGL 1IJJA 4M63C 4DV7K 2AP1A 3O08A 3K2PA 3IUCA 2GTDA 5AQGA 4ICLA 3WNGA 3L0QA 4E1JA 1TVRA 1YIJN 1NGCA 4LF4K 4Q0BA 3KLEA 3CCMN 2ZE2A 3FFIA 4BRNA 3CI5A 1MWMA 1UWBA 4CIGA 4PQUA 4JKAA 3FLCO 5KPZA 4FLTA 1ZBIA 1HX1A 4MLHA 4A59A 1IH7A 3KK3A 4DV2K 4DTJA 1QZ5A 4DLGA 1Q9YA 1RT4A 3AAQA 3V1OA 4FZXC 2O8EB 4KHYA 5KI6A 1BU6O 2IC3A 4BRKA 5CHIA 4N5SA 2V52B 3PSIA 4BGBA 4MFBA 2X74A 3WT0A 4FWRA 4DU3A 4FWKA 1BQMA 4IJAA 5J2PA 3D0PA 1V4SA 4CHNA 3O3GA 1TYQA 1T7PA 1TK0A 4AHVA 3M8RA 3E66A 1NK4A 4EIAA 2HF4A 1SKSA 1S72N 3KK1A 4I9QA 5DM7L 1FJGK 3L6QA 3QEWA 4FK4A 4M3YA 2P1JA 3P4IA 4JKDA 5CR4A 2CGLA 4FWSA 4WF9L 4JI0K 5EXWA 3LPUA 3WXMB 2Y1JA 3SQ0A 3AO3A 3NHGA 1X9WA 3L4QA 4H5NA 1ASUA 2P9PB 4CF0A 1VSLA 3A5OC 1XMOK 4W5QA 3VERA 1U47A 1YHQN 1L3UA 4IOAL 3SK3A 3LL3A 5AZIA 3ZX0A 2P5OA 4BQZA 4KHPK 4A5AA 4DQRA 4FOIA 2YHAA 2GWKA 2WBNA 4LY7A 1OVQA 2ZM6K 3U3YA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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