3VEZA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz k443a variant in complex with atp, adp and carbamoyl phosphate
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
566
structure length
566
Chain Sequence
MRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERFTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVADREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
molecule tags Transferase
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
total genus 187
structure length 566
sequence length 566
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vezA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vezA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3vezA03
4GY2B 2NRHA 3ZX3A 1RFQA 2Q0UA 4IWVA 3VEWA 3DXMA 3CJ1A 4BRHA 1NGDA 3WQTA 2QWLA 1Q18A 1KAZA 2D0PA 5JLFA 4FWSA 5AQHA 3FGUA 3VGLA 1P8ZA 4FO0A 4WQ4A 3WUHA 3J8AA 5LY3A 3FR0A 3A5LC 3LM9A 2ASPA 3R9PA 5I9EB 1S3XA 4BGAA 2QWMA 3H1QA 3SMPA 3M1FA 1D4XA 4JHDA 4IO8A 4B1UB 4B1VA 5BPNA 2FXUA 5FPMA 1HJOA 1HKCA 2QWNA 4A2AA 3GDQA 1BA0A 4JHDB 4BRKA 2QWRA 3KHYA 4ISFA 5JICA 3EKSA 1ATNA 4XH5A 1NGFA 4EAHD 2P9UA 3SJHA 1JCEA 4QS8A 3QFUA 4GNIA 3CETA 2ASOA 2ITMA 3VEXA 4BRMA 4IJNA 4B1XB 2P9UB 3GE1A 4FWRA 4BQZA 5B8HA 1BWFO 1U2VB 4PL8A 5EXWA 1NGGA 1HLUA 3H3OB 3I33A 3O5BA 4RWTA 2WUSA 2QWQA 2E1YA 3VF6A 1H1VA 1QZ5A 3P4IA 1BO5O 4RCHA 2DPNA 2FLOA 4L3QA 1MWKA 3CIPA 5LJWA 1NGJA 3VOVA 1OKJA 3LL3A 3BP8A 1CZAN 2PBDA 3MN5A 2V52B 5BN8A 4BC5A 4CZMA 4CZHA 1BUPA 3F9MA 3AARA 3JXUA 2FF3B 2BUPA 4CI6A 4CZIA 2NLXA 1NGCA 2A3ZA 3H45C 3VF2A 2I7PA 3A5NC 4JNEA 2YI1A 3CI5A 5EVZA 1T6DA 1K8KA 3R6MA 4HTLA 3UKUA 3G25A 2CGKA 5AQXA 2CGJA 5AZIA 3GL1A 1K8KB 2AA4A 2P9PA 3LDQA 3UKUB 1BOTO 3IMXA 2E2NA 1GLEG 1ESVA 1X3MA 2F9WA 3ID8A 5AFUH 1DKGD 5AZIB 3HTVA 2P9PB 4H0OA 3CQXA 4XEIA 3H6EA 1RGIA 1U6ZA 4YDUA 3AY9A 1Z05A 4LC9B 1GLJO 3IUCA 4FPBA 5ADXA 3TTDA 4B1ZA 3O08A 4FWNA 4PKHA 2CH5A 4BR5A 4FOIA 1S22A 3FZLA 1X9JA 3FZKA 5FPEA 4WQ5A 1MDUB 4BRGA 1QQNA 4BR4A 2V51B 4BR2A 2Q97A 4H0YB 1NGBA 2YJFA 2HF3A 1WUAA 3QMLA 3ENOA 1DGKN 1IG8A 4Y0WA 1ATSA 4H0PA 5EY4A 2EWSA 1DEJA 4MLEA 3R8EA 3QFPA 2HOEA 3MN9A 3FLCO 2V7ZA 3GOIA 4XH4A 4EHTA 2E1ZA 4AM6A 2BTFA 1GLBG 3ZX0A 4XH1A 2HMPA 4FOEA 3KVGA 1GLAG 4FSVA 3FE1A 3VETA 3EKUA 3M3ZA 3LM2A 4H0TB 1TUUA 2NZTA 4M7XA 4CJ7A 3VTHA 5BR9A 3DAWA 1KAXA 2YHYA 1E4FT 2QXLA 3CJBA 4IXCA 4BR9A 1V4TA 5FPDA 3QDKA 1ZC6A 3EL2A 2IVOA 2P9SA 2UYTA 3HBTA 4QS7A 1U2VA 3VEZA 1NBWA 3D7EO 4HWIA 2Q1NA 1EQYA 1GLDG 2P9SB 1TUYA 1LCUA 4BR7A 1BDGA 2Q31A 3DJCA 4ISEA 4NO7A 1BG3A 4I6MA 4CZKA 4M7YA 4O8KA 4DQ8A 3ZETA 3EO3A 4H5WA 5AQLA 4I6MB 1MA9B 3IFRA 3ULEA 3VGKA 4A62A 3M6GA 3U9DA 1NM1A 2D1KA 2ZF5O 5FPNA 3ZETB 1GLLO 1KXPA 4CZFA 3ULEB 4DHYA 3VEOA 4H5NA 5KPZA 4BRFA 3TTFA 1WOQA 3C0BA 3CQYA 2YHXA 1NLVA 2W40A 4DB3A 4BROA 1C0GA 1YVNA 2A40A 5KPRA 2QWPA 1R59O 5AQKA 5BPMA 4IZ9A 3WXJA 4WYBA 5KQ8A 4H5VA 5AQVA 3MDQA 5TKYA 1QZ6A 1E4GT 1KAYA 3BUZB 3FZMA 4CZLA 1IJJA 2GTDA 5BPLA 3VESA 5F2RA 3L4IA 3LDPA 4WQ4C 3S41A 5AQWA 3VEYA 2GEMA 5AQFA 3CERA 3LDLA 5AQTA 1HKBA 3W3DA 4H0VB 4BVPA 2P9KA 3WXKA 3MMVA 3U8XA 2FSKA 2E88A 4NB4A 2P9KB 4FWQA 5AQQA 4CBUA 4BRCA 3A5OC 1SAZA 2Q0RA 4ISGA 4B1YB 4RTFD 3W0LA 4A61A 1ZXOA 2A6AA 3LDOA 3FZFA 4MO4A 4EHUA 3A8YA 2YHWA 3QB0A 4FPAA 5AFUA 4PKGA 2P9LA 5AQIA 4CZJA 2FF6A 4BRNA 5KPTA 1HUXA 2IVPA 4H0XB 1HPMA 3TTCA 3ATUA 4JAXA 5EOYA 1NMDA 3LDNA 2W41A 3JS6A 4H5TA 5AZJA 2P9LB 4O5FA 3BF1A 3MN7A 5AQNA 3VPZA 5AQMA 4BVOA 3VGMA 2ASMA 1XUPO 2E2OA 1XQSC 5AQPA 5JMVA 4BRQA 4FL9A 4BR0A 5AZJB 4BRPA 3B8AX 3CHWA 2A42A 1XC3A 1SQKA 3MCPA 4FWLA 4BG9A 3QICA 3A0IX 3UE5A 1JCFA 3HM8A 1X3NA 3H1VX 4EFHA 3WXIA 3U4LA 4PKIA 1G99A 1QQMA 3TSUA 3WXLA 3H46O 2E8AA 2IVNA 5AQJA 4E1JA 4BQLA 1HX1A 3KZBA 2OANA 1YAGA 3MK6A 4BRIA 2PAVA 2F9TA 4JN4A 2QWOA 5BRHA 3SLCA 1J6ZA 2FSJA 5ELZA 2YJEA 1LOTB 3O1WA 3DXMB 3FZHA 4M63C 5LJVA 1QQOA 2ZGZA 3L0QA 4C23A 4EIAA 4JD2A 1JCGA 1NWKA 3D2FA 3VENA 4PL7A 3TSQA 2GELA 3VEVA 3CJCA 4MLHA 3DXKA 3O80A 4JD2B 3D2FB 2QW9A 3GG4A 4YDUC 3DXKB 5F0XA 2E2QA 3UKRA 1V4SA 4BG8A 4CBWA 2A41A 3UB5A 1T6CA 3VERA 5CE3A 2HF4A 3UKRB 3AAQA 4CBXA 1MWMA 3ATVA 3U9ZA 2E20A 2FSNA 3CJAA 4WQ5C 3WQUA 1Y64A 5JLHA 1BU6O 3WEEA 1SZ2A 5BN9A 4CZGA 4IJAA 5F1XA 3L6QA 1ATRA 4BGBA 2H3GX 3WEEB 5BRFA 3BF3A 3TPQA 3EZWA 4BRDA 1TYQA 3AAPA 3ZX2A 2GUPA 4BC4A 3GBTA 3O4WA 2VWBA 5AQOA 3H3NO 1TYQB 2CH6A 4J8FA 3CJ9A 3QBWA 3WT0A 1ZBSA 4K41A 4DCHA 2P9NA 2YCHA 4B1WB 2IIRA 4BC3A 5EX5A 1NGIA 2GWKA 4K25A 3SMSA 1C0FA 2P9NB 4QS9A 4FWPA 4BRAA 3HSCA 4FWOA 1BA1A 3MN6A 2ZGYA 3IDHA 3O8MA 5AQZA 3CJ7A 4CZEA 3HI0A 3TSPA 2VYPA 2A5XA 4H5RA 4K42A 3VF4A 2E2PA 4CD3A 5ADXH 2Q36A 3ENHA 1NGAA 3A5MC 3RSEA 3EN9A 2AP1A 2CGLA 3D2EA 3O1BA 2P9IA 1T44A 1YXQA 1Z6RA 5BREA 3RSEB 4BRLA 5E26A 5KQDA 2J4RA 2VCPA 3D2EB 3DWLA 4CD1A 2P9IB 3QBXA 4Z94A 3SK3A 4F9OA 2ZWHA 4MO5A 4FWKA 1YUWA 3ZEUA 5AQSA 2D4WA 1HKGA 5BRDA 5AQRA 5E84A 1NGHA 1GLCG 1GLFO 5AQYA 3OHRA 3ZEUB 4AM7A 1NGEA 2GWJA 5AQUA 3C7NA 4BC2A 3HZ6A 3FFKB 5AQGA 4FWMA 5AR0A 3TU5A 4H03B 1RDWX 2KHOA 2Q2RA 2V7YA 2QM1A 3C7NB 4KBOA 4B9QA 4BREA 3I8BA 3BEXA 4A2BA 1QHAA 2I7NA 4K43A 2D0OA 3O6WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2NRHA 3HPHA 3LP2A 4CJWA 1SKWA 1Q9YA 3ZT0A 3OBYA 3DXMA 4CJLA 1S6PA 2QWLA 1Q18A 4FJMA 1QVFM 1P8ZA 1U47A 3AGRA 3FR0A 4IOXA 4LF6K 4GW6A 4DUZK 4ELVA 3U3YA 2KKZA 2QKKA 1VQ6N 1XWLA 4DFPA 4E89A 4IO8A 1N5YA 2FXUA 5J2QA 5KTQA 2HNYA 1QSYA 2QWNA 1BA0A 2QWRA 2DFEA 2W42A 3L3UA 4KREA 5HL7L 3SJHA 2UXCK 2WOMA 3CETA 3BGRA 3MX5A 3VEXA 5J2PA 4JI3K 4IJNA 1YF5L 4FWRA 4BQZA 1U2VB 1NGGA 4YY3K 3RRGA 3O5BA 2D5RA 3SCXA 2WUSA 2YKNA 3LZJA 3VF6A 3H07A 4FM2A 1QZ5A 1BO5O 1TK8A 1L3SA 4DR5K 3WXMB 4N47A 3CFRA 3QNOA 1MWKA 1XMOK 3CIPA 3VOVA 1NU0A 4FLXA 3CXCM 4FJXA 2YKMA 4KI6A 3V4IA 4X62K 1Q81O 2NRVA 4QAGA 3CFPA 4DSLA 4CJ4A 1HRUA 3O9UA 1VSLA 1X9WA 3AVKA 2BUPA 3AA2A 4CZIA 3HOTA 1VQKN 2YI1A 5LMNK 4DS5A 2ZJRL 3K59A 3R6MA 4DV5K 2IAJA 1RBVA 4DLGA 5C25A 5AZIA 5IWAK 3GL1A 1K8KB 2BH1A 2P9PA 3UKUB 1NK5A 1BOTO 3IMXA 2E2NA 4I7FA 1ESVA 2A1SA 4CGIA 4CJSA 5I42A 2MX1A 3CM6A 4FYDA 1MU2A 4DLEA 3TTDA 1RTIA 2OPSA 4FK2A 4FWNA 3OYJA 2XY7A 3Q7BA 2CH5A 4JKHA 4CEEA 1OH8A 4NCBA 3ZYYX 4FOIA 4AHSA 2XO7A 2G8IA 2HVHA 1X9JA 4LH4A 4WQ5A 4BRGA 2V51B 2O8BA 3MX2A 5HRNA 4H0YB 1NGBA 4WFNL 2X6SA 3I0SA 5LL6Z 1VQNN 1IG8A 4M41A 3F2KA 4DU4A 2EWSA 3SUQA 2NRXA 2V7ZA 3GOIA 3C6HA 4JI7K 1WSFA 1GLBG 3ZX0A 1HJRA 3OYBA 4DV0K 2G8WA 1A5XA 4DF8A 3K58A 3CCMN 4LFCK 1TUUA 4M7XA 3VTHA 3THYB 1HQUA 4AHTA 2HHQA 3CJBA 4IXCA 4JI5K 1JXEA 3QDKA 4CJEA 2IVOA 2UYTA 3THWB 1U2VA 4MFBA 1J5OA 1TKUA 1SL0A 3CC7N 3LQUA 3AO5A 2XY6A 2RIUA 1TUYA 4DSEA 4BR7A 3PSIA 1BG3A 2GV9A 4I6MA 4CZKA 4M7YA 4E7HA 4FLUA 3IFRA 5C10A 3T1HK 1VRUA 4IFYA 3M6GA 5FPNA 3VQDA 3VEOA 3OYIA 5JS1A 3KTQA 1WOQA 2FBYA 2OCEA 4BROA 1J53A 3M8PA 1YHQN 2A40A 4NXMK 4JI8K 2QWPA 1O13A 1R59O 5AQKA 3LWLA 4IZ9A 4WYBA 3MDQA 3IAYA 3QO9A 1K9MO 2P5OA 3OYCA 3FZMA 4N76A 1S1VA 2VG5A 2FBTA 5BPLA 5DM7L 1RBRA 3HT3A 5F2RA 3PV8A 2OTLN 3BZKA 3LDLA 3KLEA 4DQSA 4HCBA 4W5RA 2P9KA 1ZYQA 4AILC 3OW2M 3U8XA 2FSKA 4M42A 3S3OA 4NB4A 4FWQA 1KVCA 5AQQA 4CBUA 4GMJB 2KZMA 4X66K 3C6UA 2F4VK 4C8LA 1KC8O 1VRTA 4EHUA 4F8RA 1IV0A 3ZSXA 3QB0A 3VQ6A 2HHVA 2B6AA 4AHUA 3HJFA 1REVA 2FF6A 4BRNA 1GOBA 3BDPA 1HUXA 2IVPA 2HMIA 1HPMA 3TTCA 5M1NA 4L8RB 3HP6A 1IKVA 3LDNA 4CGJA 3HVRA 1VQLN 4O5FA 5AQNA 4CEZA 2W6LA 4IKFA 3VGMA 2ASMA 1XUPO 3SPZA 1Q7YO 2WTUA 4BR0A 3B8AX 3MGZA 4DFMA 4NXNK 1SQKA 5A2QO 1JCFA 4EP5A 3HM8A 2ZQBA 2GBZA 5GIPA 1FXXA 1L3UA 4PKIA 4FM1A 2E8AA 2IVNA 2IOCA 2VGNA 4E1JA 1HX1A 5LMUK 2I5JA 1S9GA 3QEIA 5BRHA 3CMEN 5ELZA 3TAPA 2YJEA 4O5BA 1LOTB 4DR7K 4JRQA 4E3SA 4CGDA 2HHSA 2RKIA 1XHXA 1K4PA 4MLHA 3O80A 4B9TA 4WE1A 4JD2B 3SYZA 4CIGA 3MAQA 3OJSA 3NFAA 2A41A 1EP4A 3VERA 1NMNA 3UKRB 3AAQA 5HRRA 3AVHA 3U9ZA 3O4QA 1EO1A 4WQ5C 1BU6O 2X74A 5C2DA 2KW4A 4IJAA 3P5JA 1RDBA 1ATRA 2OPPA 1N6QA 3P31A 3ZSWA 1N32K 2JWLA 2NRTA 1KTQA 4BC4A 3AV9A 2VWBA 1NK0A 5DK5A 4CK1A 2OZMA 5H1SQ 3SJJA 2ZM6K 4CGGA 5KGWA 2HBMA 1CLQA 1ZBSA 4IEEA 4N41A 2P9NA 3QEWA 1KLNA 1RT3A 4KHUA 4E1MA 2IGIA 3LZIA 4LF9K 4BC3A 1C0FA 1LAWA 4OGCA 4FWPA 1HRHA 3ZLJA 4BRAA 4LY7A 3SAHA 5DMRA 4CJTA 1BA1A 3IDHA 4DV6K 3TSPA 2A5XA 4H5RA 3RMBA 2RE2A 3SBTA 3N4QA 1G15A 4RW7A 3RSEA 2AP1A 2QXFA 4B8AB 2P9IA 5FROA 1YXQA 4BRLA 1XC9A 5E26A 4CEFA 3D2EB 4CD1A 4PA1A 4MO5A 3TAFA 3MCAB 2VGMA 3ZEUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1S9E A;  2PYL A;  3VEW A;  3OYK A;  4BRH A;  1B92 A;  2G8H A;  3MWP A;  2UXB K;  5JLF A;  3FGU A;  4JI0 K;  3QES A;  1J54 A;  4WQ4 A;  4KHS A;  3J8A A;  4B9L A;  1VSH A;  1U48 A;  5JVH L;  3A5L C;  3LM9 A;  1BI4 B;  2ASP A;  3R9P A;  1S3X A;  2HST A;  1NJY A;  3VQ4 A;  1EKE A;  3M1F A;  1SS6 A;  3D0P A;  1JL2 A;  3OYD A;  1S1X A;  5FRM A;  1C1A A;  1JLA A;  4A2A A;  3GDQ A;  1B9D A;  4W5Q A;  3E1Y A;  4JHD B;  3THX B;  1D5A A;  2E5L K;  3QER A;  4DTM A;  1K4O A;  4CGH A;  1YTA A;  2VQE K;  1VSK A;  4CJF A;  3MXJ A;  3CM5 A;  4QS8 A;  4GNI A;  2ASO A;  3CC4 N;  4B9S A;  1RDD A;  2P9U B;  1WN7 A;  1OVQ A;  1NOZ A;  4FLT A;  4DQP A;  4X65 K;  4TSX A;  4MDB A;  2QWQ A;  5HLF A;  3V6D A;  4CGF A;  3P4I A;  1DTT A;  2DPN A;  1UOC A;  3VQQ A;  2WC9 A;  3LDS A;  4KB1 A;  3LL3 A;  1DLO A;  1VQP N;  1NJI O;  1RCH A;  2D0C A;  2NRR A;  3ALY A;  1ILY A;  3MN5 A;  4RW6 A;  2V52 B;  5BN8 A;  1TVR A;  4CZM A;  1IBL K;  5I3U A;  2NRW A;  5CY4 A;  1U49 A;  1IBK K;  2NLX A;  4YOT A;  4KRF A;  3A5N C;  1K8K A; 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 3RMD A;  2FBX A;  3SUO A;  2VWJ A;  4P6D A;  1N33 K;  3CG7 A;  4H0X B;  4B3M K;  4JAX A;  5EOY A;  4H5T A;  2W41 A;  4BE0 A;  3BF1 A;  4CEO A;  3VPZ A;  1NK4 A;  5J1E A;  2YNI A;  3ASM A;  2Z1G A;  5JMV A;  2EX3 A;  4K8X A;  4LF5 K;  2NNW A;  3V9W A;  3TAR A;  4EZ6 A;  3CHW A;  3F5T A;  1XC3 A;  3SQ1 A;  3MCP A;  3MXM A;  3LP0 A;  3QIC A;  3A0I X;  1IKX A;  4M3R A;  5GAD P;  3I0R A;  4PUO A;  2ZE2 A;  4O44 A;  3CCR N;  1X3N A;  3QEP A;  1KSP A;  4GV6 A;  4EFH A;  4M3T A;  3S3N A;  5GIN A;  3TSU A;  4H4M A;  3LAK A;  4BQL A;  2OAN A;  3QEV A;  3MXI A;  1YAG A;  2QI2 A;  3MK6 A;  2XRI A;  4CFA A;  2F9T A;  1J6Z A;  3TAE A;  3CCE N;  3O1W A;  4P8E A;  3DXM B;  1W97 L;  5LJV A;  4EIA A;  3L0Q A;  4JD2 A;  1JCG A;  3O9R A;  3OBW A;  3VN5 A;  4DU3 A;  3SQ0 A;  4BY9 C;  3VEV A;  1CXU A;  3CJC A;  3TAB A;  1TV6 A;  3OTO K;  3EYZ A;  1HYV A;  1S6Q A;  1RT4 A;  2QW9 A;  3D2F B;  3GG4 A;  4F2S A;  4LD0 A;  4E0D A;  1JKH A;  2E2Q A;  5JVG L;  1EWQ A;  3HST B;  3UKR A;  4JI4 K;  4CBW A;  3UB5 A;  5CE3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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