3VEZA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz k443a variant in complex with atp, adp and carbamoyl phosphate
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
566
structure length
566
Chain Sequence
MRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERFTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVADREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
molecule tags Transferase
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
total genus 187
structure length 566
sequence length 566
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vezA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vezA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3vezA03
4BG9A 4NO7A 1H1VA 2YHXA 5AZJB 3SLCA 1C0FA 3QMLA 4BC5A 4CJ7A 1NGJA 2GUPA 3TSPA 3A5NC 4BRKA 2E8AA 2P9UA 3TTFA 2VWBA 2P9PB 4BRFA 4CZFA 4BRLA 1NGFA 1DKGD 4BRPA 1ZXOA 1QQNA 3D2EB 3AY9A 3ZEUB 4FPBA 1GLAG 4EHUA 2ASOA 2QW9A 1Q18A 1K8KB 4WYBA 4FOEA 5EOYA 2Q1NA 1BWFO 2ASMA 4B1WB 2F9TA 3LDNA 3A5OC 1DGKN 1GLFO 3ENHA 2OANA 5EY4A 2A41A 3LDPA 4FWLA 5ADXH 3CI5A 4AM6A 4BROA 3BP8A 1Z6RA 4FSVA 2FSNA 4H0VB 1BDGA 2QWNA 3GOIA 5AQNA 3EL2A 3QICA 3H46O 4CZKA 3UKUB 1BA0A 1KAXA 4L3QA 4EHTA 3GDQA 1T44A 2VYPA 4KBOA 3SK3A 5E26A 2CH6A 1SZ2A 3H1QA 2QWOA 2E88A 5I9EB 2I7NA 3M1FA 4IZ9A 2UYTA 4M63C 2AA4A 3IUCA 2V51B 5AQVA 2KHOA 3CQYA 3FZMA 5JLFA 1HKBA 3IDHA 3TSQA 1QZ5A 3QBXA 5LJVA 4H0XB 4O8KA 1EQYA 3O5BA 3UKRB 4DQ8A 2D0OA 4A2BA 3CJBA 3A0IX 2E2QA 2F9WA 2AP1A 4WQ4A 4YDUC 3WEEA 4BVPA 5BPMA 3WUHA 1MA9B 3ATUA 4JAXA 3MK6A 2FXUA 3FGUA 2YI1A 2CGKA 1SQKA 5E84A 4MLEA 4B1ZA 4BG8A 4CD1A 1U2VB 2E2PA 4HWIA 2BUPA 5BN8A 1SAZA 2Q0RA 5AQWA 2PBDA 4RTFD 2IVPA 3A5MC 3OHRA 2E1ZA 2P9LA 5AQRA 3P4IA 3ZX2A 1HUXA 4M7XA 3AARA 1TYQA 3VGLA 4Z94A 5ADXA 5AQKA 4PKGA 5BR9A 3FFKB 2WUSA 4IJAA 3A5LC 1V4SA 2FF3B 1E4FT 2YCHA 3QFPA 4ISEA 1ZC6A 5BRFA 4IJNA 4H5RA 1NGHA 4BR7A 2P9IA 3LL3A 5KQ8A 3HM8A 3HTVA 1ZBSA 4ISGA 5BREA 3ULEB 3C7NB 3FZHA 4E1JA 3M6GA 4Y0WA 1QQOA 3ID8A 4K42A 2GELA 3TTCA 5CE3A 3L6QA 4PKHA 3O80A 3WT0A 4H0OA 2A3ZA 1KXPA 4BRMA 2YHYA 4B1UB 2Q2RA 5BRHA 3ENOA 5AR0A 1E4GT 3DXKA 2A42A 3UE5A 4CI6A 2ASPA 3ZX3A 4H03B 5KPRA 3O4WA 3DJCA 3BF3A 1U6ZA 2YHWA 4JD2A 4A61A 2H3GX 4IXCA 4BREA 1NGCA 3CJ1A 3TPQA 4CZGA 1ATRA 2NLXA 4CZHA 2P9NB 2NRHA 2P9KB 1YUWA 3W0LA 4BRCA 4BGAA 5AFUA 5BPNA 4CZJA 3D2FA 4CD3A 5AQJA 4XEIA 5JMVA 1TUYA 3CJ7A 3AAPA 4H0PA 3AAQA 5AQZA 1MDUB 3DAWA 3A8YA 2CGLA 1MWKA 3LM2A 4BVOA 2ZWHA 5AZJA 3FZLA 1KAYA 1ATSA 1LOTB 2QXLA 3DXMB 4CZEA 4BC2A 4FOIA 4CZIA 4H5NA 3WXKA 5EVZA 1X3NA 2HF4A 4JHDB 4M7YA 4XH5A 2HOEA 5FPEA 2P9PA 4FWNA 4C23A 3MDQA 5AQYA 4XH4A 3LDLA 2ZGZA 1QQMA 3CHWA 3D2EA 5ELZA 3ZEUA 1WUAA 4B1VA 3RSEB 1BU6O 1P8ZA 3ZETB 1K8KA 2QWPA 1NGEA 1NGAA 2P9NA 3O1BA 4K25A 4CZLA 2E2OA 3UB5A 4MO5A 3U9ZA 1BO5O 4H5VA 4BRHA 1GLBG 2ZF5O 4BC4A 3SJHA 1C0GA 5AQUA 5AQHA 4BR0A 3MMVA 3VEWA 5AQFA 4DB3A 5KQDA 4WQ4C 1V4TA 1HPMA 2E20A 5LY3A 3QDKA 1QHAA 1GLLO 4IO8A 2P9SB 3TU5A 3QBWA 3VTHA 1BA1A 4B9QA 4AM7A 3CERA 2A5XA 2ITMA 1Y64A 5AQTA 5AQPA 3M3ZA 3VF4A 4WQ5C 2HMPA 4PL8A 3UKUA 3VEVA 3U9DA 2HF3A 3CJ9A 2J4RA 3VEZA 3MN9A 4GNIA 4EIAA 3DWLA 1GLJO 4NB4A 1S22A 3S41A 1WOQA 5AQSA 5LJWA 2V7YA 4BR2A 5AZIB 2W41A 3H3NO 4B1YB 1RDWX 4EFHA 3CETA 4CZMA 4CBWA 3CIPA 1QZ6A 3WXJA 5AQMA 1KAZA 3F9MA 2V7ZA 2V52B 2EWSA 1R59O 1NBWA 3UKRA 4HTLA 4QS9A 1NGGA 2QM1A 4BRAA 4ISFA 4RCHA 3VOVA 3TSUA 5FPMA 2P9UB 2QWMA 2IIRA 1XC3A 5TKYA 2GWKA 1U2VA 1YVNA 3GG4A 4FWPA 3LDOA 2Q36A 3W3DA 4FWQA 2CH5A 5EXWA 4K41A 1RGIA 3O8MA 4RWTA 3ATVA 3CJCA 4CBUA 3VGMA 3EKSA 3HI0A 3HZ6A 1OKJA 5AQXA 4FO0A 2PAVA 5FPDA 4BC3A 2W40A 3JXUA 4BRQA 4XH1A 2BTFA 5BRDA 4BR4A 3EZWA 3GL1A 3VETA 1GLEG 3VERA 3R9PA 5BN9A 4K43A 4FWKA 1XQSC 5F0XA 4I6MB 3MN7A 3SMSA 2D1KA 1S3XA 3ULEA 3C7NA 1BG3A 1JCEA 3BF1A 3H3OB 4H5TA 3L0QA 1NM1A 1JCGA 4O5FA 1T6CA 4GY2B 2QWLA 3ZX0A 4BRGA 5F2RA 1HLUA 4JN4A 3R6MA 3WXLA 1YAGA 3BUZB 1J6ZA 2Q31A 5KPZA 1LCUA 3KZBA 5AQGA 3VEYA 1Z05A 3FZFA 4EAHD 5EX5A 1NGBA 4H0YB 4A2AA 5AQOA 4FWMA 4H5WA 3R8EA 4DCHA 2NZTA 3VESA 2Q97A 3MN6A 3FLCO 1BUPA 5AQQA 3WQUA 3SMPA 2P9KA 1HKGA 2FSJA 3H6EA 3VPZA 4PKIA 4I6MA 4QS7A 3WEEB 1DEJA 4PL7A 3EN9A 3O08A 3IFRA 4FWRA 1ATNA 1NGIA 1IJJA 1NGDA 2A40A 4MLHA 2DPNA 4H0TB 3VF6A 1D4XA 3WQTA 1X9JA 4IWVA 3TTDA 3DXMA 4BQLA 1GLCG 3I8BA 4BRIA 2P9LB 3QFUA 4BRNA 4JHDA 5B8HA 1TYQB 2YJFA 4DHYA 5F1XA 3JS6A 3VEOA 2IVOA 1IG8A 4FL9A 3VEXA 1HX1A 5KPTA 2QWQA 3RSEA 3C0BA 1XUPO 4F9OA 3ZETA 3IMXA 3HBTA 2P9IB 2GEMA 5FPNA 1TUUA 2CGJA 4FPAA 4BR9A 3LDQA 3KVGA 3FE1A 1HJOA 1G99A 3MCPA 4YDUA 4BR5A 2QWRA 3I33A 4BQZA 3B8AX 1ESVA 2E2NA 4MO4A 3L4IA 5JICA 4CBXA 5AFUH 3CJAA 4B1XB 1NMDA 4WQ5A 2ZGYA 1T6DA 2I7PA 3MN5A 3CQXA 1YXQA 2FSKA 5JLHA 3GBTA 2P9SA 4BGBA 1JCFA 4JNEA 3DXKB 4FWSA 5AQIA 5AQLA 4A62A 3U4LA 1GLDG 4FWOA 3QB0A 2FF6A 4JD2B 3G25A 3J8AA 1X3MA 2E1YA 3EO3A 4QS8A 3FR0A 3HSCA 1NWKA 2YJEA 3FZKA 3O6WA 3O1WA 2FLOA 3GE1A 2GWJA 2VCPA 5BPLA 3D7EO 5AZIA 3EKUA 3H1VX 3VENA 3U8XA 2Q0UA 3BEXA 3D2FB 2D4WA 2A6AA 2D0PA 4LC9B 1RFQA 1CZAN 1BOTO 1NLVA 3WXIA 3KHYA 3H45C 4J8FA 4BRDA 2GTDA 3VGKA 1MWMA 3VF2A 2IVNA 3LM9A 1HKCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O4NA 1H1VA 3V1OA 4P8EA 3S3NA 4HUGA 2UUCK 4M3YA 3TSPA 2E8AA 4R79A 2VWBA 2NRWA 2P9PB 3P1GA 3K58A 1TK0A 2X74A 1DKGD 4CJUA 1QQNA 4DR6K 4P8JA 1IG9A 1SS6A 2HSTA 4FJIA 4ELTA 4NCGA 4QCLA 4DS5A 4CERA 1BWFO 5KRSA 3V1QA 4O0JA 2F9TA 3C6TA 2OPRA 1VSJA 3DLLL 5EY4A 3LDPA 3J7YP 4FWLA 4JKFA 2VQFK 1BQNA 1Z6RA 4BE2A 3V6DA 4BDYA 3BZCA 1BDGA 3K5OA 3SV3A 5M1QA 5AQNA 5M1NA 4O5BA 3EL2A 3QICA 1VSEA 4ICLA 4P6CA 4L3QA 3LAKA 3AO3A 2VYPA 1SZ2A 4KPYA 4MQ3A 3MWPA 5I9EB 2I7NA 4IZ9A 2Z1IA 4GV3A 5GAHP 4M63C 2AA4A 3ZSOA 3OYHA 5M1KA 4DR2K 3CQYA 5JLFA 3WNHA 3C94A 4BDZA 1TAUA 1QTMA 3O5BA 1OVQA 3S3OA 3D45A 4A2BA 3CJBA 2E2QA 2ETJA 2F9WA 3WEEA 4BVPA 4F4KA 2KQ2A 3HOSA 4CGFA 1MA9B 3TWHA 3MK6A 2YI1A 4FYDA 1NK0A 2P51A 2E2PA 5BN8A 4JS5A 1N32K 1SAZA 2HHVA 2WC9A 5CHIA 4FJNA 1NKBA 4M7XA 4RG8A 2P1JA 3AARA 3SQ0A 1L3TA 4Z94A 1NNEA 4CVNE 5BR9A 2WUSA 3ULDA 4F3OA 1IKVA 2UUAK 3OW2M 2FF3B 3RMCA 4NCAA 4ISEA 4GVMA 2PFUA 3OYMA 3K9KA 3B6PA 1C1AA 1TAQA 4JI1K 5C42A 3LL3A 3U6FA 3SUNA 2YHAA 1N6QA 1VSFA 4HCCA 1K9MO 4C8LA 4DV7K 3ID8A 3THYA 3TTCA 3TR8A 2D0CA 3RR7A 5IT9O 1VRTA 4M3UA 2Q2RA 3TAEA 5K14A 4B9VA 3OYEA 3NF9A 5HRPA 4B3MK 3S9HA 2KZZA 3DJCA 2ZD1A 4JD2A 1ASUA 1WSHA 4A61A 4IXCA 4BWJA 4BREA 3CJ1A 4CZGA 3RR8A 4F2RA 4I2QA 3KD1E 1VK0A 4BGAA 5AFUA 3DLGA 4CZJA 4BACA 3QEIA 5AQJA 5C10A 1CXUA 2NRXA 4DR3K 1TUYA 3AAPA 5DM6L 3DAWA 2HHSA 3A8YA 2CGLA 3LM2A 2BANA 2ZJPL 1KAYA 1QS4A 1QSYA 1UOCA 2QXLA 3QNOA 4CFAA 4H5NA 3LZJA 4KFBA 4M7YA 3RMBA 2P9PA 1VQON 3VQQA 1TK5A 3TABA 4C23A 3NF8A 1J5EK 3PLAA 4FJXA 1OH6A 1J5OA 4M42A 4IDKA 3AO5A 3ZETB 4LH5A 1BCOA 4M3TA 3K5MA 3U9ZA 4LSLA 1RTDA 1GOCA 5AQHA 3I0RA 3SQ2A 2XHBA 2X6NA 2KZMA 2GBZA 1V4TA 4A59A 3O9TA 4DV2K 3QEWA 4KB1A 4IO8A 3OYIA 1BA1A 1UA1A 4AM7A 5AQPA 3ALYA 2HMPA 2Z1JA 4PL8A 5J2NA 1RT6A 4WFBL 3U9DA 2J4RA 2Y1IA 4FJ7A 4KHWA 4Z4CA 2ZJQL 4DV0K 3HP9A 1VQKN 2VG5A 3F9KA 1OH5A 1QSLA 1S22A 2G8UA 2E5LK 4Q5VA 3AO1A 1UWBA 3AVGA 4BR2A 5LJWA 4O8UA 1LV5A 3N4QA 4CF9A 3T7ZA 3CETA 3B6OA 3OYDA 1VSHA 1KAZA 1Z26A 4HTLA 3SAGA 1WN7A 4BRAA 1NK8A 2RN2A 5FPMA 5JVHL 3AGRA 1TKTA 2P9UB 1YHQN 4PY5A 2QWMA 4ILHA 1VQ9N 3GG4A 4FWPA 4NYFA 3K59A 4ILJA 3W3DA 3MGZA 1KFDA 2O8FB 4FJ8A 1ZBIA 5EXWA 4RWTA 3NFAA 1G15A 5FROA 1NOYA 4JI2K 2G8VA 4BC3A 3P39A 4BRQA 5HOOA 3AVNA 3GL1A 3VERA 5HRRA 3P31A 4CF0A 4K43A 4FWKA 5F0XA 4I6MB 3NGIA 1S3XA 3AVKA 1VAZA 1BG3A 4AHVA 1JCGA 4CHOA 1X1PA 4FVUA 4QOZB 4BRGA 3VA0A 5TKWA 1W9HA 3VTIA 4DWIA 1W97L 3BUZB 4DSEA 1J6ZA 3JAMO 3KZBA 3OYLA 3SPYA 2F4VK 3HPOA 1HNWK 1NGBA 4H0YB 4KKOA 5FRMA 3L2VA 3N4PA 2Q97A 3AJEA 3IRXA 1BI4B 1D9DA 3SMPA 3H6EA 1IV0A 1Z25A 2OTLN 4QS7A 1VQ8N 2F8TA 4AHUA 3EN9A 3O08A 1X9SA 3DMJA 3TAFA 4AILC 3SUOA 4MLHA 1NGDA 2A40A 2WONA 4NLBA 4NXMK 4H0TB 1TL1A 2HNZA 4FZZA 1TK8A 4KI6A 4BRIA 4IG0A 3QFUA 5B8HA 1TYQB 4DHYA 4BE1A 2IVOA 1IG8A 1HMVA 3VEXA 1T3VA 3AO4A 4I9LA 3LP1A 4F9OA 1XUPO 3ZETA 1NJYA 1B9DA 1PVYA 1RDCA 4DR1K 3KK7A 4FLUA 4FJGA 2GEMA 5FPNA 3E9LA 3J81O 5FRNA 2QK9A 4P6PA 5HBMA 2VG7A 1WBBA 1I39A 3QEXA 3MCPA 2QWRA 4B8AB 1D8YA 3B8AX 1Q9YA 4KHNA 2DTUA 2PZSA 2XRIA 3ZCMA 4KAZA 5AFUH 1NMDA 4WQ5A 1EX4A 4B3SK 4KV8A 3ZYYX 4ZTJA 4PA1A 1JCFA 2IAJA 3DXKB 1ZBFA 5AQIA 3PIPL 1WNSA 4JI5K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3WXJ A;  4HUF A;  2RIS A;  1KRP A;  4E0D A;  1S1W A;  5GIO A;  3J80 O;  2V52 B;  1R59 O;  3UKR A;  1W7A A;  3THX B;  4QS9 A;  2O4I A;  3EE9 A;  1IBK K;  3VOV A;  4GKK K;  3AVH A;  4C1N I;  2IIR A;  2GWK A;  3CCL N;  1YVN A;  4E1N A;  4Y1C A;  2Q36 A;  4DSI A;  4LF8 K;  1RGI A;  3LAN A;  3O8M A;  2FBY A;  3VGM A;  1JXE A;  3HI0 A;  3MXI A;  2YNI A;  3HZ6 A;  1OKJ A;  2AJQ A;  4RW4 A;  5AQX A;  1S6Q A;  4KH6 A;  1SL1 A;  1O13 A;  2W40 A;  3NDK A;  1K7J A;  3JXU A;  3K9J A;  3OJS A;  3F5T A;  2RHK A;  5EU7 A;  3P5J A;  4I7F A;  1EP4 A;  3R9P A;  3G6E N;  2QI2 A;  1EO1 A;  5BN9 A;  4UY8 O;  1CLQ A;  1FKP A;  3VQE A;  4KTW A;  4CEZ A;  3MN7 A;  4N47 A;  3SMS A;  1J9A A;  2P5O A;  3C7N A;  4FLY A;  3H3O B;  4H5T A;  1NM1 A;  3CC2 N;  3O9R A;  4DU1 A;  4GY2 B;  3SAH A;  4KO0 A;  1HLU A;  1BIS A;  3WXL A;  1YAG A;  3QER A;  1LCU A;  1VQN N;  3H07 A;  1Z05 A;  1U49 A;  3QO9 A;  4ID1 A;  5EX5 A;  3VQA A;  3G4S N;  3F73 A;  1LWE A;  1X9W A;  2QA4 N;  5C25 A;  1VSK A;  3FLC O;  3LP2 A;  2P9K A;  2WBN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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