3VEZA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz k443a variant in complex with atp, adp and carbamoyl phosphate
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
566
structure length
566
Chain Sequence
b'MRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERFTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVADREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
molecule tags Transferase
total genus 187
structure length 566
sequence length 566
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vezA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vezA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3vezA03
3CIPA 4CBUA 5BR9A 3LM2A 4IXCA 4IWVA 5AQTA 4CZMA 3ZEUB 3VEZA 2FSJA 3CJAA 1ZXOA 4FWOA 4FPBA 4FWNA 4MLHA 3BUZB 4YDUA 2D1KA 3G25A 2P9UA 3ZETA 3EKSA 3TU5A 4BQZA 4DQ8A 3ULEB 4QS7A 4EHUA 3H6EA 5AFUH 1KXPA 4BRCA 3O1BA 1CZAN 3UKUA 3LDOA 5EXWA 4JD2A 3VESA 4BRAA 1GLEG 3WT0A 4H5NA 4J8FA 3DXMB 4FWQA 4CZJA 3VEOA 3O4WA 3MMVA 5BRHA 1WUAA 1ESVA 4DCHA 2OANA 3EL2A 3IFRA 4E1JA 5EY4A 4BQLA 2YI1A 4WYBA 3H3OB 2E1YA 5BRDA 2E2OA 4NB4A 4B1YB 4MO4A 5JLHA 4PKHA 5LY3A 2DPNA 5AQVA 3M3ZA 4BREA 2ASOA 3S41A 3VEYA 1RDWX 3FZHA 3QDKA 4QS9A 2CGLA 4RTFD 1XQSC 3H1VX 5AQQA 3CJCA 4BRNA 4BRKA 2P9UB 3SLCA 4RWTA 3FZKA 1C0FA 1NGJA 3VOVA 4H0VB 3D2EA 1IG8A 3DXKA 5EX5A 3A5NC 5E84A 3ID8A 4BR7A 2QWNA 4H0YB 1OKJA 3LL3A 2FF3B 3O1WA 4JD2B 1YAGA 2IIRA 4RCHA 1GLBG 3TSPA 3D7EO 4EIAA 4FOIA 2YCHA 4H0XB 3SJHA 2IVNA 1K8KA 3W0LA 3AAPA 5AQLA 3U4LA 1NLVA 3UKRA 5AQNA 4CI6A 3CQYA 4B9QA 4DHYA 4H5WA 1S3XA 2QWLA 4K41A 4HWIA 4PKIA 2A40A 2Q36A 4H03B 4IJAA 3EKUA 2V7ZA 5ELZA 1DKGD 1NGBA 1H1VA 3DJCA 3R8EA 3W3DA 2A3ZA 2HOEA 4AM6A 1YUWA 1Z6RA 3LDPA 1XUPO 4PL7A 2V52B 3O80A 3D2EB 1XC3A 4M63C 3ZEUA 5FPMA 3FZFA 2P9SB 1HJOA 1BUPA 1BA0A 3QFPA 1JCEA 2GUPA 2IVOA 1BOTO 3IDHA 4PL8A 5JLFA 1K8KB 1TUYA 4ISFA 3LDNA 5KQ8A 3CJ1A 4JN4A 3ULEA 3WQUA 4Y0WA 5BPNA 2YHYA 4M7XA 4BROA 2YJFA 1R59O 2FXUA 5AQKA 2NRHA 5BREA 1J6ZA 3WXIA 4BRLA 3BF1A 4CZKA 4CZLA 2QM1A 3DXMA 2I7PA 2YHWA 5CE3A 1C0GA 5AQGA 3ZX0A 3MK6A 1V4TA 2ZGYA 1NMDA 2A5XA 2EWSA 3MN5A 5AQFA 3VPZA 1E4GT 3QMLA 1KAXA 4FPAA 1X9JA 4WQ4A 3DWLA 3SMPA 3VF6A 3UB5A 2F9WA 2ASMA 2E8AA 3LDQA 2YHXA 2H3GX 3VGMA 4BRIA 3IUCA 4K42A 2CH5A 4A62A 1E4FT 3JXUA 3TTCA 4K43A 2W40A 4IJNA 4K25A 2BUPA 5ADXA 4IZ9A 3O8MA 2HF3A 5E26A 5AQHA 3GDQA 3SK3A 3R9PA 3FGUA 1GLLO 4Z94A 4WQ5C 3VF4A 4ISEA 3KZBA 2D4WA 2QWPA 4BRQA 2E88A 2HF4A 4CZEA 5F1XA 1KAZA 3FLCO 2GELA 1DGKN 3MCPA 3VEVA 2V51B 2FF6A 3WQTA 1ZBSA 3WEEB 1NGHA 3QBWA 3VTHA 1BDGA 4I6MB 1MDUB 5KPRA 3U9ZA 2QWQA 4IO8A 3WXJA 1X3MA 2ZWHA 1SQKA 1U6ZA 4GY2B 2E1ZA 4BGBA 4BG8A 4FWMA 2QWRA 3MN9A 4CZIA 5AQMA 3CI5A 3ENHA 3VEXA 1YVNA 2P9PA 4FSVA 2GWJA 1ATSA 1QQOA 1GLJO 1GLDG 2P9SA 3VETA 1NBWA 1T6CA 5F0XA 1NGDA 5EOYA 3HI0A 2ZGZA 4XH5A 4C23A 3A5MC 3CERA 1HKBA 5AQXA 2PAVA 3I8BA 3ZX3A 1BWFO 3U9DA 5BPMA 3ZX2A 3FZLA 2P9NA 4FWLA 4BR9A 2FSNA 5B8HA 3MDQA 2F9TA 3WXLA 3GL1A 3BEXA 4AM7A 1ATRA 3AARA 1T44A 3R6MA 3H45C 3IMXA 3U8XA 1Z05A 3L4IA 4H0TB 4MO5A 4FWKA 4BRDA 3L6QA 3A5OC 3QB0A 1HLUA 5I9EB 5EVZA 5AQSA 2HMPA 3H46O 2FSKA 3FZMA 5KQDA 4B1UB 2KHOA 2E2QA 2I7NA 4O8KA 3BF3A 3O6WA 4BC4A 1HKGA 2P9PB 2PBDA 3FR0A 1NGGA 3EN9A 1SAZA 5LJWA 3A0IX 2UYTA 4FWRA 5JICA 4JNEA 2WUSA 1YXQA 4XH1A 3B8AX 2Q31A 1QZ5A 3VEWA 1IJJA 2CGJA 3C7NB 5F2RA 4BR4A 4BVPA 1HKCA 2P9NB 3VENA 1NWKA 2P9LB 2P9IB 3CJ9A 3O5BA 2ITMA 4CBXA 3MN6A 3HTVA 5AQYA 2ASPA 2D0OA 2QWOA 3FFKB 5BPLA 1QQNA 5AQUA 1P8ZA 3A5LC 3MN7A 4EAHD 2AP1A 2Q97A 3EZWA 3CHWA 4JHDA 1HPMA 3H3NO 3D2FB 4B1ZA 3HSCA 5FPNA 3WEEA 2GTDA 4I6MA 1LOTB 2VWBA 5AZJB 3VERA 2Q1NA 4FOEA 4BRPA 1TYQA 2E2NA 4H5RA 2NZTA 4A2AA 4BRHA 1GLFO 4HTLA 1QZ6A 2QWMA 3ATUA 3I33A 2A42A 2A6AA 3TPQA 4FWPA 4BR5A 2GWKA 3AAQA 1BU6O 4M7YA 4NO7A 2E20A 4BG9A 4CBWA 1HX1A 2VCPA 2P9KB 3VGLA 4CJ7A 4FWSA 1U2VB 1RGIA 4FO0A 1S22A 1Q18A 4BC5A 3DAWA 3GBTA 4BC3A 5AZIB 1NGEA 3VF2A 2GEMA 1NGIA 1HUXA 3M6GA 2Q0UA 4BRMA 3GE1A 5FPEA 3F9MA 1JCFA 4ISGA 4JHDB 2W41A 5AQRA 3HM8A 5FPDA 3L0QA 2Q0RA 2AA4A 3GG4A 2NLXA 3GOIA 1TYQB 3O08A 2FLOA 4CZFA 3CQXA 4A2BA 2J4RA 1MA9B 3CETA 1QQMA 2QXLA 1GLAG 1ZC6A 1GLCG 4O5FA 3KHYA 1MWMA 4H5VA 3VGKA 2A41A 4XEIA 5AQJA 4H0OA 1BG3A 3QFUA 4KBOA 1NGFA 4BRFA 4EHTA 4CD1A 5LJVA 2V7YA 1Y64A 5BN9A 1KAYA 3C7NA 3M1FA 4BGAA 2D0PA 1RFQA 2BTFA 3LDLA 3ZETB 3SMSA 2P9LA 2P9IA 3HBTA 1WOQA 5AQZA 1EQYA 4PKGA 5AQIA 3UKUB 3TSUA 4H0PA 3CJ7A 4WQ4C 2CGKA 3D2FA 3TTDA 5BRFA 5ADXH 5JMVA 4B1XB 3TTFA 3WXKA 1T6DA 1X3NA 3OHRA 4BR0A 1TUUA 5AZJA 4WQ5A 5KPTA 4CZHA 4YDUC 5KPZA 4MLEA 4B1WB 4QS8A 3RSEA 3ENOA 3C0BA 5AFUA 3ATVA 3J8AA 3QBXA 4XH4A 3QICA 2CH6A 4JAXA 1NM1A 2P9KA 1NGCA 3P4IA 1DEJA 3EO3A 3CJBA 3A8YA 1U2VA 4L3QA 4BRGA 1LCUA 5AQWA 4BC2A 2E2PA 2ZF5O 1G99A 3KVGA 3DXKB 1V4SA 1JCGA 5AZIA 4F9OA 1QHAA 3BP8A 5TKYA 3WUHA 2YJEA 4CZGA 2QW9A 5AR0A 2Q2RA 4CD3A 1SZ2A 3AY9A 5AQPA 3UKRB 4B1VA 4A61A 2VYPA 3H1QA 1D4XA 2IVPA 3RSEB 3JS6A 4LC9B 1MWKA 5AQOA 1BA1A 3HZ6A 4DB3A 4FL9A 1ATNA 1NGAA 4H5TA 4BVOA 3TSQA 3UE5A 4BR2A 4EFHA 1BO5O 3LM9A 3FE1A 5BN8A 4GNIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LAVA 4CBUA 3J7ZO 3LDSA 4IFVA 5BR9A 3T1YK 1VQMN 1TL3A 1X9SA 3E9LA 4ZHRA 3PIOL 4DR5K 3ZEUB 1RBTA 1RILA 3VQ7A 1ZXOA 4I14A 4FPBA 2IC3A 3OYEA 3BUZB 1KVBA 3ZETA 3ULEB 4HUGA 4NXNK 3H6EA 4BRCA 1RDUA 3O1BA 1YTAA 1CZAN 3LDOA 5EXWA 4H4OA 3VQ5A 3VESA 1GLEG 4H5NA 3VQAA 3KLEA 3S3NA 4FCYA 1NJWA 1CXUA 3O4QA 1CLQA 1G57A 4OKJA 3CC4N 1PVYA 4MDBA 4CJUA 3OTOK 2YI1A 4WYBA 3OYAA 2E1YA 2OZSA 2X6SA 5BRDA 2E2OA 3T3FA 5LY3A 5SZTA 4CEQA 3S41A 5CR4A 1KLMA 3WNHA 4JK7A 4DUZK 3SUPA 1K4LA 2KZZA 2OPPA 4PY5A 3H1VX 3VTIA 5LMUK 3CJCA 4BRKA 1TKUA 4FJ8A 3SLCA 4RWTA 4OO1J 4WFBL 1C0FA 4E0DA 1XNQK 4YHHK 4CJLA 2QKKA 5EX5A 3A5NC 3O9RA 5E84A 4JYAK 1NK0A 3ID8A 4JKHA 3TR8A 4FW1A 4FJMA 1YAGA 4O44A 4EIAA 1N36K 4FOIA 4DSKA 4CESA 2G8HA 3K5MA 3AAPA 5AQLA 1IKVA 4CJ5A 1HNIA 4F2RA 4E7KA 1XNRK 4CI6A 3RVCA 1RT1A 1S3XA 2QWLA 4K41A 1HRUA 3TARA 2PFUA 4PKIA 4OPHA 2Q36A 4IJAA 2HNYA 2V7ZA 5C12A 5KI6A 4JS5A 4JRPA 5E41A 2Y1IA 2HOEA 4FJ7A 4DTRA 4IFYA 1Z6RA 3LDPA 4LD0A 2V52B 2VG7A 3NVKA 4ELTA 3MK5A 4ELUA 4DSIA 4CK2A 2P9SB 1HJOA 1BUPA 1YJNN 3QFPA 4CJ3A 1BOTO 3BZCA 2GV9A 1TUYA 3JYTA 4JN4A 5D3GA 3OJUA 4M42A 3K9JA 4CHYA 1A5XA 5KGWA 4DU3A 2FXUA 5AQKA 1XI1A 1J5OA 4C1NI 2QA4N 3IKMA 3DXMA 4KO0A 4B3MK 1T3VA 3M8QA 4CW7B 2BDPA 5AJ3K 4FPAA 3TABA 4F3TA 1X9JA 1QE1A 3SQ0A 4KH4A 3IAYA 4Q5VA 4AHTA 3AVMA 3O9UA 4B9SA 4BRIA 4NCGA 2CH5A 4E89A 4DMNA 4B3SK 4IJNA 4CF8A 2VWJA 2BUPA 4CK1A 3O8MA 2HF3A 1VQ8N 5CZ1A 5E26A 3R9PA 4PUOA 3AVNA 3BGRA 3HVTA 4Z94A 4G9ZA 4ISEA 4FM1A 4CHQA 4X62K 3B6PA 3NCIA 5HRSA 5HBMA 2XY5A 4FJXA 4BRQA 2NRXA 2BGGA 2HF4A 4CZEA 1N6QA 3LANA 1CZ9A 1DGKN 3PX0A 3VEVA 3WQTA 1J54A 3VTHA 4I6MB 3I55N 1MDUB 5LMNK 4IO8A 4GY2B 4EZ6A 2E1ZA 4FWMA 1U45A 3P31A 4KREA 2G8FA 4LFCK 3LAMA 3ENHA 3K0SA 1L3SA 4LFBK 4FSVA 2GWJA 3OYDA 1GLDG 3T1HK 4FJGA 5EOYA 3S3MA 3HI0A 4XH5A 3CERA 4EP4A 4BWJA 3E9OA 4CEDA 1XHZA 5BPMA 3U9DA 3ZX2A 3ZCMA 4CEFA 2FSNA 2OTJN 2VG6A 2F9TA 3MDQA 3WXLA 3R1XA 3D0PA 1ATRA 3AARA 3MWTA 3N4PA 1T44A 3NDKA 2Q3SA 4JS4A 3IMXA 1HQEA 4H0TB 2OTLN 1CZBA 4OKEA 4BRDA 5EVZA 3SYZA 3V9ZA 2BANA 2HBMA 3OYKA 3M8SA 4FZXC 2I7NA 4DU4A 4CEZA 1HKGA 1NOZA 1OH8A 4IEIA 4CGIA 1NGGA 5LJWA 2UYTA 3NBPA 3MEGA 4FWRA 4JNEA 2WUSA 1YXQA 3CC7N 3H08A 4DS4A 3RMCA 1QZ5A 1U48A 3RMAA 2RKIA 3RRHA 1WSIA 4B3OA 1BHLA 1IBLK 1NWKA 5FRNA 4KI4A 3TANA 1BIZA 4E7LA 2IGIA 2ASPA 2D0OA 3FFKB 4A5AA 1QQNA 5AQUA 1F21A 3AVGA 4ICLA 1O13A 3CHWA 3D2FB 4W5RA 3J81O 3CF5L 1P90A 3CCRN 3WNEA 4QOZB 4DUYK 4DQRA 4DG1A 3MEEA 4KH6A 2RF2A 2VWBA 5AZJB 3VERA 3LPUA 1TYQA 4JI2K 3ATUA 4FW2A 4R79A 2GWKA 4DFKA 4CEBA 4CBWA 4KFBA 4DFJA 2E4LA 2P9KB 2EX3A 3V1QA 1JLEA 4FO0A 1S22A 4FZZA 3V9SA 4CIEA 3DAWA 1HYSA 3GBTA 4Z4CA 4J2DA 3OYCA 3V4IA 2D0CA 3DLBA 4BY9C 4G1QA 5AZIB 1NGEA 5BR8K 3OVNA 3OYJA 4RG8A 2GEMA 5IT9O 3OW2M 3ISNC 3C6HA 1QVFM 1U49A 2NNWA 1FKOA 2D5RA 4Q0BA 1SS6A 4CHOA 3ID6A 5JVGL 3CXCM 2HNZA 1ZBFA 3GG4A 3L4QA 3L2RA 4AHRA 1HYVA 1TYQB 5H1SQ 4FLTA 1KLNA 2XY7A 5CYQA 4KAZA 4B08A 4FJKA 1N5YA 3CETA 1QQMA 4CK3A 4O0JA 1ZC6A 1JXEA 4O5FA 3KHYA 4H5VA 4C8OA 3F73A 2KFZA 5AQJA 1ZBHA 4FJJA 3QFUA 3O3FA 4KBOA 4WF9L 4BRFA 1WSFA 3P83D 4JI3K 1KAYA 1Q8IA 3C7NA 3M1FA 3E01A 4NCBA 3K9KA 1BQMA 1KRPA 4JKGA 3ZSQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4GV9 A;  3VEW A;  3D6R A;  3C7N B;  1L3T A;  3EE9 A;  4PHT X;  1IKY A;  1RTD A;  1KFD A;  1S1X A;  3F2K A;  3K5N A;  5SWM A;  1DT9 A;  1D5A A;  5C2F A;  1ZBL A;  2O8B A;  2P9I B;  1NMN A;  1S9G A;  3L2V A;  3O5B A;  3MN6 A;  3PX6 A;  2YX6 A;  5GIP A;  2QWO A;  5BPL A;  1EO1 A;  3MN7 A;  4JLH A;  2X74 A;  2AP1 A;  3ZLJ A;  3L7V A;  3C94 A;  3CG7 A;  1HPM A;  4JHD A;  4B1Z A;  4XIU A;  4B3T K;  4CJP A;  3BDP A;  3HSC A;  3I8D A;  3KWI A;  2OA8 A;  2Q1N A;  4BRP A;  4IEE A;  4MQ3 A;  2NZT A;  3MEC A;  4A2A A;  4BRH A;  4HTL A;  1QZ6 A;  4FJL A;  3TPQ A;  2ZM6 K;  4FWP A;  2RHK A;  3AAQ A;  4BG9 A;  3MAQ A;  3KLH A;  3OS0 A;  1K4I A;  1WBB A;  5GIO A;  4CJ7 A;  4JI4 K;  1GOA A;  4P6C A;  1OH6 A;  4KHU A;  2KW4 A;  4BC5 A;  3HST B;  1TVR A;  3TWH A;  1S1T A;  5JS1 A;  3EYZ A;  1N33 K;  4HVJ A;  3V6D A;  1YIJ N;  1JCF A;  1IEZ A;  4JHD B;  2W41 A;  4LSL A;  2WFB A;  3I0S A;  5FPD A;  4AQY K;  1W2B M;  2DY4 A;  3ZT1 A;  4DSE A;  2NLX A;  3GOI A;  3NMU A;  4CZF A;  2G8K A;  2ZQB A;  1S5J A;  3CQX A;  3VN5 A;  2VWK A;  1HJR A;  3AO1 A;  3NF9 A;  1GLC G;  1NK8 A;  1MWM A;  4HCB A;  4GVE A;  3E1Y A;  1BG3 A;  4QAG A;  3BY5 A;  2IAJ A;  1NGF A;  2JWK A;  3OYN A;  4EHT A;  4CD1 A;  1S72 N;  3QES A;  1Y64 A;  4LF8 K;  1REV A;  4DQS A;  4DV5 K;  3MIO A;  3CPE A;  2DFE A;  2HST A;  1EXQ A;  1RFQ A;  3ZT4 A;  3LDL A;  4DU1 A;  3HBT A;  5K14 A;  3SUO A;  1J9A A;  1RTJ A;  1TKT A;  4Z4G A;  5AQI A;  3VQE A;  1KK9 A;  4CHN A;  4H0P A;  3VQC A;  4WQ4 C;  5JMV A;  4OVL A;  2VGN A;  1YTU A;  4KTZ A;  5C2D A;  1X3N A;  4BR0 A;  4KTW A;  2E5L K;  4YOR A;  3V81 A;  3I56 N;  4W5Q A;  3C0B A;  4BE1 A;  3CM6 A;  5AFU A;  3QBX A;  4FJ5 A;  3P4I A;  3QET A;  2HHX A;  1U2V A;  4L3Q A;  4IO9 L;  1NK5 A;  2RIU A;  1K8A O;  4CER A;  1Y97 A;  3M8P A;  1G99 A;  4CFB A;  1VQ5 N;  4ILG B;  1JCG A;  1QHA A;  4JI7 K;  4KHS A;  5TKY A;  1UAX A;  3MGZ A;  3L3V A;  4JRQ A;  2JWL A;  4JV5 K;  1WN7 A;  3AVF A;  3SBG A;  4B9L A;  4UQG A;  1LWF A;  2Q2R A;  3UKR B;  4B1V A;  4A61 A;  2VYP A;  3H1Q A;  3LRJ A;  5HRR A;  3JS6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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