1GOAA

Cooperative stabilization of escherichia coli ribonuclease hi by insertion of gly-80b and gly-77-> ala substitution
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
156
structure length
156
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQGWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
publication title Cooperative stabilization of Escherichia coli ribonuclease HI by insertion of Gly-80b and Gly-77-->Ala substitution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
total genus 48
structure length 156
sequence length 156
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1goaA00
3ZT1A 3AVNA 1Q9XA 1ZYQA 2D0BA 1J54A 4W5TA 2DFHA 4H4OA 4OKEA 4CCHA 4GMJB 3C6UA 5CZ1A 4IKFA 1BHLA 1BL3A 2Z1GA 3LALA 4CJVA 2ATQA 3NH1A 1XHZA 2KQ2A 3AVGA 4CJ3A 2KZZA 5C25A 2IAJA 4EP4A 4C8NA 5J2QA 1U48A 3VQ9A 3LWLA 3MEDA 4M41A 3HPHA 1RCHA 5I3UA 1NKEA 3KK1A 3E01A 3HJFA 1GOCA 5J1EA 3CFPA 4N5SA 3SCXA 5J2NA 2XY5A 4HHTA 4CFCA 4I9LA 1ASWA 3MXJA 2G8KA 3DI6A 3V9ZA 4EZ9A 2ZD1A 1VSIA 4Z4GA 4DQSA 2XO7A 1T03A 4DTXA 3P5JA 2VWKA 4Y1DA 4ID1A 3EY1A 3AVJA 3LAMA 3ZSXA 1ASUA 4CEOA 1RDDA 1C6VA 5C42A 3RWUA 2IC3A 4CJ4A 3SUOA 1C0TA 3VQDA 4DTJA 3IAYA 3LZJA 1JLCA 1X1PA 3NGZA 3S9HA 4FJ9A 4F8RA 1RT2A 3V81A 3DLRA 2IS3A 4FW1A 4N41A 4OKJA 4CJLA 4N56A 3HO1A 3AVIA 4GW6A 1RBUA 5FRNA 2BGGA 1HNVA 1RBVA 4FLXA 4AHTA 3NH0A 1KTQA 3HP9A 3M8PA 4JRQA 1EETA 2Z1IA 4AHCA 3SQ4A 4I2PA 4KI6A 1WAFA 3DMJA 3SYZA 3LWMA 1C0MA 3L2WA 1D9FA 1B92A 1QS4A 3TAMA 4E7JA 4FYDA 1S1TA 3NFAA 3HM9A 1QSYA 2HHVA 3NH2A 3TAPA 3RRHA 2YNIA 4DTOA 4DFMA 2DY4A 4CJQA 3SPYA 4M3UA 3NCIA 3NGYA 4DTSA 3ZSOA 3NBPA 4AHRA 3MXMA 3AO5A 3T19A 3QLHA 1IKVA 3TARA 5KTQA 3KLFA 2PYJA 3AA5X 3IG1A 4JLHA 4CK2A 4CFDA 1N6QA 3DOLA 1TK5A 4CFBA 4CJKA 4AHUA 4CIEA 4E1NA 1C1BA 4B9NA 4KTWA 2QKKA 1JKHA 2AJQA 1RT3A 4XIUA 2HHSA 1WAJA 2KFZA 3SQ2A 3QESA 3V9SA 3TAFA 4CGFA 4R5PA 4ZTJA 4Z4FA 1I39A 4FCYA 2QKBA 5FROA 1WSIA 2VG6A 1JL2A 4CJTA 3HSTB 4BWJA 4NCGA 3I8DA 1S1WA 5HRRA 3U3GA 3K5MA 1VSJA 3KD5E 1TGOA 1RT5A 3MAQA 4BACA 2OPPA 3QEXA 3KLHA 3LPTA 1UAXA 1FXXA 4OVLA 1HNIA 1KVCA 4MQ3A 1A5WA 3ZSRA 4DLGA 3QNOA 4FZZA 4FLYA 3AA4A 4CJRA 1FKPA 3HYFA 4QOZB 5HRNA 3AVAA 2BE2A 4E19A 3T3FA 2HNZA 3OYMA 1S6QA 3CYMA 4KV8A 1SKSA 4RW6A 1TV6A 4KTZA 5KGWA 4CIFA 1A5VA 5JS2A 1GOAA 1NK4A 4M42A 4FJ7A 3NHGA 4CF8A 2P51A 3LAKA 4OKKA 4OPJA 1TAQA 4G1QA 5D3GA 3T1AA 4CECA 2HNDA 3HL8A 3KLEA 1NK6A 1KSPA 1C1CA 3FFIA 5KI6A 4PUOA 2IGIA 3PO5A 4CERA 4B9UA 1S1UA 4DTRA 4IDKA 2KW4A 4KHWA 3QEPA 2WONA 2VG7A 3O4NA 4CJFA 3OS1A 5HRSA 4GVMA 5DMRA 4EZ6A 4ICLA 2RF2A 3P83D 3PUFA 3VQCA 3C94A 1RT7A 1YVUA 3WNFA 4DS5A 3V6DA 1WLJA 1TK0A 1NKBA 3RR8A 1L3VA 4M3TA 4IG3A 1JL1A 2ITGA 4RW9A 4CFAA 1WNSA 3G10A 3MEEA 1RTJA 3KK2A 2D0AA 3B6OA 5HLFA 3OYBA 4L8RB 1R0AA 1BCOA 4O44A 1NJZA 1T05A 4FJIA 2Y1IA 1BISA 1CXUA 3ISNC 1KVBA 3K2PA 3V1OA 4PA1A 1RBTA 3VQ6A 4CK3A 2YHAA 4JS4A 1L3TA 4K8ZA 4FJKA 1TL1A 4CESA 4CHQA 4DF8A 5CYMA 4CEQA 3KKRA 2JLEA 2YNGA 4B9MA 3RMDA 3ULDA 3DLEA 2RPIA 1HJRA 4CGGA 3OYLA 4DLEA 1T7PA 4CF2A 5T7BA 2YKNA 2XY7A 4FJ8A 3MXIA 3OS2A 5K14A 4F2RA 3KD1E 2HHUA 2E4LA 4FK0A 2XY8A 3VQQA 3WNGA 2A1RA 4J2DA 3UIQA 3V4IA 1RT1A 3K5OA 5J2MA 4E7LA 3SQ1A 1XC9A 1J5OA 4NCAA 4DG1A 1RBSA 1IKWA 3AVKA 4W5RA 3NF7A 4B9LA 1SUQA 3HXMA 4DQPA 5CZ2A 2G8FA 4PWDA 4HUFA 2XRIA 3AA3A 4OGCA 1LWCA 1JXBA 4DQRA 2FBTA 4E3SA 4ELUA 4B08A 4C8MA 2OZSA 4I9QA 2DTUA 3HVTA 3VQ8A 3M8RA 1HQEA 1JLGA 3C95A 3SV4A 3TAEA 3TAQA 1HPZA 4Z4EA 2HW3A 2WOMA 3CG7A 3OYCA 1LWEA 1S9GA 3AO1A 3M8QA 1BCMA 4Q5VA 3K57A 3NAEA 3OYGA 4BE0A 1SL1A 4RW4A 3ZSYA 1LWFA 1WSEA 4CJWA 2OPQA 3VA3A 3L8BA 2GBZA 3AO3A 3PX0A 3VQEA 1S1VA 3DRRA 3SQ0A 1D8YA 1REVA 4KB1A 4NCBA 4B3OA 3DM2A 3VQ5A 4FJXA 4CJSA 1K6YA 1YT3A 1NK0A 4DSLA 1SKWA 3RMBA 2O4IA 1HYSA 2EHGA 4IFVA 1NOYA 3QEWA 4N76A 4TSXA 2B4JA 4OJRA 3IS9A 4JRPA 3MEGA 2YKMA 1NK8A 3NGIA 1RDCA 4DTPA 2PY5A 2OYQA 2KTQA 1FK9A 4KTQA 4HCBA 1WSHA 4CEEA 1ZBLA 1BQMA 1DLOA 5SZTA 3TR8A 4O0JA 1TL3A 3RMCA 1TKTA 3CFOA 1U4BA 4CGIA 3OYFA 2KFNA 1RDBA 1ASVA 3LP1A 3HP6A 3AO2A 3OYHA 2HMIA 1CZ9A 5I42A 4M3RA 1HQUA 1MU2A 3EZ5A 4FM1A 1L5UA 1KFSA 3QEIA 1WSGA 3K5NA 1W9HA 5E41A 1F21A 3K59A 1BI4B 4B9TA 3HVRA 4Y1CA 3AVCA 3KLGA 4J2BA 4BWMA 1TKZA 3DOKA 1IH7A 2ZE2A 4HTUA 3O3FA 3V9XA 1KFDA 3RR7A 2KZMA 1GOBA 3B6PA 4OGEA 4KRFA 1CLQA 1CXQA 1TKXA 1VK0A 2HNYA 2GV9A 4I7FA 3ZSVA 4OLBA 1ZBHA 5C24A 3S3OA 2X74A 4ELTA 5J2PA 1ZBIA 1NK9A 4CGJA 4FLVA 3ITHA 4B8AB 1LAVA 3PY8A 4QAGA 3DLBA 4YNQA 1KCFA 2R7YA 1YTUA 1BQNA 4DTMA 4DU4A 1WSJA 1JXEA 3RRGA 4KI4A 1LW0A 4Z0UA 1FKOA 4H8KA 4O0IA 3SV3A 2XY6A 5FRMA 3ZT4A 4CJPA 3TAGA 2G8UA 2ETJA 2YV0X 1A5XA 3L3VA 4DSJA 1JLQA 1JLFA 1YTAA 4DSKA 3OYJA 2G8IA 4BDYA 4CJUA 1QE1A 4CGDA 1QSLA 3IRXA 4RW8A 3JYTA 3PV8A 1IG9A 1RTIA 1LW2A 4LSNA 1NJWA 4FJ5A 4OLAA 1BI4A 2QXFA 1D5AA 1SL0A 2DFEA 4DSEA 1TKDA 3KTQA 1SL2A 1Z25A 4C8OA 4CEFA 2A1SA 4IBNA 4E0DA 3AO4A 4CJEA 3TABA 2P1JA 3OY9A 1O1WA 2OPRA 3NF9A 1S5JA 5KGXA 3NDKA 1WN7A 4DWIA 5EU7A 4JS5A 4B9SA 4FLTA 4FJGA 3F9KA 3HT3A 4FW2A 3I0SA 4CEAA 2RN2A 4CHOA 4W5QA 4M45A 3SI6A 4KREA 4CE9A 4RW7A 4FJNA 3LP3A 4CF0A 1VRUA 3TANA 1TK8A 4F4KA 3KJVA 4DU1A 2OPSA 3SJJA 1U49A 1L3UA 3H08A 4DMNA 3WNEA 1SV5A 1U45A 4CHZA 4J2AA 1U04A 2YHBA 4RG8A 1NOZA 1XWLA 2X6NA 4LH5A 3SZ2A 4E7HA 2FBYA 2ZQBA 4B8CA 1RDAA 4FJHA 4KHQA 4DQIA 2OZMA 3L3UA 2QK9A 4IFYA 3V1RA 3G0ZA 4UQGA 3A2FA 3U3YA 2X78A 3SUNA 4CHNA 3VQPA 1QTMA 4LY7A 2Q3SA 4PY5A 1HYZA 4ID5A 2FC0A 1NK5A 4CIGA 3OYKA 4FK4A 4HUEA 4NYFA 4CEDA 4FM2A 3VA0A 4AH9A 1T8EA 4CEBA 3O4QA 3V1QA 4KHUA 2HVIA 4O4GA 3VQ4A 1IKYA 1S9EA 3LP2A 1VSFA 2NUBA 4I2QA 2D5RA 2YNFA 1B9DA 5CYQA 3ZT3A 4AILC 4FZXC 2HHTA 1BIUA 1TAUA 4CK1A 3OYAA 1HRHA 4CHYA 3SNNA 1UA0A 3ALYA 4AHSA 4FM0A 4CJ5A 4DTUA 3SUQA 5HP1A 4FJJA 1G15A 2GUIA 1X9MA 1NKCA 3HPGA 2JGUA 3VN5A 5HRPA 1EXQA 1HMVA 4W5NA 5KRSA 3TI0A 1XHXA 3DRPA 3CQ8A 4FLWA 3KIOA 1LAWA 4O55A 3DYAA 4BDPA 1DTTA 3L2VA 1IKXA 4CHPA 4FLUA 1W0HA 3AA2A 3DRSA 3SUPA 1HYVA 4DFPA 1D9DA 4C8LA 3KK3A 4CF9A 3OYEA 4KAZA 1RTHA 1SKRA 4B9VA 3THVA 3RTVA 1UA1A 1DTQA 3QINA 1X9WA 4E1MA 3OYIA 4FJLA 3ZSQA 2HB5A 2Z1HA 3MECA 3EYZA 4KHSA 1NJXA 2FBXA 3OYDA 4E89A 4OPKA 1VSEA 4YFUA 2HHQA 1LV5A 4H4MA 2W42A 4M3YA 1KRPA 1J9AA 1VSMA 3VQ7A 4Z4CA 3QIPA 1RTDA 1Q9YA 5KRTA 2B6AA 1VSHA 3K5LA 1L3SA 2YNHA 1EP4A 2O4GA 4DF4A 1JLEA 3L2UA 4QCLA 3L2QA 3AV9A 3QERA 3QIOA 1VSLA 3VQAA 3ZT0A 1JLBA 1X9SA 3ZSZA 1EKEA 2P5OA 3LZIA 4M3ZA 1Q8IA 3P1GA 3QO9A 3F73A 3KLIA 5HROA 2PZSA 4FXDA 3QETA 3LP0A 3V9WA 1KVAA 5FDLA 1EX4A 5HBMA 1QSSA 3OS0A 4DU3A 4FJMA 2I5JA 2FBVA 2Y1JA 2F8TA 2HVHA 3AVMA 3OYNA 4ZTFA 3PX6A 3C6TA 4ZHRA 4Z4HA 4C8KA 1S6PA 1NJYA 3OJSA 1J53A 2G8WA 4AHVA 4F3TA 1C1AA 4KO0A 1QHTA 3AVLA 3CM6A 1RT4A 1UOCA 3NF8A 1BGXT 1B9FA 3D0PA 4EP5A 4HUGA 3QEVA 4KHNA 4PQUA 1I3AA 2HHWA 1QQCA 1RBRA 2IDOA 4O5BA 4BE1A 5JS1A 2EX3A 3V9UA 1RILA 1U47A 2E6LA 3AVBA 4K8XA 1Z26A 4ELVA 3ZSWA 4FLZA 2BDPA 4M3WA 4HCCA 4FZYA 3AVFA 2E6MA 1WSFA 4LH4A 3LDSA 3DLGA 4DQQA 3ZCMA 4Z4IA 3D45A 2F8SA 3L2RA 3SPZA 2G8VA 4IG0A 4FK2A 3WNHA 4HVJA 4KFBA 2VG5A 5DK5A 4CEZA 2IOCA 3TWHA 3BDPA 4E7KA 1RT6A 4DTNA 3O3HA 1VSKA 2D0CA 2DFFA 2XHBA 3S3MA 3LANA 3ZT2A 1N5YA 2LSNA 4KHYA 3OJUA 4NYNA 4DFKA 1RNHA 3K58A 3HK2A 2PYLA 2G8HA 1IO2A 3ASMA 4WE1A 4Q0BA 4N47A 1KLMA 3HPOA 3JSMA 4LD0A 3U6FA 4KPYA 1NK7A 3VQBA 4E7IA 3S3NA 4FVMA 3NE6A 3OVNA 3RMAA 1ZBUA 3NF6A 1ZBFA 1UWBA 5SWMA 4F2SA 4W5OA 1VSDA 3CFRA 4BE2A 2Z1JA 3PX4A 1CZBA 4M3XA 3DLHA 3O3GA 3DLKA 3LPUA 2RKIA 2F96A 4CGHA 1TVRA 4DS4A 1KLNA 4F3OA 4KB0A 2BANA 2VWJA 1XI1A 2HHXA 4BDZA 1ITGA 1C0UA 4KKOA 1BIZA 4LSLA 1VRTA 3CM5A 4DSFA 1JLAA 2B5JA 3PO4A 4DFJA 1S1XA 5CY4A 3QNNA 2P5GA 4DSIA 4MFBA 4J2EA 3KKSA 1Y97A 3I0RA 3M8SA 2OA8A 3AVHA 2X6SA 4CF1A 3BGRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4U7BA 3ZT1A 2W6KA 3AVNA 1J54A 4OKEA 4BQZA 3C6UA 3D2FA 1BHLA 2Z1GA 1VQ7N 3AVGA 5C25A 4C8NA 3M1FA 3LWLA 3HPHA 1GOCA 1BU6O 3SCXA 1KC8O 1MWKA 1S72N 2CGKA 3MXJA 3SMPA 4BRMA 1ILYA 3V9ZA 3I56N 5E26A 3QBXA 4BVOA 4BC4A 4RWTA 2VWKA 2D0PA 2GUPA 3EEQA 2I7PA 3U9ZA 2EWSA 2O8BA 3RWUA 4CJ4A 1C0TA 4K43A 4DTJA 4F8RA 4DR4K 1RT2A 2P9SA 3DLRA 1GLDG 4N41A 4OKJA 5EVZA 1I94K 1RBUA 1BA1A 4ILHA 3NH0A 3FFKB 3T1HK 3HP9A 3M8PA 4JRQA 4AHCA 4I2PA 3DMJA 3LWMA 1C0MA 1B92A 2WBNA 3ZX2A 1CZAN 1SZ2A 4FYDA 4FWPA 5FPEA 1QHAA 1QSYA 5HL7L 2YNIA 3F9MA 1YJWN 3NCIA 3ZSOA 3NBPA 4AHRA 3MXMA 3AO5A 1X3MA 1V4TA 3TARA 3L4IA 4JLHA 1N8RO 4XEIA 1TK5A 4LF4K 3P4IA 4B9NA 1NMDA 3F5TA 4XIUA 2KFZA 3OTOK 1DEJA 1WSIA 3ZETA 3O5BA 4BRFA 3K5MA 4BRQA 4BACA 3QEXA 4GV3A 2ASPA 4DLGA 1A5WA 4FLYA 2NRWA 2A40A 2BE2A 4E19A 1VQ8N 3CYMA 4KV8A 1SKSA 1TV6A 4KTZA 1NLVA 3NVMA 3WXKA 1NK4A 1NGCA 3NHGA 4CF8A 3AY9A 3LAKA 1K8KB 4FSVA 1QQNA 4DV4K 4OPAA 1W97L 3FLCO 3JS6A 1LOTB 4PUOA 4CERA 4B9UA 3VF2A 2WONA 2W41A 3RSEB 3ZEUA 5HRSA 4DR1K 4B3MK 3WXLA 3PUFA 3K9JA 3ATUA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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