1GOAA

Cooperative stabilization of escherichia coli ribonuclease hi by insertion of gly-80b and gly-77-> ala substitution
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
156
structure length
156
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQGWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Cooperative stabilization of Escherichia coli ribonuclease HI by insertion of Gly-80b and Gly-77-->Ala substitution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
total genus 48
structure length 156
sequence length 156
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1goaA00
4RW8A 2RKIA 4HUGA 3RR7A 2QKBA 1VSEA 2D0CA 1HYZA 4K8XA 4JLHA 4C8NA 4C8MA 3VN5A 3DM2A 2HHSA 3NBPA 4ICLA 4CGJA 4FJ8A 3OYLA 1JLEA 3C95A 4J2DA 3TARA 4FM2A 2OZSA 2G8VA 3K2PA 3WNHA 3U3YA 2G8HA 4ID1A 1T8EA 4F8RA 3AVFA 4NCGA 1RT4A 4CHOA 3HPOA 2NUBA 1EP4A 3VQDA 4ZTJA 1YT3A 2FBXA 3QINA 4KTZA 5J2NA 4CFBA 4IFYA 2KFNA 1ZBUA 1JLBA 1BHLA 3BGRA 4DTMA 4EP4A 4Z0UA 2HW3A 4BDYA 1TAQA 1WSFA 3ZT2A 1TK0A 1NOYA 4E3SA 4DLGA 3UIQA 4FLWA 3VQ6A 4DU1A 3O4NA 5KGXA 1WAFA 1LW0A 4RW9A 3ZT4A 1VRUA 4JRPA 3AV9A 3U3GA 1YTAA 4DS5A 3WNGA 1D5AA 4CJTA 3D0PA 4HTUA 1J5OA 1QQCA 3CFRA 5C42A 5CZ2A 1HMVA 4M3TA 5HROA 4AHRA 1ITGA 4XIUA 4FJGA 3AVHA 3KK3A 1RTHA 3QEWA 1KSPA 1HQUA 1DTTA 1G15A 3AA2A 2ITGA 5I3UA 3RMCA 3PY8A 4O44A 3OY9A 1JXEA 3NF8A 5CYMA 4E7KA 3QNOA 2OPSA 1U4BA 3ALYA 1ASVA 2E6MA 2A1SA 4BACA 4DSLA 2OPQA 4QAGA 4F2RA 5CYQA 4CK2A 4BE1A 4KRFA 3TWHA 2IOCA 4DTJA 1NK4A 4CJFA 4O5BA 1FKPA 3TAMA 1S6QA 4RW6A 3K5OA 3M8RA 3ZSQA 4CEEA 4BWMA 4IBNA 3TR8A 4KAZA 1QSSA 2G8WA 2Z1JA 3ZT3A 4CERA 2PYJA 2F96A 1JLAA 3K5NA 1WSJA 4NYNA 3QO9A 3KD5E 1JLFA 4CEAA 3SJJA 3LPTA 3NF6A 4CHZA 5KRSA 4J2EA 2O4GA 4KO0A 3SQ1A 4CGGA 1RCHA 3G0ZA 1X9SA 4TSXA 4KHWA 3VQ4A 3M8PA 4CIEA 3TAEA 4FLVA 1S1WA 1DLOA 1TV6A 4KB1A 1S1VA 3EYZA 1JL1A 3G10A 4DTUA 5J2QA 4FYDA 4BWJA 4FZYA 1KVBA 3H08A 4FW2A 4CJQA 3LP3A 4N5SA 4LSLA 4CEDA 4KTWA 3V1RA 3LAKA 4IDKA 3ISNC 1REVA 5EU7A 3AVNA 4CIGA 3SQ2A 1TKTA 4LH4A 1L3TA 2YKNA 4HCCA 1RT3A 1BCOA 4OPJA 1NK6A 4CJEA 4KFBA 2VWJA 1BQNA 2VG5A 5T7BA 3OYEA 4PY5A 1HJRA 4FLXA 2B6AA 3V6DA 4AILC 4FLTA 1ZBLA 2HHXA 2YNHA 2IS3A 2Z1HA 4YNQA 1RDAA 3S9HA 4FJMA 1LW2A 4PUOA 3HO1A 3V81A 5J2PA 2HVHA 1GOAA 4AHSA 1CXQA 5I42A 3ZSOA 1HQEA 4HUFA 4KHSA 1X9MA 5FRMA 2D0AA 2E6LA 3NFAA 3L2QA 4OPKA 4CGHA 3OYIA 3RTVA 4M3ZA 1BISA 1XWLA 5HBMA 3L8BA 4OKEA 1RBSA 3HJFA 4PA1A 2YHAA 3DLRA 4FXDA 3V1QA 2AJQA 3K57A 3D45A 1VSFA 5DMRA 4O0IA 1RT1A 2KQ2A 1D9DA 4NCAA 3NGYA 5SWMA 2WONA 5E41A 4O0JA 3HYFA 4OVLA 2XY5A 4Q5VA 3SCXA 4AHUA 3ZSWA 3VQBA 4CGIA 3VQ5A 3OYHA 5HRPA 4B9MA 4I9QA 3TANA 4PQUA 4DTRA 2XY7A 4KB0A 1HRHA 1LV5A 3P83D 5D3GA 3CFPA 4HCBA 2ZD1A 3AVMA 4CJLA 3SUOA 3KLIA 2HB5A 3AO1A 4OKKA 4KHNA 3DRSA 3KK1A 4OLAA 1RT7A 3AVAA 2R7YA 1IKVA 1KTQA 2DY4A 4Y1CA 1U48A 4N41A 4B9SA 4Q0BA 4CFCA 3B6PA 4CHQA 4CHPA 3SUPA 3DRRA 3HP6A 4FK4A 3OYKA 1RT6A 4W5NA 3SV3A 1TKDA 4B3OA 4ELTA 1D9FA 1U04A 4FJNA 4DQSA 2BE2A 4OJRA 2XY6A 1KLMA 5JS2A 4I2QA 2OA8A 4FJLA 4CESA 4UQGA 1D8YA 4F4KA 5FRNA 1EX4A 3L2VA 1FKOA 1LAVA 3WNFA 3OYNA 4C8KA 3L2UA 1ZYQA 1S1UA 3KKSA 4FJ5A 3M8QA 3IS9A 3NE6A 4M3XA 1KFSA 1JLGA 4KREA 1L3VA 2HHTA 4FJ7A 4DTOA 3CFOA 3O4QA 4FM1A 4CGFA 4CFDA 3AA4A 4CE9A 3AO3A 1UWBA 3LAMA 4CJPA 1VSJA 1BI4A 1R0AA 2FBTA 4EP5A 3PO4A 4WE1A 4KI6A 1ZBHA 4DTNA 3TAFA 4Z4FA 3JYTA 4OGCA 5KI6A 3NH0A 1J54A 3NGZA 2DFHA 3SPZA 1ZBIA 4CFAA 2GUIA 3KK2A 2YNFA 1IG9A 4I2PA 4BDPA 4FJ9A 5J1EA 4KHQA 1IO2A 1ASUA 4DWIA 2B4JA 4IKFA 1X9WA 3TAPA 3S3NA 2VG7A 3AVBA 1U45A 3C6TA 4CEBA 1WSGA 4DQRA 1RDCA 3HPGA 1TAUA 4CJKA 4CGDA 2D5RA 4FCYA 3TI0A 2B5JA 4CJ3A 4IG0A 1SKRA 3LZJA 4CK3A 4CEOA 3F73A 4CF8A 4M3YA 3QESA 1HNIA 1NKEA 2G8KA 1EKEA 4FM0A 1NJWA 4RG8A 1VSDA 3ZT1A 2FC0A 3A2FA 2GV9A 5K14A 1JXBA 3F9KA 4CEZA 1RDDA 1ZBFA 1IKYA 3V9ZA 4H8KA 2OYQA 2BGGA 4DMNA 1JKHA 3AO2A 3SQ4A 1IH7A 3PV8A 3PUFA 3DLHA 3KD1E 2W42A 1S1XA 3OYGA 4I9LA 4OLBA 2X74A 2YV0X 4DU3A 3ZT0A 4DTXA 4F2SA 3QERA 3QLHA 2QKKA 5KTQA 4QOZB 4H4OA 3CM5A 3OYCA 3MECA 1J53A 4QCLA 1SL0A 1BQMA 3JSMA 2D0BA 3NF9A 2PZSA 4B9TA 3U6FA 3MEDA 4DTSA 4LD0A 3MXMA 3DLEA 3QEIA 1WN7A 1O1WA 3MAQA 1WLJA 2ZQBA 4CIFA 4DSIA 1F21A 4Z4HA 1FXXA 5FDLA 4F3OA 3P5JA 1KLNA 4O55A 4YFUA 4JRQA 3NGIA 4CJUA 3ITHA 3HM9A 5HP1A 1WAJA 1TK5A 3KJVA 4DFMA 5HLFA 4ID5A 2I5JA 1ASWA 3VQPA 3ZSYA 1NJZA 1I3AA 5HRRA 3OS1A 1CZBA 2GBZA 2OPRA 1VSKA 3M8SA 1BL3A 5CZ1A 3OYMA 4G1QA 1VRTA 3O3GA 3QEPA 1LAWA 3KLEA 4LY7A 3OYAA 1RTDA 3HP9A 1BCMA 1BIZA 4FJXA 3VQ8A 3SQ0A 2HHVA 4Z4GA 3NCIA 1SL1A 4EZ9A 1C1AA 3ZSZA 3L2WA 1QSYA 2XHBA 2QK9A 1Q8IA 3VQ7A 3SV4A 3RMDA 1KRPA 1GOBA 3RWUA 4M45A 3O3HA 4M41A 1XC9A 1NK0A 3AVIA 1JLCA 2O4IA 2PY5A 4OKJA 4B9NA 3B6OA 2JLEA 4FW1A 2HHUA 5KRTA 4E0DA 1EXQA 4FJHA 1RTJA 3IG1A 3O3FA 4E7LA 3RR8A 1WSIA 2OPPA 1L5UA 4N47A 4DFKA 4NYFA 4GMJB 1I39A 4N56A 1IKXA 4KTQA 1CZ9A 2Q3SA 4LH5A 1RBRA 2XY8A 1RBTA 1BIUA 2FBYA 3OYDA 1RBUA 3OYFA 1T05A 4M3UA 4W5OA 1U47A 4DQQA 3NAEA 3CG7A 1UA1A 1KCFA 4KKOA 1NJYA 1VSLA 2IAJA 3E01A 1SL2A 2HNYA 4B08A 4CJVA 2Y1IA 4FVMA 1TL3A 3SNNA 1QSLA 2RPIA 4C8LA 4CF0A 3LWMA 1KFDA 2Y1JA 3V9SA 1HPZA 2XRIA 4GVMA 3KKRA 3AVJA 4OGEA 1NK7A 4N76A 2X6NA 1A5VA 2RF2A 3CQ8A 4B9LA 4FJKA 2F8SA 2JGUA 4DS4A 1TGOA 3SUNA 4RW7A 1BI4B 4W5TA 4HHTA 3LALA 4DFJA 3PO5A 2F8TA 4BE2A 4DQIA 3L3UA 1W0HA 1N5YA 3AVKA 3K58A 4FZXC 4CECA 4KPYA 3C6UA 2EHGA 4KI4A 3AVCA 3V9XA 1T03A 4E7JA 4GW6A 3PX0A 4JS5A 1XHXA 3DYAA 3K5MA 3KLGA 3LWLA 1N6QA 3HT3A 4JS4A 4R5PA 3KIOA 3RRGA 1HYSA 3BDPA 3QIPA 1VSMA 5HRSA 4B9UA 4M3WA 2BANA 4CEFA 1RNHA 3ASMA 1XI1A 4BE0A 1NJXA 3SI6A 4CHYA 3QEXA 3DLKA 4E89A 4E1MA 3S3OA 1WNSA 1C0UA 2IGIA 1C0MA 4H4MA 4DLEA 1TL1A 1W9HA 4AHVA 1WSHA 1TK8A 2ATQA 5HRNA 3OYJA 4FJJA 2EX3A 2DFEA 2QXFA 1C0TA 3VQCA 3I8DA 4DSEA 3NH2A 3PX4A 1NKCA 3HK2A 3VA0A 2KFZA 4O4GA 1SKSA 1RBVA 3MEEA 3AO5A 3TABA 4AHTA 4Z4EA 3LP0A 1S6PA 3OS2A 1TVRA 3LANA 1RT5A 2P51A 3AO4A 3SUQA 1MU2A 2KZMA 3MXIA 1YVUA 3LP1A 4AH9A 2P5OA 4CJWA 2LSNA 3DI6A 1Z25A 3OJSA 3VA3A 1LWCA 4DF8A 3WNEA 3HVRA 3V1OA 5C25A 3ZSVA 4MQ3A 5KGWA 1SUQA 1A5WA 1L3UA 1S9EA 2G8IA 3K59A 1X1PA 3HPHA 3OVNA 5FROA 1NK9A 1L3SA 1B9DA 4HUEA 3AVLA 3V9UA 3LDSA 3CM6A 3EY1A 3CYMA 4Y1DA 1JLQA 4W5RA 4J2AA 5CY4A 3VQAA 3I0SA 2HMIA 4KV8A 1Q9YA 4ZTFA 1QTMA 1YTUA 1UAXA 1Z26A 3HL8A 1Q9XA 4FZZA 1EETA 1U49A 3TAGA 3I0RA 4M3RA 1NK5A 2PYLA 1IKWA 4K8ZA 1RDBA 2VG6A 3T19A 3RMBA 4B8CA 1A5XA 3NH1A 1TKZA 3PX6A 2RN2A 1C1CA 1C6VA 4CF1A 3V9WA 2G8UA 3T3FA 3TAQA 3QIOA 2XO7A 3AVGA 3QNNA 4AHCA 1VSHA 3K5LA 2VWKA 4FJIA 1UA0A 2A1RA 1UOCA 3KLFA 1VSIA 4Z4CA 2KW4A 1NKBA 4MFBA 2Z1GA 3IRXA 4EZ6A 1SV5A 5JS1A 2E4LA 3NHGA 4FLYA 4W5QA 3NF7A 3KLHA 4PWDA 3ZSRA 4CCHA 3DOKA 3DMJA 1RT2A 1T7PA 2X78A 4J2BA 4DFPA 2FBVA 1J9AA 3ZCMA 1GOCA 1LWEA 4I7FA 2G8FA 3DLBA 2YNIA 3FFIA 4M42A 4IG3A 1JL2A 1CXUA 2HNDA 3AA5X 2HHWA 1NOZA 3VQ9A 1XHZA 3THVA 4B8AB 3NDKA 4CF2A 1RTIA 3OYBA 4Z4IA 3VQQA 3HVTA 2OZMA 4ELUA 2DFFA 2P1JA 2YKMA 4FLZA 2ZE2A 4DSKA 1KVCA 1QHTA 2YNGA 4ELVA 1K6YA 3L2RA 3IAYA 2WOMA 3AA3A 1NK8A 2BDPA 3KTQA 1CLQA 3OS0A 4CK1A 1QE1A 1WSEA 4E7HA 1LWFA 1BGXT 5SZTA 1B92A 2X6SA 4E19A 4DU4A 4DQPA 4DF4A 3QEVA 4RW4A 4DG1A 3ULDA 4NCBA 3VQEA 4E1NA 3EZ5A 1KVAA 4DSJA 3P1GA 3HSTB 3MXJA 1S5JA 5C24A 2ETJA 3QETA 1B9FA 1RILA 1S1TA 3C94A 4KHUA 4E7IA 3LPUA 3RMAA 3OJUA 1DTQA 2IC3A 3RRHA 4ZHRA 1S9GA 2HVIA 3DOLA 4CJ4A 1C1BA 1FK9A 4IFVA 4C8OA 4CJSA 4DSFA 2HHQA 3HXMA 3SZ2A 4CJRA 3DRPA 3LP2A 2P5GA 4FK0A 4BDZA 4CHNA 4L8RB 4B9VA 2KTQA 3L3VA 1SKWA 3V4IA 1VK0A 1TKXA 2KZZA 2YHBA 1QS4A 5DK5A 1HNVA 3T1AA 2Z1IA 4CEQA 4CJ5A 4CF9A 3LZIA 4FLUA 4FK2A 4DTPA 1HYVA 4KHYA 3S3MA 3DLGA 1Y97A 3MEGA 3SYZA 2IDOA 4HVJA 5J2MA 4LSNA 3SPYA 4F3TA 2HNZA 3ZSXA 2DTUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3T1YK 4OPAA 4DV6K 4B1WB 2D0CA 4K8XA 4JLHA 3O9UA 4I6MA 3F5TA 4FOIA 3NBPA 5AQPA 4FJ8A 3OYLA 4FM2A 4FWLA 1S3XA 3TTFA 2G8HA 4GNIA 1RT4A 3HPOA 2A5XA 1EP4A 3M3ZA 1YT3A 4KTZA 3VF4A 5C10A 4IFYA 4KH4A 4PKIA 4DV7K 3GG4A 1NGCA 2P9KA 1NOYA 4CVNE 5AR0A 4DLGA 4DU1A 2UXCK 2OTJN 1YTAA 3D0PA 2A40A 4E1JA 5C12A 4FJGA 5I9EB 3QEWA 1KSPA 3PY8A 1DTTA 2E20A 3NVKA 2V51B 4O44A 5CYMA 4BREA 2OPSA 1U4BA 3NMUA 4BACA 1ILYA 5LJVA 4CK2A 4U7BA 2NRZA 3HM8A 1FKPA 1S6QA 4FWMA 4RW6A 1RDWX 3ZSQA 2G8WA 4JD2A 3CJ1A 4CERA 1JCFA 2F96A 1JLAA 1GLFO 1WSJA 4JN4A 3FR0A 3LPTA 5HOOA 2O4GA 3A5OC 2NZTA 4J2EA 3ID8A 3K9KA 2P9IB 3SAHA 1Q86O 4FLVA 4M7YA 5ELZA 2Q2RA 4U67L 4O5FA 3H08A 2Q1NA 4LSLA 3V1RA 5ADXA 3AVNA 3VTIA 3GE1A 4MLEA 1O13A 2VWJA 3CMAN 2VG5A 3V6DA 2B6AA 3BF1A 3FGUA 2HHXA 3CCJN 5FLXO 4FJMA 4BRCA 3ZEUB 3T1HK 3CQYA 1SQKA 5I42A 1BU6O 2PFUA 4UY8O 3L8BA 4OKEA 3HJFA 4FXDA 4BGBA 3V1QA 2AJQA 3HRGA 4NCAA 2A41A 2KQ2A 1K8KB 2JWKA 3NGYA 2IVPA 4ISGA 5AQFA 3SCXA 3OYHA 3ZSWA 3VQBA 3RSEA 3DAWA 4I9QA 4DTRA 3P83D 5D3GA 4BRLA 4OX9K 1FJGK 1KTQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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