The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
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sequence length |
116
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structure length |
116
|
Chain Sequence |
b'KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
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| total genus |
25
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-12-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4JI7 K; 3J7A P; 4JI2 K; 4B3T K; 5LMN K; 2HHH K; 1N36 K; 4LFC K; 1XNQ K; 3J80 O; 4LF8 K; 4JI4 K; 2UXC K; 2UUC K; 4DV7 K; 1N34 K; 1I94 K; 2UUB K; 4LFB K; 2VQE K; 4B3R K; 2VQF K; 4X65 K; 4LF4 K; 1IBL K; 2UUA K; 1HNW K; 4DR4 K; 4NXM K; 4DV0 K; 4NXN K; 1HNX K; 4JYA K; 4LF5 K; 4B3S K; 1N32 K; 4CVN E; 4CW7 B; 5IT9 O; 5A2Q O; 4AQY K; 3J81 O; 4LF6 K; 4DV3 K; 1HNZ K; 4GKK K; 4JI3 K; 4DV5 K; 4X64 K; 4YY3 K; 1XMQ K; 3OTO K; 4JI8 K; 4DR6 K; 4LF9 K; 4JI5 K; 4X62 K; 2F4V K; 4DR2 K; 1XMO K; 4DUY K; 4OX9 K; 1XNR K; 4K0K K; 4LFA K; 4DR3 K; 3T1Y K; 3JAM O; 4JI1 K; 4DV2 K; 5FLX O; 2UXB K; 1FJG K; 4X66 K; 4LF7 K; 4DV4 K; 4JI6 K; 1J5E K; 1HR0 K; 4DR7 K; 5IWA K; 4DUZ K; 4JV5 K; 1IBM K; 4DR1 K; 4DV6 K; 4GKJ K; 4V19 S; 4B3M K; 4DV1 K; 5BR8 K; 4DR5 K; 3T1H K; 2UU9 K; 3J7Y P; 5LMU K; 2UXD K; 2E5L K; 4JI0 K; 5LL6 Z; 5AJ3 K; 4YHH K; 4KHP K; 1IBK K; 2ZM6 K; 1N33 K; #chains in the Genus database with same CATH topology 4JI7 K; 4AHR A; 3AAP A; 4JAX A; 5AQJ A; 3VQ4 A; 3HRG A; 3C6T A; 4B3T K; 1WSG A; 4IKF A; 1ASV A; 4BQZ A; 4IDH A; 4ILG B; 4B9Q A; 1TL3 A; 4NB4 A; 2NRH A; 3NGY A; 3VTI A; 1YIJ N; 3HSC A; 4BY9 C; 5EVZ A; 1NM1 A; 1SL1 A; 2HHX A; 5AQZ A; 4IO9 L; 1UOC A; 4OVL A; 2VQE K; 3ZET B; 2VQF K; 3WUH A; 3UKU B; 4N56 A; 3UB5 A; 1QE1 A; 3KD5 E; 2P5O A; 2GX9 A; 1SKR A; 1IKW A; 4A5B A; 3VEO A; 4DTJ A; 3CCV N; 4DU4 A; 3QEX A; 4KO0 A; 1D5A A; 4FOI A; 1JLE A; 1XQS C; 3V9S A; 2Y1I A; 1TYQ B; 3ZT3 A; 1VSI A; 3I33 A; 2B4J A; 4EHU A; 1RDC A; 4YOV A; 3F9M A; 3AVA A; 1KRP A; 3ALY A; 4CHZ A; 4PQU A; 4I2P A; 2Z1I A; 4G1Q A; 5T7B A; 4UY8 O; 2NRT A; 3DRR A; 2P51 A; 3TTC A; 5CR4 A; 2R7Y A; 3ZSQ A; 1D9F A; 3MN9 A; 5M1K A; 3TI0 A; 4FWR A; 1RDB A; 2A6A A; 5CZ1 A; 4M3W A; 2E2P A; 1RT5 A; 1B92 A; 3HOS A; 3CCM N; 4IXC A; 4PKH A; 3V1O A; 4B08 A; 4OLA A; 3F73 A; 3TAP A; 5KPT A; 1EXQ A; 3SUP A; 4L3Q A; 4DV2 K; 3SMS A; 1VK0 A; 1ATR A; 3G0Z A; 3BUZ B; 2D0O A; 3CPW M; 3LP1 A; 5AQP A; 1K8K A; 3EY1 A; 1JKH A; 2LSN A; 5JIC A; 2IC3 A; 3PSI A; 3OJS A; 4RW8 A; 3FGU A; 1NGG A; 3BZC A; 1S3X A; 2A1R A; 3MAQ A; 2P9S A; 3QB0 A; 3PSF A; 3T3F A; 2D0C A; 4FM1 A; 2Y1J A; 2HBM A; 2IVP A; 2HHV A; 1GLE G; 5I9E B; 3U9D A; 1RT6 A; 4CZJ A; 2HVH A; 1TKD A; 1I3A A; 3V9U A; 1C0M A; 1W97 L; 5AZJ A; 4AHT A; 4GV3 A; 5JVH L; 1SV5 A; 2RHK A; 4A61 A; 3FLC O; 3VQ6 A; 4BWM A; 4FLW A; 1BIZ A; 1RNH A; 1U2V A; 3JXU A; 5AQS A; 4YFU A; 1N34 K; 4FXD A; 2P5G A; 2FSN A; 1NOZ A; 2HHS A; 1OH8 A; 4WE1 A; 1M1K O; 2PYJ A; 3THY B; 4O5B A; 4CJ7 A; 1LWF A; 2E1Y A; 3OYK A; 4CJ3 A; 2O8E B; 4U7B A; 1KFS A; 3SAG A; 3ULD A; 4FK4 A; 4NLB A; 3ZET A; 4MFB A; 3UKU A; 1HX1 A; 1VQ7 N; 3HM8 A; 1K9M O; 2HHQ A; 4B1W B; 1VSJ A; 3EL2 A; 4YOX A; 3OW2 M; 4DTP A; 3SQ2 A; 5KGX A; 3WXM B; 4H5W A; 1U49 A; 1QHA A; 1TYQ A; 5BRH A; 1JCE A; 4CGI A; 3OYE A; 4E1N A; 4WQ5 A; 4JKG B; 1TK5 A; 3M6G A; 3IAY A; 2F7T A; 4FJM A; 4Q5V A; 4DF4 A; 3OA9 A; 4EIA A; 3TAF A; 3V1Q A; 4AHS A; 4KPY A; 1SKS A; 3DOL A; 1GOB A; 4E89 A; 1S5J A; 4IFV A; 3KLF A; 4JI1 K; 3L8B A; 1S22 A; 1BU6 O; 4GW6 A; 3OYN A; 4F9O A; 3U4L A; 3H1V X; 1KAX A; 5IWA K; 1XI1 A; 3E66 A; 4RTF D; 3V9W A; 2QWM A; 4W5N A; 4K8Z A; 1KAY A; 5AQR A; 3KKS A; 3DI6 A; 1YJW N; 1U45 A; 3BGR A; 5ADX H; 3T1H K; 3J7Y P; 1U4B A; 4Z4I A; 1L3S A; 4GV6 A; 2Q0R A; 1T8E A; 1QQC A; 1RDA A; 1WSJ A; 1NGC A; 4QS8 A; 2RKI A; 4JKD A; 2E2O A; 2OA8 A; 4GVM A; 3VQB A; 2HMI A; 4N76 A; 1JCF A; 3NAE A; 4DTU A; 4BE2 A; 4CJT A; 4F2S A; 4ISF A; 3VEW A; 3DLG A; 3KK3 A; 4XIU A; 2P9U B; 3CET A; 4O4G A; 1TV6 A; 4N5S A; 3CJ9 A; 3MX2 A; 4CJL A; 3AO4 A; 3R6M A; 3M1F A; 4DF8 A; 4H0O A; 2ASO A; 2D1K A; 3ID6 A; 2WOM A; 3CPE A; 1NWK A; 3A5L C; 1W7A A; 4AHV A; 2ZJR L; 3P1G A; 5CE3 A; 5ELZ A; 2VG7 A; 3T19 A; 4BRG A; 2VWB A; 4ZTF A; 2YHA A; 4Z0U A; 5C24 A; 2KHO A; 3CJ7 A; 1LW0 A; 3TPQ A; 3ULE B; 3MEE A; 5AQN A; 4FVU A; 3CF5 L; 2NRW A; 4YOT A; 3A8Y A; 1ZBL A; 1BUP A; 2OCE A; 1RT3 A; 1ASU A; 2E88 A; 5JMV A; 3AA2 A; 3D7E O; 1HKC A; 5AQV A; 3F9K A; 2DY4 A; 4B9N A; 3THV A; 4DR2 K; 3L4Q A; 3OYA A; 4BC3 A; 4JN4 A; 2X6S A; 5CHI A; 3VA3 A; 5JS1 A; 3HI0 A; 4K0K K; 3S41 A; 4MO5 A; 3NH0 A; 1JLG A; 1VSD A; 2NLX A; 4E7I A; 4JHD A; 2BGG A; 2GTD A; 1Y64 A; 1GOA A; 2X74 A; 2KFN A; 4DSF A; 4KTQ A; 1RT7 A; 4KH4 A; 3NDK A; 2IVO A; 2I7N A; 2JWL A; 3Q7B A; 4LF7 K; 1W9H A; 4JI6 K; 4FJ8 A; 1BDG A; 4CEO A; 1WAJ A; 3ZLJ A; 4JKG A; 4WFA L; 1RDD A; 1XWL A; 4CJ4 A; 2A5X A; 3D2E B; 4B1U B; 1S6P A; 3CCE N; 4CJ5 A; 4BRK A; 3C95 A; 3AVG A; 1KVA A; 1NK0 A; 2ZM6 K; 4BGA A; 4H0P A; 4AF1 A; 2HF3 A; 2E4L A; 3VQ8 A; 1NKC A; 4JI2 K; 4K8X A; 3KK2 A; 3MX5 A; 2YHX A; 4LFC K; 3MXI A; 4FWO A; 4FPA A; 4WQ5 C; 3H3O B; 3PLA A; 4FJ9 A; 1RCH A; 4HUG A; 4KTZ A; 2KQ2 A; 1O1W A; 1TGO A; 4PWD A; 5CZ2 A; 4IG0 A; 4Z4C A; 4EZ9 A; 5AQK A; 4CGH A; 3THW A; 3AA3 A; 2E2N A; 1FK9 A; 4DFJ A; 1S1X A; 4PUO A; 3E01 A; 1S9E A; 4UQG A; 4CJV A; 4HUE A; 4JS4 A; 3KZB A; 1JL1 A; 2ZE2 A; 1HYV A; 3ZT2 A; 4KHQ A; 1BIS A; 3PUF A; 1BOT O; 4JD2 B; 2FLO A; 3THX B; 1GLF O; 3LZJ A; 4H03 B; 4H0T B; 3HP9 A; 2F96 A; 3CCL N; 4WF9 L; 4CE9 A; 3CJC A; 2VGN A; 4PHT X; 5B8H A; 3VEN A; 1N32 K; 1T6C A; 1ZXO A; 3AVJ A; 3R8E A; 3OYB A; 2CGK A; 4IDK A; 1HYZ A; 1JXE A; 4Z4G A; 3DLL L; 1NOY A; 3V9X A; 3WT0 A; 1X9J A; 3QBW A; 3M8Q A; 1BO5 O; 1QTM A; 4JI8 K; 4WFN L; 3S9H A; 1C1A A; 1XHZ A; 2G8H A; 4A2A A; 3ULE A; 3IMX A; 4FM0 A; 3U3Y A; 4ID1 A; 4DUY K; 5BPL A; 4FWQ A; 4CZG A; 5ADX A; 2DFH A; 2AA4 A; 2UYT A; 4BWJ A; 2OYQ A; 1SKW A; 1VSK A; 2HB5 A; 3CC4 N; 2RE2 A; 3OBY A; 2FSJ A; 3AAR A; 1RBU A; 3ZSV A; 3TU5 A; 1NJW A; 3VOV A; 4LSN A; 4JNE A; 1IKV A; 4DV6 K; 3I8B A; 3HVR A; 3BY5 A; 3TAM A; 1VQ4 N; 3KTQ A; 4FVM A; 4Z94 A; 4H5N A; 4FPB A; 3CCQ N; 2WC9 A; 5LMU K; 3K5M A; 3AGK A; 2IDO A; 1X3N A; 3R9P A; 4KHP K; 2HF4 A; 3I8D A; 4FLZ A; 4BAC A; 4W5T A; 4I7F A; 1UWB A; 5LJV A; 4M42 A; 2QM1 A; 4CIE A; 4DTS A; 2ZWH A; 4O0I A; 1LAV A; 3O4W A; 1KAZ A; 3CQ8 A; 4O44 A; 4K42 A; 2PZS A; 1EKE A; 2YNG A; 3J80 O; 3P39 A; 2UXC K; 1HRH A; 3TAN A; 3BF3 A; 2YKM A; 2YNF A; 4CJP A; 2CH5 A; 1XC3 A; 4FJX A; 3AAQ A; 3L3V A; 4CBU A; 3GBT A; 3HVT A; 1Q86 O; 3T69 A; 4PA1 A; 3H45 C; 1C1B A; 4B9U A; 2E6M A; 1QSL A; 3L2U A; 1MWK A; 3CM5 A; 1UA1 A; 2XRI A; 1BHL A; 3O9U A; 1W2B M; 3G4S N; 2YHW A; 1QHT A; 3D45 A; 4DSJ A; 4CEA A; 4KB0 A; 4B3S K; 1VAZ A; 4CVN E; 4CW7 B; 5FPE A; 1A5W A; 4RW9 A; 3U8X A; 1Q9X A; 1HKB A; 3SI6 A; 2P9I B; 2WUS A; 5KQ8 A; 1HNV A; 4GY2 B; 2F9T A; 2YI1 A; 3THX A; 4BC4 A; 5AZI B; 1XMQ K; 5M1Q A; 3FZL A; 3IDH A; 4DR6 K; 3FZH A; 3BDP A; 1TAQ A; 3RRH A; 1ITG A; 1JL2 A; 3CJB A; 4IOX A; 4BR4 A; 3C0B A; 1VQO N; 1GLJ O; 4KFB A; 4HWI A; 3ENH A; 4IEE A; 1BWF O; 2A41 A; 4H5R A; 1GLC G; 3CFR A; 4Z4F A; 3JYT A; 3MDQ A; 3OHR A; 5C42 A; 3TTD A; 4CHO A; 3O4Q A; 4BDP A; 5LY3 A; 3UKR B; 2QXL A; 4CEZ A; 3O80 A; 5GIP A; 3AO5 A; 1P90 A; 2D0P A; 2YX6 A; 1LCU A; 1K73 O; 4KTW A; 1RBV A; 4FWN A; 1ASW A; 3O9T A; 2O8C A; 2QWL A; 1HPZ A; 2OZM A; 1RFQ A; 2FF6 A; 3SUQ A; 1CXQ A; 3OS0 A; 3LPT A; 3SUN A; 3TAQ A; 1UA0 A; 4EP5 A; 3LM9 A; 3RSE B; 5HRP A; 3TAB A; 3U3G A; 3OJU A; 3NF9 A; 2P9P B; 1HQU A; 4FLY A; 4OPA A; 1MWM A; 5GAH P; 3QDK A; 1QQM A; 3NFA A; 3VEX A; 1JLF A; 4CBW A; 3CCR N; 3OVN A; 3OBW A; 2IGI A; 2A40 A; 4E7L A; 2OZS A; 5FPM A; 1O13 A; 3PV8 A; 1EWQ A; 1NLV A; 3HL8 A; 2FC0 A; 2F8S A; 3SAH A; 1C0T A; 4ISE A; 4BRL A; 2IOC A; 4BR2 A; 4Y1C A; 3GG4 A; 4BVP A; 2D4W A; 3O6W A; 4JKB A; 4C1N K; 2O8F B; 1Z6R A; 3LDQ A; 3QO9 A; 2VCP A; 4JKF A; 4IWV A; 4FM2 A; 3C6A A; 1SZ2 A; 4E19 A; 3CQY A; 4CF9 A; 2B5J A; 2GV9 A; 3OTO K; 4X62 K; 2V7Z A; 2VG5 A; 3WXL A; 3VQQ A; 2YCH A; 4CZI A; 5HRS A; 4J2D A; 4NLC A; 4B1V A; 1RTI A; 2G8U A; 2I5J A; 2P9I A; 3DLB A; 4E7H A; 1OH6 A; 4KHY A; 3T7Z A; 3G6E N; 4BVO A; 3O3H A; 3EYZ A; 3L6Q A; 5AZI A; 3EKU A; 3DMJ A; 4YNQ A; 4QAG A; 2P1J A; 2FSK A; 1TVR A; 1KC8 O; 1BG3 A; 1TKT A; 3ITH A; 3B8A X; 2E6L A; 4Y0W A; 4DLE A; 4FZX C; 1VSF A; 4YOR A; 2QWN A; 3SBG A; 3KK1 A; 3K9J A; 1F21 A; 4A62 A; 4KB1 A; 1Z26 A; 5BRF A; 4E3S A; 4JI0 K; 1SS6 A; 3WXK A; 5AJ3 K; 1YF5 L; 3VGM A; 4AHC A; 2HVI A; 2FXU A; 5AFU H; 1GLD G; 1C0U A; 2ATQ A; 4OKE A; 4E7J A; 4BRD A; 4FJG A; 1TL1 A; 3AVL A; 5HRO A; 3DAW A; 4F4K A; 1NG9 A; 2FBX A; 4BDZ A; 1RT1 A; 3AVB A; 3VET A; 4R5P A; 2BAN A; 1N36 K; 2HHU A; 3NH2 A; 1S1V A; 3A5O C; 4LY7 A; 4YDU A; 3W0L A; 4FYD A; 1XHX A; 1QVG M; 1C0G A; 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4FJJ A; 2OPP A; 2YKN A; 1ZBI A; 4Y1D A; 3OYF A; 3PX0 A; 5AQW A; 2UUB K; 4PL7 A; 1VRT A; 3VER A; 1J53 A; 1ATS A; 3CG7 A; 4DQS A; 1VRU A; 1N8R O; 3SMP A; 4FO0 A; 3ATU A; 4NXN K; 2BTF A; 3A0I X; 3DXK B; 1NGB A; 3HJF A; 4CGJ A; 4L8R B; 3C65 A; 2HHT A; 2H3G X; 3VTH A; 5DM7 L; 2KLA A; 3SZ2 A; 4AIL C; 1TAU A; 3I56 N; 4TSX A; 1NJI O; 1RT2 A; 3ZSZ A; 4B9T A; 1IG9 A; 1S9G A; 3KK7 A; 4AHU A; 3IRX A; 3OYI A; 1ZC6 A; 2AJQ A; 3J81 O; 3I55 N; 4CZM A; 2P9L B; 3ID8 A; 4ZHR A; 4DV5 K; 3C6H A; 1MU2 A; 1YAG A; 4YDU C; 1RIL A; 2QWO A; 4LF9 K; 4H4O A; 3LP2 A; 3FFK B; 2JLE A; 4FJ7 A; 3A5N C; 1HJO A; 1ZBS A; 4DB3 A; 4HUF A; 3KIO A; 3WNG A; 3LL3 A; 1NK7 A; 2VG6 A; 3THY A; 4DQQ A; 2GWK A; 5DK5 A; 1T7P A; 3CJ1 A; 2XY6 A; 3DLK A; 2J4R A; 2ZGY A; 3ENB A; 5AFU A; 1GOC A; 3K0S A; 1U48 A; 5HRR A; 2O8E A; 3MK6 A; 1NKB A; 4CEE A; 5BRE A; 3O1B A; 4KBO A; 2YHB A; 5C10 A; 1BI4 A; 3AO2 A; 1JXB A; 3QIN A; 5AQL A; 5EY4 A; 1DTT A; 5BR9 A; 4DQR A; 4V19 S; 4HTU A; 4LC9 B; 3K9K A; 4DR5 K; 3V4I A; 1DLO A; 3CM6 A; 3QEP A; 4JKH A; 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