The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
|
sequence length |
116
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structure length |
116
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
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| total genus |
25
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-12-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5LL6 Z; 4V19 S; 4CVN E; 4DUZ K; 3J7A P; 1IBK K; 2UU9 K; 4AQY K; 5BR8 K; 2HHH K; 2UXD K; 4JI1 K; 4KHP K; 4LF5 K; 1I94 K; 4DUY K; 3JAM O; 4NXM K; 5FLX O; 1XMQ K; 3J80 O; 4LFB K; 5AJ3 K; 4B3M K; 4LF4 K; 4JI4 K; 4JV5 K; 3J7Y P; 3T1H K; 4JI2 K; 4JYA K; 4DR3 K; 2ZM6 K; 4B3T K; 1N32 K; 4DR7 K; 1HNZ K; 4GKK K; 1N33 K; 4LFC K; 4DV0 K; 2F4V K; 1HNX K; 1HR0 K; 4DV3 K; 4DV1 K; 5LMU K; 4DR2 K; 4LF9 K; 1XNQ K; 4GKJ K; 4K0K K; 1IBL K; 2VQF K; 4DV4 K; 4DV2 K; 4LF8 K; 4X66 K; 4JI3 K; 1N36 K; 2UUC K; 2UUA K; 1N34 K; 4JI5 K; 1FJG K; 5A2Q O; 1XNR K; 1XMO K; 2UUB K; 4YY3 K; 4DV6 K; 4NXN K; 4DV5 K; 5IT9 O; 4X64 K; 4X65 K; 4B3R K; 4CW7 B; 4B3S K; 4OX9 K; 1HNW K; 4DR1 K; 4JI0 K; 4JI6 K; 4DR4 K; 2VQE K; 5LMN K; 3OTO K; 4LFA K; 4YHH K; 4X62 K; 1J5E K; 4JI7 K; 3T1Y K; 4DV7 K; 2UXB K; 5IWA K; 3J81 O; 2E5L K; 4DR6 K; 4LF6 K; 4LF7 K; 2UXC K; 1IBM K; 4JI8 K; 4DR5 K; #chains in the Genus database with same CATH topology 4B9M A; 3H3N O; 4BC3 A; 1KC8 O; 1YTU A; 1TK0 A; 3ZCM A; 3B8A X; 3NF7 A; 4RWT A; 4DTP A; 2WON A; 3SJJ A; 2EHG A; 3AGR A; 2DPN A; 2O4I A; 5CYM A; 1XC9 A; 3K5L A; 2D0C A; 5EXW A; 2WUS A; 3F9K A; 3CCE N; 2E1Z A; 4IFV A; 3OS1 A; 3NE6 A; 4E1J A; 1NGJ A; 3F5T A; 4CHZ A; 1K9M O; 4W5R A; 3FLC O; 4H5T A; 3QEI A; 4KO0 A; 2WTU A; 1VHX A; 2QM1 A; 2VYP A; 3CD6 N; 4WFA L; 1WSI A; 1J6Z A; 4OGC A; 3KHY A; 1IH7 A; 4DR3 K; 4IJN A; 3SQ4 A; 1Q9Y A; 1X9S A; 1UOC A; 2AA4 A; 1NJW A; 1XHZ A; 1BU6 O; 4ISE A; 4AM6 A; 4JEP A; 3V9U A; 3HPG A; 4OKJ A; 5I9E B; 2X6N A; 1WBB A; 3A5O C; 1FW6 A; 1NK0 A; 5C0Y A; 2AP1 A; 3VES A; 2VG6 A; 1BDG A; 5AQR A; 1RDB A; 5EX5 A; 3SBT A; 4EHT A; 4IJA A; 3OS0 A; 3CME N; 3O6W A; 3H45 C; 4FJN A; 3NF9 A; 5FPE A; 4F2R A; 2UUC K; 3CPE A; 3FE1 A; 2RE2 A; 2DFE A; 3OYN A; 4I9L A; 4YOT A; 3H1V X; 3QIO A; 1L5U A; 2FBT A; 2FF6 A; 4I2Q A; 3BGR A; 2ZQB A; 4BRF A; 1R0A A; 1RT4 A; 1EET A; 4O5B A; 3RRH A; 4CHP A; 2NRV A; 1YIT N; 3DOL A; 4CBX A; 2YX6 A; 2KZM A; 4WQ4 A; 1TK5 A; 4B9Q A; 3MEE A; 3OTO K; 3PSF A; 4AF1 A; 1BCO A; 5AQM A; 3C6T A; 3SUP A; 2O8D A; 1Z6R A; 3VEW A; 1GOB A; 1T3V A; 4FLW A; 4CZM A; 4OO1 J; 3SZ2 A; 3G71 N; 5E84 A; 4I7F A; 3ZSY A; 3CC2 N; 4ELT A; 4IDK A; 4KB0 A; 3C6H A; 2Z1G A; 1BO5 O; 3CYM A; 4WQ4 C; 4NYN A; 4H0X B; 4J2E A; 4W5O A; 4KHY A; 1T05 A; 2B5J A; 3CQY A; 4XH1 A; 4L8R B; 1TV6 A; 3IAY A; 4DU1 A; 1NK9 A; 4CJ3 A; 4CIF A; 4LSL A; 3KVG A; 2PZS A; 3VEX A; 1SL0 A; 4FSV A; 4Z4I A; 3AVJ A; 4DTX A; 3HK2 A; 2XY6 A; 3L2Q A; 3ZSW A; 3P5J A; 3VQA A; 5JLF A; 3I56 N; 3HBT A; 1VQ8 N; 1Q8I A; 2HB5 A; 3CXC M; 4UY8 O; 2D1K A; 3OYG A; 4CI6 A; 4JI4 K; 2ASO A; 1HYS A; 3T1H K; 3RSE A; 4NYF A; 2QXL A; 1W0H A; 3OHR A; 4B3T K; 3F9M A; 5KRT A; 3EN9 A; 4DSE A; 2D0A A; 2IC3 A; 2IS3 A; 3J8A A; 3VF2 A; 3NMU A; 1KFD A; 2JWK A; 2CGK A; 1KRP A; 3LDS A; 1JLA A; 2OZS A; 3D2F A; 3V6D A; 1SKW A; 3V9S A; 2HF3 A; 3KK3 A; 3AV9 A; 4NCG A; 1V4S A; 2BUP A; 1S1U A; 3CCL N; 2F96 A; 1QS4 A; 2P9S A; 2RKI A; 3E1Y A; 3K5O A; 1ASW A; 3MCP A; 5KQD A; 3KWI A; 4CJ7 A; 3DM2 A; 4CZK A; 2O8B A; 3HTV A; 4EZ6 A; 4CEC A; 1QTM A; 5SWM A; 1QQO A; 4KBO A; 3WQU A; 1YTA A; 4FJ7 A; 1RBU A; 1VSI A; 3AAP A; 5TKY A; 4H0Y B; 3N4P A; 3MN9 A; 1YIJ N; 4ID5 A; 3SQ0 A; 4FWO A; 3O08 A; 1VSD A; 3DXM B; 4IWV A; 5D3G A; 2EX3 A; 3MED A; 4G1Q A; 3OBW A; 4YHH K; 3CJC A; 4HTL A; 5GIP A; 3VEN A; 3NGI A; 2ZWH A; 1ZBI A; 1L3V A; 1B9D A; 3CCJ N; 5IWA K; 3J81 O; 3MXM A; 3L8B A; 1WN7 A; 4CIG A; 1BG3 A; 4FJK A; 4DSJ A; 2E6M A; 5LL6 Z; 3K0S A; 4H5R A; 4WFB L; 4OLB A; 5C10 A; 1RTH A; 3VQE A; 4DWI A; 1B9F A; 3DLG A; 3WT0 A; 4JI1 K; 1S1W A; 3G0Z A; 2GUI A; 2QTD A; 3TSQ A; 5AFU A; 2YNI A; 3VEZ A; 4BVP A; 3NBP A; 3GOI A; 2KQ2 A; 4HUF A; 3M1F A; 1SAZ A; 3OYF A; 2PFU A; 3PUF A; 1Q7Y O; 3IS9 A; 4B3M K; 2RN2 A; 3DLE A; 4KKO A; 1C1C A; 3LAN A; 2VG7 A; 3VQ9 A; 1KVB A; 1ZBU A; 4H5V A; 4DQI A; 4B3O A; 1CZA N; 1HJR A; 5DM7 L; 4HUG A; 1NJI O; 4FVM A; 2DFF A; 1N5Y A; 1HNZ K; 4GKK K; 4LFC K; 3ALY A; 4KH5 A; 4FJL A; 1VQ7 N; 4FM1 A; 1S6Q A; 3I33 A; 3HJF A; 1SV5 A; 1HQE A; 4GVM A; 3CCR N; 2IGI A; 1SKR A; 1HYZ A; 2O8D B; 4K41 A; 2ETJ A; 2D0B A; 3R8E A; 2HNY A; 4JI3 K; 3NDK A; 3AVK A; 2UUA K; 3FZM A; 3H6E A; 1N8R O; 4PWD A; 4B9N A; 1WSJ A; 2A6A A; 4DV5 K; 1ATR A; 4LSN A; 4DG1 A; 4CZG A; 3QFP A; 4ID1 A; 5MLC Q; 5BRD A; 1VQL N; 1VQ6 N; 3AA2 A; 4OPA A; 1IKV A; 4BWJ A; 2E88 A; 3ID8 A; 4CBU A; 5LJV A; 1NJZ A; 3PIO L; 2W42 A; 2NZT A; 3D7E O; 1VQP N; 4FW1 A; 2PAV A; 3AVB A; 3KKR A; 4KPY A; 1WBD A; 2F9T A; 2LSN A; 3QIC A; 1BA1 A; 4FWK A; 4Y1D A; 2HST A; 1BIS A; 3TPQ A; 2Q36 A; 4H5W A; 1IBK K; 3VQD A; 3QBW A; 4V19 S; 3HM8 A; 3MWT A; 3VGM A; 4WF9 L; 1BA0 A; 3M8P A; 3TAR A; 1XI1 A; 2GV9 A; 3ULE A; 3L2R A; 3P38 A; 2E2Q A; 4DQ8 A; 1NBW A; 3ZT4 A; 4KFB A; 3P31 A; 1WOQ A; 1H1V A; 1HKG A; 1I3A A; 4NLC A; 3AO3 A; 3FZH A; 4K8Z A; 3D2F B; 4CEO A; 4Z4E A; 2P9U A; 3PO4 A; 4O8K A; 1X9M A; 4CJ5 A; 4JKH A; 3AGK A; 3CM5 A; 1WLJ A; 4LD0 A; 3MX2 A; 4NCA A; 3OW2 M; 1J53 A; 1VAZ A; 1S9E A; 4CZH A; 4FOI A; 3VN5 A; 1LAW A; 4M3X A; 1RT6 A; 4MDB A; 1J5O A; 1GLA G; 5FRN A; 2VWB A; 1LWC A; 1U2V B; 4OKK A; 2E4L A; 2QWR A; 5JS2 A; 2HHT A; 4RG8 A; 1NK4 A; 5HRS A; 2YNH A; 2O8F A; 2QKK A; 2R7Y A; 2NRH A; 3O8M A; 3VA3 A; 4GW6 A; 4KHW A; 2CGL A; 3BZK A; 1X3M A; 2A5X A; 4CF1 A; 4FZZ A; 1N34 K; 4CJK A; 3CJ1 A; 3SV4 A; 3BUZ B; 3MX5 A; 1IO2 A; 5GAH P; 2WC9 A; 2UUB K; 5HRR A; 4YY3 K; 5JVG L; 4W5N A; 2VGN A; 3V4I A; 4O55 A; 4BDZ A; 1QQC A; 3I0S A; 4YOW A; 4FWN A; 5ELZ A; 3HOT A; 1YXQ A; 1LWE A; 1D9D A; 5C25 A; 4LH4 A; 4DR4 K; 2GEL A; 3TTC A; 4QOZ B; 3WNG A; 3RTV A; 2YHX A; 3HVT A; 1RDW X; 1JXE A; 1HKC A; 5EVZ A; 1OH6 A; 4BR7 A; 4X62 K; 4GMJ B; 4CD3 A; 4CZL A; 3CHW A; 1BGX T; 2HHX A; 1S72 N; 1Q86 O; 4KI6 A; 4DKW A; 1QE1 A; 5CHI A; 4DFP A; 3J7A P; 1VSK A; 5HRO A; 4EP5 A; 3HPO A; 4FJX A; 1E4G T; 1DKG D; 3TI0 A; 3ZT1 A; 4M3R A; 2KFN A; 3OYM A; 4FWQ A; 3HXM A; 4FK0 A; 4JD2 B; 5ADX H; 4DFM A; 2KLA A; 5FLX O; 5GAD P; 4JS4 A; 3IG1 A; 4H0T B; 5BRE A; 3OJU A; 3A0I X; 5AQH A; 3SLC A; 3VQP A; 4CF9 A; 2QWL A; 2X74 A; 4IOX A; 5FPD A; 3KD1 E; 4CEZ A; 3LDN A; 4B1Z A; 3ZET A; 3SUO A; 4E19 A; 3SQ1 A; 3U6F A; 4FLV A; 1IG8 A; 4DV0 K; 2HBJ A; 1C6V A; 2E8A A; 4GKJ K; 3CET A; 3ENH A; 4DV4 K; 3T69 A; 4LC9 B; 4CJT A; 3O3H A; 4CIE A; 4DSI A; 4BRA A; 4KHQ A; 2HBK A; 1KAZ A; 2B4J A; 3CM6 A; 1RFQ A; 3O1B A; 1JL2 A; 1C0M A; 2V7Z A; 3WXK A; 2FBY A; 2XRI A; 4FJM A; 3G4S N; 4DQS A; 2P9I A; 3OYA A; 1YVN A; 4OJR A; 2AJQ A; 3ULE B; 4CGH A; 4W5Q A; 4DTM A; 4FM2 A; 5AQS A; 2G8F A; 3LP1 A; 4CJ4 A; 3AA5 X; 3H1Q A; 3L2V A; 1UWB A; 3C94 A; 3O4W A; 1M90 O; 2NNW A; 4JK8 A; 3PV8 A; 4JKC A; 4CFD A; 4J2A A; 2P9U B; 3T3F A; 1X9J A; 2HVI A; 3Q7B A; 4JI7 K; 1S6P A; 2IDO A; 5AQZ A; 1BIU A; 3HYF A; 4CGI A; 2E5L K; 4DR6 K; 4QS9 A; 1FKP A; 3OYJ A; 2OYQ A; 4J2B A; 4O44 A; 2PYL A; 3L4I A; 2HNZ A; 3BF1 A; 3VF4 A; 1ZXO A; 3K57 A; 5AQQ A; 3LP3 A; 1UA0 A; 2RPI A; 5GAE P; 2HMP A; 1TAU A; 4MO5 A; 4FLU A; 4KHP K; 4CJR A; 1NGH A; 3IMX A; 1VK0 A; 1K8A O; 3SAF A; 2O8F B; 4CF2 A; 3OBY A; 4B1Y B; 2I7P A; 4CK2 A; 3A5L C; 2VG5 A; 4F8R A; 4O5F A; 3C0B A; 4LF4 K; 4KHN A; 1N6Q A; 3VEY A; 4BR9 A; 3SMP A; 3QNO A; 1GOC A; 5C2D A; 4EZ9 A; 2YNG A; 3DXM A; 1N33 K; 5AQN A; 1VRT A; 3W0L A; 3JYT A; 2XY8 A; 4KTZ A; 1CZB A; 4DV3 K; 4DU4 A; 3T19 A; 4Z4H A; 1QZ5 A; 4E7H A; 4C8N A; 4FLY A; 3DLR A; 5HOO A; 3LWM A; 4DTR A; 4RW8 A; 2VWJ A; 3SCX A; 4LF8 K; 4ISF A; 2BGG A; 2YKM A; 3I8B A; 1RBT A; 5KGW A; 4BQL A; 4DHY A; 1CZ9 A; 3KLE A; 3O1W A; 3CF5 L; 4C8K A; 1XNR K; 4GV9 A; 2GTD A; 4FJ5 A; 4DV6 K; 3KTQ A; 3RVC A; 5B8H A; 1NJX A; 2KTQ A; 4DSK A; 4B3R K; 1TVR A; 4H03 B; 1TKZ A; 2OPR A; 3V81 A; 4CEQ A; 1JXB A; 1L3T A; 2YJE A; 2V52 B; 1C0T A; 2KFZ A; 3NVM A; 1MWK A; 3FGU A; 4H5N A; 1HNI A; 4FZX C; 1LOT B; 4JK7 A; 1NMD A; 1ZC6 A; 2UXC K; 4NCB A; 3QER A; 3FZK A; 4PKI A; 2JGU A; 4DR5 K; 3O9U A; 5AQL A; 3U9D A; 1GLD G; 3ZET B; 1MU2 A; 4YNQ A; 3OS2 A; 3PX6 A; 4RTF D; 3JXU A; 4RW7 A; 5CZ1 A; 2FF3 B; 1NG9 A; 3SPY A; 3QB0 A; 3VEO A; 4A61 A; 2OTL N; 2P5O A; 4CHO A; 4BE2 A; 1TL1 A; 4EIA A; 1JLE A; 1W97 L; 4U67 L; 1G15 A; 1NGG A; 3V9X A; 4CJU A; 4ILH A; 4GV6 A; 4WYB A; 4CEE A; 1U6Z A; 5AQT A; 5CYQ A; 3U4L A; 4IEI A; 1BQN A; 4CZE A; 3E01 A; 1RT3 A; 4CD1 A; 3UIQ A; 4MFB A; 3NFA A; 3R1X A; 4K25 A; 3ZSX A; 3Q7C A; 5CY4 A; 4MLH A; 2P9I B; 3U9Z A; 4FWM A; 2YI1 A; 3SI6 A; 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2YHB A; 3AVL A; 4M3Y A; 3L0Q A; 2HHV A; 5AJ3 K; 2XY5 A; 1X3N A; 4JKF A; 3HOS A; 1RGI A; 4JKE A; 4YOV A; 3CJA A; 4JYA K; 3SAH A; 2FSK A; 1YHQ N; 3AVI A; 4A5A A; 3RR7 A; 3OYI A; 1ZBL A; 1HRH A; 4CK1 A; 1BWF O; 5KPR A; 4XH5 A; 3VA0 A; 2FBV A; 4E0D A; 2DTU A; 4LH5 A; 1TYQ A; 1F21 A; 3VQB A; 3KLG A; 3HRG A; 4MLE A; 5HBM A; 3OJS A; 4OPJ A; 3GG4 A; 2G8K A; 4H8K A; 4DS5 A; 3OA9 A; 4AHS A; 1FJG K; 4DS4 A; 1KVC A; 1RTJ A; 3C95 A; 4WE1 A; 4TSX A; 2W41 A; 5AQI A; 3U3Y A; 3QES A; 1C0U A; 4JD2 A; 3IUC A; 2D5R A; 3BEX A; 3VQ7 A; 3VGL A; 1D4X A; 3UKR B; 4R79 A; 4AHR A; 3QNN A; 3WXJ A; 2D4W A; 3C65 A; 2IVN A; 5AQK A; 4PY5 A; 1ZYQ A; 1OH8 A; 2GWK A; 2OCE A; 4FXD A; 3MCA B; 2J4R A; 1RDD A; 2HW3 A; 3S9H A; 3NF6 A; 4AIL C; 5JIC A; 2A1S A; 2W40 A; 1GLJ O; 4EAH D; 4CVN E; 3ULD A; 2E2P A; 3GDQ A; 2YNF A; 3VQ4 A; 1X1P A; 3L3U A; 3TAB A; 2UXD K; 5JS1 A; 3D0P A; 3SPZ A; 3HL8 A; 2HHW A; 3NCI A; 4BRH A; 1Z26 A; 4LF5 K; 1EX4 A; 4E7L A; 3RMB A; 3P39 A; 5M1K A; 3AVA A; 1NK8 A; 5KQ8 A; 3OYK A; 3V1R A; 3ZSV A; 5GIO A; 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