The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
|
sequence length |
116
|
structure length |
116
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
|
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| total genus |
25
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-12-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5BR8 K; 4CVN E; 4NXM K; 1IBK K; 4KHP K; 1N32 K; 4JI2 K; 4DV0 K; 2UUC K; 4CW7 B; 2ZM6 K; 4DV5 K; 1XMO K; 3OTO K; 1XNQ K; 2VQF K; 4DUY K; 4DR3 K; 4JI6 K; 2VQE K; 4NXN K; 4DR6 K; 5LMN K; 4LFC K; 1HNX K; 4JI7 K; 4LFA K; 2UXC K; 4DR1 K; 4K0K K; 4X64 K; 4B3T K; 4DR4 K; 3J81 O; 4LF5 K; 4JYA K; 4X66 K; 4LF7 K; 1FJG K; 5AJ3 K; 4JI5 K; 4DV4 K; 2HHH K; 3J80 O; 4JI4 K; 1XMQ K; 4DV3 K; 2UUA K; 4LFB K; 4LF8 K; 4DR7 K; 4LF4 K; 2UXD K; 4DR5 K; 1IBM K; 1XNR K; 3J7Y P; 3J7A P; 4X65 K; 4GKK K; 1HNW K; 4DR2 K; 4V19 S; 5LMU K; 2UUB K; 4DV7 K; 4B3R K; 4AQY K; 2E5L K; 1N34 K; 1N33 K; 4JI3 K; 1I94 K; 3T1Y K; 3JAM O; 4LF6 K; 5IT9 O; 2F4V K; 5IWA K; 2UU9 K; 2UXB K; 4DV1 K; 5FLX O; 5A2Q O; 1HR0 K; 1J5E K; 4LF9 K; 4DUZ K; 4GKJ K; 1N36 K; 1IBL K; 4JV5 K; 4OX9 K; 4X62 K; 4JI0 K; 4YY3 K; 4DV6 K; 3T1H K; 4B3M K; 4B3S K; 5LL6 Z; 4YHH K; 1HNZ K; 4JI8 K; 4DV2 K; 4JI1 K; #chains in the Genus database with same CATH topology 3KK3 A; 2GUP A; 3QBW A; 4DG1 A; 4MLE A; 2UUC K; 1TAQ A; 4CW7 B; 3TSU A; 4DF4 A; 3MXM A; 4DTM A; 5E26 A; 3T1A A; 4DUY K; 4XH5 A; 3OYA A; 4B1U B; 1OVY A; 4N76 A; 4A61 A; 1DT9 A; 3AVH A; 4EIA A; 3KHY A; 2EWS A; 1RBR A; 3ULE A; 3O1W A; 4YNQ A; 5FRN A; 2EHG A; 4BQZ A; 3L0Q A; 1EX4 A; 2E8A A; 4IJN A; 3BZC A; 4FWS A; 3AY9 A; 4WQ4 A; 3DLH A; 5KGX A; 5AJ3 K; 1IKV A; 4EAH D; 3QNO A; 4CHO A; 3I56 N; 1UAX A; 3KWI A; 1S72 N; 4KHS A; 4ZHR A; 4IFY A; 3CC2 N; 2DFH A; 2ZE2 A; 3BUZ B; 2YJE A; 3K59 A; 2Q2R A; 2Z1I A; 4CZE A; 3C7N B; 4CJV A; 4KFB A; 4A5A A; 3PY8 A; 1CZ9 A; 3JYT A; 4X65 K; 4E1N A; 1XWL A; 4H4O A; 2YNF A; 4KHY A; 2GBZ A; 2GWK A; 1WOQ A; 4PKH A; 1N6Q A; 2VG6 A; 3THW B; 2A42 A; 3ZSV A; 1YHQ N; 1IH7 A; 3JSM A; 2O8D A; 3OYN A; 1BQM A; 3WQT A; 1NGH A; 2W42 A; 1C0G A; 3ZCM A; 3C6T A; 2O8E A; 3CER A; 4O44 A; 3TSP A; 3LWM A; 4FJG A; 1HJR A; 2VYP A; 4FJL A; 1VQ6 N; 3VQC A; 1XI1 A; 3ULD A; 3RMB A; 2Q36 A; 4FPA A; 4N56 A; 1LCU A; 4NCA A; 4XIU A; 3SAG A; 3CJ7 A; 2P9S A; 3MN7 A; 4C8K A; 3QLH A; 2A3Z A; 3KIO A; 1YTA A; 4FO0 A; 1BA1 A; 1YF5 L; 4CEB A; 4YY3 K; 2BH1 A; 1J53 A; 3B6P A; 4DQQ A; 4K8X A; 2Y1J A; 4I9Q A; 3R9P A; 3T7Z A; 4AH9 A; 3V9W A; 3KKS A; 4BY9 C; 4FJ8 A; 3AVN A; 2QTD A; 1BUP A; 1QVF M; 1RTH A; 1C1B A; 3OYH A; 4BVO A; 2CGL A; 2P9K B; 4CJ7 A; 4PWD A; 2KFZ A; 1WLJ A; 4CF0 A; 3THX B; 2RN2 A; 2QM1 A; 4JD2 A; 2G8W A; 4HCB A; 5FPN A; 1CLQ A; 5BPM A; 3V4I A; 3SAF A; 5SZT A; 3I0R A; 4F8R A; 5TKW A; 4CER A; 3GDQ A; 3VQ6 A; 1NK6 A; 1HNX K; 1Y64 A; 4B9M A; 4YDU C; 3H46 O; 1EO1 A; 4ID5 A; 3P39 A; 1VQ8 N; 4FJ5 A; 4K0K K; 3TAQ A; 3I8D A; 2GV9 A; 4DTN A; 2Q31 A; 2P5G A; 3HBT A; 1NJW A; 5F2R A; 3J80 O; 4CIG A; 5HLF A; 3Q7C A; 2E2N A; 2FBY A; 2B4J A; 4Q5V A; 3HT3 A; 5EU7 A; 4Z94 A; 4CFC A; 5DMR A; 2ZJP L; 4YOX A; 2QKB A; 2DTU A; 2FXU A; 4CGI A; 2QI2 A; 4RW4 A; 5AQN A; 4BC4 A; 3TSQ A; 2W6K A; 3UKR A; 5BRF A; 4BRK A; 2FSK A; 4OKJ A; 5KGW A; 4ISE A; 5C10 A; 3B6O A; 4FYD A; 3M8R A; 4HWI A; 5AQH A; 5AFU A; 2DFE A; 4CJR A; 4KTQ A; 4E19 A; 3AVI A; 3KKR A; 3CET A; 3LPU A; 4H5W A; 3GOI A; 3HP9 A; 5AQM A; 1J5E K; 4CIE A; 2J4R A; 3W3D A; 5C25 A; 1KLM A; 3LDN A; 3QEW A; 2FLO A; 3RVC A; 2XO7 A; 3S41 A; 3AVK A; 3CCL N; 3NMU A; 2HB5 A; 4FJJ A; 2YHX A; 3QFU A; 3ENH A; 3ZEU A; 1KAX A; 4BR0 A; 1ZXO A; 3T1H K; 3N4Q A; 1GOB A; 1V4T A; 1T44 A; 3SAH A; 4IKF A; 1EKE A; 4FJ7 A; 4KAZ A; 2ZD1 A; 1U2V A; 4F2S A; 3D2F B; 3VTI A; 4DS4 A; 4KHP K; 1EET A; 4NLC A; 4WQ5 A; 3VF2 A; 3E01 A; 3ZEU B; 4CJ4 A; 4H8K A; 1WAF A; 2O4G A; 1VQN N; 5BRE A; 1WSI A; 1P90 A; 2O8B A; 3CC4 N; 4RW6 A; 2E2Q A; 3NH2 A; 4IFV A; 1C1C A; 1S6P A; 1WN7 A; 2P9I B; 5AZJ A; 5AQP A; 5BN9 A; 3ZSY A; 4M42 A; 4JI7 K; 3VEX A; 3IKM A; 2F8T A; 3W0L A; 2W41 A; 4A5B A; 1YVN A; 5E41 A; 4DSJ A; 1QSL A; 3VQ7 A; 1TKZ A; 5TKY A; 4EZ6 A; 4A62 A; 2OAN A; 3MX5 A; 4DV4 K; 1RT3 A; 2YJF A; 2P9U A; 2W6L A; 3HM9 A; 3QIC A; 1JXE A; 5GIN A; 4BQL A; 4DTR A; 3A5M C; 1TAU A; 1BQN A; 3OYB A; 5LJW A; 3ZSQ A; 4W5Q A; 3LM2 A; 1RDD A; 4G1Q A; 3O80 A; 1F21 A; 3A2F A; 3CMA N; 4FWN A; 5KPT A; 3OY9 A; 3KK1 A; 3EO3 A; 2D0B A; 3LDL A; 5HP1 A; 1IG8 A; 2FSN A; 1P8Z A; 1TUY A; 1BL3 A; 4A57 A; 4JKB A; 1HYV A; 2EX3 A; 4JKC A; 4AHU A; 4B1V A; 1HMV A; 3EE8 A; 3OA9 A; 1WBD A; 1TVR A; 1IJJ A; 5FRO A; 1T05 A; 4CIF A; 1K6Y A; 4GKJ K; 1NGC A; 1TYQ A; 2QWR A; 1YUW A; 4WYB A; 4BRH A; 1HPZ A; 4ISF A; 4IDK A; 4OGE A; 5GAD P; 1SL0 A; 3LAL A; 4CBU A; 1HJO A; 4B3S K; 2KTQ A; 2WC9 A; 3FZL A; 4DV2 K; 3KLH A; 3AA5 X; 5BR8 K; 3A0I X; 1D9D A; 1WSE A; 4UY8 O; 3KLF A; 3MEC A; 4M3X A; 5KQ8 A; 1S1T A; 1NKB A; 4IO9 L; 3ZET A; 2VCP A; 4ELV A; 3LZI A; 3K9J A; 3QIO A; 1SL1 A; 2VGN A; 1KQS M; 3ZT0 A; 3WXK A; 2FBV A; 5BPL A; 4KKO A; 1S3X A; 1Q9Y A; 4FZX C; 1X3M A; 4FM0 A; 3QB0 A; 4YOU A; 2HMI A; 4DR4 K; 3PLA A; 1BGX T; 3NHG A; 2XY5 A; 3HPO A; 4FLW A; 1U49 A; 2OTL N; 2F9T A; 5JVH L; 3C6H A; 2IVO A; 4JI4 K; 1UWB A; 2BE2 A; 3K5M A; 4CZM A; 5F1X A; 1VSK A; 1KSP A; 3M1F A; 3CJA A; 1ATN A; 4LY7 A; 1RDC A; 4Z4H A; 1GLF O; 1C1A A; 5BN8 A; 3PO4 A; 1GOC A; 3QML A; 3IUC A; 4DWI A; 4KI4 A; 3ZX0 A; 3FZH A; 3BDP A; 4L3Q A; 3PX4 A; 2D1K A; 2WON A; 4K25 A; 2HVI A; 2ITM A; 3KK7 A; 4K42 A; 3AO2 A; 4E7K A; 2Q3S A; 1JLA A; 3K5L A; 1I94 K; 2VGM A; 1TYQ B; 4Y1D A; 3SUP A; 3OYJ A; 2X78 A; 4CZJ A; 2V52 B; 4KH5 A; 4RWT A; 3V1O A; 5IT9 O; 3O4W A; 2UU9 K; 3UIQ A; 1NGA A; 4LF9 K; 2ZF5 O; 2HBL A; 3J8A A; 4PKI A; 3NE6 A; 3DRS A; 1KVA A; 4DQP A; 2WUS A; 3THY A; 5FPD A; 3F73 A; 4PY5 A; 4IOC L; 4XH1 A; 4JRP A; 5BRD A; 3WXM B; 3TTC A; 2E88 A; 3V1R A; 2HW3 A; 1E4F T; 2D0A A; 1BIS A; 3TAM A; 1MWK A; 2Q1N A; 5HRN A; 4I2P A; 4CK3 A; 1TGO A; 2YV0 X; 4OJR A; 1FKO A; 2IDO A; 3TAP A; 4Z0U A; 3CC7 N; 2VQF K; 2HMP A; 1NK9 A; 2KW4 A; 4Z4G A; 2HVH A; 4FXD A; 3DYA A; 3NCI A; 2O8F B; 3VQ5 A; 5AFU H; 4YDU A; 3AVA A; 4CEE A; 2HHH K; 4QOZ B; 2O8B B; 5KRT A; 3VER A; 4CZH A; 1W0H A; 4I6M A; 3JS6 A; 5C12 A; 4LH5 A; 3P1G A; 4CJK A; 3HTV A; 4FM2 A; 2UUA K; 4KRE A; 4LFB K; 5DK5 A; 4CE9 A; 1HQU A; 1IBM K; 4BGB A; 1Q82 O; 4IFE A; 3DXM A; 2ATQ A; 4MLH A; 3HJF A; 5C24 A; 1D9F A; 2BGG A; 4GV9 A; 1KTQ A; 4KPY A; 1REV A; 4I6M B; 1S1U A; 3P38 A; 5AQL A; 1S1W A; 3TPQ A; 1JCF A; 3O9S A; 4DTU A; 4KHW A; 1N8R O; 1B9D A; 5CY4 A; 1JXB A; 3NH1 A; 2YHY A; 4H0P A; 4Z4F A; 1OH7 A; 2WFB A; 3CJC A; 4F2R A; 1YI2 N; 1GLD G; 1JCE A; 3KD5 E; 4C8O A; 4IOX A; 4BRQ A; 1WSH A; 4JV5 K; 1ZC6 A; 4KH6 A; 3VES A; 3CJ9 A; 2Z1G A; 1NKE A; 3OYL A; 4BGA A; 4DV6 K; 1YJW N; 3LAK A; 4JI1 K; 3CCS N; 4K43 A; 1HPM A; 4M3U A; 1JLF A; 5HRP A; 3M8P A; 2CGJ A; 4IZ9 A; 2JLE A; 1XMO K; 1ITG A; 3MWT A; 4JI6 K; 2VQE K; 1X3N A; 4HHT A; 3G6E N; 1L3U A; 3RSE A; 2UXC K; 4JKG B; 1WBB A; 3CFR A; 1H1V A; 3QFP A; 1C0T A; 4FLT A; 4C8L A; 3CQ8 A; 1KAY A; 1KVC A; 3CI5 A; 1C0F A; 1BG3 A; 2QEX N; 2DPN A; 1GLL O; 1KRP A; 3VA0 A; 4WE1 A; 4B1Z A; 1S5J A; 3O3H A; 5C42 A; 3KD1 E; 3AVM A; 1N5Y A; 2B6A A; 2RF2 A; 5EVZ A; 1HLU A; 4DR5 K; 4ZTJ A; 3VQ9 A; 3M6G A; 3R1X A; 5CZ1 A; 2IVP A; 3O8M A; 1HNW K; 1XC3 A; 2LSN A; 3KTQ A; 3S3M A; 4CF1 A; 4DQR A; 4FWM A; 3U4L A; 4GVM A; 4KO0 A; 4FLV A; 1Y97 A; 3ZT3 A; 2E5L K; 4BRM A; 1RDU A; 4PHT X; 3KZB A; 1RBT A; 3A5L C; 4KTW A; 3L2W A; 3RRG A; 1OH5 A; 2VWJ A; 1R59 O; 3HOS A; 3J7Z O; 2NRV A; 4BAC A; 4ILH A; 3UKU B; 2OPP A; 3FGU A; 3C7N A; 1KLN A; 1IKY A; 3DLB A; 5FLX O; 4NYF A; 4E7I A; 1VQ9 N; 4DFK A; 2HST A; 1D5A A; 1LWC A; 3O6W A; 4OX9 K; 2KFN A; 4O0I A; 2H3G X; 4X62 K; 4CCH A; 4E0D A; 1JCG A; 4I9L A; 2FF3 B; 5CYM A; 3IRX A; 5AQQ A; 1A5W A; 1G15 A; 1TL3 A; 2Q97 A; 1VQM N; 2IGI A; 1HQE A; 4JK7 A; 5HRS A; 1EP4 A; 4DV0 K; 4J2D A; 3L6Q A; 1C6V A; 1DTT A; 3ASM A; 3CG7 A; 3FZF A; 3SJJ A; 2IIR A; 4FWL A; 4DR3 K; 5JS1 A; 3VQ4 A; 4C1N K; 3BZK A; 3KLE A; 3DOL A; 3GE1 A; 4FOE A; 3V9X A; 1X9W A; 4LFA K; 3HSC A; 3WXL A; 1WSJ A; 4IEI A; 3TTF A; 4OKE A; 1YTU A; 4AHC A; 3ULE B; 3LM9 A; 3MN9 A; 4FJ9 A; 3AO4 A; 3SUO A; 1HX1 A; 1BI4 B; 1YAG A; 3V1Q A; 5LJV A; 3D45 A; 3CQX A; 4FL9 A; 2I7N A; 1J54 A; 3DI6 A; 3CCU N; 1X1P A; 3U8X A; 1VQP N; 4W5O A; 3WQU A; 5DM6 L; 4FLZ A; 2GUI A; 2HBM A; 4B8C A; 2Y1I A; 3O1B A; 3J7A P; 3SPY A; 1RIL A; 2D0O A; 1SZ2 A; 1M90 O; 4BDP A; 2KZZ A; 4OLB A; 1X9S A; 4GKK K; 4PL8 A; 1VQ4 N; 1QHT A; 2VG5 A; 1GLB G; 4I7F A; 2P9P A; 4BE1 A; 3QEI A; 4BG9 A; 4DU1 A; 4W5N A; 1D8Y A; 3HK2 A; 1RFQ A; 4ZTF A; 3UB5 A; 5AQG A; 3CIP A; 3P83 D; 2D5R A; 1RGI A; 1MDU B; 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3H1Q A; 3EL2 A; 3OBW A; 5LMU K; 2UUB K; 3EKU A; 4KV8 A; 2OTJ N; 1N34 K; 3MEE A; 2P9N A; 1LV5 A; 3D7E O; 5CZ2 A; 3T1Y K; 2UYT A; 1OH6 A; 5KRS A; 3VQQ A; 4IDH A; 1RBV A; 3WT0 A; 3CCV N; 3OJS A; 1LWF A; 4CHN A; 2AJQ A; 4H0V B; 3G71 N; 4KBO A; 4DU4 A; 2GEM A; 4AHT A; 1NMN A; 2O8C A; 3D6R A; 4R79 A; 4JKD A; 5A2Q O; 1RDW X; 3NF8 A; 2BTF A; 4DFM A; 3KLI A; 3HZ6 A; 3HVR A; 1IO2 A; 3CJB A; 1CXU A; 3LP0 A; 2A40 A; 1SV5 A; 5EY4 A; 3BGR A; 2YHW A; 3WUH A; 1VQ7 N; 4CHY A; 4DLG A; 4F3O A; 5AQJ A; 3CYM A; 4JK9 A; 1QQO A; 2BDP A; 4N5S A; 3A8Y A; 3D0P A; 4GMJ B; 3D2E B; 2O8E B; 4MQ3 A; 3WNH A; 3TTD A; 3T19 A; 1QVG M; 4FJN A; 1W7A A; 2W40 A; 4M3W A; 4NO7 A; 3PX6 A; 1WSG A; 2QK9 A; 1QHA A; 4RG8 A; 3SI6 A; 4CEZ A; 3GL1 A; 5C2F A; 2JWL A; 2A6A A; 5HOO A; 1RTI A; 4L8R B; 3LL3 A; 3C0B A; 3QO9 A; 1CZA N; 2QWO A; 2P9L B; 3ZX2 A; 4E3S A; 4KI6 A; 1I39 A; 1BIZ A; 1U04 A; 4GNI A; 4JEP A; 5AR0 A; 3V9U A; 1FJG K; 1VSL A; 2E2O A; 4M3Y A; 4KB0 A; 4EP5 A; 3TAG A; 1ZBS A; 3QDK A; 1O13 A; 2HBJ A; 1NLV A; 3MX2 A; 2ZGY A; 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