1NM1A

Crystal structure of d. dicsoideum actin complexed with gelsolin segment 1 and mg atp at 1.8 a resolution
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
372
structure length
364
Chain Sequence
DVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEQEMATAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Structure of Non-Vertebrate Actin: Implications For The ATP Hydrolytic Mechanism
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin
total genus 118
structure length 364
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nm1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nm1A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1nm1A03
1BA1A 1NGCA 1NM1A 4IJNA 4BVOA 1Q18A 3VGKA 1RFQA 2ZGZA 5AQJA 4HWIA 3MN5A 3UB5A 1HKCA 4FL9A 4FWKA 4FWOA 3IDHA 3ZEUA 2P9SA 3O1WA 3O5BA 4BRNA 3ZX3A 3RSEB 4DHYA 1GLEG 1MA9B 1S3XA 1GLAG 1MWMA 2KHOA 4L3QA 4XH1A 4BG9A 3P4IA 3D2FA 1NGIA 2QWQA 4FOEA 4CZLA 4BRPA 3MK6A 4O8KA 1HKBA 3GL1A 3CERA 2A3ZA 2YHXA 1QHAA 2ASMA 2Q97A 5ELZA 2IIRA 5FPMA 4DB3A 2YHYA 5EVZA 3ENOA 1GLDG 1P8ZA 5LY3A 2P9PA 4IXCA 4QS9A 5AZIB 5B8HA 5AZJA 2P9KA 1KAZA 3A0IX 3HTVA 4H03B 4HTLA 3C7NB 3EO3A 3TU5A 2HF3A 3VEYA 2QW9A 2V7ZA 5AQVA 3DXKA 3VEWA 1V4TA 5AR0A 3EZWA 2QWOA 3D2EB 2UYTA 1C0FA 2D0OA 1T6DA 4Z94A 4GNIA 3FE1A 3EN9A 4M7YA 3H45C 4K25A 4WQ5A 4FWLA 4K43A 4BG8A 1JCEA 4FPBA 4I6MB 5F1XA 1MWKA 2AA4A 3C7NA 2V7YA 3VEXA 1DKGD 1SZ2A 2D0PA 3ZETA 4CZFA 2ZGYA 3DXKB 5ADXA 3L6QA 2AP1A 4BRLA 5AQPA 3UKRA 1R59O 3FR0A 4YDUC 5BN8A 3FZHA 1X9JA 4DCHA 1QZ5A 3SLCA 4F9OA 3BF1A 3HBTA 3DAWA 4BC2A 4FWQA 2E2QA 1D4XA 5BR9A 2P9LA 4BR7A 3FZKA 4PL7A 1XC3A 3QFUA 4BC5A 3R9PA 1GLLO 3DJCA 1WOQA 1HKGA 5EY4A 3ATUA 2GUPA 4EHUA 1NBWA 5BPNA 3MN7A 2Q1NA 3AAQA 4A2AA 2BUPA 5AQLA 3C0BA 2CH5A 2P9UA 5AQMA 2E1YA 4YDUA 5AQKA 2QWPA 4C23A 1DGKN 1HLUA 1NLVA 4BRAA 3VEZA 3H3NO 4Y0WA 3FZMA 2QXLA 4BR5A 5AQWA 3WXJA 2PAVA 3EKUA 1ZXOA 3EL2A 3O08A 2GTDA 3ZETB 4B1UB 5FPEA 4E1JA 2FSNA 5BN9A 1U2VA 1KAXA 4A2BA 3CJAA 4ISFA 3VEOA 4CBWA 3WEEB 2A41A 1Z6RA 1BDGA 3H1QA 2P9NB 2NRHA 1ESVA 3AY9A 3WEEA 5KPRA 1ZBSA 1KAYA 3CJ1A 4NB4A 3WXIA 5AQTA 3H1VX 2E2NA 2QWMA 4JD2A 1NGEA 3A5NC 3FLCO 3QBWA 5CE3A 4FWPA 4BVPA 3O80A 1U6ZA 3U8XA 2GELA 2ASPA 2FF6A 2Q2RA 3VGMA 4BR9A 4EFHA 3IMXA 5JLHA 3QMLA 4H5NA 4XEIA 4K42A 1QQMA 3QFPA 2GEMA 2PBDA 3CJ7A 4H0TB 4BRHA 1WUAA 5F0XA 1HJOA 3M1FA 1NGJA 3VOVA 3BUZB 1QQNA 5AQNA 2CGLA 3GDQA 4WQ4A 2P9IB 5AQOA 3O6WA 4J8FA 3WXKA 2V51B 1HUXA 2E2OA 1XUPO 3U4LA 3BP8A 4O5FA 2QWLA 4CZEA 4PKIA 2QWRA 4FO0A 4WQ5C 4XH5A 2HOEA 3UKUA 3GE1A 3UKRB 1H1VA 3VGLA 2IVPA 4CBXA 3L0QA 4JNEA 1BOTO 4KBOA 4NO7A 1GLCG 4GY2B 1BA0A 4JN4A 1KXPA 1E4FT 4H0OA 4JHDB 1NGBA 3A5OC 5AQXA 3DXMA 1JCFA 4FSVA 4ISEA 2VCPA 3A8YA 3HZ6A 1K8KB 1MDUB 4RCHA 1YXQA 4BRQA 3AAPA 1BU6O 3H46O 4MLHA 3LDLA 3U9DA 2A6AA 4LC9B 1Z05A 3LM2A 1LOTB 2CH6A 4K41A 5LJVA 3CQXA 4H5RA 3D2EA 4IWVA 2H3GX 3R8EA 2W41A 4QS8A 4CZHA 1IJJA 5E26A 4JHDA 2F9TA 1BO5O 1YUWA 2P9LB 4FWRA 4H0YB 3FFKB 4CZJA 3DWLA 4IO8A 1NGDA 2VWBA 3CQYA 3ZX0A 2OANA 4H5TA 1QZ6A 5FPNA 1J6ZA 2Q0UA 4M7XA 5ADXH 1RDWX 1Y64A 4PKGA 1CZAN 3JS6A 4BRKA 1ATRA 3OHRA 5BRDA 4CZMA 3SK3A 3F9MA 3D2FB 4H0PA 4XH4A 3SMPA 5AQSA 2Q0RA 2ASOA 1K8KA 1SQKA 3M3ZA 3FZFA 5AQYA 2FF3B 3LDPA 2W40A 3GBTA 4FWMA 1NGFA 5TKYA 3O1BA 4BGAA 4BRIA 2P9PB 3QICA 2BTFA 3CI5A 5JICA 3ZX2A 4I6MA 5BRHA 3QBXA 2P9KB 3LDQA 3EKSA 1XQSC 2CGJA 3CHWA 5AZIA 2P9IA 3IUCA 3MN6A 2P9SB 3WXLA 1T6CA 4AM7A 4BREA 1YAGA 3WT0A 2FSJA 3LDNA 3LM9A 4H0VB 4BC3A 4CI6A 2DPNA 5AQZA 1T44A 4B1ZA 3DXMB 4EHTA 3CJ9A 1NGHA 2YCHA 5AQFA 3MMVA 1IG8A 2QWNA 4A61A 1JCGA 1GLFO 2ZF5O 5AFUA 1ATSA 3O4WA 3TPQA 2NZTA 5LJWA 5BPLA 5AFUH 1BUPA 2J4RA 5I9EB 4RTFD 3I33A 3U9ZA 5JMVA 4QS7A 5EX5A 1OKJA 4H5WA 2FLOA 2GWJA 3ZEUB 3G25A 4BR0A 4EIAA 1TUYA 4BR4A 4BC4A 4BRFA 3CJCA 1V4SA 3L4IA 2P9UB 3FZLA 4BQLA 3SMSA 3MDQA 3VF6A 2YI1A 2E2PA 1NWKA 4CD1A 4FWNA 3M6GA 4BGBA 1QQOA 2GWKA 3ENHA 4PKHA 4B1XB 3HSCA 3WQUA 4B1WB 2YJFA 3A5MC 3B8AX 2D1KA 4RWTA 2IVNA 3KHYA 3IFRA 3RSEA 5AQHA 3S41A 2Q36A 2FXUA 4FOIA 5KQDA 4BRCA 3VERA 3R6MA 4BRMA 1BWFO 3JXUA 4MO4A 3AARA 2FSKA 1S22A 3D7EO 2I7PA 2I7NA 4CJ7A 5KPZA 2CGKA 4DQ8A 3ATVA 4MLEA 5AQGA 1TYQB 4FWSA 3VPZA 1SAZA 1TYQA 3CJBA 5EXWA 5AQUA 2A40A 4WQ4C 4BRGA 4A62A 2V52B 2A5XA 1NMDA 4BR2A 2HF4A 5JLFA 4CD3A 5AZJB 3A5LC 2E8AA 3H6EA 4PL8A 2QM1A 5F2RA 1GLBG 2E20A 1ATNA 4CZIA 5BRFA 3FGUA 3SJHA 3VETA 2Q31A 4ISGA 4CZGA 3WQTA 2EWSA 3UE5A 2WUSA 5KPTA 1E4GT 5KQ8A 4B1VA 4MO5A 1NGGA 1ZC6A 3CETA 3KZBA 3HM8A 3VEVA 3CIPA 1HX1A 3GOIA 2NLXA 2VYPA 3I8BA 4WYBA 2HMPA 1GLJO 3ULEB 4JAXA 4AM6A 5EOYA 3O8MA 4IJAA 4M63C 2YHWA 1LCUA 3KVGA 3VENA 2F9WA 1DEJA 2ZWHA 4CZKA 3QB0A 2A42A 3J8AA 4EAHD 1X3MA 1TUUA 4B1YB 4B9QA 1G99A 2ITMA 5BPMA 2E1ZA 3MN9A 3GG4A 3VESA 4BRDA 2IVOA 4CBUA 3HI0A 5AQRA 5E84A 2D4WA 2P9NA 3WUHA 3MCPA 3BF3A 1YVNA 4H0XB 4FPAA 5AQQA 1BG3A 1U2VB 2E88A 3ULEA 4BQZA 5BREA 1RGIA 1EQYA 2YJEA 1X3NA 3LDOA 3ID8A 3UKUB 5AQIA 4IZ9A 3VF4A 4JD2B 3H3OB 3VF2A 4BROA 1C0GA 3QDKA 3W0LA 5FPDA 1NGAA 4H5VA 3W3DA 1HPMA 3LL3A 3BEXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJKA 1BA1A 4BVOA 4WFBL 1NJXA 3VA0A 4FJJA 1RFQA 5AQJA 1WBDA 3UB5A 5KGXA 4YHHK 3RTVA 3IDHA 3KK1A 4E19A 4CIGA 4KTQA 1K8AO 3T1HK 1JL2A 4DHYA 3OW2M 1VSHA 3NH1A 4UY8O 3PX4A 3VQQA 4OGEA 3LZIA 1L3SA 4OLAA 1RBRA 5JVGL 3P4IA 2QWQA 4CZLA 3NVKA 5CZ2A 4F2SA 3C6TA 1HKBA 4W5QA 3GL1A 2O8CB 2A3ZA 2YHXA 2G8WA 3ENOA 1L3VA 4PUOA 1P8ZA 2P9PA 1L3TA 5FROA 1TK8A 1KSPA 1J5EK 4AHTA 3NH2A 1S1WA 4AH9A 2P9KA 1KAZA 4F2RA 3N4QA 1WLJA 1IKYA 3J7YP 2V7ZA 4UQGA 4CF0A 3L2UA 3MEDA 5AR0A 3EZWA 1IKWA 3D2EB 2UYTA 1C0FA 1JXEA 4IEIA 3M8QA 4JKCA 3EN9A 4M7YA 4K25A 4JI3K 4BG8A 2O8CA 1JCEA 1W2BM 2Y1IA 4E1MA 3LP0A 4DTUA 2ZGYA 3ULDA 2YNFA 3BDPA 2UXCK 3CC7N 5BN8A 1R59O 2D0AA 4YDUC 1NK9A 5LL6Z 3EE9A 3SUOA 5M1PA 2EX3A 1BHLA 3ZSRA 2G8HA 2HMIA 3VQCA 4FWQA 2E2QA 1D4XA 2P9LA 4CFDA 3FZKA 1NJYA 1RNHA 1VQLN 1YT3A 4LFAK 4LY7A 4CEDA 5HL7L 4IDKA 3KD1E 2OA8A 3NHGA 2E1YA 4B08A 4F8RA 1DGKN 3PO4A 1KRPA 4BRAA 4RW9A 3VEZA 4KH6A 3H3NO 2IGIA 3FZMA 3F9KA 3WXJA 2PAVA 4RW8A 3NDKA 3EL2A 1TGOA 5FDLA 3VQ4A 3MXMA 1NK6A 2KZZA 4B1UB 1VQ9N 4E1JA 4O44A 1UA1A 2QK9A 1U2VA 4DQQA 1S1TA 1S72N 3RR8A 2NUBA 5GAGP 2A41A 1VRTA 1NJWA 1LAWA 2P9NB 2NRHA 1ESVA 3AY9A 1EKEA 1ZBSA 4CHYA 3F5TA 3H1VX 1RDUA 4B9VA 3HPOA 1KQSM 4K8XA 1ZBIA 4FWPA 4OVLA 3O80A 1VQ4N 3AO3A 4BDZA 4CJFA 4EFHA 3SV4A 3IMXA 5JLHA 1WSEA 3QFPA 4DFKA 4JI8K 2GEMA 2PBDA 3CJ7A 4CE9A 3SNNA 4AHVA 1EWQA 4Y1DA 1HJOA 3P83D 4J2BA 3VOVA 3AO1A 5GADP 1N5YA 3FFIA 4WQ4A 1EO1A 5AQOA 1NOYA 4NCBA 3HXMA 3O6WA 5AJ3K 3T3FA 2OPQA 2V51B 3HP6A 2E2OA 3F73A 4KV8A 4B3MK 2QWRA 4WFAL 3CCSN 3ALYA 1U47A 3OYEA 4CBXA 4JNEA 4FJHA 1BOTO 2Z1GA 4J2DA 4CJQA 4NO7A 3K5MA 1JCFA 4U7BA 4BWJA 3Q7CA 4YOXA 1Q8IA 2NRRA 3ZSQA 4BRQA 2YV0X 3H46O 2HB5A 4DSFA 3U9DA 4JKDA 4LC9B 5GIOA 4KTWA 3LM2A 3AA5X 3D2EA 4FXDA 4QS8A 5J1EA 3VQ9A 1IJJA 5E26A 3SQ1A 4E3SA 3RR7A 2P9LB 1BO5O 3M8SA 4H0YB 5HOOA 3FFKB 3MWPA 4YFUA 1XC9A 4FJ8A 4I7FA 4M3YA 3LAMA 1NK8A 3V1OA 4B3OA 2I5JA 4IBNA 4EP4A 2ETJA 3CMAN 4JRQA 5MLCQ 4GV6A 5FPNA 4KI6A 4M7XA 2HBLA 1Y64A 4PKGA 1ATRA 3OHRA 1B9FA 4AILC 3SPYA 4H0PA 4ILJA 3NF8A 5AQSA 2ASOA 4OJRA 4N41A 3FZFA 3LDPA 4E72A 1BGXT 2PFUA 3O1BA 4BGAA 3HO1A 4YOYA 3TANA 4BWMA 4JK8A 3CI5A 1RDCA 5JICA 1KVBA 3LDQA 3NGZA 1XQSC 2HSTA 3MN6A 3SQ2A 3L4QA 4MDBA 4C1NI 3WXLA 4AM7A 4KPYA 1QSSA 1A5XA 4H0VB 4MFBA 3ZSWA 2DPNA 4CI6A 1UA0A 3CPEA 4DU1A 2YHBA 4WCEL 5TKWA 5C15A 5KRSA 5M1KA 4F3OA 2ZM6K 1BIUA 1ATSA 3TPQA 5AFUH 1DLOA 3SBGA 3U9ZA 5EX5A 2YNHA 2F96A 2GWJA 1HQUA 4B9TA 3LP3A 5IWAK 4IFVA 3KIOA 3PSIA 2HHQA 3ZSXA 4FWNA 3K5NA 2HHTA 1QQOA 1VQKN 2GWKA 4W5RA 4B1XB 1A5WA 4LFBK 1RBVA 1BCOA 4NLCA 3OYMA 3T7ZA 4FLZA 3I8DA 2D1KA 4JI0K 4FK4A 1FKPA 4DR1K 3C6UA 3S41A 2Q36A 4BRCA 1BQNA 3R6MA 4MO4A 4X62K 3OYBA 3AARA 1HNXK 1NK0A 1S22A 2I7PA 5KPZA 1K6YA 2CGKA 4JYAK 3AVFA 4DQ8A 2GV9A 4KI4A 4ICLA 5AQUA 2QKKA 3HVTA 2V52B 1DTTA 2A5XA 3CFPA 1QVGM 3M8RA 4ID5A 4CD3A 2G8KA 1IV0A 1SL2A 2QM1A 2KKZA 4DF4A 1ZBFA 3FGUA 3AVIA 1HJRA 2ITGA 5C25A 5FRNA 3N4PA 4E7LA 2RE2A 4KH5A 3KKSA 1VQ8N 4DSLA 4B9SA 3QETA 3GOIA 3MX5A 1SL0A 4O5BA 3DLGA 1S9GA 3LDSA 5K14A 3MXIA 1EXQA 4AM6A 3RVCA 1LCUA 3KVGA 1VSJA 4M3RA 4JEPA 4B9QA 3LALA 5BPMA 3B6OA 4DQSA 4CEEA 3LP1A 2YNIA 3L2QA 3KKRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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