3LDQA

Crystal structure of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitor
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 121
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldqA04
3ZX2A 3ID8A 3KZBA 3LDNA 4MO4A 4DHYA 3M6GA 4FWRA 3VEWA 2QW9A 5FPEA 5AQNA 5BN9A 3BP8A 2ZF5O 3D2FB 3FZHA 3CIPA 2P9NB 1LOTB 1RGIA 3GL1A 2YHYA 3FR0A 5AZIA 1XC3A 4JD2B 2BTFA 2ASMA 1DGKN 2P9IB 4YDUA 3VGKA 5BRFA 3IMXA 3G25A 1ZC6A 3CJ9A 2P9KB 5BPMA 2ZGYA 4BC2A 3O80A 3SMPA 4FPBA 4CD3A 3KVGA 4O8KA 2GELA 3M1FA 3WQTA 1IJJA 2YCHA 1NMDA 4BRKA 4CZFA 4CZGA 1QZ6A 5E26A 5EXWA 5FPMA 2VCPA 2E1YA 1GLEG 3A5OC 3ATVA 5KPZA 4FWLA 1V4SA 1SQKA 2FLOA 2HF3A 4WYBA 2HOEA 3D2FA 2D0PA 3VEZA 1WOQA 3AAQA 1V4TA 3LDQA 1H1VA 4BC4A 3DWLA 1C0FA 1HUXA 1U2VB 4C23A 2NLXA 1J6ZA 1KAZA 3ZEUB 1NGJA 2DPNA 3CJCA 3W0LA 3O4WA 3LDLA 4CZEA 3HI0A 2PBDA 2VYPA 3M3ZA 3SLCA 2ZGZA 2IVOA 4FO0A 1Z6RA 3GOIA 2Q0UA 5AZJB 3LDPA 4HWIA 3S41A 2AP1A 4LC9B 4BR2A 4CI6A 3MCPA 3AAPA 3ZX3A 4CBXA 4BVOA 3MN7A 3MN6A 4PL7A 1BOTO 2Q0RA 2A42A 5F2RA 3U4LA 5I9EB 3ZX0A 3DXMA 2GEMA 3CJBA 2D0OA 2ASPA 4BC5A 3A5MC 4XEIA 4BRHA 1GLBG 5TKYA 3CI5A 4H0PA 2VWBA 4BR0A 5BRHA 5LY3A 1T44A 4K25A 4MLHA 2EWSA 5AQWA 4PKHA 1ZXOA 5JICA 1BUPA 1T6DA 3CQXA 4FPAA 1NGBA 2Q1NA 4ISFA 3LM9A 3DAWA 5BPNA 3I33A 4FWNA 4JHDA 4A2AA 2YI1A 3L4IA 3A8YA 1SZ2A 3L6QA 3DXKB 1YAGA 3VERA 4WQ4C 5BPLA 1QHAA 4FWMA 3A5NC 3QFUA 4CBUA 1HKCA 5KPTA 5AQVA 2ITMA 3LDOA 5EX5A 2CH6A 4DB3A 3LL3A 4M7XA 2BUPA 2AA4A 4EFHA 4E1JA 4CZKA 5AQMA 1JCGA 3OHRA 1BO5O 1ATRA 5BN8A 4K41A 4BRPA 1RDWX 2QWMA 3BEXA 4BR9A 1K8KB 4YDUC 5ADXA 2GUPA 5BREA 4FL9A 1XQSC 2QWOA 5F0XA 3C7NA 1GLDG 2FXUA 2E88A 3VESA 1RFQA 1LCUA 2IVPA 2D4WA 3UKRB 4WQ5C 5EOYA 3VF6A 4XH5A 1SAZA 4MLEA 5AQZA 2E2OA 4ISEA 2F9WA 1WUAA 5AQFA 3CQYA 2P9PA 4L3QA 4BRQA 2CGKA 1NGEA 2Q97A 5AQXA 4QS8A 1GLLO 4A2BA 5LJVA 3GG4A 2GWKA 3R6MA 3WUHA 3ZEUA 3JXUA 5AQGA 3UE5A 2Q31A 3CETA 2ZWHA 5AQHA 1K8KA 2V52B 3SJHA 5E84A 2HMPA 3GDQA 2A41A 2P9SB 1Q18A 2QWRA 3WQUA 2YJFA 3HM8A 4DQ8A 1NGIA 1GLCG 2I7PA 1S3XA 4K42A 3SMSA 3IFRA 2P9LB 2V7ZA 4I6MA 3ULEB 4RCHA 5AQQA 1HPMA 3QMLA 3B8AX 5FPDA 5AQOA 2I7NA 4IWVA 5AQLA 4B1ZA 4BRDA 4XH4A 4F9OA 2NRHA 3WEEA 2E20A 2D1KA 1Z05A 3C0BA 3J8AA 3WXLA 4BREA 3CJ1A 3W3DA 4BRLA 2YJEA 3DXMB 4BC3A 4IZ9A 4CD1A 5AQRA 3EKUA 5AQYA 1EQYA 3TPQA 3VGMA 4Y0WA 2GTDA 2A3ZA 3O5BA 4EAHD 1CZAN 1NGAA 4QS7A 4M63C 3SK3A 1P8ZA 3AY9A 2FF6A 3I8BA 3VEYA 3MN9A 1ESVA 4H0YB 4BRMA 4CBWA 3CERA 3O1WA 1E4FT 2P9LA 4BR5A 2Q36A 5LJWA 2V51B 3MDQA 3H46O 3VENA 3L0QA 4BRNA 1KAXA 5KPRA 2PAVA 2YHXA 5B8HA 2NZTA 4FOIA 4H0XB 4PKGA 5JLFA 2E2QA 3ZETB 3O08A 3DXKA 4PL8A 1BWFO 4BQLA 3H3NO 2A40A 1DEJA 5AFUA 1NGGA 3C7NB 4KBOA 1HJOA 3QDKA 4H03B 2CGLA 2W41A 5JLHA 2WUSA 1X9JA 5AQJA 5FPNA 3EN9A 3WEEB 1BA1A 3D2EB 1JCFA 1DKGD 3IUCA 2E2NA 5CE3A 4B1WB 3WXJA 3UKUA 3FE1A 4QS9A 3U8XA 4BRIA 4IXCA 3CHWA 4FWPA 4PKIA 4BRCA 5JMVA 5BRDA 4M7YA 3HZ6A 4FWKA 3QBXA 3F9MA 1KAYA 2F9TA 3HBTA 3MMVA 4FWQA 3FZFA 1TUUA 2W40A 4FOEA 3WXKA 1S22A 3UKRA 5EVZA 4CZLA 4B1YB 3RSEB 4O5FA 2QWLA 3VPZA 4IO8A 3R9PA 1HKGA 3IDHA 4BVPA 3GE1A 3ATUA 4EHTA 5AR0A 3FGUA 2P9PB 3ENHA 2E2PA 2QWPA 2QWQA 2CGJA 4DCHA 4AM6A 5KQDA 1YUWA 5KQ8A 3QICA 1X3MA 1YXQA 4JN4A 5AQTA 1IG8A 1ZBSA 1BDGA 1BA0A 1U6ZA 5ADXH 4BROA 5ELZA 4FWSA 2OANA 3QFPA 1KXPA 4JD2A 4EHUA 3EZWA 2V7YA 3FZKA 3DJCA 1NWKA 1QZ5A 2Q2RA 3QBWA 4BR4A 3U9ZA 3VETA 4H0VB 4H5RA 1BU6O 3EL2A 3UB5A 1GLAG 3U9DA 4MO5A 3LM2A 2P9UB 1D4XA 1C0GA 1BG3A 3MN5A 4A61A 4BG8A 1QQOA 4J8FA 4HTLA 4XH1A 4BGAA 4BQZA 1XUPO 4CZJA 4H5WA 5AZJA 1HX1A 1G99A 2E1ZA 3O8MA 1MWMA 3VEOA 2UYTA 2ASOA 3H1QA 4H5TA 1T6CA 5F1XA 3H3OB 4K43A 3H45C 3EO3A 3RSEA 3TU5A 2FF3B 3R8EA 1E4GT 1U2VA 3VF4A 4BRGA 1HLUA 1NGCA 2CH5A 2QM1A 1NGFA 3EKSA 1TYQB 4IJNA 3WT0A 4JNEA 1YVNA 4IJAA 3ENOA 4BRFA 1Y64A 1R59O 4AM7A 1NLVA 4H5VA 4JAXA 2IIRA 4B1UB 3JS6A 4RTFD 3H1VX 4FSVA 4BGBA 4CZHA 3ZETA 1GLJO 5AQSA 5AQKA 4B9QA 2H3GX 1TUYA 1OKJA 3HTVA 3VEXA 3VEVA 4FWOA 4WQ5A 4H5NA 4GNIA 4ISGA 2IVNA 3A0IX 3O6WA 3KHYA 4Z94A 5AZIB 3VOVA 3WXIA 2FSKA 4H0OA 2E8AA 3BF3A 3H6EA 5BR9A 2P9SA 4A62A 2P9UA 1MDUB 1TYQA 4NB4A 4NO7A 1QQMA 4CZMA 3P4IA 3D2EA 1JCEA 1NGHA 1MA9B 4H0TB 2A6AA 3O1BA 1NM1A 2FSNA 2HF4A 1ATNA 3BF1A 4B1VA 3VF2A 1HKBA 3QB0A 5EY4A 3D7EO 4GY2B 3FZMA 2QXLA 4BRAA 2A5XA 3UKUB 3VGLA 5AQIA 2P9NA 2KHOA 1NGDA 1ATSA 2J4RA 2QWNA 3A5LC 3FLCO 4B1XB 4WQ4A 3ULEA 4BG9A 1NBWA 1X3NA 3BUZB 3GBTA 4CJ7A 2P9KA 2FSJA 4I6MB 3HSCA 2YHWA 3FZLA 2P9IA 4BR7A 4EIAA 4JHDB 5AFUH 4CZIA 1MWKA 3AARA 1QQNA 5AQPA 4RWTA 1GLFO 3FFKB 3CJ7A 3CJAA 3MK6A 5AQUA 2GWJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HQEA 1WSGA 1BISA 3O3FA 4MO4A 4FWRA 2QW9A 4CFBA 4N41A 2B3CA 4WE1A 3V1OA 1RT3A 2P9NB 5FROA 3GL1A 3FR0A 4RW8A 1XC3A 3K5MA 2RN2A 2ASMA 1DGKN 4YDUA 4HHTA 1ZBFA 1SV5A 3IMXA 3CCQN 2OA8A 2DFHA 4Z4GA 2ZGYA 3LZIA 3M5RA 2FC0A 5K14A 1WLJA 1VHXA 4OLBA 3L2QA 2QKKA 3KKSA 1IJJA 2YCHA 1I39A 2NRWA 3SAGA 1NMDA 4BRKA 3JAMO 4JS4A 1JLBA 4CZFA 3RWUA 1NKEA 3AO1A 2HHHK 1XMOK 1HMVA 3AVCA 4JKEA 5T7BA 2WFBA 1V4SA 2FLOA 4FWLA 1U49A 2E6LA 2JLEA 2HNDA 4GV6A 1V4TA 3AO3A 2YNGA 4DU1A 1Y97A 4BC4A 3CFRA 2OTJN 4DU3A 1NPIA 3CCLN 1NNEA 3W0LA 3CCEN 5C0YA 1IO2A 3TARA 4B3RK 2G8IA 3SLCA 3OBYA 1C55A 5DMRA 3PX6A 1Z6RA 5AZJB 2HHIA 1J5OA 3NBPA 2DFEA 3TTDA 1D9DA 3CXCM 3TTFA 3KOWA 3S3NA 4M41A 3OTOK 5DK5A 1BOTO 5F2RA 4YNQA 4MFBA 4DLEA 3ZX0A 3DXMA 5C24A 1SKRA 2WBNA 4FK4A 1X1PA 4KTZA 3WNFA 4R5PA 4XEIA 4CESA 4XIUA 4DR7K 4BRHA 3BZCA 1GLBG 4JKBA 4L8RB 3QETA 4LH5A 4DSFA 1SKSA 4DSLA 5BRHA 4K25A 3RMCA 2EWSA 4PUOA 1FH3A 3OYGA 2QEXN 1T6DA 3CQXA 1NGBA 3HVTA 5BPNA 1NK0A 1LV5A 2O8DB 2B5JA 1TKDA 3LP3A 2YI1A 3L4IA 3MEDA 3V1RA 4YOVA 3J7ZO 3PO4A 1QE1A 2ZJPL 5BPLA 1X9SA 4FWMA 4CBUA 3LPTA 3OVNA 3D0PA 5KPTA 2O4IA 2CH6A 4DB3A 3LL3A 5CYMA 3PSFA 4M7XA 4CGFA 2BUPA 2AA4A 3R3LA 4EFHA 1XNRK 5HLFA 3OHRA 3DMJA 3E9PA 4IDHA 2E4LA 3SUOA 1X9MA 1ATRA 3TWHA 5BN8A 4K41A 3QLHA 5MLCQ 4BR9A 1K8KB 1TKTA 4B3OA 4CEOA 4FJKA 4LFAK 1F21A 2KFNA 2K35A 3C7NA 1GLDG 4CJPA 3DLHA 3VESA 1XC9A 2D4WA 2Z1GA 5EOYA 1BGXT 4H8KA 1SAZA 3B6OA 5AQZA 1ZUTA 1FK9A 1BK8A 1TK5A 1WUAA 3BDPA 4CVNE 4L3QA 1CN2A 3NGYA 1NGEA 1W9HA 1I3AA 2Q97A 4CQKA 1RTIA 1RT1A 4DV6K 3QO9A 1NE5A 3ZEUA 2Q31A 5LMUK 1K73O 4E0DA 1M90O 4ELTA 2WONA 1PX9A 5CY4A 2F96A 1RNHA 2A41A 1FKOA 3QEVA 2P9SB 4FLTA 1K9MO 3BGRA 1GLCG 3M8QA 2YV0X 1S9GA 3KP1A 3TAQA 3IFRA 1W0HA 4IFVA 2SN3A 2VGNA 5AQQA 4WF9L 3PV8A 4M3YA 1N4NA 3QMLA 5FPDA 5HRNA 2I7NA 4IWVA 4B1ZA 2GBZA 2E20A 2D1KA 3C0BA 1VQ8N 3M8SA 4BREA 4CFAA 3QNNA 3DXMB 2G8HA 1TK0A 4CD1A 1WN7A 3EKUA 1VQ4N 1EQYA 4E3SA 1L5UA 1CZAN 3VQ9A 1WAFA 2FF6A 2N66A 1UAXA 1JLEA 5A2QO 1L3TA 5BR8K 4CK2A 4W5RA 4N56A 4KHYA 4H0YB 4OJRA 2E6MA 4CBWA 3MXIA 3O1WA 1POIA 2QXFA 4AHSA 1IKYA 3MXMA 1EXQA 4FLXA 1VQ5N 1J53A 3H46O 4KHUA 4F4KA 2YHBA 3AA3A 2YILA 3NGIA 5CR4A 2YHXA 5B8HA 4H0XB 2OPRA 4U67L 5JLFA 4J2BA 4H4OA 4GMJB 5C25A 1Q86O 1HNZK 1OH5A 1OH7A 1KRPA 4CFCA 3C7NB 3O9TA 2GV9A 2CGLA 2W41A 1N36K 4JRPA 1KC8O 1BA1A 3KHWA 4IBNA 1C1BA 4AHCA 2E2NA 3L4QA 5CE3A 3CM5A 3WXJA 4DLGA 3OYAA 1YJWN 2HW3A 2G2KA 3FE1A 5SWMA 3U8XA 4BRIA 3J81O 4CGGA 3OS0A 3KLEA 3ID6A 3LP0A 4F2RA 4FWPA 1REVA 3VMFB 3OW2M 4YORA 2UU9K 3HZ6A 3TAGA 4DV2K 4FWKA 3QBXA 1QHTA 4KI4A 4E7KA 3HBTA 1EKEA 3FZFA 2W40A 3AVHA 4CJKA 3KLFA 3M8RA 3SAFA 5EVZA 2O8BA 3MX2A 5J2MA 2QWLA 3R9PA 4ELVA 4HHFA 1VSLA 3G0ZA 3ZSOA 2RHKA 2IAJA 4DV0K 3GE1A 3ATUA 3RMDA 5AR0A 3FGUA 1A5VA 2P9PB 3ENHA 4M3WA 2E2PA 3AV9A 3OYDA 2Y1IA 2QWQA 4B9UA 4CJ4A 3T1YK 1M1KO 3RRGA 4KHNA 3QEWA 1B9DA 3TSUA 3QEPA 3SUNA 1IG8A 2NRRA 3TSQA 4GKJK 1JKZA 3KK3A 2EHGA 4ILJA 1J9AA 3IS9A 5H1SQ 2JGUA 4F8RA 3DJCA 3CCRN 2Q2RA 1RT6A 2LI7A 4GKKK 4JRQA 3P39A 3UB5A 3P31A 4JKHA 1GLAG 4I9QA 3DOKA 3LM2A 2Q3SA 1BMRA 4BG8A 1BG3A 3O9RA 5FLXO 1NK5A 4XH1A 4HTLA 3AGRA 5AZJA 2E1ZA 4JI3K 4PQUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HQE A;  1WSG A;  1BIS A;  3O3F A;  4MO4 A;  4FWR A;  2QW9 A;  4CFB A;  4N41 A;  2B3C A;  4WE1 A;  3V1O A;  1RT3 A;  2P9N B;  5FRO A;  3GL1 A;  3FR0 A;  4RW8 A;  1XC3 A;  3K5M A;  2RN2 A;  2ASM A;  1DGK N;  4YDU A;  4HHT A;  1ZBF A;  1SV5 A;  3IMX A;  3CCQ N;  2OA8 A;  2DFH A;  4Z4G A;  2ZGY A;  3LZI A;  3M5R A;  2FC0 A;  5K14 A;  1WLJ A;  1VHX A;  4OLB A;  3L2Q A;  2QKK A;  3KKS A;  1IJJ A;  2YCH A;  1I39 A;  2NRW A;  3SAG A;  1NMD A;  4BRK A;  3JAM O;  4JS4 A;  1JLB A;  4CZF A;  3RWU A;  1NKE A;  3AO1 A;  2HHH K;  1XMO K;  1HMV A;  3AVC A;  4JKE A;  5T7B A;  2WFB A;  1V4S A;  2FLO A;  4FWL A;  1U49 A;  2E6L A;  2JLE A;  2HND A;  4GV6 A;  1V4T A;  3AO3 A;  2YNG A;  4DU1 A;  1Y97 A;  4BC4 A;  3CFR A;  2OTJ N;  4DU3 A;  1NPI A;  3CCL N;  1NNE A;  3W0L A;  3CCE N;  5C0Y A;  1IO2 A;  3TAR A;  4B3R K;  2G8I A;  3SLC A;  3OBY A;  1C55 A;  5DMR A;  3PX6 A;  1Z6R A;  5AZJ B;  2HHI A;  1J5O A;  3NBP A;  2DFE A;  3TTD A;  1D9D A;  3CXC M;  3TTF A;  3KOW A;  3S3N A;  4M41 A;  3OTO K;  5DK5 A;  1BOT O; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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