3LDQA

Crystal structure of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitor
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 121
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldqA04
2NRHA 4BQLA 1D4XA 1JCGA 1GLFO 1Y64A 5JICA 1QQMA 3LDPA 1JCFA 2CH6A 4BR0A 2HF3A 3UKRA 4BGBA 4WQ4A 1ZXOA 2BTFA 4DB3A 3CI5A 3FZKA 5AQOA 4FWKA 3VEZA 2E88A 4MO5A 2P9NA 1HPMA 4JD2B 5E26A 4A2AA 2NLXA 5JLFA 3W3DA 2D4WA 2YHXA 3SK3A 1H1VA 1K8KA 4CBWA 4DHYA 5BN9A 3MCPA 4JHDB 2Q0RA 4IZ9A 4CZEA 2FSNA 3CJ7A 3HZ6A 4XEIA 4RWTA 1C0GA 3VEWA 1QHAA 4PKGA 4A2BA 1KAYA 3VGKA 2FF6A 3LDOA 5EX5A 2YI1A 5AQIA 4CZFA 5ADXH 3L6QA 4RTFD 3D2EA 5AQSA 4BR9A 1DGKN 4FWPA 3ATUA 3O80A 4EHTA 2QWOA 3DWLA 1GLAG 2GELA 3A5NC 3C7NB 4XH5A 2Q31A 1NWKA 5BRFA 3FR0A 3F9MA 3DJCA 1NMDA 4PL8A 1MWMA 4EAHD 3SMPA 3KHYA 4BC5A 4CZJA 3HSCA 3WT0A 1HX1A 3O08A 5EOYA 4F9OA 4MLHA 2QWQA 2GEMA 5I9EB 3FZFA 1BA1A 4CZGA 4GNIA 3DXMA 1HJOA 1V4SA 5KPTA 5B8HA 3CJ1A 1IG8A 1EQYA 3M6GA 1NGIA 5F0XA 2V52B 1U6ZA 4A62A 5FPDA 4BRQA 3SJHA 2D0OA 4CZIA 3U9ZA 4H0YB 3WQUA 3LDNA 3RSEB 1YXQA 2Q36A 4FPBA 4K42A 5BPMA 1HKGA 4BR5A 3DAWA 4BREA 2PAVA 2NZTA 5FPMA 2Q2RA 2YJFA 4WQ5A 3ZETB 3UKRB 1YVNA 3O1WA 2ZWHA 4BRNA 4BRGA 2A40A 3D2FB 3CJAA 2FXUA 4BVOA 2P9UA 3S41A 1GLJO 1V4TA 1U2VA 3FFKB 3VETA 2H3GX 2GWJA 3KVGA 5KQDA 2QXLA 1DKGD 5JMVA 4BG8A 5AR0A 3CJBA 4JNEA 3WXKA 1BG3A 2ZF5O 1NLVA 3R6MA 1R59O 4IJAA 2GWKA 4BC3A 3R9PA 2IIRA 4O8KA 3CETA 3GOIA 3W0LA 2J4RA 5JLHA 3MN9A 3VF2A 3FE1A 1T44A 3C0BA 3QBWA 5TKYA 4FWQA 3FZHA 1TYQA 1QQNA 2A6AA 3MDQA 5ADXA 1ATRA 1ESVA 1LOTB 5BN8A 3BF3A 4QS9A 2FSJA 4DCHA 5AQMA 2Q97A 1Q18A 3EKSA 3QFPA 5AZIA 4GY2B 1GLDG 1YAGA 3H3OB 1NGHA 3DXKB 3MMVA 1SZ2A 3CQXA 3L0QA 2E2NA 3O6WA 3VEXA 3BF1A 1P8ZA 4FWSA 2BUPA 1T6DA 2CGLA 1Z6RA 4I6MA 3HM8A 5BRDA 3ZEUA 2P9PA 3ZX0A 5LY3A 1S22A 4MLEA 4QS8A 4B9QA 2P9IA 3VEYA 4CD3A 1CZAN 1SQKA 3DXMB 4KBOA 3TPQA 4FWRA 1RDWX 1WUAA 1BA0A 2QWNA 3JXUA 5LJWA 4FWLA 1NM1A 4Z94A 4FSVA 2ITMA 1NGJA 1OKJA 3R8EA 4FO0A 2GTDA 3VESA 3GL1A 2OANA 4M7XA 5ELZA 2P9KA 3FLCO 3VGMA 5BREA 1HLUA 5AZJB 3UKUA 1XC3A 2ZGZA 4M7YA 3WEEB 2E20A 1JCEA 3VPZA 3WXLA 4E1JA 3M1FA 5AQTA 3EO3A 5AQQA 4BRIA 3IFRA 1DEJA 1BO5O 2UYTA 2D1KA 4H0OA 4PKHA 3BEXA 3ID8A 2KHOA 3A5MC 2P9SB 4RCHA 3CJCA 1G99A 2Q1NA 2YCHA 2E2QA 3LM9A 3ZX3A 3ZX2A 5AQVA 2V7YA 3H45C 4FPAA 3CIPA 3QICA 3MN5A 4PL7A 4PKIA 3A8YA 4B1VA 4BRCA 2I7PA 4B1ZA 1KAXA 3LDQA 3ATVA 3M3ZA 1NGGA 3HBTA 4O5FA 1RFQA 3BP8A 3HI0A 4H03B 4YDUC 1HKCA 2FF3B 5CE3A 1LCUA 2E1ZA 4CBUA 2HMPA 2WUSA 1RGIA 5AZIB 5AQRA 4H0XB 2A5XA 3O8MA 5BRHA 3EZWA 4I6MB 2W40A 2HF4A 4CZHA 2CH5A 3WUHA 1NGEA 2P9PB 4EIAA 3QBXA 4NB4A 3H1QA 4HWIA 4BR7A 2CGJA 3QB0A 3BUZB 3G25A 4BROA 1BU6O 1NGDA 1BDGA 4BRDA 4H5NA 2QWLA 5F1XA 4IJNA 1NBWA 2ASOA 4BC2A 3P4IA 2QWMA 2P9NB 2A41A 4CI6A 1T6CA 3GDQA 4JD2A 1Z05A 3VENA 3J8AA 4BRAA 1K8KB 4EFHA 4B1UB 1GLBG 4AM7A 5AQFA 4L3QA 4FWOA 3QMLA 1QZ6A 2E2PA 4IWVA 4BGAA 5AQGA 4FL9A 2ASMA 3LDLA 3UE5A 3H46O 2P9LA 3IMXA 2QW9A 4LC9B 3UB5A 3GE1A 3B8AX 5EVZA 5AQUA 4IXCA 4BRFA 3D2EB 3FZMA 3AY9A 1BUPA 2W41A 3IUCA 2PBDA 4DQ8A 5BR9A 2FSKA 3VEVA 1QQOA 5BPNA 5AQWA 2V7ZA 5AQZA 3C7NA 3QFUA 5F2RA 4ISEA 4H5VA 2A42A 3VF4A 1J6ZA 4B1YB 5AQHA 1X9JA 4EHUA 2IVNA 2ZGYA 5FPNA 3VEOA 1ZBSA 5AQNA 4IO8A 5AQYA 1HUXA 3LL3A 3MN7A 1SAZA 1KXPA 4K43A 4BQZA 3AAQA 3QDKA 5E84A 2HOEA 4WQ4C 2VCPA 4BRMA 3RSEA 4BR4A 4BRHA 3A5LC 5KPZA 3H1VX 1MWKA 1TUYA 4ISFA 4BVPA 2YHWA 3CJ9A 3LM2A 3ZETA 1X3MA 4WYBA 3SLCA 2I7NA 2P9UB 3MK6A 4CD1A 4C23A 1U2VB 3A5OC 3D2FA 1YUWA 1BOTO 4MO4A 4AM6A 4J8FA 4H0PA 4A61A 3TU5A 3U4LA 2Q0UA 1BWFO 2P9LB 2VYPA 1KAZA 2F9WA 3EN9A 2EWSA 3H6EA 4ISGA 3D7EO 4H5WA 2V51B 3FGUA 3SMSA 4BG9A 1TYQB 5LJVA 1ATNA 2IVOA 4CZKA 3ENHA 3GG4A 3VGLA 3VOVA 4FWNA 5AQPA 5AFUH 3ULEA 3WQTA 1E4FT 3O5BA 4BRPA 1ATSA 4FOEA 3DXKA 4K41A 3ZEUB 4BRLA 4YDUA 3CHWA 4HTLA 2E1YA 5KPRA 2D0PA 2P9IB 3WXIA 5AQKA 1E4GT 1NGFA 3ENOA 3VF6A 1MDUB 4H5RA 4NO7A 3L4IA 1GLLO 4JN4A 1IJJA 4CZLA 2CGKA 5AQXA 5AQJA 3EL2A 1XUPO 4M63C 1ZC6A 4WQ5C 1MA9B 2YJEA 4B1WB 4BC4A 2P9KB 3OHRA 3UKUB 5EY4A 2QM1A 4XH4A 4JHDA 4CZMA 3AAPA 2F9TA 5AZJA 2E2OA 2QWRA 4H0VB 3CQYA 3WEEA 1S3XA 1C0FA 1HKBA 2GUPA 1GLCG 4XH1A 1NGBA 4CBXA 1TUUA 1WOQA 3KZBA 4CJ7A 1GLEG 3U9DA 3I8BA 2IVPA 5AQLA 5KQ8A 3A0IX 2P9SA 4QS7A 4B1XB 3H3NO 2QWPA 5BPLA 3HTVA 2DPNA 4H5TA 3VERA 5EXWA 2A3ZA 1QZ5A 2AP1A 4FWMA 3CERA 4Y0WA 2E8AA 1NGAA 2AA4A 3WXJA 3U8XA 3I33A 1X3NA 2VWBA 2YHYA 2FLOA 3ULEB 4BR2A 3FZLA 3AARA 3EKUA 1XQSC 3O1BA 5AFUA 3GBTA 3MN6A 4FOIA 1NGCA 3IDHA 5FPEA 4H0TB 4JAXA 4BRKA 4K25A 3O4WA 3JS6A 2ASPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AHCA 3DI6A 4NYNA 1Y64A 1QQMA 1JCFA 3SV3A 4DB3A 4KHNA 1ZXOA 2WFBA 1WSIA 4FWKA 3VEZA 3ZSVA 4WFAL 4A2AA 5E26A 4FJ9A 4NXMK 1HMVA 5JLFA 2Y1IA 1NNEA 4CJ4A 3QIOA 2NRZA 4W5OA 1Q9YA 1VSJA 3KWIA 4LSNA 5SWMA 2PZSA 4JHDB 2VGMA 2YKNA 4CZEA 4E1MA 5KTQA 3CJ7A 3OJSA 4RW7A 4CK1A 1QHAA 3SF4D 4A2BA 4AAZA 1OVYA 2FBVA 3CQ8A 4C8OA 3VGKA 2FF6A 3HPGA 5ADXH 4GW6A 1W7AA 5AQSA 3OW2M 4BR9A 3P38A 1OMYA 3VTHA 4KB1A 3K59A 5CYMA 2E6MA 4Z4HA 1WWNA 4FW1A 4DR5K 3OYDA 4CEQA 4G1QA 5BRFA 5M1KA 4PL8A 1LWFA 4CGFA 4NXNK 4BE7B 1IBMK 4BC5A 3SUOA 2W42A 4F9OA 5C15A 1VSHA 4LF6K 3FZFA 1BA1A 1ICAA 4CZGA 5KPTA 4CJVA 3KOZA 1D8YA 1CXUA 1BGXT 2FBXA 4KHWA 4ZTFA 1U6ZA 3BY5A 3R3LA 4FW2A 1IBLK 4W5RA 4DQQA 4J2AA 1BHLA 3WQUA 3K5MA 2GUIA 4DU3A 4K42A 5DM7L 3U3YA 5T7BA 4BREA 1TAQA 4PWDA 3G71N 2Q2RA 3DM2A 3HM9A 3P39A 4WE1A 5J1EA 3S9HA 1YVNA 1VK0A 4BRNA 3A2FA 3E9OA 1O13A 2A40A 5C42A 3CW4A 4BVOA 5M1NA 3S41A 2ZQBA 3O3GA 3Q7BA 1XNRK 2GWJA 4EP4A 4ID5A 2F8TA 3SQ1A 5KQDA 1L3SA 5JMVA 3AVHA 5AR0A 4JNEA 3WXKA 4B08A 3VQAA 1RDUA 1NLVA 1YJWN 1LW0A 2BH1A 4FJJA 3HVTA 3R9PA 2NNWA 3HP9A 2J4RA 3OYNA 3MN9A 3JAMO 1T44A 4XJXA 2G8UA 1ZFUA 4FWQA 3FZHA 5ADXA 2A6AA 4LSLA 1HNVA 1D5AA 1U04A 1VSKA 4YFUA 1ATRA 1LOTB 4QS9A 5KI6A 3BF3A 1AYJA 1CHZA 3AA5X 2K35A 4YOUA 3I56N 2D0AA 4JV5K 3QFPA 1HQEA 5AZIA 3OYIA 3ZSOA 3DXKB 3RR8A 2OZSA 1YJNN 4E7KA 1T8EA 2P9PA 3P83D 1S22A 5GINA 2N2QA 4AILC 4B9QA 1N36K 1N34K 2WC9A 2LI7A 1CZAN 3DXMB 3K9JA 5GAHP 1RDWX 1WUAA 5CY0A 1WAFA 4DQSA 5MLCQ 4M3XA 1NU0A 3KLHA 4Z94A 4FSVA 3QO9A 2G8IA 4CK3A 2M8BB 1U47A 5D3GA 3O9RA 3TANA 2KKZA 4L8RB 4B3TK 3KD1E 4JI7K 4NYFA 2P9KA 4H8KA 2C1IA 3THYB 4OKJA 3VPZA 3KK7A 3WXLA 3MWPA 3M1FA 5AQQA 2OA8A 4BRIA 3CFOA 3G0ZA 3CCQN 2ATQA 4FK0A 1DEJA 1I6FA 4FLWA 4AH9A 2VG7A 3IG1A 2KHOA 3THXA 4DSIA 2Q1NA 3ZSQA 1JL2A 3HK2A 2E2QA 2V7YA 3LWMA 3CIPA 3S3MA 4DSKA 4BE1A 1D9DA 4B1ZA 1KAXA 3LDQA 2JGUA 3QIPA 4YOVA 5AJ3K 3TAPA 3ZSRA 1Q81O 1NG9A 5CE3A 2E1ZA 1TVRA 2HMPA 2KBKA 4H4OA 4IOCL 4KPYA 1KVBA 1WSFA 4E1NA 2BGGA 4H0XB 3O8MA 1RT5A 3DLHA 3T1YK 4FZYA 3WUHA 4LH5A 5M1PA 3KWGA 1U4BA 3E1YA 3DLKA 3QB0A 3L2WA 3NDKA 1QS4A 1UA0A 3OYCA 2VWJA 1BU6O 1NGDA 3MEDA 2PY5A 4B9NA 5F1XA 1Q8IA 4R79A 1WSEA 1VHXA 5HRRA 2NRWA 4GKKK 3AO1A 3N4QA 3AVKA 3RMDA 2LY5A 4ELUA 3J8AA 4BRAA 1ZU3A 1RT6A 3SZ2A 1RILA 4DQRA 3THWB 1OZZA 4IWVA 4BGAA 2P5OA 2NRTA 3KP0A 4CF9A 3UE5A 3R1XA 5M1FA 4HUGA 2RPIA 1X9WA 3IMXA 1L3UA 2QW9A 4C8KA 3LPTA 1T7EA 4CJWA 2A1SA 1NK4A 2IS3A 4H4MA 4IXCA 4CK2A 4FZXC 4ILHA 2W41A 1X1PA 4FLUA 4DQPA 4DSLA 1SS6A 3K5LA 2FSKA 5LMUK 1TGOA 2D0CA 4K8XA 5F2RA 4ISEA 4CJQA 1WAJA 1SN4A 1ZBUA 3OYBA 3OYJA 3AVFA 3VF4A 2IGIA 1J6ZA 1X9JA 4LFBK 1C0MA 4DFPA 4IO8A 1S1VA 4MDBA 1UOCA 3ZT0A 4FJXA 1BCGA 3LL3A 3LALA 4CJSA 4FK2A 1NJIO 3AAQA 2O8BA 3WNEA 5KRSA 1BCOA 2HOEA 4FVMA 1NJYA 2VCPA 1NK8A 2PFUA 4K8ZA 1TK0A 3V4IA 3PX6A 4ISFA 4M3RA 3TARA 3NF9A 3D6RA 2UUBK 4CIGA 3O9QA 1VSDA 1X3MA 4CFBA 2VG6A 3MK6A 3D2FA 4E0DA 3VQBA 4CFCA 2HSTA 3CM5A 2F4VK 3HOTA 5HP1A 3E7UX 3ZT2A 1VQ7N 2X74A 4AEIA 1KD1O 4N5SA 2F9WA 4BACA 3EN9A 4Y1CA 4FJ7A 4CHOA 3D7EO 4OPAA 3NAEA 3ZSZA 4OLAA 5LJVA 3OY9A 2HHSA 1RBUA 1YT3A 1J54A 4DR2K 5AQPA 5AFUH 1TK5A 1JLBA 3I0SA 3WQTA 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3LAKA 4CZFA 4KTWA 1DGKN 3L3UA 3ATUA 3O80A 4EHTA 2QWOA 3DWLA 3NCIA 1OVQA 2GELA 2EX3A 1MU2A 3OA9A 2Q31A 3T7ZA 1BI4A 4OPKA 4FLYA 1MWMA 1RTIA 4EAHD 5DM6L 4BEBA 1OH8A 4LF4K 1I6GA 1KTQA 1RT4A 1WSGA 3OVNA 5EOYA 4B9TA 2GEMA 4DQIA 1VSFA 2UXDK 4GNIA 2N2RA 3AVAA 1FH3A 3DXMA 4CHQA 2GV9A 3CJ1A 3MXJA 3F73A 3SI6A 2V52B 4DV5K 2LKBA 1C56A 2RN2A 4CZIA 2OPQA 2PYJA 2HBKA 3CCSN 4DTOA 1J53A 3LDNA 1B9DA 4B3SK 1YXQA 3S3OA 5FRNA 5BPMA 5M1OA 4BR5A 1VSEA 3HL8A 3T69A 2NZTA 4IOAL 1JLAA 4WQ5A 3UKRB 4LF5K 3MCAB 1E3MA 3E66A 4BECA 5KGXA 3D2FB 3CJAA 3RWUA 3R2VA 3TSPA 1GLJO 1V4TA 1U2VA 2DY4A 3VETA 2H3GX 4HCCA 3V9ZA 3KVGA 4OGCA 1KFSA 1DKGD 3C94A 1BG3A 5DK5A 2MZ0A 1UA1A 1K8AO 1R59O 5CYQA 1S6QA 2GWKA 2Z1IA 2LSNA 3VF2A 3QBWA 4DR7K 2BRZA 2QKKA 4DCHA 4KRFA 3F9KA 5AQMA 3ZCMA 3B6PA 4CJUA 2X6SA 2YHAA 3O6WA 4A5BA 3ZX0A 4A5AA 1FKPA 1OH7A 3VEYA 1RDDA 2HMIA 1C1BA 4V19S 1VQNN 1JKHA 4CD3A 4QOZB 1TKTA 3M8RA 3TWHA 1NK9A 5BR8K 5LJWA 2ZJRL 3QEPA 4FWLA 4F2SA 4C8MA 1XMOK 1NM1A 3V1QA 2ITMA 4W5TA 1NGJA 4F2RA 2DFHA 4BE2A 4FO0A 3VESA 4EZ9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4AHC A;  3DI6 A;  4NYN A;  1Y64 A;  1QQM A;  1JCF A;  3SV3 A;  4DB3 A;  4KHN A;  1ZXO A;  2WFB A;  1WSI A;  4FWK A;  3VEZ A;  3ZSV A;  4WFA L;  4A2A A;  5E26 A;  4FJ9 A;  4NXM K;  1HMV A;  5JLF A;  2Y1I A;  1NNE A;  4CJ4 A;  3QIO A;  2NRZ A;  4W5O A;  1Q9Y A;  1VSJ A;  3KWI A;  4LSN A;  5SWM A;  2PZS A;  4JHD B;  2VGM A;  2YKN A;  4CZE A;  4E1M A;  5KTQ A;  3CJ7 A;  3OJS A;  4RW7 A;  4CK1 A;  1QHA A;  3SF4 D;  4A2B A;  4AAZ A;  1OVY A;  2FBV A;  3CQ8 A;  4C8O A;  3VGK A;  2FF6 A;  3HPG A;  5ADX H;  4GW6 A;  1W7A A;  5AQS A;  3OW2 M;  4BR9 A;  3P38 A;  1OMY A;  3VTH A;  4KB1 A;  3K59 A;  5CYM A;  2E6M A;  4Z4H A;  1WWN A;  4FW1 A;  4DR5 K;  3OYD A;  4CEQ A;  4G1Q A;  5BRF A;  5M1K A;  4PL8 A;  1LWF A;  4CGF A;  4NXN K;  4BE7 B;  1IBM K;  4BC5 A;  3SUO A;  2W42 A;  4F9O A;  5C15 A;  1VSH A;  4LF6 K;  3FZF A;  1BA1 A;  1ICA A;  4CZG A;  5KPT A;  4CJV A;  3KOZ A;  1D8Y A;  1CXU A;  1BGX T;  2FBX A;  4KHW A;  4ZTF A;  1U6Z A;  3BY5 A;  3R3L A;  4FW2 A;  1IBL K;  4W5R A;  4DQQ A;  4J2A A;  1BHL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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