3LDQA

Crystal structure of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitor
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldqA04
1NGAA 4CD3A 4CZFA 2IIRA 5AQFA 4CZHA 1GLAG 3VEYA 2J4RA 4EFHA 3UKRB 3A5MC 2CH6A 2IVOA 4QS8A 3ZEUA 1NWKA 3MN7A 4CI6A 2NRHA 3O5BA 4PKHA 5AFUH 2QW9A 5AQTA 3LM2A 3LDPA 4A61A 2FXUA 4CZGA 3ATVA 3AY9A 1QZ5A 2IVPA 2P9KB 1QZ6A 2P9NA 1HUXA 3BEXA 3VGMA 3TPQA 3SK3A 2ITMA 3MK6A 4MO5A 2P9UB 2IVNA 3JS6A 5F0XA 4FWPA 4IO8A 3H3OB 3R8EA 3ZETA 3CETA 3QFUA 2YJFA 4GY2B 4BC2A 5F1XA 2D0OA 3O1WA 3VENA 2E1YA 1KXPA 3VETA 3DAWA 4CBXA 2HOEA 3P4IA 2ASMA 1NGIA 3FE1A 2Q0RA 3HZ6A 5JLFA 1MA9B 5AQHA 3O8MA 1JCGA 2QWLA 4CBWA 4B1YB 3VOVA 3CQXA 2YJEA 4AM6A 4K25A 2P9LA 3MMVA 2EWSA 3CERA 3GBTA 5AZIA 1ATNA 3VF2A 5E84A 3D2FB 1H1VA 4WQ5C 3CJBA 3I33A 1HLUA 4O5FA 3UKRA 4BVOA 3QDKA 1X3MA 3A0IX 1WUAA 1U6ZA 4BC3A 3HI0A 5AQJA 1ATSA 1T6DA 4ISEA 4BRHA 2P9KA 2QWRA 2ASOA 5AZJB 4BR4A 1G99A 4H0TB 2HF4A 4JD2A 3DWLA 3QICA 1J6ZA 1NGHA 2AP1A 2E2OA 1BDGA 3DXKA 1Z05A 4BG8A 1S3XA 1GLBG 3A5NC 1IJJA 3OHRA 5BRFA 1QHAA 4XH5A 1NGGA 4XEIA 4FPBA 1Q18A 2GUPA 4FOEA 4M63C 4BQZA 4JN4A 1C0GA 3QMLA 3A5LC 3C0BA 5EVZA 2QM1A 5EOYA 3M1FA 3MN6A 2OANA 1XQSC 2E1ZA 3WEEA 3WUHA 5B8HA 2CGKA 4PL8A 5JLHA 3DXMB 4EHTA 3VEOA 3W3DA 2FSKA 2A3ZA 3CI5A 2BUPA 4IXCA 3FLCO 3D2FA 4BR2A 4HTLA 2WUSA 3AARA 2A6AA 1E4GT 2AA4A 4CZIA 4DQ8A 4JAXA 2D0PA 4Y0WA 4B1VA 3O4WA 3WXLA 3WQTA 2Q31A 3VPZA 2KHOA 1GLCG 3A8YA 1NGDA 4BC4A 2YHWA 2FLOA 2ZF5O 4YDUA 3QB0A 4BRIA 3U9ZA 3QBWA 3FZKA 4F9OA 4H5TA 1QQMA 2Q1NA 4NB4A 3WXKA 3CJ1A 4BR5A 5BN8A 1YXQA 1HKBA 2GWKA 4JHDA 2QWOA 5F2RA 2CH5A 5BRDA 4B9QA 4H0VB 3J8AA 4NO7A 4QS7A 1JCEA 1X9JA 5KQ8A 2QWPA 4I6MB 3FR0A 4FWNA 4BRCA 2GTDA 4WQ4A 3U9DA 3U4LA 1U2VA 1NMDA 2FF3B 3LDNA 3BP8A 4IWVA 1SZ2A 3BF1A 4CZKA 3EZWA 3GDQA 4BQLA 3EO3A 2NZTA 2ZGZA 3W0LA 3GOIA 4BRDA 3H1QA 1EQYA 4H0OA 3CJ9A 4K41A 2HF3A 1TYQB 3O80A 4LC9B 2F9TA 4XH4A 3O08A 2I7NA 1NGEA 5BPLA 5BR9A 5ELZA 1ZBSA 2Q36A 3FGUA 5AR0A 1V4TA 4L3QA 1T44A 3I8BA 5AQYA 3ID8A 3LDQA 3L0QA 1RGIA 1K8KB 3AAPA 4MO4A 4RCHA 5AQRA 1GLEG 3D7EO 3O6WA 4ISFA 3A5OC 4H0PA 1YUWA 3MCPA 4FPAA 3KVGA 2VYPA 2ZGYA 4BR7A 2E20A 2YCHA 3EKSA 3FZLA 4CZJA 2V52B 4EIAA 5BPNA 2FSNA 1QQOA 5BREA 2W41A 3SMPA 4FWQA 3VF6A 5ADXA 4EAHD 1BU6O 2NLXA 4BC5A 3ZX0A 4BRGA 2A40A 3LL3A 5AQGA 5CE3A 1DKGD 5AQQA 5FPEA 4FWLA 2ASPA 3UKUB 2P9PB 3ULEB 3MN9A 2GWJA 4BR0A 3HBTA 5KPZA 3D2EB 4AM7A 4BG9A 4CZLA 4BGAA 1CZAN 3H45C 2P9UA 2P9IB 2E88A 1ATRA 3WXJA 3L6QA 5AQMA 5JICA 2UYTA 2D1KA 3WQUA 3KHYA 5BPMA 1BG3A 4K43A 1TYQA 1HJOA 3CJCA 4A2BA 3FZHA 5AQLA 2Q2RA 3EN9A 3SJHA 3ZEUB 5AQVA 1P8ZA 3MDQA 1NGJA 2PAVA 4M7XA 3VERA 4PKIA 3VEZA 1K8KA 1WOQA 5AQOA 1BO5O 3VEWA 5AQZA 1NGBA 1BOTO 1R59O 3BUZB 3G25A 3IMXA 3M3ZA 1TUUA 1GLFO 1GLLO 4WYBA 4E1JA 3C7NB 1ZC6A 2QWNA 4FWOA 1NM1A 4XH1A 3UB5A 2FSJA 4WQ5A 1MWMA 5FPDA 1HPMA 5AQXA 2F9WA 2DPNA 2HMPA 1X3NA 3O1BA 2E2QA 2P9PA 3VESA 5AZJA 5AQPA 1C0FA 4H5RA 3AAQA 3KZBA 1V4SA 2QWMA 3R9PA 1T6CA 2YHYA 3GG4A 2ZWHA 4K42A 4ISGA 3VEVA 1DGKN 5LJVA 3MN5A 5KPRA 2E8AA 1RDWX 5AQUA 1LOTB 4DHYA 5EY4A 5AQSA 3S41A 3TU5A 5E26A 5ADXH 3ATUA 1NGFA 3VEXA 2P9LB 5AQIA 3HTVA 3VF4A 4H0YB 4FL9A 2Q0UA 5AZIB 4CBUA 4FOIA 3VGLA 4GNIA 2P9SB 3L4IA 4IJAA 2V7ZA 3GL1A 4IJNA 3CIPA 2GELA 1NGCA 2E2NA 3FZFA 4H0XB 3HSCA 5EX5A 4H5VA 2V51B 1IG8A 1RFQA 3EL2A 3H46O 1ESVA 3DXMA 3LDLA 5AQKA 4BR9A 4CZEA 4PL7A 3WXIA 5LJWA 4JD2B 3C7NA 2A42A 5JMVA 4RWTA 3ENHA 1Z6RA 3B8AX 2CGJA 3DXKB 4FSVA 1HX1A 1DEJA 2A41A 3BF3A 3JXUA 2W40A 2GEMA 3CJAA 1BWFO 4MLEA 5I9EB 4A62A 5TKYA 5FPMA 3RSEB 3FZMA 1HKCA 3IDHA 3QBXA 3WT0A 5BRHA 2QWQA 4BRFA 5FPNA 3H3NO 5BN9A 4M7YA 4H5WA 1YVNA 4BRKA 3WEEB 4BRPA 1XUPO 4C23A 4BVPA 1YAGA 3U8XA 4DB3A 2CGLA 4B1XB 4I6MA 5KQDA 2PBDA 5AQWA 2YI1A 1QQNA 4PKGA 4JNEA 4BRQA 3CJ7A 3GE1A 2P9SA 2D4WA 5AFUA 2FF6A 3EKUA 2I7PA 2VCPA 1NBWA 5LY3A 1BA0A 3ENOA 4YDUC 4H03B 1S22A 1MDUB 3HM8A 4RTFD 1D4XA 2QXLA 1BUPA 1KAZA 4J8FA 5EXWA 3SLCA 2YHXA 1SAZA 2V7YA 1KAYA 1ZXOA 1Y64A 5KPTA 3ZX2A 3QFPA 2H3GX 3LM9A 4JHDB 1SQKA 4BGBA 1GLDG 1NLVA 4WQ4C 4Z94A 3DJCA 4BREA 1GLJO 3H1VX 2P9NB 4EHUA 3SMSA 4FWRA 3RSEA 4BRLA 4BRNA 3IFRA 1U2VB 3M6GA 1XC3A 4CJ7A 4B1ZA 1MWKA 4BRAA 1KAXA 4B1WB 4O8KA 4MLHA 1E4FT 3UE5A 1JCFA 4B1UB 3ZETB 4FWMA 5AQNA 1BA1A 1HKGA 2VWBA 4HWIA 3R6MA 4DCHA 3VGKA 3LDOA 4H5NA 3UKUA 4KBOA 3ULEA 4QS9A 4CD1A 4FWSA 3D2EA 4CZMA 3CQYA 4A2AA 4IZ9A 3CHWA 4FO0A 2A5XA 2Q97A 3IUCA 2BTFA 1OKJA 1LCUA 1TUYA 2P9IA 4BRMA 3H6EA 4FWKA 4BROA 2E2PA 3FFKB 3F9MA 3ZX3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HRGA 2OA8A 4CD3A 4JKAA 3SZ2A 4DFKA 1S9EA 4DQQA 3E01A 4FYDA 4NYNA 3E9OA 2CH6A 2IVOA 4QS8A 1ILYA 1NKEA 2NRHA 4KTQA 1JL2A 5FRNA 3LP2A 3LDPA 2OTJN 4CZGA 3ATVA 3TSPA 4F4KA 3F2KA 1HUXA 3C6HA 1D5AA 5HOOA 4DTSA 3K0SA 1C0MA 1W9HA 1J5OA 3HYFA 1YVUA 3KWIA 3AGRA 4O8UA 3BY5A 2P9UB 3JAMO 1VQ7N 3G10A 4FWPA 1VSMA 2YJFA 2IC3A 3IS9A 4CBXA 1TL3A 2HOEA 4M3XA 2ASMA 1RTDA 4LY7A 2Q0RA 4B8AB 3HZ6A 2EHGA 5AQHA 1EKEA 1UAXA 4DSKA 2E3FA 2YJEA 1EO1A 3CMAN 4CHNA 3CERA 1TKZA 3D2FB 1IO2A 1VQLN 2HHHK 3V81A 1HLUA 4O5FA 3UKRA 4DTPA 2F96A 3S3NA 2OZMA 3THXA 3OYGA 1SV5A 2OCEA 4ISEA 1JZAA 2Y1JA 4B9MA 5AZJB 1YJWN 4LF9K 3NDKA 4GKJK 4JD2A 3DWLA 2D5RA 2BGGA 3VQQA 4F2SA 3QICA 1J6ZA 3C6TA 2HNYA 1JXEA 5C15A 3DXKA 1ZBUA 4BG8A 1LWFA 1S3XA 2W6KA 5C2DA 5JENA 4KHPK 3OHRA 4B9LA 3BZCA 4CJPA 4FPBA 1ZBIA 4FOEA 3O9UA 2KSKA 4M63C 4BQZA 4CJ5A 3L2RA 4B3SK 3VQCA 3C0BA 4KH6A 4X65K 5EOYA 4IG0A 4B9UA 2MZ0A 2RKIA 2WFBA 4JKDA 5KGXA 3OS2A 4YOUA 3VEOA 3W3DA 2FSKA 3CCUN 4IXCA 2BUPA 4HTLA 2WUSA 5CY0A 3AARA 4KO0A 3THWB 1X1PA 3NF8A 2AA4A 4B9TA 3L2UA 4DSJA 2UUAK 4CF8A 4DS5A 3WXLA 2Q31A 4HTUA 3A8YA 4JI0K 1NGDA 4BC4A 4BDYA 1TVRA 3SBTA 3J7ZO 4F2RA 3U9ZA 3FZKA 2Q1NA 3WXKA 3CC2N 1YXQA 4B9NA 1RT7A 4CGHA 5F2RA 2CH5A 1NK0A 5I3UA 5BRDA 1T03A 4B9QA 1PE4A 3J8AA 4NO7A 4QS7A 4N41A 2QWPA 1FH3A 3ASMA 2GX9A 4N47A 4BRCA 4M3TA 2GTDA 3L3VA 1Z25A 4HUEA 1GOBA 2QXFA 2YHAA 1X9WA 3QEVA 2B68A 4A5AA 1C6VA 1VQNN 4DFMA 4DR4K 4BQLA 3NF6A 4I7FA 3W0LA 3GOIA 4BRDA 4CF0A 4X64K 4CGIA 4Z4FA 4DR6K 3E66A 4FJIA 4CFDA 1NE5A 4LC9B 4XH4A 3SAHA 3TSQA 1M90O 1IG9A 4M3ZA 2O8DA 4JK8A 2DFFA 4FZYA 1RDDA 3PLAA 3CC7N 1HYVA 4L3QA 3RMBA 3V9ZA 1T44A 4N76A 3E7RL 3L0QA 1SNBA 1RGIA 3AAPA 2X78A 4I2PA 2W6LA 3D7EO 2G8VA 3HPHA 3OYNA 1VQ5N 3A5OC 1ZBHA 4FJNA 4FPAA 2UU9K 3EKSA 4W5NA 3CMEN 4FJJA 5BPNA 2W41A 2OPQA 4PY5A 2NLXA 1A5XA 1S1VA 3P5JA 4BRGA 3AO3A 5AQGA 4JI1K 3ZSRA 4FWLA 2ASPA 4LFAK 2GWJA 3E9LA 3TARA 4FLYA 1XMQK 3KOWA 1CXQA 1NOYA 3UIQA 2P9UA 1HJRA 3ULDA 1ATRA 4PA1A 4IO9L 5AQMA 5JICA 2D1KA 4IFVA 4ILHA 2OZSA 4F8RA 2YKNA 3TTDA 1JL1A 1BG3A 4EP5A 3MEEA 5SWMA 2ATQA 4LSLA 4MDBA 1KVCA 4A2BA 3PIOL 3HP9A 4FK2A 5HBMA 4M41A 2N66A 3SJHA 5K14A 3ZEUB 2A7TA 4E0DA 4M7XA 4LF4K 5C25A 1WOQA 2O8CA 5AQZA 2E2FA 4BE0A 2HHQA 1BOTO 1LW0A 3T3FA 1JLQA 4JEPA 1FKPA 4HHTA 1DTQA 4E1JA 3O3GA 1TK5A 3C6UA 2QWNA 4CFBA 3QEXA 3QNOA 1MWMA 3OS1A 4CGGA 2UXCK 2E6LA 2F4VK 2WC9A 2DPNA 4CHZA 1JZBA 2E2QA 5AZJA 4CCHA 4H5RA 4CIGA 3R9PA 1M1KO 3AVKA 3SAGA 2ZWHA 1ZYWA 1VQMN 2X6SA 4ISGA 3VEVA 1NRBA 1DGKN 4IEIA 5LJVA 3KK2A 4KB1A 4LSNA 5AQUA 1LOTB 2E6MA 3HP6A 3S41A 1UA0A 3VEXA 3KLEA 1S1WA 5AQIA 3HL8A 1XRSB 4FL9A 3K5OA 4CBUA 3TABA 4DV6K 1BI4A 3L2VA 4EZ9A 4KV8A 2P9SB 4IJAA 1CXUA 2NRXA 4PQUA 4RG8A 4AHTA 1HR0K 3OYLA 3FZFA 4H0XB 2O8FA 1XMOK 3MWTA 3H46O 4RW7A 3QNNA 4CEZA 4X66K 4GV3A 1Y97A 2DFHA 3C7NA 1JKZA 1O1WA 2A42A 3KK7A 4NCGA 3KLFA 2O8EB 3AA5X 2KBHA 2CGJA 1NH5A 2W40A 3G71N 2GEMA 1JXBA 2NNWA 1NOZA 2UXDK 1PX9A 4MLEA 2LT8A 3PX6A 3NF7A 3TSUA 3RMDA 4Z0UA 1C56A 5T7BA 3K9JA 2E4LA 3SV4A 5TKYA 2HVIA 3RSEB 2HHSA 4WFNL 2R7YA 3CCVN 4L8RB 4JI6K 3JYTA 1FKOA 1EX4A 5BN9A 4H5WA 1YVNA 4BRKA 1GOAA 1ZFUA 2YC1C 1YAGA 3SF4D 4Y1DA 4DB3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HRG A;  2OA8 A;  4CD3 A;  4JKA A;  3SZ2 A;  4DFK A;  1S9E A;  4DQQ A;  3E01 A;  4FYD A;  4NYN A;  3E9O A;  2CH6 A;  2IVO A;  4QS8 A;  1ILY A;  1NKE A;  2NRH A;  4KTQ A;  1JL2 A;  5FRN A;  3LP2 A;  3LDP A;  2OTJ N;  4CZG A;  3ATV A;  3TSP A;  4F4K A;  3F2K A;  1HUX A;  3C6H A;  1D5A A;  5HOO A;  4DTS A;  3K0S A;  1C0M A;  1W9H A;  1J5O A;  3HYF A;  1YVU A;  3KWI A;  3AGR A;  4O8U A;  3BY5 A;  2P9U B;  3JAM O;  1VQ7 N;  3G10 A;  4FWP A;  1VSM A;  2YJF A;  2IC3 A;  3IS9 A;  4CBX A;  1TL3 A;  2HOE A;  4M3X A;  2ASM A;  1RTD A;  4LY7 A;  2Q0R A;  4B8A B;  3HZ6 A;  2EHG A;  5AQH A;  1EKE A;  1UAX A;  4DSK A;  2E3F A;  2YJE A;  1EO1 A;  3CMA N;  4CHN A;  3CER A;  1TKZ A;  3D2F B;  1IO2 A;  1VQL N;  2HHH K;  3V81 A;  1HLU A;  4O5F A;  3UKR A;  4DTP A;  2F96 A;  3S3N A;  2OZM A;  3THX A;  3OYG A;  1SV5 A;  2OCE A;  4ISE A;  1JZA A;  2Y1J A;  4B9M A;  5AZJ B;  1YJW N;  4LF9 K;  3NDK A;  4GKJ K;  4JD2 A;  3DWL A;  2D5R A;  2BGG A;  3VQQ A;  4F2S A;  3QIC A;  1J6Z A;  3C6T A;  2HNY A;  1JXE A;  5C15 A; 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