3LDQA

Crystal structure of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitor
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
b'PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 121
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldqA04
1LOTB 5AFUA 2QXLA 1NGCA 3DWLA 1Y64A 2A40A 1XQSC 1QQNA 2P9SB 3D7EO 4EIAA 3C0BA 4YDUC 4BRMA 3W0LA 1S22A 4H0VB 1BG3A 5AQTA 2Q36A 4DB3A 4BRNA 5AFUH 5FPMA 2YJEA 3C7NB 4FWQA 4M7YA 1BO5O 1QQMA 2H3GX 5AQLA 4FWMA 4CZEA 5AQWA 2P9LA 3A0IX 1MA9B 5JICA 3H1VX 3ENHA 3H3NO 2D4WA 5AZIA 3FLCO 3UKRA 3CHWA 2OANA 3FGUA 4L3QA 3VEWA 2P9NB 3VENA 4LC9B 2GUPA 5BPLA 1GLBG 3VPZA 4B9QA 3MN5A 5FPNA 3UE5A 5BRDA 4H5TA 1GLCG 4FWPA 3JS6A 3VGMA 2QWRA 4I6MB 4IWVA 3L0QA 4K42A 1X3NA 3O8MA 1R59O 2IVNA 3CJ7A 1KAZA 1NGDA 4IZ9A 3WT0A 4BREA 2DPNA 2CGLA 1GLDG 1XUPO 3CJ1A 4BRHA 2HOEA 5AQZA 2W41A 4BRDA 2ASPA 4H0TB 3O4WA 3D2FA 2P9UB 1LCUA 3LDOA 2GWKA 3H1QA 4EFHA 2FXUA 5AQGA 3CQYA 4IXCA 1YAGA 2GELA 4M63C 4H5VA 1KAXA 5AQJA 3ID8A 4QS9A 2A42A 4QS7A 3EL2A 1OKJA 2Q31A 3M1FA 3O5BA 4E1JA 2BUPA 1HKGA 3DXMB 3D2EA 3GE1A 3HI0A 2Q97A 5KPZA 2PBDA 3HSCA 3LM2A 3G25A 2BTFA 2NZTA 3QMLA 3GL1A 3FR0A 3H46O 3FZLA 3DXKA 3KVGA 1U2VA 1QQOA 3LDNA 4XEIA 4O5FA 2GWJA 2QWQA 4PKHA 3VERA 5AZJB 3HBTA 3WXJA 4CZMA 3LDQA 3VEZA 1Q18A 4BRGA 3CQXA 1BU6O 5AQNA 3TU5A 5BREA 2P9SA 3O80A 1NGJA 4CZJA 4BQLA 3ULEB 5BPMA 1HLUA 4MO4A 4FWKA 4QS8A 3FZHA 4BRFA 2HMPA 2F9TA 3C7NA 3A5NC 3W3DA 2E88A 2A41A 1YUWA 3FE1A 2D0PA 2FLOA 3ZX2A 5ADXH 5AQVA 4BRAA 2A5XA 3M3ZA 1C0GA 2ZWHA 1RGIA 3UKUB 3WUHA 3P4IA 4CZFA 1ZBSA 4XH4A 5EVZA 3U9ZA 2P9NA 1GLFO 1CZAN 4RTFD 1Z05A 4FOEA 1RDWX 3ZX0A 3AAPA 4BG9A 3CERA 3ZETB 1NMDA 2V7YA 3QFPA 4I6MA 1QZ6A 5BPNA 1NGFA 2CH6A 4FSVA 1BDGA 4CZIA 1NGBA 5AQIA 5AQUA 3ZEUB 1NGEA 3IMXA 3DAWA 4BQZA 3BUZB 5BRFA 1H1VA 1X3MA 4CD3A 3ATUA 3KHYA 2HF3A 1JCEA 1HKBA 2HF4A 2P9UA 2FF6A 1JCFA 2Q1NA 2GTDA 2VYPA 4MO5A 5E84A 3A5LC 3UB5A 4A62A 1V4TA 3MN6A 5EX5A 3GOIA 5F1XA 4K25A 5AQSA 3R9PA 4A61A 3LM9A 5AQXA 3DXMA 4B1VA 4CBUA 2ITMA 2V52B 4BC4A 3WXLA 1D4XA 3VESA 3QFUA 1RFQA 3AY9A 1K8KB 2E1ZA 2EWSA 2QWMA 3JXUA 2E2NA 2GEMA 3AARA 4WQ4A 3MK6A 3S41A 1J6ZA 1TUYA 4FPAA 4JAXA 1HX1A 2QW9A 1QZ5A 1BA0A 5FPEA 2E8AA 4AM7A 2YI1A 1YXQA 2P9KB 2V7ZA 4BR7A 5AQRA 5AZJA 1ZXOA 2A3ZA 3CJ9A 2FSNA 1T6DA 3BF1A 4JHDB 1NLVA 2A6AA 4H5WA 3GBTA 3ULEA 4WQ5A 1TUUA 2E20A 3BF3A 4EAHD 2YHXA 1P8ZA 2Q2RA 2ZGZA 4BR5A 1NGIA 4Y0WA 4CZLA 1E4FT 5ELZA 4ISEA 3LDLA 5I9EB 1ZC6A 5BN9A 2QWNA 4B1ZA 4JNEA 5AQPA 1BUPA 2NLXA 4K43A 4BVOA 1SAZA 1JCGA 3VETA 2IVOA 3UKUA 4BR9A 4BRPA 2QM1A 3CETA 5AQFA 3VEYA 5AQHA 3O1WA 1V4SA 5EXWA 1E4GT 3SK3A 4BRIA 1EQYA 3ZETA 5EY4A 1GLJO 3QBWA 1TYQB 3WXKA 3KZBA 4H0OA 4BR2A 2ASOA 1QHAA 3FZKA 4A2AA 3QBXA 3ZEUA 3ENOA 1BOTO 4H5RA 4BGBA 3O6WA 4WQ4C 5KQ8A 3OHRA 3WQUA 3WQTA 4CZHA 5BRHA 3VEVA 1NGGA 4BVPA 4EHUA 2QWPA 3VEXA 4BG8A 5AQMA 4BROA 4FPBA 1Z6RA 4GY2B 3TPQA 1BA1A 3VF2A 4H0PA 2YCHA 2VWBA 2J4RA 4FWRA 4DCHA 4JD2B 2AA4A 4DQ8A 3R8EA 5AQOA 1T6CA 4ISGA 2D1KA 2I7PA 3D2FB 1ATRA 3BP8A 4PL7A 4WQ5C 3U8XA 3H45C 3MMVA 1K8KA 2W40A 1XC3A 3DJCA 2P9PB 4B1YB 3LL3A 2ZF5O 1G99A 3HTVA 2D0OA 1MDUB 4PKGA 4KBOA 5FPDA 2CGJA 2P9KA 4JN4A 4K41A 3QDKA 3MN9A 1HJOA 3U4LA 4BR4A 4WYBA 3R6MA 1NM1A 5JLFA 3ATVA 5JMVA 1DEJA 2E1YA 4B1UB 1DGKN 4JHDA 2QWLA 1ATSA 3RSEB 5KPTA 2ZGYA 4MLEA 4DHYA 4F9OA 3VEOA 1HKCA 4MLHA 4BC2A 4B1XB 1KAYA 5AQKA 4O8KA 3VGLA 4CBWA 5AQQA 3CI5A 4CZGA 3EN9A 3LDPA 3F9MA 1GLEG 3SLCA 3GDQA 5AR0A 4CJ7A 4IJAA 4XH1A 1MWKA 4NO7A 3H6EA 3O1BA 1HPMA 1SQKA 2CGKA 3VOVA 3J8AA 1HUXA 4BGAA 3SJHA 2FSKA 2WUSA 3WXIA 5B8HA 3EZWA 1NGHA 4FWLA 4GNIA 4PKIA 3WEEB 1TYQA 3MCPA 3VF4A 2ASMA 4A2BA 4XH5A 4FO0A 1KXPA 2P9IB 4H0YB 4EHTA 4FWNA 3BEXA 4CBXA 1NGAA 5LJWA 3SMSA 4AM6A 4BRQA 1NWKA 1WOQA 2UYTA 2E2PA 1GLAG 3AAQA 4CZKA 4FL9A 4BC3A 2CH5A 3IDHA 3FFKB 1GLLO 3EKSA 5KPRA 2AP1A 1DKGD 2FSJA 4JD2A 3I33A 1T44A 2YHYA 5BR9A 4HWIA 4FWOA 4BC5A 1NBWA 5AQYA 2FF3B 5F0XA 1YVNA 4M7XA 2P9PA 2P9LB 3FZMA 3VF6A 5LY3A 1X9JA 3SMPA 3QICA 2IVPA 1IJJA 2VCPA 1MWMA 4RCHA 3VGKA 4BRLA 5AZIB 1IG8A 3UKRB 2IIRA 3CJAA 4BRCA 2V51B 3A5MC 3CJBA 3MN7A 3EKUA 3EO3A 4HTLA 4YDUA 3IUCA 1U6ZA 1WUAA 2Q0RA 4H0XB 4C23A 4PL8A 2QWOA 5EOYA 2YJFA 5KQDA 3RSEA 2YHWA 2I7NA 3CJCA 3L6QA 4BRKA 4H5NA 1S3XA 4FWSA 1ATNA 2E2QA 4B1WB 5CE3A 2Q0UA 1C0FA 3A8YA 3I8BA 4NB4A 5ADXA 4H03B 3ZX3A 5LJVA 4FOIA 5BN8A 3B8AX 2E2OA 2PAVA 3MDQA 5TKYA 4BR0A 3U9DA 3L4IA 1BWFO 3HM8A 4Z94A 3M6GA 3GG4A 3O08A 3QB0A 1ESVA 3D2EB 2KHOA 5E26A 4RWTA 4J8FA 5JLHA 4IO8A 4ISFA 4IJNA 3FZFA 1SZ2A 3A5OC 3CIPA 4CD1A 3WEEA 2NRHA 4CI6A 3DXKB 1U2VB 3HZ6A 3IFRA 5F2RA 2F9WA 2P9IA 3H3OB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HR0K 3OVNA 3MWPA 3DOKA 3NAEA 1FKOA 5MLCQ 1LAVA 1S1XA 3B6OA 3SQ4A 3W0LA 3Q7CA 4ID5A 5GAGP 2Z1GA 4H0VB 1BG3A 3JSMA 2BANA 4JKDA 3SCXA 4BRNA 1K8BA 3C7NB 4DSLA 3DLRA 3JAMO 4CZEA 3KLIA 5JVGL 2O8CA 1FXXA 3MX2A 1HJRA 4M3UA 2D4WA 3VTHA 2PYLA 3VQ7A 4FJ8A 1RCHA 3FLCO 4CJLA 3RMCA 2OANA 1SN1A 4LC9B 4AHCA 4FZZA 1LQQA 5FPNA 4H5TA 1HNVA 2QK9A 1RBTA 2YEOA 1HQUA 1X3NA 4K42A 3LZIA 3O8MA 1TK5A 4QAGA 2JWLA 1G15A 3CJ7A 4ICLA 1NGDA 1OH5A 4GKJK 4CFAA 3VQEA 1KLNA 1W0HA 4ZHRA 5AQZA 2W41A 4CJQA 2PFUA 4BRDA 3SNNA 3H1QA 2FXUA 2FBYA 3RTVA 3KTQA 2GELA 4B3OA 2HNZA 1KAXA 2MZ0A 4E7KA 4QS9A 1Z26A 3EL2A 3L3VA 1ZUTA 1BK8A 4CJEA 3O5BA 3C6UA 3KC6A 3TI0A 3AVLA 1NU0A 3HI0A 3V9UA 3CFPA 1A5WA 2PBDA 4Q5VA 3G25A 4B9VA 3HYFA 1T7AA 3L4QA 3H46O 3KVGA 1ICAA 2N2RA 1RTDA 1QQOA 3PO4A 1QSSA 3M8RA 4XEIA 5E41A 3E9OA 2GWJA 4DSFA 4CZMA 2GBZA 4ID1A 3WXJA 4OLAA 4BRGA 3SV4A 1S72N 1HMVA 3D45A 3ZT4A 4AB0A 1T0ZA 1QTMA 5FRNA 3LP2A 1WSIA 2HHTA 1I3AA 2HBJA 3V9SA 3DM2A 1NK5A 2E88A 1YUWA 4KHNA 3FE1A 3KOZA 4TSXA 2FLOA 4C8NA 3ZX2A 5AQVA 4KV8A 4Z0UA 3M3ZA 1C0GA 1VQ6N 3UKUB 3C6AA 5HRSA 4E7HA 1IKYA 2P9NA 4JI4K 1Z05A 4FW1A 3NCIA 3CERA 2B5JA 1KV0A 3ZETB 4M3WA 4I6MA 3QFPA 1QZ6A 4JS4A 3MEEA 3T1HK 5BPNA 1NGFA 2CH6A 3CMAN 3V9XA 2YIOA 4FSVA 2RE2A 4CZIA 4NLCA 5AQIA 1NGEA 3DAWA 3RR7A 4CD3A 1ILYA 1JCEA 4EZ6A 2FF6A 4CHNA 3ZSYA 2P5GA 3UB5A 4W5TA 2HB5A 2OA8A 1CLQA 3KJVA 3SF4D 5EU7A 4DSEA 4A61A 4KI6A 3DXMA 4CBUA 4IEEA 4BC4A 1RT4A 3V81A 4HCBA 1B7DA 1VQNN 1U48A 1NJIO 2EWSA 4M3RA 2GEMA 4WQ4A 3WNFA 4HVJA 1HPZA 4Z4HA 3OBWA 2O8EB 3NBPA 3DLHA 1QZ5A 2LY5A 2E8AA 4CEOA 3LP3A 1YXQA 2LT8A 1TVRA 4QCLA 3K2PA 5IT9O 4DTXA 4DLGA 1YI2N 1RBRA 3CJ9A 4IOAL 3QESA 2A6AA 4H5WA 1KC8O 4DSKA 4KAZA 2YHXA 1T05A 2Q2RA 2ZGZA 3KWGA 3DYAA 4Y0WA 5C15A 1QSYA 1I2UA 4PWDA 3U3GA 5I9EB 4FJ7A 2LN8A 3P39A 4B1ZA 5AQPA 4BVOA 2KBKA 1VNBA 3SZ2A 1L3TA 3THWB 2IVOA 4UY8O 4BR9A 1NJZA 4ILJA 1JXBA 1REVA 3VEYA 3K5NA 1E4GT 1K73O 3SK3A 3NE6A 3DLGA 4JK9A 1NOZA 4DV5K 1EQYA 1GOBA 4Y1CA 4B8AB 3AVIA 3QBWA 4FJKA 3NHGA 3EY1A 2HSTA 3KZBA 4H0OA 2OTJN 1EWRA 4C8MA 3OTOK 3MWTA 1NK9A 4UJ0A 2ZJRL 3AO2A 3ENOA 1BOTO 4H5RA 4BGBA 4WQ4C 2QKBA 3S3OA 4DQSA 1CZ9A 3ITHA 4KHPK 2QWPA 3VEXA 4BG8A 4RW8A 4BROA 3THXB 2DFHA 3AVNA 4GY2B 1X1PA 3TANA 3PSIA 5GIOA 4DCHA 3NF8A 4JD2B 4DQ8A 3VTIA 3R8EA 5JENA 3ASMA 3BP8A 3AO4A 3ZSOA 3OJUA 1LV5A 3H45C 3MMVA 3PY8A 1WNSA 4O55A 1VSJA 3SUQA 3TSUA 4LY7A 1NK8A 4FJ9A 2E6LA 1G99A 4JKFA 1SKSA 2D0OA 2KKZA 2KTQA 1MDUB 1ZFUA 5FPDA 4LF9K 4LSNA 3QEIA 5JS1A 4K41A 3J81O 4F2SA 4LF7K 3R6MA 3OYKA 5HOOA 3KOYA 4CW7B 1TK0A 2B68A 4U7BA 4G1QA 3K59A 4DHYA 5C2DA 3J80O 4FLUA 4CEFA 4MLHA 4X66K 1M90O 3PX0A 3THYB 3KK3A 3VGLA 1T7PA 2PY5A 2P51A 4CK2A 3SLCA 4DV2K 4JKEA 4NO7A 3H6EA 1HPMA 1WSJA 4H4OA 4DWIA 4RW4A 3K9KA 1W7AA 1JLQA 4OO1J 4OLBA 2JGUA 1VQPN 3F5TA 2FSKA 4FLTA 3WXIA 4Z4CA 3DRPA 4PKIA 1TYQA 1YIJN 2WBNA 1T8EA 2F96A 4A2BA 4DTNA 2VWJA 1AYJA 1KXPA 4R79A 4JI8K 2B4JA 4DTRA 3KLGA 3AVMA 2DFFA 3K5LA 1IG9A 3AAQA 3IG1A 1JZBA 4FL9A 4QOZB 2F8SA 3FFKB 1MYNA 1YTUA 4B9UA 1BRZA 1I39A 4I2PA 5SZTA 3N4PA 5BR9A 1NPIA 2FBVA 3DOLA 2OZMA 3MECA 4M7XA 3FZMA 2G8UA 3A2FA 3SMPA 1IJJA 1KVCA 4RCHA 4BRLA 1CXUA 1D5AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HR0 K;  3OVN A;  3MWP A;  3DOK A;  3NAE A;  1FKO A;  5MLC Q;  1LAV A;  1S1X A;  3B6O A;  3SQ4 A;  3W0L A;  3Q7C A;  4ID5 A;  5GAG P;  2Z1G A;  4H0V B;  1BG3 A;  3JSM A;  2BAN A;  4JKD A;  3SCX A;  4BRN A;  1K8B A;  3C7N B;  4DSL A;  3DLR A;  3JAM O;  4CZE A;  3KLI A;  5JVG L;  2O8C A;  1FXX A;  3MX2 A;  1HJR A;  4M3U A;  2D4W A;  3VTH A;  2PYL A;  3VQ7 A;  4FJ8 A;  1RCH A;  3FLC O;  4CJL A;  3RMC A;  2OAN A;  1SN1 A;  4LC9 B;  4AHC A;  4FZZ A;  1LQQ A;  5FPN A;  4H5T A;  1HNV A;  2QK9 A;  1RBT A;  2YEO A;  1HQU A;  1X3N A;  4K42 A;  3LZI A;  3O8M A;  1TK5 A;  4QAG A;  2JWL A;  1G15 A;  3CJ7 A;  4ICL A;  1NGD A;  1OH5 A;  4GKJ K;  4CFA A;  3VQE A;  1KLN A;  1W0H A;  4ZHR A;  5AQZ A;  2W41 A;  4CJQ A;  2PFU A;  4BRD A;  3SNN A;  3H1Q A;  2FXU A;  2FBY A;  3RTV A;  3KTQ A;  2GEL A;  4B3O A;  2HNZ A;  1KAX A;  2MZ0 A;  4E7K A;  4QS9 A;  1Z26 A;  3EL2 A;  3L3V A;  1ZUT A;  1BK8 A;  4CJE A;  3O5B A;  3C6U A;  3KC6 A;  3TI0 A;  3AVL A;  1NU0 A;  3HI0 A;  3V9U A;  3CFP A;  1A5W A;  2PBD A;  4Q5V A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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