3CCVN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2616a
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccvN00
3CMAN 5GADP 3OW2M 3PIOL 1VQPN 1K9MO 2ZJQL 4WFNL 1YJWN 1QVFM 3J7ZO 1Q81O 1VQMN 3CD6N 5DM6L 3G4SN 2OTJN 4IOCL 3CCEN 1JJ2M 5GAEP 3I55N 1ILYA 1YHQN 2ZJRL 3G6EN 3CCQN 1YIJN 3CCRN 1S72N 4IO9L 1VQ6N 3CF5L 1NJIO 3CPWM 1QVGM 3CC2N 3CCSN 1Q82O 5MLCQ 3I56N 1W2BM 1VQ8N 3CCLN 3PIPL 3G71N 1VQ7N 2ZJPL 5JVHL 1N8RO 2QA4N 3CC4N 1KQSM 5DM7L 1VQ5N 5GAHP 1YI2N 1YITN 3CC7N 1YJ9N 1M1KO 5H1SQ 1VQ9N 3CCMN 1OVYA 3CMEN 5HL7L 4WF9L 4WFAL 1M90O 3DLLL 4U67L 3CCUN 1VQKN 5GAGP 1Q86O 4WFBL 4IOAL 3CXCM 1KD1O 1KC8O 1K8AO 2QEXN 5JVGL 1YJNN 1VQ4N 1VQON 1Q7YO 3CCJN 3CCVN 1VQLN 2OTLN 4WCEL 1K73O 4UY8O 1VQNN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SK3A 1ATRA 3H46O 3K5NA 3M5RA 4DQRA 3L8BA 3V81A 3T1AA 5GIPA 1TAQA 1RT7A 3DJCA 4M63C 2FXUA 3R6MA 5AQFA 1N34K 3P5JA 2QWMA 4E1NA 3CFOA 2D0OA 1OKJA 3CM6A 4ID5A 1SL2A 1B9DA 5C0YA 3LPTA 5C2FA 5AQLA 2KHOA 4LSNA 4BWMA 2ZJRL 1HKBA 1BIZA 4LH5A 1VSEA 4OPAA 4JK9A 3LP1A 1RDBA 1QSLA 2Q3SA 1X9MA 3ID8A 3ZSOA 4LF4K 3VQ5A 2BE2A 4DQQA 3FZMA 4H0OA 4FXDA 3KWIA 1NJIO 3WQTA 3G10A 4BRLA 3KTQA 2Z1IA 3MXJA 1OH6A 4DR6K 1T7PA 4O8UA 2PY5A 4BRFA 1NKEA 4B1YB 3QO9A 3VF2A 1C1BA 3UKUB 3T1HK 3VOVA 2PYLA 3RRHA 4IO8A 2F4VK 1W2BM 3CCLN 2O8DB 1TL3A 4M3UA 4YOWA 5FROA 3LZIA 4CEQA 1TKDA 2PBDA 4DV5K 4H0PA 3CJ7A 2GWJA 1A5XA 3ATUA 1J5EK 1S1TA 4CEFA 4DHYA 4FK0A 2JLEA 2BDPA 4I2PA 1RBRA 2GEMA 3OVNA 1XHZA 1VRTA 5JMVA 4JS4A 5AQPA 3NCIA 1U48A 3SI6A 4U67L 2VG5A 1VQKN 2E2OA 2Q1NA 4OPHA 4ZTFA 3ZSWA 4PKHA 4CJLA 5KRTA 2XHBA 4FJ5A 4FZXC 3L6QA 4DUZK 3HPHA 2HHQA 3HXMA 5FRMA 4B1UB 3R8EA 1T03A 1P90A 4B9TA 3WT0A 1RDUA 2XY5A 4DFPA 4GV6A 5LY3A 3WXKA 1VQNN 3HT3A 3CMAN 1NJXA 5GADP 4DR1K 1O13A 3KVGA 3HSTB 4IDKA 3TPQA 4ILJA 4NYFA 4C8NA 4DS4A 4CF0A 4FJHA 3J7ZO 4BC3A 2NRWA 3M1FA 4BWJA 2NRHA 3QMLA 3VEZA 4Z4GA 4FWSA 3V9SA 4CZIA 1RTDA 1OVQA 3A5NC 4DV6K 4MQ3A 2HBMA 3TAPA 3NH1A 4O0JA 3U3GA 2VWKA 3I55N 1RGIA 3E9LA 2F8SA 4R79A 2YI1A 4YOXA 3O6WA 5DMRA 3AVLA 3RMDA 1NGFA 3SLCA 1WSJA 5AZIA 1BL3A 3MWTA 4C23A 3VQPA 2XY6A 1Z05A 3QEXA 4CJRA 4EAHD 5C25A 3SUPA 1XC3A 3DLGA 2NRZA 3O9RA 3THXB 1KFSA 3AV9A 2WONA 1E4FT 3OYLA 5AQGA 3CHWA 1S9GA 3PSFA 3KD5E 1QSSA 4B8AB 1N8RO 1J9AA 3SJHA 4J2DA 1ZBHA 3CC4N 2Y1IA 1WBBA 1BHLA 1RT2A 2XRIA 3E9OA 5HRPA 3M8QA 2E1YA 3SAGA 1XHXA 4IFYA 4NXMK 3WEEA 1LCUA 3D45A 3BDPA 3AO1A 3DXKB 2XO7A 2IC3A 4CJ7A 4F2SA 1HRHA 4JNEA 3ZSXA 4CZLA 2YNIA 1DT9A 4OKKA 2VGNA 3KKRA 1SQKA 1S1XA 5FPEA 1WLJA 2Q0UA 2KKZA 4EHTA 1V4SA 2E1ZA 3C6TA 3M8SA 3RRGA 2UUAK 4MDAA 4JKGB 2LSNA 1U2VB 4B3MK 3CCVN 2NUBA 4XH4A 4BC4A 5AQJA 3HPOA 3J80O 4BE0A 1IG8A 4JK8A 2G8IA 1U49A 4NO7A 4PL8A 4W5TA 3H3NO 4BRCA 4JI5K 2O8FA 2A41A 1WUAA 3DRPA 1EQYA 5KGWA 3ZT1A 2Y1JA 3HVTA 3UKUA 1NJYA 3QESA 3KLIA 5KRSA 4DSLA 3DLBA 1BO5O 4AH9A 1QVFM 2HMPA 4DF4A 1OH8A 2CGLA 3VERA 2FSJA 4MLEA 5DM6L 2IVNA 2GV9A 1TGOA 4RW8A 3ZX3A 2JWKA 3R3LA 3MWPA 3VEXA 4LH4A 1BCOA 3ZCMA 1VAZA 4CIGA 2A1RA 3MK6A 4H5TA 3ULEB 2ZD1A 2G8WA 3ZETB 4E7KA 3DMJA 3KWGA 3CCQN 2YV0X 4IJAA 3QEVA 3DRSA 3A0IX 4M3WA 4FWOA 2RN2A 3QEWA 3ATVA 2HNDA 1HJRA 3DLKA 3H45C 4H0TB 1B92A 5CYMA 3DLEA 3EZWA 4KBOA 1WSFA 1KLNA 3ENHA 2Z1HA 4YDUC 3RR7A 3GOIA 1ATNA 4F8RA 1HPZA 3LWLA 3TTCA 5BREA 3G71N 3ULDA 1DEJA 1RT1A 3C7NB 3RSEA 4E1MA 5T7BA 4YOYA 1KRPA 2GWKA 3IDHA 3CM5A 4FJJA 4CJ4A 3HRGA 5DK5A 5HRNA 3L4IA 3L0QA 5AQHA 3NHGA 3CC7N 5FDLA 4H0YB 3LANA 4FSVA 2D0CA 1YTUA 2V51B 3CJ1A 2HHSA 4CGHA 3BF1A 2P9UB 5E41A 4J2BA 4BVOA 4FLYA 4DTUA 3VA3A 4C8KA 4BG9A 5ADXH 2Q97A 4KB1A 4MDBA 3HSCA 4CJTA 4FM0A 2OPQA 3OYFA 2OPSA 1RT5A 2ZF5O 3EY1A 3CCJN 3F9KA 1ASVA 1S6QA 5BRFA 4DKWA 4XIUA 4NLBA 4BG8A 1KFDA 1TKTA 1NJZA 2FBYA 1TUUA 1KTQA 2RF2A 2W6KA 1Y64A 1NGEA 3RTVA 2EHGA 3MECA 4FVMA 4E19A 4WYBA 2G8HA 4KHWA 1RT6A 2IIRA 3CJAA 4Q0BA 2VCPA 2IGIA 3ZEUB 3VEWA 1BA0A 3J7YP 1WBDA 2QWQA 3V9XA 4DV0K 1CLQA 5GAEP 2G8UA 1B9FA 2FBVA 3TANA 4CJ3A 4N47A 1NKBA 1RBUA 4IG0A 4Y1CA 2G8FA 3HK2A 5HOOA 1D5AA 2WUSA 4DG1A 3VGKA 2PYJA 5TKYA 4K8ZA 3PLAA 1WAJA 4DWIA 2OYQA 2ZGZA 4HVJA 4BQZA 4DSEA 3CFRA 3C6HA 4KHSA 4M3XA 1IKXA 3NE6A 4FZYA 5HROA 1NOZA 4B1XB 4M3YA 1SS6A 3QIOA 4YOVA 2O8CB 5AQXA 4PHTX 1IBKK 4B9LA 1NNEA 1E4GT 4CFDA 1NGAA 1T05A 1N33K 3MCPA 4DV1K 4FO0A 1M1KO 4WE1A 1VSIA 4DLEA 1OVYA 4MFBA 4CF2A 1HLUA 3LP3A 5BPMA 4PL7A 3TAMA 1Q86O 1FKPA 3M8PA 5I42A 4CZHA 3VQQA 1KAXA 1BU6O 3MEEA 3O80A 3K0SA 4B1ZA 3AVIA 1VQON 1NMNA 4I7FA 4KHNA 3ZETA 3DRRA 4LY7A 1JLFA 3K5OA 3L4QA 1S5JA 3TTDA 1J54A 4FLZA 4CW7B 3D2FB 2YNHA 3AGKA 4EZ9A 2ZJQL 3TU5A 1QQNA 4DR4K 4CF9A 5FPMA 4GV3A 2A42A 4FLUA 3MN9A 4B08A 3OYCA 3VMFB 2QWLA 3WXJA 1NK9A 3VGLA 3IKMA 1NMDA 4DTRA 3O3FA 1RTHA 3OYIA 1I39A 3P4IA 1KXPA 4A57A 3LWMA 5CY4A 5EVZA 3OBWA 4CHZA 2AJQA 4AHCA 4IFEA 4CHPA 5I3UA 2OZSA 3Q7CA 3CCRN 2P9UA 3CJ9A 2WTUA 1C0FA 2VG7A 5KTQA 3P39A 1SUQA 1LW0A 4JN4A 4DB3A 3NMUA 4B1WB 1L3VA 3U9ZA 2V7ZA 2B4JA 3W0LA 2DFHA 1QQCA 2QXLA 4JEPA 4AHSA 1KAZA 1FKOA 3JS6A 4M3RA 3LDOA 4QOZB 1KQSM 1LV5A 2FC0A 2NZTA 1N36K 4X65K 4BRKA 2FF6A 1NG9A 4E7IA 4DTMA 4IOXA 1GLBG 5LMNK 3J8AA 3DLRA 3MX2A 4IKFA 3AO5A 1RT4A 3CCUN 1NGJA 3ENOA 4RW7A 3DM2A 3VENA 5JS1A 5GIOA 3KLEA 2QEXN 4Z4HA 4RW6A 1BIUA 3ZLJA 4CFCA 2F96A 1KSPA 2P9SB 2D0PA 1VQLN 3MDQA 1G99A 3SNNA 4IJNA 4J2AA 4CJFA 3THYB 3AA2A 3AA4A 3OJSA 3OYMA 1HJOA 2KLAA 1IBLK 1MU2A 5B8HA 3U6FA 3SPZA 4FZZA 4GMJB 3F73A 2KQ2A 1BQNA 5AQZA 1U4BA 4BDPA 1HR0K 4FLTA 3QICA 2P51A 4FJMA 5I9EB 4B3TK 1HX1A 5CR4A 4CJ5A 2QXFA 3SUQA 2UXCK 1Y97A 3TR8A 4ISGA 2YJFA 2UUCK 1JJ2M 3IS9A 2YHAA 4FWPA 1HNZK 4YFUA 2E2PA 3CQXA 3T19A 1IV0A 1XNRK 2HNZA 2YNFA 4OLBA 4C1NI 3HTVA 4N5SA 3PSIA 5KGXA 4FK2A 4R5PA 3MAQA 1QQMA 3VF6A 3ZT4A 2ASMA 3RR8A 4KPYA 4GVEA 3DXMA 3V6DA 3DI6A 1NGDA 3CCSN 4M42A 5M1PA 3P1GA 4DV2K 4O4GA 3V4IA 5EX5A 4ILHA 3PIPL 3OBYA 4KO0A 3TSQA 5C15A 4BDYA 2XY7A 4MLHA 1JLAA 1S6PA 2QKBA 1GLCG 3ENBA 3GBTA 1IKWA 3ZT3A 1VQ5N 1VSKA 3AAPA 3GE1A 5AFUH 2Z1JA 5AQUA 4FPAA 3SBGA 5H1SQ 3KK1A 3U4LA 1SL1A 4KTWA 1JLBA 3F2KA 3FZLA 4RW9A 1RNHA 2QM1A 5BN8A 4HUFA 4IOAL 3WNGA 4CZMA 2O8BB 3FZHA 4DR7K 1JCGA 1HQUA 3V9UA 5ADXA 3OA9A 3UE5A 1NKCA 2P9NA 3QLHA 3C6AA 2D1KA 1D9FA 2ASPA 2O4IA 4CJWA 5BPNA 4V19S 4EP4A 1TYQB 3LM9A 4KTZA 2P9PA 2RE2A 3QINA 4B9QA 4L3QA 2W40A 1VSHA 1DTQA 4LF9K 5ELZA 4FM2A 5HLFA 4ISEA 1YVNA 3F9MA 5AQSA 3L2RA 4Z4EA 3NF6A 5SZTA 4CHNA 4RTFD 4JLHA 4KI6A 1OH5A 3SQ0A 2E6LA 1NK4A 4ZTJA 1ZBIA 3D6RA 3KIOA 3P38A 3AO3A 5BPLA 4CHYA 1YT3A 4IXCA 3J81O 3IRXA 4FL9A 1HNVA 3QEIA 4CJVA 4FLVA 2QW9A 2D4WA 2KW4A 3OHRA 3NF8A 3CF5L 3H3OB 3MX5A 1EWQA 3CPWM 3AVAA 1YTAA 4X66K 4KB0A 2HHWA 3QB0A 4FW1A 3SBTA 2JWLA 3H6EA 5FPNA 4PKGA 2B6AA 2X6SA 3NBPA 3NGYA 5IWAK 5JVHL 4BR4A 4FK4A 1K8KB 2WOMA 4H5WA 3LDPA 1ZBSA 4MO5A 4FOIA 3ZSVA 4O44A 4CGDA 2HW3A 3THWB 4XEIA 2GX9A 2WC9A 3C94A 1X9JA 3A8YA 3NGIA 1KAYA 3O1WA 3CMEN 2VQEK 3LAKA 4CECA 3F5TA 1C1CA 4BVPA 2OZMA 4WFBL 1BI4A 3HBTA 2NRXA 1KD1O 3OY9A 3AA3A 4B3SK 2B5JA 1JCFA 3G0ZA 3ZT0A 3NVMA 3UB5A 1Q9XA 4A5AA 3K57A 4DSIA 2RHKA 5TKWA 2RPIA 3KKSA 2ZM6K 3L2WA 3KK7A 4WQ4C 5BRHA 3VGMA 3M8RA 1A5WA 3QFPA 4F4KA 3OS0A 4DSJA 1WN7A 3RMCA 1YJWN 3U9DA 1ZBLA 5E84A 3PY8A 4IBNA 2HHTA 1I3AA 1IBMK 3WXLA 4FJLA 4N76A 1Q81O 2ETJA 3AVNA 3A5MC 2OANA 2P1JA 2KZMA 3WUHA 2OTJN 1YF5L 4K25A 3CCEN 3D0PA 3HYFA 4Z4FA 3AVKA 3TARA 4JV5K 5LL6Z 4E0DA 4HHTA 3THVA 2EX3A 4F3OA 4FVUA 4F3TA 1QSYA 2GUIA 3HZ6A 2FLOA 3D2EB 4B3OA 5AQIA 1YIJN 2YNGA 2ZE2A 4CZFA 3VESA 4A2AA 3S41A 1G15A 2O8DA 1VSLA 2Z1GA 1QZ5A 5AQQA 2UUBK 4FW2A 1LWCA 4JD2B 2O8EB 3B6PA 1NJWA 3NVKA 1VQ8N 3BP8A 4CCHA 4BGAA 1EX4A 1VSFA 1VQ7N 2DTUA 5E26A 1LAVA 5M1OA 1TYQA 4B9SA 4IG3A 1S1UA 4FLWA 3KJVA 4DU4A 1CXQA 3NGZA 2NRVA 1JCEA 1VQ9N 1UWBA 1ESVA 4M7YA 3FFKB 4IFVA 4DU1A 1Q18A 3VEOA 1BA1A 5HP1A 1IO2A 1I94K 4OO1J 4X62K 1BDGA 5AQRA 4FWRA 2E20A 1CZAN 1SKSA 4JRPA 3K58A 3V1QA 3VEVA 1C0UA 2DY4A 3AAQA 3O4WA 3ZYYX 3HP9A 2OTLN 4WCEL 4K43A 3K9KA 1K73O 1J53A 4HCBA 4UY8O 4IEEA 5KI6A 1IH7A 3OYJA 3AARA 2HB5A 4WFNL 1HKGA 2KFZA 4BACA 5CYQA 1HYSA 2ZQBA 4BR0A 4DV4K 3TI0A 1VSJA 4KHPK 4JKAA 4B9VA 4CEEA 2QK9A 2QKKA 4OKEA 4CZKA 2HNYA 3E1YA 1NU0A 4JAXA 3ZT2A 4JI7K 3S3MA 2ZGYA 3WNFA 3SAFA 1N32K 4JI4K 5KQ8A 1BOTO 2IVOA 3AVCA 3AVBA 1QTMA 2E2NA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3SK3 A;  1ATR A;  3H46 O;  3K5N A;  3M5R A;  4DQR A;  3L8B A;  3V81 A;  3T1A A;  5GIP A;  1TAQ A;  1RT7 A;  3DJC A;  4M63 C;  2FXU A;  3R6M A;  5AQF A;  1N34 K;  3P5J A;  2QWM A;  4E1N A;  3CFO A;  2D0O A;  1OKJ A;  3CM6 A;  4ID5 A;  1SL2 A;  1B9D A;  5C0Y A;  3LPT A;  5C2F A;  5AQL A;  2KHO A;  4LSN A;  4BWM A;  2ZJR L;  1HKB A;  1BIZ A;  4LH5 A;  1VSE A;  4OPA A;  4JK9 A;  3LP1 A;  1RDB A;  1QSL A;  2Q3S A;  1X9M A;  3ID8 A;  3ZSO A;  4LF4 K;  3VQ5 A;  2BE2 A;  4DQQ A;  3FZM A;  4H0O A;  4FXD A;  3KWI A;  1NJI O;  3WQT A;  3G10 A;  4BRL A;  3KTQ A;  2Z1I A;  3MXJ A;  1OH6 A;  4DR6 K;  1T7P A;  4O8U A;  2PY5 A;  4BRF A;  1NKE A;  4B1Y B;  3QO9 A;  3VF2 A;  1C1B A;  3UKU B;  3T1H K;  3VOV A;  2PYL A;  3RRH A;  4IO8 A;  2F4V K;  1W2B M;  3CCL N;  2O8D B;  1TL3 A;  4M3U A;  4YOW A;  5FRO A;  3LZI A;  4CEQ A;  1TKD A;  2PBD A;  4DV5 K;  4H0P A;  3CJ7 A;  2GWJ A;  1A5X A;  3ATU A;  1J5E K;  1S1T A;  4CEF A;  4DHY A;  4FK0 A;  2JLE A;  2BDP A;  4I2P A;  1RBR A;  2GEM A;  3OVN A;  1XHZ A;  1VRT A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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