3CCVN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2616a
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
molecule tags Ribosome
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccvN00
1W2BM 1K73O 4WCEL 1YJNN 1ILYA 3CCSN 1VQPN 2ZJRL 3CMAN 1OVYA 2ZJPL 3CD6N 1VQ7N 1S72N 5DM6L 4IOAL 1YHQN 3PIOL 1KC8O 4UY8O 3OW2M 1VQKN 3CCLN 1M1KO 5GADP 3J7ZO 2OTJN 4WFNL 4WF9L 3CC7N 3CCJN 1VQMN 1Q82O 1Q86O 1JJ2M 3CMEN 3CPWM 3CC4N 2ZJQL 3CF5L 3CCEN 3CC2N 2QEXN 1VQ6N 5GAEP 5GAGP 1VQ4N 1YIJN 3I56N 1VQLN 3G4SN 5JVGL 3CCRN 5H1SQ 3I55N 1K9MO 3PIPL 4U67L 3CCQN 5GAHP 3DLLL 1Q7YO 4IO9L 3CCVN 2QA4N 1VQNN 1NJIO 1Q81O 1K8AO 1KD1O 3CXCM 2OTLN 1YJWN 3G71N 3CCMN 1YITN 5DM7L 5JVHL 4IOCL 1N8RO 1QVFM 1QVGM 4WFAL 4WFBL 1VQ9N 1VQ5N 1VQ8N 1VQON 3CCUN 5HL7L 5MLCQ 1YI2N 1KQSM 1M90O 3G6EN 1YJ9N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SI6A 2EWSA 3DYAA 4GMJB 1ILYA 3ZSWA 4MDBA 4BWJA 3TI0A 3NFAA 1RDAA 4O0JA 2F8TA 4DF4A 3LZIA 2J4RA 4O4GA 1C6VA 3KVGA 4KHPK 4PA1A 3ZSZA 2BGGA 1KVBA 1M1KO 4HUEA 2ZF5O 3L2VA 4WF9L 1VHXA 4DTNA 3U6FA 1S1TA 4DR4K 4MO4A 1VQMN 1Q86O 5EU7A 1NGDA 1NOZA 4CFAA 4ELUA 1TKXA 2B4JA 4JI7K 1C1CA 2WTUA 2QEXN 2QXFA 1X1PA 1QQMA 3FFIA 3VESA 4DTOA 1ZBLA 1JLQA 4B1YB 1Z6RA 2UUCK 4JS4A 2HBKA 4H0XB 5M1FA 1ZYQA 4IEIA 3ULEB 3H46O 1QSSA 3ZSRA 4CJWA 4U67L 2E2OA 4B9NA 4DS5A 4BC4A 1K8AO 1KD1O 2D5RA 4FWLA 3SQ1A 1JLBA 3AO1A 3HI0A 1RT4A 2P51A 3DXMA 4GVMA 3VN5A 3HPHA 3QEVA 4CBXA 4IDHA 4GV9A 4YDUA 5HOOA 3QMLA 2QK9A 1EQYA 1JCFA 4CEFA 4CESA 4B3SK 3P39A 4N41A 3V1QA 3VQQA 4YOYA 4CJUA 1Z25A 3OYMA 4W5NA 1HX1A 4JKFA 4JKCA 4CGHA 1GOBA 4DHYA 3RR8A 3CHWA 2QI2A 2HHWA 3WQUA 1NGCA 1RFQA 2PAVA 2ZJRL 3J80O 3AO4A 4LF4K 2LSNA 3NDKA 4I6MA 2D0AA 1TGOA 1C1BA 1N33K 2HHUA 3BGRA 4K41A 1JLAA 4YORA 4JD2A 5AQWA 1BHLA 1KXPA 1MWKA 1YF5L 3OYAA 4CBUA 4JS5A 3KK1A 4FWRA 3OYGA 2A3ZA 4M3UA 5LMUK 3QEIA 3LL3A 2W6LA 4HUGA 5AR0A 4OKKA 1QQCA 5KRSA 4Z4FA 1C0FA 4K8XA 4KHQA 5GAGP 2X78A 4FXDA 4XH4A 5AQKA 3QEPA 1QSYA 1RCHA 4FVMA 4F2RA 5HLFA 3KZBA 4FJ9A 4WQ5C 3EE8A 5JVGL 1RT2A 1GLEG 1DKGD 1BU6O 4KREA 3QFPA 4RTFD 2V7YA 2RE2A 3F2KA 2Y1IA 4FJGA 1VSKA 4JK7A 4B9LA 3I33A 4LF5K 2WOMA 3OYLA 3O5BA 2OTLN 2QWMA 3CCMN 3OS0A 2PFUA 1CXUA 3K9JA 1N8RO 1LWFA 3HVRA 4BE2A 4JV5K 4ISGA 4JI4K 3KK7A 3AVKA 1LW0A 1QQOA 2Q3SA 2I5JA 1VQ9N 2X74A 1GLAG 3HP9A 4BE1A 4CIGA 4DTPA 3C6AA 2Q0RA 3L6QA 1RT5A 4DLGA 5AQPA 4E1NA 1M90O 4FK0A 4OO1J 2XY8A 4FLTA 1NK7A 4B1WB 3K2PA 4DQ8A 4FWMA 4WCEL 1KFSA 4CF2A 3V9XA 3MX2A 3JXUA 3QEXA 1NOYA 5EXWA 4H8KA 3L8BA 3WEEA 4DTRA 3ZT1A 4JHDA 4FLYA 3T7ZA 1VSLA 2ZJPL 4RG8A 1HLUA 2W6KA 3V1OA 5KRTA 5DM6L 3D45A 4CEOA 4BRIA 1KLMA 4RWTA 3EZ5A 4IOAL 4BC2A 4ILGB 1NGBA 4FLZA 4FJXA 3KLIA 4BRHA 3G0ZA 3NGZA 3U9ZA 4JEPA 2Q2RA 5M1NA 1JXEA 2P9LA 1N36K 4JD2B 2ITMA 1XNRK 4FJJA 3I0RA 4O5FA 4CJPA 1EX4A 3CFPA 3K9KA 5F2RA 4M3RA 3AO2A 1A5WA 1NGGA 4PUOA 2QM1A 3S41A 4HTUA 1ATSA 3J8AA 4IXCA 2VG7A 3D0PA 4QS7A 4GKKK 1FW6A 1X9SA 3O8MA 1SZ2A 4LH4A 1RBTA 2HHSA 3CFOA 2GWJA 3QIPA 2E6MA 1QE1A 2A6AA 3LP1A 3RMAA 2F4VK 4G9ZA 3I56N 1X3MA 2VYPA 3OA9A 3TSPA 3NF7A 4IEEA 3SJJA 5EVZA 4E7KA 2YHBA 3E1YA 3CERA 3VQ4A 1HJRA 1IO2A 1VRUA 2ZM6K 2Q1NA 3AVCA 5CZ1A 4Z4EA 1VSEA 3HP6A 3MEEA 2Z1GA 4DV6K 5ADXA 3IRXA 1U04A 3M8PA 4E0DA 4Z4GA 3AA4A 3PV8A 1FKOA 1EWQA 1TK0A 3O1WA 1C0TA 2X6NA 2GV9A 4GKJK 1BI4A 3S3MA 1UWBA 1BOTO 3THXA 3CCUN 4A2AA 4BR7A 5I42A 4DF8A 1FKPA 3CJBA 2O8DB 1S9GA 3KHYA 4AHUA 3AA5X 3DLGA 3LDQA 3LPUA 3TANA 3C94A 4KHWA 3FZLA 3TWHA 3QESA 2HW3A 3CJAA 3RTVA 4DTUA 4E1MA 3L2WA 3FZKA 3HRGA 3TTDA 3NH0A 3OHRA 1YHQN 2NRWA 3VA3A 4KHNA 1S6PA 2AA4A 5AZIA 2JLEA 3CCLN 4FPAA 2F8SA 1E3MA 4J2DA 3W0LA 3J7ZO 4CD1A 1KAYA 3PSFA 4WFNL 5E41A 4JI6K 2VWBA 3BF1A 3LP2A 5HRRA 5CZ2A 1ZBFA 4RW4A 3A0IX 3MWPA 3C6TA 2YNFA 5I3UA 2FBYA 4YHHK 4CK2A 4X62K 1KRPA 5AQQA 5KPRA 4CI6A 4XH5A 2UXBK 1K8KA 3N4PA 4I2QA 5FRNA 1VAZA 4F2SA 2XRIA 1BCMA 1S6QA 2O8CA 4OPAA 1S22A 2Q31A 5ADXH 1KLNA 4F9OA 2BANA 3QO9A 3H45C 3OYFA 3LDNA 4FZYA 4KO0A 1SKWA 1MU2A 3BZCA 3F73A 1HPMA 3DMJA 4IO9L 2E4LA 2Q36A 1ZBSA 3P38A 2GWKA 4Y0WA 3SLCA 1WLJA 4CJTA 1NJIO 4J2EA 1NM1A 2OPQA 2OYQA 3AV9A 4PY5A 3VERA 1U6ZA 5AQSA 4H0PA 3MCAB 4Q0BA 4KHUA 4X66K 3P5JA 4EFHA 3SQ4A 3ZT2A 2HMIA 3RSEA 3TPQA 5JLFA 1SKSA 1KVAA 3SK3A 1VQON 2V52B 2YJEA 4DU3A 1U4BA 4NYNA 3A2FA 5F1XA 4LFAK 4C23A 3OBWA 1CLQA 3DI6A 4CHQA 3S3NA 3PLAA 1K73O 2FLOA 1VSDA 1BA0A 4H0VB 4AHRA 1RDUA 4B1ZA 4CZGA 2YV0X 3V81A 3GDQA 1BISA 3OS2A 1V4SA 3WXMB 1NMDA 2FC0A 4Z94A 2KHOA 2V7ZA 3A5OC 3AY9A 1H1VA 3SV4A 2O8EA 3JS6A 2A1RA 1ATRA 3KWGA 1U48A 5B8HA 3L0QA 3RMBA 5HRSA 4UY8O 4DV1K 1OH8A 4FLWA 3OYEA 3K59A 4KTQA 5AZIB 2HVHA 4B9TA 1XI1A 1S9EA 3CC7N 3P4IA 4BGBA 3D2FB 1ASUA 5CYQA 1CXQA 4FM2A 2ITGA 4RW6A 1TVRA 4H5VA 2OZMA 5K14A 5CY4A 2PYLA 4CCHA 3O3FA 2OCEA 3LDOA 4KFBA 1K8KB 1X3NA 4Z4IA 3UKRA 3VEWA 5SZTA 3P1GA 4MLEA 3A5LC 4KB0A 3AGKA 5FPEA 3CCVN 4I2PA 3L2QA 2E20A 4B9QA 4H5NA 1TYQA 3VQBA 1NGEA 1YJWN 3TABA 1OH7A 3ZSXA 1D4XA 2DTUA 1A5VA 4JI0K 3QIOA 4ICLA 4O0IA 4DV5K 5D3GA 2P1JA 1N6QA 4GV6A 1VSHA 3QFUA 1IBLK 3DRPA 4FO0A 4CF0A 4PKGA 1W97L 3VF2A 2OZSA 3VQ9A 5FDLA 3VGMA 4DSLA 1RDBA 4EZ6A 2D0CA 3FGUA 4DV4K 1YI2N 4B9VA 1L3VA 4H0TB 1ASVA 3B6PA 4UQGA 1WSGA 2P9IB 3TSUA 1YJNN 1J5EK 1RBUA 1T44A 2O4IA 2P9PB 4AM6A 4FLVA 4E3SA 2UUAK 4Z4CA 3MMVA 5AFUA 4OPHA 4HTLA 1LAVA 3J81O 4RW7A 3L2RA 2ZD1A 1NGJA 3F9KA 4AHTA 4CGFA 4E89A 4GV3A 1YXQA 1D8YA 1SAZA 3O4QA 2E1ZA 4B1VA 5AQHA 3BP8A 5FRMA 3HSTB 3UB5A 2O4GA 3L3UA 1I94K 3AAPA 1WSEA 4JKGA 2V51B 1NWKA 3CCEN 4JI3K 4CW7B 2JGUA 1LWCA 4PL8A 3M8RA 1NGAA 4CEAA 1S3XA 3SMPA 3M1FA 4I9LA 3HOSA 1EP4A 2P9UB 3A8YA 3EE9A 2WC9A 1NK4A 4BRMA 3G25A 4B9MA 3DAWA 4CZHA 3ATUA 4CJ4A 1BUPA 4RW9A 3RMCA 4CJFA 4M7YA 3THYA 3BY5A 2RPIA 3UKRB 3HL8A 3T1HK 2CGJA 4F4KA 1Q9XA 3SUOA 3D7EO 4JRQA 5DM7L 4C8OA 4FVUA 4IDKA 1TYQB 4KTWA 1B9FA 3KLGA 5C24A 2W41A 1JLGA 1NG9A 4CD3A 4FOEA 3VEZA 1U2VA 3BEXA 1NK9A 4N56A 3OBYA 3H1QA 4V19S 3CM6A 4E7HA 4DB3A 5FLXO 4OLAA 4PKHA 4AHCA 4L8RB 3HM9A 1GOCA 4BRDA 5MLCQ 1JL2A 3AO3A 4JAXA 3NH1A 3VTIA 5EY4A 5JLHA 3K5OA 4CEEA 4KBOA 3ENBA 1VQPN 4CHYA 4IOXA 1YAGA 1YT3A 1U45A 2NLXA 4CHNA 3R6MA 4M3ZA 4H5RA 3C7NA 5I9EB 4O44A 4Z0UA 2BTFA 3W3DA 5GIOA 1RTDA 4AM7A 4CJRA 3IUCA 1BL3A 1NJXA 5JMVA 1WAJA 4DR6K 1NGFA 3WXLA 2XY6A 1REVA 1V4TA 1YTAA 2HHXA 2Q0UA 5BN9A 4YNQA 4EHUA 4YOWA 3QDKA 3QNOA 3A5MC 3KLHA 2YCHA 5C2FA 3TAPA 1RT1A 4FSVA 4YOUA 4CK1A 5HP1A 4OKEA 3GL1A 1VQ4N 2IIRA 3LWLA 4J8FA 4JKGB 4M3XA 3EEQA 1TAQA 3VMFB 3WXIA 1HQEA 3LDPA 2QW9A 3UKUA 3D6RA 4N76A 3DJCA 3F9MA 4JK9A 2W42A 1OH5A 5AQLA 3G10A 3CCQN 2XHBA 1Q9YA 1OVQA 3NHGA 4HUFA 2W40A 3P31A 3V9UA 5EX5A 1NJWA 1UA1A 3G71N 3THYB 3EKSA 3SPYA 1SKRA 3MX5A 4CGJA 3H08A 3FZMA 3SV3A 1NGIA 4LSNA 3KKSA 5J2NA 3AVJA 2FSKA 5E84A 5ELZA 4WFAL 3LALA 2QWPA 1E4GT 3SAHA 4FWKA 3MEGA 3Q7CA 1U2VB 2O8FA 3HZ6A 5FPDA 1UA0A 3NMUA 4CZIA 1NJYA 4BRKA 3CQYA 3DLBA 3EKUA 3ATVA 1WBBA 3MECA 1NNEA 4IJNA 1S1XA 1NBWA 3AAQA 4FM1A 2NRRA 2KTQA 5AQMA 2G8WA 3SBTA 3AVLA 2H3GX 3AVFA 3DRRA 2HHTA 3DXMB 1QS4A 3ALYA 1JCEA 3SYZA 4Y1CA 4Z4HA 5KGWA 4FJ7A 2D1KA 3F5TA 4KTZA 4BRGA 4LC9B 3KWIA 4CJ3A 2ZGYA 3VQAA 5KI6A 3LDLA 3VQDA 3PY8A 3CJCA 1HKGA 3U9DA 2D0PA 4C1NK 4BC3A 3J7AP 4IKFA 4CJ7A 1KAZA 4C8MA 5AQRA 1OKJA 3K57A 4XIUA 4DTSA 3CPWM 2P9SA 1F21A 3MN6A 3T1YK 1GLFO 3MN5A 1L3UA 3WNFA 4DFMA 4C1NI 4NCAA 2YHYA 2IVNA 4DR5K 3U3GA 4U7BA 3T3FA 4B8AB 3HO1A 4I6MB 3SQ2A 2NRTA 1C1AA 2ASPA 2YNGA 3QERA 4JLHA 1GLCG 3HK2A 3ENHA 3O08A 1NKEA 3NH2A 2ETJA 4IG0A 5H1SQ 2KW4A 2VQEK 2UU9K 3KLFA 3SNNA 4BC5A 1ZBHA 1CZ9A 3KK3A 3WNHA 5HRPA 1J9AA 1L3TA 3JSMA 4ELTA 4ZTJA 3CXCM 2QTDA 1MA9B 3OTOK 1I39A 3VQPA 1DEJA 5JVHL 3OYNA 4C8LA 4JKBA 4O8UA 2HMPA 4O8KA 4DFJA 3V4IA 3U4LA 3ZSQA 5BR9A 1HMVA 2HHQA 2HVIA 4AF1A 4DWIA 1DTQA 3AVMA 1MWMA 4M45A 5EOYA 5C10A 4FYDA 2WBNA 4O5BA 4IWVA 1WSHA 3PSIA 1IH7A 4CHOA 3SAFA 4FWOA 3OYKA 1RBVA 1D5AA 2A5XA 3L4IA 4CF9A 4DV2K 3TARA 1G15A 1J6ZA 1YVUA 4BRPA 1XC9A 3SBGA 4BG8A 4DMNA 3HSCA 3NF9A 2I7NA 5AQTA 4O55A 4A5BA 4CJQA 2UXCK 3AVIA 4FK4A 1OVYA 4DQPA 1IV0A 3RRHA 1S5JA 4HCCA 3ZX3A 4CF8A 4DTXA 3VQEA 2NRXA 4FWNA 1GLJO 4H5WA 3AVGA 4H03B 3MCPA 4CJSA 1N34K 1W7AA 1HNWK 2HHVA 4Y1DA 4CZMA 4OJRA 1HNVA 4R79A 2FF6A 4OVLA 2PBDA 2QXLA 3WT0A 4KH4A 3ZT0A 3CC4N 3PX6A 3WUHA 2P5OA 2EHGA 3ISNC 3D2EA 3WEEB 5E26A 4BGAA 3DM2A 1KTQA 1L5UA 4JHDB 4ELVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1W2B M;  1K73 O;  4WCE L;  1YJN N;  1ILY A;  3CCS N;  1VQP N;  2ZJR L;  3CMA N;  1OVY A;  2ZJP L;  3CD6 N;  1VQ7 N;  1S72 N;  5DM6 L;  4IOA L;  1YHQ N;  3PIO L;  1KC8 O;  4UY8 O;  3OW2 M;  1VQK N;  3CCL N;  1M1K O;  5GAD P;  3J7Z O;  2OTJ N;  4WFN L;  4WF9 L;  3CC7 N;  3CCJ N;  1VQM N;  1Q82 O;  1Q86 O;  1JJ2 M;  3CME N;  3CPW M;  3CC4 N;  2ZJQ L;  3CF5 L;  3CCE N;  3CC2 N;  2QEX N;  1VQ6 N;  5GAE P;  5GAG P;  1VQ4 N;  1YIJ N;  3I56 N;  1VQL N;  3G4S N;  5JVG L;  3CCR N;  5H1S Q;  3I55 N;  1K9M O;  3PIP L;  4U67 L;  3CCQ N;  5GAH P;  3DLL L;  1Q7Y O;  4IO9 L;  3CCV N;  2QA4 N;  1VQN N;  1NJI O;  1Q81 O;  1K8A O;  1KD1 O;  3CXC M;  2OTL N;  1YJW N;  3G71 N;  3CCM N;  1YIT N;  5DM7 L;  5JVH L;  4IOC L;  1N8R O;  1QVF M;  1QVG M;  4WFA L;  4WFB L;  1VQ9 N;  1VQ5 N;  1VQ8 N;  1VQO N;  3CCU N;  5HL7 L;  5MLC Q;  1YI2 N;  1KQS M;  1M90 O;  3G6E N;  1YJ9 N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3SI6 A;  2EWS A;  3DYA A;  4GMJ B;  1ILY A;  3ZSW A;  4MDB A;  4BWJ A;  3TI0 A;  3NFA A;  1RDA A;  4O0J A;  2F8T A;  4DF4 A;  3LZI A;  2J4R A;  4O4G A;  1C6V A;  3KVG A;  4KHP K;  4PA1 A;  3ZSZ A;  2BGG A;  1KVB A;  1M1K O;  4HUE A;  2ZF5 O;  3L2V A;  4WF9 L;  1VHX A;  4DTN A;  3U6F A;  1S1T A;  4DR4 K;  4MO4 A;  1VQM N;  1Q86 O;  5EU7 A;  1NGD A;  1NOZ A;  4CFA A;  4ELU A;  1TKX A;  2B4J A;  4JI7 K;  1C1C A;  2WTU A;  2QEX N;  2QXF A;  1X1P A;  1QQM A;  3FFI A;  3VES A;  4DTO A;  1ZBL A;  1JLQ A;  4B1Y B;  1Z6R A;  2UUC K;  4JS4 A;  2HBK A;  4H0X B;  5M1F A;  1ZYQ A;  4IEI A;  3ULE B;  3H46 O;  1QSS A;  3ZSR A;  4CJW A;  4U67 L;  2E2O A;  4B9N A;  4DS5 A;  4BC4 A;  1K8A O;  1KD1 O;  2D5R A;  4FWL A;  3SQ1 A;  1JLB A;  3AO1 A;  3HI0 A;  1RT4 A;  2P51 A;  3DXM A;  4GVM A;  3VN5 A;  3HPH A;  3QEV A;  4CBX A;  4IDH A;  4GV9 A;  4YDU A;  5HOO A;  3QML A;  2QK9 A;  1EQY A;  1JCF A;  4CEF A;  4CES A;  4B3S K;  3P39 A;  4N41 A;  3V1Q A;  3VQQ A;  4YOY A;  4CJU A;  1Z25 A;  3OYM A;  4W5N A;  1HX1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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