5AQKA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 121
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqkA04
3ATUA 3A5OC 1BWFO 1LOTB 2PBDA 4H5VA 2NLXA 4BRCA 3J8AA 3H1QA 3C7NB 5KPTA 4GY2B 3UKRB 2FF3B 5TKYA 4IJAA 4CD1A 3CQYA 1DGKN 3A0IX 4WQ5A 1BO5O 3LDNA 4CZEA 2EWSA 4FL9A 4BRDA 1DKGD 2P9IB 4H0TB 2HMPA 5AQLA 5AFUH 2P9SB 4O5FA 4A2AA 1X3NA 4BRFA 4H0OA 1GLLO 3DJCA 4MLEA 3VOVA 5JMVA 2CGKA 3FZMA 4YDUC 2CH5A 4FWRA 4CZHA 3CJAA 4KBOA 4BRHA 2Q2RA 4K41A 4JN4A 4GNIA 2DPNA 3MN5A 4AM6A 4BGBA 1HKCA 4H0VB 1CZAN 5AR0A 2D0OA 2P9LB 2Q97A 4CZMA 4BR5A 5AQUA 1NGHA 1QZ6A 4H0YB 5AQOA 2CH6A 2CGLA 2H3GX 3LL3A 4FO0A 3L4IA 4CZFA 2AP1A 2P9NB 3VEYA 2GEMA 3D2EA 3GBTA 3CI5A 5AQJA 4BC4A 3MK6A 4FOEA 4MO4A 2ZGYA 2HOEA 3U8XA 2Q31A 1TYQA 2E20A 3UE5A 3JS6A 1H1VA 3SK3A 3GDQA 2WUSA 5AZJB 3DXKA 1ZC6A 5BPLA 3CIPA 3VEOA 4DCHA 3HZ6A 4IXCA 3VESA 3ENHA 2Q0UA 2AA4A 2IVPA 1SZ2A 3DAWA 3EO3A 3MCPA 1HKGA 1WUAA 1BUPA 1C0FA 3EL2A 4BRGA 4IJNA 4BG8A 4CI6A 1T6DA 3QB0A 2GUPA 2ZGZA 1ZXOA 1BDGA 3CHWA 4BRPA 4CBWA 4DQ8A 3H45C 2FXUA 3ZETA 1NLVA 3QICA 2Q0RA 4EFHA 3KHYA 4BROA 4JAXA 5F0XA 2YI1A 4FWOA 2GTDA 4BC5A 2GELA 3VF2A 5ADXH 3HM8A 2E1ZA 2V52B 1MWMA 1EQYA 1GLDG 3O1BA 5ADXA 3WQTA 1Z05A 2QWRA 4BRKA 2QWMA 5F2RA 4WQ5C 1S3XA 4CZGA 3H3NO 3U4LA 5AQNA 1NGCA 4FWMA 4ISEA 2E2PA 1QQMA 3WXKA 1X9JA 4MO5A 4EHTA 1P8ZA 2ZF5O 2P9UB 3ZEUB 4IWVA 3WT0A 3CETA 5KPZA 1WOQA 3FGUA 3O4WA 3M6GA 4FWSA 1TYQB 1GLJO 3SLCA 5JICA 1GLCG 3QFPA 2P9UA 3ZEUA 3LDOA 3U9DA 3ZX2A 3R9PA 2V51B 2P9SA 5BREA 2P9NA 4RTFD 2E8AA 1HUXA 1Y64A 2YCHA 3D7EO 2P9PA 4M63C 3UB5A 4C23A 4FWKA 1BU6O 3IFRA 2P9LA 2QXLA 3ZX0A 1Q18A 3SMSA 1QZ5A 4F9OA 3S41A 5LJWA 3FZKA 2FSKA 3O1WA 2ASOA 4L3QA 5I9EB 3KZBA 2A5XA 5AQYA 4BQZA 5FPNA 5FPDA 5AQTA 3A5LC 3BP8A 1KXPA 1NGEA 5AQRA 3FFKB 3O8MA 1HJOA 2FLOA 3RSEA 2E2QA 4ISGA 1KAZA 4BREA 4B9QA 4BRNA 1NWKA 2YHXA 1IG8A 3G25A 4PKIA 4FPBA 3M1FA 1OKJA 1JCGA 1V4SA 1GLFO 3QDKA 3P4IA 2FF6A 4BC2A 1MWKA 3HSCA 2FSNA 3IUCA 4WYBA 2E88A 1YUWA 4PL8A 5AZJA 3HTVA 3ATVA 5AQMA 2KHOA 5AQZA 4H0PA 4BRMA 4HTLA 4BVOA 1XC3A 5CE3A 1BA0A 4EIAA 4WQ4C 4FWLA 1NGBA 3WUHA 3MMVA 5F1XA 3H3OB 5AQQA 3IMXA 2OANA 3D2EB 3LM2A 5EOYA 4CZLA 5AQPA 3H6EA 3FZFA 1Z6RA 2NRHA 4FPAA 1RFQA 3JXUA 1U6ZA 4Y0WA 2HF4A 3ULEA 2QWOA 4H5WA 3CJBA 5EX5A 5BRFA 3VGMA 5KQ8A 3WQUA 2VYPA 3W3DA 3HI0A 5ELZA 4CZJA 5AQGA 4K43A 4B1WB 3FZLA 3AY9A 4FWNA 4FSVA 5AQSA 1RDWX 5BPNA 3MN7A 1D4XA 1NGAA 1QQNA 5LJVA 4BVPA 4NB4A 5BN9A 1IJJA 3SJHA 3AAQA 3GOIA 3VEZA 2ITMA 3VETA 1KAXA 3B8AX 3L0QA 3BEXA 4K25A 3DXMB 3SMPA 3VGKA 4QS7A 1RGIA 2PAVA 1ESVA 2A3ZA 2YHWA 3TPQA 3GG4A 1MDUB 1HLUA 2QWQA 3MN9A 4XH5A 5LY3A 3FZHA 3DXMA 3F9MA 1T44A 3R8EA 3IDHA 3WXIA 2E2OA 1ATNA 5AQXA 3R6MA 2GWJA 1QQOA 3BF1A 3DXKB 4FWPA 4B1ZA 4H0XB 4BRIA 5AQHA 3GE1A 1K8KB 5AQWA 2P9KA 1YVNA 3QFUA 1NM1A 4BG9A 3EKUA 4IO8A 5EXWA 4B1XB 1JCEA 4I6MB 1NGJA 3WEEB 4K42A 3VENA 2CGJA 1GLEG 1T6CA 2J4RA 3BF3A 5AZIA 3A5NC 5BR9A 5E84A 4FWQA 4H5RA 3LDPA 3MN6A 3TU5A 4M7XA 2F9TA 1NGFA 1LCUA 1G99A 2P9PB 1MA9B 3EZWA 1BA1A 3L6QA 4PKGA 3ENOA 3W0LA 3VEXA 2A40A 3QBWA 3FE1A 4B1VA 1GLBG 1HX1A 2BTFA 3CJ1A 3QMLA 3A8YA 5JLFA 5BN8A 1QHAA 1HKBA 2YHYA 4BRQA 3LDLA 2Q36A 4HWIA 4BR0A 2NZTA 3O5BA 3EKSA 4BR9A 4JNEA 3O80A 3LDQA 2A6AA 3O08A 4BR7A 5AZIB 2V7ZA 1NGDA 2D0PA 4CBUA 4EHUA 3BUZB 4CBXA 4I6MA 4B1YB 4MLHA 1YAGA 1C0GA 4BQLA 3VEVA 3LM9A 3H1VX 4EAHD 2P9KB 2E1YA 5E26A 4H5NA 4BR4A 5KPRA 3FLCO 5AQIA 5AQKA 1S22A 3D2FB 4IZ9A 5FPMA 4DHYA 3VEWA 5BRDA 2Q1NA 3WXJA 4XEIA 4CD3A 3MDQA 1HPMA 2QWNA 4JHDB 2IVNA 4ISFA 5AQFA 3A5MC 1U2VB 4JD2A 1BG3A 3U9ZA 3CJ9A 4AM7A 4A62A 1E4FT 3UKUA 2ZWHA 1U2VA 4JD2B 1XUPO 2A42A 3WEEA 2UYTA 5FPEA 4B1UB 5AFUA 2ASPA 1ATRA 4QS9A 3AARA 3VGLA 2VCPA 4BC3A 5EY4A 3KVGA 4PKHA 3D2FA 4E1JA 4BRAA 3VERA 4A2BA 3ID8A 1ATSA 2ASMA 3DWLA 2D4WA 1TUYA 3CJCA 1SAZA 3VF4A 5BRHA 3I33A 3OHRA 2I7NA 3CJ7A 2HF3A 2BUPA 3I8BA 2IVOA 3UKRA 1TUUA 1NGGA 3C7NA 2VWBA 2QWPA 1NGIA 4RCHA 3AAPA 5JLHA 3VF6A 2QM1A 3ZX3A 4O8KA 5BPMA 4NO7A 5KQDA 1XQSC 1GLAG 2GWKA 3C0BA 3HBTA 4H03B 4XH1A 2FSJA 4CZKA 1KAYA 1J6ZA 5B8HA 3WXLA 5AQVA 3ZETB 3O6WA 3ULEB 2YJFA 3FR0A 2E2NA 3GL1A 1NMDA 1ZBSA 4PL7A 2QW9A 4Z94A 1SQKA 3VPZA 1X3MA 1BOTO 2P9IA 4A61A 2IIRA 1V4TA 1JCFA 4J8FA 2YJEA 4CJ7A 2D1KA 4RWTA 3UKUB 1R59O 5EVZA 1E4GT 3CERA 4DB3A 3CQXA 2QWLA 2W41A 1NBWA 4M7YA 4XH4A 3RSEB 4WQ4A 4QS8A 1K8KA 4JHDA 3H46O 4BR2A 4YDUA 4BGAA 2I7PA 1DEJA 4FOIA 2F9WA 4H5TA 2V7YA 4CZIA 1YXQA 3EN9A 4LC9B 2W40A 2A41A 3M3ZA 4BRLA 3QBXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YEOA 4X64K 3A5OC 3SJJA 2PYLA 1BWFO 1WT7A 2NLXA 4IG3A 3KOYA 3J8AA 3I0SA 3C7NB 4CGDA 2GUIA 4GY2B 2GX9A 4J2DA 3G6EN 4FJIA 4IJAA 3CQYA 4WQ5A 2GV9A 2EHGA 4FL9A 2QEXN 4LD0A 4BRDA 1DKGD 3ENBA 1IKYA 3PIPL 3G71N 4B3TK 2HHUA 5AQLA 3M5RA 1FKPA 4BRFA 1A5WA 4MLEA 3FZMA 2VWKA 2GBZA 4CJUA 2X6SA 2CH5A 2C1IA 3CJAA 4BRHA 3MN5A 4BGBA 2HHVA 4BDZA 1C0MA 2BH1A 4H0VB 5AR0A 2D0OA 2P9LB 4CZMA 1A5XA 5C2DA 2OTJN 2HSTA 3HP9A 1HNZK 1U49A 4H0YB 1ASUA 2JDQD 4FO0A 2H3GX 4JKBA 5M1KA 1P0AA 3VEYA 1LQHA 3GBTA 1Q9YA 3OBWA 3CI5A 5AQJA 3MK6A 4J2BA 3LP0A 2ZJPL 4KRFA 4I7FA 4DMNA 2Q31A 3OYKA 4FJGA 2E20A 4KREA 1RBUA 4FJNA 1VSHA 1BL3A 3TTCA 4FK0A 1L3TA 2YIPA 4DCHA 4EP5A 1GPSA 3MX5A 1L3UA 1NK8A 4CJPA 3ENHA 1JXEA 2IVPA 4FJKA 4C8NA 4B9VA 5BR8K 3DLLL 1P00A 3DAWA 3MCPA 5CZ2A 1JXBA 1WUAA 3KLFA 1NJWA 3SBTA 3K5LA 4N5SA 3EL2A 3I55N 4IJNA 3AVFA 3PSFA 4OO1J 3NHGA 2LJMA 3U6FA 1Q8IA 4NXMK 3ZLJA 2LY6A 4RW6A 3CHWA 1BDGA 4BRPA 4CBWA 4A5BA 3VA3A 3ZSZA 4ZHRA 4RG8A 2Q0RA 4AH9A 4N41A 4CF8A 1XRSB 4NXNK 2LT8A 4Y1CA 4CJSA 2QXFA 3VF2A 5ADXH 3TAPA 2E1ZA 4C8LA 2O8BA 1HNVA 4WFAL 2QWRA 4BE2A 3VQDA 1IKWA 2KZMA 4CZGA 1JLCA 5AQNA 1RDBA 4B3MK 1C1BA 4DV7K 3SPYA 1LWEA 2O4IA 4HCCA 4JKFA 1KVBA 4MO5A 4I9QA 2ZF5O 2P9UB 1SN4A 3FGUA 5GAGP 1HYZA 3LWLA 1RTHA 4CERA 1M90O 3SLCA 1BRZA 3QFPA 2B6AA 1S6QA 4E7IA 4O55A 4LSNA 1CZ9A 1Y64A 5DM6L 2IC3A 5D3GA 1N8RO 3UB5A 4C23A 4KHNA 1BU6O 4LH5A 4LFAK 2P9LA 3CC2N 3AVGA 3CM6A 3CC4N 1QZ5A 1TL1A 4M3XA 4HCBA 4E1MA 1VQPN 4Z4HA 3DMJA 1VRUA 4BQZA 2IDOA 5AQTA 4M3UA 3DLKA 4C8MA 4E0DA 3FFKB 3TAMA 2FLOA 4CHOA 4BREA 1KAZA 2BRZA 4B9QA 3CFPA 1JLGA 3TTFA 4OPHA 4JI2K 3M1FA 5J2MA 1UA0A 1JCGA 1V4SA 3OYEA 2RKIA 4PUOA 3IUCA 2E88A 3HTVA 4H0PA 4HTLA 5CR4A 1K8AO 1OH8A 4JI7K 4EIAA 3DLHA 2QTDA 2F7TA 1NGBA 2HVIA 4G9ZA 4NLBA 3L2VA 3MMVA 1VSFA 3IMXA 1TV6A 3OYLA 1VQ4N 1W7AA 4DR3K 5EOYA 1N32K 2OCEA 4QAGA 2HHSA 2JWKA 4CZLA 3THWA 2BGGA 1XHZA 1YITN 2RF2A 4DR5K 4IOXA 3N4QA 2NRXA 3THWB 3CYMA 2W6KA 3OJUA 3S9HA 1VQNN 5KRSA 4FYDA 5J1EA 2M8BB 2HF4A 4FLZA 2KPYA 4H5WA 3CJBA 4O0JA 5BRFA 1NOZA 1NJZA 3CCRN 5KQ8A 1D5AA 3WQUA 1DT9A 3L2RA 2W6LA 3FZLA 1G15A 2ETJA 3NF6A 4FSVA 5AQSA 1RDWX 1NGAA 4BVPA 4MDBA 4KTWA 4NB4A 4AHTA 3AAQA 3CCUN 3F2KA 2ITMA 5J2QA 3VETA 1KAXA 4GKKK 3TABA 3KLEA 2Z1IA 1VHXA 4WFBL 4CW7B 1HLUA 2QWQA 3MN9A 4W5QA 1HR0K 3FZHA 3F9MA 1BK8A 3SAFA 3OS1A 1ATNA 1R0AA 1OH5A 1D9FA 3AGRA 4KB0A 3GE1A 1K8KB 3ID6A 4KPYA 1IBMK 3QEIA 1J5OA 4GKJK 4B1XB 1W97L 1NGJA 4U67L 2P5GA 3NH2A 4LY7A 1W0HA 3RVCA 3OBYA 3OYDA 1LCUA 1XHXA 1QVGM 2FBXA 1S1VA 4CEBA 3EZWA 1BA1A 4YNQA 4PKGA 1DLOA 3W0LA 3QNOA 1BI4A 3QBWA 4JV5K 4GMJB 4R5PA 3TR8A 4B1VA 3CCQN 4DQRA 2QA4N 3S3MA 1GLBG 2PYJA 2ZJRL 2NRRA 1CXQA 3CJ1A 1Z25A 5BN8A 3TAQA 1HKBA 3CYGA 2YHYA 2HHTA 3KC6A 4BR0A 4HWIA 4BE0A 3O5BA 4KTZA 4W5OA 1CLQA 4DQSA 2A6AA 3O08A 2VG7A 1HYSA 1NGDA 2D0PA 2E5LK 3RR8A 2O8EA 3K2PA 3VQCA 4BQLA 1C0GA 1IKVA 4EAHD 3SI6A 4DUZK 4H5NA 3PX6A 1FK9A 5KPRA 5AQKA 3D2FB 3C65A 2Q3SA 2C1GA 3O3HA 2Q1NA 4CD3A 2DFEA 4JK8A 1TKXA 3MEDA 5AQFA 3A5MC 3AA2A 4IEEA 1XMOK 1U45A 1E4FT 2DFHA 3VQ7A 4E1NA 2QKKA 1CXUA 2P51A 2A42A 4CJFA 5FPEA 1HPZA 5JVHL 5AFUA 1XI1A 3T19A 4QS9A 3VTIA 3AARA 4IOAL 2HBLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2YEO A;  4X64 K;  3A5O C;  3SJJ A;  2PYL A;  1BWF O;  1WT7 A;  2NLX A;  4IG3 A;  3KOY A;  3J8A A;  3I0S A;  3C7N B;  4CGD A;  2GUI A;  4GY2 B;  2GX9 A;  4J2D A;  3G6E N;  4FJI A;  4IJA A;  3CQY A;  4WQ5 A;  2GV9 A;  2EHG A;  4FL9 A;  2QEX N;  4LD0 A;  4BRD A;  1DKG D;  3ENB A;  1IKY A;  3PIP L;  3G71 N;  4B3T K;  2HHU A;  5AQL A;  3M5R A;  1FKP A;  4BRF A;  1A5W A;  4MLE A;  3FZM A;  2VWK A;  2GBZ A;  4CJU A;  2X6S A;  2CH5 A;  2C1I A;  3CJA A;  4BRH A;  3MN5 A;  4BGB A;  2HHV A;  4BDZ A;  1C0M A;  2BH1 A;  4H0V B;  5AR0 A;  2D0O A;  2P9L B;  4CZM A;  1A5X A;  5C2D A;  2OTJ N;  2HST A;  3HP9 A;  1HNZ K;  1U49 A;  4H0Y B;  1ASU A;  2JDQ D;  4FO0 A;  2H3G X;  4JKB A;  5M1K A;  1P0A A;  3VEY A;  1LQH A;  3GBT A;  1Q9Y A;  3OBW A;  3CI5 A;  5AQJ A;  3MK6 A;  4J2B A;  3LP0 A;  2ZJP L;  4KRF A;  4I7F A;  4DMN A;  2Q31 A;  3OYK A;  4FJG A;  2E20 A;  4KRE A;  1RBU A;  4FJN A;  1VSH A;  1BL3 A;  3TTC A;  4FK0 A;  1L3T A;  2YIP A;  4DCH A;  4EP5 A;  1GPS A;  3MX5 A;  1L3U A;  1NK8 A;  4CJP A;  3ENH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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