5AQKA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqkA04
1EQYA 3EN9A 3ZEUB 4IWVA 1IG8A 3O6WA 1NGEA 2VCPA 3W3DA 5BRHA 4FOEA 2VWBA 3LDQA 4M7XA 5AQYA 2A41A 5BPMA 3CQXA 2AP1A 3C0BA 1KAZA 3EKUA 4BRGA 2QWMA 3JS6A 2Q2RA 2A42A 3B8AX 3HI0A 4WYBA 3W0LA 3WEEB 5JLFA 3VEWA 4JD2A 5AQOA 3EO3A 4H5NA 1HKGA 1JCEA 3J8AA 4FWOA 2GELA 4H0YB 1HPMA 1MWMA 2QWNA 1QZ5A 1ZXOA 1NGHA 1HKCA 2E1YA 2YCHA 5BPNA 3RSEA 2Q31A 1NGFA 1NLVA 1SQKA 3D7EO 3O1BA 2P9UB 1QZ6A 3O1WA 4FSVA 4B1ZA 2PAVA 5AZIA 5AQZA 2FSKA 3FFKB 1MWKA 1GLAG 5FPDA 1X3MA 4BG9A 3VEXA 1BUPA 3GBTA 2A6AA 4BRKA 4PL7A 3A5OC 3UE5A 4I6MB 4C23A 1BA0A 5F1XA 3D2FA 1YAGA 2GWJA 2ZF5O 4BRIA 5FPEA 3QBXA 1NGJA 4MO4A 2Q0UA 2WUSA 3U8XA 3UKUB 1CZAN 3AAQA 2CGLA 1ATNA 3WXLA 3MDQA 2GWKA 3ATUA 4FWSA 1HJOA 3AAPA 4B1YB 3ZEUA 5JICA 5AR0A 4XH4A 1J6ZA 2FSJA 3DJCA 4BGBA 3BF1A 1ATRA 1K8KB 2CGJA 3CIPA 3MCPA 5F0XA 3H3OB 1NGGA 4QS9A 2E20A 1BU6O 4M63C 1MDUB 1S22A 1E4GT 2IVOA 1Z6RA 4FWRA 3H1VX 4EHUA 4RTFD 4DHYA 1NGBA 2QWLA 5AQRA 4FPAA 3SMPA 3SMSA 3WEEA 2D0OA 1RFQA 3ZX3A 2A5XA 1ZBSA 1HKBA 5LJWA 4B1VA 1E4FT 4A62A 5AQWA 3ID8A 2YHYA 3VEOA 4E1JA 4FWKA 3MMVA 1GLEG 2A40A 3D2EB 1NMDA 3CJ7A 3MK6A 2P9UA 3QB0A 4DB3A 4EIAA 4Z94A 5AQSA 4QS8A 3SK3A 3MN5A 3BF3A 4BR4A 4BROA 3A5LC 2PBDA 3DAWA 5AZJB 3GL1A 4ISFA 1QQMA 1XUPO 4BR9A 5EY4A 5CE3A 1T6CA 4IO8A 4I6MA 3UB5A 4H0XB 3BEXA 1V4SA 1R59O 5TKYA 5BR9A 1XQSC 4BR2A 1NGAA 5KPZA 4WQ4C 3DWLA 3UKUA 1BDGA 1IJJA 5KQ8A 2QWQA 4H5WA 4PL8A 1HLUA 4BRQA 2P9SB 1OKJA 3S41A 2FLOA 4BVOA 4FWNA 2ASMA 4IJAA 4IZ9A 1QQNA 1K8KA 3A5NC 3A0IX 4B9QA 3VESA 1TYQB 2QW9A 5EVZA 3GOIA 4CZJA 4HTLA 3IMXA 5AQKA 1Y64A 4PKGA 4FWLA 4CZMA 1QQOA 4FWQA 3QBWA 4BC4A 3U9DA 3VGLA 1U6ZA 3GDQA 2D4WA 3IUCA 4FOIA 1ATSA 3HZ6A 2IIRA 4M7YA 2YHWA 2BTFA 5KPTA 3CJ1A 2FSNA 3LL3A 2V51B 2I7PA 3D2EA 3WXKA 4BRMA 2OANA 1G99A 4B1WB 4CZFA 2CH6A 3FZKA 2H3GX 3CJAA 5AZJA 1BOTO 2YHXA 1DEJA 4K42A 1GLLO 4BRFA 1V4TA 3A8YA 3ZETB 2FXUA 3L4IA 5E84A 4YDUC 1H1VA 4CBXA 2D1KA 5JLHA 4NB4A 3CHWA 1HX1A 2E2NA 3IDHA 3FGUA 4BQZA 5KPRA 5E26A 3DXKB 3EL2A 3VF2A 4XH5A 3SLCA 4NO7A 4BR5A 4AM6A 2P9SA 3CJBA 1TUUA 2QWRA 1NGCA 4WQ5C 4QS7A 1P8ZA 5AQXA 4K25A 1RDWX 3JXUA 4H5VA 3M6GA 4XH1A 4EFHA 4BRLA 3BP8A 1SAZA 1TYQA 4CI6A 2P9PB 3VEYA 4A2AA 4RCHA 1BO5O 3LDLA 3FZLA 2V7ZA 1BG3A 1U2VB 2F9TA 2AA4A 3SJHA 2I7NA 2VYPA 3WQTA 1C0FA 5BRDA 3QICA 4H5RA 3IFRA 3VERA 4O8KA 5AFUA 4BQLA 1NGDA 1SZ2A 1Z05A 3VGMA 4BC3A 4F9OA 2E88A 2HMPA 3UKRB 3KVGA 2DPNA 3O4WA 5BN9A 3LDNA 4K43A 5AQMA 3O8MA 4ISEA 1GLFO 2FF6A 4BRDA 4BRPA 3F9MA 4H03B 4CBUA 1JCGA 1GLCG 3O80A 1DGKN 3CETA 3ZETA 4DQ8A 3H1QA 4FL9A 2P9NB 3WT0A 2HOEA 3FR0A 4LC9B 5BN8A 5I9EB 1GLDG 2F9WA 1XC3A 5B8HA 3TPQA 4MLHA 4DCHA 2V52B 3H46O 2Q36A 3R9PA 3DXKA 2EWSA 5AQJA 3GG4A 2ZGYA 1YVNA 2P9IB 2HF3A 4MO5A 2NRHA 2YJEA 3KZBA 3WUHA 3LM9A 4CJ7A 4EAHD 3L6QA 3FLCO 3FZHA 3ENHA 4IJNA 3DXMB 3VF6A 4CZGA 5EXWA 3VPZA 3ZX2A 3VENA 3QDKA 5AQFA 5AQTA 1C0GA 3M1FA 3U4LA 2IVNA 2P9PA 3VETA 4BG8A 2E8AA 4BC2A 4BREA 4RWTA 1BA1A 1U2VA 4XEIA 1KXPA 3FE1A 5ADXA 3H45C 3MN6A 4A61A 5FPMA 4JN4A 2Q97A 3VF4A 1ZC6A 4K41A 4JHDB 3QFPA 1LOTB 1WUAA 4FO0A 1WOQA 1X3NA 5AQQA 3CJ9A 1TUYA 4BGAA 1BWFO 2E2PA 5AQNA 2J4RA 3H3NO 4H0PA 4O5FA 2W40A 3QMLA 3UKRA 3HM8A 5ELZA 5FPNA 1X9JA 1GLBG 3CI5A 2A3ZA 1GLJO 3CJCA 4CD1A 3M3ZA 3R6MA 3G25A 4B1UB 2ASOA 4FWMA 4EHTA 5EOYA 4CZKA 3CQYA 4H0OA 3KHYA 2HF4A 3ZX0A 2QXLA 5AQHA 1QHAA 2ZWHA 2P9NA 4L3QA 4WQ4A 2E2QA 3MN9A 3C7NB 1RGIA 3VOVA 4CD3A 3OHRA 4KBOA 4BRCA 1T44A 1D4XA 3GE1A 3ULEB 3VGKA 3AY9A 4JAXA 5AQLA 4BRHA 2QWOA 3EZWA 2UYTA 2P9KB 1DKGD 2P9IA 2GUPA 3WXJA 3O08A 4BRNA 4A2BA 2P9LB 4BR0A 3U9ZA 1HUXA 4CZEA 3DXMA 3HBTA 2NZTA 1ESVA 3LM2A 1T6DA 3I33A 4HWIA 1YXQA 3LDPA 3HSCA 5BREA 3A5MC 4AM7A 1LCUA 4H5TA 3I8BA 3QFUA 4GNIA 1NM1A 2Q1NA 5AQUA 4MLEA 4Y0WA 3MN7A 4CZIA 1NGIA 3ENOA 2YJFA 3WQUA 3AARA 4PKIA 2IVPA 4JHDA 3VEVA 5AFUH 1NWKA 4BVPA 5BPLA 2YI1A 1Q18A 2D0PA 5LY3A 1MA9B 3BUZB 5EX5A 2Q0RA 3EKSA 2ITMA 1YUWA 4JD2B 2V7YA 2W41A 4J8FA 2ASPA 2ZGZA 1KAYA 5BRFA 4H0TB 4FPBA 3CERA 3ATVA 4GY2B 4YDUA 4BR7A 4BRAA 3TU5A 3RSEB 2E2OA 4PKHA 2E1ZA 4IXCA 5LJVA 2KHOA 5AQPA 5AZIB 4CZLA 3FZMA 2CH5A 3H6EA 3C7NA 4FWPA 1JCFA 3L0QA 5AQVA 3ULEA 3WXIA 5AQIA 5AQGA 2FF3B 4WQ5A 5F2RA 4H0VB 3LDOA 4CBWA 4ISGA 2NLXA 2P9KA 2BUPA 3D2FB 4CZHA 2CGKA 3HTVA 5JMVA 3FZFA 2GTDA 3R8EA 4JNEA 1S3XA 5KQDA 1NBWA 2P9LA 1KAXA 3O5BA 4BC5A 4B1XB 2QWPA 2GEMA 3P4IA 3VEZA 5ADXH 2QM1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I7FA 5HROA 1IG8A 3SNNA 3FFIA 3ZYYX 1NGEA 2VCPA 3W3DA 4FOEA 2YX6A 4F8RA 4DS4A 3AVHA 1R0AA 4JK9A 5BPMA 3C0BA 3SAGA 3EKUA 2KKZA 3JS6A 4BRGA 2Q2RA 3J7AP 3B8AX 3AVFA 4WYBA 4IOAL 4DTUA 3WNFA 3LAMA 3MECA 4JEPA 1HKGA 1JCEA 4M3RA 1HPMA 3RMCA 5HP1A 1QZ5A 3M8QA 1KQSM 3MXMA 1CZBA 3OYBA 3RSEA 4QAGA 3O1BA 4IG3A 1RTJA 2FSKA 4BG9A 4CIFA 3DRPA 1BUPA 1I6FA 4PL7A 4L8RB 3UE5A 1QQCA 4CFAA 1BA0A 3CC7N 1YAGA 3E9LA 1FKOA 2VGMA 1CN2A 4BRIA 4YFUA 3QBXA 4CJVA 4BECA 1VQNN 3ZSZA 3PY8A 1VQ6N 3T7ZA 2E3FA 1I39A 4O5BA 2CGLA 3WXLA 1RT6A 1T03A 1HNIA 4B1YB 3QEVA 3LANA 1C55A 3I56N 5JICA 4PA1A 3P39A 2FSJA 3I0SA 1ATRA 3MCPA 1N6QA 1TKDA 1NGGA 3ZSQA 3M8PA 2HVIA 5FROA 5I3UA 1MDUB 2MBKA 3TAQA 3HVTA 4FJKA 3ZLJA 4RTFD 2QWLA 3MXIA 3ZX3A 1RDCA 3MXJA 1ZBSA 4AHRA 1HKBA 1N36K 1GOAA 1HNZK 5AQWA 3QEXA 3L2VA 2YHYA 3F2KA 1GLEG 1SL0A 4DB3A 4CCHA 3Q7BA 1ZBHA 3IAYA 2B4JA 2IAJA 3ZSWA 3A5LC 1FKPA 3DAWA 2WBNA 2IOCA 2PY5A 2G8UA 1VSMA 4CJWA 1VSHA 1VQ7N 1WN7A 1ZVGA 1YJNN 4I6MA 2KZMA 1OVYA 4ICLA 1LWEA 2NUBA 4DV2K 2N69A 1SKWA 4WQ4C 4R5PA 1KTQA 1M1KO 1BDGA 1N32K 4CEOA 1HLUA 3O9UA 2HMIA 4HCCA 1JLCA 3LP2A 3CD6N 2GBZA 3R2VA 1UA0A 4E89A 3L2UA 1VSLA 1K8KA 1YHQN 1S6QA 2DTUA 4KB0A 3VQQA 3VTHA 5D3GA 2QKBA 4CJPA 3KP1A 4CZJA 3IMXA 5A2QO 4AAZA 3SUQA 3VTIA 3HPGA 1A5WA 4FJ5A 4W5NA 4BC4A 3U9DA 4FK0A 4GV6A 1K8BA 3GDQA 2LSNA 2F8TA 3ZT3A 4B08A 3KK3A 3HZ6A 5MLCQ 2YHWA 4AQYK 2BTFA 4R79A 4AEIA 3CJ1A 2FSNA 3HSTB 3DLBA 2V51B 1VSEA 1DT9A 1I3AA 1WAFA 3WXKA 1ZYVA 3L56A 4O0IA 4BRMA 4DR6K 3CCLN 1HR0K 1HNXK 4LY7A 1KLMA 1BOTO 1ITGA 3SAFA 4K42A 4DU1A 4CJQA 2IS3A 4BRFA 1ZBIA 1BI4A 1JZAA 3BZCA 1H1VA 4BDPA 3SZ2A 2OTLN 2KLAA 5C2DA 4NXMK 1SUQA 4FLZA 3P83D 5LMNK 2JWLA 3MEEA 3KLGA 1NKBA 4CF1A 3TSQA 3UIQA 4NO7A 3NHGA 2P9SA 3AGKA 4KHUA 3MX2A 2QWRA 1NGCA 2P1JA 3WXMB 1N5YA 4JI6K 1NRAA 4OO1J 1RDWX 3CPWM 4EFHA 5HL7L 3M6GA 1L4VA 1BL3A 1NK9A 2UUCK 2P9PB 1JKHA 4FCYA 1W9HA 3NGZA 3FZLA 1F21A 1N8RO 2AA4A 4JKGA 2VYPA 2YIPA 2QI2A 2PYLA 4IFEA 4DSEA 3AA3A 5C42A 2G8VA 2NY8X 4BQLA 1NK7A 1U47A 3AVMA 1N33K 1ASWA 1TKXA 4OPJA 4BC3A 3ZT1A 2E88A 4UADE 1S1XA 3ASMA 4CJTA 1JL1A 3TAFA 2QKKA 2Y1JA 3RRGA 2DPNA 3DI6A 3O8MA 2FF6A 4BRDA 4BRPA 1VSJA 3PX0A 3HK2A 1X9MA 3ZETA 1A5VA 3OYJA 4ELTA 5BN8A 5M1OA 4EP5A 4X66K 4DCHA 2G8WA 1VSDA 2KBKA 3DXKA 5HRNA 3ZT2A 3V9ZA 2ZGYA 1IBKK 3LWMA 3QI7A 3KWIA 4MO5A 2C1IA 2NY9X 2WFBA 3DXMB 5EXWA 1POIA 4JKEA 3VPZA 4FJMA 4A57A 5AQFA 1C0GA 3U4LA 1JLAA 2LY6A 4CK1A 3THVA 3NCIA 1U2VA 4XEIA 3J7YP 2NNWA 4MDBA 4A61A 4CGDA 3VF4A 4K41A 1BRZA 5CY0A 4JHDB 4JI7K 1FJGK 1WUAA 1KLNA 3K5LA 1PX9A 4DR1K 1WOQA 3LPTA 5GAEP 4RW9A 4WFNL 4UAEF 4FJLA 1TUYA 3N4PA 4O0JA 3CFOA 1IKXA 3UKRA 3HM8A 4JKAA 5ELZA 3CCJN 4DTRA 4CK3A 3IRXA 3G25A 4FLYA 4I2QA 4DTPA 4KFBA 3OBWA 1Z25A 3S3OA 4CQKA 4YNQA 4JKFA 4YHHK 3CQYA 1C0TA 1WSIA 2YHBA 4KO0A 3V1OA 2HF4A 4WQ4A 4W5QA 3VOVA 4FLVA 2E5LK 4KBOA 3GE1A 4ILJA 5GAHP 3SQ0A 2NRZA 3ULEB 3AY9A 3OY9A 4JAXA 1EO1A 2UYTA 4JYAK 2NRXA 2P9KB 3WXJA 4BRNA 4CZEA 4YY3K 3OYDA 4CEZA 1ESVA 3NF9A 3S3MA 4HWIA 2ZJPL 3V1RA 4I9LA 3LDPA 3KWGA 1NOYA 1ASUA 3TI0A 1LCUA 5CHIA 4H5TA 3I8BA 4GNIA 3TTDA 3MN7A 1NGIA 3AARA 2WTUA 2IVPA 3VEVA 3E7UX 3CFPA 3CG7A 4DKWA 5BPLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4I7F A;  5HRO A;  1IG8 A;  3SNN A;  3FFI A;  3ZYY X;  1NGE A;  2VCP A;  3W3D A;  4FOE A;  2YX6 A;  4F8R A;  4DS4 A;  3AVH A;  1R0A A;  4JK9 A;  5BPM A;  3C0B A;  3SAG A;  3EKU A;  2KKZ A;  3JS6 A;  4BRG A;  2Q2R A;  3J7A P;  3B8A X;  3AVF A;  4WYB A;  4IOA L;  4DTU A;  3WNF A;  3LAM A;  3MEC A;  4JEP A;  1HKG A;  1JCE A;  4M3R A;  1HPM A;  3RMC A;  5HP1 A;  1QZ5 A;  3M8Q A;  1KQS M;  3MXM A;  1CZB A;  3OYB A;  3RSE A;  4QAG A;  3O1B A;  4IG3 A;  1RTJ A;  2FSK A;  4BG9 A;  4CIF A;  3DRP A;  1BUP A;  1I6F A;  4PL7 A;  4L8R B;  3UE5 A;  1QQC A;  4CFA A;  1BA0 A;  3CC7 N;  1YAG A;  3E9L A;  1FKO A;  2VGM A;  1CN2 A;  4BRI A;  4YFU A;  3QBX A;  4CJV A;  4BEC A;  1VQN N;  3ZSZ A;  3PY8 A;  1VQ6 N;  3T7Z A;  2E3F A;  1I39 A;  4O5B A;  2CGL A;  3WXL A;  1RT6 A;  1T03 A;  1HNI A;  4B1Y B;  3QEV A;  3LAN A;  1C55 A;  3I56 N;  5JIC A;  4PA1 A;  3P39 A;  2FSJ A;  3I0S A;  1ATR A;  3MCP A;  1N6Q A;  1TKD A;  1NGG A;  3ZSQ A;  3M8P A;  2HVI A;  5FRO A;  5I3U A;  1MDU B;  2MBK A;  3TAQ A;  3HVT A;  4FJK A; 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