5AQKA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
b'GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 121
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqkA04
3CETA 4H5NA 3UKUA 4CZMA 3IUCA 1BOTO 3ENHA 4H5VA 4A61A 3IDHA 1NGAA 3F9MA 1X3MA 1QZ5A 3CHWA 1TUUA 4JAXA 1SAZA 2FSJA 3W0LA 4JHDB 4BG8A 5KPTA 5KQDA 1NBWA 4H0YB 1KAZA 2VYPA 4AM6A 3WQTA 3CJ1A 1HKBA 4DQ8A 3VEYA 5ADXA 5KPZA 4XEIA 3LDPA 1Z05A 2ASOA 1KXPA 5BN8A 2P9SB 4MO4A 2AA4A 4AM7A 2E2PA 3FFKB 3UB5A 4K43A 2V52B 1NMDA 4WQ5C 1V4SA 4IJNA 3I8BA 3IFRA 1NGGA 4EHTA 5JLHA 1LCUA 3VERA 1NGCA 3KVGA 1DKGD 3O5BA 4B1UB 3P4IA 2P9PA 4JHDA 1HX1A 4FWNA 3UKRA 3FLCO 2E8AA 2A6AA 2WUSA 4H0VB 1RDWX 3H1VX 3O6WA 5FPMA 2I7NA 4WYBA 1U2VB 4BGBA 2CH6A 4H0XB 3O8MA 3QMLA 5LJWA 2NLXA 1D4XA 3W3DA 1EQYA 3H6EA 2GUPA 4B1YB 4BRHA 2HF3A 3U8XA 3D2EB 3ZETB 4MLEA 4IO8A 5AQPA 1C0GA 2CGLA 4B1WB 4CZJA 3I33A 2NRHA 5I9EB 2IVPA 3DAWA 4DHYA 3IMXA 3TU5A 3L4IA 5AQWA 1GLBG 1HUXA 5AQUA 4BVPA 3G25A 4CZGA 2E1YA 4I6MB 3VETA 4FWSA 2IIRA 3SJHA 2YCHA 1BUPA 3WXIA 4H5RA 1OKJA 3ULEB 5AQFA 3HI0A 5FPEA 3FZKA 1SZ2A 1QHAA 3WUHA 3FZLA 2GEMA 1MA9B 3DXKB 3LL3A 3ENOA 4BRFA 2HF4A 5AQNA 3EZWA 4M7XA 5BRFA 5F1XA 1NGIA 4Y0WA 4BR7A 3D2EA 2GWKA 4GY2B 3ATUA 3VF6A 4BR0A 4BGAA 4PL8A 3QDKA 3LDQA 3H3OB 4FSVA 4EFHA 4B1ZA 4HWIA 2YHYA 3VEXA 4QS8A 4QS9A 4BVOA 2AP1A 4CZFA 4F9OA 1XQSC 1QZ6A 3A8YA 3VF4A 2ZGZA 2QWRA 4EAHD 3CJBA 2E2QA 2HOEA 4JD2B 3MN5A 5E26A 3CERA 4IZ9A 1TYQA 1C0FA 3VEWA 1ESVA 4B9QA 1NGDA 3MN6A 2Q31A 3D2FA 3DXKA 3FE1A 2QWLA 3O1WA 4FWRA 3JXUA 1GLCG 3AY9A 2DPNA 3H45C 3FZHA 2FF6A 1U6ZA 2V51B 4CBWA 4XH5A 1BA0A 4FPBA 1IG8A 5LJVA 4O5FA 3SMSA 2P9NB 1GLDG 3FR0A 3O1BA 1Q18A 5AQMA 2P9PB 3B8AX 2OANA 2E20A 1TUYA 4LC9B 5AZIB 3UKRB 5AR0A 1K8KA 3CJ9A 3WQUA 4IXCA 1WOQA 2QWNA 1GLEG 1NM1A 2VWBA 3KHYA 1BA1A 4A2AA 1ATRA 4BC2A 4EHUA 2GTDA 1NGHA 1QQMA 2Q0UA 2ASPA 3EO3A 3QBXA 4JD2A 2E2OA 2P9LB 5F0XA 5EY4A 3FZFA 3U9DA 4Z94A 1BDGA 4CJ7A 1BWFO 2QWPA 4PKHA 5AFUH 2ZGYA 3WXJA 5AQSA 3LDLA 4BR2A 2Q97A 4FO0A 4ISFA 4DB3A 4HTLA 1KAYA 2CGKA 4BRQA 3KZBA 4PKIA 2P9NA 3A0IX 1GLAG 5AQIA 4O8KA 5AZIA 2ITMA 5BRDA 1ATSA 2P9UB 2NZTA 4PL7A 3QFPA 1MWMA 4WQ5A 4B1XB 2YHWA 4BRLA 3UE5A 4H0OA 4M7YA 3HZ6A 4BROA 3EKUA 3QBWA 4E1JA 2P9LA 3AARA 2UYTA 1DGKN 5AQXA 5AQVA 1Y64A 3WT0A 4IWVA 3VOVA 3MN7A 5FPDA 3U4LA 5BPNA 4BQLA 2QWQA 2QXLA 4MLHA 5AQTA 1ATNA 1GLJO 2J4RA 4H03B 1LOTB 3BF1A 4K41A 4CI6A 3HSCA 4FWMA 1BG3A 5CE3A 2H3GX 2P9KA 2VCPA 3VESA 2P9UA 3AAPA 3QICA 4CZEA 4A2BA 4BREA 2E2NA 1T6DA 1TYQB 2E88A 3M1FA 5AQOA 4FL9A 3J8AA 3D2FB 5JMVA 5AQKA 1YXQA 3GOIA 4BRKA 2YJEA 3VENA 1IJJA 2QW9A 5BPMA 3BF3A 5FPNA 4ISGA 3DXMB 4FWOA 3O08A 3LM9A 5AQQA 3CJ7A 4B1VA 3AAQA 4FWQA 5JICA 3FGUA 3OHRA 4RCHA 4YDUC 4CD3A 2BUPA 4WQ4C 2IVOA 2YHXA 4NB4A 5AFUA 5B8HA 1S3XA 1K8KB 2A42A 2ZWHA 4CZHA 3GDQA 5AQLA 3C0BA 1XC3A 3GE1A 3R9PA 4A62A 5BREA 4ISEA 3H46O 5BR9A 1NLVA 2Q1NA 5JLFA 4BRMA 4RWTA 1SQKA 1YUWA 5F2RA 2Q36A 1BO5O 3CJCA 3C7NB 3DXMA 1HLUA 3H1QA 1NWKA 4BRNA 5EXWA 2E1ZA 5BPLA 3HBTA 3VF2A 1MWKA 2F9TA 2D0OA 4RTFD 3CQYA 3SMPA 3GL1A 3BUZB 2FSKA 2QWOA 4CZLA 2D4WA 5TKYA 3QFUA 1S22A 3M6GA 5AZJB 3BP8A 3H3NO 4M63C 4KBOA 2QM1A 2A5XA 3O4WA 5EX5A 1JCEA 3RSEA 5AQJA 3MN9A 4IJAA 2Q2RA 2Q0RA 3QB0A 2HMPA 1BU6O 2FLOA 2YJFA 1CZAN 3DWLA 3LM2A 3L6QA 4BR9A 3JS6A 4NO7A 5EVZA 3A5NC 2P9IA 1ZC6A 1NGEA 4BQZA 3C7NA 5AQYA 4K42A 4BRAA 1E4FT 3EN9A 1QQOA 4H5WA 3A5LC 5BRHA 1T44A 2A3ZA 3LDNA 4BRCA 4DCHA 3SK3A 2PBDA 2P9KB 3MK6A 1R59O 5AZJA 5AQRA 4JN4A 3ZEUB 3SLCA 3WEEA 2V7YA 3VPZA 3CI5A 3MDQA 3R6MA 1YVNA 1NGFA 2CGJA 2QWMA 4BC4A 1J6ZA 4K25A 3CJAA 5ELZA 2D1KA 4BR4A 1GLLO 4FOIA 1WUAA 5AQGA 1GLFO 3BEXA 3U9ZA 2CH5A 3VEVA 3MCPA 4PKGA 3HTVA 3MMVA 4CZKA 4FWKA 2YI1A 3M3ZA 2A41A 3VGMA 3VGLA 3GG4A 1KAXA 4H0TB 1E4GT 3LDOA 3CQXA 3A5OC 3EKSA 3ATVA 3WXKA 4CBUA 2P9SA 2F9WA 3DJCA 4BG9A 5KPRA 1DEJA 1HPMA 3WXLA 1NGBA 3ZEUA 3O80A 1HKCA 4GNIA 1RGIA 3ID8A 2A40A 1NGJA 4BRDA 4FOEA 5ADXH 1MDUB 2D0PA 2W41A 3CIPA 1JCGA 4C23A 2W40A 4XH1A 1P8ZA 2ZF5O 3TPQA 3R8EA 1XUPO 4CD1A 2PAVA 2V7ZA 1U2VA 1RFQA 4BRIA 4CBXA 4EIAA 3VEZA 4CZIA 3RSEB 3ZX2A 2FF3B 1V4TA 4XH4A 3ZX3A 3A5MC 3EL2A 1QQNA 1ZBSA 3UKUB 4YDUA 5LY3A 3ZETA 1Z6RA 2BTFA 2GELA 5EOYA 1X9JA 4H0PA 4J8FA 4MO5A 3VGKA 4WQ4A 4BC3A 1H1VA 4BR5A 3D7EO 4L3QA 1HKGA 2P9IB 4FPAA 1X3NA 1HJOA 4FWPA 1YAGA 2I7PA 2ASMA 5BN9A 4QS7A 1ZXOA 5AQHA 2EWSA 1T6CA 3HM8A 4I6MA 4JNEA 3FZMA 2IVNA 4FWLA 4BRGA 4BRPA 3GBTA 3S41A 2FXUA 4H5TA 3ULEA 5KQ8A 1G99A 3L0QA 2KHOA 2GWJA 3WEEB 3ZX0A 4BC5A 2FSNA 5E84A 3VEOA 1JCFA 5AQZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CYMA 3IUCA 2E5LK 3BK3C 1NGAA 3F9MA 1X3MA 1N34K 1JLBA 4HUFA 1LQQA 2FSJA 3SBTA 4KTWA 2KSKA 4H0YB 3THYA 3SJJA 1KAZA 4FJNA 4TSXA 2VYPA 1NKBA 4AM6A 3VQ7A 3C95A 4JKAA 1LWEA 2MBKA 1ZBIA 2KBKA 5KPZA 1YHQN 1M1KO 4RW7A 4AM7A 4FZYA 2RE2A 3PX6A 3UB5A 3OYIA 3IFRA 2IAJA 4DSJA 4EHTA 1LCUA 2F8SA 3ZSZA 3KVGA 4HHFA 1DKGD 4JS4A 3L8BA 5DMRA 3SUOA 2WUSA 4H4MA 3KLHA 4BGBA 4LH4A 4E7HA 3DLHA 1PE4A 5LMUK 4LFAK 3IRXA 4KPYA 2VGNA 3SNNA 4E3SA 4B1YB 5C0YA 4CJFA 4OJRA 5MLCQ 3S5TA 1RTHA 4IG0A 3J7AP 3SPZA 1HNIA 4HUGA 3NH0A 3NAEA 1SV5A 2BE2A 3AA4A 3P1GA 3R1XA 4DHYA 1LW0A 3IMXA 1N8RO 2PYLA 5AQWA 1GLBG 4CEBA 1YTAA 2UXCK 2YNFA 1KLMA 3DLEA 4AB0A 5AQFA 2XHBA 4DV2K 4B9LA 5FPEA 3ULDA 1IBLK 2G8UA 4CGHA 2PY5A 1MA9B 3DXKB 1QTMA 4UY8O 4B8AB 3LP2A 3C6HA 3KLFA 4M7XA 2LN8A 3VTHA 4GVMA 4YOTA 3NCIA 2GWKA 4DQPA 3ATUA 1SEGA 3SBGA 1QQCA 3SV4A 3LPTA 3QDKA 4B9MA 4E89A 1RDCA 4DR4K 1HNWK 5KK4A 3VEXA 4QS8A 3CMAN 2ZGZA 3FFIA 4MDBA 1D9FA 5E26A 4KI6A 1TYQA 4B9QA 1NGDA 1EXQA 2ZJQL 1SKRA 3D2FA 3VQ9A 3FE1A 4NCGA 2BH1A 2DPNA 2V51B 4CBWA 4XH5A 4Z4FA 5KI6A 1VSEA 4DS4A 3FR0A 2BDPA 5J2NA 3B8AX 1TUYA 3UKRB 4IXCA 3KC6A 4FK0A 1J5EK 1UA1A 1NM1A 4NXNK 4QAGA 5HBMA 4BC2A 1QQMA 3EO3A 2E2OA 3OBWA 5F0XA 3U9DA 4JLHA 1IKVA 3SQ2A 2DY4A 1BDGA 3VA3A 1G15A 2QWPA 5HRPA 2YIPA 3LDLA 3R2VA 3K59A 5LMNK 4B9UA 2OPPA 2Q97A 3QNNA 4KB1A 3F73A 4DB3A 4HTLA 2N66A 1TKXA 4RW4A 4E1NA 1HMVA 2P9NA 3A0IX 3SUQA 1YJ9N 4DTJA 1TKDA 2WONA 1ZYQA 3E9OA 5KGXA 3KD5E 3E01A 1IKXA 4PL7A 1MWMA 2NUBA 4JI2K 1OH6A 4H0OA 3CCVN 4M7YA 1REVA 3LWMA 4E1JA 3AARA 1DGKN 2G8FA 5AQVA 3OYJA 4FW2A 5FLXO 1JJ2M 4LSLA 4W5TA 2QWQA 2LJMA 4F3OA 2O8BA 3PSMA 1VQPN 4N56A 4DG1A 4JKCA 2G8VA 1ZVEA 1GLJO 4ELVA 3EYZA 2WC9A 1KVAA 2B68A 4DLGA 5CE3A 2E3GA 1C55A 1ZUTA 5J2MA 2VCPA 3AVHA 2P9UA 3DLLL 4AHRA 1T03A 4A2BA 3KOXA 4CJKA 2E2NA 3QEXA 1TK0A 5AQOA 4DR3K 3CC2N 4NCAA 4CF9A 4UADE 3ZT1A 4E19A 4PY5A 3KKSA 2NRVA 2PZSA 1RBUA 3E9LA 4L8RB 4DR6K 3LM9A 2HHXA 4UJ0A 4MQ3A 1BCOA 3C6TA 5JICA 4RCHA 3U3YA 4CD3A 2X78A 4EZ6A 3VQPA 2RPIA 4FW1A 5GIPA 3DOKA 4JEPA 4YNQA 2GV9A 5B8HA 4BE2A 2A42A 4CZHA 3GDQA 2KYQA 5AQLA 1RT3A 1NK6A 3I56N 4BDPA 4LH5A 4C8KA 4OPHA 1FKPA 4A59A 2VQEK 5GAHP 4CJSA 2GUIA 4ISEA 4CJUA 1W97L 5C25A 2O8CA 1X9SA 2VWKA 4J2AA 3RWUA 1JKZA 1K9MO 4M3UA 4I9LA 4CGJA 3H1QA 3KTQA 3G71N 4M3TA 1T1TA 2E1ZA 3U3GA 1QVFM 5BPLA 2ZQBA 3VF2A 3SMPA 5HOOA 2FSKA 2QWOA 2OA8A 3RR7A 3M6GA 5AZJB 3RVCA 3LAMA 3CW4A 4OLBA 2KQ2A 3HVRA 3K5MA 1JLQA 2A5XA 1HPZA 5EX5A 5AQJA 4IJAA 3OYNA 2YJFA 2HMIA 1YJNN 1CZAN 3DWLA 4AHSA 4CESA 3L6QA 3MWPA 4BR9A 4Q0BA 3THWB 5KTQA 2HBMA 3A5NC 4CIFA 3CQ8A 1ZC6A 1BL3A 4BQZA 2LKBA 3C7NA 4BRAA 1Q8IA 4FJ8A 3TANA 1T05A 4B3MK 2QKBA 1RDDA 3EN9A 4ICLA 2F7TA 3L4QA 3CFRA 3TSPA 2ASCA 3MK6A 1WMTA 1EKEA 1NE5A 1HRHA 3SLCA 3TARA 4W5NA 5M1KA 3VPZA 4E7IA 3T3FA 4B3SK 3LP0A 4FLTA 3HXMA 2FBYA 3O3HA 4CECA 4XJXA 4BR4A 2RN2A 3PLAA 1A5WA 1WUAA 4FLXA 5AQGA 1GLFO 1HYVA 3BEXA 5KGWA 4CFCA 3MX2A 5J2PA 3MCPA 1B9DA 1AHOA 1IKWA 1L3VA 2UU9K 1YT3A 4FWKA 1C6VA 3TAPA 4M42A 4WFAL 5JVGL 4CF2A 4GV9A 3LP1A 4X65K 4O0IA 2KBHA 1E4GT 3CQXA 4CBUA 3ATVA 2F4VK 5JVHL 4ID1A 4RW8A 5GIOA 4EP4A 1MU2A 5KPRA 1LQHA 2JGUA 3MWTA 4GNIA 3CCJN 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3CYM A;  3IUC A;  2E5L K;  3BK3 C;  1NGA A;  3F9M A;  1X3M A;  1N34 K;  1JLB A;  4HUF A;  1LQQ A;  2FSJ A;  3SBT A;  4KTW A;  2KSK A;  4H0Y B;  3THY A;  3SJJ A;  1KAZ A;  4FJN A;  4TSX A;  2VYP A;  1NKB A;  4AM6 A;  3VQ7 A;  3C95 A;  4JKA A;  1LWE A;  2MBK A;  1ZBI A;  2KBK A;  5KPZ A;  1YHQ N;  1M1K O;  4RW7 A;  4AM7 A;  4FZY A;  2RE2 A;  3PX6 A;  3UB5 A;  3OYI A;  3IFR A;  2IAJ A;  4DSJ A;  4EHT A;  1LCU A;  2F8S A;  3ZSZ A;  3KVG A;  4HHF A;  1DKG D;  4JS4 A;  3L8B A;  5DMR A;  3SUO A;  2WUS A;  4H4M A;  3KLH A;  4BGB A;  4LH4 A;  4E7H A;  3DLH A;  1PE4 A;  5LMU K;  4LFA K;  3IRX A;  4KPY A;  2VGN A;  3SNN A;  4E3S A;  4B1Y B;  5C0Y A;  4CJF A;  4OJR A;  5MLC Q;  3S5T A;  1RTH A;  4IG0 A;  3J7A P;  3SPZ A;  1HNI A;  4HUG A;  3NH0 A;  3NAE A;  1SV5 A;  2BE2 A;  3AA4 A;  3P1G A;  3R1X A;  4DHY A;  1LW0 A;  3IMX A;  1N8R O;  2PYL A;  5AQW A;  1GLB G;  4CEB A;  1YTA A;  2UXC K;  2YNF A;  1KLM A;  3DLE A;  4AB0 A;  5AQF A;  2XHB A;  4DV2 K;  4B9L A;  5FPE A;  3ULD A;  1IBL K;  2G8U A;  4CGH A; 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