5AQKA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 121
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqkA04
3M1FA 2HMPA 1V4TA 1GLFO 3L4IA 3P4IA 1HX1A 3IFRA 4IO8A 2E1ZA 2YHXA 4FO0A 3LM2A 2FXUA 4YDUC 1LCUA 3WEEA 1BO5O 1HLUA 1JCGA 1IJJA 1U2VA 4H0XB 1LOTB 2ITMA 3VESA 2I7NA 1HKCA 4BRNA 5AQZA 1H1VA 2ZWHA 1D4XA 4BRPA 4H0PA 3QBWA 3FZHA 1BG3A 4BC4A 1C0FA 3DWLA 3KHYA 1X9JA 3VOVA 4FOEA 1NGIA 1X3NA 2P9IB 2V52B 2GELA 4B1YB 5KPZA 1TUUA 3F9MA 3EL2A 4H0TB 2V7YA 1HPMA 1TUYA 3VEWA 2Q1NA 1ZBSA 4AM6A 4DB3A 1HKGA 4GNIA 4EHTA 4DCHA 1RDWX 1BA1A 2ZGZA 3A5OC 3CJ7A 4FWNA 5E84A 4WQ4C 4BR7A 5AZIA 3I8BA 3RSEA 2ASOA 1YAGA 1T6DA 1MWMA 3BF3A 4NB4A 1IG8A 1MA9B 2P9KB 5LJWA 3FR0A 4BRKA 1BU6O 4BRDA 3AAQA 4XH5A 5KPTA 4K42A 4CZIA 2I7PA 1X3MA 3LDNA 3A0IX 4M7XA 4BR4A 3ZEUA 2P9UA 3WEEB 2QWNA 3U4LA 4FWQA 4BR5A 2ZF5O 2ASPA 4FPAA 5AQVA 1NGJA 1ESVA 4CJ7A 1DKGD 2FF3B 1QZ6A 3FFKB 3ZX3A 3H46O 3FLCO 3WQUA 4CBXA 1Z6RA 2J4RA 4PKGA 2BUPA 4H0VB 4BRHA 5AQPA 3GE1A 3WXLA 5AQUA 4H5VA 2YJEA 2QWPA 2ZGYA 4BGBA 4BC2A 1V4SA 5ADXA 1HJOA 3ENOA 1GLLO 4YDUA 3UB5A 2FLOA 2D1KA 3ULEB 3IDHA 2AP1A 3EKUA 3HTVA 3R8EA 4CZLA 5BRHA 3H1VX 3EZWA 5BRFA 5AQNA 5JLHA 3U9DA 4B1UB 2QWLA 2P9PA 3W3DA 2QM1A 3O80A 3MN5A 2FF6A 3ATVA 3UKRB 1S3XA 2VWBA 1YXQA 3S41A 5AQHA 3MN9A 1ATSA 3WXJA 2F9WA 3LM9A 4MO4A 5CE3A 4HTLA 3WQTA 4BRQA 1EQYA 3EO3A 4C23A 2DPNA 2VYPA 2OANA 4JAXA 4B1XB 3ZEUB 1T44A 4EFHA 2YI1A 1ZC6A 4MLHA 4PL8A 4BROA 5EX5A 3O08A 3FE1A 3A5MC 1Q18A 4H5WA 2YHYA 4RCHA 1BA0A 3MN7A 4WQ4A 1BOTO 2FSKA 3A5NC 4JD2A 3VGMA 1KXPA 3LDPA 4H03B 1MDUB 4BR0A 1BDGA 2E1YA 1NLVA 1ATNA 1KAYA 4PKHA 4XH4A 3WXIA 4WQ5C 2Q97A 2QWRA 3LDOA 3BEXA 1NBWA 2A5XA 3CJCA 1YVNA 4ISFA 3VF2A 2UYTA 3D7EO 3QBXA 5EY4A 3A8YA 4BG8A 4DQ8A 3VEXA 5TKYA 2HF3A 5AQXA 3SK3A 4JN4A 2P9PB 1NM1A 2A40A 3W0LA 3U8XA 3VEOA 2QWMA 2CGJA 1ZXOA 4K43A 4BR2A 3QB0A 3HM8A 1QQOA 3O5BA 2FSJA 3MK6A 4FWLA 4F9OA 5AQRA 3BF1A 4BQZA 4JNEA 4A62A 3CERA 3ULEA 5BR9A 5F2RA 1C0GA 4I6MA 4A61A 5AQLA 2QWQA 1KAZA 2V7ZA 3DAWA 1RGIA 4RTFD 4MLEA 1WOQA 3UKRA 2GEMA 3VGKA 3FZMA 2EWSA 2GTDA 3VEZA 2FSNA 2IVPA 3B8AX 3ENHA 3G25A 4EIAA 4JHDA 3H3OB 3D2FA 2V51B 3C7NA 3OHRA 4EAHD 3D2EB 3J8AA 4JD2B 2E88A 3CIPA 1TYQB 3M3ZA 3A5LC 3CI5A 3LL3A 2BTFA 2E2NA 4IWVA 4QS7A 3MDQA 2A41A 3QDKA 2PAVA 4BVOA 2H3GX 4FSVA 2YJFA 3ZETB 4CZKA 4CZEA 4BGAA 2F9TA 3L0QA 4CI6A 4RWTA 1SZ2A 4BRFA 4DHYA 2YHWA 2NLXA 4BG9A 4CZJA 1ATRA 3QFPA 2VCPA 4K25A 3AAPA 4CD3A 5JLFA 2Q2RA 3WXKA 2WUSA 4GY2B 3VEVA 4WQ5A 5AQWA 4B1VA 1Y64A 3VERA 3VPZA 1GLBG 4EHUA 4FL9A 2ASMA 3R9PA 3MN6A 4CD1A 4I6MB 1QHAA 2QWOA 1XQSC 3VGLA 1GLAG 1GLDG 3KVGA 4BQLA 5EVZA 3C0BA 5AZJA 4BR9A 4O5FA 5KQ8A 3EN9A 4B1ZA 1GLJO 5AQYA 1NGCA 4BRMA 4CBWA 3CJ9A 3CETA 1NGAA 4JHDB 5EXWA 3D2FB 3C7NB 1JCEA 5AQTA 5AQOA 4Y0WA 2HOEA 4BRLA 2NRHA 4Z94A 4HWIA 5AQFA 3FZFA 1SAZA 3CJ1A 3DXKB 4B9QA 1E4FT 4BRAA 5LY3A 4CZHA 1K8KA 2CGKA 1CZAN 4XEIA 4ISEA 3VF6A 4IJNA 3VEYA 5AQJA 2NZTA 4KBOA 4FWKA 3D2EA 5E26A 3WUHA 4M7YA 1HUXA 4FWOA 1TYQA 2Q0RA 2GUPA 3KZBA 3R6MA 1GLCG 5KPRA 3UKUA 3CJBA 3O4WA 5B8HA 2HF4A 3ZETA 3CJAA 3AY9A 3TPQA 5BN8A 1NWKA 3BUZB 3HBTA 5BRDA 3FZLA 4CBUA 1R59O 3DXMB 2P9NB 3U9ZA 1MWKA 3H45C 3SMPA 5KQDA 1XC3A 3M6GA 5AFUH 3SMSA 5FPMA 3DJCA 3O1BA 4WYBA 5JMVA 4BRIA 5AZJB 5LJVA 3O6WA 4B1WB 2D0PA 3L6QA 1QZ5A 5AQMA 2A42A 5BPLA 4A2BA 1OKJA 3I33A 5FPEA 5EOYA 2P9SB 3EKSA 1NGHA 2IVNA 2E2PA 3UE5A 3GDQA 2YCHA 4FWMA 3SJHA 1NGGA 3CHWA 1K8KB 1Z05A 4L3QA 1DEJA 2E2QA 2D0OA 4AM7A 1BUPA 5ADXH 5F1XA 3ZX0A 3O8MA 3LDLA 4XH1A 1E4GT 1RFQA 1P8ZA 1S22A 2QW9A 3QMLA 4M63C 2PBDA 2AA4A 3DXKA 5ELZA 3UKUB 4H5TA 4LC9B 4H5NA 3AARA 3GL1A 1J6ZA 2IIRA 5BPMA 1G99A 3TU5A 2W40A 4QS8A 5AFUA 4BRCA 3BP8A 1GLEG 3VETA 1SQKA 4A2AA 3SLCA 2GWKA 3IUCA 4PL7A 5AQGA 5FPDA 3ZX2A 1U2VB 3HSCA 2P9LA 1NGEA 4MO5A 1NGDA 1KAXA 4ISGA 1YUWA 3DXMA 2P9NA 1QQMA 4FPBA 2CGLA 3JS6A 4E1JA 4CZFA 3HZ6A 2Q0UA 4FWRA 1QQNA 2E2OA 1BWFO 1NGBA 4IZ9A 4BVPA 1T6CA 5FPNA 1HKBA 1NMDA 2GWJA 2IVOA 3HI0A 3FGUA 1DGKN 2P9SA 2Q36A 2CH5A 2A3ZA 2D4WA 5AQIA 2Q31A 3FZKA 4NO7A 5AR0A 4H0YB 3ID8A 2E8AA 1XUPO 3LDQA 3MMVA 5JICA 4BRGA 4CZGA 3O1WA 5AZIB 3VF4A 2P9IA 4BREA 3RSEB 4H0OA 2W41A 3CQYA 3GBTA 5AQKA 2CH6A 3H1QA 5I9EB 4QS9A 3ATUA 2E20A 4FOIA 3MCPA 3H6EA 4O8KA 5BN9A 1WUAA 4CZMA 4J8FA 3GOIA 1NGFA 5BPNA 2A6AA 3IMXA 5F0XA 1JCFA 3CQXA 3H3NO 4BC5A 3QFUA 2P9UB 2KHOA 3WT0A 4FWSA 4IJAA 3VENA 4BC3A 3JXUA 4H5RA 4PKIA 5AQQA 4K41A 2P9LB 3GG4A 4IXCA 2QXLA 4FWPA 5AQSA 5BREA 2P9KA 3QICA 1U6ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4X62K 4FM1A 1S9EA 1V4TA 4JK9A 2G8HA 3VMFB 4IO8A 2WOMA 5C2DA 2XY8A 2YHXA 4C8MA 5GIPA 2FXUA 3WEEA 5CY0A 1BO5O 3TAPA 2I61A 3AA5X 4H0XB 2ITMA 5SZTA 4KREA 1U49A 5AQZA 1VSIA 3OYNA 2ZWHA 4B3MK 1D4XA 4FLXA 5FLXO 1HYSA 3VTHA 1RBTA 5HRRA 1VQLN 3SBTA 3CM6A 5JENA 3VQDA 4YY3K 2GELA 4B1YB 1LWFA 3RMCA 1KV0A 2WTUA 4JRQA 5C0YA 3F9MA 5J2NA 1D9DA 5KGWA 2KBJA 3QINA 3G6EN 3P83D 4JYAK 1EKEA 3BZKA 4FWNA 3K0SA 5GAEP 4BR7A 2UXCK 3RSEA 5GAGP 4I9QA 3WNHA 1MWMA 1J5EK 2IAJA 3ENBA 1LWEA 1RT4A 1IG8A 1BK8A 1JKHA 3FR0A 1C6VA 1BU6O 3SPYA 1Y97A 3AAQA 4YOYA 4LFCK 4CZIA 3AVKA 4NCAA 2JGUA 1FK9A 1J5OA 2VQEK 3TR8A 5FRMA 1CZBA 4GW6A 1JLFA 4DR3K 4JI4K 3PX0A 2OCEA 3S3NA 1WWNA 1U45A 3HP6A 1TKZA 1NGJA 1ESVA 1Q82O 2FF3B 1VQMN 4ID1A 3VQ8A 1B9FA 1OVQA 2J4RA 4C1NI 2EX3A 5AQPA 1M90O 4H5VA 4KB0A 4FJGA 4CGFA 3THXB 3HO1A 4BWJA 4BC2A 2IS3A 3K57A 4OLAA 1KVAA 2E3FA 4MQ3A 1HJOA 5ADXA 1NK4A 3LAMA 3TAQA 3P39A 4OKKA 3OVNA 3AGKA 3MWPA 1ZBIA 5BRHA 3K5OA 3H1VX 1JL1A 2OTLN 1TVRA 2W6KA 1TI5A 4A57A 4B1UB 4DTJA 3ZYYX 1HMVA 1S3XA 3V9ZA 1YXQA 3KLGA 3WNFA 5AQHA 2JDQD 1BRZA 2F9WA 1VQON 4MO4A 4BRQA 2NRRA 4EP5A 5HROA 4JKBA 4B1XB 3ZEUB 1T44A 1RT6A 4EFHA 2YI1A 2ETJA 1KLMA 2YKNA 3OTOK 1HQEA 3JSMA 4LF7K 3DLEA 4BE1A 5EX5A 5M1QA 4KHQA 1Q18A 2XHBA 3SQ2A 4RCHA 5HRSA 1QSYA 1AHOA 1BOTO 4ILJA 4BE0A 2QKKA 4DWIA 2MZ0A 1ATNA 1KAYA 3WXIA 3RRHA 1RTHA 2RPIA 2A1RA 5JVHL 4BACA 1K6YA 3ZSVA 1RT2A 1VRTA 2BANA 3OYIA 3C6TA 4PQUA 3DRSA 3EEQA 3T7ZA 4LSLA 3CC7N 4OKEA 2HF3A 1G15A 3SK3A 4JN4A 3CYMA 1J54A 1NM1A 2GUIA 2A40A 4YOUA 1UA0A 2UU9K 1JL2A 4X66K 4M42A 3AO2A 4G1QA 5AQRA 4AEIA 3CERA 5F2RA 4I6MA 4BWMA 4A61A 5AQLA 2LI7A 3OBYA 3KD1E 4IDHA 4FJ9A 1SUQA 2GEMA 4R79A 3KTQA 2EWSA 2GTDA 3VEZA 4BDYA 1I39A 2F7TA 1Z26A 1S1TA 4EIAA 3H3OB 3D2FA 3HPOA 3OHRA 4DSKA 3E1YA 1TYQB 2HNDA 3JAMO 4GKJK 4KI4A 1VSDA 3LL3A 2BTFA 4NLCA 3V1QA 3QDKA 3SJJA 2D56A 4BVOA 2YJFA 4CZKA 4HUEA 2ZJQL 3L0QA 4CI6A 2C1GA 3O3FA 3OY9A 2O8FB 2NLXA 3PUFA 3C94A 1ATRA 3CMEN 3SPZA 3QEPA 4CK3A 4FLTA 4M3TA 4JKCA 2Q2RA 3OS2A 3KOWA 3AVIA 4W5NA 1O1WA 3KWIA 1I2VA 1YVUA 1Z25A 3RR7A 1CXUA 1Y64A 3VERA 4FL9A 2ASMA 4CEZA 3R9PA 4CF8A 3OYAA 4N5SA 4WF9L 4CD1A 1XI1A 4WFAL 2HBJA 2Y1IA 1CXQA 1WAFA 4BQLA 1BISA 3C0BA 4AHVA 3EN9A 3P31A 1GLJO 5AQYA 1JJ2M 1VQ6N 2JWKA 3HP9A 3CJ9A 3CETA 2GV9A 2FBYA 5AQOA 1BL3A 3OYJA 2HOEA 1HJRA 4BRLA 3I8DA 4JK7A 2QA4N 2BH1A 4W5OA 2LR3A 3MCAB 1NK9A 5HP1A 1ZBUA 2HBMA 4W5RA 1HPZA 4BRAA 1HNZK 2VY6A 4CZHA 1BIZA 2G8IA 4IJNA 3CMAN 5AQJA 2NZTA 3WUHA 5FROA 3F5TA 4M7YA 3OYBA 1TK8A 1S72N 4ELVA 3L3UA 4YOXA 1KLNA 4LF9K 4UADE 3RRGA 3R6MA 3EYZA 4DSFA 3QLHA 4BE7B 3TPQA 3M8RA 2JWLA 5BN8A 4LY7A 3B6OA 3FZLA 1A5VA 4ICLA 3ZT4A 3I56N 5CYMA 5KQDA 4CF1A 3NCIA 4YOWA 4CJUA 4KH5A 3SMSA 4WYBA 4E3SA 4AILC 2GMOA 4IEIA 4KHSA 1SV5A 4AHTA 1TKDA 5BR8K 3L2RA 5AQMA 2A42A 1NE5A 2RN2A 1OKJA 1S5JA 3EKSA 3OYGA 1NGHA 4FK4A 3KP1A 2IVNA 3E9LA 4JV5K 4RW7A 4KHPK 4CHNA 2PFUA 3L56A 3OYHA 4F8RA 3QEVA 3HSTB 1P0AA 3QEWA 2YCHA 4EZ6A 4FWMA 2UUCK 3THVA 1S6PA 3SI6A 2B68A 4AM7A 2JLEA 4E89A 4M3UA 1VQ8N 2LSNA 4FJLA 3TSUA 1NK0A 3EE9A 4DG1A 1ZBHA 4XH1A 2RKIA 2YNHA 2LJ7A 1S22A 4Q0BA 3NH2A 4M63C 2NY9X 3N4PA 2AA4A 1YJ9N 1WSGA 3UKUB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4X62 K;  4FM1 A;  1S9E A;  1V4T A;  4JK9 A;  2G8H A;  3VMF B;  4IO8 A;  2WOM A;  5C2D A;  2XY8 A;  2YHX A;  4C8M A;  5GIP A;  2FXU A;  3WEE A;  5CY0 A;  1BO5 O;  3TAP A;  2I61 A;  3AA5 X;  4H0X B;  2ITM A;  5SZT A;  4KRE A;  1U49 A;  5AQZ A;  1VSI A;  3OYN A;  2ZWH A;  4B3M K;  1D4X A;  4FLX A;  5FLX O;  1HYS A;  3VTH A;  1RBT A;  5HRR A;  1VQL N;  3SBT A;  3CM6 A;  5JEN A;  3VQD A;  4YY3 K;  2GEL A;  4B1Y B;  1LWF A;  3RMC A;  1KV0 A;  2WTU A;  4JRQ A;  5C0Y A;  3F9M A;  5J2N A;  1D9D A;  5KGW A;  2KBJ A;  3QIN A;  3G6E N;  3P83 D;  4JYA K;  1EKE A;  3BZK A;  4FWN A;  3K0S A;  5GAE P;  4BR7 A;  2UXC K;  3RSE A;  5GAG P;  4I9Q A;  3WNH A;  1MWM A;  1J5E K;  2IAJ A;  3ENB A;  1LWE A;  1RT4 A;  1IG8 A;  1BK8 A;  1JKH A;  3FR0 A;  1C6V A;  1BU6 O;  3SPY A;  1Y97 A;  3AAQ A;  4YOY A;  4LFC K;  4CZI A;  3AVK A;  4NCA A;  2JGU A;  1FK9 A;  1J5O A;  2VQE K;  3TR8 A;  5FRM A;  1CZB A;  4GW6 A;  1JLF A;  4DR3 K;  4JI4 K;  3PX0 A;  2OCE A;  3S3N A;  1WWN A;  1U45 A;  3HP6 A;  1TKZ A;  1NGJ A;  1ESV A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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