3OA9A

Effector domain of influenza a/duck/albany/76 ns1
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
b'YITDMSIEEISREWYMLMPRQKITGGLMVKMDQAIMDKRITLKANFSVLFDQLETLVSLRAFTDDGAIVAEISPIPSMPGHSTEDVKNAIGILIGGLEWNDNSIRASENIQRFA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Non-structural protein 1
publication title A Transient Homotypic Interaction Model for the Influenza A Virus NS1 Protein Effector Domain.
pubmed doi rcsb
source organism Influenza a virus
molecule tags Viral protein
total genus 30
structure length 114
sequence length 114
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.330 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3oa9A00
4OPHA 3EE9A 3P39A 3P31A 3KWGA 4OPAA 3RVCA 3O9RA 3OA9A 3L4QA 3D6RA 3EE8A 3O9TA 3KWIA 3F5TA 2RHKA 2KKZA 3O9SA 3M5RA 3P38A 3O9QA 2GX9A 3O9UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WNEA 4LSLA 4DSEA 3HM9A 4A59A 1HUXA 3C7NB 4UQGA 1NOZA 3V4IA 4CJRA 3THXA 4CHQA 1WSJA 4Y1CA 3JXUA 3HSCA 5HRPA 3CIPA 3AVAA 4X64K 1B9FA 4KHNA 4DMNA 4ILJA 3O1WA 4H5WA 3TU5A 4CEBA 1C0MA 4B1UB 3CJBA 4W5QA 5AQVA 4LC9B 4FJ9A 4ELTA 1XWLA 3LP2A 3VQEA 1HNIA 4O0IA 2YHXA 4B1WB 2HHHK 2A41A 1BCMA 5M1KA 3CQXA 2HF3A 1RNHA 2QWOA 3CMAN 1LW0A 3EKUA 2NNWA 3DI6A 2QI2A 2NRTA 3FGUA 4E0DA 2ZQBA 3HPGA 4BQZA 4YORA 2BGGA 2YHWA 1J54A 3LANA 3QEVA 3LM9A 1IG9A 1D9DA 4JK8A 1RT6A 3C94A 2Q36A 3QB0A 4KREA 4MDAA 4DR7K 3MXJA 1SKRA 4B9VA 4CJVA 4DF8A 1WAJA 3ZT4A 3G25A 3O9RA 3LWMA 3I0RA 4IOXA 4BRHA 4JI4K 4IFEA 4DF4A 2DFFA 4H4OA 1TL1A 4JI3K 2NRWA 1NGAA 4AHRA 2O8CB 1XNRK 4TSXA 4F3TA 3LDNA 3H1QA 1TKTA 4DV5K 1UWBA 2WBNA 2FXUA 1L5UA 3E9PA 4FLUA 1KRPA 3LP3A 2HNYA 4X65K 2YHBA 3RSEB 4AQYK 1ZBSA 5T7BA 5AQUA 4DKWA 4DS5A 1LCUA 3OYJA 4DSIA 2QWQA 3CM5A 4E89A 4GV6A 4MO4A 4C8NA 4PKIA 3L4QA 1HMVA 3CJ1A 4CJWA 2YNIA 5DM6L 1X1PA 3UKRB 2O8EA 4DWIA 3O80A 3QFPA 5F2RA 3DLBA 4DUYK 4JKBA 4DQQA 2V7YA 4EHTA 2NZTA 4JI0K 1EKEA 2P9PA 1N33K 1VK0A 4BRNA 3HM8A 5EOYA 1EP4A 3SQ4A 3L2QA 1BGXT 4CZEA 5E41A 3RRGA 2ITGA 4WFAL 2P9IA 1Z26A 4OLBA 3QICA 3V1RA 1NLVA 4CHPA 4A2AA 4BC2A 5MLCQ 3TANA 2P9LB 4WYBA 3I8DA 2FLOA 1YVUA 4IJAA 4IXCA 4NO7A 4JKEA 1MWKA 4FJLA 3TAEA 5GINA 2YNGA 1BQNA 3SJHA 1BUPA 4FLWA 4DLGA 3OBWA 5AZIB 1BI4B 1VRTA 3AVIA 4JKDA 2P9SB 2IOCA 2O4GA 3TSQA 3F9MA 3DXKA 3NE6A 3H1VX 1ZBLA 3VTHA 4LSNA 3FLCO 3MX2A 1XMOK 3CJCA 4WQ4C 3A8YA 3KHYA 1IBMK 4Z4IA 4OKEA 5H1SQ 4FZXC 3VERA 1G15A 4LY7A 1NGFA 5EX5A 3M8SA 1CZAN 1EWRA 2F4VK 4L8RB 4IWVA 3S3NA 4B9SA 1NBWA 1WUAA 1JLAA 5FPEA 5CYQA 3SMPA 4FWLA 3T7ZA 1NK6A 1VSEA 3O9TA 4J2BA 4NCGA 3GL1A 1K8AO 5EXWA 1TYQA 1VSFA 1YXQA 2RF2A 3QDKA 5AZJB 3K2PA 1ESVA 4CD1A 2ZGYA 3M1FA 3KD5E 1ZBHA 3ID8A 3UE5A 4JRQA 2DPNA 3HL8A 4FJNA 3HK2A 2G8HA 1W97L 4CF0A 4F8RA 4PWDA 1UA0A 4I2PA 3VQ9A 3ZT3A 3VGLA 3G4SN 3WXIA 3KIOA 2A1RA 4BRCA 4U7BA 2G8VA 4FM2A 4H0OA 3QEIA 3PUFA 3THWB 2KFNA 4B1XB 4JEPA 1LAWA 4CEEA 1U48A 3EN9A 3C95A 3TARA 3DLKA 3O1BA 4K42A 2IGIA 4IBNA 3U6FA 2B6AA 3LPUA 1BU6O 2JLEA 5B8HA 1NKCA 1BO5O 3JAMO 3F73A 3TI0A 2VCPA 3BY5A 3CM6A 2VWKA 1F21A 3VQ7A 1FKPA 1J5EK 1BCOA 3ASMA 4ICLA 4BDPA 3D2FA 2A42A 1L3SA 2WC9A 3HOSA 1KTQA 4CJ3A 4ELUA 3DXMB 4BQLA 4CHNA 3U8XA 1XUPO 3HTVA 2OTJN 1LV5A 4B3OA 3RMCA 1QZ5A 3I8BA 5AFUH 3WNFA 4YDUC 4KFBA 3K5NA 4NYFA 1Z25A 1BWFO 2YKMA 3ULEA 3ZSRA 2HHQA 3LDSA 2QWMA 3TTCA 4CE9A 3MEDA 2QWNA 5AQJA 4FLZA 1NK8A 1A5WA 4AHUA 2O8BA 1KLMA 4CEFA 5KPRA 3QETA 3WXJA 1LAVA 3SV3A 4E7HA 4BG9A 1T03A 3F9KA 4KHPK 2YNFA 3K9JA 3V9UA 1TVRA 3NF7A 1WNSA 3R1XA 1TAUA 1IBKK 5CY4A 3KK1A 1A5XA 2P51A 4LFCK 3AY9A 4Z4HA 1QSSA 1FW6A 2VQEK 1S9GA 3HVTA 3AVBA 5C10A 1VSMA 3VGKA 1JLGA 1QQOA 3SQ0A 3QBXA 4ID1A 4Z4CA 1KSPA 2ZD1A 3TSUA 3CCUN 4DHYA 4CGDA 2NRXA 5BN9A 4OPKA 3VQBA 5AQXA 1SL2A 4AF1A 1RDBA 4G9ZA 3AVGA 4IDHA 3HVRA 3D0PA 4HCBA 3KK2A 3JYTA 2HB5A 4CJPA 3PIPL 4M7YA 4OX9K 4RCHA 2AP1A 4XH5A 3OYBA 4U67L 3OJUA 4F3OA 4DSLA 3R8EA 3SAFA 2UUBK 3FFIA 4QS7A 3SPYA 1NOYA 2Y1JA 3CFOA 4B9TA 4FW1A 4IDKA 4JK7A 2ZM6K 3AO1A 1V4SA 1RBVA 3PX4A 3ATUA 2WUSA 4DV6K 3O4QA 3A5OC 2Z1GA 4EIAA 4K41A 4FM1A 1SZ2A 1VSJA 1WSIA 4FWOA 4A2BA 5AJ3K 4LF8K 4B8AB 1UAXA 2E1ZA 3IKMA 3MN9A 4KTWA 2P5OA 1IO2A 1NGJA 1GLLO 1GOCA 3VQ6A 2QA4N 4E7IA 1SAZA 4RW8A 4JNEA 3ENOA 2B5JA 4PUOA 4AHVA 3CETA 3ZEUA 5BPNA 1LWFA 3AA4A 2KHOA 1S6PA 4FJHA 4R5PA 3DLRA 3OBYA 3ZSYA 3NH2A 3QEPA 4KH4A 3AVJA 5GAHP 4CJTA 2IVPA 4F2RA 4NLBA 3AVHA 3HBTA 1W0HA 1O1WA 4QCLA 3RR7A 1JKHA 2W40A 4BDYA 1MDUB 4XH4A 4FLTA 4JI6K 2VWBA 3GOIA 3L4IA 4FPBA 5HLFA 1KXPA 3NF8A 4KBOA 3OYNA 4KI6A 3DRRA 4CZGA 4J2EA 3QNNA 5HL7L 1IKYA 4GVMA 1EQYA 2QKKA 2FBTA 4BDZA 3IDHA 4O5FA 1IBLK 3JSMA 3DWLA 4YFUA 1OVQA 3OHRA 4HUFA 2IVOA 4JKFA 4GV3A 3IUCA 4GY2B 2GX9A 3NH0A 4B8CA 3ZX0A 1HRHA 4FVMA 3SYZA 1NWKA 4PY5A 1Z05A 2HOEA 4K43A 2ZE2A 1S6QA 2A40A 2BTFA 2IS3A 3IMXA 2HHUA 4JKHA 4IO9L 4BGAA 1RT7A 3WEEA 3ZETA 4Z4EA 2GELA 3EE8A 5CZ2A 5AFUA 1Q81O 4I7FA 3KD1E 3RMBA 1K8KA 3W0LA 2RN2A 1JLEA 4CEZA 3AVNA 5LJWA 5F0XA 3SAHA 1NK9A 1LWEA 3LALA 3D2EB 3VN5A 2NRVA 4DV4K 5E84A 3M6GA 1NNEA 5LJVA 4GKKK 5M1FA 5IT9O 2P5GA 4EAHD 1VQMN 3D6RA 3LP0A 1HYVA 3MMVA 1QSYA 1NGGA 4FWSA 1KFSA 3DLHA 1N34K 4J2DA 2D0BA 4C8OA 4E7JA 3FZMA 4CBXA 3V9SA 3B8AX 3CJ9A 3VESA 3HSTB 3BUZB 2HW3A 3Q7CA 4C8LA 4CJEA 4JN4A 4X66K 4K8XA 1I3AA 1TK0A 4DQ8A 4W5OA 2QK9A 3CXCM 1G99A 4GNIA 4BGBA 4LF6K 3CPWM 3DLLL 3V6DA 1S3XA 1VQ9N 5AQSA 4PL7A 3D45A 4M3WA 1MWMA 1N36K 5AQGA 3K57A 1D8YA 1J6ZA 4BWJA 2Q0UA 1K9MO 3S41A 3SV4A 3RVCA 4N76A 3ZYYX 1VQON 3ALYA 3IFRA 2Q0RA 5AQOA 1QVGM 3SJJA 3VQ5A 3OJSA 4A62A 4NXNK 1ATNA 3C6UA 4B1VA 3V1QA 2HMPA 5AQPA 3LM2A 4CIEA 3THVA 5AQQA 4GMJB 4DS4A 5AQNA 1BIZA 4O8KA 3ZSVA 1HKGA 2E5LK 3HP9A 1J5OA 3R9PA 5ADXH 3CQ8A 4CK3A 3RTVA 3KK3A 4FLVA 2UYTA 1QQCA 4LH4A 4QOZB 3SI6A 4DSKA 2OZMA 3T1AA 3E1YA 4DLEA 4CD3A 4DFJA 4JD2B 1S1TA 4BE2A 4M7XA 1WSHA 1V4TA 1EETA 1KAZA 1P90A 4O55A 1VQPN 1FK9A 4A5AA 3BZKA 1REVA 3KK7A 3O8MA 4FCYA 2W41A 2E2NA 3LL3A 4OGEA 3U9DA 3K59A 4O44A 3CF5L 1Q86O 2UXBK 1T6CA 5JVHL 3OYHA 4M3ZA 3RWUA 2E2PA 5AQKA 3VGMA 5FPNA 4CEOA 2PY5A 3SAGA 3AVKA 3CJAA 2O8DB 3TR8A 5M1OA 2O8FB 2O4IA 1GLBG 3LDLA 1VRUA 3EY1A 1HQEA 2P9KB 2KZMA 4M3XA 3AGKA 3AO3A 1C0FA 4BRFA 3V9XA 1ZC6A 2D5RA 3KLGA 1S1WA 4PKGA 1DTQA 1SL1A 1Q82O 3QEXA 2QEXN 3CQYA 3TAGA 3E9OA 4GKJK 5GAGP 4WFBL 2QM1A 4GVEA 3O3FA 2ASMA 3B6OA 1X9MA 1T8EA 3HO1A 1RTDA 3CERA 3LAKA 1XI1A 1ASWA 4DR1K 4M3TA 4B9QA 3F2KA 3LPTA 3FFKB 3G6EN 1U45A 3O6WA 2E6LA 1GLAG 5EY4A 4M63C 2CGKA 2EWSA 2YKNA 5GAEP 4DG1A 3HT3A 4ILGB 1XQSC 2HVHA 1IKXA 3O4WA 4E7KA 2ZJPL 4HTUA 3VOVA 2PAVA 4H0PA 4FOIA 3PSFA 3K5MA 1TUUA 4JLHA 5AR0A 3AA5X 3K58A 4IG0A 1CZ9A 3HOTA 1CXQA 1N32K 1JCEA 5J2NA 4RW9A 4PKHA 5BN8A 3OYIA 4O8UA 4XIUA 3QMLA 1HNWK 1C0GA 4H0VB 3NGZA 2BDPA 2BH1A 2A6AA 2QTDA 3SUPA 1MA9B 3QESA 3K5LA 3AVLA 1ZBIA 4YOWA 5KGWA 2P9UA 1YVNA 5KQ8A 2OYQA 1NGIA 3J7YP 4BWMA 1TKDA 5J1EA 5KPTA 1JCGA 2I7PA 3EL2A 1Q9XA 3A0IX 4DU3A 4DQSA 1D9FA 3QIOA 4O4GA 3VA3A 1RTHA 5BPLA 3ZX3A 3TTDA 3BF1A 3O5BA 4OPHA 1I39A 3THYA 5I42A 2QW9A 1FJGK 4HCCA 4N56A 3I56N 3RR8A 4FJXA 4FOEA 3PV8A 1JLCA 4I9LA 1BQMA 3EO3A 5AQZA 3THXB 2JWLA 1EXQA 2HF4A 2H3GX 4H5NA 1JJ2M 1T7PA 3OYLA 3T1HK 1BISA 4ID5A 2OZSA 3HP6A 2HNZA 3H46O 5FLXO 3J7ZO 1HLUA 3DMJA 3WNGA 3VEVA 1NG9A 4NCBA 1J53A 4DQPA 4J2AA 3HXMA 4ILHA 2FSNA 4BC4A 4CJKA 3VQPA 1L3UA 3N4PA 3DOLA 2HHXA 3AV9A 1TGOA 5ADXA 3S3OA 1U2VA 2KFZA 1QS4A 2GWJA 2WTUA 3C65A 3E66A 1UA1A 2GUIA 1U47A 4QS8A 3ENBA 2ETJA 3EYZA 1T3VA 3O9UA 2YJFA 4FJMA 2KZZA 4JHDA 1VSIA 4CK1A 4FWKA 1S1VA 2PFUA 1HX1A 3CMEN 4KHSA 2G8UA 3UKUA 4FVUA 1XHZA 3OYCA 2VQFK 4W5TA 3KZBA 1BL3A 1D5AA 5C12A 1TL3A 3AVCA 2VGNA 5KPZA 2XY7A 4CF8A 3CD6N 1Y97A 5FRMA 4BRAA 3CC4N 1W7AA 2F8SA 3BEXA 1X9JA 4BROA 1Y64A 4N41A 5JMVA 2UUCK 1RTJA 3TPQA 5EVZA 1CLQA 1CZBA 3TSPA 4H0YB 4E19A 1E4GT 2YHAA 4ZTFA 4JS4A 1K73O 3VEWA 4E7LA 3KTQA 3H3OB 1RDCA 2NUBA 4M42A 3FZKA 2I5JA 3HPHA 5CR4A 2ASOA 3CCRN 2HBMA 1YAGA 5GIPA 3A5LC 2GUPA 5AQIA 4JI7K 1ITGA 1BIUA 3SBTA 1C0UA 3PO4A 1EX4A 1ZBUA 3H08A 1RDDA 4N47A 3ENHA 4FL9A 4ZTJA 3TAPA 3J81O 3RMAA 1U49A 5EU7A 2Y1IA 3MDQA 3BP8A 2J4RA 2P9IB 1RCHA 4DV1K 3OW2M 4DSFA 4K8ZA 5I9EB 4RW7A 2XY8A 1RT5A 4BR5A 1NK7A 1QSLA 1DEJA 4WQ4A 4FJGA 2G8KA 4MQ3A 1BDGA 1VAZA 2UXCK 5JICA 5KRSA 4YNQA 1WBBA 1ZXOA 5HRNA 4A57A 3KLFA 4RTFD 4B9MA 3VF2A 1RBTA 3MK6A 4FZYA 4FSVA 4CGHA 4B1YB 1IJJA 3VQCA 3DXKB 2D0PA 2D0CA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4OPH A;  3EE9 A;  3P39 A;  3P31 A;  3KWG A;  4OPA A;  3RVC A;  3O9R A;  3OA9 A;  3L4Q A;  3D6R A;  3EE8 A;  3O9T A;  3KWI A;  3F5T A;  2RHK A;  2KKZ A;  3O9S A;  3M5R A;  3P38 A;  3O9Q A;  2GX9 A;  3O9U A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3WNE A;  4LSL A;  4DSE A;  3HM9 A;  4A59 A;  1HUX A;  3C7N B;  4UQG A;  1NOZ A;  3V4I A;  4CJR A;  3THX A;  4CHQ A;  1WSJ A;  4Y1C A;  3JXU A;  3HSC A;  5HRP A;  3CIP A;  3AVA A;  4X64 K;  1B9F A;  4KHN A;  4DMN A;  4ILJ A;  3O1W A;  4H5W A;  3TU5 A;  4CEB A;  1C0M A;  4B1U B;  3CJB A;  4W5Q A;  5AQV A;  4LC9 B;  4FJ9 A;  4ELT A;  1XWL A;  3LP2 A;  3VQE A;  1HNI A;  4O0I A;  2YHX A;  4B1W B;  2HHH K;  2A41 A;  1BCM A;  5M1K A;  3CQX A;  2HF3 A;  1RNH A;  2QWO A;  3CMA N;  1LW0 A;  3EKU A;  2NNW A;  3DI6 A;  2QI2 A;  2NRT A;  3FGU A;  4E0D A;  2ZQB A;  3HPG A;  4BQZ A;  4YOR A;  2BGG A;  2YHW A;  1J54 A;  3LAN A;  3QEV A;  3LM9 A;  1IG9 A;  1D9D A;  4JK8 A;  1RT6 A;  3C94 A;  2Q36 A;  3QB0 A;  4KRE A;  4MDA A;  4DR7 K;  3MXJ A;  1SKR A;  4B9V A;  4CJV A;  4DF8 A;  1WAJ A;  3ZT4 A;  3G25 A;  3O9R A;  3LWM A;  3I0R A;  4IOX A;  4BRH A;  4JI4 K;  4IFE A;  4DF4 A;  2DFF A;  4H4O A;  1TL1 A;  4JI3 K;  2NRW A;  1NGA A;  4AHR A;  2O8C B;  1XNR K;  4TSX A;  4F3T A;  3LDN A;  3H1Q A;  1TKT A;  4DV5 K; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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