3OA9A

Effector domain of influenza a/duck/albany/76 ns1
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
YITDMSIEEISREWYMLMPRQKITGGLMVKMDQAIMDKRITLKANFSVLFDQLETLVSLRAFTDDGAIVAEISPIPSMPGHSTEDVKNAIGILIGGLEWNDNSIRASENIQRFA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Non-structural protein 1
publication title A Transient Homotypic Interaction Model for the Influenza A Virus NS1 Protein Effector Domain.
pubmed doi rcsb
source organism Influenza a virus
molecule tags Viral protein
total genus 30
structure length 114
sequence length 114
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.330 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3oa9A00
3O9SA 3M5RA 3F5TA 3EE9A 3O9TA 3D6RA 3P31A 3O9UA 3P38A 3RVCA 3OA9A 2RHKA 3O9QA 3KWIA 2KKZA 3EE8A 3P39A 3O9RA 4OPHA 3L4QA 4OPAA 2GX9A 3KWGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NF9A 1U47A 3LDPA 4XH4A 3CMAN 4HTUA 1XC9A 3V9UA 3F9KA 3ENBA 5E26A 1P8ZA 4BR9A 5JICA 4WQ5A 3T1HK 2X6SA 3K2PA 4CESA 2E4LA 2O8FA 2X74A 3DLLL 2F8TA 3G10A 1OH7A 1J53A 3L2QA 2YNIA 1K9MO 3HVRA 4IOCL 5BRDA 5HL7L 4KTWA 5GAGP 5AQVA 3IRXA 1XMOK 3SQ4A 4LSLA 2XHBA 4JHDA 3RSEA 1HYZA 1RDAA 1KVCA 4CHZA 2P9IA 3KLFA 3BF3A 1BL3A 2V7YA 1QQMA 1VQKN 4LF9K 1R59O 3MEGA 4FM0A 3VQBA 4CJKA 1L5UA 5LJWA 2QK9A 3CCVN 3AVCA 4K8ZA 4H8KA 3L8BA 1J9AA 2QWNA 4IEIA 4YFUA 3VERA 3HJFA 2E2QA 5AFUA 3MXJA 1RT7A 4BC2A 4DFKA 1XNQK 4M7XA 5AQNA 5JS1A 2HHXA 4JK9A 4OPHA 3R8EA 2FXUA 3FZLA 4CJLA 3NGZA 3N4PA 1KTQA 2HBKA 1ITGA 3CJCA 3TWHA 5EY4A 3CCRN 2BGGA 2P9LA 2FSNA 5KQ8A 2KHOA 4AHUA 2E1YA 2RN2A 4IDHA 3AVFA 3OYLA 3MAQA 3MMVA 1M90O 3IAYA 1QQOA 5JMVA 4M42A 1J5EK 1OVQA 1RT2A 1VQLN 3FGUA 4CJ7A 5EVZA 3T69A 5LMUK 3WQUA 4CK1A 3VQ5A 1WB9A 2O8CB 3WNEA 1TYQA 3LDOA 4IXCA 4H0YB 3N4QA 4BG8A 4PKHA 3E1YA 3O9UA 3OBYA 1SZ2A 4LD0A 3KIOA 4DTUA 3SBGA 3M8QA 3NVKA 1UAXA 4JI8K 4DTOA 4DQPA 3VF2A 1RT1A 3D2EB 3JS6A 3ZT0A 3H6EA 4CJUA 3L3UA 3OJSA 1FK9A 2AP1A 3P83D 3U3YA 1NJWA 4CJ4A 4A2AA 1UOCA 5AQQA 4Q0BA 1KVAA 1C0GA 1XUPO 1Z26A 1KLNA 3MK6A 3VF4A 1VQ8N 4R79A 3AV9A 3V4IA 4M7YA 1VK0A 5MLCQ 4ILGB 2V7ZA 2WTUA 4DR4K 3EE9A 3BUZB 5J2QA 1VQ7N 3ZETB 1HKGA 5KRTA 1JLCA 2VQFK 4H0VB 2WUSA 4HTLA 3PX6A 3V9ZA 3NGYA 3HT3A 3QETA 2F4VK 4FSVA 5CYQA 2A1SA 4JEPA 1GLCG 4XEIA 2BDPA 4OGCA 1U2VA 2H3GX 4E1MA 3RR7A 4GNIA 3QBXA 4GKKK 2G8KA 2YCHA 3VA0A 4U67L 5JS2A 4N5SA 3VQ4A 4YOUA 2NRRA 1NGJA 1N34K 4CCHA 2D0PA 4BRKA 1NOYA 4R5PA 4W5QA 2JWKA 3R3LA 3DRPA 4KHPK 1NBWA 1SUQA 2FF3B 3DOLA 2IVOA 2Z1JA 5KTQA 1U04A 4YY3K 4AM6A 4CHPA 3RTVA 4GV3A 3FZFA 1BUPA 3LP1A 1N32K 5DM6L 4JI0K 4EAHD 3CC7N 3NAEA 5CE3A 2VWKA 4FYDA 4CF9A 3OYGA 1W97L 3FZMA 4CHYA 3J80O 5M1KA 1BHLA 4MDBA 3WQTA 3SZ2A 1FKOA 1K8KB 2A40A 3HSCA 2R7YA 1WNSA 2F8SA 1S5JA 1YT3A 3CQXA 4O5BA 2O8DB 2KFZA 5AQKA 3C94A 3VQPA 3AO1A 4DU3A 2HMPA 1MDUB 1XHXA 5ELZA 3O08A 3O80A 5GIOA 4ID5A 3CC2N 3L2WA 2W40A 1Q9XA 1VRTA 2AA4A 4CJPA 3M8PA 3S41A 3UKUA 5CHIA 1DLOA 3SLCA 2OANA 5CZ2A 5FROA 5GIPA 2IIRA 5DM7L 4CZFA 1ZBLA 2Q31A 1TGOA 3S3OA 1YTUA 1VSEA 1LW0A 1T8EA 5AQHA 4CZKA 1CZBA 5C42A 3O8MA 3NVMA 3LALA 4F3TA 1MA9B 1W2BM 4CGDA 3VGLA 3TARA 4DB3A 4DQIA 4NCAA 4KPYA 4B3OA 4O0IA 5I3UA 2OPPA 4UY8O 4FJ8A 1EWRA 1VRUA 3H45C 4J8FA 1VQ6N 2NRXA 4FWSA 3CM6A 3TAQA 2F9TA 4WFNL 4IOXA 1KSPA 5CZ1A 1KFSA 3CFOA 3CFRA 3CPWM 4JRQA 2D0CA 1VSHA 2EHGA 2O8CA 4DU1A 3THVA 1MWKA 3OYDA 4OJRA 3SV4A 3BGRA 1YTAA 4X65K 4FJHA 4A5BA 1OVYA 4H0PA 3G6EN 4FW2A 3ULEB 3DXKA 5M1QA 3DLRA 5BREA 4JKHA 1HNWK 4CEEA 4IG0A 1K6YA 3P38A 5BPLA 5ADXA 3HBTA 1KVBA 3ZT2A 1T6DA 1OH5A 1U49A 1X9MA 4DR7K 3R1XA 3O3FA 3MXIA 3WXKA 2G8WA 2FSJA 4NYNA 1IBMK 4OPKA 3NF7A 1S6PA 2BTFA 1QS4A 3F9MA 3ASMA 3OW2M 1EWQA 2ZD1A 4CJSA 3AO3A 3V1OA 3C7NA 4AH9A 1LCUA 4IJAA 4FJKA 4DUZK 3O4QA 3ZETA 1C1AA 3HM8A 4DTSA 4CJ5A 4F9OA 4M41A 2DFHA 1VQNN 4NCBA 5BPMA 4GW6A 4KB0A 1XHZA 4DR6K 4FK0A 3LM2A 4FVMA 3UB5A 4FLUA 4EFHA 1NGEA 5DK5A 1NK6A 3VF6A 2O8FB 2UXDK 5M1FA 3PX4A 1C0FA 3O3GA 5FPDA 4AHCA 2B5JA 1J54A 3QBWA 1RILA 4CIGA 4OKJA 1NK7A 4K8XA 1JLAA 1D5AA 2Q3SA 1KAYA 1TKXA 3OYHA 5M1OA 1S1VA 3LDSA 4IG3A 3VEYA 1HUXA 4H0XB 3OYMA 4DV3K 3HO1A 4FJLA 2A3ZA 3AVKA 4IKFA 4AQYK 4JHDB 4AHRA 2ATQA 3MX2A 3RSEB 4B3MK 2YNFA 4NYFA 2P9SA 3K9JA 5HRSA 3DLKA 1TK5A 3Q7CA 2RPIA 1SS6A 3O9RA 3SQ1A 1CLQA 3IDHA 2Q2RA 4BRDA 3VA3A 4L8RB 3OYEA 4CBUA 4E7IA 3CCJN 2HBMA 4NCGA 4GY2B 4HVJA 3HPOA 4CF8A 3OS1A 4DV6K 4MLEA 5HP1A 2HBLA 5EXWA 3P31A 4YOWA 4M3ZA 2NRTA 1WSFA 3BY5A 5E84A 3KKSA 4ILJA 3ENHA 4H5VA 3AA5X 4DQRA 2YKNA 3O9QA 5LJVA 3W0LA 1ZBSA 4OLBA 1F21A 1NWKA 3OJUA 1DTTA 5CR4A 3TAPA 1YJWN 5GINA 3VQ8A 3NF6A 3KTQA 5K14A 4X66K 2UXCK 3OYIA 3G25A 3SMSA 4JI3K 4FOEA 1T03A 3PY8A 3L3VA 3VTIA 3U9DA 4QAGA 4KREA 1LWCA 4M3TA 4CJRA 1EP4A 1KQSM 4M3YA 4I7FA 3DXMA 2UXBK 1EKEA 5I42A 1VSDA 5KPRA 4DV2K 3SV3A 4Z4GA 1EQYA 3Q7BA 1NJXA 4XH1A 4CJQA 4DSKA 4LC9B 3ZSWA 4K42A 1A5XA 3V1QA 4E0DA 1J6ZA 3MX5A 5F2RA 3OYJA 4N76A 1JLEA 5EOYA 2V51B 3KVGA 3LZJA 2OYQA 4ZTFA 3KK2A 1Q9YA 1OH6A 4JYAK 3QINA 4WYBA 2BANA 1C0UA 3ULEA 4DSFA 3TI0A 3NGIA 2JWLA 4CHQA 3T19A 3MCPA 4CZMA 3H3NO 2KTQA 3LL3A 1BA0A 1HPZA 3U9ZA 1NM1A 4O0JA 2X6NA 2J4RA 2XY8A 1XQSC 1KAZA 5AQJA 3BZCA 3HTVA 1SL2A 2GUPA 3VOVA 2ZQBA 4B9NA 4WF9L 4HCBA 3PSIA 1JCEA 1IG9A 3FZKA 3J7AP 1BG3A 1JLGA 4O5FA 4W5RA 3CJ9A 4KH5A 4DHYA 2ZGYA 4EP5A 4JS4A 1C0TA 2YHYA 1NGAA 5GAHP 2ZWHA 3G4SN 4A57A 1NMDA 2IGIA 4B1UB 1P90A 3PIOL 4FWMA 2OTLN 1Z05A 4CGHA 1RDUA 3OVNA 4YHHK 4H4MA 1HLUA 3BEXA 5AR0A 1QVFM 1KCFA 1CZ9A 1H1VA 4DF4A 1JLQA 4KKOA 2ZM6K 3U8XA 1NJIO 1KD1O 3OA9A 3KK7A 4I9LA 3PLAA 1M1KO 1NGIA 2FSKA 4A59A 1EX4A 4LF4K 5FPMA 4QS9A 3UE5A 3AO5A 3CYMA 3MDQA 4AHSA 1X3NA 2FBVA 4JAXA 1E4GT 3RR8A 3AVMA 3LDQA 3THXB 3VN5A 2O8EA 2FC0A 4YOVA 1D9DA 2Q36A 3C65A 3K9KA 3C6TA 4DV4K 4BVOA 1BIZA 3UKUB 3K5OA 3UKRB 4N47A 2G8HA 1TK8A 4PUOA 4FLTA 4FWOA 4DTMA 1HYVA 4FWLA 3GOIA 3DMJA 4B9UA 4JN4A 4DCHA 4KHSA 1NGBA 3V6DA 1QHAA 3O4WA 4RG8A 5BR9A 3V81A 3CCLN 4PWDA 4Y1CA 1Z6RA 1RCHA 4E1JA 4WQ5C 4CJ3A 1BI4B 3UIQA 3NBPA 4YORA 1HQEA 4K43A 5AQSA 3QEPA 1WAFA 3VQCA 4CEQA 1Z25A 4BG9A 4MQ3A 5JVGL 4BGBA 4EIAA 4MO4A 3SJJA 1TL3A 3VETA 3DOKA 4FJ9A 4BE1A 2CH6A 3LAMA 1X3MA 2FBTA 1RNHA 4B8CA 2IC3A 4A62A 1S6QA 2E20A 1QSLA 3SJHA 3SUOA 3A5OC 1BGXT 3PX0A 3QNNA 3VQDA 2P5GA 4NLCA 4BWJA 1JCFA 1VSJA 3HM9A 4YOTA 4B9SA 1U4BA 3AVHA 4OKEA 4M3WA 3D6RA 3P5JA 4IFVA 4QOZB 4FWQA 2I5JA 2E2OA 5KRSA 3AGKA 3DXKB 1LAVA 3KJVA 4YOXA 4FW1A 4KHNA 4UQGA 3ALYA 3HYFA 2QXLA 3L2VA 1X9SA 1VQMN 3DLGA 3KLGA 3AVNA 1NK4A 4J2DA 3VGKA 1S72N 2HNYA 2O8BB 5M1PA 5C12A 3MEEA 3SAHA 1X9JA 4FWRA 2PFUA 2VQEK 1WSJA 1BQMA 3THYB 2E5LK 4E3SA 5EU7A 3DI6A 4CE9A 2V52B 2WONA 3OS2A 3CM5A 3WNHA 3OYBA 4CD1A 3ENOA 3MXMA 5C0YA 4BR4A 3OY9A 4A5AA 3L6QA 4IJNA 3C7NB 4W5OA 2GUIA 3TTDA 2ASMA 2VGMA 4MDAA 3THWB 2AJQA 4EHUA 4CF0A 5HRPA 2E88A 4FM1A 4CJTA 3CJ7A 1DEJA 3DYAA 4RW7A 3LP0A 2GWJA 3QDKA 2P5OA 2YHBA 1HPMA 1BDGA 4JI7K 1GLEG 4BE0A 1VAZA 2YKMA 3QB0A 4E7LA 4JI5K 5CYMA 4B08A 3AAPA 3H1QA 3H08A 2W6KA 1LWEA 2KQ2A 5AFUH 4OGEA 1CXQA 4JK8A 4KH6A 1VQ4N 3TTFA 1A5VA 4LF5K 3A0IX 3KD5E 1JCGA 1TL1A 4I6MB 4O4GA 4LH4A 3PO4A 3MCAB 1YUWA 4CHOA 3TR8A 1ATNA 3BDPA 3RWUA 1REVA 1QTMA 5AQRA 4FXDA 3L2RA 3SUPA 4B1YB 5I9EB 1RBSA 5FLXO 3CETA 2ZF5O 1S3XA 5HRRA 5IWAK 3DLHA 3E9PA 4CFCA 2P9SB 2Z1HA 3K5NA 1DTQA 1QZ5A 2NZTA 3C95A 3LPUA 1NK0A 4KTZA 2VWBA 3K5MA 2O4IA 1D4XA 1DT9A 4B1XB 4GMJB 5C10A 4QCLA 5AQZA 4Y0WA 1ILYA 5AQFA 2P9KB 3IFRA 4FJIA 3THXA 4KV8A 2QWQA 2HOEA 3VMFB 3CHWA 3EKUA 1V4TA 4CEZA 4JI6K 3E9LA 4PHTX 1N5YA 3EO3A 2YHXA 3AA4A 1GOAA 4M3RA 3UKRA 2A5XA 4YDUA 5AQXA 2OZMA 4BRMA 4I2PA 1VQ5N 5HBMA 1OH8A 3S3NA 4FM2A 4QS7A 4BRPA 4B1WB 1JKHA 2QWLA 1HRHA 3GE1A 5SWMA 3QIOA 2FBXA 1C6VA 1BI4A 1GLFO 3SQ2A 2VGNA 4B3RK 3SUQA 1YVUA 1IKXA 1YF5L 4B1ZA 1BU6O 3O1WA 4JKBA 2GTDA 3H46O 1U45A 2ZGZA 4CJWA 4A61A 4BR0A 2B6AA 3DXMB 1JL2A 3WXIA 1VSMA 3CCEN 3AVBA 3LZIA 1EO1A 4A2BA 1WLJA 4OVLA 3CERA 3ZSOA 3DRRA 3ZSYA 3A8YA 1NJYA 2EWSA 1WN7A 3VQ7A 5GAEP 5FPEA 3HRGA 4CEFA 3GDQA 4OKKA 2QA4N 3VPZA 4BQZA 2UU9K 5AQGA 3LDLA 4H5TA 4ZTJA 4RCHA 3IMXA 4CF2A 2D4WA 1B9FA 4CGFA 4OPAA 1KFDA 2DFFA 2A6AA 5DMRA 1RTDA 5LY3A 1Q18A 4HHTA 2UUCK 2A41A 3LP3A 2KW4A 4O8KA 4CVNE 2UYTA 3AVAA 4PKIA 5F0XA 2O8BA 1KC8O 4F8RA 3OS0A 1S9EA 3VQ6A 3PSFA 4RTFD 4WQ4A 1NK5A 2OZSA 2ZJPL 3THYA 4JI4K 2HNDA 3H3OB 4FWPA 4LF8K 1N33K 1IO2A 4C8LA 5BR8K 1QSSA 3DWLA 4KAZA 3CJAA 3U6FA 1TKDA 2HVHA 4NB4A 1NGHA 2GEMA 3CF5L 3T3FA 4ICLA 3ZT1A 1T7PA 1GLAG 3OYFA 3THWA 4FLWA 2RHKA 3VESA 2RF2A 1OKJA 3WXLA 1TAUA 4C1NI 1JXEA 3GBTA 3QEXA 4IOAL 2PBDA 4CZGA 4I2QA 5LL6Z 3SAFA 2YI1A 2CGJA 1YHQN 3AA3A 4WE1A 1NK8A 2JLEA 3DAWA 4WFAL 3J7ZO 2YHAA 4RW4A 1QQNA 2D0BA 3QO9A 3NF8A 1GOCA 4NLBA 2VCPA 4CGIA 4CJFA 3OYAA 4Q5VA 2NLXA 1SKRA 2QI2A 2O4GA 4JD2B 4I6MA 3OYKA 3HP9A 4JKDA 1MU2A 1YVNA 3E9OA 5FDLA 2DPNA 3AAQA 2O8EB 3LAKA 4CIEA 4X62K 3ZX3A 2WFBA 4FPBA 2HHQA 3AY9A 3NDKA 5J2NA 4DQQA 1SAZA 3DLBA 5GADP 3QFUA 4ELUA 3TAMA 1RGIA 1TAQA 1ZBHA 2I7PA 1I94K 3ATVA 2OPQA 4KH4A 4GVMA 3L0QA 4AM7A 3EL2A 4FJ7A 1WOQA 4C23A 3MN9A 2P9KA 4FLYA 4J2AA 3QEWA 4NXNK 3EKSA 4CIFA 4BRIA 4YOYA 1HR0K 4U7BA 1WBDA 5C15A 4KHWA 2NRVA 2Q0UA 3HOTA 5HLFA 2NUBA 4PY5A 3I55N 3VENA 4BROA 1SKWA 2WC9A 4M63C 4CZHA 2P51A 5KQDA 2HHHK 3I33A 3NE6A 1IBKK 4H5RA 4O55A 3E66A 1L3VA 1RBTA 2QW9A 1KXPA 4G1QA 4JK7A 4DUYK 2FLOA 1CXUA 4RW9A 3LWMA 3ZX0A 4IZ9A 3I8DA 3A5NC 1NK9A 4BGAA 5AQOA 2ZE2A 3U4LA 3CCSN 4FLZA 4OO1J 3K58A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3NF9 A;  1U47 A;  3LDP A;  4XH4 A;  3CMA N;  4HTU A;  1XC9 A;  3V9U A;  3F9K A;  3ENB A;  5E26 A;  1P8Z A;  4BR9 A;  5JIC A;  4WQ5 A;  3T1H K;  2X6S A;  3K2P A;  4CES A;  2E4L A;  2O8F A;  2X74 A;  3DLL L;  2F8T A;  3G10 A;  1OH7 A;  1J53 A;  3L2Q A;  2YNI A;  1K9M O;  3HVR A;  4IOC L;  5BRD A;  5HL7 L;  4KTW A;  5GAG P;  5AQV A;  3IRX A;  1XMO K;  3SQ4 A;  4LSL A;  2XHB A;  4JHD A;  3RSE A;  1HYZ A;  1RDA A;  1KVC A;  4CHZ A;  2P9I A;  3KLF A;  3BF3 A;  1BL3 A;  2V7Y A;  1QQM A;  1VQK N;  4LF9 K;  1R59 O;  3MEG A;  4FM0 A;  3VQB A;  4CJK A;  1L5U A;  5LJW A;  2QK9 A;  3CCV N;  3AVC A;  4K8Z A;  4H8K A;  3L8B A;  1J9A A;  2QWN A;  4IEI A;  4YFU A;  3VER A;  3HJF A;  2E2Q A;  5AFU A;  3MXJ A;  1RT7 A;  4BC2 A;  4DFK A;  1XNQ K;  4M7X A;  5AQN A;  5JS1 A;  2HHX A;  4JK9 A;  4OPH A;  3R8E A;  2FXU A;  3FZL A;  4CJL A;  3NGZ A;  3N4P A;  1KTQ A;  2HBK A;  1ITG A;  3CJC A;  3TWH A;  5EY4 A;  3CCR N;  2BGG A;  2P9L A;  2FSN A;  5KQ8 A;  2KHO A;  4AHU A;  2E1Y A;  2RN2 A;  4IDH A;  3AVF A;  3OYL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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