2CGLA

Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in complex with l-fructose, adp and a modeled atp gamma phosphate.
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
479
structure length
479
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure and Reaction Mechanism of L-Rhamnulose Kinase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli bl21(de3)
molecule tags Transferase
molecule keywords RHAMNULOKINASE
total genus 165
structure length 479
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2006-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cglA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cglA02
2YJFA 2FXUA 3QFPA 1D4XA 4H0PA 4BG8A 3U9ZA 3AAPA 3H1VX 4BROA 3I8BA 3VGLA 5AFUA 2ASMA 3ZX0A 3CJ1A 4WQ5A 1NGAA 2FLOA 5KPTA 2P9LB 4JHDA 4GY2B 3VGMA 1LOTB 3VEXA 5BPNA 1KAXA 4A62A 2D1KA 3MN5A 4BGBA 4CZEA 2P9IA 4JNEA 4J8FA 1NGHA 3M3ZA 4PL8A 3BEXA 5AQSA 1HX1A 4E1JA 2D0OA 3WXJA 1GLFO 2CH5A 4XH1A 3R9PA 3H3OB 2D4WA 5LJVA 1GLAG 2HMPA 3O5BA 4CD3A 4FWNA 4K41A 3UB5A 2HF4A 1NM1A 3TPQA 5AFUH 1S22A 5AQUA 4FOEA 3R6MA 4FL9A 1NLVA 2A5XA 3CQXA 4DQ8A 3LDQA 3FR0A 4PKGA 4H03B 3UKRB 3SJHA 3ZETB 4IJAA 3ZEUA 3LDLA 4ISFA 2YHWA 5LY3A 4BQLA 1NGDA 1LCUA 2IVPA 4BVPA 2QWMA 4H0YB 2P9LA 3IFRA 3FZHA 3ATVA 1MWKA 1DKGD 2V51B 4PKHA 3GG4A 4BRKA 4XH5A 4B1ZA 4PKIA 2P9KB 2PBDA 3BUZB 1TUYA 1GLEG 4QS9A 4BRMA 2ZGZA 5EXWA 1TYQA 1DGKN 1XQSC 1NGCA 5ADXA 4H5RA 2FF3B 2VYPA 2Q31A 3CJ7A 2HOEA 3VPZA 1ZXOA 1X3NA 5E84A 2Q97A 1NGFA 1OKJA 4MLHA 3I33A 5F2RA 4FWMA 5AQHA 4B1YB 2E2PA 3AY9A 3UKUB 2VCPA 4BRCA 5EX5A 3CIPA 1E4GT 5AQNA 2A40A 5BR9A 1U2VA 3FZKA 1T44A 1QZ5A 2A41A 2ZF5O 3DXMA 3CJAA 3EL2A 4RTFD 3UKRA 3ZETA 1QQNA 2Q2RA 1SZ2A 3WXIA 4FWPA 5AQMA 5AQRA 5BPMA 4JD2A 3WQTA 3VOVA 4CZMA 4AM6A 3SMPA 3A5NC 3LM9A 4ISEA 5FPMA 4EHTA 2QM1A 2GWKA 4BR2A 4FWRA 1ZC6A 2BUPA 4KBOA 3ZX3A 1C0FA 1BUPA 4CZJA 3MK6A 3LDNA 2ZWHA 2QXLA 2YCHA 3EN9A 2QWLA 3VF4A 1NGEA 1ESVA 4DCHA 1Q18A 3LL3A 3WUHA 2AP1A 3D7EO 3FGUA 3LDPA 5AZIB 5AZIA 5FPNA 1GLJO 2FSKA 4CZFA 3HBTA 1NGJA 2QWRA 2E88A 3MCPA 2PAVA 5AQZA 4BC3A 4H5VA 1HKCA 3SMSA 2NRHA 1RDWX 5AQXA 1ATRA 2V7ZA 4O5FA 5AQJA 1R59O 3FFKB 3WT0A 1BO5O 3IUCA 3MN7A 1MA9B 2GTDA 2WUSA 3QICA 3GE1A 1NGIA 1K8KA 4BQZA 4BC2A 4CZLA 3VESA 3QB0A 2QWPA 2CH6A 5BREA 5F0XA 2I7NA 3A5OC 3CERA 1GLLO 3ATUA 4FO0A 2YHYA 2J4RA 1IJJA 1ZBSA 3CJCA 4AM7A 4QS8A 4I6MB 1V4SA 4H5NA 2DPNA 3GDQA 3VEWA 2HF3A 2V52B 2CGKA 2E1ZA 3G25A 2P9SA 1ATSA 3HI0A 5BN9A 4BRGA 4BVOA 1J6ZA 3P4IA 2UYTA 3VETA 3B8AX 3FLCO 4K25A 3QMLA 2A42A 3L0QA 4BRFA 3O80A 3M1FA 1NWKA 3ULEB 4K42A 4JAXA 2W41A 4DB3A 1U2VB 3DWLA 2OANA 2IIRA 3HM8A 3VERA 4HWIA 3D2EB 4H5WA 5BN8A 1MWMA 1BU6O 4MO4A 3LDOA 5AQYA 4H0TB 5AQQA 3R8EA 4DHYA 1HKBA 3O4WA 3EKSA 3O6WA 5JMVA 4FWQA 5TKYA 1XC3A 4CZGA 5AQKA 2NZTA 1XUPO 2YJEA 4BC4A 2E2QA 3GBTA 3ZX2A 1GLBG 3CHWA 5JICA 4Y0WA 3EO3A 2YHXA 5AQWA 3U4LA 3QBWA 3GL1A 2I7PA 3UE5A 3FZLA 4FWKA 2W40A 4FOIA 4YDUA 2YI1A 4IJNA 2P9IB 4IO8A 5B8HA 2CGJA 5AQTA 2Q0RA 4Z94A 5EVZA 1YVNA 3AARA 4M7XA 4CI6A 2CGLA 2V7YA 3O08A 3FE1A 3WEEB 1SAZA 4WQ4A 1EQYA 4H0VB 5AQIA 4H0OA 2QWOA 4BR5A 4CBUA 3C7NB 2EWSA 5AR0A 3U8XA 3O8MA 4QS7A 2P9KA 4FSVA 2P9PB 1RGIA 4BC5A 1QQOA 5ELZA 2FSNA 2P9UA 2H3GX 4FPBA 3AAQA 3CJBA 4JN4A 3VEZA 3KHYA 2F9WA 2A6AA 3VF2A 1JCEA 1BG3A 4WQ4C 3O1BA 2GUPA 2E1YA 3QFUA 3QDKA 4H0XB 5BRFA 2P9UB 4M63C 4BGAA 3HTVA 5JLHA 1V4TA 3CETA 4EFHA 4FWLA 1KXPA 2P9PA 4B9QA 4B1XB 5EOYA 1TYQB 4B1VA 2FSJA 3A5MC 1Z6RA 1YAGA 2E20A 1S3XA 5AQVA 2AA4A 1HUXA 3O1WA 3L6QA 4F9OA 5ADXH 4I6MA 3MN9A 3CQYA 5FPEA 3C7NA 3H46O 3VEYA 2VWBA 4K43A 2GEMA 3L4IA 4EHUA 3D2FB 5I9EB 3WEEA 4RWTA 4FWSA 3JS6A 4CJ7A 3HZ6A 3BF3A 4BR7A 2GELA 4CZIA 4PL7A 1T6CA 3ZEUB 5AQGA 3DJCA 3A8YA 2IVNA 4CBXA 3VEOA 1JCFA 4L3QA 2QWQA 1GLDG 3VEVA 1TUUA 4C23A 4WQ5C 3VGKA 3CJ9A 2P9NA 1NBWA 2ASPA 5JLFA 3QBXA 1BOTO 3KZBA 1JCGA 2E8AA 5CE3A 4HTLA 1H1VA 2Q0UA 4XH4A 3TU5A 3MN6A 4FPAA 3J8AA 1C0GA 1BDGA 5KPZA 2A3ZA 4IWVA 1HKGA 3A5LC 2NLXA 4BREA 1BA0A 4NO7A 3D2EA 4IZ9A 5LJWA 5KQDA 2F9TA 1QHAA 3EZWA 3MDQA 4JHDB 2Q1NA 3ENOA 3ULEA 2P9SB 3VENA 3EKUA 4BRPA 1YUWA 1X3MA 3W3DA 4JD2B 1HLUA 5AQFA 5AZJB 1RFQA 1GLCG 1KAYA 2KHOA 2FF6A 3VF6A 4BRLA 5AQOA 3F9MA 1P8ZA 2D0PA 3W0LA 2Q36A 1SQKA 3UKUA 3RSEA 5F1XA 2QW9A 4WYBA 1DEJA 1NMDA 1NGBA 1QZ6A 4B1UB 1YXQA 4BRHA 4YDUC 4BRIA 3LM2A 4BRAA 3GOIA 4IXCA 3A0IX 1K8KB 4MLEA 3DXKB 4CZKA 3KVGA 4CZHA 4BR4A 3DAWA 2P9NB 5AZJA 1KAZA 5E26A 3WXKA 3WQUA 3C0BA 4ISGA 1WOQA 4O8KA 3SK3A 4FWOA 5KQ8A 2ITMA 3SLCA 3CI5A 3U9DA 1MDUB 3H45C 4EAHD 5BRHA 3H1QA 1HPMA 4M7YA 5BPLA 3HSCA 3ID8A 3IMXA 1X9JA 4A2AA 5BRDA 4BR9A 4BG9A 1BA1A 5FPDA 2QWNA 4XEIA 4MO5A 5AQLA 4A2BA 5KPRA 3FZFA 4GNIA 4RCHA 1CZAN 3BP8A 3FZMA 4CBWA 1G99A 4NB4A 1WUAA 4BRNA 3DXKA 4EIAA 1U6ZA 2ASOA 2IVOA 1E4FT 4A61A 3H3NO 2BTFA 4BRQA 2GWJA 3OHRA 1T6DA 3H6EA 3MMVA 3S41A 1IG8A 3DXMB 1BWFO 4B1WB 3IDHA 3ENHA 4H5TA 1Y64A 3BF1A 3RSEB 1QQMA 1ATNA 3JXUA 3M6GA 4BR0A 3WXLA 2E2OA 1Z05A 5EY4A 4BRDA 5AQPA 4CD1A 3D2FA 4LC9B 2E2NA 1HJOA 2ZGYA 1NGGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HPZA 5A2QO 3NF8A 4M45A 3U9ZA 1YJWN 4DQQA 3TAMA 1KVAA 5AFUA 4DS5A 3E66A 4B08A 1L3SA 2YKNA 4DTSA 2F4VK 4JHDA 3VEXA 2O8FB 1ASVA 3MN5A 4KH6A 4CZEA 4H4MA 4N47A 2P9IA 3KJVA 4JNEA 4J8FA 1NGHA 2KZZA 3ZYYX 4B9VA 1T7PA 4KB0A 2D0OA 3RR7A 4LF4K 2CH5A 4PY5A 5LJVA 4CE9A 2G8HA 3C6AA 3UB5A 1FKPA 2O8CB 4YOYA 3R6MA 3HOSA 1NLVA 4DQ8A 3LDQA 2QK9A 2RKIA 3U6FA 4B3OA 3ZETB 3SJHA 2PYJA 4IJAA 3RR8A 1VQNN 2P9LA 1HQUA 3QEWA 3T1YK 3RMCA 2HW3A 3FZHA 3OBYA 1EETA 3V1RA 1DKGD 3ZT3A 3QEXA 3VQEA 4DV5K 1QQCA 4LF9K 3SYZA 2P9KB 2PBDA 1TUYA 3AVHA 5EXWA 4FJ8A 1TYQA 1DGKN 1XQSC 3K57A 3THWB 5ADXA 4H5RA 4AQYK 2FF3B 2VYPA 4M3TA 2Q31A 3CJ7A 3CFRA 1WBDA 4NXMK 1UOCA 1VAZA 4MDAA 1NGFA 1K9MO 1RDDA 5AQHA 2WFBA 3UKUB 2DY4A 3THXB 3ZCMA 3D0PA 5AQNA 2A40A 2HHXA 1T44A 1J9AA 3NGIA 2A41A 3CJAA 4N41A 3K5OA 5LMNK 3UKRA 5SZTA 1Q9XA 2UU9K 4RG8A 5K14A 1SZ2A 1D9FA 5AQRA 4JD2A 3P5JA 3VOVA 3CCRN 3SMPA 3LM9A 4IG0A 4LH5A 1S72N 4EP4A 2BUPA 5MLCQ 5HBMA 4AILC 3LDNA 3ZT2A 4DLEA 2HHWA 3E9LA 1NGEA 5TKWA 1JKHA 3DLGA 1Q18A 3LL3A 3TAEA 5AZIB 5AZIA 1YHQN 3CM6A 1GLJO 4KPYA 1NJZA 2FBYA 5C2FA 4J2DA 1HKCA 5AQXA 2FBVA 3VQ5A 1TVRA 3K9JA 1R59O 3QINA 4CJSA 3CF5L 4B9UA 2ITGA 3WNHA 4DTNA 4R5PA 4JRPA 4CGFA 4BC2A 4HCCA 2VWKA 2G8WA 5BREA 4IBNA 4B8CA 4DQRA 4CCHA 4FW1A 2I7NA 1QSSA 5E41A 3AVFA 3NVMA 4FO0A 4DV2K 1TGOA 2EX3A 1MU2A 3VQ4A 1VK0A 3TTDA 4AM7A 5KRTA 3SV4A 4AHUA 3GDQA 3NBPA 2HF3A 3VEWA 1NK8A 2V52B 2YKMA 3HOTA 3HPGA 1OH6A 1ATSA 5BN9A 4BVOA 4BDZA 3D6RA 4JI2K 1IKXA 1O13A 3N4QA 3O9UA 3I56N 1TV6A 3M1FA 3ULEB 4DFJA 3SQ0A 3LDSA 4M3YA 4CJ3A 4JKGB 2BGGA 5BN8A 5AQYA 4IEIA 3J81O 1XHZA 3L2WA 4M3WA 5JMVA 4FWQA 5TKYA 3SJJA 3CD6N 3TAGA 2IS3A 4BC4A 3CQ8A 3GBTA 1XNRK 3C94A 1IO2A 4DR4K 4AHTA 5KI6A 3L3UA 3KKRA 3OYHA 3EO3A 4DR5K 2HVHA 4FLTA 1QVFM 3ZSZA 1IH7A 4FWKA 3Q7CA 3OTOK 2PZSA 2DTUA 4YHHK 4M7XA 3RTVA 3O08A 2V7YA 3WEEB 3AA4A 2PFUA 3T19A 4DSLA 2QWOA 4CBUA 3AGKA 3LAKA 1OVQA 2GBZA 2QEXN 1KCFA 3PY8A 4BC5A 1VSLA 5ELZA 4CHNA 4B9NA 4R79A 1NK5A 1VSHA 3I8DA 2P9UA 4Q5VA 3AAQA 3CJBA 4RW7A 4JKGA 4JN4A 4ILHA 4DSEA 2A6AA 3VF2A 2E4LA 1BI4B 1JCEA 4DR7K 2KFZA 1KD1O 5CY4A 4LFCK 3QFUA 5BRFA 3AVCA 4M63C 3QLHA 5FRNA 4HUFA 3HPHA 4WFNL 1S9EA 4GW6A 1KXPA 3PIPL 4DV0K 4KB1A 3V9SA 4B1VA 4CF1A 1W7AA 3LP3A 4OLAA 3AVNA 1HUXA 4F9OA 2XRIA 2KTQA 2UUCK 4E7IA 3O9TA 2Z1HA 4K43A 3L4QA 4KH4A 3C6TA 5I9EB 3WEEA 4OGCA 4UQGA 2ZE2A 4KV8A 5H1SQ 4F2RA 3SZ2A 1LV5A 3AVGA 4DTUA 4BR7A 3NH0A 2GELA 3OYJA 1C0MA 4GV9A 2P5OA 5AQGA 1M1KO 3VEOA 4RW4A 1GLDG 1QSYA 1TUUA 2RF2A 1J5EK 4WE1A 4WQ5C 4IFYA 1Y97A 1ZBLA 1BQNA 1NBWA 5JLFA 3QBXA 3PSIA 1XC9A 1JCGA 2JWLA 1ZYQA 3TU5A 3V9UA 4DFKA 1C0GA 4KRFA 1IBKK 1HKGA 1J53A 1NK6A 3BGRA 3D2EA 4CFCA 4IZ9A 1NK4A 1QHAA 3EZWA 3MDQA 3QEIA 3RMBA 3EKUA 1X3MA 3N4PA 1BCOA 3T69A 1KAYA 4DU4A 2KHOA 4KH5A 5AQOA 4CJKA 4KI6A 4GKKK 4AHCA 4GVMA 1SQKA 3V9ZA 3UKUA 3OYGA 4FXDA 4ICLA 1QZ6A 5AJ3K 3LM2A 4DTXA 1TKTA 2PYLA 4OPAA 1K8KB 1A5WA 4W5RA 5C24A 4CZKA 2QXFA 3WXKA 4Z4HA 4Z4FA 5J2MA 1WOQA 1ZBFA 3L3VA 1BGXT 1VRUA 3HRGA 3NDKA 2ITMA 3WNEA 2PY5A 3SLCA 3FFIA 1JLEA 4CERA 1NKBA 4M7YA 1NKCA 4DR1K 3V9WA 4EP5A 3ID8A 3CCVN 3EY1A 3ZSXA 3SQ2A 4JS4A 5BRDA 4BR9A 1BA1A 5FPDA 2YNFA 4YFUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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