2CGLA

Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in complex with l-fructose, adp and a modeled atp gamma phosphate.
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
479
structure length
479
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords RHAMNULOKINASE
publication title Structure and Reaction Mechanism of L-Rhamnulose Kinase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli bl21(de3)
molecule tags Transferase
total genus 165
structure length 479
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2006-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cglA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cglA02
3C0BA 2QXLA 3LDPA 5AQNA 3UKRA 2I7PA 4LC9B 2HOEA 1ESVA 5AQQA 3ZX2A 1ZXOA 4B1UB 3MDQA 4CZLA 1T6CA 2V7ZA 1TUUA 4CJ7A 2VCPA 4BRFA 1HKBA 3CJCA 3J8AA 1R59O 4HTLA 2FSNA 4IWVA 4FO0A 3U9DA 3W3DA 4J8FA 1NGIA 3ATUA 3WUHA 4A2BA 1BG3A 1GLEG 3WT0A 2Q0UA 3VF4A 4O8KA 1G99A 1MA9B 3H3OB 5F0XA 4DCHA 4EFHA 2VWBA 1X9JA 1J6ZA 2CGKA 1YXQA 3VERA 3DXKB 2NZTA 2CH6A 3OHRA 1EQYA 1BU6O 4FWQA 4JHDB 1S22A 2Q0RA 3QMLA 1XC3A 4XH5A 3LDQA 4CZKA 5KPTA 2P9NA 4BRNA 2GTDA 3VEOA 2YJEA 1T44A 3GE1A 3H45C 4QS8A 5AZIB 4MLEA 5TKYA 3L6QA 3VEYA 5CE3A 3DAWA 3A5OC 3D2EB 5BRDA 1KAZA 3LM2A 3P4IA 1K8KB 1RFQA 1U2VB 2CGLA 3ENOA 4KBOA 5AQUA 3D2FA 5EY4A 1YUWA 3JS6A 3RSEB 2FF3B 2GUPA 4EIAA 2P9UB 3C7NA 2E2OA 5E26A 2P9PA 2YI1A 3UKUA 1BO5O 2P9SB 3QICA 5KQDA 1V4TA 3SLCA 1S3XA 4XH4A 3QBWA 5BPNA 3A5LC 3GDQA 4E1JA 3ENHA 4Y0WA 4JD2B 3VEVA 3VF6A 2A40A 2Q1NA 4B1YB 4ISFA 5EOYA 3ZETA 4BRPA 1NWKA 1NLVA 3LL3A 3L0QA 4BRLA 2IVOA 4A2AA 1H1VA 3FZMA 4H03B 2GEMA 3HTVA 3BF3A 4H0TB 2GELA 1JCFA 2P9LA 2D0PA 2NLXA 4BQZA 4H0XB 1BWFO 3ULEA 1KAXA 3CI5A 3FFKB 3AAQA 4BRMA 3VF2A 3G25A 3MMVA 4DQ8A 3QB0A 2OANA 3A0IX 4B1WB 1HLUA 5FPDA 4ISGA 3VGMA 2NRHA 4BRQA 5JLFA 2QWLA 4BC3A 2V7YA 5F1XA 1GLJO 4ISEA 3GL1A 2BUPA 4IJNA 3MK6A 3GG4A 5BR9A 1Z05A 1XQSC 2QWMA 4BR2A 4FOIA 3LDNA 3WQTA 1GLDG 1WUAA 2E1ZA 4MLHA 2E20A 4FWRA 4CI6A 5JICA 3AARA 1Q18A 2E88A 3LDLA 4FPAA 4BRAA 3EKUA 3VOVA 3ZX3A 5AQFA 3VEWA 5AQHA 4H5TA 3BF1A 5AQRA 3A5MC 3KHYA 5ADXA 3HSCA 2YHYA 3M1FA 1Z6RA 4BRKA 4HWIA 1GLBG 2E1YA 3I33A 1GLCG 3IDHA 5AQJA 4BRHA 3CJ1A 3LM9A 4RCHA 4K42A 5LJVA 1QZ5A 2P9IB 2J4RA 1TUYA 3VENA 5AQMA 4IO8A 5AQXA 3VGLA 2GWJA 5AQGA 1XUPO 1NGCA 2ZF5O 4BVPA 3S41A 4B1VA 4PKHA 2Q36A 3VESA 3IUCA 1TYQB 1QQNA 3HZ6A 3JXUA 4FPBA 4BRCA 2H3GX 4PKIA 3O1BA 2P9KB 1NGFA 3CHWA 4JHDA 4GNIA 3ZX0A 3R9PA 2D1KA 1QQMA 3O08A 1DGKN 2YCHA 5BN8A 5JLHA 2I7NA 4I6MB 2QWPA 4CD1A 3WEEB 1E4FT 4FWPA 5B8HA 1QQOA 1WOQA 3A5NC 3O80A 4F9OA 5LY3A 1T6DA 2D0OA 2QWRA 1KXPA 1BOTO 3D2EA 1NGAA 3CJAA 3TPQA 4H5WA 3BEXA 2WUSA 1SAZA 4NO7A 3RSEA 1ATRA 2A6AA 4YDUA 2QWQA 4CZEA 4H5RA 2P9UA 1ATNA 1DEJA 3HI0A 2P9SA 1SZ2A 2A5XA 1NBWA 4AM7A 4BR5A 3IMXA 4M7YA 4M63C 4M7XA 3MN7A 5AFUA 2E2QA 3CQYA 4IXCA 1JCEA 3HBTA 3SK3A 2HMPA 4C23A 4MO5A 3DXMB 4PKGA 4FOEA 3WXIA 3A8YA 4BR9A 3H1QA 4H0VB 4EHUA 2GWKA 2HF4A 4B1XB 3VEZA 3WXLA 4BG8A 4BC5A 1LOTB 3F9MA 4FWLA 1X3MA 4B9QA 2V52B 1HX1A 4CZIA 2ZWHA 4RWTA 3H46O 4H0PA 3MN6A 4CZFA 4K43A 2VYPA 5BPMA 3D7EO 4RTFD 1GLAG 2DPNA 4XEIA 5BN9A 1YVNA 4BR0A 2QM1A 3H6EA 2FXUA 1MWKA 3CJ7A 5FPNA 3VGKA 4CBXA 3SMPA 5AQYA 5AQLA 4BRGA 4AM6A 4BC2A 4DB3A 2W41A 4Z94A 4QS9A 5BRFA 1NGBA 3ATVA 3M3ZA 1QZ6A 2Q97A 4JAXA 3FR0A 3CJ9A 3QFPA 3ID8A 2Q31A 4WQ4C 4CZHA 4H5NA 2IIRA 4BG9A 2YHWA 3ZEUB 1IJJA 3O5BA 4K25A 5EX5A 3LDOA 1NMDA 3WQUA 1SQKA 2AP1A 2F9WA 4IZ9A 1ZC6A 5KPRA 3EN9A 1U6ZA 2P9IA 3AY9A 5ADXH 3FZKA 5JMVA 5AZJB 3VEXA 1NGGA 1RDWX 4CZGA 3VPZA 2CH5A 4BC4A 5KPZA 5EXWA 3CIPA 2ITMA 2AA4A 4L3QA 3B8AX 2PBDA 3FZLA 4PL7A 4H5VA 1TYQA 3DJCA 4FWKA 1ZBSA 3GOIA 4WQ5C 1BA0A 2P9KA 2E2PA 1LCUA 3M6GA 4CZJA 3H3NO 4BREA 1BUPA 1C0GA 5I9EB 3DXKA 5AQOA 3UE5A 2ZGZA 1RGIA 3MN9A 5AQPA 3SMSA 2ASMA 4JNEA 4FL9A 3UKRB 4K41A 5E84A 4BROA 2E2NA 4WYBA 4I6MA 1IG8A 1V4SA 3R6MA 3WXJA 4BGBA 3DWLA 2ASPA 3SJHA 3WEEA 1BDGA 2A3ZA 4H0YB 2BTFA 4JN4A 4A61A 1HPMA 4H0OA 1E4GT 2YHXA 2FSJA 4O5FA 2W40A 5AZIA 1Y64A 3O1WA 1JCGA 4BGAA 2IVNA 4EAHD 5BPLA 3CJBA 2CGJA 5AQZA 3O8MA 3EKSA 3I8BA 4GY2B 3U9ZA 5AQKA 4CBWA 4CBUA 1K8KA 1U2VA 4FWNA 5AQSA 1GLLO 1BA1A 2E8AA 1HKCA 3MCPA 4CZMA 3UB5A 3O6WA 5AQTA 1HUXA 2IVPA 2D4WA 1D4XA 1GLFO 4IJAA 2UYTA 4BRDA 3FZHA 4JD2A 5ELZA 2P9NB 3FZFA 3KVGA 3DXMA 1QHAA 2HF3A 4DHYA 5AQWA 2QW9A 5AFUH 1P8ZA 4CD3A 5LJWA 1HJOA 1NGDA 4FWOA 4FWMA 5AQIA 1MDUB 2A42A 3GBTA 4YDUC 2FLOA 1X3NA 2EWSA 2PAVA 1YAGA 4BR4A 4EHTA 1HKGA 3D2FB 1CZAN 3CQXA 1NGJA 5AQVA 3C7NB 2V51B 5F2RA 4A62A 2P9PB 3UKUB 3AAPA 5FPEA 3FGUA 3H1VX 4BR7A 5BRHA 3ZETB 2QWOA 3QBXA 5AR0A 2QWNA 4XH1A 3FLCO 3R8EA 3CETA 5BREA 3MN5A 3TU5A 3EL2A 4FWSA 4MO4A 2P9LB 2ZGYA 3WXKA 2A41A 1ATSA 2ASOA 2F9TA 3ULEB 1NM1A 3CERA 3QDKA 3O4WA 3VETA 1C0FA 3IFRA 4WQ4A 4BQLA 3ZEUA 4BRIA 3HM8A 3BUZB 5KQ8A 1OKJA 5FPMA 3L4IA 2KHOA 5AZJA 1MWMA 1NGHA 3U4LA 2FSKA 4BVOA 3FE1A 3W0LA 3EO3A 3BP8A 4FSVA 4B1ZA 2Q2RA 3KZBA 4NB4A 2FF6A 3U8XA 5EVZA 4PL8A 4WQ5A 3QFUA 1NGEA 4QS7A 2YJFA 1KAYA 1DKGD 3EZWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AA2A 3OS0A 3LWMA 3UKRA 1IBLK 2HOEA 1ESVA 4CZLA 4RG8A 4ELVA 4BRFA 3CJCA 1R59O 2FSNA 3JYTA 3U9DA 1B9FA 1X9SA 1NGIA 2HHXA 3WUHA 3VA3A 3CCMN 4DV0K 1GLEG 4B3RK 3Q7BA 3WT0A 4CF0A 3ZSYA 1J5OA 3NCIA 3H3OB 3ID6A 4BY9C 2VWJA 2VWBA 4YOWA 1X9JA 1YXQA 4W5RA 2Z1GA 3CCJN 1JL2A 4YOTA 3LPTA 1EQYA 1BU6O 1JLQA 2YKMA 3K59A 4XIUA 4J2BA 1XC3A 3QETA 3KD1E 5CZ1A 1EP4A 4JI1K 2YJEA 4OLAA 1YIJN 3GE1A 2WC9A 3VMFB 3CC4N 1JLGA 4L8RB 1ZBFA 3LP1A 4Y1DA 4CEOA 3DAWA 4AHRA 4EZ6A 1KAZA 2ITGA 3P4IA 5K14A 3ENOA 5AQUA 3RMAA 4BE0A 3D2FA 5EY4A 5IT9O 1JKHA 4CJEA 4E7JA 2FBVA 1XMOK 3C6UA 1HNVA 3MCAB 3V9SA 4F2SA 1HQEA 1S3XA 4XH4A 4CJTA 4CGGA 3NH1A 4Y0WA 3HPOA 1F21A 4B9UA 1NWKA 1BIZA 2VG6A 4JI7K 2IVOA 4JKGB 1VQ6N 2G8WA 1ITGA 3HTVA 5CY4A 2GELA 3OYCA 3OJUA 2D0PA 3QEXA 4BQZA 4H0XB 4ELUA 1BWFO 1T8EA 3PIOL 1KAXA 1T03A 2NRXA 3QB0A 2OANA 1LAWA 1BCMA 3B6OA 4BRQA 1TL3A 4NXNK 1RT5A 4ISEA 4JKDA 4IJNA 1C0UA 3MK6A 4CESA 2Z1IA 1HMVA 1W0HA 4CGJA 2OCEA 3VTHA 5J1EA 1CZBA 1WUAA 1BQNA 3NFAA 3CCQN 3NF9A 4FWRA 3K58A 4CI6A 3AARA 3QEVA 3NF6A 2YNFA 1WAFA 3K9KA 3ZX3A 4CHOA 4C1NI 5AQFA 1YTAA 5AQRA 4LH5A 5LMUK 3DRPA 4JI3K 1GLBG 4CGDA 3L2QA 2E1YA 4JI2K 1GLCG 3LM9A 4DR5K 2HVIA 1T3VA 2O8EA 2HNZA 3V81A 2E5LK 4JKFA 1WB9A 2HB5A 1EETA 5AQXA 3VGLA 4JI5K 1RT4A 4KPYA 4DUYK 3S41A 1HNZK 4CEBA 1IH7A 3ZSQA 3E01A 5M1QA 4FVUA 3IUCA 1QQNA 1QTMA 4IG0A 4FJLA 1VQ5N 3O1BA 4CGIA 4ZHRA 3R9PA 1QQCA 4FLYA 4LF8K 3CM5A 3AVFA 5BN8A 2I7NA 3IAYA 2QWPA 4FWPA 3IS9A 1WOQA 4OJRA 4F9OA 5LY3A 2D0OA 3C6HA 5C2DA 1QS4A 3D2EA 3CF5L 3TPQA 1TK0A 4BDYA 4BE2A 3THXB 3M8QA 4DTMA 1ATRA 3CCUN 4W5QA 4YDUA 4Y1CA 3QIOA 4H5RA 3TTDA 1ATNA 1RTIA 3HL8A 1Z25A 2P51A 3TANA 2JGUA 3V6DA 4CVNE 3MXIA 5AFUA 1JLEA 2RN2A 5CZ2A 3HBTA 4CGFA 4NXMK 1NJXA 4DSEA 2OTLN 3VQEA 2IGIA 4PKGA 4BR9A 5HROA 3H1QA 4DLEA 2HHUA 3LAKA 1MU2A 1RBSA 1Q7YO 4ILJA 4DR6K 2F4VK 3VQQA 1QSLA 3TAMA 4E7KA 1L5UA 4FWLA 2V52B 4DFJA 3DLKA 3B6PA 3S3OA 4I9QA 4IOXA 3MN6A 4K43A 5BPMA 1BCOA 4JLHA 1ASUA 1KLMA 4JI0K 3PV8A 3WNFA 1MWKA 3F2KA 1U4BA 1YJNN 3SMPA 2NRVA 5AQLA 4QS9A 2O4IA 1NGBA 2Y1JA 3KLGA 4DG1A 2QXFA 3BZKA 4M45A 1N33K 3LDSA 1DLOA 4B3TK 4DS5A 3QEIA 3SUQA 4FZZA 3LDOA 4CJLA 1NMDA 3WQUA 5C0YA 3NVKA 4OGCA 5M1PA 5ADXH 5GIOA 3FZKA 5AZJB 1SKRA 3N4QA 4B9TA 4E3SA 3VQ8A 3SQ1A 4BC4A 2QKKA 5KPZA 5EXWA 4DR3K 3PUFA 3AVCA 5TKWA 3RVCA 4WFAL 4CERA 4K8ZA 3V9ZA 4MDAA 3GOIA 1BA0A 2P9KA 4PQUA 4HUFA 1LCUA 4LSLA 4CZJA 3RR7A 5I9EB 1SKSA 1SS6A 3DXKA 5AQOA 2ZGZA 2ASMA 4DSIA 2HHVA 4K41A 3HSTB 2KTQA 3AVBA 1EXQA 2VQEK 1IG8A 3V9UA 2ASPA 2A3ZA 2BTFA 4FW2A 4X65K 4CEFA 1BGXT 4FJJA 2NRZA 4MQ3A 4CFBA 4DR4K 2FSJA 2JWLA 5AZIA 1Y64A 3EYZA 3ZCMA 2OPPA 3O8MA 2ETJA 2D0AA 3O9UA 5AQKA 4CBUA 1K8KA 2HVHA 5HP1A 3U3YA 3HPGA 1BQMA 2E8AA 4IFEA 4W5NA 5JS1A 1HQUA 3WNGA 5HRSA 1GLFO 5GAGP 1CLQA 2UYTA 1Q82O 1RDAA 3VQCA 3KLEA 3SV3A 4PWDA 2NRTA 1TVRA 3KWGA 5GAHP 1WLJA 5ELZA 1SV5A 2ATQA 1S1WA 4OKKA 3QINA 2QW9A 2YV0X 4DF4A 4FJKA 5FRNA 1HJOA 2IOCA 1VSLA 1NOYA 4CJKA 4K0KK 5J2QA 4CHPA 1X3NA 2EWSA 1TK8A 1YAGA 4LY7A 4FJGA 1NOZA 3SQ2A 1CZAN 3P1GA 1NGJA 5AQVA 3KJVA 4N76A 2V51B 4KKOA 5F2RA 1WBBA 3SUNA 2F96A 1C1AA 5FPEA 3FGUA 4BR7A 4HHTA 3CCEN 3TAQA 1IKYA 2JLEA 2NRRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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