2CGLA

Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in complex with l-fructose, adp and a modeled atp gamma phosphate.
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
479
structure length
479
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli bl21(de3)
publication title Structure and Reaction Mechanism of L-Rhamnulose Kinase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RHAMNULOKINASE
total genus 165
structure length 479
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2006-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cglA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cglA02
3QB0A 4WQ4C 2W40A 3HM8A 5LY3A 4EAHD 2UYTA 1QZ5A 2A41A 1BG3A 3AAQA 1GLJO 2FXUA 4DHYA 3LDQA 3H1VX 3VGLA 3WQTA 1DGKN 3BUZB 2QWLA 3VETA 2E20A 5FPMA 5KPRA 2HF3A 3IDHA 5F1XA 2NRHA 3ID8A 2FLOA 3LM2A 3CERA 3WXJA 2QW9A 5KPZA 1TUUA 5AQFA 4CD3A 4IJAA 3EL2A 4WYBA 1MWKA 2HOEA 4BR9A 2YHYA 4IWVA 2EWSA 1ZXOA 1NGDA 4A62A 4EFHA 2P9PB 3D2EB 4JN4A 1P8ZA 3ATVA 2Q97A 1HKCA 5JICA 1Z6RA 4BR2A 1X3NA 3SMSA 5BREA 1S3XA 4O5FA 3EO3A 1K8KA 1QHAA 3HTVA 4BRAA 1BA1A 1Q18A 3UKUA 3FZHA 4GNIA 1ESVA 3WUHA 4CBUA 4CZEA 3H45C 1K8KB 2I7PA 4MLHA 4AM7A 1BDGA 1MWMA 2ZF5O 3UKUB 1YVNA 3SJHA 4B1WB 1DEJA 3C0BA 2CGLA 1GLAG 2A6AA 2GTDA 2D4WA 2A42A 5AQHA 3UB5A 2CGJA 3BEXA 5JLHA 5LJVA 2QWRA 3GG4A 2Q0RA 3VPZA 5I9EB 3U9ZA 4B1ZA 4BRIA 1WUAA 2GEMA 3DXKA 4CZMA 3WXIA 4WQ4A 5B8HA 4O8KA 1T44A 5AZJA 1RDWX 3QFUA 1XQSC 2J4RA 2V51B 3CJCA 3J8AA 1R59O 4I6MA 1RGIA 2E2OA 3DXKB 4KBOA 4BGBA 3H3NO 3VGMA 2W41A 2NLXA 3EKSA 3I33A 4BVPA 5AZJB 3CJ9A 5AZIB 1C0FA 4B9QA 3TPQA 3ULEA 1V4SA 1GLLO 2IIRA 5BPNA 1NWKA 1TYQB 3IFRA 4BRKA 2P9UA 2D0PA 2YJFA 2YJEA 4EIAA 4FWRA 3JS6A 2V52B 4JD2A 3KHYA 4GY2B 1WOQA 1NBWA 4PL8A 3DXMA 5AQRA 2VWBA 1NGFA 1XC3A 3AY9A 4JD2B 2P9KA 1LCUA 1CZAN 3A5NC 3FR0A 4NO7A 4PKIA 4CJ7A 1T6DA 2P9KB 3MDQA 2A3ZA 1E4GT 4BC3A 4FOIA 3O5BA 2D1KA 4XH4A 3I8BA 3S41A 2H3GX 2ZGZA 5ADXH 1YXQA 3QBXA 5JLFA 4RWTA 1ATSA 3GOIA 3KZBA 3FGUA 2GELA 3ZX3A 1NM1A 2FF6A 1RFQA 5BRDA 5AQMA 3VOVA 3L0QA 4JNEA 3H6EA 5KQ8A 4BRHA 1TUYA 5AQLA 3FE1A 2IVOA 4H0VB 5TKYA 3VEXA 4K41A 4CZJA 5EY4A 4WQ5C 1NGIA 4BG9A 5AQTA 4IZ9A 3CJAA 1V4TA 2OANA 3ENOA 4BRQA 1SAZA 3WQUA 3LDPA 4FWPA 2YHXA 5ELZA 1T6CA 3ZEUA 1C0GA 3U9DA 3A5MC 3O8MA 2E8AA 3G25A 3R8EA 4NB4A 3D2FA 4AM6A 2P9LA 2ITMA 5KPTA 4JAXA 3GDQA 3QICA 4BQLA 3FZFA 2ASOA 1E4FT 4DQ8A 3UE5A 1NMDA 2P9LB 2QXLA 1BUPA 4FSVA 4H0XB 2QWOA 3VF4A 4BRMA 2E1ZA 4MO5A 4F9OA 4E1JA 2E2NA 5AQVA 1ATNA 3VESA 5AQOA 3H46O 4K25A 2P9NA 2QWQA 5AQYA 1XUPO 5BRFA 3FZMA 3BF1A 4J8FA 3MK6A 3DJCA 2FSKA 1BU6O 2P9NB 3LDNA 3AAPA 3QBWA 4CZFA 2ASMA 1NLVA 3UKRA 5KQDA 4H5NA 1HX1A 5EX5A 4FWQA 4K43A 3ENHA 2I7NA 2F9TA 1J6ZA 3C7NA 1GLEG 3UKRB 3MN9A 4BC5A 3F9MA 2YI1A 1SQKA 5EOYA 4I6MB 3VEWA 5AQXA 3RSEA 1HUXA 3M6GA 4BR5A 3O1WA 3SMPA 4WQ5A 3FLCO 5AQGA 3VEOA 3CJBA 3VF2A 1HPMA 2AA4A 2E2PA 4BC4A 4BRNA 3ULEB 4ISGA 4M7XA 3GL1A 5E26A 3CI5A 4B1UB 4FWNA 2P9UB 4LC9B 4ISFA 4A2BA 5BRHA 1BA0A 4JHDA 3CETA 2CH6A 1DKGD 4FL9A 2CH5A 4CZIA 3IUCA 1S22A 4CZHA 3ZETA 4H03B 2IVPA 2HMPA 5AFUH 1JCFA 3MN5A 3O08A 3QDKA 3DXMB 3HI0A 1X9JA 1KXPA 3ZETB 3VEVA 2KHOA 4BQZA 1U2VA 3A5OC 4BGAA 4H5WA 2VYPA 4DB3A 5BPLA 1KAYA 2Q2RA 4H0PA 4YDUC 4QS7A 1Y64A 2QM1A 3QFPA 1BWFO 2YCHA 4H5TA 2Q1NA 3WXKA 1U2VB 3VF6A 4EHUA 2D0OA 3GE1A 2FSJA 2FF3B 4FO0A 4BREA 3GBTA 5BPMA 4BG8A 1HLUA 3QMLA 5AQWA 4B1XB 3WXLA 3R9PA 3O80A 3O4WA 1YUWA 3VERA 1HKGA 3M3ZA 1YAGA 3CQYA 2FSNA 3FZLA 1BOTO 1QQOA 3L6QA 2Q36A 1X3MA 3EZWA 3FFKB 2YHWA 3DAWA 1H1VA 3MCPA 3ATUA 3A8YA 1EQYA 2A40A 1QZ6A 1KAZA 4XEIA 5AR0A 4BRFA 3A5LC 1G99A 4MO4A 5ADXA 2ASPA 3ZX2A 1ZBSA 2ZWHA 3MMVA 4H0OA 3MN6A 4FWSA 4BR7A 5AQZA 4C23A 3BP8A 4BRLA 2E2QA 2QWMA 2PBDA 5FPEA 5F0XA 4CD1A 3ZEUB 5LJWA 5AQIA 3D7EO 3EN9A 2CGKA 2QWNA 3LM9A 2P9PA 3D2EA 1NGEA 4QS9A 4EHTA 3BF3A 4PL7A 3D2FB 2V7YA 1LOTB 3LDOA 1NGHA 5EVZA 4BC2A 2GWJA 4FOEA 3MN7A 1HJOA 4CZLA 2E88A 3CHWA 2IVNA 4QS8A 3VGKA 4M63C 4DCHA 3WT0A 3H1QA 3HBTA 4FWKA 4M7YA 5AQJA 4K42A 4BRDA 4PKGA 1KAXA 1ATRA 4XH1A 1GLDG 2VCPA 4CI6A 4XH5A 5AQPA 4CZKA 4A2AA 2BUPA 4BR4A 5EXWA 3FZKA 5F2RA 1ZC6A 3SLCA 3M1FA 1JCGA 1GLFO 5AQSA 4Z94A 2Q31A 3OHRA 4YDUA 4BVOA 4PKHA 3CIPA 4RTFD 3LL3A 4IXCA 3VEZA 1NGBA 4HWIA 2PAVA 2GWKA 4L3QA 4H0YB 1NGJA 3ZX0A 5FPNA 3W3DA 1MA9B 1SZ2A 3HZ6A 4ISEA 3WEEA 4B1YB 3P4IA 1Z05A 2A5XA 3TU5A 3C7NB 5AQNA 1D4XA 4BROA 4IJNA 5JMVA 1GLCG 3O1BA 3WEEB 4H5RA 4B1VA 3AARA 3RSEB 3HSCA 4FWOA 4CBXA 1OKJA 5AZIA 4FWLA 1IJJA 3O6WA 2F9WA 1IG8A 3KVGA 1QQMA 3U4LA 3CJ1A 4Y0WA 4CBWA 1TYQA 2WUSA 3JXUA 2GUPA 4MLEA 5BR9A 2HF4A 4A61A 3EKUA 3B8AX 5FPDA 1NGGA 4JHDB 3H3OB 3SK3A 2V7ZA 1MDUB 5AQUA 1BO5O 5BN9A 1U6ZA 3R6MA 1NGCA 4IO8A 3CJ7A 3VENA 4BR0A 2Q0UA 2QWPA 3L4IA 3DWLA 5CE3A 4FPAA 5AQKA 1GLBG 3VEYA 4BRGA 4RCHA 3LDLA 2BTFA 2NZTA 4H5VA 4BRPA 2DPNA 2ZGYA 5BN8A 1QQNA 1NGAA 3U8XA 2P9SA 4H0TB 5AFUA 2P9IA 1JCEA 3IMXA 2AP1A 4FPBA 4HTLA 3A0IX 3CQXA 4CZGA 4BRCA 2P9SB 5AQQA 2E1YA 2P9IB 5E84A 1HKBA 3W0LA 4FWMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WQ4C 2W40A 1S72N 5CHIA 1BG3A 3BGRA 3L2VA 3THYA 3VGLA 5J2QA 1DGKN 2QWLA 4F2SA 4E19A 3IDHA 4G9ZA 5F1XA 1VQ5N 2FLOA 1JLCA 1ZYQA 1XNQK 4DR5K 5KPZA 4CD3A 3L2WA 3OYJA 4WYBA 2B5JA 4CECA 2EWSA 4A62A 1BIUA 5HBMA 4EFHA 4WFAL 2P9PB 1Q81O 1P8ZA 4DFMA 3ATVA 4FZZA 3F5TA 1Z26A 1HKCA 1EETA 4U7BA 2ZM6K 4O5FA 3RTVA 3U3GA 3KLHA 4BY9C 3ZCMA 4M3UA 2XY5A 2NRTA 1QHAA 3DRSA 3UKUA 5J2MA 3E1YA 1NK4A 3WUHA 4YOUA 2AJQA 4CBUA 4FJKA 4DR1K 2I7PA 4MLHA 3TTDA 3SV4A 4AQYK 3WNEA 4X66K 1YVNA 1QS4A 5C2FA 2A1RA 4IO9L 3HM9A 2D4WA 2ZJRL 3BDPA 5M1KA 3ID6A 2O8DB 3GG4A 2Q0RA 3VPZA 2Q3SA 1WUAA 2GEMA 3DXKA 3TTCA 5LL6Z 1S9EA 5B8HA 4O8KA 1FJGK 3QINA 4C8MA 1RDWX 3QFUA 2J4RA 3V1QA 3PO4A 3Q7BA 4CK2A 3PIOL 3K58A 5JS1A 4X62K 3EKSA 3I33A 4BVPA 5AZJB 1KFDA 4HUGA 2P5OA 4B9QA 4M45A 3I0RA 3CCMN 3ULEA 2EX3A 4IDHA 3VQAA 3CCSN 1NWKA 2F8SA 1TYQB 3BZCA 3IFRA 2PYJA 3AGKA 1FW6A 2YJFA 4EIAA 4JK9A 4B9MA 1HNVA 2IS3A 3KHYA 4W5QA 4DTNA 3HL8A 1NBWA 3M8QA 3QEPA 5AQRA 4FJ5A 2RE2A 3AY9A 2P9KA 3TSPA 3A5NC 3FR0A 4DR2K 4NO7A 1NJWA 1T6DA 3MDQA 1E4GT 4O8UA 3O5BA 3J80O 4ICLA 1TVRA 4DV6K 2OTJN 1WAJA 3I8BA 3S41A 3TAPA 3QBXA 5JLFA 1ATSA 1DT9A 2O4GA 3V9ZA 3ZX3A 2FF6A 1RFQA 3NH1A 5AQMA 1XMOK 4E3SA 3KKRA 1NJYA 4FJJA 1VQ9N 3FE1A 5TKYA 3VQPA 4KTZA 3EEQA 4WQ5C 4KHNA 5AQTA 1V4TA 3RWUA 3ENOA 3O9UA 3LDPA 4FWPA 4DKWA 1VSHA 3ZEUA 4CCHA 4BDYA 4KHWA 4FJHA 2E8AA 3G25A 3R8EA 4N56A 2QKKA 4DR3K 3D2FA 1TK0A 2P9LA 5KPTA 4JAXA 5C24A 4ILGB 4CJUA 3UE5A 1NMDA 3LZJA 2HHQA 2QXLA 3KKSA 5HRRA 2OPRA 5TKWA 1S1UA 3VF4A 4MO5A 1VK0A 3VTHA 2W6LA 5JS2A 4E1JA 4CEBA 4CJPA 5AQVA 2YX6A 5AQOA 4CJRA 4IFEA 2X78A 5AQYA 3RMCA 3DRRA 1RBVA 3MEEA 1UA1A 3J7YP 3M8SA 3THXB 3DJCA 3CC7N 4CZFA 4NXNK 3UKRA 5KQDA 4H5NA 3O3FA 4IOCL 1LW0A 1NNEA 3KIOA 4OLBA 4MDBA 4KHQA 3AA5X 2I7NA 4KKOA 2F9TA 4LSNA 4KRFA 3F9MA 3CPEA 5EOYA 3NGYA 4OPJA 3VEWA 3LAKA 5CR4A 1HUXA 5J2NA 4DF4A 3SUOA 3OJSA 3THVA 5AQGA 3VEOA 1HPMA 2AA4A 2E2PA 4BRNA 1GOAA 4M7XA 4YHHK 2ETJA 4DV4K 2JLEA 3TAMA 4CESA 4PHTX 3VA3A 4LC9B 4KB1A 4A2BA 3MECA 3IAYA 4CJEA 4CZHA 3C65A 4Z4HA 1KRPA 3ZETA 2IVPA 2O4IA 3SI6A 1JLFA 4FK2A 2E4LA 3DXMB 3HI0A 4BQZA 3A5OC 5BPLA 2Q2RA 4H0PA 4LSLA 3QFPA 4CE9A 4H5TA 2Q1NA 3WXKA 3CC2N 4YFUA 4FJMA 2FF3B 3OVNA 4AHVA 4BREA 3VMFB 3GBTA 1HLUA 4GV3A 5AQWA 4KHYA 4B1XB 3SUQA 5CZ1A 1QHTA 3QEWA 3O4WA 1YUWA 3OYNA 1OH5A 1HRHA 4YORA 3CQYA 3SBTA 3SAGA 4IEIA 4JKGA 1S1WA 2X6NA 3MAQA 4E7IA 4F2RA 4CFBA 3RMBA 3L6QA 1X3MA 3MCPA 4BE0A 1KAZA 3L2QA 4JKDA 4DTJA 5HRNA 1T7PA 4I9LA 3ZX2A 5LMUK 3TAQA 2ZWHA 5JVHL 3PY8A 1RBSA 3U3YA 4HVJA 4C23A 1NK9A 1JXBA 3BP8A 1XI1A 3NF8A 3G71N 2Y1IA 4CD1A 1CXUA 4AHUA 5LJWA 1EX4A 2CGKA 3RVCA 2P9PA 1VSKA 4J2EA 4ZHRA 4OGEA 3VN5A 3C6HA 3OBWA 2V7YA 1LOTB 4M41A 3T19A 1C0MA 4O5BA 1HJOA 2IVNA 1VSEA 1VSIA 4M63C 2VGMA 2NRVA 3DLBA 3QEIA 1KTQA 4CEZA 4GKKK 3C95A 4X64K 4BE2A 2VGNA 1ATRA 3HP6A 4XH1A 3AVKA 1HYZA 4LH4A 3VQ7A 1B9DA 4XH5A 4DS4A 4CZKA 4KB0A 4A2AA 4JKCA 4BR4A 5F2RA 1JCGA 1ZBLA 1TL1A 2O8EA 1VAZA 2XY6A 1BI4B 3PIPL 3NGZA 2LSNA 3V9UA 5EU7A 1IBLK 4FJ9A 4KPYA 1VQLN 4CW7B 3K5LA 4JKHA 3U6FA 3V1OA 3AVIA 4H0YB 1IO2A 5FPNA 3UIQA 4KHUA 4DTSA 5J1EA 5C12A 4ISEA 1YITN 3CD6N 1WSHA 1Z05A 2A5XA 2FBYA 1D4XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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