2CGLA

Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in complex with l-fructose, adp and a modeled atp gamma phosphate.
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
479
structure length
479
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure and Reaction Mechanism of L-Rhamnulose Kinase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli bl21(de3)
molecule tags Transferase
molecule keywords RHAMNULOKINASE
total genus 165
structure length 479
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2006-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cglA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cglA02
4H5TA 4CBUA 1BWFO 2QWMA 3O08A 4IXCA 3GG4A 1Y64A 4CJ7A 1BA1A 2NRHA 5B8HA 1KXPA 3ZETB 2P9UB 4IJAA 4H0OA 5KQ8A 4BR7A 5F2RA 4BRMA 3BP8A 3QMLA 3CIPA 1NWKA 3I33A 5AQYA 1GLJO 4BC5A 2FF6A 2BTFA 2QWLA 4B1WB 3HTVA 4FWKA 2PBDA 4M7YA 2NZTA 4DB3A 3VEYA 1XQSC 1ZC6A 2E88A 3A8YA 5EOYA 2ZGZA 3ZEUA 2PAVA 4CZHA 4A61A 2V7YA 5AQSA 4BRNA 2Q97A 2E20A 1KAZA 5AZJA 3JXUA 2E8AA 2P9KB 3CETA 1KAXA 5TKYA 4BG8A 1ATNA 4CZLA 3ZX2A 2ASOA 1MDUB 5FPMA 1TYQA 4BRDA 4BRFA 3MDQA 2UYTA 3L4IA 2HF4A 3MMVA 4DCHA 1NGJA 2CH5A 3QBWA 4B9QA 4B1XB 4FOIA 2CGJA 1T6CA 1X3NA 3D7EO 1U2VB 2E2OA 5AQIA 4H5RA 4JAXA 5AQLA 2Q1NA 2FSNA 1YXQA 4HWIA 1C0FA 4I6MB 1JCGA 3GOIA 1ESVA 3KVGA 4QS8A 3DWLA 4PKIA 3W0LA 3CJ9A 1J6ZA 1HLUA 2YI1A 5ELZA 1HKBA 3VETA 2E1YA 1BO5O 3LDQA 5AQWA 4FO0A 1MWKA 4CBXA 3WXIA 3FE1A 3CERA 1BG3A 4JHDA 3CQXA 5AQRA 3VEVA 3IFRA 1SQKA 5FPNA 3AAPA 1CZAN 1EQYA 4ISGA 3B8AX 3UE5A 2CH6A 2P9NB 5FPEA 3M3ZA 2A6AA 2KHOA 1X9JA 4K43A 3VEXA 3DXMB 1HJOA 4A62A 2A5XA 2ITMA 1ZXOA 1GLBG 3CJBA 4AM6A 4FPBA 4BRKA 5AQXA 4BQZA 3EKSA 2H3GX 2P9KA 2YCHA 4MO5A 3H46O 4B1ZA 2QWPA 3VPZA 4C23A 4IJNA 2V7ZA 3HZ6A 4DHYA 4K42A 1HUXA 2AA4A 4GNIA 4CD3A 3LM9A 4PKGA 4BR4A 1ATSA 1TUUA 4FWOA 3QDKA 3VGKA 1S22A 3D2EB 2YJFA 3GL1A 5AZIA 4CZEA 2A41A 1OKJA 2P9LB 4K41A 4RCHA 4WQ4C 3UKRB 3KZBA 4BR5A 4EAHD 3VF4A 2P9SA 1QQMA 1QZ5A 4FWLA 1GLEG 2IVPA 1NGCA 3U8XA 1DGKN 5AQQA 3FFKB 5AQGA 4H5NA 1DEJA 3C7NA 2ASPA 1BUPA 2P9UA 1QHAA 4H0VB 4CD1A 4M63C 4PKHA 3EZWA 3ULEA 4WQ4A 4PL8A 3O8MA 4BQLA 3EL2A 4AM7A 3A5MC 3ENOA 4BRCA 5I9EB 3H6EA 3MCPA 5AQVA 3CJ1A 4Y0WA 3VGMA 3IUCA 3VEZA 5EY4A 4BC2A 1XC3A 3HBTA 3O5BA 4JHDB 3UB5A 1YAGA 1BDGA 2QWQA 4BREA 3MK6A 4RWTA 2P9NA 3S41A 4IZ9A 4CBWA 3VF6A 1E4FT 4BRQA 4BC3A 3HSCA 4NO7A 4NB4A 4A2AA 4IO8A 2QW9A 1Z6RA 1C0GA 1K8KA 3ATUA 1IG8A 1SZ2A 4FWPA 2P9IB 4WYBA 3H45C 2D0PA 3A5OC 3KHYA 3MN5A 3VEWA 2E1ZA 1P8ZA 1V4SA 2E2NA 3WXJA 3SMSA 5F0XA 2D4WA 3EO3A 2AP1A 3SK3A 5EXWA 1GLLO 1X3MA 5ADXH 5AFUH 5AQHA 4BRGA 3WQUA 4B1YB 2HOEA 3WEEB 2F9TA 4JD2A 4CZJA 5BR9A 3H3OB 1G99A 3LDLA 1QZ6A 4YDUC 2YHYA 4FL9A 3AAQA 4QS9A 4BR2A 3BF3A 3D2EA 2WUSA 1NGEA 3C0BA 3CHWA 5AQKA 2P9LA 4M7XA 3A0IX 3UKRA 2FSKA 3OHRA 4F9OA 1SAZA 5LY3A 3FZFA 4H0TB 1BA0A 4PL7A 2IIRA 2YHWA 4XH5A 3G25A 4EFHA 3O80A 4MO4A 3A5LC 5KQDA 3FZLA 3QBXA 5BN8A 4ISEA 4BRLA 3C7NB 2Q31A 1MWMA 3IDHA 5BPMA 3BUZB 3QFPA 2HF3A 3FZMA 3MN7A 3MN6A 3CJAA 3H1VX 1S3XA 3FZHA 3GE1A 3ATVA 4H0PA 1XUPO 2Q0RA 1ZBSA 2Q2RA 4E1JA 4EIAA 4H5WA 3LL3A 4BR0A 2FSJA 3DXMA 5BREA 4A2BA 3FLCO 4H0YB 3AY9A 5JLHA 5LJWA 4L3QA 1D4XA 2QWOA 4BR9A 1IJJA 3CJCA 1NGGA 3WT0A 1U6ZA 2J4RA 3CQYA 1BU6O 3F9MA 3L6QA 4XH1A 2CGKA 3DAWA 2QWRA 1QQNA 3O4WA 5AQZA 4BROA 5E26A 1JCEA 1NGBA 3O6WA 3R6MA 4MLHA 5AQTA 4RTFD 3J8AA 1Z05A 5KPZA 1NGAA 2IVNA 2GTDA 3SLCA 3QICA 4HTLA 3ZX0A 3R9PA 1YVNA 4KBOA 1E4GT 4BRHA 3L0QA 4FWNA 4QS7A 1R59O 2E2PA 2HMPA 3VEOA 3ZETA 4BGAA 5AQFA 3EKUA 4K25A 3I8BA 2E2QA 3EN9A 5AFUA 2Q36A 2DPNA 3ENHA 4BVPA 1JCFA 5ADXA 5AQPA 3LDNA 4FWSA 3UKUB 3TU5A 3WEEA 4JD2B 3VOVA 3RSEB 1YUWA 1RGIA 5JMVA 2VWBA 1LOTB 2QXLA 3GDQA 4BG9A 2QM1A 1WOQA 1DKGD 5EX5A 5AQNA 4B1VA 2VYPA 3JS6A 1NLVA 3WXLA 3DXKA 3ULEB 3VERA 2D0OA 5BRHA 1KAYA 1GLFO 4JNEA 4BRAA 1GLAG 5AZJB 5JLFA 2GUPA 4BRIA 2A3ZA 3O1WA 1NM1A 5AQOA 4CZKA 3VESA 3FZKA 3MN9A 1NGHA 3M1FA 1ATRA 3WQTA 4CZIA 1BOTO 2V52B 5AQUA 5FPDA 1MA9B 4FOEA 3D2FB 4YDUA 4H0XB 4ISFA 2P9PA 4O5FA 5JICA 3U9ZA 4BRPA 4CZGA 2ZF5O 5KPRA 2ZGYA 2Q0UA 3H3NO 2D1KA 3LDPA 3AARA 2GELA 4B1UB 2IVOA 3BF1A 3WUHA 3R8EA 3VENA 1K8KB 1U2VA 2ZWHA 1HKCA 2V51B 4H03B 4CZFA 3FR0A 5BN9A 2P9IA 3VF2A 2I7PA 4WQ5A 4IWVA 4FSVA 5BPLA 4H5VA 2GWJA 3TPQA 5F1XA 5BPNA 2F9WA 1NBWA 1GLDG 2GWKA 2A42A 3CI5A 3DJCA 4J8FA 5LJVA 3ZX3A 1WUAA 2YJEA 1LCUA 4Z94A 3QB0A 1NGDA 4EHTA 4FWQA 3ZEUB 1NGIA 3O1BA 2VCPA 3W3DA 5AR0A 4O8KA 1GLCG 4BC4A 3GBTA 2W40A 1H1VA 3UKUA 1Q18A 4GY2B 4FPAA 3SMPA 2OANA 3U4LA 3RSEA 3WXKA 2ASMA 1T6DA 3A5NC 1HPMA 3CJ7A 1QQOA 3FGUA 2CGLA 3ID8A 3SJHA 2I7NA 5AQJA 5BRDA 3LDOA 3QFUA 3DXKB 1TYQB 1NGFA 1V4TA 1T44A 1TUYA 4FWMA 4CI6A 4LC9B 3HM8A 2FF3B 3H1QA 5E84A 2FLOA 3HI0A 3IMXA 3VGLA 2GEMA 4XH4A 3P4IA 1RFQA 1NMDA 3BEXA 1RDWX 2FXUA 3LM2A 2YHXA 4MLEA 3D2FA 4XEIA 2QWNA 2P9PB 4DQ8A 5BRFA 4I6MA 4BVOA 5CE3A 2NLXA 4CZMA 2BUPA 5AZIB 1HKGA 5KPTA 2EWSA 4BGBA 2W41A 2A40A 4EHUA 4WQ5C 3M6GA 3U9DA 5AQMA 5EVZA 2P9SB 4FWRA 1HX1A 4JN4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5MLCQ 4CBUA 1BWFO 2QWMA 4IXCA 2XY8A 3GG4A 1TKTA 3SUPA 4YOYA 2HHHK 2QKBA 4KI6A 4C8KA 3HM9A 5KQ8A 1X1PA 3MX2A 4BR7A 1I39A 1Q9YA 1BCMA 3BP8A 2Z1GA 3QMLA 4B9SA 2FF6A 1YJWN 5TKWA 3QLHA 2G8VA 4M3TA 3V1RA 2BTFA 3ENBA 1KC8O 3NF8A 4M7YA 4JKGB 4JV5K 3A8YA 1ZC6A 2E88A 5C2DA 1D5AA 4E7LA 2ZGZA 4I2QA 3P31A 2RF2A 2HBKA 4DR4K 4GV9A 3R1XA 3BY5A 2B5JA 3U6FA 4BRNA 4JI3K 4C1NI 4DMNA 5AZJA 3JXUA 3CETA 1KAXA 5TKYA 3DOLA 4CZLA 1SS6A 1J5EK 5M1PA 2KFNA 3G4SN 1QQCA 5M1OA 1MDUB 5FPMA 4CJSA 2UYTA 2HF4A 1NGJA 1NKEA 2HSTA 4CF2A 4R5PA 4B9LA 3CCVN 4B9QA 4JKHA 1S1UA 2CGJA 1NKBA 3O4NA 4CHZA 1W97L 3TSQA 3D7EO 1U2VB 5EU7A 5AQIA 5DM6L 4JAXA 2YNHA 1YXQA 3TAMA 1TK5A 3RWUA 4JKBA 3KVGA 3DWLA 2HHXA 4E1MA 2KLAA 3W0LA 2W6KA 3CFPA 2O8BA 1NK0A 2HBLA 2F8TA 1HKBA 4Z4FA 3O3FA 3VETA 4CHYA 1RTDA 1SL2A 3I56N 2E1YA 3LDQA 5AQWA 4FO0A 5FRNA 5C25A 3CERA 3ZSXA 4JHDA 3AVLA 5AQRA 3IFRA 1SQKA 4F8RA 5FPEA 3M3ZA 2G8KA 4Z4IA 1X9JA 1HNVA 2O8DB 4B08A 3VEXA 1L3UA 3CCRN 1Q8IA 2E5LK 1ZXOA 3K58A 3BZKA 3TR8A 1TL3A 2YNGA 2FBYA 4HUFA 4BQZA 3MECA 4Y1CA 1CZ9A 3SV4A 4AHTA 1L3TA 1SV5A 4UY8O 3NH0A 4FJ9A 2DFFA 4H4MA 1HYZA 4O55A 4K42A 1TAUA 2AA4A 1LWEA 3LM9A 3TWHA 1UA0A 1ATSA 4C1NK 3O9TA 3RMDA 4OLAA 1RDUA 2YKMA 1OH5A 3QDKA 4LSLA 3PO5A 4DQQA 1WLJA 2FBTA 5AZIA 1OKJA 2P9LB 4K41A 4RCHA 3L2UA 3UKRB 1K9MO 1QZ5A 5FDLA 4OKKA 2IVPA 3HK2A 3U8XA 5AQQA 5AQGA 1IBKK 1ASVA 4DTJA 2ASPA 2OCEA 4GW6A 2VG7A 4CGFA 4CD1A 5AJ3K 4JKEA 3J7YP 5CY4A 3CMAN 4AM7A 4KH6A 1IKWA 2ZQBA 4KO0A 5C15A 1KD1O 4CIFA 5AQVA 3KWGA 5HRNA 1C1BA 5EY4A 5HOOA 1A5WA 3L2RA 3V9UA 1QSYA 4DV4K 3QEWA 4GVMA 2P9NA 3S41A 1T8EA 4CEQA 4BC3A 3HSCA 1JXBA 1Q82O 2QW9A 3ITHA 1C0GA 1VQNN 3L3UA 4OPKA 1VSFA 3OYDA 4M3UA 4G9ZA 3HPOA 2G8FA 2ZD1A 1ASUA 3MN5A 5K14A 1V4SA 4B9TA 4FZXC 3ALYA 3L2VA 2AP1A 2RKIA 3BDPA 5KGXA 1X9MA 3WQUA 3QO9A 2HOEA 3BGRA 5KRSA 3CPEA 3OJSA 3P83D 4NYFA 4YDUC 1RTJA 1NK9A 4MFBA 3BF3A 3D2EA 3K57A 1UAXA 3QIOA 1S5JA 1JJ2M 3OHRA 3KLEA 2QXFA 1YHQN 3FZFA 3O9QA 1BA0A 1EKEA 4DR5K 4KKOA 4XH5A 3SBTA 4DKWA 3J7ZO 3O80A 4Z4EA 3A5LC 1FJGK 2FBXA 4BE2A 3QBXA 4FJ5A 3C7NB 2Q31A 2EHGA 3IDHA 4B9VA 1OH8A 4IG3A 3CJAA 1S3XA 3GE1A 2XO7A 3NH1A 1RT2A 3MEDA 3ATVA 4DV3K 4CK3A 4CEZA 4EIAA 1C1CA 1HYVA 3DLHA 5JLHA 3CC2N 4QCLA 3VQ7A 5LJWA 1ZBIA 1JLFA 5BR8K 3TAPA 4BR9A 3K0SA 4LFAK 4HUEA 3L6QA 3O9RA 3M8QA 2D0BA 5AQZA 4DV0K 5E26A 1TK0A 3R6MA 1TAQA 4B9UA 5KPZA 3C95A 1BGXT 2VG5A 3QICA 3OW2M 3D6RA 4KBOA 4BRHA 4FJKA 3NGZA 3QEPA 1P90A 1HR0K 5AQFA 1TKZA 2E2QA 3EN9A 4CJPA 5AFUA 4DTRA 3CYMA 4DSIA 1ITGA 5AQPA 4FWSA 4DLGA 3OS2A 3CCSN 3E9LA 3IRXA 1M1KO 4FYDA 2HVHA 3AGRA 4JKAA 2QM1A 2UXCK 2OTLN 3WXLA 2KQ2A 3MEEA 1T3VA 1XC9A 5BRHA 1GLFO 1J53A 4BRAA 4W5RA 1GLAG 4IDKA 1RBSA 4DFKA 3KD1E 2A3ZA 1NM1A 4KHQA 3FZKA 2IAJA 3AVKA 4KH4A 4N56A 3M1FA 3P39A 3G6EN 4CZIA 1KQSM 2V52B 4CEBA 5FPDA 1MA9B 4FOEA 4ISFA 2A1RA 2P9PA 5JICA 4DUYK 2ZJRL 2ZF5O 2ZGYA 4DTMA 3SPYA 1YJNN 3CPWM 3LDPA 4KREA 3AARA 4IOCL 1X9WA 4B1UB 2IVOA 3BF1A 3TTCA 3R8EA 3AVMA 5KGWA 2ZWHA 2V51B 4H03B 4CZFA 5BN9A 4CESA 4WQ5A 1ZBFA 4IWVA 3SYZA 5BPLA 4H5VA 1UWBA 2GWJA 1LV5A 4IDHA 2IS3A 3O3GA 3I55N 1VQLN 1LW0A 4NCAA 3CI5A 1KSPA 1XMOK 4NLBA 4J2AA 2O4GA 1NJYA 3CFRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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