2CGLA

Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in complex with l-fructose, adp and a modeled atp gamma phosphate.
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
479
structure length
479
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure and Reaction Mechanism of L-Rhamnulose Kinase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RHAMNULOKINASE
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli bl21(de3)
total genus 165
structure length 479
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2006-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cglA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cglA02
2P9UB 3W0LA 4RTFD 4BR9A 2ZF5O 1NGIA 3O80A 1IG8A 4KBOA 4F9OA 4BRAA 2V51B 4NO7A 5E84A 2P9IB 1RGIA 2IVNA 3VF4A 3FR0A 2P9PB 4H0OA 4B1VA 3A5NC 2GWJA 1OKJA 2ITMA 1GLJO 3QB0A 4WQ5C 4BR2A 4DHYA 2Q0UA 2UYTA 2P9PA 3OHRA 4K41A 3ZX3A 3EN9A 4BRKA 3TU5A 4WQ5A 2QW9A 1BDGA 4BG8A 1E4FT 4FWQA 4CZKA 3F9MA 3VGMA 4ISGA 3SLCA 5BREA 4DQ8A 2IVOA 3HZ6A 2YJFA 2A6AA 3H3OB 2A3ZA 2YCHA 5JMVA 4BG9A 4IZ9A 3AAQA 1YVNA 4O5FA 1QZ5A 2I7PA 4BRLA 4PL8A 2ZWHA 2Q0RA 3FLCO 1ATNA 3VESA 3QFPA 3D2EB 3BF3A 3CETA 5AQSA 5AQQA 2ZGYA 1S3XA 4JHDB 4JD2B 4H5VA 1BUPA 4FWOA 1NBWA 4CZGA 4JHDA 4BR4A 4JD2A 1HPMA 1ATSA 3CJ9A 4PKGA 5EX5A 2QWLA 4CBXA 1DKGD 1DGKN 4M7XA 1Z6RA 4Y0WA 1JCEA 5AQUA 5FPNA 3O1BA 1WOQA 4M7YA 4IXCA 2QWQA 1E4GT 1D4XA 4BC4A 3GOIA 3CIPA 4CD1A 2BTFA 4MO4A 2AA4A 2KHOA 3SMPA 1YXQA 4QS9A 2CGJA 5BRHA 2P9LA 3I33A 4H5TA 3U8XA 1Y64A 2NLXA 1GLEG 1EQYA 3LDOA 5AQMA 1ZC6A 3CERA 1HJOA 1YUWA 3MCPA 2QWRA 3U4LA 1K8KB 3EKUA 3QBXA 3WXLA 5FPEA 3CHWA 4IJNA 1K8KA 1WUAA 2ZGZA 3EKSA 5F0XA 3VEVA 5AFUH 2D1KA 2ASPA 1U6ZA 3DJCA 3VEOA 1RDWX 1MWMA 3QBWA 3FZLA 5I9EB 4BREA 4BQZA 4A2BA 2A5XA 2F9WA 3M6GA 2P9KA 3MN5A 2Q1NA 4H0TB 3UE5A 4BRGA 4H5NA 3R8EA 4FO0A 3FZKA 3ZEUB 4CD3A 3J8AA 3VGKA 5AZJB 4BRIA 4BR7A 1Q18A 3ZEUA 4ISFA 3A5OC 3L4IA 5AZJA 1BWFO 4RWTA 2FSKA 3ENHA 1JCFA 4LC9B 4PL7A 3O08A 4K42A 3MN9A 1QZ6A 1C0FA 1MWKA 5AQNA 5BN8A 2YI1A 2QWMA 1NWKA 5E26A 3BEXA 1HKBA 1Z05A 4CZIA 1C0GA 2DPNA 1V4TA 5AQHA 3VEYA 3GE1A 2D0PA 2NZTA 1X9JA 3BF1A 3MMVA 3SJHA 2PBDA 1MDUB 3H3NO 3IDHA 3H1QA 4RCHA 2PAVA 1NLVA 2GTDA 3R6MA 4JAXA 4DB3A 5KQDA 4CZFA 5AFUA 1LCUA 4FWMA 4BRFA 1G99A 3ULEB 2GWKA 5KPTA 1J6ZA 3AARA 1XC3A 3S41A 3ULEA 2YHYA 3O6WA 3GL1A 3FZHA 1BU6O 5AQKA 4A61A 3L0QA 3FFKB 4XH1A 3KZBA 2Q2RA 4BQLA 2QM1A 3D2FB 2J4RA 1SQKA 2GEMA 3LM9A 2E20A 3B8AX 3VEZA 3D2FA 1JCGA 1TUYA 3H46O 3JS6A 1NGDA 5KQ8A 4K43A 1IJJA 3VGLA 1BOTO 5AQTA 3O8MA 5LJVA 2VWBA 2EWSA 3UKUB 4B1XB 3P4IA 5AQYA 1NGEA 3EL2A 3W3DA 3UKUA 4I6MB 4BRPA 2GUPA 5AQVA 3CJBA 1GLFO 1GLBG 5BR9A 4I6MA 1QHAA 2CH5A 4MLEA 5ADXH 2VCPA 2A41A 4CZHA 3I8BA 3WQTA 3MN7A 4CI6A 2FLOA 4BC3A 1SAZA 2P9LB 5ELZA 1ZXOA 3DWLA 4FWKA 4BRCA 1NGFA 2CGKA 4ISEA 4FWNA 1CZAN 1X3NA 2FF6A 5AQXA 3C7NA 3FZFA 2E1ZA 2V7YA 4CZEA 2D4WA 4IO8A 5TKYA 4JN4A 5AR0A 5AQWA 1KAZA 4EHTA 5BPLA 5AQPA 2E2OA 3HBTA 4PKHA 4CBUA 1BO5O 5BRFA 1QQOA 1TYQB 4AM6A 3CJ7A 2WUSA 1KAXA 1NGHA 3FGUA 4A62A 5AQIA 2FSJA 1TYQA 2P9KB 3M3ZA 4H0VB 4H0PA 5BPMA 4HWIA 2FSNA 5LJWA 4XH4A 3CJAA 3CQXA 3R9PA 1XUPO 2HOEA 3HI0A 4GY2B 2OANA 4BVOA 4YDUC 4BGAA 2A42A 1ZBSA 3JXUA 2AP1A 2E8AA 3UKRB 3VF6A 4YDUA 3DXMB 3RSEA 3VETA 3QMLA 2E88A 5ADXA 3UKRA 5EXWA 3DXMA 1HKCA 3ZX0A 1NGBA 4FPAA 5F2RA 1U2VB 3WT0A 4H03B 4FOEA 4WQ4C 1BG3A 5AQOA 2H3GX 1U2VA 2YHWA 3ENOA 1NGGA 3O5BA 4WQ4A 3VEXA 2ASMA 4JNEA 2CH6A 1X3MA 3CI5A 3SMSA 4BVPA 1H1VA 2Q97A 1GLCG 1R59O 4QS7A 4GNIA 5KPZA 3H45C 3MDQA 4B1WB 2E2PA 2IVPA 5FPDA 4FWRA 2IIRA 3GBTA 2P9SB 1KXPA 2P9SA 3WQUA 1S22A 3LDQA 3ZX2A 1GLDG 5BRDA 1HX1A 4H5RA 2FF3B 1P8ZA 5AQGA 3A8YA 2V7ZA 3ATVA 3ID8A 4BGBA 2E1YA 2VYPA 3BUZB 2HMPA 4K25A 3HM8A 1KAYA 3MN6A 2ASOA 2P9UA 4FPBA 4CBWA 5JICA 5LY3A 4FWPA 4H5WA 1YAGA 4NB4A 3O1WA 3VPZA 1XQSC 2HF4A 3FZMA 1T6DA 4B1UB 3AY9A 4BRDA 2P9IA 1T44A 4FL9A 4BRHA 3U9ZA 4BR5A 2A40A 3VF2A 2I7NA 3LDPA 2W41A 1BA1A 3U9DA 3A5LC 2FXUA 3LDLA 1T6CA 2BUPA 3H1VX 1NMDA 3CJCA 3DAWA 2QWPA 1MA9B 3QDKA 4J8FA 4H0XB 2GELA 3GG4A 3AAPA 4FSVA 3D2EA 2Q36A 3MK6A 5JLFA 4IJAA 2V52B 3WXKA 2F9TA 1HLUA 3IUCA 3UB5A 4C23A 3C7NB 3DXKB 5B8HA 1SZ2A 4A2AA 3IFRA 1ESVA 3DXKA 3A0IX 3QICA 4HTLA 5AQLA 4EFHA 3A5MC 4B1ZA 1LOTB 3QFUA 2QXLA 3O4WA 4AM7A 1HKGA 4L3QA 4O8KA 4IWVA 1GLLO 4EAHD 4EIAA 2CGLA 2YJEA 3LM2A 5CE3A 1DEJA 5F1XA 4FWLA 2HF3A 3VOVA 3H6EA 2P9NB 4BROA 2NRHA 3EZWA 4CZLA 3WUHA 1HUXA 5EOYA 3TPQA 2P9NA 5JLHA 2W40A 2QWOA 3RSEB 2Q31A 5AQFA 3HSCA 3CQYA 4BC2A 3GDQA 4FOIA 1V4SA 3WXIA 3D7EO 3LDNA 5AQZA 3WXJA 1QQNA 3BP8A 4BR0A 3LL3A 4XEIA 4CJ7A 4BC5A 3ZETB 1BA0A 5AZIB 3HTVA 5EVZA 1NGJA 4BRQA 4CZJA 4MO5A 3L6QA 3ZETA 4BRMA 5AZIA 1GLAG 3EO3A 5BPNA 4H0YB 5BN9A 3KVGA 4M63C 4QS8A 3C0BA 5AQJA 3G25A 3FE1A 3KHYA 3CJ1A 2QWNA 5KPRA 4WYBA 2D0OA 3WEEB 1ATRA 4PKIA 1NGAA 4CZMA 5EY4A 4MLHA 3ATUA 1TUUA 3VERA 4E1JA 3IMXA 3WEEA 1NGCA 5FPMA 4XH5A 1RFQA 1QQMA 3VENA 3VEWA 2E2NA 2YHXA 4BRNA 3M1FA 4FWSA 3SK3A 4Z94A 4EHUA 2E2QA 5AQRA 4B1YB 4DCHA 1NM1A 4B9QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EX4A 2HHTA 3KK3A 1L3UA 1RBVA 4AHTA 5JVGL 2I5JA 1VQMN 4FJ9A 4AHVA 4KBOA 4F9OA 4BRAA 1RGIA 3FR0A 1W7AA 2ITMA 4DHYA 3QB0A 4WQ5C 4BR2A 2Q0UA 4K41A 5KTQA 3TU5A 2QW9A 1BDGA 3SBTA 3VA0A 1E4FT 3R1XA 4DWIA 3KLGA 5BREA 4LD0A 4B9NA 2YJFA 5HRSA 3AO2A 3MECA 1OH7A 4BRLA 3FLCO 3QINA 1OVQA 3LZJA 3D2EB 2IDOA 1XMOK 3C6UA 5AQQA 1L3VA 4JD2B 1BUPA 3MXMA 3NF6A 4JD2A 3O9TA 1EP4A 4G1QA 4B8CA 1YHQN 2QWLA 4BWJA 2XY6A 2AJQA 2O4GA 4C8OA 1Z6RA 1JCEA 4CGGA 1A5XA 3AO3A 4M7YA 4CEFA 4BC4A 3GOIA 2HBKA 3PO4A 1XNQK 4DF4A 1OH6A 1WSFA 1ILYA 1VQLN 4DQRA 3I33A 1EQYA 4CERA 3LP0A 3CM5A 5CR4A 3EKUA 3TTCA 1QE1A 4JKEA 3WXLA 5FPEA 4Q5VA 1RTJA 2ZGZA 3EKSA 3IS9A 3MEEA 3DRPA 2YNIA 3QBWA 4KHYA 5I9EB 3QLHA 4OGCA 4OKKA 4I9QA 4BRGA 3FZKA 3VGKA 3PSIA 5AZJB 1IKYA 2G8IA 1RDBA 3AVNA 3E1YA 3OYFA 3A5OC 3L4IA 5AZJA 4O55A 4RWTA 2FSKA 4DFPA 4LC9B 2KZZA 4N56A 3LPUA 3TAEA 3DLKA 4CGHA 1C0FA 5AQNA 5BN8A 4NYNA 4O8UA 2RHKA 3CPEA 3SAGA 1HKBA 4CZIA 4F3OA 1V4TA 3VEYA 2Y1IA 2X6NA 1WSJA 3DLEA 4DTJA 3Q7CA 1RNHA 1X9JA 1JKHA 3F9KA 2UXCK 3BF1A 2PBDA 3DRSA 1O13A 2D0AA 2GUIA 3VTHA 3H1QA 3G71N 3RMCA 1NLVA 3K5NA 4JAXA 2G8WA 1LCUA 2YKMA 4BRFA 3AA5X 1JLQA 4Z4CA 1NK6A 4OPJA 2GWKA 2HVIA 1VAZA 3VQCA 1BIUA 4GV9A 2XY8A 4XH1A 1TKXA 2Q2RA 3TABA 3RRGA 4Z4FA 3D2FB 2ZD1A 3OYKA 2PYJA 3ID6A 4CHNA 3SQ0A 4I7FA 4DFJA 3D2FA 1TUYA 4LSLA 3H46O 3ZSXA 1TL1A 1IJJA 4DR2K 2OPQA 4E1NA 3VGLA 1BOTO 4FJKA 4HVJA 4LFCK 3O8MA 5LJVA 4FK0A 3OYCA 2EWSA 3CMAN 4DQSA 5AQYA 4X65K 4I6MB 3MEDA 3CJBA 3V9XA 1DLOA 4E89A 5BR9A 4W5OA 4I6MA 3MWTA 1QHAA 4MLEA 4JKFA 1YVUA 4CZHA 1KTQA 4K0KK 3WQTA 3MN7A 4QCLA 1XC9A 4DU4A 3KK1A 2YV0X 4FJ7A 1T7PA 4FCYA 2JLEA 1NKCA 5IWAK 4JI7K 3HPGA 1BCMA 4CHPA 1SAZA 2P9LB 3K9KA 3IAYA 1ZXOA 3DWLA 1NK4A 1RT3A 2CGKA 3V9ZA 3C95A 3K5OA 2E1ZA 4C1NI 2W6KA 1RT7A 4CZEA 3CCQN 4DLEA 1BGXT 1TK8A 5AQWA 1JXBA 3AVIA 1ITGA 4XIUA 5BPLA 1JL1A 2IOCA 1HNVA 2WUSA 4WFBL 4LF5K 3HPOA 3QEIA 3I0RA 4H0VB 2FSNA 2KFZA 5M1NA 3OYHA 1HNZK 4N41A 2UUAK 2KFNA 1HMVA 3SUOA 3NGYA 4YDUC 4BVOA 4OVLA 4X62K 3RSEA 1LWCA 3AVMA 1EO1A 1HKCA 3ZX0A 3TSPA 3WT0A 4H03B 3SQ1A 2KW4A 4FOEA 4WQ4C 1BG3A 3I0SA 5BR8K 3NBPA 1W2BM 2YNFA 5C15A 3VEXA 1GOCA 1C1CA 4KREA 2WOMA 3KLEA 4KHUA 2KLAA 1H1VA 4QS7A 3ITHA 4GMJB 4DV3K 3OYIA 2IVPA 3THXB 3GBTA 3VQEA 4BE1A 1KXPA 3THXA 4OPHA 1W9HA 1IKWA 4N47A 3WQUA 1SKRA 1GLDG 4JKCA 4FJGA 3V9WA 4H5RA 2ZQBA 1N33K 4CF8A 2V7ZA 4BGBA 1KLMA 5HOOA 2VYPA 2QXFA 3ZCMA 3HVRA 3DM2A 3J80O 3O4QA 1VQKN 3SQ2A 2P9UA 3MAQA 1RTDA 3C6AA 2QI2A 1HPZA 4H5WA 4CJ5A 3O1WA 3FZMA 3SUNA 1T6DA 3THYB 2ZM6K 3AY9A 2P9IA 3MXJA 1REVA 4BRHA 5I42A 3THYA 4BR5A 4GV3A 2DFHA 3L2QA 3LDPA 4KAZA 2FXUA 5D3GA 4CIEA 1VQ5N 1VQ7N 2QWPA 4J8FA 4H0XB 3J81O 1BI4B 3O3HA 3MK6A 4PQUA 3WXKA 3KWIA 1KCFA 1BI4A 4YORA 3CPWM 1HLUA 3DXKB 5GADP 3K58A 4A2AA 5GIPA 3Q7BA 3DXKA 3A0IX 3QICA 4HTLA 1Q9YA 1N32K 4EFHA 3A5MC 2OYQA 3QFUA 1B92A 2QXLA 5HRRA 4OKJA 1WAJA 1EETA 2YHAA 3NVMA 3LM2A 5CE3A 4UQGA 5F1XA 4FWLA 3VOVA 1L5UA 5LL6Z 3H6EA 4DV2K 4JEPA 4CJPA 1NKBA 4B3RK 1JLAA 4OLAA 1VQON 3CCMN 1XNRK 1VK0A 1C1BA 2UU9K 3KJVA 3KD1E 4ZTJA 1EXQA 5TKWA 4U67L 1QQNA 3BP8A 3LL3A 4AILC 3THWB 1U4BA 5CY4A 4DUZK 3EY1A 1NGJA 3THWA 1EKEA 1DTTA 3L6QA 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3QBXA 4IEIA 1WB9A 3SNNA 3CHWA 4IJNA 3KIOA 4R79A 5F0XA 4DV5K 2O8DB 4LH5A 2D1KA 4NYFA 2ASPA 4CJ3A 3VEOA 2O8DA 2F8TA 1MWMA 4BQZA 4CGFA 3BDPA 2VG7A 4CFDA 3U3GA 4Z4IA 4DTOA 4H5NA 4M3YA 4BRIA 2BDPA 3LALA 4ZTFA 3EZ5A 1VQNN 3ENHA 2X78A 4CF0A 1JCFA 4PL7A 2OTLN 1T03A 3CCEN 1VSFA 1QZ6A 1MWKA 4DR5K 1N5YA 3CCLN 4X64K 1TAQA 3TAGA 5AJ3K 1Z05A 3BY5A 1VRTA 3CCRN 5AQHA 1NG9A 4CJRA 4YOWA 3OYGA 1YTUA 1JLGA 1S1VA 3KLFA 1SKWA 1IBMK 1MDUB 4HUEA 3H3NO 3IDHA 4DV6K 4O5BA 3I55N 1S1XA 3R6MA 4DB3A 4CZFA 4CJVA 3ULEB 4DG1A 4GV6A 3DRRA 4DV7K 3AVBA 3NH1A 3NHGA 3ULEA 1I39A 4CIFA 2YHYA 3O6WA 2DTUA 1BU6O 1JLBA 5AQKA 4A61A 1UOCA 3KZBA 2R7YA 2Z1JA 1LWFA 4BQLA 2QM1A 1RBRA 2J4RA 1NOZA 2GEMA 3T19A 2E20A 3B8AX 2HHHK 1JCGA 4B9MA 1NGDA 4K43A 3HVTA 4C8NA 5M1KA 4FJHA 4LY7A 4FLYA 1K8AO 2XHBA 1NGEA 3W3DA 1U49A 4M3ZA 2GUPA 1VSIA 5AQVA 4JI5K 1P90A 1D5AA 4FLUA 3LP2A 1CXQA 5ADXH 1JLCA 2VCPA 1T3VA 3RVCA 1G15A 2FLOA 4CI6A 3P1GA 3P5JA 3V1OA 4CGDA 4OGEA 5ELZA 4FW2A 4IKFA 1HQEA 1NGFA 1VSEA 4KI6A 4ISEA 1CZAN 5AQXA 3T69A 3C7NA 2DY4A 4CEEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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