2CGLA

Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in complex with l-fructose, adp and a modeled atp gamma phosphate.
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
479
structure length
479
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords RHAMNULOKINASE
publication title Structure and Reaction Mechanism of L-Rhamnulose Kinase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli bl21(de3)
total genus 165
structure length 479
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2006-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cglA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cglA02
1T6DA 4H0XB 4BC3A 4BG8A 4QS9A 3EN9A 3S41A 2VYPA 3M3ZA 3QBWA 2IVPA 1NWKA 4QS8A 3L0QA 4JN4A 2VCPA 4YDUC 1Z05A 2P9NB 1DEJA 4XH5A 3VEYA 3U8XA 4BREA 3VGLA 2P9NA 1Z6RA 5AQWA 1XUPO 2CH6A 1MDUB 3UKUB 4MLHA 4BRFA 3KHYA 4B9QA 3G25A 3UKUA 1ESVA 5KPRA 1EQYA 3O5BA 1BG3A 2QWNA 2I7NA 2KHOA 3VENA 4O5FA 4XH4A 2P9SB 3ATUA 1GLDG 3C7NB 4O8KA 3U4LA 3VOVA 1HKGA 3MN9A 5AQKA 3QBXA 2P9SA 2GWKA 4H0PA 3A5OC 3C7NA 3CETA 4CD3A 2W41A 3MMVA 5BPLA 3BP8A 2W40A 3QFUA 1GLAG 1ATRA 3U9DA 1IG8A 1HLUA 1BOTO 1K8KB 3CIPA 4NB4A 2IVNA 2A6AA 4IWVA 3H6EA 1K8KA 3LDOA 4AM7A 5BRFA 4AM6A 5F1XA 4B1ZA 3CQYA 2P9KA 1NGFA 1V4SA 2CGKA 4H5WA 2P9UA 2HOEA 4BRLA 2UYTA 2QXLA 2P9IB 4BR7A 1BA1A 3ATVA 4FPBA 1NLVA 1WUAA 4HTLA 3A5LC 3R9PA 3TU5A 3MK6A 2IVOA 4CZHA 4HWIA 1X9JA 1ZC6A 3ENHA 3F9MA 1NGDA 2HF4A 2Q97A 3VF6A 2OANA 2I7PA 3BEXA 5TKYA 2FSJA 4FPAA 3CJAA 3BUZB 3VF4A 2GEMA 4H5NA 4ISGA 3WUHA 2QWPA 1LOTB 4BR5A 1HPMA 4DCHA 4L3QA 3VERA 5AQVA 2V52B 3AAQA 4GY2B 3KZBA 2Q2RA 4J8FA 3O8MA 1QQOA 4CZJA 3WXIA 5BR9A 5AQMA 4A62A 1ATNA 1YUWA 2YJEA 3CQXA 4IJNA 2EWSA 1MA9B 2E2QA 3CERA 4CZLA 5JMVA 1D4XA 5EVZA 3FGUA 1IJJA 3LDPA 5F0XA 1SQKA 3CHWA 4EHUA 2D0PA 4BRAA 3B8AX 1RDWX 1OKJA 4BR9A 1HX1A 3FZFA 4BC2A 3EO3A 2GWJA 1XC3A 4FWKA 3ENOA 4LC9B 5AQIA 1QQNA 1T44A 2QWMA 3VEXA 3H3NO 4M7YA 1LCUA 2ZGZA 1H1VA 1MWKA 1NGIA 1BDGA 1BWFO 3H46O 4FO0A 3UB5A 3D7EO 2VWBA 4CZFA 1JCEA 5AQZA 5AQHA 4K42A 4BRPA 4MLEA 2ASMA 3SJHA 3QMLA 1P8ZA 3ZETB 1ZXOA 2QWQA 5BN9A 5JICA 1U2VB 3FZLA 4A2BA 4B1XB 5BREA 3GDQA 3ZETA 3IUCA 1U2VA 5AQUA 3O80A 5AQOA 1HUXA 5AQTA 1GLJO 3WQTA 3VF2A 3RSEB 4CBUA 1XQSC 4FWPA 4K43A 2CGLA 2WUSA 4JHDB 3RSEA 4FWQA 4JHDA 1ZBSA 2A41A 1DKGD 3SMPA 4EHTA 5EXWA 2D4WA 3DJCA 2ZWHA 2PBDA 5FPMA 4WQ5C 3O4WA 3HSCA 4Z94A 2QM1A 2NLXA 2D1KA 3MN5A 2YHWA 2Q0UA 3BF3A 4BRMA 3FLCO 2FF3B 1Y64A 3L4IA 1GLBG 5I9EB 5BRHA 3HBTA 3R8EA 4BRHA 4BRKA 3I8BA 4FWNA 3FZMA 3VEOA 3A5NC 4B1VA 4BRGA 4IZ9A 3M1FA 2PAVA 5F2RA 4PKGA 3AARA 3GG4A 3L6QA 4H5VA 5FPDA 3ID8A 2P9LB 3MN7A 2P9PB 2YHXA 4EIAA 4EAHD 3ZX2A 3EKUA 3IDHA 5LY3A 2P9PA 2YHYA 3GBTA 4CZGA 1BO5O 5AQXA 4PKHA 4H5RA 3AAPA 4RWTA 3AY9A 1HJOA 4C23A 5FPEA 1QQMA 1NGEA 4B1YB 2YI1A 2P9IA 4XH1A 4EFHA 2BTFA 2E8AA 5LJWA 4IO8A 5FPNA 3O1WA 1S22A 4BVPA 1NGJA 2QWRA 3D2EB 4MO5A 1BUPA 4Y0WA 2E2PA 3H45C 3WXJA 3D2EA 3FE1A 3LDNA 4FL9A 5EY4A 4WQ5A 5AQFA 3LDLA 4KBOA 2CGJA 3A5MC 3DXKB 2BUPA 3C0BA 4FWRA 4BQLA 4BR4A 1X3NA 4CJ7A 4K41A 5AZJB 3DXKA 3I33A 4RTFD 1T6CA 4M63C 2GTDA 2D0OA 5AZJA 1TUYA 5AFUA 3VGKA 3CJBA 4ISEA 4IJAA 3TPQA 2Q31A 2A40A 3JXUA 4MO4A 3IMXA 1C0GA 4H0YB 4BROA 2J4RA 2NRHA 1Q18A 3EZWA 3FFKB 3MCPA 4E1JA 5AQJA 5KPTA 3HZ6A 3HI0A 4FWSA 2E1YA 3UE5A 4BR0A 3CJ1A 1GLFO 4CZEA 1YAGA 3FZHA 4IXCA 5JLHA 5AZIB 4PL7A 3CJCA 3W0LA 1U6ZA 1CZAN 1SZ2A 4H0TB 2IIRA 5AZIA 4CZMA 1J6ZA 3QFPA 4DB3A 2E20A 3H1QA 1JCGA 1NGGA 3UKRB 3WXLA 2Q1NA 5AFUH 1TUUA 3VGMA 3UKRA 1SAZA 5BRDA 5LJVA 1KAZA 1NMDA 4CI6A 2GUPA 2E1ZA 4PL8A 5E26A 3MN6A 3VEWA 3J8AA 2FSNA 3H1VX 3VETA 3DAWA 2F9TA 3HM8A 4QS7A 2GELA 4NO7A 2A5XA 3D2FB 5BPNA 2ZF5O 2FF6A 3D2FA 4H5TA 1ATSA 4BVOA 4CBXA 1QZ6A 4B1WB 3QDKA 4JNEA 4ISFA 4WQ4A 5AQSA 4H03B 3WT0A 2V7YA 1QZ5A 3HTVA 3LDQA 3ULEB 4K25A 4BRQA 3ULEA 3CI5A 2A42A 3VPZA 2HMPA 4CBWA 4H0OA 5AQPA 3QB0A 1KXPA 1X3MA 4FOEA 1NGAA 1YXQA 1TYQB 3EKSA 5AQGA 1GLCG 3A0IX 2ZGYA 4RCHA 5AQQA 2AP1A 2P9LA 2QW9A 4FWLA 4BRCA 1HKCA 3BF1A 1TYQA 3VEZA 5AQLA 3U9ZA 3O6WA 5KQ8A 4BR2A 1JCFA 1GLEG 1YVNA 4BGBA 2AA4A 4WYBA 4DQ8A 1WOQA 2DPNA 4H0VB 2QWLA 1V4TA 3DWLA 3CJ9A 3ZX0A 2P9KB 3FR0A 1NGBA 3LM9A 4A61A 1G99A 3ZX3A 5AQYA 1E4GT 2CH5A 3H3OB 2ASOA 3WXKA 2P9UB 3SLCA 2YJFA 4A2AA 1NBWA 5AQNA 3KVGA 1E4FT 3VEVA 2F9WA 1NGCA 5BPMA 5ELZA 5B8HA 5CE3A 2Q0RA 1KAYA 4YDUA 4BRIA 2ITMA 5KQDA 5JLFA 1S3XA 3IFRA 4BGAA 3R6MA 3W3DA 4I6MB 4CZIA 4WQ4C 3SMSA 4JAXA 4CZKA 5AR0A 1RGIA 3GE1A 2FXUA 3WEEB 1MWMA 3FZKA 1DGKN 4FSVA 1BA0A 4I6MA 4FWMA 2Q36A 3WQUA 3WEEA 4DHYA 3GOIA 1R59O 4PKIA 2FLOA 3CJ7A 3MDQA 3O1BA 5AQRA 2A3ZA 1NM1A 5ADXA 2QWOA 1RFQA 2E88A 3LM2A 3QICA 4BRNA 5KPZA 2HF3A 2FSKA 1HKBA 3SK3A 3EL2A 1NGHA 2V7ZA 3OHRA 2E2NA 2NZTA 4JD2B 3VESA 3LL3A 4BC5A 5E84A 3A8YA 4JD2A 4XEIA 5EX5A 2H3GX 3P4IA 1BU6O 4FWOA 3JS6A 5BN8A 5EOYA 1QHAA 2E2OA 4FOIA 4B1UB 2ASPA 3GL1A 3M6GA 4M7XA 4GNIA 2YCHA 2V51B 1C0FA 3ZEUB 1KAXA 3O08A 4BC4A 3DXMB 5ADXH 3ZEUA 3DXMA 4BRDA 4F9OA 4CD1A 4BG9A 4BQZA 1GLLO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IRXA 4BG8A 2W6LA 4BWJA 1VSKA 1NWKA 3RMBA 4YDUC 2VCPA 2IAJA 4CEAA 4CIFA 2P9NB 3NAEA 5M1PA 4XH5A 4KTZA 3VGLA 4FLTA 4C8OA 2CH6A 1MDUB 3KHYA 4KFBA 3G25A 1ESVA 4R79A 3AVIA 1HYZA 1VQ9N 2BGGA 4E1NA 3O5BA 5LMUK 2KHOA 2JLEA 1EETA 1VSFA 3VOVA 4O8KA 3SYZA 1T7PA 3MN9A 2P9SA 3DOLA 4RG8A 3CETA 4FJKA 2GX9A 4YHHK 3ITHA 4CF2A 3MMVA 1VSJA 3MX2A 4CK1A 3AVFA 3LZJA 5BPLA 3V9UA 1UAXA 4KKOA 3THWB 4FJHA 2LSNA 1IG8A 4IDHA 5GADP 1Q9XA 1HLUA 1VSDA 4E7JA 3P83D 4DR7K 4KHPK 4LF4K 2RN2A 3HYFA 4ZHRA 3THYB 4AM7A 4AM6A 1VRTA 4YOTA 5HROA 2P9KA 1XMOK 5C2DA 1K9MO 4KTQA 4IO9L 5M1QA 1V4SA 2CGKA 3HP9A 4H5WA 4K8ZA 2HOEA 4O44A 4BRLA 3T7ZA 4B9UA 2QXLA 1BA1A 3CCRN 3HVRA 1NLVA 4HUFA 2ZM6K 3FFIA 4UQGA 3A5LC 1QVGM 1X9JA 1ZC6A 3ENHA 4FLVA 4FYDA 3VF6A 3BEXA 2NRRA 4AHCA 5C12A 4H5NA 3NDKA 3C95A 5A2QO 4YOVA 3VERA 3AAQA 1BL3A 3P5JA 3KWGA 2O8CB 4W5OA 5BR9A 2GBZA 5AQMA 4DWIA 1ATNA 3OYAA 3CQXA 4IJNA 2E2QA 3CERA 1D4XA 3LDPA 5F0XA 1SQKA 2AJQA 2D0PA 1ASWA 4BRAA 1X9MA 1HX1A 2GWJA 1XC3A 4CJSA 3L2UA 3S9HA 4LC9B 1SS6A 1XMQK 1JLCA 1KC8O 1N36K 3VEXA 4JS5A 1Y97A 2ZGZA 1BI4A 1MWKA 5H1SQ 3H46O 4V19S 2WOMA 1WSJA 5FLXO 1JCEA 3OYNA 3BZKA 3LP2A 3P39A 4KI6A 3SJHA 1VSEA 3AVKA 4A2BA 2HSTA 3RTVA 5GIPA 1Z26A 4LFBK 3O80A 5AQOA 3SUOA 1HUXA 4NYNA 3HOSA 4DS5A 4DU3A 3KJVA 4DR5K 3BY5A 1N6QA 4FWPA 4K43A 2E6MA 4JKHA 3KLIA 3J7YP 4JI2K 4DSJA 4IG0A 4DU4A 1IG9A 1SUQA 3KD5E 1BGXT 3SMPA 1RBRA 5M1NA 2HHQA 3NF6A 1TKZA 3TSPA 1NK4A 3DJCA 5FPMA 5GAEP 4WQ5C 3AVGA 2JWKA 2HHVA 2GUIA 3VQ7A 3O4WA 1IKYA 2QM1A 2P1JA 4IDKA 5LMNK 4CJLA 4BRMA 3M5RA 4F4KA 1Y64A 2G8WA 1WB9A 3SAGA 4BWMA 3RMAA 1DT9A 3A5NC 3G10A 2P5GA 3LALA 1VHXA 3L3UA 3GG4A 5FPDA 3I56N 1WNSA 3SNNA 4FK4A 5EU7A 2YHXA 2YNHA 3E01A 3EKUA 1W0HA 4CF8A 3U6FA 2P9PA 5AQXA 4H5RA 2F8TA 2ZE2A 3AY9A 3KKSA 2DTUA 4ELUA 1N33K 4A5BA 1NGEA 4XH1A 4EFHA 2BTFA 1Q86O 2EX3A 1EO1A 4YFUA 1NGJA 2HVHA 3OS0A 5CYMA 4MO5A 4CGIA 4JYAK 3WXJA 4B9SA 3D2EA 3I8DA 3PY8A 2NRWA 4EZ9A 3OJUA 3KK7A 3DRPA 3DXKB 4DR2K 1VQ8N 2O8CA 4E3SA 4CFBA 3OS2A 4X65K 2GTDA 2D0OA 3DLRA 1HYSA 2D0CA 1S1XA 4MDBA 3TPQA 2A40A 3JXUA 3V9WA 3PV8A 3S3NA 4H0YB 4RW7A 3V1OA 3VQ9A 1ASVA 4M3TA 3MCPA 1NOZA 1UA1A 3DRSA 4N56A 4GMJB 3HI0A 1SL1A 4WFNL 4FJIA 3HM9A 5FRNA 1IBLK 1S1VA 4DUYK 3CCMN 1SZ2A 5FROA 1J6ZA 4DB3A 2HHWA 3MCAB 4LF6K 2F96A 1Q9YA 3N4QA 3UKRA 1SAZA 5BRDA 3QLHA 5LJVA 4KH6A 5M1FA 3ZSYA 3D6RA 4DFJA 4FJJA 1U47A 1JKHA 1S6PA 3DAWA 3B6PA 3HM8A 4CJUA 3Q7CA 3AGKA 4IFVA 3L2QA 2A5XA 1NK6A 4KHNA 3E9PA 2HB5A 4HVJA 2DFHA 3R1XA 1WN7A 1TL3A 1QZ6A 4B1WB 3KK1A 4WQ4A 5CHIA 1ASUA 2B4JA 3WT0A 2V7YA 1QZ5A 2FBXA 3LDQA 5E41A 1FW6A 1FK9A 3CI5A 3K5OA 1DTTA 1VAZA 1N34K 4AHSA 4CE9A 3QB0A 1RTIA 1KXPA 3DM2A 1WBDA 4FOEA 1NGAA 4DSKA 1VQNN 2OPSA 4CCHA 4JI8K 2QW9A 2RE2A 3DMJA 3BF1A 2O8BA 3OYHA 3U9ZA 2Y1JA 4DSIA 3RR7A 4WE1A 1WOQA 4DTMA 2DPNA 4H0VB 2RKIA 4OPHA 3KD1E 3ZX0A 3FR0A 1NK0A 3TABA 3LM9A 4A61A 2HBKA 1NJWA 3H3OB 3VQAA 4DQRA 4F2RA 4LSNA 4A2AA 4GV6A 3VEVA 2F9WA 3CCVN 4DR6K 3EE8A 5HRSA 1O1WA 4W5TA 5BPMA 3RMDA 2X6SA 1ZBUA 3OY9A 4KH4A 4PWDA 3HJFA 1KAYA 2PZSA 1YI2N 4C1NK 1B92A 1S3XA 3O3GA 1HYVA 1JXEA 2UUBK 3W3DA 4WQ4C 1RGIA 2FXUA 3RWUA 3WQUA 4FSVA 4I6MA 1BA0A 4FWMA 4MQ3A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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