1WSEA

Co-crystal structure of e.coli rnase hi active site mutant (e48a*) with mn2+
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMALMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKARGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Identification of Single Mn(2+) Binding Sites Required for Activation of the Mutant Proteins of E.coli RNase HI at Glu48 and/or Asp134 by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ribonuclease HI
molecule tags Hydrolase
source organism Escherichia coli
total genus 44
structure length 155
sequence length 155
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2004-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1wseA00
1QTMA 1VSFA 5HP1A 4C8KA 4B9VA 1ZYQA 2KZMA 2YV0X 3SQ4A 3MXIA 1JLAA 2IC3A 3O3FA 1RDCA 5C24A 4M41A 4ELTA 4CHPA 1JXEA 1C0TA 3NGYA 1L3UA 5HRNA 4KTZA 3WNGA 1UA1A 4GMJB 1FKOA 3KLHA 1BI4A 3OYAA 1BCOA 4FCYA 4HHTA 1C1AA 2FBVA 4C8LA 3RR8A 4J2AA 1QSSA 4FK0A 2R7YA 2HNZA 1LWFA 1J53A 3OYLA 4KI4A 4KHUA 3LPUA 2QK9A 1BISA 1FKPA 2FBYA 3H08A 3V1OA 1BGXT 3ISNC 3DMJA 3M8RA 2EHGA 5CYMA 3TR8A 2NUBA 3P83D 1NK4A 2PYLA 3MEDA 3NGIA 5CZ2A 3HPOA 2DFFA 3P1GA 3B6OA 3NDKA 1VSLA 1KVCA 3QNNA 2PYJA 2KW4A 1JXBA 3BGRA 4DFPA 1BL3A 1RDBA 4CESA 4KHQA 1ASUA 1VSJA 2Z1JA 4TSXA 5SZTA 4DTXA 4CF0A 3OYBA 4XIUA 2B6AA 1NK7A 4QAGA 4KV8A 4DFJA 1RT1A 4DSEA 4AHSA 2HHVA 1HYSA 1EXQA 3OJUA 3HP6A 4DTMA 3AO1A 3LWLA 3TABA 4C8NA 1NK5A 4K8ZA 4OKEA 2F8SA 3OYJA 3ZSVA 2B5JA 2ZD1A 3HPHA 2QKBA 4KHSA 4KPYA 4OLBA 3F73A 1VSHA 3O3HA 1SL0A 2HNYA 4M45A 3U3YA 2X6NA 5KI6A 3QEXA 1KLNA 3NF6A 1QQCA 2VWJA 4CEZA 2I5JA 3OS0A 3NH1A 3M8PA 4CJEA 1S9GA 1KSPA 3RMBA 3VQBA 1B9DA 1RILA 4DF8A 1NKEA 1EX4A 4RW6A 2YKMA 5J1EA 3K5MA 1UA0A 4FJLA 4PWDA 1EP4A 2YKNA 4DS4A 1HRHA 3LP0A 3NF7A 3KTQA 4DS5A 4F2SA 3NF9A 4DQIA 1HYZA 1A5VA 2Z1GA 2G8IA 1WSFA 1KVBA 2P5OA 1CXUA 3E01A 2EX3A 2Z1IA 1B92A 4PUOA 3AVHA 3VN5A 1BI4B 3VQ5A 2FBTA 1D8YA 4J2BA 1QSLA 3VQ8A 2HHTA 4F3TA 4KHWA 3NH0A 4FJKA 4Z4EA 4DSIA 1TK8A 4KAZA 1RBVA 1ASWA 1WSEA 4KFBA 3RMAA 2G8HA 3SUOA 4BE2A 2ATQA 4FLVA 3HSTB 3O4NA 3NCIA 2F96A 3KK3A 1VSEA 3NFAA 4DSJA 4E7KA 4R5PA 4DQPA 3V1RA 2FC0A 2D5RA 2IAJA 4LY7A 3QLHA 1X1PA 3EYZA 4FJ8A 4JLHA 4E19A 3HJFA 4N5SA 2FBXA 4FW2A 2PY5A 4AHRA 3K58A 4H8KA 1TGOA 4KHYA 4CJ4A 1D9FA 3RTVA 3DLEA 4CEOA 4PY5A 4DFKA 3QO9A 4DTOA 3T3FA 1X9WA 4CHOA 1RCHA 1A5XA 3KLIA 3KKSA 2HHXA 3WNEA 1IKVA 3ZT1A 2VG5A 1JLBA 3LP3A 4C8MA 3S9HA 2O4IA 1TKTA 4N56A 4OLAA 5FDLA 1N6QA 2DFHA 4RW9A 3RRGA 2JLEA 4OPKA 1ASVA 1KVAA 1J54A 3DI6A 4LH5A 1QS4A 4NYFA 1C0MA 4DTJA 2KTQA 3CG7A 4ELUA 4AHUA 1BIUA 2HW3A 3KD5E 2QKKA 4MFBA 1RBRA 1BQMA 3ITHA 3JSMA 2OZMA 4FJHA 2HHUA 4FW1A 3OYDA 3C95A 4F4KA 3QESA 1Z26A 3PUFA 3OYKA 4O44A 4M3ZA 3HL8A 2O4GA 3HYFA 4O0JA 4FLXA 1IO2A 3I8DA 1IG9A 4M3XA 1I39A 1WSIA 3LP1A 4CIFA 4HVJA 4B8AB 3I0RA 3V9XA 4E3SA 3WNHA 3HP9A 1LAVA 3AVGA 3EZ5A 1IKWA 1RT4A 5HRPA 1HNVA 1NKCA 1VSIA 1DLOA 4Z4CA 1RT3A 4BE1A 2HVIA 2BE2A 1HPZA 1DTTA 4CGHA 1L3VA 1S1UA 4BACA 2G8FA 3ZT2A 5SWMA 4CGIA 4CGGA 4DTPA 3DRPA 3QEVA 3PX0A 3ZCMA 1LW2A 3VQPA 1NK0A 5CYQA 1LWEA 3I0SA 4QOZB 4IBNA 1BQNA 3T1AA 3RWUA 4IDKA 2VWKA 2OPRA 4HUFA 4I2QA 4ZHRA 2BDPA 5E41A 3HPGA 1RTIA 4IFVA 1TK5A 1CZBA 4AHCA 1LAWA 2D0CA 5KTQA 3TAGA 4B9LA 4IKFA 4E0DA 1RBTA 4CGFA 5J2QA 3SJJA 1WAJA 3AA2A 1SL2A 5DK5A 4Z4HA 5FROA 1JKHA 4DF4A 4AH9A 1HNIA 4OKKA 4CJKA 1SKSA 4FM1A 3UIQA 3D45A 3U6FA 5I42A 4CHYA 4ID5A 1ITGA 3ULDA 4DTRA 3IAYA 4FJJA 4KI6A 4W5OA 4Z4FA 3NGZA 3EY1A 3MEGA 4I2PA 2G8WA 2G8UA 4NCGA 3SNNA 5KGWA 2Z1HA 4J2DA 1NOYA 4E7IA 1N5YA 3AVCA 3L2QA 3L2UA 5FRMA 4LSNA 2GV9A 3KLEA 4LH4A 3SUPA 3DOLA 4CJQA 4Q0BA 3SUNA 1JL2A 1X9SA 4FJXA 4FLZA 3SYZA 5HBMA 1MU2A 4GW6A 2A1RA 3HO1A 4FYDA 3AA4A 4ZTJA 3DLKA 3P5JA 3KK1A 1NK8A 4HUEA 3AA5X 4YNQA 2D0BA 4PA1A 2OYQA 4KB1A 2OZSA 2E6MA 3L3VA 1VRTA 3KKRA 3L8BA 1NJWA 1D5AA 3VQCA 4CJSA 2KZZA 1JLEA 1A5WA 1VSMA 1HYVA 2B4JA 3ZSZA 4HTUA 3OJSA 3VQ9A 1UAXA 5CZ1A 2P5GA 3CM6A 4F3OA 4FLWA 4CGDA 2AJQA 1B9FA 3K57A 4IG3A 4N41A 4F2RA 1S6PA 3OYCA 1RBSA 1G15A 3NE6A 1RDAA 1TL3A 4YFUA 1NK9A 1LW0A 3LALA 2QXFA 4FLYA 4B3OA 3AO4A 3QNOA 4DU1A 4C8OA 2WONA 3NH2A 4M3UA 1TKXA 1BCMA 1RTHA 4B8CA 3AO3A 4JS4A 4CJWA 3KK2A 4DLEA 3OYMA 4CJPA 3ZSWA 3CFPA 5FRNA 3B6PA 4GVMA 3TWHA 4Y1DA 4M3YA 4CFAA 3NAEA 1T03A 1TK0A 1QSYA 4DSKA 4QCLA 1JLCA 2OPPA 4CF8A 3KLFA 5CY4A 4E7LA 4CFDA 4RW4A 4CCHA 2KFZA 4AHVA 1J5OA 4RW7A 4W5QA 5K14A 3VA0A 4FJ9A 2ITGA 4CIGA 4DQQA 1NJZA 4CK3A 1KCFA 4G1QA 1W0HA 3QEPA 1C1BA 3FFIA 4DSFA 4CE9A 1GOAA 1YVUA 3F9KA 3PY8A 1WAFA 4CJRA 4N76A 2G8VA 2XY8A 3AO5A 4L8RB 2BGGA 3G0ZA 4CF2A 3LWMA 2IOCA 3AVKA 4CFBA 1T8EA 2HMIA 3AVFA 2YHAA 3L3UA 1VSDA 4RG8A 3SQ0A 3C94A 3DLBA 4KTQA 4FLUA 2HHSA 3LAMA 3AO2A 4DU3A 2XY5A 4FZYA 3TAMA 3DLRA 2JGUA 2WOMA 3NF8A 4CJFA 4ID1A 2KFNA 1IH7A 4B9NA 5D3GA 4W5TA 1RT2A 4O0IA 4MQ3A 2W42A 3DRSA 1BHLA 3VQ6A 4N47A 4CEQA 4OVLA 3ZT0A 3SV4A 1Q9YA 1C1CA 2RN2A 4FJ7A 3L2VA 3ASMA 3DLHA 1Q8IA 4CJ3A 4HCCA 3QEIA 2A1SA 3AVIA 3RRHA 5KGXA 3HM9A 3K5LA 3IS9A 3S3NA 1HJRA 4Z4IA 4DQSA 4CFCA 3TI0A 1X9MA 1JLQA 2ZE2A 2PZSA 3OYNA 4BWJA 5EU7A 3SCXA 4DTSA 2GUIA 1RBUA 3IG1A 2HHQA 4DQRA 1TAUA 4B9UA 4EP5A 3ZT4A 4E1MA 3MAQA 4CF9A 3SUQA 2OA8A 3TARA 3ZSQA 3TAPA 1Y97A 3VQQA 4CJVA 1KLMA 1U47A 4KB0A 4M3TA 3CQ8A 4CHZA 1NKBA 3DYAA 1C0UA 1TV6A 2X78A 1WNSA 1U4BA 4WE1A 4NCBA 1VK0A 4FK2A 1ZBHA 3V9WA 1CXQA 3MEEA 4I7FA 2X6SA 5C42A 1BIZA 2Y1JA 1SL1A 1TKZA 1JLGA 3CFOA 1S9EA 3ALYA 3BDPA 5KRSA 3L2RA 2XO7A 4DMNA 1QE1A 4IG0A 3HXMA 3SPZA 4FJGA 4CIEA 4PQUA 2IDOA 4OPJA 2XY7A 3TANA 3QIPA 3G10A 3V4IA 1REVA 1FK9A 4F8RA 1IKYA 4I9LA 3JYTA 1KRPA 4DTNA 2ZQBA 3DM2A 1XI1A 2RPIA 3HVRA 1SUQA 2VG7A 1F21A 3C6UA 4Q5VA 4E89A 4FZZA 4OKJA 4RW8A 4M3RA 3ZSOA 4DTUA 2YNHA 4KRFA 4O4GA 4DG1A 1SKWA 3HT3A 2DFEA 2ETJA 4K8XA 1EKEA 3C6TA 1ZBFA 3QETA 3ZSYA 1NJXA 5I3UA 4CJLA 3QEWA 1WSGA 3CM5A 3DLGA 4OJRA 3SQ1A 4B08A 3VQAA 1HMVA 3SZ2A 1VRUA 3VQDA 3WNFA 4FZXC 4B9TA 3OVNA 4CJ5A 4FXDA 4O5BA 4FLTA 1K6YA 4E7JA 5HROA 3KIOA 3L2WA 4BDPA 3AVBA 4CHQA 3VQ7A 3K2PA 3TAQA 1LWCA 2YHBA 3TAEA 1ZBIA 3K5NA 1CZ9A 1U04A 3DRRA 4CERA 5HLFA 4DSLA 5J2PA 4EZ6A 3AVMA 4I9QA 2BANA 4FVMA 1NJYA 1W9HA 1U49A 1L3SA 1YTUA 4ICLA 1UWBA 2KQ2A 2YNGA 3V1QA 4CEBA 4BWMA 3OYHA 4JS5A 3PO4A 5C25A 2HVHA 2X74A 3OYGA 1I3AA 3QINA 4CEEA 1RTJA 4FJNA 3V9ZA 4KKOA 2P1JA 1O1WA 4LD0A 4HUGA 3IRXA 4CGJA 2YNIA 4BDYA 3V9UA 4JRPA 4OGCA 4CJUA 1HQUA 1JLFA 3LDSA 1Q9XA 3OYEA 4M3WA 1HQEA 1DTQA 4CK1A 4LSLA 4CEDA 3LANA 1NOZA 3MECA 4AILC 4EP4A 1S5JA 1YT3A 2GBZA 4FM2A 1RT7A 3V81A 3V6DA 3SQ2A 2XRIA 2Q3SA 3O3GA 3KJVA 1EETA 4DLGA 4B9MA 4ZTFA 4FJMA 1XHZA 2P51A 3AVLA 4H4OA 2IS3A 1QHTA 4O55A 3VQ4A 2XHBA 4BDZA 5J2NA 4KTWA 1T7PA 2DY4A 3PO5A 3U3GA 3OS2A 4OGEA 4Y1CA 1TKDA 1UOCA 1TAQA 1C6VA 5HRSA 4NYNA 4CJTA 4E1NA 5KRTA 3OY9A 3OYIA 4W5RA 3SV3A 4Z4GA 1WN7A 3AVJA 4IFYA 2DTUA 3K59A 4E7HA 3SI6A 3PX4A 3ZSXA 4KO0A 3AVNA 2Y1IA 1KFSA 3CYMA 3A2FA 1D9DA 1RDDA 3HVTA 4J2EA 4NCAA 3NBPA 1GOBA 4CK2A 1ZBUA 3V9SA 4CF1A 3VA3A 2E6LA 1FXXA 2XY6A 1LV5A 5JS1A 3KD1E 3M8SA 4EZ9A 2VG6A 1CLQA 3OS1A 4DU4A 1U45A 2OPQA 1WLJA 3MXMA 3QIOA 1WSJA 2HHWA 2E4LA 1XC9A 1IKXA 1GOCA 4KREA 3AA3A 4FM0A 1J9AA 4KHNA 3SPYA 4W5NA 3MXJA 1KFDA 3O4QA 4Z0UA 1Z25A 5T7BA 3AV9A 3PX6A 2G8KA 3ZT3A 4AHTA 3KLGA 5JS2A 1S1WA 3PV8A 3LAKA 4FJ5A 5J2MA 3M8QA 3ZSRA 2RF2A 1U48A 1T05A 4HCBA 1TL1A 5DMRA 3LZIA 3HK2A 1SV5A 4DFMA 1RT6A 4M42A 1S1VA 1JL1A 4B9SA 4BE0A 3THVA 4DWIA 3DOKA 3LPTA 3T19A 3NHGA 4JRQA 3RMCA 2HB5A 3OYFA 1RT5A 1RNHA 4CHNA 2IGIA 2RKIA 1NK6A 3LP2A 1S6QA 3S3MA 4UQGA 3TAFA 3VQEA 3K5OA 2HNDA 4H4MA 2D0AA 1L5UA 2OPSA 2YNFA 1XHXA 1R0AA 4CEAA 1XWLA 1RTDA 1S1TA 1S1XA 3AVAA 4ELVA 2LSNA 1KTQA 1YTAA 3D0PA 1ZBLA 1WSHA 3QERA 1VSKA 4CECA 1SKRA 5HRRA 1L3TA 4CEFA 4FJIA 4FK4A 3LZJA 2F8TA 1TVRA 3CFRA 3RR7A 3S3OA 3RMDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZYQA 2KZMA 1YAGA 3O3FA 1C0TA 2J4RA 4GMJB 3C7NB 3SMPA 3FZKA 3G71N 4Y0WA 4BRHA 4FCYA 4C8LA 4J2AA 3R6MA 2P9PB 2E1ZA 3L6QA 2R7YA 4FK0A 4JD2A 4RCHA 1WB9A 3V1OA 4JK7A 3TTDA 3LDPA 3TSQA 4CZGA 3P4IA 3MN9A 1NK4A 3NGIA 2DFFA 3BGRA 3J7AP 1BL3A 5C10A 2P9IB 4CF0A 1NK7A 1Z6RA 3LDNA 4AHSA 3HZ6A 3OJUA 3HP6A 4DTMA 3AO1A 4BRPA 1MA9B 2QKBA 3WXLA 3SLCA 4KPYA 3VESA 1SL0A 2HNYA 2YJEA 3QEXA 2NNWA 3OS0A 3NH1A 2ZGZA 3DXMB 2VWBA 3BUZB 1B9DA 1GLFO 1RILA 4DF8A 5J1EA 3WXKA 1A5VA 2P5OA 1CXUA 4B1UB 2FBTA 1D8YA 1NGGA 3VQ8A 4DV1K 3NH0A 4FJKA 3E9PA 4CZMA 1RBVA 2G8HA 4BRDA 1C0GA 3O4NA 4GKJK 4YY3K 4H5NA 2PAVA 2QWLA 1X1PA 3H46O 2E1YA 4FJ8A 2CGJA 4E19A 3FFKB 4FW2A 1XC3A 3K58A 2WC9A 1D9FA 4JI5K 4F9OA 5E84A 1X9WA 1RCHA 1A5XA 3KLIA 1XNRK 2UUCK 3NMUA 3ULEA 3H1VX 5ADXH 1N6QA 2JLEA 2ASMA 1QS4A 3EZWA 4DTJA 1MDUB 3CG7A 3M6GA 4AHUA 2V7ZA 2BUPA 4MFBA 1RBRA 1BWFO 4GVEA 1WBBA 3DLLL 4WCEL 4K42A 2HMPA 4O44A 4C1NI 1I39A 3T7ZA 3KK7A 4B8AB 2Q36A 3WNHA 4JKAA 1NGCA 3EZ5A 5HRPA 1HNVA 4BE1A 3VTHA 2GX9A 3G25A 3DAWA 1YITN 1DTTA 1S1UA 3CCVN 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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