The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
30
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sequence length |
116
|
structure length |
116
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule tags |
Ribosome
|
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| total genus |
30
|
| structure length |
116
|
| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4LF4 K; 4DR6 K; 4KHP K; 4LF6 K; 1XMO K; 3JAM O; 2HHH K; 4B3M K; 1HNW K; 4JI3 K; 1IBM K; 1HR0 K; 4LF8 K; 4NXM K; 2E5L K; 4JI0 K; 4JI5 K; 5BR8 K; 2UXC K; 4JI6 K; 5IT9 O; 4JI2 K; 5FLX O; 4AQY K; 4X64 K; 2VQE K; 4V19 S; 2UXB K; 3J7Y P; 1IBL K; 1N32 K; 2UU9 K; 5AJ3 K; 4JI7 K; 5IWA K; 4JI4 K; 4DUZ K; 1N36 K; 1HNZ K; 5LMN K; 3T1Y K; 4DR7 K; 4LF9 K; 1XMQ K; 4X62 K; 3OTO K; 4DR2 K; 4OX9 K; 4DV7 K; 4B3S K; 5A2Q O; 4LF5 K; 1FJG K; 5LL6 Z; 1I94 K; 4X65 K; 4DR4 K; 4DR1 K; 4DV3 K; 2ZM6 K; 4DV0 K; 4X66 K; 4DUY K; 2VQF K; 4DR5 K; 4YY3 K; 3T1H K; 4LFC K; 4B3T K; 2UUA K; 1N34 K; 1IBK K; 1N33 K; 3J80 O; 5LMU K; 4DV6 K; 1XNR K; 3J7A P; 4CW7 B; 4DV4 K; 1HNX K; 4JV5 K; 4DV2 K; 2UUC K; 4JI8 K; 4DV5 K; 4K0K K; 4GKK K; 4LFB K; 4CVN E; 2UUB K; 4GKJ K; 4LFA K; 1J5E K; 4YHH K; 4LF7 K; 4JYA K; 1XNQ K; 4DV1 K; 4DR3 K; 2F4V K; 4NXN K; 2UXD K; 4JI1 K; 3J81 O; 4B3R K; #chains in the Genus database with same CATH topology 4A5A A; 1OH7 A; 3V9Z A; 3OYD A; 4FK4 A; 1L3U A; 1WB9 A; 4FO0 A; 4CEQ A; 4CHN A; 5ADX H; 1NGC A; 4U7B A; 3U8X A; 5J2P A; 4BDZ A; 4FWQ A; 3CFP A; 5GAD P; 2G8V A; 5KPR A; 4EZ9 A; 4N56 A; 3KWG A; 5KTQ A; 4C1N I; 1RDW X; 3B8A X; 3THY B; 2HF4 A; 4JS4 A; 1VSF A; 3J8A A; 4BRA A; 3SK3 A; 1JLB A; 1T3V A; 3HK2 A; 4B1Z A; 5BPL A; 2F96 A; 3WEE A; 3K0S A; 1TKZ A; 3SQ1 A; 2ZJQ L; 3AAQ A; 4A57 A; 3VQB A; 1VQP N; 2PZS A; 2VGM A; 2XY8 A; 1Z25 A; 2I5J A; 3E9P A; 3PX6 A; 3BF3 A; 4FJK A; 1MU2 A; 3O3G A; 1Q86 O; 3ID6 A; 1XC3 A; 3MXM A; 3K9K A; 2F8S A; 1D9D A; 4X66 K; 3M1F A; 3SQ4 A; 5AQY A; 1U04 A; 4EZ6 A; 3LZI A; 1VRT A; 3WQU A; 5CZ2 A; 3O9U A; 4CBU A; 4DSE A; 3QO9 A; 2EX3 A; 3FZL A; 1WSG A; 1ASU A; 5M1N A; 2IIR A; 3M5R A; 1C1B A; 1RDU A; 4B1Y B; 3OYL A; 3V9W A; 1VRU A; 2ZQB A; 3VGM A; 3QEI A; 4LF7 K; 3QES A; 5CHI A; 3MMV A; 5T7B A; 4KBO A; 3RMB A; 4JYA K; 5AQG A; 1NK0 A; 4JI1 K; 2IGI A; 3HI0 A; 1U47 A; 1QZ5 A; 4H4M A; 2HVI A; 2XHB A; 1BQM A; 3MXJ A; 3TTD A; 2D0A A; 2Q31 A; 3B6P A; 4B1U B; 4FOE A; 4DTU A; 5M1F A; 4L3Q A; 3TI0 A; 1TL1 A; 3CCL N; 4BDP A; 1KVA A; 1KVB A; 1DT9 A; 5M1O A; 1WBB A; 3THX A; 1C0G A; 1RT2 A; 4CES A; 4FLW A; 4O4G A; 5FPE A; 3NF9 A; 4JI5 K; 3AA4 A; 1FK9 A; 1HYV A; 3IS9 A; 3QEW A; 3V1R A; 1ATR A; 3HJF A; 3AVJ A; 3J7Y P; 4JD2 A; 2A41 A; 2D4W A; 2UU9 K; 5CZ1 A; 5AQQ A; 3HPH A; 3VEX A; 1V4S A; 4IXC A; 3V1O A; 3S9H A; 3UKU B; 3LAM A; 3THV A; 2Q0R A; 4NLB A; 3TAE A; 3AVG A; 4OKJ A; 2ETJ A; 4RW7 A; 4YNQ A; 3I56 N; 3DRS A; 3DLE A; 3SPY A; 3I55 N; 4JKC A; 4BVP A; 4DU1 A; 1XWL A; 4Y1C A; 2D0O A; 3SUN A; 1BCM A; 4HUE A; 4JKG B; 2FLO A; 2V51 B; 3QIO A; 3NVM A; 1JXE A; 3C6H A; 4DTP A; 3VQ4 A; 4KO0 A; 1OH8 A; 3EEQ A; 2F9T A; 5FDL A; 5HRO A; 3J80 O; 1T8E A; 1S22 A; 3TR8 A; 3MN9 A; 3O80 A; 1GLF O; 3TAQ A; 2AP1 A; 4CHQ A; 4RWT A; 4OGE A; 3SQ2 A; 4CZE A; 3L3V A; 2G8U A; 4FWO A; 4WF9 L; 3MEG A; 1G99 A; 4DB3 A; 3VPZ A; 4GKK K; 1KLM A; 1S9G A; 2KFN A; 3RTV A; 4C8K A; 4CVN E; 4E7J A; 1NWK A; 1JLG A; 1X9S A; 2O8B A; 1KCF A; 2FBY A; 3G0Z A; 4IO8 A; 1JLE A; 3IDH A; 3L2U A; 3J81 O; 4BR5 A; 4L8R B; 4CGF A; 3UE5 A; 2NRW A; 1J53 A; 3MN5 A; 4DHY A; 3L4I A; 1GOC A; 4CZM A; 1RT1 A; 4KHP K; 4JKE A; 3SLC A; 1CLQ A; 2E1Z A; 5CY4 A; 1HNW K; 3HYF A; 4M3Y A; 5BRF A; 4BC3 A; 2G8F A; 4E7L A; 2B5J A; 4BG8 A; 3SAF A; 4CFC A; 4JI6 K; 3M3Z A; 4FWP A; 2VQE K; 4WCE L; 2UXB K; 5KRS A; 2HNY A; 4W5O A; 4CCH A; 4JI4 K; 3CM5 A; 2G8H A; 1VSI A; 4DR7 K; 3O8M A; 4FWL A; 1XMQ K; 1YVU A; 5KQD A; 1RT6 A; 3ULE B; 3OTO K; 2KW4 A; 4K25 A; 2HST A; 4E7I A; 4FJ5 A; 5BR9 A; 3CIP A; 1QQO A; 3QET A; 4CHP A; 3NHG A; 1A5X A; 4CD1 A; 4YOY A; 1QZ6 A; 3CFO A; 4RW6 A; 4DTX A; 4Y0W A; 1U2V B; 1EX4 A; 2E2Q A; 2E6M A; 1Z6R A; 2QM1 A; 3K9J A; 3AO1 A; 3OYF A; 4B1W B; 5AQS A; 4WFA L; 4AF1 A; 2RPI A; 1N33 K; 3QIC A; 5F1X A; 4HCC A; 4BAC A; 4B9N A; 4FK2 A; 1C6V A; 1KD1 O; 3GBT A; 3ZET A; 3T69 A; 4FYD A; 3CF5 L; 1ITG A; 3MCA B; 3H08 A; 4YFU A; 2UUC K; 4F9O A; 3H3O B; 3AV9 A; 3NAE A; 3AO5 A; 4JNE A; 5C0Y A; 3OY9 A; 1SKR A; 4I9Q A; 4Z4G A; 4FLX A; 4GKJ K; 4QS9 A; 1JLA A; 4DLE A; 3AVC A; 4YHH K; 4CEF A; 1Z05 A; 1EKE A; 3CJ7 A; 1Q81 O; 4DR3 K; 3KLH A; 3DOL A; 4IFY A; 4N76 A; 4K43 A; 3SMP A; 3MWT A; 4NLC A; 5BRH A; 1P90 A; 4EP4 A; 3VOV A; 1VQ4 N; 3Q7B A; 5AQL A; 4KTZ A; 4HVJ A; 2QKK A; 4B3M K; 2ASO A; 4JK7 A; 2E4L A; 4XH5 A; 4Z4H A; 3BEX A; 4B8A B; 3AVA A; 5ELZ A; 4M3U A; 1I39 A; 2NRT A; 3CC4 N; 1Q7Y O; 3UIQ A; 3VTI A; 4JHD A; 4LD0 A; 3EY1 A; 2FBV A; 4KTW A; 3CQ8 A; 2PYL A; 5AJ3 K; 5GIO A; 1X9W A; 2P5G A; 4BRC A; 1K8A O; 4CIF A; 1LWF A; 4C8M A; 4O0J A; 3VMF B; 3SV3 A; 1KSP A; 1BI4 A; 4FJX A; 1NM1 A; 4IOA L; 2YV0 X; 1NGA A; 3CJC A; 1IO2 A; 4OGC A; 3QER A; 1K9M O; 2HBK A; 1L3T A; 1U49 A; 2WTU A; 4DR4 K; 3ZCM A; 3D2F B; 5EVZ A; 1OKJ A; 3VGK A; 3TSP A; 1E4G T; 4BRN A; 2O4I A; 2A5X A; 3T1H K; 2E6L A; 2QKB A; 1ZBF A; 2HHQ A; 1BGX T; 1B92 A; 1XUP O; 4LH5 A; 1UOC A; 3N4Q A; 3AY9 A; 3I8D A; 2GWK A; 1NGE A; 2E8A A; 4EAH D; 1J6Z A; 3LDO A; 2V7Y A; 1LCU A; 1T7P A; 3O1B A; 1Q9Y A; 4CHY A; 5F0X A; 4DS5 A; 1MWK A; 2ZD1 A; 1NK4 A; 4CBW A; 4FWK A; 1NOY A; 4BQL A; 1BI4 B; 3C6U A; 2YNG A; 3GE1 A; 4B08 A; 5JS1 A; 1XI1 A; 2FBT A; 4DS4 A; 4CJW A; 1NJX A; 3U9D A; 1TAU A; 3ALY A; 4FVU A; 4RG8 A; 3U6F A; 1NGJ A; 4KH6 A; 5ADX A; 3IG1 A; 4CJV A; 1EO1 A; 2B4J A; 5DK5 A; 5AZJ A; 1HKC A; 5C2D A; 2YKN A; 1JCF A; 1VQK N; 4DWI A; 1RFQ A; 3DLR A; 4NB4 A; 4CEA A; 4FWN A; 1HPZ A; 4WQ5 C; 4FPA A; 3HPG A; 4KHQ A; 2NRX A; 3SBT A; 3KTQ A; 4FLZ A; 2Q3S A; 4XH1 A; 1C1A A; 1WNS A; 1UA0 A; 1VQ9 N; 2FC0 A; 1KFD A; 2P9N A; 3CQX A; 3ZSW A; 4BGB A; 4EHU A; 3CXC M; 4CGD A; 1TYQ B; 1TKD A; 4XH4 A; 4LF8 K; 5D3G A; 3OA9 A; 4C8O A; 3HP6 A; 1WLJ A; 5KPT A; 1NK5 A; 1TYQ A; 4CF0 A; 1KQS M; 4V19 S; 4BWJ A; 4ZHR A; 3LDL A; 1QSL A; 4AHS A; 2XY7 A; 1ATS A; 3FFI A; 3VQC A; 3THW B; 2O8E A; 4E89 A; 4MLH A; 3P4I A; 2NNW A; 5M1P A; 4KHU A; 1S3X A; 1W9H A; 4QAG A; 2DFH A; 4BRE A; 1DTT A; 3D6R A; 3F9K A; 4CIE A; 4J2A A; 4W5Q A; 1RGI A; 4DV7 K; 1WUA A; 1U6Z A; 3NF6 A; 3OYN A; 3C6T A; 3C6A A; 4O5F A; 1LAW A; 3DWL A; 4R5P A; 4CF8 A; 4CGG A; 2NRV A; 4DFJ A; 1QSY A; 4PY5 A; 3TPQ A; 2Z1I A; 1M1K O; 2QWN A; 5C10 A; 3AVF A; 4O8K A; 4FL9 A; 3CJA A; 3VEO A; 4EHT A; 4H4O A; 4Q5V A; 2DY4 A; 4J2E A; 4WQ4 A; 4CFA A; 1BOT O; 1NGH A; 3SPZ A; 1YT3 A; 5GAH P; 1YXQ A; 3PIO L; 3KZB A; 1RBV A; 2ZF5 O; 3VQD A; 2QWQ A; 4IJA A; 4RCH A; 4YDU C; 4BWM A; 5BRD A; 4FM2 A; 1LOT B; 3LL3 A; 1DTQ A; 4AHT A; 3T1A A; 1D5A A; 4I7F A; 2A6A A; 1GLC G; 3GL1 A; 4BRP A; 1NKE A; 1N6Q A; 1ZBH A; 4KV8 A; 1SV5 A; 1HQU A; 1HQE A; 3LP2 A; 4B9U A; 1Q18 A; 3E9L A; 1KC8 O; 1B9D A; 2KZZ A; 4JD2 B; 4JK9 A; 4BG9 A; 1VQ7 N; 2HOE A; 3L8B A; 3KWI A; 2F4V K; 3H1Q A; 3OYG A; 4CZH A; 3AVN A; 4JRQ A; 3MDQ A; 2AJQ A; 4BRK A; 3VA3 A; 3CCE N; 5CYQ A; 3O4N A; 5AQH A; 3RVC A; 4B3R K; 4B1X B; 1HMV A; 4DFK A; 2ZE2 A; 4I6M B; 1HRH A; 3R1X A; 3RRG A; 2HHX A; 1SAZ A; 3ZET B; 4BRD A; 1RDA A; 3BY5 A; 4FPB A; 3UKR A; 3VF6 A; 3D2E A; 4B8C A; 4BC4 A; 3ASM A; 3OYI A; 3ZEU B; 1S1W A; 3AVH A; 3DLH A; 2P9P B; 3IRX A; 3CFR A; 2IOC A; 4A62 A; 2YI1 A; 4X64 K; 3WXM B; 3H46 O; 1BDG A; 4KHS A; 1CZ9 A; 1N32 K; 3LAL A; 2NLX A; 4BE0 A; 3ZSY A; 3T1Y K; 4JEP A; 2A3Z A; 3CER A; 5H1S Q; 2IVO A; 5AQX A; 4DFM A; 3TAF A; 2X74 A; 4KTQ A; 4Z4C A; 4M45 A; 4M3W A; 1L5U A; 1Y64 A; 4DFP A; 3TAG A; 3AVB A; 1BA0 A; 3VEV A; 3OS2 A; 1HKB A; 4JKH A; 3V6D A; 3AA2 A; 1ZBI A; 4CJK A; 1MDU B; 3TTF A; 4DKW A; 4OPH A; 3V9X A; 1XHZ A; 2W40 A; 5AQF A; 4BE1 A; 4CJ5 A; 3FE1 A; 2FF6 A; 1HNX K; 4ILJ A; 1C0U A; 3VQP A; 4CJS A; 2R7Y A; 3MK6 A; 5J2Q A; 2P9S A; 1IG9 A; 2WC9 A; 3K5N A; 3JYT A; 2DPN A; 4YDU A; 3M8Q A; 3M8R A; 3KKR A; 2BAN A; 4H5R A; 4K0K K; 3L2R A; 5C12 A; 3HRG A; 2O8B B; 4PA1 A; 3AO3 A; 1K8K B; 3C94 A; 5AQW A; 3PIP L; 1BQN A; 3LM2 A; 1A5W A; 3MEC A; 4DSF A; 3G71 N; 2OTL N; 4FWS A; 3I0R A; 2OPP A; 1N8R O; 1SL0 A; 2VYP A; 4WFN L; 3K59 A; 3QEV A; 3M8S A; 3PLA A; 4M41 A; 3O6W A; 2FSK A; 3SJH A; 3CM6 A; 3WXJ A; 3T19 A; 2HHH K; 4K42 A; 1QHA A; 2P9U B; 3OBW A; 3CC7 N; 3MEE A; 4IOX A; 1SKW A; 1F21 A; 4DQS A; 3BDP A; 5BR8 K; 3VQ9 A; 4CGI A; 3DXM A; 1NGB A; 2HBL A; 4BGA A; 3NFA A; 1JXB A; 3HOT A; 1N5Y A; 1JJ2 M; 4KB1 A; 4DQQ A; 2YNF A; 2BE2 A; 4DUZ K; 3H1V X; 5CE3 A; 4W5N A; 1VSE A; 3A5M C; 5BN9 A; 4BR7 A; 2NRZ A; 1BO5 O; 2QWL A; 4RW9 A; 3OJU A; 5GAG P; 1NG9 A; 4BRG A; 1BUP A; 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4CJF A; 2OA8 A; 1KFS A; 2O8E B; 2ZJP L; 4E7K A; 2VG7 A; 2RKI A; 3EE9 A; 1BA1 A; 1RTJ A; 2XO7 A; 1CXQ A; 3SAG A; 4A59 A; 4JHD B; 4Q0B A; 1D4X A; 4DV3 K; 3KD1 E; 3AVL A; 3WNH A; 1M90 O; 1YI2 N; 3CC2 N; 3ULD A; 4HTL A; 3VF4 A; 3C65 A; 3L2Q A; 1EXQ A; 2W42 A; 4IZ9 A; 5BRE A; 1QQC A; 4CK2 A; 3PV8 A; 1EWR A; 4KHN A; 2BH1 A; 1NOZ A; 3BZC A; 4OPK A; 1QE1 A; 4CW7 B; 1QTM A; 2D0B A; 4DTR A; 2W6L A; 3ZSX A; 4N41 A; 4BVO A; 4FJG A; 1JKH A; 4JS5 A; 3JSM A; 1TUY A; 1QQN A; 1BIZ A; 1RIL A; 5K14 A; 4DV1 K; 2Z1G A; 3L2W A; 5FRN A; 3SI6 A; 2WOM A; 2P9I A; 3WXI A; 3IAY A; 1VQ8 N; 1VQN N; 3IMX A; 1J54 A; 1YJ9 N; 2OTJ N; 3VN5 A; 4W5T A; 4NCG A; 2GV9 A; 4O0I A; 1NGD A; 2YHB A; 1IJJ A; 5AQK A; 5HLF A; 2HMP A; 3EKU A; 4H0X B; 4WQ4 C; 2HW3 A; 4YOT A; 3O9T A; 1KAY A; 5LY3 A; 1T44 A; 4DTS A; 3VTH A; 3A5O C; 4C23 A; 4FJ9 A; 1SKS A; 4RTF D; 3U3G A; 3LWM A; 4GVM A; 4A2A A; 3ZSV A; 2Q36 A; 2KKZ A; 2KHO A; 3N4P A; 3SV4 A; 2P5O A; 2CGK A; 1ZBS A; 4E19 A; 1NGF A; 2Z1H A; 2RE2 A; 4LF9 K; 2RF2 A; 1O13 A; 1NKB A; 4CJE A; 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