2P9SB

Structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with atp/mg2+
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
197
structure length
197
Chain Sequence
TGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Structural protein
total genus 54
structure length 197
sequence length 197
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9sB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9sB02
1BA0A 4B1VA 1JCEA 4BC5A 5EY4A 3I8BA 4FWPA 4FPBA 3A8YA 3ZETB 3CHWA 3H1QA 3ATUA 4BRPA 3SJHA 4CZMA 2QM1A 3D7EO 3U9ZA 1U2VB 2I7PA 4PKIA 2J4RA 1KXPA 5AQNA 3CI5A 5BPNA 2YJEA 1GLLO 2Q31A 2CGJA 2W41A 3MN9A 5JICA 5AFUH 3CETA 3DXKB 3A0IX 4H5RA 3DAWA 4FSVA 3HTVA 2D0OA 4H0VB 1NGCA 3R6MA 3FZLA 2P9KA 3GE1A 3ZEUB 2AA4A 1BA1A 3TU5A 3DWLA 3EKUA 3MK6A 4BVOA 3EL2A 5AZJB 1C0GA 3SK3A 4ISFA 3WXIA 4B1YB 4IJNA 4EAHD 2QWOA 3VGMA 4MO4A 2P9PB 4BRLA 3QMLA 3WEEA 4JN4A 4H5TA 2GEMA 5KQ8A 1GLAG 2YHWA 4BGBA 5AZIB 3AAQA 1GLCG 1BUPA 4H0PA 3UKRA 3P4IA 3I33A 2GWKA 5AQXA 3H6EA 1BOTO 2FLOA 4C23A 3VEVA 1E4FT 1QQMA 4LC9B 4H0TB 2P9LB 1JCFA 2Q97A 1HPMA 1JCGA 4RCHA 2IIRA 3GOIA 2QWLA 3WXJA 1LCUA 3U8XA 3A5NC 5FPNA 4BQLA 2QW9A 3FZHA 4CD3A 3J8AA 3ATVA 4WQ5C 1P8ZA 5LJVA 5CE3A 5F1XA 2P9SB 2D1KA 4DQ8A 1OKJA 3FFKB 1T6CA 2F9TA 4FWMA 4FWNA 1TYQB 2QXLA 4H0YB 4FOEA 2CGLA 3RSEB 4CZEA 3VGLA 3LM2A 2ZGYA 1KAZA 3C7NA 2VWBA 4K25A 1HJOA 1T6DA 2ZWHA 3HI0A 3HM8A 4JHDB 3CERA 5AQTA 3B8AX 3F9MA 4WQ4A 4JNEA 4MLHA 1SZ2A 1Y64A 3O6WA 3CJCA 4CZHA 4EIAA 4AM6A 3CJ7A 1MWKA 5AFUA 2A5XA 4BR2A 2E8AA 3VEZA 4B1UB 3L6QA 1T44A 5AQVA 3VF2A 4JAXA 1NGEA 4IZ9A 4HWIA 5AQHA 3WQUA 4BR7A 3HSCA 1X3NA 3S41A 3WT0A 4B1ZA 4QS7A 4BC2A 3BUZB 2I7NA 2E1ZA 3MMVA 3QB0A 4FO0A 1DEJA 4FL9A 5BRFA 4F9OA 3VERA 4XH5A 2E2OA 3EZWA 1D4XA 5LJWA 3CIPA 3DJCA 4BG8A 3ZETA 4BR4A 2GWJA 4CZJA 4FWLA 4QS9A 5AQKA 3GBTA 3VF4A 1E4GT 1U2VA 2P9IA 5ELZA 1XUPO 3SMSA 3QFPA 4CZKA 1QQOA 1YUWA 3GL1A 3VGKA 4BC4A 3SMPA 5AQWA 3BP8A 3DXKA 3HBTA 1SQKA 3A5LC 4YDUA 3VEXA 3AARA 2F9WA 1EQYA 3A5OC 5BPLA 4XH1A 4FWQA 3U9DA 3CJ1A 4I6MA 3H3OB 1NGJA 1MA9B 2Q36A 3ZEUA 1HKCA 1ZBSA 5BR9A 4BG9A 3JS6A 1KAXA 3D2FB 4FWKA 1C0FA 2E88A 1BO5O 3KHYA 2NZTA 1BDGA 1NMDA 4XEIA 5BRHA 4M63C 4YDUC 3KVGA 2ASMA 2VYPA 4FOIA 4RTFD 4CJ7A 1XC3A 1HKBA 2V52B 2GELA 4A2BA 4CI6A 2QWPA 4BROA 1NM1A 4EHTA 4O8KA 5AZIA 3G25A 4K43A 1R59O 2HMPA 5AQGA 2EWSA 4FPAA 3JXUA 3O4WA 3FZMA 3QBXA 2QWRA 3VENA 2E1YA 5AQZA 1GLDG 4M7YA 4BRHA 1Q18A 1RGIA 5F2RA 3ZX2A 3ID8A 1YXQA 4B1XB 2A42A 1WUAA 4A62A 3O08A 3FE1A 4CBUA 2FXUA 2HF3A 3L4IA 3O1BA 4IWVA 3WUHA 1QZ6A 4PL7A 2H3GX 1NGGA 3A5MC 3MN5A 4JD2B 4K42A 3FZKA 3L0QA 2P9SA 1ATRA 2IVNA 2ASOA 1IG8A 1TYQA 1ZXOA 2QWNA 4DB3A 3RSEA 3D2EB 3QFUA 4J8FA 5AQFA 5EVZA 4NB4A 3CJBA 2YHYA 1Z05A 3KZBA 3W3DA 3LL3A 4XH4A 1LOTB 2P9UB 4BGAA 4BRFA 4BRAA 2FF6A 5BN9A 5AQYA 3DXMA 4ISEA 5E26A 4IXCA 3H46O 3UB5A 3M6GA 3HZ6A 1ATSA 3GG4A 3OHRA 3VETA 1GLBG 1BU6O 2FSJA 3VPZA 4A61A 3M1FA 1NGHA 2IVPA 4CZIA 4BREA 1TUUA 1V4SA 3FLCO 3LDNA 4BRMA 4BRGA 3ULEB 2CH5A 2QWMA 1RFQA 3O1WA 3LDLA 1NGDA 5FPMA 1GLEG 3C7NB 2YCHA 4WQ4C 5KPTA 3VEWA 2P9NB 4FWSA 1YVNA 2NRHA 3FZFA 3LDOA 3O5BA 1H1VA 1NBWA 2FSKA 3ZX3A 3VEOA 4PL8A 4CZLA 4QS8A 5LY3A 2VCPA 2Q2RA 4A2AA 4O5FA 5ADXH 1V4TA 1YAGA 5EX5A 1K8KB 2E20A 4BRIA 5BREA 2Q0RA 4H5NA 5KPRA 5AQRA 3MCPA 1ZC6A 4BRNA 3EN9A 4EFHA 2ASPA 2BTFA 1NLVA 1TUYA 3LDQA 4M7XA 1ESVA 2A3ZA 2NLXA 3CJAA 2ITMA 2OANA 4NO7A 4KBOA 1GLJO 1WOQA 1NGFA 2A40A 3VEYA 3ENHA 4GY2B 5AQUA 4GNIA 5I9EB 4HTLA 2V7YA 3UKUB 1HKGA 2YHXA 3D2FA 5AQIA 3BF3A 4PKGA 4AM7A 4IO8A 3M3ZA 5AZJA 4RWTA 1MDUB 5AQMA 3IFRA 3AY9A 3CQYA 4FWOA 2P9IB 4CZFA 5BN8A 2BUPA 3MN7A 2P9PA 1KAYA 5AQQA 3MDQA 3LM9A 3QBWA 4H5WA 5BRDA 2Q1NA 2WUSA 3R8EA 4H0OA 4BC3A 2QWQA 2Q0UA 3R9PA 5FPDA 4I6MB 2FSNA 2AP1A 2YI1A 5KQDA 3UE5A 4DHYA 2DPNA 4BRDA 3FGUA 4ISGA 2GUPA 3H45C 2P9KB 2P9LA 3GDQA 1G99A 5JLHA 1BG3A 4B1WB 1DKGD 1QHAA 1HUXA 2W40A 2A41A 1X9JA 3ENOA 3CJ9A 3H1VX 5AQJA 2KHOA 4JD2A 2V51B 2HF4A 2E2PA 5F0XA 2A6AA 2E2QA 3C0BA 2UYTA 1ATNA 1IJJA 4Z94A 3ZX0A 3MN6A 3O8MA 3D2EA 5AQLA 1U6ZA 3W0LA 4WQ5A 1J6ZA 5BPMA 3WXKA 3WEEB 3AAPA 4DCHA 5B8HA 4BRCA 3SLCA 2P9UA 5ADXA 1DGKN 3EKSA 1SAZA 3WQTA 4CD1A 4CBXA 4JHDA 4L3QA 3UKRB 5AQSA 3U4LA 2CGKA 2E2NA 4IJAA 1HLUA 5JLFA 3H3NO 1S3XA 1X3MA 1Z6RA 3TPQA 4MO5A 3CQXA 4H5VA 1GLFO 1NGBA 2PBDA 1NWKA 4BRKA 4BVPA 4CZGA 1NGIA 5E84A 2V7ZA 3VOVA 2CH6A 3ULEA 4CBWA 5AQPA 4B9QA 2ZGZA 3FR0A 5EXWA 5JMVA 1RDWX 4WYBA 5EOYA 4EHUA 1MWMA 2P9NA 2ZF5O 2D4WA 4BRQA 3O80A 1S22A 5KPZA 3IMXA 1XQSC 2IVOA 4FWRA 3DXMB 1QQNA 5TKYA 3WXLA 5AR0A 4BR0A 4E1JA 1BWFO 2FF3B 4BR5A 5AQOA 1K8KA 3IDHA 4BQZA 4H03B 1HX1A 3EO3A 2D0PA 3LDPA 3QDKA 4BR9A 2YJFA 2GTDA 4Y0WA 1QZ5A 3VF6A 2HOEA 3QICA 5FPEA 2PAVA 1NGAA 4H0XB 3IUCA 4PKHA 4K41A 3BF1A 3UKUA 3BEXA 1CZAN 4MLEA 3VESA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BA0A 1K6YA 3HOSA 4EZ9A 3B6OA 1VQON 4FWPA 4JKGB 2ZJPL 1K8AO 3HVRA 3LPTA 3H1QA 3ATUA 3Q7CA 4C8NA 3L2VA 3SQ4A 4M41A 4WCEL 3VTIA 3CC2N 3C65A 4BRPA 3QIPA 5C25A 4CZMA 2QM1A 5CR4A 4PWDA 5AQNA 3SNNA 2Q31A 4LF6K 4MDAA 4DSKA 3C6HA 2PY5A 3CETA 3DXKB 1XMOK 1OVYA 2HHXA 1O13A 2HHVA 3O4QA 4CJPA 4CGGA 1OH8A 3EKUA 4KTWA 2P51A 1L3UA 3SK3A 4G9ZA 4BY9C 4ISFA 4DTPA 4DF8A 2FBXA 4M3ZA 4IJNA 1IKVA 4DU4A 2W42A 1TV6A 4BRLA 3NH2A 2Y1IA 2HMIA 3PIOL 4JN4A 3OJSA 2DY4A 1BQNA 4IOXA 4DV6K 3QLHA 3ISNC 4LFAK 4BGBA 5AZIB 3AAQA 2UUCK 2O8BB 1UAXA 3TWHA 3P4IA 5K14A 3H6EA 4B9UA 1E4FT 1FW6A 4CK2A 2Q97A 1JCGA 4A57A 2IIRA 1TK8A 4ZHRA 3SUQA 1LAWA 3WNHA 3A5NC 3G71N 4EP4A 4BQLA 4CD3A 1Q7YO 3ATVA 2ZM6K 1P8ZA 3SYZA 2IAJA 5M1PA 1BQMA 4KH5A 3KK3A 3FFKB 1TYQB 3RSEB 1JLBA 4BACA 3L3UA 2O8FA 3TSUA 3L3VA 4Z4EA 3C7NA 4YHHK 3HM8A 3HI0A 3DOKA 4RW4A 4JK9A 3MX2A 5GIPA 4PY5A 4WQ4A 3VQ5A 4W5QA 3CJCA 4B08A 3NGZA 3OJUA 4LFBK 1QHTA 3CJ7A 5J2PA 1MWKA 5CY4A 3N4PA 1S1UA 2A5XA 3L6QA 1YI2N 3CCLN 5AQVA 3WQUA 3HSCA 3M5RA 4B1ZA 2QKKA 3CYMA 4AILC 2HNDA 1DEJA 4FL9A 4BDPA 3UIQA 4JKAA 2HVIA 3ZSOA 5C42A 3EZWA 1D4XA 3LALA 4BG8A 1ZBHA 3ZETA 4BR4A 2VQFK 1R0AA 1NK0A 3THWA 4FWLA 2W6KA 3PSFA 3NH1A 1U2VA 4CJKA 5ELZA 3RRHA 3SMSA 4YORA 3BDPA 2YNGA 4KB0A 4BC4A 4KTQA 3L2WA 3NF6A 3C95A 1SQKA 3HBTA 3AARA 1KCFA 3V9XA 1KD1O 4DV1K 5BPLA 4XH1A 4FWQA 1B92A 3CCUN 5BR8K 3CD6N 4FLTA 2Q36A 4H8KA 1WNSA 3HPOA 1ZBSA 3I55N 1HNVA 1BIUA 4HUGA 3VQ8A 1XNRK 3MECA 3KJVA 3DLHA 4DR4K 4QAGA 3TAFA 2Z1JA 1YF5L 4OKKA 4FJHA 4W5RA 4X64K 5GAEP 3KK1A 1BDGA 1XNQK 3IAYA 4RTFD 4LSLA 1NKEA 1ILYA 2GELA 2P1JA 3K59A 4CI6A 4BROA 1YTUA 1J53A 4CCHA 1RBUA 4FK4A 4M45A 4FPAA 4CW7B 4RW8A 2OPSA 3VENA 4JI5K 1Q9YA 2E1YA 3PY8A 4N41A 3K5MA 4NCBA 1VQPN 1RGIA 5F2RA 4CGDA 1XI1A 3HP9A 1NK8A 4B1XB 4ZTJA 4WFBL 1EO1A 4B9TA 2NNWA 4KH6A 4C1NK 3E9OA 2FXUA 4FJKA 3ZT1A 4NLBA 3V9SA 1RT5A 3A5MC 4JD2B 4FYDA 2P9SA 1S5JA 1ATRA 2ASOA 3O9RA 2GBZA 5IT9O 1LWFA 2YHYA 1QS4A 4CE9A 3LL3A 1RDCA 2KQ2A 4AQYK 1KTQA 4JKHA 4MFBA 2KKZA 1LOTB 2P9UB 4KHPK 3P1GA 5LMNK 1C0MA 3DXMA 4ISEA 3CMEN 4F3TA 4O4GA 3CM6A 2WC9A 2QEXN 3UB5A 4BE2A 4F3OA 3OHRA 3TAEA 2X6SA 3K5OA 2G8IA 1I94K 3OYNA 1BU6O 3J7AP 3SUPA 3DLEA 4Y1DA 3QO9A 4IO9L 3P39A 1TUUA 1YIJN 3FLCO 1WSHA 3LDNA 4I2PA 4BRGA 4CEDA 1ZBFA 2O8CA 3LDLA 1NGDA 4Z4CA 2KW4A 2YCHA 4WQ4C 1YVNA 2NRHA 3KIOA 3O5BA 3V9UA 2FSKA 1N6QA 2D0BA 3VEOA 3G0ZA 4JI8K 5LY3A 4OPJA 3ID6A 4CJ4A 1W9HA 1YAGA 4CHNA 3NHGA 5CHIA 4BRIA 5HP1A 3MCPA 4BRNA 1EX4A 3HPGA 5C24A 3U3GA 4Y0WA 4M3UA 2A3ZA 2OANA 1IH7A 1BI4A 3MXMA 3QEWA 2V7YA 1ZBIA 3UKUB 3BF3A 4PKGA 3ZT3A 3CCMN 1KRPA 1EP4A 3M3ZA 3P83D 1S1VA 3SPZA 2OPRA 4KAZA 4FM2A 4F8RA 3PX0A 1HR0K 3QBWA 2UXDK 2NRXA 2Q1NA 5BRDA 3T1HK 3TARA 3OYLA 3ZSVA 1L5UA 5FPDA 2ZD1A 3J7YP 3CF5L 4CJRA 3G6EN 4FLXA 1HYVA 1TVRA 4RW7A 4CEFA 2YNIA 2IDOA 3CFPA 2NRRA 2VWJA 4CECA 5M1KA 5JLHA 4B1WB 1NK4A 1HUXA 4OKEA 1X9JA 3THXA 5AQJA 2V51B 2E2PA 3C0BA 3PX6A 4CHYA 1U04A 2UYTA 3M8QA 1X9WA 4LY7A 1ATNA 1IJJA 4Z94A 3ZX0A 3O8MA 1RT4A 4DV2K 4WQ5A 4CVNE 4DCHA 4KHWA 3MEEA 4LF9K 4OX9K 1VSKA 3LAMA 4H4OA 1JLQA 4CEEA 4JHDA 1SL2A 3OYDA 2HHSA 2F8SA 1A5VA 3U4LA 3CC7N 2WTUA 1S9GA 3OTOK 1BCMA 3NE6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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