2P9SB

Structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with atp/mg2+
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
197
structure length
197
Chain Sequence
TGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 54
structure length 197
sequence length 197
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9sB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9sB02
4CBUA 1BA1A 2GWKA 2F9WA 4FWSA 4BR0A 3ENHA 1X3MA 5AFUH 3LDPA 2ZGZA 2PAVA 3HM8A 5LJWA 5AQPA 3R8EA 4BRAA 3BF3A 3CI5A 5F2RA 3FFKB 2AP1A 5BPLA 1HKCA 1TUYA 1QZ6A 5AZIB 4BRNA 2D1KA 4AM7A 1ZC6A 3WQTA 4C23A 4BC3A 1HKBA 3CJCA 1MA9B 2YCHA 3ZETB 2E2OA 4JN4A 4FOEA 1HJOA 4A2AA 2IVOA 1H1VA 5BREA 1LOTB 3VOVA 3RSEA 3O5BA 4A2BA 1TUUA 3CQXA 3VENA 1JCGA 2KHOA 3U9DA 5AQLA 3O08A 4JNEA 4BRFA 1YXQA 4H0VB 4H0PA 3LL3A 2VCPA 1XUPO 3MN6A 4H0YB 5LY3A 3H45C 3GG4A 3QFPA 2P9KB 3WUHA 1GLEG 4BRMA 3H6EA 1NGDA 5AZIA 3QMLA 3AAQA 3HTVA 3W0LA 5AR0A 1D4XA 3AAPA 2CGLA 4B1WB 5JLHA 2FF6A 3LM2A 3EZWA 3O80A 3SLCA 4FSVA 4B1ZA 1GLAG 3VGLA 3VEVA 1V4TA 4FWOA 5BRHA 1DKGD 1HKGA 1HUXA 3BEXA 2DPNA 3ZETA 5I9EB 3A5LC 4IZ9A 3DAWA 3C0BA 2OANA 4BGBA 1NGEA 4O5FA 3EN9A 4BRCA 4IO8A 3G25A 4BR5A 4F9OA 3MN7A 3SMSA 4BRQA 3FE1A 5EVZA 2F9TA 3DWLA 2WUSA 4BG8A 2P9IB 3DXKB 4BRGA 5BPMA 1C0FA 4PL7A 3GE1A 1OKJA 3BF1A 4DQ8A 5JICA 3A5OC 2P9KA 3CJ9A 2PBDA 1SZ2A 3VPZA 1NWKA 3GDQA 4GNIA 3H3NO 3IFRA 2ASPA 3O1BA 4JHDB 1JCEA 4IJAA 3I33A 2UYTA 4CBWA 4Y0WA 1ATNA 3VETA 5BRDA 3CJAA 2I7PA 1CZAN 2YI1A 4BGAA 2BTFA 4IJNA 3HSCA 1KXPA 3ULEB 5JLFA 3KZBA 5BPNA 5JMVA 2QWNA 3QBWA 4CZHA 3MCPA 4RTFD 5KQ8A 4CJ7A 3D7EO 2P9IA 5ADXH 3DXKA 1ATRA 3VEZA 3QB0A 4CZGA 2E2NA 2NRHA 4H5TA 2YHXA 2J4RA 4BRIA 4WQ4C 4IWVA 3CIPA 5AQTA 1SQKA 5BN8A 2P9UB 1T6DA 4AM6A 1GLLO 2HOEA 5AQZA 5EX5A 1BG3A 1T44A 2CGJA 2QM1A 3WXJA 1NGFA 2Q97A 2Q36A 1GLDG 2E8AA 3A5NC 1Y64A 2FXUA 3LDLA 4WYBA 1NLVA 4BR2A 3EKSA 2GTDA 4DHYA 4XH1A 3ULEA 5AQVA 5AQQA 2Q1NA 3KHYA 2ITMA 3H1VX 3W3DA 3ATUA 2QW9A 4K42A 4FWPA 4XH4A 1BOTO 3FZKA 3WXKA 2FF3B 5AQMA 2ASMA 3IDHA 4RWTA 1TYQB 4BRDA 3QBXA 4K41A 2A5XA 3P4IA 3SK3A 5FPEA 3F9MA 1J6ZA 1MDUB 3EKUA 1NGIA 4B1VA 5E26A 2FSNA 2CH5A 1BA0A 2P9UA 3AY9A 4H5NA 4FWLA 3CQYA 2E1YA 5AQUA 3C7NB 4QS7A 1Z05A 2QWPA 4WQ5C 3ZEUB 3VERA 4BC4A 4H0TB 4CZFA 3S41A 1YVNA 5AQWA 3KVGA 4FOIA 4BG9A 4FO0A 3VF2A 3ATVA 4Z94A 5EXWA 4JAXA 3MN5A 1BU6O 1MWMA 1DEJA 2P9NB 2V52B 3D2FB 3FZMA 4H0XB 3M1FA 3UB5A 4DCHA 3IMXA 3DXMB 5AQNA 2HMPA 4QS9A 3WXLA 4NB4A 3L6QA 2ZWHA 1TYQA 3QFUA 5AQGA 1QHAA 1X9JA 4FWMA 1WOQA 4LC9B 2A42A 3UKRB 3MMVA 1DGKN 1T6CA 4BR4A 2P9SB 1RFQA 4B1XB 1NGBA 3C7NA 5B8HA 2E20A 4JD2B 5F1XA 4FWKA 3VF6A 3ZEUA 4HWIA 4O8KA 1GLFO 1QZ5A 1BWFO 1GLJO 1JCFA 2V7ZA 1HLUA 1NGCA 2AA4A 3QICA 5KPRA 2Q2RA 2E1ZA 4EIAA 2Q31A 2ZGYA 3MN9A 3QDKA 3ZX2A 4BR7A 3D2FA 2P9NA 3H1QA 4MLHA 2VYPA 2E2PA 2QWQA 3TPQA 4H0OA 3DXMA 4BQZA 4BREA 3SMPA 1P8ZA 4FPBA 4YDUC 5AQKA 4BQLA 1XC3A 4EHUA 4M7XA 4GY2B 1E4FT 5AZJB 1BO5O 5LJVA 2IIRA 3UKUB 1ESVA 3WEEB 3GL1A 5TKYA 2P9SA 3O8MA 1R59O 2FLOA 5ADXA 4JD2A 4BRLA 4PL8A 5EY4A 1QQOA 1SAZA 3GOIA 1IJJA 4JHDA 4HTLA 3VEYA 2GEMA 1MWKA 3ZX0A 5AFUA 5BR9A 2P9LB 1HPMA 4WQ4A 1S3XA 4BROA 4BR9A 3R9PA 5CE3A 3VESA 3LDQA 1GLCG 4CZLA 3U8XA 4M7YA 4I6MB 3CHWA 1WUAA 4MO4A 1ATSA 3D2EB 3A0IX 1QQNA 5AQSA 3VGKA 3FZLA 2IVNA 4IXCA 3AARA 1KAYA 3FLCO 4BVOA 3O4WA 5AZJA 4K25A 3UKUA 2ASOA 3WXIA 5FPDA 2YHWA 4K43A 2A6AA 4FWRA 4PKHA 3DJCA 3FZFA 5EOYA 3OHRA 2NZTA 3WEEA 5AQIA 2FSJA 2FSKA 2YJFA 5E84A 3WT0A 1NGAA 5FPMA 5BN9A 3ID8A 1YAGA 3LM9A 1KAXA 4CZMA 3BUZB 1C0GA 1Q18A 5AQOA 4ISEA 3L0QA 1G99A 2HF4A 2Q0RA 2P9LA 4FL9A 1U2VB 1QQMA 4BRKA 1ZBSA 4XH5A 2Q0UA 4FWNA 4H03B 2BUPA 1KAZA 2P9PB 3O1WA 5ELZA 3FZHA 5AQYA 4I6MA 3HI0A 3M3ZA 4DB3A 3JS6A 5AQXA 4NO7A 3EL2A 4ISGA 3VEWA 3D2EA 2CGKA 4PKGA 4WQ5A 3IUCA 1HX1A 3WQUA 3TU5A 4FPAA 4EFHA 3EO3A 2H3GX 3LDNA 3CERA 2HF3A 3GBTA 4B1UB 3J8AA 5AQHA 1BDGA 4J8FA 4EAHD 2E88A 3R6MA 4RCHA 4ISFA 3HZ6A 3O6WA 4B1YB 5BRFA 5F0XA 5KPZA 4KBOA 5AQFA 3VEXA 4M63C 2VWBA 3CJ1A 5KQDA 3SJHA 4PKIA 1NGHA 3ENOA 2D0PA 1K8KB 2I7NA 4QS8A 3A5MC 4CD1A 2QXLA 4CZEA 1BUPA 2QWRA 5AQJA 1U6ZA 1NGGA 3ZX3A 2YJEA 1U2VA 1NMDA 3BP8A 1NM1A 1YUWA 2D4WA 1E4GT 2W41A 1RGIA 1NBWA 4CZKA 1EQYA 2GWJA 4FWQA 2P9PA 1XQSC 3H3OB 2A41A 2EWSA 4BC2A 4B9QA 4BRPA 3U4LA 1IG8A 3VEOA 2A40A 5KPTA 2ZF5O 2QWOA 4MO5A 2YHYA 4H5RA 4CI6A 1V4SA 4MLEA 4BVPA 4XEIA 3VF4A 3H46O 4CBXA 1X3NA 2CH6A 3FGUA 2GUPA 2E2QA 3JXUA 3M6GA 2V7YA 1RDWX 4CZJA 3MDQA 2V51B 1Z6RA 5FPNA 4H5VA 3MK6A 4H5WA 3VGMA 3FR0A 4CZIA 3U9ZA 4L3QA 3UE5A 2IVPA 3B8AX 3UKRA 4A62A 4E1JA 2W40A 1K8KA 3CETA 3I8BA 4YDUA 2QWLA 3L4IA 1ZXOA 3A8YA 3HBTA 5AQRA 4EHTA 2D0OA 3LDOA 4BRHA 2A3ZA 4CD3A 2NLXA 3RSEB 2GELA 1LCUA 1NGJA 2QWMA 1GLBG 3CJBA 4A61A 1S22A 4BC5A 3CJ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QEXN 5HOOA 2F9WA 5C12A 5LJWA 3S5TA 2OZMA 1QZ6A 4GW6A 3VTIA 2D1KA 3SQ4A 1WBBA 4Z4IA 3QEWA 3ZT4A 4OPKA 1HKBA 4DF4A 2WOMA 4N76A 1VQPN 4LF4K 3ZETB 4FOEA 2IVOA 2KQ2A 3OYFA 3P38A 4E89A 2IC3A 3VOVA 3O5BA 5C25A 1VSFA 1BI4B 2Y1IA 5DMRA 3HP9A 4JNEA 4L8RB 2BANA 3NF7A 3KD5E 2ZD1A 4H0VB 4GVMA 2OZSA 3TAQA 2HNDA 5FDLA 1QE1A 3P39A 3GG4A 1GLEG 1QSYA 2DFEA 2R7YA 1Q82O 4B3MK 4FYDA 3HTVA 2QKBA 1D4XA 3AAPA 2CGLA 3FFIA 4J2BA 1K9MO 3O80A 1WBDA 1NJWA 2QK9A 4FSVA 1K8AO 1GLAG 3O9SA 3VQQA 1VSIA 3O9RA 1RT2A 1VHXA 4ELTA 3T69A 4IO8A 3G25A 4BR5A 3NH2A 1NK6A 1CXUA 2QXFA 3SMSA 3WNGA 5EVZA 4DV6K 5KRTA 1WNSA 2Z1JA 3L2WA 4GKJK 4BG8A 4CF8A 4FM1A 3KJVA 2O8DB 1YIJN 1OKJA 3BF1A 1JL2A 3OS2A 4CF1A 1NK9A 3HK2A 2RPIA 4KHQA 1W7AA 3P83D 4Z0UA 5FRMA 3OS1A 1U04A 3IFRA 1J5EK 5IWAK 3V1OA 3KLEA 3O1BA 3IKMA 3SV3A 4DSJA 4FZXC 4CJLA 3RR8A 4M42A 4MQ3A 4O44A 5GIPA 3HSCA 4ICLA 4CGJA 2QWNA 1LAWA 1JXBA 2F8SA 3KLFA 2O4GA 5KQ8A 4CJ7A 2P9IA 3AVMA 5ADXH 5C2FA 1NOZA 2E2NA 2YHXA 4BRIA 4M3UA 4WQ4C 4JYAK 3CIPA 1JLAA 4IBNA 3SUOA 1T6DA 1N5YA 1VAZA 5AQZA 5EX5A 1LAVA 1VQNN 4CK1A 3AA3A 1HYVA 3AVNA 3L2UA 2Q97A 1QSLA 4BDYA 3CQ8A 3VQ5A 4CFAA 2DFHA 4NLBA 3KIOA 3CXCM 2FXUA 3OYJA 1Y97A 1NLVA 2JWKA 4XH1A 4QAGA 5AQVA 3ULEA 2ITMA 1Z26A 2X6SA 3W3DA 4FWPA 4JEPA 1U47A 3WXKA 4JV5K 5I42A 3CC2N 4I2QA 4K41A 3P4IA 3F9MA 2HHQA 2F4VK 1NGIA 4B1VA 1VRTA 3QIPA 2FSNA 4O0IA 2HBKA 3R1XA 3OW2M 2E1YA 5AQUA 3V9UA 2HBLA 1VSHA 4H0TB 3KLHA 4DTMA 3S41A 1XHZA 5AQWA 4KB0A 2F96A 3TSPA 3VF2A 3ATVA 4Z94A 5EXWA 1EKEA 1MWMA 4CF2A 5T7BA 1YJNN 4JLHA 2HHXA 4H0XB 2XO7A 4JI4K 4DCHA 3K9JA 2HMPA 3WXLA 5HBMA 2QKKA 4AHUA 1B9FA 3VQDA 5AQGA 1QHAA 5GIOA 4FJHA 1D8YA 4LC9B 3O9QA 3RRHA 4YHHK 4X65K 4JI1K 1X9SA 3OYLA 1RFQA 3ZSOA 1NGBA 4FWKA 3ZEUA 4I7FA 4CJ3A 1A5VA 1QZ5A 3ZT3A 4ILHA 1NGCA 2P5OA 2AA4A 2FBXA 3K0SA 2E1ZA 3PO5A 2Q31A 3ZX2A 1NOYA 4MLHA 4DFJA 2E2PA 1Q8IA 3L2VA 4H0OA 3DXMA 3CC7N 5JS1A 1NJZA 3CPEA 3M5RA 4NCAA 3SMPA 4YDUC 5AQKA 1XC3A 1T03A 3THXB 1RTDA 2B4JA 4GY2B 4E7KA 1Q81O 5LJVA 1VSLA 1KC8O 1BQMA 5SZTA 4B9UA 1ESVA 2P9SA 5GINA 1R59O 2FLOA 1SKRA 3TAEA 3DRSA 4BRLA 1L3VA 4PL8A 2YKMA 1QQOA 2I5JA 3GOIA 4DV5K 2Q3SA 2HHIA 4JI2K 3AV9A 4FLXA 5AFUA 4WQ4A 1S3XA 1BHLA 1SV5A 4I9LA 3VESA 3LDQA 4I2PA 4YOTA 4X64K 3U8XA 1S1VA 4M7YA 4I6MB 3CFRA 4GVEA 3VQ6A 1JLGA 1ATSA 1IO2A 4H4OA 3ASMA 3K2PA 5JVHL 5AQSA 3BY5A 4DQIA 2IVNA 1KAYA 5AZJA 3ZSWA 4NXMK 3CCSN 2YHWA 3O3GA 3F5TA 1S72N 4DTPA 4E7JA 5BN9A 3A2FA 2YV0X 3HRGA 3BUZB 1S1TA 4KH6A 4EP4A 3KLGA 2G8VA 1Q18A 5AQOA 3VQBA 4ISEA 4WFBL 3L0QA 2BE2A 2HF4A 1TL1A 2XY8A 4CFCA 1T05A 4KI6A 4LFAK 2G8FA 2IOCA 4BRKA 1ZBSA 1NMNA 1RDAA 2P9PB 3PSIA 5ELZA 3M8QA 4JI7K 2WONA 4M3RA 4NO7A 3EL2A 3VEWA 3WXMB 2C1GA 4PKGA 1HX1A 5C2DA 3SBTA 4E1MA 2H3GX 3C6AA 4A57A 4IG0A 3K57A 3OTOK 2VG6A 2E88A 4RCHA 5IT9O 1D5AA 1WSFA 1W0HA 1KSPA 4RW7A 2E6LA 1U4BA 5AQFA 3VEXA 2NRVA 4GV9A 2YX6A 4OLBA 3NVMA 1FKOA 1S5JA 4ID1A 4CZEA 2QXLA 4DMNA 4CE9A 3DRPA 2OA8A 3LAMA 3TAGA 1RILA 1U2VA 3CCJN 1IBKK 5HRSA 1E4GT 1X9MA 3HSTB 2A41A 2EWSA 4BC2A 3I55N 3PIPL 3THWA 1V4SA 4BVPA 5H1SQ 4B9SA 1A5WA 3OBWA 3FGUA 3S9HA 1ZBIA 3NF6A 3BZCA 1Z6RA 4H5WA 4CZIA 3U9ZA 2F7TA 3UE5A 2IVPA 4H4MA 2Z1IA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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