The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
76
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structure length |
76
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Chain Sequence |
ERRRHSGQDVHVVLKLWKTGFSLDNGDLRSYQDPSNAQFLESIRRGEVPAELRRLAHGGQVNLDMEDHRDEDFVKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure, dynamics and interactions of p47, a major adaptor of the AAA ATPase, p97.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Lipid binding protein
|
| source organism |
Rattus norvegicus
|
| molecule keywords |
NSFL1 cofactor p47
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| total genus |
10
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| structure length |
76
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| sequence length |
76
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-02-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VAZ A; 1SS6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3C7N B; 1KRP A; 3QBW A; 1NJI O; 4E19 A; 3ATV A; 1HKC A; 3K9J A; 3VQE A; 1VQM N; 4CEE A; 4DR7 K; 4FJJ A; 1TYQ B; 3CQ8 A; 1GLF O; 4Y0W A; 4B9S A; 3KHY A; 3AVA A; 1NGJ A; 3R8E A; 2W42 A; 1JLG A; 4DV5 K; 4BRN A; 3K59 A; 5FPD A; 1K6Y A; 2GUI A; 3G10 A; 4OGC A; 2ZJQ L; 3C95 A; 3H3N O; 1KLM A; 4R79 A; 1KTQ A; 1NWK A; 3TAR A; 4DQS A; 4CZJ A; 1WSI A; 3ZT3 A; 3ULE A; 3O9T A; 4WCE L; 1K73 O; 2IS3 A; 1S1W A; 3CI5 A; 3AA4 A; 3FZM A; 5B8H A; 1YIJ N; 5BPN A; 4BR4 A; 5ADX H; 4IFE A; 3AVB A; 3NCI A; 3VEY A; 4PWD A; 2FBT A; 3CJB A; 4KH5 A; 4DV4 K; 3DRP A; 3KVG A; 4B3S K; 3S41 A; 4BC4 A; 4GNI A; 3FZL A; 3LP1 A; 4CEC A; 2Q0R A; 3JXU A; 4DR4 K; 3VET A; 3FGU A; 4BRD A; 3ZSV A; 3QNO A; 2HNY A; 2YKM A; 1IBK K; 3FZH A; 3THX A; 4BRF A; 3THW A; 4GVE A; 5C2F A; 4X65 K; 3JSM A; 3LAK A; 1RTJ A; 1WBD A; 3UB5 A; 1JLC A; 1TVR A; 1B9F A; 2V7Z A; 4JN4 A; 3J81 O; 5EY4 A; 3AVH A; 3IUC A; 3RTV A; 3V1Q A; 2JLE A; 4FVU A; 1CLQ A; 1TKZ A; 3DXM B; 2UXB K; 4NLC A; 4DQP A; 2PYL A; 4JRQ A; 5AQR A; 3QIP A; 5J1E A; 2OTJ N; 1D5A A; 4JI0 K; 4XEI A; 4A5A A; 3QER A; 1N6Q A; 1XC9 A; 4C23 A; 5KQD A; 3C6H A; 1ZBH A; 3C6A A; 4U7B A; 2Q2R A; 1XHZ A; 1D9F A; 2VWB A; 3D0P A; 4M3X A; 1T05 A; 1C0G A; 4WFN L; 3O1B A; 4TSX A; 3O9Q A; 1TUY A; 2V51 B; 1IO2 A; 4LFC K; 2D0C A; 3D2E A; 3CCQ N; 5TKY A; 4QS8 A; 3BF1 A; 3ULE B; 3K5L A; 3SUO A; 1BIU A; 3EEQ A; 2BTF A; 3ITH A; 5BR8 K; 3EL2 A; 5C24 A; 3OYC A; 4LFA K; 1YI2 N; 1BO5 O; 4CJF A; 4M3Z A; 3VTI A; 4EZ6 A; 3VEN A; 4HHT A; 2O4I A; 2GWJ A; 4BRC A; 4M41 A; 4FLV A; 1H1V A; 4DV7 K; 5J2P A; 4RW7 A; 3SQ2 A; 2UYT A; 1FKO A; 4JYA K; 4H8K A; 1HUX A; 1S9G A; 4A2B A; 4KHW A; 3CQY A; 4NB4 A; 3HK2 A; 1BGX T; 2RKI A; 3AA3 A; 1BA0 A; 1VSJ A; 4K41 A; 3THX B; 2I5J A; 4WQ4 C; 3VF4 A; 3DLH A; 3THW B; 1QE1 A; 1RBT A; 3LL3 A; 4KB1 A; 1WAF A; 2BAN A; 3M5R A; 4CK2 A; 3NF7 A; 2D0B A; 3SZ2 A; 2BUP A; 4B3O A; 3L0Q A; 2HST A; 2A41 A; 3HI0 A; 4O8U A; 5BR9 A; 3ZSY A; 4CF9 A; 3HM9 A; 3SUN A; 5LJV A; 5I9E B; 2YHB A; 3CPW M; 3FFI A; 4NXM K; 1BIS A; 3TTF A; 4IO9 L; 3V1O A; 2WTU A; 3NGZ A; 1VQP N; 3L6Q A; 1TKX A; 1WNS A; 2IDO A; 4O5F A; 3PX0 A; 1QQN A; 3DOK A; 5FLX O; 3MEE A; 3MN5 A; 1TUU A; 1KCF A; 3VTH A; 3VQP A; 1CZB A; 4HVJ A; 1Z05 A; 3DAW A; 4JHD A; 3AVC A; 3GDQ A; 4CE9 A; 3O4N A; 3TAQ A; 1HKG A; 4FVM A; 4J8F A; 3PIP L; 4BAC A; 3SPZ A; 3U3Y A; 2YHY A; 1WSH A; 4EHT A; 3D2E B; 3HT3 A; 2HBM A; 1JCE A; 1NK6 A; 3ZX3 A; 3QDK A; 3ZSZ A; 1HPZ A; 2RE2 A; 4M3U A; 5HRN A; 2O8E B; 4J2E A; 4FWN A; 4ILH A; 2YJE A; 2A40 A; 5BN9 A; 3AA5 X; 4CJT A; 4JKA A; 4W5T A; 4DR2 K; 4DFJ A; 3S3M A; 3FZF A; 4XH4 A; 5C10 A; 1BUP A; 1Q82 O; 4DTM A; 4CIF A; 1OKJ A; 1RBS A; 3AVM A; 3UKR A; 4EP5 A; 4MFB A; 1RBU A; 3HXM A; 2B5J A; 4OGE A; 5H1S Q; 3MAQ A; 4J2B A; 5BN8 A; 2UUB K; 1NMN A; 1RT5 A; 1RFQ A; 3G4S N; 2NRX A; 4F2S A; 2ZF5 O; 4BWM A; 4DKW A; 4CF2 A; 3ENO A; 2QWL A; 3SQ0 A; 1WB9 A; 3U9D A; 3O6W A; 2QWP A; 3VF2 A; 4CEB A; 5DMR A; 4DLG A; 4FOE A; 4J2D A; 4NCA A; 2H3G X; 3OS2 A; 1RDB A; 1O13 A; 5KPZ A; 4DV1 K; 1NK4 A; 2YJF A; 2ZM6 K; 4Y1D A; 5MLC Q; 3K5M A; 2J4R A; 2RPI A; 1VQK N; 4O0J A; 4DB3 A; 3A5M C; 3O3G A; 4F8R A; 4CGD A; 2E88 A; 4CJU A; 2IVP A; 3DLB A; 2HHS A; 3F73 A; 1HNV A; 4FZZ A; 4N41 A; 1XC3 A; 4E0D A; 3AGR A; 3ZLJ A; 3CJC A; 4C8N A; 3RRG A; 1SUQ A; 1N33 K; 1S22 A; 4JHD B; 4E7I A; 4RW4 A; 2FBV A; 2HMP A; 1ASV A; 3ALY A; 2JWK A; 2CGJ A; 1YVN A; 3FR0 A; 4DFM A; 3IDH A; 5AQM A; 4DUY K; 3QIC A; 1EKE A; 3WXI A; 2VYP A; 1DTQ A; 1HLU A; 4Z4C A; 2IIR A; 4AF1 A; 3P83 D; 3SQ4 A; 4CJS A; 1U48 A; 4DFK A; 3T19 A; 5AQT A; 4KRE A; 2P9K A; 4QOZ B; 2E2Q A; 3MX5 A; 4DU3 A; 1W0H A; 1NK7 A; 5M1F A; 4I2Q A; 4CEO A; 4ILJ A; 4A61 A; 3ULD A; 3B8A X; 1VHX A; 4DUZ K; 3V9X A; 1TKD A; 4A5B A; 3FE1 A; 4Z4E A; 2HBJ A; 2HVI A; 4ELT A; 3KK1 A; 3P4I A; 2VQF K; 5I3U A; 2OZM A; 4EZ9 A; 1U47 A; 1VQ9 N; 2G8I A; 5GIO A; 1RT1 A; 1Q86 O; 2QWO A; 4NYN A; 2HHT A; 3BZC A; 3QO9 A; 2Z1I A; 3F5T A; 3M8R A; 4BR0 A; 3LPT A; 4AM6 A; 2NZT A; 4FJX A; 1VQO N; 4Q5V A; 3MWT A; 4WE1 A; 5FPE A; 3VQ7 A; 3A0I X; 3ZT1 A; 3JYT A; 4RW8 A; 4E1M A; 1YTA A; 3F9M A; 1HYZ A; 1OH8 A; 2EWS A; 5FRM A; 2GWK A; 4XIU A; 1JL2 A; 1L5U A; 3TWH A; 1BWF O; 4H5N A; 5CR4 A; 4I6M A; 1RDC A; 3G71 N; 1TL3 A; 1BOT O; 3MED A; 3ZCM A; 2XY5 A; 3QNN A; 1XMO K; 4XH5 A; 5ELZ A; 1RT7 A; 3OYK A; 3CCM N; 1X9J A; 2Q97 A; 4CJV A; 4FM2 A; 4FLX A; 4FWQ A; 1BL3 A; 3Q7C A; 3O80 A; 4FSV A; 3J7Z O; 4LF9 K; 2P5G A; 4E1J A; 2Z1H A; 3RMD A; 4FWP A; 3VF6 A; 3U3G A; 2OTL N; 2G8H A; 4E89 A; 4BRQ A; 2HMI A; 3GL1 A; 3A5O C; 4JKE A; 5EVZ A; 1QQO A; 1NGB A; 1T6C A; 1ZBU A; 4FW2 A; 1S6P A; 3CC4 N; 4H5W A; 2JGU A; 3NF9 A; 1JLQ A; 4MLH A; 4OPA A; 4CIE A; 3OS0 A; 4DF8 A; 3PX6 A; 3R9P A; 1FK9 A; 5I42 A; 3RMA A; 4DSE A; 2OPP A; 2O8D A; 1YJ9 N; 3DRR A; 4RWT A; 4FPA A; 1XNQ K; 3KD5 E; 4FJM A; 2WFB A; 1R59 O; 4A62 A; 3CCE N; 3NH1 A; 3PLA A; 3VN5 A; 3WT0 A; 4W5N A; 5FPN A; 4PL7 A; 3LZJ A; 1ILY A; 3DXK B; 5M1P A; 2E8A A; 5ADX A; 4BRA A; 4AHU A; 3RR8 A; 4HCC A; 2E20 A; 1XWL A; 4OX9 K; 4CFB A; 3NGY A; 5M1N A; 4FPB A; 4JKD A; 1QHT A; 3RWU A; 1NKB A; 4CZI A; 1S9E A; 2GBZ A; 3SLC A; 2YI1 A; 2A6A A; 4YOX A; 4I6M B; 4H5R A; 4CGJ A; 5C42 A; 3HP6 A; 3RMB A; 4CK3 A; 1IG8 A; 4MDA A; 2KFN A; 4DTO A; 4HUE A; 1JJ2 M; 4AM7 A; 3BF3 A; 4H0V B; 3O9R A; 3EN9 A; 3DLR A; 4AHS A; 4B9T A; 2VWJ A; 1XUP O; 1GLC G; 1YJW N; 4JI2 K; 4E7H A; 4E1N A; 4MQ3 A; 4CEF A; 5HRR A; 4CJ4 A; 2Y1I A; 2E6L A; 4DV3 K; 2YHA A; 1NMD A; 2E4L A; 5CHI A; 2NRW A; 4BWJ A; 3OYJ A; 4N47 A; 3H3O B; 2F96 A; 4DV0 K; 2V7Y A; 3QLH A; 1JLF A; 2X78 A; 3AVN A; 3VMF B; 1NK0 A; 1SQK A; 1U49 A; 1KAY A; 4EIA A; 4C8M A; 3CME N; 1RT4 A; 2O8D B; 5AQH A; 2NUB A; 1LAW A; 3MN9 A; 4LF5 K; 2VGM A; 1SZ2 A; 3SYZ A; 3NVK A; 3M6G A; 1MWM A; 4Q0B A; 4CFA A; 5AQS A; 4K43 A; 4YHH K; 3HL8 A; 3OW2 M; 3HJF A; 2XY8 A; 1O1W A; 3QEP A; 2XRI A; 4W5Q A; 3HYF A; 3KJV A; 4AH9 A; 2UXD K; 3K5O A; 5D3G A; 3HZ6 A; 3I56 N; 3K57 A; 2PZS A; 3ISN C; 3NF8 A; 3WEE A; 3WNG A; 4AQY K; 3AO4 A; 4BRI A; 3LDN A; 4CZL A; 3SAF A; 1S6Q A; 1LWE A; 1X3N A; 4M3T A; 5TKW A; 3U6F A; 4DQQ A; 2OZS A; 3QFU A; 1SKR A; 4PL8 A; 5JS2 A; 3VQA A; 4JV5 K; 3E9L A; 5EX5 A; 1HNW K; 1C0U A; 4WQ4 A; 1C0T A; 1VSF A; 1W97 L; 4IZ9 A; 4PKG A; 4DCH A; 3TAP A; 3CIP A; 4BE2 A; 3DXM A; 3QML A; 2W6K A; 5E26 A; 1ASW A; 4FLZ A; 4B1Z A; 4GKJ K; 1L3U A; 3WQT A; 2A42 A; 3NMU A; 4HUF A; 1VSI A; 2QWM A; 4JI5 K; 1VQL N; 4FYD A; 2HHW A; 2ZWH A; 4G9Z A; 3G25 A; 5GIN A; 4JKH A; 3AVF A; 4FJI A; 1TK8 A; 2D1K A; 2P9L A; 3ZX2 A; 4GW6 A; 3I8B A; 3VQ8 A; 4FZX C; 5JS1 A; 1DTT A; 1W9H A; 3E01 A; 2ZJR L; 4FK4 A; 2BH1 A; 4ILG B; 4ISG A; 1RIL A; 1KVB A; 2QEX N; 2HNZ A; 4CJQ A; 1J9A A; 4OKE A; 3WXM B; 3OYM A; 4CCH A; 4IEE A; 2D4W A; 4WQ5 A; 1TL1 A; 4BC5 A; 1HQU A; 4IOC L; 5C15 A; 1WLJ A; 4FCY A; 3V9Z A; 4CJ3 A; 3L2V A; 1QTM A; 1WOQ A; 1NK5 A; 1S3X A; 3HVT A; 4IDK A; 1QQM A; 3ID8 A; 4MLE A; 2QWR A; 4FL9 A; 3WEE B; 3OTO K; 1S72 N; 4Y1C A; 3OJU A; 3E1Y A; 3V9W A; 1NGE A; 5CYM A; 5CY4 A; 4FLT A; 3THV A; 5AQN A; 2F4V K; 3SNN A; 1BG3 A; 4JK7 A; 3F2K A; 1HR0 K; 2OA8 A; 2FBX A; 5AQU A; 5M1Q A; 5FRO A; 3IRX A; 4KB0 A; 2VG7 A; 1ATS A; 2OYQ A; 1D9D A; 1XI1 A; 1Z25 A; 1KAZ A; 4DHY A; 3MCA B; 4DSL A; 4C8O A; 1WAJ A; 3N4Q A; 1SAZ A; 1ZBF A; 2YX6 A; 3WXK A; 4JK8 A; 1VAZ A; 5SWM A; 1CXU A; 3ZT2 A; 3HP9 A; 4L8R B; 1LW0 A; 2QM1 A; 2F8T A; 2YNI A; 1YUW A; 4Z4I A; 1K8A O; 4AHV A; 4DSI A; 3WXL A; 3QES A; 4H0O A; 3BY5 A; 4NXN K; 3A2F A; 4N5S A; 4B3T K; 1NG9 A; 2OPR A; 5AQZ A; 4CJ5 A; 2P9L B; 1G15 A; 2KZZ A; 3VGK A; 4IO8 A; 2G8F A; 3CCV N; 1K9M O; 1SS6 A; 4KHN A; 1T44 A; 4DMN A; 4CGG A; 3BDP A; 4JNE A; 1TV6 A; 4KAZ A; 2O8E A; 1E4G T; 4K42 A; 2KZM A; 2PBD A; 3J8A A; 4IBN A; 3SQ1 A; 2CGL A; 1VQ5 N; 1ASU A; 4M42 A; 4MDB A; 1NJX A; 5M1O A; 3V9U A; 3T1H K; 2ZD1 A; 1LWC A; 4CD3 A; 3C65 A; 3LWM A; 2LSN A; 1Y64 A; 4ID1 A; 1IKY A; 3BUZ B; 5HRS A; 4GKK K; 4YOW A; 2B4J A; 3DLE A; 3MXI A; 3PY8 A; 1NOY A; 1ITG A; 3TAF A; 3P39 A; 3TTC A; 5F2R A; 1YAG A; 4L3Q A; 4KV8 A; 4CVN E; 5C12 A; 3MMV A; 4M7X A; 2QA4 N; 3GE1 A; 3OBW A; 2O8B A; 3SJJ A; 2OAN A; 3TR8 A; 4EFH A; 2KQ2 A; 4CJR A; 4H0X B; 3EO3 A; 4RG8 A; 2HF3 A; 2QXF A; 2QKK A; 3JS6 A; 4CJ7 A; 1NK8 A; 2QK9 A; 1OH5 A; 3C0B A; 5BRF A; 3OBY A; 3T1Y K; 3V81 A; 3VER A; 3A5N C; 2FXU A; 3MXM A; 1JXB A; 4FWL A; 1CXQ A; 4ELV A; 1KLN A; 2Z1G A; 2Q0U A; 3NHG A; 1C1B A; 1Q81 O; 3LAN A; 3MK6 A; 2OPQ A; 4OO1 J; 3K58 A; 3M8Q A; 3L2U A; 4CF0 A; 3OA9 A; 1E4F T; 1KVC A; 3CM5 A; 4WQ5 C; 5DM6 L; 4B1W B; 3TAM A; 5HL7 L; 1NJZ A; 3O1W A; 4CZK A; 3OYB A; 4DWI A; 3VGM A; 4WYB A; 4BRO A; 3NFA A; 3TSP A; 3BGR A; 1VSK A; 3KK7 A; 3M8P A; 3IS9 A; 2GX9 A; 1FXX A; 4GVM A; 4JD2 B; 3B6O A; 1GLB G; 4BG8 A; 3LDO A; 4HUG A; 2UUA K; 1KAX A; 3SAG A; 1QSS A; 3EKU A; 1TKT A; 2O8F B; 2HHX A; 2G8K A; 3KLF A; 3AA2 A; 4K0K K; 3L2W A; 4H0T B; 2E2O A; 4CF1 A; 3OYN A; 4DS4 A; 1HNZ K; 5AFU H; 2QWQ A; 2KTQ A; 4CI6 A; 4KI6 A; 2NRV A; 3D2F A; 2D5R A; 3EZ5 A; 1X1P A; 1XQS C; 3AAQ A; 5EXW A; 3O4W A; 3P38 A; 3NH0 A; 3W3D A; 4ID5 A; 4FJN A; 3LM2 A; 2IVO A; 1BDG A; 4BG9 A; 4OPH A; 1YT3 A; 5KI6 A; 2O8B B; 5J2Q A; 3E9P A; 1QQC A; 3T7Z A; 4KHP K; 2ZE2 A; 1N32 K; 4M3R A; 3EYZ A; 4GV9 A; 2V52 B; 4N56 A; 4CIG A; 3LWL A; 4AHT A; 1SL0 A; 5KRT A; 4KO0 A; 4FM1 A; 4LSN A; 1OH6 A; 2P1J A; 1U4B A; 4Z4F A; 1F21 A; 2E1Z A; 3AVL A; 4LC9 B; 3LP3 A; 4NCB A; 3BP8 A; 5AQI A; 4DLE A; 2VG5 A; 3O3F A; 1DKG D; 1UA1 A; 1G99 A; 2DFH A; 3D7E O; 4BRE A; 2G8W A; 1QSL A; 1D4X A; 1HYV A; 3QIO A; 4CW7 B; 3AVJ A; 1JXE A; 4ELU A; 4DQR A; 1LWF A; 3AO3 A; 1QSY A; 2P9P A; 4F4K A; 1QHA A; 1C1A A; 1E3M A; 3KWG A; 2P51 A; 4BC3 A; 4B08 A; 4CEA A; 3AV9 A; 2QWN A; 4I2P A; 3VQC A; 4CED A; 1MU2 A; 4IWV A; 2F9W A; 3TAG A; 3P31 A; 3TSQ A; 4CHP A; 4B3M K; 2WC9 A; 2P9U B; 5AZJ A; 5BPL A; 1KFD A; 4E3S A; 3WNE A; 1I94 K; 2Q36 A; 2Q1N A; 4YFU A; 1S1X A; 1RDD A; 2GTD A; 3OY9 A; 2UU9 K; 4CJL A; 4A2A A; 3VQ6 A; 1Y97 A; 1OVQ A; 3MN7 A; 1U6Z A; 4JRP A; 3ZEU B; 3CCU N; 3L3U A; 3IKM A; 5GAE P; 3D2F B; 1S1T A; 3QB0 A; 3CFR A; 2GV9 A; 4PHT X; 4F9O A; 5JIC A; 2KW4 A; 1WSG A; 3DI6 A; 3KWI A; 2P5O A; 3I33 A; 5GAH P; 1NGF A; 4JEP A; 2HBL A; 3AVK A; 3SV4 A; 4O55 A; 3VQ5 A; 5LY3 A; 1U2V A; 3DXK A; 3MXJ A; 4OJR A; 4O8K A; 3ZT0 A; 3L2R A; 4FWR A; 3PO4 A; 3CF5 L; 3H45 C; 2P9N A; 1NOZ A; 1LW2 A; 4BGA A; 3NBP A; 1EXQ A; 2F7T A; 4NO7 A; 3CJ9 A; 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