1VAZA

Solution structures of the p47 sep domain
Total Genus 10
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
10
sequence length
76
structure length
76
Chain Sequence
ERRRHSGQDVHVVLKLWKTGFSLDNGDLRSYQDPSNAQFLESIRRGEVPAELRRLAHGGQVNLDMEDHRDEDFVKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords NSFL1 cofactor p47
publication title Structure, dynamics and interactions of p47, a major adaptor of the AAA ATPase, p97.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Lipid binding protein
total genus 10
structure length 76
sequence length 76
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-02-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.210 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1vazA01
1SS6A 1VAZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FVMA 2IVPA 5HRSA 4X62K 1QSLA 3VPZA 3S9HA 4B3MK 4HTLA 4NYFA 4CF8A 2KW4A 3KK3A 4Y1CA 2UU9K 3CCEN 5GAEP 3HT3A 3SQ0A 3EY1A 3QEIA 2D0CA 4CZJA 4FCYA 3WT0A 4C8KA 3CD6N 4FWSA 1Q86O 3VMFB 1SKWA 1XI1A 5CYMA 1NJIO 4OVLA 2A1SA 3R9PA 3R6MA 4CGJA 1VRUA 5MLCQ 3CYMA 2I5JA 1CXQA 3O3FA 4R79A 4LF4K 5AQOA 4FJIA 3MK6A 3O9TA 4M7XA 5AQXA 3SPYA 2JLEA 1VQNN 3QERA 3DLEA 3BZCA 5AFUH 1OVYA 2F4VK 1YTUA 3AVLA 5AQVA 3KLGA 3U3GA 3F9MA 3L2RA 4C8OA 5FROA 3L6QA 3S3NA 3NMUA 4CEEA 4F8RA 1B9FA 4ZTJA 4WFBL 3QO9A 4CEAA 3M8RA 4KO0A 4B8CA 5HL7L 4CIEA 1NJZA 1RILA 3DXMA 3SUPA 2G8KA 4X65K 1F21A 1QE1A 1ESVA 1ASUA 4KHUA 1RGIA 3HP9A 4JK8A 3SAGA 4DS4A 4DTUA 3A5OC 5CHIA 3FGUA 1GLLO 3RTVA 4DV4K 4LFBK 3RMAA 4FM2A 3OYAA 5M1OA 4BRGA 4IG3A 1QQNA 4NLBA 3AGRA 3J7ZO 4XEIA 4H0XB 3NF6A 2O8BB 4RW8A 5C2DA 1JCEA 4FJJA 4FK4A 1T3VA 1H1VA 1KVCA 4LH4A 1QQCA 3D2FA 2P9KB 2Q36A 4CHYA 3EE9A 3SCXA 2YV0X 3M8PA 2P9IA 3B8AX 4DV2K 2FSJA 1IBLK 2YNHA 1HKBA 3LWMA 1S5JA 1TUYA 4DTSA 1JLGA 3VGMA 3DRRA 4C8NA 4ID1A 3OS2A 5E26A 5AQZA 4F2SA 3OVNA 3QEPA 4FJ9A 1NJXA 4GVMA 4C8MA 1D8YA 1UOCA 2ATQA 5AQFA 2PY5A 3O9SA 2E1ZA 3J8AA 4NXMK 3H45C 2Z1IA 4W5RA 5CE3A 3CCSN 4CD3A 1VQPN 4BGAA 4CFCA 1XNRK 4DR2K 2HNYA 5KRTA 4M45A 3L2UA 4CZHA 1G15A 4I6MA 4BE1A 2CGKA 1OVQA 3O3GA 3K0SA 3AVNA 1FK9A 1U45A 1OH7A 1J5EK 4K25A 4EZ9A 3ZYYX 4JI0K 3ZETA 4FJ7A 2O8FB 4DFKA 2E6MA 3CJAA 3CJ7A 3SK3A 4BE0A 5I42A 1TL3A 2QXLA 1MWMA 2YJFA 3K9JA 1WN7A 2KKZA 3NF7A 2DY4A 4KHPK 4GV6A 1JXBA 2O8EA 3LP3A 3DRPA 1HNIA 1QTMA 4BE2A 1RTDA 4KKOA 2P9SA 5TKYA 3KK7A 2OTJN 4DSIA 2EWSA 1UA0A 3FZLA 4OPJA 3T19A 3QBWA 2NUBA 1BI4B 4ISFA 3OYKA 4JS4A 4FWMA 3V4IA 1LWFA 3WNHA 1JLAA 1LWEA 1IH7A 1FXXA 3UKUA 5KGWA 3I0SA 4BREA 3ASMA 1LW0A 4C1NK 2KFZA 1EQYA 4CHNA 3I8DA 1RTJA 4IOXA 3G10A 5J2NA 3HPOA 5AQJA 2IS3A 5AQPA 5AJ3K 1XUPO 5J2PA 2HNDA 1QSYA 1T7PA 4B3SK 2ASOA 1BOTO 5CR4A 1HYSA 4AHUA 3SQ4A 3UB5A 3OBYA 3AVMA 1JLCA 4JRPA 3U3YA 1R0AA 2GEMA 2P5OA 3DYAA 4CVNE 4FLYA 3E9PA 2NRVA 4JI7K 4BACA 4BG8A 2P9PA 4YOYA 3CC4N 4E1JA 4WFAL 4XH1A 3HOTA 1BDGA 1RDUA 3IDHA 4YDUA 2V7ZA 2OYQA 4KHNA 3NBPA 4MO5A 4ICLA 1U47A 3AAPA 3CQYA 3DLRA 2P5GA 3MCAB 4FWQA 1RDAA 3LWLA 1KLMA 3AVJA 4OKKA 1KD1O 4BY9C 1QQOA 1G99A 4FWNA 4BC4A 4OLAA 3QICA 2E4LA 5HLFA 4N47A 1NG9A 4GV9A 3A0IX 4CW7B 1QVGM 3KD1E 4FLZA 5C10A 3L3UA 4FVUA 5GIPA 4IBNA 2OZMA 2D0PA 1RT6A 4CGGA 3GL1A 3WQTA 3UIQA 4Q0BA 3O80A 1YXQA 4AHSA 2KQ2A 2V51B 3E01A 3CPWM 1IBMK 4DTPA 3P39A 4A2BA 4AF1A 4DFMA 1HNVA 4HCCA 4GKJK 3CMEN 3RVCA 1NGFA 3AVIA 1HX1A 4CJSA 3KLHA 3CCRN 4J2BA 4A61A 3ZSVA 2Z1JA 2FLOA 1KAXA 1YVNA 3LDNA 5LY3A 3QIOA 1L3SA 5LL6Z 4DLGA 1LV5A 1BGXT 3GDQA 1NGBA 3DLGA 3LM9A 1DTQA 3HTVA 1NK8A 4BRQA 1CXUA 2BANA 2ZM6K 1BIZA 2IGIA 4DTXA 1XMQK 4BGBA 1BU6O 4RW7A 4FLVA 3P83D 3VOVA 2PAVA 1LW2A 2HHTA 4BRCA 1WSIA 4KI4A 2FXUA 4N41A 2HNZA 2VG5A 1YITN 3VGLA 3D45A 4O8KA 1C0FA 5EU7A 5DK5A 4CEZA 2GELA 3O8MA 1IG9A 5GAHP 3ULEA 1RBRA 3DXMB 5AQTA 5C42A 1BWFO 5SZTA 2ZJQL 4FW1A 4RW6A 3VESA 5I9EB 2O8CB 2Q2RA 3GG4A 3P1GA 2E2PA 3L2QA 1IBKK 5T7BA 5BN9A 4CF1A 1S6QA 2HSTA 5GAGP 1CZAN 2UUAK 3N4QA 2KZMA 4CGFA 1EXQA 4DWIA 3BF3A 3C6UA 3S3MA 4I9QA 4W5QA 1S9EA 1N8RO 4K8ZA 3OHRA 3T7ZA 4H8KA 2FBXA 3PO4A 1U2VB 1L3TA 4AH9A 4BWMA 1K8AO 3AA4A 1IKWA 4B9SA 2V7YA 4NB4A 5AQNA 3VF4A 3D2FB 2Q0UA 3DOKA 4PL7A 2O8BA 2P9UA 1VRTA 5I3UA 4KH4A 3TAMA 3WXLA 3M8SA 3EN9A 2G8HA 2YKMA 4H03B 1Z25A 2P9KA 3RRGA 2E20A 3CF5L 4Q5VA 2X74A 3VEWA 2QXFA 3LP1A 4CJRA 4FYDA 5FPDA 4AM7A 2E6LA 3CQ8A 2J4RA 4CHPA 1SL2A 1HMVA 3KLIA 1T6CA 2PYJA 1HNZK 1HRHA 3AVHA 4DUYK 5AQWA 1DT9A 5F2RA 4FJKA 2PFUA 4DU4A 3M5RA 4DQSA 3OA9A 4JKBA 1HUXA 4IWVA 5F1XA 3NVKA 2HMIA 3K57A 4IKFA 1MU2A 4WQ4A 3MECA 1QS4A 4IOAL 1VSHA 3G25A 1NGEA 4Z4GA 5LJWA 5AQRA 1SQKA 4OGEA 1UAXA 3DLBA 3Q7BA 3NH0A 3KLEA 1D9FA 3H3NO 3AVKA 3ZX3A 4DV6K 2XY8A 4KHWA 1J6ZA 4IEEA 4B3TK 3PSIA 2E2NA 1EX4A 1C0MA 4HWIA 1OH8A 3U6FA 3ZT3A 5GIOA 1HNWK 3EZWA 1Q81O 2O8FA 1VSJA 3H6EA 1TYQB 4JKGB 3VERA 3DRSA 4B1WB 3JAMO 3CJBA 4EZ6A 4DSEA 5KTQA 4B9VA 1D4XA 1XNQK 4KAZA 4OX9K 4Z4FA 4E0DA 4NCAA 3V1QA 5JVHL 1VQ6N 1GLAG 1Y64A 1W9HA 3GBTA 4RG8A 4DSLA 3UE5A 2HBMA 1GLBG 1BL3A 1CZ9A 1FKPA 1T05A 3EO3A 3TTDA 3NDKA 1RT5A 4PHTX 1DTTA 3OTOK 1BI4A 4JKCA 2W41A 5HRPA 2RKIA 4FWPA 4Z4IA 3WNEA 4OPAA 2NRXA 3OYDA 1QVFM 4DKWA 4K0KK 1RT3A 3ZT4A 2DFEA 2ASMA 1RCHA 3R8EA 1V4TA 4BR0A 3AVGA 3CJ9A 4XIUA 3HJFA 1NGDA 3SYZA 2A3ZA 4KHSA 1QQMA 1S1TA 3O1WA 1T8EA 4TSXA 3EKSA 4HCBA 1DGKN 5HROA 1NGAA 4FZZA 1K8KB 5A2QO 2P9PB 4FLXA 4OKJA 1ZC6A 1BISA 4YNQA 3RSEB 5KQDA 4CJLA 1RDDA 5C24A 1S3XA 5FPMA 4CK3A 2FSKA 2HHVA 5J1EA 4CK2A 2F9TA 1O13A 4DR5K 3CHWA 1NK6A 3QLHA 4CE9A 4MQ3A 1O1WA 4DV5K 2QA4N 5KQ8A 3AO5A 5C25A 3ZLJA 3CPEA 2WBNA 5BR8K 5M1NA 2A5XA 3AGKA 1VQ5N 5K14A 2E2QA 3BDPA 1TAUA 3LP2A 4CEBA 4DTRA 1WAFA 1IV0A 4ZTFA 3WXJA 5BRHA 3OYCA 4IO9L 5ADXA 2ZQBA 2WFBA 4M3UA 1S6PA 1CLQA 4AQYK 4KREA 3QNNA 1ZBHA 5JS1A 1HPMA 3OW2M 4JYAK 3SQ1A 4CJ7A 3BUZB 1C1AA 3VEXA 4A5BA 2Z1HA 3ITHA 4CCHA 3K59A 4O8UA 3CC2N 3ENHA 1QZ6A 4FLTA 3FFIA 3PLAA 2ASPA 5DM7L 1J54A 4B3OA 4M42A 1RT7A 4QS9A 3A5NC 3NGIA 5FPEA 4ZHRA 4DSJA 1Q82O 2ZWHA 5BN8A 4YOTA 1BA0A 3C65A 1VQON 3VEZA 3L8BA 3C0BA 3T3FA 1ZBIA 4DU1A 1RFQA 2F7TA 1KVBA 3WQUA 1V4SA 4E19A 4EIAA 2Y1IA 1MDUB 2VGNA 2WC9A 1B9DA 2VWJA 5GINA 3IMXA 1U49A 3HO1A 2DTUA 1IKYA 3UKRB 4KHQA 5IT9O 1YVUA 1BIUA 3VEOA 4Z4HA 1IKVA 3V1RA 4GVEA 3QEVA 1Z6RA 3ISNC 1WBBA 1L3VA 2BE2A 2HMPA 1M90O 3ZSRA 2YNIA 3IG1A 4IEIA 3QESA 3FE1A 2BDPA 3ULEB 4PKIA 5D3GA 3AA2A 3V9WA 1N6QA 3MWTA 4YOXA 3MN7A 2OA8A 2VWBA 5M1QA 3F73A 3NGYA 4QAGA 2XY6A 2O8CA 2P51A 1GOBA 3T1AA 3VENA 3WXIA 4CFBA 3OYEA 4E7JA 3A2FA 2E2OA 3H46O 1VQ7N 3L4IA 5FPNA 3PY8A 4BDZA 2HW3A 3KKRA 2Q3SA 4A59A 1XHZA 4BRFA 5CZ2A 1VQ4N 3VQDA 5AR0A 1X9MA 2NRWA 1LCUA 1IO2A 1U2VA 1HNXK 3NGZA 2NNWA 2P9UB 4IJNA 3D7EO 3OJUA 1KLNA 4BRPA 4FJMA 2CH5A 5AQYA 2G8UA 4DMNA 2QWOA 2OZSA 3RRHA 2FBYA 4HTUA 4B3RK 4YOWA 2D0BA 4Z94A 1YJNN 3V9XA 4MLEA 3M8QA 2QWNA 3E9OA 3NF9A 1HLUA 4FWRA 3ZCMA 3K5NA 3DM2A 3HXMA 2YJEA 4J2AA 5DM6L 1TKTA 1C6VA 5FRMA 4BQLA 2QWLA 1Y97A 5BR9A 5M1FA 1YJWN 3P38A 2OPPA 3ZEUA 5LMUK 4FZXC 1TKZA 1WUAA 4CJ3A 2UXDK 1TK5A 2IIRA 4KFBA 4O55A 3HP6A 1SV5A 4FJNA 3I8BA 4PWDA 4F3OA 1BUPA 4GKKK 4WYBA 4WE1A 1K73O 4IXCA 2B6AA 5AQMA 4CZMA 5KPZA 4C23A 3AVAA 2FBTA 4DB3A 4DV0K 4E7KA 4CFDA 3FLCO 1ATNA 1LOTB 3RMBA 5F0XA 3IFRA 4L8RB 4LF7K 4EHTA 3F2KA 2QI2A 4LY7A 3VQAA 3JSMA 1HYZA 3M1FA 1Q18A 1TYQA 4JKGA 2HHXA 3Q7CA 1NK4A 3MDQA 1D9DA 4BWJA 4KBOA 1BQMA 3S41A 1XMOK 3J81O 3CC7N 1XQSC 4CESA 3ZSYA 4WQ5A 4ILJA 1R59O 4B1ZA 2OPRA 2PZSA 5AQIA 1S9GA 3I33A 2RPIA 5M1KA 2QEXN 1CZBA 1YI2N 4BR7A 1SKSA 3K5OA 4JD2B 1P8ZA 3VETA 4EAHD 4JI6K 4CZGA 3L4QA 3ENBA 3ZX0A 2CGLA 1GLJO 2HBKA 4CD1A 4I7FA 3VF6A 3VN5A 1RDWX 3G0ZA 2UUCK 3VQ4A 3TTFA 1FJGK 2O4IA 2YKNA 5CZ1A 2UXBK 4IJAA 3FZFA 4CEFA 3MWPA 4YFUA 3IRXA 3OYMA 3KHYA 2Q31A 3QDKA 4BRLA 4AILC 4LFCK 4Y0WA 2GV9A 4JI2K 1RT2A 1YF5L 4Z0UA 4JN4A 4NO7A 1VAZA 1YHQN 1NKEA 1K8KA 2X78A 4HUGA 5AQQA 3LALA 1RT1A 1A5XA 1YAGA 3SPZA 2QK9A 2AJQA 3P5JA 3RSEA 1KCFA 1RBUA 1N36K 4DCHA 1VSLA 3ZSXA 5J2QA 1VQ8N 1T44A 4YDUC 4IFYA 5BPMA 1ZBLA 4BRDA 4CHZA 1X3MA 1EKEA 3KZBA 4DQ8A 2FF6A 1QHAA 5EX5A 1J9AA 1B92A 2IVOA 2VYPA 4OLBA 5BRFA 1WB9A 4OPKA 4JI1K 2RF2A 3P4IA 2P9NB 3MXIA 3RMCA 4JLHA 3J7AP 3AY9A 3L3VA 1NGGA 3QFUA 4PA1A 4WCEL 1NWKA 2IOCA 3TARA 4CEQA 1RBVA 4M7YA 1U04A 5AQKA 4E7LA 2NRHA 4K8XA 4BRKA 1NBWA 4ISEA 4UQGA 3V9ZA 2CH6A 1RTIA 2D0OA 4IOCL 4MLHA 3LDQA 1GLEG 3ATUA 1VSMA 4DFPA 3PIOL 1U6ZA 1QSSA 2HF3A 2E88A 3TSUA 3OY9A 5JLFA 3H1VX 3KWGA 5AFUA 3FFKB 5JLHA 2ZD1A 1IKXA 2GUIA 4DV1K 5CYQA 1WSHA 5EOYA 4JI4K 1VK0A 2ZGZA 3UKRA 1WSJA 2GTDA 3NHGA 2QWRA 1EETA 2B5JA 3VQCA 1KQSM 3MXJA 3SAHA 2VG7A 4O5BA 1WAJA 1S72N 3WUHA 3M6GA 5M1PA 1Q7YO 4BR9A 3SLCA 4LF8K 5E41A 1NOYA 4DSFA 1KRPA 5AZJB 3ZSOA 3VQ5A 4YOVA 1JLFA 2CGJA 3HM9A 1WOQA 5FRNA 3K5MA 2G8IA 4CEDA 4RCHA 4B08A 4DTNA 1REVA 3SUQA 4G9ZA 3NH2A 4FJHA 4N56A 4MFBA 4YORA 3CM5A 3RMDA 1C0UA 4FJGA 1WSFA 2HBJA 3O08A 1YUWA 4ILGB 2HHWA 3VQ7A 2YHYA 3MEEA 3H3OB 4M41A 1ZYQA 4CJFA 3G4SN 3CI5A 4NLCA 1GLCG 5BPNA 1KSPA 2KLAA 3C6TA 2P1JA 4CBUA 3CFRA 1HJOA 4N5SA 3O5BA 4NYNA 3LAKA 1HKCA 1HKGA 1NM1A 2DFFA 5C12A 2UYTA 4XH5A 1OH5A 4BQZA 3ZEUB 3S3OA 4BR5A 1SKRA 1JL1A 3LANA 2NLXA 3LPUA 3AVFA 1S22A 4H4OA 3NFAA 3OYJA 3SV4A 3I0RA 5ELZA 2NRRA 3THWA 4R5PA 4YY3K 3QBXA 3MN6A 4FM0A 4N76A 4B1VA 4OGCA 2FBVA 4A2AA 1W7AA 3DXKB 4KTZA 2F9WA 4LF6K 4WQ4C 4RTFD 4FOEA 4CZLA 4CECA 2VWKA 4JS5A 3D0PA 3MXMA 3O9RA 4DR7K 3EL2A 1K9MO 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 1SS6 A;  1VAZ A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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