5LJVA

Mamk double helical filament
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
NRLFLGVDLGTSHTAVMSSRGKKFLLKSVVGYPKDVIGLKLLGRPYVVGDEAFEMRSYLDIRYPLQDGVLSEISDRDIEVARHLLTHVVKSAEPGPNDEICAVIGVPARASAANKALLLKMAQEVVHTALVVSEPFMVGYGLDKLINTIIVDIGAGTTDICALKGTVPGPEDQVTLTKAGNYVDERLQNAILERHPELQMNVNVACAVKEQFSFVGTPTEVASFEFRAAGKPVRADVTEPVKIACEALMPDIIESIETLLRSFQPEYQATVLQNIVFAGGGSRIRGLAAYVKEKLRPFGDANVTCVKDPTFDGCRGALRLAEELP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-like ATPase
publication title X-ray and cryo-EM structures of monomeric and filamentous actin-like protein MamK reveal changes associated with polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Magnetospirillum magneticum amb-1
total genus 90
structure length 325
sequence length 325
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljvA02
2P9NA 1YAGA 1WUAA 4NB4A 5AQKA 4PKIA 1HLUA 1RDWX 3CQXA 3ULEA 3O5BA 3GL1A 4FWOA 1HKGA 4WQ4C 4EFHA 1XC3A 1HPMA 1NGCA 2EWSA 3EN9A 3JXUA 4K41A 3UKRB 3HSCA 1T6CA 4XEIA 5EX5A 1X9JA 1S3XA 2W41A 3GG4A 3BF3A 1NGJA 4HWIA 3MN9A 1HKCA 4ISFA 2E88A 4BRFA 1ZXOA 1MWKA 2P9KA 4K25A 4BR5A 3EZWA 3ZETA 3VEZA 2VCPA 4FWSA 4BRNA 3WT0A 4YDUC 2CH5A 3VEOA 1GLDG 1NGFA 3AAQA 3ZETB 5AZJA 4JHDA 5AZIA 1GLCG 1K8KB 5AQMA 2A42A 2A5XA 1RFQA 5E84A 2A40A 4JAXA 1C0FA 3FE1A 4MO4A 4DHYA 3CIPA 5AZJB 4JHDB 5AZIB 3L0QA 2ZGYA 3D2FA 1QQMA 2E2NA 2PBDA 1NGBA 4RCHA 5AQRA 4CZHA 3FZMA 2A41A 3BF1A 3DXMB 3J8AA 3GDQA 2D0OA 2VWBA 3A5LC 1V4SA 3HM8A 3IFRA 5FPMA 5BR9A 1QQOA 2FSNA 4BG8A 3W3DA 4JNEA 3H1QA 2J4RA 3D2FB 3VENA 2FF3B 1U2VA 2HMPA 5AQTA 2CGLA 1IJJA 2E2QA 3ID8A 3O08A 2P9LA 4M7YA 4XH4A 4PL7A 2GEMA 3A8YA 3QFUA 5AQLA 2UYTA 1U6ZA 2F9WA 3R6MA 4BVPA 4O8KA 3WXIA 3R8EA 4B1WB 2P9IA 3QBXA 3ENOA 2QWNA 3QFPA 4FOEA 2HOEA 4WYBA 4IZ9A 3MMVA 1SQKA 2Q97A 1BOTO 3GE1A 4H0VB 5AQWA 1HKBA 4BRQA 2P9IB 5FPNA 2CGJA 5JLHA 1QZ6A 3IUCA 3ZEUA 5BPMA 1NGIA 1XUPO 5AFUH 4FPAA 3S41A 5KPRA 1JCEA 3UB5A 3M1FA 5ADXH 5KPTA 1QQNA 4BR2A 4IO8A 3LM9A 4FWMA 1KAXA 4PL8A 4H03B 1X3MA 3HZ6A 4B1UB 3ZEUB 3VETA 4DQ8A 4E1JA 3VOVA 2QWQA 3CETA 1BG3A 2V51B 4DB3A 3UKRA 1LOTB 3G25A 2E2OA 4K43A 3ENHA 2ZGZA 1GLFO 2P9PB 3U8XA 4A2AA 3H3OB 4BRMA 2FSJA 2GWJA 3FZLA 3SJHA 1BO5O 1H1VA 4C23A 4CBXA 4QS9A 3P4IA 3I8BA 2ASMA 3TU5A 2YHWA 1HUXA 4H5WA 4WQ5C 2BTFA 4B1YB 4CD3A 3MCPA 5AQYA 4CZGA 3H46O 4CI6A 3DWLA 1ATSA 5AFUA 3CJBA 4MLHA 1TYQA 3WQTA 1Z6RA 2F9TA 3WXKA 5ADXA 5I9EB 3CERA 2D4WA 2Q1NA 5AQGA 4RTFD 2W40A 3I33A 3LDQA 3QBWA 4PKGA 3VEYA 3QDKA 3CJ7A 1TYQB 2IVOA 3O1BA 3VEWA 4I6MA 4H0OA 3WQUA 4DCHA 3A0IX 1QZ5A 4FWKA 2QWMA 1K8KA 5TKYA 4A61A 4Y0WA 3DXKA 3SK3A 3QICA 3DAWA 2FF6A 4L3QA 3TPQA 4H5NA 3CJ1A 1ATNA 4I6MB 1HX1A 1LCUA 4EHTA 1SAZA 2YI1A 2ZF5O 4BRGA 4F9OA 5AR0A 1E4GT 2E1YA 3UKUB 3O1WA 3DXKB 1G99A 1NM1A 5EOYA 3DXMA 1YXQA 3MDQA 4PKHA 4WQ5A 4BRHA 1JCGA 5AQPA 5BPNA 5JMVA 1QHAA 4BQZA 4CBWA 2H3GX 3EKSA 3FLCO 1GLBG 4JD2B 3CJCA 2BUPA 1ZBSA 5AQHA 2HF3A 4CZKA 5B8HA 4BC2A 3AARA 1V4TA 3VPZA 1Y64A 3BP8A 1NGAA 1MWMA 2AP1A 3KZBA 5F1XA 3A5NC 5AQXA 4O5FA 4EAHD 1D4XA 5AQUA 2DPNA 4JN4A 4CZLA 3VGLA 5AQOA 3WXJA 4BC4A 1DEJA 3O6WA 3CQYA 5BN8A 3GOIA 4IJNA 2NRHA 1XQSC 3MN5A 2I7PA 3CJ9A 1JCFA 3LDPA 3O80A 4BR0A 2E2PA 4BR9A 5LY3A 3MN6A 3D2EB 3LDOA 4BVOA 1BA0A 3VGKA 3VF4A 4B9QA 4RWTA 1DGKN 2QWOA 4GNIA 4CD1A 3U4LA 1WOQA 3WEEA 3FZHA 4H0YB 4XH5A 3FGUA 4QS8A 5F0XA 1EQYA 5AQJA 2Q0UA 1Q18A 2Q31A 3D7EO 4BREA 1GLAG 1YUWA 2P9PA 3VERA 5AQQA 1E4FT 4CZMA 4H0TB 3ZX0A 4BRLA 3WEEB 2ASOA 2P9SB 1NGEA 4BC5A 1TUUA 4XH1A 2KHOA 3HBTA 2FXUA 1NBWA 3W0LA 2HF4A 4EHUA 1X3NA 5KPZA 1T44A 4GY2B 3SMPA 1ATRA 3FZFA 2E8AA 4FWPA 3MK6A 3L4IA 2NZTA 2Q2RA 4BGBA 2QM1A 4BG9A 2WUSA 1BDGA 4BQLA 3QB0A 2IIRA 3VF6A 4NO7A 4AM6A 4A2BA 4Z94A 3JS6A 3B8AX 5FPEA 4EIAA 1MDUB 4J8FA 2GTDA 3CHWA 4MO5A 2QXLA 3M6GA 3RSEA 2QWPA 1S22A 1SZ2A 3A5MC 5LJWA 5BRDA 2V7ZA 3KHYA 5AQVA 2E1ZA 2P9NB 3ATUA 4BRPA 4FSVA 1ESVA 2GUPA 3VEVA 1GLLO 1NGGA 1NLVA 2I7NA 2P9UA 3RSEB 4KBOA 3ULEB 4BRDA 4FWNA 3EL2A 2YJEA 4BRCA 3L6QA 3UKUA 1YVNA 4FWQA 5CE3A 5FPDA 4M7XA 2E20A 4IXCA 5EXWA 3VESA 1NMDA 4MLEA 1DKGD 2P9UB 1P8ZA 1HJOA 5LJVA 3GBTA 2NLXA 2OANA 2QWRA 4JD2A 3IDHA 1ZC6A 1NWKA 3ATVA 1GLJO 2YHXA 2YHYA 1RGIA 4IJAA 3LL3A 3A5OC 5BN9A 4B1VA 1BA1A 1NGHA 1R59O 4FOIA 4BR4A 4BR7A 2D1KA 5BPLA 4K42A 5EY4A 3H6EA 4BC3A 2Q36A 4FWLA 2V52B 3WUHA 3F9MA 5ELZA 3BEXA 3WXLA 3U9DA 3H45C 4H5RA 2P9KB 3QMLA 2QW9A 4H5VA 5KQDA 4M63C 4WQ4A 5E26A 1TUYA 5JICA 3H3NO 4ISEA 1IG8A 2QWLA 1T6DA 3BUZB 3U9ZA 4H0PA 4HTLA 4B1ZA 4LC9B 3LDNA 2VYPA 4FWRA 2CH6A 5JLFA 4BROA 4BGAA 2V7YA 4AM7A 4FL9A 2ZWHA 3D2EA 5BREA 1BWFO 2ASPA 3SLCA 3EO3A 3ZX3A 3DJCA 5F2RA 3CI5A 3IMXA 2D0PA 4CBUA 2FSKA 5KQ8A 1GLEG 4QS7A 3M3ZA 3O4WA 3R9PA 1BUPA 4ISGA 3VF2A 3OHRA 2IVPA 2PAVA 5AQIA 2YCHA 4BRIA 2A6AA 4H5TA 5EVZA 5AQZA 2GWKA 3LDLA 3VGMA 3ZX2A 2CGKA 5BRHA 4H0XB 1BU6O 1KAYA 3CJAA 3HI0A 3SMSA 4CZEA 3LM2A 2P9SA 4CZFA 2Q0RA 4YDUA 4FO0A 3C7NA 5AQFA 1U2VB 3O8MA 3FR0A 4BRKA 1Z05A 3EKUA 2A3ZA 3AY9A 3AAPA 3FFKB 3KVGA 4IWVA 3C0BA 2IVNA 1MA9B 2P9LB 3H1VX 5AQSA 1NGDA 4B1XB 1C0GA 2ITMA 4CJ7A 3C7NB 4BRAA 1KXPA 2FLOA 3MN7A 3FZKA 3UE5A 5AQNA 1OKJA 4CZJA 2AA4A 2GELA 5BRFA 4CZIA 3VEXA 4A62A 1J6ZA 2YJFA 1CZAN 4FPBA 3HTVA 1KAZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJ5A 1QVGM 1WUAA 4NB4A 3E9OA 1ASVA 1OH5A 4WFAL 4CJKA 1K73O 3CQXA 3ULEA 3R3LA 3GL1A 4KKOA 3WNFA 2XY5A 4WQ4C 4FK4A 4KHUA 3WNHA 3MXIA 2X6NA 1C6VA 3CCMN 4EP4A 1SS6A 4JEPA 1KLNA 4E0DA 5FDLA 4ZHRA 4XEIA 5EX5A 1X9JA 4LH5A 2ZE2A 3KJVA 1VK0A 3O3FA 3CFOA 3LZJA 4JLHA 4DQQA 1YJWN 1NOZA 4BRFA 4X65K 2UUBK 3O3GA 4DR4K 1JKHA 2VG7A 2HHWA 1NNEA 4K25A 4JI1K 3NHGA 1ILYA 3VEZA 3KLIA 3PY8A 1BIUA 3JSMA 4BRNA 3WT0A 2CH5A 4AF1A 4RW7A 5I3UA 5AZJA 4IG3A 4CEEA 1RNHA 5AQMA 1FJGK 2A42A 4B9LA 4EP5A 5LL6Z 1C0FA 2UXDK 5GAEP 4FCYA 3THWA 3VQ6A 1RT7A 4CFDA 1C0TA 1QE1A 4DQRA 2FBYA 1QQMA 2E2NA 2I5JA 2ZGYA 3D2FA 4C8MA 3ZT4A 3OW2M 4CZHA 2A41A 3BF1A 3FZMA 3DXMB 3TSQA 3GDQA 3WNGA 1NK9A 5BR9A 3MXJA 3AVFA 3SZ2A 4CGIA 3VENA 3ZSRA 1U2VA 4LF4K 3VQ4A 2E2QA 5D3GA 1RBUA 4DSKA 2O8FA 1C0MA 2P9LA 2ETJA 5AQLA 2P1JA 1U6ZA 3MEEA 5HRNA 1KLMA 2F8TA 3R8EA 2GV9A 3ENOA 3TANA 3M8SA 2HOEA 4CJRA 1J9AA 3OYLA 3ZYYX 1VQMN 1HYZA 4H0VB 3DYAA 5LMNK 1DLOA 1HPZA 5C10A 1B9DA 5FPNA 4HUGA 2IAJA 2CGJA 3ZEUA 4DSLA 2IGIA 4A59A 1X9MA 2RN2A 4CJUA 3HO1A 2DFHA 4JI7K 3S41A 5KPRA 2KLAA 5I42A 4EZ9A 3OYEA 5KPTA 1QQNA 3NGZA 4DF8A 3SQ4A 1YJ9N 4NYNA 4PL8A 2PY5A 3HZ6A 4DQPA 3VETA 3O3HA 3OVNA 4CJSA 5JVGL 1T05A 1BG3A 3KLGA 3O9QA 1BISA 1OVQA 1LOTB 4K43A 2ATQA 3U8XA 4DQIA 3H3OB 1KVAA 4C23A 4QS9A 3P4IA 2ASMA 3TU5A 1U04A 3SAFA 2O8EA 1ATSA 3NBPA 3AO4A 4CW7B 5AFUA 3L3UA 2W6LA 3CJBA 3NMUA 2F9TA 3WXKA 5ADXA 3IAYA 3L8BA 2D4WA 3MAQA 2OPPA 4RTFD 3TTFA 4CIGA 1HQUA 3ULDA 3KWIA 1IH7A 5DM6L 5HROA 4J2EA 3CJ7A 1KSPA 4DV3K 4FJXA 4CJFA 1OVYA 1YIJN 1P90A 1UOCA 4DCHA 5HLFA 4FWKA 4CIEA 4E7HA 4Y0WA 3DXKA 3SV3A 3SK3A 4X62K 4JKFA 2P51A 4M3ZA 4I6MB 4KH6A 1LCUA 1XI1A 4BDPA 4F9OA 1K6YA 3ZSQA 1E4GT 3AVGA 2E1YA 2F7TA 2VG5A 3CC7N 2QEXN 1NM1A 1L3TA 3KTQA 4FLUA 1JCGA 5AQPA 3O9UA 1QHAA 3TAEA 3EKSA 4KHPK 4HHTA 1ZBSA 4Z4GA 5AQHA 3CCVN 4RW6A 1TVRA 4CZKA 1U4BA 4BC2A 1TAUA 1V4TA 1WAJA 1Y64A 3VPZA 4BE2A 1NGAA 4FVUA 2AP1A 1S6QA 3ZT1A 4CK3A 2OYQA 3DLGA 1QSSA 4JN4A 5AQOA 4FLWA 3O6WA 3L2RA 3GOIA 3CF5L 4L8RB 2NRHA 4CEQA 3NH2A 5HRPA 3Q7CA 3VQCA 2I7PA 1LAWA 4BE0A 1Z26A 4DV1K 3LDOA 3P83D 3K0SA 4CEZA 4CJPA 1DGKN 2HBKA 2QWOA 2PYJA 2O8CB 2HVIA 1WOQA 1HQEA 4H0YB 1XMQK 4QS8A 1SKWA 2Q31A 4E7JA 4DV2K 1YUWA 1IG9A 3DM2A 1RT5A 5AQQA 3JYTA 1E4FT 4CJTA 3WEEB 1CXUA 2P9SB 3ITHA 5JS1A 1Q8IA 3BDPA 1TUUA 3CM5A 2KHOA 4FW1A 1NBWA 3MX5A 3OBWA 3MEGA 2Z1HA 5KPZA 4JV5K 4GY2B 2E8AA 4FWPA 4FLXA 2XO7A 3G10A 5J2QA 3TABA 4BGBA 1BDGA 4CK2A 2IIRA 5HRSA 4NO7A 5DK5A 4JI6K 1JLFA 4OPAA 5KGWA 5GAGP 4DTJA 2FBTA 3LPUA 3CHWA 3M6GA 1J54A 5SWMA 1S22A 3I56N 3CCEN 5BRDA 4CEFA 3KHYA 3DLLL 5AQVA 1DTTA 4DV0K 3AA2A 3ATUA 4DLEA 4BRPA 3U3GA 1C1BA 2HBMA 4LSNA 1BL3A 3V81A 4A5AA 1GLLO 3ULEB 3DOKA 1EO1A 4CF1A 2UXBK 4FWQA 4JKGB 4O5BA 2Z1JA 4LF7K 2RF2A 3VESA 4MLEA 2P9UB 4M3WA 4JD2A 1SL0A 3NVKA 4CF8A 3T1YK 5SZTA 1GLJO 2YHXA 1RGIA 4IJAA 2IC3A 3LL3A 1QSLA 3AA5X 5KI6A 1BA1A 1R59O 4FOIA 2WONA 5EY4A 3H6EA 4FWLA 3BEXA 3ZSOA 3H45C 3M5RA 4H5RA 4KH4A 5J2NA 2G8KA 2YV0X 4CK1A 4B3OA 4WQ4A 2NRZA 5JICA 1IG8A 3QLHA 3V9ZA 3PIOL 5HP1A 4FWRA 4B9NA 3AV9A 1TV6A 2CH6A 1KTQA 1K9MO 1GOCA 4AM7A 3D2EA 1N36K 5BREA 3SLCA 1VQ5N 3SQ0A 4O55A 4MQ3A 4QS7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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