5LJVA

Mamk double helical filament
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
NRLFLGVDLGTSHTAVMSSRGKKFLLKSVVGYPKDVIGLKLLGRPYVVGDEAFEMRSYLDIRYPLQDGVLSEISDRDIEVARHLLTHVVKSAEPGPNDEICAVIGVPARASAANKALLLKMAQEVVHTALVVSEPFMVGYGLDKLINTIIVDIGAGTTDICALKGTVPGPEDQVTLTKAGNYVDERLQNAILERHPELQMNVNVACAVKEQFSFVGTPTEVASFEFRAAGKPVRADVTEPVKIACEALMPDIIESIETLLRSFQPEYQATVLQNIVFAGGGSRIRGLAAYVKEKLRPFGDANVTCVKDPTFDGCRGALRLAEELP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-like ATPase
publication title X-ray and cryo-EM structures of monomeric and filamentous actin-like protein MamK reveal changes associated with polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Magnetospirillum magneticum amb-1
molecule tags Structural protein
total genus 90
structure length 325
sequence length 325
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljvA02
4H03B 1NGGA 1MDUB 2P9UA 3ZX0A 3BF1A 1QQNA 4JD2A 5AFUA 4PKIA 5ADXA 4BRAA 3VGKA 3DXKB 4BR9A 4BGAA 1IG8A 3U4LA 3FFKB 4FWRA 5AQQA 4WQ5C 1BA0A 1YAGA 2Q1NA 3UE5A 1HPMA 4BREA 5JLFA 4BG9A 4I6MA 1GLLO 3LDPA 4FWOA 1YUWA 4Y0WA 1BG3A 4BR7A 3L0QA 5KQ8A 3LDOA 4BR2A 4XH5A 4CZKA 2QM1A 3CIPA 2P9IA 4CZHA 2QXLA 3CHWA 1Z05A 4BRMA 4BROA 5AQRA 1D4XA 4IZ9A 1P8ZA 3ZETB 4BQZA 5AQUA 4XH1A 1S3XA 4FL9A 3UKUB 3ATVA 4FWSA 1T44A 2E8AA 2V7YA 4PKGA 1RGIA 5AZIA 5BN9A 2HF4A 1NGBA 4K42A 5AQIA 5AZJB 3VESA 4CI6A 3R9PA 3ENOA 3GL1A 1BWFO 4Z94A 2FSNA 4CZFA 3QBXA 3ZX3A 5F2RA 4BRFA 2A5XA 4BRNA 3GDQA 4EIAA 5EVZA 3VF2A 4L3QA 4LC9B 5BRHA 3FZMA 3DXMB 2J4RA 4J8FA 2NLXA 3GG4A 4FOIA 3VEWA 3O08A 1NGHA 1YXQA 4FO0A 2OANA 1J6ZA 1BA1A 3H3NO 3DAWA 4CBWA 2PBDA 3VOVA 5ADXH 3CQYA 3MK6A 1CZAN 1HLUA 4EHUA 2ASPA 4ISFA 1SQKA 3CI5A 2CGJA 2P9KA 4DCHA 2Q0UA 4QS7A 3FR0A 4QS9A 3BF3A 1E4FT 3O4WA 4A61A 2UYTA 3DWLA 5I9EB 2NZTA 2BUPA 2CH5A 1GLBG 5FPDA 1GLCG 3LDNA 2A6AA 5JLHA 1Q18A 2QWNA 3ID8A 2AP1A 2QW9A 4IJNA 4ISGA 1KXPA 5EXWA 1TUYA 2IVOA 4H0OA 4H5NA 3M3ZA 5AQMA 1IJJA 2ZWHA 1OKJA 1V4SA 2DPNA 4WYBA 4BRHA 2P9KB 3CJ9A 4BR0A 4C23A 4BVOA 3WEEB 3VF6A 3DXKA 3HTVA 3H6EA 4YDUA 3AY9A 1GLJO 4M7YA 3VETA 3WUHA 4PKHA 3QFUA 3O80A 2E2QA 3LM2A 1ZC6A 2E20A 3BP8A 3IUCA 1HKBA 5JICA 3ZX2A 2QWLA 4A62A 5AQYA 2Q2RA 1S22A 4B1XB 5LJWA 3O1BA 4JNEA 3FGUA 4CBUA 3GOIA 3H3OB 4BC5A 3TPQA 2I7PA 4O8KA 3WQUA 2BTFA 3W0LA 1BO5O 4YDUC 5AQPA 2ASOA 3KZBA 3ZETA 2E88A 2Q97A 5B8HA 5E26A 3UKUA 2A42A 1LOTB 2QWPA 3VGLA 4BRIA 4BRQA 3VEOA 2PAVA 1NLVA 3FZKA 2D4WA 1EQYA 1X3NA 5AZJA 4IO8A 4H5TA 2FF6A 1T6CA 1MA9B 2ZF5O 1X3MA 2QWOA 4NB4A 2CGKA 3JXUA 2KHOA 4CZGA 1QQMA 3AAPA 4CD3A 2VCPA 2P9PB 3CJ1A 2I7NA 5AQVA 5AQZA 3DXMA 4FOEA 5BRDA 3FZLA 1U2VB 3MN6A 2YJFA 3ENHA 1QZ5A 3VENA 3M1FA 2F9TA 2E2NA 5AQWA 3B8AX 4EHTA 3SJHA 4DHYA 3I33A 4AM6A 2GELA 4K43A 4BC3A 4B9QA 1QHAA 3EL2A 1ATNA 3D2FB 5AQSA 4JHDB 4A2AA 1QQOA 1T6DA 1NGIA 3FE1A 5EOYA 4BQLA 1TUUA 2Q31A 4FWMA 3QB0A 5BPNA 3MN9A 5BRFA 2VWBA 3WXJA 4DB3A 3IFRA 2GTDA 4B1ZA 1JCEA 2P9NB 1HUXA 3LL3A 4EFHA 2ITMA 1NGFA 2HOEA 3GE1A 3KHYA 4M7XA 3UKRB 3DJCA 1HX1A 2P9SB 1HKGA 3MN7A 5AQNA 1MWKA 3WEEA 3UB5A 2D1KA 2NRHA 4HTLA 3H45C 4WQ4A 3QFPA 4KBOA 5JMVA 4IXCA 3U8XA 4PL7A 2E2PA 3CETA 3M6GA 5FPMA 1TYQB 4BR4A 3HI0A 1HKCA 2FXUA 2F9WA 3MN5A 1BDGA 5BREA 2YI1A 1KAXA 1DGKN 5BPMA 4B1WB 5ELZA 1ATRA 1WUAA 4CZEA 2D0PA 4A2BA 1ZXOA 4CJ7A 4BC2A 2E2OA 3FZHA 4XH4A 3JS6A 3WQTA 1NBWA 3EN9A 3C0BA 1NWKA 2HF3A 4JAXA 2P9LB 4H0VB 4O5FA 3WXKA 3EKUA 5AQLA 1RDWX 3HSCA 4WQ4C 4FPBA 1DEJA 5E84A 5BN8A 3MCPA 3VEYA 3VEXA 1WOQA 5AQXA 3VEZA 1U6ZA 2H3GX 3SLCA 3FZFA 1C0FA 2EWSA 1NGCA 3HM8A 3KVGA 3A8YA 3EKSA 3O6WA 4H0YB 4XEIA 3HBTA 3ZEUB 5EY4A 1JCGA 2A41A 4B1VA 3WXLA 1BU6O 1Z6RA 2E1ZA 3RSEB 4M63C 2V52B 1NGEA 4EAHD 2GUPA 5F1XA 4FWKA 4H5VA 3ATUA 2W40A 5AQHA 3D2EB 5AQJA 5KPTA 2P9PA 2ZGZA 2YHXA 1GLFO 1U2VA 3S41A 2GEMA 3BUZB 4BRPA 4H0PA 4FPAA 3O1WA 3CJCA 2WUSA 3CJ7A 3A5OC 2QWRA 2W41A 3C7NB 5AQKA 3A5NC 4RWTA 4K41A 3H1VX 5EX5A 3D2FA 3IDHA 4FWPA 2HMPA 1NGAA 3CERA 4JHDA 1SZ2A 1K8KB 3H46O 4H5WA 5CE3A 3A0IX 3LDQA 4BRGA 1R59O 3I8BA 2FSKA 1YVNA 3WXIA 3TU5A 4CZJA 3SK3A 1NMDA 3U9ZA 2FSJA 4IJAA 2P9NA 3A5MC 3A5LC 5KPRA 2IVPA 4HWIA 2QWMA 3AARA 5LJVA 2A40A 5AQFA 3VEVA 1NM1A 2Q36A 3UKRA 3CJAA 3AAQA 4DQ8A 2QWQA 2A3ZA 2P9SA 3F9MA 3O5BA 4ISEA 2AA4A 1XQSC 2P9UB 4JD2B 2YJEA 1ESVA 1MWMA 3FLCO 1GLEG 4JN4A 5AR0A 1TYQA 3WT0A 3VPZA 4CD1A 3P4IA 4FWLA 4BRKA 4I6MB 3SMSA 2CGLA 3QDKA 4H5RA 4FWQA 5AQGA 3IMXA 5BR9A 3OHRA 4E1JA 4GNIA 1ZBSA 4MO4A 3ULEA 4PL8A 5AQTA 2IIRA 2FLOA 3VERA 2P9LA 3J8AA 4F9OA 5F0XA 1V4TA 3HZ6A 5AQOA 4BRLA 4BVPA 1RFQA 2P9IB 3MMVA 5FPNA 3MDQA 2GWJA 1SAZA 4FSVA 2YHYA 1KAZA 2ASMA 2E1YA 4NO7A 1H1VA 2CH6A 4GY2B 3BEXA 3LDLA 5AZIB 4BRDA 3ZEUA 1X9JA 5AFUH 4MO5A 1GLDG 1BUPA 4H0TB 5FPEA 4B1UB 1KAYA 4QS8A 3RSEA 4AM7A 3ULEB 3VF4A 1DKGD 3D2EA 4IWVA 4BGBA 2YCHA 2D0OA 3QBWA 1GLAG 1NGDA 2FF3B 3QICA 1NGJA 4CZLA 1E4GT 4CZIA 3LM9A 4MLHA 2V51B 5LY3A 3R8EA 3D7EO 3SMPA 5KQDA 1JCFA 3CJBA 3H1QA 3W3DA 1C0GA 3EZWA 3C7NA 4BC4A 4BR5A 1XC3A 4FWNA 2ZGYA 4MLEA 3R6MA 1LCUA 3G25A 4BRCA 1K8KA 3U9DA 5BPLA 1ATSA 3L4IA 2Q0RA 3GBTA 1Y64A 1G99A 2V7ZA 2VYPA 5KPZA 4H0XB 4RTFD 4B1YB 4CBXA 3O8MA 4WQ5A 5TKYA 4BG8A 2GWKA 4RCHA 4K25A 1QZ6A 1XUPO 2IVNA 3L6QA 3VGMA 3CQXA 3EO3A 1HJOA 4CZMA 2YHWA 1BOTO 3QMLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KD5E 3ZSVA 4DR4K 4H03B 2OZSA 5CYQA 4OGCA 2P9UA 3ZX0A 3VGKA 3DXKB 3E9LA 4AHRA 4BGAA 3MWPA 4B9VA 4FWRA 1TAUA 3AO3A 3UE5A 4CF0A 3RVCA 4BREA 3EY1A 4FJ8A 3E66A 4BG9A 1GLLO 4WCEL 4X62K 4DSLA 2HMIA 3CM6A 4AF1A 3AVNA 3LDOA 4BR2A 3K5LA 1VSFA 4CZKA 3CPWM 3LZJA 4IEEA 3B6PA 2P9IA 4E89A 2WONA 3CHWA 1Z05A 4BROA 4J2AA 3K0SA 3VQCA 2BH1A 4DR3K 4YOWA 3ATVA 3O4NA 4OPKA 4FWSA 1T44A 4CJUA 2E8AA 5AZIA 3CM5A 1SV5A 1W2BM 3ZT1A 5AZJB 5C2FA 3T1YK 4Z4CA 3ENOA 2ATQA 1VQLN 2PYJA 3E9OA 1BWFO 4PA1A 3RWUA 2VG6A 3ZX3A 4BRFA 5F2RA 1WSEA 2LSNA 4YOTA 1NJXA 2P5GA 3VF2A 3OYAA 4CERA 4L3QA 1NKEA 2HBJA 1UOCA 3ZCMA 4I2PA 4RW7A 4J8FA 1WSFA 1JLQA 3VEWA 4E7HA 4DU3A 4AHUA 4FLYA 4FO0A 5HROA 2IAJA 1J6ZA 3MECA 5M1OA 3T3FA 1T05A 3DAWA 1S1WA 3O3FA 3VOVA 3MEDA 4AHSA 5ADXH 3CQYA 4YOYA 3F9KA 1CZAN 5KGXA 2QK9A 2UUAK 2ASPA 4ISFA 2P9KA 4DCHA 1JJ2M 4FZZA 3O9RA 3KLIA 2NRVA 4ZHRA 5GAHP 3FR0A 3QEPA 5C15A 1E4FT 4A61A 1CZ9A 4PHTX 3P38A 3DWLA 4JV5K 2HHHK 1GLBG 3LDNA 2KFZA 3G0ZA 4DV1K 3CXCM 2XHBA 4DFJA 1DTTA 1IKVA 4ZTJA 1IKWA 2O8DA 5M1KA 4ISGA 4WFBL 3QLHA 2VQEK 4JI5K 3ENBA 4H0OA 1IJJA 2ZWHA 1OKJA 4BRHA 1YF5L 4KKOA 3HTVA 3AY9A 5DMRA 2W6KA 1KTQA 4M7YA 3QETA 3K59A 1NMNA 2RKIA 2HSTA 2VGMA 2E2QA 4C8NA 3ZLJA 3V1OA 3ZSQA 2FBVA 2ETJA 4WF9L 2UUBK 3K9KA 3THXA 4CK3A 2Q2RA 2NUBA 4OPAA 4QAGA 3EYZA 1S22A 4AHCA 3CCEN 5GAGP 1UA0A 3O1BA 4IFYA 4FJ9A 3TPQA 1HNZK 3CD6N 4YFUA 1HNWK 3WNFA 3WQUA 4HUEA 5LMNK 2HHSA 4CFBA 2ASOA 3MXJA 1N36K 4CJ5A 5B8HA 5E26A 1LOTB 3VMFB 1WN7A 4BRQA 1RT3A 4TSXA 3FZKA 2D4WA 2ZJQL 2FBYA 2FF6A 1OH8A 4NB4A 5EU7A 2CGKA 2KHOA 4FXDA 5M1FA 1S1VA 4CZGA 1YVUA 2VG5A 2VCPA 5I42A 2Y1IA 5AQVA 1BIZA 3PO5A 3ENHA 5C2DA 3J80O 4DV2K 3SJJA 3OYFA 1TV6A 3M1FA 2F9TA 2E2NA 3R1XA 1X1PA 4IG0A 3NCIA 2GELA 3L4QA 3QEXA 2HBKA 4B9QA 2F8SA 1VRUA 1ATNA 5AQSA 3HJFA 1TAQA 3K2PA 4A2AA 4HHTA 1T6DA 1LWCA 1QSYA 1NGIA 5EOYA 4FJGA 4DTNA 4BDYA 4C1NI 3T69A 1QS4A 5C24A 4DB3A 2A1SA 2GTDA 4B1ZA 2KFNA 3LL3A 4ID5A 3GE1A 3KHYA 4KH5A 3HL8A 3O9TA 2GUIA 1SL2A 1T8EA 1HKGA 3AGKA 1HYVA 3UB5A 4WQ4A 4KBOA 5JMVA 1XNQK 1RT1A 4KHWA 5FPMA 4BR4A 2FXUA 4CW7B 1S1UA 3M8PA 1BDGA 2O8EB 2YI1A 1DGKN 2WFBA 5ELZA 1ATRA 3SQ4A 3FZHA 4W5RA 1NG9A 1NBWA 3AA2A 3TARA 3M8SA 5HRRA 4LH5A 1IKYA 1I94K 3V9XA 1KFSA 3PIOL 4JRPA 1U6ZA 2D5RA 1NK0A 3F73A 1NOZA 1EO1A 1NGCA 3A8YA 2X78A 4DQSA 2GX9A 3TAQA 4KRFA 3WXLA 1BU6O 1Z6RA 2E1ZA 1QVFM 5HBMA 5AQHA 4DF8A 5AQJA 1L5UA 2P9PA 2ZGZA 2YNHA 4DTRA 1SKRA 3BUZB 2O8CA 4BRPA 4N56A 3DOLA 2WUSA 3ITHA 4OO1J 3IAYA 2ZD1A 4JKAA 4DWIA 2JWLA 3DMJA 5DM6L 4K41A 5EX5A 1TK5A 2HMPA 4JHDA 4B8CA 4H5WA 4KTWA 3BZCA 3A0IX 3LDQA 4IFVA 1WB9A 3RMDA 4PWDA 3WXIA 3TU5A 3SK3A 4B3RK 3P31A 2XY6A 4IJAA 4IOCL 4NCAA 1VRTA 2D0AA 1HR0K 2IVPA 4HWIA 2KTQA 3RMBA 1FKOA 3UKRA 3CJAA 3AVBA 4DQ8A 3AO4A 2QWQA 1DT9A 2IDOA 4ISEA 1RDBA 2AA4A 2P9UB 4DFKA 1GLEG 4BE1A 1LWEA 3OYNA 1NU0A 3THWA 4W5NA 2RHKA 5BR9A 1CXQA 4CJFA 1S5JA 1ZBSA 4YOUA 3NVMA 2FLOA 2X74A 3VERA 3J8AA 4F9OA 2E6MA 3NMUA 3HZ6A 5AQOA 2HHUA 4CGHA 2P9IB 2HHQA 3ZSWA 1SAZA 4FSVA 1YITN 4IFEA 3VQBA 1IBKK 1KAZA 3AVLA 1H1VA 2CH6A 1D9DA 3TAEA 3ULDA 3LDLA 3AVKA 3OYKA 4B3OA 5AZIB 1OVQA 4DV4K 1X9JA 5AFUH 4Q5VA 1GLDG 4FVMA 4OGEA 4DSIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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