5LJVA

Mamk double helical filament
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
NRLFLGVDLGTSHTAVMSSRGKKFLLKSVVGYPKDVIGLKLLGRPYVVGDEAFEMRSYLDIRYPLQDGVLSEISDRDIEVARHLLTHVVKSAEPGPNDEICAVIGVPARASAANKALLLKMAQEVVHTALVVSEPFMVGYGLDKLINTIIVDIGAGTTDICALKGTVPGPEDQVTLTKAGNYVDERLQNAILERHPELQMNVNVACAVKEQFSFVGTPTEVASFEFRAAGKPVRADVTEPVKIACEALMPDIIESIETLLRSFQPEYQATVLQNIVFAGGGSRIRGLAAYVKEKLRPFGDANVTCVKDPTFDGCRGALRLAEELP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-like ATPase
publication title X-ray and cryo-EM structures of monomeric and filamentous actin-like protein MamK reveal changes associated with polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Magnetospirillum magneticum amb-1
molecule tags Structural protein
total genus 90
structure length 325
sequence length 325
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljvA02
4YDUA 3A8YA 3TU5A 4JHDA 3H1VX 3AAPA 5ELZA 1YUWA 4K43A 4CZEA 4BR5A 4A2BA 1TUYA 4IO8A 4C23A 2QWOA 1NM1A 1T6CA 3LM9A 5F2RA 2QWMA 1XUPO 3UKRB 4BG8A 1U2VA 3KZBA 3I33A 3GDQA 3VESA 3DXMB 1QZ5A 3MMVA 1WOQA 4FWOA 5BN8A 3VEXA 4WQ5A 4XH5A 4PKGA 5AQPA 4DB3A 1T44A 4PKIA 4AM7A 2YJEA 3WQUA 1NGFA 2FF3B 3QMLA 1MDUB 5BRDA 3SMPA 3DXMA 1SAZA 3VEVA 3O5BA 1GLAG 3H46O 3ULEB 1DGKN 3TPQA 2YJFA 5AQVA 1JCGA 1GLCG 4CZHA 3ENHA 3VF6A 2Q1NA 5ADXH 3UKUB 1NLVA 1WUAA 2P9NB 3ZX3A 5BREA 5BPMA 3O1BA 2A5XA 3GE1A 4BR4A 3RSEA 3VETA 3BF1A 4JD2B 4CZMA 2FSKA 3QFUA 4BC3A 3HM8A 2FLOA 2Q36A 1NGHA 3H1QA 2BTFA 4BRPA 3L4IA 2QXLA 1H1VA 3LL3A 5AQUA 4QS9A 3D2FA 4XH4A 2NRHA 1SQKA 2FSNA 4BR2A 4BRKA 3SMSA 1GLBG 3WXKA 2J4RA 4PL7A 3CQXA 1DKGD 3FZMA 1BUPA 5AQIA 3R6MA 4H0OA 1NGJA 3IDHA 5TKYA 1S22A 3I8BA 4BR0A 5AQWA 4CJ7A 5AQYA 4ISGA 1MA9B 2ZGYA 3C7NB 3LDNA 4FL9A 2E88A 2QW9A 1V4SA 2EWSA 2D0PA 3AAQA 4FWPA 4FWLA 3WUHA 3ZETB 4IJNA 2ZGZA 4H5RA 2Q31A 2GTDA 3C0BA 2BUPA 3A5MC 3FZLA 3W3DA 1E4GT 4DQ8A 1GLJO 4BG9A 3VEWA 4EHUA 3VEZA 3VEOA 3SK3A 4CD3A 4A61A 5ADXA 4ISEA 4JAXA 4XEIA 1X9JA 5KPTA 4IWVA 4H03B 3QBWA 2QWRA 4M7XA 2GWJA 5AZJA 4EAHD 4BGAA 4FWNA 2I7PA 2ASOA 3DXKA 3O08A 3HTVA 5AQOA 5FPMA 5AQKA 2E8AA 2CH6A 1KAXA 1HX1A 3HZ6A 3CJ7A 1KXPA 1GLDG 3CJ1A 4M7YA 5AZIB 3D7EO 4DHYA 4BRIA 4CZIA 3VF4A 5AR0A 5AQGA 1J6ZA 2I7NA 3W0LA 4BVPA 1LCUA 3FLCO 1LOTB 5EY4A 3H45C 2GEMA 4H0PA 4BRNA 1NGGA 5AQFA 4BRGA 3DWLA 1QQOA 1QQMA 1TYQB 3BP8A 4PL8A 2P9IB 4H0TB 1X3MA 5BN9A 3ATVA 1ATRA 3IFRA 2V7ZA 4FPBA 3QBXA 5AQNA 5JICA 3SLCA 2W40A 1HKBA 1XC3A 2FXUA 2AA4A 4BRHA 5F1XA 4CBWA 2ZWHA 3EN9A 3EL2A 4BQZA 3MK6A 4BVOA 1GLLO 3BEXA 2P9IA 4RTFD 4MLEA 3UKRA 2IVOA 3U4LA 2CH5A 1JCFA 5BPNA 3FFKB 3WXIA 5BPLA 4QS8A 3ZX0A 1HKCA 3MN7A 5BR9A 3HBTA 4BC5A 4EFHA 5EXWA 2P9SB 4GNIA 4I6MB 3QDKA 1NGBA 2YHYA 1V4TA 3AY9A 4IXCA 3VGMA 4BRAA 1X3NA 3FGUA 4FWRA 5AQRA 3O80A 4FSVA 5EX5A 4FWQA 3H3OB 2NLXA 3MN9A 3ULEA 4PKHA 4F9OA 1RDWX 3GG4A 2P9SA 2D1KA 4I6MA 4WYBA 5LJVA 4BQLA 3A5LC 3UKUA 4BR7A 2PBDA 5AQJA 1K8KB 1MWMA 2GELA 2P9NA 3DJCA 1NGDA 2Q0RA 2E2NA 3G25A 3UE5A 3D2EB 5AQTA 1ESVA 4JD2A 4FO0A 4EHTA 1U6ZA 3GOIA 4BROA 2GUPA 3U9ZA 5KPZA 3F9MA 1ATNA 5F0XA 2QWQA 3M6GA 3VENA 5E26A 4DCHA 3CQYA 4MO5A 3A5NC 3VGKA 1K8KA 1YVNA 2AP1A 3LM2A 3R9PA 2QWNA 4CZKA 1NGAA 1NWKA 4BRFA 5AQQA 3IMXA 3SJHA 5LY3A 2CGLA 3MCPA 2E2PA 1BU6O 2ZF5O 4H5WA 2GWKA 4BRCA 1QZ6A 4JN4A 2YHXA 2A6AA 4WQ4C 2A42A 3ENOA 1IG8A 3WQTA 1ATSA 4Y0WA 1KAYA 1RFQA 1S3XA 1DEJA 1YAGA 3CJAA 3C7NA 1Z6RA 4B1VA 3ZEUB 4FPAA 4RCHA 3ZETA 3H3NO 2HF4A 3BUZB 4O8KA 2QM1A 3CI5A 3U8XA 4H5VA 5AFUH 1HLUA 2V51B 3ZX2A 2KHOA 3O4WA 5B8HA 2HOEA 2HMPA 3FZKA 4AM6A 1ZXOA 3HSCA 3VPZA 5JLFA 5AQXA 1BG3A 3VGLA 5FPNA 4NO7A 5KQ8A 4B1WB 2W41A 3MN6A 4FOEA 3VOVA 4O5FA 3DAWA 4K42A 1ZBSA 3U9DA 1NGEA 2Q97A 5AQSA 1BOTO 3LDOA 1P8ZA 1BDGA 2HF3A 2YHWA 3VEYA 2H3GX 2IIRA 4BRDA 3WT0A 4HWIA 1MWKA 3BF3A 2D4WA 2E1ZA 2V7YA 3EO3A 3A5OC 5AZIA 5JMVA 4A2AA 2D0OA 1D4XA 3A0IX 4BREA 3WXLA 4H5NA 1NBWA 1E4FT 4WQ4A 3KHYA 1XQSC 3LDLA 3VF2A 4H0YB 1U2VB 3O8MA 3EKUA 1BWFO 4B1ZA 1HUXA 2E2OA 5AQHA 4RWTA 1YXQA 1TYQA 4BRMA 4MLHA 5KPRA 1HJOA 2IVNA 4CI6A 1BA0A 3R8EA 5EVZA 3QFPA 5AFUA 3GBTA 4B1UB 1BA1A 1EQYA 4NB4A 1GLFO 1QHAA 2PAVA 4M63C 1Z05A 2P9KB 4MO4A 5JLHA 3IUCA 3B8AX 1NGCA 3M1FA 4H5TA 4B9QA 4QS7A 5AQMA 3QB0A 4A62A 3GL1A 4K41A 5BRFA 2VCPA 3RSEB 2A3ZA 2Q2RA 2P9KA 1TUUA 1C0GA 1BO5O 2OANA 4H0VB 4BC4A 3S41A 4IJAA 5EOYA 3AARA 3JXUA 3OHRA 4B1XB 3D2FB 2P9PB 3CJ9A 3M3ZA 2DPNA 2ASMA 4ISFA 2UYTA 3WEEB 3L0QA 3LDQA 1OKJA 2WUSA 1Y64A 3D2EA 1Q18A 1JCEA 4E1JA 4IZ9A 3WXJA 2P9PA 5AQZA 2QWLA 4FWMA 2E1YA 2ASPA 3H6EA 3WEEA 4BGBA 1KAZA 3EZWA 4JNEA 5CE3A 2F9TA 5FPDA 2A41A 2CGJA 2IVPA 4BC2A 4BR9A 4CBXA 5LJWA 5BRHA 1T6DA 3FE1A 4YDUC 3FZHA 3KVGA 3HI0A 4CZLA 2A40A 3CIPA 3MN5A 1RGIA 4L3QA 2VWBA 4CZFA 3O1WA 2NZTA 1R59O 4CBUA 4K25A 2P9UB 2E2QA 3FZFA 3VERA 2P9LB 4HTLA 4LC9B 1QQNA 3ID8A 4CD1A 1CZAN 2VYPA 4KBOA 2YCHA 2YI1A 4WQ5C 3ZEUA 3UB5A 1GLEG 5AZJB 4H0XB 2E20A 5FPEA 1HKGA 2CGKA 3P4IA 3LDPA 4B1YB 4Z94A 5AQLA 3DXKB 1NMDA 2Q0UA 3FR0A 2ITMA 2P9UA 2V52B 2P9LA 2FF6A 2QWPA 3CETA 3O6WA 5I9EB 1G99A 4FWKA 1ZC6A 4CZGA 3CERA 1SZ2A 4FWSA 1C0FA 3EKSA 1NGIA 4GY2B 1HPMA 4BRQA 2F9WA 4EIAA 3JS6A 4JHDB 5KQDA 2FSJA 3J8AA 4BRLA 3CHWA 3CJCA 1IJJA 3ATUA 3CJBA 3MDQA 5E84A 3L6QA 3QICA 4J8FA 4FOIA 4XH1A 4CZJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4E89A 5HP1A 1QVFM 2YNHA 3NGIA 1NKEA 4A2BA 4IO8A 3AVGA 3CC7N 1WN7A 2QWMA 4FLYA 5C15A 3E66A 3VESA 1KD1O 3TTFA 3B6PA 4PWDA 1QZ5A 4IG0A 4LFBK 1TK8A 3TAMA 1VAZA 1WSHA 4Y1CA 2UXBK 3VTIA 4M3YA 2YJEA 1NGFA 1TK0A 4CK3A 3THYA 1MDUB 5BRDA 3SMPA 3OYDA 3V9UA 1SAZA 3VEVA 3ZLJA 4HCBA 2YKNA 4F3OA 3VF6A 1SKRA 4E1NA 1WUAA 4B3SK 5C42A 5IWAK 3IAYA 3RSEA 3T1HK 2OCEA 2Y1JA 4BC3A 2FLOA 1NGHA 4C8NA 1VSEA 3PUFA 4FZXC 3LZJA 4W5RA 2QXLA 1H1VA 1BQMA 3LL3A 3D2FA 3AVNA 1SQKA 3N4PA 4JYAK 4BR2A 4IOXA 1U45A 3WXKA 4JI0K 2X78A 4CF1A 4DQRA 3FZMA 1SUQA 4JK7A 5J2NA 5TKYA 3E01A 1S22A 5AQWA 5KGWA 3ZT0A 2OTLN 2O8FB 1A5XA 3C7NB 5C12A 5GAEP 2OPRA 2EWSA 4FWLA 3ZETB 3WUHA 4DU4A 4FK4A 2O8CB 2ZGZA 1WSIA 1RDBA 2GTDA 3O9QA 3MXJA 2RKIA 2BUPA 3FZLA 3W3DA 4DQ8A 1KC8O 1Q81O 3VEWA 4EHUA 1S1UA 3SK3A 5JVHL 4JAXA 2VGMA 4KB0A 3V9WA 1X1PA 1I3AA 4IWVA 3HRGA 3QBWA 2QWRA 3O4NA 4W5NA 1TVRA 4EAHD 3P83D 4DTNA 2PY5A 4BGAA 3PIPL 4JI4K 2ASOA 5AQOA 4CJKA 3SUNA 1OVQA 2GV9A 3ZSRA 2E8AA 3P31A 1HYSA 3VQCA 3HO1A 3CJ7A 4JI6K 4WF9L 3CJ1A 4M7YA 3D7EO 1VQ7N 4CJ5A 4CZIA 3J7ZO 1NJXA 2BANA 4B9TA 5AQGA 1J6ZA 2I7NA 4BVPA 3K2PA 3V1OA 5EY4A 3H45C 4KREA 3SPYA 4L8RB 1MU2A 1WNSA 3CXCM 4X62K 4HUEA 3U3GA 4H0TB 5KI6A 3DM2A 3QBXA 2G8VA 5JICA 2W40A 3LAKA 2G8FA 1IKVA 1EKEA 3SZ2A 3J81O 1KTQA 4JK8A 2AA4A 3BZCA 5M1FA 3PO5A 3SNNA 4Z4EA 4CJSA 2E6LA 3J7YP 3OYIA 4DU1A 4MLEA 3O4QA 3LDSA 4CGGA 5M1KA 1QQCA 3FFKB 5BPLA 4QS8A 3ZX0A 3F73A 3VQ8A 3QETA 3MN7A 5BR9A 3HSTB 1VQ6N 4KHSA 3QDKA 4BWJA 3D45A 2YHYA 5DMRA 1V4TA 3VGMA 1QHTA 1BISA 4FWRA 5AQRA 1BIZA 4CFDA 2XRIA 1W2BM 3MN9A 4JI2K 3BDPA 4KAZA 1RDWX 3KLIA 1X9MA 3C94A 3HPGA 2P9NA 3DJCA 2Q0RA 4EHTA 3K59A 1XMQK 3U9ZA 3F9MA 4OKJA 3OBWA 3M6GA 4DCHA 4OVLA 1K8KA 3VGKA 3EE9A 3LM2A 2AP1A 2QWNA 3I0SA 5T7BA 3E9PA 3QNOA 1YJWN 3MXIA 2CGLA 3MCPA 3VQBA 2F4VK 1QZ6A 1S5JA 1TKDA 1L3TA 4JKFA 3ZT3A 4YFUA 2YKMA 4KB1A 1Z26A 3ASMA 2O8DB 4YORA 2VGNA 3ZEUB 5KGXA 2HF4A 4H5VA 2JGUA 4KH4A 1HLUA 2V51B 4FM0A 1RT2A 4B3MK 3O4WA 5B8HA 3FZKA 1NK9A 2HNDA 2YV0X 4BDYA 4M3RA 5AQXA 3OS1A 4H4MA 3VGLA 5FPNA 3MEGA 2W41A 1JXEA 3LALA 1GOCA 4O5FA 3DAWA 4W5QA 1CZBA 3OYFA 2W6LA 2KFNA 1BDGA 2YHWA 1L5UA 3CG7A 2H3GX 1RDDA 4BRDA 3WT0A 2D4WA 1HR0K 4N47A 3OS2A 3A5OC 3LP0A 1S1VA 2D0OA 3WXLA 4H5NA 1NBWA 3D0PA 4A59A 3TI0A 4LD0A 4CEOA 1RCHA 1XQSC 3F9KA 4CHZA 5CY4A 1U2VB 3SQ2A 1BWFO 1CZ9A 1FW6A 3L2RA 1TYQA 3LAMA 1N6QA 1VQKN 2B5JA 3EEQA 3NDKA 4FJ5A 3CPEA 4KHYA 2IVNA 4CI6A 5I42A 3R8EA 2WONA 3QFPA 3CCVN 4HVJA 1GLFO 4CGIA 4JKCA 5CZ2A 4M41A 1VQPN 4YNQA 1Z05A 4HTUA 2BGGA 1HRHA 5JLHA 3B8AX 1TGOA 1S9EA 1HNVA 1XWLA 2WTUA 4QS7A 3LWMA 4B9UA 4LSNA 5J2MA 4BWMA 3GL1A 2D5RA 3RMCA 4G9ZA 5BRFA 3O9RA 3LWLA 2IGIA 2OYQA 4DV7K 3PX4A 3SUQA 3CCQN 2PYJA 4BC4A 2AJQA 3OYBA 1QSYA 3QEVA 3KLFA 2HHQA 3RMDA 3PV8A 1S72N 2WC9A 1N33K 3M8QA 2G8UA 2ASMA 4ISFA 2UYTA 3WEEB 2RE2A 2WUSA 3D2EA 3OS0A 1KQSM 3IRXA 3TAEA 1OH5A 4DTRA 2P9PA 5AQZA 3SCXA 1KLMA 2E1YA 3PSIA 4DV5K 2O8EA 4NCAA 4JNEA 1T8EA 2KZMA 2O4GA 2IVPA 1HJRA 4CBXA 4OJRA 3AV9A 4JLHA 4FLZA 3FZHA 1OH7A 5FROA 4CK2A 2NRXA 3HI0A 1JL1A 4DG1A 2A40A 4DR6K 1HNIA 1N36K 2HW3A 1EETA 4CZFA 3TR8A 2P1JA 1R59O 3SQ1A 2P9UB 2P9LB 3THXA 3OYLA 3K0SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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