5LJVA

Mamk double helical filament
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
NRLFLGVDLGTSHTAVMSSRGKKFLLKSVVGYPKDVIGLKLLGRPYVVGDEAFEMRSYLDIRYPLQDGVLSEISDRDIEVARHLLTHVVKSAEPGPNDEICAVIGVPARASAANKALLLKMAQEVVHTALVVSEPFMVGYGLDKLINTIIVDIGAGTTDICALKGTVPGPEDQVTLTKAGNYVDERLQNAILERHPELQMNVNVACAVKEQFSFVGTPTEVASFEFRAAGKPVRADVTEPVKIACEALMPDIIESIETLLRSFQPEYQATVLQNIVFAGGGSRIRGLAAYVKEKLRPFGDANVTCVKDPTFDGCRGALRLAEELP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title X-ray and cryo-EM structures of monomeric and filamentous actin-like protein MamK reveal changes associated with polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Magnetospirillum magneticum amb-1
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-like ATPase
total genus 90
structure length 325
sequence length 325
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljvA02
5BN9A 5JLFA 3QB0A 2ZF5O 3FLCO 5LJVA 3HZ6A 4H0YB 1YUWA 4CBXA 2AA4A 4PKHA 4PKGA 3WXIA 4B1YB 5AQPA 4FL9A 2F9WA 3BF3A 2YI1A 3H6EA 3FZMA 5CE3A 1MWMA 5AQJA 3SJHA 4BGAA 3MCPA 3GDQA 4H0XB 3EKSA 2FSJA 5F1XA 2YJFA 1QQMA 2DPNA 2I7PA 4IWVA 3TU5A 5KPRA 3D2FB 4BREA 3WXLA 3IUCA 2HOEA 3IMXA 4MLEA 4XH1A 4B9QA 5AFUH 4AM7A 3SLCA 2P9NB 3UE5A 2ZGYA 4BR5A 3GOIA 3U4LA 5AZIA 3JXUA 3LDLA 1ZBSA 3GG4A 3MDQA 2QWLA 1K8KA 3P4IA 2W41A 3BP8A 2P9LB 4H0OA 1Z05A 1GLEG 3ULEA 1HX1A 2Q0RA 2GEMA 2YHXA 3C7NA 3MN7A 1DKGD 4IO8A 4BRKA 3ZEUA 1QQNA 4BRPA 4GNIA 4JD2A 2F9TA 2ZWHA 3IFRA 3VEWA 3VENA 1JCFA 3ID8A 3LDPA 4FWOA 1HLUA 2NRHA 2E2QA 1SAZA 5AZJB 4GY2B 3KHYA 3A5MC 1IG8A 5TKYA 4H5RA 2Q36A 2FXUA 5ELZA 4FO0A 3VETA 1BG3A 3C0BA 1GLJO 3O8MA 3ATVA 3GE1A 2FSNA 4CBWA 3FE1A 4F9OA 1QHAA 1BA0A 3L4IA 3ZX0A 3WXKA 2NLXA 4K42A 1C0GA 4ISFA 2I7NA 2FF3B 2PAVA 2QWPA 5E84A 2YHYA 4H0VB 4M7XA 1HJOA 4RCHA 5LJWA 4I6MA 4BRFA 5AQIA 3W3DA 4EIAA 1TYQA 4PL7A 1NGGA 1NGDA 4B1ZA 2IVOA 4CZMA 1BU6O 5FPMA 3UKUB 1X3MA 4CZEA 2D4WA 1NGFA 1Z6RA 2E2NA 3H1QA 3J8AA 3LDOA 3VEVA 3ZX2A 5AZIB 1BOTO 2QWQA 4JNEA 4IXCA 1E4FT 3M3ZA 4NB4A 2QWNA 4JHDA 2Q0UA 3CERA 1QZ5A 5BN8A 4KBOA 5AQZA 4FWLA 3VGMA 3O5BA 1QQOA 4BG9A 3CJ9A 2OANA 5EXWA 3VF6A 4BR2A 5AQKA 2EWSA 2FF6A 2Q97A 4B1VA 3HBTA 3M1FA 4BRMA 4BR7A 1WUAA 1NM1A 2P9KA 3SK3A 3QDKA 3GBTA 4AM6A 5EOYA 1WOQA 5AQOA 4EHUA 3CIPA 4CZHA 3O80A 1TUUA 3HSCA 5FPNA 3UB5A 2E20A 3FZHA 5AQMA 3ENHA 5BR9A 5EX5A 3H3NO 5JLHA 4BG8A 1NGEA 3CJBA 3VF2A 5BPLA 1GLFO 3HI0A 1Y64A 3A8YA 2D0PA 5LY3A 4QS8A 3UKRA 2HF3A 5B8HA 3MK6A 3BEXA 1V4SA 2D0OA 3VESA 1G99A 5AQGA 5AQYA 1LCUA 1T44A 3ATUA 3WUHA 2IIRA 4MO5A 5BPNA 4EFHA 4B1UB 4K43A 5F2RA 2E2OA 3RSEB 4DHYA 4I6MB 3FZLA 3S41A 3W0LA 4ISGA 1NLVA 4YDUA 4DQ8A 1TYQB 3MMVA 3CJ7A 3H45C 4WQ5C 4XH4A 3JS6A 3FFKB 1XUPO 3L0QA 3ZEUB 3QFPA 4BR4A 4HTLA 4B1WB 2W40A 2GELA 4O5FA 3FZKA 2QWOA 4L3QA 4A61A 4DCHA 2A6AA 3CHWA 5AQRA 1C0FA 2P9LA 4E1JA 2P9UB 3VEYA 3LDQA 5AQXA 3OHRA 1RFQA 4RTFD 3U9ZA 2P9UA 2WUSA 2YCHA 4CZFA 3IDHA 2AP1A 4BRLA 2HMPA 3EL2A 4BC4A 1GLLO 1NGJA 4FPAA 1H1VA 4A2AA 4H03B 4WQ4C 5BRHA 1NGAA 3VGKA 2QWRA 5EY4A 4ISEA 4BR0A 2CGLA 4K41A 4BROA 5I9EB 4XEIA 2HF4A 4K25A 4M7YA 1S22A 5E26A 3VEZA 2D1KA 3MN9A 4JD2B 1IJJA 5AQNA 2GUPA 3CJCA 4PL8A 3DXKB 1LOTB 3C7NB 4IJNA 2GWJA 3CETA 3WQTA 2BTFA 3O6WA 3EKUA 2P9PA 2BUPA 3L6QA 3WEEA 1U6ZA 1GLDG 4BRHA 1ZC6A 5JMVA 5KQDA 5BPMA 1K8KB 1NWKA 4J8FA 4BQLA 3HTVA 1NGHA 2QXLA 2P9NA 3HM8A 3LM2A 4O8KA 3ZETA 4NO7A 4CZIA 5JICA 3A5NC 3DWLA 1XC3A 3SMSA 4BC2A 4BRDA 4BGBA 3DAWA 4M63C 1NGCA 1EQYA 3A5OC 4XH5A 3KZBA 3SMPA 2A41A 2CH6A 5FPDA 4BRAA 5AQSA 1S3XA 4WYBA 2E88A 4MLHA 2VYPA 3ULEB 3H46O 4BRQA 2ASOA 3QBXA 4CD3A 1SZ2A 5BREA 2FSKA 5ADXH 1MWKA 1HPMA 4RWTA 2NZTA 3EO3A 1HUXA 4BC5A 3MN6A 1MDUB 1NMDA 3O1WA 4CZJA 5AQWA 4HWIA 3DJCA 2VCPA 5AQUA 4BRNA 2KHOA 1YXQA 1GLCG 1HKGA 3QMLA 2J4RA 1V4TA 5AQFA 4FOEA 1RGIA 1NGBA 5EVZA 4JAXA 4FOIA 2IVNA 2Q31A 3CI5A 3TPQA 1GLBG 2V7YA 5AQVA 3UKUA 2CGKA 1HKBA 4QS9A 2GTDA 1TUYA 1XQSC 1P8ZA 3VF4A 3H1VX 3M6GA 4BR9A 3AY9A 2P9SB 5F0XA 1DGKN 4FWNA 3WQUA 4A62A 1NGIA 2E1ZA 4FWKA 5FPEA 2P9IA 1YVNA 5AQHA 2H3GX 4CZGA 4QS7A 2GWKA 1U2VB 1ATNA 4H5NA 2YJEA 3U8XA 4BVOA 4FPBA 4CD1A 5KQ8A 1BA1A 1BWFO 5AR0A 2E1YA 1BO5O 4Z94A 4H5WA 3D2EA 3EN9A 3ENOA 3VEOA 1T6DA 2A40A 4BVPA 5AFUA 3F9MA 5AQLA 3A0IX 2A3ZA 4BRCA 4JHDB 4CZLA 3A5LC 4PKIA 2ZGZA 5AQQA 1JCGA 4EAHD 3G25A 1SQKA 2YHWA 3QFUA 3CJ1A 5AQTA 4JN4A 3WXJA 1E4GT 3FGUA 3O08A 3ZX3A 5AZJA 3MN5A 1J6ZA 1ESVA 3WEEB 1YAGA 2Q1NA 3B8AX 2P9PB 4MO4A 2QM1A 3LM9A 1JCEA 2A42A 2CH5A 3VGLA 4CI6A 4BRGA 4BC3A 1CZAN 2E2PA 5KPZA 3DXKA 3D2EB 2QWMA 2PBDA 1D4XA 2ASPA 4CBUA 1KAZA 1BDGA 2IVPA 4H5VA 1ATRA 3LL3A 2Q2RA 3WT0A 3KVGA 2UYTA 3BUZB 3RSEA 3VPZA 2ASMA 4FWQA 1X9JA 2ITMA 3O1BA 4FWSA 3QICA 5KPTA 5BRFA 1OKJA 4B1XB 3D7EO 3AAPA 4H0PA 1HKCA 1R59O 3CJAA 3VEXA 2CGJA 1DEJA 3R9PA 3VERA 2V51B 3I8BA 4EHTA 4FSVA 4FWPA 3UKRB 4BRIA 2E8AA 1ZXOA 3CQXA 1KAYA 3O4WA 4YDUC 4LC9B 4Y0WA 3LDNA 2V52B 4CJ7A 4FWRA 3FZFA 2P9IB 5ADXA 3EZWA 5BRDA 3CQYA 3QBWA 1X3NA 1GLAG 2P9SA 3AAQA 3R6MA 2VWBA 1NBWA 2P9KB 1U2VA 1ATSA 2A5XA 4BQZA 4H5TA 2FLOA 3AARA 4CZKA 1KXPA 3H3OB 3DXMA 1BUPA 1KAXA 2QW9A 2V7ZA 4WQ5A 3VOVA 4FWMA 3BF1A 4DB3A 4IJAA 3D2FA 1RDWX 4C23A 3I33A 4IZ9A 1T6CA 4WQ4A 1MA9B 1QZ6A 3FR0A 4A2BA 3ZETB 4H0TB 1Q18A 3U9DA 3R8EA 3GL1A 3DXMB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BN9A 3E9PA 3RMAA 1NJWA 4RW4A 2ZF5O 1BIZA 3FLCO 3A2FA 5LJVA 1RBTA 2HHUA 2E6LA 3J7AP 3M8QA 3I8DA 1SV5A 1YUWA 2GV9A 3ZSXA 1SL0A 3LALA 4DV3K 2NRWA 3H6EA 4CJLA 4JLHA 1MWMA 5C25A 4ILHA 1S9EA 4BGAA 2E6MA 3MCPA 2FC0A 3GDQA 1S6PA 1D9FA 5F1XA 4F2RA 1GOCA 3LP3A 3D2FB 1XI1A 2RHKA 5T7BA 4DR1K 4O4GA 3OYBA 4XH1A 3CCEN 2ZJRL 5AFUH 4W5TA 3SLCA 4C8KA 2PY5A 4RG8A 1VQNN 5CR4A 3U4LA 4BR5A 4IOXA 4CJ4A 3LDLA 2QWLA 1ZBIA 5C10A 1TAQA 3QEWA 2A1SA 4CVNE 1HX1A 3OY9A 5MLCQ 3L4QA 1WSFA 4IO8A 4UY8O 3NH1A 2GX9A 2F9TA 3VENA 1EWQA 3RTVA 3RRHA 4OPAA 1NK0A 3S9HA 4DTNA 4LFCK 3G4SN 4H5RA 2Q36A 3NGYA 1OH8A 3THYA 2JWLA 3ENBA 1T03A 3VETA 4W5NA 1GLJO 1UAXA 3H08A 4O5BA 4CK1A 4JK7A 1N5YA 2D0BA 1W97L 3QEIA 3ZLJA 1LWEA 3ZX0A 2NLXA 4K42A 3THXA 4ISFA 2R7YA 2PAVA 3SQ2A 2BANA 2YHYA 3CQ8A 2DTUA 4DSFA 4I6MA 3B6PA 5AQIA 1HYZA 1JLFA 3O9UA 5J1EA 2OA8A 4CHYA 4PL7A 1NKBA 1NGDA 4B1ZA 1BU6O 4A5AA 3UKUB 1Q82O 1X3MA 4CZEA 1C0UA 4HCBA 1WLJA 1BOTO 3KK1A 1E4FT 3AVJA 4NB4A 1QZ5A 4JI3K 5JVHL 1N34K 2IDOA 5AQZA 3VGMA 1LV5A 3O5BA 3ID6A 4WFBL 4DLGA 4IKFA 1SKRA 3CJ9A 3VF6A 1GOAA 3O4NA 4FJKA 1E3MA 2FF6A 5DM6L 3HBTA 2VG5A 3SPYA 4ID5A 3NDKA 2P9KA 4RW8A 3SK3A 4LF9K 3VQCA 1XWLA 1VRUA 4AHRA 1XHXA 2JLEA 5EOYA 5I42A 3CIPA 3L3UA 1XNQK 2O8DA 4CJVA 1Z26A 1ZBHA 4R5PA 1TUUA 5FPNA 4LF8K 3FZHA 2HW3A 3DM2A 3AVIA 3CJBA 3VF2A 3O9SA 4KAZA 1RTDA 4Z4CA 4QS8A 4YFUA 4KHPK 5B8HA 3U6FA 2YNFA 2UU9K 2O8CB 3DLEA 1LCUA 4NLCA 4CEBA 2P5GA 2IIRA 4DHYA 4PHTX 4YY3K 1VQON 3W0LA 4JYAK 4ISGA 1NLVA 4CGGA 5GADP 1EKEA 3CJ7A 4WQ5C 2QKKA 4DLEA 3IS9A 4BR4A 4FM1A 2RPIA 4HTLA 3TWHA 4EZ6A 2W40A 4O5FA 4DR7K 3FZKA 1VSIA 5H1SQ 1NK5A 3CHWA 2F96A 4YNQA 3IKMA 5AQRA 2VG6A 3VEYA 3LDQA 1DTTA 4RTFD 2X74A 4CEZA 3THWB 2WUSA 5HP1A 1K8AO 3QNOA 5LL6Z 2AP1A 1NGJA 4FPAA 1H1VA 4A2AA 1NGAA 4NCAA 4GKJK 4BR0A 3MX2A 3SI6A 3Q7CA 4CW7B 1SKWA 1BIUA 4H4OA 4CF1A 2HF4A 4M7YA 2O8FA 4FJNA 2D1KA 2GUPA 4Z4GA 1LAVA 1CLQA 1YJ9N 1ITGA 3RWUA 3WQTA 1KTQA 3OYHA 1C1BA 3OS1A 2I5JA 2WBNA 1U6ZA 4BRHA 3OYAA 5JMVA 1T8EA 1K8KB 4OGCA 3AA5X 3SV3A 2P9NA 1D8YA 3BZKA 3SMSA 4YOYA 4WCEL 4GV6A 3CCMN 3KZBA 2CH6A 5FPDA 5KGWA 4FJ9A 4FLVA 3IRXA 2FBXA 4CHOA 4MLHA 4N56A 2VYPA 3H46O 1RILA 1B9DA 4FW1A 2ASOA 4DR3K 2IC3A 1SZ2A 3SPZA 4YOWA 1Q7YO 3PX0A 4FK4A 1N6QA 4DTUA 1TK5A 2UUCK 4CJPA 1NMDA 2QA4N 4M41A 4FLUA 5AQUA 4BRNA 1KFSA 1JLCA 1HKGA 4OLAA 2F7TA 4B8CA 5KTQA 3QETA 2VGMA 4KKOA 1VSMA 3SAFA 4DV5K 1VAZA 1NJXA 2V7YA 1TL1A 3PLAA 2D5RA 3E66A 3J7YP 1HKBA 3O9TA 4QS9A 5HRSA 1O13A 4V19S 1F21A 1HNVA 1LWFA 2PYLA 4JI6K 4AHCA 3CCRN 2VQFK 2P9SB 2XY8A 1DGKN 1FXXA 4FK0A 4FWKA 4FJHA 3HP6A 1OVYA 2H3GX 4KH5A 4H5NA 2YJEA 5CY4A 3DXMB 1BWFO 5AR0A 1HQEA 1VK0A 4FJ7A 3FFIA 5DM7L 3F9MA 4FLXA 4JHDB 4CZLA 3K9JA 3NFAA 3HPHA 1JCGA 4EAHD 1SQKA 3QFUA 4WE1A 5LMUK 4JN4A 3V1OA 4M3RA 3L8BA 3EE8A 3FGUA 2HBLA 1ESVA 3WEEB 3DLGA 4MO4A 4ELUA 4CECA 2A42A 4MFBA 1LW0A 1VSFA 3VGLA 4BRGA 5M1OA 2E2PA 4J2BA 3D2EB 4E19A 2RE2A 1VQMN 1D4XA 2ASPA 2ZJQL 4CBUA 4K0KK 2O8FB 1BDGA 3TAEA 3M5RA 1ATRA 2GUIA 1Q9YA 3TAMA 3K5LA 2Q2RA 1RDCA 3KVGA 3JAMO 1JL2A 4QCLA 1VQ5N 3RSEA 3DLBA 3VPZA 2ASMA 1X9JA 4HVJA 2ITMA 3QICA 5KPTA 3RR8A 5BRFA 3LZJA 4H0PA 1R59O 5GINA 3HPOA 4B9SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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