2HF4A

Crystal structure of monomeric actin in its atp-bound state
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
374
structure length
364
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Crystal Structures of Expressed Non-polymerizable Monomeric Actin in the ADP and ATP States.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein
total genus 123
structure length 364
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf4A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2hf4A03
3VGMA 2E2QA 2VWBA 4M63C 1RGIA 3U9ZA 1LCUA 4FWRA 4FWKA 4H0TB 4CZHA 3FZFA 4MLEA 2FXUA 3GOIA 4Y0WA 3FZMA 1H1VA 3H3OB 4GNIA 4H0YB 4XH4A 3RSEA 4O5FA 3BF1A 3WXJA 1XUPO 1ZXOA 1JCGA 2AP1A 3VPZA 5AQMA 1HX1A 1P8ZA 1MA9B 1YVNA 2NRHA 4YDUC 4FWNA 4DHYA 5AR0A 3HBTA 2YCHA 3KZBA 1BA1A 2WUSA 3FLCO 3ZEUA 4BC5A 4H03B 3C7NA 4BREA 4B1UB 4JHDB 4BRQA 4IJAA 3ATUA 4XH5A 5BN8A 4BR4A 3G25A 4ISEA 4M7YA 4BRGA 1NBWA 2ZWHA 4FWPA 3WUHA 2NLXA 1GLCG 5FPEA 2F9WA 3L6QA 3MN7A 2QXLA 4CZGA 3IMXA 4BR2A 3D7EO 5BPLA 3WXKA 5AQYA 2P9UA 4PL8A 1KAZA 2D1KA 2W41A 1XC3A 4IJNA 3MCPA 2CGJA 3CQXA 5AQKA 3GBTA 3CJ7A 1HJOA 3EL2A 4L3QA 4QS9A 3H1VX 4BRPA 2ZGYA 4BR5A 3ENHA 2GEMA 4CJ7A 5I9EB 1QQMA 5E26A 3LDLA 5F1XA 2FF3B 1J6ZA 3BP8A 1SAZA 3LDNA 3O5BA 5BRFA 5AQHA 3TPQA 2QWLA 2ASMA 2FSKA 5AQLA 3DWLA 2CGLA 4FSVA 4IWVA 1HUXA 4JHDA 1BOTO 1GLBG 2I7PA 2FLOA 3C0BA 4KBOA 1ATRA 2J4RA 3R6MA 4EAHD 4B1WB 4FWLA 4H5RA 5CE3A 2QWQA 1C0GA 2GELA 3GL1A 2ZGZA 2YHXA 3MMVA 4BRMA 2Q36A 2P9LB 2BTFA 2P9IB 1ATSA 2V7ZA 4NB4A 4J8FA 3RSEB 1BUPA 1QZ6A 3OHRA 3U9DA 3VESA 3QB0A 5AZJB 1NGCA 3O80A 5AQGA 2GUPA 4EHTA 3U4LA 5AQNA 1GLLO 3FE1A 4IXCA 3FFKB 3GE1A 2Q0UA 3ENOA 2GWKA 5LY3A 4GY2B 1IG8A 3QMLA 3UB5A 1BDGA 4CBXA 3EZWA 2VYPA 3FZKA 4FL9A 1WOQA 2FF6A 1GLAG 3O08A 4BR0A 3A5MC 3M1FA 1KAXA 1XQSC 1ESVA 4CBUA 4XEIA 5BPMA 4ISGA 3VF2A 3A0IX 4WQ5C 4AM7A 1S22A 3D2FB 3F9MA 5EVZA 3SMSA 4FOIA 5BRDA 2YHYA 4BRHA 3MDQA 4BRIA 5JMVA 1E4GT 1TYQB 3BEXA 3AAPA 4O8KA 1GLEG 4FPAA 3CI5A 4WQ4C 5BRHA 4B1YB 1C0FA 2P9LA 3UKUB 2P9IA 2DPNA 1QZ5A 4BQZA 4JN4A 3VEOA 3D2EB 5AZJA 3WQTA 5BN9A 4MO4A 5FPMA 3VEWA 1JCEA 5AQRA 4JNEA 2A3ZA 2AA4A 5KPZA 5FPNA 1E4FT 3H3NO 3CIPA 3MK6A 4B9QA 1YUWA 4FO0A 3VEZA 1V4TA 5AQWA 4BC4A 5ADXA 2HMPA 2OANA 4FWMA 1GLFO 4DB3A 3AAQA 4MLHA 2E2OA 1NGBA 3SK3A 3LDPA 4BVOA 1BO5O 3D2FA 1Q18A 4EFHA 5KPRA 3LL3A 2YI1A 3QICA 4FWSA 1NLVA 4H0PA 5AQFA 1TYQA 2E88A 3WQUA 2PAVA 1TUYA 3DAWA 5AFUA 5KQDA 4HWIA 4CZFA 3HSCA 3UKUA 4K43A 2V51B 3FR0A 3VEXA 2E20A 1LOTB 5BPNA 3D2EA 3TU5A 1D4XA 2P9NB 4CZIA 3VOVA 4I6MA 4CZJA 3WXIA 3DXMB 2E1YA 4H0OA 3VGLA 5AQSA 4C23A 1HKCA 2HF3A 1WUAA 3W0LA 4BVPA 4DCHA 2Q31A 2YHWA 2ZF5O 3A5LC 5EX5A 1R59O 4YDUA 3CJAA 3SMPA 2QWPA 1T6CA 2IVNA 3VGKA 3BUZB 3EKSA 4B1ZA 4XH1A 3UE5A 3JXUA 3EO3A 4MO5A 2QWNA 3VEYA 1QQNA 4E1JA 5AQXA 2A5XA 2H3GX 3ZX0A 2HOEA 3QDKA 3ZETB 2CH6A 5B8HA 3M6GA 1ATNA 3UKRB 3O1WA 2F9TA 5JICA 4RWTA 1TUUA 2P9SB 3MN5A 1NWKA 1U2VA 2Q0RA 4M7XA 1RFQA 2HF4A 4DQ8A 2E1ZA 2Q97A 4BGBA 3FZHA 5EOYA 2P9NA 3VEVA 2E2PA 2W40A 4CBWA 4Z94A 2P9PB 2CH5A 1NGHA 4PKGA 1OKJA 3GG4A 4FPBA 3DXMA 3CJCA 2ASPA 1NMDA 3QBWA 4H0VB 1NGFA 1NGAA 3B8AX 4CD3A 3R8EA 3P4IA 3DXKB 3M3ZA 3S41A 4BRDA 4BG8A 1KXPA 4RTFD 2IVPA 1K8KB 1G99A 2I7NA 2CGKA 3VF6A 5AQTA 1Y64A 4CD1A 3KVGA 3CQYA 1X3MA 4F9OA 2YJFA 1HLUA 4PL7A 2VCPA 5F2RA 1YXQA 4CI6A 3GDQA 1U6ZA 4I6MB 3ZETA 4BGAA 2IVOA 4CZLA 2FSNA 2D0OA 4JAXA 1T6DA 5ELZA 3UKRA 5JLHA 1MDUB 3QBXA 2P9SA 2ITMA 1GLDG 2P9KB 1IJJA 1GLJO 1HPMA 2YJEA 5AFUH 3CERA 3WEEB 4FWQA 4QS7A 3CETA 3JS6A 4H5WA 2P9PA 2QWOA 3I8BA 4K25A 3ULEB 1NM1A 3WT0A 3CHWA 5AQZA 3VETA 3QFUA 5JLFA 3H1QA 1MWKA 1QHAA 2A6AA 2QW9A 3EKUA 3ID8A 3O4WA 4FWOA 4BR7A 2NZTA 5LJWA 3J8AA 4EHUA 4A2AA 3H45C 3FZLA 5AZIB 4LC9B 2ASOA 3DXKA 2QM1A 5AQPA 4BRNA 4B1VA 2FSJA 3WXLA 1DKGD 4ISFA 2A42A 4BC3A 3H6EA 1K8KA 3O1BA 1BU6O 4EIAA 3HI0A 3VERA 1NGEA 3KHYA 4WQ5A 1U2VB 4H5VA 5AQVA 1RDWX 1SQKA 5EY4A 1NGDA 2V7YA 3QFPA 4CZMA 3L0QA 5F0XA 3SJHA 1ZBSA 4A61A 4BC2A 2QWRA 3CJ1A 4WQ4A 3A5NC 5KQ8A 2QWMA 4JD2B 2P9KA 5E84A 4PKHA 5BREA 1BA0A 3CJBA 3HZ6A 3O8MA 4A62A 3FGUA 3WEEA 3ZX3A 4WYBA 4BR9A 3MN9A 3DJCA 1X9JA 4K41A 2IIRA 2Q1NA 4BRKA 3AY9A 4BRLA 1HKBA 4K42A 3ULEA 3A8YA 2D0PA 2KHOA 3LM9A 4HTLA 3CJ9A 4CZEA 1BWFO 2BUPA 4H5TA 3U8XA 1EQYA 5BR9A 2GTDA 4PKIA 1CZAN 1BG3A 3W3DA 1MWMA 4FOEA 5LJVA 5AZIA 5FPDA 1NGGA 4BQLA 2PBDA 1HKGA 3O6WA 1DEJA 4B1XB 1JCFA 5EXWA 2GWJA 4RCHA 5KPTA 1T44A 2A41A 3H46O 3HTVA 3LM2A 5AQQA 1YAGA 4BRFA 1Z6RA 5AQOA 2EWSA 3VENA 3ATVA 1V4SA 1X3NA 5AQIA 1SZ2A 3EN9A 4BRAA 1NGJA 3AARA 4JD2A 2Q2RA 2V52B 4AM6A 1S3XA 3ZEUB 1QQOA 1DGKN 2D4WA 3VF4A 3C7NB 3HM8A 1Z05A 4QS8A 3I33A 4NO7A 3BF3A 4BRCA 2E8AA 3IFRA 5TKYA 1KAYA 4H5NA 3ZX2A 5AQUA 4A2BA 4BG9A 4IO8A 4H0XB 2UYTA 1NGIA 5ADXH 1ZC6A 3IUCA 4IZ9A 2A40A 3LDOA 3A5OC 3SLCA 3R9PA 4BROA 2E2NA 4CZKA 3IDHA 3L4IA 5AQJA 3LDQA 2P9UB 3MN6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WF9L 5IWAK 4M63C 4DU4A 1RGIA 2NRRA 5J2PA 3OYJA 1YTUA 4GV6A 4ILGB 1EP4A 3HOTA 2NRXA 1VRTA 1FW6A 3WXJA 1DTQA 4DV1K 1XUPO 4JI7K 4R5PA 4O4GA 4V19S 2AP1A 2BANA 3HL8A 1HX1A 1YVNA 2NRHA 4E7JA 5K14A 4CJUA 3TSQA 3DOLA 2WUSA 3FLCO 3ZEUA 3VN5A 3SPZA 2AJQA 4B1UB 1YI2N 1U04A 1WSJA 4FM1A 3V81A 3EZ5A 3NFAA 5SZTA 4CEQA 2F7TA 2GBZA 5H1SQ 3E9LA 1ASUA 4DMNA 2NRZA 4BRGA 4CJ3A 4FWPA 4LSLA 2NLXA 5FPEA 4YOUA 4KHPK 3HVTA 1VQ8N 4CHZA 4HUEA 3QINA 2HHQA 2UXBK 4B9NA 4IDKA 3HP9A 5GINA 4DSJA 3IMXA 3NMUA 1S9EA 3PIPL 1BQMA 1FK9A 3D7EO 3ENBA 3KLIA 5BPLA 2O8FA 1NJWA 4PL8A 2D1KA 1C1AA 1XC3A 4IJNA 3THXB 1YJNN 3GBTA 1JXEA 3EL2A 4DV6K 1N5YA 4QS9A 3SQ4A 1VQNN 4Z4HA 4BR5A 3RMBA 2GEMA 2KZMA 3VQ5A 5HOOA 4DTRA 3NF9A 1J6ZA 2ZD1A 3LDNA 3PO4A 5BRFA 3RTVA 2QWLA 2ASMA 3DWLA 4DF4A 1QQCA 1BOTO 1QE1A 3HK2A 1W97L 3C0BA 1BIUA 4JI8K 4B1WB 4FWLA 3C95A 3S3MA 3SNNA 1C0GA 4BACA 2ZGZA 2YHXA 5FDLA 2P9LB 4JI3K 4MDBA 3F9KA 1S6PA 4CJ5A 3U3GA 4KREA 1FXXA 5LMNK 1JJ2M 1A5VA 2GUPA 4KV8A 4LF6K 5AQNA 3CQ8A 1CLQA 1CZBA 2Q0UA 1RDDA 1T05A 3K5MA 3LZJA 5HP1A 3QMLA 2YKNA 3ID6A 4OO1J 4CBXA 3FZKA 4N47A 2W00A 4FYDA 1WOQA 3O08A 1N34K 3A5MC 3AVMA 4U7BA 2DFHA 4CJEA 4CBUA 4AHVA 2PYJA 3A0IX 2P1JA 2VGNA 4JRQA 4AM7A 3EE8A 3D2FB 4DR1K 5EVZA 4PUOA 4GV9A 3VA3A 4BRIA 5JMVA 3D0PA 1E4GT 2VG6A 4FPAA 3CI5A 4WQ4C 4X64K 2X78A 4CHPA 3N4PA 1J9AA 2D0BA 3TI0A 4J2BA 4DQSA 3SUQA 2P9IA 3EE9A 2DPNA 2KKZA 2YNIA 4CEDA 1QZ5A 1Q81O 2Z1HA 4CEEA 4A57A 4JN4A 3D2EB 3MXIA 1J54A 3OBWA 4O0IA 3TAGA 3VEWA 3DLRA 3AA4A 5AQRA 3HPGA 3QEPA 4ZHRA 4DTUA 1E4FT 3H3NO 4YFUA 1L3VA 1ZBHA 1QSLA 4NXNK 3WNHA 4DF8A 2HMPA 2OYQA 3TAFA 3HYFA 4MLHA 4FK2A 4K8XA 1NGBA 3HP6A 1VRUA 1YJWN 4DR7K 3ZSWA 3SUPA 4BDYA 5KGWA 1J5OA 1S1WA 3LL3A 3VQ4A 2F96A 2YI1A 2QA4N 4FWSA 2VWJA 3DMJA 3JSMA 3V4IA 3KK1A 5HRPA 2E88A 3WQUA 3LWLA 2PAVA 1TUYA 2VG7A 1KVBA 3L3UA 4DQPA 3DYAA 2GX9A 1C0UA 3G4SN 4K43A 4BE1A 3FR0A 2HVHA 3IS9A 1XNQK 1IKXA 3CCUN 2OA8A 3RMDA 4I6MA 4CZJA 3SUOA 5M1NA 3MECA 4DR2K 4FJNA 3LPTA 3SBGA 3L4QA 4DSEA 4DV7K 4CEFA 2DFFA 1HNVA 2WC9A 3AO5A 4JLHA 1RDCA 2ZF5O 3A5LC 4IFEA 3L2RA 4QCLA 1REVA 1T6CA 3RR8A 3AVHA 4DTXA 3VEYA 4CJ4A 1LAVA 4E1JA 4DTPA 3QIOA 4FVMA 4YOTA 1ZBIA 2YNFA 3CCLN 4JK8A 4KTWA 2QXFA 3ZETB 2CH6A 4LFCK 4FJIA 2ITGA 3MN5A 2XO7A 3AVFA 1LWEA 1RFQA 3B6OA 2E1ZA 5KRSA 2E2PA 1XHZA 2QKBA 4OLBA 3CD6N 2P9PB 2CH5A 1NGHA 3HRGA 4JYAK 4M3XA 1WSEA 2Q3SA 4CJPA 5A2QO 4DTMA 5I42A 1GOCA 2P51A 3QBWA 3RRGA 3EY1A 3CPEA 1NGAA 2O8EB 3ZT3A 1OVYA 3R8EA 1LW2A 3E9OA 3G6EN 3C6TA 3SUNA 1HYZA 1TVRA 1KXPA 3CM5A 2I7NA 3THWB 2CGKA 1EO1A 3HT3A 3DI6A 4CD1A 3OW2M 4PL7A 3OYLA 5F2RA 3V9UA 3O9TA 4M3RA 1U6ZA 4I6MB 5EU7A 3AO1A 4BGAA 2BDPA 4CZLA 3VQAA 1E3MA 1RT3A 1WAFA 3I0RA 2C1IA 5C15A 3HJFA 2YJEA 5AFUH 3NHGA 3TSPA 1TKDA 4FJMA 4H5WA 2F4VK 1DT9A 1X9SA 2QWOA 4W5OA 3KD5E 1NM1A 2UU9K 4RW9A 1XC9A 1SUQA 4QAGA 3EKUA 4JKCA 2QW9A 4KHWA 4DFPA 1RTDA 4BR7A 2O8BA 2YV0X 4A2AA 3WNFA 3ZT4A 1SL2A 1LAWA 4DFKA 4BRNA 2QM1A 3IAYA 3HPOA 3O1BA 1K8KA 5HROA 1WSFA 2IS3A 3CCQN 4EIAA 3VERA 4WQ5A 1SQKA 5EY4A 2HHUA 3QFPA 3L0QA 5HLFA 1QSSA 4J2DA 2QEXN 4HTUA 2QWRA 3O9RA 4CJRA 4Z4EA 3M8PA 5E84A 4PKHA 2RN2A 5BREA 1BA0A 3DRPA 3HZ6A 4CFAA 4CECA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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