2HF4A

Crystal structure of monomeric actin in its atp-bound state
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
374
structure length
364
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
source organism Drosophila melanogaster
publication title Crystal Structures of Expressed Non-polymerizable Monomeric Actin in the ADP and ATP States.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
total genus 123
structure length 364
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf4A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2hf4A03
4FWSA 4IJNA 2YHXA 3GG4A 5AQTA 1NGGA 3B8AX 4B1WB 3HSCA 2ASMA 3ATVA 2VCPA 2IVOA 4H0XB 4A2BA 1NMDA 4WYBA 3WUHA 4QS8A 3IMXA 4H5VA 5AQLA 4IJAA 2P9KA 3LM9A 4B9QA 2V7ZA 4H5WA 4BR5A 5AQIA 2BTFA 1V4TA 3FLCO 3HI0A 2P9SA 4PKIA 2ZGZA 5BRDA 2D4WA 4NB4A 2GUPA 5KQDA 2E1YA 3QMLA 4CZIA 1XQSC 4B1ZA 2GWJA 1X3MA 2FSKA 3M3ZA 3P4IA 2CGJA 5AQHA 4ISGA 3W3DA 4BRCA 4EAHD 3WQUA 4MO5A 4FWQA 5BR9A 4H5RA 1T6CA 1TUUA 1T44A 1RFQA 2YHWA 3A5OC 1HLUA 1Z6RA 3ZETA 2QM1A 1BA0A 2HF3A 4FSVA 5AQWA 2FSJA 2E1ZA 4FPBA 3A5NC 5EX5A 5JLFA 5EOYA 3MDQA 4QS9A 2QWMA 3VEVA 3WEEA 4EHUA 2Q31A 5EXWA 4BR0A 1HPMA 1T6DA 5I9EB 4JN4A 4CD3A 1K8KA 3EN9A 4CZFA 3H45C 3WT0A 2PAVA 1HKBA 1NGAA 2DPNA 3WEEB 3FGUA 3KHYA 2P9UB 5KPTA 2QXLA 3GBTA 3A0IX 2IVNA 1NLVA 4BC5A 4M63C 4MLHA 1QQMA 1ESVA 4YDUC 1U2VB 4ISEA 5KQ8A 2FF6A 2OANA 3DXMA 4CZJA 3CQXA 4AM7A 1NGEA 4FWMA 4A61A 1QQNA 1GLJO 2J4RA 2V52B 4H5TA 1NWKA 5BREA 2Q2RA 3VF6A 2V7YA 3HZ6A 2D0PA 3QBWA 1HJOA 3FZKA 4WQ4C 1C0FA 4CBXA 3MCPA 1HKCA 3M1FA 3H1VX 5AQFA 3KVGA 4GY2B 3AARA 2D1KA 4BVPA 2A6AA 2V51B 3QICA 5AQOA 1QZ6A 2CGKA 3O6WA 4EFHA 1D4XA 3HTVA 2Q0UA 3L6QA 4K25A 2NLXA 1GLLO 4CZMA 2GWKA 4CI6A 3FFKB 3UKRA 1ATRA 2WUSA 2GEMA 3QDKA 5F1XA 3U9DA 1NGJA 5KPZA 1BDGA 3VEOA 3WXIA 4BG9A 3D2FB 3EKSA 4FWPA 4BRIA 2PBDA 3L4IA 1JCGA 3GL1A 2QWNA 4BRFA 4BRDA 3ID8A 4BR4A 3QFPA 3R9PA 3BUZB 4GNIA 3LM2A 5FPDA 1Z05A 4B1UB 5AQMA 3H6EA 5AQXA 3CJ1A 3LDPA 1NGCA 3QFUA 3S41A 1G99A 1MWKA 2A40A 3ENOA 3VEXA 2Q97A 2ZF5O 5F2RA 1BUPA 3O1BA 3VF2A 4YDUA 4RWTA 4CJ7A 4AM6A 5AQZA 5TKYA 3G25A 5JMVA 3AY9A 5KPRA 4BR9A 3O5BA 5E26A 3RSEA 4O5FA 4PL8A 1GLFO 3LDNA 3FZHA 3VEYA 2IVPA 4FO0A 1LCUA 3GDQA 4QS7A 5LJWA 3EKUA 2FSNA 3LL3A 4XH4A 3RSEB 4JAXA 4FWKA 3O4WA 4PL7A 3H1QA 4H5NA 1DKGD 2A3ZA 3CI5A 1KAXA 3MN9A 1OKJA 1X9JA 5ADXH 4K43A 1EQYA 3JS6A 5ELZA 4BROA 4E1JA 2FXUA 4H03B 2YJEA 1DEJA 4H0YB 1BOTO 4KBOA 1U6ZA 3VGMA 5BPLA 3FR0A 3W0LA 2FLOA 4BRAA 4CD1A 3BF3A 3EZWA 4BG8A 4CZLA 4K42A 2E88A 1S22A 2P9UA 3GOIA 3EL2A 3CIPA 3IFRA 3U9ZA 4IWVA 4M7XA 1U2VA 3CQYA 2QWPA 3I8BA 4B1XB 1ZXOA 2E2PA 2P9IB 3QBXA 4IZ9A 2H3GX 3SMSA 3ZX0A 3CETA 2Q0RA 1XUPO 4FWNA 2A42A 1ATNA 1DGKN 1J6ZA 3EO3A 3WXLA 1ZC6A 4F9OA 3VENA 1WOQA 1NGFA 3A8YA 4IO8A 4EIAA 3ULEB 4H0PA 2P9LB 5AFUA 3AAQA 5E84A 3A5MC 3IDHA 2VWBA 1BWFO 4I6MB 3R6MA 5AQVA 2E2NA 4NO7A 4B1VA 2CH5A 3A5LC 3F9MA 4BGBA 4DB3A 4B1YB 3HM8A 5BRHA 4BQLA 5LJVA 4O8KA 4BRGA 3D2EB 2HMPA 1CZAN 5AQQA 2E2OA 3SMPA 4C23A 4HWIA 1KXPA 4Y0WA 2UYTA 3D2FA 2HF4A 2E8AA 1Q18A 4BC4A 4BR2A 1V4SA 2VYPA 5FPMA 1HX1A 2Q36A 5AR0A 4CBUA 4XH1A 1SAZA 3ZEUA 1YAGA 3FE1A 4FPAA 1P8ZA 3MN7A 2E2QA 1GLDG 5BRFA 1YUWA 4MO4A 1GLAG 3MN6A 5BPMA 3ZEUB 4ISFA 2YCHA 2ZGYA 3FZMA 2I7NA 3IUCA 3L0QA 4BQZA 5AZJB 3VGKA 2QWLA 2QWQA 4JD2B 1JCEA 1S3XA 5AZIB 4BRPA 3MN5A 1SQKA 3BP8A 1YXQA 3ZX3A 3FZLA 5F0XA 3C7NB 2NZTA 4BREA 2Q1NA 4BVOA 2ASPA 4XEIA 1C0GA 1BU6O 2P9PA 2GELA 4WQ5C 1NBWA 1QQOA 1SZ2A 3OHRA 1NGIA 2NRHA 3CJ7A 2P9PB 2P9NA 1KAYA 3ATUA 2YHYA 1RDWX 3DAWA 4BRKA 1E4FT 1BO5O 2P9NB 3O08A 4PKGA 5JICA 4H0TB 4RCHA 1HKGA 5AFUH 4FWOA 3DXKA 3AAPA 3MK6A 4WQ4A 3LDQA 1QZ5A 4M7YA 5FPEA 2P9KB 4XH5A 4JNEA 2BUPA 3WXKA 1Y64A 3KZBA 4MLEA 3DXKB 1LOTB 4A62A 1BA1A 2GTDA 2P9SB 4PKHA 5FPNA 4BRNA 3LDLA 2W41A 1MDUB 3H46O 4H0VB 3H3NO 1NGBA 1GLBG 4IXCA 5AQUA 1X3NA 3CJCA 1BG3A 1NGHA 1R59O 3VEWA 1NGDA 5LY3A 4A2AA 1JCFA 1WUAA 5B8HA 5AQJA 3R8EA 2KHOA 2QWRA 2ZWHA 2P9IA 3M6GA 2YJFA 3DJCA 3VESA 4JHDA 2W40A 3O1WA 3VERA 3CJAA 1MWMA 2I7PA 3SK3A 1YVNA 4BRHA 3GE1A 1QHAA 4EHTA 4BRQA 1IJJA 2E20A 4JHDB 4RTFD 4CZEA 4H0OA 3ZETB 3ULEA 4BRLA 3VPZA 2P9LA 3VEZA 4CZHA 2ITMA 3U4LA 3FZFA 4WQ5A 5CE3A 5AQNA 3CHWA 4I6MA 3UB5A 1HUXA 3J8AA 3ENHA 4CZGA 3CJBA 4FWRA 2AP1A 2ASOA 2A5XA 3ZX2A 1K8KB 3O8MA 3D2EA 4FOEA 2CGLA 1RGIA 3TPQA 2F9TA 2F9WA 2D0OA 4BGAA 3VETA 3UKUA 4FL9A 2QWOA 1ZBSA 3MMVA 4CBWA 3SLCA 1GLCG 4FWLA 5AQPA 3U8XA 5BN8A 2YI1A 5EVZA 1MA9B 4CZKA 3UKUB 3VOVA 1NM1A 4FOIA 4LC9B 2QW9A 3DXMB 3O80A 3BF1A 3TU5A 4BC2A 1KAZA 2IIRA 3SJHA 3QB0A 4DHYA 4Z94A 5BPNA 3LDOA 3H3OB 1IG8A 3C0BA 5AQSA 4DQ8A 3BEXA 5ADXA 1ATSA 4L3QA 5AQKA 3D7EO 3DWLA 3I33A 5AZJA 2FF3B 1H1VA 1GLEG 3CERA 4BR7A 1TYQA 4JD2A 5AZIA 5BN9A 3C7NA 1XC3A 5AQRA 3UE5A 5EY4A 4K41A 5AQGA 3WQTA 2AA4A 4BC3A 2HOEA 2A41A 1TYQB 3JXUA 5AQYA 1TUYA 4DCHA 3VGLA 5JLHA 3VF4A 3WXJA 2EWSA 3CJ9A 4BRMA 4HTLA 4J8FA 3UKRB 2CH6A 3HBTA 1E4GT
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SNNA 2WBNA 1D9FA 5GAHP 2E6MA 4B1WB 4AH9A 3G71N 4DR6K 4KHPK 4A2BA 3OYLA 1ZBLA 3LM9A 4B9QA 1LW2A 1WBDA 2V7ZA 1RBSA 2BTFA 3FLCO 4I2PA 5HP1A 4DR3K 3ZYYX 3S5TA 3MEDA 4DR5K 5HRRA 1RILA 4KH5A 2E1YA 3TSPA 4RW9A 4B1ZA 2A1RA 2UXBK 2GWJA 3NVKA 1B92A 4CCHA 3P4IA 2CGJA 5AQHA 4OPKA 4BRCA 5GAGP 3THXB 4DFKA 4E3SA 2HHWA 2BANA 1T6CA 4Q5VA 1RTIA 4ELUA 4DTJA 3T1HK 4JKAA 4FSVA 5GIPA 3BDPA 2FSJA 3KWIA 5LMUK 1GOBA 5JLFA 3MDQA 4QS9A 4ZHRA 3LWLA 4JS5A 4FJJA 3WEEA 4CJ3A 3E9LA 2Q31A 3QEVA 2HHXA 5EXWA 4BR0A 4DSFA 3SV3A 5HL7L 4CD3A 2HSTA 5C0YA 4NXMK 3H45C 4BE0A 4JKCA 3WEEB 3CC2N 3NGZA 4K8ZA 5M1FA 3OYDA 2W6LA 1NNEA 2DFHA 2PY5A 4CJKA 2NNWA 3HPGA 2P9UB 3GBTA 1VSHA 5HLFA 3VQ4A 1NLVA 4BC5A 1RT7A 4IKFA 2XY8A 4O8UA 5CZ2A 1U2VB 4ISEA 3KLGA 2F8SA 2OANA 5C10A 2KLAA 2WFBA 3M8RA 3CQXA 3VQ7A 4AM7A 5DM7L 1S1WA 3ZSQA 3IRXA 3JYTA 1YF5L 4H5TA 1N36K 1NWKA 4W5RA 2KW4A 2O8FA 3MXMA 3I0SA 4WQ4C 4CBXA 1K6YA 1HKCA 3H1VX 3AARA 4BVPA 4PY5A 1EX4A 3KK7A 2O8FB 5AQOA 2CGKA 3HTVA 3QO9A 4PUOA 3ULDA 3E9OA 2NLXA 4JKGA 1TV6A 4DR4K 3V81A 3NH2A 4CI6A 3UKRA 4AHSA 3O9SA 3T19A 1A5VA 2GEMA 3V4IA 3QDKA 3MXJA 5F1XA 1NGJA 4JKGB 3CCJN 1HRHA 4FZYA 4BG9A 3EKSA 2KKZA 1XMQK 1FW6A 1BCMA 4DSKA 3DM2A 2WONA 3N4PA 1TL1A 4BRFA 1WN7A 4BR4A 2B6AA 4XIUA 1S6QA 3L3VA 3CJ1A 3O3FA 3QFUA 5GADP 4KTQA 4J2EA 5SZTA 3HO1A 4NYNA 1G99A 3ENOA 5F2RA 4DV5K 2IC3A 4N47A 4CJ7A 5AQZA 5TKYA 1S6PA 1XHXA 4M3UA 1QSLA 4BR9A 4HCBA 3C6HA 2O8CB 4YOTA 5MLCQ 4FO0A 5LJWA 1S72N 3KK2A 2FSNA 4DTOA 1KD1O 4JAXA 4FM0A 4CEZA 1C1AA 4MDAA 1X9JA 3AVNA 4CJ5A 3JS6A 2HBKA 4WCEL 4H03B 2E4LA 3AV9A 4JI5K 2P1JA 4FLYA 1VSDA 1TKXA 1FK9A 5HBMA 3BY5A 5BPLA 3FR0A 4BRAA 4GV3A 4K42A 4FK4A 3CM6A 4CFCA 3EL2A 3IFRA 3QERA 2FBXA 3IAYA 4CEEA 3CQYA 3I8BA 4B1XB 1TKZA 4GVMA 3SMSA 3KIOA 5FDLA 4CECA 1J6ZA 3KLEA 1VQ8N 1ZC6A 4DG1A 2O8EB 4C8MA 1VQ9N 2KZMA 4C1NI 2C1GA 5FRNA 1WOQA 4IO8A 1IG9A 3NFAA 1JLFA 3V1RA 3QEPA 2ITGA 3QETA 5E84A 5DM6L 4ZTFA 3T69A 2VQFK 4I6MB 4FJLA 1SV5A 4O55A 5SWMA 4DSLA 4BGBA 3T7ZA 4B1YB 3K5NA 2E5LK 1EETA 3D2EB 1GOCA 1NK6A 5FROA 4HUGA 4HCCA 2E2OA 1Q9XA 2O8BA 3SMPA 4HVJA 1QVGM 3D2FA 2HF4A 2NRZA 5K14A 4KHYA 1Q18A 4JI1K 4CBUA 3CCVN 1WBBA 4RW4A 1RDUA 4JKEA 1YAGA 2YKNA 5HRPA 3C6TA 5CYMA 4NLCA 3SAHA 1VQ4N 1O1WA 1BGXT 5BRFA 3PUFA 1GLAG 5JENA 2G8FA 3BGRA 2PYLA 2ZJRL 4CHQA 2D0CA 2ZGYA 1DTTA 3FZMA 1LAWA 1KVCA 4BQZA 4CIEA 2QWLA 5AZIB 2KTQA 2FBYA 3FZLA 5FRMA 2NZTA 2Y1IA 4XJXA 3MX2A 2WTUA 3OYJA 4WFNL 2ASPA 4XEIA 4CF0A 1C0GA 2GELA 4WQ5C 3QNNA 1QQOA 3OHRA 2C1IA 3F5TA 1NGIA 3JSMA 3CJ7A 3DRSA 1XNRK 4DTPA 4JV5K 2P9NA 4M3TA 3ATUA 1B9DA 3TR8A 4DFPA 3SPYA 4B9TA 4CERA 4BRKA 4OPJA 1E4FT 4F3OA 2P9NB 4H0TB 4RCHA 4DUZK 1YJNN 3MK6A 4CEAA 3HT3A 1QZ5A 4M7YA 3ENBA 2P9KB 2YNFA 1RT4A 3P1GA 4XH5A 2PZSA 4CEQA 3NBPA 3KZBA 1BIUA 2P9SB 5FPNA 4Z4HA 2YHAA 1MDUB 1J9AA 1IH7A 1GLBG 4FM2A 1W0HA 3MAQA 4C8KA 4M45A 4CJPA 3CJCA 2VGMA 1R59O 4KH6A 3UIQA 2VWKA 4A2AA 4JRQA 2JWKA 1QSSA 3NDKA 4KHSA 2QWRA 4YNQA 2JLEA 4FLXA 4Z0UA 4CIGA 3AO2A 5C12A 2XO7A 3VERA 1U49A 3L2QA 3QLHA 3TANA 3OTOK 3SK3A 1YVNA 2GBZA 2OPRA 3HL8A 1KFDA 4I7FA 3GE1A 3NH1A 4EHTA 1VRUA 3VEZA 1NU0A 3U4LA 2I5JA 3QNOA 3AVCA 2HNDA 3ENHA 3O8MA 2UUBK 1C0UA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1QHA A;  1IJJ A;  4RTF D;  1U47 A;  1HQE A;  4CZH A;  2ITM A;  3VTI A;  1MU2 A;  1TK8 A;  5AQN A;  3CHW A;  4JEP A;  2OPP A;  1HUX A;  1S5J A;  4E19 A;  4MFB A;  2AP1 A;  1S1X A;  3ZX2 A;  1K8K B;  4O0I A;  4I9L A;  1NKE A;  4JI7 K;  2CGL A;  3L2V A;  3AVH A;  2YKM A;  3TPQ A;  1JL2 A;  2F9W A;  2D0O A;  5I42 A;  4Q0B A;  4DV7 K;  4FM1 A;  4FL9 A;  1ZBS A;  4QAG A;  3AVK A;  1GLC G;  3LZJ A;  3U8X A;  5BN8 A;  3WXM B;  1TVR A;  5CYQ A;  4FOI A;  1A5X A;  4LC9 B;  3BF1 A;  3TU5 A;  4BC2 A;  2HHT A;  1Q82 O;  4RW6 A;  3LDO A;  3H3O B;  3C0B A;  3CG7 A;  3TSQ A;  1X9W A;  5AQK A;  3I33 A;  4LH4 A;  5AZJ A;  5JS1 A;  3KLF A;  1GLE G;  1TYQ A;  3WNG A;  4CES A;  3OYM A;  4U7B A;  1OH5 A;  3G10 A;  4C8N A;  5AQG A;  1EWQ A;  3O4N A;  3WQT A;  1TYQ B;  4B3R K;  4IDH A;  4U67 L;  4W5T A;  3VGL A;  1RCH A;  4LD0 A;  3WNH A;  3OVN A;  2Z1H A;  4ZTJ A;  1KVB A;  4G1Q A;  3EZ5 A;  4BRM A;  4HTL A;  4J8F A;  4OGC A;  4B9V A;  3RTV A;  1F21 A;  2CH6 A;  3HBT A;  1E4G T; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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