2HF4A

Crystal structure of monomeric actin in its atp-bound state
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
374
structure length
364
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin-5C
publication title Crystal Structures of Expressed Non-polymerizable Monomeric Actin in the ADP and ATP States.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 123
structure length 364
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf4A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2hf4A03
4KBOA 3F9MA 3FLCO 3EL2A 2V52B 2ZWHA 1KAXA 4H5VA 4H5WA 5AZJA 5JLHA 1XC3A 2W41A 3H3NO 5ADXH 5AQZA 2P9UA 4BREA 4FWQA 4E1JA 4O5FA 1HJOA 5BRDA 1X3MA 2DPNA 2P9UB 2QWOA 1GLCG 3MK6A 2V51B 1RFQA 3VPZA 1NBWA 5AQQA 5AQOA 3UB5A 5FPNA 3EN9A 3O08A 3QFPA 3ENOA 3VEVA 2P9NA 4AM6A 3CJCA 2VWBA 2QWQA 4CZKA 4EFHA 2QWLA 4EIAA 2P9NB 1BA0A 3ZEUA 3GE1A 2ASMA 2P9SB 4FWOA 4WQ5A 1BA1A 2ZF5O 5AQWA 1NGBA 2GUPA 3H46O 2A5XA 1MDUB 3M1FA 3O1WA 5AQVA 4BRMA 1NGGA 5AQSA 1NGCA 2ASOA 4JD2A 1ZBSA 2ITMA 3SLCA 4EHTA 3HZ6A 1WOQA 2IIRA 4PKIA 3C7NB 3CQYA 2QWPA 4FWLA 3WEEB 1XUPO 1WUAA 1U2VB 1YXQA 2WUSA 1GLFO 1NGIA 4H0TB 4HWIA 5EY4A 3VF6A 4M7YA 5F1XA 3OHRA 5CE3A 2NZTA 3WXIA 1U6ZA 3ULEA 2VCPA 1ESVA 4DCHA 1TYQA 2YHXA 3ULEB 1Q18A 4H5TA 3VERA 3GG4A 1E4FT 1DGKN 3HBTA 5KQ8A 3EO3A 5E84A 5AQHA 2V7ZA 2BUPA 4BRGA 3WUHA 4BC2A 2Q2RA 3ZETB 4IXCA 5AZIB 4M7XA 1KAYA 2YJEA 4NO7A 3W3DA 3VEOA 4XH5A 3U8XA 1KAZA 1OKJA 3A5MC 5JMVA 3UKRA 3IDHA 1HX1A 3A8YA 5JLFA 1ATNA 3MN9A 2P9LB 4H0VB 3UKRB 1K8KA 3P4IA 1MA9B 2QW9A 3LM9A 5AFUA 1K8KB 4B1ZA 1NGFA 1BU6O 1Z6RA 4ISEA 4CBWA 2Q0RA 4BR4A 2D1KA 4BROA 1SZ2A 1NLVA 3WXJA 1JCFA 4GNIA 2AP1A 1GLDG 2HF3A 5AQXA 3CIPA 4BRHA 3D2EA 2Q97A 3WXLA 4BRDA 3HM8A 3EZWA 3D2EB 3JXUA 3EKUA 1Y64A 1P8ZA 3AY9A 4BVPA 3BUZB 3ATUA 5BN9A 2Q31A 5BN8A 4B1YB 4I6MA 3VETA 1LOTB 1HLUA 3FFKB 1QZ6A 2E1YA 3FZLA 3BP8A 4CBXA 4PKGA 4BRKA 4CBUA 2CGKA 4JNEA 5AQNA 5JICA 1NGAA 2HMPA 4BC3A 3U4LA 4CD3A 1G99A 4WQ5C 3WT0A 5BPLA 3LL3A 1H1VA 2D4WA 4PL7A 4JHDA 4FPAA 3EKSA 2E20A 2GEMA 5B8HA 5AQLA 4JHDB 3TPQA 2YI1A 4BR9A 3WXKA 2CH6A 2FXUA 1QQOA 3H6EA 4DB3A 4CZFA 4B1VA 3I33A 1MWKA 3QBXA 4NB4A 3ID8A 4FOIA 5BPNA 3DAWA 4B9QA 2A6AA 2P9SA 3UE5A 3A5LC 4FWNA 1NGEA 2IVPA 4BQLA 3AAPA 3O5BA 1ZXOA 3TU5A 3CI5A 4MO4A 3VEZA 2A40A 3MN5A 4WYBA 2E2QA 2QWRA 3C7NA 4BRIA 2FLOA 4DQ8A 3WEEA 2Q36A 3FE1A 4H0XB 1U2VA 2D0PA 3DXKA 4PKHA 1EQYA 3B8AX 1ZC6A 3QBWA 4H0PA 2E2OA 1IG8A 3DXKB 4FWRA 4FO0A 2QWNA 2I7NA 2E1ZA 2E2PA 3DXMA 1YVNA 3GOIA 4YDUA 2BTFA 3H45C 3KZBA 1V4TA 3DXMB 3FZKA 3KVGA 4MLEA 3UKUB 1QZ5A 4CZHA 3GL1A 3SMSA 2HF4A 5AQUA 3VEWA 4BRAA 1BG3A 3CQXA 3IUCA 1NGJA 5F2RA 4XEIA 3ZETA 3ZX3A 5AZIA 4IJNA 2QM1A 1GLBG 3CJ1A 3CJAA 2FSKA 4H5NA 3AAQA 3LDQA 4H5RA 4CZJA 4K41A 4CD1A 3HI0A 2FSJA 2OANA 3LDOA 3VENA 3VOVA 4BRQA 5LJVA 4FWSA 4PL8A 1QQNA 5BR9A 5E26A 4BRCA 4QS9A 2P9LA 2I7PA 3LDPA 5EX5A 5ADXA 2QXLA 3DJCA 3LDLA 1JCEA 5AQPA 3VF2A 1R59O 1IJJA 5AQGA 3RSEB 4K42A 4A2BA 4ISGA 3KHYA 5AQIA 4BGAA 3R6MA 1TUUA 4IJAA 4CZEA 5FPDA 4RCHA 2E2NA 3CERA 4K25A 1SQKA 2P9KA 4XH1A 3U9DA 3H3OB 1NGDA 1BUPA 1DEJA 2P9IB 3SK3A 2P9KB 1NM1A 4A2AA 5AQFA 3MN6A 4MLHA 4AM7A 2A41A 3QMLA 1ATRA 1NMDA 4LC9B 2UYTA 1YUWA 4FOEA 4FWMA 5KQDA 3LDNA 3M6GA 4BQZA 3DWLA 3FZFA 5KPRA 1HUXA 3R9PA 3ATVA 4IZ9A 2YHWA 3MN7A 3R8EA 2YCHA 3CJBA 5ELZA 4L3QA 5LJWA 4CZIA 4H0OA 3JS6A 4CZGA 1BWFO 4ISFA 1BO5O 1ATSA 1GLEG 2GWJA 5EOYA 4FWKA 5AQJA 1HKCA 4IWVA 4A61A 4BR7A 5LY3A 3H1QA 3WQTA 2FSNA 3VEYA 4CZLA 4GY2B 1KXPA 3QFUA 4BRLA 5AQRA 3BF1A 5BREA 4MO5A 4M63C 2QWMA 4YDUC 3FZHA 4CI6A 2KHOA 3L6QA 1J6ZA 5AZJB 4J8FA 4H0YB 2PAVA 3CJ7A 3VGLA 3VF4A 5AFUH 5I9EB 2V7YA 1Z05A 2CGJA 3W0LA 4EHUA 5AQKA 4WQ4A 3GDQA 3J8AA 1T6DA 2D0OA 2ASPA 2ZGZA 4RTFD 3O80A 3FZMA 3C0BA 2ZGYA 3ZEUB 4CJ7A 3O4WA 4FSVA 3L4IA 1GLJO 3UKUA 3GBTA 2IVNA 3BEXA 1NGHA 5AQTA 2E8AA 2A42A 4Z94A 4FWPA 3SJHA 4BC4A 5KPZA 1YAGA 4JD2B 3AARA 1LCUA 2VYPA 4B1WB 3WQUA 1S22A 3A0IX 4EAHD 2EWSA 2FF3B 1T6CA 2CGLA 1HKGA 2NLXA 2Q0UA 3M3ZA 1GLLO 3I8BA 5AR0A 3QDKA 3FR0A 3ZX2A 4A62A 4BG8A 1QHAA 2HOEA 3VESA 1V4SA 5EVZA 3U9ZA 1X9JA 3G25A 1SAZA 4FL9A 3VGKA 2E88A 3O8MA 2YHYA 1TYQB 2H3GX 2P9PA 3CHWA 4BR2A 4B1UB 5FPMA 3VGMA 2P9PB 5EXWA 2FF6A 2Q1NA 1D4XA 3MDQA 3MMVA 4DHYA 4CZMA 5TKYA 4BG9A 4FPBA 3RSEA 4BRNA 4BRPA 4Y0WA 3O1BA 2YJFA 1HKBA 2AA4A 2PBDA 2W40A 3IFRA 1TUYA 1C0FA 3H1VX 2NRHA 3MCPA 2GELA 2GTDA 3VEXA 2P9IA 4BRFA 5AQYA 5AQMA 4O8KA 2IVOA 4BVOA 1HPMA 1RGIA 1BDGA 4B1XB 4QS7A 4QS8A 4F9OA 3ZX0A 3S41A 1BOTO 3CETA 5BRHA 1GLAG 2J4RA 5BPMA 5BRFA 1T44A 1MWMA 1QQMA 5FPEA 3SMPA 1E4GT 4JAXA 3D2FA 3LM2A 3CJ9A 5KPTA 3A5NC 3HSCA 3A5OC 3D2FB 3QICA 3FGUA 1RDWX 3HTVA 4RWTA 3IMXA 1S3XA 3BF3A 3QB0A 4BR5A 2F9WA 4BGBA 4H03B 3ENHA 4K43A 4C23A 1XQSC 2CH5A 4WQ4C 1C0GA 4BC5A 4JN4A 1DKGD 4XH4A 5F0XA 1CZAN 4HTLA 3D7EO 4I6MB 3L0QA 2GWKA 1NWKA 4IO8A 4BR0A 2F9TA 1X3NA 2A3ZA 1JCGA 3O6WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2NRXA 4KBOA 1FJGK 3M8SA 3OA9A 1Z25A 3EL2A 1KAXA 4I7FA 3NAEA 1TAQA 1XC3A 5ADXH 4BREA 4N47A 5I42A 4FJ5A 2DPNA 3BY5A 4FZYA 3ENBA 2IS3A 3KLGA 3IS9A 1RFQA 1HQEA 4PWDA 3UB5A 3O08A 1NOYA 4Q0BA 2P9NA 4CGFA 1VQMN 4O44A 1KVCA 2P9NB 5HRPA 1BA0A 3GE1A 4LF7K 1UOCA 2P9SB 2YNFA 4FWOA 4WQ5A 4ILJA 1NGBA 2QTDA 2A5XA 3QEXA 1NGGA 5AQSA 1NGCA 2ASOA 4JD2A 4ZTJA 1ZBSA 2ITMA 4WCEL 4BE7B 4DR3K 4AHTA 1IKYA 3C7NB 2QWPA 4FWLA 3WEEB 1WUAA 2P1JA 4W5QA 4F2SA 4FXDA 4H0TB 2KW4A 5CE3A 4IEIA 3VQCA 1ESVA 1W2BM 4M3TA 3VERA 4ILGB 1QVFM 1HMVA 4FJXA 4FJNA 1RBSA 3K0SA 4B3MK 1HYZA 3P31A 4CJLA 3WUHA 2XHBA 5HLFA 5AZIB 5MLCQ 1KD1O 2HBJA 3ZT2A 3ZT0A 1UA0A 3ASMA 4BY9C 4U7BA 2LSNA 2E4LA 3A5MC 2WBNA 3O4NA 3UKRA 4YOVA 2XY5A 1T03A 1HX1A 3A8YA 4KH4A 4DMNA 3UKRB 4JYAK 1K8KA 1JLAA 3P4IA 1MA9B 2QW9A 4UQGA 3NGIA 1IBMK 1K8KB 4B1ZA 3O3GA 1VSJA 4CHYA 4BR4A 4CGDA 1NLVA 1JCFA 1S9GA 2ZE2A 2HF3A 5AQXA 1KTQA 3HM9A 3AA4A 2UXCK 1Y64A 3EZ5A 1VQ6N 4C8MA 3SJJA 3C6TA 1RTJA 5BN8A 2KFZA 4I6MA 4OKEA 3VETA 2E1YA 2D0CA 5FROA 3BP8A 3AVKA 3QNOA 1WSIA 3AVMA 4JNEA 4DFJA 2PZSA 5JICA 3I0SA 3TABA 3MX5A 3SPYA 2QXFA 1G99A 2QEXN 4WQ5C 4DR7K 3V9UA 1QSYA 3SI6A 3ALYA 3KK2A 4PHTX 4DWIA 4FPAA 3EKSA 2E20A 4B9UA 4KI6A 3TPQA 3WXKA 1NK0A 3LWMA 2XY6A 4B1VA 3ZSYA 3ID8A 3HPHA 4JKFA 1ILYA 3K2PA 3SQ4A 3LP2A 2A6AA 3QERA 4BEBA 5CZ1A 1KC8O 3UE5A 3PLAA 1Q81O 1ASWA 1EWRA 2BANA 1NK4A 3C6HA 2Z1JA 3VN5A 3OJUA 1ZXOA 3M8QA 3VTHA 3TU5A 1VQ4N 3CI5A 1M90O 4DUZK 2A40A 3T69A 2E2QA 4BRIA 3ZSZA 1CZ9A 2Q36A 3FE1A 3KWGA 3CMAN 3OTOK 4DR2K 1EQYA 4IG3A 1L3SA 1Z26A 4GV3A 3F5TA 4DU1A 2ZM6K 2OTJN 1K73O 4YDUA 4ZTFA 3WNEA 3H45C 2QI2A 4KB0A 3NF7A 3KVGA 3O9RA 4MLEA 3UKUB 4JRQA 4WF9L 3IKMA 1QZ5A 4CK2A 3SMSA 3ZSOA 1G15A 3VEWA 4BRAA 4A5BA 3CQXA 1QHTA 1IH7A 3HOSA 1NK9A 3AO2A 3VTIA 4GMJB 1D5AA 2F8SA 1GLBG 4LF5K 4DUYK 1I94K 2FSKA 3RTVA 3RMAA 3LDQA 1BCOA 4CIFA 3LDOA 4I2QA 1JL1A 3SBTA 4FK0A 5LJVA 1QQNA 5CHIA 3U3YA 3LAKA 3JAMO 3P1GA 2HHHK 3L2WA 2OPSA 3DJCA 3OYDA 1JCEA 4OVLA 4OKJA 3VF2A 3MECA 3AVJA 4YOXA 4M42A 5JS1A 1HNXK 4CFCA 3AO5A 4DQIA 4ISGA 3NGYA 1S6PA 1BL3A 4CGJA 3OYBA 3OW2M 4E3SA 5C15A 4OGEA 3H3OB 3DRSA 3SUOA 4AM7A 4IOCL 2A41A 1NMDA 4DTOA 3K5OA 4NXMK 4JI6K 4B3SK 4LFBK 2UYTA 3TAPA 4KHWA 1B9FA 3CMEN 1UA1A 4NCGA 3M6GA 3O9TA 1HUXA 3WNGA 3ATVA 3MN7A 3V9SA 1HQUA 4X64K 1VSIA 4DTMA 2YCHA 3CJBA 4H0OA 3JS6A 4CZGA 1S1WA 4AHUA 1BWFO 1U04A 4ISFA 1ATSA 2GWJA 4IWVA 5LY3A 4CJ3A 3OYNA 4OKKA 4YORA 2B4JA 2Z1IA 3AGRA 3HL8A 2OZSA 3VEYA 3S3OA 1JJ2M 3SUPA 4CZLA 4B3OA 3J7ZO 3QFUA 5AQRA 1EKEA 3ZSRA 4M63C 4BDZA 3EE8A 3L4QA 1HYVA 4YDUC 2OA8A 2KHOA 2OZMA 5AZJB 3CJ7A 3VGLA 3R1XA 1JLGA 5AFUH 1TK8A 4M3ZA 3AGKA 3THWA 4JI3K 3VQ6A 3GDQA 1JXBA 2E6MA 4DV1K 3THWB 4KHUA 1EP4A 4CGIA 4Z4HA 1T6DA 2D0OA 5GAEP 3EYZA 3THYA 3HP6A 1LV5A 3FZMA 3C0BA 3TAMA 2F4VK 3ZEUB 3THYB 2ATQA 1GLJO 2NRTA 2IVNA 3BEXA 1NGHA 5M1FA 5AQTA 3C6AA 4CESA 1YI2N 3TTCA 1XWLA 4Z94A 2NRZA 1S1UA 2BE2A 5C10A 4BC4A 5KPZA 2OPQA 3DM2A 3AARA 2ZQBA 4DS5A 3TAGA 1ZBLA 2VYPA 4B1WB 4EAHD 2FF3B 1C6VA 4B9MA 1U4BA 4I9QA 2Q0UA 4JK7A 2EHGA 4O8UA 3VQ9A 1D8YA 1VSKA 4BG8A 1QHAA 1YITN 1V4SA 4DSJA 1B9DA 1SAZA 2X6SA 3VQ8A 1U48A 3VGKA 4KREA 4Z4EA 3O8MA 3TAEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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