5AQXA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
387
structure length
387
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKSTRAAAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 118
structure length 387
sequence length 387
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqxA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqxA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqxA04
2QM1A 1NGEA 5AQZA 4H0VB 2QWQA 2IVPA 3FZHA 4FWLA 4BC2A 4C23A 4YDUC 4HTLA 1YXQA 5B8HA 1HKGA 1S3XA 4WQ5A 4EIAA 3VEYA 2ASMA 1DKGD 4CZKA 4BRFA 4M7XA 1QZ5A 3MDQA 4DHYA 5AQPA 4BGAA 3W3DA 3D2FB 3VGMA 5EOYA 3QMLA 1NGAA 4FPBA 4BG9A 3GG4A 4H0OA 3O4WA 2VCPA 4BR2A 1JCGA 4JN4A 3DAWA 2Q31A 5JMVA 4FO0A 2Q0RA 3FE1A 1NGIA 3LDQA 3HSCA 3HI0A 1QZ6A 3FGUA 4BRHA 3DXMB 4M63C 4B1YB 2IVOA 3O08A 4BR4A 2YHYA 3R9PA 3AY9A 1XUPO 3R6MA 1T6CA 2QXLA 5AQHA 1BU6O 2BUPA 4I6MA 2P9SB 3VEXA 2QWNA 3C7NB 3B8AX 3S41A 5AQJA 2UYTA 4FWRA 4LC9B 1BUPA 2FLOA 1BWFO 1SQKA 2QWLA 2F9WA 3ZEUB 1SZ2A 3VGKA 1QHAA 4IJAA 1E4FT 3DWLA 1NGHA 1GLCG 1HKCA 5AQVA 5BPLA 1NGBA 2P9UA 5I9EB 2H3GX 3SK3A 1K8KA 3MK6A 1RDWX 4BQZA 1TUYA 3M1FA 1GLEG 3A8YA 1P8ZA 1BA0A 1HX1A 3M6GA 5AQQA 3ATUA 5BN8A 3WXLA 4WQ5C 3WEEA 4HWIA 1MWMA 3ZX0A 1IJJA 2ZF5O 5FPMA 5AQMA 5ADXA 2P9LB 1KAXA 1NLVA 3CHWA 2E2NA 3CETA 1Z05A 4A62A 4XEIA 2GUPA 4BC3A 5BPMA 1MDUB 5LY3A 4PL7A 2GEMA 5AQTA 3UKUA 3CJ9A 4IWVA 3WXKA 2GWJA 5BR9A 3VERA 4RWTA 5AR0A 3WT0A 2YI1A 2Q2RA 1DGKN 5AFUA 3ULEB 4MO5A 4PKIA 2V7ZA 4CZEA 3W0LA 4BGBA 2P9PB 1IG8A 3CQYA 3U8XA 1YAGA 5FPDA 1GLDG 1GLFO 5JLHA 1ATNA 1ZBSA 3LM2A 3VEOA 2HOEA 4J8FA 1WUAA 4H0XB 1T44A 4ISGA 3VPZA 1CZAN 4CBWA 1RFQA 2GTDA 3QBXA 5E84A 5ELZA 1JCFA 2HF3A 2FXUA 3QFPA 4BRDA 3DXKA 3MMVA 3IMXA 5EX5A 4H0TB 4BG8A 2P9IA 3FZFA 1KAYA 3ID8A 1HUXA 3O1WA 3VEVA 3U9DA 1Q18A 2FSNA 4XH4A 5TKYA 3QB0A 2ASOA 2A3ZA 3O5BA 3FZLA 3CIPA 4WQ4A 3O80A 4BREA 3HM8A 2YCHA 2WUSA 4FWQA 3ZX3A 3VGLA 4MO4A 1XC3A 2V52B 4B9QA 5AQXA 4CI6A 2E20A 1C0FA 3HTVA 4B1ZA 1NBWA 3D2EB 1WOQA 5AZIB 4JAXA 3CJ1A 2A41A 2OANA 2D0PA 3QICA 2KHOA 3SMSA 4DCHA 3UKRA 2D1KA 3AAPA 3A5MC 4CZHA 3JS6A 4BRNA 2CH6A 2AP1A 1MWKA 2NLXA 5AQRA 3H45C 2P9NA 1LCUA 2IIRA 3VETA 2A40A 3VF4A 4F9OA 2NZTA 3VOVA 4BVOA 1TYQA 1HJOA 1QQMA 5KQ8A 4JHDB 3GDQA 3HZ6A 4BRQA 4MLEA 3RSEB 3DJCA 5F2RA 1X3MA 3QBWA 4FWKA 1D4XA 3VENA 5BRHA 4K41A 3JXUA 4H03B 3P4IA 2I7PA 4XH1A 5EY4A 3KVGA 2J4RA 1QQNA 4CD3A 3AARA 3G25A 2W40A 3R8EA 4FWPA 2F9TA 3EL2A 1NGDA 4Y0WA 5JICA 4K42A 3SMPA 3MN6A 5KPTA 4CZIA 4FSVA 5AQFA 1X9JA 5ADXH 4CZMA 4IJNA 1NWKA 4BVPA 3ZETB 3DXMA 2FF6A 3A5NC 1X3NA 3BUZB 4FOIA 1ATSA 2P9KB 3MN9A 3BF1A 4A2BA 4BR0A 4KBOA 2YHWA 3O8MA 2P9SA 4NB4A 2A5XA 4O5FA 4AM6A 3C7NA 4FWSA 3A5LC 1U2VB 3H3NO 2E2OA 2Q1NA 4IO8A 3TU5A 4BR9A 3LDNA 3F9MA 2VYPA 4JD2B 1V4SA 4BRPA 3VF6A 3GL1A 2QWPA 4M7YA 5AFUH 2YHXA 1ESVA 1C0GA 3ZEUA 1NM1A 3L4IA 4H5TA 2GWKA 4FWNA 2CGJA 5FPEA 2Q97A 2AA4A 3ATVA 4H0PA 3A0IX 1SAZA 4BR5A 2QW9A 2FF3B 2PBDA 5BRFA 3GE1A 2ITMA 3FR0A 2E1ZA 1KAZA 5CE3A 3EN9A 5BPNA 3KZBA 4EFHA 2YJFA 1J6ZA 3VF2A 3O6WA 4FPAA 5E26A 1NGJA 3UB5A 4RCHA 3WQUA 4CJ7A 3ENHA 3WXJA 4QS8A 3LL3A 1V4TA 4NO7A 2E2QA 3EO3A 3H1VX 4K43A 1GLAG 3CERA 4EAHD 2D0OA 1BDGA 1NGGA 2E88A 2IVNA 1H1VA 4BROA 3CJAA 4CD1A 5LJWA 4BC5A 3HBTA 4WYBA 3L6QA 3CI5A 4ISEA 3IUCA 4K25A 3IFRA 5JLFA 3UE5A 5AQGA 1NGFA 1MA9B 2EWSA 2VWBA 1R59O 1TUUA 3FFKB 2D4WA 5KQDA 3ULEA 5AQWA 2E8AA 3MN7A 4A61A 5AZJA 4BRGA 1GLBG 1TYQB 4CZLA 2P9PA 4GNIA 3H6EA 4L3QA 5AQNA 3QDKA 3QFUA 2HF4A 1EQYA 2YJEA 4I6MB 3VEWA 3EKSA 4B1WB 3LM9A 3H3OB 5AQOA 2NRHA 3CQXA 5EXWA 4IZ9A 3J8AA 4BR7A 4BRCA 1NMDA 3ZX2A 4B1UB 4EHTA 1HPMA 2P9UB 2ZGZA 1K8KB 4CZFA 3GOIA 2FSJA 2QWOA 3BF3A 4CZJA 3MN5A 1T6DA 3FZMA 3TPQA 5AQSA 4H5WA 3EKUA 4RTFD 4BRIA 2ZGYA 3WEEB 4E1JA 4IXCA 4XH5A 3FLCO 3D2FA 1BO5O 3I33A 1ZC6A 1OKJA 2CH5A 2QWRA 3D2EA 4BRAA 3U9ZA 5AZIA 2V51B 5AQYA 3C0BA 4DB3A 2BTFA 2FSKA 1RGIA 3WXIA 3IDHA 4PKGA 3KHYA 1NGCA 2ZWHA 4WQ4C 4GY2B 2HMPA 4QS7A 5EVZA 3I8BA 3UKUB 5BRDA 1LOTB 3LDOA 1BA1A 4JNEA 3VEZA 2Q36A 1GLJO 4O8KA 1Z6RA 4CBXA 1DEJA 5BN9A 4H5VA 4ISFA 3WUHA 4JHDA 5F1XA 1E4GT 5FPNA 3RSEA 3O1BA 2Q0UA 3OHRA 4FWMA 4H5RA 1ATRA 3U4LA 2I7NA 4YDUA 2PAVA 3H46O 5BREA 2GELA 5AQKA 1GLLO 2A6AA 4DQ8A 5LJVA 1HKBA 4FL9A 3H1QA 1JCEA 5AQLA 3CJCA 3ENOA 3GBTA 2QWMA 2V7YA 1S22A 1XQSC 4PKHA 1QQOA 3DXKB 2A42A 5KPRA 4BQLA 4EHUA 5F0XA 2P9IB 1HLUA 1Y64A 3LDPA 2CGLA 3L0QA 3CJBA 5AQUA 4QS9A 2W41A 3ZETA 3SLCA 4FWOA 4PL8A 5AQIA 1YVNA 4FOEA 4BRMA 2E2PA 2P9KA 4BC4A 3D7EO 2ASPA 2P9LA 1YUWA 3BEXA 5AZJB 1G99A 1ZXOA 3SJHA 1BG3A 3MCPA 3M3ZA 4MLHA 3EZWA 4H5NA 1U2VA 4CBUA 3AAQA 3FZKA 5KPZA 3WQTA 3BP8A 3CJ7A 1KXPA 3A5OC 4JD2A 2E1YA 3UKRB 3VESA 4H0YB 4A2AA 3LDLA 1U6ZA 1BOTO 4B1VA 2DPNA 4BRLA 4AM7A 4CZGA 4B1XB 4Z94A 4BRKA 2P9NB 2CGKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QM1A 1JLQA 3KLEA 1BCOA 3ZSWA 3HJFA 5AQZA 4DV7K 4LF6K 4O8UA 3L2UA 1LQHA 4FWLA 1RTDA 1HNIA 1LQQA 4HTLA 1CN2A 1I6FA 4WQ5A 3K0SA 4EIAA 1ICAA 2N2RA 1DKGD 4HHTA 4OGEA 4DHYA 3TAQA 4KHUA 3G4SN 3W3DA 3ZT1A 3J80O 3D2FB 4JV5K 3SQ1A 1OH5A 4JLHA 3RWUA 3QMLA 1VSJA 1HMVA 2JGUA 3GG4A 3V1QA 2LY6A 5HP1A 1JCGA 4IG0A 3DAWA 3AVNA 4FO0A 3AVHA 4KKOA 3TAPA 1QZ6A 4YOYA 4BRHA 3DXMB 4JI6K 4E89A 4DV4K 4B1YB 2HHVA 3LAKA 1QSLA 5DM6L 2IVOA 2XO7A 4BE1A 2BGGA 1XUPO 1NJIO 2MN5A 4FM0A 1OH8A 1BU6O 1RDDA 1XMQK 3WNEA 2UUAK 3C7NB 4DFKA 2ITGA 1NJZA 4WFAL 4FLWA 1BWFO 2GUIA 2O4IA 3PSMA 3MWTA 3ZEUB 3VGKA 1Z26A 2BE2A 1GLCG 4JKGB 5CYQA 4LF4K 4BY9C 3F5TA 4BQZA 2W6LA 3L3VA 4FM2A 1BA0A 2HBJA 1JL2A 3M6GA 4EP5A 2OCEA 5BN8A 4WQ5C 1GPSA 3BZCA 4HTUA 4CJTA 3WEEA 4HWIA 3AVJA 1IJJA 3TSUA 1U48A 1RBVA 1KFSA 3AVBA 4XEIA 4F2SA 5BPMA 2GX9A 2VGNA 4C8NA 5LY3A 1R0AA 3SUPA 3JYTA 4DQSA 2OZSA 4HUGA 3UKUA 1DQ7A 1J5EK 3CJ9A 2HNYA 2XHBA 4KHWA 2YI1A 4DV3K 5JS2A 5AFUA 3ULEB 4M3TA 1OMYA 4PKIA 4DQPA 3KC6A 4BGBA 2HMIA 2P9PB 2YHAA 2Y1IA 2O8FB 1IH7A 2KPYA 2IDOA 5HROA 3S3NA 4KI6A 3E1YA 3P38A 4C1NI 1NRAA 3O4NA 1SV5A 2HOEA 4J8FA 1WUAA 4H0XB 1T44A 4FLXA 5C25A 5KRSA 3DYAA 3DLLL 3IRXA 5E84A 1A5VA 1KSPA 3DXKA 3K5LA 3THXA 2MBKA 1F21A 4H0TB 4BG8A 3FZFA 3ID8A 4KHPK 1HUXA 2LKBA 3VEVA 3VQ6A 2B6AA 2FSNA 4ID1A 1IKYA 3CPWM 2G8IA 4KFBA 4RW7A 4CCHA 2YCHA 4FWQA 3U6FA 3CCQN 3NCIA 5HBMA 1S1WA 5C2FA 4CI6A 3NHGA 2E20A 2KFNA 3RTVA 4AHRA 3VMFB 1RT6A 4E7KA 5AZIB 3SBTA 3NF9A 4E1MA 1B3CA 3G6EN 3HO1A 1T8EA 4U7BA 1IBKK 4CZHA 3KOYA 2VQEK 4BRNA 1RTJA 2NLXA 3MX2A 1MWKA 3TI0A 3H45C 1VQON 4CK3A 3VF4A 3OBYA 1HJOA 4AH9A 3VQEA 4Q0BA 3PO5A 5JENA 3GDQA 1C1CA 2OA8A 5F2RA 1X3MA 1EETA 3QBWA 1D4XA 2QXFA 3EYZA 1ZBUA 3P4IA 3K5NA 3DMJA 1HYSA 2I7PA 3KVGA 1B7DA 4CD3A 4B9TA 3H08A 2LT8A 1IKXA 3AARA 2BH1A 2W40A 4Y0WA 1HYZA 4MQ3A 5JICA 3PX6A 2O8EB 4DSFA 3SMPA 3G71N 3NGZA 5AQFA 3G10A 3R1XA 4KTQA 4DTRA 3ID6A 2VG5A 3CMEN 3KLIA 3DXMA 3OS2A 1NMNA 4FJKA 4HHFA 2NRTA 2YNIA 1X3NA 1T7PA 3CFPA 3T3FA 2B3CA 1T7BA 2P1JA 3BF1A 3SAHA 3C6UA 1DTQA 4KBOA 2YHWA 1Q8IA 4PA1A 4AM6A 3C7NA 1NJWA 3A5LC 1S6QA 3AVFA 4JD2B 3IAYA 3VF6A 2QWPA 4IFYA 1ESVA 3ZEUA 1NM1A 5LMNK 1O1WA 2LI7A 4CJVA 2N66A 4DQRA 1HR0K 4JKGA 2AA4A 1T0ZA 5CHIA 2HHHK 2GMOA 1SAZA 2RN2A 2FF3B 2PBDA 3PLAA 3CCLN 3KHWA 3NH1A 2HHWA 4AB0A 3SF4D 3KZBA 4DR6K 5HL7L 4WE1A 3T1HK 2B68A 4Z4EA 3O6WA 1NGJA 4E3SA 1NOYA 2WC9A 3WQUA 4CJ7A 2DFFA 1N34K 1NK6A 1P90A 4LY7A 3ZSVA 1XNRK 1P00A 1ZYVA 4K43A 4DUYK 4EAHD 2KZMA 2D0OA 1DTTA 2UUCK 4PY5A 4BC5A 3IKMA 3L6QA 4BDZA 4K25A 3KJVA 3ZLJA 2KBHA 3CC2N 2IS3A 1NGFA 2EWSA 1B92A 1QHTA 4KREA 5FRNA 4B8CA 2D4WA 1WN7A 4GW6A 3ULEA 4KB0A 4M42A 5DK5A 2W42A 2P9PA 3H6EA 3HVTA 4JI8K 5AQNA 3EZ5A 4K8XA 1EQYA 2YJEA 4O5BA 1N6QA 3VQBA 1C6VA 3HP9A 3CMAN 1LWFA 1IBLK 1SEGA 3CQXA 5EXWA 4IZ9A 5JVGL 1NMDA 1S9GA 4OJRA 2FC0A 4GV6A 3VQDA 2ZGZA 1FKPA 2ZQBA 2E5LK 2QWOA 3BF3A 1UOCA 4FLUA 4CEOA 4LF8K 1LAVA 3AVKA 3OS1A 1FK9A 3CCRN 3BK3C 1RBUA 2Q3SA 3THVA 4IXCA 4JKHA 4DMNA 3HP6A 1BO5O 1IKVA 4X65K 5FLXO 3NFAA 1GOAA 3VQ8A 5AZIA 1YIJN 2VY6A 4DB3A 2FSKA 1KTQA 5KGWA 4YOVA 5IT9O 3KHYA 1NGCA 2ZWHA 1KLMA 1YTUA 2NRZA 2RHKA 1AYJA 1LOTB 4JK7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2QM1 A;  1JLQ A;  3KLE A;  1BCO A;  3ZSW A;  3HJF A;  5AQZ A;  4DV7 K;  4LF6 K;  4O8U A;  3L2U A;  1LQH A;  4FWL A;  1RTD A;  1HNI A;  1LQQ A;  4HTL A;  1CN2 A;  1I6F A;  4WQ5 A;  3K0S A;  4EIA A;  1ICA A;  2N2R A;  1DKG D;  4HHT A;  4OGE A;  4DHY A;  3TAQ A;  4KHU A;  3G4S N;  3W3D A;  3ZT1 A;  3J80 O;  3D2F B;  4JV5 K;  3SQ1 A;  1OH5 A;  4JLH A;  3RWU A;  3QML A;  1VSJ A;  1HMV A;  2JGU A;  3GG4 A;  3V1Q A;  2LY6 A;  5HP1 A;  1JCG A;  4IG0 A;  3DAW A;  3AVN A;  4FO0 A;  3AVH A;  4KKO A;  3TAP A;  1QZ6 A;  4YOY A;  4BRH A;  3DXM B;  4JI6 K;  4E89 A;  4DV4 K;  4B1Y B;  2HHV A;  3LAK A;  1QSL A;  5DM6 L;  2IVO A;  2XO7 A;  4BE1 A;  2BGG A;  1XUP O;  1NJI O;  2MN5 A;  4FM0 A;  1OH8 A;  1BU6 O;  1RDD A;  1XMQ K;  3WNE A;  2UUA K;  3C7N B;  4DFK A;  2ITG A;  1NJZ A;  4WFA L;  4FLW A;  1BWF O;  2GUI A;  2O4I A;  3PSM A;  3MWT A;  3ZEU B;  3VGK A;  1Z26 A;  2BE2 A;  1GLC G;  4JKG B;  5CYQ A;  4LF4 K;  4BY9 C;  3F5T A;  4BQZ A;  2W6L A;  3L3V A;  4FM2 A;  1BA0 A;  2HBJ A;  1JL2 A;  3M6G A;  4EP5 A; 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