5AQXA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
387
structure length
387
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKSTRAAAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 118
structure length 387
sequence length 387
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqxA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqxA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqxA04
1QZ6A 1K8KB 1GLCG 2QWRA 4WQ5A 5FPDA 1Q18A 2P9NA 1E4GT 5ELZA 3MN6A 4NO7A 1E4FT 4CJ7A 3A5LC 1U2VA 3MN9A 4FO0A 5KPRA 4IJAA 5BRDA 1S22A 2KHOA 3FLCO 4MLEA 3WQTA 2FF6A 5AQIA 1KAYA 2PBDA 1LCUA 1MDUB 3O1WA 3QFPA 5KPZA 4CZKA 2YJFA 1MWMA 4BRDA 2QWLA 5AQZA 3ZETB 4WQ4A 2HOEA 4CZEA 1JCEA 1ZXOA 3QMLA 5ADXA 3C0BA 2PAVA 3WQUA 3ZX3A 3MCPA 4NB4A 4IZ9A 2QM1A 4FWQA 2P9PA 3ZEUA 4FWNA 4I6MB 1GLAG 5TKYA 4PKHA 5AQVA 2P9LB 2NZTA 3VGKA 2V7YA 3VF2A 4BRQA 5CE3A 4FWKA 3KVGA 4BGBA 2E2PA 4WQ4C 1XC3A 3CJ9A 5JMVA 3O5BA 4JHDA 3IFRA 3A8YA 3H6EA 4PL7A 4K43A 4H0YB 4FPBA 1BU6O 2CGKA 3CJBA 4FSVA 5AZJA 4CD1A 1NGBA 4EHTA 2YHWA 1RDWX 3HBTA 5AQGA 3JXUA 1ZBSA 4H5RA 4H5WA 3M3ZA 3DXKB 3MN7A 1DGKN 3VF6A 3S41A 3VEXA 1NM1A 2E20A 1KAXA 3W0LA 1YAGA 3CETA 3L4IA 3A5MC 3H46O 3GBTA 1BUPA 2FSKA 4GNIA 2FF3B 4JAXA 2F9WA 4CZHA 3LDOA 3H3OB 3HSCA 2Q2RA 4CZLA 5E84A 1NGDA 4O8KA 1YXQA 3CI5A 3EZWA 4BVOA 5FPNA 5EXWA 3GE1A 3A5OC 3QFUA 4CBXA 3KHYA 4FWMA 4CZJA 3VGMA 4BRAA 5AR0A 4EHUA 5BREA 2E1YA 2P9UB 2F9TA 1JCGA 5AQXA 2E2OA 4BR0A 2V7ZA 2VCPA 1GLFO 3J8AA 4B1XB 4J8FA 4B1UB 3FFKB 3M1FA 4H0PA 3U4LA 3UKUA 4B1WB 1QHAA 3ENOA 2QXLA 4A2BA 3IMXA 3IDHA 4FWPA 4A61A 3VPZA 3QDKA 3MN5A 2BTFA 4L3QA 4JN4A 1NGHA 2QWMA 3U8XA 5E26A 4K25A 3SMSA 3I33A 3I8BA 4BR5A 1GLBG 2P9PB 2WUSA 3HI0A 4MLHA 3VETA 2A40A 5KQ8A 3L6QA 2HF3A 4IXCA 1TYQB 4BRIA 3WT0A 4EIAA 1BOTO 3VEZA 3H3NO 2UYTA 1DEJA 4BRHA 4HWIA 2ZF5O 1T6CA 1EQYA 2QWOA 2GWKA 3KZBA 3WEEB 3AAPA 1Y64A 5AQKA 2D1KA 1SAZA 1X3NA 2GTDA 3VEOA 4MO4A 1BA1A 3FZLA 4BG8A 2HF4A 3LL3A 5AZIB 5JICA 3CJAA 1LOTB 4BR9A 4FWRA 5AQTA 3DXMA 2YCHA 3QICA 5F0XA 4H0TB 1KXPA 3EKUA 4JD2A 1IJJA 2EWSA 1SZ2A 3LDPA 5BRHA 2BUPA 4CBWA 2QWPA 5FPMA 2E2NA 3D2FB 5JLFA 2OANA 3CJ1A 3B8AX 4Z94A 2I7PA 4BRNA 3DAWA 3G25A 3VESA 4H5VA 1GLJO 2P9KB 5KPTA 2GUPA 2VYPA 2YI1A 5AQFA 5EX5A 1TUYA 3M6GA 3O80A 1WUAA 4BC3A 4MO5A 3O6WA 2QWNA 1YUWA 4HTLA 5AQOA 4BRFA 3SK3A 2IVPA 4CZGA 4H0VB 3BF1A 2AP1A 3EO3A 5AQLA 1C0FA 4FWLA 2A3ZA 3D2EB 3R8EA 3SLCA 4H03B 4BRKA 1HX1A 5LJVA 2ASPA 4BR2A 3HTVA 3ULEB 1GLEG 3SJHA 3LDNA 1X9JA 2Q1NA 3VEWA 4B1VA 2E8AA 3CIPA 1NBWA 1T6DA 3C7NB 1TUUA 3JS6A 3W3DA 1K8KA 5BN9A 1ATSA 5F2RA 1HLUA 3AAQA 3CERA 3U9DA 5EOYA 3AARA 1NGCA 2IVNA 1HKBA 3UKRB 2P9IA 5BPNA 4BC5A 3ZX2A 2D0OA 1NGJA 4BRCA 3HM8A 4CI6A 2A41A 1RFQA 3TU5A 2P9SB 4C23A 1NGFA 2IVOA 5AFUA 4YDUC 4FL9A 4QS8A 4BGAA 4PL8A 3FR0A 3FE1A 2YJEA 3VEYA 3D7EO 2YHYA 3MMVA 1BG3A 1KAZA 2P9NB 4M63C 3IUCA 4QS9A 2DPNA 2E88A 1U2VB 4DQ8A 3VGLA 4PKIA 4I6MA 1NGGA 4A2AA 2P9LA 4XH4A 3R9PA 1HPMA 1NGIA 4DCHA 4BRPA 5AQQA 4IO8A 1HKGA 3FZHA 3VOVA 4A62A 1NLVA 4EFHA 3R6MA 2AA4A 2ASOA 3ID8A 4BQZA 4BC2A 3GG4A 3ZEUB 3GL1A 4K41A 4BC4A 3UE5A 5AQRA 1U6ZA 4AM7A 5AQWA 1HKCA 4F9OA 2VWBA 3GOIA 4XEIA 2Q0RA 1MA9B 2CGLA 3H1VX 4JHDB 3MK6A 4H0OA 3VEVA 2A6AA 4RCHA 1NGEA 3BP8A 3LM9A 3OHRA 4PKGA 3UB5A 2GWJA 2ZGZA 5AZJB 4FPAA 3RSEA 1T44A 1XQSC 2Q36A 3FGUA 4O5FA 1YVNA 2V51B 1MWKA 4FOEA 5EY4A 4AM6A 5BPMA 2A5XA 2ZGYA 4B9QA 4BRMA 1X3MA 3EL2A 4IJNA 3SMPA 4QS7A 4H0XB 4H5TA 2W40A 4CZIA 4E1JA 5AQMA 1CZAN 3QBWA 1DKGD 3O8MA 3AY9A 5B8HA 5AQJA 2P9UA 1Z05A 2P9IB 1QQOA 2J4RA 2CGJA 4BRGA 2Q31A 3QBXA 1BO5O 2CH6A 2IIRA 3ATUA 1HJOA 3U9ZA 4RTFD 1RGIA 1ZC6A 3DJCA 3EKSA 4WYBA 3H45C 4CZMA 1OKJA 1BWFO 4FWSA 3WXIA 4CD3A 4BROA 3CJ7A 4ISGA 4BRLA 5LY3A 4WQ5C 4BR7A 3O08A 5BR9A 4GY2B 3HZ6A 1HUXA 3VF4A 3UKUB 3ATVA 1TYQA 5ADXH 4CBUA 3BF3A 3F9MA 4LC9B 4M7XA 5AQUA 1ATNA 3WEEA 4YDUA 2QWQA 1BA0A 5F1XA 3TPQA 1NMDA 1QQMA 4M7YA 1J6ZA 5JLHA 1G99A 1BDGA 3QB0A 4BQLA 2FXUA 4JNEA 5AZIA 2E2QA 3P4IA 3O4WA 4B1YB 1ATRA 3FZFA 4CZFA 3LDLA 2NRHA 3ZETA 4BREA 3WXLA 1IG8A 1NGAA 4DB3A 5I9EB 4H5NA 3D2FA 1R59O 3RSEB 3VERA 3FZKA 3BEXA 1D4XA 4Y0WA 2ZWHA 4XH5A 4BVPA 5LJWA 5BRFA 2A42A 4BR4A 1Z6RA 4BG9A 2P9KA 5KQDA 3DXMB 4B1ZA 3L0QA 4KBOA 4JD2B 1SQKA 3CHWA 5AQNA 2D0PA 2I7NA 3WXJA 3A5NC 1H1VA 3MDQA 4EAHD 5EVZA 4RWTA 2QW9A 2W41A 4ISEA 3EN9A 5AQHA 3WUHA 1P8ZA 2H3GX 1QZ5A 1GLLO 2ITMA 3D2EA 1NWKA 5AFUH 2Q97A 1XUPO 3DWLA 2Q0UA 3CJCA 3ULEA 3DXKA 1V4SA 3O1BA 3VENA 4DHYA 2FSNA 5BN8A 1S3XA 5BPLA 2HMPA 3H1QA 3LM2A 3FZMA 2YHXA 2CH5A 3C7NA 3CQYA 1WOQA 1V4TA 2V52B 2ASMA 2GELA 2GEMA 1C0GA 2D4WA 3WXKA 2E1ZA 3CQXA 1JCFA 2FLOA 4FWOA 3UKRA 5FPEA 1ESVA 3ZX0A 4K42A 4ISFA 3LDQA 1QQNA 3GDQA 2NLXA 3ENHA 5AQYA 4XH1A 4FOIA 3A0IX 5AQSA 2P9SA 4IWVA 5AQPA 3BUZB 2FSJA 1GLDG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5GIPA 2N69A 1B3CA 4DR1K 4WQ5A 1EETA 3VA0A 4Z4EA 1Q8IA 2VGNA 5ELZA 3EE8A 4CGJA 1U2VA 3MN9A 5KPRA 4M3WA 4FZXC 3OS2A 5BRDA 4JKFA 2FF6A 4JRPA 2PBDA 1WBDA 1LCUA 3DLHA 3O1WA 3ULDA 5KPZA 3SI6A 3PO4A 4HHTA 2ZJQL 3VQDA 2P5GA 3AVHA 5LMNK 1NKCA 5ADXA 3NVKA 3C0BA 4N5SA 3ZX3A 3MCPA 1X9SA 3CM6A 1T7PA 2UXDK 1L3TA 4YOVA 3L2UA 3I8DA 4DU1A 4IEEA 4BRQA 2KSKA 4KHNA 4FWKA 3KVGA 4BGBA 3HT3A 1QSYA 1NRBA 1RT7A 4CEAA 3NHGA 3CJ9A 4K8XA 4DV7K 1TKXA 2RPIA 2YKMA 3H6EA 3O9UA 4Z4GA 4GVEA 3R2VA 2CGKA 3CPEA 4ID5A 3KK2A 4EHTA 4W5NA 2YHWA 1RDWX 1HJRA 4JKAA 4FLTA 5AQGA 4FJXA 3JXUA 1VQNN 1UA1A 3DXKB 3VF6A 3VEXA 1NM1A 5KGWA 1SV5A 3CETA 1OVYA 4OO1J 1BUPA 4Y1DA 4GNIA 4NCAA 4IG3A 3E01A 2NRRA 3SQ2A 3HSCA 4DSFA 4ZHRA 2O8BB 3E1YA 1NK4A 5E84A 2XY7A 1NGDA 4BVOA 3NE6A 3BDPA 3QNNA 3CCLN 4CBXA 3DLKA 4CZJA 2JGUA 1NRAA 2B4JA 5BREA 3C6HA 1YITN 3IRXA 4JKCA 4E7IA 2HNYA 1WSJA 2P9UB 1JCGA 2ZE2A 1EX4A 2D0AA 2RHKA 1WT7A 3ID6A 4KHUA 3J8AA 2YBRC 3PIOL 4CIEA 3SBTA 4B1UB 3SUQA 4C1NI 3FFKB 4JKEA 3DOKA 4J2DA 1QHAA 4DTMA 1KV0A 2QXLA 4NLCA 3OYGA 1K6YA 2B3CA 3IMXA 1UAXA 3HO1A 4DTNA 1IO2A 4A61A 1VQON 3SJJA 2YHBA 2BTFA 3E9LA 4CEDA 4JN4A 4CFBA 3NF9A 4HUEA 4E0DA 2P9PB 4KFBA 4MLHA 2A40A 3I55N 4BE2A 3L6QA 4HUFA 1TYQB 4EIAA 4LF6K 1RDUA 3VQQA 4DQPA 4IDKA 2LSNA 4HWIA 2VG5A 3K59A 1VQLN 3KLHA 1KFDA 4YOUA 3GKUA 1TKZA 4MO4A 5I42A 1LAVA 1BA1A 5IWAK 3LZIA 3KLGA 3LL3A 5JICA 3CJAA 1LOTB 2F8SA 1TVRA 3EE9A 1OH5A 2O8FA 4FWRA 5M1QA 3AVFA 5F0XA 4DQSA 4FVMA 1NJYA 4K0KK 4OVLA 1WB9A 4CBWA 2QWPA 5FPMA 2XHBA 3CW4A 2KKZA 2HHIA 1WSEA 2YNFA 1XI1A 4KAZA 4BDPA 3G25A 3T7ZA 4CIGA 4DUZK 5KPTA 2KW4A 2C1GA 5EX5A 2YX6A 1TUYA 3M6GA 3O80A 4BC3A 3ZT1A 3DRRA 3R1XA 5AQOA 4W5TA 2IVPA 4IG0A 1KTQA 2HHTA 4OLBA 4MQ3A 1WAFA 3R8EA 3WNFA 4E19A 1NK7A 5C2DA 4FCYA 1HX1A 1NNEA 5LJVA 2ZJPL 2KBJA 3ULEB 4E1NA 3O9SA 3DM2A 1I6GA 1HYSA 2Q1NA 2R7YA 4JKGA 2E8AA 3VQ5A 1T6DA 3M8PA 1TUUA 1VSJA 4IFYA 2PY5A 2UXBK 5A2QO 3KOZA 1HLUA 3AAQA 4JI4K 4F4KA 3AARA 1HKBA 5LL6Z 4DFJA 1S1VA 1TV6A 3V1QA 3ZX2A 4BC5A 4CJ4A 4CEZA 1YF5L 4DMNA 4CJFA 2D0OA 1K9MO 3TU5A 1RFQA 2G8VA 4FJIA 2P9SB 4YDUC 3WNHA 3BK3C 3OJSA 3M8SA 2HHWA 3QIPA 3FE1A 3D7EO 2YHYA 3MMVA 1ITGA 4CJEA 4M3UA 3KIOA 4QS9A 3J7AP 2DPNA 1U2VB 1NGGA 4KHQA 2LR3A 1RT5A 3EY1A 3E66A 4LFCK 1XHZA 4IO9L 3R9PA 5TKWA 3NMUA 2Z1GA 3QERA 2F4VK 4A62A 1NLVA 1SN1A 5CYQA 3L3VA 1B9DA 2YHAA 4K41A 1P0AA 3UE5A 1NKEA 1VRUA 2QKBA 3DLEA 3PIPL 2F7TA 4FYDA 1BQMA 2VWBA 1BI4B 3GOIA 3PLAA 4H0OA 4Z4IA 1NGEA 4PKGA 4N56A 1NPIA 3O9QA 4CGGA 2PFUA 3LZJA 1IBLK 3CYMA 4FPAA 4I2QA 2YILA 1WWNA 3I0SA 1J9AA 4B8CA 1MWKA 4EP4A 2JDQD 2KZZA 3LWLA 2ZGYA 4FLWA 5J2NA 4B9QA 3U3YA 4BRMA 4IJNA 1DQ7A 1SS6A 1X3MA 2GX9A 4DFPA 1CZAN 1DLOA 3QBWA 1DKGD 3VQEA 1EWRA 1VHXA 1Z05A 3AVIA 1TK0A 5CYMA 2ZD1A 4CEEA 3QBXA 3HYFA 1BO5O 5KI6A 2XO7A 1HJOA 4RTFD 3ZCMA 3OA9A 1L3SA 4WYBA 4IKFA 4KB1A 1OKJA 2N66A 2GUIA 4FWSA 1RT6A 4ISGA 4L8RB 4WQ5C 1OMYA 1TL1A 3O08A 4LD0A 4CJPA 1VNAA 2NUBA 1T0ZA 1D5AA 2VWKA 3ZSRA 4GY2B 4LFAK 3CF5L 3O4NA 1RDBA 3VF4A 2OTJN 4CHPA 1WSHA 5ADXH 3P38A 4CF9A 3F9MA 1SL0A 4KHWA 4PQUA 3AO2A 1JL2A 2KQ2A 1ATNA 3ZSWA 1Z26A 3NVMA 1JLCA 4YORA 4AQYK 4JI1K 3T19A 1N33K 3TPQA 1NMDA 5C2FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5GIP A;  2N69 A;  1B3C A;  4DR1 K;  4WQ5 A;  1EET A;  3VA0 A;  4Z4E A;  1Q8I A;  2VGN A;  5ELZ A;  3EE8 A;  4CGJ A;  1U2V A;  3MN9 A;  5KPR A;  4M3W A;  4FZX C;  3OS2 A;  5BRD A;  4JKF A;  2FF6 A;  4JRP A;  2PBD A;  1WBD A;  1LCU A;  3DLH A;  3O1W A;  3ULD A;  5KPZ A;  3SI6 A;  3PO4 A;  4HHT A;  2ZJQ L;  3VQD A;  2P5G A;  3AVH A;  5LMN K;  1NKC A;  5ADX A;  3NVK A;  3C0B A;  4N5S A;  3ZX3 A;  3MCP A;  1X9S A;  3CM6 A;  1T7P A;  2UXD K;  1L3T A;  4YOV A;  3L2U A;  3I8D A;  4DU1 A;  4IEE A;  4BRQ A;  2KSK A;  4KHN A;  4FWK A;  3KVG A;  4BGB A;  3HT3 A;  1QSY A;  1NRB A;  1RT7 A;  4CEA A;  3NHG A;  3CJ9 A;  4K8X A;  4DV7 K;  1TKX A;  2RPI A;  2YKM A;  3H6E A;  3O9U A;  4Z4G A;  4GVE A;  3R2V A;  2CGK A;  3CPE A;  4ID5 A;  3KK2 A;  4EHT A;  4W5N A;  2YHW A;  1RDW X;  1HJR A;  4JKA A;  4FLT A;  5AQG A;  4FJX A;  3JXU A;  1VQN N;  1UA1 A;  3DXK B;  3VF6 A;  3VEX A;  1NM1 A;  5KGW A;  1SV5 A;  3CET A;  1OVY A;  4OO1 J;  1BUP A;  4Y1D A;  4GNI A;  4NCA A;  4IG3 A;  3E01 A;  2NRR A;  3SQ2 A;  3HSC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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