4WYBA

Structure of the bud6 flank domain in complex with actin
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
367
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein/protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structure of a Bud6/Actin Complex Reveals a Novel WH2-like Actin Monomer Recruitment Motif.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 96
structure length 357
sequence length 367
chains with identical sequence C, E, G, I, K, M, O, Q, S, U, X
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4wybA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4wybA04
5KQDA 5BRDA 1C0FA 4FWSA 4DB3A 3MDQA 1YVNA 2HMPA 2ASMA 3IMXA 3SLCA 5KPTA 5BN8A 4ISEA 4JD2B 1QZ6A 3ULEA 4BG8A 4BGAA 1G99A 2E2OA 3VGLA 1TUYA 3C7NA 2QWNA 1P8ZA 2Q1NA 3VPZA 3R8EA 3ZX3A 4CZEA 4RWTA 1TYQB 1V4SA 4K43A 2P9IB 3MK6A 3H3NO 4WQ5C 4FWMA 2QXLA 4FL9A 4BC2A 4EFHA 4K41A 3ZEUA 4WYBA 3KHYA 3RSEB 3UKRA 2ZGZA 1TYQA 3O8MA 5AZJA 2GWKA 5AQPA 3EKUA 3QFUA 4JHDB 5LY3A 4MO4A 3HBTA 5AQYA 1SZ2A 5F2RA 4CD1A 3HI0A 3H6EA 4QS7A 1ATRA 3GDQA 4H0OA 1Z6RA 1DGKN 4FOEA 2OANA 3WEEB 2NRHA 3CHWA 5BPLA 3O08A 2D4WA 3FFKB 4O5FA 4BVPA 3LM9A 5AQVA 4CBUA 5E26A 5BRHA 3GG4A 1DKGD 1XQSC 5E84A 3DXKA 2P9UB 5JMVA 3L0QA 1HPMA 3H1QA 1WUAA 5FPMA 1ESVA 3HSCA 4BRNA 5AFUH 2A40A 4XH1A 1QQOA 3MN5A 5BREA 2QWPA 4IWVA 1MWKA 1V4TA 3FLCO 2YI1A 2A42A 2A41A 3D2FB 3FZLA 4GNIA 5AQZA 3VERA 3VETA 3DXMA 2QWMA 2A3ZA 2CGKA 4XH5A 1LOTB 2QWRA 3U9ZA 4MO5A 3AARA 3KZBA 5EXWA 1GLBG 1BUPA 5AZIA 4K42A 1T6DA 1S3XA 4CJ7A 2P9PA 4BQLA 5AQNA 2FXUA 4EHUA 4BR5A 3SMSA 1JCEA 5EX5A 1GLCG 1NGEA 3IDHA 5ELZA 4NO7A 3FZHA 2BUPA 3CQYA 4IO8A 2P9SA 4IJNA 1BA0A 3JXUA 4BR7A 4A62A 2P9NB 3SMPA 3CERA 4M7XA 1BO5O 1T6CA 3VEOA 1ATNA 4B1VA 5EVZA 1NGCA 4H5WA 2A5XA 4CZKA 5BPNA 1GLLO 2P9NA 5CE3A 3ENOA 3M6GA 2P9LB 3LL3A 5JICA 4H5RA 3M1FA 3LM2A 2ASPA 1IJJA 5AQSA 1ATSA 4CZGA 1R59O 4FWKA 5BN9A 2W40A 4HTLA 4BRLA 2NZTA 3ATUA 5EY4A 3QBWA 4BR2A 5AQTA 2CGLA 1SQKA 2V51B 3ATVA 1GLEG 2KHOA 3AAQA 4BRHA 3LDOA 1IG8A 1GLAG 5FPNA 1XUPO 2FF3B 4EAHD 4BRGA 3TPQA 5ADXH 4ISGA 1K8KB 5FPEA 3WXKA 3R9PA 4FOIA 1HKGA 4YDUA 3IUCA 2D1KA 2GWJA 3WXLA 1NGFA 5AQWA 4JD2A 3ZX2A 5KPRA 4BR4A 5AQXA 3LDPA 4PL8A 5AQJA 2P9IA 5AQGA 3UE5A 3VENA 3FGUA 3OHRA 3EL2A 5FPDA 2ZF5O 4FWOA 4JAXA 3RSEA 2Q31A 1U2VB 1EQYA 3QDKA 5LJWA 3U8XA 4FWLA 1BA1A 3DJCA 4JHDA 4PL7A 2GEMA 3FZFA 3H1VX 3CQXA 5AQLA 3MCPA 3WXJA 2QW9A 4L3QA 1NM1A 3MN7A 4MLHA 3QFPA 3WEEA 5F1XA 2FLOA 3VEXA 4BRPA 3D2EB 3EN9A 4B1ZA 1RFQA 2WUSA 2P9KB 3MN9A 2YHXA 1Z05A 2E8AA 3GBTA 2P9UA 1BDGA 2E1ZA 1NWKA 3CJ7A 1YAGA 1KAZA 1BOTO 3P4IA 1KXPA 4BG9A 4RCHA 1H1VA 1X9JA 4O8KA 1HLUA 4LC9B 1BU6O 1QQNA 5LJVA 4EIAA 2YHWA 1X3NA 1QZ5A 3QB0A 4DQ8A 5AQFA 2DPNA 5EOYA 2EWSA 4YDUC 4B9QA 4BRFA 2YJFA 5JLFA 3D2FA 1RGIA 3WT0A 3FE1A 1NMDA 1CZAN 2I7NA 2E2NA 3LDNA 4H0TB 4BRKA 4CD3A 5KPZA 3CI5A 2ZWHA 3CIPA 4A2AA 1Y64A 1KAYA 2VWBA 2Q2RA 2QWOA 4XH4A 4RTFD 5BRFA 4M63C 4NB4A 3JS6A 4CZMA 1BG3A 1X3MA 1T44A 1HKCA 4CBWA 4IJAA 4GY2B 2E2PA 2PBDA 1GLDG 4HWIA 2QWQA 1LCUA 5BR9A 3A5OC 3AAPA 3R6MA 4DCHA 4CI6A 5BPMA 3VEZA 3U9DA 1QHAA 2UYTA 3L6QA 4F9OA 1RDWX 4H0PA 2A6AA 1C0GA 1GLJO 4CZIA 1ZBSA 5AFUA 3CJBA 3VEYA 3MN6A 1ZXOA 2P9LA 3A5MC 4I6MB 1NGBA 2ZGYA 3UB5A 4A2BA 1HKBA 4ISFA 3QMLA 1TUUA 4E1JA 1XC3A 2AP1A 5I9EB 2YJEA 2V7YA 3MMVA 3HM8A 3UKUB 1DEJA 2CH5A 3GOIA 3S41A 3VGMA 5AR0A 4BC3A 1QQMA 3VESA 1S22A 3O80A 2FSNA 3SK3A 5KQ8A 2CH6A 3D7EO 3UKUA 1NGIA 4DHYA 1ZC6A 4B1XB 3O1BA 3VF4A 5JLHA 4H0XB 2QWLA 2J4RA 3BEXA 1HJOA 4FO0A 2V7ZA 2HF3A 1BWFO 2HF4A 3A5NC 4M7YA 1K8KA 3G25A 3QICA 5AQIA 5TKYA 4FWNA 3CJ1A 4H0YB 2ASOA 3I8BA 3ULEB 5AQQA 4K25A 3C7NB 2E88A 4FPAA 4BQZA 2Q36A 4BRCA 4BC5A 4H5TA 3U4LA 1J6ZA 3TU5A 2I7PA 4Z94A 3EZWA 1U6ZA 3ZEUB 4BVOA 4MLEA 3UKRB 5AZJB 3VEVA 2VYPA 1U2VA 3VF2A 2HOEA 4BRAA 3H45C 3VGKA 4AM7A 1NLVA 2V52B 2YCHA 3A8YA 3AY9A 4CZJA 4CZHA 3ZETB 4B1WB 5AQHA 2QM1A 2CGJA 2IVOA 2E2QA 3O4WA 1HX1A 3O6WA 5AQKA 1D4XA 3LDLA 3EO3A 3ZX0A 3DWLA 3O1WA 4FWQA 2GTDA 4C23A 1MDUB 1KAXA 4KBOA 3D2EA 4QS9A 3ZETA 3ID8A 4BGBA 2P9KA 3CETA 3DXKB 3CJ9A 3WQTA 1HUXA 2Q97A 4WQ4A 1Q18A 4FWRA 2BTFA 5ADXA 1YUWA 3C0BA 2IVNA 3J8AA 2GUPA 3A5LC 2H3GX 3O5BA 5B8HA 3GL1A 4CZLA 4H5NA 4B1UB 2NLXA 4H03B 4XEIA 4CBXA 1E4FT 1YXQA 1WOQA 2FSKA 3DXMB 3IFRA 3M3ZA 3A0IX 1MA9B 2D0PA 2ITMA 3F9MA 5AZIB 1GLFO 2PAVA 4Y0WA 4BRDA 2AA4A 2E20A 2P9PB 3H46O 3L4IA 1OKJA 2FSJA 1SAZA 4B1YB 3BF3A 2Q0UA 2P9SB 3I33A 2GELA 5AQUA 4A61A 2F9WA 3WQUA 2VCPA 3WXIA 4PKIA 3BUZB 3W0LA 3ENHA 4IZ9A 4BRMA 4AM6A 2YHYA 4QS8A 5AQOA 1NBWA 5AQRA 1MWMA 2IIRA 3CJCA 3CJAA 3FR0A 3DAWA 3B8AX 4WQ4C 4CZFA 4I6MA 2FF6A 3LDQA 5AQMA 4BC4A 4BREA 4WQ5A 3HTVA 3BP8A 2IVPA 4JN4A 4FWPA 3GE1A 4FPBA 2Q0RA 1NGHA 4BROA 3EKSA 3VF6A 1JCGA 5F0XA 2D0OA 2F9TA 4PKHA 3W3DA 3FZMA 4H0VB 4EHTA 2E1YA 4FSVA 1NGJA 2W41A 1NGAA 4IXCA 4J8FA 4H5VA 3HZ6A 4BR9A 3KVGA 3QBXA 4BRQA 4BRIA 1NGGA 3WUHA 3VEWA 4PKGA 1E4GT 1JCFA 3BF1A 4BR0A 3FZKA 3SJHA 3H3OB 1NGDA 3VOVA 4JNEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BRDA 4DFMA 3MDQA 4K8ZA 2HMPA 5J2MA 4LFCK 2ASMA 3IMXA 3RVCA 1KQSM 4CHQA 5BN8A 1REVA 1SV5A 3CCLN 3ULEA 4BGAA 3THXA 1BCOA 3VPZA 1VSMA 1W97L 2O8BA 2Q1NA 4C8MA 1V4SA 4YHHK 4FCYA 2P9IB 3SQ4A 1UA1A 4OO1J 1WSIA 1S1WA 1O1WA 4KO0A 4FWMA 4FLUA 2ZGZA 4MO4A 3HBTA 2OPRA 4HTUA 4H0OA 1IBLK 5GIPA 4CJKA 2BGGA 4DV3K 3KLFA 3CHWA 3O08A 1DLOA 4DFPA 1BQMA 4LY7A 4KAZA 4I2QA 4E72A 5E26A 3ZLJA 1RBVA 1S5JA 1XQSC 1ZBIA 3DXKA 5JMVA 2QEXN 3L0QA 3H1QA 5M1PA 1WUAA 1ESVA 4BRNA 4DLGA 1EWRA 3D2FB 3PV8A 3VETA 2Y1IA 1LOTB 3U9ZA 4CJ4A 2NRWA 1BUPA 3U3YA 4M3UA 2KZZA 1T6DA 4U67L 4CHOA 4DTJA 3HPGA 4CGJA 3LANA 3N4QA 5JENA 1JCEA 4OJRA 1GLCG 3OJSA 3IDHA 3E66A 5ELZA 3CQYA 4IO8A 4C8KA 3K5NA 1SL0A 2P9SA 1UOCA 1BA0A 4A62A 4FLWA 4CW7B 2IDOA 3CERA 4OVLA 4DTUA 3VEOA 2PZSA 4FZXC 4A5BA 5EVZA 4Z0UA 3F73A 2QA4N 5C10A 4W5RA 4NYNA 5CE3A 4NCBA 3C94A 4RW4A 4EZ6A 1NK8A 1U48A 3B6PA 3SI6A 2P9LB 2YKNA 3VA3A 4ZTJA 3NF7A 4DWIA 5JS2A 4WF9L 3CF5L 3ZSRA 3L2QA 1S1TA 4IOCL 4DR1K 1W9HA 4HTLA 5KGXA 4BR2A 3QBWA 4CIFA 1SQKA 5LL6Z 2UUCK 3SUOA 2KHOA 3CQ8A 3LDOA 2HHXA 4DTNA 4CHYA 1IG8A 4R79A 4GKKK 2F8TA 3OYAA 1K8KB 1C0MA 5LMNK 1Q9YA 2O8DA 3CC7N 4FOIA 1TL1A 2O8EB 5M1QA 1HKGA 2D1KA 2GWJA 3WXLA 2UXCK 2GBZA 4Z4HA 4AHTA 3ZX2A 5KPRA 5HRPA 3LDPA 4Z4IA 3OYBA 5AQGA 2OA8A 2RKIA 3BY5A 2E6LA 3NH0A 3OHRA 3EL2A 2VWKA 4J2AA 3OYDA 4FWOA 4JAXA 1NK9A 3BZKA 3K0SA 5JVHL 4FWLA 4LF6K 1VSFA 1YTUA 4O55A 3H1VX 3CQXA 1KFDA 2OPSA 3JSMA 3QFPA 3CCEN 3G0ZA 5F1XA 4R5PA 3OBWA 1OVYA 4KHNA 3MEDA 2P9KB 1KD1O 1Z05A 1Q9XA 2P9UA 1BDGA 1BOTO 4E1NA 2VWJA 3HPOA 4DUZK 1S1VA 1BU6O 4B9VA 2D0AA 2YHWA 1X3NA 1S9GA 4KHUA 4B9TA 2EWSA 4YDUC 4B9QA 2DY4A 1VQKN 1VQ9N 1RGIA 3FE1A 1CZAN 2I7NA 2E2NA 2ZD1A 2OYQA 1C0TA 1Y64A 2VWBA 3R1XA 4CIEA 4I9QA 3MXJA 4NLBA 1TL3A 2KQ2A 1T44A 4DLEA 1VSHA 4CBWA 4KHYA 2E2PA 5KGWA 1IBMK 5BR9A 3VQPA 2W6KA 4FJKA 1N6QA 4CI6A 3AA5X 3SPZA 3U9DA 3AVKA 2UYTA 4NYFA 4DQIA 3DI6A 1RDWX 4FW2A 5AFUA 1ZBSA 3VTIA 3B6OA 3OYKA 1QVFM 3VEYA 3CCSN 1ZXOA 1S6PA 4OGCA 3TSPA 1NGBA 3UB5A 4CEZA 5FRMA 2FBYA 4QCLA 1TUUA 4FK4A 4WCEL 2YJEA 5J1EA 3P31A 3TTDA 1C1BA 3V9SA 4E89A 4CK2A 1NK5A 3MMVA 4HUGA 4AHRA 3VGMA 4CGGA 1VQ4N 4LFBK 3LALA 4BC3A 1IKVA 2FSNA 5KQ8A 2OTJN 2OPPA 2HSTA 3D7EO 3DLBA 3DYAA 4B1XB 3O1BA 5JLHA 2NRRA 3EY1A 1RBRA 1RT1A 1TKXA 1HQUA 2QWLA 1HJOA 1VQ8N 4CFAA 2EX3A 4M7YA 4M45A 1NJZA 3QICA 5AQIA 3DLRA 3G71N 1RT3A 4FWNA 3N4PA 3HM9A 5DM6L 3I8BA 3ULEB 3TABA 3THXB 2O8BB 4YOXA 1ZBHA 4BRCA 2OZSA 4H5TA 3IRXA 3LP1A 4H4MA 1LW2A 3U4LA 3TU5A 2I7PA 4Z4CA 4MDAA 4MLEA 3BGRA 1Y97A 1RT6A 1RDBA 4M3WA 1J54A 3H45C 2E5LK 3HJFA 2P1JA 2VQEK 3VQAA 3A8YA 4CZJA 2WFBA 3SAFA 2IVOA 4JI5K 4GVMA 1HMVA 2GTDA 4KBOA 3ZETA 1NJWA 4QS9A 4KV8A 1ASWA 3ID8A 3DXKB 2HNZA 1HUXA 4F2RA 3NGZA 3ZSYA 3OYNA 3J8AA 2GUPA 3A5LC 3D6RA 4IG3A 4JRPA 4CE9A 4H03B 1HQEA 3TAFA 4OX9K 2VG5A 4CK3A 3IAYA 1RDDA 3M8PA 3A0IX 2D0PA 2ITMA 4HHTA 3F9MA 4DTXA 1Q82O 4BEBA 4BRDA 1TAUA 3H46O 3D0PA 3HP9A 2VQFK 3AVFA 1YIJN 3O4NA 3QNOA 1DTQA 1SAZA 2B4JA 5KI6A 3VTHA 1XC9A 2Q0UA 4X66K 2P9SB 5AQUA 4A61A 4IZ9A 4BRMA 5AQRA 1VK0A 2IIRA 4CEBA 2G8UA 3FR0A 3B8AX 4I2PA 3SZ2A 1U45A 2F96A 4YOVA 3AVMA 4DSLA 3LDQA 3LAKA 3F5TA 4FWPA 4XJXA 1RT5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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