4WYBA

Structure of the bud6 flank domain in complex with actin
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
367
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structure of a Bud6/Actin Complex Reveals a Novel WH2-like Actin Monomer Recruitment Motif.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 96
structure length 357
sequence length 367
chains with identical sequence C, E, G, I, K, M, O, Q, S, U, X
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4wybA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4wybA04
4E1JA 1YUWA 3HM8A 3QMLA 5LJVA 3C7NA 3VOVA 2ZF5O 4FL9A 1ATNA 3VGMA 5JLFA 4ISGA 2D1KA 2E2QA 3FZFA 4PKGA 1ATSA 3VF6A 1NGGA 5EOYA 3ZX0A 2QWNA 3ZEUB 4AM7A 1JCFA 3BF1A 4CI6A 3H46O 3M1FA 3VEYA 3LDNA 4CZIA 4CZJA 3QICA 4BVOA 3ZETA 1U2VB 1LCUA 4FSVA 2CGLA 5FPNA 1V4SA 4PL7A 1NGBA 3EKSA 1BG3A 3JS6A 3I8BA 2WUSA 3W3DA 1NLVA 3A8YA 1KAZA 3VETA 4B1XB 2ZGZA 4FO0A 3QBWA 1QQMA 3ID8A 2E1ZA 1ZC6A 2D4WA 2YJFA 4BVPA 1MWMA 1QHAA 3A5LC 1ESVA 3M3ZA 4RTFD 3UB5A 3D2EB 3S41A 4H03B 5AQOA 2HOEA 3MDQA 3CIPA 2VYPA 5AQHA 4FWKA 1LOTB 1KAXA 1ZXOA 1U6ZA 4FWOA 2NZTA 3DXKB 4HWIA 3EZWA 4XH5A 3W0LA 2V52B 2GEMA 1QZ5A 4M63C 3MK6A 4JNEA 4JHDB 2BTFA 4ISEA 1RFQA 1DGKN 3FLCO 3MN5A 2YJEA 3FGUA 2V7YA 1JCGA 3VEOA 5AQJA 4CD3A 3BP8A 2F9TA 4JAXA 4BC2A 2W40A 4BC3A 1GLBG 4KBOA 1HPMA 5AQMA 4B9QA 4BRHA 2A40A 1J6ZA 3LL3A 5FPDA 4EIAA 4H5NA 4L3QA 5AQVA 3ENOA 4BR4A 2P9PA 4A61A 3ENHA 3QFUA 4CZKA 2OANA 1MDUB 3CJ9A 2YCHA 4H5TA 2V7ZA 5JLHA 4BRIA 3VESA 4CD1A 2P9LB 1QQOA 2FF3B 2YI1A 4QS8A 4WQ4C 5E26A 3CJAA 3R9PA 1GLEG 1IG8A 3DWLA 2Q36A 3UE5A 3HZ6A 3WEEB 2VWBA 1NBWA 3QDKA 3AAPA 3C7NB 2YHXA 3F9MA 3FZHA 3U8XA 3LDPA 3L6QA 1BUPA 3UKUA 3AY9A 2QWPA 3UKRA 5LY3A 3LDOA 4BRFA 4BRMA 2ITMA 1KXPA 4RWTA 4PKIA 3SLCA 1NGDA 1SZ2A 3WQTA 3ZETB 5F1XA 2ASMA 4IJNA 5BRFA 1T44A 2ASOA 3VENA 1Z05A 5AZIA 4B1VA 3BEXA 3WUHA 2QWRA 4BQLA 2GUPA 1S22A 3IUCA 5AQUA 3CI5A 4H5RA 4CZGA 3FE1A 2NLXA 1GLAG 4BRAA 2IVNA 5ELZA 3O80A 1ATRA 2I7PA 3CJ1A 3D7EO 4IO8A 4F9OA 4H0XB 3R6MA 3H1QA 5BPLA 2FXUA 4MO4A 4A62A 4A2AA 5AFUH 4DQ8A 3MN7A 4IWVA 5AQZA 4WYBA 4Z94A 2A5XA 5F0XA 3QFPA 2E2PA 4CBUA 3VEVA 3MN6A 2E20A 3FZMA 2HF3A 4PL8A 1P8ZA 2DPNA 1HKCA 2FF6A 2P9UA 5B8HA 4H0OA 4AM6A 1WOQA 4M7XA 1Q18A 5JMVA 1H1VA 4CZFA 1BWFO 5BR9A 5JICA 4JN4A 2PAVA 5EY4A 4BR0A 2BUPA 2H3GX 3BF3A 5TKYA 4EHTA 3BUZB 4I6MA 2D0PA 4CZHA 1YXQA 2Q1NA 3EO3A 4BREA 3OHRA 1WUAA 3IFRA 4B1WB 4A2BA 4FOIA 1NGHA 2I7NA 3WXKA 4EHUA 1TUYA 1BDGA 1Y64A 2P9PB 2QM1A 4BC4A 2P9IA 1GLCG 1E4FT 3SK3A 1Z6RA 2GWJA 2P9KA 2QWLA 5AQFA 2FLOA 4BG9A 4C23A 4FPAA 1TYQA 5EX5A 1NWKA 4XH1A 2ASPA 2CGJA 3DAWA 3HTVA 5BN9A 1X3NA 5AQLA 3G25A 5KPRA 3LDLA 4WQ5A 5LJWA 4BR2A 3CJBA 3UKUB 5AQPA 3O5BA 3CQYA 1K8KA 3UKRB 4BRNA 1T6CA 1NM1A 2A41A 3U4LA 4B1YB 1S3XA 1GLFO 3VEXA 2ZWHA 4BRDA 3ULEA 4LC9B 2J4RA 1X9JA 4Y0WA 1OKJA 4FWLA 3WXJA 2QWMA 4BRCA 3H3OB 3SMSA 1GLDG 5AQGA 5AQKA 1RDWX 3AAQA 3I33A 5AQQA 3ATUA 5AZIB 2Q0RA 3EN9A 1NGEA 2CGKA 3LM9A 1KAYA 3H6EA 3VF4A 4H5VA 3TU5A 3H45C 4B1UB 3FZKA 4YDUA 2GWKA 2Q31A 3ZX3A 4BRKA 5AQRA 3LDQA 5CE3A 1NGFA 3CHWA 3IDHA 5AQYA 3SMPA 1HKGA 2KHOA 3R8EA 3H3NO 1GLLO 1C0FA 3RSEA 2GTDA 3ZX2A 3CETA 4BROA 4CZLA 4B1ZA 2P9UB 5BPMA 5BRDA 1R59O 2YHYA 3GDQA 3WXLA 4FWPA 2Q0UA 2QXLA 4BR9A 4BRGA 3D2FA 3MCPA 4ISFA 3DXMA 4H0TB 2P9NA 3VGLA 4K25A 2PBDA 3O1WA 4I6MB 3VF2A 3WQUA 1BA1A 3L0QA 4JD2A 4BQZA 4K42A 1CZAN 1G99A 4K43A 4FOEA 4BGBA 2E8AA 1BU6O 3LM2A 4IXCA 5KPTA 2IVPA 3VEZA 4M7YA 5E84A 5AR0A 5AQWA 1V4TA 4FWRA 2Q2RA 5FPMA 4BRPA 1EQYA 3A5MC 4BGAA 4EFHA 2EWSA 4CJ7A 2E88A 4MO5A 4BRQA 2E2NA 1TYQB 2F9WA 2QWQA 2IIRA 1YVNA 3H1VX 1SAZA 1JCEA 2P9SA 4NO7A 3KHYA 2ZGYA 4MLEA 2A3ZA 4EAHD 3GE1A 5EXWA 5AQTA 1MA9B 1XUPO 3SJHA 3O6WA 2YHWA 3WXIA 5BRHA 2HF4A 4BR5A 1NGCA 5KQ8A 1K8KB 3GL1A 2W41A 4BR7A 4IZ9A 4QS7A 2AP1A 3A0IX 5AQXA 1T6DA 2FSJA 3U9DA 2GELA 2AA4A 1SQKA 3ULEB 4DCHA 1TUUA 1NGJA 3VERA 3ATVA 3O4WA 5AZJA 3FR0A 4FWQA 2VCPA 3O1BA 4QS9A 2Q97A 3FZLA 4J8FA 3GOIA 5AQSA 1QZ6A 3GBTA 4CZMA 2E2OA 4PKHA 4WQ4A 4O8KA 4FWMA 1BO5O 2V51B 3TPQA 3ZEUA 3HSCA 4MLHA 1YAGA 3DJCA 1HKBA 1U2VA 4H0YB 1XC3A 3CJCA 2QWOA 2CH5A 5EVZA 1D4XA 1HLUA 4IJAA 2QW9A 3VGKA 3M6GA 1BA0A 1NGIA 3EL2A 4HTLA 4K41A 3RSEB 4FWNA 2HMPA 5AQIA 3U9ZA 4CBWA 3L4IA 3QB0A 3AARA 1X3MA 5F2RA 4H0VB 3D2FB 5ADXA 3D2EA 1BOTO 2D0OA 3DXMB 5BREA 2P9NB 3C0BA 5FPEA 3VPZA 3A5OC 4BG8A 4BC5A 2IVOA 3J8AA 4JD2B 4H5WA 1HUXA 3MMVA 4RCHA 3FFKB 3HBTA 4FPBA 3DXKA 5BN8A 2FSKA 3QBXA 4O5FA 1NMDA 3CQXA 4NB4A 3A5NC 2E1YA 1DEJA 3B8AX 3EKUA 3P4IA 1C0GA 1NGAA 5AQNA 4DHYA 3O08A 4DB3A 4WQ5C 4FWSA 4JHDA 2CH6A 5I9EB 5AFUA 1ZBSA 3MN9A 3VEWA 4CZEA 2A42A 1MWKA 4XH4A 2NRHA 4BRLA 2P9SB 1DKGD 3JXUA 1QQNA 1HJOA 1HX1A 3KZBA 4GY2B 4GNIA 2FSNA 3GG4A 5KPZA 4CBXA 3HI0A 1RGIA 1IJJA 3O8MA 4H0PA 5KQDA 2A6AA 3WT0A 2UYTA 5ADXH 3CJ7A 2P9LA 3IMXA 1GLJO 3CERA 3KVGA 5BPNA 1E4GT 2P9IB 5AZJB 4YDUC 4XEIA 1XQSC 2P9KB 3WEEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HM8A 5LJVA 1Q81O 3I0RA 3VOVA 2ZF5O 3VGMA 5JLFA 1IKXA 2B6AA 1LW2A 3OW2M 2E2QA 3WNHA 4PKGA 1TK0A 4BDYA 5EOYA 4KTQA 2HSTA 1VQ4N 4FW2A 1OH8A 3NBPA 4CIEA 4CI6A 3VEYA 1Q86O 3M8PA 4A5AA 3RR7A 4BVOA 1S1XA 3ZSXA 4J2BA 1LCUA 4FSVA 3QIPA 4K8XA 2C1IA 4CK2A 4OPKA 3KLGA 4M3XA 3LWMA 1A5XA 1NGBA 1TV6A 3V1OA 1IV0A 3LAMA 3A8YA 4BDZA 2IGIA 2Z1GA 3HJFA 2E1ZA 3KIOA 3A5LC 1ESVA 1K73O 1K9MO 5AQOA 2HOEA 4CGDA 3MDQA 2IDOA 4E72A 3NF6A 4WF9L 2BDPA 1NKEA 4CEAA 3LZJA 1ZXOA 1BQNA 3OS0A 2NZTA 3EZWA 4FLTA 3K5NA 3E66A 4OKEA 4E7HA 4PHTX 3VQQA 5C15A 3OYJA 4JHDB 3AVJA 1VK0A 1S6QA 3SPYA 1RFQA 3IRXA 4FZZA 1VRUA 2B5JA 4JAXA 4BC2A 4BACA 1KSPA 4FLWA 4KBOA 1TKTA 4OVLA 1LWCA 4PQUA 5FPDA 4EIAA 4H5NA 3WNGA 4L3QA 5AQVA 3HPGA 4MQ3A 3NDKA 1Y97A 1N36K 3QFUA 2GBZA 2ZE2A 3MEEA 4BEBA 3CJ9A 2NRXA 2VWKA 4CGJA 2FF3B 4IOCL 4WQ4C 2UUAK 5CHIA 4WFNL 3L2VA 1IG8A 3DWLA 4JKDA 3HZ6A 4W5QA 5J2MA 1NBWA 3AAPA 3KK7A 4IEIA 4CF9A 3F9MA 3DM2A 3LDPA 1RTDA 1VQ7N 4N5SA 1YJ9N 3OYEA 3SBTA 1KLMA 1QSSA 4BRFA 3L2QA 2OPPA 4Z0UA 1UOCA 1U04A 3NH0A 5F1XA 2ASOA 2QK9A 4E3SA 4RW8A 3B6PA 4DU1A 1U45A 4BQLA 2GUPA 1QSLA 3VQBA 3PX0A 3P5JA 3FE1A 2NLXA 3PV8A 4BRAA 5KTQA 1SL2A 5HP1A 3ZSQA 3IKMA 5ELZA 4NCGA 1TGOA 3SQ4A 5C2FA 4F9OA 3R6MA 5GADP 4WFBL 5BPLA 3CC2N 1ASWA 2KQ2A 4KPYA 4A2AA 4FJNA 2YX6A 3MN7A 4DR3K 2UXBK 4W5OA 3QFPA 2E2PA 4DV7K 3AVIA 4CBUA 2JGUA 2XY7A 4CFCA 4PL8A 3TAFA 3TSPA 3ZCMA 1YIJN 4H0OA 3CFRA 3RMBA 1WOQA 1X9MA 1EETA 1JLAA 5JMVA 1WN7A 4BE1A 4DQSA 1RBVA 4CF1A 4B9TA 2BUPA 1SKSA 3BF3A 2ZJQL 4EHTA 3BUZB 4CHOA 3NF8A 3TAQA 3CCLN 4BREA 4A2BA 1NGHA 3T3FA 3MXIA 2KFZA 1BDGA 3U6FA 3O4QA 3E9PA 3DI6A 2G8WA 4U67L 1GLCG 1Z6RA 4FJLA 3AVMA 5AQFA 4BG9A 3O3HA 1HNVA 4NCBA 1TYQA 1NWKA 3P1GA 4JRQA 3ITHA 1QQCA 2CGJA 2HHIA 4DTXA 2OPSA 3CF5L 1QTMA 3DRPA 5LJWA 1UA1A 3OYDA 3VQ7A 4CEFA 4CFDA 1XNQK 3CQYA 1E3MA 1T6CA 2P51A 5CR4A 4B9NA 2A41A 3SCXA 1HNIA 1GLFO 4JK8A 3CCSN 4NLCA 3ULEA 3T1AA 2J4RA 4UQGA 3MWPA 4Y0WA 3AVGA 3OYKA 1GLDG 5LMNK 1RDWX 1NNEA 4B8AB 3DLEA 5AQQA 4N76A 1KFSA 3V1QA 4DUYK 3EN9A 4NLBA 3LM9A 4FVMA 2E4LA 3HOSA 3VF4A 3Q7CA 4YDUA 4KHNA 1M1KO 1SUQA 5C42A 3P83D 1NKBA 3HK2A 3T1YK 3A2FA 4KHYA 3SUNA 4GKKK 1FK9A 4XIUA 1EX4A 4HCBA 4CJWA 3CC7N 5SWMA 3H3NO 2ATQA 3O9UA 3AO4A 4CJTA 3CETA 4FZYA 3EE8A 2P9UB 5BRDA 5LL6Z 3I8DA 4ZHRA 1U48A 3THXA 3K5MA 1BI4B 2Q0UA 1KLNA 1C6VA 4YOXA 3MCPA 3D6RA 4DTJA 3QEXA 3O1WA 3TTCA 3WQUA 4DKWA 3QESA 3DRSA 4JD2A 4E19A 3PIPL 1CZAN 1G99A 2RPIA 4YOYA 1S9EA 3LM2A 4M42A 4B9LA 3KK1A 1FW6A 1NJZA 1VQ6N 5AQWA 3SAGA 4FWRA 2Q2RA 4BRPA 3V9SA 4OKKA 4OPHA 1EQYA 3N4PA 4BGAA 4YY3K 3P38A 4FJKA 4MO5A 2WOMA 3BDPA 2QXFA 1X9SA 2QWQA 4DQPA 4H4MA 3AVFA 1JCEA 3KHYA 3DLGA 5EXWA 4E89A 3C6UA 3RVCA 3SJHA 3WXIA 5BRHA 4FM2A 3MCAB 4IFYA 4BR7A 3CYGA 4QS7A 1T6DA 3R1XA 5KRSA 1J53A 2GELA 1XWLA 2AA4A 3F2KA 1TUUA 1NGJA 3O4WA 5AZJA 2XO7A 4MDAA 4RW7A 4IG3A 1S72N 4BECA 4AHVA 3GOIA 3DLLL 5DK5A 2AJQA 3M8QA 3O3FA 2GUIA 2E2OA 3DLKA 4WQ4A 3DLBA 1WSGA 4NCAA 2FBYA 1YAGA 4JK7A 3OYAA 1HKBA 4E1NA 3G0ZA 1B92A 1U2VA 3SJJA 2QWOA 1NKCA 3DLRA 2QW9A 1NOYA 3M6GA 5FROA 3EL2A 4B9VA 4K41A 4FWNA 5DMRA 4LH4A 2HB5A 3OYLA 4CBWA 2WFBA 3TABA 3CG7A 4YFUA 1WSIA 4B3RK 4ELUA 4H0VB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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