4WYBA

Structure of the bud6 flank domain in complex with actin
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
367
structure length
357
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structure of a Bud6/Actin Complex Reveals a Novel WH2-like Actin Monomer Recruitment Motif.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 96
structure length 357
sequence length 367
chains with identical sequence C, E, G, I, K, M, O, Q, S, U, X
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4wybA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4wybA04
3MN7A 4RWTA 3FR0A 4CZGA 2P9LB 1U6ZA 3IDHA 3MCPA 2CGJA 3ATUA 5EX5A 3C7NA 3LDNA 4IZ9A 2CGKA 4BRPA 4RCHA 2IVNA 3BUZB 5BPLA 4BR2A 2D0PA 4EHTA 2P9UB 4JHDA 1JCEA 2Q97A 4BR0A 3D2FA 3QICA 3VEXA 4FWSA 1TUUA 2P9IA 3GBTA 4DQ8A 4WQ5C 3BP8A 1GLEG 2PAVA 4H5NA 4WQ5A 4H0OA 1BWFO 3VERA 5AR0A 4BVPA 2Q2RA 3LDQA 1GLDG 3QFUA 5AQFA 2QWMA 3DXMA 3DXKA 5EVZA 2KHOA 1YUWA 3CETA 4L3QA 4MO4A 4B1XB 1QQNA 5BRFA 1C0GA 1NGAA 3FZLA 2A3ZA 2P9LA 3SJHA 5KQ8A 1RDWX 3A5OC 1NGBA 2YJFA 1DKGD 2Q1NA 2UYTA 2FXUA 2ZF5O 1T6DA 2ASMA 3AAPA 1KAXA 5AQPA 4EHUA 2P9KB 3MN6A 4IJNA 4PKIA 3WUHA 4EIAA 4BC5A 5LJVA 3O4WA 3CJCA 3VEOA 2P9UA 2CGLA 1DEJA 2H3GX 3DWLA 5EOYA 2A5XA 1SQKA 3O5BA 3C0BA 4MLHA 2CH5A 2E2NA 4A2AA 5EXWA 2D0OA 3JS6A 2HF4A 4FPAA 3FGUA 1NWKA 2E88A 3GL1A 3LDPA 3M3ZA 3GG4A 4BVOA 1NMDA 3VPZA 1ATRA 4I6MB 2D1KA 2ASPA 3ZX0A 2E1YA 5LY3A 3A8YA 3MK6A 4FWOA 2FSJA 4LC9B 1SZ2A 5ADXA 3EKUA 3VOVA 1NGJA 1BO5O 1YXQA 4CZIA 2FLOA 2CH6A 3W3DA 3B8AX 3EL2A 4RTFD 1S3XA 4CZMA 1TYQB 4IXCA 2P9KA 2W40A 4PKHA 4A61A 5AQQA 3I8BA 4CZJA 1T44A 1KXPA 1MA9B 2AP1A 3VGLA 3CERA 4JAXA 3O8MA 5E26A 2QWQA 2IVPA 1WOQA 4QS7A 4B1VA 4H5VA 5FPDA 3ENOA 2QWLA 5BRHA 1C0FA 3R8EA 3ATVA 4FOIA 2E2QA 5AQRA 3FE1A 3VETA 3CQYA 4QS9A 4ISGA 2D4WA 4H0TB 3TPQA 1H1VA 2NLXA 5BN9A 1EQYA 2VCPA 3WXLA 3A5LC 1KAYA 4EAHD 5CE3A 5AQNA 4M7YA 1Q18A 4FWPA 4CD1A 5KQDA 2ZGZA 3SK3A 3ULEB 4IJAA 5BPMA 4WQ4C 4FWRA 4O8KA 4CJ7A 5BREA 5AFUH 1Y64A 5TKYA 5JICA 4WQ4A 5F0XA 2V7YA 4HWIA 2QWNA 2HF3A 1TYQA 4C23A 3WQTA 2QWRA 3H1QA 1RFQA 1GLAG 3SLCA 1KAZA 5AQXA 5AZIB 4GY2B 2FSNA 5AQVA 1Z6RA 5KPRA 2PBDA 5EY4A 5AZJB 3G25A 1BUPA 4XEIA 1QZ5A 4BRIA 2VYPA 5FPMA 1IJJA 2GWKA 2AA4A 2DPNA 3QDKA 1ATSA 3MMVA 1NLVA 1BU6O 2FF6A 2E2PA 3LDLA 2P9NB 4BREA 3ID8A 3A5MC 4B1WB 4ISFA 3QFPA 3D2EB 3O6WA 1QQOA 3AARA 3WXKA 3O1WA 4ISEA 3P4IA 4CD3A 3SMPA 1U2VB 3HI0A 3ULEA 4BRGA 5AQZA 3VF4A 5AQOA 2GTDA 4A62A 3H1VX 4A2BA 1CZAN 4CZKA 4BR9A 4F9OA 1D4XA 1Z05A 3VEZA 1K8KB 1XC3A 3U8XA 2P9SB 4BRKA 3W0LA 4K25A 3A5NC 1GLJO 1X9JA 2F9TA 3GDQA 3H46O 5E84A 1YVNA 1IG8A 3JXUA 3M1FA 4FWQA 5AZJA 1JCGA 2I7NA 4NO7A 4BR7A 2IIRA 3DJCA 1XQSC 4H0YB 2ZWHA 3DAWA 2FF3B 3U9ZA 4BROA 3VEWA 3UB5A 1HKBA 2GELA 1ZXOA 3AY9A 5I9EB 4CBWA 3QMLA 5AQGA 3KVGA 4M7XA 3RSEB 4B1YB 3FZHA 4XH4A 2YHYA 3VF2A 3D2EA 4H5WA 1YAGA 2J4RA 2V51B 1MWKA 2ZGYA 2Q31A 4BQLA 1U2VA 4K41A 3ZEUB 4BRNA 3VF6A 3H45C 4GNIA 1S22A 3AAQA 2YHWA 1K8KA 3VEVA 4BRFA 2P9SA 5BRDA 3CJBA 1JCFA 4KBOA 3LDOA 4BG9A 5KPZA 3WQUA 2A41A 5JLFA 1NGEA 3ZETB 3MDQA 5BPNA 4HTLA 4AM7A 1HUXA 4BQZA 3VENA 5BN8A 4CZEA 4PL7A 1QQMA 3EN9A 5JMVA 3D7EO 4FSVA 4XH1A 3I33A 1NBWA 3QB0A 2A6AA 4PKGA 3HM8A 3WEEB 4IWVA 4IO8A 5AFUA 3ZX3A 4I6MA 4MO5A 3RSEA 2ITMA 5AQUA 4CI6A 4CZLA 4EFHA 1NGGA 1MWMA 3FZKA 3ZEUA 1T6CA 5AQTA 1J6ZA 1BOTO 2VWBA 3MN5A 4QS8A 4CBUA 3BEXA 1MDUB 2BTFA 3IUCA 4FWMA 1HKGA 1HPMA 2YHXA 4K43A 3UKUB 4J8FA 5B8HA 1WUAA 3UKRB 4JD2B 4BGAA 3WXIA 2F9WA 4E1JA 4H0XB 3R9PA 3TU5A 3VGKA 4BR5A 3ZETA 1R59O 4BRLA 3J8AA 3ENHA 4BG8A 3FFKB 4FO0A 4BRDA 2WUSA 4WYBA 3LL3A 5AQLA 1HKCA 2V7ZA 3HZ6A 2IVOA 2GUPA 3CJ9A 2QWPA 5FPNA 3WEEA 4BRAA 2E20A 4H5TA 2ASOA 3O1BA 3U9DA 3HSCA 4B1ZA 2Q0UA 1HJOA 1V4TA 2QW9A 2V52B 4B1UB 2EWSA 5AQKA 2Q0RA 1TUYA 4YDUC 1X3NA 3FZFA 3H6EA 3CJ7A 1LCUA 4YDUA 1NM1A 5AQSA 3U4LA 4B9QA 4H03B 4DHYA 1NGDA 3GOIA 3UE5A 2HMPA 4M63C 3L4IA 3L6QA 3UKUA 2YCHA 3VESA 2A42A 2I7PA 4O5FA 3WXJA 4BRMA 2P9PB 2NZTA 2W41A 5AQIA 3IMXA 3UKRA 4JD2A 1ATNA 5AZIA 2NRHA 1GLFO 3MN9A 5F2RA 1LOTB 3CQXA 3OHRA 4FWKA 4PL8A 5ELZA 1E4FT 2BUPA 3M6GA 3R6MA 4JN4A 4CBXA 1ZBSA 3H3OB 5BR9A 3FLCO 5AQMA 4BC3A 3BF3A 4BRQA 2GEMA 1NGCA 2E1ZA 4BGBA 5KPTA 4H0PA 1P8ZA 4CZHA 2YJEA 4XH5A 2P9NA 5AQYA 3O80A 2YI1A 4DCHA 2Q36A 2A40A 4BC4A 1GLCG 3FZMA 4AM6A 1HLUA 2GWJA 4JNEA 1NGFA 1BA0A 2QXLA 3F9MA 4BR4A 5AQJA 3VEYA 5LJWA 4BRCA 2P9PA 3L0QA 2E8AA 4BC2A 1XUPO 4NB4A 3H3NO 4DB3A 1NGIA 3QBWA 1QHAA 4MLEA 1HX1A 4CZFA 3KHYA 5JLHA 1QZ6A 3CI5A 5AQWA 1BDGA 3CIPA 1BA1A 3BF1A 3CJ1A 4FWNA 3LM2A 5AQHA 3HBTA 4H0VB 4FWLA 3C7NB 3EKSA 2FSKA 2HOEA 3IFRA 3CJAA 2QM1A 3EO3A 4K42A 1X3MA 3GE1A 4Z94A 1DGKN 2OANA 5ADXH 4H5RA 3KZBA 3A0IX 4JHDB 4FL9A 1OKJA 1ESVA 4FPBA 3WT0A 3D2FB 1G99A 1NGHA 3VGMA 3CHWA 1V4SA 5F1XA 4BRHA 2P9IB 1BG3A 4FOEA 3LM9A 1E4GT 1GLBG 1ZC6A 1GLLO 3S41A 3SMSA 2QWOA 4Y0WA 3QBXA 5FPEA 1SAZA 3ZX2A 3HTVA 3EZWA 1RGIA 3DXMB 3O08A 3DXKB 2E2OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EU7A 1HQEA 1HNIA 2P9LB 3IDHA 1XWLA 3MCPA 2ZJQL 5EX5A 4A59A 1SL2A 1VRTA 4DTNA 1RDAA 4N5SA 4BR2A 2E6MA 1RDDA 5HOOA 3SNNA 2Q97A 3TR8A 3OYIA 1VQMN 3VEXA 4FJNA 3G71N 4NCBA 1Q7YO 4CF2A 3CC4N 4E7JA 4E89A 4WQ5C 3AVMA 1GLEG 4CEOA 3A2FA 4DTPA 4WQ5A 2YV0X 3VERA 5SZTA 2Q2RA 4KRFA 1GLDG 4EP4A 1DLOA 1A5XA 2QWMA 3NF7A 1HRHA 3SPYA 3L3VA 1C0GA 2I5JA 2A3ZA 2QEXN 3SJHA 4OPKA 1RDWX 1NGBA 4PQUA 1NNEA 4M3RA 2FXUA 2ASMA 4PKIA 2R7YA 1S1XA 5J2MA 3SV4A 2CGLA 2H3GX 1SQKA 3O5BA 1CZBA 5DM7L 2D0OA 2LSNA 4KFBA 4FPAA 3LDPA 3GL1A 2VG6A 3NAEA 2O8DA 3RMCA 1NOYA 4O5BA 3K5OA 2HNZA 4JRQA 1XHXA 4HCCA 3THXA 3NVKA 1YJNN 1BQNA 2X74A 1X9SA 4CZIA 1N8RO 3OYCA 1QSYA 4RTFD 3KKRA 2VG5A 3NF6A 2FBXA 1L3VA 2D0BA 1MA9B 3CERA 4B1VA 1BI4B 1S6QA 5H1SQ 3LZIA 1QE1A 2ZE2A 2QWLA 1TK5A 4E7KA 3JYTA 4KHUA 5K14A 3HK2A 1VK0A 3HP9A 5HRNA 5I3UA 1HNXK 4ISGA 4FZXC 2QXFA 1K9MO 1XMOK 2NLXA 5BN9A 2QKKA 3ZSXA 3A5LC 3O3FA 1KAYA 5CE3A 2OA8A 5AQNA 4M7YA 1Q18A 1U48A 3HO1A 2ZGZA 1KLMA 2ZM6K 4IJAA 1WSIA 3P1GA 4CJQA 4JLHA 3LZJA 1A5VA 5JICA 4BDYA 2HF3A 1WLJA 4C23A 1KVCA 4QOZB 1RFQA 3SLCA 2OPRA 3F2KA 5AQXA 4YOWA 4DLEA 2UUBK 2PBDA 4R5PA 4CHYA 3SPZA 1QHTA 1I94K 1K73O 2VYPA 3LPUA 4CJLA 4ELVA 3S3NA 2F8TA 2DPNA 2P5OA 2O8FA 3MX5A 2F96A 3MMVA 3RMAA 1EP4A 4MQ3A 2FF6A 3LDLA 3A5MC 4HVJA 1L3TA 4CJ4A 1EETA 1NKCA 1U2VB 1Q8IA 5AQZA 3VF4A 1KFSA 2QK9A 3CQ8A 4A2BA 2O8EA 1J5OA 4DFPA 3C6TA 4XJXA 4HUEA 1K8KB 1XC3A 3AO2A 3IAYA 1JXBA 4IEEA 4BRKA 2KFNA 4K25A 3A5NC 1GLJO 1X9JA 2F9TA 3K0SA 4K8XA 4J2AA 3M1FA 1VAZA 3KD1E 1QS4A 2B5JA 2WOMA 2IIRA 2ITGA 1XQSC 3NH0A 3DAWA 4JI2K 2FF3B 4UY8O 4BROA 1S1TA 4RW9A 3OYKA 4M41A 2E5LK 5JS2A 3PV8A 3J80O 4OLBA 2YNIA 3QMLA 3RVCA 4OX9K 2ETJA 2Y1IA 3FZHA 3N4PA 2OYQA 3HXMA 5IWAK 4BQLA 2ZGYA 4GVEA 4KB1A 3VF6A 3Q7BA 4C8MA 4FCYA 2G8HA 4DMNA 3AAQA 1D9DA 1YTAA 5BRDA 4O0IA 4LD0A 3CM5A 1TKDA 3C6AA 3QIOA 3WQUA 3SBGA 4HCBA 4CEQA 4YOTA 5JLFA 5BPNA 4FM0A 3V81A 4B9NA 4HTLA 5M1KA 1RBUA 4OVLA 1QVGM 1QQMA 5C42A 1TAUA 4XH1A 3I33A 1NBWA 4PKGA 3HM8A 3CFOA 3ZX3A 3OW2M 4MDBA 3SUPA 4I6MA 2D0AA 3THWB 1T05A 4CI6A 1Q82O 3CYGA 1IKXA 1MWMA 2HHSA 1MU2A 1JL1A 2VWBA 5CYMA 3MN5A 3OBWA 3L2VA 4BY9C 3VQAA 4HHTA 2YHXA 1ZBHA 5B8HA 1WUAA 3OJSA 3BDPA 3UKRB 1RT5A 4WE1A 3ZSZA 4BGAA 3WXIA 4O0JA 4H0XB 3R9PA 3SQ0A 3RRHA 1RCHA 3LP2A 2NNWA 3AA5X 3OYJA 3ENHA 3AVNA 4FO0A 4WYBA 4CGFA 3D45A 1HKCA 2V7ZA 5CZ2A 1YIJN 3WEEA 3E01A 5GAEP 1X9MA 3HOSA 3LDSA 3U9DA 3HSCA 1V4TA 2V52B 2EWSA 3DI6A 2JGUA 3LALA 4KPYA 5HLFA 1F21A 1D5AA 3ZT0A 1S5JA 4DSLA 3SUOA 1NGDA 2ZJRL 5E41A 3V1RA 3UKUA 4GKKK 2A42A 2I7PA 4CW7B 4FK0A 2NZTA 3AVBA 3E9PA 4JD2A 3OYHA 4ZTFA 4N41A 3KLIA 1BISA 2HW3A 1OH5A 3TANA 1E4FT 2BUPA 5J2NA 4B9MA 2HHTA 4AQYK 4DQPA 2FBYA 2YHBA 5I42A 1IBKK 4CK2A 5BR9A 3THXB 3SJJA 3FLCO 3SUNA 1WBDA 3BF3A 4BRQA 2GEMA 1HNZK 1S9GA 4H0PA 4LFBK 2D5RA 2W6LA 5AQYA 3M8RA 4DCHA 3THYB 2A40A 4BC4A 3QEXA 5FRNA 4CEAA 3FZMA 4FLTA 3O4NA 1UWBA 2HNYA 2P51A 4F3TA 4IEIA 3MXMA 4DWIA 5AQJA 3ZSRA 2E8AA 4BC2A 1IKWA 1XUPO 3KKSA 1NKBA 4DB3A 4Y1CA 1QHAA 1HMVA 1HX1A 1ZBUA 4MLEA 4CEFA 4FK4A 3LWMA 2YX6A 3KHYA 3ZT1A 3QETA 2YHAA 3NGZA 2KKZA 3CIPA 4E7IA 3PX6A 1U04A 3KWGA 3BF1A 3MEEA 3T1HK 1VQON 3C7NB 2XY8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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