4WYBA

Structure of the bud6 flank domain in complex with actin
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
367
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of a Bud6/Actin Complex Reveals a Novel WH2-like Actin Monomer Recruitment Motif.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Contractile protein/protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 96
structure length 357
sequence length 367
chains with identical sequence C, E, G, I, K, M, O, Q, S, U, X
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4wybA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4wybA04
1J6ZA 1NGEA 3ENOA 3H1VX 4I6MB 1MA9B 2FLOA 3VEZA 2QWMA 3O4WA 3UKUB 4B1ZA 5AQZA 4FWSA 5F1XA 2DPNA 3VERA 3LM2A 3HSCA 3IUCA 2Q31A 1T6DA 4NB4A 5AQLA 3TPQA 5FPEA 4MO4A 5I9EB 4CJ7A 3CJCA 3R6MA 2P9LB 4K41A 5AQKA 4L3QA 4BC4A 4F9OA 4DCHA 1XUPO 5AQRA 3DXMB 3AAPA 1U6ZA 5AZJB 1GLBG 2YHWA 5B8HA 5TKYA 4XH1A 4CZFA 1LCUA 5FPNA 5KPRA 1RDWX 3SJHA 1ATRA 2P9IA 3AY9A 3A5NC 2HMPA 2VCPA 3TU5A 4H0XB 2GWKA 1NGBA 4YDUC 5AQNA 3R9PA 2QWQA 3LDQA 4H5NA 3QB0A 3VEXA 4EAHD 4RCHA 4CZEA 4K42A 2OANA 3A5OC 4EFHA 3GBTA 2P9NA 1ATSA 3RSEB 3VF2A 4BRCA 5AQJA 2KHOA 3ID8A 2QXLA 4M7XA 2GEMA 2CGLA 5AZJA 3G25A 3O08A 5AQVA 2FSJA 3GOIA 3DJCA 1BDGA 4XH5A 3R8EA 1GLJO 2NLXA 5AR0A 1K8KA 3A8YA 2YJFA 3MDQA 1NWKA 3VOVA 3I8BA 3IDHA 2ZGYA 4IJNA 1GLAG 2E1ZA 2GTDA 2P9SB 4M7YA 5BN9A 3SMSA 4ISGA 5BN8A 4BG9A 4EIAA 4MLHA 4CZLA 2V7YA 4Y0WA 1KAYA 3A5MC 3CIPA 3FZHA 5AQUA 4DQ8A 5AZIB 1HJOA 1TYQB 2E2NA 1TUYA 3CJ7A 3QBWA 2VWBA 1SQKA 2A41A 3FZMA 3M6GA 1XQSC 3ATUA 1YVNA 3MN9A 1CZAN 3CETA 1S3XA 3VEOA 2I7NA 3ZETA 4BR2A 4IWVA 3HZ6A 2Q2RA 2QM1A 4CZMA 5BRFA 4FWOA 3AARA 3FZKA 4HTLA 3L4IA 3MCPA 3WXIA 3WEEB 4MLEA 3HI0A 3FLCO 4CBUA 5EX5A 5AQGA 3HBTA 3MN6A 3DXMA 2IVPA 2H3GX 2D4WA 3QMLA 4Z94A 5AFUH 1XC3A 3KHYA 4H5RA 5BPNA 1R59O 1BO5O 4K25A 3H45C 4JD2A 2VYPA 4BRHA 5JLFA 2IIRA 2Q36A 3GE1A 4E1JA 3DXKA 5LY3A 3LDOA 1TYQA 2Q1NA 3KVGA 5E26A 2IVOA 4A2AA 4AM7A 4JHDB 4FWLA 4CD1A 3MMVA 2HF3A 3D2FA 1GLDG 4BRGA 1JCFA 3UKRA 3D7EO 3L0QA 4FWQA 3OHRA 5JLHA 3ZEUB 5EVZA 4BRDA 1NGHA 4B1XB 2P9UB 3CERA 3BF1A 1WOQA 2FF6A 2F9WA 1HPMA 1BU6O 2FXUA 5AFUA 1GLCG 4BQZA 4BVPA 1HKGA 3BP8A 1NGGA 2P9UA 2ZWHA 4DB3A 1Y64A 3M3ZA 2D0OA 2IVNA 1T44A 1SAZA 4H0YB 4FWPA 4O8KA 3I33A 3WXJA 4B1YB 5CE3A 5AQXA 2YCHA 1QZ5A 2QWNA 5AQYA 3VESA 4FPBA 3FGUA 5FPDA 2Q97A 4BRNA 1MDUB 2I7PA 4BGBA 3A0IX 1Q18A 1DEJA 3HM8A 1Z05A 5FPMA 2A5XA 3ENHA 3CQYA 2BTFA 4BRAA 3H46O 3SLCA 4QS7A 3LM9A 3VGLA 3O80A 5F0XA 4GY2B 3DAWA 2A3ZA 5BREA 3H3OB 4CZHA 4H0TB 1HLUA 1IJJA 4A61A 4A62A 5ADXH 2Q0UA 5ELZA 5F2RA 1BWFO 3ZX0A 4CBWA 3EZWA 3ULEB 4BR5A 4BRQA 3VF4A 1NGIA 3UKRB 3P4IA 2ASOA 3B8AX 2EWSA 1NM1A 2QW9A 3WXLA 2J4RA 3ZX3A 3WQTA 2P9PB 3RSEA 5AQSA 3VGMA 2P9PA 4WQ4A 1SZ2A 3H6EA 4PL8A 3DWLA 4FWNA 2A6AA 2NZTA 3QFUA 3QICA 4JD2B 3W0LA 5BRDA 4WQ4C 3UB5A 4RWTA 3VEYA 3CJBA 2P9KA 1NMDA 1Z6RA 2V51B 2YI1A 4FO0A 2ITMA 4EHTA 3D2EA 3QFPA 2CH5A 1U2VA 4WYBA 4BQLA 2D0PA 4NO7A 2P9IB 4JN4A 2HOEA 5AQHA 4M63C 2FSKA 5AQIA 4LC9B 3MN5A 3QBXA 1JCGA 3QDKA 4FWKA 4BRFA 4B9QA 4EHUA 3KZBA 5BPLA 4BROA 1E4FT 2P9NB 2QWRA 3S41A 1V4TA 1HUXA 5JICA 4WQ5A 5EY4A 1QQMA 4KBOA 2P9KB 2V7ZA 2P9LA 4CZKA 2V52B 2HF4A 3CHWA 1BG3A 4H5TA 5BRHA 2Q0RA 1HKCA 3EO3A 3UKUA 4H03B 2UYTA 3J8AA 2F9TA 2W40A 5JMVA 4CBXA 5AQPA 3SK3A 4BC3A 3ATVA 1NGFA 5LJVA 5KPTA 4BVOA 1G99A 1K8KB 4H0OA 1JCEA 1E4GT 3UE5A 3FZLA 1TUUA 1HKBA 2E1YA 4IJAA 1EQYA 1NGJA 1D4XA 3W3DA 4JAXA 1DKGD 4YDUA 2D1KA 3WUHA 1T6CA 2GUPA 4QS8A 5AQFA 5EOYA 1NLVA 3ZX2A 3CJ9A 1P8ZA 3BEXA 3EKSA 4PKIA 2E88A 4BGAA 1YUWA 3H3NO 4JNEA 3EKUA 4BRMA 4I6MA 4RTFD 4ISEA 1X3MA 4H5WA 4JHDA 2ZGZA 1X9JA 4MO5A 1OKJA 1KAXA 3EL2A 4CZJA 2YJEA 4BRKA 2QWLA 2YHYA 3ULEA 3C7NA 3VEWA 5AQWA 3CJ1A 1NBWA 3JXUA 1RFQA 2E2PA 3CI5A 3VETA 1IG8A 1ZC6A 4O5FA 4B1UB 4CI6A 2NRHA 1GLEG 1C0FA 4H0PA 4K43A 4BRLA 3ZETB 3O1WA 1U2VB 2AP1A 1S22A 4B1WB 2GWJA 2PAVA 3MK6A 1MWMA 5KQ8A 3H1QA 3JS6A 1KAZA 5EXWA 3O1BA 4FL9A 4WQ5C 2CH6A 4XH4A 1ZXOA 2ZF5O 4BR0A 2FF3B 1BUPA 1LOTB 1ZBSA 1HX1A 2WUSA 3D2FB 4FOIA 4FWRA 4AM6A 2E20A 1GLFO 3WQUA 4BC5A 1YAGA 3IMXA 1NGAA 3GL1A 5KQDA 1YXQA 4HWIA 4FPAA 2BUPA 1QHAA 3U4LA 4H0VB 3VGKA 4BREA 3DXKB 5AQOA 3A5LC 2AA4A 2A42A 4BRPA 4CZGA 4BR7A 4IZ9A 4CD3A 4J8FA 3O5BA 1QZ6A 5ADXA 1GLLO 2A40A 3FFKB 1QQNA 2ASMA 2QWOA 1V4SA 2W41A 3C0BA 4PKGA 3ZEUA 3CQXA 3WEEA 4PKHA 2E2QA 2GELA 4GNIA 4IXCA 4BG8A 4BR9A 5BPMA 3VPZA 4ISFA 3FE1A 2QWPA 3VF6A 3WT0A 3LL3A 1BA1A 1BOTO 3FZFA 3LDLA 3VEVA 5AQMA 4H5VA 5KPZA 5AQTA 2FSNA 2E2OA 5AZIA 1DGKN 3U9ZA 4C23A 3LDPA 4BC2A 1MWKA 1RGIA 3CJAA 1ATNA 2CGJA 3F9MA 3L6QA 3LDNA 2CGKA 3HTVA 1X3NA 3U9DA 4BRIA 3WXKA 3EN9A 3GG4A 2PBDA 5BR9A 1H1VA 2P9SA 1C0GA 1ESVA 4IO8A 3BUZB 3O8MA 3MN7A 3GDQA 2ASPA 5E84A 3U8XA 4BR4A 4DHYA 1BA0A 1QQOA 2E8AA 5LJWA 1NGCA 4FOEA 4A2BA 1KXPA 3O6WA 4FWMA 3BF3A 3D2EB 3C7NB 1WUAA 4B1VA 1NGDA 2YHXA 4XEIA 3IFRA 5AQQA 4CZIA 3VENA 4FSVA 3AAQA 3SMPA 4PL7A 3M1FA 3FR0A 4QS9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OO1J 3K5NA 3ENOA 1RT1A 2R7YA 3H08A 4A5AA 4J2BA 1OVYA 4DR4K 1XMQK 5AJ3K 4MO4A 3CJCA 4FCYA 4Z4CA 5C24A 1TK0A 1D9DA 1QTMA 4Z0UA 5AZJB 3OS1A 4W5RA 4DTNA 1EO1A 1RDWX 3THXB 1JJ2M 5HRSA 1ATRA 2P9IA 3AY9A 5JVGL 1ZBUA 1NGBA 1ITGA 3OJUA 3QEPA 3C95A 1L3UA 2QWQA 2XRIA 3ITHA 3NVKA 2Z1IA 3LAKA 1S1VA 4C8LA 4EAHD 4H4MA 2OANA 4CFBA 3M8RA 3TAEA 4B3RK 3ALYA 3A5OC 3AV9A 2QXFA 4JI8K 2WBNA 3ZYYX 3VF2A 4CJVA 1QSLA 2UXDK 4LY7A 1HMVA 3U3GA 1EWQA 1YF5L 3L3UA 5CYMA 4CF1A 2GEMA 4OKEA 3V1RA 1WAFA 3IS9A 3B6PA 3VQEA 3DJCA 2OPQA 1K8KA 1N8RO 3AVGA 2YJFA 4JKAA 3SUQA 1VQKN 3K59A 1JLBA 1GLAG 4CFCA 2P9SB 4M7YA 1BIUA 4EIAA 1ZBHA 1WSIA 5CZ2A 4CZLA 1KAYA 1NJXA 3OYHA 3L4QA 3FZHA 5AQUA 1YHQN 4O44A 1TYQB 3CJ7A 2QK9A 3LALA 2HVHA 1SQKA 3WNEA 2A41A 3L2VA 3M6GA 4DTJA 1XQSC 1VQ7N 3ATUA 1YVNA 4JEPA 1CZAN 4EZ6A 2FBVA 1B9DA 4BR2A 4IWVA 3HZ6A 1JKHA 2Q2RA 2QM1A 4CZMA 2C1GA 4HTLA 3L4IA 4MLEA 3HI0A 1HNXK 1RTHA 3HBTA 3MN6A 3DXMA 3SZ2A 3E9OA 3SV4A 1NNEA 1KD1O 4CK2A 3KHYA 3NF6A 4K25A 3H45C 4DMNA 3MX2A 3LDOA 3KVGA 5E26A 2ITGA 2NRRA 2B4JA 4N47A 3DI6A 1C0UA 5KRTA 4CD1A 1HR0K 4FW2A 4JK8A 3L2RA 3CCQN 3VQ6A 3UKRA 4ILHA 5JLHA 4FLWA 1FJGK 1VSDA 3SBTA 2QKKA 4CGGA 2BDPA 3CCMN 1MU2A 3ID6A 3EYZA 2FF6A 5LMUK 2FXUA 5AFUA 4BVPA 4K8XA 4CJQA 3BP8A 1NGGA 2ZWHA 4DSEA 3CYGA 1KVBA 4FK2A 1ZYQA 4E89A 3I33A 2QWNA 4OJRA 4R5PA 3O4NA 5C2DA 3FGUA 2KTQA 3QO9A 3Q7BA 1J5OA 2I7PA 3PIOL 3KIOA 4BGBA 4BWJA 5D3GA 1Q18A 5GIOA 2HBJA 3KK7A 4E72A 4M45A 1JLAA 2JGUA 3E66A 4M42A 3LM9A 4B9VA 3C65A 4LH5A 3HRGA 5F0XA 3NDKA 1XHXA 1U45A 2Z1HA 3VQ9A 5BREA 3NGZA 3RR8A 3OS2A 5ADXH 2Q0UA 1BWFO 4O55A 4CJ5A 3ZCMA 4FJ9A 1VQLN 4JS4A 3OYMA 5FRNA 2D0BA 4FXDA 1KCFA 4NXMK 3DM2A 3VGMA 3ZSRA 1S9EA 4B3TK 1K6YA 4PL8A 3A2FA 1VQ8N 2HHHK 4FWNA 2A6AA 3HVTA 3I56N 3ZSQA 4WF9L 4WQ4C 3AA2A 3E01A 3UB5A 4CFDA 2P9KA 3TARA 4FO0A 3AVFA 4CJTA 4EHTA 3BGRA 2CH5A 1U2VA 2YHAA 1CLQA 3TANA 2P9IB 3LPUA 1WSEA 2KW4A 5E41A 3MN5A 1TL1A 4IFEA 3T1AA 3KZBA 3LZIA 4CJ4A 2RHKA 3C94A 4BROA 2NRZA 3KD1E 3DLGA 2RN2A 1C1BA 5EY4A 3QETA 4CHOA 4KBOA 4DR3K 1W7AA 1S6PA 2V7ZA 4DFPA 4F3OA 2HF4A 4JKCA 1DLOA 3QESA 4ZHRA 3CHWA 4FJIA 4KRFA 5C10A 3VA0A 4JS5A 2Z1JA 3QINA 3PY8A 3O4QA 4H03B 4UQGA 5JMVA 4DSLA 1ASUA 4IG3A 5EU7A 4HHTA 2UU9K 2NRVA 2G8IA 4H0OA 3UE5A 2PYLA 1HKBA 1LW2A 2G8UA 1VSEA 2DTUA 1VSMA 4YDUA 1T6CA 1WSGA 2GUPA 3THVA 1M1KO 5AQFA 1OH8A 2IGIA 1P8ZA 5I3UA 2E88A 2NRTA 4E7JA 4BRMA 1JLQA 1YUWA 4HUGA 1IG9A 4OLBA 1KVAA 1X3MA 3CFPA 4H5WA 1U47A 1LW0A 2OZSA 1EX4A 1X9JA 1FKPA 4MO5A 1KAXA 3LP1A 1YITN 4CW7B 4YHHK 3HM9A 3KK1A 4DV1K 4BWMA 2DFFA 1NK9A 1RCHA 1K8AO 1IG8A 3HYFA 4LFAK 4OPAA 1NMNA 3KWGA 3LANA 4CI6A 3G71N 2NRHA 1C0FA 4H0PA 4K43A 4BRLA 1U2VB 3NF9A 2AP1A 4FLXA 3PV8A 5HRPA 2YNIA 3WNHA 3MWPA 1A5VA 2CH6A 4DU3A 4CJRA 3LPTA 2XY7A 1RDDA 3D2FB 4CVNE 3NVMA 3WQUA 1YJ9N 3OYAA 1GOCA 3PX4A 3RMCA 3S9HA 4DSKA 1VQON 4RW4A 3PX0A 5AQOA 3SJJA 3A5LC 2O8CA 4MQ3A 4CZGA 1BQNA 4BR7A 2X78A 4IZ9A 1XWLA 4UY8O 4K0KK 3FFKB 2ASMA 1J9AA 1WLJA 1V4SA 3C0BA 3CQXA 4PKHA 3CM6A 1TV6A 4PWDA 3FFIA 3Q7CA 4GNIA 4I7FA 5BPMA 3CCLN 1IKVA 3WT0A 3LWLA 2P5GA 2HHUA 3FZFA 1HYSA 3LDLA 3RRGA 3VEVA 3RMDA 1CXQA 4JK7A 2FSNA 1UAXA 3U9ZA 3AO5A 1C1CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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