4WYBA

Structure of the bud6 flank domain in complex with actin
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
367
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein/protein binding
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Structure of a Bud6/Actin Complex Reveals a Novel WH2-like Actin Monomer Recruitment Motif.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 96
structure length 357
sequence length 367
chains with identical sequence C, E, G, I, K, M, O, Q, S, U, X
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4wybA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4wybA04
4BRDA 2FF6A 2A42A 5FPMA 4BRKA 1GLCG 5I9EB 5F0XA 2ZF5O 5AQQA 2FSJA 2UYTA 4K41A 2P9SB 4FOIA 2NLXA 5AZIB 4IZ9A 4WQ5C 4XH4A 4CD1A 4H0YB 4MLHA 1YAGA 4JAXA 2IVOA 2E2NA 1BDGA 4PL7A 3DXMA 3A5OC 4JD2B 3QB0A 2CH5A 1OKJA 3UKRA 3VEZA 3IMXA 3H6EA 5AQPA 4JHDB 5AQWA 3UB5A 4BR9A 3QFPA 4QS8A 4CZLA 3ID8A 3C7NB 4DB3A 1XC3A 2YHWA 3UKUB 1KAYA 3ATVA 1E4GT 4BRAA 2Q0RA 2QWNA 4CZFA 3CJ9A 5AQJA 3QBWA 3SMSA 3CETA 3KVGA 4MO4A 4CZJA 4ISFA 2HOEA 2V52B 4A62A 2P9SA 4XEIA 5AQNA 1QHAA 3U9ZA 1QQOA 2Q1NA 3LDPA 1ESVA 4M7XA 5LJVA 3KZBA 1NLVA 4JN4A 4B1YB 2A6AA 3U8XA 2HF4A 1HKGA 2BUPA 1G99A 2E88A 2J4RA 3FZMA 5BR9A 4JD2A 2D4WA 3IFRA 4BRLA 4A61A 1JCGA 1QZ5A 1SAZA 2V51B 5E26A 1NGAA 3O6WA 4BQZA 2AA4A 1NBWA 4K25A 4B1XB 4HWIA 2DPNA 3CI5A 4WQ4A 1IG8A 3WXKA 2ASPA 4BR2A 3A0IX 3G25A 4BR7A 5F1XA 3CJAA 3RSEB 3D2FA 3KHYA 2GWKA 4B1ZA 1K8KB 2VYPA 1MDUB 1S3XA 3WEEA 4AM6A 1SQKA 2E1ZA 2W41A 4RTFD 1J6ZA 3WT0A 5LJWA 4H0OA 4MLEA 3J8AA 4BG9A 5FPDA 4XH5A 4H5TA 5AQMA 3CQXA 5ADXH 4L3QA 4H03B 1V4TA 4BRCA 4BRIA 2D0OA 2QXLA 3QMLA 3O1WA 3AAQA 2ASOA 2E20A 4CBWA 1MWKA 3VF2A 1JCEA 1NMDA 1H1VA 4B1WB 3O8MA 2YJEA 2P9KB 2FSNA 2GEMA 3P4IA 3DWLA 1TUUA 4KBOA 5KPRA 5FPNA 4H5NA 2P9PB 2YHXA 4H0XB 4M7YA 4C23A 3O4WA 1XQSC 3ULEB 1QQMA 4CZKA 1GLJO 3RSEA 3GG4A 1BA1A 2IIRA 1K8KA 4O5FA 4NB4A 5AZJA 4Z94A 1RDWX 1TYQB 2Q36A 3ATUA 4K43A 3FZKA 4CZEA 1TUYA 4EHUA 4IO8A 3L6QA 1ATRA 3I8BA 2FXUA 3IUCA 4J8FA 3WXJA 2QWMA 5AQHA 5LY3A 1KXPA 3B8AX 4K42A 4QS9A 4BROA 2A5XA 1NGIA 4BRMA 1RFQA 3FR0A 3H3NO 3A5MC 4BGAA 1ATSA 3FZHA 5BN8A 5AQKA 2PBDA 1BOTO 3MMVA 4YDUA 4DHYA 3C0BA 3SMPA 4BR5A 2IVNA 3SK3A 1NGGA 4IJAA 2P9LB 2CGJA 4FPAA 4B1VA 3TU5A 4ISGA 3SLCA 3O80A 3EO3A 5EXWA 2CGLA 5AQYA 1LCUA 5AQZA 5AFUH 1TYQA 3FFKB 4F9OA 3AY9A 1GLEG 4IWVA 3O08A 2GUPA 3SJHA 3VETA 3DXKB 4PL8A 1GLLO 3R9PA 2QW9A 2Q97A 3FZFA 3L0QA 1HKBA 3ZX3A 5ADXA 3M6GA 4PKGA 1HUXA 5AQIA 5AZIA 1ATNA 4FWQA 2P9IB 1E4FT 5AQTA 3VEWA 4BVOA 2QWQA 3VOVA 4A2BA 4BC5A 1NGHA 2V7YA 4FOEA 1NGCA 2AP1A 4FWRA 2YHYA 3H3OB 3A5LC 1NGDA 1GLFO 3VENA 4DCHA 1HJOA 1T6DA 1X3MA 3R8EA 5TKYA 4JHDA 1D4XA 2WUSA 3C7NA 1NGEA 1R59O 5BREA 2IVPA 3O1BA 3ENOA 3CJCA 3WXIA 4DQ8A 2EWSA 4A2AA 4BQLA 3VF4A 3UKUA 1GLAG 1MWMA 4BC4A 3MDQA 4WYBA 5ELZA 4BC3A 3BUZB 1HLUA 3UE5A 2QWLA 4Y0WA 1XUPO 5AQXA 2GTDA 4FSVA 1HX1A 5BRFA 3I33A 5AQGA 5BPNA 4FPBA 2E2QA 4CZMA 3M3ZA 1WOQA 4CZHA 3LDNA 3VF6A 2OANA 1MA9B 3VEOA 1IJJA 2P9UB 3H1QA 4FL9A 2ITMA 3D2EB 3BF1A 1NGFA 4BG8A 5BPLA 5EVZA 3H1VX 1NWKA 4B9QA 3BF3A 5JICA 3VEXA 3WQUA 2Q31A 4GNIA 4JNEA 4XH1A 2VCPA 3U4LA 2E2OA 4I6MB 4FO0A 5AQRA 5CE3A 2F9TA 1BWFO 4CBUA 5B8HA 3S41A 5AR0A 4BRHA 2A3ZA 2P9NB 3QBXA 3TPQA 3QDKA 5AFUA 5JLHA 1QQNA 1X3NA 3LM2A 4FWLA 2FSKA 1WUAA 1Y64A 3EKSA 1P8ZA 5AQFA 1YUWA 1JCFA 3LL3A 3DXMB 4O8KA 3ZX2A 2ASMA 3WXLA 2QM1A 2ZGZA 4WQ5A 1Q18A 3VPZA 3EKUA 1C0FA 3ENHA 5AQSA 2KHOA 3BP8A 4B1UB 4FWPA 2QWPA 3FZLA 3WQTA 4BVPA 2GWJA 3LM9A 4RWTA 4H5WA 3GE1A 3A8YA 5JLFA 3HM8A 4HTLA 2P9KA 3EN9A 3ZETB 3R6MA 3D7EO 1NGBA 1NGJA 1GLDG 4MO5A 2QWOA 2FF3B 2P9PA 2YJFA 2P9NA 2NZTA 1DEJA 3ULEA 1U6ZA 4BRNA 3HBTA 4FWNA 2BTFA 4LC9B 3VEYA 1HPMA 2YCHA 2CH6A 2V7ZA 3LDLA 1BA0A 1KAXA 1T44A 4BR4A 4BREA 2Q0UA 4H5VA 2YI1A 3U9DA 1BG3A 3LDQA 3CJ7A 2ZWHA 1Z05A 3EL2A 4H0TB 3CJBA 4BRGA 2E2PA 3BEXA 5AQVA 3A5NC 3MN9A 2CGKA 1SZ2A 2W40A 3FGUA 2HF3A 3JS6A 2HMPA 3VGLA 5EX5A 3ZEUB 1U2VB 4YDUC 2D0PA 3HI0A 1C0GA 3CHWA 3MK6A 3ZETA 1DGKN 2I7NA 4QS7A 2VWBA 1CZAN 3ZX0A 3D2FB 4BC2A 3MN5A 3CJ1A 3WEEB 1DKGD 4FWMA 2E1YA 3LDOA 2PAVA 3O5BA 3IDHA 5BRHA 2P9LA 3AARA 1YXQA 2H3GX 1RGIA 1BO5O 2NRHA 1X9JA 5KQ8A 3VERA 3AAPA 3FE1A 3GOIA 3QFUA 4H0VB 4CJ7A 4BR0A 1T6CA 5EOYA 4CZIA 3DXKA 5KPZA 3H46O 5FPEA 1QZ6A 3MCPA 2Q2RA 3MN6A 4BRQA 2GELA 4EAHD 2P9IA 4IJNA 1BUPA 1LOTB 1YVNA 3L4IA 1U2VA 3ZEUA 1GLBG 3CERA 3VESA 3MN7A 3VGMA 2A41A 3GDQA 5BN9A 3VGKA 4WQ4C 4RCHA 1ZBSA 3GBTA 3FLCO 5AQLA 4CI6A 4EFHA 4M63C 1HKCA 5F2RA 5AQOA 5AZJB 3F9MA 4GY2B 3W0LA 4BGBA 4FWKA 4PKIA 4IXCA 3HSCA 4CZGA 4E1JA 1BU6O 2FLOA 2ZGYA 1V4SA 1Z6RA 1KAZA 1EQYA 4NO7A 1ZXOA 4PKHA 5KPTA 3QICA 2D1KA 5E84A 5AQUA 4FWSA 4CD3A 4ISEA 4H0PA 5EY4A 3EZWA 2P9UA 2QWRA 3DJCA 3D2EA 4FWOA 4BRFA 3UKRB 3CQYA 3DAWA 4EHTA 5BPMA 1NM1A 4EIAA 2F9WA 3HZ6A 5BRDA 3M1FA 5KQDA 2A40A 3JXUA 3GL1A 3WUHA 1S22A 1ZC6A 3VEVA 3H45C 3CIPA 4I6MA 4BRPA 4AM7A 5JMVA 3W3DA 4CBXA 4H5RA 2I7PA 3OHRA 2E8AA 3HTVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FF6A 4DSEA 1K73O 1C1AA 2UYTA 3VQDA 4FOIA 1BQMA 3SQ0A 3C94A 4XH4A 4H0YB 4MLHA 4RW4A 4PQUA 3NHGA 4C8LA 2E2NA 2AJQA 4PL7A 3OYFA 1NOYA 3PX4A 4JD2B 4WCEL 1IG9A 3IMXA 3H6EA 5AQPA 3JSMA 4FM0A 4CZLA 3UB5A 3C7NB 1BL3A 3AA5X 3IKMA 3UKUB 1KAYA 5CZ2A 1TAUA 4IO9L 4BRAA 4CFDA 4CZFA 3OYBA 3CJ9A 4YOYA 5AQJA 1YITN 3SMSA 3CETA 3OYCA 5D3GA 4CF8A 4M3XA 2P5GA 1ASWA 4JKGB 2O8FB 4BE1A 4XEIA 3NVMA 3U9ZA 1QHAA 5LJVA 1NU0A 3J7AP 1KFDA 2YKNA 4OKKA 2A6AA 1JLFA 2HF4A 1G99A 3C6TA 2EHGA 4KTWA 3KJVA 1J9AA 4YFUA 4JD2A 2D4WA 1A5VA 2ETJA 3T1YK 3NGIA 1SAZA 4BQZA 5KTQA 1VSKA 2G8KA 3OYLA 3QEXA 2HHHK 3C95A 3V9SA 4DSLA 3L2VA 3P5JA 1VQ4N 3PV8A 3WXKA 2IOCA 4DS5A 5F1XA 4BR7A 5GAHP 3CJAA 1K8KB 3C6AA 1MDUB 3KKSA 2XHBA 4JKGA 1SQKA 3O4QA 4JI7K 2O8FA 5IT9O 1EETA 4H0OA 3TTCA 3M8SA 4DR2K 3CQXA 5ADXH 4L3QA 4H03B 1V4TA 3SAHA 5HROA 4BRCA 5JS1A 1QSYA 2D0OA 5HRPA 1NK6A 3NF6A 2X6NA 2ASOA 4M3RA 3K5NA 4RW8A 1TKDA 3NDKA 1NMDA 1U49A 3O8MA 2D0CA 2FSNA 1C0TA 2FBTA 3K5LA 3DWLA 3VQ6A 5GINA 1HNXK 3E1YA 2HNDA 1JLEA 3NF8A 2P9PB 2YHXA 1KSPA 5HRNA 2DY4A 4CZKA 3EEQA 1GLJO 4M42A 4DR5K 2HHIA 1HNWK 1K8KA 3ZT3A 5C42A 4RG8A 1KQSM 4CEQA 3MX2A 4CJEA 3FZKA 4N56A 3E9OA 1RT4A 3DOLA 3L6QA 4JKBA 3WXJA 2QWMA 5AQHA 1N34K 5LY3A 2HB5A 3MWTA 2WOMA 1KXPA 2IGIA 4F8RA 3EY1A 3VQ9A 1Q9XA 3QO9A 2Q3SA 5J2NA 4QS9A 1S6QA 3HPOA 2XO7A 4QAGA 4BRMA 1WLJA 3S5TA 3I0RA 1ATSA 4IFYA 4YDUA 4DHYA 1EWQA 3SLCA 2VG6A 1D8YA 1W0HA 1LCUA 1BQNA 3LP2A 3HYFA 5AQZA 3V4IA 3ZT1A 3FFKB 2GUPA 3V9ZA 1RT7A 1KFSA 3ZX3A 2OTLN 3M6GA 3DLHA 5AZIA 1ATNA 4OX9K 3VEWA 2OPSA 3VOVA 4UQGA 2OA8A 3S3OA 1NGHA 2V7YA 3THXB 1IH7A 2AP1A 2HHUA 3VQQA 2C1GA 3O9SA 4E7IA 3A5LC 3OW2M 3TABA 2JGUA 4BEBA 3PX0A 1X3MA 3ZSVA 3NE6A 1KLNA 4BWMA 1YIJN 1N36K 3V1OA 1TKXA 1VQKN 3HSTB 1R59O 2IVPA 3O1BA 3PUFA 4BQLA 4A2AA 5CY4A 4BC4A 1ZBLA 4WYBA 4BC3A 3VQ8A 3CFRA 4FJ5A 4CK3A 2GTDA 1HX1A 3ISNC 4CEOA 5BRFA 1HNVA 3I33A 1ZBHA 3TSQA 3ASMA 4CZMA 1WOQA 3ZSQA 1HNZK 3LDNA 3BDPA 2WONA 4AHRA 1MA9B 1IJJA 2P9UB 4FL9A 3L2UA 3D2EB 5M1QA 4Z4EA 3BF1A 4FLZA 4F4KA 5BPLA 4FM2A 3H1VX 3TAMA 4CJRA 1NWKA 4OPAA 3CCLN 3BZKA 4N76A 3BF3A 1HMVA 2O4IA 3L2QA 3AVKA 2P5OA 4Y1CA 1SL2A 3KD1E 1VHXA 2Q31A 4FCYA 4JNEA 2X6SA 4XH1A 3RMAA 2VCPA 4M45A 2E2OA 4I6MB 3LAMA 3JYTA 4CEZA 2F9TA 1BWFO 3S41A 2GV9A 5AR0A 1F21A 4BRHA 4DR4K 5TKWA 2P9NB 3LPUA 3AVHA 3QBXA 2XY5A 1RT5A 5HRRA 4Z4GA 1N5YA 5AFUA 1IKYA 1X3NA 2FSKA 1P8ZA 5AQFA 4DUYK 2XY7A 3CD6N 3DM2A 5DK5A 4UY8O 4O8KA 4DUZK 1WBBA 3THWB 4YY3K 1Q18A 4CJ3A 3VPZA 3EKUA 3VA3A 1VQNN 1C0FA 3CC2N 1C1CA 1WSFA 4X65K 4BY9C 3BP8A 4CJFA 4IKFA 4B1UB 3HOTA 2UXBK 3LM9A 4RWTA 1LWFA 3SYZA 3MAQA 4KH5A 4MDBA 3D7EO 3R6MA 3KTQA 2WFBA 3AVAA 5AJ3K 3T7ZA 2P9NA 2NZTA 1DEJA 3HBTA 2BTFA 2QTDA 3ZT4A 4DQIA 1VQ7N 2V7ZA 2NRTA 3K5MA 4DV6K 4LF9K 1JKHA 2YI1A 4YORA 3U9DA 4I2PA 2O8BB 2ZWHA 3EL2A 3THWA 2QI2A 4BRGA 2FBXA 3IAYA 2IS3A 5KRTA 1ASUA 3MN9A 2QA4N 2RN2A 3V1QA 3V9WA 3VGLA 4C8MA 3M8RA 4OGEA 4YDUC 3I8DA 1TGOA 3IG1A 3LAKA 2I7NA 1Q8IA 1S1WA 4FW2A 4CF1A 4EP5A 4JKAA 3ZX0A 4BC2A 3MN5A 4ZHRA 4JKFA 3KLHA 4Y1DA 4FWMA 3P1GA 4CEEA 3O5BA 2ZM6K 5BRHA 1NMNA 2E4LA 2HNZA 1CZ9A 4FZZA 3FE1A 4H0VB 3OYJA 4DU1A 4CEBA 3SZ2A 3I56N 4YOTA 3NMUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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