2Q3SA

Ensemble refinement of the protein crystal structure of gene product from arabidopsis thaliana at5g06450
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
206
structure length
200
Chain Sequence
SASFDGPKFKMTDGSYVQTKTIDVGSSTDISPYLSLIREDSILNGNRAVIFDVYWDVGFTKTSGWSLSSVKLSTRNLCLFLRLPKPFHDNLKDLYRFFASKFVTFVGVQIEEDLDLLRENHGLVIRNAINVGKLAAEARGTLVLEFLGTRELAHRVLWSDLGQLDSIEAKWEKAGPEEQLEAAAIEGWLIVNVWDQLSDE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Protein At5g06450
publication title Ensemble refinement of protein crystal structures: validation and application.
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 61
structure length 200
sequence length 206
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2q3sA00
3QIOA 3LALA 3NH0A 4FJLA 3VQ7A 1NK5A 2Y1JA 3JSMA 1MU2A 4ELTA 2OPRA 2IS3A 1WLJA 4CGFA 1NJXA 3HJFA 2NUBA 3M8RA 4C8LA 1F21A 4Y1CA 3C95A 2O4IA 1JLQA 1ZBFA 3DOLA 3ISNC 4RW8A 4OGCA 1J9AA 4CGHA 3HM9A 4IBNA 2PY5A 4LSNA 4J2EA 4FJIA 1YTUA 2HHQA 1NJZA 3K5MA 1HNIA 3MECA 4GVMA 1WSIA 3NGIA 4HUFA 4KRFA 2FC0A 4FJ7A 1JLEA 4CIGA 3KIOA 4DSJA 1RBTA 1C1CA 3V9SA 4IG3A 3PX0A 4FJ9A 1KSPA 3RMBA 3NBPA 3L2QA 3OVNA 1NKCA 2E6LA 1GOCA 3V1OA 3ZT4A 4E7HA 1TAUA 3NGYA 4CK2A 4W5RA 3U3GA 4E7IA 1EXQA 3L2RA 1IKWA 2JLEA 1ASWA 3SZ2A 4FZXC 2BGGA 4O44A 5JS1A 3AVLA 1RBVA 4HHTA 4IDKA 3NH1A 1RTIA 2YNIA 5J2PA 3CYMA 3QEPA 4Z4IA 1T03A 3L2VA 3MEGA 2YKMA 4R5PA 3IRXA 4Z4CA 4CF8A 1KVAA 4E89A 4DTUA 1TKTA 3QIPA 2YKNA 5I3UA 4B3OA 4DF4A 1CZBA 4OGEA 4BE2A 1B92A 4Y1DA 4ELVA 1Y97A 4LH4A 4N76A 1U45A 1S9EA 5KGWA 4DWIA 4CERA 4DU4A 3HL8A 5C24A 3CG7A 3NF7A 2EX3A 4CF9A 4ZHRA 3QERA 3PO4A 2YNHA 1HPZA 1L3TA 5JS2A 1DTTA 4FJHA 4CJKA 3OJSA 3L3VA 4O55A 3BDPA 3TAPA 3B6PA 4HUEA 1QSLA 1BISA 1X9MA 3OYNA 4CHQA 4DLEA 1R0AA 3SQ0A 3ITHA 2IAJA 1S6PA 4YFUA 3TAFA 4YNQA 3ULDA 2OZSA 2RKIA 4KPYA 1Z25A 4FCYA 1KLNA 4CEBA 3K59A 2ITGA 3V9WA 3VQDA 2RF2A 3LAMA 4CECA 1TKDA 4M3ZA 4FJ5A 1BCMA 3ZSVA 4AHUA 4CJQA 1NK7A 4CHZA 3CFOA 3AVAA 1FXXA 3P5JA 3P1GA 3C6TA 4KAZA 2B5JA 1LV5A 4ELUA 3VN5A 4FW1A 3KK3A 1BCOA 1TKXA 4FLUA 4QAGA 4CIEA 1S1VA 4KB1A 3DLKA 4E19A 5HRPA 4ID5A 1HJRA 3SYZA 2BDPA 4IFYA 3DLBA 5HRNA 3OYHA 1NKEA 4MFBA 4DSKA 3KLFA 3OJUA 3I8DA 3K5NA 1RDBA 3NF8A 3ASMA 4CJRA 2G8UA 2HNDA 1KTQA 1HNVA 3O3HA 3PO5A 3QEXA 3T3FA 4DMNA 4E3SA 1W9HA 2YNFA 4HCBA 4NCGA 1DTQA 1I3AA 3SUQA 3KKSA 5I42A 4B9LA 4LH5A 1A5VA 2VWKA 4DS4A 2F96A 2OZMA 4K8ZA 2F8SA 2Z1JA 1Z26A 3KK1A 1JL2A 1HYZA 4FM1A 2QXFA 2VG7A 3ZT1A 4FK4A 4MQ3A 1UAXA 1BQNA 2OPQA 2G8FA 2PZSA 4KFBA 5FDLA 3OYDA 4J2AA 3OYAA 1VRUA 4OPJA 3I0RA 3MXIA 1C0UA 5SWMA 3S3NA 5HLFA 1VSLA 2IOCA 4E7JA 4C8KA 4FW2A 4JRQA 3RTVA 4FJXA 3G10A 3AV9A 2KFZA 3AO2A 4O5BA 1ASVA 1CXUA 3SNNA 3AO1A 4DFKA 5HROA 5DMRA 2D0BA 4E1MA 1JLFA 4DQRA 1U47A 3SQ4A 3RR8A 4BE0A 4M45A 1WN7A 1BIUA 1WSEA 1RTDA 3QLHA 2GBZA 4IG0A 1ASUA 2ATQA 4JLHA 1RBSA 3QESA 4FYDA 2Y1IA 1C6VA 3VQAA 3LPTA 3WNGA 3OS2A 3KD1E 1TVRA 1KVCA 1CXQA 2D0AA 2G8WA 4CEFA 4DFMA 3PX4A 3PX6A 1N6QA 2YV0X 3DYAA 5D3GA 1HYSA 4F8RA 2XO7A 4CHPA 1D8YA 1A5WA 4J2DA 3NDKA 2XY5A 3HK2A 2OPSA 1J54A 1RDAA 1WSJA 3D45A 1ZBIA 4O4GA 4FK0A 4DU1A 1RT1A 1N5YA 2HNYA 2ZD1A 3C94A 4KTWA 3S3OA 1ZBLA 1UA1A 4DF8A 4DTXA 4FVMA 1GOAA 1LAVA 1REVA 4E1NA 4FM2A 3SCXA 4RW6A 4KI4A 4CESA 4RW7A 3LPUA 3K5LA 1HQUA 1T8EA 3DLHA 4F3TA 1TK0A 4F4KA 1XWLA 2ZE2A 2P1JA 4DQSA 2G8IA 3V1QA 3HPOA 5KTQA 1VK0A 1CZ9A 1D9DA 4GW6A 1X9WA 3AVCA 2QKBA 1ITGA 1NK4A 4CEEA 1NKBA 1WSGA 3MXMA 3NF6A 3SPZA 1VSFA 4CFDA 4I7FA 4FZZA 1NK6A 5FRMA 4BWJA 5J2MA 4Q0BA 4OJRA 4E0DA 3OS1A 2IGIA 1XI1A 4KHUA 3ZSQA 3ALYA 1XC9A 5SZTA 4I9LA 2KZMA 4CK1A 5EU7A 2BANA 2FBYA 4DTNA 1X9SA 4OLBA 3AO3A 3QNOA 4M3XA 3HPGA 4BACA 1EETA 4H8KA 2HHVA 1O1WA 3KK2A 3EYZA 3PY8A 3ZSYA 4CK3A 4N5SA 3F9KA 3VQ8A 4Z0UA 4CJ4A 4CEDA 1BI4B 1ZYQA 3HVTA 3HP9A 2RPIA 4CHYA 1NK8A 1BL3A 2GV9A 4I2QA 4F2SA 2Q3SA 3LWLA 4Z4FA 5KRTA 3RMDA 4CIFA 3HO1A 4ZTJA 4N47A 3KLEA 3AA2A 1G15A 1SKWA 4IKFA 4DSLA 3WNFA 2HHXA 1KRPA 4DSIA 3AVBA 3KLIA 4DU3A 3TAMA 3KLHA 1BGXT 5CYMA 3ZSXA 2DTUA 2HMIA 4CHNA 2XY8A 3RR7A 4I9QA 1L3UA 4DTMA 2I5JA 3DRSA 1ZBUA 1CLQA 2G8HA 5K14A 1KFSA 1VSHA 4H4OA 4M3WA 4FLZA 3ZCMA 3VQQA 1B9DA 3NH2A 4FXDA 2YHBA 1GOBA 3VQ6A 3SJJA 2VG5A 4FJGA 4C8NA 4NYNA 1SKSA 3P83D 2A1RA 3K5OA 1T7PA 4B9SA 2XY6A 4W5OA 3L3UA 1QS4A 1QQCA 2HNZA 3TARA 2X78A 4B9TA 3AO4A 5HRRA 5CZ2A 3AVFA 1JLAA 3EZ5A 4N41A 4DQPA 4FJKA 4CJ3A 1HQEA 5HBMA 4KTQA 3VQ5A 1RT2A 1HYVA 3HP6A 1YVUA 4LD0A 4DSEA 3KKRA 4OVLA 3V9UA 3SV3A 1RT6A 3AVKA 2E6MA 4FJNA 1ZBHA 4KTZA 2AJQA 1TK5A 1WNSA 3KD5E 4AH9A 3SQ2A 5CZ1A 1JL1A 3OYCA 3QINA 4HUGA 1SL0A 4FLWA 4NCBA 4CF0A 1NK0A 2B6AA 4E7KA 5CY4A 1RILA 1WSHA 4DQIA 1U49A 2HVIA 1K6YA 4CJLA 2HW3A 3CFPA 3V6DA 1JKHA 4CFAA 4XIUA 4W5TA 2ETJA 2QKKA 4M3UA 3AVJA 4EP5A 3DRPA 4LY7A 2HHWA 4DS5A 1LW0A 1RT5A 4CGIA 3UIQA 3DMJA 3U3YA 4CJPA 3OS0A 1IKVA 3V1RA 3SQ1A 3M8QA 3THVA 1RBUA 4Q5VA 1QSSA 4F2RA 1X1PA 1YTAA 5HP1A 1L3VA 3AVGA 1S5JA 4C8OA 1NJYA 3CFRA 3LWMA 3MAQA 4AHRA 3ZSRA 4JS4A 2F8TA 3V81A 4M3TA 4ID1A 4E7LA 2RN2A 1A5XA 2PYLA 2IC3A 3EY1A 4O0IA 4L8RB 1WSFA 3RMCA 4CFCA 2KFNA 4GMJB 3V4IA 2EHGA 2P51A 4OKKA 2GUIA 1W0HA 3KTQA 5J1EA 4RG8A 1RDCA 1KVBA 3V9ZA 3QNNA 1RTJA 1S1TA 4J2BA 3L2UA 3TAGA 1UA0A 4QCLA 1FK9A 3WNEA 3T1AA 2A1SA 3LP0A 1KLMA 4AHCA 2HHUA 3C6UA 4CEOA 1SKRA 2Z1HA 1RTHA 1KFDA 3HSTB 1YT3A 3B6OA 1QTMA 4M3RA 4LSLA 3MXJA 1S1WA 2VG6A 5C42A 1QHTA 4AHTA 3L2WA 3T19A 4ZTFA 3M8SA 4CJTA 4CEQA 1VSJA 4FLXA 4OLAA 4BDYA 3HT3A 3QO9A 5HRSA 4CGJA 3CQ8A 3RWUA 2KW4A 4WE1A 1NJWA 4Z4EA 1B9FA 4DTSA 1U4BA 2KZZA 3DOKA 1J5OA 1EX4A 3SUNA 2G8KA 1C0MA 1U04A 4W5QA 1S1UA 1BIZA 1BQMA 4H4MA 3O4QA 5T7BA 2DY4A 4ICLA 3QEWA 2P5OA 3DI6A 3CM5A 3NCIA 4DG1A 5KRSA 2OA8A 5CYQA 3M8PA 2YNGA 1TAQA 4FK2A 4B8CA 2DFFA 1VSKA 1S9GA 3I0SA 4NYFA 3TI0A 3AVNA 1HMVA 2R7YA 4FLVA 1IH7A 1RBRA 4CJFA 1C1AA 1RCHA 2HB5A 4PA1A 3F73A 3SUOA 4CGDA 3JYTA 5FROA 2LSNA 1QE1A 1NOZA 3OYBA 3L8BA 3AVMA 4HCCA 1FKPA 2HHTA 4FM0A 5C25A 2WONA 3E01A 5DK5A 3SV4A 1D9FA 1TL3A 3DLGA 3PV8A 1IG9A 1NOYA 4KHYA 3LAKA 3VQPA 3HYFA 4CJUA 4DSFA 4KB0A 4CGGA 1LAWA 1EP4A 3A2FA 3OYJA 4FJ8A 3OYKA 3U6FA 2Z1GA 1RT7A 4RW9A 3LZIA 1XHZA 3DLRA 2ZQBA 1L5UA 3S9HA 5KGXA 4DTPA 3QETA 1VRTA 1LWCA 3O3GA 3KLGA 3CM6A 3VQBA 3WNHA 2X6NA 3NFAA 4KKOA 4B08A 4CEZA 3IG1A 4B9MA 4CJEA 3RRHA 4EP4A 1UOCA 1TGOA 5E41A 4M41A 3RRGA 3LDSA 1VSIA 3QEVA 4F3OA 4M3YA 1WAFA 4UQGA 3DRRA 1KCFA 2VWJA 4O0JA 3V9XA 4B9NA 4KI6A 4IFVA 1RNHA 2JGUA 2X74A 2XHBA 4DTOA 4EZ6A 4G1QA 4FLTA 3O4NA 4Z4HA 3OY9A 4DFJA 1NK9A 4B9VA 4KHSA 4PY5A 4KV8A 3NE6A 4KO0A 3H08A 1IKYA 3AA4A 3VA3A 4CJ5A 3QEIA 2Z1IA 1Q8IA 3OYLA 3K57A 3MEDA 2BE2A 2FBVA 2QK9A 3AVHA 4OKJA 1RT3A 1I39A 3VQEA 1SV5A 4CCHA 3TR8A 1D5AA 1EKEA 2O4GA 4FJMA 3K2PA 2D0CA 3BGRA 2KQ2A 3AA3A 4DFPA 2HHSA 1JLGA 4BWMA 2W42A 1JLBA 3S3MA 2KTQA 3SI6A 3VA0A 4CFBA 3AA5X 1IO2A 5J2QA 3SUPA 4RW4A 4CE9A 4FJJA 2XRIA 4KHQA 1S6QA 3OYMA 3HXMA 2PYJA 3G0ZA 2D5RA 3TANA 4QOZB 3TAQA 4PUOA 2P5GA 1XHXA 4AHSA 1BI4A 1TV6A 4DQQA 1LWEA 3NAEA 1JXEA 1SUQA 3DLEA 2B4JA 4C8MA 3O3FA 1LW2A 1UWBA 3VQ4A 3RMAA 3TAEA 3NGZA 3ZT0A 4W5NA 1LWFA 1DLOA 3LP1A 3ZT2A 4FLYA 4OKEA 1L3SA 4HVJA 3AVIA 3LP2A 4N56A 4FZYA 3AO5A 1BHLA 2X6SA 4CF2A 4PQUA 4PWDA 4BDPA 2WOMA 1JXBA 1WAJA 2FBTA 4B8AB 3TABA 5KI6A 4NCAA 4BDZA 3D0PA 3IS9A 4JRPA 1VSMA 2DFHA 3IAYA 4KREA 3OYFA 1TKZA 3MEEA 3LZJA 3SPYA 1Q9XA 4B9UA 2FBXA 1RDDA 4BE1A 4OPKA 2OPPA 3ZSZA 2G8VA 1C0TA 1VSDA 3OYEA 3VQ9A 1SL1A 2OYQA 1S1XA 3ZT3A 1JLCA 4TSXA 4M42A 4CJWA 1J53A 4JS5A 5FRNA 4KHNA 4DTJA 3LP3A 3FFIA 4KHWA 5J2NA 4DLGA 2XY7A 3PUFA 1FKOA 3NF9A 1C1BA 3HPHA 3ZSOA 4DTRA 1T05A 2E4LA 3LANA 4CJVA 3KJVA 3OYGA 3OYIA 1RT4A 1QSYA 4Z4GA 4CJSA 1SL2A 4CEAA 3DM2A 3VQCA 1TL1A 2YHAA 4AILC 4K8XA 2DFEA 3HVRA 1HRHA 3TWHA 1Q9YA 2HVHA 3NHGA 4CF1A 1U48A 1VSEA 4CHOA 3ZSWA 3K58A 1IKXA 4HTUA 1TK8A 4AHVA 4EZ9A 4I2PA 2IDOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KHPK 1Q82O 3ID8A 1NK5A 2BH1A 4CW7B 1XUPO 2IS3A 1WLJA 4CGFA 3HJFA 1JLQA 3DOLA 4RW8A 3G71N 4OGCA 4IBNA 2Q2RA 3D2FA 4J2EA 1YXQA 3K5MA 2FC0A 1JLEA 3KIOA 4DSJA 2VYPA 1C1CA 3V9SA 1H1VA 3RMBA 3NBPA 3JAMO 3OVNA 1GOCA 3C6HA 5AQGA 4KI4A 5EOYA 1EXQA 3ID6A 3SZ2A 1ASWA 5AZJA 4LFBK 2CGKA 4HHTA 3QEPA 3NH1A 1RTIA 4CF8A 1KVAA 4B3OA 1TKTA 4DR4K 3CMEN 2E2PA 3VEYA 4DF4A 3RSEB 3N4QA 5B8HA 3AGKA 3UKRA 2ZJQL 4DU4A 4H0OA 1L3TA 4FJHA 5M1FA 4HUEA 1BISA 3E9LA 1R0AA 1KAYA 3TAFA 4YNQA 2RKIA 4H0VB 1Z25A 5H1SQ 3K59A 3V9WA 3VQDA 2RF2A 3LAMA 4FJ5A 4CZIA 2W6LA 5KPTA 2Q36A 1NGFA 3FGUA 4FW1A 1TKXA 1S1VA 4KB1A 3C7NB 5HRPA 2BDPA 1HJRA 2YHWA 4EIAA 3DLBA 3E1YA 4DSKA 1BWFO 3K5NA 2O8BB 4M63C 3C65A 3NF8A 2G8UA 2VCPA 1KTQA 3PO5A 3E9OA 4DMNA 1NMDA 4E3SA 2YNFA 3VOVA 5I42A 4QS9A 3ZEUB 1JL2A 2QXFA 1QVFM 2GWKA 5AR0A 4MQ3A 1UAXA 4CD3A 4AM7A 4FW2A 2QWLA 1ZC6A 1KC8O 1CXUA 2F9TA 5TKWA 2HOEA 4E1MA 4DQRA 4BE0A 3FE1A 2ZGYA 1ASUA 4XEIA 1RBSA 3QESA 3WNGA 3OS2A 3LPTA 1EO1A 3A5OC 1TVRA 1CXQA 3P31A 2G8WA 4DFMA 3PX6A 3CCQN 1N6QA 5D3GA 1Q7YO 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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