3F2KA

Structure of the transposase domain of human histone-lysine n-methyltransferase setmar
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
222
structure length
197
Chain Sequence
HELTENQKNRRFEVSSSLILRNHNEPFLDRIVTCDEKWILYDNRHPKKVMVTIWWSAAGLIHYSFLNPGETITSEKYAQEIDEMNQKLQRLQLRKGPILLHDNARPHVAQPTLQKLNELGYEVLPHPPYSPDLLPTNYHVFKHLNNFLQGKRFHNQQDAENAFQEFVESQSTDFYATGINQLISRWQKCVDCNGSYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title The Crystal Structure of Transposase Domain of Human Histone-lysine N-methyltransferase SETMAR.
rcsb
molecule keywords Histone-lysine N-methyltransferase SETMAR
total genus 67
structure length 197
sequence length 222
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.1.1.43: Histone-lysine N-methyltransferase.
pdb deposition date 2008-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01359 Transposase_1 Transposase (partial DDE domain)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.470 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3f2kA00
3K9JA 5CR4A 4MDAA 5HOOA 2F7TA 3HOTA 3F2KA 4U7BA 3K9KA 4R79A 4MDBA 3HOSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JI0K 3OA9A 4DF4A 1YTAA 1FW6A 4RW9A 3C0BA 3HO1A 3MECA 1I39A 1VQKN 1WB9A 1SAZA 1SKSA 4CZHA 4B9NA 3RMAA 2UXDK 4IOAL 1BA1A 3F5TA 4W5OA 4FWMA 2QWRA 5I3UA 2IS3A 3CCMN 3HTVA 4JEPA 1T7PA 4QS8A 4FLYA 4FJLA 4H03B 4CZIA 4KB0A 3HOTA 3VETA 1HPZA 1I94K 3FZKA 4FLWA 4PL7A 3VQ6A 4UY8O 1DGKN 1HKCA 2KW4A 2DY4A 2HBLA 3ZCMA 4R5PA 3SUNA 5AQZA 1Q9YA 4XEIA 3LAKA 4BR5A 1TVRA 5BRDA 1NGFA 3NFAA 3TWHA 2AP1A 4B08A 1QTMA 3TSPA 3ENHA 4LF5K 2GUIA 3K5NA 2QWMA 4BRCA 2ZJRL 4DSIA 3FE1A 4CK3A 3H3OB 3E66A 5E26A 3OY9A 3AVIA 1QZ5A 4IZ9A 3L4IA 3P5JA 1T6DA 5AQKA 5ADXH 1JJ2M 2P9UB 3WNHA 3RTVA 1HPMA 2W42A 1WSIA 5AQTA 3OBYA 5KQ8A 4CFDA 4H0VB 5F1XA 5GAEP 3LP3A 1S1WA 2G8VA 1ZBIA 4GY2B 3VGMA 1YF5L 2NUBA 1SKWA 2O8FB 5AQUA 1JKHA 4F9OA 4JKBA 1BCOA 5AQIA 4DU3A 3V6DA 4KRFA 5KPZA 4GV9A 3WT0A 3AVGA 3LPUA 4CJEA 4WQ5C 1U6ZA 4CBXA 4IBNA 4BDZA 3KJVA 1VQON 4BR0A 3PUFA 3GG4A 2KFNA 1VRUA 2IVPA 4CZKA 2OANA 4GKJK 2G8IA 4G9ZA 3HVRA 4BACA 1GLLO 1YTUA 3AVBA 4DMNA 1WSJA 3FR0A 3IUCA 3EEQA 3ZT2A 4CHPA 5JICA 4RWTA 1HQEA 3SBTA 1S5JA 3QINA 3ZLJA 4Z0UA 3AAQA 3E01A 4FXDA 1IJJA 4CJRA 4A57A 4ILGB 1NNEA 4FLZA 1KLNA 3I33A 4CJQA 4HTLA 3C6TA 4NYNA 3I0SA 1D9FA 1YIJN 2P5GA 4M3TA 5FDLA 3CQ8A 3CJ7A 3WNFA 2HHHK 3AVJA 3CCSN 1KQSM 3C6HA 3HVTA 2P9PA 5AQNA 3EZWA 2UXBK 1TKTA 1IKXA 4CFAA 4FO0A 3I0RA 1OH8A 5HOOA 4CVNE 2OPPA 4H5TA 1BIZA 1VSDA 1VSKA 5C2DA 1WSEA 4CESA 3K58A 3QEIA 4IG3A 3FFKB 1EWRA 4CGHA 4Z4IA 3PLAA 3HBTA 4W5TA 4AHSA 3MMVA 1E4FT 1QQMA 3IFRA 1JLCA 2NRXA 2ITMA 2D0BA 1NU0A 3TAEA 2RPIA 4MLEA 3MX2A 4DFMA 2ASMA 3NBPA 4JNEA 3VQ8A 2BTFA 1W7AA 1JCFA 1RT2A 4BR4A 3THWA 1TKDA 3UKUB 3CXCM 3R3LA 1VQLN 3QNOA 2W6LA 4UQGA 2VGMA 3SV4A 5J2MA 2QTDA 3OYLA 5KGXA 4M3ZA 4Y1CA 4IDKA 5F0XA 3OYGA 5FPEA 4K43A 3ZSQA 2BUPA 4DV4K 4DKWA 4E7HA 1LAVA 2O8DA 1GOAA 3TSQA 2KTQA 4IO9L 3VEWA 1SL1A 4DQ8A 4FWPA 2O4GA 3THVA 2OZMA 3GBTA 3LDLA 1RDAA 5GADP 1DLOA 1ATSA 4OGCA 4BG8A 3MXJA 4DS5A 3HSCA 1TUYA 3T3FA 2FSJA 4BRFA 3CCRN 4DR6K 2IC3A 3DOKA 3CJ1A 1JLEA 1RBUA 3BF3A 2G8UA 3H46O 3CCJN 4AHTA 1ILYA 4IOXA 4WQ4C 3LL3A 5K14A 4N56A 4F2RA 1JL1A 3CJBA 1GLJO 1O13A 3DI6A 4A5AA 3HRGA 4Z4CA 1IKWA 5T7BA 4KV8A 4KHSA 2F8SA 4FYDA 2RF2A 4IG0A 3KKSA 3NDKA 1HNWK 3QFUA 3NVMA 4ISEA 1A5XA 2ETJA 3NF8A 4BRNA 1YJ9N 3O6WA 3KK2A 2YNGA 4QS9A 4CHOA 4LH5A 3LPTA 4FWKA 1OH7A 3ALYA 5FLXO 3M8RA 1U49A 3VN5A 4H5RA 3K0SA 4KHUA 1SUQA 3M8PA 3NH0A 4CD1A 3SQ1A 3MDQA 3W3DA 3G71N 4B3MK 4IKFA 4FK4A 2A40A 1UWBA 1NK7A 1KD1O 1QE1A 1CZAN 1TKZA 4KTWA 3RRHA 3TAQA 2PYJA 1RDCA 3SJJA 1S3XA 2RHKA 1L3UA 4DQQA 3P38A 2Z1IA 4EHUA 4FOIA 3ATVA 1ITGA 1UA0A 4B3SK 2A6AA 2ASPA 2HHWA 2Q1NA 3CD6N 1YT3A 3CM6A 2ASOA 1KFSA 2DTUA 4JRPA 3ZT1A 1W2BM 5J2NA 3ENOA 1BI4B 2QXLA 4DV1K 1Z6RA 1VQ4N 5GAHP 2FBYA 3VQAA 1DKGD 3LALA 1OVYA 3O9QA 3QICA 4IDHA 5HRRA 4K42A 4BRHA 3MN5A 1SKRA 3TTCA 3K2PA 1M1KO 2QKKA 4NCBA 3WUHA 4DV7K 2NNWA 5BR9A 1XUPO 1ZBFA 4HVJA 4M3RA 3LZJA 4YHHK 4K8ZA 3DXKA 1CLQA 4BY9C 2GTDA 2NRTA 1IKYA 4LF4K 2ZF5O 3AAPA 1I3AA 5C42A 1GLDG 4W5RA 4LF9K 1NK0A 2GX9A 3EL2A 1EQYA 4AH9A 5HRPA 1T3VA 4I2QA 3LDPA 1H1VA 4CZFA 3H08A 3L2UA 1FXXA 3CPWM 3M5RA 2E6MA 3VQ4A 3OVNA 3AY9A 4CJWA 1K9MO 4FJKA 1MWMA 3NE6A 1QQCA 4M7YA 3ZETA 4CEEA 5AQJA 3RR8A 4G1QA 4LF8K 3UB5A 1HJRA 1BIUA 3KLIA 1NGHA 1D9DA 2VG5A 4Z4EA 5AQMA 3GE1A 5LJWA 1NGJA 1HRHA 4V19S 4CGFA 3BP8A 2Z1GA 3OYJA 1OH6A 1T03A 4F4KA 2V7YA 3RMBA 2F7TA 4DLEA 1WN7A 1M90O 3GDQA 3LP0A 4FWLA 2F96A 3A5LC 3SQ4A 4JKHA 4M63C 4CHNA 3L8BA 1TGOA 4LFBK 3HT3A 1Z26A 3KLFA 2NLXA 3VTIA 1RTIA 2KHOA 4I9QA 2QA4N 4M3YA 4DQPA 3OTOK 3KK7A 4IEEA 4E7KA 2O8DB 1DTQA 1HUXA 3T1HK 2A41A 2W40A 1RDDA 3OYFA 3QMLA 3EKSA 4Z4HA 1WAFA 2VQEK 1HNVA 2HSTA 1REVA 1Q8IA 4Y0WA 2O8FA 5IWAK 1GLEG 3J7ZO 5JVHL 2W6KA 3MK6A 1KCFA 4B1ZA 3F9KA 4CK2A 5J2PA 3AVFA 3VQ7A 1YI2N 1K6YA 4I9LA 3JYTA 2DFEA 3QDKA 3VEVA 3KLGA 1KAYA 4LD0A 1YVUA 1U2VA 3DLLL 1NGEA 2UUAK 3HP9A 4KKOA 1NOZA 3J7YP 1WBBA 2HNYA 4DV6K 1UOCA 3J80O 4FWNA 1NGDA 3ULEA 4BROA 3D2EA 2V7ZA 2PZSA 1GLAG 1WSHA 4I7FA 2HHXA 3EKUA 2XY7A 3DOLA 4N5SA 4Q5VA 4B9TA 4FJ7A 2FLOA 3VTHA 5EOYA 2D0AA 3I56N 4FW2A 2VGNA 3CMEN 2Z1JA 3MAQA 4PKHA 1LW2A 3MWPA 4GKKK 4H4OA 3KIOA 5CYQA 4ELTA 1NK8A 2X6NA 4DV2K 4OKEA 4M42A 3PSIA 3L6QA 1BQMA 1S1XA 3F9MA 2EX3A 4YOXA 5EY4A 1IBLK 4B1UB 3CJCA 3LP1A 2KZMA 1J5OA 3NAEA 5HRSA 1NMNA 4ELUA 4N47A 4H8KA 3P39A 4DR5K 3OYIA 3HI0A 3H3NO 2ZD1A 3HL8A 4CFCA 4DU4A 4HCCA 4H0XB 4FZZA 2X6SA 4PA1A 5M1OA 3L2VA 1CXUA 3NF9A 4JV5K 1S6QA 2HMPA 1RILA 2HBKA 3ZSZA 2QWOA 3AVHA 2I7NA 2CGLA 4H0PA 1QQOA 1WLJA 2ZJPL 1Q9XA 3MWTA 1JLBA 3CERA 3QEWA 2Q0RA 1N33K 5LY3A 1XNQK 3OYHA 2EWSA 1NGIA 4YFUA 3AO4A 4PKGA 1N36K 3PO4A 2A3ZA 1NKEA 2E6LA 3SK3A 3DXKB 5SWMA 1N32K 4DFPA 4DSLA 4OX9K 2IOCA 2D1KA 3UKUA 3Q7BA 1VQ5N 3CPEA 3CG7A 3NMUA 2YJEA 2HNZA 3S3NA 2WUSA 3VF4A 3PX6A 3SAHA 2BANA 4KTZA 4M45A 1EO1A 1NJZA 4FM1A 4AM6A 1VQ9N 1BGXT 4OO1J 1EKEA 2FBTA 4IFVA 4K0KK 4KI6A 3TPQA 3SUPA 1NKCA 3MCPA 3AA2A 3DLBA 5C2FA 4RG8A 3ZETB 3H45C 3VQEA 5KPTA 1IBMK 4MQ3A 4BRQA 3TARA 1X1PA 3ENBA 4YNQA 3NGZA 4CJLA 3AA5X 1HNZK 1BG3A 1SQKA 1C0UA 3TU5A 1X9SA 3D45A 4FJ9A 3DRPA 3OS2A 2DFHA 4O4GA 4FPAA 3G0ZA 3P1GA 3QLHA 4ICLA 4B8AB 1WNSA 4JI4K 3FZLA 4B9SA 1QSLA 4EFHA 3EE9A 3VPZA 3CFRA 2IVOA 5FROA 2B6AA 4PQUA 4CJUA 4W5QA 3UE5A 3FGUA 3B6PA 2GWKA 2JWKA 3TR8A 3KHYA 2QK9A 3OYAA 5C12A 1BHLA 1HJOA 1RTJA 4FLXA 4IEIA 3WXIA 3O5BA 1J54A 4X66K 3O4NA 2VCPA 3RSEB 5BPNA 4JD2A 4E1NA 1DTTA 3BZKA 3HYFA 1X9JA 1ZBUA 1EWQA 4IFEA 2OCEA 2IDOA 2J4RA 3AVLA 3HPGA 4BRIA 3HPHA 3L2QA 3SAGA 4NO7A 4O8UA 5EU7A 1BA0A 3A5MC 1NLVA 3R8EA 1U2VB 3CQYA 3BF1A 2XO7A 1XNRK 3VQ9A 1C0TA 3AARA 3DRSA 1QQNA 2P9NB 4DTJA 1LAWA 1QHAA 3ULEB 3D2EB 4X62K 1KVAA 2GBZA 1NWKA 3HOSA 5CZ2A 3SLCA 1BI4A 4WCEL 2E2NA 3JXUA 3RRGA 3ZSWA 2PBDA 4H5VA 4ELVA 4CGDA 3DYAA 2F8TA 3MN9A 3E9PA 4FJNA 4ZTJA 4C23A 2HF3A 4DCHA 4NCAA 2ZGYA 2Q97A 3VGKA 4B3TK 2QKBA 4KAZA 2UXCK 1C0FA 2V52B 4CJVA 4JI5K 3EO3A 3WQTA 4C8LA 4DTNA 5JVGL 1VSLA 2A1SA 3SJHA 1MA9B 2HVIA 1VAZA 4DR3K 1U48A 2XRIA 4CHYA 3FZMA 3TAGA 3QESA 4KHYA 4GV6A 3BUZB 4FLTA 4E7LA 1NK4A 3ZEUB 3MN6A 1BOTO 4CJ7A 4CECA 4BWMA 2HNDA 4XH5A 2OTLN 4BR9A 4CEAA 3ID6A 1JCGA 4AHCA 4CIEA 3CJAA 4FLUA 3QB0A 1TL1A 3LWLA 1YHQN 2VG7A 1C0GA 1TKXA 2NRVA 1SV5A 4Z4FA 1QVFM 4FK2A 4RTFD 2GELA 3R6MA 1XI1A 4H5WA 4IJAA 1Y97A 3MXMA 3KK1A 1XHZA 3H1VX 4DUYK 4HWIA 1DEJA 5HL7L 1UA1A 3ATUA 4CEQA 3ZT4A 1KXPA 3TAMA 1S6PA 2WBNA 5FRMA 1C1BA 3DAWA 4JI3K 3BY5A 3M1FA 3BEXA 2FF6A 3SPZA 4CZGA 2R7YA 4DSJA 2WTUA 4K41A 4CF2A 1NJWA 4KH5A 4CK1A 3UIQA 1LOTB 4JAXA 4E19A 3TTDA 3IG1A 2GV9A 3JS6A 3R9PA 3DM2A 3TAPA 1A5WA 3K5MA 5AQXA 1RT4A 3AVKA 3OYKA 4FSVA 1JLGA 4E7IA 2ZM6K 3CI5A 4C8MA 4EHTA 4DTXA 2Q0UA 4CIFA 1BWFO 4BE0A 1GLCG 4CEBA 4X64K 1NK5A 2HB5A 5TKYA 5GIPA 4YOVA 5MLCQ 1U04A 4IXCA 4BC5A 3V9WA 1EX4A 3CFPA 3QBXA 2O8CB 4ID1A 3NH2A 1FK9A 2OPSA 3VQBA 2YHXA 2P9SB 2YCHA 5EX5A 4RW7A 4DF8A 3VQPA 1NGCA 3ZX2A 3MN7A 5AQSA 3C94A 4CJTA 4FWQA 4CF9A 4J2DA 4DV0K 4DLGA 3M8SA 3UKRA 5KRSA 3NH1A 4E0DA 3QFPA 3J7AP 3I8DA 3NF6A 4EAHD 4RW8A 4JI7K 1QS4A 5BPLA 5A2QO 1HNXK 4JD2B 3OBWA 4FM2A 1LCUA 1RT7A 2QW9A 4FLVA 2BDPA 3EY1A 2UU9K 5JLHA 4OVLA 4IFYA 3W0LA 3LAMA 3VF6A 3OJUA 3BZCA 3RMDA 3S3OA 3EN9A 4B1WB 1NGGA 4WFAL 3N4QA 3G4SN 3C65A 2NRRA 4B3RK 2E2OA 3VEXA 2QXFA 4ILJA 3JSMA 4DSFA 3U6FA 4NYFA 5CR4A 4BRAA 4EP5A 3CF5L 1QZ6A 4C8NA 3CYMA 3CFOA 4LC9B 1VSMA 5E84A 4B9QA 3HM9A 1CZBA 4DTSA 1TAQA 3PY8A 3QEXA 3NGIA 3IS9A 2D4WA 2JWLA 3IRXA 4JS5A 3HJFA 4CJ5A 1BUPA 3K5OA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3K9J A;  5CR4 A;  4MDA A;  5HOO A;  2F7T A;  3HOT A;  3F2K A;  4U7B A;  3K9K A;  4R79 A;  4MDB A;  3HOS A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4JI0 K;  3OA9 A;  4DF4 A;  1YTA A;  1FW6 A;  4RW9 A;  3C0B A;  3HO1 A;  3MEC A;  1I39 A;  1VQK N;  1WB9 A;  1SAZ A;  1SKS A;  4CZH A;  4B9N A;  3RMA A;  2UXD K;  4IOA L;  1BA1 A;  3F5T A;  4W5O A;  4FWM A;  2QWR A;  5I3U A;  2IS3 A;  3CCM N;  3HTV A;  4JEP A;  1T7P A;  4QS8 A;  4FLY A;  4FJL A;  4H03 B;  4CZI A;  4KB0 A;  3HOT A;  3VET A;  1HPZ A;  1I94 K;  3FZK A;  4FLW A;  4PL7 A;  3VQ6 A;  4UY8 O;  1DGK N;  1HKC A;  2KW4 A;  2DY4 A;  2HBL A;  3ZCM A;  4R5P A;  3SUN A;  5AQZ A;  1Q9Y A;  4XEI A;  3LAK A;  4BR5 A;  1TVR A;  5BRD A;  1NGF A;  3NFA A;  3TWH A;  2AP1 A;  4B08 A;  1QTM A;  3TSP A;  3ENH A;  4LF5 K;  2GUI A;  3K5N A;  2QWM A;  4BRC A;  2ZJR L;  4DSI A;  3FE1 A;  4CK3 A;  3H3O B;  3E66 A;  5E26 A;  3OY9 A;  3AVI A;  1QZ5 A;  4IZ9 A;  3L4I A;  3P5J A;  1T6D A;  5AQK A;  5ADX H;  1JJ2 M;  2P9U B;  3WNH A;  3RTV A;  1HPM A;  2W42 A;  1WSI A;  5AQT A;  3OBY A;  5KQ8 A;  4CFD A;  4H0V B;  5F1X A;  5GAE P;  3LP3 A;  1S1W A;  2G8V A;  1ZBI A;  4GY2 B;  3VGM A;  1YF5 L;  2NUB A;  1SKW A; 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 3HBT A;  4W5T A;  4AHS A;  3MMV A;  1E4F T;  1QQM A;  3IFR A;  1JLC A;  2NRX A;  2ITM A;  2D0B A;  1NU0 A;  3TAE A;  2RPI A;  4MLE A;  3MX2 A;  4DFM A;  2ASM A;  3NBP A;  4JNE A;  3VQ8 A;  2BTF A;  1W7A A;  1JCF A;  1RT2 A;  4BR4 A;  3THW A;  1TKD A;  3UKU B;  3CXC M;  3R3L A;  1VQL N;  3QNO A;  2W6L A;  4UQG A;  2VGM A;  3SV4 A;  5J2M A;  2QTD A;  3OYL A;  5KGX A;  4M3Z A;  4Y1C A;  4IDK A;  5F0X A;  3OYG A;  5FPE A;  4K43 A;  3ZSQ A;  2BUP A;  4DV4 K;  4DKW A;  4E7H A;  1LAV A;  2O8D A;  1GOA A;  3TSQ A;  2KTQ A;  4IO9 L;  3VEW A;  1SL1 A;  4DQ8 A;  4FWP A;  2O4G A;  3THV A;  2OZM A;  3GBT A;  3LDL A;  1RDA A;  5GAD P;  1DLO A;  1ATS A;  4OGC A;  4BG8 A;  3MXJ A;  4DS5 A;  3HSC A;  1TUY A;  3T3F A;  2FSJ A;  4BRF A;  3CCR N;  4DR6 K;  2IC3 A;  3DOK A;  3CJ1 A;  1JLE A;  1RBU A;  3BF3 A;  2G8U A;  3H46 O;  3CCJ N;  4AHT A;  1ILY A;  4IOX A;  4WQ4 C;  3LL3 A;  5K14 A;  4N56 A;  4F2R A;  1JL1 A;  3CJB A;  1GLJ O;  1O13 A;  3DI6 A;  4A5A A;  3HRG A;  4Z4C A;  1IKW A;  5T7B A;  4KV8 A;  4KHS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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