4QS7A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) structure in glucose-bound form
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
460
structure length
455
Chain Sequence
WGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEDFHLPEGRQRELGFTFSFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDEVQKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSNDGSGIGAALLAASHSLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Hexokinase-1
publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 162
structure length 455
sequence length 460
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs7A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs7A01
1QHAA 3GDQA 2Q0RA 3BF3A 2D1KA 4J8FA 4HWIA 3VEXA 1MA9B 2CGJA 3ZX3A 1J6ZA 1K8KA 3W3DA 2GUPA 1T6CA 1BU6O 3MN6A 3ZETB 5F0XA 4AM7A 2P9IB 3EKSA 1X3MA 5TKYA 4XH5A 4A2BA 1GLFO 4H0XB 1BOTO 4XH1A 5EOYA 3H3OB 2V51B 3U8XA 3VGLA 4KBOA 1ESVA 1HKCA 3VENA 1HUXA 1IG8A 3GL1A 3VF6A 1D4XA 2QWLA 1E4GT 1RDWX 2GEMA 4GY2B 4B9QA 5BPMA 1XQSC 3EKUA 4NB4A 5AR0A 1QZ5A 3FZLA 2ZGYA 4BRMA 5AQKA 2ASMA 3I8BA 1G99A 1NGDA 3A5OC 5FPMA 2E1YA 3VOVA 3VEWA 3MMVA 2BUPA 4H0OA 4FSVA 2F9TA 3SLCA 3IMXA 4BG9A 2W40A 3MN5A 1WOQA 4JAXA 4BRPA 3U9DA 3O1WA 4BG8A 3D2FA 3KVGA 4H5VA 3R6MA 3CHWA 5AZIB 2CH5A 5JLHA 3B8AX 3O4WA 4IO8A 3GE1A 3VGKA 2WUSA 3FLCO 3HI0A 3ZETA 4CBXA 1HKBA 1X9JA 5BR9A 1DEJA 2J4RA 3WT0A 4MO4A 1ATRA 3FZMA 3A5NC 4BROA 1ZC6A 4I6MA 5KPTA 2EWSA 3ULEA 4BR0A 4JD2B 1U6ZA 5KQ8A 2PBDA 1LOTB 5AQQA 2HOEA 2P9LA 3DXMB 1MWKA 2YJEA 5KPRA 5LJWA 3AARA 2FSNA 3HTVA 3IUCA 3QBWA 1TYQB 2FLOA 3VEYA 2QWNA 4FWKA 3EN9A 3BUZB 3GOIA 3FZFA 1TUYA 2IVOA 3LDLA 2P9NB 4FWMA 5AQYA 2Q36A 4BRKA 3P4IA 5AQPA 3WXIA 1GLDG 4H0TB 4CZFA 3D7EO 2V7ZA 4WQ5A 1ZXOA 2IIRA 1T44A 2E2NA 4PKHA 4CZJA 4CZLA 2YJFA 5ADXA 1IJJA 5AQNA 3CJCA 3O1BA 2A41A 4IJNA 4JNEA 2V7YA 4Y0WA 2Q0UA 4A62A 1QQNA 2P9PB 2AP1A 3CQXA 1LCUA 5BREA 3MK6A 2NRHA 4CJ7A 2E20A 5BPLA 4FOEA 3VF4A 3TU5A 4CD3A 4BVPA 4GNIA 3L4IA 2NZTA 2VCPA 3QMLA 4BR7A 4BRHA 3OHRA 4K41A 4YDUC 1NGAA 3KZBA 3CERA 3BP8A 5KQDA 1KXPA 2QW9A 4PKGA 4BRAA 2UYTA 5AQXA 5BRDA 3QICA 4CZIA 2P9SB 3AY9A 4A61A 2BTFA 1MDUB 5F1XA 2PAVA 4E1JA 2E2OA 4RWTA 3H1QA 4DB3A 4BRQA 1RGIA 2E8AA 2QWPA 1DKGD 3O8MA 1GLEG 3WXLA 1KAXA 3DWLA 4JN4A 4B1XB 4FL9A 1BDGA 3VEZA 3RSEA 4H5TA 5F2RA 3CJAA 1R59O 3ZEUB 2D0PA 4WQ5C 4L3QA 3ENOA 4H0YB 3VEVA 1SQKA 5EXWA 4QS8A 3UKUA 1GLCG 1QZ6A 2ZWHA 2P9PA 5AQFA 4C23A 1YVNA 3JS6A 4JHDB 2HF3A 5JICA 4WQ4C 3G25A 5EX5A 3UKRB 3C7NA 4MLEA 1S3XA 3L6QA 2A40A 2FXUA 3WQUA 4EIAA 1HPMA 3H3NO 3H6EA 2VWBA 5FPEA 1NGEA 2I7NA 2YCHA 1NGCA 3ENHA 4BRDA 4BREA 1QQOA 2GWJA 4BQZA 4MO5A 4BR4A 1XC3A 5ADXH 3CJ1A 1S22A 2P9IA 4HTLA 4M63C 4EHUA 1HJOA 2I7PA 5AFUH 4K43A 3A5LC 3CJ9A 4B1WB 4CBWA 3M1FA 1BWFO 2CGLA 2V52B 4FWRA 4CZHA 2GWKA 1NBWA 3VEOA 4CZMA 3BEXA 4B1ZA 5BRHA 3R8EA 4ISGA 3KHYA 4Z94A 4BRNA 3L0QA 4CD1A 4IZ9A 3LM9A 1WUAA 2D0OA 3VERA 4WYBA 5AQSA 4BRFA 3UB5A 3JXUA 4BR2A 5AQOA 4EHTA 4NO7A 3M3ZA 2P9UB 2IVPA 3CI5A 3IFRA 1GLAG 5AZJB 2ASPA 2GELA 1Z05A 1NGJA 2VYPA 3CETA 2A42A 1NMDA 2CGKA 4FWSA 2Q1NA 3AAQA 4EFHA 2ITMA 1E4FT 5JMVA 2QXLA 3QFUA 5AZIA 1K8KB 3DXKB 3BF1A 3MN9A 4ISEA 3SMPA 1YAGA 1NLVA 2QWQA 5AFUA 1CZAN 3WUHA 4XEIA 1YUWA 4B1UB 3VPZA 3O6WA 3U4LA 1ATSA 3A5MC 4QS9A 4O8KA 1ZBSA 3FGUA 4K42A 5BPNA 1GLBG 1U2VB 5AQRA 3FZHA 5AQWA 3ATVA 1BG3A 2DPNA 4XH4A 3VGMA 1ATNA 1JCFA 3I33A 1YXQA 2FSJA 2IVNA 2YHYA 3EL2A 4JD2A 1NGHA 3J8AA 3H46O 4H5RA 5AQMA 1GLLO 4BGBA 3FE1A 3DXMA 1JCGA 3CJ7A 4QS7A 1KAYA 4O5FA 1TYQA 2P9UA 5LJVA 3CIPA 3WEEB 5AQHA 4BRLA 4IXCA 4AM6A 4FWOA 1NGFA 2P9NA 2OANA 3LM2A 3D2FB 5E26A 1SAZA 5EY4A 1P8ZA 1NGGA 2ASOA 3AAPA 4RCHA 3O08A 4PKIA 3H45C 5KPZA 3DXKA 4BGAA 5AQVA 1C0GA 4CZEA 2CH6A 5I9EB 3LDNA 2HMPA 2HF4A 3A0IX 1NM1A 4FWLA 2Q97A 4MLHA 2W41A 2FF3B 4FPBA 3HSCA 4I6MB 2E2PA 4BRCA 3ULEB 1U2VA 3MCPA 3QBXA 3WXJA 3QB0A 1V4SA 1NGBA 3HM8A 5AQLA 2E2QA 2P9LB 3U9ZA 3LL3A 1C0FA 1Q18A 1DGKN 1NGIA 4DHYA 5BN9A 3VESA 4A2AA 1RFQA 1KAZA 2A3ZA 2QWRA 3ZX2A 2FF6A 4CBUA 2QM1A 2AA4A 2P9SA 3WQTA 3WEEA 3ZX0A 4H03B 1BUPA 5AQIA 3SJHA 3D2EB 2P9KB 4CI6A 1NWKA 4FPAA 4H0PA 1EQYA 4CZGA 2Q2RA 3O80A 1GLJO 5LY3A 1V4TA 4H5NA 1BA0A 1JCEA 3O5BA 5AQTA 3LDOA 4LC9B 4BVOA 3WXKA 3DAWA 1SZ2A 3ZEUA 4FWQA 2D4WA 4M7XA 4RTFD 5FPDA 2E88A 1MWMA 3LDQA 4DQ8A 3W0LA 2ZGZA 4FO0A 1Z6RA 4YDUA 5BN8A 4H0VB 4JHDA 2A6AA 3CJBA 4BR9A 3EZWA 2H3GX 5BRFA 4IWVA 4FOIA 2YI1A 4BRIA 2F9WA 4BRGA 4DCHA 3UKRA 3MN7A 3MDQA 3EO3A 4PL8A 3ID8A 3ATUA 1BA1A 5JLFA 5AQZA 3H1VX 4ISFA 1QQMA 2KHOA 3FFKB 4IJAA 2FSKA 4EAHD 1HLUA 5AQGA 1HX1A 1TUUA 4CZKA 3IDHA 2GTDA 4BC3A 4B1YB 3FZKA 3GG4A 3M6GA 3F9MA 2NLXA 4K25A 4FWNA 2YHXA 3D2EA 1X3NA 2P9KA 3SK3A 2E1ZA 3C0BA 5ELZA 3S41A 1H1VA 4FWPA 3CQYA 4BC5A 3R9PA 3RSEB 1HKGA 4BC2A 4PL7A 4BC4A 1Y64A 4H5WA 1BO5O 3GBTA 5B8HA 1OKJA 4WQ4A 3SMSA 3UKUB 3TPQA 1T6DA 5EVZA 3A8YA 3HBTA 2ZF5O 5AQUA 5AZJA 3DJCA 5AQJA 3UE5A 4BQLA 4B1VA 3HZ6A 3QDKA 3QFPA 3LDPA 3VETA 4M7YA 3VF2A 2QWMA 3C7NB 5CE3A 5E84A 2Q31A 5FPNA 1XUPO 2YHWA 2QWOA 3FR0A 4BR5A 2A5XA 4F9OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D1KA 4RW8A 2QXFA 4DTPA 4CCHA 2CGJA 3ZX3A 4F4KA 3TWHA 2GUPA 3EKSA 3SPZA 2KLAA 1FK9A 4XH5A 4H0XB 4XH1A 1KLNA 4FZYA 3ZT4A 4CHZA 4LF5K 4KHNA 1ASWA 4FJ7A 2EHGA 2BH1A 3U8XA 4W5NA 4JI1K 4CEZA 5J2NA 3AA4A 3VF6A 4OGEA 3OYDA 1D4XA 4KTZA 5BR8K 1WSFA 3K2PA 1Q82O 3PV8A 1LW2A 4B9QA 3NGYA 3AO5A 3CCSN 4N5SA 1WB9A 3EKUA 3VN5A 2ASMA 3I8BA 1NKEA 3J7ZO 2E1YA 3HPOA 4JKBA 3LPUA 1HPZA 3IMXA 4FJJA 4MDBA 4KB0A 3V9ZA 3DRPA 2IC3A 4JRPA 4O5BA 4FM0A 1P90A 1T05A 1IKVA 4CEQA 5HRNA 1QVGM 3ZYYX 4BE0A 2YNHA 4PWDA 3SAFA 4CHPA 4ELVA 1CZBA 1NMNA 4CBXA 4DWIA 4JI8K 1DEJA 2J4RA 4O8UA 4M41A 3OYFA 1ATRA 3ZCMA 1OH8A 3P5JA 4CJSA 3A5NC 4JV5K 2DFHA 5C10A 3O4QA 5KPTA 1BL3A 4JD2B 2KQ2A 3AVJA 3L4QA 4LH4A 4C1NK 2FLOA 2QWNA 3SUNA 4FWKA 3VQ8A 1VQ9N 4CF2A 1SL2A 4K8ZA 4ICLA 3AGRA 3FZFA 4R5PA 2P9NB 4OPJA 4F3TA 3C65A 3P4IA 3WXIA 1VSLA 3S3NA 1VQNN 4HUEA 4CZFA 4WQ5A 2E2NA 4JS4A 4CZJA 5J2QA 4Z4HA 5AQNA 3CJCA 3NVMA 1QQCA 2O8EB 4JNEA 3HYFA 4Y0WA 4FM1A 2Q0UA 1QQNA 2P9PB 4K0KK 1RT4A 3QEPA 4CJVA 1LCUA 5BREA 1S72N 4LF8K 2UXCK 3V4IA 1YITN 3V6DA 5BPLA 4FOEA 4CD3A 4GNIA 4ILGB 1SL1A 3QMLA 4BR7A 3WXMB 4K41A 4DSJA 2X6SA 1X9SA 1DT9A 5DM6L 4HCBA 3RMBA 1UWBA 1Q9YA 1SKWA 4GVEA 3QICA 3G4SN 1CXUA 3T69A 1Q86O 3NCIA 1SKRA 5IWAK 3OTOK 4HUFA 3LAMA 3ISNC 5F1XA 2PAVA 2HHTA 2HHUA 3H1QA 3NH2A 2PZSA 3DRSA 4B9MA 3D0PA 2QWPA 3RMAA 5FRNA 3ZSWA 1DKGD 1GLEG 3VQPA 5AJ3K 5F2RA 1EWQA 2OPSA 3C6HA 4MFBA 1RDUA 1R59O 4CGGA 2F8SA 2YHBA 1NOZA 3L2RA 3ENOA 4EZ9A 1W2BM 1SQKA 2ZWHA 1VSJA 3OY9A 4OX9K 1YVNA 4JHDB 4OJRA 5JICA 4WQ4C 3OA9A 2UUCK 3BY5A 4MLEA 3L6QA 5KRTA 4OGCA 4LFAK 2YCHA 3PO4A 2W42A 4B8CA 2KTQA 4LY7A 3VA3A 3PX6A 4BQZA 5ADXH 5HOOA 3T1YK 2HHHK 1RBSA 4M63C 4CW7B 4EHUA 4JI6K 1NU0A 2F7TA 5CY4A 4K43A 4JKDA 3QO9A 5M1FA 4W5QA 3K9KA 4CZMA 4B1ZA 5BRHA 4JI0K 3KHYA 3NHGA 1C0TA 4IZ9A 2WC9A 4I2PA 4OPKA 3UB5A 3JXUA 2O8CB 2P9UB 3CI5A 4UY8O 3CMEN 3RWUA 2HHWA 3SUPA 2ASPA 2OPRA 3MAQA 1NGJA 5K14A 3HRGA 4FLYA 3HJFA 1KQSM 3SQ1A 2Q1NA 4EFHA 4ILJA 4BDZA 2HSTA 1E4FT 2D0AA 1M90O 4JI5K 3DLRA 4EP5A 3QFUA 2Y1IA 2ATQA 4R79A 1VQ5N 1RT1A 1YAGA 3EE9A 1IKWA 1NLVA 1MU2A 1RBRA 2QWQA 3SBTA 4B1UB 4CGHA 5GIPA 5A2QO 3O6WA 2JGUA 1JKHA 3H08A 1K6YA 3FGUA 4K42A 3OBWA 1U2VB 1QTMA 1K73O 3ATVA 1BG3A 4DQQA 1IBLK 2YHYA 3KD1E 4E1MA 3FE1A 1JCGA 4JS5A 3CJ7A 4I2QA 1JXBA 3THXB 1VQ4N 3AA3A 1BISA 2HW3A 3D6RA 1N34K 3THYB 4FWOA 5KRSA 1S5JA 3LM2A 3DLGA 3ZSZA 1WLJA 3D2FB 5E26A 1SAZA 3CG7A 4AF1A 4C8LA 3DOLA 2FBTA 4GVMA 1P8ZA 1NGGA 2ASOA 2F8TA 3SAGA 1IO2A 4PKIA 5KPZA 3OYBA 3VQ6A 1C0GA 1YIJN 4PHTX 1B9FA 1IG9A 3A0IX 5C2DA 4FWLA 4KAZA 3F9KA 4MLHA 3NH0A 1TKXA 1XNRK 1OVYA 4CF9A 2HVIA 3DOKA 1NGBA 5AQLA 3HP6A 2P9LB 1T8EA 4CEBA 4JKGB 1XMOK 1NGIA 4IFVA 3AO4A 1NNEA 4A2AA 1TAUA 1RFQA 5J2PA 1KAZA 4CHNA 2FF6A 2QM1A 4DTOA 4CJTA 4JRQA 3LP1A 3SQ2A 4PUOA 3WQTA 4E0DA 1LWCA 4PQUA 4A59A 5T7BA 1TV6A 5AQIA 5KI6A 4CFBA 4XIUA 3QESA 3D2EB 5I3UA 1WN7A 4DU1A 4JI3K 4DMNA 4CZGA 2Q2RA 3AVIA 1QSLA 1ASUA 3O3GA 4KPYA 3O5BA 5AQTA 4N41A 3LDOA 1TK8A 1VRTA 3DLKA 1TK5A 2IS3A 2D4WA 4O0JA 1R0AA 5M1KA 3C6UA 3QEVA 1B9DA 3LDQA 3VQCA 4DQ8A 2FC0A 5DMRA 2O8FA 2ZGZA 1L3UA 1Z6RA 5C15A 4U67L 2A6AA 3CFRA 3LZIA 4IWVA 2YI1A 2F9WA 4BRGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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