4QS7A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) structure in glucose-bound form
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
460
structure length
455
Chain Sequence
WGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEDFHLPEGRQRELGFTFSFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDEVQKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSNDGSGIGAALLAASHSLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hexokinase-1
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 162
structure length 455
sequence length 460
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs7A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs7A01
4H0PA 2D4WA 1T6DA 3UE5A 3CJ1A 1S3XA 2FF6A 3DXMB 5KPRA 5BPMA 3AY9A 1BA0A 5AQMA 1KXPA 3VF6A 3DXKB 5AQYA 5AQGA 4FO0A 2KHOA 5FPNA 4CZFA 2IVNA 4IO8A 1HKBA 4JN4A 4BR0A 1JCEA 3LDNA 2P9LA 4YDUC 3ZETB 4QS8A 3WQUA 4HTLA 1BUPA 4B1VA 4BROA 2A6AA 3WXKA 5EX5A 4RTFD 5I9EB 2OANA 1Z05A 4BRFA 3VGLA 4XH1A 4H0VB 1K8KB 5KQDA 1QZ6A 4B1YB 5BN9A 3CJ9A 2I7NA 2PAVA 4MLHA 1QHAA 4BRGA 2ZGZA 4I6MA 3U4LA 1R59O 3AAQA 3M1FA 4EHUA 1NWKA 3LL3A 1T44A 2QM1A 5EOYA 3OHRA 2A5XA 4CZEA 3VERA 3GBTA 2BTFA 4H0OA 5AQQA 4BRLA 2NZTA 2ZGYA 2HOEA 3QICA 4FWRA 3BF3A 3A5MC 2P9NB 2A40A 3EN9A 3IMXA 4PKIA 1YAGA 1ATNA 4BC3A 5EY4A 3KVGA 1MWKA 5F2RA 4KBOA 1BDGA 4BR4A 2W40A 3LDPA 3KZBA 1ZXOA 1LCUA 3CQXA 3IDHA 3IUCA 4QS9A 3A0IX 5LY3A 4FSVA 4IZ9A 2ASMA 4MO5A 2H3GX 2NLXA 4AM7A 1QQMA 2YHWA 3TPQA 2VYPA 4FPBA 5FPMA 2FSKA 2E1ZA 2VCPA 4XH4A 2P9LB 4B1WB 1GLBG 4HWIA 3VF2A 5JLHA 2FLOA 2Q0UA 3CQYA 5ADXH 2W41A 3VEVA 3WT0A 3WXLA 2QWPA 4RCHA 5AR0A 2EWSA 5AQFA 5AQWA 4EAHD 3CERA 4WQ4C 2QWNA 4FWQA 2HF4A 1NGCA 1J6ZA 5AQOA 1LOTB 2E2QA 4DCHA 1YVNA 5BPLA 3BEXA 4MLEA 3SMSA 1OKJA 2GEMA 2D0OA 5BN8A 1RFQA 2J4RA 4H5VA 1SZ2A 4DQ8A 3A5LC 4CZLA 2DPNA 1X9JA 1RGIA 3GDQA 3UKRA 2V7YA 4CZMA 1NM1A 2QWMA 2QWRA 4EHTA 4BRMA 1NGJA 2P9NA 4NB4A 3CJ7A 4EIAA 5B8HA 1GLLO 4K43A 3VOVA 2PBDA 3JS6A 5LJWA 3EO3A 3AARA 3L6QA 4K41A 1HPMA 4CD1A 4JHDA 1G99A 1HJOA 4CI6A 4A61A 3HBTA 1X3NA 1HLUA 3A8YA 2V52B 3RSEA 1SQKA 3EZWA 3LDOA 3H45C 2Q2RA 5AQTA 3FE1A 4H0TB 2A42A 5AQXA 3C7NB 5JLFA 1P8ZA 2D1KA 2A41A 3VEYA 4O8KA 1NMDA 1BWFO 1MDUB 1C0FA 3HZ6A 4BQLA 2F9TA 5JMVA 1ESVA 4EFHA 3H46O 2YCHA 4IJAA 4M63C 2P9UA 1NGHA 3MN6A 5AQVA 1MWMA 3O5BA 4H03B 3O6WA 3VEOA 1U2VA 4Z94A 3MCPA 4CD3A 4ISGA 4M7YA 2YHXA 3L0QA 1V4SA 4RWTA 3FFKB 4DB3A 4WYBA 3KHYA 3MN9A 3HI0A 1BO5O 3AAPA 2WUSA 5FPDA 1YUWA 3GG4A 1E4GT 3GE1A 1TYQA 3WQTA 1QQOA 2CGLA 2V7ZA 3QBWA 3MN5A 3UKRB 2VWBA 1NGGA 3IFRA 1NGDA 1XC3A 5F1XA 1C0GA 3CJBA 3FGUA 3U8XA 5AQJA 3O80A 3DAWA 2YHYA 4BGBA 4WQ5A 4BRIA 3VGMA 4PKHA 2I7PA 1DGKN 2CGKA 3CETA 2BUPA 4BRCA 1BOTO 1NGEA 1Z6RA 1HX1A 3H1QA 3MMVA 2CGJA 1EQYA 2YJEA 4JHDB 3GL1A 2A3ZA 3CJCA 4PKGA 1NGIA 3D2EB 1JCGA 4BR2A 3M6GA 1HUXA 4GNIA 3RSEB 3ZX0A 4JD2B 4B1XB 2YI1A 3D7EO 4JNEA 3C7NA 3WXIA 3TU5A 3D2FA 3ULEA 5AQHA 3FZKA 4C23A 3FLCO 3EKUA 3MDQA 2FXUA 2Q1NA 2ZF5O 1S22A 3CI5A 4QS7A 3VGKA 4DHYA 5KPZA 3VETA 4BRHA 5AFUH 1BA1A 4GY2B 4FOIA 5FPEA 2P9UB 2P9IB 4O5FA 4H0XB 1GLJO 3DJCA 1U2VB 4A62A 3O8MA 5KQ8A 4ISFA 5AQIA 3QDKA 3VF4A 4A2BA 4BRNA 1KAXA 5AQSA 5ELZA 2FSNA 2FSJA 5F0XA 1D4XA 5AQRA 1XQSC 1Q18A 3H3NO 5BRFA 1TYQB 1X3MA 5BR9A 5AQNA 5ADXA 4XEIA 1IJJA 5BRDA 4BG8A 3UKUB 1HKCA 4B1UB 4BRPA 3LM2A 3H1VX 4BC4A 3QFUA 5AQPA 2CH6A 4FWSA 1ATSA 2ITMA 1GLDG 1NGFA 2ZWHA 3HSCA 3I33A 1ATRA 2QWOA 1NBWA 3ZEUA 3D2EA 2GWKA 1IG8A 2HMPA 3MN7A 3W3DA 2E20A 2E8AA 5AZJA 1H1VA 4JD2A 4AM6A 5LJVA 2Q31A 3LDQA 1MA9B 1TUYA 4B1ZA 1NGBA 4CBUA 2P9SA 3O08A 4LC9B 3F9MA 2P9KB 3WEEA 2V51B 3HM8A 3D2FB 1TUUA 3QMLA 1RDWX 3ULEB 2P9PA 4CZIA 1JCFA 4MO4A 4CZJA 5E26A 4FPAA 1GLEG 3VEWA 3R6MA 1GLFO 2UYTA 3R8EA 4BVOA 1BG3A 3L4IA 3J8AA 4H0YB 3P4IA 5E84A 3QB0A 4B9QA 2P9IA 4FWPA 4J8FA 4BR5A 2GTDA 4BGAA 4JAXA 3O4WA 3WXJA 1CZAN 4H5NA 5TKYA 4YDUA 2E88A 2HF3A 2IVOA 3SLCA 1QZ5A 3ATUA 4BR7A 4CZKA 3ZX2A 3H6EA 1V4TA 3W0LA 1WOQA 2Q97A 3MK6A 2GWJA 4BRDA 4FWLA 5AZIB 1GLCG 4BQZA 3U9ZA 2GUPA 3QFPA 1QQNA 3EL2A 4CZHA 3UB5A 4FWOA 5AQZA 3BUZB 3SJHA 4FWNA 5AQKA 4WQ5C 3C0BA 3UKUA 3CIPA 2E2OA 4Y0WA 2YJFA 5BRHA 2GELA 4BR9A 3U9DA 3ENHA 3R9PA 1XUPO 4IXCA 4PL8A 4H5WA 2CH5A 2Q0RA 4CBXA 4F9OA 1YXQA 1KAZA 3ENOA 5EVZA 3ZEUB 3FZLA 3S41A 3VEXA 3EKSA 1DEJA 3DXMA 4L3QA 3VESA 5AZJB 3M3ZA 4PL7A 5KPTA 4FWMA 3SK3A 1E4FT 2P9KA 3A5NC 3I8BA 3DXKA 2P9SB 5BREA 3WEEB 4BRAA 3ID8A 4NO7A 1ZC6A 3FZFA 1Y64A 2E1YA 3QBXA 3VENA 2F9WA 2P9PB 3VEZA 4M7XA 3SMPA 5CE3A 2QWLA 3HTVA 4CBWA 2AA4A 1DKGD 3O1WA 2IIRA 3ZETA 4BC5A 4FWKA 4E1JA 3JXUA 1U6ZA 1ZBSA 3BP8A 3G25A 3WUHA 3LM9A 5EXWA 3FZHA 1KAYA 1NGAA 5AZIA 3ATVA 4ISEA 1K8KA 1WUAA 3CHWA 4CZGA 3GOIA 2E2NA 1T6CA 4A2AA 1HKGA 4BG9A 2IVPA 4H5TA 5JICA 2QWQA 1NLVA 4FL9A 5AQLA 4BC2A 3VPZA 2D0PA 3FR0A 4CJ7A 4WQ4A 4IWVA 3B8AX 4K25A 4FOEA 4K42A 3H3OB 1SAZA 4I6MB 5AQUA 2QXLA 2FF3B 3FZMA 3O1BA 4BREA 2NRHA 3ZX3A 5AFUA 2E2PA 4BRQA 2ASPA 3A5OC 5BPNA 1GLAG 3LDLA 3CJAA 4IJNA 4H5RA 3DWLA 4XH5A 2ASOA 2QW9A 2AP1A 2Q36A 4BVPA 1BU6O 4BRKA 3BF1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H0PA 2D4WA 1T6DA 3UE5A 4RW7A 4ILHA 5BPMA 3TAEA 3NVKA 3OYJA 4B9NA 4CGHA 4OPHA 3SBTA 4DS5A 1KXPA 3VF6A 4IG3A 5AQYA 1S5JA 2KHOA 3D0PA 4B9VA 4CJFA 1RDCA 3OW2M 3P31A 4CEFA 2UUAK 4IO8A 4I2QA 5GAGP 1IKWA 3SAHA 4RW6A 3LDNA 4E7IA 3RTVA 4QS8A 3CM6A 3WQUA 4DQQA 1LWFA 1U4BA 5EX5A 5I9EB 1HQEA 1N6QA 1M90O 3BGRA 2JLEA 4LH5A 4BRFA 3VGLA 4XH1A 3VQDA 1YTUA 1Z26A 4QCLA 4CFBA 3Q7BA 5BN9A 3CJ9A 1BGXT 2I7NA 4MLHA 1WSEA 3OYHA 5CY4A 3AA5X 4I6MA 3OA9A 4EHUA 5FRNA 2DY4A 2WONA 4CVNE 1T44A 3O9RA 4DU1A 4DTPA 3OHRA 4OKJA 4FZYA 3PSFA 3VERA 1QHTA 3GBTA 4H0OA 1WNSA 2JGUA 4BRLA 2NZTA 1JLCA 3QICA 1FKPA 1EXQA 2ZJRL 1KVBA 3O4QA 3DRRA 1ZYQA 1A5WA 2F96A 3EN9A 3IMXA 3AVNA 3OYDA 4FJXA 1GOAA 1C0TA 4DKWA 5EY4A 3LAKA 1MWKA 1K73O 4Y1DA 1VQPN 4JV5K 3LDPA 4DV1K 1T7PA 2P5GA 4M41A 3A0IX 4JKFA 4N76A 4IZ9A 1J53A 3THWB 2VYPA 5FPMA 3O9UA 2FSKA 3V9ZA 4IOXA 3KLGA 1NOZA 2VCPA 4A5AA 3F73A 4N5SA 2OPPA 4B1WB 1QSSA 2RN2A 1GLBG 3CCVN 2DTUA 2Q0UA 3D6RA 2F7TA 4DFJA 4W5NA 1YIJN 5C2FA 3LP1A 1OH8A 2QWNA 3C65A 3SQ2A 4DCHA 2E2QA 4E89A 3G71N 3CMAN 2NRZA 1FK9A 3SMSA 1OKJA 2GEMA 4MDAA 2W6KA 3NBPA 1YTAA 1RDBA 3FFIA 3NDKA 3A5LC 4M3TA 2DPNA 1X9JA 2AJQA 2V7YA 1NM1A 4GMJB 1NGJA 2P9NA 3IS9A 3T1YK 1B9FA 5LMUK 4BE1A 4J2BA 3SI6A 3CJ7A 1GLLO 1JL1A 1RT1A 3VOVA 4CERA 4KI6A 4DR4K 3VTHA 3JS6A 1RT3A 4JKGB 4OLAA 4ICLA 3CCRN 4K41A 5KRTA 5HRSA 5I42A 2HBMA 1G99A 4CI6A 3THVA 1RT5A 3JAMO 3RSEA 3KK7A 5C25A 4FYDA 3HPHA 3TANA 1IBMK 4FJNA 4H0TB 5I3UA 4QAGA 3C7NB 4OGCA 1O13A 1N36K 4M3YA 4KREA 4DSIA 4O8KA 1NMDA 1SL2A 1MDUB 4YOTA 1Q82O 4BQLA 3SZ2A 4DF4A 3H46O 4IJAA 4FJ9A 1M1KO 1LAWA 3MN6A 1MWMA 3O5BA 4HUGA 3DLHA 1LWEA 4DV4K 3MEEA 4M7YA 3PV8A 4RWTA 4M3ZA 3CCSN 4WYBA 3AO4A 3N4QA 3AVFA 1BO5O 2WUSA 3GE1A 1NKCA 4FLZA 1QQOA 2CGLA 3QBWA 4IG0A 3LAMA 3TTDA 4B3OA 4JI4K 1RBVA 1NGGA 4C8LA 3HRGA 1TAQA 1NGDA 3P1GA 2UXBK 3U8XA 3DAWA 5J2NA 4KKOA 4WQ5A 4BRIA 1GOCA 4PKHA 2I7PA 4XIUA 2BUPA 4LSNA 3TTFA 3KKSA 4AHRA 1NGEA 3EE8A 1HX1A 2HNZA 3H1QA 3MECA 3J7YP 1EQYA 4JHDB 4DTXA 1MU2A 3GL1A 3D2EB 4BR2A 3OS0A 3M6GA 1HUXA 1Q9YA 1HQUA 1TK5A 5K14A 4JKHA 4DR2K 3FLCO 2O8BA 5LMNK 2E6MA 2Q1NA 4C1NK 4QS7A 5KPZA 4DHYA 1XWLA 3P5JA 3CCQN 5AFUH 4LFBK 4FOIA 4LF4K 1U04A 2JWKA 1GLJO 1VSDA 3DJCA 1L3SA 5KQ8A 3VF4A 4FM1A 1KAXA 4CJ5A 2FSJA 4NLBA 5AQRA 4BACA 4BDPA 3KD5E 3H3NO 1TYQB 2G8VA 5AQNA 4Z4HA 2XY5A 4I9QA 4OKEA 4O5BA 1SKSA 4FZXC 1IJJA 4CJSA 4DUYK 5BRDA 3UKUB 1HKCA 4B1UB 4IEEA 4BC4A 4DQSA 3J7AP 1DTQA 1D9DA 2ZWHA 2GUIA 3K5NA 3VMFB 1NBWA 1NK6A 2HMPA 5HRRA 4CF1A 4JKAA 3ZT1A 3M5RA 1VSLA 4CHQA 4YOXA 3D45A 3VQ8A 4DR5K 2NRVA 3ULEB 2P51A 4BDZA 2HHSA 2W42A 4MO4A 1VQON 1K8AO 1JLQA 3THYB 5CZ2A 3TAQA 4CK3A 4BR5A 4CIFA 2GTDA 4BGAA 1RDAA 4JAXA 4OO1J 1JLBA 3LWLA 2OYQA 1QZ5A 3ZX2A 2DFEA 3H6EA 1Z25A 4DF8A 1TVRA 2GWJA 5AZIB 4BRDA 3ZT0A 4BQZA 3U9ZA 2KKZA 4CHZA 1J5EK 3QFPA 3K5OA 2OZSA 4F2RA 1UOCA 4FWNA 4WQ5C 1L3UA 1QVGM 4AHSA 1O1WA 2E2OA 1JXBA 4C8NA 3U9DA 4NCGA 4JI6K 3OJUA 4CFAA 4F8RA 3T1AA 4CJ4A 2CH5A 2HSTA 3PO4A 4U67L 1RDUA 3S41A 4Z4FA 1WSIA 3ZYYX 2OTLN 4E3SA 3VESA 4JLHA 3CXCM 1JLGA 4IOCL 4FWMA 1VSMA 4AF1A 2XY8A 2F8SA 3T7ZA 1VSIA 1X9SA 4Q5VA 1HJRA 3VQBA 3WEEB 4BRAA 4GV9A 2XHBA 4NO7A 2HVHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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