4QS7A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) structure in glucose-bound form
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
460
structure length
455
Chain Sequence
WGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEDFHLPEGRQRELGFTFSFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDEVQKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSNDGSGIGAALLAASHSLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Hexokinase-1
publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
molecule tags Transferase
total genus 162
structure length 455
sequence length 460
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs7A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs7A01
2P9SA 1HKGA 5AZJA 4WQ4A 3BF3A 2A6AA 3CQYA 4CZFA 4EHUA 3CJAA 1KAZA 5AQNA 1ATNA 1YUWA 2QWPA 5AQGA 2P9LB 1EQYA 3QBXA 3CHWA 4YDUA 2IIRA 3G25A 4BG9A 3A5LC 3ENOA 4BR5A 4AM6A 4DCHA 2P9IB 2P9KA 2ZF5O 3H1VX 3OHRA 3D2FA 3GG4A 4FWPA 5EX5A 4BR0A 3WXJA 3F9MA 1E4GT 4CBWA 1GLAG 1LOTB 2FSKA 3I8BA 2VCPA 4H03B 2H3GX 4H5RA 3KZBA 4O8KA 1HLUA 4FWNA 3U9ZA 5I9EB 4L3QA 3KVGA 1DEJA 2FSJA 3HTVA 2GTDA 1NBWA 4QS9A 4CI6A 3VESA 3UKUB 2OANA 3MN9A 5BPNA 4BC5A 4JD2A 3D7EO 5AQZA 2GUPA 4BVPA 3VEWA 2ZGYA 1YAGA 2HMPA 2I7PA 4BVOA 3EKUA 1NGBA 4K42A 4IXCA 1GLDG 5KPTA 1DGKN 5KPRA 1DKGD 3HM8A 2P9PB 3HBTA 1HKBA 5BRDA 2P9SB 3R8EA 1NM1A 1K8KA 5AZJB 3H45C 3O5BA 4I6MA 4BR7A 1BOTO 5EOYA 4RCHA 3SLCA 3WXLA 4PKHA 4ISGA 2VYPA 3M3ZA 4CJ7A 2AP1A 3WEEA 2A42A 3FZMA 4BQLA 4CD1A 3BEXA 4C23A 2D1KA 5LJVA 1KAYA 2P9KB 4Z94A 3AARA 3MDQA 4CZHA 3D2FB 1BDGA 5JLHA 1X9JA 3AY9A 1KXPA 3R9PA 3IDHA 5EVZA 4J8FA 1GLJO 1HX1A 2W40A 3LM2A 3R6MA 2P9UA 1S22A 5AQVA 4FWLA 1RFQA 5ADXH 4BRNA 3D2EB 1NGDA 3SMSA 4K25A 2QW9A 4A62A 5AQMA 3JXUA 4WQ4C 3U9DA 4AM7A 5B8HA 5BPMA 4MO5A 4JD2B 1RDWX 1V4SA 3EKSA 1YXQA 5JLFA 1NWKA 4XEIA 3WQTA 4FWQA 4IWVA 5AQOA 4YDUC 4JHDA 4BQZA 1NMDA 2E88A 3SMPA 1MWKA 2P9NA 1C0FA 3EZWA 3WXIA 3VETA 4NO7A 4DQ8A 2E2QA 1QZ6A 1TUUA 2CGKA 5F2RA 1U2VA 4BGBA 3O6WA 5AR0A 2A3ZA 3DWLA 1K8KB 2FXUA 4I6MB 3IMXA 1BWFO 1WOQA 3EO3A 3FE1A 3H3OB 3H46O 4MLHA 2YJEA 3UKRB 3CJCA 3FGUA 3WEEB 4CZKA 1GLEG 5EXWA 3VEOA 1T44A 5KPZA 1XQSC 3C7NA 2CH5A 2ZGZA 4IJAA 3ZX3A 4FL9A 1JCEA 1D4XA 1WUAA 2QXLA 2NZTA 4BR4A 4MO4A 2FF3B 2P9UB 3AAQA 4FWKA 3WXKA 3CJBA 2DPNA 5AQFA 2AA4A 3ULEA 2GELA 3CI5A 4EHTA 2D4WA 5AQKA 1YVNA 4NB4A 4WQ5C 3A5MC 3JS6A 3S41A 3IUCA 4BRFA 5LJWA 3HI0A 1MA9B 3J8AA 3D2EA 5AQQA 3A0IX 3HZ6A 2Q1NA 5AQJA 4H0YB 1TYQB 1Q18A 4M7YA 3LDOA 2E2OA 2QWLA 2HF4A 2YHXA 4H0VB 2V7YA 4JHDB 3DJCA 2E1ZA 1BA1A 2E2NA 2P9NB 4BRCA 2FF6A 4BC4A 1QQNA 3MN5A 4JAXA 2QWRA 1U2VB 5AQRA 3EN9A 1CZAN 3QFPA 2UYTA 4BR9A 4B1WB 2PBDA 5AFUA 3CERA 2IVPA 3I33A 1XC3A 3RSEA 3VF4A 4BC3A 4JN4A 3FZKA 4FO0A 4DHYA 3LDNA 4QS7A 4PL7A 3M6GA 3TU5A 1ATSA 5ELZA 1SQKA 3L6QA 3MN7A 1RGIA 2YI1A 3O1WA 4M7XA 5BPLA 3H1QA 1BA0A 1C0GA 4PKIA 3ZEUA 3UKRA 2YHWA 1NGGA 4BC2A 4CBUA 3C7NB 2YCHA 3CJ7A 1E4FT 4JNEA 1QZ5A 1P8ZA 3VERA 3M1FA 4FOIA 1ESVA 2D0OA 5BRHA 2YHYA 4BG8A 4XH4A 3MK6A 4CZIA 4K41A 1LCUA 3ULEB 3QMLA 4BRPA 3QDKA 4H0XB 3BP8A 3FR0A 2QWMA 3FZHA 4FOEA 3TPQA 1TUYA 3WT0A 3LDPA 4WYBA 4FPAA 1Z6RA 4CZLA 5AQLA 3H3NO 3ENHA 1GLFO 4GNIA 4EIAA 1IJJA 3O80A 4B1YB 1TYQA 4A2AA 4H0OA 4M63C 1MDUB 4FWMA 3QB0A 1JCGA 1HKCA 3B8AX 3A5NC 1X3MA 3O4WA 2ASOA 4KBOA 4BRHA 1U6ZA 2E20A 3RSEB 5FPEA 1HJOA 3BUZB 3LM9A 3VEXA 4FWOA 4BRKA 4HTLA 3VENA 5JICA 2A41A 4BRAA 4F9OA 2NRHA 2IVNA 3ZEUB 2NLXA 1Y64A 3GE1A 3LDQA 4LC9B 3CJ9A 2Q2RA 5BRFA 5CE3A 4BRLA 4PKGA 1NLVA 2V52B 3H6EA 4BRIA 2E1YA 3VGKA 2I7NA 4B9QA 4ISEA 2QWOA 3VGLA 4CZJA 3LL3A 4Y0WA 3VF2A 5BREA 3A5OC 3ID8A 1GLCG 4B1VA 1Z05A 3QFUA 5F1XA 1V4TA 5AZIB 3MCPA 3HSCA 4ISFA 1HPMA 1ATRA 4XH1A 3SK3A 2F9WA 3FLCO 4BRDA 2HOEA 4BROA 3VGMA 2GEMA 2YJFA 4B1UB 4CD3A 1NGEA 3C0BA 2FLOA 2ASPA 5BR9A 1IG8A 2ASMA 4MLEA 1JCFA 3DAWA 2E2PA 5AQIA 3P4IA 5AQYA 2V51B 2QWQA 5EY4A 1NGFA 3LDLA 5FPNA 5AQXA 5E26A 4O5FA 3WQUA 2PAVA 2BUPA 4IJNA 1SZ2A 4CZGA 4A61A 1SAZA 4BR2A 3ATUA 5FPDA 2CGJA 2EWSA 4EFHA 3O1BA 4QS8A 2D0PA 4B1ZA 3VEZA 1KAXA 3ZETA 5AQUA 5TKYA 3GBTA 4H5NA 2WUSA 5AQPA 4EAHD 4H0PA 5LY3A 4DB3A 2V7ZA 3GDQA 3VEYA 5ADXA 2Q0RA 2Q97A 3VOVA 4FPBA 1NGCA 3A8YA 4BRMA 2W41A 3DXMA 4CBXA 1G99A 2BTFA 5FPMA 1GLLO 2GWKA 3L4IA 3ZX0A 2A5XA 3KHYA 1GLBG 3MMVA 1BG3A 3UE5A 4HWIA 1BO5O 3GL1A 1HUXA 5AQSA 4WQ5A 4A2BA 5AQHA 3UB5A 3BF1A 4K43A 5AQTA 3DXKA 1NGHA 4H0TB 5AZIA 3IFRA 3CIPA 2Q36A 3O8MA 3W0LA 5KQDA 3U8XA 1S3XA 4IO8A 4H5WA 4E1JA 2Q31A 2E8AA 4H5VA 3FZFA 3W3DA 2F9TA 2CH6A 1NGAA 1OKJA 5BN9A 4GY2B 4BRGA 2CGLA 3VEVA 4XH5A 4CZMA 3ZX2A 2P9LA 4IZ9A 4BGAA 3FZLA 4FWSA 1NGJA 2HF3A 1J6ZA 4BRQA 2P9IA 1T6CA 3ATVA 1ZXOA 3MN6A 1QHAA 5AFUH 2QM1A 1XUPO 3VPZA 2VWBA 4BREA 1NGIA 3EL2A 3ZETB 4FSVA 5AQWA 3L0QA 3O08A 1X3NA 1BU6O 1MWMA 5BN8A 2A40A 3VF6A 3QBWA 4RTFD 4H5TA 4B1XB 5E84A 2ZWHA 3CJ1A 4FWRA 3UKUA 5KQ8A 3DXMB 1BUPA 2J4RA 3FFKB 2FSNA 3SJHA 3AAPA 1T6DA 1R59O 2KHOA 2IVOA 1QQMA 1ZC6A 2GWJA 2Q0UA 3GOIA 4RWTA 3CQXA 5F0XA 1ZBSA 3DXKB 1QQOA 5JMVA 3QICA 4CZEA 3U4LA 2P9PA 1H1VA 3WUHA 2ITMA 2QWNA 4PL8A 3CETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HKGA 4WQ4A 2G8UA 1JL1A 3CQYA 2E4LA 1KAZA 5AQGA 4I9LA 4LFBK 1EQYA 1SUQA 5FLXO 2NRRA 3KIOA 2WONA 3ITHA 2HBJA 3A5LC 1QTMA 4JKDA 4FM1A 4BR5A 4DCHA 4BE2A 2ZF5O 5EX5A 1O1WA 3CC2N 4DSLA 1S6QA 1Y97A 4NYFA 3OYMA 3THYA 3THWB 1NOYA 4LFAK 3I55N 5GIOA 3NE6A 4EZ6A 4JKGA 3U9ZA 3E01A 4CE9A 1SL0A 1O13A 1DEJA 4CI6A 3L3UA 4MQ3A 2OANA 1HJRA 3MN9A 5M1FA 1BQNA 5BPNA 4DR7K 4RW7A 4QCLA 4CFAA 2ZGYA 1VSJA 5HL7L 4BVOA 1XWLA 4K42A 3P83D 2D0BA 2LSNA 3DLKA 4FYDA 2HHWA 4WF9L 5GADP 2P9PB 5BRDA 4CJFA 2P9SB 1K8KA 5AZJB 3H45C 3O5BA 4BR7A 1NK4A 4RCHA 4DV0K 4PKHA 4CJSA 4E1NA 2VYPA 2Y1IA 4CJ7A 1CLQA 1VSLA 4BQLA 2D1KA 5SZTA 1N32K 1VSMA 2P9KB 2X74A 4Z94A 3QEXA 1K9MO 3PX4A 3MDQA 4CZHA 3D2FB 1LWFA 5C2DA 5HROA 3DLEA 3HL8A 3MX5A 3O9UA 4ILHA 3IDHA 3K59A 5EVZA 4DR4K 4CF9A 4I2PA 4X62K 4U7BA 3R6MA 2P9UA 3THXB 1LV5A 4CCHA 4K25A 4CK2A 3OS0A 1IKWA 1U45A 3M8PA 3HT3A 4AM7A 4DQSA 5BPMA 3HPGA 5JLFA 1R0AA 4NXMK 5AQOA 3PX0A 3O4QA 3O9QA 3SMPA 4OKEA 2HHSA 1C0FA 2RE2A 2OTLN 4I2QA 2E6LA 3VETA 3QIPA 3ZT2A 3F73A 4BGBA 3CXCM 1TVRA 2NRVA 2B5JA 3IMXA 4DS4A 1WOQA 3EO3A 5DMRA 4R79A 3H46O 3NHGA 3UKRB 3CJCA 3WEEB 3LPUA 4DFKA 4M3WA 1KCFA 3OA9A 3NH1A 3B6PA 3SPZA 2UU9K 3DMJA 4Z4HA 2ZGZA 4FLZA 3ZX3A 1BL3A 1JCEA 4B9SA 1IKXA 2NZTA 1W2BM 3IG1A 4MO4A 2W42A 4KRFA 3CJBA 2DPNA 3IS9A 5AQFA 4DFMA 1C0TA 3S41A 5J2QA 3IUCA 5LJWA 3QNNA 2XHBA 3HI0A 3CPWM 5AQQA 4HHTA 1NK6A 2QXFA 4CEDA 3OS1A 2ATQA 4Y1CA 4C8LA 4H0YB 1TYQB 4CF8A 2YHAA 4CEZA 4AHSA 4M7YA 3C94A 1QQCA 4PY5A 3DJCA 5DM7L 1EP4A 1BA1A 2P9NB 1NJZA 4RW9A 1EWRA 4BC4A 3AVHA 1XI1A 1TKTA 4ID1A 4LSLA 3VTHA 2VG5A 5AQRA 1CZAN 4BR9A 3T3FA 2ZM6K 1U4BA 5LL6Z 3VF4A 2EX3A 1NG9A 3V9UA 4FO0A 4PL7A 4N41A 4CFDA 1WSEA 4Z4EA 3MXIA 1RGIA 4M7XA 3DOLA 3LANA 3OBYA 3PIOL 1C0GA 3UKRA 2PYLA 4PWDA 4CBUA 1OH5A 2KFZA 4E7HA 4MDAA 4CJRA 1P8ZA 3VERA 3NF9A 5AJ3K 2X6SA 4JV5K 3ULEB 1LCUA 5M1PA 4H0XB 3KK2A 4B3RK 3QO9A 3SAFA 2KFNA 1IH7A 3TPQA 3WT0A 1TUYA 3AVCA 1WB9A 3LDPA 2F4VK 4KO0A 1D8YA 4N5SA 2VWKA 3VTIA 4FLTA 4B3MK 3H3NO 4YNQA 1GLFO 4RG8A 2F8SA 4GNIA 4EIAA 4E7IA 3OJSA 1TKXA 2QA4N 1TYQA 2BGGA 4M42A 1MDUB 5CYQA 4DG1A 1RTHA 1JCGA 5CZ1A 3VQ8A 3DM2A 3O4WA 1WSHA 2ASOA 4KBOA 3I8DA 3CM6A 5JVGL 4CJUA 4ICLA 2GUIA 3BUZB 1DTTA 4HTLA 3VENA 1KVBA 3AVFA 4BRAA 4FLUA 5J1EA 2ZD1A 1Y64A 1S1WA 4GV9A 4FZXC 5M1QA 4PKGA 1VQ4N 3VQ5A 1IKYA 3VGKA 4W5NA 2O8CB 1LWEA 2QWOA 4DFPA 4FW1A 4O55A 5HOOA 3HK2A 5BREA 1BQMA 3K0SA 4B1VA 1HR0K 4EZ9A 3QFUA 4OPAA 4KB0A 4XH1A 3HSCA 4ISFA 1HPMA 1ATRA 1DLOA 4N76A 1LWCA 4DF8A 3NF7A 3TAGA 1HNZK 4C8OA 4I7FA 1KSPA 3K5MA 2F96A 2FLOA 4IDKA 4MFBA 2GBZA 5BR9A 1VQPN 4MLEA 1NNEA 4JKEA 1JCFA 2OTJN 1ASWA 5JS1A 5AQIA 3P4IA 3OY9A 5EY4A 3WNHA 5FROA 1T3VA 2HHHK 4LF4K 3F9KA 3HSTB 4M3RA 3CC7N 4BR2A 4B9VA 4C8MA 3O1BA 4PHTX 3ZETA 4BACA 4I9QA 5TKYA 5MLCQ 3GBTA 1QSYA 1ZBLA 2WUSA 4LSNA 1RTJA 3GDQA 3IKMA 3CFRA 5ADXA 1RDCA 4CEFA 4KHSA 1U49A 4AH9A 3N4QA 2W41A 3DLLL 4O44A 4BY9C 2BTFA 5FPMA 4C8NA 3L3VA 2GWKA 4IFVA 4J2BA 1RDDA 2P51A 2NRTA 3KJVA 1RDAA 3RR7A 3UE5A 4HWIA 3MX2A 1B9FA 3MEGA 4QOZB 3P5JA 4WQ5A 5AQHA 1OH6A 4BDZA 1T7PA 2YNHA 4DLEA 2OPRA 1VQ9N 3AVJA 3SPYA 4CJLA 1S3XA 5CR4A 4IO8A 3HXMA 1EO1A 3TAMA 3RRGA 1GOCA 5C10A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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