4QS7A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) structure in glucose-bound form
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
460
structure length
455
Chain Sequence
WGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEDFHLPEGRQRELGFTFSFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDEVQKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSNDGSGIGAALLAASHSLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
molecule keywords Hexokinase-1
total genus 162
structure length 455
sequence length 460
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs7A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs7A01
4WQ4C 4A61A 1YVNA 1JCEA 3GOIA 3CJ9A 4E1JA 3SMSA 2E2NA 3C7NA 2GWJA 3CERA 2GELA 4JD2B 3KVGA 1GLFO 5KPRA 3UKRA 1NLVA 3ZEUB 3BP8A 2KHOA 3KZBA 2P9UA 1HPMA 1T6DA 2VYPA 4CJ7A 1KAXA 4PL7A 4RCHA 3WT0A 3VERA 3WQUA 2YCHA 5AQGA 1J6ZA 3MN7A 4Y0WA 3VEVA 1BA0A 4B1UB 2PAVA 3DXMA 1QQOA 1Y64A 4BRMA 3AAPA 4BR5A 4BRLA 5AQJA 5AQZA 3CJ1A 3LDPA 4BC3A 3O8MA 4WYBA 4BG9A 2HF3A 2QWRA 5TKYA 3SLCA 2E20A 5AQTA 4BREA 3M1FA 2F9TA 5I9EB 1ATRA 1X9JA 3HM8A 3SMPA 3MN6A 1V4TA 3O1BA 3WXIA 4LC9B 3VOVA 3M6GA 4H5VA 3W0LA 3H46O 4BGBA 3CJAA 3ZETA 3DXMB 2ASPA 2V52B 5F2RA 5BR9A 3JS6A 4IWVA 1ATNA 3H1VX 2A3ZA 4XH4A 5AQNA 4DQ8A 5F0XA 3DXKA 3AAQA 4FPBA 3H3OB 4BGAA 2D4WA 4A2BA 4FOIA 2A40A 3CI5A 3TPQA 3H6EA 1HX1A 2YHWA 3EKUA 3KHYA 5JLHA 1NGJA 2ZWHA 3I33A 1R59O 2E2QA 4BR9A 1QZ6A 3IDHA 4CZLA 2YHXA 3HTVA 2PBDA 2V51B 4Z94A 3ENOA 4CD3A 1MWMA 5AQUA 4IJAA 3VEYA 3VEOA 4CZGA 2UYTA 4B1ZA 2I7NA 4BR4A 5AFUA 1NGGA 2H3GX 3A0IX 3O4WA 1OKJA 2HF4A 3SK3A 5BN8A 3LM2A 2IVOA 3CQYA 3C0BA 3QDKA 5BREA 4CBXA 4K41A 3VEZA 4BRCA 2ZF5O 5FPMA 3IFRA 5E84A 1E4GT 4XH5A 3R8EA 2Q36A 3GBTA 1LCUA 1BO5O 3QBWA 3F9MA 5AZJB 3VGMA 4CD1A 5ADXH 4GNIA 1BG3A 1GLDG 3EN9A 4NB4A 3GG4A 2Q0RA 1S22A 1MDUB 5AQOA 5KPZA 3VETA 4JD2A 2YJFA 1U2VA 3DAWA 3LDOA 3ZEUA 1LOTB 1S3XA 3CIPA 3O6WA 1BDGA 5AQXA 3VEXA 2QWQA 3MCPA 3WUHA 3D2EB 2Q1NA 4BRQA 4ISGA 1WOQA 3LL3A 4DB3A 4IJNA 2WUSA 5AQQA 5EVZA 1NGAA 4BR7A 4NO7A 1DKGD 4H0YB 4HTLA 5BRDA 4C23A 1HUXA 1V4SA 5BPLA 4BRNA 3MN5A 3IUCA 5KPTA 1E4FT 1U2VB 4AM6A 1DEJA 4ISFA 3O08A 2QWOA 3DJCA 4XEIA 3U9ZA 1GLAG 1GLJO 3EZWA 1P8ZA 2YI1A 3O5BA 4CZKA 2FSJA 3FGUA 4BG8A 5B8HA 2QWLA 4M7XA 4CZFA 1QQNA 2FF6A 2YHYA 1YAGA 3DWLA 3FZKA 3A5NC 2E88A 2ASMA 4BRGA 3A5LC 4B1YB 4BRIA 1TUYA 2V7YA 4BRPA 4H5RA 4ISEA 4QS7A 2ASOA 2VCPA 4M7YA 1WUAA 1BA1A 3VF4A 3LDNA 2GTDA 3L6QA 5JMVA 5BPMA 3QBXA 3QB0A 5CE3A 2YJEA 1GLEG 1NBWA 1HLUA 1GLCG 4IO8A 4RWTA 1ZC6A 4AM7A 2FXUA 1NGFA 2D1KA 4B1VA 5KQDA 5LJVA 4K43A 2E2OA 1C0FA 2CGKA 2P9LB 5AQPA 4KBOA 4JN4A 2FLOA 2E8AA 3VF6A 1ESVA 3ATVA 4B1WB 3OHRA 2I7PA 3QICA 2GUPA 4PKGA 2P9NA 1ZXOA 4F9OA 4H5TA 3AARA 4HWIA 1IG8A 4BR2A 4EHTA 1EQYA 1ATSA 3I8BA 4EAHD 4EHUA 1KXPA 2ZGYA 3ULEA 5AZJA 1T44A 2AA4A 2Q2RA 2AP1A 2IIRA 2W41A 4K42A 3VGKA 2A5XA 4B9QA 5BRFA 1NGBA 4CZEA 2P9NB 3HZ6A 1SQKA 2GEMA 5FPEA 5E26A 5AQFA 5AR0A 2BTFA 2P9KB 3LDLA 2BUPA 5FPDA 1XC3A 2CH6A 3WXJA 3A8YA 1Z05A 5AQYA 4FO0A 3M3ZA 3ATUA 5FPNA 3D2EA 1NMDA 3UE5A 3HSCA 3ID8A 1NGDA 4BQLA 1TYQA 1NWKA 1RFQA 2EWSA 4PL8A 5AFUH 2D0PA 3R9PA 4BC2A 4QS9A 3ULEB 3VGLA 1NGCA 5BPNA 1YUWA 3QMLA 4FWOA 3FR0A 4A2AA 5F1XA 5ADXA 1K8KA 3B8AX 2P9SB 2HOEA 2V7ZA 5EOYA 1NGHA 3O1WA 3FLCO 2CGJA 4CZIA 2NZTA 2F9WA 3G25A 3VEWA 1BWFO 4CZJA 3WEEB 1JCGA 1X3MA 4WQ4A 2OANA 4FWMA 2FSKA 4JHDB 3A5OC 1TYQB 4JNEA 1IJJA 4QS8A 4CZHA 2CGLA 5AQRA 2IVNA 2IVPA 3H3NO 1KAYA 3CJ7A 5AQWA 4BVPA 5LJWA 4PKIA 3CHWA 2ZGZA 4BQZA 4DCHA 1K8KB 4YDUA 5JICA 1Q18A 3LM9A 4RTFD 1C0GA 1ZBSA 2VWBA 3S41A 3WQTA 3R6MA 2FF3B 4H0PA 5AZIA 5ELZA 3MDQA 5AQMA 5EY4A 4O5FA 4FWRA 4FPAA 5AQHA 2Q97A 3RSEA 2QWPA 2QW9A 2P9PA 4MO5A 5EXWA 4IZ9A 1SZ2A 4MLEA 3W3DA 3FZHA 4L3QA 2A42A 4IXCA 1KAZA 1DGKN 4YDUC 4I6MB 1BUPA 3D2FB 1HJOA 3FFKB 4BRFA 1RDWX 2P9LA 3TU5A 5EX5A 1BU6O 1NGEA 4XH1A 4O8KA 5AZIB 4PKHA 5AQIA 1RGIA 1GLLO 1MWKA 3FZFA 1YXQA 3AY9A 4BC5A 2W40A 3RSEB 3BF3A 5AQKA 2Q0UA 2Q31A 2ITMA 2CH5A 2P9PB 4FWQA 5BRHA 4BVOA 3EO3A 3C7NB 1CZAN 3VPZA 1QZ5A 3FZLA 3HBTA 2E1ZA 3A5MC 3UKRB 1HKGA 5AQLA 2P9UB 4FWKA 3EL2A 1BOTO 4BRHA 1Z6RA 3CJCA 3U4LA 4BRKA 3UKUA 2GWKA 3IMXA 4H0VB 3WXLA 2A41A 3FZMA 2E1YA 3CETA 1SAZA 2DPNA 1TUUA 4FWPA 1XQSC 2P9KA 3UB5A 4DHYA 3CJBA 5LY3A 3CQXA 1T6CA 4H0XB 2QWNA 3ZX3A 4EIAA 3HI0A 1H1VA 3JXUA 3WXKA 2D0OA 3EKSA 5AQVA 2FSNA 4H5NA 3U8XA 1X3NA 2NLXA 4FL9A 4MLHA 3UKUB 1JCFA 2P9SA 5KQ8A 2A6AA 5JLFA 4FWNA 3ZETB 1GLBG 4H5WA 4CI6A 5AQSA 3ZX0A 4JAXA 2NRHA 3WEEA 4A62A 3ENHA 4FOEA 3DXKB 4CBUA 1QHAA 2J4RA 2P9IA 4H0TB 3GE1A 4JHDA 3VENA 2QXLA 3BUZB 1XUPO 3MN9A 4H0OA 4MO4A 4CBWA 3L4IA 4M63C 3ZX2A 1MA9B 3P4IA 3VESA 3U9DA 4BC4A 4H03B 4CZMA 3D7EO 3H1QA 2HMPA 2QM1A 4WQ5A 1NM1A 3L0QA 2QWMA 4GY2B 3MMVA 3MK6A 3J8AA 3BEXA 1NGIA 3SJHA 2P9IB 4BR0A 1QQMA 1U6ZA 3FE1A 4BROA 3LDQA 4FSVA 3VF2A 4BRAA 1HKCA 4FWSA 1D4XA 3BF1A 4BRDA 1G99A 4K25A 4FWLA 1HKBA 4I6MA 3H45C 3GL1A 3D2FA 4B1XB 3QFPA 5BN9A 4EFHA 3GDQA 3O80A 2E2PA 4WQ5C 3QFUA 4J8FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EO1A 3AGKA 4M3YA 1CLQA 3SMSA 3E9LA 2RE2A 2X74A 3V9ZA 4HCBA 2GELA 4JD2B 2W6LA 3BZCA 1NLVA 3BP8A 2KHOA 3KZBA 2RN2A 3S3NA 3JYTA 1HPMA 2VYPA 3L3UA 3L4QA 1U04A 1KAXA 4PL7A 4DR2K 3SQ2A 4OJRA 3DYAA 2UXCK 3ASMA 5AQGA 1O1WA 1D8YA 3CCSN 4DFMA 4CFBA 3AAPA 1VSMA 3THXA 5AQJA 5AQZA 3E9OA 3M5RA 4ILHA 4Q0BA 3LDPA 3PX6A 2HF3A 4Z4HA 4JI0K 5TKYA 2ZD1A 4BREA 2FC0A 5I9EB 3CQ8A 1RT2A 4B9LA 3H46O 4BGBA 3B6PA 2ASPA 4IWVA 4XH4A 5F0XA 2QA4N 3DOKA 4C8NA 4W5TA 3QINA 4JKGA 4BDPA 3MWPA 2KFNA 2D4WA 2KKZA 1QQCA 1LAVA 2UU9K 1TKTA 3CI5A 4X62K 1HX1A 2RF2A 3OS0A 2Y1IA 4PUOA 4AHSA 1C0UA 4LD0A 5HLFA 3K0SA 3IDHA 4A5BA 1JLQA 3RMBA 2BH1A 2PBDA 3MCAB 4DF4A 3RMDA 5I42A 1T05A 1A5XA 2UYTA 3CCUN 4NLCA 1N33K 4EZ9A 2NRXA 2PFUA 1TK8A 2I7NA 3DLRA 3ZYYX 4BR4A 5HL7L 3PX4A 1OKJA 2HF4A 2A1SA 3IG1A 4CJSA 3EY1A 3CQYA 3C0BA 5BREA 1W9HA 3I0RA 3VEZA 3OBWA 1NKCA 4ELUA 2ZF5O 4IFEA 1B9DA 2KLAA 2G8IA 1L5UA 2RKIA 3GBTA 3HOTA 4DS4A 1BO5O 4NXMK 2KW4A 3F9MA 4CD1A 4GKJK 3DLKA 4GNIA 4DU1A 3CCEN 2HBJA 5M1NA 4NB4A 1S22A 5AQOA 4OO1J 1IG9A 5BR8K 1QSSA 3VQ7A 3PY8A 4I2QA 4CVNE 4F3OA 3OYCA 1LOTB 3CIPA 1S1UA 3UIQA 4DQQA 4H4MA 1RDUA 4CJ5A 4IJNA 4FZYA 4C23A 4CEBA 4KTWA 5BPLA 3PV8A 3WNFA 1OVQA 4E1MA 1YT3A 4ISFA 4O8UA 3QETA 2QWOA 4KTQA 1ILYA 3EZWA 4JI3K 1P8ZA 4CGGA 3K57A 4W5QA 2FSJA 3CPEA 3FGUA 4KH5A 1RT7A 3VA0A 3NAEA 3A5NC 3F2KA 3KLGA 1TUYA 4ILJA 2PZSA 5A2QO 1VQ6N 2UUCK 4BRPA 4H5RA 4QOZB 1C0TA 5JMVA 5BPMA 3O3FA 4IFYA 4O5BA 1QE1A 1C1CA 3AVCA 4IEEA 1VRTA 1NBWA 4C1NK 1GLCG 3TR8A 3JSMA 4IO8A 2PYLA 1ZC6A 4AM7A 1NGFA 4B1VA 4K43A 4B8CA 3THYA 1C0FA 2P9LB 1HYSA 3PSIA 1Z25A 2NNWA 2E8AA 4KREA 5KRTA 2P9NA 4C8MA 3NGZA 3KWGA 4F9OA 1FJGK 4CESA 1EQYA 4FVUA 3ZSQA 4DLEA 4CF2A 4DWIA 3K59A 2VWJA 1ATSA 2ZE2A 3DLLL 2OYQA 2G8VA 3THYB 4EHUA 4BE0A 4B08A 1KXPA 4YORA 3TSUA 2YNFA 5AZJA 2W41A 4DMNA 2IIRA 3CFPA 5BRFA 3LPTA 1NGBA 4JI6K 2P9NB 3N4PA 3L2RA 2F8TA 5AQFA 5AR0A 1JXBA 1R0AA 4FO0A 4QAGA 4KPYA 3M3ZA 1XNQK 2P5OA 3PIPL 1NMDA 4YFUA 3V4IA 3HSCA 4BDZA 1NGDA 2X6SA 5AFUH 2XY7A 2D0PA 3O9UA 1VQPN 3VGLA 3THVA 1RT1A 3QMLA 4IDKA 3OYIA 4ZTFA 3E66A 5F1XA 3QERA 1BQNA 2P9SB 4IG3A 4OPKA 1NGHA 2B6AA 4CJTA 5JS2A 1RDBA 2CGJA 2NZTA 4W5OA 5J2QA 1X9MA 3A5OC 1IJJA 5FLXO 4DV4K 3K9JA 4CZHA 2CGLA 2RHKA 2IVPA 4FJJA 2G8WA 1KAYA 5AQWA 1Q81O 4PKIA 2ZGZA 1SUQA 2VG6A 4BQZA 2QI2A 1Q18A 1UWBA 4KH4A 3AGRA 3S41A 3KKRA 4O0IA 3V9UA 3M8PA 4KHWA 2ZM6K 3AA2A 3KJVA 2X78A 3NF8A 4K0KK 4F8RA 2QW9A 2P9PA 4IZ9A 4EP4A 2A42A 1TAUA 3ISNC 4I6MB 4EP5A 1BI4B 1BUPA 3FFKB 1RDWX 3P38A 3L2UA 4JK9A 1NGEA 4CGIA 5DM6L 1GLLO 3FFIA 1YIJN 1B9FA 2KQ2A 4IG0A 2W40A 4X65K 3BF3A 5AQKA 3SBGA 2P9PB 4IEIA 4CJUA 4LF4K 1NK0A 1CZAN 1QZ5A 1TKDA 3VQDA 3AVGA 3UKRB 5HBMA 1SKWA 4Z4CA 4CEAA 4JS4A 3AV9A 3TSPA 2P9UB 4FWKA 1BOTO 1Z6RA 3VQ9A 1JLFA 3UKUA 2GWKA 2HNYA 2FBVA 1KQSM 3OVNA 4FYDA 1TUUA 2HVIA 4XIUA 4DHYA 3CJBA 3OA9A 5LY3A 4CF8A 4JKHA 1T6CA 4H0XB 2UXDK 2WOMA 1S1XA 4JS5A 2ZJPL 3EKSA 3LWLA 2FSNA 1GOAA 1ZBUA 3UKUB 1C1BA 4MLHA 4CJWA 5C12A 4DTMA 3CCRN 1L3VA 5GIOA 5KQ8A 2A6AA 1CZ9A 3EEQA 4ICLA 4PY5A 3M8SA 1NJWA 3NF6A 3V9SA 1DTTA 5AQSA 4A62A 3TSQA 2G8UA 4CBUA 3CCJN 3VENA 2P9IA 4JHDA 3LALA 4H0OA 4MO4A 4CBWA 4FM1A 4CF1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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