4CZI | Genus

Total Genus 99

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	99
sequence length	326
structure length	316
Chain Sequence	ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSTAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments. pubmed doi rcsb
source organism	Caulobacter vibrioides
molecule tags	Structural protein
molecule keywords	ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus	99
structure length	316
sequence length	326
ec nomenclature
pdb deposition date	2014-04-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF06723	MreB_Mbl	MreB/Mbl protein

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	4cziA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	4cziA02
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	4cziA03

1RGIA 4H0VB 2GEMA 2YHWA 3SMSA 2NRHA 3VF6A 4LC9B 3ZX2A 2AP1A 1LOTB 4B1ZA 4K41A 4DB3A 4XH4A 1TUUA 4JHDA 4BRMA 2VWBA 1CZAN 3WEEB 3DAWA 2E88A 3VPZA 3VENA 5AQMA 3EKUA 5AZIB 1ATRA 3ZX3A 3WQUA 1ESVA 3U9ZA 5AQNA 5AQIA 4CJ7A 1K8KB 4ISEA 4CZGA 1IG8A 2W41A 3H1VX 3IDHA 3MMVA 2FSJA 4CBXA 2A42A 5AQGA 3JS6A 1NGDA 1JCGA 4XH1A 1T6DA 5AFUA 3LDLA 3QMLA 1MDUB 1BG3A 5BRFA 2P9LA 3H1QA 1V4SA 2YJEA 1RDWX 2F9TA 2CH5A 4H0YB 2ASPA 2HF4A 4BQLA 3DXKA 3VGMA 4WQ4C 4JHDB 5AQWA 4I6MA 5E26A 3VEXA 2FXUA 3F9MA 3WEEA 4H0XB 1D4XA 3WXKA 4FO0A 2P9KB 3H3OB 4NB4A 4DCHA 4AM7A 3D2FA 2E2NA 2D0OA 3VGKA 4BGAA 3ZEUB 2E2QA 3A5LC 3W0LA 1HKGA 4CBWA 2P9KA 3LDOA 3BUZB 3QFUA 1DGKN 5ADXH 2QWLA 1TUYA 1NGBA 4JD2A 4FWNA 4HTLA 1QQMA 3SLCA 4RWTA 3GL1A 1NGCA 4BC3A 2E1YA 4IO8A 1C0FA 4A2BA 2P9LB 3VEYA 1WUAA 3LM9A 3MN7A 1JCEA 1HX1A 3LDNA 4RCHA 3UKRB 4PKHA 3HSCA 3KVGA 2Q97A 3VEWA 4H0PA 5KPTA 1BDGA 3J8AA 3CIPA 3H3NO 4JNEA 1KAZA 5BN9A 1ATNA 4E1JA 3DWLA 3CERA 4H0OA 1J6ZA 3L0QA 4BC4A 5I9EB 1NBWA 3CQXA 1G99A 2IIRA 1HKBA 2Q36A 1S3XA 4GY2B 1C0GA 4BRNA 3QB0A 4CZEA 4CZMA 4FSVA 4F9OA 1DEJA 2VCPA 2P9PB 3MK6A 4BRGA 3WXJA 3HTVA 4B1UB 1QZ6A 4CZLA 3ZEUA 5KPZA 3DXMA 5AQTA 1BA1A 2DPNA 2ZGYA 4BROA 4BR2A 3WQTA 2GUPA 3O6WA 4I6MB 5BRHA 3R6MA 3CJ7A 1MA9B 1YAGA 3TU5A 4YDUA 4FPAA 2Q1NA 3GBTA 2CGJA 2AA4A 2E1ZA 4IXCA 3UE5A 5AQVA 3O1BA 4FOEA 1QQOA 3CETA 1HLUA 2QWNA 4BRLA 3BP8A 4C23A 1RFQA 1BA0A 3DJCA 3D2EA 3HI0A 2P9NB 3O80A 3U4LA 3ZETA 2BTFA 4A62A 1E4FT 4FWMA 2P9SB 5EXWA 3HM8A 3WT0A 3O5BA 1GLBG 5AZJA 3W3DA 1NGGA 3G25A 1BUPA 4XH5A 1TYQB 1Z6RA 1SQKA 1Z05A 4CZIA 2CH6A 5AQSA 4EHUA 1OKJA 3I8BA 1KXPA 2GTDA 5JMVA 4FL9A 3FZKA 2V52B 3U8XA 3GG4A 3O08A 3AAPA 4H5RA 3QBWA 3KHYA 4H5TA 3VGLA 3L4IA 1YUWA 2PBDA 1NMDA 2ZGZA 3U9DA 5AQKA 1XC3A 4CZJA 1XUPO 4EFHA 1ZC6A 1U2VA 1GLEG 5AR0A 4BREA 1ZBSA 5LY3A 2IVNA 3SJHA 2I7NA 2PAVA 4QS7A 5AFUH 3FFKB 1R59O 4GNIA 4CZFA 1YXQA 4DQ8A 4BC5A 5LJWA 3VF2A 3CJAA 5AQOA 2I7PA 3EZWA 4IWVA 2QWPA 3AAQA 1GLCG 4B1VA 4IJNA 1GLFO 2GWKA 5BR9A 1NWKA 5AZJB 2FF6A 2P9SA 3WUHA 3H6EA 3GE1A 4BVOA 3P4IA 2P9NA 4BRFA 4BC2A 5AQUA 3M6GA 4Y0WA 4BG9A 3VEOA 5F0XA 4BRCA 4PL7A 2P9IB 4A2AA 3O1WA 1T44A 3AARA 3UKUB 3MCPA 4CD1A 4O8KA 4CI6A 2P9IA 3C0BA 2YI1A 4O5FA 5AQPA 5TKYA 3TPQA 1ATSA 3GOIA 2OANA 4WQ5A 1NGAA 5BN8A 3EL2A 4FWKA 5F2RA 5JLHA 3DXKB 4M7YA 4L3QA 1NGFA 4JN4A 2NZTA 4FWSA 3SMPA 4B1YB 3ID8A 2YHXA 2FSKA 1JCFA 4ISGA 2Q0UA 2VYPA 5AQHA 4BRHA 4FWLA 2F9WA 4YDUC 3H45C 2HOEA 3A0IX 1ZXOA 3QICA 4MLEA 5AZIA 3ULEA 2A40A 3LDQA 3MDQA 5B8HA 1KAXA 4M63C 3HBTA 5EY4A 4EAHD 3ULEB 2QWRA 3UKRA 2V7ZA 3QDKA 4K42A 4H5WA 3IFRA 3LM2A 5BREA 2QWOA 2D4WA 1WOQA 2D0PA 5AQXA 5BPNA 3VERA 1XQSC 1SZ2A 5EX5A 1NLVA 2QW9A 4JAXA 4K43A 4CBUA 4JD2B 4BR5A 4EIAA 5FPEA 1Q18A 1V4TA 5AQLA 4BR9A 3CJCA 2Q0RA 1T6CA 1EQYA 3LL3A 3UB5A 3ENHA 4FWOA 4CZKA 3A5OC 4BR0A 3FR0A 1IJJA 1NM1A 5EOYA 3RSEA 3VETA 2EWSA 2E20A 3ZETB 2E8AA 5AQFA 1GLJO 2Q31A 4FWRA 4B9QA 5KQDA 2FLOA 4RTFD 2GELA 4MO5A 3D2EB 3ENOA 1U6ZA 5BPMA 5EVZA 5BPLA 4DHYA 5KQ8A 4BRIA 1BU6O 2IVOA 3C7NA 3L6QA 3VF4A 2UYTA 3CJBA 3HZ6A 3GDQA 3FLCO 1K8KA 3VEVA 5AQQA 5F1XA 3FZMA 3WXIA 2W40A 1DKGD 3KZBA 5AQRA 3DXMB 2J4RA 3CJ9A 4H03B 5BRDA 3BEXA 1U2VB 2KHOA 1SAZA 2HF3A 1NGJA 3FE1A 4MLHA 3ATUA 2P9PA 4PKGA 4BRPA 3S41A 1QZ5A 2YHYA 4IJAA 4CZHA 1S22A 3M3ZA 2H3GX 4NO7A 3CI5A 3QFPA 3CJ1A 4AM6A 2HMPA 5E84A 4BG8A 1NGEA 4FWPA 3IMXA 3AY9A 3SK3A 3A5MC 5AQZA 1P8ZA 2A5XA 5CE3A 2A41A 3A8YA 2GWJA 4WQ5C 1KAYA 3JXUA 2V51B 3ZX0A 1NGIA 2E2PA 4QS9A 2NLXA 1TYQA 3WXLA 4PKIA 3FZHA 2ZF5O 2A6AA 3I33A 4B1XB 3ATVA 4BRKA 3OHRA 1MWMA 4H5NA 2QWQA 5ADXA 4BRDA 4WYBA 4FPBA 2ITMA 4BR7A 1QHAA 1BOTO 1HJOA 3R9PA 3B8AX 3LDPA 1X3NA 3R8EA 2D1KA 4IZ9A 2V7YA 4Z94A 1BWFO 4QS8A 1YVNA 2Q2RA 2YCHA 3FZFA 3VOVA 2CGKA 2ZWHA 3MN5A 3D2FB 4K25A 3EO3A 4A61A 2QWMA 5FPMA 3H46O 3QBXA 3BF1A 4MO4A 3MN9A 3BF3A 4KBOA 5JLFA 3M1FA 1MWKA 4J8FA 4BRAA 4H0TB 2FF3B 4CD3A 1HPMA 3EKSA 4XEIA 4PL8A 3O4WA 2E2OA 1HUXA 1NGHA 3UKUA 4FOIA 3C7NB 2YJFA 2P9UB 4FWQA 4EHTA 5AQYA 5JICA 3IUCA 3EN9A 2IVPA 4ISFA 2ASMA 1QQNA 2BUPA 2P9UA 5FPDA 4BR4A 4WQ4A 2QM1A 3D7EO 1E4GT 1HKCA 4HWIA 4BRQA 3RSEB 1LCUA 1X9JA 3MN6A 1GLLO 3VEZA 5AQJA 2WUSA 1GLDG 1BO5O 4H5VA 2FSNA 3O8MA 4BVPA 4BGBA 1H1VA 4B1WB 5FPNA 5KPRA 1X3MA 3VESA 4M7XA 5LJVA 5ELZA 2A3ZA 3FGUA 4BQZA 2QXLA 3FZLA 1GLAG 3A5NC 2ASOA 1Y64A 2CGLA 3CQYA 3CHWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

2FBVA 2YHWA 1EX4A 1IO2A 4LC9B 3OBYA 3PV8A 1KRPA 4YFUA 1F21A 2AP1A 2GBZA 4XH4A 4CK1A 4BY9C 1KVBA 3PIPL 4PA1A 1IV0A 1CZAN 2E88A 3EKUA 3THWB 5FLXO 1ESVA 3L4QA 4CJ7A 1K8KB 2O8FA 2W41A 1YJWN 4W5QA 4EZ6A 1NGDA 1JCGA 1T3VA 1KD1O 4X66K 4J2BA 4FK2A 2I5JA 1L3UA 5AFUA 2IOCA 3G4SN 4LF9K 2P9LA 5MLCQ 2FBYA 1C0UA 1D8YA 3RMAA 1MU2A 2CH5A 2F9TA 3MECA 2ASPA 4JLHA 4CHYA 5AQWA 4I6MA 5E26A 3NAEA 3F9MA 3WEEA 1EXQA 4AHVA 5M1NA 2HHIA 2D0OA 4GKJK 3S3OA 3W0LA 1HKGA 3NE6A 3LDOA 2XRIA 3QFUA 1D5AA 1XMOK 2QWLA 4KAZA 4JD2A 4XIUA 2YHAA 3SAFA 4HTLA 2E1YA 1TGOA 1XHXA 1T05A 3LM9A 2HHTA 3LDNA 2P5OA 4PKHA 3J80O 3QLHA 1B9FA 3HM9A 4DTRA 3M8RA 4CHOA 2BE2A 3U3YA 5KPTA 2R7YA 4YOTA 3J8AA 3CIPA 2OPQA 4UQGA 3SZ2A 4JNEA 1KLNA 2F4VK 4F2SA 3KK7A 1T8EA 3SJJA 2JWLA 3CERA 4LH4A 5I9EB 3CQXA 1G99A 4YHHK 4N47A 1ITGA 4M42A 4F9OA 2P9PB 2O8DA 1A5XA 1IKWA 3QESA 1NJYA 4W5NA 2O4IA 1NK0A 5IT9O 4DG1A 1ZYQA 3AVJA 3DXMA 1BA1A 4BR2A 3V4IA 3O6WA 1KTQA 4OJRA 1ASUA 5BRHA 3CJ7A 4W5OA 1VSDA 1YAGA 2ZJQL 2Q1NA 3GBTA 2E1ZA 3K5MA 3UE5A 3DRSA 3SUOA 1QQOA 3CETA 2Z1HA 2W6LA 1P90A 3BP8A 4FM2A 3I55N 1RDBA 1I3AA 1TKTA 1S1WA 4B3OA 3HI0A 2P9NB 4KH4A 2GX9A 3AVNA 3D6RA 1K9MO 4FJMA 1CLQA 2BTFA 4A62A 2P9SB 3HM8A 3O5BA 5AZJA 4YY3K 4DR5K 4DTPA 2OPSA 4KREA 1Z05A 5AQSA 4IDKA 4M3RA 1IBKK 1KXPA 4LY7A 3GG4A 4DTNA 2HNZA 2NRXA 3E9LA 4PY5A 2KTQA 3M5RA 3VGLA 3L4IA 2JWKA 1NMDA 1RDAA 3CXCM 4E7HA 1HPZA 4MDBA 1XUPO 1U2VA 1KQSM 4BREA 1RTIA 3HXMA 2G8VA 4CCHA 4BDZA 1T03A 2VGNA 1R59O 1HRHA 1WSEA 4CZFA 3CCQN 4CIGA 3VQDA 3HVTA 5AQOA 1FXXA 4IWVA 4FJ9A 5C2FA 1EO1A 4JKGB 1GLCG 3E66A 1GLFO 5BR9A 1NWKA 4R79A 4O0IA 2HNDA 2D0AA 1WSJA 4BVOA 2RHKA 3O9SA 1FJGK 5AQUA 1VQMN 4FZZA 3VA3A 4BG9A 4FJKA 1Q8IA 2OPPA 3UKUB 3AVCA 3DRRA 1QS4A 4CI6A 3C0BA 5AQPA 4Q5VA 3TPQA 1WB9A 3NF9A 4WQ5A 4C8KA 5BN8A 1LV5A 4FWKA 2ZD1A 3DXKB 4M7YA 4M3TA 3AVBA 2FBTA 1NGFA 3TABA 3U6FA 4B1YB 1C6VA 1IKYA 3ID8A 2ZE2A 4ISGA 3VA0A 2Q0UA 2VYPA 5AQHA 4DSFA 3SUNA 4IOAL 2LSNA 2F9WA 3H45C 2HOEA 3A0IX 4MLEA 3QICA 1GOCA 2F7TA 3J81O 3ULEA 4HCCA 2IAJA 4F3OA 4M63C 3UKRA 4K42A 3DI6A 4H5WA 1JLEA 3O3GA 4K0KK 2VG5A 5HBMA 4DQQA 2Z1IA 1XQSC 3BGRA 1NLVA 3ASMA 4OO1J 1HNIA 4FK4A 5AQLA 1HYSA 3K5NA 3CJCA 4E7LA 3MWTA 3SUPA 2HB5A 3ZT4A 3FR0A 3R3LA 4I2QA 1NM1A 2KZZA 3VETA 2EWSA 5AQFA 3NH2A 2GV9A 1L3SA 1LWCA 3S3MA 5BR8K 3HP9A 5KQDA 3L2WA 4HUFA 4MO5A 3D2EB 1W2BM 4DV6K 2O8CB 4LFCK 5BPLA 4DHYA 1S5JA 5KQ8A 3KWGA 4I2PA 4B8CA 3L6QA 1NU0A 2BDPA 4DKWA 1GOBA 3OYAA 5AQQA 3VMFB 3G0ZA 3OYIA 3THYB 2E6MA 4J2EA 3KZBA 1JLCA 4LSNA 3CJ9A 1ZBHA 2OPRA 3BEXA 1SAZA 3FE1A 2B5JA 3AVFA 1I94K 1QZ5A 2YHYA 3DYAA 4CZHA 3M3ZA 1VQ7N 3CI5A 3QFPA 2HHSA 1W9HA 4FWPA 3A5MC 1C1CA 1TK5A 1P8ZA 4LSLA 3D45A 1QSSA 1RBRA 3QEVA 1RBSA 2HHXA 1IG9A 4WQ5C 1KFSA 1S9GA 1KAYA 4CEZA 2V51B 4DS4A 3T1HK 1NGIA 4QS9A 3OYBA 3WXLA 3I33A 2D0CA 3OYKA 3L3UA 4B9UA 4Z4GA 3HJFA 4FJ7A 4CEOA 3NVMA 3SPYA 3E9PA 2QWQA 3AVGA 4O5BA 3K57A 2OTLN 4DQPA 3HO1A 2XHBA 4I7FA 2GUIA 4BR7A 3DLEA 3HPGA 2IGIA 3PO4A 1CXUA 3JSMA 2D1KA 4JKHA 4IZ9A 4FYDA 1S1VA 3VQBA 4E3SA 1YVNA 3CFOA 3RWUA 4E7IA 3VOVA 3NGIA 3CCRN 4CJ3A 2ZWHA 4K25A 1RTJA 5FPMA 3H46O 3QBXA 3DM2A 3O4QA 1MWKA 3OBWA 4FJIA 4FVMA 4CD3A 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1XI1A 1REVA 3H3NO 1EWQA 5LL6Z 1NJXA 1ATNA 4H4OA 3DWLA 3L0QA 1NBWA 3RR8A 1HKBA 1S3XA 1C0GA 4BRNA 1OH5A 1VQ6N 4F4KA 3MK6A 4BRGA 5HOOA 4DTSA 1QZ6A 1YF5L 4CJWA 4YOXA 4TSXA 4LF7K 3EZ5A 4NLCA 3RR7A 4AHRA 3C6TA 3L3VA 3F73A 5GINA 3OS2A 3T7ZA 5JS1A 1HMVA 4OGCA 4C8MA 3T69A 1RT7A 3WNEA 3PX6A 4JI8K 2AA4A 2OYQA 3O1BA 1IKVA 2KLAA 2QWNA 1N5YA 1OVYA 3PX4A 4C23A 4DLEA 5A2QO 4FLTA 3D2EA 3QEXA 3U4LA 3ZETA 4KV8A 1BISA 5EXWA 3W3DA 3ZT3A 3G25A 3I0SA 1BIUA 4NLBA 5IWAK 4E7JA 1Z6RA 4CFDA 3TSUA 4EHUA 3VQAA 1OKJA 4KI6A 3OYGA 2GTDA 3M8QA 5DK5A 4FCYA 2P1JA 2HHVA 4F3TA 3DLRA 3SBGA 1XNQK 3AVMA 3NVKA 4WFBL 4M3UA 4EP4A 1DTQA 4OPKA 2VWJA 3HL8A 4M3WA 1VQLN 2UXCK 5K14A 1EETA 3AO1A 2PBDA 4ZTFA 5AQKA 3P5JA 1XC3A 4CZJA 3E1YA 3IS9A 1ZC6A 2HNYA 4EFHA 2KQ2A 4RW7A 4NXMK 4LH5A 5LY3A 3RMCA 2PAVA 5KTQA 3HOTA 5KGWA 4B08A 1YXQA 2O4GA 4BC5A 5LJWA 4CHZA 1WSFA 2WONA 2RPIA 3EZWA 3QIOA 2QWPA 3CC4N 3U3GA 4B1VA 2FF6A 1XHZA 2PYJA 1C0MA 3H6EA 3TSPA 4CGIA 1X9MA 3P4IA 1B9DA 4BRFA 3NH1A 4BC2A 3QEIA 1KC8O 3KKSA 5F0XA 1BI4B 3RMDA 4PL7A 2P9IB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4CZIA

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Chord Diagram

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