4CZIA

C. crescentus mreb, single filament, empty
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
326
structure length
316
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSTAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
source organism Caulobacter vibrioides
molecule tags Structural protein
total genus 99
structure length 316
sequence length 326
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cziA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cziA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cziA03
3VETA 1RFQA 2I7PA 1EQYA 2DPNA 2E1ZA 4CZGA 4CZIA 2A5XA 2D1KA 4M63C 3WQUA 3EKSA 3MN7A 5EX5A 3ZETB 3SJHA 1U2VA 2FLOA 1BWFO 1LOTB 1U2VB 3GL1A 3LDLA 5LY3A 3G25A 2BTFA 2YJEA 4I6MA 5KPRA 4FWSA 1NGAA 3DWLA 5AQPA 1HPMA 2ASMA 3KHYA 4FWQA 4GY2B 4E1JA 5BRFA 4FOIA 3L0QA 2P9KA 2QXLA 3IDHA 3R6MA 3CJ7A 5EOYA 2QW9A 3SMPA 2P9KB 4Z94A 4J8FA 3O80A 2AP1A 5AQLA 4CZMA 3VOVA 2QWMA 3BF1A 3J8AA 4BG8A 4CD3A 1IG8A 3D2EA 1J6ZA 3D2EB 3EZWA 4IO8A 4A61A 4EFHA 5AQTA 5I9EB 2A40A 1GLCG 3CI5A 1QZ6A 4K42A 1OKJA 4F9OA 3C7NA 4NB4A 4BROA 4CZLA 3ZEUA 2Q1NA 1GLLO 4BR9A 5F1XA 3ZEUB 4WQ4C 4H0TB 4MO4A 4JHDA 5KPTA 1BA0A 5E26A 3UE5A 4BRQA 4JHDB 1V4TA 2HF4A 5EVZA 4BRNA 3H6EA 3L6QA 4H0VB 4B1VA 1JCGA 3CJ1A 4A2BA 4BC5A 1JCFA 5AQYA 1NGBA 3FR0A 1RGIA 3FZKA 3W3DA 4JN4A 3DJCA 4QS8A 5BRDA 2Q0RA 2V51B 4CZKA 2P9PA 2E2QA 1GLDG 3VEOA 2P9PB 4BRLA 2ASOA 1HLUA 3QFPA 4FOEA 3WUHA 3VF4A 1T44A 3JS6A 3ZX2A 3QB0A 2CH6A 4H5WA 2QM1A 5AQUA 1BUPA 2J4RA 1G99A 1MWKA 3VESA 3ENHA 3WEEA 4BR0A 4LC9B 3WEEB 5FPDA 4B1ZA 4QS7A 2Q36A 2QWRA 5AQNA 1KAXA 3EO3A 2D4WA 3U9ZA 4BQLA 1CZAN 5E84A 2PAVA 2UYTA 5AQXA 4IWVA 3ULEA 4AM7A 3CHWA 4MLHA 4BRMA 4H5NA 4JD2A 3U9DA 5BPNA 3LDNA 2W40A 4JD2B 2I7NA 3HM8A 3H46O 1SZ2A 3VGLA 3H3OB 2GWJA 3H1QA 4BC2A 3O6WA 3SLCA 1SQKA 4BGAA 4FL9A 1RDWX 1ATSA 3CJAA 2Q97A 2OANA 4CBUA 3VPZA 4DHYA 3VF2A 3VEVA 5JICA 3U8XA 4HTLA 1YXQA 4BR5A 2A42A 3MCPA 3VERA 3WXIA 1Z05A 1BG3A 1KAYA 2GTDA 4YDUC 1MA9B 4BR2A 3U4LA 5AZJA 5AZJB 2E2OA 3B8AX 1NGEA 3D2FA 3M6GA 4K25A 4XH1A 4BVPA 3D2FB 3TU5A 4BRFA 1MWMA 3HTVA 3VEZA 1HKCA 3LL3A 5AQGA 1C0FA 3ATUA 5F2RA 3ZETA 4IZ9A 4CD1A 5F0XA 2E2NA 2P9LA 4HWIA 2P9LB 3O1WA 1QZ5A 3MK6A 1GLBG 4BRIA 4BRCA 1T6DA 3P4IA 4AM6A 3BP8A 3EKUA 5LJWA 2YHXA 1T6CA 5BREA 2P9UA 4GNIA 2P9UB 4PL7A 4CBWA 3FLCO 1U6ZA 5B8HA 1X9JA 3OHRA 2GEMA 2V52B 4H5VA 5AQIA 2HF3A 3JXUA 1S22A 1HJOA 1NGGA 4Y0WA 3VEYA 3SMSA 1GLEG 4FWLA 2HOEA 3TPQA 4H5TA 2V7ZA 5AQFA 2FF6A 3O4WA 4CBXA 4FO0A 1NGIA 2WUSA 5BPLA 1SAZA 4K43A 4EHUA 3WQTA 2F9WA 3CJBA 3CJ9A 1YAGA 1YVNA 1C0GA 3HSCA 2GUPA 5AFUA 2IVPA 1TUYA 1Q18A 3ZX3A 4EAHD 2P9IA 5CE3A 1QHAA 4B1XB 2P9IB 3QBWA 5AQQA 4DQ8A 3FE1A 1TYQA 1NGHA 2FXUA 4BC4A 4BC3A 4WQ5A 5BR9A 1TYQB 2QWNA 3FGUA 5ADXH 5FPEA 4H0XB 2CGJA 4YDUA 1BU6O 2A6AA 3R8EA 5FPNA 4K41A 4M7YA 1TUUA 2IIRA 4MLEA 2Q0UA 5AQSA 4PKGA 5AQMA 5BN9A 2IVOA 4BRAA 4BRKA 5BN8A 2E88A 2V7YA 3AARA 5AQKA 3VF6A 2E8AA 3QICA 4BRGA 3HBTA 4CZEA 1KXPA 3O08A 5TKYA 3LM9A 4FWOA 4BG9A 3I8BA 4PKIA 1JCEA 2QWPA 3UB5A 2HMPA 5EY4A 2EWSA 1X3NA 4B1WB 4L3QA 3VEWA 2YI1A 1GLAG 2FF3B 4WYBA 2NZTA 1HUXA 3BUZB 4RTFD 3QFUA 4JAXA 3AAQA 4H0YB 3AAPA 4BRDA 1BOTO 2A3ZA 4FPBA 1GLFO 1ZXOA 3LDOA 2GELA 2NLXA 1DEJA 2ITMA 4IJNA 3CIPA 1NGCA 1DGKN 3MDQA 3H1VX 2H3GX 5AFUH 5FPMA 4IJAA 3WXJA 2D0PA 5AQWA 1NGFA 1NM1A 1NWKA 2E20A 4BRPA 3LDQA 1E4GT 4BR4A 1KAZA 2CGKA 2VWBA 4BRHA 4B1YB 1P8ZA 1E4FT 3WXLA 4B9QA 3CJCA 2PBDA 4WQ4A 2YHWA 4A62A 3VEXA 3A5LC 3A5OC 3GBTA 5AQHA 3A8YA 3DAWA 1IJJA 1NBWA 3MN5A 3QDKA 4CZJA 2YCHA 3CERA 3H45C 4FWRA 5ADXA 3LM2A 4FWNA 3KZBA 3SK3A 1QQOA 3VENA 1H1VA 4FWMA 1WOQA 1WUAA 1HKGA 4H03B 2NRHA 3FZMA 5JLFA 2A41A 4XH5A 5AR0A 4BR7A 5KQ8A 3CQYA 3RSEA 3VGKA 3MN6A 5AQRA 1HKBA 3RSEB 3S41A 4I6MB 3GG4A 2QWLA 1DKGD 2ZGZA 3FZFA 4O8KA 2GWKA 3MN9A 2QWOA 3UKUA 1Z6RA 1ZBSA 1NMDA 3UKUB 2W41A 4ISGA 3BEXA 3D7EO 4EIAA 4DCHA 4RWTA 3DXMA 3M1FA 2YHYA 3FZLA 3DXMB 5JMVA 2IVNA 5AQJA 1NLVA 3ZX0A 4C23A 2Q31A 5EXWA 5AZIA 4XH4A 4M7XA 1NGDA 3C7NB 4ISFA 5AZIB 1NGJA 3KVGA 3ATVA 1ESVA 5KQDA 3ID8A 4H0OA 1Y64A 4O5FA 3IMXA 3EL2A 2E1YA 2F9TA 3O1BA 4CZFA 3F9MA 3O8MA 3HI0A 3DXKA 1V4SA 3WT0A 4EHTA 3ENOA 1XQSC 3A5NC 3DXKB 5BRHA 3LDPA 4CJ7A 3GOIA 2P9SA 3CETA 2CH5A 1HX1A 2ZF5O 4QS9A 1MDUB 2P9SB 1D4XA 3CQXA 1S3XA 4FSVA 5KPZA 4FWPA 2D0OA 5BPMA 5AQZA 4BQZA 4FWKA 4XEIA 2E2PA 1QQMA 2ZWHA 4H5RA 1BO5O 2BUPA 3QBXA 4JNEA 2Q2RA 2ZGYA 3IUCA 3M3ZA 4CI6A 1K8KA 4CZHA 4KBOA 1K8KB 1XUPO 3H3NO 3HZ6A 4DB3A 2VYPA 3FZHA 2ASPA 4BGBA 4BREA 3WXKA 1YUWA 1BA1A 5LJVA 3MMVA 4NO7A 3EN9A 4PL8A 4B1UB 3FFKB 4MO5A 3ULEB 3VGMA 3QMLA 2VCPA 4ISEA 1XC3A 3GDQA 3BF3A 2CGLA 1ZC6A 1LCUA 3W0LA 5ELZA 2QWQA 3O5BA 4A2AA 1ATRA 4RCHA 1BDGA 2KHOA 2FSJA 4BVOA 3L4IA 3AY9A 5AQVA 1X3MA 4WQ5C 2P9NA 3A0IX 4H0PA 3I33A 1R59O 3GE1A 2P9NB 1GLJO 4FPAA 5JLHA 3A5MC 3UKRA 3IFRA 1ATNA 3C0BA 4IXCA 3UKRB 2YJFA 5AQOA 4PKHA 2FSNA 2FSKA 1QQNA 3R9PA 2AA4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2B5JA 3VETA 2HVHA 2E1ZA 4X66K 1NK4A 3HVTA 4A5AA 2FBTA 3ZETB 3SJHA 1YF5L 3HPGA 1LOTB 1WSJA 1B92A 3GL1A 3LDLA 5LY3A 2BTFA 2YJEA 1CXUA 4GV3A 5I3UA 1WAFA 3VQ4A 1NGAA 1Q81O 1JLEA 2ASMA 3KHYA 2P9KA 3IDHA 3OTOK 1QE1A 3QEPA 2XY8A 2AP1A 4M3XA 4UY8O 2QWMA 3WXMB 3CCMN 4E89A 5FLXO 2YNFA 4FJGA 4W5QA 4IO8A 2E5LK 5I9EB 4CIEA 3HYFA 3CI5A 1QZ6A 4PA1A 3C7NA 4BROA 4CHZA 3ZEUA 4KI6A 3CM5A 2LSNA 5E26A 4LF9K 1V4TA 3S3MA 4I2QA 1WSFA 3AO3A 4OJRA 3H6EA 4QOZB 3MWPA 1KRPA 1GOCA 4A2BA 4FZYA 3MXIA 3OYEA 1RTHA 1REVA 2R7YA 4JN4A 1IBLK 2Q0RA 1L5UA 1GLDG 2QKKA 4YFUA 4BRLA 3WUHA 1DTQA 3QLHA 4M3YA 1T44A 1BUPA 1YHQN 4BE7B 4BR0A 3PX6A 4LC9B 3WEEB 1UAXA 4H4OA 5FPDA 4B1ZA 4QS7A 2Q36A 4FM2A 2OYQA 1RTJA 3EO3A 4I9LA 5CHIA 2IAJA 5E84A 2X6NA 4DTJA 2PAVA 3AA3A 4MLHA 3QEVA 4DV0K 3BZCA 1X1PA 4JD2A 3AVGA 1UWBA 3CFRA 4DR6K 3J7ZO 3VGLA 3E1YA 3H3OB 3NF8A 2Z1HA 4BC2A 3SLCA 1IV0A 1SQKA 3TSPA 3CJAA 3M5RA 1UOCA 4FLYA 1CZ9A 4HTLA 1XC9A 4BR5A 2A42A 3MCPA 3AA4A 4LF7K 4BR2A 1NKCA 3CCSN 5AZJA 3ZSZA 1YTAA 1HPZA 3THYA 4AHUA 1XNRK 1W0HA 3D2FA 3M6GA 1BIUA 4M3ZA 3L2WA 4JK8A 1VSFA 1HKCA 5J1EA 4CIGA 1C0FA 3ATUA 4IZ9A 2O8EB 4HWIA 5J2NA 2O8CB 2I5JA 4BRIA 3OJUA 1RDUA 4BRCA 4A57A 1RT4A 3CC4N 1NOZA 3EKUA 4U67L 5LJWA 2YHXA 1T6CA 3DRSA 4CERA 4LF5K 4PL7A 1Q9YA 3CM6A 4KHYA 1FJGK 4N41A 4Z4EA 4GV6A 4DV7K 1SS6A 5AQIA 3CCUN 2OZSA 4CGJA 4CJVA 2HF3A 4DV3K 4HUGA 4Y0WA 1HJOA 3CF5L 1N32K 2P5OA 1D8YA 1BQNA 2HOEA 1JJ2M 1EKEA 1XI1A 2V7ZA 4BACA 3O4WA 3QIOA 4RW9A 4GVEA 2WUSA 1SAZA 4CGGA 4FCYA 2F9WA 1HQUA 1YVNA 3MXMA 3HSCA 3AO4A 3TAMA 5AFUA 3CMEN 4EAHD 4MQ3A 4NXNK 4BE0A 3TAFA 3QBWA 4ZTFA 4DQ8A 4IEEA 4FK2A 2A1RA 1BCOA 4AHVA 1TYQA 4BC3A 3PX4A 1F21A 2QWNA 1W9HA 4CEAA 1N8RO 3NBPA 4C8KA 1FK9A 4M7YA 5KGWA 1OH5A 3OS0A 4DTUA 3MXJA 2E88A 2V7YA 3AARA 4B9LA 3QICA 4BRGA 4DTNA 3MAQA 2O8DA 4BECA 3ZT2A 2KLAA 5TKYA 1JL1A 1KXPA 4JI1K 1D9DA 1ASUA 2E6MA 3QO9A 4BG9A 4LF8K 1RTDA 1C1CA 1S1VA 3HL8A 4Z4CA 1HUXA 4LH4A 3AAQA 2DFFA 3OYJA 3KKRA 1WB9A 1BOTO 4QCLA 2KFZA 2KZMA 4CESA 4NYFA 4CJ4A 2ITMA 4CCHA 1NGCA 1DGKN 1I3AA 2G8FA 4CVNE 3WXJA 2YX6A 2D0PA 3LAMA 1NM1A 4ILHA 4BRPA 3LDQA 4O5BA 4F2RA 1E4GT 1P90A 4B1YB 1E4FT 3HOTA 2FBYA 3MECA 3AGRA 4RW8A 3U3YA 3CD6N 3VEXA 3HVRA 3BGRA 1RBUA 2AJQA 1EWRA 3A5OC 5AQHA 4B08A 3NMUA 4JI0K 3SV3A 3A8YA 3OYLA 3DAWA 3KKSA 1IJJA 3MN5A 1KSPA 1J53A 1WNSA 3G0ZA 1X9MA 3LM2A 4JI5K 3KZBA 4CEDA 3SK3A 3VENA 1H1VA 3ZSVA 3WNEA 1WUAA 2ZM6K 3F2KA 4W5TA 4F3TA 4FJ5A 3L4QA 4E1MA 3QNOA 2PFUA 5KQ8A 3SAGA 3CQYA 3MN6A 1HKBA 4OVLA 3NF7A 1NU0A 2JLEA 4CFDA 4O8KA 1W97L 1RBSA 3O9UA 4C8NA 1B9FA 1WSGA 1Z6RA 1OVQA 1NMDA 1ZBSA 3MWTA 2W41A 4DR1K 1NJZA 4DCHA 3M1FA 3DXMB 3VQQA 1TL1A 2IVNA 3I8DA 4CF9A 1T3VA 4KHUA 4DR2K 1IH7A 3ZX0A 1QTMA 2Q31A 5EXWA 4FLTA 3C7NB 3P39A 1NJYA 4FLVA 1NGJA 3KVGA 1ESVA 5KQDA 4H0OA 2UUBK 2Y1IA 2W6LA 3O8MA 4CF8A 4YOXA 3HI0A 3LAKA 4EHTA 3A5NC 3DLKA 3THXB 3RTVA 3MEGA 2JWLA 3NF9A 3THWB 3ITHA 2OA8A 3PV8A 2ZF5O 3ZT3A 1D4XA 4FVUA 1RDBA 1S3XA 3HM9A 4DU3A 4FWKA 3LP3A 2ZWHA 4N47A 3SJJA 1BO5O 1IKXA 2BUPA 5HRRA 4JNEA 5IT9O 2Z1GA 1K6YA 5M1QA 3M3ZA 4FM1A 3BZKA 1HYVA 5C12A 3F73A 2OZMA 4KBOA 1K8KB 5EU7A 3VA0A 1XUPO 1OVYA 3HZ6A 4DB3A 3J7AP 3O9SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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