4CZIA

C. crescentus mreb, single filament, empty
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
326
structure length
316
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSTAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 99
structure length 316
sequence length 326
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cziA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cziA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cziA03
3KVGA 5EOYA 5AFUH 3SLCA 4H5NA 5ADXH 4A2AA 4QS9A 4KBOA 3VEVA 4BRIA 5KPTA 4CZIA 3WXLA 1ATRA 2VCPA 1HUXA 2NLXA 3IFRA 4FWQA 1C0GA 1T6DA 4I6MA 2GTDA 2HF4A 2E8AA 4BR2A 3WXKA 4O5FA 3M6GA 3IUCA 2NZTA 4AM6A 3HSCA 4FWMA 3A8YA 2P9NA 3R8EA 3S41A 1NGJA 2P9KA 3UKUB 4BG9A 2W41A 5KQ8A 2D0PA 2A41A 3RSEA 2QWPA 3ZEUB 2CGLA 4L3QA 4DB3A 1ZC6A 4IXCA 3WEEA 5EX5A 4ISGA 3A5OC 3FZHA 3U4LA 5F1XA 1EQYA 1DGKN 1GLFO 2P9IB 4FPBA 1OKJA 4HWIA 3D7EO 5BPMA 4H0VB 4CJ7A 4NB4A 5AQLA 2P9SB 3ULEB 4B1WB 4B1VA 2F9WA 3H1QA 1U2VA 2V51B 3VGKA 1GLLO 4FWPA 1RDWX 4H0PA 3TU5A 4RWTA 4DCHA 5CE3A 2ZWHA 4EAHD 2GELA 3DWLA 1TYQA 3W3DA 4BR0A 1ZBSA 2FSKA 5AFUA 2Q0RA 5AQRA 3GOIA 2GWKA 5BR9A 5ADXA 1YXQA 3GG4A 2WUSA 5EY4A 1R59O 5AQSA 1BO5O 5B8HA 5BREA 5JICA 2Q97A 4MO4A 4H0OA 4CZKA 1MWMA 4Z94A 3F9MA 4WQ4A 4MLHA 3VGMA 4BGBA 3ID8A 4O8KA 3EZWA 1QQOA 3H45C 3CJ7A 4JHDA 4K43A 1HKGA 1JCFA 4XH5A 2F9TA 3VERA 3VETA 2Q36A 3KHYA 1V4TA 1NBWA 2BTFA 4H5RA 2AA4A 4A62A 1TUYA 4FWRA 4I6MB 5AQHA 3M3ZA 2CGKA 3UE5A 1WUAA 2CGJA 3SMPA 2YHXA 3CQXA 5AQJA 4JAXA 4BR5A 3O6WA 5AQUA 1C0FA 2P9NB 1BWFO 3H3NO 3J8AA 4FWKA 2P9UA 5JLHA 5TKYA 4BRGA 5BRDA 1CZAN 1P8ZA 3CIPA 3ATVA 3B8AX 2I7NA 4BRAA 3ZX2A 3U9DA 2Q31A 3O4WA 1GLBG 3DJCA 2QWLA 4CZFA 1GLEG 3ENOA 3O5BA 4BRKA 4F9OA 4RCHA 4B1XB 4BRPA 1BOTO 4YDUA 3MN5A 4BC3A 1YVNA 1NGDA 4EHUA 3ZETB 4RTFD 4CBWA 3UB5A 1ZXOA 3DXKB 1TUUA 2J4RA 3MMVA 3SMSA 4B1ZA 1NGCA 1BUPA 4CZEA 3IMXA 4IZ9A 2FSJA 3HBTA 2ZGZA 3WXJA 4CZHA 2IVOA 3CJCA 1SAZA 1K8KA 5BRHA 2FF6A 3GE1A 2FF3B 3AY9A 3FZMA 3A5MC 1TYQB 2PBDA 3C7NB 5AQKA 3UKRA 3CQYA 2H3GX 4AM7A 1X3MA 4BRLA 1U6ZA 2YJFA 3G25A 3FZKA 1LCUA 2ASMA 2I7PA 3BF3A 1JCGA 4EHTA 1NGEA 5ELZA 3A5NC 4XH4A 2VWBA 5JLFA 3DXMA 3A0IX 1NM1A 3GDQA 3KZBA 2IIRA 4BVPA 3FLCO 5BPLA 1GLCG 3QICA 1XC3A 2HOEA 3FE1A 5AQNA 3H46O 3FR0A 4CZGA 3D2EB 3CJ9A 3O8MA 3LDNA 3WUHA 3VENA 2VYPA 2YI1A 3LDQA 4IWVA 3WT0A 5AZIB 3LM2A 2E2PA 4BQLA 3JS6A 3IDHA 5AQGA 1DKGD 2D0OA 1KAXA 1XQSC 1BA0A 2P9UB 3VEOA 3LL3A 2FLOA 4BC5A 1S3XA 1BU6O 4JD2A 5AQWA 4PKGA 3BEXA 1LOTB 1H1VA 3VF6A 3AAPA 3L6QA 4A2BA 5E26A 2E20A 4XH1A 5AR0A 1MWKA 1BA1A 1GLJO 3U9ZA 1T6CA 4BRDA 1ATSA 3HM8A 2P9LB 4BRMA 3FGUA 4CI6A 3MN7A 4EFHA 2YHWA 2D4WA 3QBXA 4FL9A 4Y0WA 1X3NA 1G99A 5AQXA 3O1WA 4BVOA 2QWQA 3VESA 3WXIA 4BRCA 1K8KB 2OANA 4FWLA 5E84A 1YUWA 4FO0A 1NGAA 4H5TA 4BC2A 4ISEA 1ATNA 1NGHA 1NWKA 2AP1A 3UKRB 3MK6A 4CZMA 3QBWA 5FPDA 1NLVA 4E1JA 3LDLA 2NRHA 2Q0UA 5LJVA 4B1UB 4GNIA 4WQ5C 3I8BA 1IJJA 1QQNA 3DXMB 2EWSA 4BR9A 1RGIA 1SQKA 2A42A 4IJNA 5F2RA 2V7ZA 1RFQA 2KHOA 1YAGA 2P9KB 3QFUA 1NGFA 4H0XB 4BRFA 3RSEB 4CD1A 2QWNA 5FPNA 2IVPA 3BUZB 2IVNA 4FOEA 2QWOA 4QS8A 3WEEB 3UKUA 2YHYA 2QW9A 3O80A 4M63C 4HTLA 3H3OB 3MCPA 4LC9B 1HPMA 2QXLA 1NGBA 1X9JA 3EN9A 2GUPA 1ESVA 2QWRA 2P9IA 3LM9A 4K25A 2HF3A 4JD2B 2A5XA 2Q1NA 4CD3A 4MLEA 4CZJA 3QFPA 3ULEA 2P9SA 5LJWA 1U2VB 4H0TB 2HMPA 4DHYA 4H0YB 4M7XA 3O08A 1Z05A 4K41A 4DQ8A 3VGLA 4B1YB 3EKSA 3ZX3A 2V52B 3H1VX 1KAYA 3ZX0A 2P9PA 3FFKB 2ITMA 3CI5A 4CBUA 4FWNA 5AZJA 2E1ZA 2ASPA 2QWMA 3QMLA 3FZFA 3WQTA 4GY2B 3TPQA 4C23A 1QHAA 3CETA 5KPZA 3D2FA 1XUPO 3OHRA 1MDUB 1NMDA 4QS7A 4JHDB 3FZLA 5BPNA 1HJOA 1D4XA 2CH5A 2GWJA 1QQMA 3I33A 1MA9B 2ASOA 2V7YA 3VEZA 3C0BA 1HX1A 2PAVA 4H5VA 1HKBA 4K42A 5I9EB 1NGGA 3SJHA 3HZ6A 3R6MA 3MN6A 3U8XA 2E1YA 2YJEA 3VEXA 4IJAA 1Q18A 4CBXA 4H5WA 1J6ZA 2BUPA 3CJAA 3H6EA 2QM1A 4JNEA 2CH6A 3MDQA 5AQZA 3VF2A 2Q2RA 4M7YA 2E88A 3P4IA 5EXWA 5FPEA 1Y64A 4CZLA 4FPAA 4BG8A 3HTVA 2A6AA 3EKUA 1Z6RA 1GLDG 1NGIA 2FXUA 3EO3A 4J8FA 5F0XA 1HKCA 3ZETA 2A40A 1QZ5A 4BR7A 3VEYA 3CJ1A 1GLAG 3MN9A 1KAZA 3CERA 3DXKA 5AQVA 5AQMA 3O1BA 4BC4A 1T44A 3AARA 5AQTA 2P9PB 2DPNA 4BQZA 4JN4A 2E2OA 4BGAA 1S22A 5AZJB 2GEMA 4FSVA 3HI0A 3C7NA 1SZ2A 3VPZA 4B9QA 1HLUA 3D2FB 3BF1A 4WQ4C 4XEIA 3L4IA 2D1KA 2ZGYA 1DEJA 3WQUA 4BROA 4ISFA 5AQFA 5AQQA 1QZ6A 1E4GT 3A5LC 4WQ5A 3W0LA 5EVZA 1IG8A 5FPMA 3LDOA 1V4SA 3JXUA 4PKHA 3GL1A 3BP8A 4IO8A 3CHWA 1E4FT 4FWOA 4PL8A 4BRNA 1JCEA 3L0QA 1BDGA 2W40A 3AAQA 3M1FA 3ZEUA 5KPRA 5BN9A 3D2EA 5BN8A 5AZIA 5BRFA 3QB0A 3GBTA 5KQDA 3ENHA 4H03B 4WYBA 5AQPA 1KXPA 2UYTA 5AQOA 3VEWA 3VF4A 2YCHA 3DAWA 5AQYA 4BRQA 4PKIA 4BR4A 4FWSA 4EIAA 4FOIA 5JMVA 2ZF5O 4YDUC 3R9PA 3SK3A 4BRHA 4NO7A 3EL2A 5AQIA 4PL7A 4A61A 1WOQA 3CJBA 3ATUA 2P9LA 4MO5A 3LDPA 2E2QA 3QDKA 2A3ZA 1BG3A 2FSNA 4BREA 2E2NA 3VOVA 5LY3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KVGA 4FLZA 2WONA 4H8KA 3PV8A 3JYTA 4FJ7A 4H5NA 4QS9A 2NUBA 2ZJPL 4ELVA 5KPTA 2Y1IA 1ATRA 1NJXA 3JAMO 4W5TA 4JK8A 4AHTA 5FRMA 4FWQA 2ETJA 4B9TA 1C0GA 1T6DA 1ASVA 2HF4A 3LPUA 4L8RB 3IUCA 4PWDA 2PYJA 4R5PA 2P9NA 3SUNA 2HBKA 4BDPA 3SQ0A 4BG9A 2PZSA 3ZEUB 3T7ZA 1ZC6A 3ZSQA 4DSFA 4B9SA 4YOXA 4ISGA 5F1XA 1TKDA 1GLFO 3VMFB 1L5UA 3C94A 1W97L 1J9AA 1ITGA 2OPQA 4FLTA 2UXCK 3V81A 4NB4A 3ULEB 4B1WB 4R79A 4EZ9A 3TTFA 3KLGA 4KHNA 3PO5A 2O8CB 3DLHA 4E7KA 3RRHA 4H0PA 3QEVA 1IG9A 3PSIA 1J5EK 3TSPA 1BCMA 2GELA 3THYB 2NRZA 4DTUA 4JKGB 2GWKA 2NRTA 4JI5K 5BREA 5JICA 3O9TA 4MO4A 4CZKA 4CJRA 1IKWA 3K59A 3F9MA 3VGMA 4WQ4A 4BGBA 3QLHA 3OYKA 3EZWA 2YHAA 4CHPA 3NHGA 4CGJA 4JKEA 3PO4A 4K43A 1HKGA 1TAQA 4PA1A 3HK2A 3AA4A 4DMNA 3VERA 3NVKA 3OYMA 3VQQA 2YHBA 1V4TA 4W5OA 4CHYA 2AA4A 5AQHA 4JV5K 1L3VA 4EP5A 2B4JA 3OYJA 3UE5A 1WUAA 2CGJA 3SMPA 1WSEA 3CQXA 4U67L 2IAJA 3TTCA 1SKWA 5H1SQ 3DLBA 1VSMA 1FKPA 5JENA 3BZKA 3DOKA 3NGZA 5JLHA 4FVUA 2DFEA 5BRDA 2O8EA 3CIPA 1IH7A 3B8AX 3CYMA 4BRAA 2Q31A 3TAQA 1GLBG 3ISNC 2QKBA 2QWLA 2X78A 3V9XA 1TK5A 4N56A 3ENOA 2UXBK 3C6UA 3F9KA 4YNQA 4W5QA 4DSEA 4BRPA 2HW3A 4CEBA 4BC3A 2RKIA 4IFVA 4Z4GA 1RTHA 3QEIA 2YV0X 4I9QA 1FKOA 2HHUA 1TUUA 1SKRA 2J4RA 3MMVA 3SMSA 2XHBA 4F3OA 1QVFM 1K6YA 4CZEA 1DT9A 1FJGK 2ZE2A 4IZ9A 2FSJA 5JVHL 3S3OA 2ZGZA 3QETA 2UUAK 4CZHA 3SPZA 5CYMA 2P5GA 1K8KA 2HHTA 3L4QA 3AY9A 2Q3SA 1TYQB 1TL1A 4I9LA 1S6QA 2KZZA 1X3MA 3CM5A 1U6ZA 2YNFA 4CJLA 3Q7CA 4HUFA 2ASMA 4EHTA 2YNGA 3V9UA 3DXMA 3PY8A 3RR7A 3K5OA 3QICA 2B5JA 1XC3A 2FBXA 3VTHA 5AQNA 4DR3K 4K8ZA 3IG1A 3TAMA 3CJ9A 2VYPA 2Z1GA 3CCRN 4FM2A 4JRQA 3O3HA 3JS6A 1WBBA 1KAXA 2PYLA 3CF5L 1BA0A 3EYZA 3LP2A 3VEOA 4FLWA 4KRFA 1BU6O 4FK2A 5AQWA 1O1WA 4DV7K 3NMUA 4E7JA 1LOTB 2GBZA 3AAPA 1XC9A 1IBMK 3KWIA 4M3TA 3EEQA 4M41A 1S1XA 1GLJO 4CVNE 3U9ZA 4YOYA 2ZD1A 1RT2A 3HPGA 4CFDA 1ATSA 1GOAA 3B6OA 3RWUA 2XRIA 2G8KA 3AVFA 4K0KK 2D4WA 3O1WA 3K9JA 2QWQA 5C24A 4BRCA 1NK7A 1RTJA 2OANA 4E7IA 1YUWA 4H5TA 3K5MA 3I8DA 4ISEA 4CHQA 1WSFA 1NWKA 1KLNA 3UKRB 3MECA 1NLVA 1D9DA 4ILHA 3LDLA 2NRHA 1LW0A 1I39A 2Q0UA 3CCSN 1NK4A 3DOLA 4N41A 3I8BA 3HVTA 2O8DB 4CEDA 1FXXA 2ITGA 4BY9C 2A42A 5F2RA 2IOCA 1RFQA 1JLFA 4FJ5A 4B3SK 3PX6A 2QWNA 2IVPA 4FOEA 1SUQA 2QW9A 1X1PA 4HTLA 4LC9B 4ELTA 1VQON 1W2BM 1NGBA 2Z1JA 1X9JA 3EN9A 3DLLL 2HF3A 3LPTA 4JD2B 3SQ1A 4CZJA 3LP1A 5A2QO 3QFPA 3ULEA 4HCCA 1U2VB 1Q82O 2E6LA 3EE9A 1F21A 3FFIA 4E7HA 4DHYA 3TSUA 3D0PA 2O8CA 3L3VA 4V19S 2HVIA 1UAXA 1WN7A 1KAYA 2ITMA 5CHIA 3CI5A 2YNIA 4GKJK 2E1ZA 3NF9A 5CR4A 1RCHA 2NRRA 4JRPA 3OJUA 4O44A 3WQTA 3PX4A 4CJPA 4JKGA 4CK2A 3CETA 4QOZB 3QEWA 1NK5A 5HRPA 1MDUB 1NMDA 3LP0A 4CJ4A 3O9UA 4JHDB 5BPNA 5BR8K 2GWJA 1QQMA 2OTJN 3C0BA 1NK6A 1HX1A 3L2QA 3ZT1A 2F8SA 2WFBA 1NKEA 1RBTA 1NGGA 1N33K 1VAZA 1M1KO 3U8XA 3VEXA 3VQPA 4F3TA 5C15A 1Q18A 5AJ3K 4H5WA 1J6ZA 4IFEA 3H6EA 3E1YA 3VQ4A 4BDZA 3C6HA 5J2PA 1NJIO 3ZSZA 3VF2A 5AQZA 1QSLA 4M7YA 5EXWA 3P5JA 2HNDA 4DWIA 1Z6RA 1GLDG 3DLRA 1LWCA 2FXUA 1U04A 2VG7A 3QERA 4J8FA 4J2EA 2HNYA 2EHGA 4A57A 2A40A 3H08A 4BR7A 3ZSRA 1A5WA 2D0AA 1WB9A 4CEFA 2OZSA 1S1VA 4BC4A 4Y1DA 2DPNA 3WXMB 1TK8A 3CXCM 1RT3A 4CFCA 2W42A 3SUQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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