3A5OC

Crystal structure of a dictyostelium p109i ca2+-actin in complex with human gelsolin segment 1
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
366
Chain Sequence
QALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMVGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAILNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAAAAIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for actin assembly, activation of ATP hydrolysis, and delayed phosphate release
pubmed doi rcsb
molecule keywords Gelsolin
molecule tags Contractile protein
source organism Homo sapiens
total genus 114
structure length 366
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a5oC01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a5oC02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3a5oC03
4CZJA 4CBUA 3I33A 1MA9B 3CIPA 1TYQB 1K8KB 2ZWHA 2CH5A 2Q0UA 3GBTA 1R59O 3WUHA 4GY2B 3WQTA 4EIAA 3ZETB 4BRCA 2AA4A 4L3QA 3D2FB 2FSKA 3C7NB 3ULEA 2P9UB 4BRLA 5BN9A 1SQKA 5BPLA 3CJ7A 2P9KB 3WXJA 1ZXOA 1E4FT 2VWBA 4CZHA 2DPNA 1H1VA 2HMPA 3VESA 4B1ZA 5JMVA 1NBWA 5BPMA 4HWIA 1NWKA 4RCHA 4BC3A 5BRHA 1GLLO 5FPNA 4FWPA 5E84A 2A42A 5EY4A 1MWMA 4DQ8A 2E2OA 1LCUA 5AQVA 3A5LC 3O5BA 3WT0A 1KAYA 3J8AA 5FPMA 3QDKA 1TUYA 4FPBA 1ESVA 1G99A 3ATUA 5F0XA 4CZLA 5JICA 4FWOA 4QS8A 4BRGA 1HPMA 1QQOA 3A0IX 3MMVA 3LM2A 1U2VB 4BRPA 3FZLA 3QICA 4H0PA 5AQLA 2FF3B 3MN9A 1EQYA 4M7XA 5BREA 1BOTO 2ASOA 2BUPA 4H0VB 2D1KA 4A62A 3EO3A 1X3NA 3HBTA 4O8KA 1JCGA 1ZC6A 4H5WA 4CZEA 3CJ1A 2ITMA 4IO8A 1Z05A 1KAZA 1WOQA 2ZGYA 1XUPO 4BC4A 4FWLA 4MO5A 1NGGA 4J8FA 3W0LA 1RFQA 4FWMA 2FSNA 4PKHA 3WXIA 4BVOA 2Q97A 2V51B 3FLCO 3HTVA 2A41A 2CGLA 4BRHA 1QZ6A 4CZIA 4H0TB 4QS7A 3ZEUB 3DJCA 3VEVA 4K42A 2YHYA 2HOEA 1KXPA 3UKUB 3R6MA 4M7YA 5AQHA 4H03B 4BR5A 2F9WA 1V4SA 1ATRA 1GLAG 5JLFA 3GOIA 4IZ9A 4JHDA 3QB0A 3H3NO 4K43A 3W3DA 3O8MA 3VOVA 2GEMA 4BQZA 2KHOA 1IG8A 5LJVA 5AQOA 3EKUA 3ZETA 4CZFA 3H1VX 4NB4A 4XH1A 3AARA 1QZ5A 3AAPA 2NLXA 3O6WA 5F1XA 3HM8A 4BRMA 3EZWA 4BGAA 2P9PA 2P9NA 4A2BA 5AQFA 4LC9B 4FL9A 5LJWA 4Y0WA 3LM9A 2D4WA 1HX1A 3LDLA 1J6ZA 4EHTA 3VGLA 4BROA 1QQMA 2QWOA 4JN4A 4JHDB 3SLCA 3CJCA 4BR4A 2FF6A 3SMPA 3ZX0A 4FWQA 3VF4A 4WQ4C 2ZGZA 4IJAA 4BRIA 5FPDA 4M63C 1P8ZA 5B8HA 1JCFA 3G25A 1T6DA 1HKBA 3QBXA 5LY3A 3WEEB 2E2PA 2P9PB 2P9NB 4FO0A 3KVGA 4C23A 1HJOA 4MO4A 3AY9A 4FWRA 4BGBA 4H0OA 4PKGA 1BG3A 1U2VA 3FFKB 3RSEB 3CJBA 4BC2A 4FWSA 2PBDA 1NGHA 3CJAA 3A5OC 3FR0A 3BF3A 5AQJA 4WQ4A 2V52B 4BVPA 3JS6A 3VF6A 3WQUA 4MLEA 4B1WB 5AQGA 4B9QA 4BRKA 3QFPA 1QHAA 4H5RA 4AM7A 1NGBA 3QMLA 2A40A 3R8EA 4HTLA 3P4IA 4BRNA 4WQ5C 4NO7A 2YI1A 2A6AA 4BG9A 4CD3A 3M6GA 3TPQA 3CHWA 4BR7A 2P9LB 1LOTB 4Z94A 1YXQA 4O5FA 3CI5A 3U9ZA 3EN9A 5AQKA 1ATSA 1NM1A 1NGEA 3FE1A 3L4IA 2UYTA 4H5VA 3ZEUA 1GLEG 3JXUA 4ISGA 2WUSA 2E8AA 2YCHA 1SZ2A 1DKGD 3L0QA 4WYBA 4BRFA 2IVNA 3SK3A 2E88A 3UKUA 5BR9A 2QXLA 2NZTA 1C0GA 5AQYA 2V7ZA 4WQ5A 5AZIB 4XEIA 3GG4A 2FLOA 1KAXA 3BF1A 2GELA 1GLDG 1BA0A 4ISFA 5E26A 2W40A 4IWVA 5AR0A 3DXKB 4DB3A 4RTFD 4A2AA 3MN5A 5KPZA 3GE1A 4YDUC 1NGIA 2AP1A 2QM1A 3KHYA 5KQ8A 2IVPA 1NGAA 4RWTA 5AQUA 2Q0RA 5AQMA 3MCPA 2CGKA 4JNEA 5AZJB 2E2NA 2QWQA 1MWKA 2E20A 3ENHA 1Y64A 4BRDA 4IXCA 4DHYA 5KPRA 3H46O 1X9JA 4FSVA 2FXUA 2HF4A 2YJEA 1QQNA 1NGCA 4PKIA 4FOIA 1MDUB 1HKCA 3D7EO 1HKGA 5ADXA 3FGUA 5F2RA 4CI6A 1E4GT 5JLHA 2F9TA 3SJHA 4CZMA 5FPEA 3ATVA 2P9SB 5AQZA 1RGIA 4YDUA 4CZGA 3DAWA 5ADXH 4QS9A 2P9IB 1V4TA 1T6CA 2I7NA 3WEEA 4GNIA 2Q2RA 4PL7A 3CETA 1GLFO 1NGDA 4JD2B 4MLHA 3RSEA 4E1JA 4JAXA 4F9OA 3UKRA 4CD1A 3CERA 3VEYA 5KPTA 1CZAN 1GLBG 2A3ZA 4BRQA 1BDGA 1DEJA 3OHRA 3S41A 2V7YA 3HSCA 4EFHA 4BR9A 1Q18A 1YUWA 4H5NA 3ZX2A 2QW9A 2ASPA 3M1FA 3HZ6A 1YAGA 1SAZA 3AAQA 4BRAA 3O1WA 2E1ZA 2YHXA 2P9LA 3H6EA 3VEZA 1S3XA 3VGMA 3UB5A 2IIRA 5AFUA 4FWNA 2ZF5O 4I6MA 4K25A 3H3OB 4EAHD 1BU6O 3UKRB 3ENOA 2BTFA 2VYPA 3O1BA 2W41A 3A5NC 3LL3A 5AFUH 2VCPA 4BC5A 1HLUA 4EHUA 1TUUA 5EOYA 1BA1A 2CGJA 3M3ZA 3VGKA 3WXKA 1NLVA 4XH4A 3IUCA 5AQRA 3VEOA 4CZKA 5AZIA 2D0PA 4CBWA 2PAVA 3EKSA 2J4RA 3BUZB 3CJ9A 4H5TA 5KQDA 4XH5A 1WUAA 4B1YB 2QWNA 1HUXA 2QWLA 3DXKA 4A61A 3EL2A 1RDWX 1NGFA 3A8YA 5AQQA 3B8AX 3FZMA 3FZHA 4I6MB 3TU5A 1BO5O 4BR0A 2IVOA 2Q36A 5AZJA 5BPNA 1NGJA 1GLJO 4ISEA 1ATNA 3CQXA 3DWLA 5EXWA 3VPZA 1IJJA 4K41A 4KBOA 3ULEB 2GWKA 4CJ7A 2QWMA 3D2EA 1NMDA 3ZX3A 4BR2A 3BEXA 3L6QA 1U6ZA 4PL8A 2H3GX 3U4LA 1C0FA 2P9SA 2Q1NA 4AM6A 5I9EB 5AQSA 3MN7A 1Z6RA 1X3MA 1D4XA 5AQXA 3IMXA 2P9IA 2HF3A 5BRFA 5EVZA 1S22A 3C0BA 1XQSC 2FSJA 3MK6A 3VEXA 3H1QA 5AQTA 3A5MC 5BRDA 4JD2A 1YVNA 3O80A 4CBXA 3O4WA 3QFUA 3I8BA 3LDOA 4IJNA 4B1UB 3WXLA 4B1VA 3D2EB 2EWSA 3VEWA 3H45C 3U9DA 1BUPA 2YHWA 3DXMA 3LDQA 2ASMA 3MN6A 5EX5A 2GTDA 5AQNA 3UE5A 4BREA 4FPAA 2QWPA 3GL1A 5CE3A 2YJFA 5AQWA 3QBWA 3R9PA 3SMSA 3CQYA 3VERA 1ZBSA 3VETA 2E1YA 3ID8A 2E2QA 3VF2A 1TYQA 1K8KA 3LDNA 5ELZA 4H0XB 4BQLA 3U8XA 5AQIA 3KZBA 4BG8A 1OKJA 2QWRA 2D0OA 1DGKN 2CH6A 3D2FA 2A5XA 2Q31A 3GDQA 5TKYA 3C7NA 3VENA 2P9UA 3MDQA 3DXMB 2I7PA 4H0YB 2P9KA 3FZFA 3BP8A 4FOEA 3F9MA 2NRHA 1XC3A 3O08A 1JCEA 1T44A 2GWJA 5BN8A 3IDHA 4B1XB 3LDPA 5AQPA 4DCHA 2OANA 1BWFO 2GUPA 3HI0A 4FWKA 3FZKA 3IFRA 1GLCG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MA9B 3CIPA 2A1RA 1HYSA 2Q0UA 4NCAA 4NYFA 1VQLN 3DYAA 3QLHA 4GY2B 3WQTA 3ZETB 2ZQBA 3MEDA 3HO1A 4L3QA 4B9MA 4DTMA 3TARA 3DLLL 4I2QA 3I0RA 4B9TA 1S9GA 4Z4EA 1HQUA 2P9KB 3EYZA 1ZXOA 1T3VA 3THYB 4AHUA 1SV5A 3TTCA 2HMPA 3VESA 4B1ZA 2DFEA 1S6QA 4IFYA 5BPMA 4GV6A 3LAMA 3HM9A 5FPNA 5IT9O 1RBTA 4QAGA 4OJRA 4YHHK 4IG0A 1VQON 3RTVA 3TWHA 1CLQA 1KAYA 3QDKA 1ZBHA 1ESVA 2NRRA 1G99A 4KFBA 4W5QA 4DR2K 5JICA 4BRGA 2XHBA 1HPMA 3LP1A 1LW2A 3NGZA 1QQCA 5I42A 2OTLN 3BZKA 3LPUA 5FRMA 2FF3B 3MN9A 1EQYA 4M7XA 1BOTO 3I56N 2BUPA 2UUCK 4DV3K 2ZD1A 2UUAK 4CJUA 5J2MA 3KK7A 3NBPA 3EO3A 1X3NA 4O8KA 3G4SN 3NVKA 2ZGYA 2VQEK 1XUPO 1B9DA 2P1JA 3DOLA 3WNFA 1O13A 3CC7N 3THWA 3SQ1A 3HP6A 3FLCO 4CFCA 3K0SA 3CYGA 3ZEUB 3DJCA 4K42A 4CVNE 2HOEA 1WSJA 1B92A 3UKUB 4GW6A 4OPJA 3NGYA 3SUQA 2F9WA 4CEDA 3V9SA 2OZSA 1ATRA 1GLAG 4BDYA 3GOIA 4IZ9A 2BDPA 3H3NO 3W3DA 3O8MA 3VOVA 4AHSA 2KHOA 1IG8A 1JXEA 5AQOA 3EKUA 3ZETA 2FC0A 2Q3SA 3TANA 4XH1A 4KHQA 1BIZA 2D0CA 3M5RA 5F1XA 4CGDA 4B9SA 1Q81O 4FJMA 4N76A 1F21A 3NF6A 2P9NA 2Y1IA 3TR8A 2F8SA 1KQSM 1T03A 3LM9A 3AV9A 2HB5A 1HX1A 1RTHA 1RTDA 3LDLA 3T3FA 4BROA 1WB9A 2X74A 4JHDB 3CJCA 4BR4A 4JK9A 4FWQA 1Q7YO 4IFVA 1W2BM 2ZGZA 4KH5A 1TKXA 3T1YK 2F96A 1FW6A 3QBXA 5LY3A 3TI0A 1NK4A 3HVTA 2F8TA 4DSIA 4C23A 1VHXA 3AY9A 4H4OA 3MEGA 4BGBA 4CEFA 3FFKB 3CJBA 3F9KA 1D8YA 3CJAA 3SJJA 3A5OC 3WXMB 4HCCA 3BF3A 3VQQA 3AA4A 4JI4K 4XJXA 3C94A 4FXDA 3OYCA 4NCGA 4H5RA 3R8EA 3P38A 4NO7A 3M6GA 4B08A 4FLYA 3HP9A 3O4NA 3CHWA 3TPQA 4CGIA 1LOTB 4O5FA 3OYBA 3CI5A 4CJ4A 4Z4HA 3CCEN 3ZSVA 3PO5A 5AQKA 1ATSA 4JKDA 2E6MA 4CJLA 2ZJRL 3SUOA 1C0TA 3ZEUA 1GLEG 5KRSA 4ISGA 2YCHA 4BRFA 1WSGA 3L2RA 1XI1A 2RF2A 3UKUA 1DTTA 2NZTA 5HL7L 3SUNA 3L2WA 5AQYA 2V7ZA 3HPHA 5HRNA 3VN5A 1IO2A 3HK2A 1U49A 3V81A 1Y97A 3DXKB 4DB3A 2A1SA 2FBXA 4BWMA 1HNXK 2AP1A 4NYNA 1MU2A 2IC3A 4B8CA 4N56A 1MWKA 1YT3A 3ENHA 4BRDA 4IXCA 3V9XA 2FXUA 2HF4A 2YJEA 1NGCA 4RW7A 3AVBA 3DLRA 4PKIA 4FOIA 1MDUB 4J2AA 4OLAA 1HKGA 3KK1A 5FPEA 3SJHA 4CZMA 4DR6K 4DU1A 4N41A 4RW6A 4DSEA 5JVGL 3CF5L 3S3NA 2HHWA 3T19A 3T1AA 1V4TA 3OS0A 2I7NA 1NJXA 2G8KA 4LF8K 1VQ9N 1YTAA 4GV9A 4KKOA 1RDCA 3OS1A 1VQNN 4CEOA 1NGDA 3D0PA 3DRPA 4E1JA 3VQCA 2A3ZA 4FK2A 4M3TA 4BRQA 5GAHP 1DEJA 3EE9A 4B3TK 4EFHA 1YIJN 3AO2A 3CM6A 4H5NA 1L3UA 3PO4A 3AAQA 3QEVA 4BRAA 4OX9K 1VQ7N 4CF1A 4MDBA 1L3VA 3RR7A 3UB5A 2IIRA 2ZE2A 4WE1A 3TAEA 3SAFA 2ZF5O 4I6MA 4EAHD 3NH2A 3HJFA 4E7KA 1BU6O 2W42A 4C8OA 3ENOA 3LANA 3O9QA 2O8DA 4LD0A 1NK6A 3OY9A 3K5OA 3A5NC 3LL3A 4X66K 4BC5A 4L8RB 3SYZA 3V1RA 3VGKA 3OYKA 3ALYA 1NLVA 1UWBA 4XH4A 3KTQA 4CZKA 4Z4IA 1B9FA 3PX6A 1NK7A 3EKSA 4RW8A 4LFAK 2J4RA 1KLMA 1RCHA 3DXKA 4GVEA 1WAJA 3OA9A 3A8YA 1LAVA 2XRIA 3J7YP 2KFZA 3RWUA 1BISA 2HBKA 1TKDA 3NFAA 4KH6A 4CK3A 3VTIA 4FLVA 3TU5A 1IKYA 3MXMA 1HPZA 3CQXA 4K41A 3V4IA 3ULEB 4JI0K 4M3XA 2QWMA 2VG5A 1KCFA 1QE1A 3ZSWA 4BR2A 3NF7A 2ZM6K 3KD5E 3L6QA 4KHNA 3NHGA 3M8PA 4BE0A 2QKBA 3U4LA 2DFFA 4AM6A 4PUOA 3CD6N 3CYMA 2NRTA 5AQSA 1Z6RA 3VQ4A 4FJIA 5BRFA 1LAWA 1J53A 2UXCK 1S22A 2YNIA 1XQSC 3L2UA 4IOCL 3VEXA 5AQTA 1W9HA 1TAUA 2GV9A 4M42A 1ZYQA 3QFUA 2QEXN 4F8RA 4B1VA 3D2EB 5M1FA 4FZZA 3H45C 4CGFA 4NLBA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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