2Q97A

Complex of mammalian actin with toxofilin from toxoplasma gondii
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
366
structure length
353
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Toxofilin from Toxoplasma gondii forms a ternary complex with an antiparallel actin dimer
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein/cell invasion
source organism Toxoplasma gondii
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 113
structure length 353
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q97A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q97A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q97A03
4B1WB 4CZKA 5BN9A 1YAGA 3U4LA 2QWNA 3D2FA 4FO0A 5AQWA 3U8XA 4CZIA 4CZMA 2A5XA 2YCHA 1NM1A 3I33A 4I6MB 1NGJA 3JXUA 4A61A 3D7EO 4ISGA 3OHRA 2E1ZA 3CJ7A 1NGGA 1NGHA 2Q1NA 1SQKA 1V4SA 2PAVA 2D1KA 5LJWA 3VESA 3CJ1A 4FWKA 4FPAA 3EKSA 3I8BA 3CJCA 1BU6O 3O5BA 5AQHA 4CD3A 3FE1A 2F9WA 5AQVA 5KQDA 4XH5A 4BR9A 4BRGA 4RTFD 4ISFA 5EXWA 2Q97A 3VEWA 3CI5A 4F9OA 2QXLA 3VGLA 2Q31A 4NO7A 3VENA 3IDHA 3QDKA 3DXMA 1TYQA 3A0IX 3AAPA 3WT0A 3HI0A 4BRIA 4DB3A 3O6WA 4WQ5C 5ADXH 2A41A 3UKRB 4BGAA 3LDQA 2ZWHA 2BTFA 4IWVA 3MMVA 3FLCO 4K42A 3CJ9A 3M6GA 4WYBA 1NGFA 5EOYA 5F0XA 1QZ6A 1U6ZA 3R8EA 4DQ8A 4XH4A 2V52B 4CBUA 3DJCA 2D0OA 2AA4A 5BPMA 3WXLA 2VCPA 1GLFO 1KXPA 3W0LA 1ZXOA 3MN5A 5EX5A 4FL9A 3KHYA 3WEEB 3MN9A 4BRFA 1JCGA 2V51B 1WOQA 4BC2A 3L0QA 4CJ7A 1HPMA 5ELZA 3BUZB 2FSKA 3R9PA 3EZWA 1K8KA 5AQZA 2YJFA 1GLJO 1H1VA 1NLVA 4PL8A 4JNEA 5JLHA 1ESVA 1BUPA 3ZETA 2P9KA 2A42A 3FZKA 1C0FA 1TYQB 4FWLA 4FOEA 4JHDA 2GWKA 3D2EA 4EFHA 1GLAG 5EVZA 4EHTA 2E8AA 4BR7A 3BF1A 4FWNA 4H0OA 3VERA 3S41A 4CZEA 1BA1A 2Q0RA 4A2BA 3CETA 1X3NA 4PKGA 1GLDG 2P9LB 5BR9A 1Z05A 2OANA 1R59O 2YHXA 3BEXA 1QQOA 2ZGZA 2I7PA 2W41A 3P4IA 3FZHA 4BRHA 5F1XA 5AQSA 1BDGA 3FZFA 1ZC6A 3AAQA 1HLUA 4BC3A 4WQ4C 2ITMA 4QS8A 4JAXA 5CE3A 5BRHA 3H3NO 1MDUB 4BR5A 4EIAA 4YDUA 3VEXA 1T6DA 3VEYA 1JCFA 5LY3A 4CZLA 1XQSC 3WQTA 1NWKA 1X9JA 3MN7A 2P9KB 2E2PA 3H6EA 3QBWA 2ASMA 2UYTA 4JHDB 3D2EB 3UKRA 3H46O 3ZX3A 5AQJA 4FPBA 3O1BA 4K41A 5JMVA 2QM1A 4RWTA 4M63C 4AM7A 2P9NA 4BRDA 4H0TB 4LC9B 3LL3A 1GLEG 2IVNA 3C7NA 1V4TA 2CGLA 4JN4A 4ISEA 1YXQA 3TU5A 4DCHA 3VF2A 3SK3A 3CQXA 5F2RA 3ULEA 3WEEA 2Q36A 2FSJA 3A5OC 1HKGA 3DWLA 2A3ZA 1C0GA 1NGAA 4AM6A 4B9QA 2J4RA 3GG4A 3HBTA 3UE5A 5I9EB 1OKJA 1NMDA 1HKCA 3H45C 1QQMA 2W40A 5BPLA 3ZEUA 4B1UB 4EAHD 4H0YB 4Y0WA 1P8ZA 2QWLA 4MO5A 5BREA 3ID8A 4C23A 3HSCA 4CZHA 4JD2A 1YVNA 3AARA 2A6AA 5AQUA 4BC4A 4BRQA 4WQ5A 1T44A 2NZTA 4BQLA 4A62A 4HTLA 1BOTO 1TUUA 2P9LA 3H3OB 2E88A 1BWFO 3BF3A 3MDQA 1HKBA 1NGEA 2FF6A 2P9NB 4IJNA 4Z94A 3ZX0A 2E2QA 3C7NB 2GUPA 4FWPA 5BPNA 5TKYA 1RFQA 2HF3A 2YHWA 1NGCA 3CHWA 3GE1A 5AFUA 3ULEB 1KAXA 2P9UB 1CZAN 4MLHA 1TUYA 4FWMA 1XC3A 4B1ZA 1MWMA 3GBTA 4BC5A 4BRPA 4CI6A 1HUXA 1E4GT 3FFKB 1BA0A 2VWBA 1S3XA 5AQTA 2NRHA 2ZF5O 2A40A 2I7NA 3ZEUB 2VYPA 3CERA 4BRCA 4H5WA 4RCHA 2GEMA 4JD2B 3VGMA 4B1YB 3IMXA 5BN8A 4HWIA 5AQOA 4H5NA 3KZBA 4CZFA 2WUSA 3J8AA 4MO4A 5FPEA 4CD1A 2HF4A 2CH5A 2GELA 1T6CA 1U2VA 2HOEA 3SLCA 4IZ9A 2CGKA 3WXIA 1BO5O 1J6ZA 4FOIA 2V7YA 1EQYA 3FZLA 5AQPA 3JS6A 5KQ8A 2EWSA 3HTVA 3WXKA 1DEJA 3EL2A 4A2AA 3VETA 3M1FA 3VGKA 4WQ4A 1IG8A 5AQIA 4BQZA 3QFPA 1YUWA 1NGDA 3LM9A 4KBOA 2IIRA 3H1VX 1LCUA 1Y64A 3A5MC 3SJHA 1S22A 4QS9A 3WQUA 1ATSA 4FWQA 4BRKA 4IXCA 4FWOA 3O8MA 3VOVA 3UKUA 4CZGA 2FLOA 1LOTB 3RSEA 1U2VB 2FXUA 5AQLA 3CQYA 3H1QA 3QMLA 3ENHA 3MK6A 2AP1A 3QB0A 4B1VA 4H0XB 1HJOA 2YI1A 3O4WA 3WXJA 1Q18A 1ATRA 2P9UA 3F9MA 1SZ2A 5AR0A 2V7ZA 3B8AX 1GLBG 3HZ6A 4J8FA 2YHYA 5AQQA 5BRDA 3AY9A 5AQGA 2HMPA 5JICA 4M7XA 4XH1A 2QWRA 5FPNA 2CH6A 5B8HA 3BP8A 3U9ZA 3QFUA 1D4XA 1E4FT 1GLCG 3LDNA 3FZMA 4BROA 2P9PA 4GNIA 1RGIA 1WUAA 4BRNA 3QBXA 1ATNA 1JCEA 3IFRA 1NGIA 3VF6A 3QICA 3O08A 4PKIA 3UKUB 1NBWA 5EY4A 5AQXA 3VEVA 4BR2A 3RSEB 4FWRA 3FGUA 2F9TA 1NGBA 4BVPA 4GY2B 1Z6RA 4E1JA 2P9IB 4M7YA 5BRFA 4BR0A 4O8KA 2YJEA 3DXKA 2QWPA 3MCPA 3TPQA 4BR4A 4FSVA 4H03B 2FSNA 3M3ZA 3LDOA 4QS7A 3EKUA 3D2FB 1SAZA 3CJAA 4CBWA 1IJJA 3VF4A 4BVOA 2E2OA 1X3MA 4BREA 5FPDA 2BUPA 1BG3A 3A5NC 3LDLA 4NB4A 2D0PA 3L4IA 3DAWA 1MWKA 1XUPO 3W3DA 1KAYA 3FR0A 3G25A 2P9PB 4H5RA 1MA9B 3O80A 5AZIA 2GWJA 5E84A 5AQKA 5AZJA 2H3GX 3ZX2A 4B1XB 2ASPA 3CIPA 1RDWX 4BRMA 3GOIA 3VEOA 3U9DA 2P9SA 3CJBA 1HX1A 4PKHA 4XEIA 5KPTA 2E1YA 5AQYA 3MN6A 4DHYA 2ZGYA 3DXMB 1DGKN 2QWQA 3GL1A 3DXKB 3KVGA 4PL7A 2ASOA 3GDQA 3SMPA 5LJVA 1ZBSA 4CBXA 1G99A 2KHOA 3HM8A 5E26A 3A8YA 5ADXA 4H5VA 2CGJA 3LM2A 4L3QA 4CZJA 4K43A 4I6MA 5AQNA 1QQNA 2QW9A 4MLEA 5FPMA 4EHUA 2FF3B 2PBDA 3EO3A 3UB5A 3WUHA 4BRLA 4FWSA 5KPRA 2DPNA 4BGBA 2QWOA 3ENOA 3C0BA 4K25A 2QWMA 4H0VB 1DKGD 2IVPA 3VPZA 5JLFA 2E20A 3VEZA 2D4WA 1QZ5A 5AQRA 4IO8A 2Q2RA 3IUCA 5AQFA 5AZIB 3SMSA 4BRAA 3R6MA 4YDUC 2IVOA 3LDPA 5AQMA 2Q0UA 3L6QA 5AZJB 3ATUA 1GLLO 1KAZA 5KPZA 1K8KB 1QHAA 2P9SB 3O1WA 3A5LC 5AFUH 4IJAA 4BG8A 2P9IA 3ZETB 3EN9A 4H0PA 4H5TA 3ATVA 4BG9A 4O5FA 2E2NA 2GTDA 2NLXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NK5A 2O8FB 5FROA 1X9MA 3D2FA 1KD1O 5AQWA 1J5EK 4KHSA 4CZIA 2A5XA 1NM1A 4CW7B 3JXUA 1S6QA 3LZIA 3CCEN 2GBZA 1D5AA 3AA3A 2Q1NA 1V4SA 3OS2A 4X62K 4JK7A 5J2QA 3O9UA 3NMUA 1X1PA 3I8BA 4A57A 3DLKA 1BU6O 3O5BA 5AQHA 1YJWN 2F9WA 3QEXA 3VQ8A 3ID6A 4IEIA 4ISFA 1C1BA 3IDHA 3QDKA 3DXMA 3AAPA 2JGUA 4OGCA 3SBGA 4BGAA 2VG6A 3V81A 3RMDA 3N4QA 3DLBA 4IWVA 3E66A 4CERA 5F0XA 1ASWA 3V9UA 4FW2A 3HO1A 4CFBA 3DJCA 4G9ZA 3V9XA 3CYGA 5BPMA 3WXLA 3CCMN 5EX5A 5HROA 2GUIA 3QO9A 5CHIA 5FRMA 3TWHA 4CJ3A 1JCGA 3AVIA 1QTMA 2V51B 1RTJA 3SI6A 1N5YA 1N34K 2FSKA 1CXUA 1EKEA 2YJFA 1NLVA 4E7LA 4JNEA 4DLEA 1ESVA 4JKCA 1BUPA 2ZJQL 2OCEA 2A42A 1T7PA 3THXA 1S1UA 3MEEA 2BGGA 4AF1A 4EFHA 3S9HA 4J2BA 1GLAG 2O8FA 4CZEA 1U04A 2Q0RA 3PIPL 1C1AA 1Z05A 4HUFA 1KVBA 4FLTA 1R59O 2YHXA 2HHVA 4KHYA 2ZGZA 1VSLA 4KHQA 4OGEA 2ZE2A 1BHLA 3FZHA 4LF6K 4BRHA 4PWDA 3ZSOA 4RW6A 5A2QO 4ZTFA 4DMNA 1VSKA 1I39A 3J7AP 2Y1IA 1YJ9N 4YDUA 4DV4K 5M1QA 2HBLA 4R79A 5LY3A 3WQTA 2E2PA 3QBWA 3MXMA 1S1WA 1VAZA 1NKBA 4JHDB 3CXCM 5C24A 3SPYA 1JLGA 3H46O 4DSJA 2D0AA 4FPBA 3CCJN 4Y1DA 4HCBA 4M63C 2QXFA 4H0TB 3TSPA 3LL3A 1O13A 4DFKA 4Q0BA 4M3UA 3G0ZA 2OTJN 1UAXA 2OZMA 1M90O 3CQXA 1BGXT 4DTJA 3OBYA 4BECA 4KAZA 1WAJA 3C95A 3T3FA 4DTOA 3EYZA 2J4RA 3HBTA 5I9EB 3ZCMA 1HRHA 3CCRN 3IKMA 1HKCA 5BPLA 1XI1A 1TAQA 3MWTA 1L3UA 5C0YA 1XMQK 2PYJA 4LSLA 3AARA 4BRQA 3PY8A 4CF8A 5JVHL 1M1KO 1T44A 1U48A 1J9AA 4A62A 3BDPA 3TSUA 1J54A 3K5MA 1TUUA 4MQ3A 4IJNA 3CFRA 4MDAA 1J53A 1VSJA 4WF9L 4DTMA 1XHXA 4FWPA 1RFQA 4CFDA 4V19S 4DQSA 4DFPA 1HPZA 3DRRA 2NRRA 3B6PA 3V9ZA 1Y97A 4CHYA 1TUYA 5MLCQ 4B1ZA 1W97L 4BRPA 1HUXA 1BA0A 4LFCK 3L3UA 1WNSA 1VQ9N 1B9DA 4ILHA 1IG9A 2VWBA 2RN2A 4DTRA 2I5JA 3O3GA 2ZF5O 3PUFA 2W42A 3ZEUB 2VYPA 2Q3SA 3HM9A 1EX4A 3SZ2A 3QNOA 1QVGM 3LP1A 2HMIA 4M3WA 2G8UA 3KZBA 4OPKA 2HHQA 4M41A 2G8VA 5FPEA 2EHGA 4KTQA 4PY5A 2NRXA 4ZHRA 2GELA 1U2VA 4FOIA 3L2UA 3OJUA 2WONA 5LMNK 1RBTA 5AQPA 1HYSA 3WNGA 4NXNK 3A2FA 2EWSA 3HTVA 3WXKA 1YTUA 1CZ9A 3EL2A 3MWPA 3LZJA 3RR7A 1SKRA 4QOZB 3PSIA 1TL3A 1NGDA 3LM9A 3L2QA 3IAYA 4RW4A 2FBTA 4IDHA 4Q5VA 1OH6A 3LPTA 4KHUA 1HNZK 1J5OA 4NXMK 1Y64A 4YNQA 1TAUA 1X9WA 4LY7A 3WQUA 3HOSA 1ATSA 4FWQA 4CE9A 4DS4A 4YORA 3IS9A 2YKMA 3C6UA 4PHTX 3ASMA 3O8MA 5J1EA 3KLEA 4B9SA 2O8CB 1HYVA 4IDKA 2W6LA 3UKUA 5IT9O 5CYQA 3RSEA 4O55A 5C10A 2NRTA 2ATQA 4CIFA 4BE0A 3ENHA 3HSTB 1ZBLA 3NF8A 4FLYA 4HTUA 3AO1A 4DTNA 4O5BA 2YI1A 1WSGA 1Q18A 4KH5A 1SZ2A 4DR5K 2V7ZA 3B8AX 3DOKA 3SUOA 1BISA 5AQQA 2HBMA 2VQEK 2AJQA 2HMPA 5JICA 4F4KA 4LFAK 5TKWA 4NCBA 4M7XA 3AVNA 2YV0X 2CH6A 4OX9K 1REVA 5B8HA 1RBRA 3MXJA 3DI6A 1FK9A 4JI3K 2P1JA 2A1SA 1GLCG 1RGIA 4BRNA 4CJ5A 4DR4K 1ATNA 1JCEA 1NK8A 3DYAA 3IFRA 3RMCA 1NGIA 4OKKA 1NJXA 3VEVA 3HYFA 2DTUA 1HQUA 1RNHA 3L8BA 1Z6RA 3QEWA 1CLQA 4F2SA 4CFAA 2P9IB 1FW6A 1HQEA 2ZJPL 1Q82O 3CM5A 1VSEA 2QWPA 4AHVA 5GAHP 4JKBA 4BR4A 4LF4K 2FSNA 4DV5K 3TAGA 3LWLA 3EKUA 1NKCA 3K5LA 1HNXK 3DLLL 3RR8A 3CJAA 1IJJA 4KO0A 2HHIA 3KK2A 4B08A 3T69A 1C0UA 2X6NA 1U45A 2BUPA 2RF2A 5H1SQ 4WFNL 1NK4A 4NB4A 3C6HA 4CIEA 4DKWA 3W3DA 3BY5A 3O80A 1NKEA 3J7ZO 1VQKN 4YOYA 3G71N 3ZX2A 3CC4N 4B1XB 4DQQA 4FJLA 1HNIA 4CEDA 4W5QA 2KKZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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