2Q97A

Complex of mammalian actin with toxofilin from toxoplasma gondii
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
366
structure length
353
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Toxofilin from Toxoplasma gondii forms a ternary complex with an antiparallel actin dimer
pubmed doi rcsb
source organism Toxoplasma gondii
molecule tags Structural protein/cell invasion
total genus 113
structure length 353
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q97A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q97A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q97A03
2IVNA 1X3NA 5FPEA 3FR0A 4QS9A 3UKRB 2OANA 2J4RA 2HF4A 2GTDA 4CZGA 3I33A 2EWSA 3L6QA 3H45C 3AAPA 3VEXA 1ZBSA 3L4IA 4H5VA 3AY9A 3DXMA 3W0LA 4BR2A 3VPZA 4BC2A 2P9IB 1C0FA 4FWKA 1HX1A 1DKGD 1JCFA 1K8KA 2E2PA 4CBXA 4JNEA 1Q18A 5KPZA 2QM1A 4CD3A 1BA1A 4H0YB 4IJNA 1ATSA 1U2VA 4JN4A 4MLHA 3U4LA 2P9UB 2QWPA 2BUPA 4O8KA 2UYTA 2YHWA 5AQNA 4IXCA 3LDOA 1GLJO 2ASMA 3M6GA 4HTLA 4H5RA 1Y64A 3QFPA 2V7YA 1DEJA 3BP8A 4K42A 4DCHA 3IFRA 4J8FA 3R9PA 3UKUB 5E26A 4A62A 2IVPA 4Z94A 3GE1A 1G99A 4YDUA 1NGJA 3A5OC 3VEVA 4RWTA 1NBWA 1S3XA 4WQ4A 3HTVA 3GL1A 3EZWA 4H5TA 3WEEA 3QB0A 2QWQA 4XH4A 1XC3A 4BRPA 4FWQA 4WQ4C 1YVNA 1QQMA 2ITMA 3B8AX 2ZGZA 3QBWA 4L3QA 3EO3A 3D2EA 1QZ5A 3KVGA 3M3ZA 3WXLA 1CZAN 1QQOA 1S22A 2IIRA 2VYPA 1J6ZA 3VF4A 2W40A 2QWMA 4BR4A 1BA0A 1T44A 2IVOA 3CJBA 3VEZA 2ASOA 3VGKA 3A5NC 4H5NA 4CZKA 4BQZA 2YI1A 3D2FA 4H0OA 2FLOA 4CZEA 2AP1A 2FSJA 3WQUA 3D7EO 3VF6A 2QW9A 4IJAA 3LDLA 3KZBA 2E1ZA 1ATNA 3WUHA 4JHDA 2P9LB 2P9PB 1NWKA 2A42A 2GUPA 3GOIA 3KHYA 2A41A 3LDNA 5BR9A 3VENA 1KXPA 1BWFO 1SQKA 3ENHA 2YJFA 5BPMA 4JAXA 2YHYA 3DJCA 4B1ZA 5BREA 3LM2A 1R59O 1T6CA 3BF3A 5LJVA 5AQKA 4BRCA 5EVZA 4CZIA 3M1FA 4I6MA 5CE3A 4M7YA 3O6WA 1ZXOA 3AARA 3CQXA 5BRFA 3R6MA 1KAXA 2I7PA 4FL9A 1HUXA 4BRAA 4FWLA 5AQFA 4LC9B 5FPMA 5F1XA 3C7NB 5KQ8A 3H1QA 4H0XB 3CJCA 5AQXA 4MLEA 4A2BA 4PL8A 3DXKA 1NGFA 3ATVA 5AZIB 4BROA 3IDHA 3ZEUB 3A5MC 4BRGA 5BPNA 2Q0UA 2AA4A 4O5FA 5BPLA 1NGBA 4HWIA 3S41A 5JICA 1XQSC 1YXQA 1RGIA 5JLFA 4BC4A 4C23A 3LM9A 2FSKA 1DGKN 3BUZB 4H5WA 1NLVA 1MWKA 4PL7A 1GLAG 4BGBA 2V52B 1LCUA 1RFQA 3AAQA 4XEIA 2H3GX 1TUYA 1KAZA 5AQSA 5AZJA 4IWVA 4B9QA 3O4WA 1Z05A 4BRQA 1U6ZA 4NO7A 5BRHA 4CZHA 3ZETA 4BRKA 3JS6A 2ZGYA 3SJHA 2F9TA 1T6DA 4BR9A 1NGAA 2FSNA 5EOYA 4K25A 3FZHA 3ZX3A 3ATUA 3HM8A 4GNIA 2P9NA 3SK3A 3OHRA 1BDGA 3CJ1A 2E2QA 3QDKA 3CQYA 4BRFA 1E4FT 4WYBA 3O5BA 2Q0RA 3CJ7A 4BRNA 1MDUB 1GLFO 3D2FB 1TYQA 2BTFA 5AQJA 4CZFA 4YDUC 4BR5A 5AQTA 4RCHA 3ULEB 3FGUA 5AR0A 3RSEB 5EXWA 3VERA 3LL3A 4JD2B 1HKGA 1SAZA 4IO8A 1NMDA 3C0BA 3HSCA 5EY4A 3HZ6A 3UB5A 4BRHA 4H03B 4M7XA 2P9KA 3FE1A 3ID8A 2HOEA 4BRDA 4MO4A 4WQ5A 4PKGA 2F9WA 2QWRA 5AQQA 1E4GT 4FWRA 3FFKB 2P9UA 3U8XA 5LY3A 3MN9A 3WXJA 4F9OA 5KPRA 2D0PA 2KHOA 4WQ5C 5BRDA 3EL2A 3VESA 1IG8A 5ADXA 5AFUA 3GDQA 5AQUA 2P9SA 3UKUA 3O80A 5F2RA 3VEWA 3VGMA 2E8AA 1NGCA 1BO5O 2VCPA 4QS7A 2NZTA 4AM6A 1NGEA 4FOIA 1GLDG 4BGAA 4CI6A 4FWNA 4MO5A 3DXMB 2E20A 3TPQA 4BVOA 2CGLA 1WUAA 3IUCA 3VF2A 4BC3A 2DPNA 4NB4A 5AQIA 3O1BA 3I8BA 5AZJB 3FZLA 5E84A 1K8KB 4FWSA 1GLBG 1HJOA 3QBXA 5B8HA 2E1YA 2ASPA 2E2OA 3MN5A 2QWNA 3U9DA 1U2VB 3FZFA 4B1WB 4FOEA 3TU5A 2Q31A 3BF1A 1H1VA 2W41A 4A61A 2D1KA 4KBOA 4PKIA 4PKHA 2Q97A 2NLXA 3WXKA 3G25A 4EIAA 3DWLA 3EKSA 5AFUH 4DQ8A 5ADXH 4DHYA 2YJEA 2P9NB 4CD1A 4BG8A 5I9EB 3H1VX 3SMPA 2Q36A 4ISEA 2QWLA 1BOTO 4H0VB 3P4IA 2HF3A 3UE5A 2QXLA 5AQWA 1X9JA 1BUPA 2P9LA 2P9PA 3H6EA 5AQPA 1XUPO 2V51B 4BC5A 3L0QA 3HI0A 5AQVA 1BG3A 5KPTA 1TYQB 3CIPA 1QQNA 4FWMA 1TUUA 4B1UB 3WEEB 4QS8A 1X3MA 1NGHA 2I7NA 4K41A 5AQLA 3ZX0A 3U9ZA 5AQYA 4ISFA 4K43A 3EKUA 3D2EB 4EHUA 3WQTA 2QWOA 1HLUA 1C0GA 1JCEA 5AQMA 3C7NA 3CHWA 2YHXA 3MDQA 2CH6A 2P9KB 3H46O 5FPDA 3H3NO 1KAYA 4Y0WA 1HKBA 3R8EA 4BG9A 5AZIA 5AQRA 3A0IX 3CETA 3J8AA 3ZEUA 5AQZA 3A8YA 3UKRA 4FPAA 2YCHA 1NGGA 4RTFD 5AQHA 3A5LC 3ENOA 3FLCO 3O08A 4FSVA 3SLCA 4BVPA 1V4TA 2FF3B 4FWPA 2WUSA 5EX5A 3QICA 4XH5A 1LOTB 2GWKA 2VWBA 5F0XA 5AQGA 4JHDB 2P9SB 4B1VA 2P9IA 5BN8A 4FPBA 1P8ZA 2ZF5O 5TKYA 4BR0A 3GG4A 4FO0A 4CBWA 2FF6A 3LDPA 3VOVA 5JMVA 2NRHA 4I6MB 3W3DA 1IJJA 2GELA 3VGLA 1NM1A 3DAWA 4BREA 4EAHD 1JCGA 1D4XA 1QHAA 2CH5A 1NGDA 1BU6O 2D4WA 3QFUA 4EHTA 3EN9A 2Q2RA 5ELZA 1SZ2A 3GBTA 4H0TB 4GY2B 5AQOA 4BRMA 4CZLA 4B1XB 3CJAA 4EFHA 5KQDA 3F9MA 1GLLO 2GWJA 1Z6RA 3CI5A 3DXKB 5FPNA 4BQLA 4E1JA 2CGJA 5BN9A 4H0PA 3VEYA 3H3OB 3MN7A 2A5XA 1MWMA 3WT0A 1ZC6A 3O1WA 4CBUA 4XH1A 1GLEG 1YAGA 4AM7A 5JLHA 3VETA 3MN6A 2E2NA 3SMSA 3FZKA 3LDQA 3ULEA 4CZMA 3FZMA 3HBTA 2A6AA 2GEMA 4BRIA 3RSEA 1V4SA 2A40A 4ISGA 3MK6A 3WXIA 4BR7A 1RDWX 4DB3A 4CZJA 1GLCG 3CJ9A 4JD2A 1ATRA 5LJWA 4FWOA 3CERA 1NGIA 3QMLA 2D0OA 4B1YB 1QZ6A 2ZWHA 1WOQA 2Q1NA 3IMXA 4IZ9A 2A3ZA 2FXUA 1ESVA 3ZETB 3VEOA 3BEXA 3ZX2A 1HKCA 2PAVA 1HPMA 4CJ7A 3MMVA 4M63C 1YUWA 2E88A 4BRLA 1MA9B 3JXUA 2CGKA 3O8MA 4A2AA 1OKJA 2V7ZA 1EQYA 3MCPA 2PBDA 2HMPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FPEA 3FR0A 1S1VA 3DM2A 1QQCA 2OANA 2HF4A 3NE6A 4C8OA 4Z4FA 3CCLN 3LPUA 4M3RA 3ZSYA 2Z1IA 3BY5A 1TV6A 2E6MA 3DXMA 1VSMA 4CJQA 4LF4K 3O4NA 1A5XA 1C0FA 3CYMA 4OKEA 3OY9A 2VGNA 1HX1A 4CBXA 2YHBA 3E66A 4CE9A 4HTUA 4DF8A 1W97L 2QM1A 3QETA 2KW4A 1RT2A 3MX5A 3TI0A 4Z4IA 2P9UB 4DKWA 4CHOA 4I2QA 1YJ9N 2NRVA 4AHVA 3LDOA 3NGIA 2VG5A 3KWIA 3P38A 4YOTA 4J8FA 4DFKA 3THWA 2UXCK 4FW2A 1G99A 4YDUA 1YTUA 3T69A 4DUYK 3K0SA 1JJ2M 3VN5A 3NHGA 3CPEA 1XHZA 2HHXA 4H5TA 3QB0A 4N47A 4XH4A 2FBVA 4A59A 4BRPA 1WB9A 4WQ4C 1YVNA 1QQMA 3KKRA 3J80O 3HRGA 2ZGZA 4GVMA 3D2EA 1QZ5A 3WXLA 3F9KA 4JK8A 1S22A 3ZT2A 4C8KA 1J6ZA 2HHQA 2W40A 3KLEA 3ZT0A 3TTDA 4B3SK 4YOVA 1T44A 4KI4A 2BANA 3A5NC 2B4JA 1IKYA 5FROA 3ASMA 4FJNA 5GINA 2YI1A 3D2FA 4NCAA 1FJGK 4CZEA 4FLZA 2FSJA 1RTIA 2F8TA 4LSNA 1ATNA 2OPSA 1W9HA 5MLCQ 4JYAK 5JS2A 2IGIA 4O0JA 3QEWA 5EU7A 1SQKA 1BWFO 4EZ6A 4DSFA 4CF1A 2YHYA 1NK8A 4JI7K 5BREA 2BDPA 3LM2A 1MU2A 1R59O 1T6CA 3MCAB 3JSMA 3M1FA 4BWMA 2OCEA 4YOYA 4M7YA 1ZXOA 3QEIA 4IOCL 5BRFA 2ZE2A 1YIJN 3I55N 4FWLA 4MDAA 2PFUA 4CJTA 4DLEA 4M3TA 2NRXA 4LC9B 4E19A 5F1XA 4X62K 1QVFM 1KD1O 5KQ8A 5AQXA 4MLEA 2QKKA 4PL8A 3DXKA 1EWRA 1YITN 3ZEUB 5C0YA 2AA4A 2D0CA 1HYVA 1XQSC 1VSIA 4BC4A 4EP4A 3OS1A 4CJ4A 4M45A 3BUZB 4FK4A 1HYZA 3T1HK 2OZSA 3OYEA 4JI5K 1RFQA 3AAQA 4CIFA 4XEIA 2F7TA 5DM6L 1U45A 3LWMA 4H8KA 5JS1A 1BCOA 1Z05A 3OYCA 1RDAA 1U6ZA 5BRHA 4W5RA 5T7BA 3EY1A 1D9FA 2HVHA 1B92A 4KTZA 2ZGYA 4OPJA 3O3GA 4CGJA 1UWBA 4DV4K 4BR9A 3KK3A 2FSNA 5EOYA 3ZLJA 2HNZA 3AA2A 4A5AA 2ITGA 4DSKA 4FZZA 2O8EA 2YNGA 1TKTA 4CJUA 3CCJN 3QDKA 1S9EA 4CHNA 4BRFA 2PZSA 4BECA 3HT3A 2JWKA 4BRNA 5HLFA 1TKXA 1GLFO 1ZBFA 2G8FA 3VQCA 4BR5A 5AQTA 3AVAA 4RCHA 1IKXA 1OH5A 4CFBA 2DFEA 5AR0A 1YJWN 3NBPA 4JKCA 3EYZA 4NXNK 4OPAA 1QS4A 4B8AB 4LF8K 1SAZA 1NMDA 4I2PA 3HSCA 5HRRA 3UB5A 4OO1J 4BRHA 2IOCA 4M3XA 2HOEA 2DFFA 4CVNE 4GW6A 3K5MA 1J5OA 4WQ5A 2QWRA 4JKGA 3SBTA 1E4GT 4FWRA 3U8XA 1KVAA 3Q7CA 4DSLA 2X6SA 3C6AA 4E0DA 3A2FA 1U47A 5ADXA 3E9LA 3AA4A 3NDKA 2P9SA 3UKUA 3AGKA 3HL8A 4IEEA 2E8AA 1RBUA 4KH5A 1XNRK 1WBDA 1UAXA 4QS7A 1VQ9N 1QTMA 2C1IA 3SV3A 5HROA 2XRIA 4FOIA 1SS6A 5DK5A 3DXMB 4JEPA 4FLWA 3KLGA 2Q3SA 4NYNA 5GAGP 2UUAK 1WUAA 2KQ2A 3SCXA 3G0ZA 4W5QA 5AQIA 4B3MK 4E7LA 3O1BA 5AZJB 1N32K 3FZLA 3V9XA 3L2VA 4PA1A 1Q86O 4FOEA 4RW4A 1HNZK 3HJFA 4A61A 3NFAA 3HYFA 4PKHA 1X9SA 4JK9A 1WLJA 4EIAA 3DWLA 4DHYA 3O4QA 4BG8A 1T8EA 2RPIA 4B08A 1YVUA 2Q36A 2QWLA 4LD0A 4DQSA 3P4IA 2QXLA 1ILYA 4IKFA 2KLAA 5AQPA 4DU4A 4JI0K 2YX6A 3IKMA 1BG3A 4B8CA 4LF5K 2KKZA 3RMAA 1X3MA 1NGHA 5AQLA 4OX9K 3ZX0A 3VQ4A 1RT6A 4K43A 1VRUA 3I56N 3DLGA 1L3VA 1TL1A 1QSYA 2FBYA 4CJ5A 1DT9A 3D2EB 3KK2A 1VSFA 1Y97A 1JLQA 1W0HA 3AVHA 5AQMA 3C7NA 1RT7A 3VQBA 1HJRA 4JV5K 4GV6A 3H3NO 5TKWA 3CCSN 3L3VA 5AZIA 4LF9K 3SAHA 3P1GA 2YCHA 4AHTA 2FBXA 3MEEA 4RTFD 3A5LC 3N4PA 1C1CA 2AJQA 4QAGA 3FLCO 2WUSA 4DV0K 4I7FA 1NJXA 5F0XA 4CESA 5AQGA 3DLKA 1VQKN 3HSTB 1P8ZA 2ZF5O 3EEQA 4O4GA 4FO0A 2UUCK 4F2SA 2BE2A 2NRHA 3W3DA 5JVGL 4FLVA 2KZMA 1HNWK 1B9DA 3ZT4A 4EAHD 1JCGA 1D4XA 4Z4GA 1EP4A 1OH7A 5IWAK 3OYMA 3LP0A 3GBTA 4H0TB 4HVJA 2Y1IA 1B9FA 3LANA 3F9MA 1VHXA 4DTUA 1N8RO 1GLLO 4B3TK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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