2Q97A

Complex of mammalian actin with toxofilin from toxoplasma gondii
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
366
structure length
353
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein/cell invasion
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Toxofilin from Toxoplasma gondii forms a ternary complex with an antiparallel actin dimer
pubmed doi rcsb
source organism Toxoplasma gondii
total genus 113
structure length 353
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q97A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q97A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q97A03
2A3ZA 5FPNA 4H5TA 4K42A 3ZX3A 5TKYA 2ZGYA 3CQXA 1GLAG 4BR4A 1NGEA 4B1XB 4Z94A 3R8EA 1KAXA 4MO5A 5AZJB 4WQ5A 3H3NO 4A61A 3ATVA 3LDOA 2YHXA 2FLOA 2F9WA 4H0TB 1NGCA 4BRDA 3A5MC 2VWBA 3EL2A 4FWQA 3MN6A 1ZXOA 4FWSA 1EQYA 3UKUB 3GE1A 5AQRA 1RGIA 4PL7A 4QS8A 4FPAA 1NGJA 3HZ6A 2AA4A 4BR7A 4JHDB 3BP8A 4FSVA 2HF3A 5EXWA 2PBDA 1R59O 4BRIA 2E1YA 1MDUB 4XH5A 3KZBA 4F9OA 2E20A 3U9DA 2QWPA 4EFHA 2PAVA 3KHYA 5ADXH 1HKGA 2P9SB 3RSEA 5AQOA 1MWKA 1T6CA 3O6WA 2GWKA 3DJCA 3ATUA 1GLFO 4CZMA 3M6GA 4JN4A 5AQWA 4FWLA 1NBWA 2CGKA 2GUPA 4GY2B 4H5RA 1DEJA 1JCEA 3FLCO 2QWOA 3QICA 3QBWA 4BGAA 2P9KB 4BRQA 3L0QA 5BREA 4BRLA 3KVGA 4FWNA 1H1VA 3GOIA 4DCHA 4FWMA 2IIRA 1NGHA 1NGFA 2HOEA 2FSKA 2UYTA 3SMSA 2A42A 1QQNA 3CHWA 2Q0UA 5EX5A 2QWLA 1V4SA 5BPLA 4IJAA 3FZHA 3M3ZA 3DXKA 3CIPA 3DAWA 2ASOA 4JHDA 4CZLA 3VEOA 4RWTA 5BRFA 2BUPA 1X3NA 2GELA 2J4RA 4JAXA 2Q36A 1K8KA 1S3XA 4PKIA 3JXUA 5AQMA 1NGBA 2DPNA 1U6ZA 1J6ZA 4B1ZA 3LL3A 2Q31A 5AQNA 3ID8A 1BA1A 1ESVA 2QWQA 3HTVA 3O1WA 3MMVA 2IVPA 3VGKA 5BN9A 3RSEB 5LJVA 4NB4A 5BRDA 1LOTB 4FOEA 3VGLA 2P9LA 3A5OC 4DHYA 2ZF5O 4EAHD 4CD3A 2CH6A 1ATNA 4BR2A 5F1XA 3VF6A 1XUPO 2QWNA 3QDKA 5AQYA 4CZEA 2Q0RA 4JD2A 4A2AA 1Q18A 3FZFA 2IVOA 3M1FA 2FSNA 5KQDA 3W0LA 1CZAN 4FL9A 3AARA 1QHAA 5E84A 4H03B 5KPRA 2F9TA 5LJWA 3IFRA 4QS9A 4WQ4C 2NZTA 4CJ7A 1IG8A 2OANA 3CI5A 3O8MA 4FWRA 4IZ9A 2I7PA 2Q97A 3O4WA 4BQLA 2E2PA 3VGMA 3WT0A 1E4FT 1DGKN 3C0BA 4BRCA 3DXKB 4B1VA 3FZKA 3JS6A 3VEVA 3QMLA 1NGAA 2FSJA 5JLHA 1X9JA 1GLDG 2BTFA 1BDGA 3U8XA 5FPEA 3AY9A 2HMPA 3I33A 4CZIA 2W40A 5AQTA 2FF3B 2ASMA 4FOIA 2WUSA 3LDPA 3O5BA 2QWMA 1K8KB 1NLVA 3ZEUA 4BC4A 3CJ9A 3S41A 3CJAA 3UE5A 3J8AA 3VOVA 2CH5A 5AQKA 3R6MA 4BR9A 2YHWA 2E2OA 2V52B 4HWIA 2E8AA 3FFKB 4BR5A 4FO0A 4ISEA 2P9LB 4O8KA 3A5LC 3C7NB 4H0VB 5AQZA 3WXKA 1MA9B 3MN7A 3VEZA 3GG4A 4J8FA 4YDUC 4EIAA 4C23A 5EY4A 4O5FA 3MK6A 4IO8A 1KAZA 3ZX0A 2P9UB 1WUAA 3UKRA 3LM2A 4JD2B 1NGDA 4WQ4A 3TPQA 5BN8A 3BF1A 3LDNA 4Y0WA 3SMPA 3D7EO 2IVNA 1BU6O 2D0PA 5AQPA 3WUHA 4BC3A 3EZWA 5AQJA 1RFQA 5BPNA 3HBTA 1NM1A 4BRPA 4BG9A 1Z05A 3VEWA 1Z6RA 1BOTO 4K25A 4FWPA 4AM6A 4XH1A 4BRKA 3VETA 5ELZA 2P9NB 1HLUA 5BR9A 1ZC6A 1YVNA 3H1VX 4CZGA 3SLCA 1OKJA 4A62A 1BG3A 1KXPA 3ZETA 4BVPA 3R9PA 4AM7A 4B1WB 1HKCA 3GDQA 3QB0A 1G99A 3W3DA 3L6QA 5AQXA 1Y64A 2QM1A 2W41A 4BREA 3QFPA 2A6AA 4H0YB 2HF4A 3GL1A 4I6MB 3A0IX 3I8BA 1V4TA 4H0XB 3H45C 3FR0A 4LC9B 1SZ2A 1U2VB 1MWMA 2YJFA 3MN5A 4BC2A 4M7XA 3ZEUB 5KPTA 2E88A 3D2EB 3H46O 3QFUA 5EOYA 4CBUA 5AQLA 1LCUA 4CZFA 4ISFA 4L3QA 3O08A 1HKBA 2GEMA 3H3OB 1T6DA 4JNEA 3EN9A 3BUZB 3HM8A 4BVOA 4DB3A 4BRHA 1SAZA 5EVZA 4YDUA 5AQUA 3C7NA 1BUPA 3MCPA 2I7NA 4K41A 3AAQA 1ATRA 4H0PA 3CQYA 4QS7A 4CI6A 2P9UA 3DXMA 1E4GT 4MO4A 3EKUA 1JCFA 4KBOA 2A5XA 2P9PA 3CJ7A 1C0GA 1QQOA 3G25A 5F2RA 1TYQA 3HI0A 5AQHA 3VESA 1RDWX 3UKRB 3VPZA 1GLJO 2Q1NA 2FXUA 1NWKA 4BRGA 3LDQA 2GTDA 3QBXA 4PL8A 3VF4A 4DQ8A 5AZIA 2A41A 5JICA 3OHRA 3IUCA 3WEEA 2P9NA 3GBTA 1C0FA 2D0OA 1X3MA 3O80A 3FE1A 3FZLA 3O1BA 2V7ZA 4CZJA 1DKGD 3SJHA 3ZX2A 4BG8A 4BQZA 1GLLO 3ENOA 3CJBA 2A40A 2FF6A 2YJEA 4BROA 3ZETB 3WXIA 2QXLA 2NRHA 2V51B 1U2VA 1QZ6A 3ULEB 5JLFA 3SK3A 4IXCA 3VF2A 3D2EA 4BRAA 1XC3A 1NMDA 1TUYA 5AR0A 2ASPA 3VENA 2VYPA 1XQSC 3EO3A 3WXLA 3TU5A 4A2BA 2E1ZA 4BR0A 4FWKA 5LY3A 2H3GX 5AQSA 5I9EB 1GLEG 3FZMA 4BRMA 1QQMA 2YCHA 2E2NA 5E26A 5ADXA 4CBXA 2NLXA 3ENHA 3VEYA 2CGJA 4CZKA 4CD1A 4CBWA 5AQGA 3DXMB 4XH4A 4IWVA 2P9IA 2ZWHA 2P9PB 4BC5A 4RCHA 2GWJA 1TYQB 3BEXA 4M7YA 1QZ5A 1ATSA 4H5VA 1GLBG 4NO7A 2QW9A 4BRFA 1BA0A 2D1KA 3D2FA 5F0XA 4FWOA 2QWRA 5AZIB 3U4LA 4B9QA 3HSCA 1D4XA 1S22A 3VEXA 2ZGZA 4I6MA 3UB5A 3MN9A 4B1UB 5JMVA 3CERA 3WEEB 4CZHA 4XEIA 5AFUA 1SQKA 2YI1A 3FGUA 1YUWA 5AZJA 5BPMA 1T44A 2EWSA 2D4WA 5AFUH 3ULEA 5AQIA 4BGBA 2Q2RA 4IJNA 4E1JA 5B8HA 1KAYA 4BRNA 3UKUA 2E2QA 4GNIA 4WQ5C 1P8ZA 5FPDA 5FPMA 1YXQA 4PKHA 1IJJA 1ZBSA 3VERA 1HUXA 4HTLA 1BO5O 2V7YA 3AAPA 3WXJA 4PKGA 3U9ZA 4M63C 5KQ8A 1NGIA 3H6EA 3LDLA 3L4IA 4MLEA 1YAGA 2YHYA 4MLHA 3MDQA 2P9SA 5AQFA 4EHUA 2VCPA 4EHTA 4H5WA 4RTFD 2CGLA 2KHOA 4WYBA 4B1YB 5CE3A 1TUUA 3EKSA 4ISGA 3LM9A 1HX1A 3F9MA 4FPBA 3WQTA 4H5NA 3CETA 5AQQA 2P9IB 4K43A 3A8YA 3WQUA 3P4IA 1JCGA 1HJOA 2AP1A 5AQVA 5BRHA 3BF3A 3DWLA 2P9KA 1NGGA 3CJCA 3IDHA 1BWFO 3D2FB 3IMXA 2ITMA 3A5NC 3CJ1A 3H1QA 5KPZA 4H0OA 1HPMA 3B8AX 1GLCG 1WOQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H5TA 2HNZA 1Q9YA 4B1XB 2NRXA 3R8EA 1KFDA 2HHIA 3DLHA 3QEWA 2YHXA 2FLOA 2D0BA 5HP1A 3A5MC 2O8EA 4OKEA 3G6EN 1SKSA 1ZXOA 1EQYA 3UKUB 1XHZA 3L2WA 3O3FA 3WXMB 1U48A 1EKEA 1IKWA 3NMUA 4CJ3A 4DV3K 2HF3A 3E9PA 4CGHA 4KHSA 4DSIA 5HLFA 3OYFA 4ID1A 3DRRA 2PBDA 1R59O 4BRIA 2I5JA 2IAJA 4LF4K 1KFSA 2QWPA 3CMEN 3OYDA 1K6YA 1RT7A 3ZYYX 1KVCA 3ALYA 4GV6A 3DJCA 4E7JA 4C8NA 3M6GA 4JN4A 5AQWA 3RR8A 4FWLA 1VQ4N 1UOCA 3HXMA 3VTIA 4FK4A 1TV6A 2HW3A 4I7FA 1XHXA 1NMNA 2BDPA 1GOAA 2E4LA 3L0QA 4F2RA 3A2FA 4ICLA 3K9JA 1VSKA 3OYBA 1JLBA 5GINA 4E7IA 1BCMA 1NJYA 1T7PA 1NGHA 2HOEA 2UYTA 3CHWA 2Q0UA 2QWLA 2VG6A 3AA3A 5BPLA 4DR7K 4HUGA 4EZ6A 5KGWA 3DRPA 3SNNA 1HRHA 3TAPA 5M1QA 2YNFA 1WAJA 1HYZA 3HVTA 4JKEA 5JVHL 4JS4A 3DAWA 2ASOA 2NRWA 3QNNA 5FRNA 4H4MA 5BRFA 4PY5A 2C1IA 1BI4B 1SL2A 2J4RA 4OO1J 1RDDA 2DFFA 1JLEA 4PKIA 1Q8IA 1U6ZA 4KHQA 4DTXA 3RVCA 4JKCA 5AQNA 2QWQA 1T8EA 2KFZA 3O1WA 2Q3SA 3NF9A 1KRPA 3RSEB 1BISA 4NB4A 4DKWA 3K5LA 3DI6A 3S3OA 1W2BM 5C0YA 2P9LA 4NLBA 1XNRK 4R5PA 4E7LA 4CECA 1NK8A 5F1XA 3VF6A 3QDKA 4FJ9A 1YJ9N 2O8CA 1C6VA 4CZEA 3J80O 1EX4A 2Q0RA 3HPHA 2RE2A 4KFBA 2P1JA 2IVOA 4YFUA 1CZAN 4LFAK 1ASWA 3J7AP 4DR3K 4WQ4C 4CJ7A 4DTOA 4X66K 3K9KA 4CK3A 4IFVA 2E2PA 4CHZA 3TSQA 3C95A 3QMLA 4NCBA 2YKMA 4DUYK 2FSJA 4JI4K 3OYIA 1GLDG 1OH8A 1YTUA 3THXB 5FPEA 4FJHA 3P83D 4N56A 5AJ3K 3PUFA 4CESA 1RT3A 1VRUA 2GX9A 3LDPA 1WBDA 3QESA 2Z1JA 1NLVA 4DTJA 4E19A 4DSFA 3KTQA 3AO3A 3CFRA 2ZQBA 2KLAA 2CH5A 4O5BA 3BY5A 4DV1K 1SUQA 2YHWA 2E2OA 2V52B 1QHTA 3ULDA 4IFYA 3NBPA 4FJMA 4HVJA 5J1EA 3N4QA 3RMCA 1NK9A 4O8KA 4F2SA 3A5LC 2JLEA 3C7NB 4C8KA 1IBKK 3GG4A 3DLBA 3RMBA 5EY4A 4B9UA 3MK6A 4IO8A 1WUAA 4C1NI 4JD2B 4JKFA 4WQ4A 4N76A 4Y0WA 3D7EO 1BU6O 3AVHA 4AHCA 3VQ6A 1RDAA 4DFMA 1RFQA 5BPNA 1WLJA 1NM1A 2JWLA 1RBSA 3VEWA 4FWPA 4M41A 4JS5A 2PZSA 3V9SA 1SKRA 3VQ8A 4CGIA 3KK7A 3H1VX 3NGIA 1BG3A 4QOZB 1KXPA 1S6PA 4BVPA 4B1WB 5AQXA 5C10A 3S3NA 4A5AA 2QM1A 1HMVA 3IG1A 1FK9A 3SBTA 2A6AA 1D8YA 2QEXN 2ETJA 4LC9B 4O0IA 3C6TA 1MWMA 3MN5A 1FJGK 4M42A 2AJQA 5KPTA 2E88A 3D2EB 5AQLA 4OPJA 3EEQA 4ISFA 1VSFA 1HKBA 1T6DA 1VQ8N 1RCHA 4BVOA 3HM8A 4DB3A 1SAZA 1VQ9N 3V9XA 4CHQA 1C1BA 4CF9A 3SAGA 5I42A 4WFAL 4NXNK 1K9MO 1HNVA 1OH5A 3VQPA 3NHGA 1QTMA 1E4GT 3I8DA 1VQMN 4KBOA 4LH5A 3HI0A 2BH1A 3VESA 3PIOL 3UKRB 3AO4A 1GLJO 1S5JA 1RT6A 2GTDA 3NFAA 3QBXA 4PL8A 3VF4A 4DQ8A 3AVLA 3BGRA 4KKOA 5JICA 3C94A 1RT2A 3SPZA 2KFNA 4KH5A 1C0FA 3O80A 3K5NA 1W97L 2O8DA 4KHWA 3SJHA 4OPKA 1GLLO 3ENOA 2FF6A 4XIUA 2HHHK 4BROA 3ZETB 3WXIA 2QXLA 2NRHA 4RW7A 4M3RA 2Z1IA 5E41A 1U2VA 1QZ6A 3ULEB 3HO1A 3SK3A 3QIOA 3NGYA 4MDBA 4BRAA 1NMDA 2UUBK 3VENA 2G8FA 1VK0A 1XQSC 3WXLA 4A2BA 2E1ZA 1RT5A 4IEIA 4B9TA 2E2NA 5E26A 2XY6A 1S72N 4YOWA 1UA1A 1TL1A 4WF9L 3L2QA 1NU0A 4CBWA 2O8BB 1TVRA 3DXMB 5SWMA 2YKNA 2X78A 4NYFA 4FLXA 2C1GA 4FJ7A 4BRFA 2QW9A 3WNFA 3O9RA 1RBVA 3OYEA 3LPTA 5CY4A 4FWOA 5M1PA 5H1SQ 3P31A 4KHUA 3T19A 2IC3A 1D4XA 5JS1A 3ZSRA 3UB5A 4KB1A 5JMVA 4MQ3A 2VWKA 1SQKA 3NCIA 3PX6A 3FGUA 1YUWA 3CM5A 5AFUH 1XMQK 2QK9A 5B8HA 4Z4CA 3UKUA 4JK7A 3VQCA 3DOKA 3VERA 3SUQA 1IO2A 3OS2A 3L4QA 4GV9A 1VQ6N 4HTLA 1B9DA 4B08A 2V7YA 3M8PA 4M63C 5KQ8A 1BHLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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