2Q97A

Complex of mammalian actin with toxofilin from toxoplasma gondii
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
366
structure length
353
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Toxofilin from Toxoplasma gondii forms a ternary complex with an antiparallel actin dimer
pubmed doi rcsb
source organism Toxoplasma gondii
molecule tags Structural protein/cell invasion
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 113
structure length 353
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q97A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q97A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q97A03
5AQJA 3VF6A 1XUPO 5AQLA 3H3OB 3VGKA 3AAPA 3A0IX 5EVZA 3W0LA 4PL7A 3MCPA 3SMPA 4WQ4C 1TUUA 3HZ6A 4FO0A 3WQTA 3MDQA 5BPNA 3DXKA 3WXKA 1DEJA 3CJCA 4NO7A 4M7XA 3RSEB 1GLDG 2F9WA 2P9SB 1BDGA 2YHWA 3FZLA 1HJOA 4IJNA 5KQ8A 2I7PA 4CZIA 4BRKA 1MDUB 4QS8A 5AZJB 1P8ZA 3HM8A 1TYQB 2QWQA 3O08A 1EQYA 5AQQA 3A5OC 5EY4A 3LDPA 5KPZA 4BR0A 3ULEB 1GLAG 5AQWA 4BRDA 3ZETA 3CJ1A 1ESVA 5FPMA 4BC5A 1SZ2A 3D2EB 3H1QA 2UYTA 3AY9A 2P9NB 3CQYA 2GWKA 4BRFA 3QB0A 2E2PA 5AZJA 1TYQA 4FWKA 4BQZA 5KQDA 5FPDA 3DXMB 4QS7A 3CQXA 4CZHA 5BPMA 5JLFA 2P9PB 4DQ8A 3L0QA 2YHYA 5AQGA 3ZETB 2E2QA 1E4GT 2QXLA 2P9IB 4CZFA 3ATUA 2P9KA 2VCPA 4BRPA 4A61A 4NB4A 3F9MA 1NGIA 4J8FA 5BR9A 2CGLA 4ISFA 3ZX3A 3BUZB 5CE3A 2A6AA 3CJBA 1HX1A 3VEOA 3HI0A 3CIPA 3HTVA 3VEVA 3ZEUA 4BG9A 2V51B 1BA1A 4BRMA 2ASPA 2PBDA 3FZKA 1NGCA 3QFUA 2FSJA 5BN8A 4H5VA 4IZ9A 3FZHA 3JS6A 3J8AA 5AR0A 2Q31A 2E20A 2ZGYA 4H0TB 4HTLA 4Y0WA 4BR2A 3FGUA 1NM1A 2FXUA 4GNIA 5B8HA 3VEYA 1T44A 4CBUA 3MN9A 3UKUB 2Q2RA 4FOEA 4BRAA 3VF2A 3W3DA 1BWFO 5AFUH 1NGFA 3GOIA 4DB3A 1X9JA 2E2OA 1NLVA 3SK3A 1BOTO 3VGMA 3CJAA 3FFKB 4YDUA 5AZIB 1WUAA 3O8MA 4AM7A 3M3ZA 5I9EB 1ZC6A 3WXJA 3P4IA 4XH1A 3VESA 3WUHA 2QWOA 4YDUC 4QS9A 5EXWA 2I7NA 2FF3B 5BRHA 3AARA 2HOEA 4FWNA 4H5RA 3UKUA 1BO5O 4FWMA 4BC3A 2Q0RA 1Y64A 4ISEA 3QMLA 4BRCA 4A2AA 3BEXA 5BPLA 1HPMA 2CGJA 3BF1A 4B1ZA 1Z05A 4DHYA 2HF4A 2IVNA 1NGGA 4M63C 5JMVA 3FE1A 4CBWA 3GE1A 4JHDA 4A62A 1HKGA 1S3XA 4BREA 3QDKA 1JCEA 4B1WB 2NLXA 3O80A 2V52B 3QICA 4FOIA 4MLHA 1GLFO 2QWPA 4B1UB 3TU5A 2NZTA 1MWKA 3VERA 1NWKA 3CJ7A 2FF6A 4BQLA 5FPEA 3VEWA 4CI6A 3QFPA 2Q1NA 4F9OA 1NMDA 4H0VB 1QZ5A 2AA4A 2QWNA 2E2NA 4BR5A 1C0GA 3UKRA 2CH6A 2P9IA 1QQMA 3ZEUB 3WT0A 2QM1A 2E1YA 2HMPA 2F9TA 2VYPA 1MWMA 4H0OA 3VPZA 4FPBA 1LOTB 3OHRA 4FWSA 5EX5A 3WXIA 4RWTA 4B9QA 3GBTA 3SJHA 2A3ZA 2V7YA 3A8YA 3D7EO 1U2VB 1RGIA 5TKYA 1LCUA 3CHWA 3EZWA 2W41A 3S41A 2PAVA 3H45C 5AQFA 3RSEA 3O5BA 4PL8A 3VF4A 3WXLA 2YI1A 4WQ5A 3UKRB 4IWVA 1TUYA 5AQXA 4KBOA 3MN5A 1S22A 1DKGD 1MA9B 4RTFD 1CZAN 3CETA 5AZIA 5LJVA 1KAXA 4K42A 3M1FA 5AQKA 5AQZA 4CBXA 1YAGA 3L6QA 2WUSA 1NGHA 1RFQA 5AFUA 3B8AX 4BRLA 3LDNA 4EAHD 2D0PA 1QQOA 2QW9A 5E26A 2YJFA 3D2EA 2YHXA 2E8AA 3D2FB 2ITMA 2P9NA 2GUPA 5AQUA 3VENA 2ASOA 2Q36A 1HKCA 4H0YB 4E1JA 3ZX2A 4FL9A 3A5MC 4BGBA 4FWLA 3H3NO 5F2RA 3WQUA 3R8EA 2IVPA 4BVPA 4WYBA 4EFHA 2D1KA 4GY2B 2P9PA 4BRIA 2GELA 3R6MA 4BR7A 2OANA 3KVGA 2P9KB 3LM2A 1NGBA 1G99A 2W40A 4B1VA 3C7NB 5F1XA 3VGLA 1QHAA 3U9DA 3CI5A 2FLOA 4XEIA 3CERA 3TPQA 3LDQA 3DWLA 1DGKN 5AQVA 1T6DA 3DJCA 2A42A 3ENOA 1ATRA 2VWBA 1ZXOA 2ZF5O 3FR0A 3UE5A 3ZX0A 5ADXA 2V7ZA 4JNEA 4BROA 4C23A 5JICA 1NGJA 4PKIA 1ATNA 4AM6A 3C7NA 5AQHA 3BP8A 1GLCG 3IMXA 4FWQA 5BREA 4DCHA 4O8KA 1QZ6A 4K43A 5LJWA 3SMSA 4M7YA 1U2VA 4HWIA 5AQOA 4LC9B 2E88A 2J4RA 1C0FA 3EKSA 4ISGA 1KAZA 4PKHA 5FPNA 4I6MA 3O6WA 2BUPA 4WQ4A 3LL3A 1IG8A 5AQMA 5ADXH 3ATVA 4L3QA 5AQYA 4Z94A 2H3GX 2QWLA 4IJAA 2NRHA 1ZBSA 4B1YB 5AQRA 4BG8A 4MO5A 3IUCA 1ATSA 1BA0A 2ASMA 2D0OA 4H5NA 2BTFA 2YJEA 1OKJA 3ULEA 4BRQA 4CZGA 4BRGA 3QBWA 1IJJA 1X3NA 2P9UB 3H6EA 4RCHA 5KPTA 3GG4A 3LDOA 2DPNA 4XH5A 3WEEA 4BC2A 4H5WA 3G25A 3R9PA 1NBWA 3UB5A 4CZLA 4JN4A 4JD2B 1QQNA 3U8XA 3H46O 1NGAA 4CD1A 1H1VA 2GWJA 2AP1A 2IIRA 4CZMA 5AQIA 2A41A 3MN7A 4H0PA 3VETA 2KHOA 4CZKA 4EHUA 2CGKA 2P9LB 1RDWX 5AQSA 2EWSA 1R59O 3WEEB 1GLEG 5KPRA 4JAXA 4MLEA 1HUXA 2E1ZA 3GL1A 3DAWA 2FSNA 3BF3A 4H5TA 3A5NC 1GLJO 3VEXA 3EKUA 3IDHA 3AAQA 3U4LA 1BU6O 1E4FT 2A40A 1KXPA 3LM9A 2Q0UA 2QWRA 4BGAA 1NGEA 1XQSC 4FSVA 5BRDA 3FLCO 1YVNA 4EIAA 5BRFA 4FWPA 4BRNA 3ID8A 2P9SA 1YXQA 5BN9A 4BRHA 4A2BA 2IVOA 3I33A 3SLCA 1J6ZA 3GDQA 1SQKA 1HKBA 1BG3A 4EHTA 3MK6A 4WQ5C 3LDLA 4PKGA 3U9ZA 4IO8A 4MO4A 1U6ZA 1XC3A 4I6MB 3FZMA 3HSCA 5EOYA 3C0BA 5LY3A 3EL2A 2CH5A 3H1VX 3KZBA 3CJ9A 2ZWHA 4CZJA 4BR9A 1K8KA 4BC4A 5JLHA 3MMVA 3DXMA 2GTDA 2GEMA 4H0XB 3HBTA 2ZGZA 3EN9A 1T6CA 3ENHA 1GLLO 5AQNA 5E84A 3D2FA 1YUWA 1JCFA 2P9UA 4FWRA 4K25A 4BR4A 1GLBG 3O1BA 4CJ7A 3VEZA 2A5XA 5ELZA 5AQPA 1JCGA 3VOVA 4FPAA 4FWOA 3M6GA 4XH4A 3O4WA 1NGDA 5AQTA 1V4SA 4JHDB 3A5LC 3O1WA 1KAYA 2HF3A 3KHYA 1K8KB 4CZEA 4H03B 3IFRA 4O5FA 5F0XA 1X3MA 2D4WA 3I8BA 1BUPA 1WOQA 1SAZA 1Q18A 2YCHA 3L4IA 1V4TA 3FZFA 3MN6A 1Z6RA 4B1XB 1HLUA 4CD3A 4BVOA 3DXKB 2FSKA 2Q97A 4K41A 2P9LA 1D4XA 4JD2A 3JXUA 2QWMA 3EO3A 3QBXA 4IXCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JXBA 4GVEA 1KD1O 5AQJA 2F8TA 3RMDA 3KIOA 2OZSA 1C0UA 3H3OB 2OZMA 1C1AA 4CGHA 3VGKA 3PX4A 4Z4EA 1REVA 2YHAA 4WQ4C 3HJFA 4O0JA 3HPOA 2OCEA 2XY8A 1W97L 1VSIA 1VQ4N 1T03A 4NO7A 3ITHA 1GLDG 1VQLN 1OH8A 4CEFA 2F9WA 1QVGM 2HMIA 5LMNK 3LDSA 3WNGA 4I9LA 2UUBK 3AVMA 2QEXN 2I7PA 4BRKA 5CZ2A 1NG9A 2YKNA 3HM8A 3QEIA 2EHGA 1U45A 1EQYA 5AQQA 3VQ9A 3OS0A 5EY4A 5GADP 2OTLN 1GLAG 1QHTA 5AQWA 3TABA 2O8CB 3ZSOA 5J2PA 2DTUA 4FJHA 2HSTA 1SZ2A 3D2EB 4RW4A 1VQKN 1WBDA 3CQYA 4QOZB 1U4BA 4BRFA 3QB0A 1HNWK 4RW7A 5AZJA 3TAEA 3S3NA 4FWKA 1JXEA 3ZT3A 3C95A 4BQZA 4YY3K 4I2QA 4W5QA 5BPMA 4FJ9A 1N32K 1L3SA 4CJKA 4DLGA 2X78A 2E2QA 1E4GT 2RKIA 4NCGA 3TTDA 4R79A 3SYZA 4CHZA 3VEOA 4BE2A 3CIPA 4E19A 4X65K 3ZT0A 1OH5A 3VEVA 2HBMA 1WB9A 1KC8O 4BG9A 3J7ZO 2V51B 4MDAA 1BA1A 2ASPA 3QFUA 1S9EA 1C0MA 1RT6A 2RF2A 4DTPA 4LY7A 4H0TB 2O8DA 4Y0WA 3T3FA 5B8HA 3TANA 3K5MA 4BRAA 3VF2A 3W3DA 1BWFO 2HBJA 4AQYK 2KZZA 3GOIA 4DB3A 4AHSA 4CEOA 3U6FA 3LANA 2P51A 2E2OA 3VGMA 1BOTO 1CXUA 5AZIB 2IGIA 4Y1DA 4E7IA 4J2AA 3HRGA 3O8MA 2NRVA 3P4IA 4OGCA 5HL7L 3WUHA 1C1BA 4QS9A 4KAZA 5JENA 5EXWA 2JLEA 4FWNA 3SPYA 4CK1A 4JKEA 1BO5O 3THWA 5M1KA 4F4KA 3CC7N 3OYCA 3OYEA 4AHCA 2CGJA 3BDPA 4WE1A 1SKSA 2G8WA 4JI7K 3BF1A 5IT9O 3SUNA 4MFBA 1S72N 1IO2A 4DR1K 2R7YA 1NGGA 1OVQA 3MEEA 4M63C 1VQ6N 4JHDA 3CFRA 4A62A 2UXBK 2VGNA 4IDHA 3KKRA 1ZBIA 1I3AA 2QTDA 4X66K 2NRXA 2QWPA 2HHHK 3J81O 4L8RB 1HYSA 5GAHP 4NCAA 1J5OA 1KVCA 4F9OA 5FPEA 1NK8A 2Q1NA 2JGUA 4V19S 3VQ4A 4O8UA 3LP1A 4JKBA 1TAUA 4E72A 4BR5A 1C0GA 3UKRA 4DSIA 1WBBA 2P9IA 4RW9A 3THXB 2F96A 1QQMA 3ZEUB 2E1YA 2VYPA 4CK3A 1TL3A 3VPZA 4FPBA 1RDBA 4F3TA 1UAXA 5M1NA 4FWSA 4ELTA 4IEEA 4RWTA 4B9QA 3GBTA 3L4QA 3A8YA 1U2VB 2NRRA 4CEEA 2W41A 3LALA 1D5AA 3O5BA 4PL8A 1KLNA 4B9UA 4HVJA 5AQXA 1VQ7N 1S22A 1DKGD 4RTFD 2QKBA 1C0TA 5LJVA 3SBTA 4K42A 5AQKA 5AQZA 3VA0A 3SQ2A 3NH0A 4CHQA 3T1HK 3MECA 5AFUA 4C8OA 1JLAA 4CJLA 3DMJA 2D0PA 2QW9A 4CJTA 3D2EA 3NGIA 3THYA 3D2FB 1S9GA 3AA4A 3DLLL 1IV0A 2ITMA 3CCRN 2GUPA 3AVIA 2O8EA 4H0YB 4E1JA 3ZX2A 4FL9A 4BGBA 1NJXA 5F2RA 3N4QA 5C2DA 2KQ2A 4WF9L 3WQUA 3R8EA 4X62K 3BY5A 1ZBUA 4N76A 2YV0X 4DR5K 3OYAA 1W9HA 4N47A 4HCCA 1N36K 1IKXA 2DFHA 3ZSZA 4CEQA 1NGBA 1G99A 4M3UA 4YOYA 5F1XA 3HSTB 3J80O 1QHAA 3CI5A 2FLOA 3CMAN 3TPQA 4JI2K 4AF1A 3LP0A 5GINA 4OKEA 4WCEL 4FW2A 3OJSA 4DV0K 3DJCA 2A42A 2ZF5O 3CM6A 1IKWA 3C7NA 5AQHA 3HOTA 1ZBFA 3FFIA 3IMXA 2ZQBA 5BREA 4DCHA 1NK7A 5LJWA 2O8FB 1HNXK 1QQCA 2ZJRL 3AVLA 1KQSM 4JKFA 4O55A 1KAZA 2VWJA 3V81A 1XHXA 4WQ4A 5AQMA 3ATVA 4L3QA 3OS2A 1FKPA 3L2UA 3DLKA 3SZ2A 2NRHA 2IC3A 3VTHA 3IUCA 1ATSA 2WTUA 1BA0A 4OO1J 2BTFA 3PSFA 1OKJA 4ID1A 2OPRA 3ULEA 4DMNA 4CZGA 4BRGA 4E1MA 2B6AA 3VQ6A 2HW3A 3DYAA 1L5UA 5KPTA 4YOXA 1S6QA 4B08A 3NHGA 3HM9A 4CJSA 1NBWA 4M3YA 4LSNA 4FJ7A 1J53A 3KWIA 4JD2B 1QQNA 4IKFA 3H46O 4EZ9A 4UY8O 4CD1A 4CHYA 5C0YA 5KGWA 3PO5A 4N41A 2AP1A 4JKCA 2IIRA 1S6PA 4IG0A 3MN7A 1ASWA 4CZKA 1NJIO 3EE8A 1R59O 3WEEB 1NJWA 3LWMA 1NK5A 3PX0A 2FSNA 2OTJN 3PV8A 4F2RA 4J2DA 1BU6O 4DU3A 5C25A 1KXPA 2HB5A 4FJLA 2QWRA 5E41A 3KK3A 4Z0UA 4C1NK 4FSVA 4W5NA 3ENBA 5BRFA 1N8RO 5BN9A 4BRHA 4A2BA 4ELVA 3I33A 1N34K 1RT5A 1J6ZA 5IWAK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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