2Q97A

Complex of mammalian actin with toxofilin from toxoplasma gondii
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
366
structure length
353
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Toxofilin from Toxoplasma gondii forms a ternary complex with an antiparallel actin dimer
pubmed doi rcsb
source organism Toxoplasma gondii
molecule tags Structural protein/cell invasion
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 113
structure length 353
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q97A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q97A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q97A03
3LDNA 2EWSA 3QMLA 4A2BA 3J8AA 2D4WA 3MN5A 3SMSA 2ASOA 1CZAN 4CBXA 1HKBA 3IFRA 4XH4A 4KBOA 2GUPA 3M1FA 4M63C 4B1ZA 5JLFA 5KQ8A 1TUYA 3ENHA 5JICA 4IO8A 2ITMA 3HSCA 1JCEA 4A61A 1KAZA 2QXLA 2Q2RA 1HKCA 4Z94A 2FSJA 1H1VA 4B1WB 3AAQA 1DKGD 3FR0A 1XUPO 3A0IX 4CZJA 4BRKA 5EOYA 5KPZA 4BG9A 3KZBA 2E2QA 3D2EA 4H0TB 2FSNA 4QS8A 3WT0A 4BR2A 2QM1A 1MWKA 1MWMA 3ZX3A 1NGHA 2IVPA 1HPMA 5BRDA 1YUWA 3O5BA 3FZKA 2V7ZA 4WQ5A 1IG8A 1C0GA 2A5XA 4A2AA 1U2VA 1HJOA 3CJ7A 4BRHA 5EVZA 3ATUA 3JXUA 1BA1A 3H1VX 1NLVA 4HWIA 1P8ZA 4O8KA 3IUCA 3AARA 4CZKA 3L0QA 3VOVA 3H45C 3DAWA 1NGDA 1E4GT 1YAGA 5BRHA 3VEYA 5ADXH 3H46O 4XH1A 5AQRA 1BDGA 1NGCA 5E26A 3VF2A 5FPMA 3L4IA 4FWQA 3CETA 4EHTA 4DHYA 4H5RA 3A5OC 4FWOA 3U9DA 1TUUA 4I6MB 4WQ5C 4BR4A 4YDUC 2A40A 1K8KB 4WQ4C 3CIPA 2I7PA 2ASMA 2PAVA 3CJBA 3VEWA 4K41A 1T6CA 1TYQB 1NGAA 1IJJA 3ZETB 2QWPA 4JNEA 3UB5A 5AZIA 1WOQA 3GBTA 2P9NA 3R8EA 3U4LA 4H5TA 1C0FA 3UKRB 4PL8A 1X3MA 1NWKA 2E20A 5JLHA 2QWNA 4XH5A 3HZ6A 4MO4A 4H0YB 5E84A 2P9SA 3LDQA 2WUSA 4B9QA 3GG4A 2AP1A 1S3XA 2Q1NA 3I8BA 3C0BA 5CE3A 2Q36A 2V7YA 4IWVA 4DCHA 1NBWA 1KAXA 3BUZB 4M7XA 4EFHA 3HBTA 4JN4A 2YHYA 3SLCA 3AY9A 3S41A 3VEZA 1S22A 2P9LA 3FZMA 2CH5A 3ZETA 1QZ5A 4IZ9A 3RSEB 2D1KA 2GWKA 3MN7A 4JHDB 1X3NA 4PKHA 2IVNA 3CJAA 2NLXA 3O1WA 1NGGA 2P9KA 3VEOA 2V51B 2E1ZA 4EIAA 2QWLA 3IDHA 1NGEA 4A62A 4FWKA 3W0LA 1Z05A 3QICA 1NGBA 2VYPA 1QQMA 2IIRA 3B8AX 4CZGA 4Y0WA 4JHDA 1JCGA 1XC3A 2UYTA 3CQXA 3VGMA 5BN8A 2P9PB 5B8HA 3GDQA 3KHYA 4FWNA 2GTDA 3CJ1A 3I33A 1NGJA 3VF4A 2BUPA 5AZJB 3O08A 4IJNA 3H6EA 4CBWA 4WYBA 2YJEA 2A41A 4RWTA 1BO5O 2KHOA 4H0PA 1XQSC 3MK6A 3EO3A 3QFUA 4BRIA 3FZHA 4QS9A 1BA0A 4RTFD 1HKGA 2VCPA 3VPZA 2E88A 3O1BA 1K8KA 2QWOA 4QS7A 1BU6O 3ZEUB 5KQDA 3D2FA 4CZLA 3UKRA 4BVPA 4BRLA 2P9UB 3P4IA 1LOTB 4FWRA 3VGLA 3RSEA 1D4XA 3FFKB 5AZIB 5AFUH 4CBUA 3D2EB 1U6ZA 5EXWA 5AQFA 3VF6A 5LJWA 3WQTA 2CH6A 3TPQA 2HOEA 5AFUA 3UE5A 3LL3A 3CHWA 1GLCG 5BN9A 1QZ6A 1ZXOA 3ATVA 4IJAA 2PBDA 2FLOA 4H5NA 1QQOA 3MN6A 4DB3A 3M6GA 3DXMA 4BRQA 3H3OB 5AQIA 2YHWA 4CI6A 2A3ZA 2QWMA 3LDOA 5AQLA 2VWBA 4FWPA 1GLEG 3O4WA 5AQXA 1YXQA 4L3QA 3A5NC 4H5VA 2Q0UA 2W41A 1GLFO 1RDWX 1Q18A 1G99A 3WEEB 1BUPA 2Q0RA 5AQZA 4BR5A 3LM2A 3LM9A 5AQKA 4PKGA 4BQZA 2J4RA 3CERA 2P9NB 3MCPA 5AQVA 5KPTA 4E1JA 2AA4A 3JS6A 4K43A 3W3DA 3WXIA 3MDQA 4CZEA 1HUXA 3HM8A 2ZGYA 3VENA 3WEEA 3CJ9A 1DEJA 3LDPA 4FPBA 4GY2B 4MO5A 2E2PA 4BRAA 1BOTO 3FZLA 2YI1A 4FWLA 1ATNA 5BRFA 5FPDA 5AQYA 5JMVA 2CGJA 3DWLA 3SK3A 1BG3A 1RGIA 2CGKA 5BPLA 5LY3A 3VGKA 3DXKA 3IMXA 4YDUA 4CD1A 3UKUB 2CGLA 2HF4A 4H03B 1NGIA 4BRDA 4PKIA 3R9PA 1GLAG 5EY4A 4RCHA 3ZX0A 5BPNA 2A6AA 2D0PA 4BR9A 1KAYA 4BRFA 4BRCA 1TYQA 3SJHA 4B1XB 1SQKA 5EX5A 1LCUA 4FPAA 2QW9A 1ESVA 2P9UA 4H0VB 2GEMA 3FZFA 4MLHA 4AM6A 4CZIA 4O5FA 5AQGA 3GOIA 4JD2B 3BF3A 3R6MA 3WQUA 2IVOA 3A5MC 2GWJA 4I6MA 4BROA 5F2RA 5AQMA 5AQQA 3QBWA 3U8XA 4EAHD 5AQWA 4MLEA 4FL9A 3F9MA 1OKJA 3EKUA 5BR9A 2HMPA 1DGKN 3ID8A 1QQNA 2P9SB 1JCFA 2DPNA 5AR0A 1HLUA 1KXPA 1J6ZA 1QHAA 5F1XA 2OANA 3FGUA 4H0OA 4BG8A 1RFQA 4DQ8A 5AZJA 3DJCA 3QBXA 3KVGA 4BR0A 2H3GX 5AQHA 1EQYA 2E8AA 2ZWHA 5AQNA 3EKSA 1HX1A 4H5WA 3ZEUA 4FOEA 4CZHA 4JAXA 4CD3A 3ULEA 2Q31A 4BRPA 3C7NA 1YVNA 3WXJA 4B1YB 2NRHA 2YHXA 4BVOA 3MN9A 1GLDG 3QDKA 2FF3B 2Q97A 1ATSA 4BC2A 3SMPA 5TKYA 5FPNA 2P9KB 4LC9B 4BRGA 5F0XA 4JD2A 3QB0A 3U9ZA 3O80A 5LJVA 2W40A 1SAZA 4CZMA 3M3ZA 2GELA 2A42A 2V52B 3ULEB 5I9EB 1GLLO 2YJFA 3OHRA 1ZC6A 5BPMA 1Z6RA 4H0XB 4C23A 1T6DA 2P9PA 3BP8A 3DXKB 4B1UB 2QWRA 3UKUA 2D0OA 3AAPA 2E2NA 2NZTA 3GE1A 4BGAA 1R59O 3HI0A 1E4FT 3A8YA 2HF3A 4BQLA 5BREA 3WUHA 4BGBA 1NMDA 2I7NA 1T44A 4F9OA 5ADXA 4XEIA 4NB4A 4FSVA 3HTVA 2P9IA 3VEXA 2ZGZA 3CJCA 5AQPA 2FSKA 4BREA 5KPRA 4K25A 3VETA 3CI5A 3H1QA 3BEXA 3L6QA 2F9WA 3VERA 4K42A 2FXUA 2P9IB 4J8FA 5FPEA 1BWFO 4FOIA 3G25A 4BRNA 2FF6A 3D7EO 2QWQA 5ELZA 3TU5A 4FWSA 1ZBSA 3ENOA 2BTFA 3VEVA 4BRMA 3BF1A 3DXMB 1U2VB 2E1YA 3ZX2A 1X9JA 2ZF5O 3FLCO 4WQ4A 4AM7A 3C7NB 3WXLA 3H3NO 4PL7A 5AQUA 1MDUB 3QFPA 5AQTA 3LDLA 4FO0A 5AQSA 2E2OA 4EHUA 3FE1A 4ISGA 3WXKA 2F9TA 1GLJO 3A5LC 4CZFA 1SZ2A 4BC5A 4GNIA 3O6WA 4CJ7A 4FWMA 3D2FB 3EZWA 1GLBG 3VESA 3MMVA 4BR7A 4ISEA 3CQYA 4IXCA 2ASPA 4HTLA 4M7YA 4B1VA 4BC4A 5AQOA 3O8MA 1WUAA 1ATRA 1NM1A 1Y64A 5AQJA 3EN9A 1V4TA 2YCHA 4BC3A 3EL2A 4ISFA 1NGFA 3GL1A 4NO7A 1V4SA 2P9LB 1MA9B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WAFA 2IAJA 3SCXA 2FBYA 3NGYA 2D4WA 3MN5A 3AO4A 2KKZA 1CZAN 4NLBA 4E89A 4W5TA 2D5RA 3ZSOA 4DTXA 4RW6A 3IFRA 3ZT1A 3M1FA 1IKVA 1QE1A 4M3XA 5DM6L 4IO8A 1VQKN 2F8SA 2QXLA 4M3RA 1HKCA 4DLGA 3V9XA 2OA8A 1H1VA 3LZJA 4YORA 4KHPK 2GX9A 4B1WB 1XUPO 2E6LA 4CZJA 4ILJA 5EOYA 5KPZA 1A5VA 3NF8A 3OYKA 1KSPA 4B3MK 2E2QA 4H0TB 5HROA 4QS8A 3WT0A 4RW4A 5JVHL 1BHLA 1RTIA 2IVPA 3FZKA 4LF8K 4WQ5A 3T69A 3RMDA 2A5XA 5AJ3K 2W6KA 1HJOA 3CJ7A 4CJWA 1NLVA 2O4GA 1P8ZA 4KHUA 1LWCA 1YHQN 3S3NA 2FC0A 3L0QA 3VOVA 1F21A 1TKZA 2NNWA 1U04A 5BRHA 5GIOA 3G6EN 4FJNA 4XH1A 3THXB 1NGCA 2A1RA 5EU7A 4BE7B 4I2QA 4EHTA 4H5RA 4CIGA 2VGNA 4AHRA 2GUIA 2YV0X 2A40A 3RRGA 5C24A 3T1HK 3CIPA 4H8KA 1TYQB 1NGAA 4J2EA 4KH4A 1RT1A 4PA1A 3ZETB 4JNEA 1HYSA 4YHHK 3CCJN 4PHTX 5AZIA 1WOQA 3OYFA 3TAMA 3LP1A 4H5TA 1C0FA 1W2BM 5JLHA 3ZCMA 2QWNA 1RILA 4XH5A 3HZ6A 4MDBA 4CJRA 4JKDA 2HBKA 3LDQA 1WBBA 2F96A 2HHIA 4B9QA 1I39A 2AP1A 4B3SK 4WFBL 1RBTA 3K9JA 5GAGP 3DOLA 4EFHA 3NCIA 4JN4A 1C1CA 3ZYYX 4FCYA 3TANA 3P5JA 4JKHA 4DQIA 3FZMA 3M8QA 3RSEB 4Z4EA 4JHDB 4PKHA 3O1WA 4BACA 2B4JA 1VSHA 2P9KA 4JI3K 3M5RA 2V51B 3IDHA 1M90O 1JLBA 4A62A 4FWKA 1NGBA 1NK0A 2HW3A 2EHGA 4A59A 4R5PA 1EWRA 4BDPA 5JS1A 2Z1JA 4Y0WA 3SBGA 3T1YK 3NH0A 1ASWA 3CQXA 1KTQA 2P9PB 3CCLN 1OH6A 3KK2A 2HHTA 1KC8O 1L5UA 3CJ1A 5M1FA 3OYAA 2WBNA 4JRPA 2BH1A 4CFCA 2BUPA 4JI4K 3RVCA 4UQGA 3IG1A 3O08A 4IJNA 4KB1A 2KZMA 1IKXA 4WYBA 4DTNA 5HRPA 3MK6A 1BISA 3T3FA 4IEIA 3KK1A 3NMUA 4L8RB 2B6AA 1K8KA 3AVBA 4FJJA 4CESA 2QKBA 3D2FA 2DY4A 3UKRA 1VRTA 2C1GA 1WNSA 2VWKA 3CQ8A 4CJUA 1SS6A 3WXMB 4CBUA 3D2EB 1KLNA 3BDPA 1RBVA 5AQFA 4OKJA 3ZSVA 3JYTA 2CH6A 4OKEA 4A5AA 1WSHA 4B8CA 3AVCA 1DLOA 3UE5A 1N33K 3CHWA 1VSFA 1QZ6A 3MAQA 1L3UA 3AO3A 1VAZA 1K8AO 3PO5A 3ULDA 3VQBA 4I2PA 4M42A 5AQIA 2YHWA 4CI6A 2QWMA 4FWPA 4BECA 3O4WA 5AQXA 3M8RA 2LSNA 4L3QA 3A5NC 2FBTA 3MXJA 2HHWA 1KVBA 1RBUA 3U3YA 5AQZA 4BR5A 3LM2A 3LM9A 2UUAK 4PKGA 4BQZA 5E41A 3JSMA 2J4RA 4CHNA 4CJSA 4E1JA 3K5LA 4JI1K 1TV6A 3CJ9A 4DFJA 1DEJA 3LDPA 3NVKA 4MO5A 2E2PA 3EEQA 4FWLA 1ATNA 5FPDA 4CGIA 4JKFA 5AQYA 4C8NA 3L2RA 3SPZA 5JMVA 3VA0A 2O8FB 1BG3A 4CFBA 1TVRA 3CCMN 3DXKA 1SKWA 2HNDA 2Q3SA 1TKTA 4BRDA 3DYAA 2NRZA 4CJQA 4AHSA 5J2QA 1BGXT 4W5NA 3HPGA 3EE8A 1X9MA 4BR9A 2D0PA 4E7IA 1Z26A 1RBRA 4DR1K 1VSKA 1LCUA 2QW9A 1ESVA 2DFFA 2KLAA 3THVA 4GV9A 4CZIA 3FZFA 4O5FA 2QEXN 3PUFA 2VWJA 1XMQK 3BF3A 3R6MA 4I6MA 4BROA 3G0ZA 5AQQA 3DLKA 1OKJA 3VQPA 4CGDA 2P9SB 1JCFA 1IKYA 1HLUA 4B8AB 5KI6A 5F1XA 4AHUA 3FGUA 3ISNC 3HOSA 2QTDA 1RFQA 5AZJA 3DJCA 4IFEA 4AILC 2H3GX 2E8AA 3TAPA 4I7FA 3C6UA 4UY8O 3QNOA 1YTUA 2O8EA 1MU2A 4EP5A 3QDKA 3QETA 2FF3B 1TKXA 4KREA 3N4PA 5F0XA 5FPNA 4DFPA 4BRGA 3O80A 2W40A 4CZMA 2HBMA 3F5TA 2GELA 4E7HA 4HCBA 3OHRA 3NGIA 1Z6RA 3M8PA 2P9PA 4BE0A 1WSGA 1VSMA 1T7PA 5J1EA 4LFCK 1VQNN 1NK7A 1C0MA 2NZTA 4BGAA 1FXXA 3HI0A 4LF9K 2HNZA 1L3SA 3HPHA 2UUCK 2HF3A 3VMFB 3VQ6A 5GADP 5BREA 1YJNN 2PFUA 2DFHA 5IT9O 2I7NA 3F73A 3OYEA 3SZ2A 2G8IA 4FLYA 4XEIA 2O8EB 4NB4A 4FSVA 2FBXA 4TSXA 4OGCA 3VEXA 4FJIA 1BQNA 3CJCA 2W6LA 4BREA 2XY7A 1JLQA 3CI5A 1TL1A 2VGMA 4DV3K 1EWQA 4FXDA 1D9DA 4M41A 4QOZB 3BY5A 4DTMA 4K42A 4CF0A 4O5BA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3HTV A;  4FJL A;  1YT3 A;  5KPR A;  1LW0 A;  4GVM A;  1VSI A;  3DLL L;  1O1W A;  4KTQ A;  2ZJQ L;  1B9F A;  3H1Q A;  3BEX A;  3C65 A;  2WOM A;  3QEP A;  4ZHR A;  3E01 A;  3VER A;  4B08 A;  2QA4 N;  1CZB A;  1RDD A;  4IKF A;  4DFM A;  2P9I B;  1VQ4 N;  4NXM K;  3VQ7 A;  4FOI A;  4MQ3 A;  3ZT0 A;  4BRN A;  3K9K A;  2QWQ A;  4FYD A;  3OYL A;  3ENO A;  1HYZ A;  3Q7C A;  4RW7 A;  4PY5 A;  1N5Y A;  5M1Q A;  1U2V B;  2E1Y A;  4DMN A;  3E66 A;  4E7K A;  4DF8 A;  2YKM A;  3THW B;  4CGF A;  5AQU A;  1MDU B;  4KB0 A;  3O9S A;  4KV8 A;  4YOU A;  4K8X A;  4O0J A;  4DSJ A;  3CYG A;  1X9W A;  1VSD A;  4FZY A;  3OW2 M;  1HNW K;  5M1K A;  4CEA A;  3G10 A;  3J81 O;  1S72 N;  3VES A;  1W7A A;  4ISE A;  3HP6 A;  4HVJ A;  1P90 A;  4B9S A;  2XRI A;  3DLB A;  3CFR A;  2I5J A;  3MWP A;  1VQO N;  5AQO A;  3O3F A;  3O8M A;  4DV7 K;  4JKA A;  3VQQ A;  1WUA A;  1ATR A;  1Y64 A;  3TR8 A;  4BC3 A;  1TAQ A;  3EL2 A;  4E7L A;  1IH7 A;  3WNF A;  1V4S A;  4FJ5 A;  2NUB A;  4B3R K;  2HVI A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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