4B1UB

Structure of the phactr1 rpel domain and rpel motif directed assemblies with g-actin reveal the molecular basis for actin binding cooperativity.
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
371
structure length
349
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Structures of the Phactr1 RPEL domain and RPEL motif complexes with G-actin reveal the molecular basis for actin binding cooperativity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 118
structure length 349
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4b1uB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4b1uB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4b1uB03
2A40A 3LM2A 3D7EO 3O08A 2IVOA 3CI5A 3I8BA 4PKGA 2Q1NA 3FZFA 4BR2A 2QWQA 3M1FA 1Z6RA 1NM1A 3ULEB 1NGFA 4FWLA 5BRFA 4B9QA 3U8XA 3DAWA 2YI1A 3A5NC 5AQOA 3SMPA 3A0IX 1X3NA 4I6MA 3CJAA 3R9PA 3VEXA 3O1BA 4A2AA 1XQSC 5EXWA 4GY2B 3ZX3A 4CZIA 4FWPA 5ADXH 1HUXA 4BVPA 3VEZA 1GLLO 3HSCA 2QWMA 2QWRA 2P9IB 3ZETA 3WEEB 1T44A 5BPLA 2P9KB 5AQQA 1NWKA 3AY9A 4FOEA 5AQHA 3ENHA 1Y64A 3EKSA 1LCUA 1QHAA 2GTDA 4FO0A 4Z94A 1C0GA 2J4RA 3EZWA 5AQFA 1YXQA 1NGGA 5AQSA 4QS8A 1JCGA 4O5FA 3UKRB 4EAHD 2Q97A 1CZAN 4BG9A 1NGAA 3B8AX 3DXKA 2V7YA 3VEYA 1NGCA 3VESA 3UE5A 3H3OB 2V52B 3MCPA 5AFUH 5BRDA 4K42A 1DKGD 4A2BA 5FPDA 5BN8A 2I7NA 4MO4A 1QZ6A 5KQ8A 4H0OA 3ULEA 5TKYA 2PBDA 2QM1A 4BC2A 2QWNA 1R59O 2VWBA 2Q0UA 1YAGA 3QB0A 5F1XA 2CGLA 1Q18A 5BPMA 1KAXA 3D2EB 4CZKA 3JS6A 5EX5A 2ZWHA 2P9IA 3WEEA 3TU5A 2IVPA 2QWLA 4QS7A 1E4FT 2P9KA 2EWSA 3FLCO 4K25A 2FXUA 4YDUA 4BRHA 3H45C 1NGDA 4FWSA 4BRGA 4DCHA 3ATVA 5KPTA 3QBWA 4PKHA 3WQTA 2OANA 1QZ5A 3UKRA 5BR9A 2E8AA 3L0QA 4IO8A 4BRQA 5AZJB 3G25A 1XUPO 3R6MA 3BF3A 1HPMA 3LDNA 4AM6A 4BGBA 2GUPA 3H3NO 2QXLA 3DJCA 3VEWA 3AAPA 5E26A 3A5MC 3VGKA 1HJOA 2KHOA 1GLFO 3LDOA 4EFHA 1S3XA 1NGHA 5BREA 1NGIA 5ELZA 3CJ9A 4BRCA 1BO5O 1E4GT 2P9SB 1NGEA 2P9NB 4BG8A 2D4WA 3AAQA 4HTLA 1MDUB 2BUPA 3IUCA 4MLHA 3D2EA 4JNEA 4WQ4A 2ZGZA 4DB3A 3GL1A 1KAYA 1NGBA 4LC9B 1GLDG 4M7XA 3H6EA 3QMLA 4BR9A 2CH5A 5FPNA 3F9MA 5AR0A 1JCEA 2D1KA 4BC4A 5KPRA 3A5OC 5F2RA 2A3ZA 2ASOA 5AQGA 5FPMA 3VF2A 4BRFA 4PL7A 5LJWA 3VENA 2NRHA 1ZXOA 5BN9A 3EO3A 1U6ZA 3LDLA 3MN6A 5AZJA 3SMSA 2Q36A 4MLEA 3BEXA 4IJNA 2PAVA 1ATRA 4FWRA 1GLAG 3HI0A 3ZX0A 3FZHA 4J8FA 4IZ9A 4A61A 4H0YB 1YUWA 2CGKA 2FSKA 1HX1A 1BU6O 3QICA 3GOIA 1KXPA 5CE3A 3C0BA 2UYTA 2P9SA 4BR4A 2P9NA 4PL8A 4CBWA 1QQOA 2HF4A 4BREA 2WUSA 1GLJO 5LY3A 4AM7A 3TPQA 4CJ7A 4ISEA 3H1VX 5AQPA 4B1ZA 1T6DA 3ZEUB 3BF1A 1ESVA 3ENOA 4FWQA 5AQTA 1G99A 3UB5A 3I33A 3LM9A 3MN5A 3U9ZA 4BR7A 5B8HA 4H5TA 4BRMA 3JXUA 3VGMA 4CZEA 4FPBA 3GE1A 3LL3A 3CHWA 4F9OA 4O8KA 4CD3A 3DXMB 5AQXA 5ADXA 3O6WA 3HM8A 3A8YA 4RWTA 4EHTA 4XH5A 4CZGA 4M7YA 5E84A 3W0LA 4CBUA 3HTVA 4BRNA 1S22A 4BRDA 3VF4A 4BR5A 3O1WA 4KBOA 2QWPA 2P9UB 2H3GX 1BDGA 1DEJA 2FLOA 3KZBA 3SK3A 4CI6A 3FZMA 4WQ5A 3QDKA 4EIAA 3ATUA 5AZIB 3MMVA 4H0TB 4Y0WA 2QWOA 3ZEUA 3A5LC 4FWKA 1MWKA 5AQUA 3CJ7A 2FF6A 2QW9A 5AFUA 4H5VA 2E1ZA 2HOEA 1HKBA 3CQYA 1SAZA 3D2FB 1ATNA 2AP1A 2E88A 3WXLA 4CZFA 5JLHA 3WXKA 5AQJA 3SLCA 3VGLA 3WUHA 3LDQA 4FPAA 5KQDA 2YJEA 3CJCA 4BRLA 2Q31A 1H1VA 3DXMA 3U9DA 4B1WB 2D0PA 4NO7A 2E2PA 4JAXA 1BOTO 4IXCA 1KAZA 1D4XA 5AQMA 3VOVA 1SZ2A 3VEOA 3KVGA 4B1YB 1HKCA 2ITMA 1NLVA 3MDQA 4QS9A 4BVOA 2F9TA 2P9UA 1MA9B 1RGIA 4FWOA 1TUUA 1OKJA 1ATSA 1BWFO 3O4WA 3UKUB 3DWLA 4B1XB 5LJVA 2VCPA 1X3MA 5AZIA 3FZLA 3QBXA 4BRIA 1QQMA 3CIPA 5BRHA 1ZC6A 5AQNA 1WOQA 1YVNA 4EHUA 2V51B 3FGUA 2W41A 2GWKA 4C23A 3GG4A 3AARA 1NGJA 3D2FA 1K8KB 5EY4A 2YJFA 2FF3B 1IG8A 3VPZA 2A6AA 4NB4A 3S41A 3W3DA 2ASMA 2P9PB 4CZLA 1V4TA 4FWMA 4JHDB 4YDUC 1GLCG 2I7PA 3BP8A 2YCHA 3GDQA 5JMVA 1V4SA 1GLEG 4BC3A 2FSNA 2YHYA 4PKIA 4BRPA 3EL2A 3IDHA 4JN4A 2D0OA 5EVZA 2ASPA 3WXJA 3UKUA 1J6ZA 1NBWA 5AQIA 3MN7A 1LOTB 3WQUA 1TYQB 3ID8A 4H0XB 3M6GA 3L6QA 5I9EB 3M3ZA 4BROA 4CBXA 3BUZB 4BQZA 4H03B 4HWIA 5BPNA 2FSJA 3WXIA 1SQKA 4MO5A 5AQVA 2V7ZA 3MN9A 2AA4A 2Q0RA 2GWJA 3WT0A 1K8KA 2E2NA 3FZKA 4IWVA 3J8AA 4WQ4C 3HBTA 5AQRA 2NZTA 2VYPA 3O5BA 3QFUA 4FSVA 1BUPA 2P9PA 4JHDA 3O8MA 2A42A 3QFPA 4XEIA 5AQLA 4BRKA 1QQNA 3L4IA 1WUAA 4DQ8A 1DGKN 4FWNA 4RTFD 3R8EA 2P9LB 4BQLA 5AQZA 3U4LA 2HF3A 4JD2B 2F9WA 5F0XA 1Z05A 2IIRA 4IJAA 4K41A 1BA0A 4H5WA 5EOYA 2CH6A 4ISFA 2E1YA 1T6CA 2E2QA 4RCHA 4CD1A 4BC5A 2YHWA 1TYQA 3VERA 3H46O 3CERA 2NLXA 2W40A 4B1VA 1P8ZA 2E2OA 2BTFA 4A62A 1RFQA 4H5RA 3RSEB 1U2VB 3C7NB 3CJ1A 3EKUA 3SJHA 4K43A 3MK6A 3P4IA 5AQKA 3VETA 4H0VB 5JICA 4E1JA 1XC3A 4L3QA 3VEVA 3EN9A 5AQWA 4BGAA 1IJJA 2E20A 4H0PA 3ZX2A 1HKGA 2DPNA 3KHYA 2ZF5O 2Q2RA 1ZBSA 5AQYA 2P9LA 4CZMA 4JD2A 2CGJA 4I6MB 2HMPA 3HZ6A 1NMDA 4H5NA 3GBTA 4DHYA 5KPZA 1C0FA 3LDPA 3FFKB 3CQXA 3CJBA 3O80A 5FPEA 1HLUA 1MWMA 5JLFA 1RDWX 4M63C 3ZETB 1BG3A 3IFRA 2YHXA 4WYBA 2GELA 2IVNA 4XH1A 1JCFA 4FOIA 4CZHA 4B1UB 1EQYA 2ZGYA 3FR0A 4XH4A 3RSEA 4GNIA 1U2VA 3CETA 3C7NA 3IMXA 4BRAA 3H1QA 4ISGA 2GEMA 4CZJA 1TUYA 4FL9A 3VF6A 1X9JA 2A41A 1BA1A 3OHRA 4WQ5C 1GLBG 3FE1A 2A5XA 3DXKB 4BR0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D7EO 4CK1A 2PFUA 4B08A 4PKGA 4JRQA 2QWQA 1E3MA 1NM1A 1RBUA 4CJ3A 2YI1A 2OA8A 4OX9K 3A0IX 4NLCA 1W0HA 1IBMK 4Z4IA 2IOCA 2KFZA 1XQSC 1ZBUA 2RE2A 4CHOA 4X62K 3NE6A 1KFSA 5ADXH 1HUXA 4BVPA 3VEZA 2O8FA 2QWRA 4FJXA 5KGWA 3HP6A 2IGIA 3AY9A 4FOEA 4DQSA 2DY4A 2J4RA 5MLCQ 1S1TA 1VQMN 3QEVA 5AQSA 4QS8A 4AHTA 2Q97A 3B8AX 5I3UA 5CR4A 2V7YA 1NGCA 5SWMA 3H3OB 5LMUK 5AFUH 3AO5A 4ELTA 5FPDA 4CJEA 4JKAA 4LF6K 5AJ3K 1Z26A 1O13A 4CF2A 2PBDA 2YKMA 3LWLA 2Q0UA 1VQ6N 5F1XA 3SUNA 3ALYA 5BPMA 1WB9A 4JI7K 4KHWA 4CZKA 3QIPA 3JS6A 5EX5A 3VA3A 4DU1A 4U7BA 1L3SA 3AVFA 2F8SA 2P9IA 3KK2A 3WEEA 1KRPA 3FLCO 4K25A 2FXUA 3T1YK 3LZIA 1HMVA 4FVMA 4IOCL 4BRGA 4KO0A 1FJGK 3K0SA 2ZJRL 3UKRA 4IO8A 3R3LA 3VQDA 4E72A 3DLGA 1NKBA 2QXLA 3DJCA 4DQQA 3V81A 3AAPA 2FBXA 3SCXA 1HJOA 3HSTB 2KHOA 1GLFO 3AO2A 1FXXA 1NGHA 4CESA 1NGIA 4JKHA 1KVBA 3CJ9A 1U49A 4J2EA 2D4WA 4G9ZA 3ZT0A 3MEDA 3D2EA 4HCCA 3M8RA 4DB3A 4AH9A 3PO4A 3KTQA 3H6EA 4BR9A 2WBNA 4CIFA 4GVMA 4BC4A 3C6AA 3A5OC 3VQ5A 5F2RA 1L3TA 3VA0A 1ZXOA 3OYAA 3M8PA 3WNFA 4W5NA 3PIPL 3CC4N 5AZJA 3MN6A 3SMSA 4MLEA 3G71N 1NG9A 2IC3A 4CEEA 4WF9L 3AVKA 4DUYK 2Y1JA 1K73O 2HHUA 4IG0A 4A61A 4Y1CA 1YUWA 3QICA 1BU6O 1KXPA 3T19A 3C0BA 4R79A 4PL8A 4CBWA 1KLNA 4FJKA 5LY3A 4DTUA 4AM7A 3H1VX 3DLRA 3G4SN 3OA9A 1FW6A 1T6DA 3BF1A 1ESVA 4IDHA 2YNHA 4FWQA 3VQ8A 4KREA 3UB5A 4JKGA 3I33A 3U9ZA 2WONA 4H5TA 3L3UA 1RBTA 2HVHA 3CCLN 2UUBK 3PO5A 1VQNN 4O8KA 1RBRA 4ILGB 3AVIA 2GBZA 1JXBA 3OVNA 4CK3A 3A8YA 1NK4A 3V9WA 3HTVA 4BRNA 3HPGA 3SZ2A 3NF7A 4KBOA 3MXMA 2I5JA 3VQQA 3O9SA 2FLOA 3QLHA 3JSMA 3FZMA 4CJWA 3V1RA 1HJRA 1VSKA 3ATUA 3MMVA 3EE9A 3OYNA 3V4IA 3N4PA 4Y0WA 3LP3A 2OPPA 1X9MA 2UU9K 2QWOA 3ZEUA 1MWKA 5AQUA 1FKPA 1ASVA 4DV0K 4PUOA 4FZXC 2O8BB 3AA5X 4H5VA 3L4QA 2W6LA 3WXLA 1ATNA 5JLHA 5AQJA 3SLCA 1KTQA 3WUHA 2YJEA 3O3GA 4O5BA 1K6YA 3O9TA 3DXMA 3D0PA 1BOTO 4ICLA 1QE1A 3SAFA 3OY9A 1TK8A 3KVGA 4B1YB 3KLFA 3I0SA 3MDQA 4QS9A 4CJUA 4BVOA 2BGGA 4OLAA 4CE9A 1RGIA 2QK9A 3N4QA 1TUUA 1OKJA 1BWFO 3UKUB 5LJVA 1UA0A 4M3TA 3PY8A 4BRIA 1SKRA 2GX9A 1QQMA 2HNDA 2OPQA 1ZC6A 5AQNA 4CJVA 1KQSM 4LH4A 3AA2A 1LAVA 1LW2A 4MDAA 4JKBA 3ZYYX 3VN5A 4M42A 1TAUA 1NJXA 3SBGA 3PLAA 3P83D 3VQ7A 3SUOA 4HTUA 5CZ2A 4FK4A 3KK7A 4LH5A 1N34K 3AA4A 1T03A 2O4IA 3ASMA 3S41A 3THWB 5HRSA 2P9PB 1V4TA 4V19S 4JHDB 1GLCG 2LSNA 1U04A 5JMVA 5A2QO 1VAZA 3AVLA 3BZCA 4KFBA 1A5VA 4DS5A 2G8KA 2BANA 4BRPA 1RT5A 1RILA 2O8CA 1S9GA 5HROA 4OO1J 1I3AA 2D0OA 4YOXA 4X66K 4R5PA 3HPOA 1VQ9N 3TI0A 3LP2A 1HYSA 3TAQA 2XY5A 5M1QA 1SL0A 4PY5A 3ZCMA 3M6GA 3L6QA 5I9EB 3LP0A 4HHTA 1EO1A 4FJHA 2UUCK 4I9LA 5J1EA 3CM6A 3ITHA 5BR8K 4JYAK 5FROA 4MO5A 2YV0X 1IBLK 3NF8A 1KD1O 3FZKA 3QEWA 3QINA 1QTMA 5KRSA 3DRPA 4CHNA 3HBTA 4CJRA 4RW7A 2O8DB 3O5BA 2VWKA 3QFPA 3O9QA 3V1OA 3CXCM 1YITN 4O4GA 4H8KA 1DGKN 4B3MK 1T8EA 4DFMA 3U4LA 4CK2A 4JD2B 4F2RA 3CCMN 5F0XA 3U6FA 1Z05A 4K41A 4IDKA 4Q5VA 4FJIA 2E1YA 4DTOA 5HOOA 1C1BA 3K5LA 4OLBA 1KFDA 1TYQA 4DU3A 1XC9A 3ZSWA 1RFQA 1SL2A 3VQBA 3C7NB 1VQ8N 4CECA 3SJHA 4C1NI 3TTCA 3RR8A 4F8RA 1R0AA 1Q82O 3V9UA 5CYMA 3AVJA 2D0BA 1HQUA 4CFBA 4E1JA 4L3QA 4LD0A 3VEVA 1NJZA 5AQWA 4H0PA 1HKGA 3AO1A 4OPKA 3V6DA 1ZBHA 4DV7K 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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