2P9LB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
203
structure length
201
Chain Sequence
IQAVLTLYAQGLGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
molecule keywords Actin-like protein 3
total genus 54
structure length 201
sequence length 203
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9lB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9lB02
2ASMA 4JAXA 3EL2A 1NGBA 4K25A 1ATSA 4KBOA 5AR0A 3VOVA 3SK3A 4B1ZA 4BR4A 2CH6A 4WQ4C 4BROA 1Z05A 1T6DA 5AQKA 4FOEA 4BC3A 4MO4A 3ZEUB 1YUWA 5AZJA 3UE5A 4WQ4A 3KZBA 4H0XB 3SLCA 4BGAA 4H0OA 3QB0A 3HZ6A 3CI5A 2Q31A 3R8EA 5BPMA 4ISEA 3H46O 4H0PA 4BG9A 2CGLA 1KAYA 5AQMA 1QHAA 3H3OB 3WXIA 5FPDA 3VGLA 3WQUA 3U4LA 3SMSA 4JHDB 3HTVA 5AQGA 4FWRA 2GTDA 2QWOA 2F9WA 4DHYA 2PAVA 2A42A 3MN5A 4BQLA 2Q1NA 4CBWA 1QQMA 5AQJA 2P9UB 4B1UB 2GELA 5AFUA 5AQFA 3LDOA 3LM2A 2KHOA 3EO3A 3FZFA 1IG8A 3UKUA 2QWLA 1G99A 4Y0WA 3H1QA 5FPMA 1HJOA 1TYQB 3M1FA 4I6MB 4RWTA 3FR0A 2ZWHA 1U6ZA 3BUZB 3A8YA 2GEMA 3O1WA 2P9NB 2QM1A 1QQOA 4HTLA 4H0YB 3C7NA 3C0BA 1BO5O 3DXMA 5BREA 3ATVA 1BU6O 1Z6RA 5FPNA 4NO7A 1V4TA 4QS7A 1ESVA 4BRNA 2GWJA 1NM1A 3DXKA 1OKJA 4BR9A 2P9KA 3UKRA 3ZETB 1S3XA 4BC2A 1GLAG 2A6AA 3JS6A 1NGJA 5AZIA 1ATNA 1K8KA 1BA0A 3M6GA 5EXWA 4O5FA 4M63C 3WXLA 3VEOA 5F1XA 4IWVA 4RCHA 4BRFA 3CJAA 1HX1A 5AQPA 3VETA 1Q18A 2H3GX 4BRIA 1BOTO 3HSCA 3ULEB 4CI6A 2P9PB 4BG8A 4BREA 3VEYA 5BN8A 2UYTA 1SZ2A 5EOYA 2IIRA 3O4WA 4A2BA 1DEJA 1E4GT 3EKSA 5AQRA 2CGJA 4CZKA 1XUPO 4H5NA 3RSEA 1H1VA 3J8AA 3MN9A 5F2RA 3FZKA 3M3ZA 2YJEA 2AP1A 3KHYA 1MWKA 3VEXA 4F9OA 3VF6A 1HKBA 5BPLA 1X3MA 1DKGD 1NWKA 1BWFO 2QWPA 4JN4A 2P9SA 3VPZA 3L6QA 1KAXA 4Z94A 4BRAA 1P8ZA 2HOEA 2P9LB 3VF4A 4BR5A 3O5BA 4FWLA 1YXQA 4H5RA 3W3DA 4E1JA 2CGKA 4BVOA 4CZEA 4FOIA 4PL8A 4FWSA 4CD1A 2ITMA 4BRMA 3CJCA 4FWPA 2A5XA 2HF3A 4BRDA 3GE1A 1RDWX 5AQQA 1X3NA 4A2AA 1GLLO 2D0PA 3UB5A 4CJ7A 2E1YA 2FSJA 4BRHA 3S41A 4C23A 4PKHA 5BRFA 3LM9A 1HLUA 4BR7A 4BQZA 2W41A 4JD2B 3EZWA 3QBXA 4CZLA 3GDQA 4H5WA 2BTFA 3U8XA 2YHYA 4FSVA 2PBDA 4M7XA 2YHWA 4PKIA 3WXJA 1T44A 4FPAA 1KXPA 3D2EB 3FFKB 3MN6A 1GLDG 1BUPA 4XH4A 3TU5A 3JXUA 5BN9A 3WT0A 4JNEA 4J8FA 3GOIA 3O8MA 5TKYA 4HWIA 2Q97A 2VWBA 2V7YA 3EN9A 3KVGA 2ZGYA 5CE3A 5KQDA 4H0TB 3B8AX 2QWRA 3AY9A 4IO8A 4BVPA 5AFUH 3CJ1A 2E1ZA 5BPNA 3LDLA 2E8AA 1ZXOA 2Q2RA 4FWKA 1C0FA 4WQ5A 5AQWA 5JMVA 4GNIA 2QWQA 4CZIA 1U2VA 5AQOA 3FZHA 3AAPA 3WEEA 2D4WA 3G25A 2D0OA 2I7NA 4QS9A 3CJBA 1T6CA 5E84A 3A5MC 2IVNA 2HF4A 3FE1A 1HUXA 4BRQA 2P9IB 2QXLA 3R9PA 2V7ZA 2YCHA 2YHXA 4BR0A 2E2QA 3BF1A 4L3QA 1MDUB 3LDPA 3LDNA 1HKGA 4BC5A 2QWMA 4BC4A 4M7YA 3D2FA 5EY4A 2AA4A 4NB4A 5JLHA 4WYBA 5AQSA 1HKCA 1XQSC 3QFPA 2Q0RA 5ADXH 3MCPA 1NGDA 4QS8A 1BDGA 4H0VB 1EQYA 1LCUA 2NRHA 2P9LA 3IFRA 4FWNA 3SJHA 1NMDA 4CZMA 3VESA 4A62A 5LY3A 3LL3A 4DCHA 1Y64A 1GLEG 1QQNA 5JICA 2FF3B 3P4IA 3ZEUA 1ATRA 4B1YB 3BF3A 5AQUA 2VYPA 3VF2A 1NGAA 3W0LA 2FF6A 3CJ9A 4A61A 5KPRA 2E2NA 2GWKA 3WXKA 4ISGA 1RFQA 5ELZA 4EHTA 2OANA 4AM6A 3CIPA 3HBTA 4EFHA 3H45C 3CQXA 1R59O 2P9KB 4JHDA 4IJNA 5AQXA 4DB3A 5AZIB 4CZJA 3QDKA 2ZGZA 1K8KB 4BRPA 2V52B 4H5TA 4K41A 4CZGA 3O08A 1V4SA 4MLEA 1E4FT 4CBUA 1NBWA 3GG4A 3L4IA 4EHUA 4FWMA 1ZC6A 4IJAA 4BRCA 1TUYA 3H1VX 2P9UA 1MA9B 3IDHA 1BG3A 2VCPA 2A3ZA 3VERA 1JCEA 5E26A 3IMXA 3ENOA 3SMPA 1QZ5A 3BP8A 3CQYA 2DPNA 4YDUA 4FWOA 2FSKA 1NLVA 1TYQA 4I6MA 3RSEB 4B1XB 4MLHA 3AAQA 3VEZA 1DGKN 1LOTB 1SQKA 3DJCA 1YAGA 1GLBG 2HMPA 2FLOA 4GY2B 5BRDA 3CETA 2P9NA 4XH1A 3CERA 3L0QA 3MDQA 3AARA 3QICA 5KPTA 3O1BA 3A0IX 4IXCA 2IVOA 3CHWA 3FZMA 3I8BA 4FO0A 3FGUA 2P9SB 1GLFO 3O6WA 4BRLA 4EIAA 4XH5A 2P9IA 1NGCA 2ZF5O 4WQ5C 3I33A 3MK6A 2J4RA 3DAWA 3ZETA 3FZLA 3U9DA 4B9QA 4BRGA 5LJVA 1ZBSA 3HM8A 5AQVA 3MMVA 5EX5A 4PKGA 5AQYA 5AZJB 1S22A 3HI0A 5KQ8A 5F0XA 4B1WB 1JCFA 3GBTA 3QFUA 2YJFA 5EVZA 3ZX0A 5AQZA 4CZFA 3QBWA 2ASOA 3WQTA 1NGEA 5LJWA 5AQHA 1NGGA 3GL1A 3LDQA 4RTFD 4BR2A 2NLXA 3ZX2A 4MO5A 5JLFA 2W40A 2YI1A 1GLJO 3H6EA 2WUSA 2EWSA 3ULEA 4CBXA 1SAZA 2P9PA 3EKUA 4XEIA 1NGFA 2A41A 4O8KA 2Q36A 3A5OC 4K42A 1XC3A 2I7PA 1NGIA 3TPQA 5BR9A 3U9ZA 1WUAA 3A5LC 3D7EO 1WOQA 5BRHA 1GLCG 1BA1A 3ID8A 4ISFA 1JCGA 2V51B 3VEWA 5B8HA 1CZAN 1NGHA 3UKUB 4H5VA 2BUPA 2E20A 5AQIA 5AQNA 4IZ9A 4PL7A 3BEXA 4DQ8A 4EAHD 3WUHA 4LC9B 5ADXA 3A5NC 2FXUA 2E88A 4B1VA 3DWLA 5AQTA 2NZTA 3ATUA 3QMLA 2FSNA 1X9JA 1U2VB 2A40A 2E2OA 3CJ7A 3C7NB 3WEEB 3VEVA 3FLCO 3DXMB 1D4XA 2IVPA 2GUPA 4FWQA 4FPBA 1HPMA 2ASPA 3H3NO 1YVNA 3VGMA 4JD2A 4BRKA 3OHRA 3VENA 4CZHA 3DXKB 1RGIA 2D1KA 4FL9A 4BGBA 3UKRB 3ENHA 4K43A 3MN7A 3ZX3A 3F9MA 1MWMA 4AM7A 3VGKA 5AQLA 2F9TA 1IJJA 2QW9A 3IUCA 4CD3A 2E2PA 1QZ6A 2QWNA 3O80A 5I9EB 3D2FB 1C0GA 3D2EA 4H03B 2Q0UA 5KPZA 5FPEA 1J6ZA 1KAZA 2CH5A 1TUUA 3R6MA 4YDUC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ASMA 5AR0A 3VOVA 4CJQA 4DSJA 3KD5E 4BR4A 3C6TA 4I2QA 4WQ4C 4O4GA 4KHSA 4FXDA 1EP4A 3VQEA 3CCVN 4M3UA 4E89A 3CFRA 4PWDA 1BIUA 2PYLA 1E3MA 3LP2A 1YITN 3HPOA 1KAYA 1QHAA 3PIOL 5KRTA 3VGLA 3U4LA 3SMSA 3NH0A 2YNHA 3HTVA 5AQGA 1N32K 2I5JA 1TKTA 3DLLL 3U3YA 2D0AA 3CF5L 2XY6A 3P31A 3T1HK 3QEVA 4CBWA 1QQMA 4CIGA 5AQFA 3LM2A 5EU7A 1VHXA 2KHOA 4FJMA 2QWLA 4LSLA 1JLQA 3IAYA 4DQSA 3QEIA 3JAMO 4I6MB 1NJYA 3L2UA 1X9SA 2BGGA 4XIUA 2ZWHA 1J5EK 3CFPA 1WLJA 1BI4B 1B9DA 4F2SA 1RBTA 1S72N 1OVQA 3RR7A 1TGOA 4DV3K 4YOXA 4CVNE 2X78A 4QS7A 3SAHA 3O3FA 4BRNA 3SUNA 1OKJA 2P9KA 2RHKA 3ZETB 4BC2A 1GLAG 3NF7A 1TK0A 1WAFA 4B3TK 4JI6K 3L4QA 1BA0A 2ZM6K 3I56N 3NF8A 3E9LA 2YHAA 2EHGA 4JI7K 3K2PA 4BRFA 3T7ZA 3HVRA 4CIEA 5AQPA 4QCLA 1Q18A 4BRIA 4B9MA 3AO3A 4BG8A 1L3VA 1SZ2A 2IIRA 1DEJA 3OYIA 3VA0A 4FJXA 5F2RA 3CG7A 3M3ZA 3VEXA 4ID1A 4JI3K 1N34K 1NWKA 5HLFA 1BWFO 4QOZB 4DU1A 5J2MA 3CC7N 3IKMA 3V6DA 2HOEA 2QXFA 2F8TA 4DV4K 4FJHA 2X74A 4FJ8A 1NG9A 4PL8A 4KHNA 3AVAA 3THYA 2F4VK 2A5XA 2HF3A 1RDWX 4M3TA 3DRPA 2D0PA 2E1YA 1JKHA 2YKNA 4C23A 3LZIA 2W41A 1FXXA 3MECA 3T19A 3QBXA 4DTNA 4FW2A 4FSVA 4MDBA 4BE2A 3EE9A 2YHWA 3SBTA 4FLVA 4Z4CA 4J2BA 3SV4A 2Z1IA 4V19S 1TK8A 3JXUA 1ASUA 5C0YA 3DRSA 3AGKA 4CJVA 1BL3A 5TKYA 2Q97A 3NGZA 1Q81O 2VWBA 2RPIA 5CE3A 4OX9K 3DLEA 5KQDA 3ZSOA 4BVPA 4CEBA 4IDKA 5BPNA 3LDLA 1IH7A 2Q2RA 3AVKA 3KK3A 2P5GA 1Z26A 3HO1A 5M1PA 4JKBA 3F2KA 4PY5A 1XMQK 4IBNA 2D4WA 4CHPA 1A5WA 3RR8A 3E9OA 2WFBA 1T6CA 3CPEA 3O4NA 3QESA 3A5MC 2O8EA 3FE1A 3C65A 2YHBA 2P9IB 2QXLA 4LH5A 4GVEA 2YCHA 2YHXA 3NVMA 4BR0A 1W97L 4L3QA 4LF9K 3LDNA 1HKGA 3OS0A 3MXIA 3D45A 5EY4A 4FVUA 5C25A 4AQYK 4EZ9A 4WYBA 5AQSA 3V81A 1HKCA 3QFPA 1VSJA 4FYDA 1NGDA 1N36K 1Q9YA 4H0VB 3IFRA 2NRHA 1NMDA 3PUFA 5HP1A 1RBVA 4DCHA 1OH8A 1UA1A 1KVBA 1Y64A 3KK2A 3RMCA 4DLEA 1S6QA 4K8ZA 3BF3A 4FM2A 3QLHA 1J9AA 4HCCA 2O8BA 1BQMA 2IS3A 4FJGA 2O8FA 2VG6A 3V9XA 1NGAA 3W0LA 3SJJA 3SAGA 3SI6A 4AILC 4LFBK 3CJ9A 4A61A 5KPRA 3WXKA 5ELZA 3D6RA 5D3GA 2OANA 1RDUA 2KW4A 3E01A 2P9KB 4IJNA 5AQXA 4Z4HA 3QEPA 3M8PA 4E0DA 1P90A 4CZJA 3L2QA 3QDKA 3K57A 3AVIA 3U6FA 3CM5A 1JLCA 4CZGA 4JK7A 3MEEA 4NYFA 1VK0A 4DU4A 3TARA 4YFUA 1E4FT 4CBUA 4LFCK 1M90O 2DFFA 4IJAA 4IOAL 1TUYA 1NK5A 2VCPA 3CM6A 4CF1A 2VQFK 1FKPA 1CZ9A 1JLAA 3CQYA 2D0CA 4FWOA 1TYQA 3VA3A 1DGKN 2QKKA 4L8RB 1KLNA 3LPTA 4KHQA 2YKMA 1GLBG 4GY2B 1U49A 3L0QA 1NJWA 5KPTA 3AARA 4ELUA 2IVOA 3CHWA 4N5SA 3I8BA 4CHNA 4DR1K 2YX6A 1WSIA 1RTJA 3O6WA 4BRLA 4DV2K 4EIAA 1RDDA 2G8VA 2ZJPL 4M3WA 3V9WA 2ZF5O 4JKDA 3I33A 2J4RA 3U9DA 4WFAL 4BRGA 5LJVA 1ZBSA 4PKGA 1Q82O 4OPJA 3TR8A 4CJ3A 4B1WB 3HSTB 3THYB 4CF8A 1VQ4N 5EVZA 5AQZA 2ASOA 3WQTA 3LDQA 3PLAA 1XNQK 1T03A 5C12A 1GLJO 2IAJA 2EWSA 3EKUA 4XEIA 3ZT0A 1HYZA 5GAHP 2VWJA 4FJNA 4ELVA 4C8MA 4W5RA 4RW8A 1WOQA 4KKOA 3VQCA 5HL7L 3VEWA 1NNEA 4RG8A 4GKKK 1HQEA 1NGHA 1M1KO 2E20A 2D5RA 4KH5A 3ISNC 3MX2A 4PL7A 2ZD1A 3KIOA 1ILYA 3RWUA 1NU0A 1KRPA 3DWLA 1RTHA 1IBMK 1HNIA 1X9JA 3OBWA 3AVGA 4DTRA 1D4XA 2IVPA 3K5OA 3E9PA 1WBDA 2ASPA 2O8EB 2NRZA 1JLBA 4JD2A 4BRKA 3OHRA 4OJRA 4OO1J 4BGBA 4I7FA 1K73O 3F9MA 1MWMA 1BQNA 3EEQA 1LWEA 4AM7A 5AQLA 4ILGB 4CD3A 4KHPK 1DT9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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