3T7ZA

Structure of methanocaldococcus jannaschii nop n-terminal domain
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
119
structure length
119
Chain Sequence
MIYVTFTPYGAFGVKDNKEVSGLEDIEYKKLFNEEEIPDIMFKLKTQPNKIADELKEEWGDEIKLETLSTEPFNIGEFLRNNLFKVGKELGYFNNYDEFRKKMHYWSTELTKKVIKSYA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Protein binding
source organism Methanocaldococcus jannaschii
publication title Structurally Conserved Nop56/58 N-terminal Domain Facilitates Archaeal Box C/D Ribonucleoprotein-guided Methyltransferase Activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nucleolar protein Nop 56/58
total genus 40
structure length 119
sequence length 119
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.220 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3t7zA00
3ID6A 3NVMA 2NNWA 4BY9C 3T7ZA 3NVKA 3NMUA 5GINA 5GIOA 3PLAA 5GIPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OPSA 1NJXA 4QAGA 3SZ2A 3DOKA 4CJVA 2ZWHA 1S6PA 2AP1A 2D5RA 3AVHA 5T7BA 5AQRA 4WYBA 3CC4N 5M1QA 1YVUA 4FJLA 4FWRA 5AQUA 5FPMA 3D2FB 3C6AA 5EOYA 1KRPA 3TAGA 1K8KA 4B1ZA 1L3VA 3QESA 4OGCA 4CJ3A 3PIOL 5AQFA 3AO3A 2NLXA 1NK7A 3B6OA 1NJZA 4DCHA 1NK6A 4KREA 4CJRA 5CR4A 1CLQA 3MAQA 1OH5A 4H4OA 3C6TA 1QE1A 4JV5K 4CECA 3MEDA 2GWKA 2DFFA 3O9RA 5JICA 3AVAA 4KH5A 3KK1A 4CF9A 1XC9A 1IV0A 3RTVA 2IVPA 1QQOA 4M3UA 2O8FB 3TTFA 1YVNA 2G8UA 5D3GA 5AZJA 1BQMA 3K9JA 4CIGA 3QEWA 3SMPA 4I9QA 1J5OA 1MU2A 1NK4A 1QZ5A 3OYNA 4GVMA 5AQQA 3CCQN 4H8KA 2RF2A 4OKKA 1HLUA 1ASVA 4DS4A 5BR8K 4IXCA 3ZX0A 4QS9A 5FPNA 4FJ5A 5J1EA 5JLFA 4DHYA 3SBGA 3VEOA 3DXMB 4JAXA 3QDKA 2GX9A 2B4JA 3KLIA 5LY3A 1JJ2M 2O8CB 1GLAG 4FWKA 2YHYA 2UUAK 2B6AA 3PIPL 3RVCA 2O4GA 4FW1A 1D4XA 4KHNA 1VSHA 4YNQA 3DI6A 4XH5A 2NRHA 5LJVA 4BGBA 3VN5A 3LDOA 4H0VB 1QSSA 4N56A 3VA3A 1NK9A 1HPMA 3QMLA 4MDAA 4NLCA 4BDYA 3BDPA 3C0BA 3M8SA 3O6WA 1GLDG 3S3NA 3KKRA 3L2VA 1RT4A 4CHOA 2ITGA 4JS5A 4IKFA 2KFZA 1QSYA 2GTDA 1IKYA 1X9SA 4O0JA 3MEGA 3IG1A 1BG3A 1GOBA 3EN9A 4Z0UA 2ZGYA 5C24A 2VQEK 3G0ZA 3CCRN 3R6MA 1RBRA 3I55N 4ISGA 1FK9A 1S22A 1O1WA 1LCUA 5SZTA 1VAZA 4KHYA 4QOZB 4RG8A 2ATQA 3ISNC 1KTQA 1XHXA 5IT9O 1IG9A 2VWKA 2E6LA 4HUFA 4IDHA 3VENA 4BRCA 2HHHK 3IDHA 4FM1A 1V4SA 3MDQA 3IUCA 2OCEA 3NFAA 2OPRA 4PY5A 3SQ1A 2GBZA 1RTIA 1JKHA 2VGMA 4KH4A 3KLGA 3J8AA 4DR1K 4KV8A 2P51A 3U6FA 4M3XA 3BP8A 3O9TA 2UXDK 3KK7A 4C8KA 4DS5A 1RT5A 5LMNK 4X66K 1K9MO 2ZF5O 4IOCL 1TYQB 1S1TA 4N76A 4FWSA 4KHUA 4FZZA 1QHAA 3ZEUA 3MCAB 1HX1A 3THXA 3OYMA 1NJWA 2OZSA 3KZBA 4FLVA 2PYLA 4FWMA 5HRSA 3GG4A 3TR8A 4NYNA 1GLCG 1ZBUA 1RNHA 4CW7B 4X65K 4BRLA 3CQYA 3OS1A 1KCFA 4BVOA 1IBKK 4KHPK 1VQ6N 2PBDA 1KAYA 1W7AA 1W9HA 5GAGP 2HMIA 3U8XA 5H1SQ 3LDSA 4O5FA 1Q86O 4H4MA 1TL3A 4O0IA 4LF8K 4CJQA 3VEXA 5AQKA 2XO7A 5AJ3K 4CK1A 2FBXA 3PUFA 3Q7BA 4QCLA 5AQVA 4LFAK 4Q5VA 3SPYA 3C95A 4DV0K 1T6CA 1XMOK 2G8WA 4FJ8A 3VQAA 1JLBA 3C65A 2ZM6K 1ZBHA 1KAZA 4CJLA 2R7YA 1N34K 4YORA 3HJFA 1FXXA 3KIOA 3WXLA 3PSIA 3FZMA 3RMAA 4FJGA 3ZSQA 4LH4A 2V7ZA 3BZCA 3MK6A 4JKAA 4YOXA 2I7PA 1XWLA 2HF3A 1E4GT 3DLRA 4MO5A 4B3OA 4NO7A 4E7HA 4OX9K 1BO5O 1RDUA 5C10A 3SNNA 3D2EA 3B6PA 5AZIA 4FLUA 1KSPA 1IO2A 2IS3A 2B5JA 4M3RA 2FBVA 3DRSA 3OYAA 1TKTA 1YIJN 1YTUA 5LMUK 5ELZA 1Z26A 1QVFM 3RMDA 1SQKA 3L8BA 4DFKA 2O8DA 1P90A 3FFKB 3P38A 1C1AA 3AGRA 3TSPA 4ZHRA 4IO9L 4Z4GA 1U6ZA 1X3MA 2P9PB 2O8EA 3NH2A 3NF8A 4KPYA 2A1SA 4CGGA 5JS2A 4G9ZA 5E84A 4FPAA 1KLMA 3VQ5A 4DSJA 4IBNA 1BUPA 3BF3A 4G1QA 5DM7L 1IG8A 4WF9L 3CPWM 3H1VX 2KZMA 4H0YB 4AQYK 4CEQA 1GLJO 3SCXA 2QEXN 3MWPA 3JSMA 2RPIA 1WBDA 1IKXA 1HYVA 2FF6A 3QEXA 2OA8A 2NRTA 4DMNA 3QETA 4BR2A 2HHXA 2YNIA 3R8EA 4GY2B 3A8YA 3OS0A 4HVJA 3EZ5A 3KVGA 4QS8A 3MXMA 3DM2A 3W3DA 3THWA 1RTJA 2QW9A 4BR0A 4K43A 1TKZA 4AHSA 4U67L 5BN8A 2HBLA 4AHCA 1IKVA 3PX0A 4JKEA 1W0HA 5LL6Z 4KI6A 4DLEA 1Q82O 2YV0X 1K8KB 4JD2A 3EY1A 4PL7A 2Q3SA 3CD6N 4CFCA 4PHTX 3CM6A 4E7LA 1LW2A 3LAMA 3LPTA 1Z6RA 4WQ5C 4JKBA 4FWLA 3L2QA 4B9MA 1X3NA 2DPNA 2HF4A 3FZHA 1NGHA 4BRDA 2PZSA 3AVFA 5C2FA 1RCHA 2HHVA 3CPEA 3H6EA 2BTFA 3WNFA 4FLXA 3H08A 1Z05A 3NF9A 2GUIA 1YHQN 1KC8O 2I7NA 1S1WA 1B9FA 3MEEA 4A2BA 5AZJB 1JL2A 1N6QA 4JKCA 3KTQA 3LDQA 3WUHA 3SV3A 4FZYA 2YI1A 3MN9A 2GUPA 1SKRA 4DQIA 4FCYA 4ICLA 3TAQA 4ELVA 2CH6A 3LZIA 4FWPA 4FJ7A 4GV9A 2UUCK 3F73A 1N36K 2YJEA 5AQYA 4YDUC 4DTUA 3V1OA 2ZJRL 4OPAA 4DFJA 3RMCA 4CBUA 4Q0BA 3ZSXA 4FJ9A 3OYJA 3EKSA 1FKOA 3O80A 3VEYA 3TARA 3UB5A 4NCGA 1WSEA 4JHDA 4DF8A 1JLQA 1D8YA 3TPQA 2O8BA 4KB1A 2JGUA 1U49A 4H5RA 3UE5A 4LC9B 1G15A 1SS6A 3OTOK 1XQSC 4FK0A 4KO0A 3K58A 4IEIA 5C42A 1EO1A 1VK0A 1GOAA 3EYZA 1HUXA 3AV9A 5E26A 3J7ZO 3D6RA 3PO4A 1J6ZA 4LSLA 4CHPA 4LY7A 1JLGA 1WBBA 2E20A 1QSLA 3FE1A 4FSVA 4DU4A 5AQIA 4DSKA 4JKFA 3AVKA 4R79A 3SQ0A 1K73O 3EEQA 3VPZA 4IJNA 4FVUA 3QNNA 2BE2A 3WXMB 3V1QA 1T03A 1QZ6A 3UIQA 1J9AA 4YOTA 2EHGA 1MA9B 4DR6K 4H5WA 1RDCA 4LF5K 3D0PA 2IIRA 4W5NA 1HR0K 3QBWA 3OY9A 3A5LC 2ZGZA 1S1UA 4JKDA 3V81A 4CEBA 5AQJA 3SAHA 3AGKA 2QWMA 4YOUA 2CGKA 4K0KK 4WQ4C 1UA0A 2G8HA 4RW4A 3OYIA 5C0YA 3EE9A 1OKJA 4F8RA 3C6HA 2QWOA 2VG6A 4PKHA 4BR9A 1TK0A 5FLXO 1HJOA 1OVYA 1C0GA 2ZQBA 1WUAA 1JXEA 3NBPA 2PFUA 4FOEA 3C94A 3SJJA 3H3NO 1JLAA 3ZEUB 1JLFA 3DRRA 4B9SA 4E0DA 4FJIA 2Q0UA 3DLEA 1W2BM 2Z1HA 3THXB 2CGJA 3ZSYA 3ASMA 2NRZA 3KLEA 4DTOA 2HOEA 3THVA 3CHWA 3AA2A 4JI3K 4F2RA 4GNIA 2F4VK 4O44A 4I2PA 3L4QA 5EU7A 3E9LA 3RRHA 4OPJA 1ITGA 1RDDA 2IC3A 5ADXA 1HNZK 2P9KA 4B1VA 4MLEA 1ESVA 1HKGA 3LDLA 1ZBFA 3QIPA 5F2RA 1TUYA 1YXQA 4CJKA 4DU3A 4CJ5A 3ZT4A 3WXKA 3I56N 1TKXA 1RDAA 4JN4A 3O9QA 5JMVA 5JS1A 1DEJA 3VTIA 1EXQA 4YHHK 3L6QA 4WE1A 3AVGA 4CZGA 4IOAL 2G8VA 4YOWA 1HNXK 1BI4A 5AFUA 4B3SK 3ENHA 1OH6A 4O8UA 4E7IA 4O5BA 3LZJA 4AHTA 4FJXA 5BR9A 3ITHA 1VRTA 3O9SA 3CXCM 1KLNA 3JXUA 3K57A 4YY3K 2VQFK 1Q9XA 4BGAA 3RMBA 1U4BA 4FXDA 3ULEA 5GAEP 3VA0A 3UKUA 4DQ8A 1IBLK 3NGYA 3BUZB 3OYGA 2EWSA 3T69A 4AHUA 3HBTA 1RT7A 4AM6A 4DQSA 5J2MA 4WCEL 3D2EB 3MXJA 4K42A 3WNEA 4JK8A 1JCFA 5AZIB 4CZEA 5F1XA 4RW7A 4FJNA 1WSHA 2LSNA 4B3RK 2CGLA 2NNWA 3CMAN 4ILHA 1A5VA 4DTMA 2UXBK 3E1YA 4B1WB 4CD1A 1NU0A 4Z4EA 3E9OA 3M5RA 1X9MA 1BOTO 2YHWA 2O8EB 3TAFA 1RT6A 3CC7N 4H0XB 4Y1DA 5MLCQ 4M3TA 4IWVA 4GKKK 2HHSA 4BREA 1VQ5N 4RW6A 1YITN 5EY4A 1BISA 1BIUA 3P5JA 4IOXA 3ZT0A 4BACA 3GOIA 4DQQA 4AHVA 3OYCA 4FK4A 4CZLA 4OLBA 1B9DA 2FLOA 4JK9A 4A57A 3P83D 2Z1GA 2I5JA 4HHTA 1XMQK 5KGWA 3DLBA 1YJ9N 3CJCA 2BANA 3G4SN 1SKWA 5KPZA 1WN7A 3A0IX 1NGAA 1HRHA 1RDBA 5FROA 5AR0A 4DB3A 4M7XA 2HBJA 3OA9A 5AQMA 1Q81O 1U2VA 2XHBA 2P5OA 1BA0A 2FXUA 5GINA 4BROA 3DLLL 4JRPA 1TK8A 4RCHA 3PX4A 1KAXA 3THWB 1C0MA 3LL3A 2D0PA 2RE2A 2V7YA 2YNHA 1X1PA 4JD2B 3WXJA 4BG9A 1U04A 1TVRA 5BN9A 4CEFA 3VOVA 4B3TK 2OTJN 4FJKA 5I3UA 1T6DA 1E3MA 3FZKA 3A5MC 3I8BA 3T19A 3SV4A 4Y0WA 4B9NA 2UUBK 4ILGB 3E66A 4H0OA 4A62A 3V9XA 2G8IA 4CD3A 1IKWA 4OJRA 4NYFA 4CBWA 2E1ZA 2HVIA 3RSEA 3KJVA 1LV5A 3CQXA 5GAHP 3L2WA 5FRNA 1HYSA 2P9IB 2Z1IA 5J2NA 3TTDA 3OYLA 3VGMA 2V52B 3ID8A 4DR4K 2XY7A 1BU6O 1VSIA 3CFOA 3HXMA 5HP1A 1NMDA 3AVNA 1QTMA 3HVTA 1EKEA 2F9WA 3L4IA 4HCBA 3AARA 3DOLA 4DSEA 3V4IA 2BGGA 5KQ8A 4DQPA 3ZETA 1SV5A 1FW6A 3G71N 3CM5A 3V9SA 4I9LA 1V4TA 4YDUA 4JHDB 3O3GA 4NB4A 1EETA 4ZTJA 1YF5L 3V1RA 2O8BB 3NHGA 4KHQA 1QQCA 2E88A 4JI0K 4YOVA 4KTQA 4LF7K 3LP0A 3KK2A 5GIOA 1HQUA 1QQMA 1S1VA 4B9TA 4JI7K 1WSJA 4DV5K 5AQZA 3BGRA 2HBKA 3VQEA 1CXUA 5J2QA 1HMVA 3A5NC 3AVMA 4R5PA 3E9PA 3ZSWA 4BWMA 1YT3A 3CCUN 1EQYA 5JLHA 3NE6A 3CF5L 5DK5A 4KHSA 2HHUA 1BHLA 3B8AX 4H03B 4W5QA 2YCHA 1ZBIA 1VQLN 4O4GA 4CJ4A 4E3SA 3NCIA 3V9UA 3DLGA 3SQ2A 3NH0A 1QHTA 2X6SA 5E41A 3VQBA 4DV2K 3SUPA 1GLEG 2WBNA 4DSIA 4JI4K 1T8EA 1S3XA 3WT0A 4JI8K 2AJQA 3HL8A 4RTFD 1VQ4N 4CJUA 5DMRA 4W5RA 4C8OA 4C8MA 1NLVA 4EAHD 1NJYA 3O5BA 1I39A 3QEPA 4CCHA 1J5EK 4OKJA 3I33A 5FPDA 5JVGL 1VHXA 1XNQK 1RDWX 4CJSA 5K14A 3NH1A 4O55A 5BRFA 2QI2A 3L2UA 3L2RA 2X6NA 3ENOA 5C15A 4WQ4A 3OBYA 3SUOA 3VGLA 1YI2N 1CZAN 1VQPN 3QINA 3P4IA 4LF6K 3IRXA 4BQZA 3F5TA 4FJMA 4B8CA 2YX6A 2G8KA 3S41A 4KAZA 4WFNL 4BY9C 4OKEA 3VF6A 3IFRA 3EL2A 4PKGA 4JEPA 3HM8A 1ZXOA 3FR0A 3G6EN 3SUQA 4CE9A 2P9KB 3HVRA 3SUNA 4AF1A 1Q18A 1YJNN 3VEVA 1QQNA 3KLFA 1BWFO 1RBSA 5AQOA 1KQSM 4ELTA 4CEZA 3SAGA 3SMSA 3SQ4A 4WFAL 2GV9A 2O4IA 4J2EA 2ETJA 3MCPA 2UYTA 1RGIA 2YHXA 3PSFA 3N4QA 4EP4A 4BQLA 4JNEA 3OYBA 3M8RA 4DSLA 3ID6A 2UU9K 5F0XA 3WQUA 3QO9A 4UQGA 3HPHA 4CF2A 1ZBLA 1BQNA 5KGXA 3TSUA 4BRPA 1DTQA 1X9JA 2WOMA 5AQTA 4QS7A 3HYFA 3K9KA 4J2DA 1W97L 3VQCA 4U7BA 4M63C 2IDOA 5M1PA 4C8NA 2E2QA 2YJFA 3VEZA 3HSCA 3HZ6A 4CZJA 4KI4A 4KFBA 3ULEB 1RT3A 3UKUB 4CESA 1P8ZA 1EWRA 4DV6K 1Y97A 2WONA 1JCEA 3AY9A 3K0SA 4FJJA 5FRMA 2OYQA 1RTDA 4EHUA 3OHRA 2D0CA 5CZ2A 1GOCA 4B1XB 4BR4A 1VQ8N 2YHBA 3HO1A 1S9GA 1WSGA 3MXIA 1A5XA 2XRIA 2RN2A 3UKRA 3CCLN 3LWLA 4CZKA 2X78A 4DSFA 3HM9A 3MN6A 3ZCMA 3ZSVA 1XUPO 3JS6A 3ZT3A 4DV3K 3HT3A 1BIZA 4L8RB 4CJEA 4BC5A 4W5TA 3KWGA 2W42A 3VQ4A 4H5VA 3T3FA 1BDGA 2H3GX 4AHRA 1LWCA 3QEVA 4DR5K 3VQ7A 4IFVA 4BRFA 4KB0A 1NGIA 4M41A 4PWDA 4BRKA 3NAEA 3A5OC 4K25A 3ZSZA 5TKWA 4DKWA 4CHYA 3R9PA 5J2PA 2D0BA 3PO5A 3QICA 4CF0A 2IVOA 3O1BA 2HMPA 2D4WA 3OVNA 4DQRA 1N32K 4CF8A 3W0LA 2IAJA 3KK3A 2NUBA 3V9ZA 4V19S 2FSKA 4EZ6A 4CVNE 4NCBA 4CHNA 3AO1A 4N5SA 4MFBA 1U2VB 3OYKA 3KD5E 2E1YA 1TAQA 4JYAK 4N41A 4FL9A 3RWUA 4LF9K 2P9NA 3CJBA 1MDUB 3THYA 4NCAA 4NLBA 4JI2K 4DUZK 1NGFA 3NVKA 4DR3K 1NOZA 2Q2RA 4E1JA 2HSTA 3I0SA 3OW2M 4KHWA 5BREA 4OO1J 1B92A 2KQ2A 3WEEA 3NGIA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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