3T7ZA

Structure of methanocaldococcus jannaschii nop n-terminal domain
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
119
structure length
119
Chain Sequence
MIYVTFTPYGAFGVKDNKEVSGLEDIEYKKLFNEEEIPDIMFKLKTQPNKIADELKEEWGDEIKLETLSTEPFNIGEFLRNNLFKVGKELGYFNNYDEFRKKMHYWSTELTKKVIKSYA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Nucleolar protein Nop 56/58
publication title Structurally Conserved Nop56/58 N-terminal Domain Facilitates Archaeal Box C/D Ribonucleoprotein-guided Methyltransferase Activity.
pubmed doi rcsb
source organism Methanocaldococcus jannaschii
molecule tags Protein binding
total genus 40
structure length 119
sequence length 119
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.220 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3t7zA00
3NVMA 3ID6A 2NNWA 4BY9C 5GINA 3NVKA 5GIPA 3T7ZA 3NMUA 3PLAA 5GIOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FWLA 2YHYA 1U2VA 2P9UA 4HUFA 4EFHA 4EHTA 1RT2A 4W5NA 3D2EB 2E2PA 2X6SA 4BRPA 2D0PA 2X6NA 4FWPA 4FL9A 1DEJA 3SJHA 1WBBA 2Q2RA 4DU4A 4HVJA 1T05A 4CD3A 3LZIA 3ENOA 2YNGA 1NGHA 4FVUA 5FROA 3AA3A 4NYNA 1QZ5A 3RMAA 3SAGA 3LDSA 3VGKA 2E20A 2HSTA 4DV2K 4B1VA 1BO5O 3D6RA 4BQZA 2OPSA 3DLLL 1BQMA 1JLEA 1KTQA 3AO5A 3ITHA 3HRGA 3NHGA 4N47A 3VA0A 4QS9A 3OBYA 1L3TA 3CJ1A 2ITGA 2VG7A 2QWMA 5E26A 3OYAA 2J4RA 4N41A 4OLAA 3WT0A 4DWIA 1EWQA 2QA4N 3MEGA 1SL2A 1HR0K 4DR3K 1SV5A 5AZIB 4C1NK 4H0XB 1HUXA 5M1QA 4CZJA 3CF5L 4AHUA 4JKFA 3VN5A 1GLCG 1BIZA 4AF1A 3L8BA 1D4XA 1OH8A 1A5WA 3TU5A 5HRSA 4K43A 4U7BA 3MN5A 4F9OA 3KJVA 1RDWX 1EP4A 3HM8A 4Y1DA 2ZD1A 4GY2B 1T3VA 4DS5A 4IJAA 1S5JA 4CJFA 3M8QA 1ZBUA 1J6ZA 4CHQA 3HZ6A 1LWEA 4GV3A 1CZAN 1IKVA 3ASMA 4JEPA 4O0JA 1D5AA 3JXUA 5F1XA 4JRPA 3B6OA 4O5FA 3VA3A 4PQUA 1GLFO 4B9LA 1NJWA 3HJFA 4IO8A 1N36K 4DTMA 3HOTA 3AA4A 4B9NA 4FWRA 3MEEA 4WCEL 4Z0UA 1KAZA 5A2QO 5ADXH 5BRHA 2HHVA 1BOTO 3TAFA 1RT4A 1X1PA 1KLMA 3J7AP 2O8EA 3JSMA 4BRDA 3LPTA 3TWHA 3A8YA 5BPLA 5AQGA 4CEFA 3DRSA 4IOAL 1U2VB 2P9UB 4DCHA 2D0AA 4WYBA 1ATNA 4FJNA 2QW9A 2ITMA 3N4QA 4FWNA 2BE2A 4JKEA 5AQPA 1ASUA 4M7YA 3L4QA 5F0XA 1W2BM 1Q9XA 4NCAA 4E1MA 2QI2A 4EP5A 4IDHA 3MMVA 4XH5A 1OVQA 3IDHA 3M5RA 5AQUA 4B1XB 4QAGA 2AP1A 1TL3A 3CCUN 3K57A 4WF9L 3NH2A 1MDUB 3CIPA 4A2AA 1LOTB 3O1WA 1E3MA 1REVA 2IAJA 3PIPL 3SUNA 1NNEA 4FZXC 3CM6A 4CHPA 2P9IA 3WQTA 4PA1A 1NK7A 2D1KA 4KH4A 1NK4A 1VAZA 3KK3A 3AVFA 4EIAA 1SKRA 4EP4A 4HHTA 2E2NA 1NK9A 1IG8A 3C0BA 5C2DA 4A61A 3L2VA 3AGRA 4KH5A 4UY8O 4CZIA 3V9UA 4BRIA 1BQNA 1L5UA 1N33K 4CK1A 1S6PA 4KFBA 1KAYA 3G71N 2PAVA 2UYTA 4KTZA 5M1PA 2HBLA 3TABA 3ZX3A 4HTUA 3C6UA 1DTQA 5H1SQ 5C24A 1CZBA 3C6AA 3ZSZA 3NDKA 2P51A 5AJ3K 3FZHA 1WAJA 3OYMA 1XI1A 2BH1A 5T7BA 4KO0A 3AVLA 2HHWA 1IBMK 5LJWA 4OGEA 2FLOA 4AQYK 4DTNA 3P39A 3UKRA 3AY9A 4CF9A 1WSHA 1LAWA 1BCMA 4LF9K 4DS4A 1SUQA 1Q7YO 4KBOA 1OH5A 4M7XA 3CJ7A 1C1AA 3EY1A 2O8EB 5GIPA 3RWUA 2ZJRL 1VQ6N 3V81A 4CBWA 1HPZA 2ZQBA 3V1QA 1YTUA 4H8KA 2Q31A 3QEPA 4BWMA 3ZEUB 2BUPA 2QWPA 5AZJA 3VETA 3VQ7A 3EZ5A 5EXWA 2ZGZA 1L3VA 3SUPA 1NGDA 2F4VK 1O1WA 1N5YA 3OY9A 2FF6A 5I42A 4FJ5A 1S1WA 2YNIA 5J2MA 1KVAA 4JS4A 1QE1A 4Z4EA 4LFBK 3NF6A 1TKZA 4KV8A 1TK0A 4Z94A 1YIJN 1QSLA 2HNDA 3CYMA 3C6HA 2XO7A 5KGXA 4PY5A 2P5GA 1NK6A 1L3SA 2P9IB 1NK8A 3SK3A 2YHAA 2A1SA 1JCGA 3U9ZA 3VERA 4B9TA 3TAMA 4DU1A 1YITN 1R0AA 4B3TK 4CIEA 3OYGA 3WNEA 3QMLA 1BL3A 4B3MK 4DF4A 3AVHA 4HUGA 3CFOA 1DLOA 1VQ7N 1Q18A 3HVTA 3NAEA 2O8BA 4NXMK 1IO2A 4L3QA 3ALYA 1ZC6A 4B9UA 3DLGA 4DSLA 4G9ZA 2QKBA 5C2FA 4BR4A 2FSNA 2NRTA 3LPUA 5GADP 4ILJA 1JXEA 1W97L 2FF3B 3IG1A 2PZSA 3S3MA 2BTFA 3B6PA 4DV1K 1S6QA 4FPAA 4G1QA 4BVOA 3LP3A 1I3AA 3CXCM 1QQCA 1NGIA 1BHLA 4DG1A 1WN7A 4OVLA 3RMDA 4QCLA 4FJMA 3O1BA 3BZKA 1UAXA 4Z4GA 2RE2A 3ULDA 3AAQA 3OYBA 3VQAA 1YVNA 3NF9A 5LY3A 4WQ4C 2G8HA 1K6YA 4FLTA 4B9SA 1VRUA 1E4GT 5CZ1A 3MECA 4BRLA 4CHZA 2WONA 3SQ1A 1J53A 4DTSA 3M3ZA 3LP1A 1XHZA 4PL8A 3VF2A 2W6KA 3MN9A 4YFUA 5AZJB 5ADXA 5C42A 3E9PA 5BR8K 4M3TA 1NJZA 3A2FA 3F9MA 5AQYA 1ZBIA 4BRMA 5J1EA 4CJSA 1RGIA 5DM6L 4OO1J 3VOVA 1HYZA 4BR7A 1OVYA 4ELVA 3CMEN 4CGFA 4RW7A 3I8DA 4E7LA 3V1OA 2RKIA 5CE3A 4CJ3A 2GUPA 1S1UA 3F73A 4H5RA 3EKSA 1X9MA 4CJUA 1QVGM 1S9EA 4HCBA 4NYFA 5LMUK 3GDQA 1SL0A 3O8MA 2O4GA 4I9LA 1RFQA 1LW0A 3D2FA 1KCFA 1NJXA 4F3OA 1QSYA 1HYVA 4JKCA 5KI6A 1VK0A 3HP6A 3BP8A 5CZ2A 2O8BB 4BC2A 5FPMA 4FWMA 3THXA 2XHBA 3F5TA 4A57A 3C6TA 1RBVA 2JLEA 2IVOA 1KC8O 1ASVA 4FLYA 2KTQA 3RTVA 1S72N 1ITGA 5CR4A 5BN9A 4CJPA 3OS0A 4CF2A 3NGZA 3SQ0A 1VQ5N 1JLBA 4M3UA 5KPTA 1GLJO 4XH1A 1RDBA 3FZKA 5AQVA 4KTWA 3CJAA 3PIOL 4LF6K 3CPWM 1RTIA 1NOYA 2FBVA 1BGXT 5M1FA 4Z4FA 5C10A 4KI4A 4FK2A 1FKOA 4KB1A 4XH4A 1TKDA 3OJUA 2AA4A 3DXKA 1P90A 4ILHA 4OLBA 4A62A 4CIGA 4O0IA 1XC3A 4KAZA 4PUOA 3OYLA 2RN2A 1TVRA 2E8AA 4LD0A 3TSUA 2V51B 5AQKA 4FJLA 4BRHA 4DTOA 2CGKA 1GLEG 2CGJA 3MDQA 1C0GA 2B4JA 3DXMA 2HVIA 3T1HK 3J81O 3OTOK 4NCGA 5JMVA 3RR7A 1C1BA 4KKOA 3HOSA 3AO4A 2Q3SA 3HI0A 2NRRA 4O4GA 2HBMA 3IFRA 2ETJA 2YV0X 3G10A 1WSEA 3SZ2A 4CZGA 4YORA 5JICA 4B3SK 5I9EB 2A41A 3DJCA 1NMNA 3QIPA 1XC9A 1DGKN 1JXBA 1XNRK 3D2FB 3DM2A 3A5MC 3L2QA 4C8KA 5AQNA 1X3NA 2VWBA 2GWJA 4CJVA 1SKWA 2KW4A 3A5OC 2W42A 4BRAA 3THXB 1NGBA 4JD2B 3VQ9A 4IEEA 2HHHK 3R8EA 3HT3A 3C65A 3KLFA 3LP0A 2QK9A 1VSIA 1HNWK 2E2QA 3CPEA 1U4BA 3VQBA 4B3OA 3CC2N 2Q1NA 1D9FA 3L3UA 3SAHA 4KHSA 1RBSA 1T6CA 2NRWA 4B1YB 3PO5A 3TTCA 1B9FA 1EKEA 5AQQA 1HJOA 3CHWA 3TSQA 2HB5A 4ZTFA 4IOCL 1BISA 1IBKK 3T19A 3W3DA 2OA8A 1WSIA 3B8AX 2OPRA 1P8ZA 3E66A 4KHNA 3Q7BA 3K59A 4IOXA 3CCRN 1NGGA 3DXKB 3PO4A 2NNWA 5M1KA 2Z1IA 4BRKA 3NE6A 4CJEA 4YHHK 1J54A 2CH5A 3VQEA 2G8KA 2LSNA 3O5BA 4CGDA 3V9XA 2DY4A 5GINA 1S1TA 3DXMB 4CFBA 2KZMA 3NF8A 5KPRA 3IRXA 1YJNN 2KHOA 3BF1A 3MXMA 4M3WA 2ATQA 3OVNA 4E1NA 1ESVA 3ZCMA 3CCLN 3QINA 4CGJA 1HNXK 3JS6A 3AA2A 4IO9L 1I94K 2QM1A 4YY3K 1RDUA 3VPZA 3EZWA 3V4IA 4I2PA 5HOOA 4E0DA 3WNHA 4ILGB 2RF2A 5JLFA 3CG7A 1ASWA 4BR2A 4DQSA 1VSHA 1TYQA 2DFEA 4BVPA 4ZHRA 1UWBA 1UA0A 3A5NC 1WSFA 4BREA 4JNEA 4KI6A 4BE2A 5KQ8A 4DQ8A 4M3YA 2QTDA 4H0OA 4IFEA 2NLXA 3CQ8A 2P9KA 4BQLA 2Q36A 4H0PA 4M63C 5AR0A 3QO9A 4KRFA 4FM0A 1ZBFA 5BR9A 5LMNK 3ZT2A 2FSKA 1D9DA 1X9WA 4FK0A 2E5LK 2E6LA 1O13A 3CFRA 4WQ5A 2QWQA 3S9HA 4LH4A 1HQEA 3C7NA 3F2KA 4NB4A 4BC3A 4FM2A 4PKGA 4FJHA 3VTIA 4J2EA 3VQ5A 4K25A 4O55A 3LALA 3WNGA 4W5RA 3G4SN 4DSIA 3GBTA 3QEIA 2QWNA 1A5VA 4RW6A 4JI7K 4H5VA 1RTDA 4RW9A 4CF8A 1BI4A 1XQSC 4WFAL 1KVCA 1YHQN 2HBKA 2QWRA 5E41A 4H4MA 4JK9A 4CJ7A 2A3ZA 4M41A 3KLIA 4WFBL 2G8IA 3UIQA 5F2RA 2EHGA 3GE1A 5EX5A 4YOTA 3BF3A 5JLHA 3K9JA 4CW7B 5HP1A 1JCFA 1X3MA 5EOYA 3V9WA 4DSFA 3ZEUA 3U6FA 4FO0A 1R59O 4CJ5A 1D8YA 3ULEA 4CZHA 1JLGA 1VQ4N 4MO5A 3ISNC 3QBWA 5C25A 4AHSA 4DR2K 4RG8A 1C1CA 3T3FA 1JL1A 3DLKA 4AHCA 4NLCA 4PHTX 4JKHA 3HPGA 4OKJA 3NF7A 1HMVA 4IG0A 1N34K 3ZSWA 1VQPN 1KVBA 3MN7A 2VGNA 2ZJQL 1H1VA 3WXLA 4FLUA 1KD1O 2E88A 4JAXA 1TYQB 1N8RO 2OCEA 3O9QA 4B1UB 3QERA 3GOIA 4BDZA 1HPMA 2F9WA 2W40A 3SMPA 4EZ9A 4DF8A 2P9KB 1VSEA 3J7ZO 1NKCA 2HHSA 3ZETA 3OYKA 2E6MA 1TAQA 4HWIA 2V52B 3U9DA 3AO2A 4H5WA 1TUUA 2A40A 3CERA 2ZM6K 1EWRA 4KHYA 5DK5A 3C7NB 1QZ6A 2BANA 3FFIA 3QFPA 4GNIA 4WFNL 4JLHA 3IS9A 3BDPA 2QWLA 4BWJA 1VSLA 1JLAA 3SYZA 4DTRA 1IG9A 3LL3A 3R9PA 3LDOA 1VQON 1K73O 3ENBA 1V4TA 1BI4B 4B1ZA 4FCYA 4CJWA 5AQJA 1KAXA 4O8UA 1Q8IA 3DI6A 4DTPA 4A59A 3VQPA 5KRTA 5SZTA 1BUPA 1TV6A 3U8XA 5HRRA 4GV9A 4B9MA 3SBTA 2VQFK 3RR8A 3C94A 5KRSA 1S3XA 4JKAA 3ULEB 4BACA 1NK0A 4J8FA 3SV3A 1NGAA 2G8WA 1E4FT 1T7PA 4ID5A 5AFUH 4WE1A 1S1VA 1RTJA 4FWSA 4LSNA 4E7KA 4CBUA 3SUQA 2RHKA 3OS2A 1BIUA 5ELZA 4QS8A 4H5NA 4CK3A 5IWAK 4DHYA 4B9QA 1NLVA 2D0CA 1ZYQA 5FPNA 3HTVA 4DSEA 3DRRA 3WXKA 4AHVA 4H0VB 1Z6RA 2KQ2A 2A6AA 4YOUA 1U45A 2UUAK 4I9QA 3J8AA 2V7ZA 3V6DA 4E89A 3U3YA 2VG5A 3O4WA 3ZETB 4GMJB 4E1JA 3ZSOA 4CEOA 4O44A 4YOWA 4F8RA 1WB9A 4UQGA 3NGYA 4DU3A 3MXIA 2G8VA 5AQIA 5DM7L 3OYDA 2QXFA 3BEXA 3P31A 1RT6A 4F4KA 2FXUA 4DV5K 5IT9O 3O4NA 4FJXA 3FFKB 3DYAA 3H3NO 1U48A 4CHYA 4FOEA 2NUBA 3DOLA 3HPHA 4JI4K 5AQMA 2FC0A 3T7ZA 3OHRA 2KZZA 3CI5A 1Y97A 3FLCO 1HQUA 4FLWA 3VQQA 4FJ7A 1KFDA 4OKKA 3M8PA 2IDOA 4KHUA 1EETA 3NFAA 3ZT0A 3KHYA 3CC4N 2UUCK 2P9NA 1VQNN 3RSEA 1SQKA 4CGHA 3RRHA 1BA1A 1WOQA 3MK6A 4B8AB 2DFHA 4CZFA 3QEVA 2XRIA 3ZX0A 4C1NI 1TAUA 3TR8A 1ZBLA 5AQTA 3LANA 2I7PA 4YOYA 3VF4A 1RT5A 2NRVA 2WUSA 3MN6A 3W0LA 3V9ZA 4E7IA 4CZLA 3AA5X 1CXQA 1TUYA 3J80O 2E2OA 4JK7A 3MX2A 3L0QA 1QQNA 4M3RA 1W9HA 4FM1A 5EY4A 3CFPA 3BGRA 1NGEA 2HOEA 2OPQA 4CVNE 2O8CA 4KH6A 4FLZA 4DFPA 3HP9A 4BRGA 5M1OA 4DR5K 2BDPA 2JWLA 3WUHA 4K8ZA 3LAKA 4MLEA 3P5JA 1HKGA 1Z26A 2HNZA 3LWLA 5HROA 4DKWA 3OYJA 4CIFA 2H3GX 2VYPA 1MA9B 3VEOA 4DQIA 1JJ2M 3MX5A 4JD2A 1XMQK 3P4IA 2GWKA 3L3VA 4B1WB 4NLBA 3VEVA 5EU7A 1NJYA 1UA1A 4FJGA 3ZLJA 1IH7A 4AH9A 3RMCA 2HF3A 4O5BA 3QESA 2X74A 4K0KK 2ZWHA 5I3UA 4KB0A 1J5EK 1J5OA 3HXMA 1KFSA 3LP2A 2HHUA 1ATSA 4DR1K 3AV9A 1BU6O 3DRPA 2OPPA 2VWKA 4CEEA 4K8XA 4CEZA 1NGJA 3R1XA 5KQDA 3DAWA 1QSSA 1MU2A 1BG3A 5HBMA 3AO1A 3K5MA 4ZTJA 4CCHA 3ID8A 2BGGA 1YAGA 4PL7A 3H45C 2P1JA 4YDUA 2P9NB 1WSJA 3VF6A 3RSEB 4CF0A 4JK8A 2P9SA 2GELA 3SCXA 1U6ZA 2YHWA 2YCHA 3I0SA 1RILA 2I5JA 5FDLA 2GX9A 4JKBA 2F7TA 3U3GA 4LF4K 3FZMA 2UXCK 4Y0WA 3H1VX 4CESA 4JI5K 2W41A 4DR7K 3PSFA 2YX6A 4JI2K 3VEYA 1IBLK 2UU9K 4ISEA 4FW1A 3CJ9A 2FSJA 4DV6K 3DOKA 3LDPA 1G15A 2O8CB 4OKEA 2FBTA 1W7AA 4DFKA 2B5JA 4FWKA 3PV8A 4CFCA 5AFUA 1KQSM 2O4IA 3KKSA 3MWTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3NVM A;  3ID6 A;  2NNW A;  4BY9 C;  5GIN A;  3NVK A;  5GIP A;  3T7Z A;  3NMU A;  3PLA A;  5GIO A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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