3H3NO

Glycerol kinase h232r with glycerol
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
501
structure length
501
Chain Sequence
AEKNYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSYRFYGSEVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLSDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAVAATQTFKFKAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Enterococcus casseliflavus
publication title Structural characterizations of glycerol kinase: unraveling phosphorylation-induced long-range activation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glycerol kinase
total genus 185
structure length 501
sequence length 501
chains with identical sequence X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2009-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h3nO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h3nO01
3A5NC 2F9TA 2P9KB 2ZGZA 3FZMA 4NO7A 3FZFA 4YDUC 4I6MA 5AQMA 1C0FA 4PL7A 1GLFO 4JHDB 1NGJA 3DXKB 4QS7A 1TYQA 3CJAA 3D2FA 2FSKA 3VEVA 3QMLA 2QWLA 4BRDA 3HZ6A 3FZKA 1GLCG 3OHRA 3VOVA 4WQ4A 4CD3A 3BF1A 4BC3A 1QZ5A 1BDGA 3H3OB 1T44A 4JD2A 4O8KA 1T6DA 3W0LA 5JLFA 1GLBG 3R6MA 2A42A 4EFHA 1HUXA 4B1UB 2H3GX 3I8BA 4BRIA 1XQSC 2D4WA 4BR5A 3QBWA 2GELA 1TUUA 1Q18A 3M3ZA 2CGJA 3IFRA 5LY3A 2I7NA 3O8MA 3BEXA 5AQRA 5FPMA 3HI0A 3G25A 3GG4A 1NLVA 4LC9B 3U9ZA 2P9UA 3TPQA 5AQGA 4FWSA 1U6ZA 4PL8A 4BR4A 3AAQA 3H45C 1KAXA 4H0OA 3O4WA 3ENHA 2Q1NA 2P9NB 3QB0A 4BR9A 3U9DA 4BREA 1NGCA 2YI1A 1HPMA 2VYPA 3WT0A 2ITMA 2KHOA 2A3ZA 4EAHD 3C7NA 5AQJA 3HTVA 3VEXA 1RGIA 4B1YB 3W3DA 3M6GA 5ADXH 3H6EA 5BR9A 4CI6A 2HF3A 4CZJA 1MA9B 5LJWA 2Q0UA 2W41A 3UKUB 4DCHA 3ATUA 5AQPA 4PKIA 4JHDA 3CJBA 4WQ5C 3DXKA 5EOYA 4CBUA 1ZXOA 5FPEA 3EKUA 2HMPA 4K43A 3U8XA 3D2EA 4M7YA 1QQNA 4CZKA 1NGAA 3EN9A 3MN5A 3VETA 2QW9A 1SAZA 5AFUH 3VENA 3A5MC 3O6WA 3EKSA 4FOIA 4YDUA 2P9LB 4CZIA 3MN6A 3VGKA 3SJHA 3O1BA 3IDHA 2PBDA 2QWQA 3SLCA 1LCUA 4JD2B 1P8ZA 2NRHA 1KAYA 4BRFA 1IJJA 3RSEB 4ISGA 3VEWA 2YCHA 1LOTB 2A40A 4RWTA 5AQYA 4IXCA 1BA0A 3VERA 1BWFO 3WXIA 1WOQA 1KXPA 3CJCA 4BC2A 1D4XA 4RCHA 4BQLA 2P9NA 1HJOA 1C0GA 2AP1A 2Q36A 5AQKA 3SMPA 2UYTA 5JMVA 3O08A 3HM8A 3QDKA 5AQZA 1MDUB 1XUPO 1V4SA 4XH4A 4L3QA 4BRQA 4H03B 4H0XB 3LL3A 3MK6A 5ELZA 3WUHA 3S41A 3FZHA 5B8HA 3DWLA 3IMXA 3BUZB 4DB3A 3JXUA 3UB5A 3LDQA 3UKUA 5FPNA 4BR7A 1S22A 4QS8A 2WUSA 1ZC6A 4XH1A 3FGUA 4Y0WA 4A61A 3C0BA 3I33A 5BN9A 3KHYA 1GLLO 2E1YA 5EVZA 3O5BA 1QQMA 5KQDA 3DAWA 3H1VX 3SK3A 1Y64A 2OANA 1GLEG 2P9LA 3D2EB 4FSVA 5E26A 1H1VA 5AQOA 4WQ5A 2J4RA 1TUYA 2V7YA 2CH5A 4K42A 3RSEA 5BPLA 2GWJA 4MO5A 3A8YA 5KPZA 3A5OC 5AQLA 1NGDA 2D1KA 3M1FA 4FWLA 3GDQA 1ESVA 4CZMA 4NB4A 1NBWA 4BVPA 1E4GT 3JS6A 2D0PA 3CETA 3ZX3A 4A2AA 4RTFD 3LDLA 5AQIA 5EX5A 4BRAA 1V4TA 4QS9A 4BRNA 2P9PB 1DKGD 4FOEA 3CQYA 4BVOA 1NGGA 2P9IA 3LDOA 4CZFA 4BRGA 1BUPA 5AQVA 3BP8A 4A2BA 1RFQA 4FWQA 3FZLA 1G99A 1GLJO 2QWNA 5F2RA 4B9QA 3VF4A 3AY9A 4H5RA 3LM2A 3VGMA 3GL1A 4H0TB 4H0YB 1NGFA 1HKBA 2FF6A 2QM1A 2V51B 5AZIB 4BC4A 4ISEA 3ULEB 2ASMA 2YJFA 2E20A 1ATRA 4HTLA 4AM6A 2FF3B 3H1QA 3H3NO 4PKGA 2YHYA 2FXUA 3ENOA 2GUPA 2Q31A 2ZGYA 5EXWA 4CBWA 4M7XA 2YHXA 4XH5A 1X3MA 3DXMB 1ATSA 5BRHA 4JAXA 4B1WB 4B1VA 4BGBA 4K25A 1QZ6A 2ASOA 3MDQA 4MO4A 2YJEA 1K8KB 1OKJA 3VF6A 3WEEA 3WQTA 3VESA 3AARA 3L0QA 5AQHA 5KQ8A 4BRCA 4BG8A 4BRHA 2E1ZA 3GOIA 2QWPA 3CIPA 2GTDA 1DEJA 4PKHA 4BGAA 5F0XA 4JN4A 4H0PA 5CE3A 2NZTA 2QXLA 4H5NA 2P9PA 4F9OA 2HOEA 5KPTA 3L4IA 3A0IX 1MWKA 5KPRA 3CQXA 1NGIA 3EO3A 4IO8A 4CD1A 4DHYA 5AQQA 5F1XA 2E2OA 1Z6RA 4FL9A 3VGLA 2P9IB 4BRPA 3MMVA 1BA1A 5E84A 4E1JA 5BPNA 3LDPA 4CZGA 5AFUA 2IVPA 1HX1A 1DGKN 3ZX2A 2BTFA 2W40A 3ZETB 5AZJB 5AZIA 4FWOA 3ULEA 1KAZA 3FFKB 4EIAA 1E4FT 5AR0A 4H5TA 4FWNA 3EZWA 4M63C 2FSNA 2IVOA 1MWMA 5AQXA 4EHUA 2E2PA 4MLEA 3DJCA 4FWKA 3DXMA 3QFUA 3FE1A 1QHAA 4FPAA 3CJ7A 2QWMA 2E2QA 3KVGA 2EWSA 4IZ9A 2GWKA 2Q97A 3VF2A 3P4IA 3O80A 4GY2B 3VEYA 4GNIA 3WXLA 4BC5A 5BPMA 3TU5A 4IWVA 1K8KA 2NLXA 3QICA 3QFPA 2V7ZA 4BQZA 3WEEB 2E88A 3B8AX 3WQUA 1RDWX 3EL2A 1IG8A 4IJNA 4CBXA 2E2NA 3R8EA 3VEOA 1BU6O 3L6QA 1ATNA 2A41A 5BREA 1BG3A 1YUWA 4ISFA 4B1XB 3VPZA 1X9JA 5JICA 2CGKA 1YAGA 1QQOA 1JCFA 1R59O 1XC3A 5AQWA 2ASPA 2ZWHA 3U4LA 2YHWA 2Q2RA 2I7PA 3ZETA 3AAPA 3ATVA 5AZJA 1NGEA 4J8FA 2PAVA 3ZX0A 2A5XA 2P9SB 1GLAG 4BRMA 2BUPA 2HF4A 1X3NA 3VEZA 4FWRA 4CZEA 3O1WA 3WXKA 3UKRA 4BRLA 3FLCO 2VWBA 1CZAN 3MCPA 1U2VB 4FWPA 3ZEUA 1GLDG 4CZLA 1HKCA 2QWRA 2F9WA 3A5LC 3MN9A 4K41A 4EHTA 5BRDA 1HLUA 1S3XA 1T6CA 3HBTA 3F9MA 5EY4A 2P9KA 4XEIA 5AQFA 5AQNA 1YXQA 2IIRA 1BOTO 3CHWA 3LM9A 4BROA 1ZBSA 3UE5A 3J8AA 2Q0RA 4WQ4C 2E8AA 4WYBA 5FPDA 1HKGA 2CH6A 4BR2A 2VCPA 3IUCA 1JCGA 4BRKA 3CERA 4I6MB 4B1ZA 5AQUA 2QWOA 1NM1A 1WUAA 3WXJA 4CJ7A 4DQ8A 5ADXA 1TYQB 3D2FB 5AQTA 2CGLA 1JCEA 1NGHA 3D7EO 4MLHA 1BO5O 3ID8A 4AM7A 1NMDA 3SMSA 3MN7A 2FLOA 4H0VB 5BN8A 3CJ1A 4BG9A 5JLHA 3R9PA 3LDNA 5AQSA 1SZ2A 5TKYA 2AA4A 4C23A 4Z94A 2DPNA 4H5VA 1NWKA 3CI5A 2P9SA 1NGBA 3KZBA 3H46O 3CJ9A 3GE1A 4H5WA 1SQKA 4FO0A 1YVNA 2D0OA 3BF3A 1U2VA 3GBTA 2IVNA 2P9UB 4A62A 4FWMA 2A6AA 3UKRB 3HSCA 1J6ZA 4HWIA 4KBOA 4CZHA 4JNEA 4FPBA 2GEMA 2FSJA 4IJAA 5LJVA 5BRFA 5I9EB 3ZEUB 1EQYA 2ZF5O 4O5FA 3FR0A 3C7NB 3QBXA 4BR0A 1Z05A 2V52B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AVGA 2P9KB 1EP4A 1Q81O 3FZMA 1YT3A 3DLHA 1WN7A 5AQMA 1C0FA 4KREA 3OYNA 1NGJA 4KO0A 3CCSN 3QNNA 3CJAA 3D2FA 2G8UA 3VEVA 3QMLA 4BRDA 4ILHA 1J9AA 3VOVA 3BF1A 1BDGA 1T44A 4CEDA 2HBLA 2Y1IA 1S9GA 3W0LA 4EFHA 5CYQA 3I8BA 4FCYA 4LF9K 1RT7A 4EZ9A 1TUUA 5D3GA 4AHCA 3M3ZA 1XHXA 2CGJA 4CJ4A 2I7NA 2HHHK 3BEXA 1VQ4N 1J54A 5IT9O 3G25A 3GG4A 1NLVA 4LC9B 4IKFA 1S1UA 4FWSA 4EZ6A 4FW1A 2HHSA 5KI6A 1NK8A 1WSJA 2PYLA 3ENHA 1NK6A 1JLBA 4FJJA 2XO7A 4YOTA 1ZBFA 2VYPA 1Z26A 4KHUA 3C7NA 4CGIA 3VEXA 1RGIA 1NKBA 1K8AO 3M6GA 5ADXH 2HVHA 2GV9A 3UKUB 4CFDA 5AQPA 3LAKA 2I5JA 1QSSA 4JHDA 3DXKA 1T3VA 1ZXOA 4C1NI 4DFMA 4KH5A 1UAXA 1T7PA 3D2EA 4LSLA 4OKJA 1VK0A 3CFOA 1C0UA 1SAZA 3ENBA 1RDCA 3O6WA 3G6EN 4FOIA 4YDUA 3NGZA 4GV3A 3MN6A 4CK2A 4JD2B 1BHLA 1P8ZA 2NRHA 4FM1A 1IO2A 1KAYA 5T7BA 3VEWA 1KVCA 2YCHA 1LOTB 3ISNC 3TSQA 3VQEA 1D9DA 2RKIA 2NNWA 4CF0A 4IFEA 4BC2A 1K73O 1DT9A 1U04A 4GW6A 1HJOA 2Q36A 2YHAA 1KCFA 1JLGA 4FJGA 4NYNA 1Q9XA 1EKEA 4KHQA 1MDUB 2E5LK 3SUNA 2W6KA 3OA9A 1VSEA 4XH4A 4JRPA 2G8FA 3G10A 4H0XB 4AHSA 3EYZA 5ELZA 4Z4GA 4U7BA 1TV6A 3BUZB 3LANA 3R3LA 3VQPA 3JXUA 4M41A 1YI2N 1LW2A 2BGGA 4JI8K 4BR7A 2DFHA 4BE1A 4YFUA 3FGUA 4DV5K 4OPJA 3J81O 3SZ2A 1VRUA 3THXB 3KHYA 1F21A 2IAJA 1GLLO 2E1YA 3SAFA 1UA1A 3O5BA 4G1QA 3IKMA 4JKAA 2G8HA 3DAWA 4CGFA 2YHBA 2PY5A 4PQUA 2FBXA 2P9LA 3AGKA 4DTXA 4IOCL 1S1TA 4FSVA 5E26A 3NGYA 2KFZA 4WQ5A 5AJ3K 4DTUA 3NAEA 1TUYA 2VG5A 5BPLA 3E1YA 4DLGA 1XI1A 3MEGA 5AQLA 3M1FA 3TAQA 4JS5A 3VMFB 3K5MA 2D0PA 3CETA 4FLYA 1VSHA 2VWJA 3CCUN 1EWRA 1DKGD 5DMRA 4CEZA 3LALA 4A2BA 3AA4A 4FWQA 3SI6A 4KRFA 3J80O 1G99A 1GLJO 3HPHA 4AH9A 4J2DA 4H5RA 4CIFA 3GL1A 4H0TB 1NGFA 3QNOA 2V51B 3CM5A 5AZIB 3TSUA 2BE2A 4ISEA 4DMNA 4FVUA 1ATRA 4HTLA 1RBTA 4O0JA 2VWKA 4NLBA 1YJ9N 3C6UA 3H1QA 2YHYA 1UOCA 3ENOA 5C42A 2Q31A 2KZMA 1BI4B 2YHXA 4XH5A 4PY5A 1ATSA 2HNZA 4JAXA 4JKGB 1GOAA 4B1WB 4K25A 2F4VK 1EO1A 4MO4A 1K8KB 4BE2A 1J5EK 3MWTA 3VESA 3QEPA 3AARA 2KZZA 2O8FA 3CF5L 4BRHA 2E1ZA 4O4GA 2YNGA 3C95A 4PKHA 3TI0A 3DLRA 1FKPA 4DTRA 4NYFA 1SKWA 1A5XA 3TAFA 4J2EA 3K59A 3L4IA 3CQXA 2ZM6K 5F1XA 1XNRK 1KVBA 3SPYA 2P9IB 5J1EA 1LV5A 2XY8A 5AFUA 3KWIA 1DGKN 3ZX2A 4OGCA 5AZJB 4FWOA 3RMCA 1EX4A 1KAZA 3E9LA 1E4FT 3FFKB 4LF5K 1OH6A 3EZWA 3OS0A 1HQEA 1MWMA 4WFNL 1YIJN 1JXEA 3HRGA 1JLQA 4LF7K 2EWSA 4FLXA 2Q97A 4DSEA 4V19S 4R5PA 3TU5A 4OLBA 1JXBA 4CFCA 4CJWA 1S1VA 5KRTA 4PA1A 1RCHA 2X6SA 3BZCA 4CF9A 4TSXA 4LF4K 3EL2A 4IJNA 4CBXA 2E2NA 1IKVA 3L6QA 2A41A 4I7FA 1YUWA 3KD5E 1WAJA 4CESA 3FFIA 1X9JA 4IBNA 3NF9A 5AQWA 2ZWHA 1IV0A 4N41A 3KKRA 2Q2RA 2I7PA 4YOYA 3CCRN 2QI2A 5C15A 4HUEA 3MCPA 1C1CA 3D6RA 3OVNA 3R1XA 4DR1K 1K9MO 3LP3A 4JYAK 3ALYA 3MCAB 3AA3A 3OYMA 1LWCA 3D45A 2QWRA 5MLCQ 3TANA 3F9KA 3QERA 2HSTA 3EE8A 5HP1A 3ZLJA 3HP9A 2P9KA 5LMUK 1W9HA 3LM9A 3L2WA 1RBUA 4FM2A 1RILA 3ZSQA 3TWHA 4WQ4C 4OX9K 4AILC 4DQQA 1JCGA 2HNDA 4I6MB 3KLHA 4DSKA 3QESA 1WLJA 5ADXA 3SQ2A 5C2FA 3D7EO 1RTIA 3L2QA 4ID1A 3DLBA 3ID8A 4AM7A 4FVMA 4FW2A 1NMDA 4JI7K 2FLOA 4X64K 5BR8K 5M1OA 4CEAA 4CJ3A 1JLAA 4BG9A 3RMBA 4WF9L 3SYZA 5TKYA 2Z1JA 5GAEP 1EXQA 2B5JA 2WBNA 5H1SQ 2BDPA 4DS5A 3H46O 1DTQA 2NRRA 4DR2K 3BF3A 3GBTA 2IVNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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