3H3NO

Glycerol kinase h232r with glycerol
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
501
structure length
501
Chain Sequence
b'AEKNYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSYRFYGSEVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLSDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAVAATQTFKFKAK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Glycerol kinase
molecule tags Transferase
source organism Enterococcus casseliflavus
publication title Structural characterizations of glycerol kinase: unraveling phosphorylation-induced long-range activation
pubmed doi rcsb
total genus 185
structure length 501
sequence length 501
chains with identical sequence X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2009-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h3nO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h3nO01
3VERA 3A5OC 4BG9A 4EFHA 2E1YA 2EWSA 4HTLA 3R8EA 1QHAA 2FSNA 3BF1A 3CETA 2PBDA 1HLUA 1RGIA 1BA1A 1BO5O 1Z6RA 5FPNA 2A6AA 1S3XA 3D2FB 3DWLA 4BC5A 2E2PA 4MO4A 5AZIB 3ZETB 3C7NB 4BQLA 3LM9A 3BUZB 4EHTA 1OKJA 4B1VA 5EY4A 1IG8A 5I9EB 3CHWA 2P9PA 1JCFA 2NZTA 3DAWA 1NWKA 4BRMA 3DJCA 3CJCA 2AP1A 1LOTB 2GWKA 2A3ZA 3C7NA 4BRAA 4DQ8A 4PKIA 5BN9A 2ZWHA 2P9SB 2CGKA 3WT0A 1XC3A 2W41A 4BR4A 2P9LA 3VENA 5EOYA 3BEXA 1JCGA 5BRFA 2ZGZA 2FSKA 1MWMA 5EXWA 1NGGA 4FOIA 2ASPA 1KXPA 5JLHA 3WQTA 3WUHA 4FSVA 2OANA 4H5NA 3CJAA 2GELA 2YI1A 1WOQA 3GBTA 2IVPA 4PKGA 3A0IX 1IJJA 4YDUA 4I6MB 4XH4A 3FZLA 4IJNA 4BROA 5ADXA 3VGKA 5AZJA 3GE1A 1GLCG 2QWOA 3ATVA 5KPRA 2QW9A 3HI0A 3L0QA 4AM6A 1QQMA 3KVGA 1GLEG 3VEWA 2E2OA 1LCUA 3D2EA 4IXCA 3UKUB 4RCHA 3O08A 2IVNA 4IJAA 4M63C 3VGLA 4C23A 2VYPA 4QS8A 3RSEA 1BUPA 1GLAG 4FOEA 3LL3A 2W40A 2YCHA 3FLCO 3H46O 3SMSA 4H0PA 3SK3A 3FE1A 3QFUA 3P4IA 2P9IA 4BVPA 3H6EA 3VESA 4EIAA 4CBXA 2YJEA 1NM1A 4FWRA 3OHRA 4XEIA 4JHDA 5EX5A 3VEZA 1S22A 1X3MA 4YDUC 3U8XA 2QWLA 3LDOA 1TYQB 3VEYA 4BR9A 5JLFA 1H1VA 2D1KA 1NLVA 4WQ4C 4H5RA 3I33A 4FWNA 1HUXA 5AR0A 1QZ6A 1J6ZA 4ISGA 1D4XA 3LM2A 4FO0A 2YHXA 3I8BA 3JS6A 4H0OA 4MLEA 4NO7A 4H0VB 3QB0A 4FPAA 4M7XA 3VPZA 3U9DA 4BRGA 3L6QA 1NGHA 3UB5A 1G99A 1HKCA 3M1FA 4FWQA 4Y0WA 2BUPA 2HMPA 4BRLA 3FZMA 3FZFA 2CGJA 4ISFA 3ZX3A 4EAHD 3WEEB 1BOTO 3MN9A 2NRHA 4O8KA 3FR0A 3HBTA 4GY2B 5AQWA 3O80A 1QQOA 4BR5A 3WXLA 5AQTA 2D4WA 3O6WA 3CQYA 2BTFA 4CD1A 1QZ5A 1P8ZA 3EL2A 5AQNA 4CJ7A 1NGBA 5E26A 2D0PA 2P9UA 3FGUA 4RTFD 4BRKA 3A5MC 2P9NB 4A2BA 3FZKA 4PL8A 4K25A 1Y64A 2NLXA 2VCPA 4BG8A 2FF6A 4MLHA 2CGLA 3GG4A 4A62A 4IWVA 2V7ZA 2F9TA 3SLCA 4JHDB 3SJHA 3GOIA 3IMXA 3HZ6A 4H5WA 2HF3A 2Q31A 4H0TB 3FZHA 3LDLA 1HKBA 4BRQA 4K41A 3ULEA 4BC4A 5FPEA 1U2VB 1XUPO 3MMVA 5B8HA 5BRHA 2P9SA 5AQVA 5LJWA 3QFPA 3JXUA 4IZ9A 1K8KB 1HPMA 3WQUA 5AQPA 3QBXA 3L4IA 1NGDA 2QM1A 3EO3A 4I6MA 3TPQA 2A41A 4F9OA 1BG3A 3A5LC 3ZETA 2ZGYA 2GTDA 1EQYA 4QS9A 3A5NC 1ZC6A 4EHUA 2Q0UA 1SAZA 3HM8A 1BU6O 1GLLO 4O5FA 5AQSA 4B1UB 1E4FT 4AM7A 4CZLA 5BPNA 4WYBA 5AQXA 3J8AA 5AQRA 1NGJA 2E2QA 1MWKA 3CJBA 4CBWA 4M7YA 5AQYA 5AQKA 5AQJA 5KQ8A 3ID8A 4BRDA 4CBUA 5CE3A 1T6CA 3VF6A 3WXKA 2QWNA 1X9JA 1YVNA 3QMLA 3C0BA 3QICA 3CQXA 4FWMA 3MCPA 5F0XA 3AAQA 3MN7A 2QWQA 4BREA 1MA9B 1ZBSA 4NB4A 4CI6A 1DKGD 4JN4A 2WUSA 3MN5A 2YJFA 5AFUA 4KBOA 3ULEB 2Q97A 4J8FA 3UKRB 3ZEUB 4BRCA 3H1VX 3CIPA 2DPNA 5ADXH 2ASOA 3ENOA 1Z05A 2GEMA 3BP8A 3SMPA 4RWTA 4BR2A 5JMVA 3H3OB 4IO8A 4H03B 1QQNA 5AQGA 1YXQA 5TKYA 3KZBA 1RDWX 2Q0RA 1T6DA 3UKUA 4BVOA 2V7YA 3IDHA 3O5BA 3F9MA 2P9KA 4WQ5A 5AZIA 2HF4A 3EZWA 2Q36A 4B1XB 4FWKA 1SZ2A 1HJOA 5EVZA 4CZFA 5AQIA 2QWMA 1TUYA 2E1ZA 4A61A 3O1WA 2YHYA 3AARA 4FWSA 2IIRA 3O4WA 4DB3A 1TUUA 3O1BA 2I7NA 1GLJO 4BC2A 1C0FA 3D7EO 2P9UB 2QWPA 5AQLA 4L3QA 4B1YB 4BRIA 2P9PB 3U4LA 4DHYA 1Q18A 4ISEA 1SQKA 4A2AA 1NGIA 4BC3A 3CI5A 3VEOA 2FF3B 5BPLA 3VF2A 4DCHA 2GWJA 1V4SA 2Q2RA 2ITMA 3UKRA 3ZEUA 1DGKN 1YUWA 2GUPA 4CD3A 4FL9A 3LDPA 2E88A 5AQMA 1ATRA 3H3NO 3HSCA 3DXKB 3MDQA 1GLDG 2ZF5O 4GNIA 2E20A 4JD2B 3R9PA 4BR7A 2A40A 2P9NA 3M3ZA 3MK6A 2AA4A 3VF4A 1JCEA 2A5XA 1NBWA 1U2VA 3B8AX 2J4RA 1C0GA 4K43A 3WEEA 3IFRA 2P9KB 1XQSC 2F9WA 4XH5A 4BGBA 4B1ZA 3CERA 3LDQA 2QWRA 2HOEA 4JNEA 4BRNA 3EN9A 4FPBA 3RSEB 2P9LB 3D2EB 3G25A 5BR9A 2ASMA 4CZMA 4B9QA 1T44A 2Q1NA 2D0OA 1BDGA 1MDUB 4PKHA 2UYTA 2CH5A 4PL7A 2E8AA 5LJVA 3M6GA 5AQFA 5AZJB 4WQ4A 4HWIA 1HKGA 1BA0A 3DXMB 5BREA 3BF3A 3W3DA 3ZX2A 1NGFA 1TYQA 2FLOA 1GLFO 1NGEA 2V51B 5AQUA 3WXJA 3IUCA 1R59O 5AQOA 3VOVA 1K8KA 1KAYA 3ATUA 3LDNA 4CZGA 3QDKA 1RFQA 5BPMA 1ESVA 4JD2A 2IVOA 2PAVA 1GLBG 3AY9A 4CZJA 4H5TA 3CJ1A 2QXLA 3VEVA 2KHOA 4BRFA 1YAGA 4BR0A 4XH1A 4MO5A 4H0XB 1KAZA 4K42A 2I7PA 4QS7A 5JICA 1DEJA 4FWPA 5BRDA 3U9ZA 1NMDA 5F1XA 5KQDA 1U6ZA 2V52B 1V4TA 1BWFO 3VGMA 3ZX0A 2E2NA 3R6MA 4FWOA 3DXKA 4CZIA 5FPDA 2P9IB 3VEXA 2H3GX 4H0YB 5KPZA 3H1QA 1X3NA 3A8YA 5AQHA 2FXUA 4Z94A 3ENHA 1WUAA 3D2FA 1ATNA 3MN6A 5KPTA 3EKUA 4H5VA 3O8MA 2YHWA 4LC9B 3AAPA 4FWLA 4JAXA 4WQ5C 5AFUH 3HTVA 3W0LA 1ATSA 4CZHA 3CJ9A 5AQQA 2A42A 4CZEA 1CZAN 1NGCA 3DXMA 1NGAA 4B1WB 3TU5A 3GDQA 4BGAA 5FPMA 4BRHA 1HX1A 3S41A 3H45C 3QBWA 5LY3A 2CH6A 3CJ7A 3EKSA 5ELZA 4BQZA 5E84A 1ZXOA 2FSJA 5BN8A 1E4GT 4E1JA 5AQZA 3VETA 3WXIA 4CZKA 3KHYA 4BRPA 1KAXA 5F2RA 3GL1A 3UE5A 2VWBA 3FFKB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O9QA 2RE2A 3A5OC 3NGYA 4EFHA 2DY4A 3CXCM 4CFBA 1NOZA 1HLUA 2Z1IA 1C0UA 1VAZA 4DQSA 3BY5A 3OVNA 1XI1A 1NJYA 3RRGA 2O8FB 2E2PA 1I3AA 1L3SA 2O8CB 3T69A 4DWIA 3BUZB 3ZT4A 1KLMA 4DSJA 5M1PA 1L3UA 4DSEA 4CEEA 1BL3A 3RMDA 1DT9A 3K2PA 1VQKN 1JCFA 4JKFA 2NZTA 3AO2A 4K8ZA 4NXMK 1YT3A 4RW9A 3OS0A 2GWKA 4BRAA 2OTJN 2ZWHA 3O4QA 4IOXA 3CMEN 1S1XA 5BRFA 2ZGZA 2FSKA 5EXWA 1QHTA 4F4KA 1VQPN 1KXPA 3WQTA 4H5NA 3AA5X 3AVHA 4CHQA 3GBTA 2IVPA 4FLUA 4CJQA 1Q9YA 4IO9L 2B5JA 4NLBA 3FZLA 3BGRA 1ILYA 3RMAA 1GLCG 2QWOA 3HI0A 4DSIA 4G9ZA 2E6MA 1YITN 1WSHA 2E2OA 4K0KK 1LCUA 3VQCA 4IXCA 2QXFA 3NFAA 3MWTA 4FLYA 2BE2A 3NMUA 3C6TA 5BR8K 2E6LA 4QS8A 3KD1E 3RSEA 1CZ9A 1BUPA 3QEWA 3TAFA 3M8QA 3NE6A 3LL3A 3CD6N 2WOMA 2RN2A 2W40A 3VA0A 1B9DA 3FLCO 3C95A 1XNRK 2AJQA 2XY8A 5JS1A 2P9IA 4B3OA 3H6EA 4E7KA 3HPHA 1HRHA 4FK4A 4CBXA 3Q7CA 3OBWA 3ISNC 3KKSA 4JI2K 3RRHA 3WXMB 4DQRA 3OYBA 1TK5A 3LDOA 4BR9A 5JLFA 3PIOL 4OPHA 4CHNA 4E7LA 1WSFA 1X9MA 4Q5VA 3QEXA 4X64K 4C1NI 1J6ZA 4OKKA 1D4XA 2YHXA 3JS6A 4LSLA 3QB0A 4LF4K 4FPAA 4M7XA 1TL3A 3VPZA 3U9DA 4BRGA 3HM9A 4XIUA 3ZYYX 4Y0WA 2BUPA 4BRLA 4I7FA 3V1OA 1ASWA 3M5RA 4ISFA 4YOUA 1S1TA 4EAHD 4BDZA 4JI0K 2NRRA 2PZSA 4I2QA 3HBTA 3O6WA 1DTQA 3CQYA 2Z1JA 4NCGA 4CD1A 1P8ZA 3EL2A 5AQNA 1NGBA 3KLHA 2QKKA 5H1SQ 3LP0A 3ZSOA 3FGUA 1EO1A 2WFBA 4BRKA 2HVIA 3BZCA 3CCMN 4CEAA 2P9NB 4A2BA 4AILC 2VQEK 4PL8A 2KW4A 3B6PA 2IDOA 2HHHK 2CGLA 4A62A 3TTCA 3E1YA 2QTDA 3IMXA 2GX9A 2UXBK 2X74A 2HF3A 3M8PA 3LDLA 1JL1A 4ID5A 4OVLA 4FJJA 4K41A 1U2VB 5BRHA 5B8HA 2P9SA 2E4LA 1HPZA 5AQVA 1OH5A 1NK5A 3K59A 4YOWA 3WQUA 3CC4N 3NVMA 2NRTA 3L4IA 4N56A 4EZ6A 4CHYA 1KC8O 3TPQA 1LWEA 3LDSA 3OJSA 3K58A 4JK7A 2W6KA 4ILJA 3SV3A 1TKXA 2B6AA 2Q0UA 3ASMA 4KV8A 3HM8A 1GLLO 4CFCA 5AQSA 3OTOK 5M1QA 4B1UB 3SI6A 1E4FT 1IH7A 2YNIA 2WBNA 1TVRA 4DG1A 1S1UA 3SAFA 1MWKA 3CPWM 4PQUA 1KCFA 3P38A 1WNSA 3ID8A 4BRDA 2HNZA 4CJUA 1BIZA 1YVNA 4CCHA 1C0MA 1RBVA 5CR4A 3ID6A 3O4NA 3CQXA 4FWMA 2P5GA 4ELTA 4CIFA 4F3TA 1C6VA 3AAQA 1IBMK 3MN7A 4BREA 1ZBSA 1ZBIA 1RT4A 1IV0A 1DKGD 2WUSA 5GIPA 3NF7A 2YJFA 1VQ7N 3THXB 4J8FA 3K5LA 4B9TA 2UU9K 2HVHA 4C8LA 5ADXH 2GEMA 4AH9A 1KSPA 4R79A 3AGKA 4JK9A 2VGMA 5I3UA 5M1KA 3DLRA 4W5RA 1T6DA 3AVMA 4WF9L 2OA8A 1S1VA 3O5BA 3F9MA 3NH2A 4V19S 3HVRA 4WQ5A 4IKFA 5AZIA 3S3OA 1NKBA 4DFPA 4A5BA 4CZFA 5CHIA 4KH6A 4M3XA 1TUYA 3QESA 1T05A 3SQ2A 4QOZB 2X6NA 3KD5E 4W5QA 2PYLA 4DB3A 1OVQA 3AA3A 4EZ9A 1DLOA 5E41A 2XRIA 3VQ4A 4B1YB 2P9PB 1VQMN 4DHYA 3NHGA 2KQ2A 2A1RA 2G8IA 4JS4A 4A2AA 4CJLA 1QE1A 2FF3B 4CK3A 3HL8A 3VF2A 3TSPA 3ZEUA 4W5TA 1DGKN 4DSFA 3H3NO 3DXKB 4FLTA 3ZLJA 2OZSA 1XHZA 4GNIA 1VQ4N 2A40A 3CMAN 4CFDA 1QS4A 4CECA 4E19A 3CFOA 5IT9O 3E66A 3DRPA 3KK1A 3B8AX 2J4RA 3S3NA 2P9KB 3SV4A 4IOCL 5FRMA 4DFMA 4B1ZA 4WFNL 4M3RA 1VSKA 4F3OA 3LDQA 2HOEA 4BRNA 4B9NA 3EN9A 4FPBA 3MECA 5DK5A 2FBXA 4FJNA 3G25A 4DS4A 1A5VA 2ASMA 2O4GA 5T7BA 1HMVA 4OLAA 2Q1NA 4E0DA 1RTHA 4DTUA 5SZTA 3V9UA 2BH1A 2UYTA 2F8SA 4C8KA 4PL7A 2ITGA 5LJVA 4WFAL 1BA0A 3IG1A 1VK0A 5JVHL 4CJ4A 4CF0A 2F96A 4KO0A 1EKEA 3ZX2A 1TYQA 1GLFO 1NGEA 2V51B 2VWKA 4DLEA 1C0TA 4FJIA 3CF5L 1KAYA 3ATUA 3OYEA 1VQ9N 4B3MK 1UWBA 3MWPA 1RFQA 4J2DA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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