3H3NO

Glycerol kinase h232r with glycerol
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
501
structure length
501
Chain Sequence
AEKNYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSYRFYGSEVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLSDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAVAATQTFKFKAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Glycerol kinase
publication title Structural characterizations of glycerol kinase: unraveling phosphorylation-induced long-range activation
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus casseliflavus
molecule tags Transferase
total genus 185
structure length 501
sequence length 501
chains with identical sequence X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2009-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h3nO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h3nO01
3KVGA 3DXKB 4IZ9A 2Q0RA 3DXMA 5AQYA 2BTFA 4GY2B 3L0QA 2Q97A 3DXMB 1X3MA 3WT0A 2FSKA 2D0OA 4IJAA 1KAXA 1Z05A 2IIRA 2HF4A 4BC2A 4NB4A 5F2RA 4H03B 3WQTA 3GDQA 3QFPA 4H5TA 1U2VA 4B1XB 3WUHA 3VETA 4H0YB 2OANA 2E1ZA 1BWFO 3ATUA 3S41A 5AQPA 4DHYA 1U2VB 4BC3A 3W0LA 5AQOA 2I7NA 3GG4A 3H1VX 5FPMA 4FOEA 2P9PA 5FPEA 1GLDG 3F9MA 3MCPA 3MDQA 4XH5A 5AFUH 3VEXA 1NBWA 4BGAA 3WXLA 5ADXH 1NGDA 4CD1A 3HZ6A 2P9PB 2VWBA 5F0XA 3DAWA 3ENOA 4BQZA 3TPQA 4ISEA 4A2BA 4HWIA 1BG3A 2E20A 1NGGA 3VGLA 5KPRA 5LY3A 5CE3A 3KZBA 4O8KA 4K42A 5JLHA 3O1WA 2GEMA 2QWNA 4WQ4C 2E2OA 2E1YA 3CHWA 4H5RA 3RSEA 4H0TB 1GLEG 4BRHA 4H0XB 3RSEB 2NRHA 3CJ7A 2A6AA 2ZGZA 4FOIA 3UKRA 3FLCO 3MN9A 1XQSC 1MWKA 4ISGA 3UKRB 5FPDA 2P9IA 4FL9A 3VF6A 5AQGA 3WQUA 4B1WB 1RDWX 4WYBA 3O8MA 3R8EA 4BC5A 3DJCA 4CZMA 3LM9A 2CGKA 2ITMA 1BA0A 2P9IB 1BU6O 4BRQA 1QQOA 4HTLA 1H1VA 4K25A 1X3NA 3AY9A 1ZBSA 3CJAA 1LOTB 3FZFA 3FZKA 2PAVA 3IDHA 4A2AA 3L4IA 4XEIA 4FWSA 2YHYA 4YDUC 4BRCA 1Q18A 1WUAA 4H5WA 1YUWA 2CGLA 3CI5A 1J6ZA 5ELZA 1NWKA 2CH5A 2A41A 5AQXA 3I33A 3WEEA 2QXLA 4Y0WA 2DPNA 5AQNA 3HI0A 3VF4A 1ATNA 2PBDA 3QB0A 1IG8A 3DWLA 3GE1A 1QHAA 5KQDA 3C0BA 3R9PA 3A5NC 2CGJA 2QW9A 4EHTA 4BRGA 1NM1A 5B8HA 1MA9B 4JAXA 3H45C 4JN4A 4MLHA 1QQMA 4WQ5C 2UYTA 1TUUA 2V52B 5BN9A 4A61A 4CJ7A 4LC9B 2HF3A 2W40A 2D4WA 1OKJA 3CETA 5AQTA 2Q0UA 3O80A 1BUPA 1JCEA 3FZHA 1NLVA 3P4IA 4FWRA 2D1KA 3ATVA 3JS6A 3CJCA 1NGHA 4CZFA 1ESVA 4RWTA 2E2PA 4H5VA 4H5NA 2ZGYA 3FFKB 2HOEA 4BG8A 3HM8A 1HX1A 5AQJA 5KQ8A 4B1YB 4BREA 3G25A 3LDQA 1CZAN 1MWMA 3BF1A 1SAZA 5BRHA 4BRDA 1NGIA 4PKGA 4CBXA 4BRIA 4BR4A 4XH4A 5LJWA 4PKIA 2E2NA 3WXKA 4FWPA 4BRLA 3MN6A 4BVPA 5AQMA 4FWMA 2YHWA 1R59O 2Q36A 4CI6A 1SQKA 2F9TA 3IFRA 4L3QA 1Z6RA 2QWOA 3A8YA 4EAHD 3SLCA 3I8BA 2VYPA 1BO5O 2VCPA 5BPNA 5BREA 4CD3A 4C23A 4F9OA 5AQWA 1E4FT 3AAQA 1QZ6A 4IWVA 5AQFA 1DKGD 4RCHA 3IMXA 4ISFA 3EKUA 4O5FA 1RFQA 1U6ZA 3H3NO 3A5LC 5AQIA 3ZETA 4BR5A 2YCHA 3LM2A 1QQNA 2J4RA 3H1QA 4BR7A 3IUCA 3ZETB 3EO3A 4DCHA 4CBWA 1DGKN 1HKBA 3D2EA 4BRNA 4FWKA 4PKHA 3FR0A 5BRFA 3D2EB 1BDGA 1ATSA 4QS8A 5TKYA 4KBOA 3VERA 3BF3A 2CH6A 5AQSA 3VGMA 3AARA 1NGEA 3MMVA 3B8AX 4FPBA 1MDUB 4E1JA 4DB3A 1Y64A 3OHRA 4M7YA 5E84A 4EFHA 1GLLO 3H46O 4EIAA 5AZIA 3D7EO 3ZEUA 3QICA 1NGCA 2A40A 3U8XA 4CZGA 1DEJA 3FZMA 5AZIB 1V4SA 3ZEUB 3VEWA 2I7PA 1TUYA 1ZC6A 2YI1A 2P9NA 3BEXA 3A5MC 2FF6A 1KAZA 3QFUA 1QZ5A 2YJEA 2P9NB 2AA4A 4BG9A 5BPLA 4B1VA 4BRAA 2QWLA 1SZ2A 3AAPA 1C0FA 3MN5A 1RGIA 3C7NA 3L6QA 3MK6A 1ZXOA 1ATRA 1NGFA 3C7NB 5AZJA 3VF2A 3FE1A 3SMPA 3GOIA 2QWMA 1IJJA 2GUPA 5AZJB 4A62A 5AQUA 2NZTA 1BA1A 2A42A 3KHYA 4FO0A 1GLCG 2Q31A 3EZWA 1D4XA 5I9EB 3UE5A 4CZEA 3CJBA 3HSCA 4WQ4A 2EWSA 5AQHA 4CZHA 3H3OB 3ZX0A 3CERA 2FF3B 4MO5A 2KHOA 4FSVA 3O4WA 4BRKA 2QWRA 2FSJA 5EOYA 5JICA 5AQLA 4FWLA 4DQ8A 2AP1A 3M3ZA 2QM1A 4PL7A 3M1FA 3ID8A 3U4LA 1GLJO 2WUSA 4QS9A 3MN7A 2HMPA 2P9SA 5F1XA 4H0OA 1S22A 1HUXA 4BR2A 3CJ1A 1YVNA 4H0VB 5AQKA 2P9SB 3FZLA 3CQYA 4B9QA 3QDKA 1T6CA 4IXCA 5BR9A 3UKUA 2FSNA 4I6MA 4YDUA 3O5BA 3LDOA 3O6WA 4AM6A 2ZWHA 4M7XA 3ZX3A 3QBWA 2GWKA 3UKUB 4RTFD 4I6MB 4K41A 3ULEA 3TU5A 3LDPA 2YHXA 1K8KA 1X9JA 3HTVA 3UB5A 5BRDA 3CQXA 3VOVA 1YXQA 3ULEB 4Z94A 3QBXA 1HPMA 3BUZB 1K8KB 3LDLA 2P9LA 2FXUA 4B1UB 2ASOA 4MO4A 4AM7A 5EVZA 4FWNA 3VENA 2FLOA 2IVOA 3LDNA 2P9LB 5E26A 3HBTA 3EKSA 4EHUA 4CZKA 1V4TA 4FPAA 5AQRA 4NO7A 2IVNA 1EQYA 5BN8A 1P8ZA 4FWQA 4JNEA 2E8AA 1NGJA 3BP8A 4WQ5A 3VEVA 3CJ9A 2ASPA 5JLFA 1C0GA 1YAGA 3SJHA 3VGKA 2E88A 1E4GT 4M63C 1HLUA 1TYQA 3D2FA 3LL3A 1HJOA 1BOTO 3QMLA 4FWOA 3SMSA 5BPMA 4BRFA 2IVPA 3U9ZA 1TYQB 4J8FA 3D2FB 4QS7A 4BR9A 1XUPO 5EXWA 3O1BA 3VEYA 2E2QA 3U9DA 1GLAG 2D0PA 3R6MA 3O08A 4IJNA 4BGBA 3EL2A 2QWQA 4B1ZA 2Q1NA 2NLXA 2QWPA 3A0IX 5AQQA 4H0PA 1T44A 2ASMA 4GNIA 4CZIA 4BR0A 1KXPA 2A5XA 5AQVA 4JD2A 1GLBG 3VEZA 1XC3A 5AR0A 2H3GX 4JD2B 2BUPA 4BROA 2YJFA 3CIPA 4JHDA 3ENHA 3JXUA 4BQLA 2Q2RA 2V51B 2A3ZA 3J8AA 3M6GA 2ZF5O 1JCGA 4IO8A 4BVOA 1HKCA 4JHDB 2P9KA 1JCFA 4MLEA 4CBUA 4BRPA 3H6EA 1NGBA 2P9KB 3FGUA 4CZJA 1LCUA 4XH1A 3A5OC 3WEEB 2GWJA 4BRMA 5EX5A 3GL1A 1G99A 3ZX2A 1HKGA 1T6DA 2P9UA 3WXJA 1WOQA 1NMDA 1NGAA 3GBTA 3W3DA 5LJVA 2P9UB 5KPTA 4BC4A 5AQZA 2W41A 4K43A 4PL8A 3VEOA 5KPZA 5EY4A 4CZLA 5JMVA 1S3XA 3SK3A 3WXIA 3VPZA 2GELA 1GLFO 2F9WA 2GTDA 1KAYA 2V7ZA 3DXKA 3EN9A 5AFUA 2V7YA 5ADXA 3VESA 5FPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VSJA 4IZ9A 1JKHA 2Q0RA 2ZJPL 1SL2A 1RBRA 2Q97A 3DXMB 4CF9A 3ASMA 3OYLA 1C0UA 1X3MA 1HNVA 4IJAA 1VQ5N 1ZBUA 3T1AA 5DK5A 4BC2A 4NB4A 3CG7A 4GKKK 3OYKA 3GDQA 3KK2A 2D0CA 3T1HK 3VN5A 3CCUN 1U2VA 4FZXC 3WUHA 3HPHA 2BDPA 3SUPA 1BWFO 4DQSA 2KQ2A 4XIUA 2G8UA 5A2QO 4BC3A 4FOEA 3F9MA 3MCPA 5AFUH 4GV3A 1NBWA 4E7JA 4CJPA 5ADXH 3HZ6A 3THWB 5F0XA 1LV5A 1LW2A 3DAWA 2RF2A 2Z1IA 3E66A 2OTLN 1U49A 3TPQA 1JLBA 4ISEA 1RTJA 4Z4GA 2DY4A 2E5LK 2F7TA 1NKEA 4W5QA 5JLHA 3Q7BA 3O1WA 3OBWA 3VQDA 4IO9L 4M3UA 1QQCA 2YNIA 3LWMA 2A6AA 3SPYA 3J7AP 3R3LA 5FPDA 5JVHL 4KHWA 3CM6A 2P9IA 2F8TA 2IC3A 3R8EA 3O8MA 4OO1J 3NDKA 4LSLA 4BWMA 1G15A 4K25A 1ZBSA 4IEIA 3FZFA 3TSQA 3ZSRA 4AF1A 2PY5A 3L4IA 1U4BA 1KCFA 4YDUC 4FM2A 4CHNA 3CI5A 1J6ZA 4NLCA 3NVKA 3J7ZO 3BDPA 4YOXA 5AQXA 3I33A 3CD6N 4R5PA 5HOOA 1BL3A 3TTCA 5HLFA 1NKBA 4HUEA 3NMUA 2DPNA 2FBTA 2W42A 3VF4A 5I42A 1U48A 3GE1A 3C0BA 4IFEA 3T1YK 4E7LA 4I9QA 1YVUA 2CGJA 3DRPA 4RG8A 1Q9XA 4BRGA 5B8HA 1WNSA 4KHSA 1MA9B 3H45C 4JN4A 3DOKA 2V52B 1QSLA 3EZ5A 4LC9B 1A5VA 3LWLA 3C6TA 1W9HA 1D5AA 4DTNA 2YNHA 1JCEA 2KKZA 2VQEK 1T05A 4B9TA 2OZMA 1WN7A 2F4VK 4JKEA 3AVJA 3JS6A 4CHPA 4KH4A 2EHGA 3CJCA 3ZSWA 1NGHA 4MFBA 4CZFA 2A1SA 3KWGA 3HM8A 1BIZA 5C25A 4LH5A 3LDQA 1CZAN 3T69A 1IBKK 3BF1A 4ILJA 4E0DA 3DM2A 1KVCA 3VQ8A 4YOTA 1F21A 3OYIA 4BR4A 1FJGK 4FWPA 1CXQA 4BVPA 4FJ5A 2YV0X 4LF5K 4FM0A 2E6MA 5T7BA 2YHWA 1VQPN 3VQAA 1N34K 2HBJA 3IFRA 3SNNA 4H4OA 3CMEN 1CXUA 1N36K 1VQ4N 2GUIA 4C1NK 3THXB 4JKAA 5BPNA 5BREA 4KO0A 3MWPA 1M1KO 4IWVA 1QZ6A 5LY3A 4B9UA 1RFQA 4BR5A 3I56N 3SZ2A 4KH6A 2HNZA 5HRSA 1IG9A 4DQIA 3ZETB 3CFOA 3FFIA 1HYZA 4BRNA 5GAHP 3FR0A 4C8KA 1IKVA 2RN2A 4DFPA 1BDGA 3DI6A 4DUYK 1UA0A 5AQSA 3O3HA 4E1JA 1GOCA 1Y64A 1YTAA 4G9ZA 3AA4A 5AZIA 3ID6A 2QI2A 1DEJA 1XWLA 1I94K 4CK3A 1UOCA 4M3XA 4JRPA 3L2VA 1KAZA 4YOVA 3T19A 4B1VA 4BRAA 2QWLA 4FJ8A 3AAPA 1RGIA 2ZQBA 3V1RA 2VGMA 1ZXOA 1J5OA 1ATRA 4NYFA 4FLUA 3AVIA 1LWEA 3VF2A 1VQKN 3FE1A 3GOIA 3ALYA 4PA1A 3KK1A 4A62A 1NU0A 4JKGB 3TARA 4KTZA 4FO0A 4ZTFA 4N76A 2HBMA 3TAFA 3AVBA 4JKCA 1QSYA 4Z4IA 5I9EB 3UE5A 4CZEA 4DV5K 3LP1A 2ATQA 3L8BA 2PYJA 4J2BA 4A5BA 1QVGM 5E41A 1XNRK 4FSVA 4B9NA 3O4WA 3AO3A 4BRKA 4DWIA 3SQ0A 5AQLA 3NGYA 4DQ8A 5J1EA 4AHVA 2XY5A 1NJIO 3OJUA 1MU2A 3NVMA 2X74A 2WUSA 4OJRA 4CJTA 4YNQA 3V9ZA 4FZYA 1YVNA 3SV3A 1NOYA 4B9QA 1J9AA 4DR4K 4CIGA 3NFAA 1HJRA 3UKUA 5FRMA 4YDUA 3O5BA 3LDOA 2HHXA 3TSPA 3QBWA 4FJXA 4RTFD 3HVTA 1VSMA 3LDPA 3QNNA 2YHXA 1X9JA 5BRDA 4JS4A 1YXQA 5C10A 3ULEB 3SI6A 3QBXA 3BUZB 1K8KB 4CEEA 2RKIA 4Z4CA 3K5NA 4FWNA 1J54A 2IVOA 3HBTA 4FLYA 4Z4HA 1NJXA 1S5JA 4WCEL 5CHIA 4CGIA 2E8AA 2O4GA 1NGJA 1X9WA 2O8CA 2KW4A 3CCSN 1YAGA 1QTMA 4GV9A 1WSGA 1QE1A 1B9FA 4E1MA 4Z4EA 3D2FA 3SMSA 3U9ZA 1TYQB 4J8FA 4QS7A 4NCGA 4DSEA 3U9DA 2D0PA 3R6MA 3O08A 1DTTA 4IJNA 3HM9A 4DF8A 4KTQA 1KVBA 3EL2A 3HYFA 5I3UA 5J2QA 4AHTA 1UA1A 2WFBA 3KK7A 3LPUA 4ELTA 3ZSYA 1FKOA 4F8RA 5AQVA 1KVAA 2HB5A 3V9XA 3VEZA 5HROA 4JD2B 3ZT3A 3ISNC 4GW6A 4BROA 1QHTA 1K9MO 4BQLA 3OYJA 2Q2RA 1JCGA 4IO8A 4JHDB 1BCMA 2P9KA 4MLEA 3QLHA 1W0HA 4TSXA 1NK8A 4N56A 1KD1O 1JL1A 4B9MA 3FGUA 4KPYA 1FXXA 3OYEA 4Q0BA 4DMNA 1OH7A 4C8LA 1ITGA 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1YUWA 1NWKA 1RBSA 2CH5A 3O9QA 2A41A 4JKHA 4CEZA 3TAGA 1W97L 4PWDA 3L3VA 2QXLA 2QKKA 3A2FA 4Y0WA 3CQ8A 3UIQA 1IBLK 3CXCM 1IG8A 3QESA 5KQDA 5C42A 4KI6A 3QEPA 2QW9A 1NM1A 3E1YA 4RW4A 4JAXA 3LPTA 4FLTA 3P83D 2NRTA 4WQ5C 4CJFA 4CIFA 4CK1A 4WFNL 4A61A 4DV7K 1BI4A 3M8QA 2D4WA 1OKJA 4IEEA 4DG1A 1NK6A 1NK7A 1BUPA 3NH2A 3HXMA 4M3ZA 3VQEA 3E9PA 1XNQK 3R1XA 4FWRA 2D1KA 4ILGB 2HVHA 3CCRN 1HYSA 1KC8O 4K0KK 4U7BA 1QS4A 1SKRA 5KQ8A 4B1YB 4FK2A 2JGUA 3JAMO 2QXFA 3ZYYX 4KAZA 5KGXA 1NK4A 4CBXA 1XHZA 5HP1A 3QIPA 4PKIA 4J2AA 4BDZA 3PV8A 1VSHA 3F2KA 5AQMA 1K8AO 3CC4N 4FWMA 1IKYA 4J2DA 1VQ8N 3F9KA 1R59O 1SQKA 1ASWA 2F9TA 1Z6RA 1C1BA 2VGNA 1O1WA 1D9FA 4CJEA 1Q9YA 4CD3A 4C23A 2AJQA 1W7AA 1DKGD 4RCHA 4O5FA 3EKUA 2YX6A 3A5LC 3V81A 2YCHA 3VA0A 3OYAA 4LH4A 4BR7A 3EO3A 1VQ7N 3HPGA 4CESA 1HKBA 3D2EA 3RTVA 4FWKA 2JLEA 5BRFA 1RDAA 2YHBA 4YOWA 4FJKA 4IFYA 2G8IA 4O5BA 4KBOA 3RR8A 3BF3A 2CH6A 3PY8A 3VGMA 3MMVA 1HQEA 3EYZA 1MDUB 4HTUA 3QEVA 1VSLA 3N4PA 3VMFB 2P1JA 4DB3A 3NH0A 4M7YA 4EFHA 3I8DA 4YHHK 1GLLO 3EE8A 3H46O 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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