3DXMB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck0993548
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
b'GVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization of two classes of small molecule inhibitors of Arp2/3 complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 51
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3dxmB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3dxmB02
4J8FA 1LCUA 4O8KA 1TYQB 1RDWX 2P9KA 3UKRA 2GWJA 3VEOA 2PBDA 2E1YA 3A5OC 3L6QA 4I6MB 2HF3A 4M63C 5FPNA 5AZIB 4BR5A 1Y64A 5F0XA 3D2EA 2CH5A 2Q31A 4FWLA 4O5FA 3U8XA 1T6DA 3ATUA 2DPNA 4JHDB 4H03B 4BR0A 1BUPA 1YXQA 3HZ6A 3BF3A 5EVZA 4LC9B 4BR4A 4CZHA 3VEXA 2P9KB 4QS7A 3H3NO 3M1FA 3DJCA 3UKRB 3LDQA 4DQ8A 4BREA 5AQFA 3MCPA 2HMPA 2KHOA 1K8KA 3D7EO 3WXIA 3D2EB 1HX1A 3UKUA 2P9UA 3GDQA 3FZHA 4XEIA 3QBXA 4FOIA 4JN4A 3AAPA 2YJEA 2D1KA 1DGKN 5ADXH 3UB5A 3WUHA 3AAQA 1HPMA 3VEVA 4CZJA 5AQLA 3IUCA 3CQXA 5EXWA 4AM6A 1K8KB 4WQ4A 1TUUA 5LY3A 3UKUB 5AQQA 2WUSA 1SAZA 4BRMA 5JMVA 5AQRA 3ZEUA 3MN7A 1NGGA 1GLEG 5TKYA 2E2OA 1HLUA 1U6ZA 4BC3A 5BRDA 4PL8A 1V4TA 2E88A 3JXUA 4IJNA 4BVPA 4EFHA 4QS8A 2E2NA 4BRAA 2QW9A 1NLVA 4FO0A 1HKCA 1BO5O 3WXLA 2HOEA 3KVGA 4EIAA 1YUWA 3RSEB 3VEYA 1T44A 3ZEUB 3H1VX 4E1JA 5BN9A 5BRFA 4RTFD 3GG4A 4CZEA 3W3DA 1GLBG 3R6MA 2IVNA 3I33A 3H46O 1NM1A 3VEZA 1DKGD 2IVOA 3AY9A 5CE3A 3WXJA 4BG8A 3I8BA 4YDUC 3HSCA 1NGAA 1HJOA 3HM8A 4PKGA 1HKBA 3WQUA 2A3ZA 3TPQA 4ISFA 5ELZA 3FLCO 3M3ZA 4Y0WA 4FWOA 3W0LA 1HUXA 1ATNA 5E26A 2FLOA 4EAHD 3BUZB 3O1WA 2D0PA 5AQXA 1GLFO 3O4WA 3A5MC 1SZ2A 3VGMA 5AQMA 5LJVA 4H5TA 1CZAN 1X3NA 2Q2RA 4FWNA 4BRFA 3UE5A 1NBWA 1KAXA 5AQNA 2YJFA 1RGIA 3MN5A 5AQZA 3JS6A 3ULEA 1NWKA 3VF6A 3J8AA 4MLHA 1E4FT 4BRCA 2IIRA 3DXKA 3FZKA 2E20A 2V7ZA 4BC5A 2FSJA 2QWOA 3C7NA 4BR7A 4BRPA 4CI6A 2FSKA 4MLEA 2D0OA 3R9PA 3FZFA 4AM7A 3IDHA 4BRDA 3IFRA 4H5WA 2QWQA 3VENA 4A2AA 3A0IX 3QB0A 5E84A 3ULEB 2Q97A 3A5NC 4B9QA 3LL3A 1NGHA 4FPBA 1S3XA 3DXKB 2FF6A 3DWLA 3VPZA 2ASPA 3BEXA 5AQWA 2QWMA 2P9LA 5BN8A 3VF2A 4DCHA 2W41A 4IZ9A 4CBXA 3GBTA 4ISEA 2E8AA 3CI5A 1U2VA 1SQKA 2QXLA 2I7NA 1BWFO 2VYPA 3VETA 4JD2A 5BPLA 1T6CA 3KZBA 4B1ZA 3HBTA 2GTDA 3CQYA 1ATRA 3SMPA 1KAZA 4HTLA 3CJ7A 4BRIA 2BTFA 1ZBSA 5BRHA 2P9LB 2P9UB 1JCEA 3O6WA 1TUYA 1NGDA 1HKGA 4C23A 1U2VB 4BR2A 3CETA 5JLFA 4DHYA 3ZX0A 3DAWA 5AR0A 4FWSA 4JD2B 3B8AX 3CHWA 5KPTA 1DEJA 1BDGA 1ESVA 4BC2A 4H5RA 3VERA 3MN9A 4WQ5C 4CZGA 1X9JA 1NGFA 1R59O 2AA4A 4WQ4C 2A41A 2OANA 3O5BA 4IXCA 2Q0UA 3R8EA 1XQSC 2CH6A 1JCGA 4GNIA 3S41A 4HWIA 3WT0A 5AQSA 3FGUA 3VEWA 4CJ7A 4B1WB 2F9WA 4KBOA 3G25A 3H3OB 3MN6A 3O08A 5ADXA 4BRGA 1IG8A 3EKUA 5AFUH 2UYTA 3CJAA 3EKSA 2YHYA 1ZXOA 2GEMA 1Z6RA 1V4SA 1QHAA 2YCHA 1ATSA 4BGAA 4K41A 3ID8A 3WEEA 3QFUA 5JLHA 3LM2A 4WYBA 4MO5A 1RFQA 2NZTA 2VCPA 2NLXA 4DB3A 5KQ8A 4H0YB 4BRHA 1BA1A 4PKIA 2VWBA 1XC3A 1BOTO 4IO8A 1BU6O 4BGBA 4BQZA 2E2PA 4PL7A 5AQJA 4RWTA 1YVNA 3TU5A 4EHTA 4JNEA 3O1BA 3GL1A 1KXPA 1IJJA 1MDUB 3WEEB 4XH5A 4CZLA 3KHYA 3SMSA 5EOYA 5AQOA 4CZFA 1Q18A 3CJBA 1BG3A 3VGKA 1JCFA 3D2FA 4FWKA 3OHRA 4BRNA 4CZKA 1J6ZA 1NGBA 1QQOA 3BF1A 2A6AA 3RSEA 3LM9A 2D4WA 2H3GX 2GWKA 2YHXA 4BC4A 2QWNA 5FPEA 4A61A 4FWMA 4L3QA 2E1ZA 2HF4A 1GLJO 1NGCA 3C0BA 2F9TA 1YAGA 3IMXA 4RCHA 5LJWA 5AQPA 2CGLA 3VOVA 1QQNA 3GOIA 4CZIA 3HTVA 3D2FB 2PAVA 3EN9A 2NRHA 4H0PA 2CGKA 4B1XB 1P8ZA 1GLCG 1LOTB 2GELA 3QMLA 4NO7A 5EX5A 1MWMA 2ASOA 2ZGZA 2ZF5O 3BP8A 3P4IA 5AQKA 3MMVA 1BA0A 3GE1A 3ZX3A 3WXKA 3LDPA 1NGJA 3C7NB 4BR9A 2QM1A 5BPNA 5B8HA 1XUPO 3QDKA 5AQYA 2V7YA 1EQYA 2FF3B 4K42A 4BVOA 5JICA 5AZJA 1ZC6A 3LDLA 2P9PA 3ZX2A 1E4GT 3MK6A 1QZ6A 4K25A 1NMDA 2Q1NA 2I7PA 3F9MA 3M6GA 3CIPA 4FWPA 5AQVA 2J4RA 2V52B 2BUPA 1Z05A 3A5LC 2IVPA 3A8YA 2YHWA 3H6EA 2FSNA 5AQHA 5AZJB 1WUAA 1MWKA 2P9PB 3LDOA 3O8MA 3EZWA 4GY2B 3FE1A 1C0FA 5I9EB 4BQLA 4WQ5A 3QICA 3WQTA 2A5XA 5F1XA 5BREA 3CJ9A 4M7XA 4BG9A 4B1UB 1G99A 2FXUA 5KPZA 4XH4A 4FPAA 4CD1A 5BPMA 3ENOA 3LDNA 3QFPA 3VGLA 2Q36A 3U9ZA 4H0VB 3SJHA 1QQMA 4ISGA 3MDQA 4H0XB 2E2QA 2ZGYA 4H5NA 2QWRA 4M7YA 5AQUA 3CERA 3AARA 4YDUA 2P9NA 4H5VA 1NGEA 3VF4A 1GLAG 5AQIA 5FPMA 3SK3A 2QWPA 2QWLA 3L4IA 2ASMA 4K43A 2AP1A 4MO4A 4CBUA 4BRLA 3EL2A 1QZ5A 2A40A 3FZMA 1D4XA 4CBWA 4JAXA 4XH1A 3FR0A 2W40A 3H45C 3EO3A 4BRQA 4PKHA 4F9OA 3O80A 4H0OA 4FWQA 2P9NB 2ZWHA 3CJ1A 4FL9A 3H1QA 1NGIA 4B1VA 4IWVA 3ZETA 3CJCA 3DXMA 4FWRA 4A2BA 4H0TB 5EY4A 2P9SA 1H1VA 5AQTA 1X3MA 4CD3A 2CGJA 2P9IA 4A62A 2YI1A 5KQDA 4BROA 2ITMA 3L0QA 4BRKA 1KAYA 5FPDA 5AQGA 4CZMA 4IJAA 3ATVA 2A42A 1WOQA 1TYQA 2V51B 2Q0RA 3VESA 4QS9A 1C0GA 4Z94A 3ZETB 3DXMB 4I6MA 3SLCA 5AFUA 5AZIA 4NB4A 2P9SB 3FFKB 2GUPA 3U4LA 5BR9A 4FSVA 5F2RA 4FOEA 1GLLO 3ENHA 4EHUA 1GLDG 3QBWA 2EWSA 2P9IB 4JHDA 3FZLA 4B1YB 5KPRA 1S22A 1OKJA 1MA9B 3U9DA 3HI0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JI0K 3LP1A 2E1YA 3L6QA 2GV9A 4M63C 4DV7K 5FPNA 5AZIB 3VA3A 1J5EK 3D2EA 2CH5A 1VK0A 1TAUA 2UU9K 4QOZB 3MCAB 4BR0A 1BUPA 3VQ9A 4DTNA 4BR4A 2P9KB 3TR8A 2JWLA 2XO7A 4GMJB 3ISNC 2Z1HA 2KHOA 1RTJA 3WXIA 4FM0A 1HX1A 2VG6A 3AVBA 4RW7A 3VQBA 5GINA 1KLMA 3NF6A 2D0AA 1VQ9N 4FZZA 3WUHA 3IG1A 4KHQA 2HBMA 3AAQA 3VEVA 1QSYA 5AQLA 4AM6A 1NK8A 3NBPA 4J2EA 1K8KB 5LY3A 3NVMA 3UKUB 2ZD1A 5M1FA 4LH5A 4ZTJA 5JMVA 4Z4FA 4ZTFA 4AHTA 4R5PA 1HLUA 1U6ZA 3P38A 2Z1IA 1YI2N 1NK5A 1V4TA 2E88A 3P39A 4BVPA 1IO2A 4EFHA 5HOOA 4ELUA 2E2NA 2F8TA 1WSIA 2KZZA 4DU1A 2HOEA 3KVGA 3MEDA 4JI3K 1CXQA 3H1VX 2D0BA 4E1JA 5BN9A 1U4BA 4W5QA 3QIPA 3GG4A 3VQ5A 3SAGA 1NM1A 4OPJA 1N5YA 4PWDA 2FBXA 3M8PA 3VQ8A 1XC9A 1C0TA 3DYAA 1IKVA 1HJOA 1RDDA 3HM8A 3ENBA 1WAFA 4GKKK 4JKBA 1DLOA 4DSJA 2A3ZA 3CFPA 3TPQA 1G15A 5ELZA 3L2RA 3M3ZA 4FWOA 3AO2A 3AA4A 4K8ZA 1HUXA 4C8OA 3O3HA 3O1WA 3O9RA 4IO9L 2D0PA 5AQXA 5T7BA 3O4WA 5BR8K 1DTTA 2ETJA 2VQFK 4C1NI 1KVBA 3IAYA 5LJVA 3R1XA 4H5TA 4A5BA 3TAGA 4FWNA 3AO1A 1VQ6N 1IBLK 4O44A 5LMNK 4CIFA 1KVCA 5JS1A 3JS6A 1QTMA 1NWKA 3VF6A 2KQ2A 3K59A 3OYLA 4YORA 4JLHA 1S6QA 2PY5A 3ZLJA 2E20A 2HSTA 2ITGA 2LSNA 3IDHA 3O3FA 4E0DA 4DTSA 2QWQA 4A2AA 3QB0A 4FW2A 3ULEB 3D45A 3ZT0A 5KI6A 4A59A 4FPBA 4DWIA 4X64K 1WB9A 3DXKB 4C1NK 4JK9A 2ASPA 2IC3A 3SPZA 5BN8A 3VF2A 2W41A 4CBXA 3SQ4A 4CEZA 4AHVA 4WFBL 4OPHA 3M8QA 1U2VA 1SQKA 4CK1A 2I7NA 5A2QO 1RDAA 1JXBA 4JD2A 1T6CA 3RWUA 3KK7A 4NCBA 2IS3A 4E19A 3NMUA 4JI1K 3CQYA 1TGOA 1TK0A 1KAZA 3N4PA 4HTLA 4W5OA 2VG5A 2GX9A 1QS4A 1GOCA 5C10A 4KHSA 2P9LB 5MLCQ 3DMJA 1T3VA 1NGDA 2HHTA 1HKGA 3PO4A 5KPTA 2RE2A 3KWIA 4B9LA 4BC2A 2ZM6K 2OZMA 4WCEL 4H5RA 4DV5K 4JI4K 4CZGA 4CECA 3RVCA 1NGFA 2YHAA 2OANA 4IXCA 4BECA 4KH5A 3S5TA 3TTCA 1XQSC 4IEIA 2QEXN 3WT0A 4DV1K 1BL3A 4IOAL 4JK8A 2F9WA 3C65A 1C1CA 4CEQA 1YIJN 3AVGA 3SBGA 1IBKK 2A1SA 2JLEA 4PQUA 1XHXA 3CJAA 4KREA 2HVIA 3EKSA 3G4SN 1S9GA 1Z6RA 3LAMA 1V4SA 1QHAA 1J54A 3V1QA 5M1PA 5JLHA 4WYBA 4MO5A 3G10A 1ZBUA 2X6NA 3DLGA 4BRHA 4BDYA 2HHWA 3SQ2A 1XC3A 4EZ9A 3PLAA 4BGBA 4BQZA 4GVEA 4PL7A 2FBTA 3K5LA 1KCFA 4BDPA 4OLAA 3RRGA 1WSFA 1LWCA 1IJJA 1MDUB 3WEEB 2O8CB 3SMSA 5EOYA 3PY8A 4CZFA 1Q18A 2B4JA 1BG3A 3OYMA 2Z1JA 4CJQA 2E6LA 1J6ZA 3BF1A 1UA0A 4FVUA 4JI5K 1SKRA 2QXFA 4L3QA 4IG3A 1D5AA 1KSPA 2A1RA 1YAGA 4RCHA 2O8BB 4CHZA 5AQPA 1KFDA 3VOVA 3GOIA 4CZIA 1XNRK 4CJFA 3B6OA 4NO7A 5EX5A 5AQKA 2ASOA 2ZF5O 2YNIA 3LDPA 3PV8A 4W5TA 3SJJA 5B8HA 5C2FA 4CF1A 4DSIA 5E41A 1C1BA 4CEFA 3OTOK 3E1YA 5C24A 3ZX2A 1ZYQA 1E4GT 2P1JA 1NMDA 3CCVN 2Q1NA 3M6GA 2WOMA 3CIPA 4WFNL 5AQVA 5GADP 1HYVA 4O0IA 3CF5L 2BUPA 3THVA 3O9UA 2IVPA 5DMRA 2FSNA 4FJIA 3OYKA 4FLVA 3LDOA 3O8MA 3EZWA 4GY2B 1D8YA 3NGYA 3HRGA 5F1XA 3KK1A 3R3LA 1NK4A 1D9FA 4FLTA 4B3RK 4CE9A 3CCSN 4LF5K 4CD1A 5BPMA 3UIQA 3MAQA 3S3NA 1VSLA 1RBUA 1CLQA 1Q7YO 4H0VB 1JKHA 4DV4K 3SJHA 1RTDA 4H0XB 3J81O 1HJRA 5AQUA 5HROA 4M3TA 2P9NA 3AVNA 4FM1A 2D5RA 2NRXA 3VF4A 4ZHRA 5SZTA 5M1QA 4OX9K 2QWLA 3EL2A 1QZ5A 2A40A 3V9SA 1D4XA 2W40A 3QIOA 4KV8A 1LW0A 4LF6K 1EETA 3CQ8A 4CJ4A 3HJFA 4FWQA 4CEEA 4CERA 3CJ1A 3K58A 3O9SA 1WSEA 4JKFA 3ZETA 4F8RA 4FWRA 4A2BA 3CC2N 3KD1E 4KTZA 4CGHA 5AQTA 1X3MA 3C94A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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